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CN110225983A - 治疗癌症的方法 - Google Patents

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CN110225983A
CN110225983A CN201780084548.0A CN201780084548A CN110225983A CN 110225983 A CN110225983 A CN 110225983A CN 201780084548 A CN201780084548 A CN 201780084548A CN 110225983 A CN110225983 A CN 110225983A
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A.费多里夫
S.格哈特
R.G.克鲁格
J.拉莱奥
H.穆罕默德
S.奥布赖恩
J.鲁宾
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GlaxoSmithKline Intellectual Property Development Ltd
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Abstract

本发明涉及在需要的受试者中，例如，在需要的人中治疗癌症的方法，包括测定5‑甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)多核苷酸或多肽的水平，或在人样品中MTAP突变的存在或不存在，和如果MTAP多核苷酸或多肽的水平相对于参照降低或如果MTAP多核苷酸或多肽中存在突变，则向人施用有效量的I型蛋白质精氨酸甲基转移酶(I型PRMT)抑制剂，从而治疗所述人的癌症。

Description

治疗癌症的方法
技术领域
本发明涉及在需要的受试者中治疗癌症的方法。
背景技术
有效治疗过度增生性疾病，包括癌症，是肿瘤学领域的持续目标。通常，癌症由控制细胞分裂、分化和凋亡细胞死亡的正常过程的失调引起，并且其特征在于恶性细胞的增殖，其具有无限生长、局部扩张和全身转移的潜力。正常过程的失调包括信号转导途径的异常和对与正常细胞中发现的因子不同的因子的响应。
用于癌症治疗的靶向疗法的扩展开发和使用反映了对关键致癌途径的日益了解，以及这些途径的靶向扰动如何对应于临床反应。预测靶向治疗功效的困难可能是对通路失调的因果机制(例如激活突变，扩增)的总体知识有限的结果。肿瘤治疗的临床前转化研究研究侧重于确定哪种肿瘤类型和基因型最有可能从治疗中获益。治疗选定的患者群体可以帮助最大化治疗的潜力。肿瘤模型的临床前细胞反应分析已成为新型癌症治疗开发的基础。
精氨酸甲基化是对参与多种细胞过程的蛋白质的重要翻译后修饰，例如基因调控、RNA加工、DNA损伤应答和信号转导。含有甲基化精氨酸的蛋白质存在于细胞核和胞质组分中，这表明催化甲基转移到精氨酸上的酶也存在于这些亚细胞腔隙中(综述于Yang,Y.&Bedford,M.T.Protein arginine methyltransferases and cancer.Nat Rev Cancer13,37-50,doi:10.1038/nrc3409(2013)；Lee,Y.H.&Stallcup,M.R.Minireview:proteinarginine methylation of nonhistone proteins in transcriptional regulation.MolEndocrinol23,425-433,doi:10.1210/me.2008-0380(2009))。在哺乳动物细胞中，甲基化精氨酸以三种主要形式存在：ω-NG-单甲基-精氨酸(MMA)、ω-NG,NG-不对称二甲基精氨酸(ADMA)或ω-NG,N’G-对称的二甲基精氨酸(SDMA)。每种甲基化状态都可以以不同方式影响蛋白质-蛋白质相互作用，因此有可能为底物的生物活性赋予不同的功能性后果(Yang,Y.&Bedford,M.T.Protein arginine methyltransferases and cancer.Nat Rev Cancer13,37-50,doi:10.1038/nrc3409(2013))。
精氨酸甲基化主要在富含甘氨酸、精氨酸(GAR)基序的情况下通过蛋白质精氨酸甲基转移酶(PRMT)家族的活性发生，所述蛋白质精氨酸甲基转移酶将甲基从S-腺苷-L-甲硫氨酸(SAM)转移至底物精氨酸侧链，产生S-腺苷-高半胱氨酸(SAH)和甲基化精氨酸。该蛋白质家族由10个成员组成，其中9个已被证明具有酶活性(Bedford,M.T.&Clarke,S.G.Protein arginine methylation in mammals:who,what,and why.Mol Cell33,1-13,doi:10.1016/j.molcel.2008.12.013(2009))。根据酶促反应的产物，PRMT家族分为四种亚型(I-IV型)。IV型酶甲基化内部胍基氮并且仅在酵母中描述(Fisk,J.C.&Read,L.K.Protein arginine methylation in parasitic protozoa.Eukaryot Cell10,1013-1022,doi:10.1128/EC.05103-11(2011))；类型I-III酶通过单一甲基化事件产生单甲基-精氨酸(MMA，Rme1)。MMA中间体被认为是相对低丰度的中间体，然而，PRMT7的主要III型活性的选择底物可以保持单甲基化，而I型和II型酶分别催化从MMA向不对称二甲基精氨酸(ADMA，Rme2a)或对称的二甲基精氨酸(SDMA，Rme2s)的进展。II型PRMT包括PRMT5和PRMT9，然而，PRMT5是负责形成对称二甲基化的主要酶。I型酶包括PRMT1、PRMT3、PRMT4、PRMT6和PRMT8。PRMT1、PRMT3、PRMT4和PRMT6普遍表达，而PRMT8主要限于脑(综述于Bedford,M.T.&Clarke,S.G.Protein arginine methylation in mammals:who,what,and why.MolCell33,1-13,doi:10.1016/j.molcel.2008.12.013(2009))。
PRMT1的错误调节和过表达与许多实体和造血系统癌症有关(Yang,Y.&Bedford,M.T.Protein arginine methyltransferases and cancer.Nat Rev Cancer13,37-50,doi:10.1038/nrc3409(2013)；Yoshimatsu,M.等人Dysregulation of PRMT1 and PRMT6,Type I arginine methyltransferases,is involved in various types of humancancers.Int J Cancer128,562-573,doi:10.1002/ijc.25366(2011))。PRMT1与癌症生物学之间的联系主要是通过调节相关底物上发现的精氨酸残基的甲基化。在几种肿瘤类型中，PRMT1可以通过组蛋白H4的甲基化驱动异常致癌程序的表达(Takai,H.等人5-Hydroxymethylcytosine plays a critical role in glioblastomagenesis byrecruiting the CHTOP-methylosome complex.Cell Rep9,48-60,doi:10.1016/j.celrep.2014.08.071(2014)；Shia,W.J.等人PRMT1 interacts with AML1-ETO topromote its transcriptional activation and progenitor cell proliferativepotential.Blood119,4953-4962,doi:10.1182/blood-2011-04-347476(2012)；Zhao,X.等人Methylation of RUNX1 by PRMT1 abrogates SIN3A binding and potentiates itstranscriptional activity.Genes Dev22,640-653,doi:10.1101/gad.1632608(2008),以及通过其对非组蛋白底物的活性驱动异常致癌程序的表达(Wei,H.,Mundade,R.,Lange,K.C.&Lu,T.Protein arginine methylation of non-histone proteins and its rolein diseases.Cell Cycle13,32-41,doi:10.4161/cc.27353(2014))。在许多这些实验系统中，其底物的PRMT1依赖性ADMA修饰的破坏降低了癌细胞的增殖能力(Yang,Y.&Bedford,M.T.Protein arginine methyltransferases and cancer.Nat Rev Cancer13,37-50,doi:10.1038/nrc3409(2013))。
在PCT申请PCT/US2014/029710中报道了可用于治疗癌症的1型PRMT抑制剂，其通过引用并入本文。期望鉴定更可能响应这些化合物的基因型。
发明内容
在一个实施方案中，本发明提供在需要的人中治疗癌症的方法，包括：测定
a.5-甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)多核苷酸或多肽的水平，或
b.人样品中MTAP突变的存在或不存在，和
如果MTAP多核苷酸或多肽的水平相对于对照降低或如果在MTAP多核苷酸或多肽中存在突变，向人施用有效量的I型蛋白质精氨酸甲基转移酶(I型PRMT)抑制剂，从而治疗所述人的癌症。
在一个实施方案中，本发明提供在需要的人中抑制癌细胞增殖的方法，该方法包括向人施用有效量的I型蛋白质精氨酸甲基转移酶(I型PRMT)抑制剂，从而抑制人的癌细胞增殖，其中所述癌细胞具有5-甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)的突变和/或相对于对照具有降低水平的MTAP多核苷酸或多肽。
在一个实施方案中，本发明提供预测患有癌症的人是否将对用I型蛋白质精氨酸甲基转移酶(I型PRMT)抑制剂的治疗敏感的方法，该方法包括测定
a.5-甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)多核苷酸或多肽的水平，或
b.人样品中MTAP突变的存在或不存在，
其中相对于对照降低水平的MTAP多核苷酸或多肽或MTAP中突变的存在指示所述人将对1型PRMT抑制剂的治疗敏感。
在一个实施方案中，本发明提供用于治疗癌症的试剂盒，该试剂盒包含特异性结合5-甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)多核苷酸或多肽的试剂。
在一个实施方案中，提供药物组合物，其包含I型PRMT抑制剂或其药学上可接受的盐，其用于治疗人的癌症，其中至少来自人的第一样品被确定具有MTAP突变、相对于对照的MTAP多核苷酸或多肽水平降低或两者。
在一个实施方案中，本发明提供I型PRMT抑制剂在制备用于治疗人的癌症的药物中的用途，其中来自人的一种或多种样品被确定具有MTAP突变、相对于对照的MTAP多核苷酸或多肽水平降低或两者。
附图简述
图1：精氨酸残基的甲基化类型。来自Yang,Y.&Bedford,M.T.Protein argininemethyltransferases and cancer.Nat Rev Cancer 13,37-50,doi:10.1038/nrc3409(2013)。
图2：癌症相关PRMT1底物的功能类别。已知的PRMT1底物及其与癌症相关生物学的关联(Yang,Y.&Bedford,M.T.Protein arginine methyltransferases and cancer.NatRev Cancer 13,37-50,doi:10.1038/nrc3409(2013)；Shia,W.J.等人PRMT1 interactswith AML1-ETO to promote its transcriptional activation and progenitor cellproliferative potential.Blood 119,4953-4962,doi:10.1182/blood-2011-04-347476(2012)；Wei,H.,Mundade,R.,Lange,K.C.&Lu,T.Protein arginine methylation of non-histone proteins and its role in diseases.Cell Cycle 13,32-41,doi:10.4161/cc.27353(2014)；Boisvert,F.M.,Rhie,A.,Richard,S.&Doherty,A.J.The GAR motif of53BP1 is arginine methylated by PRMT1 and is necessary for 53BP1 DNA bindingactivity.Cell Cycle 4,1834-1841,doi:10.4161/cc.4.12.2250(2005)；Boisvert,F.M.,Dery,U.,Masson,J.Y.&Richard,S.Arginine methylation of MRE11 by PRMT1 isrequired for DNA damage checkpoint control.Genes Dev 19,671-676,doi:10.1101/gad.1279805(2005)；Zhang,L.等人Cross-talk between PRMT1-mediated methylationand ubiquitylation on RBM15 controls RNA splicing.Elife 4,doi:10.7554/eLife.07938(2015)；Snijders,A.P.等人Arginine methylation and citrullination ofsplicing factor proline-and glutamine-rich(SFPQ/PSF)regulates its associationwith mRNA.RNA 21,347-359,doi:10.1261/rna.045138.114(2015)；Liao,H.W.等人PRMT1-mediated methylation of the EGF receptor regulates signaling and cetuximabresponse.J Clin Invest 125,4529-4543,doi:10.1172/JCI82826(2015)；Ng,R.K.等人Epigenetic dysregulation of leukaemic HOX code in MLL-rearranged leukaemiamouse model.J Pathol 232,65-74,doi:10.1002/path.4279(2014)；Bressan,G.C.等人Arginine methylation analysis of the splicing-associated SR protein SFRS9/SRP30C.Cell Mol Biol Lett 14,657-669,doi:10.2478/s11658-009-0024-2(2009))。
图3：用化合物D处理的细胞系的Methylscan评估。具有甲基化变化的蛋白质的百分比(与变化的方向性无关)按照所示的官能团分类。
图4：化合物A对PRMT1的抑制模式。在18分钟PRMT1反应后测定IC50值，并将数据拟合至3参数剂量反应等式。(A)代表性实验，显示作为[SAM]/Km app的函数绘制的化合物A IC50值与非竞争性抑制的等式拟合，IC50＝Ki/(1+(Km/[S]))。(B)代表性实验，显示作为[肽]/Km app的函数绘制的IC50值。插图显示与混合抑制的等式拟合的数据，以评估相对肽H4 1-21底物，化合物A对PRMT1的抑制(v＝Vmax*[S]/(Km*(1+[I]/Ki)+[S]*(1+[I]/K’)))。α值(α＝Ki’/Ki)＞0.1但＜10指示混合抑制剂。
图5：化合物A对PRMT1的效力。使用在平衡条件下(底物浓度等于Km app)运行的放射性测定法监测PRMT1活性，该放射性测定法测量3H从SAM到H4 1-21肽的转移。通过将数据拟合至3参数剂量-反应等式来确定IC50值。(A)作为PRMT1:SAM:化合物A-三-HCl预孵育时间的函数绘制的IC50值。空心圆和实心圆表示两个独立的实验(0.5nM PRMT1)。插图显示60分钟PRMT1:SAM:化合物A-三-HCl预孵育后化合物A-三-HCl抑制PRMT1活性的代表性IC50曲线。(B)通过盐形式分类的PRMT1的化合物A抑制。在60分钟PRMT1:SAM:化合物A预孵育和20分钟反应后测定IC50值。
图6：与化合物A(橙色)和SAH(紫色)复合的PRMT1在处分辨的晶体结构。插图显示该化合物结合在肽结合口袋中并与PRMT1侧链发生关键相互作用。
图7：化合物A对PRMT1直系同源物的抑制。使用在平衡条件下(底物浓度等于Km app)的放射性测定法监测PRMT1活性，该放射性测定法测量3H从SAM到H4 1-21肽的转移。通过将数据拟合至3参数剂量-反应等式来确定IC50值。(A)对于大鼠(○)和狗(●)直系同源物，作为PRMT1:SAM:化合物A预孵育时间的函数绘制的IC50值。(B)作为大鼠(○)、狗(●)或人(□)PRMT1浓度的函数绘制的IC50值。(C)在60分钟PRMT1:SAM:化合物A预温育和20分钟反应后测定IC50值。数据是测试化合物A的多种盐形式的平均值。基于对于非竞争性抑制剂的等式Ki＝IC50/(1+(Km/[S]))以及IC50测定代表ESI*构象的假设，计算Ki *app值。
图8：化合物A对PRMT家族成员的效力。在60分钟PRMT:SAM:化合物A预孵育后，使用在平衡条件下(Km app的底物浓度)运行的放射性测试监测PRMT活性。通过将数据拟合至3-参数剂量-响应等式来确定化合物A的IC50值。(A)数据是测试化合物A的多种盐形式的平均值。Ki *app值基于对于非竞争性抑制剂的等式Ki＝IC50/(1+(Km/[S]))以及IC50测定代表ESI*构象的假设计算。(B)作为PRMT3(●)、PRMT4(○)、PRMT6(■)或PRMT8(□):SAM:化合物A预孵育时间的函数绘制IC50值。
图9：细胞中MMA-western。用化合物A-三-HCl(“化合物A-A”)、化合物A-单-HCl(“化合物A-B”)、化合物A-游离碱(“化合物A-C”)和化合物A-二-HCl(“化合物A-D”)处理RKO细胞72小时。固定细胞，用抗Rme1GG染色以检测MMA和抗微管蛋白以使信号归一化，并使用Odyssey成像系统成像。相对于微管蛋白的MMA相对于化合物浓度作图，以使用双相曲线拟合等式在GraphPad中产生曲线拟合(A)。EC50(第一个拐点)、标准偏差和N的总结显示在(B)中。
图10：PRMT1在肿瘤中的表达。mRNA表达水平获自Cancer Genomics的cBioPortal。显示ACTB水平和TYR分别指示对应于普遍表达的基因的水平表达相对于具有受限表达的基因的表达。
图11：化合物A在细胞培养物中的抗增殖活性。在6天的生长测试中评估196种人癌细胞系对化合物A的敏感性。每个细胞系的gIC50值显示为具有预测的人类暴露的条线图，如(A)中所示。在(B)中，Ymin-T0(细胞毒性的量度)绘制为的条线图，其中每个细胞系的gIC100值显示为红点。从大鼠14天MTD(150mg/kg，Cave＝2.1μM)计算的Cave用红色虚线表示。
图12：化合物A的时间过程对培养细胞中的精氨酸甲基化标记的影响。(A)用化合物A处理的Toledo DLBCL细胞中ADMA、SDMA和MMA的变化。显示甲基化的变化相对于微管蛋白±SEM(n＝3)归一化。(B)精氨酸甲基化标记的代表性蛋白质印迹。定量的区域由凝胶右侧的黑条表示。
图13：化合物A对精氨酸甲基化的剂量反应。(A)来自U2932细胞系中化合物A剂量反应的MMA和ADMA的代表性蛋白质印迹图像。对于(B)定量的区域由凝胶左侧的黑条表示。(B)暴露72小时后5种淋巴瘤细胞系中50％最大诱导MMA或50％最大减少ADMA所需的最小有效化合物A浓度+标准偏差(n＝2)。6天生长死亡测定中的相应gIC50值如红色所示。
图14：响应于淋巴瘤细胞中的化合物A的精氨酸甲基化标记的耐久性。(A)用化合物A培养的Toledo DLBCL细胞系中ADMA、SDMA和MMA的变化的稳定性。显示甲基化的变化相对于微管蛋白±SEM(n＝3)归一化。(B)精氨酸甲基化标记的代表性蛋白质印迹。对(A)定量的区域在凝胶侧用黑条表示。
图15：淋巴瘤细胞系的增殖时间过程。在Toledo(A)和Daudi(B)细胞系(每个细胞系n＝2)的10天时间过程中评估细胞生长。显示了单个生物学重复的代表性数据。
图16：化合物A在第6天和第10天在淋巴瘤细胞系中的抗增殖作用。(A)淋巴瘤细胞系中第6天(浅蓝色)和第10天(深蓝色)增殖测定的平均gIC50值。(B)在第6天(浅蓝色)和第10天(深蓝色)的Ymin-T0与相应的gIC100(红点)。
图17：按亚型分类的化合物A在淋巴瘤细胞系中的抗增殖作用。(A)每个细胞系的gIC50值显示为条线图。在(B)中，Ymin-T0(细胞毒性的量度)绘制为条形图，其中每个细胞系的gIC100值显示为红点。从ATCC或DSMZ细胞系储存库收集亚型信息。
图18：人淋巴瘤细胞系中细胞周期的碘化丙啶FACS分析。将3种淋巴瘤细胞系Toledo(A)、U2932(B)和OCI-Ly1(C)用0、1、10、100、1000和10,000nM化合物A处理10天，在处理后第3、5、7、10天取样。数据代表生物重复的平均值±SEM，n＝2。
图19：用化合物A处理的淋巴瘤细胞系中的胱天蛋白酶-3/7活化。在Toledo(A)和Daudi(B)细胞系中，在10天的时间过程中评估细胞凋亡。胱天蛋白酶3/7活化显示为相对于DMSO处理的细胞的倍数诱导。对每种细胞系进行两次独立的重复。显示了每种的代表性数据。
图20：化合物A在携带Toledo异种移植物的小鼠中的功效。在28(A)或24(B)天的期间内，用化合物A口服QD(37.5、75、150、300、450、或600mg/kg)或用75mg/kg(B)BID治疗小鼠，且每周两次测量肿瘤体积。
图21：化合物A在6天和10天时在AML细胞系中的作用。(A)AML细胞系中6天(浅蓝色)和10天(深蓝色)增殖测定的平均gIC50值。(B)在第6天(浅蓝色)和第10天(深蓝色)的Ymin-T0与相应的gIC100(红点)。
图22：使用化合物A的ccRCC细胞系体外增殖时间过程。(A)2种ccRCC细胞系相对于对照(DMSO)的生长。显示了来自单个重复的代表性曲线。(B)在时间过程中对ccRCC细胞系的gIC50和％生长抑制的总结(平均值±SD；每种细胞系n＝2)。
图23：化合物A在ACHN异种移植物中的功效。每天用化合物A口服治疗小鼠28天，每周两次测量肿瘤体积。
图24：化合物A在乳腺癌细胞系中的抗增殖作用。在6天增殖测定中用化合物A处理的乳腺癌细胞系的gIC50和生长抑制(％)(红色圆圈)的条线图。代表三阴性乳腺癌(TNBC)的细胞系以橙色显示；其他亚型是蓝色的。
图25：化合物A在第7天和第12天在乳腺癌细胞系中的作用。在具有相应gIC50(红点)的乳腺癌细胞系中，7天(浅蓝色)和10天(深蓝色)增殖测试的平均生长抑制(％)值。在用乳腺癌而非淋巴瘤或AML细胞系的长期增殖测定中观察到的效力和抑制百分比的增加表明某些肿瘤类型需要更长时间暴露于化合物A以充分显示抗增殖活性。
图26：培养中MTAP状态和癌症细胞系对化合物A的敏感性。具有MTAP部位缺失或MTAP RNA下调的细胞系被分类为“低”(空心圆)。从CCLE下载拷贝数和表达数据。
图27：在乳腺癌细胞系中外源MTA对化合物A的效力的影响。使用化合物A和固定浓度的MTA进行6天增殖测定的EC50、gIC100、Ymin-T0。MTAP状态如上所示。ND-不足的生长窗口和这种MTA浓度来确定参数。
图28：化合物A与外源性MTA结合的效力增加。浅灰色突出显示效力增加＞5倍，深灰色表示＞10倍。ND-不足的生长窗口和这种MTA浓度来确定参数。
发明详述
如本文所用，“I型蛋白质精氨酸甲基转移酶抑制剂”或“I型PRMT抑制剂”是指抑制以下任意一种或多种的试剂：蛋白质精氨酸甲基转移酶1(PRMT1)、蛋白质精氨酸甲基转移酶3(PRMT3)、蛋白质精氨酸甲基转移酶4(PRMT4)、蛋白质精氨酸甲基转移酶6(PRMT6)抑制剂和蛋白质精氨酸甲基转移酶8(PRMT8)。在一些实施方案中，所述I型PRMT抑制剂为小分子化合物。在一些实施方案中，所述I型PRMT抑制剂选择性抑制以下任意一种或多种：蛋白质精氨酸甲基转移酶1(PRMT1)、蛋白质精氨酸甲基转移酶3(PRMT3)、蛋白质精氨酸甲基转移酶4(PRMT4)、蛋白质精氨酸甲基转移酶6(PRMT6)抑制剂和蛋白质精氨酸甲基转移酶8(PRMT8)。在一些实施方案中，所述I型PRMT抑制剂为PRMT1、PRMT3、PRMT4、PRMT6和PRMT8的选择性抑制剂。
鉴于它们在调节多种生物过程中的作用，精氨酸甲基转移酶是调节的有吸引力的靶标。现已发现，本文所述的化合物及其药学上可接受的盐和组合物作为精氨酸甲基转移酶的抑制剂是有效的。
以下更具体地描述具体官能团和化学术语的定义。化学元素是根据Handbook ofChemistry and Physics,75版内页的CAS版本元素周期表所定义，且总体来说具体官能团也根据其中所述而定义。此外，在Thomas Sorrell，Organic Chemistry，UniversityScience Books，Sausalito，1999；Smith和March，March’s Advanced Organic Chemistry，第5版，John Wiley&Sons，Inc.，New York，2001；Larock，Comprehensive OrganicTransformations，VCH Publishers，Inc.，New York，1989；和Carruthers，Some ModernMethods of Organic Synthesis，3rd Edition，Cambridge University Press，Cambridge，1987中描述了有机化学的一般原则以及具体官能团和反应性。
本文所述的化合物可包含一个或多个非对称中心，并因此可以不同异构体形式存在，如对映异构体和/或非对映异构体。例如，本文所述的化合物可为单一对映异构物、非对映异构体或几何异构体的形式，或可为立体异构体混合物的形式，包括外消旋混合物和富含一种或多种立体异构体的混合物。可通过本领域技术人员已知的方法将异构体从混合物中分离，包括手性高效液相色谱(HPLC)以及手性盐的形成和结晶；或者可通过不对称合成制备优选的异构体。例如参见：Jacques等人，Enantiomers，Racemates和Resolutions(Wiley Interscience，New York，1981)；Wilen等人，Tetrahedron 33:2725(1977)；Eliel，Stereochemistry of Carbon Compounds(McGraw–Hill，NY，1962)；以及Wilen，Tables ofResolving Agents and Optical Resolutions p.268(E.L.Eliel，Ed.，Univ.of NotreDame Press，Notre Dame，IN 1972)。本发明还包括本文所述的作为单个异构体的化合物，其基本不含其它异构体，或者包括作为不同异构体混合物的化合物。
应理解，本发明的化合物可描绘为不同的互变异构体。还应当理解，当化合物具有互变异构形式时，所有互变异构形式都包括在本发明的范围内，并且本文所述任何化合物的命名不排除任何互变异构形式。
除非另有说明，否则本文描述的结构也意味着包括仅在一个或多个同位素富集原子的存在方面不同的化合物。例如，具有本发明结构的化合物，除了用氘或氚替代氢，用18F替代19F，或用富含13C-或14C-的碳替代碳，都在本发明的范围内。这些化合物可用作例如生物测定中的分析工具或探针。
列出一系列值时，它旨在包含该范围内的每个值和子范围。例如"C1-6烷基"预期包括，C1；C2、C3、C4、C5、C6、C1-6、C1-5、C1-4、C1-3、C1-2、C2-6、C2-5、C2-4、C2-3、C3-6、C3-5、C3-4、C4-6、C4-5和C5-6烷基。
"自由基(Radical)"是指特定基团上的连接点。自由基包括特定基团上的二价自由基。
