[go: up one dir, main page]

CZ126699A3 - Polypeptid obsahující antigenní část rozpustného antigenu M. tuberculosis nebo variantu uvedeného antigenu, molekula DNA kódující tento polypeptid, expresivní vektor, hostitelská buňka, způsoby diagnostiky infekce M. tuberculosis a diagnostické kity - Google Patents

Polypeptid obsahující antigenní část rozpustného antigenu M. tuberculosis nebo variantu uvedeného antigenu, molekula DNA kódující tento polypeptid, expresivní vektor, hostitelská buňka, způsoby diagnostiky infekce M. tuberculosis a diagnostické kity Download PDF

Info

Publication number
CZ126699A3
CZ126699A3 CZ991266A CZ126699A CZ126699A3 CZ 126699 A3 CZ126699 A3 CZ 126699A3 CZ 991266 A CZ991266 A CZ 991266A CZ 126699 A CZ126699 A CZ 126699A CZ 126699 A3 CZ126699 A3 CZ 126699A3
Authority
CZ
Czechia
Prior art keywords
seq
tuberculosis
ala
pro
antigen
Prior art date
Application number
CZ991266A
Other languages
English (en)
Inventor
Steven G. Reed
Yasir A. W. Skeiky
Davin C. Dillon
Antonio Campos-Neto
Raymond Houghton
Thomas S. Vedvick
Daniel R. Twardzik
Michael J. Lodes
Original Assignee
Corixa Corporation
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from US08/818,111 external-priority patent/US6338852B1/en
Application filed by Corixa Corporation filed Critical Corixa Corporation
Publication of CZ126699A3 publication Critical patent/CZ126699A3/cs

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/195Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
    • C07K14/35Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Mycobacteriaceae (F)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)

Description

Polypeptid obsahující antigenní část rozpustného antigenů M.
tuberculosis nebo variantu uvedeného antigenů, molekula DNA kódující tento polypeptid, expresivní vektor, hostitelská buňka, způsoby diagnostiky infekce M. tuberculosis a diagnostické kity.
Oblast techniky
Vynález popisuje detekci infekci mikroorganizmem Mycobacterium tuberculosis. Vynález zvláště popisuje polypeptidy obsahující antigen Myobacterium tyberculosis nebo jeho část nebo jeho variantu a použití takového polypeptidu pro sérovou diagnostiku infekce Mycobacterium tuberculosis.
Dosavadní stav techniky
Tuberkulóza je chronické infekční onemocnění, které je v obecném případě způsobeno infekcí mikroorganizmem Mycobacterium tuberculosis. Tuberkulóza je majoritním onemocněním v rozvojových zemích a stala se rostoucím problémem ve vyspělých státech světa. Ročně se objevuje 8 miliónů nových případů a 3 milióny lidí umírá. Ačkoli infekce může být po určitou dobu bez symptomů, onemocnění se běžněji projevuje jako akutní zánět plic, vedoucí k teplotě a neproduktivnímu kašli. Jestliže toto onemocnění není zaléčeno dochází k vážným komplikacím a k úmrtí.
Ačkoli tuberkulózu lze léčit rozsáhlou léčbou antibiotiky, taková léčba není dostatečná pro prevenci rozšíření onemocnění. Infikovaní jedinci, kteří zůstávají po určitou dobu bez symptomů, jsou však infekční. Navíc ačkoli kompliance režimu léčby je kritická, je obtížné sledovat chování pacienta. Někteří pacienti nedodržují průběh léčby, což může vést k vytvoření rezistence na léky.
Aby se zabránilo rozšíření tuberkulózy je nutná účinná vakcinace a přesná, časná diagnóza onemocnění. V současné době
nejúčinnějším způsobem indukce ochranné imunity je vakcinace živými bakteriemi. Nejběžnějšim mikroorganizmem Mycobacterium pro tyto účely je Bacillus Calmette-Guerin (BCG), nevirulentní kmen Mycobacterium bovis. V některých zemích, jako jsou Spojené státy, kde je v rozporu bezpečnost a účinnost BCG, neprovádějí vakcinaci u obecné veřejnosti. Diagnóza se běžně provádí kožním testem, který zahrnuje intradermální expozici tuberkulinu PPD (derivát čištěného proteinu). Odezvy T buněk specifických na antigen jsou měřitelné zarudnutím v místě injekce 48 až 72 hodin po injekci, která indikuje vystavení mykobakteriálních antigenů. Citlivost a specifita tohoto testu je však problém. Tímto testem nelze odlišit jednotlivce vakcinované BCG od infikovaných jedinců.
Zatímco se ukázalo, že makrofágy působí jako základní činitelé při imunitě proti mikroorganizmu M. tuberculosis, takovou imunitu převážně indukují T-buňky. Základní úloha T-buněk při ochraně proti infekci mikroorganizmem M. tuberculosis vyplývá za situace, kdy u pacientů s onemocněním AIDS se často výskytuje mikororganizmus M. tuberculosis, což je způsobeno deplecí T buněk CD4, přičemž tento stav se spojuje s infekcí lidským virem selhání imunity. Ukázalo se, že T-buňky CD4 reaktivní na mycobacterium jsou potentními producenty gammainterferonu (IFN-γ), který naopak spouští anti-mykobakteriální účinky makrofágů u myší. Zatímco úloha IFN-γ u lidí je méně jasná, studie ukazují, že 1,25-dihydroxy-vitamin D3, a to buď samotný nebo v kombinaci s IFN-γ nebo s nádor nekrotizujícím faktorem alfa, aktivuje lidské makrofágy, aby inhibovaly infekci mikroorganizmem M. tuberculosis. Je známo, že IFN-γ stimuluje lidské makrofágy, aby se tvořil 1,25-dihydroxyvitamin D3. Podobně se ukázalo, že IL-12 hraje úlohu při stimulaci tuberculosis. tuberculosis rezistence k infekci mikroorganizmem
M.
Problém imunologie infekce mikroorganizmem M. se popisuje v publikaci Chán and Kaufmann, • · • · · · ···· · ·· · • · ··· · · ·· ··· ··· ······· · · ···· ·· ·· ·· ·· ··
Tuberculosis: Pathogenesis, Protection and Control, Bloom (ed.), ASM Press, Washington, DC, 1994.
Je nutné vytvořit vylepšené způsoby diagnostiky pro detekci tuberkulózy. Tento vynález plně naplňuje tuto potřebu a dále poskytuje jiné výhody.
Podstata vynálezu
Vynález popisuje kompozice a metody diagnostiky tuberkulózy. Připravují se polypeptidy, které obsahují antigenní část rozpustného antigenu mikroorganizmu M.
i tuberculosis nebo varianty takového antigenu, který se liší pouze v konzervativních substitucích nebo/a modifikacích. V jednom provedení vynálezu rozpustný antigen vykazuje jednu z následujících N-terminálních sekvencí:
(a) Asp-Pro-Val-Asp-Ala-Val-Ile-Asn-Thr- Thr-Cys-Asn-Tyr-GlyGln-Val-Val-Ala-Ala-Leu (SEQ ID NO: 115);
(b) Ala-Val-Glu-Ser-Gly-Met-Leu-Ala-Leu-Gly-Thr-Pro-Ala-ProSer (SEQ ID NO: 116);
(c) Ala-Ala-Met-Lys-Pro-Arg-Thr-Gly-Asp-Gly-Pro-Leu-Glu-AlaAla-Lys-Glu-Gly-Arg (SEQ ID NO: 117);
(d) Tyr-Tyr-Trp-Cys-Por-Gly-Gln-Pro-Phe-Asp-Pro-Ala-Trp-GlyPro (SEQ ID NO: 118);
(e) Asp-Ile-Gly-Ser-Glu-Ser-Thr-Glu-Asp-Gln-Gln-Xaa-Ala-Val (SEQ ID NO:119);
(f) Ala-Glu-Glu-Ser-Ile-Ser-Thr-Xaa-Glu-Xaa-Ile-Val-Pro (SEQ
ID NO: 120);
(g) Asp-Pro-Glu-Pro-Ala-Por-Pro-Val-Pro-Thr-Thr-Ala-Ala-SerPro-Pro-Ser (SEQ ID NO: 121);
(h) Ala-Pro-Lys-Thr-Tyr-Xaa-Glu-Glu-Leu-Lys-Gly-Thr-Asp-ThrGly (SEQ ID NO: 122);
(i) Asp-Pro-Ala-Ser-Ala-Pro-Asp-Val-Pro-Thr-Ala-Ala-Gln-LeuThr-Ser-Leu-Leu-Asn-Ser-Leu-Ala-Asp-Pro-Asn-Val-Ser-PheAla-Asn (SEQ ID NO: 123);
• · ·· · · · ·· ·· ··· ··· ······· · · ···· ·· ·· · · ·· ·· (j) Xaa-Asp-Ser-Glu-Lys-Ser-Ala-Thr-Ile-Lys-Val-Thr-Asp-AlaSer (SEQ ID NO: 129);
(k) Ala-Gly-Asp-Thr-Xaa-Ile-Tyr-Ile-Val-Gly-Asn-Leu-Thr-AlaAsp (SEQ ID NO: 130) nebo (l) Ala-Pro-Glu-Ser-Gly-Ala-Gly-Leu-Gly-Gly-Thr-Val-Gln-AlaGly (SEQ ID NO:131), kde Xaa může být libovolná aminokyselina.
Dále vynález popisuje polypeptidy obsahující imunogenní část antigenu mikroorganizmu M. tuberculosis nebo variantu takového antigenu, který se liší pouze konzervativními substitucemi a/nebo modifikacemi, přičemž antigen má jednu z následujících N-terminálních sekvencí:
(m) Xaa-Tyr-Ile-Ala-Tyr-Xaa-Thr-Thr-Ala-Gly-Ile-Val-Pro-GlyLys-Ile-Asn-Val-His-Leu-Val (SEQ ID NO: 132) nebo (n) Asp-Pro-Pro-Asp-Pro-His-Gln-Xaa-Asp-Met-Thr-Lys-Gly-TyrTyr-Por-Gly-Gly-Arg-Arg-Xaa-Phe (SEQ ID NO: 124) kde Xaa může být libovolnou aminokyselinou.
V jiném provedení rozpustný antigen mikroorganizmu M. tuberculosis obsahuje aminokyselinovou sekvenci kódovanou sekvencí DNA vybranou ze skupiny zahrnující sekvence uvedené v SEQ ID NO: 1,2,4-10, 13-25, 52, 94 a 96, doplňky uvedených sekvencí a sekvence DNA, které hybridizují se sekvencí uvedenou v SEQ ID NO: 1,2, 4-10, 13-25, 52, 94 a 96 nebo s jejich doplňky za stringentních podmínek.
Polypeptidy obsahují antigenní oblast antigenu mikroorganizmu M. tuberculosis nebo varianty takového antigenu, která se liší pouze konzervativními substitucemi a/nebo modifikacemi, přičemž antigen obsahuje aminokyselinovou sekvenci kódovanou sekvencí DNA vybranou ze skupiny zahrnující sekvence uvedené v SEQ ID NO: 26-51, 133, 134, 158-178 a 196, doplňky uvedené sekvence a sekvence DNA, které hybridizují se • · ··· ·· ·· ··· · · · • · φ φ φ · φ · · ••ΦΦ ·· ·· φφ ·· ·· sekvencí uvedenou v SEQ ID NO: 26-51, 133, 134, 158-178 a 196 nebo jejím doplňkem za stringentních podmínek.
Vynález dále popisuje sekvence DNA kódující shora v textu uvedené polypeptidy, rekombinantní expresivní vektory obsahující uvedené sekvence DNA a hostitelské buňky transformované nebo transfekované takovými expresivními vektory.
Vynález popisuje fúzní proteiny obsahující první a druhý polypeptid podle vynálezu nebo v jiném případě polypeptid podle vynálezu a známý antigen mikroorganizmu M. tuberculosis.
Dalším aspektem vynálezu jsou způsoby a diagnostické křty pro detekci tuberkulózy u pacienta. Uvedené způsoby zahrnují:
a) kontakt biologického vzorku alespoň s jedním shora v textu uvedeným polypeptidem a
b) detekci přítomnosti protilátek ve vzorku, přičemž protilátky se vážou na polypeptid nebo polypeptidy, čímž se v biologickém vzorku detekuje infekce mikroorganizmem M. tuberculosis.
Vhodné biologické vzorky zahrnují krev, sputum, sérum, plazmu, sliny, mozkomíšní mok a moč. Diagnostické kity obsahují jeden nebo více shora uvedených polypeptidů v kombinaci s detekčním činidlem.
Vynález také popisuje způsoby detekce infekce mikroorganizmem M. tuberculosis zahrnující:
(a) získání biologického vzorku od pacienta, (b) kontakt vzorku alespoň s jedním oligonukleotidovým primerem při polymerázové řetězcové reakci, přičemž oligonukleotidový primer je specifický pro sekvenci DNA kódující shora v textu uvedené polypeptidy a (c) detekci sekvence DNA ve vzorku, který se amplifikuje v přítomnosti prvního a druhého oligonukleotidového primerů. V jednom provedení vynálezu oligonukleotidový primer obsahuje alespoň přibližně 10 po sobě souvisle jdoucích nukleotidů uvedené sekvence.
• ·
Vynález dále popisuje způsob mikroorganizmem M. tuberculosis u pacientů, který zahrnuje:
(a) získáni biologického vzorku z těla pacienta kontakt vzorku s oligonukleotidovou sondou specifickou detekce infekce (b) pro sekvenci
DNA kódující shora v textu uvedené polypeptidy a detekci sekvence DNA ve vzorku, přičemž
DNA hybridizuje s oligonukleotidovou sekvence V j ednom sondou.
provedení vynálezu oligonukleotidová sonda obsahuje alespoň přibližně 15 po sobě souvisle jdoucích nukleotidů uvedené sekvence DNA.
Dále vynález popisuje monoklonální a protilátky, které se váží na polypeptidy popisované shora v textu stejně jako způsoby jejich použití při detekci infekce mikroorganizmem M. tuberculosis.
polyklonální
Jak se uvádí shora v textu vynález se obecně týká kompozic a způsobů diagnostiky tuberkulózy. Kompozice podle vynálezu zahrnují polypeptidy, které obsahují alespoň jednu antigenní část antigenu mikroorganizmu M. tuberculosis nebo variantu takového antigenu, jenž se liší pouze v konzervativních substitucích a/nebo v modifikacích. Polypeptidy podle vynálezu zahrnují, ale nejsou omezeny na rozpustné antigeny mikroorganizmu M. tuberculosis. Termín „rozpustný antigen mikroorganizmu M. tuberculosis'1' je protein pocházející z mikroorganizmu M. tuberculosis, který se nachází ve filtrátu kultury mikroorganizmu M. tuberculosis. Termín „polypeptid znamená aminokyselinové řetězce libovolné délky, které zahrnují proteiny v plné délce (to znamená antigeny), kde aminokyselinové zbytky jsou spojeny kovalentními peptidovými vazbami. Polypeptid obsahující antigenní část jednoho ze shora uvedených antigenů může zahrnovat celou antigenní část nebo může obsahovat další sekvence. Uvedené další sekvence mohou pocházet z antigenu přirozeného mikroorganizmu M. tuberculosis • · ······· · · ···· · · * · · · ·· · · nebo může být heterogenní a pak takové sekvence mohou (ale nemusí) být antigenní.
Termín „antigenní část antigenu (který může být nebo nemusí být rozpustný) je část, která je schopna reagovat se sérem získaným z jedinců infikovaných mikroorganizmem M. tuberculosis (to znamená, že generují absorbanci se sérem získaným z infikovaných jedinců alespoň o tři standardní odchylky vyšší, než je absorbance získaná se sérem z neinfikovaných jedinců, přičemž absorbance se získala reprezentativním testem ELISA) . Termín „jedinec infikovaný mikroorganizmem M. tuberculosis je člověk, jenž se infikoval mikroorganizmem M. tuberculosis (například vykazuje pozitivní odezvu na PPD, která má v průměru alespoň 0,5 cm). Infikovaní jedinci vykazují symptomy tuberkulózy nebo jsou bez symptomů. Polypeptidy vykazující alespoň antigenní část jednoho nebo více zde popsaných antigenů mikroorganizmu M. tuberculosis se mohou obecně použít za účelem detekce tuberkulózy samostatně nebo v kombinaci.
Kompozice a metody podle vynálezu také zahrnují varianty shora uvedených polypeptidů. Termín „varianta A znamená polypeptid, který se liší od přirozeného ‘antigenu pouze konzervativními substitucemi a/nebo modifikacemi tak, že si zachoval antigenní vlastnosti polypeptidu. Takové varianty se mohou v obecném případě identifikovat modifikací jedné ze shora popsaných polypeptidových sekvencí a hodnocením antigenních vlastností modifikovaného polypeptidu za použití zde popsaných reprezentativních postupů.
Termín „konzervativní substituce je ta substituce, kde aminokyselina je nahrazena jinou aminokyselinou, která má podobné vlastnosti a to takové, že odborník v oboru chemie peptidů bude předpokládat, že sekundární struktura a hydropatická podstata polypeptidu se v podstatě nezmění. Následující aminokyseliny reprezentují konzervativní změny: (1) ala, pro, gly, glu, asp, gin, asn, ser, thr • ·· • φφφ • · · · · · • ΦΦ φφφ «φ φφ
(2) cys, ser, tyr, thr
(3) val, ile, leu, met ala
(4) lys, arg, his a
(5) phe, tyr, trp, his.
Varianty se mohou také modifikovat, například delecí nebo adicí aminokyselin, které mají minimální vliv na antigenní vlastnosti, sekundární strukturu a hydropatickou podstatu polypeptidů. Polypeptid může být například spojen se signální (nebo vedoucí) sekvencí na N-terminálním konci proteinu, který řídí transfer proteinu při translaci a po translaci. Polypeptid se může za účelem jednoduché syntézy, čištění nebo identifikace polypeptidů (např. poly-His) nebo za účelem zvýšit schopnost polypeptidů vázat se na pevnou podložku spojit s linkerem nebo s jinou sekvencí. Polypeptid se může spojovat s oblastí imunoglobinu Fc.
Termín „kombinovaný polypeptid je polypeptid, jenž obsahuje alespoň jednu ze shora uvedených antigenních vlastností a jednu nebo více dalších antigenních sekvencí mikroorganizmu M. tuberculosis, které jsou spojeny do jednoduchého aminokyselinového řetězce prostřednictvím peptidové vazby. Sekvence může být spojena přímo (to znamená bez vložených aminokyselin) nebo mohou být spojeny linkerovou sekvencí (například Gly-Cys-Gly), která v podstatě nemění antigenní vlastnosti polypeptidů.
V obecném případě antigeny mikroorganizmu M. tuberculosis sekvence DNA kódující takové antigeny se připravují použitím různých postupů. Rozpustné antigeny se mohou izolovat z filtrátů kultur mikroorganizmu M. tuberculosis postupem dobře známým v oboru, jenž zahrnuje chromatografií s výměnou iontů a s reverzními fázemi. U čištěných antigenů se pak mohou hodnotit požadované vlastnosti, jako je schopnost reagovat se sérem získaným z jednotlivce infikovaného mikroorganizmem M. tuberculosis. Takové testy se mohou provést za použití zde popsaných metod. Antigeny se pak mohou částečně sekvenovat ·· «· ·« ·<4 ·· ·· ···· · · · · · · · • ·· · · ··· · · · · ······· a · ···· ·· ·· ·· ·· aa například za použití tradiční Edmanovi chemie, což se popisuje v publikaci Edman and Berg, EUR. J. Biochem. 80: 116-132,
1967.
Antigeny se také mohou produkovat rekombinantním postupem za použití sekvence DNA, která kóduje antigen, jenž se začlenil do expresivního vektoru a exprimuje se ve vhodném hostiteli. Molekuly DNA kódující rozpustné antigeny se mohou izolovat testováním vhodné expresivní knihovny mikroorganizmu M. tuberculosis pomocí antiséra (například králičího), které vzniklo specificky proti rozpustným antigenům mikroorganizmu M. tuberculosis. Sekvence DNA kódující antigeny , které mohou nebo nemusí být rozpustné se mohou identifikovat testováním vhodné knihovny genomu mikroorganizmu M. tuberculosis nebo cDNA expresivní knihovny se sérem získaným od pacientů infikovaných mikroorganizmem M. tuberculosis. Takové testování je možné uskutečnit za použití metod dobře známých v oboru, které se popisují v publikaci Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratories, Cold Spring Harbor, NY, 1989.
Sekvence DNA kódující rozpustné antigeny se mohou také získat testováním přítomnosti sekvencí DNA vhodné cDNA mikroorganizmu M. tuberculosis nebo knihovny genomové DNA, která hybridizuje s degenerovanými oligonukleotidy odvozenými z částečných aminokyselinových sekvencí izolovaných rozpustných antigenů. Degenerované oligonukleotidové sekvence určené pro použití v takovém testu se mohou navrhnout a syntetizovat a test se může provést způsobem popsaným (například) v publikaci Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratories, Cold Spring Harbor, NY (a v dalších zde uvedených publikacích). Za účelem izolace sond z knihovny cDNA nebo z genomové knihovny je možné také použit polymerázovou řetězcovou reakci (PCR), při níž se použijí shora uvedené oligonukleotidy. Testování knihovny je možné provést za použití izolované sondy.
Co se týče způsobu přípravy, zde popsané antigeny jsou „antigenní. Antigeny mají schopnost získaným z jednotlivců infikovaných tuberculosis. Reaktivita se může hodnotit například za použití testů ELISA, kde absorbance se sérem infikovaných jedinců, která je alespoň o tři standardní odchylky vyšší než absorbance získaná se sérem z neinfikovaných jednotlivců, se považuje za pozitivní.
Antigenní vlastnosti antigenů mikroorganizmu M. tuberculosis se mohou připravovat a identifikovat za použití metod dobře známých v oboru, které se popisují v publikaci Paul, Fundamental Immunology, 3d ed., Raven Press, 1993, pp. 243-247 a v dalších publikacích, které se zde uvádějí jako citace. Takové metody zahrnují testování vlastností polypeptidových částí. Může reagovat se sérem mikroorganizmem M.
antigenních se použít reprezentativní zde popsaný test ELISA. Antigenní část polypeptidu je část, která v takovém reprezentativním testu dává signál, který je v podstatě stejný jako generuje antigen v plné délce. Jinými slovy antigenní část antigenů mikroorganizmu M. tuberculosis generuje ve zde popsaném modelu testu ELISA alespoň přibližně 20 %, s výhodou 100 % signálu indukovaného antigenů v plné délce.
Části a jiné varianty antigenů mikroorganizmu M. tuberculosis se mohou generovat syntetickým nebo rekombinantnim způsobem. Syntetické polypeptidy obsahují méně než 100 aminokyselin a v obecném případě méně než přibližně 50 aminokyselin a mohou vznikat za použití metod dobře známých v oboru. Takové polypeptidy se mohou například syntetizovat za použití libovolného běžně dostupného postupu na pevné fázi, jako je například Merrifieldova syntéza na pevné fázi, kde se postupně připojuj i aminokyseliny k rostoucímu aminokyselinovému řetězci (popisuje se v sekvenci Merrifield,
J. Am. Chem. Soc. 85; automatizovanou syntézu
2149-2146, 1963). Zařízení pro polypeptidů je běžně dostupné u • · • · · · ······· · 9
9999 99 99 99 99 99 dodavatelů, jako je Applies BioSystems, Inc., Foster City, CA a používá se podle doporučení výrobce. Varianty přirozeného antigenu se mohou připravovat za použití standardních metod mutageneze, jako je místně specifická mutageneze oligonukleotidů. Aby se připravily zkrácené polypeptidy, může se také odstranit sekce sekvence DNA za použití standardních metod.
Rekombinantní polypeptidy obsahující části a/nebo varianty přirozeného antigenu se mohou snadno připravit ze sekvence DNA kódující polypeptid za použití řady metod. Supernatanty z vhodných systémů hostitel/vektor, které vylučují rekombinantní protein do kultivačního média se musí nejdříve zahustit za použití běžně dostupných filtrů. Koncentrát se může nanést na vhodnou purifikační matrici, jako je afinitní matrice nebo pryskyřice s iontoměničem. Pro další čištění rekombinantního proteinu se může použít jeden nebo více cyklů na HPLC s reverzní fází.
Pro expresi zde popsaných rekombinantních polypeptidů lze použít libovolný expresivní vektor známý v oboru. Exprese lze dosáhnout ve vhodné hostitelské buňce, kterou je možné transformovat nebo transfekovat expresivním vektorem, který obsahuje molekulu DNA, jenž kóduje rekombinantní polypeptid. Vhodné hostitelské buňky zahrnují prokaryontní, kvasinkové a vyšší eukaryontní buňky. S výhodou se používají jako hostitelské buňky bakterie E. coli, kvasinky nebo savčí buněčná linie, jako je COS nebo CHO. Sekvence DNA exprimované tímto způsobem mohou kódovat přirozeně se vyskytující antigeny, části přirozeně se vyskytujících antigenů nebo jejich další varianty.
Bez ohledu na způsob přípravy, dosažené zde popsané polypeptidy jsou v podstatě v čisté formě. Upřednostňuje se, aby polypeptidy dosahovaly čistoty alespoň přibližně 80 %, s výhodou alespoň přibližně 90 % a nejvýhodnější je alespoň ······· · · ···· ·· ·· ·· ·· ·· přibližně 99 %. Při použití zde popsaných způsobů lze tyto v podstatě čisté polypeptidy kombinovat.
V určitých specifických provedeních vynálezu se popisují polypeptidy obsahující alespoň antigenní část rozpustného antigenu mikroorganizmu M. tuberculosis (nebo variantu takového antigenu), kde antigen vykazuje jednu z následujících N-terminálních sekvencí:
(a) Val-Pro-Val-Asp-Ala-Val-Ile-Asn-Thr-Thr-Cys-Asn-TyrGly-Gln-Val-Val-Ala-Ala-Leu (SEQ ID NO: 115) (b) Ala-Val-Glu-Ser-Gly-Met-Leu-Ala-Leu-Gly-Thr-Pro-AlaPro-Ser (SEQ ID NO: 116) (c) Ala-Ala-Met-Lys-Pro-Arg-Thr-Gly-Asp-Gly-Pro-Leu-GluAla-Ala-Lys-Glu-GlyArg (SEQ ID NO: 117) (d) Tyr-Tyr-Trp-Cys-Pro-Gly-Gln-Pro-Phe-Asp-Pro-Ala-TrpGly-Pro (SEQ ID NO: 118) (e) Asp-Ile-Gly-Ser-Thr-Glu-Asp-Gln-Gln-Xaa-Ala-Val (SEQ ID NO: 119) (f) Ala-Glu-Glu-Ser-Ile-Se-Thr-Xaa-Glu-Xaa-Ile-Val-Por (SEQ ID NO: 120) (g) Asp-Pro-Glu-Pro-Ala-Pro-Pro-Val-Pro-Thr-Thr-Ala-AlaSer-Pro-Pro-Ser (SEQ ID NO: 121) (h) Ala-Pro-Lys-Thr-Tyr-Xaa-Glu-Glu-Leu-Lys-Gly-Thr-AspThr-Gly (SEQ ID NO: 122) (i) Asp-Pro-Ala-Ser-Ala-Pro-Asp-Val-Pro-Thr-Ala-Ala-GlnGln-Thr-Ser-Leu-Leu-Asn-Ser-Leu-Ala-Asp-Pro-Asn-ValSer-Phe-Ala-Asn (SEQ ID NO: 123) (j) Xaa-Asp-Ser-Glu-Lys-Ser-Ala-Thr-Ile-Lys-Val-Thr-AspAla-Ser (SEQ ID NO: 129) (k) Ala-Gly-Asp-Thr-Xaa-Ile-Tyr-Ile-Val-Gly-Asn-Leu-ThrAla-Asp (SEQ ID NO: 130) (l) Ala-Pro-Glu-Ser-Gly-Ala-Gly-Leu-Gly-Gly-Thr-Val-GlnAla-Gly (SEQ ID NO: 131) kde Xaa může být libovolná aminokyselinová sekvence, upřednostňuje se cysteinový zbytek. Sekvence DNA kódující • · ······· · · ···· ·· ·· ·· ·· ·· antigen určený shora v textu jako (g) se popisuje v sekvenci SEQ ID NO: 52, předpokládaná aminokyselinová sekvence se popisuje v SEQ ID NO: 53. Sekvence DNA kódující antigen určený shora v textu jako (a) je uveden v SEQ ID NO: 96; jeho dedukovaná aminokyselinová sekvence je uvedena v SEQ ID NO: 97. Sekvence DNA odpovídající antigenu (d) je uvedena v SEQ ID NO: 24, Sekvence DNA odpovídající antigenu (c) se uvádí v SEQ ID NO: 25 a DNA sekvence odpovídající antigenu (1) se popisuje v SEQ ID NO: 94 a její dedukovaná aminokyselinová sekvence je uvedena v SEQ ID NO: 95.