“烷基”是指具有1至20个碳原子的直链或支链饱和烃基基团(“C1–20烷基”)。在一些实施方案中，烷基具有1至10个碳原子("C1-10烷基")。在一些实施方案中，烷基具有1至9个碳原子("C1-9烷基")。在一些实施方案中，烷基具有1至8个碳原子("C1-8烷基")。在一些实施方案中，烷基具有1至7个碳原子("C1-7烷基")。在一些实施方案中，烷基具有1至6个碳原子("C1-6烷基")。在一些实施方案中，烷基具有1至5个碳原子("C1-5烷基")。在一些实施方案中，烷基具有1至4个碳原子("C1-4烷基")。在一些实施方案中，烷基具有1至3个碳原子("C1-3烷基")。在一些实施方案中，烷基具有1至2个碳原子("C1-2烷基")。在一些实施方案中，烷基具有1个碳原子("C1烷基")。在一些实施方案中，烷基具有2至6个碳原子("C2-6烷基")。C1-6烷基基团的实例包括甲基(C1)、乙基(C2)、正丙基(C3)、异丙基(C3)、正丁基(C4)、叔丁基(C4)、仲丁基(C4)、异丁基(C4)、正戊基(C5)、3-戊基(C5)、戊基(C5)、新戊基(C5)、3-甲基-2-丁基(C5)、叔戊基(C5)、和正己基(C6)。烷基的其它实例包括正庚基(C7)、正辛基(C8)等。在某些实施方案中，烷基的每种情况独立地为任选取代的，例如，未取代的(“未取代的烷基")或取代有一个或多个取代基(“取代的烷基")。在某些实施方案中，烷基为未取代的C1-10烷基(例如，-CH3)。在某些实施方案中，烷基为取代的C1-10烷基。
在一些实施方案中，烷基取代有一个或多个卤素。"全卤代烷基"为其中所有氢原子独立地被卤素，例如，氟、溴、氯或碘代替的本文定义的取代的烷基。在一些实施方案中，烷基部分具有1至8个碳原子("C1-8全卤代烷基")。在一些实施方案中，烷基部分具有1至6个碳原子("C1-6全卤代烷基")。在一些实施方案中，烷基部分具有1至4个碳原子("C1-4全卤代烷基")。在一些实施方案中，烷基部分具有1至3个碳原子("C1-3全卤代烷基")。在一些实施方案中，烷基部分具有1至2个碳原子("C1-2全卤代烷基")。在一些实施方案中，所有氢原子被氟代替。在一些实施方案中，所有氢原子被氯代替。全卤代烷基基团的实例包括-CF3、-CF2CF3、-CF2CF2CF3、-CCl3、-CFCl2、-CF2Cl等。
"烯基"是指具有2至20个碳原子和一个或多个碳-碳双键(例如，1、2、3或4个双键)，和任选一个或多个叁键(例如，1、2、3或4个叁键)的直链或支链的烃基基团("C2-20烯基")。在某些实施方案中，烯基不包含叁键。在一些实施方案中，烯基具有2至10个碳原子("C2-10烯基")。在一些实施方案中，烯基具有2至9个碳原子("C2-9烯基")。在一些实施方案中，烯基具有2至8个碳原子("C2-8烯基")。在一些实施方案中，烯基具有2至7个碳原子("C2-7烯基")在一些实施方案中，烯基具有2至6个碳原子("C2-6烯基")。在一些实施方案中，烯基具有2至5个碳原子("C2-5烯基")。在一些实施方案中，烯基具有2至4个碳原子("C2-4烯基")。在一些实施方案中，烯基具有2至3个碳原子("C2-3烯基")。在一些实施方案中，烯基具有2个碳原子("C2烯基")。一个或多个碳-碳双键可为内部的(如在2-丁烯基中)或末端的(如在1-丁烯基中)。C2-4烯基基团的实例包括乙烯基(C2)、1-丙烯基(C3)、2-丙烯基(C3)、1-丁烯基(C4)、2-丁烯基(C4)、丁间二烯基(C4)等。C2-6烯基基团的实例包括上述C2-4烯基以及戊烯基(C5)、戊二烯基(C5)、己烯基(C6)，等。烯基的其它实例包括庚烯基(C7)、辛烯基(C8)、辛三烯基(C8)，等。在某些实施方案中，烯基的每种情况独立地为任选取代的，例如，未取代的(“未取代的烯基")或取代有一个或多个取代基(“取代的烯基")。在某些实施方案中，烯基为未取代的C2-10烯基。在某些实施方案中，烯基为取代的C2-10烯基。
"炔基"是指具有2至20个碳原子和一个或多个碳-碳叁键(例如，1、2、3或4个叁键)，和任选一个或多个双键(例如，1、2、3或4个双键)的直链或支链的烃基基团("C2-20炔基")。在某些实施方案中，炔基不包含双键。在一些实施方案中，炔基具有2至10个碳原子("C2-10炔基")。在一些实施方案中，炔基具有2至9个碳原子("C2-9炔基")。在一些实施方案中，炔基具有2至8个碳原子("C2-8炔基")。在一些实施方案中，炔基具有2至7个碳原子("C2-7炔基")。在一些实施方案中，炔基具有2至6个碳原子("C2-6炔基")。在一些实施方案中，炔基具有2至5个碳原子("C2-5炔基")。在一些实施方案中，炔基具有2至4个碳原子("C2-4炔基")。在一些实施方案中，炔基具有2至3个碳原子("C2-3炔基")。在一些实施方案中，炔基具有2个碳原子("C2炔基")。一个或多个碳碳叁键可为内部的(如在2-丁炔基中)或末端的(如在1-丁炔基中)。C2-4炔基基团的实例包括，但不限于，乙炔基(C2)、1-丙炔基(C3)、2-丙炔基(C3)、1-丁炔基(C4)、2-丁炔基(C4)，等。C2-6烯基基团的实例包括上述C2-4炔基以及戊炔基(C5)、己炔基(C6)，等。炔基的其他实例包括庚炔基(C7)、辛炔基(C8)，等。在某些实施方案中，炔基的每种情况独立地为任选取代的，例如，未取代的(“未取代的炔基")或取代有一个或多个取代基(“取代的炔基")。在某些实施方案中，炔基为未取代的C2-10炔基。在某些实施方案中，炔基为取代的C2-10炔基。
“稠合”或“邻位稠合”在本文中可互换使用，并且是指具有两个原子和一个共同键的两个环，例如，
萘
“桥接”是指以下环系统，其包含(1)桥头原子或原子团，所述桥头原子或原子团连接同一环的两个或更多个非相邻位置；或(2)连接环系统的不同环的两个或多个位置的桥头原子或原子团，并且因此不形成邻位稠合的环，例如，
“螺”或“螺稠合”是指连接到碳环或杂环系统的相同原子的一组原子(孪位附着)，从而形成环，例如，
还考虑了桥头原子处的螺环融合。
"碳环基"或"碳环的"是指在非芳环体系中具有3至14个环碳原子("C3-14碳环基")和0个杂原子的非芳族环状烃基基团。在某些实施方案中，碳环基是指在非芳环体系中具有3至10个环碳原子(C3-10碳环基")和0个杂原子的非芳族环状烃基基团。在一些实施方案中，碳环基具有3至8个环碳原子("C3-8碳环基”)。在一些实施方案中，碳环基具有3至6个环碳原子("C3-6碳环基”)。在一些实施方案中，碳环基具有3至6个环碳原子("C3-6碳环基”)。在一些实施方案中，碳环基具有5至10个环碳原子("C5-10碳环基")。示例性C3-6碳环基包括，但不限于，环丙基(C3)、环丙烯基(C3)、环丁基(C4)、环丁烯基(C4)、环戊基(C5)、环戊烯基(C5)、环己基(C6)、环己烯基(C6)、环己二烯基(C6)，等。示例性C3-8碳环基包括，但不限于，上述C3-6碳环基以及环庚基(C7)、环庚烯基(C7)、环庚二烯基(C7)、环庚三烯基(C7)、环辛基(C8)、环辛烯基(C8)、双环[2.2.1]庚基(C7)、双环[2.2.2]辛基(C8)，等。示例性C3-10碳环基包括，但不限于，上述C3_8碳环基以及环壬基(C9)、环壬烯基(C9)、环癸基(C10)、环癸烯基(C10)、八氢-lH-茚基(C9)、十氢萘基(C10)、螺[4.5]癸基(C10)，等。如此前实例所述，在一些实施方案中，碳环基基团为单环(“单环碳环基”)或为稠合、桥接或螺环稠合的系统(如二环系统(“二环碳环基”))，并且可为饱和的或可为部分不饱和的。“碳环基”也包括环系统，其中如上所述的碳环基环与一个或多个芳基或杂芳基基团稠合，其中连接点位于碳环基环上，且在该情况下，碳的数目继续被指定为碳环环系统中的碳数目。在某些实施方案中，碳环基的每种情况独立地为任选取代的，例如，未取代的(“未取代的碳环基")或取代有一个或多个取代基(“取代的碳环基")。在某些实施方案中，所述碳环基为未取代的C3-10碳环基。在某些实施方案中，所述碳环基为取代的C3-10碳环基。
在一些实施方案中，"碳环基"为具有3至14个环碳原子的单环、饱和碳环基("C3-14环烷基")。在一些实施方案中，"碳环基"为具有3至10个环碳原子的单环、饱和碳环基("C3-10环烷基")。在一些实施方案中，环烷基具有3至8个环碳原子("C3-8环烷基")。在一些实施方案中，环烷基具有3至6个环碳原子("C3-6环烷基")。在一些实施方案中，环烷基具有5至6个环碳原子("C5-6环烷基")。在一些实施方案中，环烷基具有5至10个环碳原子("C5-10环烷基")。C5-6环烷基基团的实例包括环戊基(C5)和环己基(C5)。C3-6环烷基基团的实例包括上述C5-6环烷基以及环丙基(C3)和环丁基(C4)。C3-8环烷基基团的实例包括上述C3-6环烷基以及环庚基(C7)和环辛基(C8)。在某些实施方案中，环烷基的每种情况独立地为未取代的(“未取代的环烷基")或取代有一个或多个取代基(“取代的环烷基")。在某些实施方案中，环烷基为未取代的C3-10环烷基。在某些实施方案中，环烷基为取代的C3-10环烷基。
"杂环基"或"杂环的"是指具有环碳原子和1至4个环杂原子的3-至14-元非芳环体系的基团，其中各杂原子独立地选自氮、氧和硫("3-14元杂环基")。在某些实施方案中，杂环基或杂环的是指具有环碳原子和1-4个环杂原子的3-10元非芳环体系的基团，其中各杂原子独立地选自氮、氧和硫("3-10元杂环基")。在包含一个或多个氮原子的杂环基中，连接点可为碳或氮原子，只要化合价允许。杂环基可为单环("单环杂环基")或稠合、桥接或螺环稠合的的环体系，如双环体系("双环杂环基")，且可为饱和或可为部分不饱和的。杂环基二环环系统可在一个或两个环中包含一个或多个杂原子。“杂环基”还包括环系统，其中如上所定义的杂环基环，与一个或多个碳环基基团稠合，其中连接点位于碳环基上或杂环基环上，或者包括环系统，其中如上所定义的杂环基环与一个或多个芳基或杂芳基基团稠合，其中连接点位于杂环基环上，且在该情况下，环成员的数目继续被指定为杂环基环系统中的环成员数目。在某些实施方案中，杂环基的每种情况独立地为任选取代的，例如，未取代的(“未取代的杂环基")或取代有一个或多个取代基(“取代的杂环基")。在某些实施方案中，杂环基为未取代的3-10元杂环基。在某些实施方案中，杂环基为取代的3-10元杂环基。
在一些实施方案中，杂环基为具有环碳原子和1-4个环杂原子的5-10元非芳环体系，其中各杂原子独立地选自氮、氧和硫("5-10元杂环基")。在一些实施方案中，杂环基为具有环碳原子和1-4个环杂原子的5-8元非芳环体系，其中各杂原子独立地选自氮、氧和硫("5-8元杂环基")。在一些实施方案中，杂环基为具有环碳原子和1-4个环杂原子的5-6元非芳环体系，其中各杂原子独立地选自氮、氧和硫("5-6元杂环基")。在一些实施方案中，所述5-6元杂环基具有1-3个独立选自氮、氧和硫的环杂原子。在一些实施方案中，所述5-6元杂环基具有1-2个独立选自氮、氧和硫的环杂原子。在一些实施方案中，所述5-6元杂环基具有一个选自氮、氧和硫的环杂原子。
示例性的包含一个杂原子的3元杂环基基团包括但不限于氮杂环丙烷基、氧杂环丙烷基、硫杂环丙烷基。示例性的包含一个杂原子的4元杂环基基团包括但不限于氮杂环丁烷基、氧杂环丁烷基和硫杂环丁烷基。包含一个杂原子的示例性的5元杂环基基团包括但不限于四氢呋喃基、二氢呋喃基、四氢噻吩基、二氢噻吩基、吡咯烷基、二氢吡咯基和吡咯基-2,5–二酮。示例性的包含两个杂原子的5元杂环基基团包括但不限于二氧杂环戊烷基、氧杂硫杂环戊烷基(oxasulfuranyl)、二硫杂环戊烷基(disulfuranyl)和噁唑烷-2-酮。示例性的包含三个杂原子的5元杂环基基团包括但不限于三唑啉基、噁二唑啉基和噻二唑啉基。示例性的包含一个杂原子的6元杂环基基团包括但不限于哌啶基、四氢吡喃基、二氢吡啶基和硫杂环己基。示例性的包含两个杂原子的6元杂环基基团包括但不限于哌嗪基、吗啉基、二硫杂环己基、二氧杂环己烷基。示例性的包含三个杂原子的6元杂环基基团包括但不限于三氮杂环己烷基(triazinanyl)。示例性的包含一个杂原子的7元杂环基基团包括但不限于氮杂环庚烷基、氧杂环庚烷基和硫杂环庚烷基。示例性的包含一个杂原子的8元杂环基基团包括但不限于氮杂环辛烷基、氧杂环辛烷基和硫杂环辛烷基。示例性的与C6芳基环稠合的5元杂环基基团(本文也称为5,6-二环杂环)包括但不限于二氢吲哚基、异二氢吲哚基、二氢苯并呋喃基、二氢苯并噻吩基、苯并噁唑啉酮基(benzoxazolinonyl)等。示例性的与芳基环稠合的6元杂环基基团(本文也称为6,6-二环杂环)包括但不限于四氢喹啉基、四氢异喹啉基等。
“芳基”是指单环或多环(如二环或三环)的4n+2芳香环系统(如具有6、10或14个在环形排列中共享的π电子)并在该芳香环系统中具有6-14个环碳原子和0个杂原子的基团(“C6–14芳基”)。在一些实施方案中，芳基基团具有六个环碳原子(“C6芳基”；如苯基)。在一些实施方案中，芳基基团具有十个环碳原子(“C10芳基”；如萘基如1–萘基和2–萘基)。在一些实施方案中，芳基基团具有十四个环碳原子(“C14芳基”；如蒽基)。“芳基”还包括环系统，其中芳基环，如上所定义，与一个或多个碳环基或杂环基基团稠合，其中连接基团或连接点位于芳基环上，且在该情况下，碳原子的数目继续被指定为芳基环系统中的碳原子数目。在某些实施方案中，芳基的每种情况独立地为任选取代的，例如，未取代的(“未取代的芳基")或取代有一个或多个取代基(“取代的芳基")。在某些实施方案中，芳基为未取代的C6-14芳基。在某些实施方案中，芳基为取代的C6-14芳基。
"杂芳基"是指5-14元单环或多环(如二环或三环)的4n+2芳香环系统(如具有6或10个在环形排列中共享的π电子)并在该芳香环系统中具有环碳原子和1-4个环杂原子的基团，其中各杂原子独立地选自氮、氧和硫("5-14元杂芳基")。在某些实施方案中，杂芳基是指a radical of a具有环碳原子和在芳环体系中的1-4个环杂原子的5-10元单环或双环的4n+2芳环体系的基团，其中各杂原子独立地选自氮、氧和硫("5-10元杂芳基")。含有一个或多个氮原子的杂芳基基团中，只要原子价允许，连接点可为碳或氮原子。杂芳基二环系统可在一个或两个环内包含一个或多个杂原子。“杂芳基”包括这样的环系统，其中如上所定义的杂芳基环与一个或多个碳环基或杂环基基团稠合，其中连接点位于杂芳基环上，且在该情况下，环成员的数目继续被指定为杂芳基环系统中环成员的数目。“杂芳基”还包括这样的环系统，其中如上所定义的杂芳基环与一个或多个芳基基团稠合，其中连接点位于芳基或杂芳基环上，且在该情况下，环成员的数目继续被指定为稠合(芳基/杂芳基)环系统中环成员的数目。二环杂芳基基团中的一个环不含有杂原子(如吲哚基，喹啉基，咔唑基等)，连接点可位于两环之一上，例如位于具有杂原子的环(如2–吲哚基)上或位于不含有杂原子的环(如5–吲哚基)上。
在一些实施方案中，杂芳基为具有环碳原子和设置在芳环体系中的1-4个环杂原子的5-14元芳环体系，其中各杂原子独立地选自氮、氧和硫("5-14元杂芳基")。在一些实施方案中，杂芳基为具有环碳原子和设置在芳环体系中的1-4个环杂原子的5-10元芳环体系，其中各杂原子独立地选自氮、氧和硫("5-10元杂芳基")。在一些实施方案中，杂芳基为具有环碳原子和设置在芳环体系中的1-4个环杂原子的5-8元芳环体系，其中各杂原子独立地选自氮、氧和硫("5-8元杂芳基")。在一些实施方案中，杂芳基为具有环碳原子和设置在芳环体系中的1-4个环杂原子的5-6元芳环体系，其中各杂原子独立地选自氮、氧和硫("5-6元杂芳基")。在一些实施方案中，所述5-6元杂芳基具有1-3个独立选自氮、氧和硫的环杂原子。在一些实施方案中，所述5-6元杂芳基具有1-2个独立选自氮、氧和硫的环杂原子。在一些实施方案中，所述5-6元杂芳基具有1个选自氮、氧和硫的环杂原子。在某些实施方案中，杂芳基的每种情况独立地为任选取代的，例如，未取代的("未取代的杂芳基")或取代有一个或多个取代基("取代的杂芳基")。在某些实施方案中，杂芳基为未取代的5-14元杂芳基。在某些实施方案中，杂芳基为取代的5-14元杂芳基。
包含一个杂原子的示例性5-元杂芳基包括，但不限于，吡咯基，呋喃基和噻吩基。包含2个杂原子的示例性5-元杂芳基包括，但不限于，咪唑基、吡唑基、噁唑基、异噁唑基、噻唑基和异噻唑基。包含3个杂原子的示例性5-元杂芳基包括，但不限于，三唑基、噁二唑基和噻二唑基。包含4个杂原子的示例性5-元杂芳基包括，但不限于，四唑基。包含1个杂原子的示例性6-元杂芳基包括，但不限于，吡啶基。包含2个杂原子的示例性6-元杂芳基包括，但不限于，哒嗪基，嘧啶基和吡嗪基。包含3或4个杂原子的示例性6-元杂芳基分别包括，但不限于，三嗪基和四嗪基。包含1个杂原子的示例性7-元杂芳基包括，但不限于，氮杂环庚三烯基、氧杂环庚三烯基和硫杂环庚三烯基。示例性6,6-双环杂芳基包括，但不限于，萘啶基、蝶啶基、喹啉基、异喹啉基、噌啉基、喹喔啉基、酞嗪基和喹唑啉基。示例性5,6-双环杂芳基包括，但不限于，下式任一种：
在单环或双环杂芳基基团的任一个中，连接点可为任何碳或氮原子，只要化合价允许。
“部分不饱和”是指包含至少一个双键或叁键的基团。术语“部分不饱和”旨在涵盖具有多个不饱和位点的环，但并不包括如本文所定义的芳族基(例如，芳基或杂芳基基团)。同样，“饱和”是指不包含双重或叁键的基团，即全包含单键。
在一些实施方案中，本文所定义的烷基、烯基、炔基、碳环基、杂环基、芳基和杂芳基，为任选取代的(例如，“取代”或“未取代的”烷基，“取代”或“未取代的”烯基，“取代”或“未取代的”炔基，“取代”或“未取代的”碳环基，“取代”或“未取代的”杂环基，“取代”或“未取代的”芳基或“取代”或“未取代的”杂芳基)。通常，术语“取代的”，不管其前面是否有术语“任选地”，是指基团(如碳或氮原子)上存在的至少一个氢被可允许的取代基代替，如其取代产生稳定化合物的取代基，所述化合物例如为不自发进行转化的化合物，所述转化例如为重排、环化、消除或其它反应。除非另外说明，“取代的”基团在该基团的一个或多个可取代的位置具有取代基，且当在任何给定结构中的多于一个位置被取代时，每个位置上的取代基相同或不同。术语“取代的”被认为包括被有机化合物所有可允许的取代基取代，包括导致形成稳定的化合物的任何本文所述的取代基。本发明考虑到任何以及所有的该组合以获得稳定化合物。为了本文的目的，例如氮的杂原子可具有氢取代基和/或如本文所述的任何合适的取代基，其满足杂原子的原子价并导致形成稳定部分。
示例性碳原子取代基包括，但不限于，卤素、-CN、-NO2、-N3、-SO2H、-S03H、-OH、-ORaa、-ON(Rbb)2、-N(Rbb)2、-N(Rbb)3 +X、-N(ORcc)Rbb、-SH、-SRaa、-SSRCC、-C(＝O)Raa、-CO2H、-CHO、-C(ORcc)2、-CO2Raa、-OC(＝O)Raa、-OCO2Raa、-C(＝O)N(Rbb)2、-OC(＝O)N(Rbb)2、-NRbbC(＝O)Raa、-NRbbCO2Raa、-NRbbC(＝O)N(Rbb)2、-C(＝NRbb)Raa、-C(＝NRbb)ORaa、-OC(＝NRbb)Raa、-OC(＝NRbb)ORaa、-C(＝NRbb)N(Rbb)2、-OC(＝NRbb)N(Rbb)2、-NRbbC(＝NRbb)N(Rbb)2、-C(＝O)NRbbSO2Raa、-NRbbSO2Raa、-SO2N(Rbb)2、-SO2Raa、-SO2ORaa、-OSO2Raa、-S(＝O)Raa、-OS(＝O)Raa、-Si(Raa)3、-OSi(Raa)3-C(＝S)N(Rbb)2、-C(＝O)SRaa、-C(＝S)SRaa、-SC(＝S)SRaa、-SC(＝O)SRaa、-OC(＝O)SRaa、-SC(＝O)ORaa、-SC(＝O)Raa、-P(＝O)2Raa、-OP(＝O)2Raa、-P(＝O)(Raa)2、-OP(＝O)(Raa)2、-OP(＝O)(ORcc)2、-P(＝O)2N(Rbb)2、-OP(＝O)2N(Rbb)2、-P(＝O)(NRbb)2、-OP(＝O)(NRbb)2、-NRbbP(＝O)(ORcc)2、-NRbbP(＝O)(NRbb)2、-P(RCC)2、-P(RCC)3、-OP(Rcc)2、-OP(Rcc)3、-B(Raa)2、-B(ORcc)2、-BRaa(ORcc)、C1-10烷基、C1-10全卤代烷基、C2-10烯基、C2-10炔基、C3-10碳环基、3-14元杂环基、C6-14芳基和5-14元杂芳基，其中各个烷基、烯基、炔基、碳环基、杂环基、芳基和杂芳基独立地取代有0、1、2、3、4或5个Rdd基团；
或碳原子上的两个孪位氢被基团＝O、＝S、＝NN(Rbb)2、＝NNRbbC(＝O)Raa、＝NNRbbC(＝O)ORaa、＝NNRbbS(＝O)2Raa、＝NRbb、或＝NORcc替代；Raa的每种情况独立选自C1-10烷基、C1-10全卤代烷基、C2-10烯基、C2-10炔基、C3-10碳环基、3-14元杂环基、C6-14芳基和5-14元杂芳基，或两个Raa基团连接以形成3-14元杂环基或5-14元杂芳基环，其中各个烷基、烯基、炔基、碳环基、杂环基、芳基和杂芳基独立地取代有0、1、2、3、4或5个Rdd基团；
Rbb的每种情况独立选自氢、-OH、-ORaa、-N(RCC)2、-CN、-C(＝O)Raa、-C(＝O)N(Rcc)2、-CO2Raa、-S02Raa、-C(＝NRcc)ORaa、-C(＝NRCC)N(RCC)2、-SO2N(Rcc)2、-SO2Rcc、-SO2ORcc、-SORaa、-C(＝S)N(RCC)2、-C(＝O)SRcc、-C(＝S)SRCC、-P(＝O)2Raa、-P(＝O)(Raa)2、-P(＝O)2N(Rcc)2、-P(＝O)(NRcc)2、C1-10烷基、C1-10全卤代烷基、C2-10烯基、C2-10炔基、C3-10碳环基、3-14元杂环基、C6-14芳基和5-14元杂芳基，或两个Rbb基团连接以形成3-14元杂环基或5-14元杂芳基环，其中各个烷基、烯基、炔基、碳环基、杂环基、芳基和杂芳基独立地取代有0、1、2、3、4或5个Rdd基团；
Rcc的每种情况独立选自氢、C1-10烷基、C1-10全卤代烷基、C2-10烯基、C2-10炔基、C3-10碳环基、3-14元杂环基、C6-14芳基和5-14元杂芳基，或两个Rcc基团连接以形成3-14元杂环基或5-14元杂芳基环，其中各个烷基、烯基、炔基、碳环基、杂环基、芳基和杂芳基独立地取代有0、1、2、3、4或5个Rdd基团；
Rdd的每种情况独立选自卤素、-CN、-NO2、-N3、-SO2H、-SO3H、-OH、-ORee、-ON(Rff)2、-N(Rff)2、-N(Rff)3 +X、-N(ORee)Rff、-SH、-SRee、-SSRee、-C(＝O)Ree、-CO2H、-CO2Ree、-OC(＝O)Ree、-OCO2Ree、-C(＝O)N(Rff)2、-OC(＝O)N(Rff)2、-NRffC(＝O)Ree、-NRffCO2Ree、-NRffC(＝O)N(Rff)2、-C(＝NRff)ORee、-OC(＝NRff)Ree、-OC(＝NRff)ORee、-C(＝NRff)N(Rff)2、-OC(＝NRff)N(Rff)2、-NRffC(＝NRff)N(Rff)2,-NRffSO2Ree、-SO2N(Rff)2、-SO2Ree、-S02ORee、-OS02Ree、-S(＝O)Ree、-Si(Ree)3、-OSi(Ree)3、-C(＝S)N(Rff)2、-C(＝O)SRee、-C(＝S)SRee、-SC(＝S)SRee、-P(＝O)2Ree、-P(＝O)(Ree)2、-OP(＝O)(Ree)2、-OP(＝O)(ORee)2、C1-6烷基、C1-6全卤代烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C3-10碳环基、3-10元杂环基、C6-10芳基、5-10元杂芳基，其中各个烷基、烯基、炔基、碳环基、杂环基、芳基和杂芳基独立地取代有0、1、2、3、4或5个Rgg基团，或两个孪位Rdd取代基可连接以形成＝O或＝S；
Ree的每种情况独立选自C1-6烷基、C1-6全卤代烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C3-10碳环基、C6-10芳基、3-10元杂环基和3-10元杂芳基，其中各个烷基、烯基、炔基、碳环基、杂环基、芳基和杂芳基独立地取代有0、1、2、3、4或5个Rgg基团；
Rff的每种情况独立选自氢、C1-6烷基、C1-6全卤代烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C3-10碳环基、3-10元杂环基、C6-10芳基和5-10元杂芳基，或两个Rff基团连接以形成3-14元杂环基或5-14元杂芳基环，其中各个烷基、烯基、炔基、碳环基、杂环基、芳基和杂芳基独立地取代有0、1、2、3、4或5个Rgg基团；且
Rgg的每种情况独立地为，卤素、-CN、-NO2、-N3、-SO2H、-SO3H、-OH、-O1-6烷基、-ON(C1-6烷基)2、-N(C1-6烷基)2、-N(C1-6烷基)3 +X-、-NH(C1-6烷基)2 +X-、-NH2(C1-6烷基)+X-、-NH3 +X、-N(OC1-6烷基)(C1-6烷基)、-N(OH)(C1-6烷基)、-NH(OH)、-SH、-S1-6烷基、-SS(C1-6烷基)、-C(＝O)(C1-6烷基)、-CO2H、-CO2(C1-6烷基)、-OC(＝O)(C1-6烷基)、-OCO2(C1-6烷基)、-C(＝O)NH2、-C(＝O)N(C1-6烷基)2、-OC(＝O)NH(C1-6烷基)、-NHC(＝O)(C1-6烷基)、-N(C1-6烷基)C(＝O)(C1-6烷基)、-NHCO2(C1-6烷基)、-NHC(＝O)N(C1-6烷基)2、-NHC(＝O)NH(C1-6烷基)、-NHC(＝O)NH2、-C(＝NH)O(C1-6烷基)、-OC(＝NH)(C1-6烷基)、-OC(＝NH)OC1-6烷基、-C(＝NH)N(C1-6烷基)2、-C(＝NH)NH(C1-6烷基)、-C(＝NH)NH2、-OC(＝NH)N(C1-6烷基)2、-OC(NH)NH(C1-6烷基)、-OC(NH)NH2、-NHC(NH)N(C1-6烷基)2、-NHC(＝NH)NH2、-NHSO2(C1-6烷基)、-SO2N(C1-6烷基)2、-SO2NH(C1-6烷基)、-SO2NH2,-SO2C1-6烷基、-SO2OC1-6烷基、-OSO2C1-6烷基、-SOC1-6烷基、-Si(C1-6烷基)3、-OSi(C1-6烷基)3-C(＝S)N(C1-6烷基)2、C(＝S)NH(C1-6烷基)、C(＝S)NH2、-C(＝O)S(C1-6烷基)、-C(＝S)SC1-6烷基、-SC(＝S)SC1-6烷基、-P(＝O)2(C1-6烷基)、-P(＝O)(C1-6烷基)2、-OP(＝O)(C1-6烷基)2、-OP(＝O)(OC1-6烷基)2、C1-6烷基、C1-6全卤代烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C3-10碳环基、C6-10芳基、3-10元杂环基、5-10元杂芳基；或两个孪位Rgg取代基可连接以形成＝O或＝S；其中X为抗衡离子。
“抗衡离子”或“阴离子抗衡离子”为与阳离子季氨基相缔合以保持电中性的带负电荷的基团。示例性的抗衡离子包括卤素离子(如F–、Cl–、Br–、I–)、NO3 –、ClO4 –、OH–、H2PO4 –、HSO4 –、SO4 –2、磺酸根离子(如甲磺酸根、三氟甲磺酸根、对甲苯磺酸根、苯磺酸根、10–樟脑磺酸根、萘–2–磺酸根、萘–1–磺酸–5–磺酸根、乙烷–1–磺酸–2–磺酸根等)和羧酸根离子(如醋酸根、乙酸根、丙酸根、苯甲酸根、甘油酸根、乳酸根、酒石酸根、羟乙酸根等)。
"卤代"或"卤素"是指氟(氟、-F)、氯(氯、-CI)、溴(溴、-Br)、或碘(碘、-I)。
只要化合价允许，氮原子可为取代或未取代的，且包括伯氮、仲氮、叔氮和季氮原子。示例性的氮原子取代基包括但不限于，氢、-OH、-ORaa、-N(RCC)2、-CN、-C(＝O)Raa、-C(＝O)N(Rcc)2、-CO2Raa、-SO2Raa、-C(＝NRbb)Raa、-C(＝NRcc)ORaa、-C(＝NRCC)N(RCC)2、-SO2N(Rcc)2、-SO2Rcc、-SO2ORcc、-SORaa、-C(＝S)N(RCC)2、-C(＝O)SRcc、-C(＝S)SRCC、-P(＝O)2Raa、-P(＝O)(Raa)2、-P(＝O)2N(Rcc)2、-P(＝O)(NRcc)2、C1-10烷基、C1-10全卤代烷基、C2-10烯基、C2-10炔基、C3-10碳环基、3-14元杂环基、C6-14芳基和5-14元杂芳基，或连接至氮原子的两个Rcc基团连接以形成3-14元杂环基或5-14元杂芳基环，其中各个烷基、烯基、炔基、碳环基、杂环基、芳基和杂芳基独立地取代有0、1、2、3、4或5个Rdd基团，且其中Raa、Rbb、Rcc和Rdd如上定义。
在某些实施方案中，氮原子上存在的取代基为氮保护基(也称为氨基保护基)。氮保护基包括，但不限于，-OH、-ORaa、-N(RCC)2、-C(＝O)Raa、-C(＝O)N(Rcc)2、-CO2Raa、-SO2Raa、-C(＝NRcc)Raa、-C(＝NRcc)ORaa、-C(＝NRCC)N(RCC)2、-SO2N(Rcc)2、-SO2Rcc、-SO2ORcc、-SORaa、-C(＝S)N(RCC)2、-C(＝O)SRcc、-C(＝S)SRCC、C1-10烷基{例如、芳烷基、杂芳烷基)、C2-10烯基、C2-10炔基、C3-10碳环基、3-14元杂环基、C6-14芳基和5-14元杂芳基基团，其中各个烷基、烯基、炔基、碳环基、杂环基、芳烷基、芳基和杂芳基独立地取代有0、1、2、3、4或5个R基团，且其中Raa、Rbb、Rcc和Rdd如本文所定义。氮保护基是本领域众所周知的且包括Protecting Groupsin Organic Synthesis,T.W.Greene and P.G.M.Wuts,3 rd edition,John Wiley&Sons,1999中所述的那些，在此引入作为参考。
酰胺氮保护基(例如，-C(＝O)Raa)包括，但不限于，甲酰胺、乙酰胺、氯乙酰胺、三氯乙酰胺、三氟乙酰胺、苯基乙酰胺、3-苯基丙酰胺、吡啶酰胺、3-吡啶基甲酰胺、N-苯甲酰基苯基丙氨酰基衍生物、苯甲酰胺、对苯基苯甲酰胺、邻硝基苯基乙酰胺、邻硝基苯氧基乙酰胺、乙酰乙酰胺、(N'-二硫基苄基氧基酰基氨基)乙酰胺、3-{对-羟基苯基)丙酰胺、3-(邻-硝基苯基)丙酰胺、2-甲基-2-(邻硝基苯氧基)丙酰胺、2-甲基-2-(邻-苯偶氮基苯氧基)丙酰胺、4-氯丁酰胺、3-甲基-3-硝基丁酰胺、邻-硝基肉桂酰胺、N-乙酰基甲硫氨酸、邻硝基苯甲酰胺、和邻-(苯甲酰基氧基甲基)苯甲酰胺。
氨基甲酸酯氮保护基(例如，-C(＝O)ORaa)包括，但不限于，氨基甲酸甲酯、氨基甲酸乙酯、氨基甲酸9–芴基甲酯(Fmoc)、氨基甲酸9–(2–磺基)芴基甲酯、氨基甲酸9–(2,7-二溴)芴基甲酯、氨基甲酸2,7-二–叔丁基–[9–(10,10-二氧–10,10,10,10–四氢噻吨基)]甲酯(DBD–Tmoc)、氨基甲酸4–甲氧基苯甲酰甲酯(Phenoc)、氨基甲酸2,2,2-三氯乙酯(Troc)、氨基甲酸2-三甲基甲硅烷基乙酯(Teoc)、氨基甲酸2–苯基乙酯(hZ)、氨基甲酸1–(1–金刚烷基)–1–甲基乙酯(Adpoc)、氨基甲酸1,1-二甲基–2–卤代乙酯、氨基甲酸1,1-二甲基–2,2-二溴乙酯(DB–t–BOC)、氨基甲酸1,1-二甲基–2,2,2-三氯乙酯(TCBOC)、氨基甲酸1–甲基–1–(4–联苯基)乙酯(Bpoc)、氨基甲酸1–(3,5-二–叔丁基苯基)–1–甲基乙酯(t–Bumeoc)、氨基甲酸2–(2’–和4’–吡啶基)乙酯(Pyoc)、氨基甲酸2–(N,N-二环己基甲酰胺基)乙酯、氨基甲酸叔丁酯(BOC)、氨基甲酸1–金刚烷基酯(Adoc)、氨基甲酸乙烯酯(Voc)、氨基甲酸烯丙酯(Alloc)、氨基甲酸1–异丙基烯丙酯(Ipaoc)、氨基甲酸肉桂酯(Coc)、氨基甲酸4–硝基肉桂酯(Noc)、氨基甲酸8–喹啉基酯、氨基甲酸N–羟基哌啶基酯、烷基二硫代氨基甲酸酯、氨基甲酸苄酯(Cbz)、氨基甲酸对-甲氧基苄酯(Moz)、氨基甲酸对-硝基苄酯、氨基甲酸对-溴苄酯、氨基甲酸对-氯苄酯、氨基甲酸2,4-二氯苄酯、氨基甲酸4–甲基亚硫酰基苄酯(Msz)、氨基甲酸9–蒽基甲酯、氨基甲酸二苯基甲酯、氨基甲酸2–甲基硫代乙酯、氨基甲酸2–甲基磺酰基乙酯、氨基甲酸2–(对-甲苯磺酰基)乙酯、氨基甲酸[2–(1,3-二硫杂环己基)]甲酯(Dmoc)、氨基甲酸4–甲基硫代苯酯(Mtpc)、氨基甲酸2,4-二甲基硫代苯酯(Bmpc)、氨基甲酸2–磷基乙酯(Peoc)、氨基甲酸2-三苯基磷基异丙酯(Ppoc)、氨基甲酸1,1-二甲基–2–氰基乙酯、氨基甲酸间-氯–对-酰氧基苄酯、氨基甲酸对-(二羟基硼基)苄酯、氨基甲酸5–苯并异唑基甲酯、氨基甲酸2–(三氟甲基)–6–色酮基甲酯(Tcroc)、氨基甲酸间-硝基苯酯、氨基甲酸3,5-二甲氧基苄酯、氨基甲酸邻-硝基苄酯、氨基甲酸3,4-二甲氧基–6–硝基苄酯、氨基甲酸苯基(邻-硝基苯基)甲酯、氨基甲酸叔戊酯、硫代氨基甲酸S–苄酯、氨基甲酸对-氰基苄酯、氨基甲酸环丁酯、氨基甲酸环己酯、氨基甲酸环戊酯、氨基甲酸环丙基甲酯、氨基甲酸对-癸氧基苄酯、氨基甲酸2,2-二甲氧基酰基乙烯酯、氨基甲酸邻-(N,N-二甲基甲酰胺基)苄酯、氨基甲酸1,1-二甲基–3–(N,N-二甲基甲酰胺基)丙酯、氨基甲酸1,1-二甲基丙炔酯、氨基甲酸二(2–吡啶基)甲酯、氨基甲酸2–呋喃基甲酯、氨基甲酸2–碘乙酯、氨基甲酸异冰片酯、氨基甲酸异丁酯、氨基甲酸异烟碱酯、氨基甲酸对-(对’–甲氧基苯基偶氮)苄酯、氨基甲酸1–甲基环丁酯、氨基甲酸1–甲基环己酯、氨基甲酸1–甲基–1–环丙基甲酯、氨基甲酸1–甲基–1–(3,5-二甲氧基苯基)乙酯、氨基甲酸1–甲基–1–(对-苯基偶氮苯基)乙酯、氨基甲酸1–甲基–1–苯基乙酯、氨基甲酸1–甲基–1–(4–吡啶基)乙酯、氨基甲酸苯酯、氨基甲酸对-(苯基)苄酯、氨基甲酸2,4,6-三–叔丁基苯酯、氨基甲酸4–(三甲基铵)苄酯和氨基甲酸2,4,6-三甲基苄酯。
磺酰胺氮保护基(例如，-S(＝O)2Raa)包括，但不限于，对甲苯磺酰胺(Ts)、苯磺酰胺、2,3,6,-三甲基-4-甲氧基苯磺酰胺(Mtr)、2,4,6-三甲氧基苯磺酰胺(Mtb)、2,6-二甲基-4-甲氧基苯磺酰胺(Pme)、2,3,5,6-四甲基-4-甲氧基苯磺酰胺(Mte)、4-甲氧基苯磺酰胺(Mbs)、2,4,6-三甲基苯磺酰胺(Mts)、2,6-二甲氧基-4-甲基苯磺酰胺(iMds)、2,2,5,7,8-五甲基色满-6-磺酰胺(Pmc)、甲磺酰胺(Ms)、β-三甲基甲硅烷基乙烷磺酰胺(SES)、9-蒽磺酰胺、4-(4',8'-二甲氧基萘基甲基)苯磺酰胺(DNMBS)、苄基磺酰胺、三氟甲基磺酰胺和苯甲酰甲基磺酰胺。
其它氮保护基包括，但不限于，吩噻嗪基–(10)–酰基衍生物、N’–对-甲苯磺酰氨基酰基衍生物、N’–苯基氨基硫代酰基衍生物、N–苯甲酰基苯基丙氨酰基衍生物、N–乙酰基蛋氨酸衍生物、4,5-二苯基–3–唑啉–2–酮、N–邻苯二甲酰亚胺、N-二硫代琥珀酰亚胺(N–dithiasuccinimide，Dts)、N–2,3-二苯基马来酰亚胺、N–2,5-二甲基吡咯、N–1,1,4,4–四甲基二甲硅烷基氮杂环戊烷加合物(STABASE)、5–取代的1,3-二甲基–1,3,5-三氮杂环己烷–2–酮、5–取代的1,3-二苄基–1,3,5-三氮杂环己烷–2–酮、1–取代的3,5-二硝基–4–吡啶酮、N–甲基胺、N–烯丙基胺、N–[2–(三甲基甲硅烷基)乙氧基]甲基胺(SEM)、N–3–乙酰氧基丙基胺、N–(1–异丙基–4–硝基–2–氧代-3–吡咯啉–3–基)胺、季铵盐、N–苄基胺、N-二(4–甲氧基苯基)甲基胺、N–5-二苯并环庚基胺、N-三苯基甲基胺(Tr)、N–[(4–甲氧基苯基)二苯基甲基]胺(MMTr)、N–9–苯基芴基胺(PhF)、N–2,7-二氯–9–芴基亚甲基胺、N–二茂铁基甲基氨基(Fcm)、N–2–吡啶甲基氨基N’–氧化物、N–1,1-二甲基硫代亚甲基胺、N–亚苄基胺、N–对-甲氧基亚苄基胺、N-二苯基亚甲基胺、N–[(2–吡啶基)基]亚甲基胺、N–(N’,N’-二甲基氨基亚甲基)胺、N,N’–亚异丙基二胺、N–对-硝基亚苄基胺、N–亚水杨基胺、N–5–氯亚水杨基胺、N–(5–氯–2–羟基苯基)苯基亚甲基胺、N–亚环己基胺、N–(5,5-二甲基–3–氧代-1–环己烯基)胺、N–硼烷衍生物、N-二苯基硼酸(borinic acid)衍生物、N–[苯基(五酰基铬-或钨)酰基]胺、N–铜螯合物、N–锌螯合物、N–硝基胺、N–亚硝基胺、胺N-氧化物、二苯基磷酰胺(Dpp)、二甲基硫代磷酰胺(Mpt)、二苯基硫代磷酰胺(Ppt)、氨基磷酸二烷基酯、氨基磷酸二苄基酯、氨基磷酸二苯基酯、苯亚磺酰胺、邻-硝基苯亚磺酰胺(Nps)、2,4-二硝基苯亚磺酰胺、五氯苯亚磺酰胺、2–硝基–4–甲氧基苯亚磺酰胺、三苯基甲基亚磺酰胺和3–硝基吡啶亚磺酰胺(Npys)。
在一些实施方案中，存在于氧原子上的取代基为氧保护基(也称作羟基保护基)。氧保护基包括，但不限于，-Raa、-N(Rbb)2、-C(＝O)SRaa、-C(＝O)Raa、-C O2Raa、-C(＝O)N(Rbb)2、-C(＝NRbb)Raa、-C(＝NRbb)ORaa、-C(＝NRbb)N(Rbb)2、-S(＝O)Raa、-SO2 Raa、-Si(Raa)3、-P(RCC)2、-P(RCC)3、-P(＝O)2Raa、-P(＝O)(Raa)2、-P(＝O)(ORcc)2、-P(＝O)2N(Rbb)2和-P(＝O)(NRbb)2，其中Raa、Rbb和Rcc如本文所定义。氧保护基是本领域中公知的且包括在ProtectingGroups in Organic Synthesis，T.W.Greene和P.G.M.Wuts，3rd edition，John Wiley&Sons，1999中详细描述的那些，将该文献通过参考引入本文中。
示例性的氧保护基包括，但不限于，甲基、甲氧基甲基(MOM)、甲基硫甲基(MTM)、叔丁基硫甲基、(苯基二甲基甲硅烷基)甲氧基甲基(SMOM)、苄氧基甲基(BOM)、对-甲氧基苄氧基甲基(PMBM)、(4–甲氧基苯氧基)甲基(p-AOM)、愈创木酚甲基(GUM)、叔丁氧基甲基、4–戊烯基氧基甲基(POM)、甲硅烷氧基甲基、2–甲氧基乙氧基甲基(MEM)、2,2,2-三氯乙氧基甲基、双(2–氯乙氧基)甲基、2–(三甲基甲硅烷基)乙氧基甲基(SEMOR)、四氢吡喃基(THP)、3–溴四氢吡喃基、四氢噻喃基、1–甲氧基环己基、4–甲氧基四氢吡喃基(MTHP)、4–甲氧基四氢噻喃基、4–甲氧基四氢噻喃基S,S-二氧化物、1–[(2–氯–4–甲基)苯基]–4–甲氧基哌啶–4-基(CTMP)、1,4-二烷–2-基、四氢呋喃基、四氢噻喃基(tetrahydrothiofuranyl)、2,3,3a,4,5,6,7,7a–八氢-7,8,8-三甲基–4,7–桥亚甲基苯并呋喃–2–基(2,3,3a,4,5,6,7,7a–octahydro–7,8,8–trimethyl–4,7–methanobenzofuran–2–yl)、1–乙氧基乙基、1–(2–氯乙氧基)乙基、1–甲基–1–甲氧基乙基、1–甲基–1–苄氧基乙基、1–甲基–1–苄氧基–2–氟乙基、2,2,2-三氯乙基、2-三甲基甲硅烷基乙基、2–(苯基硒基)乙基(2–(phenylselenyl)ethyl)、叔丁基、烯丙基、对-氯苯基、对-甲氧基苯基、2,4-二硝基苯基、苄基(Bn)、对-甲氧基苄基、3,4-二甲氧基苄基、邻-硝基苄基、对-硝基苄基、对-卤代苄基、2,6-二氯苄基、对-氰基苄基、对-苯基苄基、2–吡啶甲基、4–吡啶甲基、3–甲基–2–吡啶甲基N–氧桥(oxido)、二苯基甲基、p,p’-二硝基二苯甲基、5-二苯并环庚基、三苯基甲基、α–萘基二苯基甲基、对-甲氧基苯基二苯基甲基、二(对-甲氧基苯基)苯基甲基、三(对-甲氧基苯基)甲基、4–(4′–溴苯甲酰甲基氧基苯基)二苯基甲基、4,4′,4″-三(4,5-二氯苯二酰亚胺基苯基)甲基、4,4′,4″-三(乙酰丙酰基(levulinoyl)氧基苯基)甲基、4,4′,4″-三(苯甲酰氧基苯基)甲基、3–(咪唑–1-基)双(4′,4″-二甲氧基苯基)甲基、1,1–双(4–甲氧基苯基)–1′–芘基甲基、9–蒽基、9–(9–苯基)呫吨基、9–(9–苯基–10–氧代)蒽基、1,3–benzodisulfuran–2-基、苯并异噻唑基S,S-二氧化物、三甲基甲硅烷基(TMS)、三乙基甲硅烷基(TES)、三异丙基甲硅烷基(TIPS)、二甲基异丙基甲硅烷基(IPDMS)、二乙基异丙基甲硅烷基(DEIPS)、二甲基己基(乙基，thexyl)甲硅烷基、叔丁基二甲基甲硅烷基(TBDMS)、叔丁基二苯基甲硅烷基(TBDPS)、三苄基甲硅烷基、三–对-二甲苯基甲硅烷基、三苯基甲硅烷基、二苯基甲基甲硅烷基(DPMS)、叔丁基甲氧基苯基甲硅烷基(TBMPS)、甲酸酯、苯甲酰基甲酸酯、乙酸酯、氯乙酸酯、二氯乙酸酯、三氯乙酸酯、三氟乙酸酯、甲氧基乙酸酯、三苯基甲氧基乙酸酯、苯氧基乙酸酯、对-氯苯氧基乙酸酯、3–苯基丙酸酯、4–氧代戊酸酯(乙酰丙酸酯)、4,4–(亚乙基二硫代)戊酸酯(乙酰丙酰基二硫代乙缩醛)、新戊酸酯、金刚烷酸酯(adamantoate)、巴豆酸酯、4–甲氧基巴豆酸酯、苯甲酸酯、对-苯基苯甲酸酯、2,4,6-三甲基苯甲酸酯(酸酯(mesitoate))、碳酸叔丁酯(BOC)、碳酸烷基甲基酯、碳酸9–芴基甲酯(Fmoc)、碳酸烷基乙酯、碳酸烷基2,2,2-三氯乙酯(Troc)、碳酸2–(三甲基甲硅烷基)乙酯(TMSEC)、碳酸2–(苯基磺酰基)乙酯(Psec)、碳酸2–(三苯基磷基)乙酯(Peoc)、碳酸烷基异丁酯、碳酸烷基乙烯酯、碳酸烷基烯丙酯、碳酸烷基对-硝基苯基酯、碳酸烷基苄酯、碳酸烷基对-甲氧基苄酯、碳酸烷基3,4-二甲氧基苄酯、碳酸烷基邻-硝基苄酯、碳酸烷基对-硝基苄酯、硫代碳酸烷基S–苄基酯、碳酸4–乙氧基–1–萘基酯、二硫代碳酸甲酯、2–碘苯甲酸酯、4–叠氮基丁酸酯、4–硝基–4–甲基戊酸酯、邻-(二溴甲基)苯甲酸酯、2–甲酰基苯磺酸酯、2–(甲基硫代甲氧基)乙基、4–(甲基硫代甲氧基)丁酸酯、2–(甲基硫代甲氧基甲基)苯甲酸酯、2,6-二氯–4–甲基苯氧基乙酸酯、2,6-二氯–4–(1,1,3,3–四甲基丁基)苯氧基乙酸酯、2,4–双(1,1-二甲基丙基)苯氧基乙酸酯、氯二苯基乙酸酯、异丁酸酯、单琥珀酸酯、(E)–2–甲基–2–丁烯酸酯、邻-(甲氧基酰基)苯甲酸酯、α–萘甲酸酯、硝酸酯、N,N,N’,N’–四甲基二氨基磷酸烷基酯、N–苯基氨基甲酸烷基酯、硼酸酯、二甲基硫膦基、2,4-二硝基苯基次磺酸烷基酯、硫酸酯、甲烷磺酸酯(甲磺酸酯)、苄磺酸酯和甲苯磺酸酯(Ts)。
在某些实施方案中，存在于硫原子上的取代基为硫保护基(也称作硫醇保护基)。硫保护基包括，但不限于，-Raa、-N(Rbb)2、-C(＝O)SRaa、-C(＝O)Raa、-CO2Raa、-C(＝O)N(Rbb)2、-C(＝NRbb)Raa、-C(＝NRbb)ORaa、-C(＝NRbb)N(Rbb)2、-S(＝O)Raa、-SO2Raa、-Si(Raa)3-P(RCC)2、-P(RCC)3、-P(＝O)2Raa、-P(＝O)(Raa)2、-P(＝O)(ORcc)2、-P(＝O)2N(Rbb)2和-P(＝O)(NRbb)2，其中Raa、Rbb和Rcc如本文所定义。硫保护基是本领域中公知的并且包括在Protecting Groups in Organic Synthesis，T.W.Greene和P.G.M.Wuts，3rd edition，JohnWiley&Sons，1999中详细描述的那些，将该文献通过参考引入本文中。
“药学上可接受的盐”是指那些在合理的医学判断范围内适用于与人和其它动物的组织接触而没有过多毒性、刺激、过敏反应等，且与合理的利益/风险比相称的盐。药学上可接受的盐是本领域熟知的。例如，Berge等人在J.Pharmaceutical Sciences(1977)66:1–19中详细描述了药学上可接受的盐。本发明化合物的药学上可接受的盐包括源自合适的无机和有机酸和碱的那些。药学上可接受的无毒酸加成盐的实例是与无机酸(例如盐酸、氢溴酸、磷酸、硫酸和高氯酸)形成的或与有机酸(例如乙酸、草酸、马来酸、酒石酸、柠檬酸、琥珀酸或丙二酸)或者通过使用本领域中所用的方法(例如离子交换)形成的氨基的盐。其他药学上可接受的盐包括己二酸盐、海藻酸盐、抗坏血酸盐、天冬氨酸盐、苯磺酸盐、苯甲酸盐、硫酸氢盐、硼酸盐、丁酸盐、樟脑酸盐、樟脑磺酸盐、柠檬酸盐、环戊烷丙酸盐、二葡糖酸盐、十二烷基硫酸盐、乙磺酸盐、甲酸盐、延胡索酸盐、葡庚糖酸盐、甘油磷酸盐、葡糖酸盐、半硫酸盐、庚酸盐、己酸盐、氢碘化物、2–羟基–乙磺酸盐、乳糖醛酸盐、乳酸盐、月桂酸盐、月桂基硫酸盐、苹果酸盐、马来酸盐、丙二酸盐、甲磺酸盐、2–萘磺酸盐、烟酸盐、硝酸盐、油酸盐、草酸盐、棕榈酸盐、双羟萘酸盐、果胶酸盐(pectinate)、过硫酸盐、3–苯基丙酸盐、磷酸盐、苦味酸盐、特戊酸盐、丙酸盐、硬脂酸盐、琥珀酸盐、硫酸盐、酒石酸盐、硫氰酸盐、对甲苯磺酸盐、十一酸盐、戊酸盐等。源自合适的碱的盐包括碱金属、碱土金属、铵和N+(C1–4烷基)4盐。代表性的碱或碱土金属盐包括钠盐、锂盐、钾盐、钙盐、镁盐等。在适当时，其他药学上可接受的盐包括季铵盐。
本发明提供I型PRMT抑制剂。在一个实施方案中，所述I型PRMT抑制剂为式(I)的化合物:
或其药学上可接受的盐，
其中
X为N，Z为NR4，且Y为CR5；或
X为NR4，Z为N，且Y为CR5；或
X为CR5，Z为NR4，且Y为N；或
X为CR5，Z为N，且Y为NR4；
RX为任选取代的C1-4烷基或任选取代的C3-4环烷基；
L1为键、-O-、-N(RB)-、-S-、-C(O)-、-C(O)O-、-C(O)S-、-C(O)N(RB)-、-C(O)N(RB)N(RB)-、-OC(O)-、-OC(O)N(RB)-、-NRBC(O)-、-NRBC(O)N(RB)-、-NRBC(O)N(RB)N(RB)-、-NRBC(O)O-、-SC(O)-、-C(＝NRB)-、-C(＝NNRB)-、-C(＝NORA)-、-C(＝NRB)N(RB)-、-NRBC(＝NRB)-、-C(S)-、-C(S)N(RB)-、-NRBC(S)-、-S(O)-、-OS(O)2-、-S(O)2O-、-SO2-、-N(RB)SO2-、-SO2N(RB)-、或任选取代的C1-6饱和或不饱和烃链，其中该烃链的一个或多个亚甲基单元任选且独立被以下替代：-O-、-N(RB)-、-S-、-C(O)-、-C(O)O-、-C(O)S-、-C(O)N(RB)-、-C(O)N(RB)N(RB)-、-OC(O)-、-OC(O)N(RB)-、-NRBC(O)-、-NRBC(O)N(RB)-、-NRBC(O)N(RB)N(RB)-、-NRBC(O)O-、-SC(O)-、-C(＝NRB)-、-C(＝NNRB)-、-C(＝NORA)-、-C(＝NRB)N(RB)-、-NRBC(＝NRB)-、-C(S)-、-C(S)N(RB)-、-NRBC(S)-、-S(O)-、-OS(O)2-、-S(O)2O-、-SO2-、-N(RB)SO2-、或-SO2N(RB)-；
各个RA独立地选自氢、任选取代的烷基、任选取代的烯基、任选取代的炔基、任选取代的碳环基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基、任选取代的杂芳基、连接至氧原子时的氧保护基和连接至硫原子时的硫保护基；
各个RB独立地选自氢、任选取代的烷基、任选取代的烯基、任选取代的炔基、任选取代的碳环基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基、任选取代的杂芳基和氮保护基，或相同氮原子上的RB和RW可与中间氮一起形成任选取代的杂环；
RW为氢、任选取代的烷基、任选取代的烯基、任选取代的炔基、任选取代的碳环基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基、或任选取代的杂芳基；条件是当L1为键时，RW不为氢、任选取代的芳基、或任选取代的杂芳基；
R3为氢、C1-4烷基、或C3-4环烷基；
R4为氢、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯基、任选取代的C2-6炔基、任选取代的C3-7环烷基、任选取代的4-至7-元杂环基；或任选取代的C1-4烷基-Cy；
Cy为任选取代的C3-7环烷基、任选取代的4-至7-元杂环基、任选取代的芳基、或任选取代的杂芳基；且
R5为氢、卤素、-CN、任选取代的C1-4烷基、或任选取代的C3-4环烷基。在一方面，R3为C1-4烷基。在一方面，R3为甲基。在一方面，R4为氢。在一方面，R5为氢。在一方面，L1为键。
在一个实施方案中，所述I型PRMT抑制剂为式(I)的化合物，其中-L1-RW为任选取代的碳环基。
在一个实施方案中，所述I型PRMT抑制剂为式(V)的化合物
或其药学上可接受的盐，其中环A为任选取代的碳环基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基、或任选取代的杂芳基。在一方面，环A为任选取代的碳环基。在一方面，R3为C1-4烷基。在一方面，R3为甲基。在一方面，Rx为未取代的C1-4烷基。在一方面，Rx为甲基。在一方面，L1为键。
在一个实施方案中，所述I型PRMT抑制剂为式(VI)的化合物
或其药学上可接受的盐。在一方面，环A为任选取代的碳环基。在一方面，R3为C1-4烷基。在一方面，R3为甲基。在一方面，Rx为未取代的C1-4烷基。在一方面，Rx为甲基。
在一个实施方案中，所述I型PRMT抑制剂为式(II)的化合物:
或其药学上可接受的盐。在一方面，-L1-RW为任选取代的碳环基。在一方面，R3为C1-4烷基。在一方面，R3为甲基。在一方面，Rx为未取代的C1-4烷基。在一方面，Rx为甲基。在一方面，R4为氢。
在一个实施方案中，所述I型PRMT抑制剂为化合物A:
或其药学上可接受的盐。化合物A和制备化合物A的方法公开于PCT/US2014/029710，至少在第171页(化合物158)和第266页，第[00331]段。
在一个实施方案中，所述I型PRMT抑制剂为化合物A-三-HCl，其为化合物A的三HCl盐形式。在另一实施方案中，所述I型PRMT抑制剂为化合物A-单-HCl，其为化合物A的单HCl盐形式。在另一实施方案中，所述I型PRMT抑制剂为化合物A-游离碱，其为化合物A的游离碱形式。在另一实施方案中，所述I型PRMT抑制剂为化合物A-二-HCl，其为化合物A的二HCl盐形式。
在一个实施方案中，所述I型PRMT抑制剂为化合物D:
或其药学上可接受的盐。
I型PRMT抑制剂进一步公开在PCT/US2014/029710中，其通过引用并入本文。示例性的I型PRMT抑制剂公开于PCT/US2014/029710的表1A和表1B中，且制备I型PRMT抑制剂的方法至少描述于PCT/US2014/029710的第226页第[00274]段至第328页第[00050]段中。
在一个实施方案中，提供在需要的人中治疗癌症的方法，该方法包括确定以下任一种或多种：a.5-甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)多核苷酸或多肽的水平，b.MTAP突变的存在或不存在，和c.人样品中甲硫腺苷(MTA)的水平，和如果MTAP多核苷酸或多肽的水平相对于对照减少和/或甲硫腺苷(MTA)的水平相对于对照增加和/或存在MTAP多核苷酸或多肽的突变，向人施用有效量的I型蛋白质精氨酸甲基转移酶(I型PRMT)抑制剂，从而治疗人的癌症。在一方面，突变为MTAP缺失。在一方面，所述样品包括癌细胞。在另一方面，确定a和b二者。在一方面，该方法还包括给药一种或多种其他抗肿瘤剂。在另一方面，所述癌症为实体瘤或血液癌。在一方面，癌症为淋巴瘤、急性骨髓性白血病(AML)、肾癌、黑素瘤、乳腺癌、膀胱癌、结肠癌、肺癌或前列腺癌。在一方面，I型PRMT抑制剂为式I、II、V或VI的化合物。在一方面，I型PRMT抑制剂为化合物A。在另一方面，I型PRMT抑制剂为化合物D。在一个实施方案中，提供在需要的人中治疗癌症的方法，该方法包括确定以下任一种或多种：a.5-甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)多核苷酸或多肽的水平，b.MTAP突变的存在或不存在，和c.人样品中甲硫腺苷(MTA)的水平，和如果MTAP多核苷酸或多肽的水平相对于对照减少和/或甲硫腺苷(MTA)的水平相对于对照增加和/或存在MTAP多核苷酸或多肽的突变，向人施用有效量的化合物A，从而治疗人的癌症。在另一实施方案中，提供在需要的人中治疗癌症的方法，该方法包括测定a.5-甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)多核苷酸或多肽的水平，或b.在人样品中MTAP突变的存在或不存在，和如果MTAP多核苷酸或多肽的水平相对于对照减少或存在MTAP多核苷酸或多肽的突变，向人施用有效量的化合物A，从而治疗人的癌症。在一些方面，相对于对照，MTAP多核苷酸或多肽的水平减少至少约10％，至少约20％，至少约30％，至少约40％，至少约50％，至少约60％，至少约70％，至少约80％，至少约90％，至少约95％，或至少约99％。在一些其它方面，相对于对照，MTA的水平增加至少约2-倍，至少约3-倍，至少约4-倍，至少约5-倍，至少约10-倍，至少约15-倍，至少约20-倍，至少约25-倍，30-倍，至少约35-倍，至少约40-倍，至少约45-倍，或至少约50-倍。
在另一实施方案中，提供在需要的人中抑制癌细胞增殖的方法，该方法包括向人施用有效量的I型蛋白质精氨酸甲基转移酶(I型PRMT)抑制剂，从而抑制所述人的癌细胞增殖，其中所述癌细胞具有5-甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)的突变和/或相对于对照MTAP多核苷酸或多肽的水平减少和/或相对于对照甲硫腺苷(MTA)的水平增加。在一方面，所述突变为MTAP缺失。在一方面，MTAP多核苷酸或多肽减少的水平或MTAP的突变增加癌细胞中的甲硫腺苷(MTA)的水平使得蛋白质精氨酸甲基转移酶5(PRMT5)的活性被抑制。在一方面，癌细胞中MTAP多核苷酸或多肽减少的水平或MTAP的突变增加癌细胞对I型PRMT抑制剂的敏感性。在一方面，癌细胞为实体瘤癌细胞或血液癌细胞。在另一方面，癌细胞为淋巴瘤细胞、急性骨髓性白血病(AML)细胞、肾癌细胞、黑素瘤细胞、乳腺癌细胞、膀胱癌细胞、结肠癌细胞、肺癌细胞、或前列腺癌细胞。在一方面，I型PRMT抑制剂为式I、II、V或VI的化合物。在一方面，I型PRMT抑制剂为化合物A。在另一方面，I型PRMT抑制剂为化合物D。在另一实施方案中，提供在需要的人中抑制癌细胞增殖的方法，该方法包括向人施用有效量的化合物A，从而抑制所述人的癌细胞增殖，其中所述癌细胞具有5-甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)的突变和/或相对于对照MTAP多核苷酸或多肽的水平减少和/或相对于对照甲硫腺苷(MTA)的水平增加。在一些方面，相对于对照，MTAP多核苷酸或多肽的水平减少至少约10％，至少约20％，至少约30％，至少约40％，至少约50％，至少约60％，至少约70％，至少约80％，至少约90％，至少约95％，或至少约99％。在一些其它方面，相对于对照，MTA的水平增加至少约2-倍，至少约3-倍，至少约4-倍，至少约5-倍，至少约10-倍，至少约15-倍，至少约20-倍，至少约25-倍，30-倍，至少约35-倍，至少约40-倍，至少约45-倍，或至少约50-倍。
在另一实施方案中，本发明提供预测患有癌症的人是否将对用I型蛋白质精氨酸甲基转移酶(I型PRMT)抑制剂的治疗敏感的方法，该方法包括测定a.5-甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)多核苷酸或多肽的水平或b.在人样品中MTAP突变的存在或不存在，其中相对于对照MTAP多核苷酸或多肽降低的水平或MTAP突变的存在指示所述人将对用I型PRMT抑制剂的治疗敏感。在另一实施方案中，本发明提供预测患有癌症的人是否对用I型蛋白质精氨酸甲基转移酶(I型PRMT)抑制剂的治疗敏感的方法，该方法包括确定以下任一种或多种：a.5-甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)多核苷酸或多肽的水平，b.MTAP突变的存在或不存在，和c.人样品中甲硫腺苷(MTA)的水平，其中相对于对照MTAP多核苷酸或多肽降低的水平和/或MTAP突变的存在和/或相对于对照MTA增加的水平指示所述人将对用I型PRMT抑制剂的治疗敏感。在一方面，突变为MTAP缺失。在一方面，所述样品包括癌细胞。在一方面，确定a和b二者。在另一方面，该方法还包括给药一种或多种其他抗肿瘤剂。在一方面，所述癌症为实体瘤或血液癌。在一方面，癌症为淋巴瘤、急性骨髓性白血病(AML)、肾癌、黑素瘤、乳腺癌、膀胱癌、结肠癌、肺癌或前列腺癌。在一方面，I型PRMT抑制剂为式I、II、V或VI的化合物。在一方面，I型PRMT抑制剂为化合物A。在另一方面，I型PRMT抑制剂为化合物D。在一些方面，相对于对照，MTAP多核苷酸或多肽的水平减少至少约10％，至少约20％，至少约30％，至少约40％，至少约50％，至少约60％，至少约70％，至少约80％，至少约90％，至少约95％，或至少约99％。在一些其它方面，相对于对照，MTA的水平增加至少约2-倍，至少约3-倍，至少约4-倍，至少约5-倍，至少约10-倍，至少约15-倍，至少约20-倍，至少约25-倍，30-倍，至少约35-倍，至少约40-倍，至少约45-倍，或至少约50-倍。
在另一实施方案中，提供用于在分类为响应者的人中治疗癌症的I型PRMT抑制剂，其中响应者的特征为在人样品中存在5-甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)的突变或相对于对照MTAP多核苷酸或多肽降低的水平或相对于对照甲硫腺苷(MTA)的水平增加。在一方面，突变为MTAP缺失。在一方面，所述样品包括癌细胞。在一方面，响应者的特征为存在5-甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)的突变。在另一方面，响应者的特征为存在5-甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)的突变和相对于对照MTAP多核苷酸或多肽降低的水平。在另一方面，响应者的特征为在人样品中存在5-甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)的突变，相对于对照MTAP多核苷酸或多肽降低的水平，和相对于对照甲硫腺苷(MTA)的水平增加。在一些方面，相对于对照，MTAP多核苷酸或多肽的水平减少至少约10％，至少约20％，至少约30％，至少约40％，至少约50％，至少约60％，至少约70％，至少约80％，至少约90％，至少约95％，或至少约99％。在一些其它方面，相对于对照，MTA的水平增加至少约2-倍，至少约3-倍，至少约4-倍，至少约5-倍，至少约10-倍，至少约15-倍，至少约20-倍，至少约25-倍，30-倍，至少约35-倍，至少约40-倍，至少约45-倍，或至少约50-倍。在另一方面，该方法还包括给药一种或多种其他抗肿瘤剂。在一方面，所述癌症为实体瘤或血液癌。在一方面，癌症为淋巴瘤、急性骨髓性白血病(AML)、肾癌、黑素瘤、乳腺癌、膀胱癌、结肠癌、肺癌或前列腺癌。在一方面，I型PRMT抑制剂为式I、II、V或VI的化合物。在一方面，I型PRMT抑制剂为化合物A。在另一方面，I型PRMT抑制剂为化合物D。在一个实施方案中，提供用于在分类为响应者的人中治疗癌症的化合物A，其中响应者的特征为在人样品中存在5-甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)的突变或相对于对照MTAP多核苷酸或多肽降低的水平或相对于对照甲硫腺苷(MTA)的水平增加。在一个实施方案中，提供用于在分类为响应者的人中治疗癌症的化合物A，其中响应者的特征为在人样品中存在MTAP缺失。