V dalším specifickém provedení vynálezu se popisují polypeptidy obsahující alespoň imunogenní část antigenu mikroorganizmu M. tuberculosis, který vykazuje jednu z následujích N-terminálních sekvencí nebo jejich variantu, které se liší pouze konzervativními substitucemi a/nebo modifikacemi:
(m) Xaa-Tyr-Ile-Ala-Tyr-Xaa-Thr-Thr-Ala-Gly-Ile-Val-ProGly-Lys-Ile-Asn-Val-His-Leu-Val (SEQ ID NO: 132) nebo (n) Asp-Pro-Pro-Asp-Pro-His-Gln-Xaa-Asp-Met-Thr-Lys-GlyTyr-Tyr-Pro-Gly-Gly-Arg-Arg-Xaa-Phe (SEQ ID NO: 124) kde Xaa může být libovolná aminokyselina, přičemž se upřednostňuje cysteinový zbytek.
V jiném specifickém provedení vynálezu se popisují polypeptidy obsahující alespoň antigenní část rozpustného antigenu mikroorganizmu M. tuberculosis (nebo varientu takového antigenu), která obsahuje jednu nebo více aminokyselinových sekvencí kódovaných (a) sekvencemi DNA uvedenými v SEQ ID NO: 1, 2, 4-10, 13-25, 52, 94 a 96 a (b) doplňky takových sekvencí DNA nebo (c) sekvencemi DNA v podstatě homologními se sekvencí (a) nebo (b).
V dalších specifických provedeních vynálezu se popisují polypeptidy obsahující alespoň antigenní část antigenu mikroorganizmu M. tuberculosis (nebo varianty takového antigenu), který může nebo nemusí být rozpustný a obsahuje .
······· · · ···· ·· ·· ·· ·· ·· jednu nebo více aminokyselinových sekvencí kódovaných (a) sekvencemi DNA uvedenými v SEQ ID NO: 26-51, 133, 134, 158178 a 196, (b) doplňky takových sekvencí nebo (c) sekvencemi
DNA, které jsou v podstatě homologní se sekvencí uvedenou v (a) nebo (b).
Ve specifickém shora popsaném provedení vynálezu antigeny mikroorganizmu M. tuberculosis zahrnují varianty, které jsou kódovány sekvencemi DNA, jenž jsou v podstatě homologní s jednou nebo více ze zde uvedených sekvencí DNA. Termín „v podstatě homologní znamená sekvence DNA, které jsou schopny hybridizovat za stringentních podmínek. Vhodné stringentní podmínky zahrnují promytí v roztoku 5XSSC, 0,5 % SDS, 1,0 mM EDTA (pH8,0); hybridizaci při teplotě 50 °C až 65 °C, v roztoku 5XSSC, přes noc nebo v případě homologie mezi specie hybridizace probíhá při teplotě 45 °C v roztoku 0,5 X SSC; pak následuje dvakrát promytí s každým z roztoků 2X, 0,5X a 0,2X
SSC obsahujícím 0,1% SDS při teplotě 65 °C po dobu 20 minut. Takové hybridizující sekvence DNA také zahrnuje vynález. Jsou to nukleotidové sekvence, které kódují imunogenní polypeptid.
Vynález také popisuje fúzní proteiny, které obsahují první a druhý polypeptid podle vynálezu nebo v jiném případě polypeptid podle vynálezu a známý antigen mikroorganizmu M. tuberculosis , jako je shora v textu popsaný antigen o molekulové hmotnosti 38 000, nebo ESAT-6 (SEQ ID NO: 98 a 99). Fúzní proteiny podle vynálezu mohou také zahrnovat mezi prvním a druhým polypeptidem linkerový peptid.
Sekvence DNA kódující fúzní protein podle vynálezu se zkonstruoval za použití známých rekombinantních postupů za účelem začlenění oddělených sekvencí DNA kódujících první a druhý polypeptid do vhodného expresivního vektoru. 3'konec sekvence DNA kódující první polypeptid se ligoval s nebo bez peptidového linkeru k 5'konci sekvence DNA, která kóduje druhý polypeptid tak, že čtecí rámce sekvencí jsou ve fázi, jenž umožní translací mRNA dvou sekvencí DNA na jeden fúzní • · ······· · · ···· ·· ·· ·· ·· ·· protein, který si zachová biologickou aktivitu jak prvního tak druhého polypeptidu.
Sekvence peptidového linkeru je možné použít k separaci prvního a druhého polypeptidu na vzdálenost, jenž je dostatečná, aby se každý polypeptid balil do své sekundární a terciální struktury. Taková sekvence peptidového linkeru se začlenila do fúzního proteinu za použití standardních metod, které jsou dobře známy v oboru. Vhodné sekvence peptidového linkeru se mohou vybrat na základě následujících faktorů (1) jejich schopnost přijmout flexibilní extendovanou konformaci, (2) jejich neschopnost přijmout sekundární strukturu, která může interagovat s funkčními epitopy na prvním a druhém polypeptidu a (3) nedostatek hydrofóbních nebo nabitých zbytků, které mohou reagovat s funkčním epitopem polypeptidu.
Preferované sekvence peptidového linkeru obsahují Gly, Asn a Ser zbytky. V linkerové sekvenci je možné použít taky další neutrální aminokyseliny, jako jsou Thr a Ala. Aminokyselinové sekvence, které je možné použít jako linkery se popisují v publikaci Maratea et al., Gene 40: 39-46, 1985; Murphy et al., Proč. Nati. Acad. Sci. USA 83: 8258-8562, 1986; U.S.
Patent č. 4,935,233 a U.S. Patent č. 4,751, 180. Linkerové sekvence mohou být tvořeny jednou až 50 aminokyselinami. Sekvence peptidového linkeru nejsou nutné v případě, že první a druhý polypeptid má nepodstatnou N-terminální aminokyselinovou oblast, která se může použít při separaci funkčních domén a sloužit jako prevence sférické překážky.
Vynález poskytuje způsoby použití shora popsaných polypeptidů při diagnostice tuberkulózy. Uvedené způsoby se používají při detekci infekce mikroorganizmem M. tuberculosis v biologických vzorcích za použití jednoho nebo více shora uvedených peptidů a to buď samotných nebo v kombinaci. V provedeních vynálezu, kde se používá více polypeptidů, je • · ve vzorku, předchozí které mohou možné použít jiné polypeptidy, než jsou ty zde popsané, jako je například antigen o molekulové hmotnosti 38 000, jenž se popisuje v publikaci Andersen and Hansen, Infect. Immun. 57: 2481-2488, 1989. Termín „biologický vzorek je libovolný protilátky obsahující vzorek získaný z pacienta. Upřednostňuje se, aby vzorek byl plná krev, sputum, sérum, plazma, sliny, mozkomíšní mok nebo moč. Výhodnější je, aby vzorkem byla krev, sérum nebo plazma a vzorek se získal od pacienta nebo z krevní banky. Polypeptid(y) se používají v testu, jak se popisuje shora v textu, za účelem stanovení přítomnosti nebo absence protilátek proti polypeptidu(ům) takových protilátek indikuje k mykobakteriálním antigenům, tuberkulózu.
V provedeních vynálezu, kde se používá více jak jeden polypeptid je výhodné, aby polypeptidy byly komplementární (to znamená, že jeden komponent polypeptidu se použije při detekci infekce ve vzorcích, kde infekci nelze detekovat jiným komponentem polypeptidu). Komplementární polypeptidy je možné obecně identifikovat použitím jednotlivých polypeptidů, aby se vyhodnotily vzorky sér získané ze skupiny pacientů, o kterých se ví, že jsou infikováni mikroorganizmem M. tuberculosis. Když se stanoví, který test vzorků je pozitivní (jak se popisuje dále v textu) s každým polypeptidem, může se vytvořit kombinace dvou nebo více polypeptidů, které jsou schopny detekovat infekci u většiny nebo u všech testovaných vzorků. Takové polypeptidy jsou komplementární. Přibližně 25 až 30 % vzorků séra z jednotlivců infikovaných tuberkulózou jsou negativní na protilátky proti libovolnému samotnému proteinu, jako je například shora zmíněný antigen o molekulové hmotnosti 38 000. Komplementární polypeptidy se proto mohou použít v kombinaci s antigenem o molekulové hmotnosti 38 000, aby se zvýšila citlivost diagnostického testu.
Přítomnost senzibilace indikovat
Harlow and Lané, Antibodies: Harbor Laboratory, 1988).
Existuje řada formátů testů, které může odborník použít pro detekci protilátek ve vzorku (popisuje se v publikaci A Laboratory Manual, Cold Spring Preferované provedení vynálezu zahrnuje použití polypeptidu imobilizovaného na pevné podpoře. Na něj navážou protilátky a a tím se odstraní ze vzorku. Vázané protilátky se pak mohou detekovat za použití detekčního činidla , které obsahuje reportní skupinu. Vhodné detekční činidla zahrnují protilátky, které se váží na komplex protilátka/polypeptid a volný polypeptid se značí reportní skupinou (např. semi-kompetativním testu). V jiném případě se může využít kompetativní test, kde protilátky, které se vážou na polypeptid jsou značeny reportní skupinou a umožňují po inkubaci antigenů se vzorkem navázat imobilizovány antigen. Rozsah, ve kterém komponenty vzorku inhibují navázání značených protilátek na polypeptid indikuje reaktivitu vzorku s zmobilizovaným polypeptidem.
Pevným podkladem může být libovolný pevný materiál, který je dobře znám v oboru a na který se může antigen zachytit. Pevným podkladem může být testovací prohlubeň mikrotitrační destičky nebo nitrocelulózová nebo jiná vhodná membrána. V jiném případě pevným podkladem mohou být kuličky nebo disky, skleněná vlákna, latex nebo plastový materiál, jako je polystyren nebo polyvinylchlorid. Pevným podkladem mohou být také magnetické částice nebo vláknitý optický senzor, jak se popisuje v U.S. patentu č. 5,359,681.
Polypeptidy se mohou vázat na pevný podklad za použití řady způsobů, které jsou známy v oboru, jejichž použití se popisuje v patentové a vědecké literatuře. V souladu s vynálezem termín „vázaný znamená nekovalentní spojení, jako je adsorpce a kovalentní spojení (které může tvořit přímé spojení mezi antigenem a funkčními skupinami na pevném podkladě nebo může jít o vazbu síťovacím činidlem). Preferuje se navázání na povrch prohlubně mikrotitrační destičky nebo na ·
• · • ··
Polypeptid se může je potažena vhodným hydroxylová skupina například vázat na membránu. V takových případech se adsorpce dosáhne kontaktem polypeptidu s pevným podkladem ve vhodném pufru, který trvá po vhodně dlouhou dobu. Doba kontaktu kolísá s teplotou, ale v typickém případě se pohybuje mezi 1 hodinou a jedním dnem. V obecném případě při kontaktu prohlubně plastikové mikrotitrační destičky (polystyren nebo polyvinylchlorid) s polypeptidem jeho množství kolísá od přibližně 10 ng do přibložně 1 ug. Upřednostňuje se množství přibližně 100 ng, které je dostatečné pro navázání dostatečného množství antigenu.
Kovalentni vazby polypeptidu na pevnou podložku se může obecně dosáhnout tak, že podložka nejdříve reaguje s bifunkčním činidlem, které bude reagovat jak s podložkou tak s funkční skupinou na polypeptidu. Touto skupinou je a aminoskupina.
podložku, která polymerním potahem za použití benzochinonu nebo kondenzací aldehydové skupiny na podložce s aminem nebo aktivním vodíkem, který se nachází na polypeptidu (uvádí se například v Pierce Immunotechnology Catalog a Handbook, 1991, A12-A13).
V jistých provedeních vynálezu je používaným testem ELISA. Tento test se provádí tak, že nejdříve dochází ke kontaktu polypeptidového antigenu imobilizovaného na pevné podložce, běžně se používají prohlubně mikrotitračních destiček, se vzorkem tak, že protilátky proti polypeptidu ve vzorku mohou reagovat s imobilizovaným polypeptidem. Nenavázaný vzorek se pak odstraní z imobilizovaného polypeptidu a přidá se detekční činidlo schopné vázat se na imobilizovaný komplex protilátkapolypeptid. Množství detekčního činidla, které zůstává navázané na pevné podložce se pak stanoví za použití způsobu vhodného pro specifickou detekci činidla.
Když je polypeptid imobilizovaný na podložce, jak se popisuje shora v textu , zbývající vazebné místo proteinu je na podložce blokováno. Za tímto účelem se může použít libovolné vhodné blokační činidlo, které je známo v oboru, jako je albumin bovinního séra nebo Tween 20™ (Sigma Chemical Co., St. Louis, MO) . Imobilizovaný polypeptid se pak inkubuje se vzorkem a protilátkám se umožní vázat se na antigen. Před inkubací se vzorek může zředit vhodným ředidlem, jako je fyziologický roztok (PBS) pufrovaný fosforečnanem. Vhodná doba kontaktu (to znamená doba inkubace) je časový úsek, který je dostatečný pro detekci přítomnosti protilátek ve vzorku infikovaném mikroorganizmem M. tuberculosis. Upřednostňuje se, aby doba kontaktu byla dostatečná pro dosažení stupně navázání, který tvoří alespoň 95 % stupně navázání při rovnováze mezi navázanými a nenavázanými protilátkami. Pro odborníka je jednoduché rozpoznat, že čas nezbytný pro dosažení rovnováhy lze jednoduše stanovit testem stupně navázání, který se objevuje během určitého časového úseku. V obecném případě je 30 minut při teplotě místnosti dostatečný inkubační čas.
Nenavázaný vzorek se pak může odstranit promytím pevného podkladu vhodným pufrem, jako je PBS obsahující 0,1 % Tween 20™. Na pevnou podložku se pak nanese detekční činidlo. Vhodné detekční činidlo je libovolný komplex protilátka-polypeptid a ten se pak detekuje libovolným způsobem, který je dobře znám v oboru. Detekční činidlo s výhodou obsahuje vazebné činidlo (jako je například protein A, protein G, imunoglobin, lektin nebo volný antigen) spojené s reportní skupinou. Preferované reportní skupiny zahrnují enzymy (jako je peroxidáza křenu), substráty, ko-faktory, inhibitory, barviva, radionuklidy, luminiscenční skupiny, fluorescenční skupiny a biotin. Konjugace vazebného činidla s reportní skupinou se může dosáhnout použitím standardních metod. Běžná vazebná činidla se také mohou spojit s různými reportními skupinami, které pocházejí z mnoha komerčních zdrojů (například Zymed Laboratories, San Francisco, CA and Pierce, Rockford, IL).
• · ······· · ·
9 9 9 99 99 99 99 99
Detekční činidlo se pak inkubuje s imobilizovaným komplexem protilátka-polypeptid po dobu, která je dostatečná k detekci navázaných protilátek. Vhodně dlouhá doba se může stanovit podle instrukcí výrobce nebo testováním stupně navázání, který se dosahuje během časového úseku. Nenavázané detekční činidlo se odstraní a navázané detekční činidlo se detekuje použitím reportní skupiny. Způsob použitý pro detekci reportní skupiny závisí na podstatě reportní skupiny.
V případě radioaktivních skupin je obecně vhodný scintilační počítač a autoradiografické metody. Spektroskopické metody lze použít při detekci barviv, luminiscenčních skupin a fluorescenčních skupin. Biotin se může detekovat za použití avidinu spojeného s různými reportními skupinami (běžně jsou to radioaktivní nebo fluorescenční skupiny nebo enzymy). Enzymové reportní skupiny se mohou detekovat přidáním substrátu (po specifickou dobu) a pak následuje spektroskopická nebo jiná analýza reakčních produktů.
Za účelem stanovení přítomnosti nebo absence protilátek proti mikroorganizmu M. tuberculosis ve vzorku se srovnává signál detekovaný z reportní skupiny, která zůstává navázána na pevné podložce, se signálem, jenž odpovídá s předem určenou hraniční hodnotou. V jednom preferovaném provedení vynálezu předem určená hodnota je průměrný signál získaný v případě, že imobilizovaný antigen se inkubuje se vzorky z neinfikovaného pacienta. Vzorek, který generuje signál, jenž je o tři standardní odchylky vyšší než předem určená hraniční hodnota, se považuje za pozitivní, co se týká výskytu tuberkulózy.
V jiném preferovaném provedení se předem určená hraniční hodnota stanoví za použití křivky příjemce-operátor („Receiver Operátor Curve) podle metody, která se popisuje v publikaci Sackett et al., Clinical Epidemiology: A Basic Science for Clinical Medicine, Little Brown and Co., 1985, pp. 106-107.
V tomto provedení vynálezu se může hraniční hodnota stanovit z grafu, kam se vynáší skutečný pozitivní rozsah (to znamená • · citlivost) a falešný pozitivní rozsah (to znamená 100 % specifita), který koresponduje s každou možnou hraniční hodnotou výsledku diagnostického testu. Hraniční hodnota na grafu, která je nejblíže hornímu rohu po levé ruce (to znamená hodnota, která uzavírá největší plochu) je nejpřesnější hraniční hodnota a vzorek generující signál, který je vyšší než hraniční hodnota, se může považovat za pozitivní. V jiném případě se hraniční hodnota může posunout po grafu doleva, aby se minimalizoval falešný pozitivní rozsah nebo doprava, aby se minimalizoval falešný negativní rozsah. Vzorek generující signál, který je vyšší než hraniční hodnota se stanovil zde uvedeným způsobem, se považuje v případě tuberkulózy za pozitivní.
V podobném provedení vynálezu se test uskutečnil testem ve formátu s rychlým průtokem nebo ve stripovacím formátu, kde antigen je imobilizovaný na membráně, jako je nitrocelulóza. Při průtočném testu se protilátky ve vzorku váží na imobilizovaný polypeptid, přičemž vzorek prochází membránou. Detekční činidlo (např. komplex protein A-koloidní zlato) se pak váže na komplex protilátka-polypeptid, přičemž roztok obsahující detekční činidlo prochází membránou. Detekce vázaného detekčního činidla se pak provede způsobem popsaným shora v textu. Při testu ve stripovacím formátu se jeden konec membrány, na které je navázaný polypeptid, ponoří do roztoku, jenž obsahuje vzorek. Vzorek migruje podél membrány oblastí obsahující detekční činidlo a do oblasti s imobilizovaným polypeptidem. Koncentrace detekčního činidla na polypeptidů indikuje ve vzorku přítomnost protilátek proti-mikroorganizmu M. tuberculosis. Koncentrace detekčního činidla v uvedeném místě generuje viditelný patern, jako je čára. Nepřítomnost takového paternu indikuje negativní výsledek. Stanovilo se množství polypeptidů imobilizovaného na membránu, které je dostatečné pro vytvoření vizuálně rozeznatelného paternu v případě, že vzorek obsahuje množství protilátek, které je • · dostatečné pro vznik pozitivního signálu v testu ELISA, jak se popisuje shora v textu. Upřednostňuje se, aby množství polypeptidů imobilizovaného na membráně bylo v rozmezí mezi přibližně 25 ng až přibližně 1 ug, výhodnější je rozmezí od přibližně 50 ng do přibližně 500 ng. Takové testy je možno v typickém případě provést s velmi malým množstvím (například jedna kapka) séra nebo krve pacienta.
Samozřejmě existuje řada jiných protokolů, které jsou vhodné pro použiti polypeptidů podle vynálezu.
Dále vynález popisuje protilátky proti polypeptidům podle vynálezu. Protilátky se mohou připravit libovolnou z řady metod známých v oboru. Tyto metody se popisují v publikaci Harlow and Lané, Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, 1988. Při takové metodě se imunogen obsahující antigenní polypeptid zavedl injekcí do libovolného z řady savců (například myš, krysa, králík, ovce a koza). V tomto kroku polypeptidy podle vynálezu mohou sloužit jako imunogen, aniž se modifikují. V jiném případě zvláště v případě relativně krátkých polypeptidů se dosáhne silné imunitní odezvy, jestliže polypeptid se spojil s nosičovým proteinem, jako je bovinní sérový albumin nebo hemocyanin kuželnatky. Imunogen se zavede injekcí do zvířecího hostitele. Upřednostňuje se předem stanovit rozvrh, který zahrnuje jednu nebo více dávek imunizace. Ze zvířat se v pravidelných intervalech odebírá krev. Polyklonální protilátky, které jsou specifické pro polypeptid, se pak mohou izolovat z antiséra například afinitní chromatografií za použití polypeptidů spojeného s vhodným pevným nosičem. Monoklonální protilátky, které jsou specifické pro antigenní polypeptid se mohou připravovat například použitím metody popsané v publikaci Kohler and Milstein, Eur. J. Immunol. 6: 511-519, 1976. Tyto metody zahrnují přípravu buněčných linií, které jsou schopny produkovat protilátky vykazující požadovanou specifitu (to znamená reaktivitu s polypeptidem. Takové buněčné linie se • · • · ······· · · ···· ·· ·· ·· ·· ·· mohou produkovat například z buněk sleziny ze zvířat, která se imunizovala, jak se popisuje shora v textu. Buňky sleziny se pak immortalizuji například fúzí s myelomovým buněčným fúzním partnerem, upřednostňuje se ten, který je syngenní s imunizovaným zvířetem. Může se použít řada fúzních metod. Například se mohou kombinovat na několik minut buňky sleziny a myelomu s neiontovým detergentem a pak se mohou v nízké hustotě nanést na plotnu se selektivním médiem, které podporuje růst hybridních buněk, ale nikoli buněk myelomu. Preferované způsoby selekce používají HAT (hypoxantin, aminopterin, tymidin) selekci. Po uplynutí dostatečně dlouhé doby, většinou to jsou přibližně jeden až dva týdny, se objeví hybridy. Selektují se jednotlivé kolonie a testuje se jejich vazebná aktivita proti polypeptidu. Preferují se hybridomy s vysokou reaktivitou a specifitou.
Ze supernatantů se izolují rostoucí kolonie hybridomu. Aby se zvýšil výtěžek mohou se použít různé metody, jako je zavedení buněčné linie hybridomu injekcí do peritoneální kavity vhodného obratlovce, jako je například myš. Monoklonální protilátky se mohou pak sklízet z kapaliny ascitů nebo z krve. Kontaminanty je možné z protilátek odstranit použitím běžných metod, jako je chromatografie, gelová filtrace, precipitace a extrakce. Polypeptidy podle vynálezu se mohou použít v čistícím procesu, jako je například afinitní chromatografie.
Protilátky se mohou použít v diagnostických testech při detekci přítomnosti antigenů mikroorganizmu M. tuberculosis za použití testů podobných těm, které se detailněji popisují shora v textu, a jiných metod známých v oboru, přičemž tak vznikají metody pro detekci infekce pacienta mikroorganizmem M. tuberculosis.
Diagnostická činidla podle vynálezu mohou také obsahovat sekvence DNA kódující jeden nebo více shora popsaných polypeptidů nebo jednu nebo více jejich částí. Při testu
Q Λ ···· ···
Z4 ··· · ···· ι«· · ·· založeném, na polymerázové řetězcové reakci (PCR) se mohou použít alespoň dva oligonukleotidové primery za účelem amplifikace cDNA mikroorganizmu M. tuberculosis získané z biologického vzorku, přičemž alespoň jeden z oligonukleotidových primerů je specifický pro molekulu DNA kódující polypeptid podle vynálezu. Přítomnost amplifikované cDNA se pak detekuje za použití metod, které jsou dobře známy v oboru, jako je gelová elektroforéza. V podobném případě oligonukleotidové sondy, které jsou specifické pro molekulu DNA kódující polypeptid podle vynálezu se mohou použít při hybridizací za účelem detekovat přítomnost polypeptidu podle vynálezu v biologickém vzorku.
Termín „oligonukleotidový primer/sonda specifická pro molekulu DNA znamená oligonukleotidovou sekvenci, která vykazuje alespoň přibližně 80 %, s výhodou alespoň přibližně 90 % a nejvýhodnější je alespoň přibližně 95 % identity s molekulou DNA, jenž je středem zájmu. Oligonukleotidové primery/nebo sondy, které se mohou použít při diagnostických metodách podle vynálezu s výhodou mají alespoň přibližně 10 až 40 nukleotidů. V preferovaném provedení oligonukleotidové primery obsahují alespoň přibližně 10 po sobě jdoucích nukleotidů molekuly DNA kódující jeden ze zde popsaných polypeptidů. Upřednostňuje se, aby oligonukleotidové sondy, které se používají při diagnostických metodách podle vynálezu, obsahovaly alespoň přibližně 15 po sobě jdoucích oligonukleotidů molekuly DNA kódující jeden ze zde popsaných nukleotidů. Metody testů založených na hybridizací a PCR jsou dobře známy v oboru (například Mullis et al., Ibid; Ehrlich, Ibid.). Primery nebo sondy se mohou také použít při detekci sekvencí specifických pro mikroorganizmus M. tuberculosis v biologickém vzorku. Proby DNA nebo primery, které obsahují zde popsané oligonukleotidové sekvence se mohou použít samostatně, v kombinaci s jinými sekvencemi nebo s dříve antigen o toto·· » · * · · · · ··· to · ··« · to · to • •••••to to to ···· ·· ·· · * to · ·· definovanými sekvencemi, jako molekulové hmotnosti 38 000.
je zde uvedený
Přehled obrázků na výkrese
Na obrázku č. 1A a B je zobrazena stimulace proliferace produkce interferonu-γ v T buňkách získaného od prvního a druhého imunitního donora M. tuberculosis pomocí antigenů o molekulové hmotnosti 14 000, 20 000 a 26 000, jak se popisuje v příkladu 1.
Na obrázcích 2A až D ukazuje reaktivitu antiséra proti sekrečním proteinům mikroorganizmu M. tuberculosis , známému antigenů M. tuberculosis 85b a antigenům Tb38-1 a TbH-9 s lyzátem M. tuberculosis (dráha 2), se sekrečními proteiny (dráha 3), s rekombinantním Tb38-1 (dráha 4), rekombinantní TbH-9 (dráha 5) a rekombinantní 85b (dráha 5).
Obrázek č. 3A ukazuje stimulaci proliferace v TbH-9specifických klonech T buněk sekrečními proteiny M. tuberculosis, rekombinantním TbH-9 a kontrolním antigenem TbRall.
Obrázek č. 3B ukazuje stimulaci produkce interferonu-γ v TbH-9-specifickém klonu T buněk sekrečními proteiny M. tuberculosis, PPD a rekombinantním TbH-9.
Obrázek č. 4 ukazuje reaktivitu dvou reprezentativních polypeptidů se sérem od infikovaných a neinfikovaných jedinců mikroorganizmem M. tuberculosis ve srovnání s reaktivitou bakteriálního lyzátu.
Obrázek č. 5 ukazuje reaktivitu čtyř reprezentativních polypeptidů se sérem z z infikovaných a neinfikovaných jedinců, která se srovnává s reaktivitou antigenů o molekulové hmotnosti 38 000.
Obrázek č. 6 ukazuje reaktivitu natigenu o molekulové hmotnosti 38 000 a antigenů TbRall se sérem z pacientů • ·
4 infikovaných mikroorganizmem M. tuberculosis, donorů pozitivních na PPD a normálních donorů.
Obrázek č. 7 ukazuje reaktivitu antigenu TbRa2A se sérem negativním na antigen o molekulové hmotnosti 38 000.