在另一实施方案中，本发明提供5-甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)的突变，其用作生物标记以治疗/诊断响应于I型PRMT抑制剂的癌症。在一个实施方案中，本发明提供MTAP缺失突变，其用作生物标记以治疗/诊断响应于I型PRMT抑制剂的癌症。在另一实施方案中，本发明提供5-甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)的突变，其用作生物标记以治疗/诊断响应于化合物A的癌症。在一个实施方案中，本发明提供MTAP缺失突变，其用作生物标记以治疗/诊断响应于化合物A的癌症。
在另一实施方案中，本发明提供5-甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)的突变，其用于诊断方法。在一个实施方案中，本发明提供MTAP缺失突变，其用于诊断方法。在另一实施方案中，本发明提供5-甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)的突变，其用于治疗。在一个实施方案中，本发明提供MTAP缺失突变，其用于治疗。
术语“多肽”和“蛋白质”可互换使用，并且在本文中用作通用术语，指天然蛋白质、片段、肽或多肽序列的类似物。因此，天然蛋白质、片段和类似物是多肽属的物种。
在本文中提及的术语“多核苷酸”是指长度至少10个碱基的核苷酸的聚合物形式，为核糖核苷酸或脱氧核苷酸或任何一种类型核苷酸的修饰形式。术语包括单链和双链形式的DNA。
如本文所用，“MTAP”或“5-甲硫腺苷磷酸化酶”是催化甲硫腺苷(MTA)可逆磷酸化为腺嘌呤和5-甲基硫代核糖-1-磷酸的蛋白质(登录号：UniprotKB-Q13126(MTAP_HUMAN))。UniprotKB-Q13126-1(同种型1)中所示的MTAP序列如下再现：
(SEQ ID NO：1)。
如本文所述，“MTAP多核苷酸”是指编码MTAP多肽的多核苷酸。示例性MTAP多核苷酸序列可参见NCBI Reference Sequence：NM_002451.3。NM_002451.3中所示的序列如下再现：
(SEQ ID NO：2)。
“甲硫腺苷”或“MTA”或“5-甲硫腺苷”是指具有以下所示结构的化合物:
样品中MTA的水平可以通过本领域熟知的许多方法测量。例如，可以使用液相色谱-质谱(LC-MS)测量样品中的MTA水平。使用LC-MS测量MTA水平描述于例如Mavrakis,K.J.等人,Disordered methionine metabolism in MTAP/CDKN2A-deleted cancers leads todependence on PRMT5.Science 351,1208-1213,doi:10.1126/science.aad5944(2016)。
在多肽或编码多肽的基因及其语法变型中，“突变”意指多肽或编码多肽的基因具有一个或多个等位基因变型、剪接变型、衍生变型、替换变型、缺失变型，和/或插入变型、融合多肽、直系同源基因(orthologs)，和/或种间同系物。举例而言，MTAP的至少一个突变将包括对于在所述细胞中产生的至少一种MTAP蛋白，其中多肽或编码所述多肽的多核苷酸的部分全部序列在细胞中不存在或不表达的MTAP。例如，MTAP蛋白可由细胞以截短形式(truncated form)产生，而且所述截短形式的序列在截短物的序列中可能是野生型的。缺失可意味着不存在全部或部分基因或由基因编码的蛋白。MTAP突变还意味着在多核苷酸单一碱基处的突变或一单独的氨基酸取代。此外，在细胞中表达的或由细胞编码的一些蛋白质可能是突变的，例如在一单独氨基酸处，而相同细胞中产生的相同蛋白质的其它拷贝可能是野生型的。
可通过本领域熟知的多种方法在多核苷酸或翻译蛋白中检测突变。这方法包括但不限于测序、RT-PCR和原位杂交，例如基于荧光的原位杂交(FISH)、抗体检测、蛋白降解测序等。检测MTAP突变例如MTAP缺失的方法，是本领域技术人员公知的，并且在本文的详细说明和实施例中描述。确定MTAP多核苷酸或多肽水平降低的方法是本领域熟知的并且在实施例中显示。该方法可包括使用对MTAP多核苷酸特异的引物或对MTAP多肽特异的抗体。
用于测试一项或多项突变的样品(例如生物学样品)可选自蛋白质、核苷酸、细胞囊泡或细胞组分、血清、细胞、血液、血液组分、尿液和唾液。测试突变可通过本领域已知的和/或本文所述的若干种技术进行。在一些实施方案中，所述样品包含一种或多种癌细胞。
对照可以是本领域技术人员可以选择的任何一种，例如来自人的匹配细胞，来自人的匹配组织，与肿瘤相同来源但已知具有野生型MTAP的细胞，或者与在相同来源的非癌细胞或具有野生型MTAP的细胞中看到的相关的设计的对照。
任何核酸包括基因或PCR产物或其片段或部分的序列可通过本领域已知的任何方法(例如化学测序或酶法测序)测序。DNA的“化学测序”指的是如Maxam和Gilbert(1977)(Proc.Natl.Acad.Sci.USA 74:560)中所述的方法，其中DNA通过各自的碱基特异性反应随机裂解。DNA的“酶法测序”指的是如Sanger(Sanger等,(1977)Proc.Natl.Acad.Sci.USA74:5463)中所述的方法。
常规分子生物学、微生物学和重组DNA技术包括测序技术是本领域的技术人员所公知的。这类技术在文献中有完全地说明。参见，例如Sambrook,Fritsch&Maniatis,Molecular Cloning:A Laboratory Manual,Second Edition(1989)Cold Spring HarborLaboratory Press,Cold Spring Harbor,N.Y.(herein"Sambrook等,1989")；DNACloning:A Practical Approach,Volumes I and II(D.N.Glover ed.1985)；Oligonucleotide Synthesis(M.J.Gait编1984)；Nucleic Acid Hybridization(B.D.Hames&S.J.Higgins eds.(1985))；Transcription And Translation(B.D.Hames&S.J.Higgins,编(1984))；Animal Cell Culture(R.I.Freshney,ed.(1986))；ImmobilizedCells And Enzymes(IRL Press,(1986))；B.Perbal,A Practical Guide To MolecularCloning(1984)；F.M.Ausubel等(编),Current Protocols in Molecular Biology,JohnWiley&Sons,Inc.(1994)。
肽核酸(PNA)亲和性分析是传统杂交分析的衍生方法(Nielsen等,Science 254:1497-1500(1991)；Egholm等,J.Am.Chem.Soc.114:1895-1897(1992)；James等，ProteinScience 3:1347-1350(1994))。PNA是遵循沃森-克里克碱基配对原理的结构DNA模拟物，并用于标准DNA杂交分析。PNA在杂交分析中显示较高的特异性，因为PNA/DNA错配比DNA/DNA错配更不稳定而且互补性PNA/DNA链比互补性DNA/DNA链形成更强的键。
已研发出DNA微阵列以检测遗传变型和多态性(Taton等,Science 289:1757-60,2000；Lockhart等,Nature 405:827-836(2000)；Gerhold等，,Trends in BiochemicalSciences 24:168-73(1999)；Wallace,R.W.,Molecular Medicine Today 3:384-89(1997)；Blanchard and Hood,Nature Biotechnology 149:1649(1996)。DNA微阵列由高速机器人在玻璃或尼龙基质上制造的，并且含有已知身份的DNA片段(“探针”)。所述微阵列用于基于传统的碱基配对原理匹配已知和未知DNA片段(“靶”)。
在一个实施方案中，提供了用于治疗癌症的试剂盒，其包含用于确定权利要求1的a和b中的一个或多个的试剂盒，和用于确定权利要求1的a或b中的一个或多个的手段。在一个方面，该手段选自引物、探针和抗体。
寡核苷酸探针或探针是核酸分子，其长度通常在约8个核苷酸至数百个核苷酸的范围内。这种分子通常用于通过在严格杂交条件下与这种靶核酸序列杂交来鉴定样品中的靶核酸序列。
本文中提及的“寡核苷酸”包括天然存在和修饰的核苷酸，其通过天然存在的和非天然存在的寡核苷酸键连接在一起。寡核苷酸是一种多核苷酸亚类，其通常包括200个碱基或更少的长度。优选地，寡核苷酸为10至60碱基长度并且最优选12、13、14、15、16、17、18、19或20至40碱基长度。寡核苷酸通常为单链的，例如对于探针，尽管寡核苷酸可以是双链的，例如用于构建基因突变体。寡核苷酸可以是正义或反义寡核苷酸。
PCR引物也为核酸序列，尽管PCR引物通常为非常短长度的寡核苷酸，其用于聚合酶链反应。本领域的技术人员可使用从靶序列得到的序列信息研发和生产PCR引物和杂交探针。(参见，例如Sambrook等，上述，或Glick等，上述)。
在一个实施方案中，本发明提供包含I型PRMT抑制剂或其药学上可接受的盐的药物组合物，其用于治疗人的癌症，其中至少该人的第一样品测定为具有MTAP突变、相对于对照MTAP多核苷酸或多肽水平降低，或二者。
在一个实施方案中，提供I型PRMT抑制剂在制备用于治疗人的癌症的药物中的用途，其中该人的一种或多种样品测定为具有MTAP突变、相对于对照MTAP多核苷酸或多肽降低的水平，或二者。
在一方面，所述癌症选自头颈部癌症、乳腺癌、肺癌、结肠癌、卵巢癌、前列腺癌、神经胶质瘤、成胶质细胞瘤、星形细胞瘤、多形性成胶质细胞瘤、Bannayan-Zonana综合征、考登病、Lhermitte-Duclos疾病、炎性乳腺癌、威尔姆斯肿瘤、尤因肉瘤、横纹肌肉瘤、室管膜瘤、成神经管细胞瘤、肾癌、肝癌、黑素瘤、胰腺癌、肉瘤、骨肉瘤、骨的巨细胞肿瘤、甲状腺癌、成淋巴细胞性T细胞白血病、慢性髓细胞性白血病、慢性淋巴细胞性白血病、毛细胞白血病、急性成淋巴细胞性白血病、急性骨髓性白血病、AML、慢性中性粒细胞性白血病、急性成淋巴细胞性T细胞白血病、浆细胞瘤、成免疫细胞性大细胞白血病、套细胞白血病、多发性骨髓瘤巨核细胞白血病、多发性骨髓瘤、急性巨核细胞性白血病、前髓细胞性白血病、红白血病、恶性淋巴瘤、霍奇金淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤、成淋巴细胞性T细胞淋巴瘤、伯基特淋巴瘤、滤泡性淋巴瘤、成神经细胞瘤、膀胱癌、尿路上皮癌、外阴癌、子宫颈癌、子宫内膜癌、肾癌、间皮瘤、食管癌、唾液腺癌、肝细胞癌、胃癌、睾丸癌、颊癌、口腔癌、GIST(胃肠道间质瘤)、和睾丸癌。
在一方面，本发明的方法进一步包括向人给药一种或多种其他抗肿瘤剂。
在一方面所述人具有实体瘤。在一方面所述肿瘤选自头颈部癌症、胃癌、黑素瘤、肾细胞癌(RCC)、食管癌、非小细胞肺癌、前列腺癌、结肠直肠癌、卵巢癌和胰腺癌。在另一方面所述人具有液体肿瘤如弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)、多发性骨髓瘤、慢性淋巴细胞性白血病(CLL)、滤泡性淋巴瘤、急性骨髓性白血病和慢性髓细胞性白血病。
本发明还涉及治疗或减轻选自以下的癌症的严重性的方法：脑(神经胶质瘤)、成胶质细胞瘤、Bannayan-Zonana综合征、考登病、Lhermitte-Duclos疾病、乳腺癌、炎性乳腺癌、威尔姆斯肿瘤、尤因肉瘤、横纹肌肉瘤、室管膜瘤、成神经管细胞瘤、结肠、头与颈、肾、肺、肝、黑素瘤、卵巢、胰腺、前列腺、肉瘤、骨肉瘤、骨的巨细胞肿瘤、甲状腺、成淋巴细胞性T-细胞白血病、慢性髓细胞性白血病、慢性淋巴细胞性白血病、毛细胞白血病、急性成淋巴细胞性白血病、急性骨髓性白血病、慢性中性粒细胞性白血病、急性成淋巴细胞性T-细胞白血病、浆细胞瘤、成免疫细胞性大细胞白血病、套细胞白血病、多发性骨髓瘤巨核细胞白血病、多发性骨髓瘤、急性巨核细胞性白血病、前髓细胞性白血病、红白血病、恶性淋巴瘤、霍奇金淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤、成淋巴细胞性T细胞淋巴瘤、伯基特淋巴瘤、滤泡性淋巴瘤、成神经细胞瘤、膀胱癌、尿路上皮癌、肺癌、外阴癌、子宫颈癌、子宫内膜癌、肾癌、间皮瘤、食管癌、唾液腺癌、肝细胞癌、胃癌、睾丸癌、颊癌、口腔癌、GIST(胃肠道间质瘤)和睾丸癌。
本发明所用术语“治疗”及其语法变化形式是指治疗性治疗。在提到特定病症时，治疗意味着，通过将病症的一种或多种生物学表现消除或降低到不可检测的水平，该效果持续一段时间(认为期间该表现呈缓解状态，且无额外治疗)，从而：(1)改善或预防病症或该病症的一种或多种生物学表现；(2)干扰(a)引发或造成该病症的生物级联中的一个或多个点或(b)病症的一种或多种生物学表现；(3)缓解与病症或其治疗相关的一种或多种症状、效应或副作用；或(4)延缓病症的发展或该病症的一种或多种生物学表现。从而也能推想预防性治疗。技术人员将会意识到，“预防”不是绝对的术语。在医学中，“预防”被理解为是指药物的预防性给药，以显著降低病症或其生物学表现的可能性或严重性，或延迟该病症或其生物学表现的发生。例如当认为受试者是处于发展为癌症的高风险时，预防性治疗是适当的(例如当受试者具有极强的癌症家族病史或当受试者暴露于致癌物质时)。
“有效量”是指药物或药剂的量，其将引起例如研究人员或临床医生正在寻求的组织、系统、动物或人的生物或医学反应。此外，术语“治疗有效量”是指与未接受该量的相应受试者相比导致改善的疾病、病症或副作用的治疗、愈合、预防或缓解或者降低疾病或病症的发展速度的任何量。该术语在其范围内还包括有效增强正常生理功能的量。
如本发明所用，术语“癌症”、“赘生物”和“肿瘤”可以单数或复数形式互换使用，是指经历恶性转化使其变为对宿主生物体具有病理性的细胞。可以通过成熟的技术，特别是组织学检查，容易地将原发性癌细胞与非癌细胞区分开来。如本发明所用的癌细胞的定义不仅包括原发性癌细胞，还包括衍生自前驱癌细胞的任何细胞。这包括转移的癌细胞，以及衍生自癌细胞的体外培养物和细胞系。当提及通常表现为实体瘤的癌症类型时，“临床可检测”的肿瘤是基于肿瘤块可检测到的肿瘤；例如，通过诸如计算机断层摄影(CT)扫描、磁共振成像(MRI)、X射线、超声或物理检查触诊的程序，和/或由于可检测到从患者获得的样品中一种或多种癌症特异性抗原的表达。肿瘤可能是造血性(或血液学或血液或血液相关的)癌症，例如衍生自血细胞或免疫细胞的癌症，其可被称为“液体肿瘤”。基于血液肿瘤的临床病症的具体实例包括：白血病，如慢性髓细胞性白血病、急性髓细胞性白血病，慢性淋巴细胞性白血病和急性淋巴细胞性白血病；浆细胞恶性肿瘤，如多发性骨髓瘤、MGUS和瓦尔登斯特伦氏巨球蛋白血症；淋巴瘤，如非霍奇金淋巴瘤、霍奇金淋巴瘤；等等。
癌症可以是其中存在异常数量的母细胞或不期望的细胞增殖或被诊断为血癌(包括淋巴性和骨髓性恶性肿瘤)的任何癌症。骨髓性恶性肿瘤包括但不限于：急性骨髓性(或髓细胞性或骨髓性或成髓细胞性)白血病(未分化或分化的)、急性早幼粒细胞(或早幼粒细胞性或前髓细胞性或前髓母细胞性)白血病、急性骨髓单核细胞性(或骨髓单核母细胞性)白血病、急性单核细胞性(或单核母细胞性)白血病、红细胞白血病和巨核细胞性(或巨核母细胞性)白血病。这些白血病可以一起称为急性骨髓性(或髓细胞性或骨髓性的)白血病(AML)。骨髓恶性肿瘤还包括骨髓增生性疾病(MPD)，其包括但不限于：慢性骨髓性(或髓细胞性)白血病(CML)、慢性骨髓单核细胞性白血病(CMML)、原发性血小板增多症(或血小板增多症)和真性红细胞增多症(PCV)。骨髓恶性肿瘤还包括：骨髓发育不良(或骨髓增生异常综合征或MDS)，其可被称为难治性贫血(RA)、具有过量母细胞的难治性贫血(RAEB)以及具有过量转化中的母细胞的难治性贫血(RAEBT)；以及伴有或不伴有原因不明性髓样上皮化生的骨髓纤维化(MFS)。
造血系统癌症还包括淋巴恶性病，其会影响淋巴结、脾脏、骨髓、外周血和/或结外位点。淋巴癌包括B细胞恶性病，包括但不限于B细胞非霍奇金淋巴瘤(B-NHL)。B-NHL可以是无痛的(或低度)、中度(或侵袭性)或高度(高侵袭性)。无痛B细胞淋巴瘤包括：滤泡性淋巴瘤(FL)；小淋巴细胞性淋巴瘤(SLL)；边缘区淋巴瘤(MZL)，包括结节MZL、结外MZL、脾MZL和具有绒毛状淋巴细胞的脾MZL；淋巴浆细胞性淋巴瘤(LPL)；以及粘膜相关淋巴样组织(MALT或结外边缘区)淋巴瘤。中度B-NHL包括：涉及或不涉及白血病的套细胞性淋巴瘤(MCL)、弥漫性大细胞淋巴瘤(DLBCL)、滤泡性大细胞(或3级或3B级)淋巴瘤和原发性纵隔淋巴瘤(PML)。高度B-NHL包括伯基特淋巴瘤(BL)、伯基特样淋巴瘤、小无裂细胞淋巴瘤(SNCCL)和成淋巴细胞性淋巴瘤。其它B-NHL包括免疫母细胞性淋巴瘤(或免疫细胞瘤)、原发性渗出性淋巴瘤、HIV相关(或AIDS相关)的淋巴瘤和移植后淋巴增生性病症(PTLD)或淋巴瘤。B细胞恶性病还包括但不限于：慢性淋巴细胞性白血病(CLL)、幼淋巴细胞性白血病(PLL)、瓦尔登斯特伦氏巨球蛋白血症(WM)、毛细胞白血病(HCL)、大颗粒淋巴细胞性(LGL)白血病、急性淋巴性(或淋巴细胞性或成淋巴母细胞性)白血病和卡斯尔曼氏病。NHL还可包括：T细胞非霍奇金淋巴瘤(T-NHL)，其包括但不限于未列名(NOS)的T细胞非霍奇金淋巴瘤、外周T细胞淋巴瘤(PTCL)、间变性大细胞淋巴瘤(ALCL)、血管免疫母细胞性淋巴样病(AILD)、鼻腔型自然杀伤(NK)细胞/T细胞淋巴瘤、γ/δ淋巴瘤、皮肤型T细胞淋巴瘤、蕈样肉芽肿和塞扎里综合征(Sezary syndrome)。
造血系统癌症还包括霍奇金淋巴瘤(或疾病)，其包括典型霍奇金淋巴瘤,结节硬化型霍奇金淋巴瘤,混合细胞型霍奇金淋巴瘤,淋巴细胞主型(LP)霍奇金淋巴瘤,结节LP霍奇金淋巴瘤和淋巴细胞缺乏型霍奇金淋巴瘤。造血系统癌症还包括浆细胞疾病或癌症，如多发性骨髓瘤(MM)，其包括和郁积型MM,意义未确定(或未知或未明)的单克隆丙种球蛋白病(MGUS),浆细胞瘤(骨,髓外),淋巴浆细胞性淋巴瘤(LPL),瓦尔登斯特伦氏巨球蛋白血症,浆细胞白血病和原发性淀粉样变性病(AL)。造血系统癌症还可包括其它造血细胞的其它癌症，包括多形核白细胞(或中性粒细胞),嗜碱性粒细胞,嗜酸性粒细胞,树突状细胞,血小板,红细胞和自然杀伤细胞。包括造血细胞的组织在本发明中被称为“造血细胞组织”，其包括骨髓；外周血；胸腺；和外周淋巴组织，诸如脾脏、淋巴结、与粘膜相关的淋巴组织(例如与肠相关淋巴组织)、扁桃体，派伊尔淋巴集结和阑尾，以及与其他粘膜相关的淋巴组织，例如支气管内衬。
典型地，在本发明中，对所治疗的易感肿瘤具有活性的任何抗肿瘤剂都可以在癌症治疗中被共同施用。该药物的实例可以在Cancer Principles and Practice ofOncology by V.T.Devita，T.S.Lawrence，和S.A.Rosenberg(编辑)，第10版(2014年12月5日)，Lippincott Williams&Wilkins Publishers中找到。本领域普通技术人员将能够基于药物的特定特征和所涉及的癌症来辨别可使用哪些药剂组合。可用于本发明的典型的抗肿瘤剂包括但不限于：抗微管或抗有丝分裂剂如二萜和长春花生物碱；铂配位络合物；烷基化剂如氮芥、氧氮磷杂己环、烷基磺酸酯、亚硝基脲和三氮烯；抗生素如放线菌素、蒽环类和博来霉素；拓扑异构酶I抑制剂如喜树碱；拓扑异构酶II抑制剂如表鬼臼毒素；抗代谢物如嘌呤和嘧啶类似物和抗-叶酸化合物；激素和激素类似物；信号传导途径抑制剂；非受体酪氨酸激酶血管生成抑制剂；免疫治疗剂；促凋亡剂；细胞周期信号传导抑制剂；蛋白酶体抑制剂；热休克蛋白抑制剂；癌症代谢抑制剂；和癌症基因治疗剂如基因修饰的T细胞。
用于与本发明方法或组合联合或共同施用的其他活性成分的实例是抗肿瘤剂。抗肿瘤剂的实例包括但不限于化学治疗剂；免疫调节剂；免疫调节剂；和免疫刺激佐剂。
抗微管或抗有丝分裂剂是时相特异性药物(phase specific agent)，其在细胞周期中的M期或有丝分裂期针对肿瘤细胞的微管具有活性。抗微管剂的实例包括但不限于二萜类化合物和长春花生物碱。
天然来源的二萜类化合物是时相特异性的抗癌剂，其在细胞周期中的G2/M期起作用。认为二萜类化合物使微管的β-微管蛋白亚基稳定是通过与该蛋白结合。然后使蛋白的分解受到抑制，有丝分裂停止，接着发生细胞死亡。二萜类化合物的实例包括但不限于紫杉醇(paclitaxel)及其类似物多西紫杉醇(docetaxel)。
紫杉醇，5β,20-环氧-1,2α,4,7β,10β,13α-六羟基紫杉-11-烯-9-酮4,10-二乙酸酯2-苯甲酸酯13-(2R,3S)-N-苯甲酰基-3-苯基异丝氨酸酯(5β,20-epoxy-1,2α,4,7β,10β,13α-hexa-hydroxytax-ll-en-9-one4,10-diacetate 2-benzoate 13-ester with(2R,3S)-N-benzoyl-3-phenylisoserine)，其是从太平洋紫杉树(Taxus brevifolia)中分离出来的天然二萜产物，且在商业上可得到可注射的溶液其为萜类紫杉烷家族的成员。其在1971年由Wani M.C.，等人，J.Am.Chem.Soc.，93(9)：2325-2327(1971)首次分离出来，并通过化学和X-射线结晶学方法表征其结构。其活性的机理之一是关于紫杉醇能结合微管蛋白，进而抑制癌细胞生长(Schiff P.B.and Horwitz S.B.，Proc.Natl.Acad.Sci.USA，77：1561-1565(1980)；Schiff P.B.，等人，Nature，277：665-667(1979)；Kumar N.，J.Biol.Chem.，256：10435-10441(1981))。有关一些紫杉醇衍生物的合成和抗癌活性的综述，参见:D.G.I.Kingston等,Studies in Oranic Chemistry vol.26,标题为“New Trends in Natural Products Chemistry 1986”,Attaur-Rahman,P.W.LeQuesne,Eds.(Elsevier,Amsterdam,1986)pp 219-235。
在美国，已经批准紫杉醇的临床使用，用于治疗难治的卵巢癌(Markman M.，YaleJ.Biol.Med.，64(6)：583-590(1991)；McGuire W.P.，等人，Ann.Intern.Med.，111(4)：273-279(1989))和用于治疗乳腺癌(Holmes F.A.，等人，J.Natl.Cancer Inst.，83(24)：1797-1805(1991))。其为治疗皮肤癌(Einzig A.I.，et.al.，Cancer Treat.Res.，58：89-100(1991))和头和颈癌(Forastiere A.A.，Semin.Oncol.，20(4Suppl.3)：56-60(1993)的可能的候选药物。该化合物还具有治疗多囊性肾病(Woo D.D.，et.al.，Nature，368(6473)：750-753(1994))、肺癌和疟疾的潜力。采用紫杉醇治疗患者，导致骨髓抑制(IgnoffoR.J.et.al，Cancer Chemotherapy Pocket Guide，(1998))，这与高于阈浓度(50nM)的给药的持续时间有关(Kearns，C.M.，et.al.，Semin.Oncol.，22(3Suppl.6)：16-23(1995))。
多西紫杉醇，5β-20-环氧-1,2α,4,7β,10β,13α-六羟基紫杉-11-烯-9-酮13-(2R,3S)-N-羧基-3-苯基异丝氨酸，N-叔丁基酯，4-乙酸酯2-苯甲酸酯，三水合物((2R,3S)-N-carboxy-3-phenylisoserine,N-tert-butyl ester,13-ester with 5β-20-epoxy-1,2α,4,7β,10β,13α-hexahydroxytax-11-en-9-one 4-acetate 2-benzoate,trihydrate)，是在商业上可得到可注射的溶液多西紫杉醇可用于治疗乳腺癌。多西紫杉醇是适量(q.v.)紫杉醇的半合成衍生物，其利用天然前体即从欧洲紫杉树的针叶中提取的10-去乙酰基浆果赤霉素(baccatin)III制备。多西紫杉醇治疗的主要剂量限制性毒性是嗜中性白细胞减少症。
长春花生物碱是来源于长春花属植物的时相特异性的抗肿瘤药物。长春花生物碱通过特异性地结合微管蛋白而在细胞周期的M期(有丝分裂)起作用。因此，被结合的微管蛋白分子不能聚合成微管。认为有丝分裂在中期被停止，随后细胞死亡。长春花生物碱的实例包括但不限于长春碱，长春新碱和长春瑞滨。
长春碱，长春碱硫酸盐(vincaleukoblastine sulfate)，以注射液市售。尽管已经表明其有可能作为各种实体瘤的二线治疗，但是其最初表明用于治疗睾丸癌和各种淋巴瘤，包括霍奇金病；以及淋巴细胞和组织细胞的淋巴瘤。骨髓抑制是长春碱的剂量限制性副作用。
长春新碱，长春碱22-氧代-硫酸盐(vincaleukoblastine,22-oxo-,sulfate)，以注射溶液市售。长春新碱显示用于治疗急性白血病，还发现在用于霍奇金和非霍奇金恶性淋巴瘤治疗方案中的用途。脱发和神经作用是长春新碱最常见的副作用，并产生较小程度的骨髓抑制和胃肠粘膜炎作用。
长春瑞滨，3',4'-二脱氢-4'-脱氧-C'-去甲长春碱(norvincaleukoblastine)[R-(R*,R*)-2,3-二羟基丁二酸(dihydroxybutanedioate)(1:2)(盐)]，以长春瑞滨酒石酸盐注射溶液市售，是半合成的长春花生物碱。长春瑞滨可作为单独的药物或与其它化学治疗剂(如顺铂)组合，用于治疗各种实体瘤，特别是非小细胞肺癌、晚期乳腺癌和激素难治性前列腺癌。骨髓抑制是长春瑞滨最常见的剂量限制性副作用。
铂配位络合物是非时相特异性的抗癌剂，其与DNA相互作用。铂络合物进入肿瘤细胞，进行水合作用，并与DNA形成链内和链间交联，导致对肿瘤不利的生物学作用。铂配位络合物的实例包括但不限于顺铂和卡铂。
顺铂，顺式-二氨二氯合铂，以注射溶液市售。顺铂最初用于治疗转移性睾丸癌和卵巢癌以及晚期的膀胱癌。顺铂的主要剂量限制性副作用是肾毒性和耳毒性，所述肾毒性可通过水合和利尿来控制。
卡铂，二氨[1,1-环丁烷-二羧酸根(2-)-O,O']合铂，以注射溶液市售。卡铂最初用于晚期卵巢癌的一线和二线治疗。骨髓抑制是卡铂的剂量限制性毒性。
烷基化剂是非时相特异性的抗癌药物和强亲电试剂。通常，烷基化剂借助于烷基化作用，通过DNA分子的亲核部分如磷酸基(phosphate)、氨基、巯基、羟基、羧基和咪唑基，与DNA形成共价键。这种烷基化作用破坏核酸功能，导致细胞死亡。烷基化剂的实例包括但不限于氮芥(如环磷酰胺、美法仑(melphalan)和苯丁酸氮芥)、磺酸烷基酯(如白消安(busulfan)、亚硝基脲如卡莫司汀)，以及三氮烯(如达卡巴嗪(dacarbazine))。
环磷酰胺，2-[双(2-氯乙基)氨基]四氢-2H-1,3,2-氧氮磷环类2-氧化物一水合物，以注射溶液或片剂市售。环磷酰胺可作为单独的药物或与其它化学治疗剂组合，用于治疗恶性淋巴瘤、多发性骨髓瘤和白血病。脱发、恶心、呕吐和白细胞减少症是环磷酰胺最常见的剂量限制性副作用。
美法仑，4-[双(2-氯乙基)氨基]-L-苯基丙氨酸，以注射溶液或片剂市售。美法仑可用于多发性骨髓瘤和不可切除的卵巢上皮癌的姑息疗法。骨髓抑制是美法仑最常见的剂量限制性副作用。
苯丁酸氮芥，4-[双(2-氯乙基)氨基]苯丁酸，以片剂市售。苯丁酸氮芥可用于慢性淋巴细胞性白血病，恶性淋巴瘤(如淋巴肉瘤、巨滤泡性淋巴瘤和霍奇金病)的姑息疗法。骨髓抑制是苯丁酸氮芥最常见的剂量限制性副作用。
白消安，1,4-丁二醇二甲磺酸酯，以片剂市售。白消安用于慢性髓细胞性白血病的姑息疗法。骨髓抑制是白消安最常见的剂量限制性副作用。
卡莫司汀，1,3-[双(2-氯乙基)-1-亚硝基脲，以单瓶装的冻干产物市售。卡莫司汀可作为单独的药物或与其它药物组合，用于脑瘤、多发性骨髓瘤、霍奇金病和非霍奇金淋巴瘤的姑息疗法。延迟的骨髓抑制是卡莫司汀最常见的剂量限制性副作用。
达卡巴嗪，5-(3,3-二甲基-1-三氮亚烷基(triazeno))-咪唑-4-羧酰胺，以单瓶装的产物市售。达卡巴嗪可用于转移性恶性黑素瘤的治疗，并且可与其它药物组合，用于霍奇金病的二线治疗。恶心、呕吐和厌食是达卡巴嗪最常见的剂量限制性副作用。
抗生素类抗癌剂是非时相特异性的药物，其结合或嵌入DNA中。这种作用破坏核酸的正常功能，导致细胞死亡。抗生素类抗肿瘤药物的实例包括但不限于放线菌素(如放线菌素D)；蒽环类(anthrocyclins)(如道诺霉素和多柔比星)；以及博来霉素。
放线菌素D(Dactinomycin，也称为Actinomycin D)，以注射液形式市售。放线菌素D可用于威尔曼瘤(Wi1m's tumor)和横纹肌肉瘤的治疗。恶心、呕吐和厌食是放线菌素D最常见的剂量限制性副作用。
道诺霉素，(8S-顺-)-8-乙酰基-10-[(3-氨基-2,3,6-三脱氧-α-L-来苏-己吡喃糖基(hexopyranosyl))氧基]-7,8,9,10-四氢-6,8,11-三羟基-1-甲氧基-5,12-并四苯二酮(naphthacenedione)盐酸盐，以脂质体可注射形式或可注射形式市售。道诺霉素可在急性非淋巴细胞性白血病和晚期HIV相关的卡波西肉瘤的治疗中用于诱导缓解。骨髓抑制是道诺霉素最常见的剂量限制性副作用。
多柔比星，(8S,10S)-10-[(3-氨基-2,3,6-三脱氧-α-L-来苏-己吡喃糖基)氧基]-8-乙醇酰基-7,8,9,10-四氢-6,8,11-三羟基-1-甲氧基-5,12-并四苯二酮盐酸盐，以或ADRIAMYCIN注射形式市售。多柔比星主要用于急性成淋巴细胞性白血病和急性成髓细胞性白血病的治疗，但也是治疗某些实体瘤和淋巴瘤的有用组分。骨髓抑制是多柔比星最常见的剂量限制性副作用。
博来霉素，是从轮丝链霉菌(streptomyces verticilus)菌株中分离出来的细胞毒素糖肽类抗生素的混合物，以市售。博来霉素可作为单独的药物或与其它药物组合，用于鳞状细胞癌、淋巴瘤和睾丸癌的姑息疗法。肺部和皮肤毒性是博来霉素最常见的剂量限制性副作用。
拓扑异构酶I抑制剂包括，但不限于，喜树碱。认为喜树碱的细胞毒性活性与其拓扑异构酶I抑制活性相关。喜树碱的实例包括，但不限于伊立替康，拓扑替康，和7-(4-甲基哌嗪o-亚甲基)-10,11-亚乙基二氧基-20-喜树碱的各种光学形式。
伊立替康，(4S)-4,11-二乙基-4-羟基-9-[(4-哌啶基哌啶基)羰基氧基]-1H-吡喃并[3',4',6,7]中氮茚并(indolizino)[1,2-b]喹啉-3,14(4H,12H)-二酮盐酸盐，以注射溶液市售。伊立替康是喜树碱的衍生物，其与其活性代谢物SN-38一起结合在拓扑异构酶I-DNA复合物上。认为由于双链不可修复的(irreparable)断裂，导致出现细胞毒性，所述断裂是由拓扑异构酶I:DNA:伊立替康或SN-38三元复合物与复制酶之间的相互作用引起的。伊立替康可用于治疗结肠或直肠的转移癌。伊立替康的剂量限制性副作用是骨髓抑制，包括嗜中性白细胞减少症，以及包括腹泻的GI效应。
托泊替康，(S)-10-[(二甲基氨基)甲基]-4-乙基-4,9-二羟基-1H-吡喃并[3',4',6,7]中氮茚并[1,2-b]喹啉-3,14-(4H,12H)-二酮一盐酸盐，以注射溶液市售。托泊替康是喜树碱的衍生物，其与拓扑异构酶I-DNA复合物结合，并阻止单链断裂的再连接，所述单链断裂是通过拓扑异构酶I响应DNA分子的扭转张力(torsional strain)所引起的。托泊替康用于卵巢转移癌和小细胞肺癌的二线治疗。盐酸托泊替康的剂量限制性副作用是骨髓抑制，主要是嗜中性白细胞减少症。
同样感兴趣的是以下式A’的喜树碱衍生物，目前正在研发，其包括外消旋混合物(R,S)形式以及R和S对映异构体：
已知为化学名“7-(4-甲基哌嗪基-亚甲基)-10,11-亚乙二氧基-20(R,S)-喜树碱(外消旋混合物)或“7-(4-甲基哌嗪基-亚甲基)-10,11-亚乙二氧基-20(R)-喜树碱(R对映异构体)或“7-(4-甲基哌嗪基-亚甲基)-10,11-亚乙二氧基-20(S)-喜树碱(S对映异构体)。该化合物以及相关化合物(包括制备方法)公开在美国专利号6,100,273，6,063,923；5,342,947；5,559,235；和5,491,237中。
拓扑异构酶II抑制剂包括，但不限于，表鬼臼毒素。表鬼臼毒素是来源于曼德拉草(mandrake)植物的时相特异性的抗肿瘤药物。表鬼臼脂毒素通常通过与拓扑异构酶II和DNA形成三元复合物，导致DNA链断裂来影响处于细胞周期的S和G2期的细胞。链断裂积聚，接着细胞死亡。表鬼臼脂毒素的实例包括但不限于依托泊苷(etoposide)和替尼泊苷(teniposide)。
依托泊苷，4'-去甲基-表鬼臼脂毒素9[4,6-0-(R)-亚乙基-β-D-吡喃葡萄糖苷]，以VePESID注射溶液或胶囊市售，并且常称之为VP-16。依托泊苷可作为单独的药物或与其它化疗剂组合，用于治疗睾丸癌和非小细胞肺癌。骨髓抑制是依托泊苷最常见的副作用。白细胞减少症的发生率(incidence)倾向于比血小板减少症的发生率更严重。
替尼泊苷，4'-去甲基-表鬼臼脂毒素9[4,6-0-(R)-噻吩亚甲基-β-D-吡喃葡萄糖苷]，以注射溶液市售，并且通常称之为VM-26。替尼泊苷可作为单独的药物或与其它化疗剂组合，用于治疗儿童急性白血病。骨髓抑制是替尼泊苷最常见的剂量限制性副作用。替尼泊苷可引起白细胞减少症和血小板减少症。
抗代谢肿瘤药物是时相特异性的抗肿瘤药物，其作用于细胞周期的S期(DNA合成)，通过抑制DNA的合成，或者通过抑制嘌呤或嘧啶碱基的合成进而限制DNA的合成。因此，S期不能继续下去，接着细胞死亡。抗代谢类抗肿瘤药物的实例包括但不限于氟尿嘧啶、甲氨蝶呤、阿糖胞苷、巯基嘌呤、硫鸟嘌呤，以及吉西他滨。
5-氟尿嘧啶，5-氟-2,4-(1H,3H)嘧啶二酮，以氟尿嘧啶市售。5-氟尿嘧啶的施用导致胸苷酸合成的抑制，并且还掺入到RNA和DNA中。结果通常是细胞死亡。5-氟尿嘧啶可作为单独的药物或与其它化疗剂组合，用于治疗乳腺癌、结肠癌、直肠癌、胃癌和胰腺癌。骨髓抑制和粘膜炎是5-氟尿嘧啶的剂量限制性副作用。其它的氟嘧啶类似物包括5-氟脱氧尿嘧啶核苷(氟尿苷)和5-氟脱氧尿嘧啶核苷一磷酸。
甲氨蝶呤，N-[4[[(2,4-二氨基-6-蝶啶基(pteridinyl))甲基]甲基氨基]苯甲酰基]-L-谷氨酸，以甲氨蝶呤钠市售。甲氨蝶呤在S期具有细胞时相特异性作用，其通过抑制合成嘌呤核苷酸和胸苷酸所需的二氢叶酸还原酶来抑制DNA的合成、修复和/或复制。甲氨蝶呤可作为单独的药物或与其它化疗剂组合，用于治疗绒毛膜癌、脑膜白血病、非霍奇金淋巴瘤，以及乳腺癌、头癌、颈癌、卵巢癌和膀胱癌。预期骨髓抑制(白细胞减少症、血小板减少症和贫血)和粘膜炎是施用甲氨蝶呤的副作用。
阿糖胞苷，4-氨基-1-β-D-阿糖呋喃糖-2(1H)-嘧啶酮，以市售，并且通常称之为Ara-C。认为阿糖胞苷在S-期具有细胞时相特异性，其通过将阿糖胞苷末端掺入到生长的DNA链中而抑制DNA链的延长。阿糖胞苷作为单独的药物或与其它化疗剂组合，用于治疗急性白血病。其它的胞苷类似物包括5-氮杂胞苷和2',2'-二氟脱氧胞苷(吉西他滨)。阿糖胞苷引起白细胞减少症、血小板减少症和粘膜炎。
巯基嘌呤，1,7-二氢-6H-嘌呤-6-硫酮一水合物，以市售。巯基嘌呤在S期通过至今尚未清楚的机理抑制DNA的合成具有细胞时相特异性。巯基嘌呤可作为单独的药物或与其它化疗剂组合，用于治疗急性白血病。预期骨髓抑制和胃肠粘膜炎是高剂量巯基嘌呤的副作用。可使用的巯基嘌呤类似物是硫唑嘌呤(azathioprine)。
硫鸟嘌呤，2-氨基-1,7-二氢-6H-嘌呤-6-硫酮，以市售。硫鸟嘌呤在S期通过至今尚未清楚的机理抑制DNA的合成具有细胞时相特异性。硫鸟嘌呤可作为单独的药物或与其它化疗剂组合，用于治疗急性白血病。骨髓抑制，包括白细胞减少症、血小板减少症和贫血是施用硫鸟嘌呤最常见的剂量限制性副作用。然而，还发生胃肠副作用，而且该副作用可能是剂量限制性的。其它的嘌呤类似物包括喷司他丁(pentostatin)、赤式羟基壬基腺嘌呤(erythrohydroxynonyladenine)、磷酸氟达拉滨和克拉屈滨。
吉西他滨，2'-脱氧-2',2'-二氟胞苷一盐酸盐(β-异构体)，以市售。吉西他滨通过阻断细胞通过G1/S边界的发展在S期具有细胞时相特异性。吉西他滨可与顺铂组合，用于治疗局部的晚期非小细胞肺癌，也可以单独地用于治疗局部的晚期胰腺癌。骨髓抑制(包括白细胞减少症、血小板减少症和贫血)是施用吉西他滨最常见的剂量限制性副作用。
激素和激素类似物为治疗癌症有用的化合物，其中激素和癌症的生长和/或缺少生长之间存在关系。用于治疗癌症的激素和激素类似物的实例包括，但不限于，肾上腺皮质类固醇类(例如强的松和氢化波尼松)，其用于治疗儿童的恶性淋巴瘤和急性白血病；氨鲁米特和其它芳香酶抑制剂(例如阿那曲唑(anastrozole)、来曲唑、vorazole和依西美坦(exemestane))，其用于治疗肾上腺皮质癌和包含雌激素受体的激素依赖性乳腺癌；孕酮(例如醋酸甲地孕酮)，其用于治疗激素依赖性乳腺癌和子宫内膜癌；雌激素、雄激素以及抗雄激素(例如氟他胺、尼鲁米特、比卡鲁胺、醋酸环丙孕酮)和5α-还原酶(例如非那雄胺(finasteride)和度他雄胺(dutasteride))，其用于治疗前列腺癌和良性前列腺肥大；抗雌激素(例如他莫昔芬、托瑞米芬、雷洛昔芬、屈洛昔芬、iodoxyfene(tamoxifen,toremifene,raloxifene,droloxifene,iodoxyfene)，以及美国专利5,681,835、5,877,219和6,207,716中公开的选择性雌激素受体调节剂(SERMS)，其用于治疗激素依赖性乳腺癌和其它易发性癌症；以及促性腺素-释放激素(GnRH)及其类似物，其刺激黄体化激素(LH)和/或促卵泡激素(FSH)的释放，用于治疗前列腺癌，例如，LHRH激动剂和拮抗剂，例如醋酸戈舍瑞林(goserelin acetate)和luprolide。
信号转导途径抑制剂为阻断或抑制引起细胞内变化的化学过程的那些抑制剂。本文所用的该变化为细胞增殖或分化。用于本发明的信号传导抑制剂包括但不限于受体酪氨酸激酶、非-受体酪氨酸激酶、SH2/SH3域阻断剂、丝氨酸/苏氨酸激酶、磷脂酰肌醇-3激酶、肌醇信号传导，以及Ras癌基因的抑制剂。
几种蛋白酪氨酸激酶催化细胞生长的调节中涉及的多种蛋白中的特定酪胺酰残基的磷酸化。该蛋白酪氨酸激酶可以大致分类为受体或非-受体激酶。
受体酪氨酸激酶为跨膜蛋白，其具有胞外配体结合域、跨膜域，以及酪氨酸激酶域。受体酪氨酸激酶涉及细胞生长的调节，并通常称为生长因子受体。许多这些激酶的不合适的或不受控制的活化，即异常激酶生长因子受体活性(例如通过过表达或突变)，已经显示出导致不受控制的细胞生长。因此，这类激酶的异常活性已经与恶性组织生长联系起来。因此，这类激酶的抑制剂可以提供癌症治疗方法。生长因子受体包括，例如，表皮生长因子受体(EGFr)、血小板衍生生长因子受体(PDGFr)、erbB2、erbB4、血管内皮生长因子受体(VEGFR)、具有免疫球蛋白-样和表皮生长因子同源性域的酪氨酸激酶(TIE-2)、胰岛素生长因子-I(IGFI)受体、巨噬细胞集落刺激因子(Cfms)、BTK、ckit、cmet、成纤维细胞生长因子(FGF)受体、Trk受体(TrkA、TrkB和TrkC)、ephrin(eph)受体，以及RET原癌基因。生长受体的多种抑制剂处于研发之中，包括配体拮抗剂、抗体、酪氨酸激酶抑制剂和反义寡核苷酸。生长因子受体和抑制生长因子受体功能的药剂公开在，例如，Kath J.C.，Exp.Opin.Ther.Patents，10(6):803-818(2000)；Shawver L.K.，等人，DrugDiscov.Today，2(2)：50-63(1997)；和Lofts，F.J.和Gullick W.J.，“Growth factorreceptors as targets.”in New Molecular Targets for Cancer Chemotherapy，KerrD.J.和Workman P.(editors)，(1994年6月27日)，CRC Press中。生长因子受体抑制剂的非限制性实例包括帕唑帕尼和索拉非尼。
帕唑帕尼，5-[[4-[(2,3-二甲基-2H-吲唑-6-基)甲基氨基]-2-嘧啶基]氨基]-2-甲基苯磺酰胺，为VEGFR抑制剂且可作为片剂商购。帕唑帕尼公开且受保护于国际申请号PCT/US01/49367，国际申请日为2001年12月19日，国际公开号WO02/059110且国际公开日为，2002年8月1日，其整个公开在此引入作为参考。帕唑帕尼指示用于治疗晚期肾细胞癌和晚期软组织肉瘤。3级疲劳和高血压是帕唑帕尼最常见的剂量限制副作用。
索拉非尼，4-[4-[[4-氯-3-(三氟甲基)苯基]氨基甲酰基氨基]苯氧基]-N-甲基-吡啶-2-甲酰胺，为多激酶抑制剂，且可作为片剂商购。索拉非尼指示用于治疗肾细胞癌、肝细胞癌和某些分化型甲状腺癌。
酪氨酸激酶，其不是生长因子受体激酶，称为非受体酪氨酸激酶。用于本发明的作为抗癌药物靶标(target)或潜在靶标的非受体酪氨酸激酶包括cSrc、Lck、Fyn、Yes、Jak、cAbl、FAK(黏着斑激酶)、Brutons酪氨酸激酶、及Bcr-Abl。有关这种非受体激酶和抑制非受体酪氨酸激酶功能的药物的描述，参见Sinha S.和Corey S.J.，J.Hematother.Stem CellRes.,8(5)：465-480(2004)和Bolen，J.B.，Brugge，J.S.，Annu.Rev.Immunol.，15：371-404(1997)。
SH2/SH3域阻断剂是破坏结合于各种酶或衔接蛋白(adaptor proteins)中的SH2或SH3域的药物，所述酶或衔接蛋白包括PI3-K p85亚单元、Src家族激酶、衔接分子(Shc、Crk、Nck、Grb2)、及Ras-GAP。有关SH2/SH3域作为抗癌药物靶标的论述，参见SmithgallT.E.，J.Pharmacol.Toxicol.Methods，34(3)：125-32(1995)。
丝氨酸/苏氨酸激酶的抑制剂包括但不限于MAP激酶级联阻断剂，其包括Raf激酶(rafk)、促分裂原或细胞外调节激酶(MEK)和细胞外调节激酶(ERK)的阻断剂；蛋白激酶C家族成员阻断剂，包括PKC(α、β、γ、ε、μ、λ、ι、ζ)阻断剂；IkB激酶(IKKa，IKKb)；PKB家族激酶；AKT激酶家族成员；TGFβ受体激酶；以及雷帕霉素(mTOR)抑制剂的哺乳动物靶标，包括但不限于雷帕霉素(FK506)和rapalogs、RAD001或依维莫司(Afinitor)、CCI-779或替西罗莫司、AP23573、AZD8055、WYE-354、WYE-600、WYE-687和Pp121。丝氨酸/苏氨酸激酶抑制剂的实例包括但不限于曲美替尼、达拉菲尼和Akt抑制剂afuresertib和N-{(1S)-2-氨基-1-[(3,4-二氟苯基)甲基]乙基}-5-氯-4-(4-氯-1-甲基-1H-吡唑-5-基)-2-呋喃甲酰胺。
曲美替尼，N-{3-[3-环丙基-5-(2-氟-4-碘-苯基氨基)-6,8-二甲基-2,4,7-三氧代-3,4,6,7-四氢-2H-吡啶并[4,3-d]嘧啶-1-基]苯基}乙酰胺，为MEK抑制剂且可作为片剂商购。曲美替尼公开且受保护于国际申请号PCT/JP2005/011082，国际申请日为2005年6月10日；国际公开号WO 2005/121142且国际公开日为2005年12月22日，其整个公开在此引入作为参考。曲美替尼指示用于治疗一些不可切除的或转移性黑素瘤。
达拉菲尼，N-{3-[5-(2-氨基-4-嘧啶基)-2-(1,1-二甲基乙基)-1,3-噻唑-4-基]-2-氟苯基}-2,6-二氟苯磺酰胺，为B-Raf抑制剂且可作为胶囊商购。达拉菲尼公开且受保护于国际申请号PCT/US2009/042682，国际申请日为2009年5月4日，其整个公开在此引入作为参考。达拉菲尼指示用于治疗一些不可切除的或转移性黑素瘤。
Afuresertib，N-{(1S)-2-氨基-1-[(3-氟苯基)甲基]乙基}-5-氯-4-(4-氯-1-甲基-1H-吡唑-5-基)-2-噻吩甲酰胺或其药学上可接受的盐，为Akt抑制剂，且公开且受保护于国际申请号PCT/US2008/053269，国际申请日为2008年2月7日；国际公开号WO 2008/098104且国际公开日为2008年8月14日，其整个公开在此引入作为参考。Afuresertib可按照国际申请号PCT/US2008/053269所述制备。
N-{(1S)-2-氨基-1-[(3,4-二氟苯基)甲基]乙基}-5-氯-4-(4-氯-1-甲基-1H-吡唑-5-基)-2-呋喃甲酰胺或其药学上可接受的盐，为Akt抑制剂，且公开且受保护于国际申请号PCT/US2008/053269，国际申请日为2008年2月7日；国际公开号WO 2008/098104且国际公开日为2008年8月14日，其整个公开在此引入作为参考。N-{(1S)-2-氨基-1-[(3,4-二氟苯基)甲基]乙基}-5-氯-4-(4-氯-1-甲基-1H-吡唑-5-基)-2-呋喃甲酰胺可按照国际申请号PCT/US2008/053269所述制备。
包括PI3-激酶、ATM、DNA-PK和Ku的阻断剂的磷脂酰肌醇3-激酶家族成员的抑制剂也可用于本发明。这些激酶在Abraham R.T.,Curr.Opin.Immunol.,8(3):412-418(1996)；Canman C.E.,and Lim D.S.,Oncogene,17(25):3301-3308(1998)；Jackson S.P.,Int.J.Biochem.Cell Biol.,29(7):935-938(1997)；和Zhong H.,等人,Cancer Res.,60(6):1541-1545(2000)中讨论。
在本发明中也有用的是肌醇信号传导抑制剂，例如磷脂酶C阻断剂和肌醇类似物。此类信号抑制剂描述于New Molecular Targets for Cancer Chemotherapy中的Powis G.和Kozikowski A.,“Inhibitors of Myo-Inositol Signaling.”,Kerr D.J.和Workman P.(编辑),(1994年6月27日),CRC Press。
另一组信号转导途径抑制剂是Ras癌基因的抑制剂。此类抑制剂包括法呢基转移酶、香叶基-香叶基转移酶和CAAX蛋白酶的抑制剂以及反义寡核苷酸、核酶和其他免疫疗法。已经显示这种抑制剂阻断含有野生型突变体ras的细胞中的ras活化，从而起到抗增殖剂的作用。Ras致癌基因抑制在Scharovsky O.G.等人，J.Biomed.Sci.，7(4)：292-298(2000)；Ashby M.N.，Curr.Opin.Lipidol.，9(2)：99-102(1998)；和Bennett C.F.andCowsert L.M.，Biochim.Biophys.Acta.，1489(1)：19-30(1999)中讨论。
受体激酶配体结合的拮抗剂也可作为信号转导抑制剂。该类信号转导途径抑制剂包括使用人源化抗体或受体酪氨酸激酶的细胞外配体结合结构域的其它拮抗剂。受体激酶配体结合的抗体或其它拮抗剂的实例包括，但不限于，西妥昔单抗曲妥单抗曲妥单抗emtansine帕妥珠单抗ErbB抑制剂，包括拉帕替尼、埃罗替尼和吉非替尼；和2C3VEGFR2特异性抗体(参见Brekken R.A.，等人，癌症Res.，60(18)：5117-5124(2000))。
西妥昔单抗为嵌合小鼠人抗体，其可作为商购。西妥昔单抗抑制表皮生长因子受体(EGFR)。西妥昔单抗与放射治疗的组合指示用于治疗头与颈的鳞状上皮细胞癌，且还指示用于治疗一些结肠直肠癌。
曲妥单抗为人源化单克隆抗体，其可作为商购。曲妥单抗结合至HER2(也称为ErbB2)受体。曲妥单抗的最初适应症为HER2阳性乳腺癌。
曲妥单抗emtansine为抗体-药物缀合物，由连接至细胞毒素剂emtansine(DM1)的单克隆抗体曲妥单抗组成，且可作为可注射溶液商购。曲妥单抗emtansine指示用于治疗一些HER2-阳性转移性乳腺癌。
帕妥珠单抗为单克隆抗体，其可作为商购。帕妥珠单抗为HER二聚抑制剂，结合至HER2以抑制其与其它HER受体的二聚化，认为其导致缓慢的肿瘤生长。帕妥珠单抗指示与曲妥单抗和多西紫杉醇组合用于治疗一些HER2-阳性转移性乳腺癌。
拉帕替尼，N-(3-氯-4-{[(3-氟苯基)甲基]氧基}苯基)-6-[5-({[2-(甲基磺酰基)乙基]氨基}甲基)-2-呋喃基]-4-喹唑啉胺为ErbB-1和ErbB-2(EGFR和HER2)酪氨酸激酶的双重抑制剂，且可作为片剂商购。拉帕替尼指示与卡培他滨组合用于治疗HER2-阳性转移性乳腺癌。
埃罗替尼，N-(3-乙炔基苯基)-6,7-双{[2-(甲基氧基)乙基]氧基}-4-喹唑啉胺，为ErbB抑制剂，且可作为片剂商购。埃罗替尼指示与吉西他滨组合用于治疗一些局部晚期或转移性非小细胞肺癌，和用于治疗一些局部晚期不可切除的或转移性胰腺癌。
吉非替尼，N-(3-氯-4-氟-苯基)-7-甲氧基-6-(3-吗啉-4-基丙氧基)喹唑啉-4-胺，为ErbB-1抑制剂，且可作为片剂商购。吉非替尼指示作为单一治疗用于在基于铂的化疗和多西紫杉醇化疗都失败后治疗具有晚期或转移性非小细胞肺癌的患者。
非受体激酶血管生成抑制剂也可用于本发明。与血管生成有关的VEGFR和TIE2抑制剂，已在上面关于信号转导抑制剂中讨论过(二者的受体均为受体酪氨酸激酶)。血管生成通常与erbB2/EGFR信号传导相关联，因为已经表明erbB2和EGFR的抑制剂抑制血管生成，主要是VEGF的表达。因此，非受体酪氨酸激酶抑制剂可与本发明的EGFR/erbB2抑制剂组合。例如，抗-VEGF抗体不能识别VEGFR(受体酪氨酸激酶)，但却与配体结合；整联蛋白(αvβ3)的小分子抑制剂会抑制血管生成；也证实了内皮抑制素和血管生成抑制素(非-RTK)可与公开的化合物组合使用(参见Bruns C.J.，等人，癌症Res.，60(11)：2926-2935(2000)；Schreiber A.B.，等人，Science，232(4755)：1250-1253(1986)；Yen L.，等人，致癌基因，19(31)：3460-3469(2000))。
免疫治疗方法中使用的药物也可用于式(I)的化合物组合。有许多免疫策略，以对erbB2或EGFR产生免疫反应。这些策略一般属于肿瘤疫苗接种领域。通过用小分子抑制剂组合抑制erbB2/EGFR信号传递途径，可以大大地增强免疫方法的疗效。有关抗erbB2/EGFR的免疫/肿瘤疫苗方法的讨论，参见Reilly R.T.，等人，Cancer Res.，60(13)：3569-3576(2000)；和Chen Y.，等人，癌症Res.，58(9)：1965-1971(1998)。
用于促细胞凋亡方法的药物(例如Bcl-2反义寡核苷酸)也可用于本发明的组合。蛋白质的Bcl-2家族的成员阻断细胞凋亡。因此，Bcl-2的上调与药物抗性相联系。研究表明，表皮生长因子(EGF)刺激Bcl-2家族的抗细胞凋亡成员(即Mcl-1)。因此，设计下调Bcl-2在肿瘤中的表达的策略已经证实在临床上是有益的。有关这种利用Bcl-2的反义寡核苷酸促细胞凋亡的策略的讨论，参见Waters J.S.，等人，J.Clin.Oncol.，18(9)：1812-1823(2000)；和Kitada S.，等人，Antisense Res.Dev.，4(2)：71-79(1994)。
细胞周期信号抑制剂抑制细胞周期控制中所涉及的分子。称作细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶(CDK)的蛋白激酶家族，及其与称作细胞周期蛋白的蛋白质家族的相互作用，通过真核细胞周期控制细胞发展。对于通过细胞周期的正常细胞发展而言，不同细胞周期蛋白/CDK复合物的协同活化和钝化是必要的。若干细胞周期信号抑制剂正在开发中。例如，包括CDK2、CDK4和CDK6的细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶及其抑制剂的实例，可参见例如，Rosania G.R.和Chang Y.T.，Exp.Opin.Ther.Patents，10(2)：215-230(2000)。此外，p21WAF1/CIP1已被描述为细胞周期蛋白依赖性激酶(Cdks)的有效且通用的抑制剂(BallK.L.，Prog.Cell Cycle Res.，3：125-134(1997))。已知诱导p21WAF1/CIP1表达的化合物涉及抑制细胞增殖和具有肿瘤抑制活性(Richon V.M.，等人，Proc.Natl.Acad.Sci.USA，97(18)：10014-10019(2000))，并作为细胞周期信号传导抑制剂包括在内。组蛋白去乙酰化酶(HDAC)抑制剂涉及p21WAF1/CIP1的转录激活(Vigushin D.M.，and Coombes R.C.，Anticancer Drugs，13(1)：1-13(2002))，并且是用于本文的组合的合适细胞周期信号传导抑制剂。此类HDAC抑制剂的实例包括但不限于伏立诺他、罗米地辛、帕比司他、丙戊酸和mocetinostat。
伏立诺他，N-羟基-N'-苯基-辛烷二酰胺，为HDAC抑制剂，且可作为胶囊商购。伏立诺他指示用于治疗皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)。
罗米地辛，(1S,4S,7Z,10S,16E,21R)-7-亚乙基-4,21-二(丙-2-基)-2-氧杂-12,13-二硫杂-5,8,20,23-四氮杂双环[8.7.6]二十三-16-烯-3,6,9,19,22-戊酮，为HDAC抑制剂，且可作为可注射的溶液商购。罗米地辛指示用于治疗CTCL。
帕比司他，(2E)-N-羟基-3-[4-({[2-(2-甲基-1H-吲哚-3-基)乙基]氨基}甲基)苯基]丙烯酰胺，为非选择性HDAC抑制剂，且可作为胶囊商购。帕比司他，与硼替佐米和地塞米松组合，指示用于治疗多发性骨髓瘤。
丙戊酸，2-丙基戊酸，为HDAC抑制剂，且可尤其作为胶囊商购。丙戊酸指示作为单一治疗和辅助治疗以用于治疗一些癫痫发作且已探索用于治疗多种癌症。
Mocetinostat，N-(2-氨基苯基)-4-[[(4-吡啶-3-基嘧啶-2-基)氨基]甲基]苯甲酰胺，为苯甲酰胺HDAC抑制剂。Mecetinostat目前经历临床试验以用于治疗多种癌症。
蛋白酶体抑制剂是阻断蛋白酶体作用的药物，是分解蛋白质的细胞复合物，如p53蛋白。几种蛋白酶体抑制剂已经上市或正在研究用于治疗癌症。适用于本文的组合的蛋白酶体抑制剂包括但不限于硼替佐米、双硫仑、表没食子儿茶素没食子酸酯、salinosporamide A和卡非佐米。
硼替佐米，[(1R)-3-甲基-1-({(2S)-3-苯基-2-[(吡嗪-2-基羰基)氨基]丙酰基}氨基)丁基]硼酸，为蛋白酶体抑制剂，且可作为可注射的溶液商购。硼替佐米指示用于治疗多发性骨髓瘤和套细胞淋巴瘤。
双硫仑，1,1',1”,1”'-[二硫烷二基二(硫代甲酰基次氮基)]四乙烷，可作为片剂商购。双硫仑指示作为助剂以在选择的慢性酒精患者中控制节酒。当双硫仑与金属复合形成二硫代氨基甲酸酯复合物时，其为蛋白酶体抑制剂，且该二硫代氨基甲酸酯复合物已探索用于治疗多种癌症(Cheriyan V.T.，等人，PLoS One，9(4)：e93711(2014))。
表没食子儿茶精没食子酸酯(EGCG)，[(2R,3R)-5,7-二羟基-2-(3,4,5-三羟基苯基)色满-3-基]3,4,5-三羟基苯甲酸酯，为茶叶中最丰富的儿茶素，且为蛋白酶体抑制剂。EGCG已探索用于治疗多种癌症(Yang H.，等人，Curr.Cancer Drug Targets，11(3)：296-306(2011))。
Salinosporamide A，(4R,5S)-4-(2-氯乙基)-1-((1S)-环己-2-烯基(羟基)甲基)-5-甲基-6-氧杂-2-氮杂双环[3.2.0]庚烷-3,7-二酮，也称为marizomib，为蛋白酶体抑制剂。Salinosporamide A已探索用于治疗多种癌症。
卡非佐米，(2S)-4-甲基-N-[(2S)-1-[[(2S)-4-甲基-1-[(2R)-2-甲基氧杂环丙烷-2-基]-1-氧代戊-2-基]氨基]-1-氧代-3-苯基丙-2-基]-2-[[(2S)-2-[(2-吗啉-4-基乙酰基)氨基]-4-苯基丁酰基]氨基]戊酰胺，为选择性蛋白酶体抑制剂，且可作为可注射的溶液商购。卡非佐米指示用于治疗某些多发性骨髓瘤。
70千道尔顿热休克蛋白(Hsp70s)和90千道尔顿热休克蛋白(Hsp90s)是普遍表达的热休克蛋白家族。Hsp70s和Hsp90s过度表达某些癌症类型。正在研究几种Hsp70和Hsp90抑制剂用于治疗癌症。用于本文组合的Hsp70和Hsp90抑制剂的实例包括但不限于坦螺旋霉素和根赤壳菌素。
坦螺旋霉素，17-N-烯丙基氨基-17-de甲氧基格尔德霉素，为抗生素格尔德霉素的衍生物，且为Hsp90抑制剂。坦螺旋霉素已探索用于治疗多种癌症。
根赤壳菌素，[1aS-(1aR*,2Z,4E,14*,15aR*)]-8-氯-1a,14,15,15a-四氢-9,11-二羟基-14-甲基-6H-oxireno[e][2]苯并氧杂环十四(benzoxacyclotetradecin)-6，12(7H)-二酮，也称为单孢菌素，为Hsp90抑制剂。根赤壳菌素已探索用于治疗多种癌症。
许多肿瘤细胞显示出与正常组织明显不同的代谢。例如，糖酵解的速率(将葡萄糖转化为丙酮酸的代谢过程)增加，并且产生的丙酮酸被还原为乳酸，而不是通过三羧酸(TCA)循环在线粒体中进一步氧化。即使在有氧条件下也经常看到这种效应，并且被称为Warburg效应。
乳酸脱氢酶A(LDH-A)是肌肉细胞中表达的乳酸脱氢酶的同种型，通过将丙酮酸还原成乳酸(然后可以将其输出细胞)，在肿瘤细胞代谢中起关键作用。该酶已被证明在许多肿瘤类型中被上调。Warburg效应中描述的葡萄糖代谢的改变对于癌细胞的生长和增殖是至关重要的，并且已经显示使用RNA-i敲低LDH-A导致异种移植物模型中细胞增殖和肿瘤生长的减少(Tennant D.A.，等人，Nat.Rev.Cancer，10(4)：267-277(2010)；Fantin V.R.，等人，Cancer Cell，9(6)：425-434(2006))。