Obrázek č. 8 ukazuje reaktivitu antigenu se sekvencí SEQ ID NO: 60 se sérem z pacientů infikovaných mikroorganizmem M. tuberculosis a normálních donorů.
Obrázek č. 9 ukazuje reaktivitu rekombinantního antigenu TbH-29 (SEQ ID NO: 137) se sérem z pacientů infikovaných M. tuberculosis, donorů pozitivních na PPD a normálních donorů, jak stanovila nepřímá ELISA.
Obrázek č. 10 ukazuje reaktivitu rekombinantního antigenu TbH-33 (SEQ ID NO: 140) se sérem pacientů infikovaných mikroorganizmem M. tuberculosis sérem z pacientů infikovaných stanovilo přímým a nepřímým testem ELISA.
Obrázek č. 11 ukazuje reaktivitu rostoucích koncentrací rekombinantního antigenu TbH-33 (SEQ ID NO: 140) se sérem z pacientů infikovaných mikroorganizmem M. tuberculosis a z normálních donorů, jak se stanovilo testem ELISA.
a z normálních donorů a se M. tuberculosis, jak se
Výčet sekvencí:
SEQ ID NO: 1 je sekvence DNA TbRal
SEQ ID NO: 2 je sekvence DNA TbRalO.
SEQ ID NO: 3 je sekvence DNA TbRal1.
SEQ ID NO: 4 je sekvence DNA TbRal2.
SEQ ID NO: 5 je sekvence DNA TbRal3
SEQ ID NO: 6 je sekvence DNA TbRal6
SEQ ID NO: 7 je sekvence DNA TbRal7
SEQ ID NO: 8 je sekvence DNA TbRal8
SEQ ID NO: 9 je sekvence DNA TbRal9
SEQ ID NO: 10 je sekvence DNA TbRa24
SEQ ID NO: 11 je sekvence DNA TbRa26
SEQ ID NO: 12 je sekvence DNA TbRa28
• · • ·· • 9 • ··«
9 9 9 9 9 9 9 ·
Φ · · φ 9 9 99 9 9 9 9 9 9
SEQ ID NO: 13 je sekvence DNA TbRa29
SEQ ID NO: 14 je sekvence DNA TbRa2A
SEQ ID NO: 15 je sekvence DNA TbRa3
SEQ ID NO: 16 je sekvence DNA TbRa32
SEQ ID NO: 17 je sekvence DNA TbRa35
SEQ ID NO: 18 je sekvence DNA TbRa36
SEQ ID NO: 19 je sekvence DNA TbRa4
SEQ ID NO: 20 je sekvence DNA TbRa9
SEQ ID NO: 21 je sekvence DNA TbRaB
SEQ ID NO: 22 je sekvence DNA TbRaC
SEQ ID NO: 23 je sekvence DNA TbRaD
SEQ ID NO: 24 je sekvence DNA YYWCPG
SEQ ID NO: 25 je sekvence DNA AAMK
SEQ ID NO: 26 je sekvence DNA TbL-23
SEQ ID NO: 27 je sekvence DNA TbL-24
SEQ ID NO: 28 je sekvence DNA TbL-25
SEQ ID NO: 29 je sekvence DNA TbL-28
SEQ ID NO: 30 je sekvence DNA TbL-29
SEQ ID NO: 31 je sekvence DNA TbH-5
SEQ ID NO: 32 je sekvence DNA TbH-8
SEQ ID NO: 33 je sekvence DNA TbH-9
SEQ ID NO: 34 je sekvence DNA TbM-1
SEQ ID NO: 35 je sekvence DNA TbM-3
SEQ ID NO: 36 je sekvence DNA TbM-6
SEQ ID NO: 37 je sekvence DNA TbM-7
SEQ ID NO: 38 je sekvence DNA TbM-9
SEQ ID NO: 39 je sekvence DNA TbM-12
SEQ ID NO: 40 je sekvence DNA TbM-13
SEQ ID NO: 41 je sekvence DNA TbM-14
SEQ ID NO: 42 je sekvence DNA TbM-15
SEQ ID NO: 43 je sekvence DNA TbH-4
SEQ ID NO: 44 je sekvence DNA TbH-4-FWD.
SEQ ID NO: 45 je sekvence DNA TbH-12
SEQ ID NO: 46 je sekvence DNA Tb38-1
28 9 9 9 9 9 99 9 9 9 9999 99 « 9 9 9 9 999 9 9 4 9 99 99 • 9 · · • · · · i · ·· ··
SEQ ID NO: 47 je sekvence DNA Tb38-4 SEQ ID NO: 48 je sekvence DNA TbL-17 SEQ ID NO: 49 je sekvence DNA TbL-20 SEQ ID NO: 50 je sekvence DNA TbL-21 SEQ ID NO: 51 je sekvence DNA TbH-16 SEQ ID NO: 52 je sekvence DNA DPEP SEQ ID NO: 53 je dedukovaná aminokyselinová sekvence DPEP
SEQ ID NO: 54 je proteinová sekvence DPV N-terminálního
antigenů SEQ ID NO: 55 je proteinová sekvence AVGS N-terminálního
antigenů SEQ ID NO: 56 je proteinová sekvence AAMK N-terminálního
antigenů SEQ ID NO: 57 je proteinová sekvence YYWC N-terminálního
antigenů SEQ ID NO: 58 je proteinová sekvence DIGS N-terminálního
antigenů SEQ ID NO: 59 je proteinová sekvence AEES N-terminálního
antigenů SEQ ID NO: 60 je proteinová sekvence DPEP N-terminálního
antigenů SEQ ID NO: 61 je proteinová sekvence APKT N-terminálního
antigenů SEQ ID NO: 62 je proteinová sekvence DPAS N-terminálního
antigenů
SEQ ID NO: 63 je dedukovaná aminokyselinová sekvence peptidů
TbM-1
SEQ ID NO: 64 je dedukovaná aminokyselinová sekvence TbRal
SEQ ID NO: 65 je dedukovaná aminokyselinová sekvence TbRalO
SEQ ID NO: 66 je dedukovaná aminokyselinová sekvence TbRall
SEQ ID NO: 67 je dedukovaná amino kyselinová sekvence TbRal2
SEQ ID NO: 68 je dedukovaná aminokyselinová sekvence TbRal3
SEQ ID NO: 69 je dedukovaná aminokyselinová sekvence TbRal6
SEQ ID NO: 70 je dedukovaná aminokyselinová sekvence TbRal7
······· · · ···« ·· ·· ·· ·· ··
SEQ ID NO: 71 je dedukovaná aminokyselinová sekvence TbRal8
SEQ ID NO: 72 je dedukovaná aminokyselinová sekvence TbRal9
SEQ ID NO: 73 je dedukovaná aminokyselinová sekvence TbRa24
SEQ ID NO: 74 je dedukovaná aminokyselinová sekvence TbRa26
SEQ ID NO: 75 je dedukovaná aminokyselinová sekvence TbRa28
SEQ ID NO: 76 je dedukovaná aminokyselinová sekvence TbRa29
SEQ ID NO: 77 je dedukovaná aminokyselinová sekvence TbRa2A
SEQ ID NO: 78 je dedukovaná aminokyselinová sekvence TbRa3
SEQ ID NO: 79 je dedukovaná aminokyselinová sekvence TbRa32
SEQ ID NO: 80 je dedukovaná aminokyselinová sekvence TbRa35
SEQ ID NO: 81 je dedukovaná aminokyselinová sekvence TbRa36
SEQ ID NO: 82 je dedukovaná aminokyselinová sekvence TbRa4
SEQ ID NO: 83 je dedukovaná aminokyselinová sekvence TbRa9
SEQ ID NO: 84 je dedukovaná aminokyselinová sekvence TbRaB
SEQ ID NO: 85 je dedukovaná aminokyselinová sekvence TbRaC
SEQ ID NO: 86 je dedukovaná aminokyselinová sekvence TbRaD
SEQ ID NO: 87 je dedukovaná aminokyselinová sekvence YYWCPG
SEQ ID NO: 88 je dedukovaná aminokyselinová sekvence TbAAMK
SEQ ID NO: 89 je dedukovaná aminokyselinová sekvence Tb38-1
SEQ ID NO: 90 je dedukovaná aminokyselinová sekvence TbH-4
SEQ ID NO: 91 je dedukovaná aminokyselinová sekvence TbH-8
SEQ ID NO: 92 je dedukovaná aminokyselinová sekvence TbH-9
SEQ ID NO: 93 je dedukovaná aminokyselinová sekvence TbH-12
SEQ ID NO: 94 je sekvence DNA DPAS
SEQ ID NO: 95 je dedukovaná aminokyselinová sekvence DPAS
SEQ ID NO: 96 je sekvence DNA DPV
SEQ ID NO: 97 je dedukovaná aminokyselinová sekvence DPV
SEQ ID NO: 98 je sekvence DNA ESAT-6
SEQ ID NO: 99 je dedukovaná aminokyselinová sekvence EASAT-6
SEQ ID NO: 100 je sekvence DNA TbH-8-2
SEQ ID NO: 101 je sekvence DNA TbH-9FL
SEQ ID NO: 102 je dedukovaná aminokyselinová sekvence TbH-9FL
SEQ ID NO: 103 je sekvence DNA TbH-9-1
SEQ ID NO: 104 je dedukovaná aminokyselinová sekvence TbH-9-1
• · · • · · · • · ···· ·· ·· ·· ·· ··
SEQ ID NO: 105 je sekvence DNA TbH-9-4
SEQ ID NO: 106 je dedukovaná aminokyselinová sekvence TbH-9-4
SEQ ID NO: 107 je sekvence DNA Tb38-1F2IN
SEQ ID NO: 108 je sekvence DNA TbH-lF2 RP
SEQ ID NO: 109 je dedukovaná aminokyselinová sekvence Tb37-FL
SEQ ID NO: 110 je dedukovaná aminokyselinová sekvence Tb38-IN
SEQ ID NO: 111 je sekvence DNA Tb38-1F3
SEQ ID NO: 112 je dedukovaná aminokyselinová sekvence Tb38-1F3
SEQ ID NO: 113 je sekvence DNA Tb38-1F5
SEQ ID NO: 114 je sekvence DNA Tb38-1F6
SEQ ID NO : 115 je dedukovaná N-terminální aminokyselinová
sekvence DPV
SEQ ID NO: 116 je dedukovaná N-terminální aminokyselinová
sekvence AVGS
SEQ ID NO: 117 je dedukovaná N-terminální aminokyselinová
sekvence AAMK
SEQ ID NO: 118 je dedukovaná N-terminální aminokyselinová
sekvence YYWC
SEQ ID NO: 119 je dedukovaná N-terminální aminokyselinová
sekvence DIGS
SEQ ID NO: 120 je dedukovaná N-terminální aminokyselinová
sekvence AAES
SEQ ID NO: 121 je dedukovaná N-terminální aminokyselinová
sekvence DPEP
SEQ ID NO: 122 je dedukovaná N-terminální aminokyselinová
sekvence APKT
SEQ ID NO: 123 je dedukovaná N-terminální aminokyselinová
sekvence DPAS
SEQ ID NO: 124 je proteinová sekvence DPPD N-terminálního
antigenu
SEQ ID NO: 125-128 jsou proteinové sekvence čtyř fragmentů DPPD cyanogenbromidu
SEQ ID NO: 129 je N-terminální proteinová sekvence antigenu XDS ···· ··· ···· • · · · ···· · ·· · ······· · ·
00·· 00 00 00 00 00
SEQ AGD ID NO: 130 je N-terminální proteinová sekvence antigenu
SEQ APE ID NO: 131 je N-terminální proteinová sekvence antigenu
SEQ XYI ID NO: 132 je N-terminální proteinová sekvence antigenu
SEQ ID NO: 133 je sekvence DNA antigenu TbH-29
SEQ ID NO: 134 je sekvence DNA antigenu TbH-30
SEQ ID NO: 135 je sekvence DNA antigenu TbH-32
SEQ ID NO: 136 je sekvence DNA antigenu TbH-33
SEQ 29 ID NO: 137 je předpokládaná aminokyselinová sekvence TbH-
SEQ 30 ID NO: 138 je předpokládaná aminokyselinová sekvence TbH-
SEQ 32 ID NO: 139 je předpokládaná aminokyselinová sekvence TbH-
SEQ 33 ID NO: 140 je předpokládaná aminokyselinová sekvence TbH-
SEQ ID NO: 141-146 jsou primery pro PCR užívané při přípravě
fúzního proteinu obsahujícího TbRa3, proteinu o molekulové hmotnosti 38 000 a Tb38-1.
SEQ ID NO: 147 je sekvence DNA fúzního proteinu obsahujícího
TbRa3, proteinu o molekulové hmotnosti 38 000 a Tb38-1
SEQ ID NO: 148 je aminokyselinová sekvence fúzního proteinu obsahujícího TbRa3, proteinu o velikosti 38 000 a Tb38-1
SEQ ID NO: 149 je sekvence DNA antigenu mikroorganizmu M.
tuberculosis o molekulové hmotnosti 38 000
SEQ ID NO: 150 je aminokyselinová sekvence antigenu mikroorganizmu M. tuberculosis o molekulové hmotnosti 38 000
SEQ ID NO: 151 je sekvence DNA XP14
SEQ ID NO: 152 je sekvence DNA XP24
SEQ ID NO: 153 je sekvence DNA XP31
SEQ ID NO: 154 je 5'DNA sekvence XP32
SEQ ID NO: 155 je 3'DNA sekvence XP32
• · ·
SEQ ID NO: 156 je předpokládaná aminokyselinová sekvence XP14 SEQ ID NO: 157 je předpokládaná aminokyselinová sekvence kódovaná reverzním doplňkem XP14
SEQ ID NO: 158 je sekvence DNA XP27
SEQ ID NO: 159 je sekvence DNA XP36
SEQ ID NO: 160 je 5'DNA sekvence XP4
SEQ ID NO: 161 je 5'DNA sekvence XP5
SEQ ID NO: 162 je 5'DNA sekvence XP17
SEQ ID NO: 163 je 5'DNA sekvence XP30
SEQ ID NO: 164 je 5'DNA sekvence XP2
SEQ ID NO: 165 je 3'DNA sekvence XP2
SEQ ID NO: 166 je 5'DNA sekvence XP3
SEQ ID NO: 167 je 3'DNA sekvence XP3
SEQ ID NO: 168 je 5'DNA sekvence XP6
SEQ ID NO: 169 je 3'DNA sekvence XP6
SEQ ID NO: 170 je 5'DNA sekvence XP18
SEQ ID NO: 171 je 3'DNA sekvence XP18
SEQ ID NO: 172 je 5'DNA sekvence XP19
SEQ ID NO: 173 je 3'DNA sekvence XP19
SEQ ID NO: 174 je 5'DNA sekvence XP22
SEQ ID NO: 175 je 3'DNA sekvence XP22
SEQ ID NO: 176 je 5'DNA sekvence XP25
SEQ ID NO: 177 je 3'DNA sekvence XP25
SEQ ID NO: 178 je DNA sekvence v plné délce TbH4-XPl
SEQ ID NO: 179 je předpokládaná aminokyselinová sekvence TbH4-
XP1
SEQ ID NO: 180 je předpokládaná aminokyselinová sekvence kódovaná reverzním doplňkem TbH4-XPl
SEQ ID NO: 181 je první předpokládaná aminokyselinová sekvence kódovaná XP36
SEQ ID NO: 182 je druhá předpokládaná aminokyselinová sekvence kódovaná XP36
SEQ ID NO: 183 je předpokládaná aminokyselinová sekvence kódovaná reverzním doplňkem XP36
O O · ·· · · ·· J J · · · · ···· • · · ♦ · · • · · · • · · · • · ·
SEQ ID NO: 184 je ···· · · · · ·· DNA sekvence RDIF2 • « · ·
SEQ ID NO: 185 je DNA sekvence RDIF5
SEQ ID NO: 186 je DNA sekvence RDIF8
SEQ ID NO: 187 je DNA sekvence RDIF10
SEQ ID NO: 188 je DNA sekvence RDIF11
SEQ ID NO: 189 je předpokládaná aminokyselinová sekvence RDIF2
SEQ ID NO: 190 je předpokládaná aminokyselinová sekvence RDIF5
SEQ ID NO: 191 je předpokládaná aminokyselinová sekvence RDIF8
SEQ ID NO: 192 je předpokládaná aminokyselinová sekvence
RDIF10
SEQ ID NO: 193 je předpokládaná aminokyselinová sekvence
RDIF11
SEQ ID NO: 194 je 5' DNA sekvence RDIF12
SEQ ID NO: 195 je 3' DNA sekvence RDIF12
SEQ ID NO: 196 je DNA sekvence RDIF7
SEQ ID NO: 197 je předpokládaná aminokyselinová sekvence RDIF7 SEQ ID NO: 198 je DNA sekvence DIF2-1
SEQ ID NO: 199 je předpokládaná aminokyselinová sekvence
RDIF2-1
SEQ ID NO: 200-207 jsou primery pro PCR používané při přípravě fúzního proteinu obsahujícího TbRa3, protein o molekulové hmotnosti 38 000, Tb38-1 a DPEP (zde se uvádí jako TbF-2)
SEQ ID NO: 208 je DNA sekvence fúzního proteinu TbF-2
SEQ ID NO: 209 je aminokyselinová sekvence fúzního proteinu TbF-2
Příklady provedení vynálezu
Příklad 1: Izolace polypeptidů z filtrátu kultury mikroorganizmu M. tuberculosis a jejich charakterizace.
Příklad ilustruje přípravu rozpustných polypeptidů mikroorganizmu M, tuberculosis z filtrátu kultury. Není-li · · ·«····· · · ···· ·· ·· ·· ·· v textu uvedeno jinak všechny hodnoty uvedené v procentech jsou vyjádřena jako procenta hmotnost/objemu.
Mikroorganizmus M. tuberculosis (buď H37Ra, ATCC č. 25177, nebo H37Rv, ATCC č. 25618) se kultivoval ve sterilním médiu GAS při teplotě 37 °C po dobu 14 dní. Médium se pak filtrovalo přes filtr o velikosti pórů 0,45 μ vakuovou filtrací (za účelem zachycení velké části buněk) do sterilní nádoby o objemu 2,5 1. Médium se pak filtrovalo přes filtr o velikosti pórů 0,2 μ do sterilní lahve o objemu 4 1. Pak se do filtrátu kultury přidal NaN3 o koncentraci 0,04 %. Lahve se pak umístily v chlazené místnosti, kde je teplota 4 °C.
Koncentrace filtrátu kultury se zvýšila tak, že se umístil do rezervoáru o objemu 12 1, autoklávoval se a vnesl se do míchané cely Amicon o objemu 400 ml, která se promyla etanolem a která zahrnuje membránu o 10 000 000 MWCO. Tlak se udržoval za použití plynného dusíku na hodnotě 0,42 MPa. Tento postup redukuje objem z 12 1 přibližně na 50 ml.
Filtrát kultury se pak dialyzoval do hydrogenuhličitanu amonného o koncentraci 0,1 % za použití membrány esteru celulózy o 8 000 000 MWCO, přičemž se dvakrát vyměnil roztok hydrogenuhličitanu amonného. Koncentrace proteinu se pak stanovila běžně dostupným testem BCA (Pierce, Rockford, IL).
Dialyzovaný filtrát kultury se pak lyofilizoval a polypeptidy se resuspendovaly v destilované vodě. Polypeptidy se pak dialyzovaly proti 0,01 mM 1, 3-bis[tris (hydroxymetyl) metylamino]propan, pH 7,5 (Bis-Tris propanový pufr), což jsou počáteční podmínky pro chromatografií s výměnou iontů. Frakcionace se uskutečnila za použití gelové profúzní chromatografie na POROS 146 II Q/M iontoměničové koloně o rozměrech 4,6 mm x 100 mm (Perseptive BioSystems, Framigham, MA) ekvilibrované Bis-Tris propanovým pufrem pH 7,5 o koncentraci 0,01 mM. Polypeptidy se eluovaly lineárním gradientem 0 až 0,5 M NaCl ve shora uvedeném systému pufru. Eluent se monitoroval při vlnové délce 220 nm.
• 9 • · • · ··«···· · « • · · · · *» 19 9 9 9 9 9 9
Polypeptidy eluované z iontoměničové kolony se dialyzovaly proti destilované vodě a lyofilizovaly se. Výsledný materiál se rozpustil v roztoku 0,1 % kyselině trifluorooctové (TFA) pH 1,9 ve vodě a polypeptidy se čistily na koloně Delta-Pak C18 (Waters, Milford, MA) o velikosti pórů 300 angstromů, velikosti partikulí 5 mikronů (3,9 x 150 mm) . Polypeptidy se z kolony eluovaly lineárním gradientem 0 až 60 % ředícího pufru (0,1 % TFA v acetonitrilu). Rychlost průtoku byla 0,75 ml/min a eluent HPLC se monitoroval při vlnové délce 214 nm. Tiby se dosáhlo maximální čistoty jednotlivých vzorků shromáždily se frakce obsahující eluované polypeptidy. Získalo se přibližně 200 čištěných polypeptidů.
U izolovaných polypeptidy se pak testovala schopnost indukovat proliferací T-buněk při přípravě PBMC. PBMC z donorů, o kterých se ví, že vykazují pozitivní kožní test PPD a jejichž T-buňky proliferuji jako odezva na PPD, a surové rozpustné proteiny z MTB se kultivovaly v médiu, které obsahuje RPMI 1640 doplněném 10 % sebraným lidským sérem a gentamicinem o koncentraci 50 ug/ml. Do dvou kultivačních kultur se přidaly vždy stejné izolované polypeptidy v koncentraci 0,5 až 10 ug/ml. Po šesti dnech kultivace v 96 prohlubních ploten s kulatým dnem se odstranilo z každé prohlubně médium o objemu 200 ul a 50 ul za účelem stanovení množství IFN-γ, jak se popisuje dále v textu. Plotny se pak vystavily působení 1 uCi/prohluběň tritiovaného tymidinu po dalších 18 hodin, buňky se shromáždily a stupeň pohlcení tritia se stanovil za použití plynového scintilačního počítače. Frakce, kde proliferace obou replikátů jsou třikrát vyšší než proliferace pozorovaná v buňkách kultivovaných v samotném médiu, se považuje za pozitivní.
IFN-γ se měřil za použití testu ELISA. Destičky na test ELISA se potáhly myššími monoklonálními protilátkama proti lidskému IFN-γ (Chemicon) v PBS po dobu čtyř hodin při teplotě místnosti. Pak se prohlubně blokovaly PBS, které obsahuje 5 % • · • ·
(hmotnost/objem) netučného sušeného mléka, po dobu 1 hodiny při teplotě místnosti. Pak se destičky šestkrát promyly roztokem PBS s 0,2 % TWEEN-20 a vzorky se na destičkách pro test ELISA naředily 1:2 kultivačním médiem a inkubovaly se přes noc při teplotě místnosti. Destičky se opět promyly a do každé prohlubně se přidalo polyklonální králičí anti-lidské IFN-γ sérum ředěné 1:3 000 v PBS/10 % normální kozí sérum. Destičky se pak inkubovaly po dobu dvou hodin při teplotě místnosti, promyly se a přidala se křenová peroxidáza spojená s anti-králičím IgG (Jackson Labs.) v ředění 1:2 000 v roztoku PBS/5% netučné sušené mléko. Po dalších dvou hodinách inkubace při teplotě místnosti se destičky promyly a přidal se substrát TMB. Reakce se zastavila po 20 minutách s 1 N kyselinou sírovou. Optická hustota se stanovila při vlnové délce 450 nm, přičemž vlnová délka 570 nm se použila jako referenční vlnová délka. Frakce, které vykazují dvakrát vyšší OD ve srovnání s průměrnou hodnotou OD z buněk kultivovaných v samotném médiu plus tři standardní odchylky, se považuje za pozitivní.
Za účelem sekvenování se polypeptidy jednotlivě sušily na ošetřených filtrech ze skleněných vláken Biobrene™ (Perkin Elmer/Applied BioSystems Division, Foster City, CA) . Filtry s polypeptidem se vnesly na proteinový sekvenátor Perkin Elmer/Applied BioSystems Division Procise 492. Polypeptidy se sekvenovaly od N-konce za použití tradičního postupu Edmanovi chemie. Porovnáním retenčního času PTH aminokyselinového derivátu s vhodnými standardy PTH derivátu se stanovila aminokyselinová sekvence pro každý polypeptid.
Za použití shora popsaného postupu se izolovaly antigeny, které vykazují následující N-terminální sekvence:
(a) Asp-Pro-Val-Asp-Ala- Val- Ile-Asn-Thr-Thr-Xaa-Asn-TyrGly-Gln-Val-Val-Ala-Ala-Leu (SEQ ID NO: 54) (b) Ala-Val-Glu-Ser-Gly-Met-Leu-Ala-Leu-Ala-Leu-Gly-Thr-ProAla-Pro-Ser (SEQ ID NO: 55) • · • · ·»····· · · • · · · ·· ·> · · · · ·· (c) Ala-Ala-Met-Lys-Pro-Arg-Thr-Gly-Asp-Gly-Pro-Leu-Giu-AlaAla-Lys-Glu-Gly-Arg (SEQ ID NO: 56) (d) Tyr-Tyr-Trp-Cys-Por-Gly-Gln-Pro-Phe-Asp-Pro-Ala-Trp-GlyPro (SEQ ID NO: 57) (e) Asp-Ile-Gly-Ser-Glu-Ser-Thr-Glu-Asp-Gln-Gln-Xaa-Ala-Val (SEQ ID NO: 58) (f) Ala-Glu-Glu-Ser-Ile-Ser-Thr-Xaa-Glu-Xaa-Ile-Val-Pro (SEQ ID NO: 59) (g) Asp-Pro-Glu-Pro-Ala-Pro-Pro-Val-Pro-Thr-Ala-Ala-Ala-AlaPro-Pro-Ala (SEQ ID NO: 60) a (h) Ala-Pro-Lys-Thr-Tyr-Xaa-Glu-Glu-Leu-Lys-Gly-Thr-Asp-ThrGly (SEQ ID NO: 61) kde Xaa může být libovolná aminokyselina.
Další antigen se izoloval vedle shora popsané metody použitím mikroborového HPLC izolačního kroku. Frakce obsahující směs antigenů z shora popsaného chromatografického stupně čištění o objemu 20 ul se čistila na koloně Aquapore C18 (Perkin Elmer/Applied Biosystems Division, FosterCity, CA) s velikostí pórů 7 mikronů a o velikosti kolony 1 mm x 100 mm (Perkin Elmer/Applied Biosystems Division Model 172 HPLC. Frakce se z kolony eluovaly lineárním gradientem 1 %/minutu acetonitrilu (obsahující 0,05 % TFA) ve vodě (0,05 % TFA) při rychlosti průtoku 80 ul/min. Eluent se monitoroval při vlnové délce 250 nm. Původní frakce se separovala do čtyř hlavních plků plus jiné menší komponenty a získal se polypeptid, který vykazuje molekulární hmotnost 12 054 (stanovilo se hmotnostní spektrometrií) a následující N-terminální sekvenci:
(i) Asp-Pro-Ala-Ser-Ala-Pro-Asp-Val-Pro-Thr-Ala-Ala-Gln-GlnThr-Ser-Leu-Leu-Asn-Asn-Leu-Ala-Asp-Pro-Asp-Val-Ser-PheAla-Asp (SEQ ID NO: 62)
Tento polypeptid je schopen indukovat proliferaci a produkci IFN-γ při přípravě PBMC.
0 0 · ··· ···· • 00 · · · · · · ·· 0 * · · · 0 · · · · 000 000
000««·· 0 0
00·· 00 0 · · · 00 00
Další rozpustné antigeny se izolovaly z filtrátu kultury mikroorganizmu M. tuberculosis následovně. Filtrát kultury mikroorganizmu M. tuberculosis se připravil způsobem, který se popisuje shora v textu. Provedla se dialýza proti Bis-Tris propanovému pufru při pH 5,5. Frakcionace se uskutečnila za použití aniontměničové chromatografie na koloně Poros QE o rozměrech 4,6 x 100 mm (Perseptive Biosystems) ekvilibrovaný s Bis-Tris propanovým pufrem pH 5,5. Polypeptidy se eluovaly lineárním gradientem NaCl o koncentraci 0 až 1,5 M ve shora popsaném systému při rychlosti průtoku 10 ml/min. Eluent kolony se monitoroval při vlnové délce 214 nm.
Shromáždily se frakce eluované z iontoměničové kolony a provedla se chromatografie s reverzní fází za použití kolony Poros R2 o rozměrech 4,6 x 100 mm (Perseptive Biosystems) . Polypeptidy se eluovaly z kolony lineárním gradientem 0 až 100 % acetonitrilu (0,1 % TFA) při rychlosti průtoku 5 ml/min.
Eluent se monitoroval při vlnové délce 214 nm.
Frakce obsahující eluované polypeptidy se lyofilizovaly a resuspendovaly se ve vodném roztoku 0,1 % TFA v objemu 80 ul a dále se provedla chromatografie s reverzní fází na koloně Vydac C4 o rozměrech 4,6 x 150 mm (Western Analytical, Temecula, CA) s lineárním gradientem 0 až 100 % acetonitrilu (0,1 % TFA) při rychlosti průtoku 2 ml/min. Eluent se monitoroval při vlnové délce 214 nm.
Frakce s biologickou aktivitou se separovaly do jednoho hlavního píku plus jiných menších komponentů. Westernův přenos tohoto píku na membránu PVDF ukázal tři hlavní pruhy o molekulové hmotnosti 14 000, 20 000 a 26 000. Stanovilo se, že tyto polypeptidy mají následující N-terminální sekvence:
(j ) Xaa-Asp-Ser-Glu-Lys-Ser-Ala-Thr-Ile-Lys-Val-Thr-Asp-AlaSer (SEQ ID NO: 129) (k) Ala-Gly-Asp-Thr-Xaa-Ile-Tyr-Ile-Val-Gly-Asn-Leu-Thr-AlaAsp (SEQ ID NO: 130) a « · · « : μ.
tuberculosis značených 32P, (1) Ala-Por-Glu-Ser-Gly-Ala-Gly-Leu-Gly-Gly-Thr-Val-Gln-AlaGlu (SEQ ID NO: 131), kde Xaa může být libovolná aminokyselina.
Za použití zde popsaných testů se ukázalo, že uvedené polypeptidy indukují proliferaci a produkci IFN-γ v přípravcích PBMC. Obrázek IA a B ukazují výsledky takových testů za použití přípravků PBMC z prvního a druhého donoru.
Testováním genomové knihovny mikroorganizmu M.
za použití degenerovaných oligonukleotidů které odpovídají N-terminální sekvenci a obsahují odchylku kodonu mikroorganizmu M. tuberculosis se získaly sekvence DNA, které kódují antigeny označené jako (a), (c) , (d) a (g) . Testování se uskutečnilo za použití sondy odpovídající antigenů (a), přičemž se identifikoval klon vykazující sekvenci SEQ ID NO: 96. Polypeptid kódovaný sekvencí SEQ ID NO: 96 je obsažen v sekvenci SEQ ID NO: 97. Testování se uskutečnilo za použití sondy odpovídající antigenů (g), přičemž se identifikoval klon vykazující sekvenci SEQ ID NO: 52. Polypeptid kódovaný sekvencí SEQ ID NO: 52 je obsažen v sekvenci SEQ ID NO: 53. Testování se uskutečnilo za použití sondy odpovídající antigenů (d) , přičemž se identifikoval klon vykazující sekvenci SEQ ID NO: 24 a dále se uskutečnilo testování odpovídající antigenů (c), přičemž se vykazující sekvenci SEQ ID NO: 25.
Shora uvedené aminokyselinové sekvence se porovnávaly se známými aminokyselinovými sekvencemi v genové bance za použití systému DNA STAR. Databáze obsahuje 173 000 proteinů a je kombinací databází Swiss a PIR proteinovými sekvencemi (verze sekvencemi antigenů (a) až (h) podstatné homologie.
Zjistilo se, že aminokyselinová sekvence antigenů (i) je homologní se sekvencí mikroorganizmu M. laprae. Sekvence za použití sondy identifikoval klon spolu s překládanými 87). Mezi aminokyselinovými a (1) se nedetekovaly žádné «··« · · · ···· ··· · ···· · ·· · ·· ··· ·· ·· ··· ··· ··«·*·· · · •··· ·· ·· «· ·· ·· mikroorganizmu M.laprae se z genomové DNA za použití z GENBANK. Tato sekvence se knihovny mikroorganizmu M homologu mikroorganizmu M.
NO: 94).
amplifikovala v plné délce sekvence, která se získala pak používala při testování tuberculosis a získala se kopie tuberculosis v plné délce (SEQ ID
Zjistilo se, že aminokyselinová sekvence antigenů (j) je homologní se známým proteinem mikroorganizmu M. tuberculosis překládaným ze sekvence DNA. Podle nej lepších znalostí vynálezce, nebylo známo, že tento protein dříve vykazoval stimulační aktivitu T-buněk. Zjistilo se, že aminokyselinová sekvence antigenů (k) je příbuzná se sekvencí z mikroorganizmu M. leprae.
Výsledky proliferace a testů IFN-γ pro tři shora uvedené reprezentativní antigeny za použití tří PPD pozitivních donorů se uvádějí v tabulce č. 1:
Tabulka č. 1: Výsledky PMBC proliferace a testů IFN-γ
Sekvence proliferace IFN-γ
(a) + -
(c) +++ +++
(d) ++ + +
(g) +++ +++
(h) + + + +++
V tabulce se označují odezvy, které dávají stimulační index (SI) mezi hodnotami 2 a 4 (ve srovnání s buňkami, které se kultivují v samotném médiu), jako +, SI mezi 4 až 8 nebo 2 až 4 při koncentraci 1 ug nebo méně se označují jako ++ a SI větší než 8 se označil jako +++. Zjistilo se, že antigen se sekvencí (i) vykazuje pro jeden donor vysoký SI (+++) a nižší SI (++ a +) pro dva další donory při proliferaci a testech *
··· · * · Μ t · · • · · · · · · t · * ·
9 9 9 9 · < · · W · · · ·
9 9 9 9 9 9 9
9 99 9 9 · 9 9 9 9 9
IFN-γ. Tyto výsledky indikují, že tyto antigeny jsou schopny indukovat proliferaci a/nebo produkci interferonu γ.
Příklad 2: Použití séra pacienta pro izolaci antigenů mikroorganizmu M. tuberculosis
Tento příklad zobrazuje izolaci antigenů z lyzátu mikroorganizmu M. tuberculosis testováním séra jedinců infikovaných mikroorganizmu M. tuberculosis.
Mikroorganizmus M. tuberculosis označený H37Ra (Difco Laboratories) se přidal do 2 % roztoku NP40. V jiném případě se homogenizoval a třikrát se sonifikoval. Výsledná suspenze se centrifugovala při 13 000 ot./min. v mikrocentrifugačních zkumavkách a supernatant procházel injekčním filtrem o velikosti pórů 0,2 mikronů. Filtrát se navázal na kuličky Macro Prep DEAE (BioRad, Hercules, CA) . Kuličky se extenzivně promývaly 20 mM Tris pH 7,5 a navázané proteiny se eluovaly ÍM NaCl. Eluát NaCl se dialyzoval přes noc proti 10 mM Tris pH 7,5. Dialyzivaný roztok se ošetřil DNázou a RNázou v koncentraci 0,05 mg/ml po dobu 30 minut při teplotě místnosti a pak α-D-aminázidázou v koncentraci 0,5 jednotek/mg při hodnotě pH 4,5 po dobu 3 až 4 hodin při teplotě místnosti. Po té, co pH opět dosáhlo hodnoty 7,5 materiál se frakcionoval přes FPLC za použití kolony Bio Scale-Q-20 (BioRad). Frakce se kombinovaly do devíti skupin, koncentrovaly se v Centriprep 10 Amicon, Beverly, MA) a westernovým přenosem se testovala serologická aktivita za použití séra z pacientů infikovaných mikroorganizmem M. tuberculosis, které nebylo imunoreaktivní s jinými antigeny podle vynálezu.
U nejvíce reaktivní frakce se provedl SDS-PAGE a transfer na PVDF. Pruh o molekulové hmotnosti přibližně 85 000 se vyřízl a výsledkem je sekvence:
(m) Xaa-Tyr-Ile-Ala-Tyr-Xaa-Thr-Thr-Ala-Gly-Ile-Val-Pro-GlyLys-Ile-Asn-Val-His-Leu-Val (SEQ ID NO: 132) kde Xaa může být libovolná aminokyselina.
• φ · · · « ;·= Μ» proteinového antigenů v celkovém objemu 2 ml, který obsahuje 100 ug muramyldipeptidu (Calbiochem, La Jolla, CA) a 1 ml nekompletního Freundova adjuvans. O čtyři týdny později se opět podkožně aplikovala dávka 100 ug antigenů nekompletního Freundova adjuvans. Nakonec se králík imunizoval intravenózně o čtyři týdny později s 50 ug proteinového antigenů. Antisérum se použilo k testování expresivní knihovny, jak se popisuje v publikaci Sambrook et al., Mlecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratories, Cold Spring Harbor, NY, 1989. Izolovaly se bakteriofágové plaky, které exprimují imunoreaktivní antigeny. Z plaků se získal fágemid a odvodily se nukleotidové sekvence klonů mikroorganizmu M. tuberculosis.
Izolovalo se 32 klonů. Z nich 25 reprezentuje sekvence, které nebyly dříve v mikroorganizmu M. tuberculosis identifikovány. Proteiny se idnukují IPTG a izolují se gelovou elucí, jak se popisuje v publikaci Skeiky et al., J. Exp. Med. 181: 1527-1537, 1995. V sekvencích SEQ ID NO: 1 až 25 se uvádějí reprezentativní částečné sekvence identifikovaných v tomto testu. Odpovídající aminokyselinové sekvence jsou uvedeny v SEQ ID NO: 64-88.
Porovnáním těchto sekvencí se známými sekvencemi v genové bance za použití shora popsaných databází se zjistilo, že klony jako TbRA2A, TbRA16, TbRA18 a TbRA29 (SEQ ID NO: 77, 69, 71, 76) vykazují stejnou homologii se sekvencemi dříve identifikovanými v mikroorganizmu Mycobacterium leprae, ale nikoli v mikroorganizmu M. tuberculosis. TbRAll, TbRA26, TbRA28 a TbDPEP (SEQ ID NO: 66, 74, 75, 53) byly už dříve identifikovány v mikroorganizmu M. tuberculosis. Nezjistila se podstatná homologie s TbRAl, TbRA3, TbRA4, TbRA9, TbRAlO, TbRA13, TbRA17, TbRA19, TbRA29, TbRA32, TbRA36 a překrývajícími se klony TbRA35 a TbRA12 (SEQ ID NO: 64, 78,
82, 83, 65, 68, 76, 72, 76, 81, 80, 67). Klon TbRa24 se překrývá s klonem TbRa29.
molekul DNA předpokládané • » částečný klon TbH-8 a- TbH-4 (SEQ ID NO: 43) a TbH-4-FWD (SEQ ID NO: 44) jsou sekvence ze stejného klonu, které na sebe nenavazují. Aminokyselinové sekvence antigenů, které jsou zde definovány jako Tb38-1, TbH-4, TbH-8, TbH-9 a TbH-12 jsou uvedeny v sekvenci SEQ ID NO: 89-93. Porovnání těchto sekvencí se známými sekvencemi v genové bance za použití shora uvedených databází nevykazuje žádné podstatné homologie s TbH4, TbH-8, TbH-9 a TbM-3. Ačkoli malá homologie se našla s TbH9. Zjistilo se, že TbH-12 je homologní s antigenním proteinem o molekulové hmotnosti 34 000, který se dříve identifikoval v mikroorganizmu M. paratuberculosis (Acc. No. S28515) . Zjistilo se, že Tb38-1 se nachází 34 párů baží upastream otevřeného čtecího rámce antigenu ESAT-6, který se dříve identifikoval v mikroorganizmu M. bovis (Acc. No. U34848) a v mikroorganizmu M. tuberculosis (Sorensen et al., Infec. Immun.63: 1710-1717, 1995).
Sondy odvozené od Tb38-1 a TbH-9, jenž se izolovaly z knihovny H37Ra, se použily pro identifikaci klonů v knihovně H37Rv. Tb38-1 hybridizoval s Tb38-1F2, Tb38-1F3, Tb38-1F5 a Tb38-1F6 (SEQ. ID NO: 107, 108, 111, 113 a 114). Sekvence SEQ ID NO: 107 a 108 jsou sekvence z klonu Tb38-1F2, nenavazují však na sebe bez přerušení. Z klonu Tb38-IF2 se odvodily dva otevřené čtecí rámce; jeden odpovídá Tb37FL (SEQ ID NO: 109) , druhý může být homolog Tb38-1 a nazývá se Tb38-IN (SEQ ID NO: 110) . Odvozená aminokyselinová sekvence Tb38-1F3 je uvedena v SEQ ID NO: 112. Sonda TbH-9 identifikovala v knihovně H37Rv tři klony: TbH-9-FL (SEQ ID NO: 101), který může být homologem TbH-9 (R37Ra) , TbH-9-1 (SEQ ID NO: 103) a TbH-8-2 (SEQ ID NO: 105), který je částečným klonem TbH-8. Odvozené aminokyselinové sekvence těchto tří klonů jsou uvedeny v SEQ ID NO: 102, 104 a 106.
Další testování knihovny genomové DNA mikroorganizmu M. tuberculosis, jak se popisuje shora v textu, vedlo k odhalení dalších reaktivních klonů, které reprezentují sedm různých
• · ' *. * * · · 1 · • · · Λ · ’
genů. Jeden z těchto genů se identifikoval jako shora uvedený antigen o molekulové hmotnosti 38 000. Stanovilo se, že jeden je identický s proteinem teplotního šoku alfa-krystalin, který byl dříve zjištěn v mikroorganizmu M. tuberculosis. Třetí gen je identický se shora popsaným antigenem TbH-8. DNA sekvence zbývajících pěti klonů (zde se označují jako TbH-29, TbH-30, TbH-32 a TbH-33) jsou uvedeny v SEQ ID NO: 133136. Předpokládané aminokyselinové sekvence jsou uvedeny v SEQ ID NO: 137-140. Sekvence DNA a aminokyselinové sekvence těchto antigenů se porovnaly se sekvencemi s genové banky, jak se popisuje shora v textu. Nezjistila se žádná homologie s 5'koncem TbH-29 (který obsahuje reaktivní otevřený čtecí rámec), ačkoli se zjistilo, že 3'konec TbH-29 je stejný jako kosmid Y227 mikroorganizmu M. tuberculosis. Zjistilo se, že TbH-32 a TbH-33 jsou identické s dříve identifikovaným inzerčním elementem IS6110 mikroorganizmu M. tuberculosis a s kosmidem Y50 mikroorganizmu M. tuberculosis. Nezjistila se podstatná homologie s TbH-30.
Pozitivní fágemid se použil k infekci bakterie E. coli XL1 Blue MRF', jak se popisuje v publikaci Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratories, Cold Spring Harbor, NY, 1989. Indukce rekombinantního proteinu se provedla přidáním IPTG. S indukovaným a neindukovaným lyzátem se provedl test SDS-PAGE ve dvou provedeních a přenesl se na nitrocelulózové filtry. Filtry reagovaly s lidským sérem proti mikroorganizmu M. tuberculosis (ředění 1:200), které je reaktivní s TbH, a s králičím sérem (ředění 1:200 nebo 1:250), které je reaktivní s N-terminální oblastí lacZ o molekulové hmotnosti 4 000. Inkubace sér trvala dvě hodiny při teplotě místnosti. Vázané protilátky se detekovaly přidáním proteinu A značeným I a následnou expozici filmu, která trvala různou dobu v rozsahu od 16 hodin do 11 dní. Výsledky imunoblotů jsou uvedeny v tabulce č. 2.
ft ·
Tabulka č. 2
antigen Lidské M. tb sérum Anti-lacZ sérum
TbH-29 45 000 45 000
TbH-30 Není reaktivní 29 000
TbH-32 12 000 12 000
TbH-33 16 000 16 000
Pozitivní reakce rekombinantních antigenů lidského mikroorganizmu M. tuberculosis s lidským M. tuberculosis sérem a anti-lacZ sérem ukazuje, že reaktivita lidského M. tuberculosis séra směřuje k fúznímu proteinu. Antigeny reaktivní s anti-lacZ sérem, ale nikoli s lidským M. tuberculosis sérem může být výsledek toho, že lidské M. tuberculosis sérum rozeznává konformační epitopy nebo kinetika navázání antigenu a protilátky může být taková, že dvouhodinová expozice séra na imunoblot není dostatečná.
Provedly se studie, aby se stanovilo, zda antigeny TbH-9 a Tb38-1 reprezentují buněčné proteiny nebo se vylučují do kultivačního média mikroorganizmu M, tuberculosis. Při první studii se králičí sérum vytvořilo proti A) sekrečním proteinům mikroorganizmu M. tuberculosis, B) proti známému sekrečnímu rekombinantnímu antigenu mikroorganizmu M. tuberculosis 85b, C) rekombinantnímu Tb-38-1 a D) rekombinantímu TbH-9 za použití protokolů, které se v podstatě popisují v příkladu 3A. Celý lyzát mikroorganizmu M. tuberculosis, koncentrovaný supernatant kultur mikroorganizmu M. tuberculosis a rekombinantí antigeny 85b, TbH-9 a Tb38-1 se oddělily na denaturujícím gelu, imobilizovaly se na nitrocelulózových membránách a duplikáty blotů se testovaly použitím králičího séra, jak se popisuje shora v textu.
Výsledky uvedené analýzy za použití kontrolního séra (panel I) a antiséra (panel II) proti sekrečním proteinům, • · • · • · ···· rekombinantnímu Tb38-1 a rekombinantnímu TbH-9 jsou uvedeny na obrázcích 2A až D, kde označení drah je následující:
1) proteinové standardy molekulárních hmotností
2) 5 ug lyzátu mikroorganizmu M. tuberculosis
3) 5 ug sekrečních proteinů
4) 50 ng rekombinantního Tb38-1
5) 50 ng rekombinantního TbH-9 a
6) 50 ng rekombinanntího 85b.
Rekombinantní antigeny se manipulovaly se šesti terminálními histidinovými zbytky a očekává se proto, že jejich pohyblivost bude o 1 000 větší než je pohyblivost nativního proteinu. Na obrázku 2D je zobrazena molekulová hmotnost rekombinantního TbH-9, která je přibližně o 10 000 menší než molekulová hmotnost antigenu v celé délce, což je 42 000. To vede k podstatnému rozdílu velikosti imunoreaktivního netivního antigenu TbH-9 v dráze lyzátu (označeno šipkou). Tyto výsledky naznačují, že Tb38-1 a TbH-9 jsou vnitrobuněčné antigeny a nejsou aktivně vylučovány mikroorganizmem M. tuberculosis.
Zjištění, že TbH-9 je vnítrobuněčný antigen se potvrdilo stanovením reaktivity klonů T buněk specifických pro TbH-9 s rekombinantním TbH-9, se sekrečními proteiny mikroorganizmu M. tuberculosis a PPD. Klon T-buněk specifický pro TbH-9 (označený 131TbH-9) se generoval z PMBC zdravých donorů pozitivních na PPD. Proliferační odezva 131TbH-9 na sekreční proteiny, rekombinanntí TbH-9 a kontrolní antigen mikroorganizmu M. tuberculosis, TbRall se stanovil měřením pohlcení tritiovaného tymidinu, jak se popisuje v příkladu 1. Jak se zobrazuje na obrázku 3A, klon 131TbH-9 specificky odpovídá TbH-9, což naznačuje, že TbH-9 není podstatný komponent sekrečních proteinů mikroorganizmu M. tuberculosis. Orázek č. 3B ukazuje produkci IFN-γ druhým klonem T-buněk specifickým pro TbH-9 ( označeným PPD 800-10) připraveným z PBMC ze zdravého donoru pozitivního na PPD, pak následuje stimulace klonu T-buněk se sekrečními proteiny, PPD nebo • · • · rekombinanntím TbH-9. Tyto výsledky dále potvrzují, že TbH-9 není vylučován mikroorganizmem M. tuberculosis.
C. Použití séra z pacientů, kteří vykazují extrapulmonární tuberkulózu, pro identifikaci sekvencí DNA kódujících antigeny mikroorganizmu M. tuberculosis.
Z mikroorganizmu M. tuberculosis z kmene Erdman se izolovala genomová DNA, náhodně se štěpila a použila se konstrukci expresivní knihovny za použití expresivního systému Lambda ZAP (Stratagene, La Jolla, CA) . Výsledná knihovna se testovala za použiti skupin sér získaných z jednotlivců s extrapulmonární tuberkulózou, jak se popisuje shora v textu v příkladu 3B, jako sekundární protilátky se použily kozí anti-lidské IgG+A+M(H+L) konjugované s alkalickou fosfatázou.
Izolovalo se 18 klonů. Zjistilo se, že čtyři z nich (zde se označují jako XP14, XP24, XP31 a XP32) nesou určitou podobnost se známými sekvencemi. Stanovené sekvence DNA XP14, XP24 a XP31 jsou uvedeny v SEQ ID NO: 151 až 153, přičemž 5' a 3'sekvence DNA XP32 jsou uvedeny v SEQ ID NO: 154 a 155. Předpokládaná aminokyselinová sekvence XP14 je uvedena v SEQ ID NO: 156. Zjistilo se, že reverzní komplement XP14 kóduje aminokyselinovou sekvenci, která je uvedena v SEQ ID NO: 157.
Porovnáním sekvencí zbývajících 14-ti klonů (zde se označují jako XP1-XP6, XP17-XP19, XP22, XP25, XP27, XP30 a
XP36) se sekvencemi v genové bance, jak se popisuje shora v textu, nevykazuje žádnou homologii s výjimkou 3'konců XP2 a XP6, které nesou homologii se známým kosmidem mikroorganizmu M. tuberculosis. Sekvence DNA XP27 a XP36 jsou uvedeny v SEQ ID NO: 158 a 159, přičemž 5'sekvence XP4, XP5, XP17 a XP30 jsou uvedeny v SEQ ID NO 160 až 163 a 5'a 3' sekvence XP2, XP3, XP6, XP18, XP19, XP22 a XP25 jsou uvedeny v SEQ ID NO: 164 a 165, 166 a 167, 168 a 169, 170 a 171, 172 a 173, 174 a 175 a 176 a 177. Zjistilo se, že XP1 se překrývá se sekvencemi DNA TbH4, jak se popisuje shora v textu. Plná délka sekvence • · ······· · · ···· ·· ·· ·· ·· ··
DNA TbH4-XPl je uvedena v SEQ ID NO: 178. Zjistilo se, že tato sekvence DNA obsahuje otevřený čtecí rámec kódující aminokyselinovou sekvenci uvedenou v SEQ ID NO: 179. Zjistilo se, že reverzní komplement TbH4-XPl obsahuje otevřený čtecí rámec kódující aminokyselinovou sekvenci uvedenou v SEQ ID NO: 180. Zjistilo se, že sekvence DNA XP36 obsahuje dva otevřené čtecí rámce kódující aminokyselinovou sekvenci uvedenou v SEQ ID NO 181 a 182, přičemž reverzní komponent obsahující otevřený čtecí rámec kódující aminokyselinovou sekvenci je uveden v SEQ ID NO: 183.
Rekombinanntí protein XP1 se připravil způsobem popsaným v příkladu 3B, přičemž při jeho čištění se použila afinitní chromatografická kolona s ionty kovu. Zjistilo se, že rekombinantí XP1 stimuluje proliferaci buněk a produkci IFN-γ v T-buňkách, které se izolovaly z donorů imunních k mikroorganizmu M. tuberculosis.
C. Příprava rozpustných antigenů mikroorganizmu M. tuberculosis za použití králičího anti-séra proti děleným proteinům mikroorganizmu M. tuberculosis
Lyzát mikroorganizmu M. tuberculosis se připravil způsobem, který se popisuje shora v textu v příkladu 2. Výsledný materiál se dělil na frakce pomocí HPLC a serologická aktivita frakcí se testovala westernovým přenosem za použití séra z pacientů infikovaných mikroorganizmem M. tuberculosis, které vykazují slabou nebo žádnou imunoreaktivitu s jinými antigeny podle vynálezu. Králičí anti-sérum se vytvořilo proti nej silněji reagující frakci za použití způsobu popsaného v příkladu 3A. Anti-sérum se použilo pro testování expresivní knihovny genomové DNA mikroorganizmu M. tuberculosis kmene Erdman, která se připravila způsobem popsaným shora v textu. Izolovaly se plaky bakteriofága, jenž exprimuje imunoreaktivní antigen. Z plaků se získal fágemid a stanovily se nukleotidové sekvence klonů mikroorganizmu M. tuberculosis.
• · · · • · ······· · · ···· ·· ·· ·· ·· *·
Izolovalo deset odlišných klonů. Zjistilo se, že jeden z nich je shora v textu uvedený TbRa35, a další z nich je dříve identifikovaný antigen mikroorganizmu M. tuberculosis HSP60. Dále se zjistilo, že ze zbývajících osmi klonů šest (zde se označují jako RDIF2, RDIF5, RDIF8, RDIF10, RDIF11 a RDIF12) nese podobnost se dříve určenými sekvencemi mikroorganizmu M. tuberculosis. Stanovené sekvence DNA RDIF2, RDIF5, RDIF8, RDIF10 a RDIF11 jsou uvedeny v SEQ ID NO: 184188, přičemž odpovídající předpokládané sekvence jsou uvedeny v SEQ ID NO: 189-193. 5'a 3'sekvence DNA RDIF12 jsou uvedeny v SEQ ID NO: 194 a 195. Nezjistila se žádná podstatná homologie s antigenem RDIF-7. Stanovená sekvence DNA a předpokládané aminokyselinové sekvence RDIF7 jsou uvedeny v SEQ ID NO: 196 a 197. Izoloval se další klon, zde uvedený jako RDIF6, zjistilo se však, že je stejný jako RDIF5.
Připravily se rekombinantní RDIF6, RDIF8, RDIF10 a RDIF11 způsobem popsaným shora v textu. Zjistilo se, že tyto antigeny stimulují buněčnou proliferací a produkci IFN-γ v T-buňkách izolovaných z donoru imunních proti mikroorganizmu M. tuberculosis.
Příklad 4: Čištění a charakterizace polypeptidu z izolovaného proteinového derivátu tuberkulinu.