已经在癌症前体病变中发现了高水平的脂肪酸合酶(FAS)。FAS的药理学抑制影响癌症发展和维持中涉及的关键癌基因的表达。Alli P.M.，等人，Oncogene，24(1)：39-46(2005)。
癌症代谢的抑制剂，包括LDH-A的抑制剂和脂肪酸生物合成的抑制剂(或FAS抑制剂)，适合在本文中组合使用。
癌症基因治疗涉及使用病毒或非病毒基因递送载体选择性转移重组DNA/RNA以修改癌症细胞以用于治疗目的。癌症基因疗法的实例包括但不限于自杀和溶瘤细胞基因疗法，以及过继性T细胞疗法。
用于与本发明方法或组合进行组合或共同给药的其他一种或多种活性成分(抗肿瘤剂)的其他实例为CD20的抗体或其它拮抗剂、类维生素A、或其它激酶抑制剂。该抗体或拮抗剂的实例包括，但不限于利妥昔单抗(和)、奥伐木单抗和贝沙罗汀
利妥昔单抗为嵌合单克隆抗体，其可作为和商购。利妥昔单抗结合至B细胞上的CD20且引起细胞凋亡。利妥昔单抗静脉内给药且批准用于治疗类风湿性关节炎和B-细胞非霍奇金淋巴瘤。
奥伐木单抗为完全人单克隆抗体，其可作为商购。奥伐木单抗结合至B细胞上的CD20且用于在对用氟达拉滨和阿仑单抗的治疗难治的成人中治疗慢性淋巴细胞性白血病CLL；一种白细胞癌症)。
贝沙罗汀，4-[1-(5,6,7,8-四氢-3,5,5,8,8-五甲基-2-萘基)乙烯基]苯甲酸，可作为胶囊商购。贝沙罗汀为选择性激活类维生素A X受体(RXRs)的类维生素A的子集成员。这些类维生素A受体具有与视黄酸受体(RARs)不同的生物活性。贝沙罗汀指示用于治疗某些CTCL。
用于与本发明方法或组合进行组合或共同给药的其他一种或多种活性成分(抗肿瘤剂)的其他实例为Toll-样受体4(TLR4)拮抗剂。
已知磷酸氨基烷基氨基葡萄糖苷(AGP)可用作疫苗佐剂和免疫刺激剂，用于刺激细胞因子产生，激活巨噬细胞，促进先天免疫应答，并增强免疫动物中的抗体产生。磷酸氨基烷基氨基葡萄糖苷(AGP)是Toll-样受体4(TLR4)的合成配体。通过TLR4的AGP及其免疫调节作用在专利公开中公开，例如WO 2006016997、WO 2001090129和/或美国专利No.6,113,918，并且已在文献中报道。另外的AGP衍生物公开在美国专利号7,129,219、美国专利号6,911,434和美国专利号6,525,028中。某些AGP充当TLR4的激动剂，而其他AGP被认为是TLR4拮抗剂。
用于与本发明方法或组合进行组合的选择的抗肿瘤剂包括但不限于：阿巴瑞克、abemaciclib、阿比特龙、阿法替尼、阿柏西普、aldoxorubicin、阿雷替尼、阿仑单抗、三氧化二砷、门冬酰胺酶、阿西替尼、AZD-9291、贝利司他、苯达莫司汀、贝伐单抗、博纳吐单抗、博舒替尼、维汀-布仑妥昔单抗、卡巴他赛、卡博替尼、卡培他滨、色瑞替尼、氯法拉滨、考比替尼、克唑替尼、达雷木单抗、达沙替尼、地加瑞克、狄诺塞麦、地努图希单抗、多西紫杉醇、埃罗妥珠单抗、恩替诺特、恩杂鲁胺、表柔比星、艾日布林、非格司亭、氟马替尼、氟维司群、呋喹替尼、吉妥珠单抗奥佐米星、替伊莫单抗、依鲁替尼、艾代拉里斯、伊马替尼、伊立替康、伊沙匹隆、艾沙佐米、来那度胺、乐伐替尼、甲酰四氢叶酸、氮芥、耐昔妥珠单抗、奈拉滨、奈妥吡坦、尼洛替尼、奥妥珠单抗、奥拉帕尼、高三尖杉酯碱、奥西替尼、奥沙利铂、紫杉醇、帕博西尼、帕洛诺司琼、帕尼单抗、培非格司亭、聚乙二醇干扰素α-2b、培美曲塞、普乐沙福、泊马度胺、帕纳替尼、普拉曲沙、奎扎替尼、镭-223、雷莫芦单抗、瑞戈非尼、罗拉匹坦、瑞卡帕布、西普鲁塞-T、索尼吉布、舒尼替尼、talimogene laherparepvec、tipiracil、拓扑替康、曲贝替定、三氟尿苷、曲普瑞林、尿苷、凡德他尼、velaparib、威罗菲尼、维奈妥拉、长春新碱、维莫德吉和唑来膦酸。
实施例
以下实施例示出本发明的多个非限制性方面。
实施例1
精氨酸甲基化和PRMT
精氨酸甲基化是对参与多种细胞过程的蛋白质的重要翻译后修饰，例如基因调控、RNA加工、DNA损伤应答和信号转导。含有甲基化精氨酸的蛋白质存在于细胞核和胞质组分中，这表明催化甲基转移到精氨酸上的酶也存在于这些亚细胞腔隙中(综述于Yang,Y.&Bedford,M.T.Protein arginine methyltransferases and cancer.Nat Rev Cancer13,37-50,doi:10.1038/nrc3409(2013)；Lee,Y.H.&Stallcup,M.R.Minireview:proteinarginine methylation of nonhistone proteins in transcriptional regulation.MolEndocrinol23,425-433,doi:10.1210/me.2008-0380(2009))。在哺乳动物细胞中，甲基化精氨酸以三种主要形式存在：ω-NG-单甲基-精氨酸(MMA)、ω-NG,NG-不对称二甲基精氨酸(ADMA)或ω-NG,N’G-对称的二甲基精氨酸(SDMA)。每种甲基化状态都可以以不同方式影响蛋白质-蛋白质相互作用，因此有可能为底物的生物活性赋予不同的功能性后果(Yang,Y.&Bedford,M.T.Protein arginine methyltransferases and cancer.Nat Rev Cancer13,37-50,doi:10.1038/nrc3409(2013))。
精氨酸甲基化主要在富含甘氨酸、精氨酸(GAR)基序的情况下通过蛋白质精氨酸甲基转移酶(PRMT)家族的活性发生，所述蛋白质精氨酸甲基转移酶将甲基从S-腺苷-L-甲硫氨酸(SAM)转移至底物精氨酸侧链，产生S-腺苷-高半胱氨酸(SAH)和甲基化精氨酸(图1)。该蛋白质家族由10个成员组成，其中9个已被证明具有酶活性(Bedford,M.T.&Clarke,S.G.Protein arginine methylation in mammals:who,what,and why.Mol Cell33,1-13,doi:10.1016/j.molcel.2008.12.013(2009))。根据酶促反应的产物，PRMT家族分为四种亚型(I-IV型)(图1)。IV型酶甲基化内部胍基氮并且仅在酵母中描述(Fisk,J.C.&Read,L.K.Protein arginine methylation in parasitic protozoa.Eukaryot Cell10,1013-1022,doi:10.1128/EC.05103-11(2011))；类型I-III酶通过单一甲基化事件产生单甲基-精氨酸(MMA，Rme1)。MMA中间体被认为是相对低丰度的中间体，然而，PRMT7的主要III型活性的选择底物可以保持单甲基化，而I型和II型酶分别催化从MMA向不对称二甲基精氨酸(ADMA，Rme2a)或对称的二甲基精氨酸(SDMA，Rme2s)的进展。II型PRMT包括PRMT5和PRMT9，然而，PRMT5是负责形成对称二甲基化的主要酶。I型酶包括PRMT1、PRMT3、PRMT4、PRMT6和PRMT8。PRMT1、PRMT3、PRMT4和PRMT6普遍表达，而PRMT8主要限于脑(综述于Bedford,M.T.&Clarke,S.G.Protein arginine methylation in mammals:who,what,and why.MolCell33,1-13,doi:10.1016/j.molcel.2008.12.013(2009))。
PRMT1是主要的1型酶，能够在许多细胞底物上催化MMA和ADMA的形成(Bedford,M.T.&Clarke,S.G.Protein arginine methylation in mammals:who,what,and why.MolCell33,1-13,doi:10.1016/j.molcel.2008.12.013(2009))。在许多情况下，PRMT1依赖性ADMA修饰是其底物的生物活性和运输所必需的(Nicholson,T.B.,Chen,T.&Richard,S.Thephysiological and pathophysiological role of PRMT1-mediated protein argininemethylation.Pharmacol Res60,466-474,doi:10.1016/j.phrs.2009.07.006(2009))，且PRMT1的活性占细胞ADMA水平的～85％(Dhar,S.等人Loss of the major Type Iarginine methyltransferase PRMT1 causes substrate scavenging by otherPRMTs.Sci Rep3,1311,doi:10.1038/srep01311(2013)；Pawlak,M.R.,Scherer,C.A.,Chen,J.,Roshon,M.J.&Ruley,H.E.Arginine N-methyltransferase 1 is required forearly postimplantation mouse development,but cells deficient in the enzymeare viable.Mol Cell Biol20,4859-4869(2000))。PRMT1的完全敲除导致许多底物中MMA的显著增加，表明PRMT1的主要生物学功能是将MMA转化为ADMA，而其他PRMT可以建立和维持MMA(Dhar,S.等人Loss of the major Type I arginine methyltransferase PRMT1causes substrate scavenging by other PRMTs.Sci Rep3,1311,doi:10.1038/srep01311(2013))。此外，在PRMT1丢失时SDMA水平增加，这可能是ADMA损失和MMA相应增加的结果，MMA可作为产生SDMA的II型PRMT的底物。I型PRMT的抑制可能通过ADMA的丧失、MMA的增加、或者转换为与SDMA相关的不同甲基化模式而导致底物功能改变(Dhar,S.等人Lossof the major Type I arginine methyltransferase PRMT1 causes substratescavenging by other PRMTs.Sci Rep3,1311,doi:10.1038/srep01311(2013))。
小鼠中Prmt1基因座的破坏导致早期胚胎致死，并且纯合胚胎未能发展超过E6.5，表明PRMT1在正常发育中的需要(Pawlak,M.R.,Scherer,C.A.,Chen,J.,Roshon,M.J.&Ruley,H.E.Arginine N-methyltransferase 1 is required for earlypostimplantation mouse development,but cells deficient in the enzyme areviable.Mol Cell Biol20,4859-4869(2000)；Yu,Z.,Chen,T.,Hebert,J.,Li,E.&Richard,S.A mouse PRMT1 null allele defines an essential role for argininemethylation in genome maintenance and cell proliferation.Mol Cell Biol29,2982-2996,doi:10.1128/MCB.00042-09(2009))。需要条件或组织特异性敲除以更好地理解PRMT1在成人中的作用。源自Prmt1缺失小鼠的小鼠胚胎成纤维细胞经历生长停滞，多倍化，染色体不稳定性和与DNA损伤应答蛋白MRE11的低甲基化相关的自发DNA损伤，表明PRMT1在基因组维持和细胞增殖中的作用(Yu,Z.,Chen,T.,Hebert,J.,Li,E.&Richard,S.Amouse PRMT1 null allele defines an essential role for arginine methylation ingenome maintenance and cell proliferation.Mol Cell Biol29,2982-2996,doi:10.1128/MCB.00042-09(2009))。PRMT1蛋白和mRNA可以在广泛的胚胎和成体组织中检测到，与其作为负责大多数细胞精氨酸甲基化的酶的功能一致。尽管PRMT本身可以进行翻译后修饰并与相互作用的调节蛋白相关，但PRMT1保留基础活性而无需进行额外修饰(综述于Yang,Y.&Bedford,M.T.Protein arginine methyltransferases and cancer.Nat RevCancer13,37-50,doi:10.1038/nrc3409(2013))。
PRMT1和癌症
PRMT1的错误调节和过表达与许多实体和造血系统癌症有关(Yang,Y.&Bedford,M.T.Protein arginine methyltransferases and cancer.Nat Rev Cancer13,37-50,doi:10.1038/nrc3409(2013)；Yoshimatsu,M.等人Dysregulation of PRMT1 and PRMT6,Type I arginine methyltransferases,is involved in various types of humancancers.Int J Cancer128,562-573,doi:10.1002/ijc.25366(2011))。PRMT1与癌症生物学之间的联系主要是通过调节相关底物上发现的精氨酸残基的甲基化(图2)。在几种肿瘤类型中，PRMT1可以通过组蛋白H4的甲基化驱动异常致癌程序的表达(Takai,H.等人5-Hydroxymethylcytosine plays a critical role in glioblastomagenesis byrecruiting the CHTOP-methylosome complex.Cell Rep9,48-60,doi:10.1016/j.celrep.2014.08.071(2014)；Shia,W.J.等人PRMT1 interacts with AML1-ETO topromote its transcriptional activation and progenitor cell proliferativepotential.Blood119,4953-4962,doi:10.1182/blood-2011-04-347476(2012)；Zhao,X.等人Methylation of RUNX1 by PRMT1 abrogates SIN3A binding and potentiates itstranscriptional activity.Genes Dev22,640-653,doi:10.1101/gad.1632608(2008),以及通过其对非组蛋白底物的活性驱动异常致癌程序的表达(Wei,H.,Mundade,R.,Lange,K.C.&Lu,T.Protein arginine methylation of non-histone proteins and its rolein diseases.Cell Cycle13,32-41,doi:10.4161/cc.27353(2014))。在许多这些实验系统中，其底物的PRMT1依赖性ADMA修饰的破坏降低了癌细胞的增殖能力(Yang,Y.&Bedford,M.T.Protein arginine methyltransferases and cancer.Nat Rev Cancer13,37-50,doi:10.1038/nrc3409(2013))。
一些研究已将PRMT1与血液和实体肿瘤的发展联系起来。PRMT1通过例如MLL和AML1-ETO融合关键驱动因子的甲基化与白血病发展相关，导致致癌途径的激活(Shia,W.J.等人PRMT1 interacts with AML1-ETO to promote its transcriptional activationand progenitor cell proliferative potential.Blood119,4953-4962,doi:10.1182/blood-2011-04-347476(2012)；Cheung,N.等人Targeting Aberrant EpigeneticNetworks Mediated by PRMT1 and KDM4C in Acute Myeloid Leukemia.Cancer Cell29,32-48,doi:10.1016/j.ccell.2015.12.007(2016))。来自表达AML1-ETO的小鼠的骨髓细胞中PRMT1的敲低抑制了克隆形成，证明了PRMT1在维持该模型的白血病表型中的重要需求(Shia,W.J.等人PRMT1 interacts with AML1-ETO to promote its transcriptionalactivation and progenitor cell proliferative potential.Blood119,4953-4962,doi:10.1182/blood-2011-04-347476(2012))。PRMT1也是MLL融合复合物的一个组成部分，促进与H4R3甲基化相关的异常转录激活，并且PRMT1的敲低可以抑制MLL-EEN介导的造血干细胞转化(Cheung,N.,Chan,L.C.,Thompson,A.,Cleary,M.L.&So,C.W.Protein arginine-methyltransferase-dependent oncogenesis.Nat Cell Biol9,1208-1215,doi:10.1038/ncb1642(2007))。在乳腺癌患者中，发现PRMT1的高表达与较短的无疾病存活期和具有晚期组织学分级的肿瘤相关(Mathioudaki,K.等人Clinical evaluation of PRMT1 geneexpression in breast cancer.Tumour Biol32,575-582,doi:10.1007/s13277-010-0153-2(2011))。为此，PRMT1已参与促进转移和癌细胞侵袭(Gao,Y.等人The dualfunction of PRMT1 in modulating epithelial-mesenchymal transition andcellular senescence in breast cancer cells through regulation of ZEB1.SciRep6,19874,doi:10.1038/srep19874(2016)；Avasarala,S.等人PRMT1 Is a NovelRegulator of Epithelial-Mesenchymal-Transition in Non-small Cell LungCancer.J Biol Chem290,13479-13489,doi:10.1074/jbc.M114.636050(2015))，且PRMT1介导的雌激素受体α(ERα)甲基化可以增强生长促进信号转导途径。即使在存在抗雌激素的情况下，这种甲基化驱动机制也可为乳腺癌细胞提供生长优势(Le Romancer,M.等人Regulation of estrogen rapid signaling through arginine methylation byPRMT1.Mol Cell31,212-221,doi:10.1016/j.molcel.2008.05.025(2008))。此外，PRMT1通过调节同源重组和非同源末端连接DNA修复途径来促进基因组稳定性和对DNA损伤剂的抗性(Boisvert,F.M.,Rhie,A.,Richard,S.&Doherty,A.J.The GAR motif of 53BP1 isarginine methylated by PRMT1 and is necessary for 53BP1 DNA bindingactivity.Cell Cycle4,1834-1841,doi:10.4161/cc.4.12.2250(2005)；Boisvert,F.M.,Dery,U.,Masson,J.Y.&Richard,S.Arginine methylation of MRE11 by PRMT1 isrequired for DNA damage checkpoint control.Genes Dev19,671-676,doi:10.1101/gad.1279805(2005))。因此，PRMT1的抑制可能使癌症对DNA损伤因子敏感，特别是在DNA修复机制可能受突变影响的肿瘤中(如乳腺癌中的BRCA1)(O'Donovan,P.J.&Livingston,D.M.BRCA1 and BRCA2:breast/ovarian cancer susceptibility gene products andparticipants in DNA double-strand break repair.Carcinogenesis31,961-967,doi:10.1093/carcin/bgq069(2010))。总之，这些观察结果证明了PRMT1在肿瘤生物学的临床相关方面的关键作用，并提出了探索与例如促进DNA损伤的治疗相结合的理论基础。
RNA结合蛋白和剪接机制是PRMT1底物的主要类别，并且通过其生物学功能以及白血病的复发突变与癌症生物学有关(Bressan,G.C.等人Arginine methylation analysisof the splicing-associated SR protein SFRS9/SRP30C.Cell Mol Biol Lett14,657-669,doi:10.2478/s11658-009-0024-2(2009)；Sveen,A.,Kilpinen,S.,Ruusulehto,A.,Lothe,R.A.&Skotheim,R.I.Aberrant RNA splicing in cancer；expression changesand driver mutations of splicing factor genes.Oncogene35,2413-2427,doi:10.1038/onc.2015.318(2016)；Hsu,T.Y.等人The spliceosome is a therapeuticvulnerability in MYC-driven cancer.Nature525,384-388,doi:10.1038/nature14985(2015))。在最近的一项研究中，PRMT1显示在急性巨核细胞白血病中甲基化RNA结合蛋白RBM15(Zhang,L.等人Cross-talk between PRMT1-mediated methylation andubiquitylation on RBM15 controls RNA splicing.Elife4,doi:10.7554/eLife.07938(2015))。PRMT1介导的RBM15甲基化调节其表达；因此，显示AML细胞系中PRMT1的过表达通过下调RBM15来阻断分化，从而阻止其结合对分化重要的基因的前mRNA内含子区域的能力。为了鉴定推定的PRMT1底物，利用蛋白质组学方法(Methylscan，Cell SignalingTechnology)鉴定具有精氨酸甲基化状态变化的蛋白质，以响应工具PRMT1抑制剂，化合物D。来自化合物D-和DSMO处理的细胞提取物的蛋白质片段使用甲基精氨酸特异性抗体(ADMA，MMA，SDMA)免疫沉淀，并通过质谱法鉴定肽。虽然许多蛋白质经历精氨酸甲基化的变化，但鉴定的大多数底物是用工具化合物处理的AML细胞系中的转录调节因子和RNA加工蛋白质(图3)。
总之，PRMT1对癌症相关途径的影响表明抑制可能导致抗肿瘤活性，为治疗AML、淋巴瘤和实体肿瘤适应症提供了新的治疗机制。如新兴文献中所述，几种机制支持PRMT1抑制剂在血液学和实体瘤中使用的基本原理，包括：抑制白血病中AML-ETO驱动的肿瘤发生，抑制乳腺癌中生长促进信号转导，以及通过RNA结合蛋白的甲基化和剪接体机制调节剪接。抑制包括PRMT1的I型PRMT代表了一种易于控制的抑制异常癌细胞增殖和存活的策略。
生物化学
用化合物A进行详细的体外生物化学研究，以表征对I型PRMT的抑制效力和机制。
抑制机制
通过底物竞争实验探索了化合物A对PRMT1的抑制机制。通过将化合物A IC50值作为底物浓度的函数除以其Km app绘图，且将得到的图与竞争性、非竞争性和未竞争性抑制的Cheng-Prusoff关系进行比较，来检测抑制剂形态(Copeland,R.A.Evaluation of enzymeinhibitors in drug discovery.A guide for medicinal chemists andpharmacologists.Methods Biochem Anal46,1-265(2005))。化合物A的IC50值随着SAM浓度的增加而降低，表明化合物A对PRMT1的抑制与SAM是非竞争性的，当拟合至非竞争性抑制的方程时，Ki app值为15nM(图4A)。当化合物A IC50值作为H4 1-21肽的函数作图(图4B)，未观察到明确的形态趋势，表明混合型抑制。使用全局分析进行进一步分析，得到3.7的α值，证实肽机理是混合的并且得到19nM的Ki app值(图4B，插图)。
时间依赖性和可逆性
在变化的SAM：PRMT1：化合物A预孵育时间和20分钟反应后，通过测量IC50值来评估化合物A的时间依赖性抑制。与SAM无竞争性的抑制机制意味着需要产生SAM：PRMT1复合物以支持化合物A的结合，因此在预孵育期间包括SAM(保持在Km app)。化合物A显示PRMT1甲基化的时间依赖性抑制，其通过较长的预孵育时间的效力增加而证明(图5A)。由于观察到时间依赖性抑制，进一步的IC50测定包括60分钟SAM：PRMT1：化合物A预孵育和40分钟反应时间以提供化合物效力的更好表示。这些条件产生的IC50为3.1±0.4nM(n＝29)，其大于该测试的理论紧密结合极限(0.25nM)10倍。在不同的PRMT1浓度下检查IC50值表明，由于活性部分较低，实际的紧密结合限度将显著低于0.25nM(图5B)。化合物A的盐形式没有显著影响针对PRMT1测定的IC50值(图5B)。
对时间依赖性抑制的两种解释是缓慢结合的可逆抑制和不可逆抑制。为了区分这两种机制，使用亲和选择质谱法(ASMS)检查化合物A与PRMT1的结合。ASMS首先分离结合的配体与未结合配体，然后通过MS检测可逆结合的配体。用化合物A2小时预孵育PRMT1：SAM来确保完全形成时间依赖性复合物(ESI*)，其基于(图5A)中所示的曲线。其中在预孵育20分钟后观察到最大效力。在这些条件下，使用ASMS可检测化合物A。这表明主要机制本质上是可逆的，因为ASMS将无法检测到不可逆结合的化合物A。尚未进行包括解离速率分析在内的确定性可逆性研究，并将进一步验证该机制。
结晶学
为了确定抑制剂结合模式，确定与PRMT1和SAH结合的化合物A的共晶结构(分辨率)(图6)。SAH是PRMT1从SAM中除去甲基后形成的产物；因此，SAH和SAM应该同样占据PRMT1的相同口袋。抑制剂在通常由直接与SAH袋相邻的底物肽占据的裂隙中结合，并且其二胺侧链占据推定的精氨酸底物位点。末端甲胺与距SAH的硫醚的Glu162侧链残基形成氢键，并且SAH结合口袋通过Tyr57和Met66桥接至化合物A。化合物A通过在化合物A的吡唑氮的质子和Glu65的酸性侧链之间形成氢键来结合PRMT1；二乙氧基支链环己基部分位于由Tyr57、Ile62、Tyr166和Tyr170形成的疏水沟槽中的溶剂暴露表面。SAH和抑制剂结合之间的空间分离，以及与诸如Tyr57的残基的相互作用可以支持酶研究中揭示的SAM非竞争机制。发现化合物A结合在底物肽袋中并且二胺侧链可以模拟底物精氨酸残基的胺，意味着抑制剂形式可能与肽竞争。生物化学抑制模式研究支持化合物A是关于肽的混合抑制剂(图4B)。化合物A的时间依赖性行为以及肽裂缝外的底物肽的外部位点结合的可能性都可以导致与肽不竞争的抑制模式，解释了结构和生化研究所暗示的形态差异。
直系同源
为了便于解释毒理学研究，针对PRMT1的大鼠和狗直系同源物评估化合物A的效力。与人PRMT1一样，化合物A显示出对大鼠和狗PRMT1的时间依赖性抑制，IC50值随着预孵育的增加而降低(图7A)。另外，在一系列酶浓度(0.25-32nM)中未观察到化合物A效力的变化，表明测量的IC50值未接近人、大鼠或狗的测定的紧密结合极限(图7B)。使用与用于评估人PRMT1的条件相当的条件测定IC50值，并显示化合物A效力在所有物种中变化＜2倍(图7C)。
选择性
在一组PRMT家族成员中评估化合物A的选择性。在60分钟SAM：酶：化合物A预孵育后，针对代表性的I型(PRMT3，PRMT4，PRMT6和PRMT8)和II型(PRMT5/MEP50和PRMT9)家族成员测定IC50值。化合物A抑制了以不同效力测试的所有I型PRMT的活性，但未能抑制II型家族成员(图8A)。I型PRMT的另外表征显示化合物A是PRMT4、PRMT6和PRMT8的时间依赖性抑制剂，这是由于增加酶:SAM:化合物A预孵育时间后观察到效力增加；然而，PRMT3没有显示出时间依赖性行为(图8B)。
为了进一步表征化合物A的选择性，在单一浓度的化合物A(10μM，反应生物学)下评估二十一种甲基转移酶的抑制。对PRDM9观察到最高抑制程度，18％。总之，化合物A显示对测试的甲基转移酶的最小抑制，表明它是I型PRMT的选择性抑制剂(表1)。安全性部分描述了其他选择性测定。