Polypeptid mikroorganizmu M. tuberculosis se izoloval z izolovaného proteinového derivátu tuberkulinu (PPD) následujícím způsobem:
PPD se připravilo podle publikovaného postupu s některými modifikacemi (popisuje se v publikaci Seibert et al., Tuberculin purified protein derivative. Preparation and analyses of large quantity for standard. The American Review of Tuberculosis 44:9-25, 1941). Kmen Rv mikroorganizmu M. tuberculosis se kultivoval po dobu 6 týdnů v syntetickém médiu v míchaných nádobách při teplotě 37 °C. Nádoby obsahující bakteriální kulturu se pak zahřívaly na teplotu 100 °C ve • · ······· · · ···· ·· ·· ·· ·· φ·
Tb01B93 1-2 ++++ 1, 853 0, 634 0, 998 1, 022 1,030 1,314
Tb01B93 1-19 ++++ 2, 657 2,322 0, 608 0, 837 1,857 2,335
Tb01B93 1-8 +++ 2, 703 0, 527 0,492 0,281 0,501 2, 002
Tb01B93 1-10 +++ 1, 665 1,301 0, 685 0,216 0, 448 0, 458
Tb01B93 1-11 +++ 2, 817 0, 697 0, 509 0, 301 0,173 2, 608
Tb01B93 1-15 ++ + 1,28 0,283 0, 808 0,218 1,537 0, 811
Tb01B93 1-16 +++ 2, 908 >3 0, 899 0,441 0, 593 1, 080
Tb01B93 1-25 +++ 0, 395 0, 131 0, 335 0,211 0,107 0, 948
Tb01B93 1-87 +++ 2, 653 2,432 2,282 0, 977 1,221 0, 857
Tb01B93 1-89 +++ 1,912 2,370 2,436 0, 876 0,520 0, 952
Tb01B94 1-108 +++ 1, 639 0, 341 0, 797 0, 368 0, 654 0, 798
Tb01B94 1-201 +++ 1,721 0,419 0, 661 0, 137 0, 064 0, 692
Tb01B93 1-88 ++ 1,939 1,269 2,519 1,381 0, 214 0, 530
Tb01B93 1-92 ++ 2,355 2,329 2, 78 0, 685 0, 997 2,527
Tb01B94 1-109 ++ 0, 933 0, 620 0, 574 0, 441 0, 5 2, 558
Tb01B94 1-210 ++ 2, 777 >3 0,393 0, 367 1,004 1,315
Tb01B94 ++ 2,913 0, 476 0,251 1,297 1,990 0,256
• * « A • · • ·· ······· · · ···· ·« ·· ·· 9· ··
1-224
Tb01B93 1-9 + 2, 694 0,278 0,210 0,140 0, 181 1,586
Tb01B93 1-14 + >3 1,538 0, 282 0,291 0,549 2, 880
Tb01B93 1-21 + 2,645 0, 739 2,499 0,783 0,536 1, 770
Tb01B93 1-22 + 0,714 0, 451 2, 082 0,285 0,269 1, 159
Tb01B93 1-31 + 0,956 0,490 1,019 0, 812 0,176 1,293
Tb01B93 1-32 2,261 0, 786 0, 668 0,273 0, 535 0, 405
Tb01B93 1-52 0, 658 0, 114 0,434 0,330 0,273 1,140
Tb01B93 1-99 2,118 0, 584 1, 62 0, 119 0, 977 0, 729
Tb01B94 1-130 1,349 0,224 0, 86 0,282 0, 383 2,146
Tb01B94 1-131 0,685 0, 324 1,173 0, 059 0,118 1,431
AT4- 0070 normální 0,072 0, 043 0, 092 0, 071 0, 040 0,039
AT4- 0105 normální 0,397 0,121 0,118 0,103 0, 078 0, 390
3/15/94 -1 normální 0,227 0, 064 0, 098 0,026 0, 001 0,228
4/15/93 -2 normální 0,114 0,240 0, 071 0, 034 0,041 0,264
5/26/94 -4 normální 0, 089 0,259 0,096 0,046 0, 008 0,053
5/26/94 -3 normální 0,139 0, 093 0, 085 0, 019 0,067 0,01
β 4 • 4 • · • *4 4 • 44
5Ί »4*4 44 » 4 4 « • 4 44
44
Na základě hraničních hodnot získaných z křivek přijímačoperátor antigen TbRa3 detekoval 23 pozitivních sér ze 27, TbH4 detekoval 18 pozitivních sér ze 27 a TbH12 detekoval 15 pozitivních sér ze 27. Jestliže se tyto antigeny použijí v kombinaci, dosáhne se u těchto čtyřech antigenů teoretické citlivosti 27 pozitivních sér ze 27, což indikuje, že tyto antigeny jeden 'druhého doplňují při serologické detekci infekce mikroorganizmem M. tuberculosis. Navíc několik rekombinantních antigenů detekovalo pozitivní sérum, které nebylo detekováno ani použitím antigenu o molekulové hmotnosti 38 000, což ukazuje, že tyto antigeny mohou být komplementární s antigenem o molekulové hmotnosti 38 000.
Reaktivita rekombinantního antigenu TbRall se sérem od pacientů s mikroorganizmem M. tuberculosis ukazuje, že je negativní v případě antigenu o molekulové hmotnosti 38 000, stejně jako v případě séra z donorů pozitivních na PPD a normálních donorů, což se stanovilo testem ELISA, jak se popisuje shora v textu. Výsledky jsou uvedeny na obrázku č. 6 a indikují, že antigen TbRall, zatímco je negativní se sérem získaným z PPD pozitivních a normálních donorů, detekoval s=rum, které je bylo negativní s antigenem o molekulové hmotnosti 38 000. Z třinácti negativních sér testovaných antigenem o molekulové hmotnosti 38 000 jich bylo devět pozitivních s antigenem TbRall, což indikuje, že tento antigen může reagovat s podskupinou sér, které jsou negativní při reakci s antigenem o molekulové hmotnosti 38 000. Naopak reakce antigenu TbRall se skupinou sér, která jsou pozitivní s antigenem o molekulové hmotnosti 38 000, průměrná hodnota OD 450 v případě antigenu TbRall byla nižší než hodnota získaní při reakci s antigenem s molekulovou hmotností 38 000. Data indikují obrácený vztah mezi přítomností aktivity antigenu TbRall a pozitivity antigenu o molekulové hmotnosti 38 000.
Antigen TbRa2A se testoval v nepřímém testu ELISA. Na začátku se použilo 50 ul séra v ředění 1:100 a inkubovalo se ·
• · • · • · to ·· to · • ··· • ·· · · t <
• to»· ·· «to ·· ·· ·» při teplotě místnosti po dobu 30 minut, následuje promytí roztokem PBS a Tween, pak následuje inkubace s proteinem A (Zymed, San Francisco, CA) v ředění 1 : 10 000 označeným biotinem. Následuje promytí a přidá se 50 ul komplexu streptavidin-křenová peroxidáza (Zymed) v ředění 1:10 000 a směs se inkubovala po dobu 30 minut. Po promytí se test vyvíjel v přítomnosti substrátu TBM, jak se popisuje shora v textu. Reaktivita TbRa2A se sérem získaným z pacientů pozitivních na mikroorganizmus M. tuberculosis a se sérem s normálních donorů je uvedena v tabulce č. 4. Průměrná hodnota v případě reaktivity antigenů TbRa2A se sérem získaným od pacientů pozitivních na mikroorganizmus M. tuberculosis byla 0,444 se standardní odchylkou 0,309. Průměrná hodnota reaktivity se sérem v případě normálních donorů byla 0,109 se standardní odchylkou 0,029. Testování sér, které vykazují negativní reakci s antigenem o molekulové hmotnosti 38 000 (obrázek č. 7) také indikuje, že antigen Tbra2A je schopen detekovat sérum této skupiny.
Tabulka č. 4: Reaktivita antigenů TbRa2A se sérem z pacientů pozitivních na mikroorganizmus M. tuberculosis a se sérem z normálních donorů.
Sérum ID status OD 450
Tb85 TB 0, 680
Tb86 TB 0,450
Tb87 TB 0,263
Tb8 8 TB 0,275
Tb89 TB 0,403
Tb91 TB 0,393
Tb92 TB 0,401
Tb93 TB 0,232
Tb94 TB 0, 333
Tb95 TB 0,435
Tb96 TB 0,284
·· *· ·· · ·· ·· ···· ··· ···· • ·· · · ··· · · · · ·· ··· ·· ·· ··· ··· ······· · · ···· ·· ·· ·· ·· ··
Tb97 TB 0, 320
Tb99 TB 0, 328
TblOO TB 0, 817
TblOl TB 0, 607
Tbl02 TB 0,191
Tbl03 TB 0, 228
Tbl07 TB 0, 324
Tbl09 TB 1,572
Tbll2 TB 0, 338
DL4-0176 normální 0, 036
AT4-0043 normální 0, 126
AT4-0044 normální 0,130
AT4-0052 normální 0, 135
AT4-0053 normální 0, 133
AT4-0062 normální 0, 128
AT4-0070 normální 0, 088
AT4-0091 normální 0, 108
AT4-0100 normální 0,106
AT4-0105 normální 0,108
AT4-0109 normální 0, 105
Reaktivita rekombinantního antigenů (g) (SEQ ID NO: 60) se sérem získaných z pacientů pozitivních na mikroorganizmus M. tuberculosis a se sérem z normálních donorů se stanovila testem ELISA, jak se popisuje shora v textu. Obrázek č. 8 ukazuje výsledky titrace antigenů (g) se čtyřmi séry získanými z pacientů, kteří jsou pozitivní na mikroorganizmus M. tuberculosis, jenž všechny vykazují pozitivní reakci s antigenem o molekulové hmotnosti 38 000, a se čtyřmi séry normálních donorů. Všechny čtyři pozitivní séra reagují s antigenem (g).
Reaktivita rekombinantního antigenů TbH-29 (SEQ ID NO: 137) se séry získanými z pacientů pozitivních na mikroorganizmus M. tuberculosis, z donorů pozitivních na PPD a normálních donorů se stanovila nepřímým testem ELISA, jak se popisuje shora v textu. Výsledky jsou uvedeny na obrázku č. 9. Antigen TbH-29 detekoval 30 ze 60-ti M. tuberculosis sér a 2 z 27 normálních sér.
Obrázek č. 10 ukazuje výsledky testů ELISA (přímých i nepřímých) antigenu TbH-33 (SEQ ID NO: 140) se séry získanými z pacientů, kteří jsou pozitivní na mikroorganizmus M. tuberculosis a se séry s normálních donorů a se slitými séry získanými z pacientů, kteří jsou pozitivní na mikroorganizmus M. tuberculosis. Ukázalo se, že průměrná hodnota OD 450 je vyšší u sér získaných z pacientů pozitivních na mikroorganizmus M. tuberculosis než u sér z normálních donorů, přičemž hodnota OD 450 je podstatně vyšší v nepřímém testu ELISA než je tomu v přímém testu ELISA. Obrázek č. 11 znázorňuje titrační křivku reaktivity rekombinantního TbH-33 se séry získanými od pacientů a od normálních donorů, které ukazují, že hodnota OD 450 roste se zvyšující se koncentrací antigenu.
Reaktivita rekombinantních antigenů RDIF6, RDIF8 a RDIF10 (SEQ ID NO: 184-187) se séry získanými z pacientů pozitivních na mikroorganizmus M. tuberculosis a z normálních donorů se stanovila testem ELISA, jak se popisuje shora v textu. Antigen RDIF6 detekoval 6 pozitivních sér z 32 a žádné z 15 normálních sér; antigen RDIF8 detekoval 14 pozitivních sér ze 32 a žádné z 15 normálních sér; a antigen RDIF10 detekoval 4 pozitivní séra ze 27 a 1 sérum Z 15 normálních sér. Navíc se zjistilo, že antigen RDIF10 nedetekuje žádné Z 5-ti sér získaných donorů pozitivních na PPD.
Příklad 7: Příprava a charakterizace fúzních proteinů mikroorganizmu M. tuberculosis.
Fúzní protein obsahující antigen TbRA3, antigen o molekulové hmotnosti 38 000 a antigen Tb38-1 se připravil následujícím způsobem:
• · ··· · · ·· ··· »· ······· · · ····*· ·· ·· ·· ··
Každá z DNA konstrukcí TbRa3, 38kD a Tb38-1 se modifikovala PCR za účelem provést jejich fúzi a následnou expresi fúzního proteinu TbRa3-38kD-Tb38-l. DNA antigenů TbRa3, 38kD a Tb38-1 se použila pro provedení PCR za použití primerů PDM-64 a PDM-65 (SEQ ID NO: 141 a 142) , PDM-57 a PDM58 (SEQ ID NO: 143a 144) a PDM-69 a PDM-60 (SEQ ID NO: 145146). V každém případě se amplifikace DNA uskutečnila za použití 10 ul 10x koncentrovaného pufru Pfu, 2 ul 10 mM dNTP, 2 ul každého z primerů PCR při koncentraci 10 uM, 81,5 ul vody, 1,5 ul Pfu DNA polymerázy (Stratagene, La Jolla, CA) a 1 ul DNA v koncentraci 70 ng/ul (v případě antigenu TbRa3) nebo 50 ng/ul (v případě antigenů 38 000 a Tb38-1) . V případě antigenu TbRa3 se denaturace provedla při teplotě 94 °C po dobu 2 minut, pak následuje 40 cyklů při teplotě 96 °C po dobu 15 vteřin a při teplotě 72 °C po dobu 1 minuty a poslední cyklus probíhá při teplotě 72 °C po dobu 4 minuty. V případě antigenu s molekulovou hmotností 38 000 se denaturace provedla při teplotě 94 °C po dobu 2 minut, pak následuje 40 cyklů při teplotě 96 °C po dobu 30 vteřin a při teplotě 68 °C po dobu 15 vteřin a při teplotě 72 °C po dobu 3 minut a poslední cyklus probíhá při teplotě 72 °C po dobu 4 minut. V případě antigenu Tb38-1 se denaturace provedla při teplotě 94 °C po dobu 2 minut, pak následuje 10 cyklů při teplotě 96 °C po dobu 15 vteřin a při teplotě 68 °C po dobu 15 vteřin a při teplotě 72 °C po dobu 1,5 minuty, 30 cyklů při teplotě 96 °C po dobu 15 vteřin, při teplotě 64 °C po dobu 15 vteřin a při teplotě 72 °C po dobu 1,5 minuty a poslední cyklus probíhá při teplotě 72 °C po dobu 4 minuty.
PCR fragment antigenu TbRa3 se štěpil restrikčními endonukleázami Ndel a EcoRl a klonoval se přímo do vektoru PT7aL2IL1 za použití restrikčních míst Ndel a EcoRl. PCR fragment o molekulové hmotnosti 38 000 se štěpil restrikčními enzymy Sse8387I, ošetřil se T4 DNA polymerázou, aby měl tupé konce a pak se štěpil EcoRl za účelem přímého klonování do ······· · · ···· ·· ·· ·· ·· · · vektoru pT7AL2Ra3-l, který se štěpil restrikčnimi enzymi Stul a EcoRI. PCR fragment antigenu Tb38-1 se štěpil restrikčnimi enzymy Eco47III a EcoRI a přímo se sub-klónoval do pT7AL2Ra3/38kD-17, který se štěpil stejnými enzymy. Celá fúze se pak přenesla do pET28b za použití restrikčních míst Ndel a EcoRI. Fúzní konstrukce se potvrdila sekvenováním DNA.
Expresivní konstrukce se transformovala do BLR pLys S E.coli (Novagen, Madison, WI) a kultivoval se přes noc na půdě LB s kanamycinem (30 ug/ml) a chloramfenikolem (34 ug/ml) . Tato kultura (12 ml) se používala k inokulaci 500 ml 2XYT se stejnými antibiotiky a kultura se indukovala pomocí IPTG při hodnotě OD 560 0,44, přičemž konečná koncentrace IPTG je 1,2 mM. Čtyři hodinu po indukci se bakterie sebraly z sonifikovaly se ve 20 mM Tris (pH8,0), 100 mM NaCl, 0,1 % DOC, 20 ug/ml leupeptidnu, 20 mM PMSF, pak následuje centrifugace při 26 OOOxg. Výsledný pelet se resuspendoval v 8 M močovině, 20 mM Tris (pH8,0), 100 mM NaCl a vázal se na Pronavázanou niklovou pryskyřici (Invitrogen, Carlsbad, CA) . Kolona se několikrát promyla shora uvedeným pufrem a eluovala se imidazolovým gradientem (k 8 M močovině se přidal 50 mM, 100 mM, 500 mM imidazol, 20 mM Tris(pH8,0), lOOmM NaCl). Eluát obsahující uvedený protein se pak dialyzoval proti 10 mM Tris (pH8,0) .
Sekvence DNA a aminokyselinové sekvence výsledného fúzního proteinu (zde označeného jako TbRa3-38 kD-Tb38-l) jsou uvedeny v SEQ ID NO: 147 a 148.
Fúzní protein obsahující dva antigeny TbH-9 a Tb38-1 (zde označené jako TbH9-Tb38-l) se připravil za použití podobného postupu uvedeného shora v textu. Sekvence DNA fúzního proteinu TbH9-Tb38-l je uvedena v SEQ ID NO: 151.
Fúzní protein obsahující antigeny TbRa3, antigen o molekulové hmotnosti 38 000, Tb38-1 a DPEP se připravil následujícím způsobem.
• · · · • ·
Každá z konstrukcí DNA TbRa3, 38 kD a Tb38-1 se modifikovala PCR a klonoval se do vektorů v podstatě stejným způsobem jako se popisuje shora v textu. Při amplifikaci fragmentu Tb38-1A se použily primery PDM-69 (SEQ ID NO: 145) a PDM-83 (SEQ ID NO: 200). Tb38-1A se liší od Tb38-1 přítomností restrikčního místa Dral na 3'konci kódující oblasti, která udržuje konečnou aminokyselinu intaktní, zatímco se tvoří tupé restrikční místo, které je v rámci. Fúze TbRa3/38kD/Tb38-lA se pak přenesla do pET28b za použití restrikčních míst Ndel a EcoRI.
DNA DPEP se použila pro provedení PCR za použití primerů PDM-84 a PDM-85 (SEQ ID NO: 201 a 202) a 1 ul DNA při koncentraci 50 ng/ul. Denaturace proběhla při teplotě 94 °C po dobu 2 minut, pak následuje 10 cyklů při teplotě 96 °C po dobu 15 vteřin, při teplotě 68 10 po dobu 15 vteřin a 72 °C po dobu 1,5 minuty; následuje 30 cyklů při teplotě 96 °C po dobu 15 vteřin, 64 °C po dobu 15 vteřin a 72 °C po dobu 1,5 minuty a poslední cyklus probíhá při teplotě 72 °C po dobu 4 minut.PCR fragment DPEP se štěpil restrikčními enzymy EcoRI a Eco72I a klonoval se přímo do konstrukce pET28Ra3/38kD/38-lA, která se štěpila restrikčními enzymy Dral a EcoRI. Správnost fúzní konstrukce se potvrdila sekvenováním DNA. Rekombinantní protein se připravil postupem, jenž se popisuje shora v textu. Sekvence DNA a aminokyselinové sekvence výsledného fúzního proteinu (zde se označuje jako TbF-2) se uvádí v SEQ ID NO: 203 a 204.
Příklad 8: Použití fúzních proteinů mikroorganizmu M.
tuberculosis při sérologické diagnostice tuberkulózy. Účinnost fúzního proteinu TbRa3-38kD-Tb38-l, který se připravil podle postupu popsaného shora v textu, při sérologické diagnostice tuberkulózy se stanovila testem ELISA.
Při testu ELISA se postupovalo podle protokolu popsaném v příkladu 6, při čemž se prohlubně destiček potáhly fúzním • · • · • ··· proteinem 200 ng/prohlubeň. Ze skupiny pacientů pozitivních na tuberkulózu, což se dříve prokázalo buď testem ELISA nebo westernovým přenosem, se vybral panel sér za účelem reakce s každým ze tří antigenů jednotlivě nebo v kombinaci. Takový panel umožní podrobné stanovení serologické reaktivity fúzního proteinu, což umožní zjistit zda všechny tři epitopy reagují s fúzním proteinem. Jak ukazuje tabulka č. 5, všechny čtyři séra, která reagují s antigenem TbRa3 jsou detekovatelné pouze fúzním proteinem. Je možné také detekovat tři séra, která reagují pouze s antigenem Tb38-1, stejně je tomu v případě dvou sér, jenž reagují pouze s antigenem o molekulové hmotnosti 38 000. Zbývajících 15 sér je při reakci s fúzním proteinem pozitivních, což se stanovilo na základě hraniční hodnoty testu odpovídající průměru hodnot negativních výsledků plus tři standardní odchylky. Tato data ukazují, že všechny tři epitopy ve fúzním proteinu jsou aktivní.
Tabulka 5: Reaktivita tří-peptidového fúzního proteinu se séry z pacientů pozitivních na mikroorganizmus M. tuberculosis.
ID séra Status ELISA a/nebo westernův přenos Reaktivita jednotlivých proteinů Fúzní rekombin ant Fúzní rekombin ant
38 000 Tb38-1 TbRa3 OD 450 Status
01B93I-40 TB - - + 0, 413 +
01B93I-41 TB - + + 0, 392 +
01B93I-29 TB + - + 2, 217 +
01B93I- 109 TB + +/- + 0,522 +
01B93I- 132 TB + + + 0,937 +
5004 TB +/- + +/- 1, 098 +
15004 TB + + + 2,077 +
• · • ··· ······· · · ···· · · ·* ·· · · ··
39004 TB + + + 1, 675 +
68004 TB + + + 2,388 +
99004 TB - + +/- 0, 607 +
107004 TB - + +/- 0, 667 +
92004 TB + +/- +/- 1,070 +
97004 TB + - +/- 1,152 +
118004 TB + - +/- 2, 694 +
173004 TB + + + 3,258 +
175004 TB + + 2,514 +
274004 TB - - + 3,220 +
276004 TB - + - 2,991 +
282004 TB + - - 0, 824 +
289004 TB - - + 0, 848 +
308004 TB - + - 3, 338 +
314004 TB - + - 1,362 +
317004 TB + - - 0,763 +
312004 TB - - + 1,079 +
D176 PPD - - - 0,145
D162 PPD - - - 0, 073 -
D161 PPD - - - 0, 097 -
D27 PPD - - 0, 082 -
A6-124 Normál - - - 0, 053 -
A6-125 Normál - - - 0, 087 -
A6-126 Normál - - - 0, 346 +/-
A6-127 Normál - 0, 064 -
A6-128 Normál - - 0, 034 -
A6-129 Normál - - 0, 037 -
A6-130 Normál - 0,057 -
A6-131 Normál - 0, 054 -
A6-132 Normál 0, 022 -
A6-133 Normál - - 0,147 -
A6-134 Normál - - - 0,101 -
A6-135 Normál 0, 066 -
• ·
A6-136 Normál - - 0, 054 -
A6-137 Normál - - - 0, 065
A6-138 Normál - - - 0, 041
A6-139 Normál - - - 0, 103
A6-140 Normál - - - 0,212 -
A6-141 Normál - - - 0, 056
A6-142 Normál - - - 0, 051
Reaktivita fúzního proteinu TbF-2 se sérem z pacientů, kteří jsou pozitivní na mikroorganizmus M. tuberculosis, se testovala testem ELISA podle protokolu popsaného shora v textu. Výsledky uvedených studií (tabulka 6) ukazují, že všechny antigeny fungují nezávisle na fúzním proteinu.
• · · ·
Tabulka 6: Reaktivita fúzního proteinu TbF-2 se sérem TB a s normálním sérem
Sérum ID Status TbF OD450 Status TbF-2 OD450 Status ELISA Reafctivitq
38 kD TbRa3 Tb38-1 DPEP
B931-40 TB 0.57 + 0.321 + - + - +
B931-41 TB 0.601 + 0.396 + + + + -
B931-109 TB 0.494 + 0.404 + + + ± -
B931-132 TB 1.502 + 1.292 + + + + +
5004 TB 1.806 + 1.666 + ± ± + -
15004 TB 2.862 + 2.468 + + + + -
39004 TB 2.443 + 1.722 + + + + -
68004 TB 2.871 + 2.575 + + + + -
99004 TB 0.691 + 0.971 + - ± + -
107004 TB 0.875 + 0.732 + - + + -
92004 TB 1.632 + 1.394 + + + + -
97004 TB 1.491 + 1.979 + + + - +
118004 TB 3.182 + 3.045 + + ± - -
173004 TB 3.644 + 3.578 + 4- + + -
175004 TB 3.332 + 2.916 + + + - -
274004 TB 3.696 + 3.716 + - + - +
276004 TB 3.243 + 2.56 . + - - + -
282004 TB 1.249 + 1.234 + + - - -
289004 TB 1.373 + 1.17 -I- ' - + - -
308004 TB 3.708 + 3.355 + - - + -
314004 TB 1.663 + 1.399 + - - + -
317004 TB 1.163 + 0.92 + + - - -
312004 TB 1.709 + 1.453 + - + - -
380004 TB 0.238 0.461 + - + - +
451004 TB 0.18 - 0.2 - - - - ±
478004 TB 0.188 - 0.469 + - - - i
410004 TB 0.384 + 2.392 + + - - +
411004 TB 0.306 + 0.874 + - + - +
421004 TB 0.357 + 1.456 + - + - +
528004 TB 0.047 - 0.196 - - - - +
A6-87 Normál 0.094 - 0.063 - - - - -
A6-88 Normál 0.214 - 0.19 - - - - -
A6-89 Normál 0.248 - 0.125 - - - - -
A6-90 Normál 0.179 - 0.206 - - - - -
A6-91 Normál 0.135 - 0.151 - - - - -
A6-92 Normál 0.064 - 0.097 - - - - -
A6-93 Normál 0.072 - 0.098 '·: - - - -
A6-94 Normál 0.072 - 0.064 - - - - -
A6-95 Normál 0.125 - 0.159 - - - - -
A6-96 Normál 0.121 - 0.12 - - - - -
Cut-off 0.284 0.266
Pro odborníky bude zajímavé, když bude možné ve fúzním proteinu zaměnit pořadí jednotlivých antigenů, přičemž se očekává, že fúzní protein bude vykazovat srovnatelnou aktivitu, protože každý z epitopů je stále funkčně dostupný. Navíc se může pro konstrukci funkčních proteinů použít zkrácené formy proteinů obsahující aktivní epitopy.