表1对化合物A的抑制测试的甲基转移酶。在固定浓度的SAM(1μM)测定酶，与SAMKm值无关。
总之，化合物A是I型PRMT家族成员的有效、可逆、选择性抑制剂，显示出对PRMT1、PRMT6和PRMT8的等效生化能力，IC50值在3-5nM之间。与化合物A复合的PRMT1的晶体结构显示化合物A在肽袋中结合，并且晶体结构以及酶学研究都与SAM非竞争机制一致。
生物学
细胞机制效应
预计PRMT1的抑制导致细胞PRMT1底物上的ADMA降低，包括组蛋白H4的精氨酸3(H4R3me2a)，伴随MMA和SDMA的增加(Dhar,S.等人Loss of the major Type I argininemethyltransferase PRMT1 causes substrate scavenging by other PRMTs.Sci Rep3,1311,doi:10.1038/srep01311(2013))。为了评估化合物A对精氨酸甲基化的影响，使用抗体检测MMA在细胞内-western测定中评估与增加的MMA相关的剂量反应，并测定10.1+4.4nM的细胞机理EC50(图9)。剂量反应似乎是双相的，可能是由于I型PRMT之间的差异活性或对特定底物子集的差异效力。使用描述双相曲线的方程来拟合数据，并且因为在测试的浓度范围内没有与第二拐点相关的明显平台，报告了第一个拐点。在该测定形式中测试了各种盐形式，并且所有盐形式都显示出相似的EC50值，因此，对于所有生物学研究，认为它们是可互换的(图9)。进行另外的研究以检查选择的肿瘤类型中的时间、耐久性和对其他甲基化状态的影响，如下所示。化合物A对MMA诱导的效力表明化合物A可用于研究与抑制细胞中1型PRMT相关的生物学机制。
癌症中的I型PRMT表达
通过癌症基因组图谱(TCGA)和cBioPortal代表的其他原发肿瘤数据库从＞100个癌症研究中收集的多种肿瘤类型的基因表达数据分析表明PRMT1在癌症中高度表达，其中相对于其他实体和血液恶性肿瘤淋巴瘤中水平最高(弥漫型大B-细胞淋巴瘤，DLBCL)(图10)。还调查了ACTB(一种常见的持家基因)和TYR(一种在皮肤中选择性表达的基因)的表达，以分别表征与高普遍存在的表达或组织限制性表达相关的范围。淋巴瘤在其他癌症中的高表达提供额外的置信度，即化合物A抑制的靶标存在于对应于临床前研究中评估的细胞系的原发性肿瘤中。PRMT 3、4和6也在一系列肿瘤类型中表达，而PRMT8表达似乎更受限于预测，因为其组织特异性表达(Lee,J.,Sayegh,J.,Daniel,J.,Clarke,S.&Bedford,M.T.PRMT8,a new membrane-bound tissue-specific member of the protein argininemethyltransferase family.J Biol Chem280,32890-32896,doi:10.1074/jbc.M506944200(2005))。
细胞表型效应
使用Cell Titer Glo(Promega)分析化合物A在6天生长-死亡测定中抑制培养的肿瘤细胞系生长的能力，该Cell Titer Glo(Promega)定量ATP作为细胞数的替代。在广泛的接种密度范围内随时间评估所有细胞系的生长，以鉴定在整个6天测定中允许增殖的条件。将细胞以最佳接种密度接种，并在孵育过夜后，加入20点2倍滴定的化合物并将板孵育6天。在加入化合物时收获细胞的复制平板以定量细胞的起始数(T0)。将6天处理后获得的值表示为T0值的函数，并相对于化合物浓度作图。将T0值归一化至100％并表示化合物添加时的细胞数。将数据与4参数方程拟合以产生浓度响应曲线，并测定生长IC50(gIC50)。gIC50是“生长窗口”的中点，即化合物添加时的细胞数(T0)与6天后的细胞数(DMSO对照)之间的差异。生长-死亡测定法可用于量化净种群变化，明确地将细胞死亡(细胞毒性)定义为与化合物添加时的数量(T0)相比更少的细胞。负Ymin-T0值表示细胞死亡，而gIC100值表示100％抑制生长所需的化合物浓度。使用该测定法在196种代表实体和血液恶性肿瘤的人癌细胞系中评估化合物A的生长抑制作用(图11)。
化合物A在大多数细胞系中诱导接近或完全生长抑制，其中子集显示细胞毒性反应，如负Ymin-T0值所示(图11B)。这种作用在AML和淋巴瘤癌细胞系中最为明显，其中50和54％的细胞系分别显示出细胞毒性反应。从大鼠14天MTD(150mg/kg，Cave＝2.1μM)计算的总AUC或暴露(Cave)用作化合物A的临床相关浓度估计值以评估敏感度。虽然淋巴瘤细胞系显示细胞毒性，且gIC100值低于2.1μM，但评估的所有肿瘤类型中的许多细胞系显示gIC50值＜2.1μM，表明与抗肿瘤活性相关的浓度可在患者中实现。狗21天MTD稍高(25mg/kg；总AUC或Cave＝3.2μM)，因此来自大鼠的较低浓度提供了更保守的靶标以鉴别细胞系敏感性。淋巴瘤细胞系对I型PRMT抑制高度敏感，中值gIC50为0.57μM，细胞毒性在54％中观察到。在实体瘤类型中，在黑素瘤和肾癌细胞系(主要代表透明细胞肾癌)中观察到化合物A的有效抗增殖活性，然而，在该测定形式中，反应主要是细胞抑制的(图11，表2)。
表2化合物A的6天增殖概述。基于在大鼠14天MTD(150mg/kg，Cave＝2.1μM)中实现的浓度，gIC50＜2.1μM用作靶标。
评价化合物A的抗增殖作用表明PRMT1的抑制导致代表一系列实体和血液恶性肿瘤的细胞系的有效抗肿瘤活性。总之，这些数据表明实体和血液恶性肿瘤的临床开发是必要的。优先适应症包括：
·淋巴瘤：在54％的细胞系中有细胞毒性
·AML：在50％的细胞系中有细胞毒性
·肾细胞癌：在60％的细胞系中gIC50≤2.1μM
·黑素瘤：在71％的细胞系中gIC50≤2.1μM
·乳腺癌，包括TNBC：在41％的细胞系中gIC50≤2.1μM
淋巴瘤生物学
细胞机理效应
为了评估化合物A对淋巴瘤中精氨酸甲基化的影响，用0.4μM化合物A或载体处理人DLBCL细胞系(Toledo)长达120小时，之后通过western分析使用针对各种精氨酸甲基化状态的抗体评估蛋白质裂解物。如所预测的，在化合物暴露时ADMA甲基化降低，而MMA增加(图12)。还观察到SDMA水平的增加，表明MMA的增加可能导致PRMT5的潜在底物库中的积累，PRMT5是SDMA形成的主要催化剂。鉴于检测到具有不同动力学的多种底物，以及DMSO处理的样品中ADMA水平的可变性，全泳道和显著的45kDa条带均被表征以评估ADMA。MMA的增加在24小时内明显，到48小时接近最大值，而45kDa ADMA带的减少需要72-96小时才能达到最大效果。在化合物暴露48小时后SDMA的增加是明显的并且持续增加至120小时，这与MMA到ADMA(通过I型PRMT)的转化至SDMA(通过II型PRMT)的潜在转变一致(图12)。
在一组淋巴瘤细胞系中测定与化合物A对精氨酸甲基化(MMA，ADMA，SDMA)的作用相关的剂量反应(图13)。在整个泳道和在评估的所有细胞系中降低至不可检测的水平的单个45kDa条带上测量ADMA降低。总体而言，实现50％最大效应所需的浓度在细胞系中是相似的，并且在6天生长死亡测定中与gIC50不相符，表明缺乏敏感性不能通过目标参与不良解释。
为了确定响应化合物A的精氨酸甲基化的全局变化的耐久性，在化合物冲洗后用化合物A处理的细胞中评估ADMA、SDMA和MMA水平(图14)。将Toledo细胞与0.4μM化合物A一起培养72小时，以对精氨酸甲基化标记建立稳健的作用。然后洗涤细胞，在无化合物A的培养基中培养，每天收集样品至120小时，并通过western分析检查精氨酸甲基化水平。MMA水平迅速下降，在化合物A冲洗后24小时回到基线，而ADMA和SDMA分别在24和96小时后恢复到基线。值得注意的是，相对于ADMA蛋白质印迹中的大多数其他物种，45kDa ADMA条带的恢复似乎延迟，表明化合物A的精氨酸甲基化变化的耐久性可能因底物而异。即使在冲洗6小时后，SDMA似乎仍继续增加。这与到120小时观察到的持续增加且没有任何明显的平稳期(图12)以及在冲洗后尚未恢复到基线的MMA的持久增加相一致。每种修饰的耐久性通常反映化合物A引起的精氨酸甲基化变化的动力学，其中MMA是最快的。
细胞表型效应
为了评估与化合物A抑制生长相关的时间过程，在淋巴瘤细胞系的子集中进行延长持续时间的生长-死亡测定。类似于先前描述的6天增殖测定，优化接种密度以确保在整个测定期间的生长，并且在从第3-10天开始的选定时间点通过CTG评估细胞数。早在6天就观察到生长抑制，在Toledo和Daudi淋巴瘤细胞系中最多为8天(图15)。
在第6天和第10天评估更大的细胞系组以测量长期暴露于化合物A的效果，并确定在6天测定中显示细胞抑制反应的细胞系是否可能在稍后的时间点发生细胞毒性。延长暴露于化合物A的时间对评估的淋巴瘤细胞系的效力(gIC50)或细胞毒性(Ymin-T0)具有最小影响(图16)，表明6天增殖评估可用于评估敏感性。
鉴于生长抑制在第6天是明显的并且延长暴露对效力或抑制百分比的影响最小，代表霍奇金和非霍奇金亚型的一组广泛的淋巴瘤细胞系以6天生长-死亡测定形式进行评估(图17)。所有亚型在这种形式下似乎同样敏感，并且许多细胞系经历细胞毒性(如负Ymin-T0所示)，与分类无关，表明化合物A在评估的所有淋巴瘤亚型中具有抗肿瘤作用。
增殖测定结果表明PRMT1的抑制在淋巴瘤细胞系的亚组中诱导明显的细胞毒性。为了进一步阐明这种效果，使用碘化丙锭染色然后流式细胞术评估用化合物A处理的淋巴瘤细胞系中的细胞周期分布。在6天增殖试验中显示一系列Ymin-T0和gIC50值的细胞系以低密度接种以允许在试验期间进行对数生长，并用不同浓度的化合物A处理。与生长-死亡测定结果一致，以时间和剂量依赖性方式在Toledo细胞中观察到亚G1(＜G1)中细胞的积累(指示细胞死亡)，在用化合物A浓度≥1000nM处理3天后开始(图18)。到第7天，在浓度≥100nM时，亚G1群体的增加明显。在U2932和OCI-Ly1(在6天增殖试验中经历明显的细胞抑制生长抑制的细胞系)中，这种作用仅在10μM化合物A时才明显。在该试验形式中没有显示任何其他细胞周期阶段的显着影响。
为了确认细胞周期的FACS分析，在10天的时间过程中进行胱天蛋白酶切割的评估作为细胞凋亡的额外测量。优化接种密度以确保在整个测定期间的一致生长，并使用发光胱天蛋白酶-Glo 3/7测定(Promega)评估胱天蛋白酶活化。将胱天蛋白酶-Glo 3/7信号归一化为细胞数(通过CTG评估)并显示为相对于对照(DMSO处理的)细胞的倍数诱导。在DLBCL细胞系中的10天时间过程中监测胱天蛋白酶3/7活性，该DLBCL细胞系显示对化合物A的细胞毒性(Toledo)和细胞抑制(Daudi)反应(图19)。与在生长-死亡测定中观察到的情况一致，Toledo细胞系显示出稳健的胱天蛋白酶活化，同时在所有时间点细胞数量减少，而Daudi细胞系中胱天蛋白酶活性的诱导不太明显并且限于最高浓度的化合物A。
与细胞周期谱一起，这些数据表明化合物A在Toledo DLBCL细胞系中诱导胱天蛋白酶介导的细胞凋亡，表明在其他淋巴瘤细胞系中观察到的细胞毒性可能反映化合物A对凋亡途径的激活。在化合物A处理后经历细胞毒性和细胞抑制性反应的细胞系之间比较基因表达模式和体细胞改变，以鉴定与细胞毒性相关的预测性生物标志物。尽管该分析显示没有明显的相关性，但是对文献的检查以及探索合理组合的方法确定了5-甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)基因的缺失作为细胞毒性的潜在标记。
小鼠异种移植物中的抗肿瘤作用
在Toledo(人DLBCL)异种移植模型中评估化合物A对肿瘤生长的影响。将带有皮下Toledo肿瘤的雌性SCID小鼠称重，用卡尺测量肿瘤，并根据肿瘤大小将小鼠随机分组到每组10只小鼠的治疗组中。每天给小鼠口服载体或化合物A(150mg/kg-600mg/kg)达28天。在整个研究中，每周两次进行称重小鼠和肿瘤测量。在所有剂量下观察到显著的肿瘤生长抑制(TGI)，并且在＞300mg/kg的剂量下观察到消退(图20，表5)。在任何剂量组中没有显著的体重减轻。
鉴于在评估的所有剂量下观察到完整的TGI，进行第二项研究以测试化合物A在较低剂量下的抗肿瘤作用以及相对于每日(QD)比较每日两次(BID)给药。在该第二项研究中，给小鼠口服载体或化合物A(37.5mg/kg-150mg/kg)达24天QD或75mg/kg BID。在该研究中，75mg/kg的BID给药导致与150mg/kg相同的TGI(分别为95％和96％)，而≤75mg/kg QD导致部分TGI(≤79％)(图20，表5)。在任何剂量组中未观察到显著的体重减轻。这些数据表明，用相同的总日剂量给药的BID或QD应该产生相似的功效。
其它肿瘤类型
AML
除淋巴瘤细胞系外，化合物A在6天增殖试验中检测的AML细胞系子集中具有有效的细胞毒活性(表3)。10个细胞系中的8个具有＜2μM的gIC50值，并且化合物A在5个细胞系中诱导细胞毒性。尽管PRMT1与M2 AML亚型的AML-ETO融合特征相互作用(Shia,W.J.等人PRMT1 interacts with AML1-ETO to promote its transcriptional activation andprogenitor cell proliferative potential.Blood119,4953-4962,doi:10.1182/blood-2011-04-347476(2012))，但携带该融合蛋白(Kasumi-1和SKNO-1)的细胞系不是通过gIC50测量而显示对化合物A的敏感性或经历细胞毒性的唯一细胞系(表3，图21)。因此，这种致癌融合蛋白的存在并不能完全预测AML细胞系对化合物A的敏感性。
表3 AML细胞系中化合物A活性的概述
与淋巴瘤研究类似，在第6天和第10天评估一组细胞系以测量长期暴露于化合物A的效果，并确定在6天测定中显示细胞抑制反应的AML细胞系是否可能在稍后时间点发生细胞毒性。与淋巴瘤结果一致，延长暴露于化合物A的时间对评估的AML细胞系的效力(gIC50)或细胞毒性(Ymin-T0)具有最小影响(图21)。
肾细胞癌
与其他实体瘤类型相比，肾细胞癌细胞系具有最低的中值gIC50。尽管在用化合物A处理时，所测试的细胞系均未显示出细胞毒性反应，但均显示完全生长抑制，并且10个中的6个具有≤2μM的gIC50值(表4)。所描述的10个细胞系中的7个代表透明细胞肾癌(ccRCC)，其是肾癌的主要临床亚型。
表4化合物A在肾细胞癌细胞中的抗增殖作用的概述
为了评估化合物A对肾癌细胞系中生长抑制的时间过程，在第3、4、5和6天通过一组4个ccRCC细胞系中的CTG评估细胞生长(图22)。活性的最大变化发生在第3天和第4天之间，其中所有细胞系显示降低gIC50值并增加生长抑制。在4个细胞系中的3个化合物A的效力(通过gIC50评估)到第4天最大，并且在6天测定持续时间内进一步没有变化。另外，在评估的所有细胞系中，生长抑制百分比达到100％。因此，ccRCC细胞系中的最大生长抑制在细胞系筛选策略中使用的6天生长窗口内是明显的。
在增殖期间评估胱天蛋白酶活化，并且与Ymin-T0值所示的缺乏明显细胞毒性一致，胱天蛋白酶切割仅发生在最高浓度(30μM)，表明凋亡可能对化合物A在ccRCC细胞系中诱导的整体生长抑制作用影响最小。
在携带人肾细胞癌异种移植物(ACHN)的小鼠中评估化合物A对肿瘤生长的影响。将带有皮下ACHN细胞系肿瘤的雌性SCID小鼠称重，并通过卡尺测量肿瘤，并根据肿瘤大小随机分组到每组10只小鼠的治疗组中。小鼠每天口服给予载体或化合物A(150mg/kg-600mg/kg)，最多59天。在整个研究中，称重小鼠并每周两次进行肿瘤测量。在所有剂量下观察到显著的肿瘤生长抑制，并且在＞300mg/kg的剂量下观察到消退。在每天600mg/kg治疗的动物中观察到显著的体重减轻，因此，给药组在第31天终止(图23，表5)。
表5化合物A体内功效
*p＜0.05，双尾t检验
**ACHN功效研究的600QD组在第31天终止
总之，这些数据表明在人类实体和血液肿瘤的皮下异种移植物中可以以相似剂量实现100％TGI。
乳腺癌
乳腺癌细胞系显示出对化合物A的一系列敏感性，并且在许多情况下，在6天增殖测定中显示出部分生长抑制(图24)。代表三阴性乳腺癌(TNBC)的细胞系与非TNBC细胞系相比具有略低的中值gIC50值(对于TNBC和非TNBC分别为3.6μM和6.8μM)。
由于化合物A对增殖的作用是细胞抑制的并且在大多数乳腺癌细胞系中没有导致完全生长抑制，因此进行延长的持续时间生长-死亡测定以确定对化合物A的敏感性是否会随着延长的暴露而增加。在测试的17种细胞系中有7种最大抑制百分比增加＞10％，且gIC50减少＞2倍(图25)。在延长的暴露测定中，17种细胞系中有11种具有gIC50≤2μM(65％)，而17种细胞系中有7种(41％)在7天测定形式中符合该标准。
黑素瘤
在实体瘤类型中，化合物A在黑素瘤细胞系中具有最有效的抗增殖作用(图11)。评估的7个细胞系中的6个具有小于2μM的gIC50值(表6)。无论gIC50值如何，化合物A在所有黑素瘤细胞系中均具有细胞抑制作用。
表6黑素瘤细胞系中化合物A活性的概述
实施例2
预测性生物标记
细胞系对化合物A的敏感性排序(通过gIC50)和与体细胞改变或基因表达的关系使用通过Cancer Cell Line Encylopedia(CCLE)获得的基因组数据检查。另外，淋巴瘤细胞系通过它们对化合物A经历细胞毒性反应的能力进行分级。使用该方法可以确定与任何癌症相关改变没有明显的相关性，这可能是由于化合物A在细胞培养中的广泛活性。因此，基于用PRMT5抑制观察到的组合活性研究了合理的方法。
最近的研究描述了5-甲基硫腺苷磷酸化酶(MTAP)基因的丢失可能抑制肿瘤细胞中内源性PRMT5的机制。MTAP基因在癌症中经常被删除，包括40％的成胶质细胞瘤、25％的黑素瘤和胰腺癌，以及15％的非小细胞肺癌。(Mavrakis,K.J.等人,Disorderedmethionine metabolism in MTAP/CDKN2A-deleted cancers leads to dependence onPRMT5.Science 351,1208-1213,doi:10.1126/science.aad5944(2016)；Marjon,K.等人,MTAP Deletions in Cancer Create Vulnerability to Targeting of the MAT2A/PRMT5/RIOK1 Axis.Cell Rep 15,574-587,doi:10.1016/j.celrep.2016.03.043(2016)；Kryukov,G.V.等人,MTAP deletion confers enhanced dependency on the PRMT5arginine methyltransferase in cancer cells.Science 351,1214-1218,doi:10.1126/science.aad5214(2016))。MTAP的丧失导致代谢物甲硫腺苷(MTA)水平增加，显示出抑制PRMT5的生化活性，导致SDMA的细胞水平降低(Mavrakis,K.J.et al.,Disorderedmethionine metabolism in MTAP/CDKN2A-deleted cancers leads to dependence onPRMT5.Science 351,1208-1213,doi:10.1126/science.aad5944(2016)；Marjon,K.etal.,MTAP Deletions in Cancer Create Vulnerability to Targeting of the MAT2A/PRMT5/RIOK1 Axis.Cell Rep 15,574-587,doi:10.1016/j.celrep.2016.03.043(2016)；Kryukov,G.V.et al.,MTAP deletion confers enhanced dependency on the PRMT5arginine methyltransferase in cancer cells.Science 351,1214-1218,doi:10.1126/science.aad5214(2016))。鉴于化合物A和PRMT5抑制剂对癌细胞系的生长抑制的组合作用，MTAP缺失可提供内源性PRMT5被部分抑制的情况，从而使细胞对PRMT1抑制敏感并降低功效所需的化合物A的浓度。在肿瘤类型不可知的方式中，MTAP损失与化合物A敏感性无关。然而，与化合物A治疗相关的较低中值gIC50与淋巴瘤和黑素瘤细胞系中的MTAP缺失(相对于MTAP富含细胞系的差异＞5倍)相关(图26)。虽然这些差异在统计学上并不显著，部分原因是选择的肿瘤类型中的数量较少(N)，但这些观察结果有助于预测性生物标志物假说的发展。此外，在淋巴瘤中，具有MTAP缺失的细胞系响应化合物A经历细胞毒性，如从阳性Ymin-T0向阴性Ymin-T0的转变所示(表7)。
表7.基于肿瘤类型和MTAP状态的癌细胞系的中值生长参数
最近的出版物突出了MTA可以抑制PRMT5的机制，也评估了培养细胞中MTA的水平。虽然MTAP富含和缺乏细胞系存在一些差异，但总体MTA水平似乎随着培养时间的增加而增加(Kamatani,N.&Carson,D.A.Abnormal regulation of methylthioadenosine andpolyamine metabolism in methylthioadenosine phosphorylase-deficient humanleukemic cell lines.Cancer Res 40,4178-4182(1980))。这导致了这样的假设：如果MTA水平未达到在测定过程中抑制PRMT5所需的水平，用于研究MTAP表达与对化合物A的敏感性之间的关系的6天增殖试验可能不足以揭示相关性。为了进一步研究升高的MTA水平与化合物A组合以抑制癌细胞生长的潜力，在6天增殖试验中用化合物A的20点滴定测试固定浓度的外源MTA(1、10、50或100μM)。选择六种乳腺癌细胞系，其通过MTAP缺乏未显示对化合物A的增加的敏感性。由于最高浓度的MTA对生长窗口的影响，EC50值用于比较效力而不是gIC50。在用至少一种MTA浓度评估的每种细胞系中，化合物A的EC50降低(＞10倍)是明显的(图27)。另外，在对任一单一药剂具有细胞抑制或无应答的5种细胞系中的3种中，从细胞抑制转变为细胞毒性(阴性Ymin-T0)是明显的(图28)。
总之，该数据表明MTAP的肿瘤特异性丧失可通过增加PRMT5的内源性抑制剂揭示对化合物A的增加的敏感性。由于MTAP缺失的肿瘤中MTA水平升高会抑制PRMT5，因此MTAP缺失可能具有作为化合物A敏感性的预测性生物标志物的潜在用途。为了确定MTA水平是否达到足以抑制MTAP缺失肿瘤中PRMT5的浓度，目前正在评估具有MTAP缺失的细胞系以及原发性肿瘤中的MTA水平。
序列表
<110> GlaxoSmithKline Intellectual Property Development Limited
<120> 治疗癌症的方法
<130> PU66172
<150> US 62/428,780
<151> 2016-12-01
<160> 2
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 283
<212> PRT
<213> 智人
<400> 1
Met Ala Ser Gly Thr Thr Thr Thr Ala Val Lys Ile Gly Ile Ile Gly
1 5 10 15
Gly Thr Gly Leu Asp Asp Pro Glu Ile Leu Glu Gly Arg Thr Glu Lys
20 25 30
Tyr Val Asp Thr Pro Phe Gly Lys Pro Ser Asp Ala Leu Ile Leu Gly
35 40 45
Lys Ile Lys Asn Val Asp Cys Val Leu Leu Ala Arg His Gly Arg Gln
50 55 60
His Thr Ile Met Pro Ser Lys Val Asn Tyr Gln Ala Asn Ile Trp Ala
65 70 75 80
Leu Lys Glu Glu Gly Cys Thr His Val Ile Val Thr Thr Ala Cys Gly
85 90 95
Ser Leu Arg Glu Glu Ile Gln Pro Gly Asp Ile Val Ile Ile Asp Gln
100 105 110
Phe Ile Asp Arg Thr Thr Met Arg Pro Gln Ser Phe Tyr Asp Gly Ser
115 120 125
His Ser Cys Ala Arg Gly Val Cys His Ile Pro Met Ala Glu Pro Phe
130 135 140
Cys Pro Lys Thr Arg Glu Val Leu Ile Glu Thr Ala Lys Lys Leu Gly
145 150 155 160
Leu Arg Cys His Ser Lys Gly Thr Met Val Thr Ile Glu Gly Pro Arg
165 170 175
Phe Ser Ser Arg Ala Glu Ser Phe Met Phe Arg Thr Trp Gly Ala Asp
180 185 190
Val Ile Asn Met Thr Thr Val Pro Glu Val Val Leu Ala Lys Glu Ala
195 200 205
Gly Ile Cys Tyr Ala Ser Ile Ala Met Ala Thr Asp Tyr Asp Cys Trp
210 215 220
Lys Glu His Glu Glu Ala Val Ser Val Asp Arg Val Leu Lys Thr Leu
225 230 235 240
Lys Glu Asn Ala Asn Lys Ala Lys Ser Leu Leu Leu Thr Thr Ile Pro
245 250 255
Gln Ile Gly Ser Thr Glu Trp Ser Glu Thr Leu His Asn Leu Lys Asn
260 265 270
Met Ala Gln Phe Ser Val Leu Leu Pro Arg His
275 280
<210> 2
<211> 4937
<212> DNA
<213> 智人
<400> 2
ctccgcactg ctcactcccg cgcagtgagg ttggcacagc caccgctctg tggctcgctt 60
ggttccctta gtcccgagcg ctcgcccact gcagattcct ttcccgtgca gacatggcct 120
ctggcaccac caccaccgcc gtgaagattg gaataattgg tggaacaggc ctggatgatc 180
cagaaatttt agaaggaaga actgaaaaat atgtggatac tccatttggc aagccatctg 240
atgccttaat tttggggaag ataaaaaatg ttgattgcgt cctccttgca aggcatggaa 300
ggcagcacac catcatgcct tcaaaggtca actaccaggc gaacatctgg gctttgaagg 360
aagagggctg tacacatgtc atagtgacca cagcttgtgg ctccttgagg gaggagattc 420
agcccggcga tattgtcatt attgatcagt tcattgacag gaccactatg agacctcagt 480
ccttctatga tggaagtcat tcttgtgcca gaggagtgtg ccatattcca atggctgagc 540
cgttttgccc caaaacgaga gaggttctta tagagactgc taagaagcta ggactccggt 600
gccactcaaa ggggacaatg gtcacaatcg agggacctcg ttttagctcc cgggcagaaa 660
gcttcatgtt ccgcacctgg ggggcggatg ttatcaacat gaccacagtt ccagaggtgg 720
ttcttgctaa ggaggctgga atttgttacg caagtatcgc catggcgaca gattatgact 780
gctggaagga gcacgaggaa gcagtttcgg tggaccgggt cttaaagacc ctgaaagaaa 840
acgctaataa agccaaaagc ttactgctca ctaccatacc tcagataggg tccacagaat 900
ggtcagaaac cctccataac ctgaagaata tggcccagtt ttctgtttta ttaccaagac 960
attaaagtag catggctgcc caggagaaaa gaagacattc taattccagt cattttggga 1020
attcctgctt aacttgaaaa aaatatggga aagacatgca gctttcatgc ccttgcctat 1080
caaagagtat gttgtaagaa agacaagaca ttgtgtgtat tagagactcc tgaatgattt 1140
agacaacttc aaaatacaga agaaaagcaa atgactagta aacatgtggg aaaaaatatt 1200
acattttaag ggggaaaaaa aaacccacca ttctcttctc cccctattaa atttgcaaca 1260
ataaagggtg gagggtaatc tctactttcc tatactgcca aagaatgtga ggaagaaatg 1320
ggactctttg gttatttatt gatgcgactg taaattggta cagtatttct ggagggcaat 1380
ttggtaaaat gcatcaaaag acttaaaaat acggacgtac tttgtgctgg gaactctaca 1440
tctagcaatt tctctttaaa accatatcag agatgcatac aaagaattat atataaagaa 1500
gggtgtttaa taatgatagt tataataata aataattgaa acaatctgaa tcccttgcaa 1560
ttggaggtaa attatgtctt agttataatt agattgtgaa tcagccaact gaaaatcctt 1620
tttgcatatt tcaatgtcct aaaaagacac ggttgctcta tatatgaagt gaaaaaagga 1680
tatggtagca ttttatagta ctagttttgc tttaaaatgc tatgtaaata tacaaaaaaa 1740
ctagaaagaa atatatataa ccttgttatt gtatttgggg gagggatact gggataattt 1800
ttattttctt tgaatctttc tgtgtcttca catttttcta cagtgaattt aatcaaatag 1860
taaagttgtt gtaaaaataa aagtggattt agaaagatcc agttcttgaa aacactgttt 1920
ctggtaatga agcagaattt aagttggtaa tattaaggtg aatgtcattt aagggagtta 1980
catctttatt ctgctaaaga agaggatcat tgatttctgt acagtcagaa cagtacttgg 2040
gtttgcaaca gctttctgag aaaagctagg tgtttaatag tttaactgaa agtttaacta 2100
tttaaaagac taaatgcaca ttttatggta tctgatattt taaaaagtaa tgtttgattc 2160
tcctttttat gagttaaatt attttatacg agttggtaat ttttgctttt taataaagtg 2220
gaagcttgct tttttaactc tttttttatt gttattttat agaaatgctt tttgttggcc 2280
gggcacagtt gctcatccat gtaatcccag cactgtggga ggccgagacg ggtggatcac 2340
aaggtcagga gatcgagacc atcctggcta atgcgttgaa actccgtctc tactaaaaat 2400
acaaaaaatt agctgggcgt ggtggtgggc acctgtagtc ccagctactc aggaggctga 2460
ggcaggagaa tggtgtgaac ctgggaggtg gagcttgcag tgagcagagc ttgcagtgag 2520
acgagcttgt gccactgcac tccagcctgg gcaacagagt aagactcagt ctcaaaaaaa 2580
aaaaaaagag tgaaatgctt tttgtttgct tcagtttttt atcatgggga gatctttttc 2640
ctcagaattg ttttcttttc actgtaggct attacaggat acttcaggat caagatacag 2700
aaccttttat ttaaagagtt tgtaaagtca atgtgtttgt ttgtgtctct gagattgact 2760
tcaagataat aagctgctaa ttgtaaacaa aacagttacc ctccagtatt aatatgactc 2820
attagtgtga gccatttggg tcaagtatga ttatgaccct tggacttcct gatgtagtat 2880
taaatttcaa ctctggttat ccattagcaa tctgtagaga acttaatgaa cctgaaccca 2940
ggcttctcta gctctggtaa cgtgtgattg ttttcactac aatatgatac atagatggta 3000
ccttactttt cctcattctt aataggtgtc taagaatgtc agggcaaaag tatgggcatt 3060
tttcttgcta tgttcagaaa gtacagttct ctccaacttg cagaggtact tttcttgatt 3120
aaatagcctt ctctagcaac atcattttca gactaactaa atgaatgcag tatactcttt 3180
tctttgttct caatcattca ctccttatgc aaagccaata taattttcct cataccttat 3240
gcttgaggat attgttgaag aacacttcct ggaacacttc tcacttgtga tgctgtacta 3300
attttttttt tttaatttaa gctagtatac taagtgaaca ccatggtcag ttgtgagcat 3360
tttggtttcc gcaaaggatg gatggtgagc atcatgggaa agctgtagtt tagtgactta 3420
gcccttagtg attaatagat ttgcatgtac atagaagtct ttgttggcct tataatctgc 3480
tgttatattt ggcatggatt ttcatggttt tgagaatgac atcctggccc tgtggtcccc 3540
gagggtcatg gtccttgtga cctggcccct gttcactgcc cccttcgcta gcacgagttg 3600
ctgtgcaggg ctggaggtag ctaccatggc ttgtttcaag gaaggaaact ctggtacggt 3660
ggcaccctca ggagtggagg acagtgaact tccttgaaga gggagtgact aaggtgacct 3720
ccaacctgcc ctgagccagc tgccctgcag gtgccacgtg agcctgctct ggcatccaca 3780
ggatgctcct ggagcctctt ctctggctgc tacctcaggg catggttgtg gccccaccaa 3840
cacctatttt ccaaataatt attcattctt gtgacagtgg cctgaacatg tttttaattt 3900
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tatctgatgg gttaggaagt cacgaaatga ggagttcttg ccacatttgc agagtccctc 4020
cttgataagg tttggcggtg tccccaccca aatctcatgt tgaattgtag ttcccataat 4080
ccccacatgt tgtgggaggg acccagtggg aggtaattaa atcatggggg tggttacccc 4140
cacactgctg ttctcatgat actgagttct cacaagtcct gtttgtttta taaggggctt 4200
ttcccccttt tgctcaacac ttcttcctgc catcatgtga agaaggacgt gtttgtttcc 4260
ccttctgcca cgattgtaag tttcctgagg ccttcccagc tatgtggaac tgtgagttaa 4320
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atggactaat acactcctca aatgttttga agattgttgc accttggaac taccagtgtg 4440
cacacaatct ggctcaatgt atatattggc ccagcaaggc aaagaactga agttccagga 4500
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agcagtaaat gaagaccatg gaagaaaaga aggaatgcca aagatcgagg aaatctacca 4620
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gaacctcggg atcccaaaga atgaggggaa tttcttcaga aagacaatct cggcatgcat 4740
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ttgcctagta gtattctgtc atatgcctat cttacaattt gattatctat tcacctgttg 4860
atgaatgttt gaattttttc catttgagga attttatgaa taaagctgct ataagcatga 4920
aaaaaaaaaa aaaaaaa 4937

Claims (23)

1.在需要的人中治疗癌症的方法，该方法包括测定
a.5-甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)多核苷酸或多肽的水平，或
b.人样品中MTAP突变的存在或不存在，和
如果MTAP多核苷酸或多肽的水平相对于对照降低或如果在MTAP多核苷酸或多肽中存在突变，向人施用有效量的I型蛋白质精氨酸甲基转移酶(I型PRMT)抑制剂，从而治疗所述人的癌症。
2.在需要的人中抑制癌细胞增殖的方法，该方法包括向人施用有效量的I型蛋白质精氨酸甲基转移酶(I型PRMT)抑制剂，从而抑制人的癌细胞增殖，其中所述癌细胞具有5-甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)的突变和/或相对于对照具有降低水平的MTAP多核苷酸或多肽。
3.预测患有癌症的人是否将对用I型蛋白质精氨酸甲基转移酶(I型PRMT)抑制剂的治疗敏感的方法，该方法包括测定
a.5-甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)多核苷酸或多肽的水平，或
b.人样品中MTAP突变的存在或不存在，其中相对于对照降低水平的MTAP多核苷酸或多肽或MTAP中突变的存在指示该人将对用I型PRMT抑制剂的治疗敏感。
4.一种I型PRMT抑制剂，其用于在分类为响应者的人中治疗癌症，其中响应者的特征在于在人样品中存在5-甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)的突变或相对于对照降低水平的MTAP多核苷酸或多肽。
5.权利要求1-4任一项所述的方法，其中所述I型PRMT抑制剂为蛋白质精氨酸甲基转移酶1(PRMT1)抑制剂、蛋白质精氨酸甲基转移酶3(PRMT3)抑制剂、蛋白质精氨酸甲基转移酶4(PRMT4)抑制剂、蛋白质精氨酸甲基转移酶6(PRMT6)抑制剂、或蛋白质精氨酸甲基转移酶8(PRMT8)抑制剂。
6.权利要求1-5任一项所述的方法，其中所述I型PRMT抑制剂为式(I)的化合物:
或其药学上可接受的盐，
其中
X为N，Z为NR4，且Y为CR5；或
X为NR4，Z为N，且Y为CR5；或
X为CR5，Z为NR4，且Y为N；或
X为CR5，Z为N，且Y为NR4；
RX为任选取代的C1-4烷基或任选取代的C3-4环烷基；
L1为键、-O-、-N(RB)-、-S-、-C(O)-、-C(O)O-、-C(O)S-、-C(O)N(RB)-、-C(O)N(RB)N(RB)-、-OC(O)-、-OC(O)N(RB)-、-NRBC(O)-、-NRBC(O)N(RB)-、-NRBC(O)N(RB)N(RB)-、-NRBC(O)O-、-SC(O)-、-C(＝NRB)-、-C(＝NNRB)-、-C(＝NORA)-、-C(＝NRB)N(RB)-、-NRBC(＝NRB)-、-C(S)-、-C(S)N(RB)-、-NRBC(S)-、-S(O)-、-OS(O)2-、-S(O)2O-、-SO2-、-N(RB)SO2-、-SO2N(RB)-、或任选取代的C1-6饱和或不饱和烃链，其中该烃链的一个或多个亚甲基单元任选且独立被以下替代：-O-、-N(RB)-、-S-、-C(O)-、-C(O)O-、-C(O)S-、-C(O)N(RB)-、-C(O)N(RB)N(RB)-、-OC(O)-、-OC(O)N(RB)-、-NRBC(O)-、-NRBC(O)N(RB)-、-NRBC(O)N(RB)N(RB)-、-NRBC(O)O-、-SC(O)-、-C(＝NRB)-、-C(＝NNRB)-、-C(＝NORA)-、-C(＝NRB)N(RB)-、-NRBC(＝NRB)-、-C(S)-、-C(S)N(RB)-、-NRBC(S)-、-S(O)-、-OS(O)2-、-S(O)2O-、-SO2-、-N(RB)SO2-、或-SO2N(RB)-；
各个RA独立地选自氢、任选取代的烷基、任选取代的烯基、任选取代的炔基、任选取代的碳环基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基、任选取代的杂芳基、连接至氧原子时的氧保护基和连接至硫原子时的硫保护基；
各个RB独立地选自氢、任选取代的烷基、任选取代的烯基、任选取代的炔基、任选取代的碳环基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基、任选取代的杂芳基和氮保护基，或相同氮原子上的RB和RW可与中间氮一起形成任选取代的杂环；
RW为氢、任选取代的烷基、任选取代的烯基、任选取代的炔基、任选取代的碳环基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基、或任选取代的杂芳基；条件是当L1为键时，RW不为氢、任选取代的芳基、或任选取代的杂芳基；
R3为氢、C1-4烷基、或C3-4环烷基；
R4为氢、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯基、任选取代的C2-6炔基、任选取代的C3-7环烷基、任选取代的4-至7-元杂环基；或任选取代的C1-4烷基-Cy；
Cy为任选取代的C3-7环烷基、任选取代的4-至7-元杂环基、任选取代的芳基、或任选取代的杂芳基；且
R5为氢、卤素、-CN、任选取代的C1-4烷基、或任选取代的C3-4环烷基。
7.权利要求6所述的方法，其中所述I型PRMT抑制剂为式(II)的化合物:
或其药学上可接受的盐。
8.权利要求6或7所述的方法，其中所述I型PRMT抑制剂为式(I)或(II)的化合物，其中-L1-RW为任选取代的碳环基。
9.权利要求1-8任一项所述的方法，其中所述I型PRMT抑制剂为化合物A:
或其药学上可接受的盐。
10.权利要求1-9任一项所述的方法，其中所述突变为MTAP缺失。
11.权利要求1和3-10任一项所述的方法，其中所述样品包括癌细胞。
12.权利要求1和3-11任一项所述的方法，其中所述癌症为实体瘤或血液癌症。
13.权利要求2和5-10任一项所述的方法，其中所述癌细胞为实体瘤癌细胞或血液癌细胞。
14.权利要求1和3-12任一项所述的方法，其中所述癌症为淋巴瘤、急性骨髓性白血病(AML)、肾癌、黑素瘤、乳腺癌、膀胱癌、结肠癌、肺癌、或前列腺癌。
15.权利要求2、5-10和13任一项所述的方法，其中所述癌细胞为淋巴瘤细胞、急性骨髓性白血病(AML)细胞、肾癌细胞、黑素瘤细胞、乳腺癌细胞、膀胱癌细胞、结肠癌细胞、肺癌细胞、或前列腺癌细胞。
16.权利要求2、5-10、13和15任一项所述的方法，其中MTAP多核苷酸或多肽降低的水平或MTAP的突变增加癌细胞中甲硫腺苷(MTA)的水平使得蛋白质精氨酸甲基转移酶5(PRMT5)的活性被抑制。
17.权利要求2、5-10、13和15-16任一项所述的方法，其中MTAP多核苷酸或多肽降低的水平或癌细胞中MTAP的突变增加癌细胞对1型PRMT抑制剂的敏感性。
18.权利要求1、3、5-12和14任一项所述的方法，其中测定a和b二者。
19.权利要求1-18任一项所述的方法，进一步包括给予一种或多种其他抗肿瘤剂。
20.一种用于治疗癌症的试剂盒，其包括用于测定权利要求1、3、5-12、14和18中任一项的a和b中的一种或多种的试剂盒，以及用于测定权利要求1、3、5-12、14和18中任一项的a或b中的一种或多种的工具。
21.权利要求20的试剂盒，其中所述工具选自引物、探针和抗体。
22.包含I型PRMT抑制剂或其药学上可接受的盐的药物组合物，其用于治疗人的癌症，其中至少来自人的第一样品被确定具有MTAP突变、相对于对照的MTAP多核苷酸或多肽水平降低或两者。
23.I型PRMT抑制剂在制备用于治疗人的癌症的药物中的用途，其中来自人的一种或多种样品被确定具有MTAP突变、相对于对照的MTAP多核苷酸或多肽水平降低或两者。
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Families Citing this family (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2020252446A1 (en) * 2019-06-13 2020-12-17 Board Of Regents, The University Of Texas System Combination therapy for treating mtap-deficient tumors
MX2022004917A (es) * 2019-10-22 2022-08-04 Lupin Ltd Combinación farmacéutica de inhibidores de prmt5.
CA3161733A1 (en) * 2020-01-07 2021-05-15 Everett Stone Improved human methylthioadenosine/adenosine depleting enzyme variants for cancer therapy
US20240299356A1 (en) * 2021-02-25 2024-09-12 The Regents Of The University Of California Development of prmt-targeting therapy to enhance egfr-targeting drug efficacy in nsclc
WO2023049851A1 (en) * 2021-09-24 2023-03-30 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Inhibitors of the peptidyl-prolyl cis/trans isomerase (pin1), combinations and uses thereof
WO2023086934A1 (en) * 2021-11-12 2023-05-19 Ideaya Biosciences, Inc. Combination therapy comprising a mat2a inhibitor and a taxane
CN119684195A (zh) * 2024-12-19 2025-03-25 上海交通大学 一种以金刚烷为疏水基团修饰的prmt1蛋白降解剂及其应用

Citations (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN1213406A (zh) * 1996-03-08 1999-04-07 加利福尼亚大学董事会 抑制甲硫腺苷磷酸化酶缺陷细胞的腺苷酸琥珀酸合成酶活性的方法
CN1321765A (zh) * 2000-04-29 2001-11-14 上海博德基因开发有限公司 一种新的多肽——人甲硫基腺苷磷酸化酶37和编码这种多肽的多核苷酸
US20040247600A1 (en) * 2003-02-14 2004-12-09 Leoni Lorenzo M. Compositions and methods for the detection and treatment of methylthioadenosine phosphorylase deficient cancers
CN1908187A (zh) * 2006-07-19 2007-02-07 中国科学院遗传与发育生物学研究所 蛋白质精氨酸甲基转移酶5在白血病细胞检测和治疗中的应用
US20140315904A1 (en) * 2013-03-14 2014-10-23 Epizyme, Inc. Arginine methyltransferase inhibitors and uses thereof
WO2016038550A1 (en) * 2014-09-11 2016-03-17 Novartis Ag Inhibition of prmt5 to treat mtap-deficiency-related diseases
WO2016145150A2 (en) * 2015-03-11 2016-09-15 The Broad Institute Inc. Selective treatment of prmt5 dependent cancer

Family Cites Families (15)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5559235A (en) 1991-10-29 1996-09-24 Glaxo Wellcome Inc. Water soluble camptothecin derivatives
US5342947A (en) 1992-10-09 1994-08-30 Glaxo Inc. Preparation of water soluble camptothecin derivatives
AP9300587A0 (en) 1992-11-12 1995-05-05 Glaxo Inc Water soluble camptothecin derivatives.
US5681835A (en) 1994-04-25 1997-10-28 Glaxo Wellcome Inc. Non-steroidal ligands for the estrogen receptor
US5491237A (en) 1994-05-03 1996-02-13 Glaxo Wellcome Inc. Intermediates in pharmaceutical camptothecin preparation
US6113918A (en) 1997-05-08 2000-09-05 Ribi Immunochem Research, Inc. Aminoalkyl glucosamine phosphate compounds and their use as adjuvants and immunoeffectors
CN1606446A (zh) 2000-05-19 2005-04-13 科里克萨有限公司 用单糖和二糖类化合物预防和治疗传染病和其他疾病的方法
AU2001281001B2 (en) 2000-08-04 2005-11-03 Corixa Corporation New immunoeffector compounds
SI2311825T1 (sl) 2000-12-21 2016-02-29 Novartis Ag Pirimidinamini kot angiogenetski modulatorji
US6911434B2 (en) 2002-02-04 2005-06-28 Corixa Corporation Prophylactic and therapeutic treatment of infectious and other diseases with immunoeffector compounds
US6525028B1 (en) 2002-02-04 2003-02-25 Corixa Corporation Immunoeffector compounds
US7960522B2 (en) 2003-01-06 2011-06-14 Corixa Corporation Certain aminoalkyl glucosaminide phosphate compounds and their use
DE602005004286T2 (de) 2004-06-11 2009-01-02 Japan Tobacco Inc. 5-amino-2,4,7-trioxo-3,4,7,8-tetrahydro-2h-pyridoä2,3-düpyrimidinderivate und verwandte verbindungen zur behandlung von krebs
UY30892A1 (es) 2007-02-07 2008-09-02 Smithkline Beckman Corp Inhibidores de la actividad akt
WO2014153226A1 (en) * 2013-03-14 2014-09-25 Epizyme, Inc. Arginine methyltransferase inhibitors and uses thereof

Patent Citations (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN1213406A (zh) * 1996-03-08 1999-04-07 加利福尼亚大学董事会 抑制甲硫腺苷磷酸化酶缺陷细胞的腺苷酸琥珀酸合成酶活性的方法
CN1321765A (zh) * 2000-04-29 2001-11-14 上海博德基因开发有限公司 一种新的多肽——人甲硫基腺苷磷酸化酶37和编码这种多肽的多核苷酸
US20040247600A1 (en) * 2003-02-14 2004-12-09 Leoni Lorenzo M. Compositions and methods for the detection and treatment of methylthioadenosine phosphorylase deficient cancers
CN1908187A (zh) * 2006-07-19 2007-02-07 中国科学院遗传与发育生物学研究所 蛋白质精氨酸甲基转移酶5在白血病细胞检测和治疗中的应用
US20140315904A1 (en) * 2013-03-14 2014-10-23 Epizyme, Inc. Arginine methyltransferase inhibitors and uses thereof
WO2016038550A1 (en) * 2014-09-11 2016-03-17 Novartis Ag Inhibition of prmt5 to treat mtap-deficiency-related diseases
WO2016145150A2 (en) * 2015-03-11 2016-09-15 The Broad Institute Inc. Selective treatment of prmt5 dependent cancer

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
DANIELLE QUEIROZ CALCAGNO等: "DNA and histone methylation in gastric carcinogenesis", 《WORLD JOURNAL OF GASTROENTEROLOGY》 *
SHUNSHENG ZHENG等: "Arginine methylation-dependent reader-writer interplay governs growth control by E2F-1", 《MOLECULAR CELL》 *

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Publication number Publication date
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