···· ··· · • ·· · ···· · • · · · · ·· · · • · · · · · · • · · · ·· · · ·· - Sekvenční protokol (1) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 1:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 766 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 1
CGAGGCACCG GTAGTTTGAA CCAAACGCAC AATCGACGGG CAAACGAACG GAAGAACACA 60
ACCATGAAGA TGGTGAAATC GATCGCCGCA GGTCTGACCG CCGCGGCTGC AATCGGCGCC 120
GCTGCGGCCG GTGTGACTTC GATCATGGCT GGCGGCCCGG TCGTATACCA GATGCAGCCG 180
GTCGTCTTCG GCGCGCCACT GCCGTTGGAC CCGGCATCCG CCCCTGACGT CCCGACCGCC 240
GCCCAGTTGA CCAGCCTGCT CAACAGCCTC GCCGATCCCA ACGTGTCGTT TGCGAACAAG 300
GGCAGTCTGG TCGAGGGCGG CATCGGGGGC ACCGAGGCGC GCATCGCCGA CCACAAGCTG 360
AAGAAGGCCG CCGAGCACGG GGATCTGCCG CTGTCGTTCA GCGTGACGAA CATCCAGCCG 420
GCGGCCGCCG GTTCGGCCAC CGCCGACGTT TCCGTCTCGG GTCCGAAGCT CTCGTCGCCG 480
GTCACGCAGA ACGTCACGTT CGTGAATCAA-GGCGGCTGGA TGCTGTCACG CGCATCGGCG 540
ATGGAGTTGC TGCAGGCCGC AGGGNAACTG ATTGGCGGGC CGGNTTCAGC CCGCTGTTCA 600
GCTACGCCGC CCGCCTGGTG ACGCGTCCAT GTCGAACACT CGCGCGTGTA GCACGGTGCG 660
GTNTGCGCAG GGNCGCACGC ACCGCCCGGT GCAAGCCGTC CTCGAGATAG GTGGTGNCTC 720
GNCACCAGNG ANCACCCCCN NNTCGNCNNT TCTCGNTGNT GNATGA (1) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 2: (i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE: (A) DÉLKA: 752 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 2 766
ATGCATCACC ATCACCATCA CGATGAAGTC ACGGTAGAGA CGACCTCCGT CTTCCGCGCA 60
GACTTCCTCA GCGAGCTGGA CGCTCCTGCG CAAGCGGGTA CGGAGAGCGC GGTCTCCGGG 120
GTGGAAGGGC TCCCGCCGGG CTCGGCGTTG CTGGTAGTCA AACGAGGCCC CAACGCCGGG 180
TCCCGGTTCC TACTCGACCA AGCCATCACG TCGGCTGGTC GGCATCCCGA CAGCGACATA 240
0 0 0 0 0 0 · ···« ·· 00 0· 0 · ··
TTTCTCGACG ACGTGACCGT GAGCCGTCGC CATGCTGAAT TCCGGTTGGA AAACAACGAA 300
TTCAATGTCG TCGATGTCGG GAGTCTCAAC GGCACCTACG TCAACCGCGA GCCCGTGGAT 360
TCGGCGGTGC TGGCGAACGG CGACGAGGTC CAGATCGGCA AGCTCCGGTT GGTGTTCTTG 420
ACCGGACCCA AGCAAGGCGA GGATGACGGG AGTACCGGGG GCCCGTGAGC GCACCCGATA 480
GCCCCGCGCT GGCCGGGATG TCGATCGGGG CGGTCCTCCG ACCTGCTACG ACCGGATTTT 540
CCCTGATGTC CACCATCTCC AAGATTCGAT TCTTGGGAGG CTTGAGGGTC NGGGTGACCC 600
CCCCGCGGGC CTCATTCNGG GGTNTCGGCN GGTTTCACCC CNTACCNACT GCCNCCCGGN 660
TTGCNAATTC NTTCTTCNCT GCCCNNAAAG GGACCNTTAN CTTGCCGCTN GAAANGGTNA 720
TCCNGGGCCC NTCCTNGAAN CCCCNTCCCC CT 752
(2) Informace ο sekvenci SEQ ID NO: 3:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 813 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 3
CATATGCATC ACCATCACCA TCACACTTCT AACCGCCCAG CGCGTCGGGG GCGTCGAGCA 60
CCACGCGACA CCGGGCCCGA TCGATCTGCT AGCTTGAGTC TGGTCAGGCA TCGTCGTCAG . 120
CAGCGCGATG CCCTATGTTT GTCGTCGACT CAGATATCGC GGCAATCCAA TCTCCCGCCT 180
GCGGCCGGCG GTGCTGCAAA CTACTCCCGG AGGAATTTCG ACGTGCGCAT CAAGATCTTC 240
ATGCTGGTCA CGGCTGTCGT TTTGCTCTGT TGTTCGGGTG TGGCCACGGC CGCGCCCAAG 300
ACCTACTGCG AGGAGTTGAA AGGCACCGAT ACCGGCCAGG CGTGCCAGAT TCAAATGTCC 360
GACCCGGCCT ACAACATCAA CATCAGCCTG CCCAGTTACT ACCCCGACCA GAAGTCGCTG 420
GAAAATTACA TCGCCCAGAC GCGCGACAAG TTCCTCAGCG CGGCCACATC GTCCACTCCA 480
CGCGAAGCCC CCTACGAATT GAATATCACC TCGGCCACAT ACCAGTCCGC GATACCGCCG 540
CGTGGTACGC AGGCCGTGGT GCTCAMGGTC TACCACAACG CCGGCGGCAC GCACCCAACG 600
ACCACGTACA AGGCCTTCGA TTGGGACCAG GCCTATCGCA AGCCAATCAC CTATGACACG 660
CTGTGGCAGG CTGACACCGA TCCGCTGCCA GTCGTCTTCC CCATTGTTGC AAGGTGAACT 720
GAGCAACGCA GACCGGGACA ACWGGTATCG ATAGCCGCCN AATGCCGGCT TGGAACCCNG 780
TGAAATTATC ACAACTTCGC AGTCACNAAA NAA 813 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 4:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 447 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 4:
CGGTATGAAC ACGGCCGCGT CCGATAACTT CCAGCTGTCC CAGGGTGGGC AGGGATTCGC 60
CATTCCGATC GGGCAGGCGA TGGCGATCGC GGGCCAGATC CGATCGGGTG GGGGGTCACC 120
CACCGTTCAT ATCGGGCCTA CCGCCTTCCT CGGCTTGGGT GTTGTCGACA ACAACGGCAA 180
CGGCGCACGA GTCCAACGCG TGGTCGGGAG CGCTCCGGCG GCAAGTCTCG GCATCTCCAC 240
CGGCGACGTG ATCACCGCGG TCGACGGCGC TCCGATCAAC TCGGCCACCG CGATGGCGGA 300
CGCGCTTAAC GGGCATCATC CCGGTGACGT CATCTCGGTG AACTGGCAAA CCAAGTCGGG 360
CGGCACGCGT ACAGGGAACG TGACATTGGC CGAGGGACCC CCGGCCTGAT TTCGTCGYGG 420
ATACCACCCG CCGGCCGGCC AATTGGA 447
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 5:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 604 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 5:
GTCCCACTGC GGTCGCCGAG TATGTCGCCC AGCAAATGTC TGGCAGCCGC CCAACGGAAT 60
CCGGTGATCC GACGTCGCAG GTTGTCGAAC CCGCCGCCGC GGAAGTATCG GTCCATGCCT 120
AGCCCGGCGA CGGCGAGCGC CGGAATGGCG CGAGTGAGGA GGCGGGCAAT TTGGCGGGGC 180
• · ·φ φ φ • · * φ φ φ • ·· · · ΦΦΦ
72 • · · φφφφ Φ Φ Φ ·
φφφφ φ φ * · φφ φ Φ
CCGGCGACGG NGAGCGCCGG AATGGCGCGA GTGAGGAGGT GGNCAGTCAT GCCCAGNGTG 240
ATCCAATCAA CCTGNATTCG GNCTGNGGGN CCATTTGACA ATCGAGGTAG TGAGCGCAAA 300
TGAATGATGG AAAACGGGŇG GNGACGTCCG NTGTTCTGGT GGTGNTAGGT GNCTGNCTGG 360
NGTNGNGGNT ATCAGGATGT TCTTCGNCGA AANCTGATGN CGAGGAACAG GGTGTNCCCG 420
NNANNCCNAN GGNGTCCNAN CCCNNNNTCC TCGNCGANAT CANANAGNCG NTTGATGNGA 480
NAAAAGGGTG GANCAGNNNN AANTNGNGGN CCNAANAANC NNNANNGNNG NNAGNTNGNT 540
NNNTNTTNNC ANNNNNNNTG NNGNNGNNCN NNNCAANCNN NTNNNNGNAA NNGGNTTNTT 600
NAAT 604
Informace o sekvenci SEQ ID NO: 6:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 633 párů baží
(B) TYP: nukleová kyselina
(C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová
(D) TOPOLOGIE: lineární
(xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 6:
TTGCANGTCG AACCACCTCA CTAAAGGGAA CAAAAGCTNG AGCTCCACCG CGGTGGCGGC 60
CGCTCTAGAA CTAGTGKATM YYYCKGGCTG CAGSAATYCG GYACGAGCAT TAGGACAGTC 120
TAACGGTCCT GTTACGGTGA TCGAATGACC GACGACATCC TGCTGATCGA CACCGACGAA 180
CGGGTGCGAA CCCTCACCCT CAACCGGCCG CAGTCCCGYA ACGCGCTCTC GGCGGCGCTA 240
CGGGATCGGT TTTTCGCGGY GTTGGYCGAC GCCGAGGYCG ACGACGACAT CGACGTCGTC 300
ATCCTCACCG GYGCCGATCC GGTGTTCTGC GCCGGACTGG ACCTCAAGGT AGCTGGCCGG 360
GCAGACCGCG CTGCCGGACA TCTCACCGCG GTGGGCGGCC ATGACCAAGC CGGTGATCGG 420
CGCGATCAAC GGCGCCGCGG TCACCGGCGG GCTCGAACTG GCGCTGTACT GCGACATCCT 480
GATCGCCTCC GAGCACGCCC GCTTCGNCGA CACCCACGCC CGGGTGGGGC TGCTGCCCAC 540
CTGGGGACTC AGTGTGTGCT TGCCGCAAAA GGTCGGCATC GGNCTGGGCC GGTGGATGAG 600
CCTGACCGGC GACTACCTGT CCGTGACCGA CGC 633
(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO:7:
(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
• · • · · <1 · » • 9 · • · 9 9 99 • · · ···· ·· • 9 • · • · « ·
9 ··
9 9 999 9 9 « • · «
TGGCCAGAGT 60
GCCCGTCGCG 120
CGAGTTCGGC 180
CGCCGGCTGG 240 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 7:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 1362 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 7:
CGACGACGAC GGCGCCGGAG AGCGGGCGCG AACGGCGATC GACGCGGCCC
CGGCACCACC CAGGAGGGAG TCGAATCATG AAATTTGTCA ACCATATTGA
CCCCGCCGAG CCGGCGGCGC GGTCGCCGAG GTCTATGCCG AGGCCCGCCG
CGGCTGCCCG AGCCGCTCGC CATGCTGTCC CCGGACGAGG GACTGCTCAC
GCGACGTTGC GCGAGACACT GCTGGTGGGC CAGGTGCCGC GTGGCCGCAA GGAAGCCGTC 300
GCCGCCGCCG TCGCGGCCAG CCTGCGCTGC CCCTGGTGCG TCGACGCACA CACCACCATG 360
CTGTACGCGG CAGGCCAAAC CGACACCGCC GCGGCGATCT TGGCCGGCAC AGCACCTGCC 420
GCCGGTGACC CGAACGCGCC GTATGTGGCG TGGGCGGCAG GAACCGGGAC ACCGGCGGGA 480
CCGCCGGCAC CGTTCGGCCC GGATGTCGCC GCCGAATACC TGGGCACCGC GGTGCAATTC 540
CACTTCATCG CACGCCTGGT CCTGGTGCTG CTGGACGAAA CCTTCCTGCC GGGGGGCCCG .600
CGCGCCCAAC AGCTCATGCG CCGCGCCGGT GGACTGGTGT TCGCCCGCAA GGTGCGCGCG 660
GAGCATCGGC CGGGCCGCTC CACCCGCCGG CTCGAGCCGC GAACGCTGCC CGACGATCTG 720
GCATGGGCAA CACCGTCCGA GCCCATAGCA ACCGCGTTCG CCGCGCTCAG CCACCACCTG 780
GACACCGCGC CGCACCTGCC GCCACCGACT CGTCAGGTGG TCAGGCGGGT CGTGGGGTCG 840
TGGCACGGCG AGCCAATGCC GATGAGCAGT CGCTGGACGA ACGAGCACAC CGCCGAGCTG 900
CCCGCCGACC TGCACGCGCC CACCCGTCTT GCCCTGCTGA CCGGCCTGGC CCCGCATCAG 960
GTGACCGACG ACGACGTCGC CGCGGCCCGA TCCCTGCTCG ACACCGATGC GGCGCTGGTT 1020
GGCGCCCTGG CCTGGGCCGC CTTCACCGCC GCGCGGCGCA TCGGCACCTG GATCGGCGCC 1080
GCCGCCGAGG GCCAGGTGTC GCGGCAAAAC CCGACTGGGT GAGTGTGCGC GCCCTGTCGG 1140
TAGGGTGTCA TCGCTGGCCC GAGGGATCTC GCGGCGGCGA ACGGAGGTGG CGACACAGGT 1200
GGAAGCTGCG CCCACTGGCT TGCGCCCCAA CGCCGTCGTG GGCGTTCGGT TGGCCGCACT 1260
GGCCGATCAG GTCGGCGCCG GCCCTTGGCC GAAGGTCCAG CTCAACGTGC CGTCACCGAA 1320 ·· ·« ·· to »· to · to · · • toto • ·· ·· ·· • · · to
1119 to · • · to ·
GGACCGGACG GTCACCGGGG GTCACCCTGC GCGCCCAAGG AA
1362 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 8:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 1458 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 8:
GCGACGACCC CGATATGCCG GGCACCGTAG CGAAAGCCGT CGCCGACGCA CTCGGGCGCG 60
GTATCGCTCC CGTTGAGGAC ATTCAGGACT GCGTGGAGGC CCGGCTGGGG GAAGCCGGTC 120
TGGATGACGT GGCCCGTGTT TACATCATCT ACCGGCAGCG GCGCGCCGAG CTGCGGACGG 180
CTAAGGCCTT GCTCGGCGTG CGGGACGAGT T AAA G C T Gh G CTT'oGCGeCc GTGACGGTAC 240
TGCGCGAGCG CTATCTGCTG CACGACGAGC AGGGCCGGCC GGCCGAGTCG ACCGGCGAGC 300
TGATGGACCG ATCGGCGCGC TGTGTCGCGG CGGCCGAGGA CCAGTATGAG CCGGGCTCGT 360
CGAGGCGGTG GGCCGAGCGG TTCGCCACGC TATTACGCAA CCTGGAATTC CTGCCGAATT 420
CGCCCACGTT GATGAACTCT GGCACCGACC TGGGACTGCT CGCCGGCTGT TTTGTTCTGC 480
CGATTGAGGA TTCGCTGCAA TCGATCTTTG CGACGCTGGG ACAGGCCGCC GAGCTGCAGC 540
GGGCTGGAGG CGGCACCGGA TATGCGTTCA GCCACCTGCG ACCCGCCGGG GATCGGGTGG 600
CCTCCACGGG CGGCACGGCC AGCGGACCGG TGTCGTTTCT ACGGCTGTAT GACAGTGCCG 660
CGGGTGTGGT CTCCATGGGC GGTCGCCGGC GTGGCGCCTG TATGGCTGTG CTTGATGTGT 720
CGCACCCGGA TATCTGTGAT TTCGTCACCG CCAAGGCCGA ATCCCCCAGC GAGCTCCCGC 780
ATTTCAACCT ATCGGTTGGT GTGACCGACG CGTTCCTGCG GGCCGTCGAA CGCAACGGCC 840
TACACCGGCT GGTCAATCCG CGAACCGGCA AGATCGTCGC GCGGATGCCC GCCGCCGAGC 900
TGTTCGACGC CATCTGCAAA GCCGCGCACG CCGGTGGCGA TCCCGGGCTG GTGTTTCTCG 960
ACACGATCAA TAGGGCAAAC CCGGTGCCGG GGAGAGGCCG CATCGAGGCG ACCAACCCGT 1020
GCGGGGAGGT CCCACTGCTG CCTTACGAGT CATGTAATCT CGGCTCGATC AACCTCGCCC 1080
GGATGCTCGC CGACGGTCGC GTCGACTGGG ACCGGCTCGA GGAGGTCGCC GGTGTGGCGG 1140
TGCGGTTCCT TGATGACGTC ATCGATGTCA GCCGCTACCC CTTCCCCGAA CTGGGTGAGG 1200
75 • to toto • · · to • toto to· · · • · « ···> ·· ·· ·· ·· • · · »· • · ··· t * • · · · to ··· ·«·· * ·· ·♦ ·· ·· • · • to to·· • ··
CGGCCCGCGC CACCCGCAAG ATCGGGCTGG GAGTCATGGG TTTGGCGGAA CTGCTTGCCG 1260
CACTGGGTAT TCCGTACGAC AGTGAAGAAG CCGTGCGGTT AGCCACCCGG CTCATGCGTC 1320
GCATACAGCA GGCGGCGCAC ACGGCATCGC GGAGGCTGGC CGAAGAGCGG GGCGCATTCC 1380
CGGCGTTCAC CGATAGCCGG TTCGCGCGGT CGGGCCCGAG GCGCAACGCA CAGGTCACCT 1440
CCGTCGCTCC GACGGGCA .1458
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 9:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 862 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 9:
ACGGTGTAAT CGTGCTGGAT CTGGAACCGC GTGGCCCGCT ACCTACCGAG ATCTACTGGC 60
GGCG.CAGGGG GCTGGCCCTG GGCATCGCGG TCGTCGTAGT CGGGATCGCG GTGGCCATCG 120
TCATCGCCTT CGTCGACAGC AGCGCCGGTG CCAAACCGGT CAGCGCCGAC AAGCCGGCCT 180
CCGCCCAGAG CCATCCGGGC TCGCCGGCAC CCCAAGCACC CCAGCCGGCC GGGCAAACCG 240
AAGGTAACGC CGCCGCGGCC CCGCCGCAGG GCCAAAACCC CGAGACACCC ACGCCCACCG 300
CCGCGGTGCA GCCGCCGCCG GTGCTCAAGG AAGGGGACGA TTGCCCCGAT TCGACGCTGG 360
CCGTCAAAGG TTTGACCAAC GCGCCGCAGT ACTACGTCGG CGACCAGCCG AAGTTCACCA 420
TGGTGGTCAC CAACATCGGC CTGGTGTCCT GTAAACGCGA CGTTGGGGCC GCGGTGTTGG 480
CCGCCTACGT TTACTCGCTG GACAACAAGC GGTTGTGGTC CAACCTGGAC TGCGCGCCCT 540
CGAATGAGAC GCTGGTCAAG ACGTTTTCCC CCGGTGAGCA GGTAACGACC GCGGTGACCT 600
GGACCGGGAT GGGATCGGCG CCGCGCTGCC CATTGCCGCG GCCGGCGATC GGGCCGGGCA 660
CCTACAATCT CGTGGTACAA CTGGGCAATC ŤGCGCTCGCT GCCGGTTCCG TTCATCCTGA 720
ATCAGCCGCC GCCGCCGCCC GGGCCGGTAC CCGCTCCGGG TCCAGCGCAG GCGCCTCCGC 780
CGGAGTCTCC CGCGCAAGGC GGATAATTAT TGATCGCTGA TGGTCGATTC CGCCAGCTGT 840
GACAACCCCT CGCCTCGTGC CG
862 • ·
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 10:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 622 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (Xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 10:
TTGATCAGCA CCGGCAAGGC GTCACATGCC TCCCTGGGTG TGCAGGTGAC CAATGACAAA 60
GACACCCCGG GCGCCAAGAT CGTCGAAGTA GTGGCCGGTG GTGCTGCCGC GAACGCTGGA 120
GTGCCGAAGG GCGTCGTTGT CACCAAGGTC GACGACCGCC CGATCAACAG CGCGGACGCG 180
TTGGTTGCCG CCGTGCGGTC CAAAGCGCCG GGCGCCACGG TGGCGCTAAC CTTTCAGGAT 240
CCCTCGGGCG GTAGCCGCAC AGTGCAAGTC ACCCTCGGCA AGGCGGAGCA GTGATGAAGG 300
TCGCCGCGCA GTGTTCAAAG CTCGGATATA CGGTGGCACC CATGGAACAG CGTGCGGAGT 360
TGGTGGTTGG CCGGGCACTT GTCGTCGTCG TTGACGATCG CACGGCGCAC GGCGATGAAG 420
ACCACAGCGG GCCGCTTGTC ACCGAGCTGC TCACCGAGGC CGGGTTTGTT GTCGACGGCG 480
TGGTGGCGGT GTCGGCCGAC GAGGTCGAGA TCCGAAATGC GCTGAACACA GCGGTGATCG 540
GCGGGGTGGA CCTGGTGGTG TCGGTCGGCG GGACCGGNGT GACGNCTCGC GATGTCACCC 600
CGGAAGCCAC CCGNGACATT CT 622
) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 11:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 1200 párů baží
(B) TYP: nukleová kyselina
(C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová
(D) TOPOLOGIE: lineární
(Xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 11:
GGCGCAGCGG TAAGCCTGTT. GGCCGCCGGC ACACTGGTGT TGACAGCATG CGGCGGTGGC 60
ACCAACAGCT CGTCGTCAGG CGCAGGCGGA ACGTCTGGGT CGGTGCACTG CGGCGGCAAG 120
AAGGAGCTCC ACTCCAGCGG CTCGACCGCA CAAGAAAATG CCATGGAGCA GTTCGTCTAT 180
» · · • · • · · · • ·
• ·
GCCTACGTGC GATCGTGCCC GGGCTACACG TTGGACTACA ACGCCAACGG GTCCGGTGCC 2.4 0
GGGGTGACCC AGTTTCTCAA CAACGAAACC GATTTCGCCG GCTCGGATGT CCCGTTGAAT 300
CCGTCGACCG GTCAACCTGA CCGGTCGGCG GAGCGGTGCG GTTCCCCGGC ATGGGACCTG 360
CCGACGGTGT TCGGCCCGAT CGCGATCACC TACAATATCA AGGGCGTGAG CACGCTGAAT 420
CTTGACGGAC CCACTACCGC CAAGATTTTC AACGGCACCA TCACCGTGTG GAATGATCCA 480
CAGATCCAAG CCCTCAACTC CGGCACCGAC CTGCCGCCAA CACCGATTAG CGTTATCTTC 540
CGCAGCGACA AGTCCGGTAC GTCGGACAAC TTCCAGAAAT ACCTCGACGG TGTATCCAAC 600
GGGGCGTGGG GCAAAGGCGC CAGCGAAACG TTCAGCGGGG GCGTCGGCGT CGGCGCCAGC 660
GGGAACAACG GAACGTCGGC CCTACTGCAG ACGACCGACG GGTCGATCAC CTACAACGAG 720
TGGTCGTTTG CGGTGGGTAA GCAGTTGAAC ATGGCCCAGA TCATCACGTC GGCGGGTCCG 780
GATCCAGTGG CGATCACCAC CGAGTCGGTC GGTAAGACAA TCGCCGGGGC CAAGATCATG 840
GGACAAGGCA ACGACCTGGT ATTGGACACG TCGTCGTTCT ACAGACCCAC CCAGCCTGGC 900
TCTTACCCGA TCGTGCTGGC GACCTATGAG ATCGTCTGCT CGAAATACCC GGATGCGACG - 960
ACCGGTACTG CGGTAAGGGC GTTTATGCAA GCCGCGATTG GTCCAGGCCA AGAAGGCCTG 1020
GACCAATACG GCTCCATTCC GTTGCCCAAA TCGTTCCAAG CAAAATTGGC GGCCGCGGTG 1080
AATGCTATTT CTTGACCTAG TGAAGGGAAT TCGACGGTGA GCGATGCCGT TCCGCAGGTA 1140
GGGTCGCAAT TTGGGCCGTA TCAGCTATTG CGGCTGCTGG GCCGAGGCGG GATGGGCGAG 1200
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 12:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 1155 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 12:
GCAAGCAGCT GCAGGTCGTG CTGTTCGACG AACTGGGCAT GCCGAAGACC AAACGCACCA 60
AGACCGGCTA CACCACGGAT GCCGACGCGC TGCAGTCGTT GTTCGACAAG ACCGGGCATC 120
CGTTTCTGCA ACATCTGCTC GCCCACCGCG ACGTCACCCG GCTCAAGGTC ACCGTCGACG 180
• ·
GGTTGCTCCA AGCGGTGGCC GCCGACGGCC GCATCCACAC CACGTTCAAC CAGACGATCG 240
CCGCGACCGG CCGGCTCTCC TCGACCGAAC CCAACCTGCA GAACATCCCG ATCCGCACCG. 300
ACGCGGGCCG GCGGATCCGG GACGCGTTCG TGGTCGGGGA CGGTTACGCC GAGTTGATGA 360
CGGCCGACTA CAGCCAGATC GAGATGCGGA TCATGGGGCA CCTGTCCGGG GACGAGGGCC 420
TCATCGAGGC GTTCAACACC GGGGAGGACC TGTATTCGTT CGTCGCGTCC CGGGTGTTCG 480
GTGTGCCCAT CGACGAGGTC ACCGGCGAGT TGCGGCGCCG GGTCAAGGCG ATGTCCTACG 540
GGCTGGTTTA CGGGTTGAGC GCCTACGGCC TGTCGCAGCA GTTGAAAATC TCCACCGAGG 600
AAGCCAACGA GCAGATGGAC GCGTATTTCG CCCGATTCGG CGGGGTGCGC GACTACCTGC 660
GCGCCGTAGT CGAGCGGGCC CGCAAGGACG GCTACACCTC GACGGTGCTG GGCCGTCGCC 720
GCTACCTGCC CGAGCTGGAC AGCAGCAACC GTCAAGTGCG GGAGGCCGCC GAGCGGGCGG 780
CGCTGAACGC GCCGATCCAG GGCAGCGCGG CCGACATCAT CAAGGTGGCC ATGATCCAGG 840
TCGACAAGGC GCTCAACGAG GCACAGCTGG CGTCGCGCAT GCTGCTGCAG GTCCACGACG 900.
AGCTGCTGTT CGAAATCGCC CCCGGTGAAC GCGAGCGGGT CGAGGCCCTG GTGCGCGACA 960
AGATGGGCGG CGCTTACCCG' CTCGACGTCC CGCTGGAGGT GTCGGTGGGC TACGGCCGCA 1020
GCTGGGACGC GGCGGCGCAC TGAGTGCCGA GCGTGCATCT GGGGCGGGAA TTCGGCGATT 1080
TTTCCGCCCT GAGTTCACGC TCGGCGCAAT CGGGACCGAG TTTGTCCAGC GTGTACCCGT 1140
CGAGTAGCCT CGTCA 1155
2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 13: (i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE: (A) DÉLKA: 1771 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (Xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 13:
GAGCGCCGTC TGGTGTTTGA ACGGTTTTAC CGGTCGGCAT CGGCACGGGC GTTGCCGGGT 60
TCGGGCCTCG GGTTGGCGAT CGTCAAACAG GTGGTGCTCA ACCACGGCGG ATTGCTGCGC 120
ATCGAAGACA CCGACCCAGG CGGCCAGCCC CCTGGAACGT CGATTTACGT GCTGCTCCCC 180
• · • ·
- 79 ·· ·· • · · · · • · · · • · · · · • · · · • · · · · · ·· ·· ·· • · · · • ··· · · • · · · · · · • · · · ·· ·· ·· • · • · • · • · · • • ·
GGCCGTCGGA TGCCGATTCC GCAGCTTCCC GGTGCGACGG CTGGCGCTCG GAGCACGGAC 240
ATCGAGAACT CTCGGGGTTC GGCGAACGTT ATCTCAGTGG AATCTCAGTC CACGCGCGCA 300
ACCTAGTTGT GCAGTTACTG TTGAAAGCCA CACCCATGCC AGTCCACGCA TGGCCAAGTT 360
GGCCCGAGTA GTGGGCCTAG TACAGGAAGA GCAACCTAGC GACATGACGA ATCACCCACG 420
GTATTCGCCA CCGCCGCAGC AGCCGGGAAC CCCAGGTTAT GCTCAGGGGC AGCAGCAAAC 480
GTACAGCCAG CAGTTCGACT GGCGTTACCC ACCGTCCCCG CCCCCGCAGC CAACCCAGTA 540
CCGTCAACCC TACGAGGCGT TGGGTGGTAC CCGGCCGGGT CTGATACCTG GCGTGATTCC 600
GACCATGACG CCCCCTCCTG GGATGGTTCG CCAACGCCCT CGTGCAGGCA TGTTGGCCAT 660
CGGCGCGGTG ACGATAGCGG TGGTGTCCGC CGGCATCGGC GGCGCGGCCG CATCCCTGGT 720
CGGGTTCAAC CGGGCACCCG CCGGCCCCAG CGGCGGCCCA GTGGCTGCCA GCGCGGCGCC 780
AAGCATCCCC GCAGCAAACA TGCCGCCGGG GTCGGTCGAA CAGGTGGCGG CCAAGGTGGT 840
GCCCAGTGTC GTCATGTTGG AAACCGATCT GGGCCGCCAG TCGGAGGAGG GCTCCGGCAT 900
CATTCTGTCT GCCGAGGGGC TGATCTTGAC CAACAACCAC GTGATCGCGG CGGCCGCCAA 960
GCCTCCCCTG GGCAGTCCGC CGCCGAAAAC GACGGTAACC TTCTCTGACG GGCGGACCGC 1020
ACCCTTCACG GTGGTGGGGG CTGACCCCAC CAGTGATATC GCCGTCGTCC GTGTTCAGGG 1080
CGTCTCCGGG CTCACCCCGA TCTCCCTGGG TTCCTCCTCG GACCTGAGGG TCGGTCAGCC 1140
GGTGCTGGCG ATCGGGTCGC CGCTCGGTTT GGAGGGCACC GTGACCACGG GGATCGTCAG 1200
CGCTCTCAAC CGTCCAGTGT CGACGACCGG CGAGGCCGGC AACCAGAACA CCGTGCTGGA 1260
CGCCATTCAG ACCGACGCCG CGATCAACCC CGGTAACTCC GGGGGCGCGC TGGTGAACAT 1320
GAACGCTCAA CTCGTCGGAG TCAACTCGGC CATTGCCACG CTGGGCGCGG ACTCAGCCGA 1380
TGCGCAGAGC GGCTCGATCG GTCTCGGTTT TGCGATTCCA GTCGACCAGG CCAAGCGCAT 1440
CGCCGACGAG TTGATCAGCA CCGGCAAGGC GTCACATGCC TCCCTGGGTG TGCAGGTGAC 1500
CAATGACAAA GACACCCCGG GCGCCAAGAT CGTCGAAGTA GTGGCCGGTG GTGCTGCCGC 15.60
GAACGCTGGA GTGCCGAAGG GCGTCGTTGT CACCAAGGTC GACGACCGCC CGATCAACAG 1620
CGCGGACGCG TTGGTTGCCG CCGTGCGGTC CAAAGCGCCG GGCGCCACGG TGGCGCTAAC 1680
CTTTCAGGAT CCCTCGGGCG GTAGCCGCAC AGTGCAAGTC ACCCTCGGCA AGGCGGAGCA 1740
GTGATGAAGG TCGCCGCGCA GTGTTCAAAG C
1771 • ·
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 14:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 1058 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 14:
CTCCACCGCG GTGGCGGCCG CTCTAGAACT AGTGGATCCC CCGGGCTGCA GGAATTCGGC 60
ACGAGGATCC GACGTCGCAG GTTGTCGAAC CCGCCGCCGC GGAAGTATCG GTCCATGCCT 120
AGCCCGGCGA CGGCGAGCGC CGGAATGGCG CGAGTGAGGA GGCGGGCAAT TTGGCGGGGC 180
CCGGCGACGG CGAGCGCCGG AATGGCGCGA GTGAGGAGGC GGGCAGTCAT GCCCAGCGTG 240
ATCCAATCAA CCTGCATTCG GCCTGCGGGC CCATTTGACA ATCGAGGTAG TGAGCGCAAA 300
TGAATGATGG AAAACGGGCG GTGACGTCCG CTGTTCTGGT GGTGCTAGGT GCCTGCCTGG 360
CGTTGTGGCT ATCAGGATGT TCTTCGCCGA AACCTGATGC CGAGGAACAG GGTGTTCCCG 420
TGAGCCCGAC GGCGTCCGAC CCCGCGCTCC TCGCCGAGAT CAGGCAGTCG CTTGATGCGA 480
CAAAAGGGTT GACCAGCGTG CACGTAGCGG TGCGAACAAC CGGGAAAGTC GACAGCTTGC 540
TGGGTATTAC CAGTGCCGAT GTCGACGTCC GGGCCAATCC GCTCGCGGCA AAGGGCGTAT 600
GCACCTACAA CGACGAGCAG GGTGTCCCGT TTCGGGTACA AGGCGACAAC ATCTCGGTGA 660
AACTGTTCGA CGACTGGAGC AATCTCGGCT CGATTTCTGA ACTGTCAACT TCACGCGTGC . 720
TCGATCCTGC CGCTGGGGTG ACGCAGCTGC TGTCCGGTGT CACGAACCTC CAAGCGCAAG 780
GTACCGAAGT GATAGACGGA ATTTCGACCA CCAAAATCAC CGGGACCATC CCCGCGAGCT 840
CTGTCAAGAT GCTTGATCCT GGCGCCAAGA GTGCAAGGCC GGCGACCGTG TGGATTGCCC 900
AGGACGGCTC GCACCACCTC GTCCGAGCGA GCATCGACCT CGGATCCGGG TCGATTCAGC 960
TCACGCAGTC GAAATGGAAC GAACCCGTCA ACGTCGACTA GGCCGAAGTT GCGTCGACGC 1020
GTTGNTCGAA ACGCCCTTGT GAACGGTGTC AACGGNAC
1058 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 15:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 542 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (Xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 15:
GAATTCGGCA CGAGAGGTGA TCGACATCAT CGGGACCAGC CCCACATCCT GGGAACAGGC 60
GGCGGCGGAG GCGGTCCAGC GGGCGCGGGA TAGCGTCGAT GACATCCGCG TCGCTCGGGT 120
CATTGAGCAG GACATGGCCG TGGACAGCGC CGGCAAGATC ACCTACCGCA TCAAGCTCGA 180
AGTGTCGTTC AAGATGAGGC CGGCGCAACC GCGCTAGCAC GGGCCGGCGA GCAAGACGCA 240
AAATCGCACG GTTTGCGGTT GATTCGTGCG ATTTTGTGTC TGCTCGCCGA GGCCTACCAG 300
GCGCGGCCCA GGTCCGCGTG CTGCCGTATC CAGGCGTGCA TCGCGATTCC GGCGGCCACG 360
CCGGAGTTAA TGCTTCGCGT CGACCCGAAC TGGGCGATCC GCCGGNGAGC TGATCGATGA 420
CCGTGGCCAG CCCGTCGATG CCCGAGTTGC C C G A.O Lj AAzi GTGCTGCCAG GCCGGTAGGA 480
AGCGTCCGTA GGCGGCGGTG CTGACCGGCT CTGCCTGCGC CCTCAGTGCG GCCAGCGAGC 540
GG 542
2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 16: (i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE: (A) DÉLKA: 913 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina 1 (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 16:
CGGTGCCGCC CGCGCCTCCG TTGCCCCCAT TGCCGCCGTC GCCGATCAGC TGCGCATCGC 60
CACCATCACC GCCTTTGCCG CCGGCACCGC CGGTGGCGCC GGGGCCGCCG ATGCCACCGC 120
TTGACCCTGG CCGCCGGCGC CGCCATTGCC ATACAGCACC CCGCCGGGGG CACCGTTACC 180
GCCGTCGCCA CCGTCGCCGC CGCTGCCGTT TCAGGCCGGG GAGGCCGAAT GAACCGCCGC 240
CAAGCCCGCC GCCGGCACCG TTGCCGCCTT TTCCGCCCGC CCCGCCGGCG CCGCCAATTG 300
CCGAACAGCC AMGCACCGTT GCCGCCAGCC CCGCCGCCGT TAACGGCGCT GCCGGGCGCC 360
GCCGCCGGAC CCGCCATTAC CGCCGTTCCC GTTCGGTGCC CCGCCGTTAC CGGCGCCGCC 420
• · • · ··· · ··
GTTTGCCGCC AATATTCGGC GGGCACCGCC AGACCCGCCG GGGCCACCAT TGCCGCCGGG 480
CACCGAAACA ACAGCCCAAC GGTGCCGCCG GCCCCGCCGT TTGCCGCCAT CACCGGCCAT 540
TCACCGCCAG CACCGCCGTT AATGTTTATG AACCCGGTAC CGCCAGCGCG GCCCCTATTG 600
CCGGGCGCCG GAGNGCGTGC CCGCCGGCGC CGCCAACGCC CAAAAGCCCG GGGTTGCCAC 660
CGGCCCCGCC GGACCCACCG GTCCCGCCGA TCCCCCCGTT GCCGCCGGTG CCGCCGCCAT 720
TGGTGCTGCT GAAGCCGTTA GCGCCGGTTC CGCSGGTTCC GGCGGTGGCG CCNTGGCCGC 780
CGGCCCCGCC GTTGCCGTAC AGCCACCCCC CGGTGGCGCC GTTGCCGCCA TTGCCGCCAT 840
TGCCGCCGTT GCCGCCATTG CCGCCGTTCC CGCCGCCACC GCCGGNTTGG CCGCCGGCGC 900
CGCCGGCGGC CGC 913
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 17:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 1872 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 17:
GACTACGTTG GTGTAGAAAA ATCCTGCCGC CCGGACCCTT AAGGCTGGGA CAATTTCTGA 60
TAGCTACCCC GACACAGGAG GTTACGGGAT GAGCAATTCG CGCCGCCGCT CACTCAGGTG 120
GTCATGGTTG CTGAGCGTGC TGGCTGCCGT CGGGCTGGGC CTGGCCACGG CGCCGGCCCA 180
GGCGGCCCCG CCGGCCTTGT CGCAGGACCG GTTCGCCGAC TTCCCCGCGC TGCCCCTCGA 240
CCCGTCCGCG ATGGTCGCCC AAGTGGCGCC ACAGGTGGTC AACATCAACA CCAAACTGGG ·300
CTACAACAAC GCCGTGGGCG CCGGGACCGG CATCGTCATC GATCCCAACG GTGTCGTGCT 360
GACCAACAAC CACGTGATCG CGGGCGCCAC CGACATCAAT GCGTTCAGCG TCGGCTCCGG 420
CCAAACCTAC GGCGTCGATG TGGTCGGGTA TGACCGCACC CAGGATGTCG CGGTGCTGCA 480
GCTGCGCGGT GCCGGTGGCC TGCCGTCGGC GGCGATCGGT GGCGGCGTCG CGGTTGGTGA 540
GCCCGTCGTC GCGATGGGCA ACAGCGGTGG GCAGGGCGGA ACGCCCCGTG CGGTGCCTGG 600
CAGGGTGGTC GCGCTCGGCC AAACCGTGCA GGCGTCGGAT TCGCTGACCG GTGCCGAAGA 660 • · • · · ·
83 • · · · • · · · · · • · · · • · · · · · • • ·
GACATTGAAC GGGTTGATCC AGTTCGATGC CGCAATCCAG CCCGGTGATT CGGGCGGGCC 720
CGTCGTCAAC GGCCTAGGAC AGGTGGTCGG TATGAACACG GCCGCGTCCG ATAACTTCCA 780
GCTGTCCCAG GGTGGGCAGG GATTCGCCAT TCCGATCGGG CAGGCGATGG CGATCGCGGG 840
CCAAATCCGA TCGGGTGGGG GGTCACCCAC CGTTCATATC GGGCCTACCG CCTTCCTCGG 900
CTTGGGTGTT GTCGACAACA ACGGCAACGG CGCACGAGTC CAACGCGTGG TCGGAAGCGC 960
TCCGGCGGCA AGTCTCGGCA TCTCCACCGG CGACGTGATC ACCGCGGTCG ACGGCGCTCC 1020
GATCAACTCG GCCACCGCGA TGGCGGACGC GCTTAACGGG CATCATCCCG GTGACGTCAT 1080
CTCGGTGAAC TGGCAAACCA AGTCGGGCGG CACGCGTACA GGGAACGTGA CATTGGCCGA 1140
GGGACCCCCG GCCTGATTTG TCGCGGATAC CACCCGCCGG CCGGCCAATT GGATTGGCGC 1200
CAGCCGTGAT TGCCGCGTGA GCCCCCGAGT TCCGTCTCCC GTGCGCGTGG CATTGTGGAA 1260
GCAATGAACG AGGCAGAACA CAGCGTTGAG CACCCTCCCG TGCAGGGCAG TTACGTCGAA. 1320
GGCGGTGTGG TCGAGCATCC GGATGCCAAG GACTTCGGCA GCGCCGCCGC CCTGCCCGCC 1380
GATCCGACCT GGTTTAAGCA CGCCGTCTTC TACGAGGTGC TGGTCCGGGC GTTCTTCGAC 1440
GCCAGCGCGG ACGGTTCCGN CGATCTGCGT GGACTCATCG ATCGCCTCGA CTACCTGCAG 1500
TGGCTTGGCA TCGACTGCAT CTGTTGCCGC CGTTCCTACG ACTCACCGCT GCGCGACGGC 1560
GGTTACGACA TTCGCGACTT CTACAAGGTG CTGCCCGAAT TCGGCACCGT CGACGATTTC 1620
GTCGCCCTGG TCGACACCGC TCACCGGCGA GGTATCCGCA TCATCACCGA CCTGGTGATG 1680
AATCACACCT CGGAGTCGCA CCCCTGGTTT CAGGAGTCCC GCCGCGACCC AGACGGACCG 1740
TACGGTGACT ATTACGTGTG GAGCGACACC AGCGAGCGCT ACACCGACGC CCGGATCATC 1800
TTCGTCGACA CCGAAGAGTC GAACTGGTCA TTCGATCCTG TCCGCCGACA GTTNCTACTG 1860
GCACCGATTC TT 1872
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 18:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 1482 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 18:
• · • ·
• · · · • · · · · · • · · · • · · · · · • • ·
84
CTTCGCCGAA ACCTGÁTGCC GAGGAACAGG GTGTTCCCGT GAGCCCGACG GCGTCCGACC 60
CCGCGCTCCT CGCCGAGATC AGGCAGTCGC TTGATGCGAC AAAAGGGTTG ACCAGCGTGC 120
ACGTAGCGGT CCGAACAACC GGGAAAGTCG ACAGCTTGCT GGGTATTACC AGTGCCGATG 180
TCGACGTCCG GGCCAATCCG CTCGCGGCAA AGGGCGTATG CACCTACAAC GACGAGCAGG 240
GTGTCCCGTT TCGGGTACAA GGCGACAACA TCTCGGTGAA ACTGTTCGAC GACTGGAGCA 300
ATCTCGGCTC GATTTCTGAA CTGTCAACTT CACGCGTGCT CGATCCTGCC GCTGGGGTGA 360
CGCAGCTGCT GTCCGGTGTC ACGAACCTCC AAGCGCAAGG TACCGAAGTG ATAGACGGAA 420
TTTCGACCAC CAAAATCACC GGGACCATCC CCGCGAGCTC TGTCAAGATG CTTGATCCTG 480
GCGCCAAGAG TGCAAGGCCG GCGACCGTGT GGATTGCCCA GGACGGCTCG CACCACCTCG 540
TCCGAGCGAG CATCGACCTC GGATCCGGGT CGATTCAGCT CACGCAGTCG AAATGGAACG 600
AACCCGTCAA CGTCGACTAG GCCGAAGTTG CGTCGACGCG TTGCTCGAAA CGCCCTTGTG 660
AACGGTGTCA ACGGCACCCG AAAACTGACC CCCTGACGGC ATCTGAAAAT TGACCCCCTA 720
GACCGGGCGG TTGGTGGTTA TTCTTCGGTG GTTCCGGCTG GTGGGACGCG GCCGAGGTCG 780
CGGTCTTTGA GCCGGTAGCT GTCGCCTTTG AGGGCGACGA CTTCAGCATG GTGGACGAGG 840
CGGTCGATCA TGGCGGCAGC AACGACGTCG TCGCCGCCGA AAACCTCGCC CCACCGGCCG 900
AAGGCCTTAT TGGACGTGAC GATCAAGCTG GCCCGCTCAT ACCGGGAGGA CACCAGCTGG 960
AAGAAGAGGT TGGCGGCCTC GGGCTCAAAC GGAATGTAAC CGACTTCGTC AACCACCAGG 1020
AGCGGATAGC GGCCAAACCG GGTGAGTTCG GCGTAGATGC GCCCGGCGTG GTGAGCCTCG 1080
GCGAACCGTG CTACCCATTC GGCGGCGGTG GCGAACAGCA CCCGATGACC GGCCTGACAC 1140
GCGCGTATCG CCAGGCCGAC CGCAAGATGA GTCTTCCCGG TGCCAGGCGG GGCCCAAAAA 1200
CACGACGTTA TCGCGGGCGG TGATGAAATC CAGGGTGCCC AGATGTGCGA TGGTGTCGCG 1260
TTTGAGGCCA CGAGCATGCT CAAAGTCGAA CTCTTCCAAC GACTTCCGAA CCGGGAAGCG 1320
GGCGGCGCGG ATGCGGCCCT CACCACCATG GGACTCCCGG GCTGACACTT CCCGCTGCAG 1380
GCAGGCGGCC AGGTATTCTT CGTGGCTCCA GTTCTCGGCG CGGGCGCGAT CGGCCAGCCG 1440
GGACACTGAC TCACGCAGGG TGGGAGCTTT CAATGCTCTT GT
1482 ·· ·· (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 19:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 876 párů bázi (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 19:
GAATTCGGCA CGAGCCGGCG ATAGCTTCTG GGCCGCGGCC GACCAGATGG CTCGAGGGTT 60
CGTGCTCGGG GCCACCGCCG GGCGCACCAC CCTGACCGGT GAGGGCCTGC AACACGCCGA 120
CGGTCACTCG TTGCTGCTGG ACGCCACCAA CCCGGCGGTG GTTGCCTACG ACCCGGCCTT 180
CGCCTACGAA ATCGGCTACA TCGNGGAAAG CGGACTGGCC AGGATGTGCG GGGAGAACCC 240
GGAGAACATC TTCTTCTACA TCACCGTCTA CAACGAGCCG TACGTGCAGC CGCCGGAGCC 300
GGAGAACTTC GATCCCGAGG GCGTGCTGGG GGGTATCTAC CGNTATCACG CGGCCACCGA 360
GCAACGCACC AACAAGGNGC AGATCCTGGC CTCCGGGGTA GCGATGCCCG CGGCGCTGCG 420
GGCAGCACAG ATGCTGGCCG CCGAGTGGGA TGTCGCCGCC GACGTGTGGT CGGTGACCAG 480
TTGGGGCGAG CTAAACCGCG ACGGGGTGGT CATCGAGACC GAGAAGCTCC GCCACCCCGA' 540
TCGGCCGGCG GGCGTGCCCT ACGTGACGAG AGCGCTGGAG AATGCTCGGG GCCCGGTGAT 600
CGCGGTGTCG GACTGGATGC GCGCGGTCCC CGAGCAGATC CGACCGTGGG TGCCGGGCAC 660
ATACCTCACG TTGGGCACCG ACGGGTTCGG TTTTTCCGAC ACTCGGCCCG CCGGTCGTCG 720
TTACTTCAAC ACCGACGCCG AATCCCAGGT TGGTCGCGGT TTTGGGAGGG GTTGGCCGGG. 780
TCGACGGGTG AATATCGACC CATTCGGTGC CGGTCGTGGG CCGCCCGCCC AGTTACCCGG 840
ATTCGACGAA GGTGGGGGGT TGCGCCCGAN TAAGTT 876
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 20:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 1021 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 20
ATCCCCCCGG GCTGCAGGAA TTCGGCACGA GAGACAAAAT TCCACGCGTT AATGCAGGAA 60 • ··
86 • · · · ··· · ·· • · · · • · · · · · • « ·
CAGATTCATA ACGAATTCAC AGCGGCACAA CAATATGTCG CGATCGCGGT TTATTTCGAC 120
AGCGAAGACC TGCCGCAGTT GGCGAAGCAT TTTTACAGCC AAGCGGTCGA GGAACGAAAC 180
CATGCAATGA TGCTCGTGCA ACACCTGCTC GACCGCGACC TTCGTGTCGA AATTCCCGGC 240
GTAGACACGG TGCGAAACCA GTTCGACAGA CCCCGCGAGG CACTGGCGCT GGCGCTCGAT 300
CAGGAACGCA CAGTCACCGA CCAGGTCGGT CGGCTGACAG CGGTGGCCCG CGACGAGGGC 360
GATTTCCTCG GCGAGCAGTT CATGCAGTGG TTCTTGCAGG AACAGATCGA AGAGGTGGCC 420
TTGATGGCAA CCCTGGTGCG GGTTGCCGAT CGGGCCGGGG CCAACCTGTT CGAGCTAGAG 480
AACTTCGTCG CACGTGAAGT GGATGTGGCG CCGGCCGCAT CAGGCGCCCC GCACGCTGCC 540
GGGGGCCGCC TCTAGATCCC TGGGGGGGAT CAGCGAGTGG TCCCGTTCGC CCGCCCGTCT 600
TCCAGCCAGG CCTTGGTGCG GCCGGGGTGG TGAGTACCAA TCCAGGCCAC CCCGACCTCC 660
CGGNAAAAGT CGATGTCCTC GTACTCATCG ACGTTCCAGG AGTACACCGC CCGGCCCTGA 720
GCTGCCGAGC GGTCAACGAG TTGCGGATAT TCCTTTAACG CAGGCAGTGA GGGTCCCACG 780
GCGGTTGGCC CGACCGCCGT GGCCGCACTG CTGGTCAGGT ATCGGGGGGT CTTGGCGAGC 840
AACAACGTCG GCAGGAGGGG TGGAGCCCGC CGGATCCGCA GACCGGGGGG GCGAAAACGA 900
CATCAACACC GCACGGGATC GATCTGCGGA GGGGGGTGCG GGAATACCGA ACCGGTGTAG 960
GAGCGCCAGC AGTTGTTTTT CCACCAGCGA AGCGTTTTCG GGTCATCGGN GGCNNTTAAG 1020
T (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 21: (i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE: (A) DÉLKA: 321 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 21 1021
CGTGCCGACG AACGGAAGAA CACAACCATG AAGATGGTGA AATCGATCGC CGCAGGTCTG 60
ACCGCCGCGG CTGCAATCGG CGCCGCTGCG GCCGGTGTGA CTTCGATCAT GGCTGGCGGN 120
CCGGTCGTAT ACCAGATGCA GCCGGTCGTC TTCGGCGCGC CACTGCCGTT GGACCCGGNA 180
• · · · • · · · · 4 · ·· ··· ··· ······· · ·___.
4··4 44 44 44 44 44
TCCGCCCCTG ANGTCCCGAC CGCCGCCCAG TGGACCAGNC TGCTCAACAG NCTCGNCGAT 240
CCCAACGTGT CGTTTGNGAA CAAGGGNAGT CTGGTCGAGG GNGGNATCGG NGGNANCGAG 300
GGNGNGNATC GNCGANCACA A 321
(2) Informace ο sekvenci SEQ ID NO: 22:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 373 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 22:
TCTTATCGGT TCCGGTTGGC GACGGGTTTT GGGNGCGGGT GGTTAACCCG CTCGGCCAGC 60
CGATCGACGG GCGCGGAGAC GTCGACTCCG ATACTCGGCG CGCGCTGGAG CTCCAGGCGC 120
CCTCGGTGGT GNACCGGCAA GGCGTGAAGG AGCCGTTGNA GACCGGGATC AAGGCGATTG 180
ACGCGATGAC CCCGATCGGC CGCGGGCAGC GCCAGCTGAT CATCGGGGAC CGCAAGACCG 240
GCAAAAACCG CCGTCTGTGT CGGACACCAT CCTCAAACCA GCGGGAAGAA CTGGGAGTCC 300
GGTGGATCCC AAGAAGCAGG TGCGCTTGTG TATACGTTGG CCATCGGGCA AGAAGGGGAA' 360 CTTACCATCG CCG 373 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 23:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 352 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 23:
GTGACGCCGT GATGGGATTC CTGGGCGGGG CCGGTCCGCT GGCGGTGGTG GATCAGCAAC 60 TGGTTACCCG GGTGCCGCAA GGCTGGTCGT TTGCTCAGGC AGCCGCTGTG CCGGTGGTGT 120 TCTTGACGGC CTGGTACGGG TTGGCCGATT TAGCCGAGAT CAAGGCGGGC GAATCGGTGC 180 TGATCCATGC CGGTACCGGC GGTGTGGGCA TGGCGGCTGT GCAGCTGGCT CGCCAGTGGG 240 • · « · < · • · · · » · · 0 ·«·· ·· ·· ·· ··
GCGTGGAGGT TTTCGTCACC GCCAGCCGTG GNAAGTGGGA CACGCTGCGC GCCATNGNGT 300
TTGACGACGA NCCATATCGG NGATTCCCNC ACATNCGAAG TTCCGANGGA GA 352
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 24: (i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE: (A) DÉLKA: 726 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 24:
GAAATCCGCG TTCATTCCGT TCGACCAGCG GCTGGCGATA ATCGACGAAG TGATCAAGCC 60
GCGGTTCGCG GCGCTCATGG GTCACAGCGA GTAATCAGCA AGTTCTCTGG TATATCGCAC 120
CTAGCGTCCA GTTGCTTGCC AGATCGCTTT CGTACCGTCA TCGCATGTAC CGGTTCGCGT 180
GCCGCACGCT CATGCTGGCG GCGTGCATCC TGGCCACGGG TGTGGCGGGT CTCGGGGTCG 240
GCGCGCAGTC CGCAGCCCAA ACCGCGCCGG TGCCCGACTA CTACTGGTGC CCGGGGCAGC 300
CTTTCGACCC CGCATGGGGG CCCAACTGGG ATCCCTACAC CTGCCATGAC GACTTCCACC 360
GCGACAGCGA CGGCCCCGAC CACAGCCGCG ACTACCCCGG ACCCATCCTC GAAGGTCCCG 420
TGCTTGACGA TCCCGGTGCT GCGCCGCCGC CCCCGGCTGC CGGTGGCGGC GCATAGCGCT 480
CGTTGACCGG GCCGCATCAG CGAATACGCG TATAAACCCG GGCGTGCCCC CGGCAAGCTA 540
CGACCCCCGG CGGGGCAGAT TTACGCTCCC GTGCCGATGG ATCGCGCCGT CCGATGACAG 600
AAAATAGGCG ACGGTTTTGG CAACCGCTTG GAGGACGCTT GAAGGGAACC TGTCATGAAC 660
GGCGACAGCG CCTCCACCAT CGACATCGAC AAGGTTGTTA CCCGCACACC CGTTCGCCGG 720
ATCGTG 726
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 25:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 580 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 25:
» * φ« ·· «··« · · · » · * · • «« * · ··· · » · · • · · · · * · ·· »·· «»« ···«*·· 9 · ······ · · 99 9 9 99
CGCGACGACG ACGAACGTCG GGCCCACCAC CGCCTATGCG TTGATGCAGG CGACCGGGAT 60
GGTCGCCGAC CATATCCAAG CATGCTGGGT GCCCACTGAG CGACCTTTTG ACCAGCCGGG . 120
CTGCCCGATG GCGGCCCGGT GAAGTCATTG CGCCGGGGCT TGTGCACCTG ATGAACCCGA 180
ATAGGGAACA ATAGGGGGGT GATTTGGCAG TTCAATGTCG GGTATGGCTG GAAATCCAAT 240
GGCGGGGCAT GCTCGGCGCC GACCAGGCTC GCGCAGGCGG GCCAGCCCGA ATCTGGAGGG 300
AGCACTCAAT GGCGGCGATG AAGCCCCGGA CCGGCGACGG TCCTTTGGAA GCAACTAAGG 360
AGGGGCGCGG CATTGTGATG CGAGTACCAC TTGAGGGTGG CGGTCGCCTG GTCGTCGAGC 420
TGACACCCGA CGAAGCCGCC GCACTGGGTG ACGAACTCAA AGGCGTTACT AGCTAAGACC 480
AGCCCAACGG CGAATGGTCG GCGTTACGCG CACACCTTCC GGTAGATGTC CAGTGTCTGC 540
TCGGCGATGT ATGCCCAGGA GAACTCTTGG ATACAGCGC? (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 26: (i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE: (A) DÉLKA: 160 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 26: 580
AACGGAGGCG CCGGGGGTTT TGGCGGGGCC GGGGCGGTCG GCGGCAACGG CGGGGCCGGC 60
GGTACCGCCG GGTTGTTCGG TGTCGGCGGG GCCGGTGGGG CCGGAGGCAA CGGCATCGCC 120
GGTGTCACGG GTACGTCGGC CAGCACACCG GGTGGATCCG 160
(2) Informace ο sekvenci SEQ ID NO: 27:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 272 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (Xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 27:
φφφφ φφ • · φφ • φ « • · «φ φφ φφ
ΦΦΦ • · • · • Φ φφ φφ • · · φ • · · · • φφ ΦΦΦ φ φ φφ φφ
GACACCGATA CGATGGTGAT GTACGCCAAC GTTGTCGACA CGCTCGAGGC GTTCACGATC 60
CAGCGCACAC CCGACGGCGT GACCATCGGC GATGCGGCCC CGTTCGCGGA GGCGGCTGCC 120
AAGGCGATGG GAATCGACAA GCTGCGGGTA ATTCATACCG GAATGGACCC CGTCGTCGCT 180
GAACGCGAAC AGTGGGACGA CGGCAACAAC ACGTTGGCGT TGGCGCCCGG TGTCGTTGTC 240
GCCTACGAGC GCAACGTACA GACCAACGCC CG 272
(2) Informace ο sekvenci SEQ ID NO: 28:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 317 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 28:
GCAGCCGGTG GTTCTCGGAC TATCTGCGCA CGGTGACGCA GCGCGACGTG CGCGAGCTGA 60
AGCGGATCGA GCAGACGGAT CGCCTGCCGC GGTTCATGCG CTACCTGGCC GCTATCACCG 120
CGCAGGAGCT GAACGTGGCC GAAGCGGCGC GGGTCATCGG GGTCGACGCG GGGACGATCC 180
GTTCGGATCT GGCGTGGTTC GAGACGGTCT ATCTGGTACA TCGCCTGCCC GCCTGGTCGC 240
GGAATCTGAC CGCGAAGATC AAGAAGCGGT CAAAGATCCA CGTCGTCGAC AGTGGCTTCG 300
CGGCCTGGTT GCGCGGG 317
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 29:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 182 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 29:
GATCGTGGAG CTGTCGATGA ACAGCGTTGC CGGACGCGCG GCGGCCAGCA CGTCGGTGTA 60 • · · · • · • · · · · · · ···· · · ·· · ·
GCAGCGCCGG ACCACCTCGC CGGTGGGCAG CATGGTGATG ACCACGTCGG CCTCGGCCAC 120
CGCTTCGGGC GCGCTACGAA ACACCGCGAC ACCGTGCGCG GCGGCGCCGG ACGCCGCCGT 180
GG 182
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 30:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 308 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 30:
GATCGCGAAG TTTGGTGAGC AGGTGGTCGA CGCGAAAGTC TGGGCGCCTG CGAAGCGGGT 60
CGGCGTTCAC GAGGCGAAGA CACGCCTGTC CGAGCTGCTG CGGCTCGTCT ACGGCGGGCA 120
GAGGTTGAGA TTGCCCGCCG CGGCGAGCCG GTAGCAAAGC TTGTGCCGCT GCATCCTCAT 180
GAGACTCGGC GGTTAGGCAT TGACCATGGC GTGTACCGCG TGCCCGACGA TTTGGACGCT ' 240
CCGTTGTCAG ACGACGTGCT CGAACGCTTT CACCGGTGAA GCGCTACCTC ATCGACACCC 300
ACGTTTGG (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 31:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 267 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (Xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 31:
CCGACGACGA GCAACTCACG TGGATGATGG TCGGCAGCGG CATTGAGGAC GGAGAGAATC 60
CGGCCGAAGC TGCCGCGCGG CAAGTGCTCA TÁGTGACCGG CCGTAGAGGG CTCCCCCGAT 120
GGCACCGGAC TATTCTGGTG TGCCGCTGGC CGGTAAGAGC GGGTAAAAGA ATGTGAGGGG 180
ACACGATGAG CAATCACACC TACCGAGTGA TCGAGATCGT CGGGACCTCG CCCGACGGCG 240
TCGACGCGGC AATCCAGGGC GGTCTGG
267 • · • · • ·
• · · · · · · ···· ·· ·· ·· • · • · · ·
92
2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 32: -
(i)CHARAKTERIŠTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 1539 párů baží
(B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová
(D) TOPOLOGIE: lineární
(xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 32:
CTCGTGCCGA AAGAATGTGA GGGGACACGA TGAGCAATCA CACCTACCGA GTGATCGAGA 60
TCGTCGGGAC CTCGCCCGAC GGCGTCGACG CGGCAATCCA GGGCGGTCTG GCCCGAGCTG 120
CGCAGACCAT GCGCGCGCTG GACTGGTTCG AAGTACAGTC AATTCGAGGC CACCTGGTCG 180
ACGGAGCGGT CGCGCACTTC CAGGTGACTA TGAAAGTCGG CTTCCGCTGG AGGATTCCTG 240
AACCTTCAAG CGCGGCCGAT AACTGAGGTG Qů *7QZ.-Ίη. - Ί CGACTTTTCC AGAACATCCT 300
GACGCGCTCG AAACGCGGTT CAGCCGACGG TGGCTCCGCC GAGGCGCTGC CTCCAAAATC 360
CCTGCGACAA TTCGTCGGCG GCGCCTACAA GGAAGTCGGT GCTGAATTCG TCGGGTATCT 420
GGTCGACCTG TGTGGGCTGC AGCCGGACGA AGCGGTGCTC GACGTCGGCT GCGGCTCGGG 480
GCGGATGGCG TTGCCGCTCA CCGGCTATCT GAACAGCGAG GGACGCTACG CCGGCTTCGA 540
TATCTCGCAG AAAGCCATCG CGTGGTGCCA GGAGCACATC ACCTCGGCGC ACCCCAACTT 600
CCAGTTCGAG GTCTCCGACA TCTACAACTC GCTGTACAAC CCGAAAGGGA AATACCAGTC 660
ACTAGACTTT CGCTTTCCAT ATCCGGATGC GTCGTTCGAT GTGGTGTTTC TTACCTCGGT 720
GTTCACCCAC ATGTTTCCGC CGGACGTGGA GCACTATCTG GACGAGATCT CCCGCGTGCT 780
GAAGCCCGGC GGACGATGCC TGTGCACGTA CTTCTTGCTC AATGACGAGT CGTTAGCCCA 840
CATCGCGGAA GGAAAGAGTG CGCACAACTT CCAGCATGAG GGACCGGGTT ATCGGACAAT 900
CCACAAGAAG CGGCCCGAAG AAGCAATCGG CTTGCCGGAG ACCTTCGTCA GGGATGTCTA 960
TGGCAAGTTC GGCCTCGCCG TGCACGAACC ATTGCACTAC GGCTCATGGA GTGGCCGGGA 1020
ACCACGCCTA AGCTTCCAGG ACATCGTCAT CGCGACCAAA ACCGCGAGCT AGGTCGGCAT 1080 *
CCGGGAAGCA TCGCGACACC GTGGCGCCGA GCGCCGCTGC CGGCAGGCCG ATTAGGCGGG 1140 -
CAGATTAGCC CGCCGCGGCT CCCGGCTCCG AGTACGGCGC CCCGAATGGC GTCACCGGCT 1200
GGTAACCACG CTTGCGCGCC TGGGCGGCGG CCTGCCGGAT CAGGTGGTAG ATGCCGACAA 1260
• · · · · · • ·
AGCCTGCGTG ATCGGTCATC ACCAACGGTG ACAGCAGCCG GTTGTGCACC AGCGCGAACG 1320
CCACCCCGGT CTCCGGGTCT GTCCAGCCGA TCGAGCCGCC CAAGCCCACA TGACCAAACC 1380
CCGGCATCAC GTTGCCGATC GGCATACCGT GATAGCCAAG ATGAAAATTT AAGGGCACCA 1440
ATAGATTTCG ATCCGGCAGA ACTTGCCGTC GGTTGCGGGT CAGGCCCGTG ACCAGCTCCC 1500
GCGACAAGAA CCGTATGCCG TCGATCTCGC CTCGTGCCG 1539 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 33:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 851 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 33:
CTGCAGGGTG GCGTGGATGA GCGTCACCGC GGGGCAGGCC GAGCTGACCG CCGCCCAGGT 60
CCGGGTTGCT GCGGCGGCCT ACGAGACGGC GTATGGGCTG ACGGTGCCCC CGCCGGTGAT 120
CGCCGAGAAC CGTGCTGAAC TGATGATTCT GATAGCGACC AACCTCTTGG GGCAAAACAC 180
CCCGGCGATC GCGGTCAACG AGGCCGAATA CGGCGAGATG TGGGCCCAAG ACGCCGCCGC 240
GATGTTTGGC TACGCCGCGG CGACGGCGAC GGCGACGGCG ACGTTGCTGC CGTTCGAGGA 300
GGCGCCGGAG ATGACCAGCG CGGGTGGGCT CCTCGAGCAG GCCGCCGCGG TCGAGGAGGC 360
CTCCGACACC GCCGCGGCGA ACCAGTTGAT GAACAATGTG CCCCAGGCGC TGAAACAGTT 420
GGCCCAGCCC ACGCAGGGCA CCACGCCTTC TTCCAAGCTG GGTGGCCTGT GGAAGACGGT 480
CTCGCCGCAT CGGTCGCCGA TCAGCAACAT GGTGTCGATG GCCAACAACC ACATGTCGAT 540
GACCAACTCG GGTGTGTCGA TGACCAACAC CTTGAGCTCG ATGTTGAAGG GCTTTGCTCC 600
GGCGGCGGCC GCCCAGGCCG TGCAAACCGC GGCGCAAAAC GGGGTCCGGG CGATGAGCTC 660
GCTGGGCAGC TCGCTGGGTT CTTCGGGTCT GGGCGGTGGG GTGGCCGCCA ACTTGGGTCG 720
GGCGGCCTCG GTACGGTATG GTCACCGGGA TGGCGGAAAA TATGCANAGT CTGGTCGGCG 780
GAACGGTGGT CCGGCGTAAG GTTTACCCCC GTTTTCTGGA TGCGGTGAAC TTCGTCAACG 840
GAAACAGTTA C
851 • · · · · · (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 34:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 254 párů bázi (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 34:
GATCGATCGG GCGGAAATTT GGACCAGATT CGCCTCCGGC GATAACCCAA TCAATCGAAC 60
CTAGATTTAT TCCGTCCAGG GGCCCGAGTA ATGGCTCGCA GGAGAGGAAC CTTACTGCTG 120
CGGGCACCTG TCGTAGGTCC TCGATACGGC GGAAGGCGTC GACATTTTCC ACCGACACCC 180
CCATCCAAAC GTTCGAGGGC CACTCCAGCT TGTGAGCGAG GCGACGCAGT CGCAGGCTGC 240
GCTTGGTCAA GATC 254
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 35:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 1227 párů baží
(B) TYP: nukleová kyselina
(C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová
(D) TOPOLOGIE: lineární
(xi) POPIS SEKVENCE: SEQ : ID NO: 35:
GATCCTGACC GAAGCGGCCG CCGCCAAGGC GAAGTCGCTG TTGGACCAGG AGGGACGGGA 60
CGATCTGGCG CTGCGGATCG CGGTTCAGCC GGGGGGGTGC GCTGGATTGC GCTATAACCT 120
TTTCTTCGAC GACCGGACGC TGGATGGTGA CCAAACCGCG GAGTTCGGTG GTGTCAGGTT 180
GATCGTGGAC CGGATGAGCG CGCCGTATGT GGAAGGCGCG TCGATCGATT TCGTCGACAC 240
TATTGAGAAG CAAGGTTCAC CATCGACAAT CCCAACGCCA CCGGCTCCTG CGCGTGCGGG 300
GATTCGTTCA ACTGATAAAA CGCTAGTACG ACCCCGCGGT GCGCAACACG TACGAGCACA 360
CCAAGACCTG ACCGCGCTGG AAAAGCAACT GAGCGATGCC TTGCACCTGA CCGCGTGGCG 420
GGCCGCCGGC GGCAGGTGTC ACCTGCATGG TGAACAGCAC CTGGGCCTGA TATTGCGACC 480
AGTACACGAT TTTGTCGATC GAGGTCACTT CGACCTGGGA GAACTGCTTG CGGAACGCGT 540
• 4 · · · • · · 4 • · · · ···· 4 4 4 · 95 • · · 4 · 4 4 4 4 4 4 44 4
4 4 4 4 4 44 44 44
CGCTGCTCAG CTTGGCCAAG GCCTGATCGG AGCGCTTGTC GCGCACGCCG TCGTGGATAC 600
CGCACAGCGC ATTGCGAACG ATGGTGTCCA CATCGCGGTT CTCCAGCGCG TTGAGGTATC 660
CCTGAATCGC GGTTTTGGCC GGTCCCTCCG AGAATGTGCC TGCCGTGTTG GCTCCGTTGG 720
TGCGGACCCC GTATATGATC GCCGCCGTCA TAGCCGACAC CAGCGCGAGG GCTACCACAA 780
TGCCGATCAG CAGCCGCTTG TGCCGTCGCT TCGGGTAGGA CACCTGCGGC GGCACGCCGG 840
GATATGCGGC GGGCGGCAGC GCCGCGTCGT CTGCCGGTCC CGGGGCGAAG GCCGGTTCGG 900
CGGCGCCGAG GTCGTGGGGG TAGTCCAGGG CTTGGGGTTC GTGGGATGAG GGCTCGGGGT 960
ACGGCGCCGG TCCGTTGGTG CCGACACCGG GGTTCGGCGA GTGGGGACCG GGCATTGTGG 1020
TTCTCCTAGG GTGGTGGACG GGACCAGCTG CTAGGGCGAC AACCGCCCGT CGCGTCAGCC ' 1080
GGCAGCATCG GCAATCAGGT GAGCTCCCTA GGCAGGCTAG CGCAACAGCT GCCGTCAGCT 1140
CTCAACGCGA CGGGGCGGGC CGCGGCGCCG ATAATGTTGA AAGACTAGGC AACCTTAGGA 1200
ACGAAGGACG GAGATTTTGT GACGATC 1227
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 36:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 181 párů baží
(B) TYP: nukleová kyselina
(C) DRUH ŘETĚZCE: j ednořetězcová
(D) TOPOLOGIE: lineární
(xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 36:
GCGGTGTCGG CGGATCCGGC GGGTGGTTGA ACGGCAACGG CGGGGCCGGC GGGGCCGGCG 60
GGACCGGCGC TAACGGTGGT GCCGGCGGCA ACGCCTGGTT GTTCGGGGCC GGCGGGTCCG 120
GCGGNGCCGG CACCAATGGT GGNGTCGGCG GGTCCGGCGG ATTTGTCTAC GGCAACGGCG 180
G 181
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 37:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 290 párů bázi (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 37:
GCGGTGTCGG CGGATCCGGC GGGTGGTTGA ACGGCAACGG CGGTGTCGGC GGCCGGGGCG 60
GCGACGGCGT CTTTGCCGGT GCCGGCGGCC AGGGCGGCCT CGGTGGGCAG GGCGGCAATG 120
GCGGCGGCTC CACCGGCGGC AACGGCGGTC TTGGCGGCGC GGGCGGTGGC GGAGGCAACG 180
CCCCGGACGG CGGCTTCGGT GGCAACGGCG GTAAGGGTGG CCAGGGCGGN ATTGGCGGCG 240
GCACTCAGAG CGCGACCGGC CTCGGNGGTG ACGGCGGTGA CGGCGGTGAC 290
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 38:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 34 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 38:
GATCCAGTGG CATGGNGGGT GTCAGTGGAA GCAT 34 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 39:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 155 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 39:
GATCGCTGCT CGTCCCCCCC TTGCCGCCGA CGCCACCGGT CCCACCGTTA CCGAACAAGC 60
TGGCGTGGTC GCCAGCACCC CCGGCACCGC CGACGCCGGA GTCGAACAAT GGCACCGTCG 120
TATCCCCACC ATTGCCGCCG GNCCCACCGG CACCG
155 • · toto • · » to to · · (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 40:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 53 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 40:
ATGGCGTTCA CGGGGCGCCG GGGACCGGGC AGCCCGGNGG GGCCGGGGGG TGG (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 41:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 132 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 41:
GATCCACCGC GGGTGCAGAC GGTGCCCGCG GCGCCACCCC GACCAGCGGC GGCAACGGCG 60
GCACCGGCGG CAACGGCGCG AACGCCACCG TCGTCGGNGG GGCCGGCGGG GCCGGCGGCA 120
AGGGCGGCAA CG 132
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 42:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 132 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 42:
GATCGGCGGC
CCNGCCAAGA
CGGNACGGNC
ATCCTCCGNG
GGGGACGGCG GGAAGGGCGG
TCCNCCAATG GCGCGAATGG
NAACGGGGGC
CGGACAGGGC
GCCGNÁGCCA
GGCAACGGCG
120
GCANCGGCGG CA
132 • · (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 43:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 702 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 43:
CGGCACGAGG ATCGGTACCC CGCGGCATCG GCAGCTGCCG ATTCGCCGGG TTTCCCCACC 60
CGAGGAAAGC CGCTACCAGA TGGCGCTGCC GAAGTAGGGC GATCCGTTCG CGATGCCGGC 120
ATGAACGGGC GGCATCAAAT TAGTGCAGGA ACCTTTCAGT TTAGCGACGA TAATGGCTAT 180
AGCACTAAGG AGGATGATCC GATATGACGC AGTCGCAGAC CGTGACGGTG GATCAGCAAG 240
AGATTTTGAA CAGGGCCAAC GAGGTGGAGG CCCCGATGGC GGACCCACCG ACTGATGTCC 300
CCATCACACC GTGCGAACTC ACGGNGGNTA AAAACGCCC-C CCA-.CAGNTG GTNTTGTCCG 360
CCGACAACAT GCGGGAATAC CTGGCGGCCG GTGCCAAAGA GCGGCAGCGT CTGGCGACCT 420
CGCTGCGCAA CGCGGCCAAG GNGTATGGCG AGGTTGATGA GGAGGCTGCG ACCGCGCTGG' 480
ACAACGACGG CGAAGGAACT GTGCAGGCAG AATCGGCCGG GGCCGTCGGA GGGGACAGTT 540
CGGCCGAACT AACCGATACG CCGAGGGTGG CCACGGCCGG TGAACCCAAC TTCATGGATC 600
TCAAAGAAGC GGCAAGGAAG CTCGAAACGG GCGACCAAGG CGCATCGCTC GCGCACTGNG 660
GGGATGGGTG GAACACTTNC ACCCTGACGC TGCAAGGCGA CG 702
) Informace o sekvenci SEQ ID NO : 44:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 702 párů baží
(B) TYP: nukleová kyselina
(C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová
(D) TOPOLOGIE: lineární
(xi) POPIS ; SEKVENCE: SEQ ID NO: 44:
GAAGCCGCAG CGCTGTCGGG CGACGTGGCG GTCAAAGCGG CATCGCTCGG TGGCGGTGGA 60
GGCGGCGGGG TGCCGTCGGC GCCGTTGGGA TCCGCGATCG GGGGCGCCGA ATCGGTGCGG 120
CCCGCTGGCG CTGGTGACAT TGCCGGCTTA GGCCAGGGAA GGGCCGGCGG CGGCGCCGCG 180
• · • · ·*··*·· · · • ·· · · · fl 9 9 9 9 9 9
CTGGGCGGCG GTGGCATGGG AATGCCGATG GGTGCCGCGC ATCAGGGACA AGGGGGCGCC 240
AAGTCCAAGG GTTCTCAGCA GGAAGACGAG GCGCTCTACA CCGAGGATCC TCGTGCCG 298 (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO:45:
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 45:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 1058 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 45:
GCACTGCACC AGTGGAGGAG 60
CCATGACCTA CTCGCCGGGT AACCCCGGAT ACCCGCAAGC GCAGCCCGCA GGCTCCTACG 120
GAGGCGTCAC ACCCTCGTTC GCCCACGCCG ATGAGGGTGC GAGCAAGCTA CCGATGTACC 180
TGAACATCGC GGTGGCAGTG CTCGGTCTGG CTGCGTACTT CGCCAGCTTC GGCCCAATGT 240
TCACCCTCAG TACCGAACTC GGGGGGGGTG ATGGCGCAC-T GTCCGGTGAC ACTGGGCTGC 300
CGGTCGGGGT GGCTCTGCTG GCTGCGCTGC TTGCCGGGGT GGTTCTGGTG CCTAAGGCCA 360
AGAGCCATGT GACGGTAGTT GCGGTGCTCG GGGTACTCGG CGTATTTCTG ATGGTCTCGG 420
CGACGTTTAA CAAGCCCAGC GCCTATTCGA CCGGTTGGGC ATTGTGGGTT GTGTTGGCTT 480
TCATCGTGTT CCAGGCGGTT GCGGCAGTCC TGGCGCTCTT GGTGGAGACC GGCGCTATCA 540
CCGCGCCGGC GCCGCGGCCC AAGTTCGACC CGTATGGACA GTACGGGCGG TACGGGCAGT 600
ACGGGCAGTA CGGGGTGCAG CCGGGTGGGT ACTACGGTCA GCAGGGTGCT CAGCAGGCCG 660
CGGGACTGCA GTCGCCCGGC CCGCAGCAGT CTCCGCAGCC TCCCGGATAT GGGTCGCAGT 720
ACGGCGGCTA TTCGTCCAGT CCGAGCCAAT CGGGCAGTGG ATACACTGCT CAGCCCCCGG 780
CCCAGCCGCC GGCGCAGTCC GGGTCGCAAC AATCGCACCA GGGCCCATCC ACGCCACCTA 840
CCGGCTTTCC GAGCTTCAGC CCACCACCAC ČGGTCAGTGC CGGGACGGGG TCGCAGGCTG 900
GTTCGGCTCC AGTCAACTAT TCAAACCCCA GCGGGGGCGA GCAGTCGTCG TCCCCCGGGG 960
GGGCGCCGGT CTAACCGGGC GTTCCCGCGT CCGGTCGCGC GTGTGCGCGA AGAGTGAACA 1020
GGGTGTCAGC AAGCGCGGAC GATCCTCGTG CCGAATTC
1058
100 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 46:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 327 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 46:
CGGCACGAGA GACCGATGCC GCTACCCTCG CGCAGGAGGC AGGTAATTTC GAGCGGATCT 60
CCGGCGACCT GAAAACCCAG ATCGACCAGG TGGAGTCGAC GGCAGGTTCG TTGCAGGGCC 120
AGTGGCGCGG CGCGGCGGGG ACGGCCGCCC AGGCCGCGGT GGTGCGCTTC CAAGAAGCAG 180
CCAATAAGCA GAAGCAGGAA CTCGACGAGA TCTCGACGAA TATTCGTCAG GCCGGCGTCC 240
AATACTCGAG GGCCGACGAG GAGCAGCAGC AGGCGC i ό i CTCGCAAATG GGCTTCTGAC 300
CCGCTAATAC GAAAAGAAAC GGAGCAA 327
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 47:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 170 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 47:
CGGTCGCGAT GATGGCGTTG TCGAACGTGA CCGATTCTGT ACCGCCGTCG TTGAGATCAA 60
CCAACAACGT GTTGGCGTCG GCAAATGTGC CGNACCCGTG GATCTCGGTG ATCTTGTTCT 120
TCTTCATCAG GAAGTGCACA CCGGCCACCC TGCCCTCGGN TACCTTTCGG 170
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 48:
(i) CHARAKTERIŠTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 127 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 48:
101
GATCCGGCGG CACGGGGGGT GCCGGCGGCA GCACCGCTGG CGCTGGCGGC AACGGCGGGG 60
CCGGGGGTGG CGGCGGAACC GGTGGGTTGC TCTTCGGCAA CGGCGGTGCC GGCGGGCACG 120
127 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 49:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 81 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 49:
CGGCGGCAAG GGCGGCACCG CCGGCAACGG GAGCGGCGCG GCCGGCGGCA ACGGCGGCAA
CGGCGGCTCC GGCCTCAACG G (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 50:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 149 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 50:
GATCAGGGCT GGCCGGCTCC GGCCAGAAGG GCGGTAACGG AGGAGCTGCC GGATTGTTTG 60
GCAACGGCGG GGCCGGNGGT GCCGGCGCGT CCAACCAAGC CGGTAACGGC GGNGCCGGCG 120
GAAACGGTGG TGCCGGTGGG CTGATCTGG
149
102 • ft ft ftft • ··· ft · · · · · · • ••ft ftft ftft ·· (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 51:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 355 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 51:
CGGCACGAGA TCACACCTAC CGAGTGATCG AGATCGTCGG GACCTCGCCC GACGGTGTCG 60
ACGCGGNAAT CCAGGGCGGT CTGGCCCGAG CTGCGCAGAC CATGCGCGCG CTGGACTGGT 120
TCGAAGTACA GTCAATTCGA GGCCACCTGG TCGACGGAGC GGTCGCGCAC TTCCAGGTGA 180
CTATGAAAGT CGGCTTCCGC CTGGAGGATT CCTGAACCTT CAAGCGCGGC CGATAACTGA 240
GGTGCATCAT TAAGCGACTT TTCCAGAACA TCCTGACGCG CTCGAAACGC GGTTCAGCCG 300
ACGGTGGCTC CGCCGAGGCG CTGCCTCCAA AATCCCTGCG ACAATTCGTC GGCGG 355
ft* 2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 52:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 999 párů baží
(B) TYP: nukleová kyselina
(C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová
(D) TOPOLOGIE: lineární
(xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 52:
ATGCATCACC ATCACCATCA CATGCATCAG GTGGACCCCA ACTTGACACG TCGCAAGGGA. 60
CGATTGGCGG CACTGGCTAT CGCGGCGATG GCCAGCGCCA GCCTGGTGAC CGTTGCGGTG 120
CCCGCGACCG CCAACGCCGA TCCGGAGCCA GCGCCCCCGG TACCCACAAC GGCCGCCTCG 180
CCGCCGTCGA CCGCTGCAGC GCCACCCGCA CCGGCGACAC CTGTTGCCCC CCCACCACCG 240
GCCGCCGCCA ACACGCCGAA TGCCCAGCCG GGCGATCCCA ACGCAGCACC TCCGCCGGCC 300
GACCCGAACG CACCGCCGCC ACCTGTCATT GCCCCAAACG CACCCCAACC TGTCCGGATC 360
GACAACCCGG TTGGAGGATT CAGCTTCGCG CTGCCTGCTG GCTGGGTGGA GTCTGACGCC 420
GCCCACTTCG ACTACGGTTC AGCACTCCTC AGCAAAACCA CCGGGGACCC GCCATTTCCC 480
GGACAGCCGC CGCCGGTGGC CAATGACACC CGTATCGTGC TCGGCCGGCT AGACCAAAAG 540
CTTTACGCCA GCGCCGAAGC CACCGACTCC AAGGCCGCGG CCCGGTTGGG CTCGGACATG 600
GGTGAGTTCT ATATGCCCTA CCCGGGCACC CGGATCAACC AGGAAACCGT CTCGCTCGAC 660
103 • · · · · • · · · • · · · 9··· 44 4 · · 9 9 9 9999 9 99 9
9 9 9 9 » · ·· • • ·
GCCAACGGGG TGTCTGGAAG CGCGTCGTAT TACGAAGTCA AGTTCAGCGA TCCGAGTAAG 720
CCGAACGGCC AGATCTGGAC GGGCGTAATC GGCTCGCCCG CGGCGAACGC ACCGGACGCC 780
GGGCCCCCTC AGCGCTGGTT TGTGGTATGG CTCGGGACCG CCAACAACCC GGTGGACAAG 840
GGCGCGGCCA AGGCGCTGGC CGAATCGATC CGGCCTTTGG TCGCCCCGCC GCCGGCGCCG 900
GCACCGGCTC CTGCAGAGCC CGCTCCGGCG CCGGCGCCGG CCGGGGAAGT CGCTCCTACC 960
CCGACGACAC CGACACCGCA GCGGACCTTA CCGGCCTGA 999
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 53:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 332 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární
(xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO : 53:
Met His His His His His His Met His Gin Val' Asp Pro Asn Leu Thr
1 5 10 15
Arg Arg Lys Gly Arg Leu Ala Ala Leu Ala Ile Ala Ala Met Ala Ser
20 25 30
Ala Ser Leu Val Thr Val Ala Val Pro Ala Thr Ala Asn Ala Asp Pro
35 40 45
Glu Pro Ala Pro Pro Val Pro Thr Thr Ala Ala Ser Pro Pro Ser Thr
50 55 60
Ala Ala Ala Pro Pro Ala Pro Ala Thr Pro Val Ala Pro Pro Pro Pro
65 70 75 80
Ala Ala Ala Asn Thr Pro Asn Ala Gin Pro Gly Asp Pro Asn Ala Ala
85 90 95
Pro Pro Pro Ala Asp Pro Asn Ala Pro Pro Pro Pro Val Ile Ala Pro
100 105 110
Asn Ala Pro Gin Pro Val Arg Ile Asp Asn Pro Val Gly Gly Phe Ser
115 120 125
Phe Ala Leu Pro Ala Gly Trp Val Glu Ser Asp Ala Ala His Phe Asp
130 135 140
Tyr Gly Ser Ala Leu Leu Ser Lys Thr Thr Gly Asp Pro Pro Phe Pro
104 ·· ·· • 0 • 0 • 0 0 0 0 0 0 · 0 0 0 0 0* 0 0 0 0 0 0 00 0 0 0 00 0 0 00 0 0 0 0 0 00 0 0 0
• 0 • 0 • · • 0 • · • ·» 0 • 0 • 0 0 0
145 150 155 160
Gly Gin Pro Pro Pro Val Ala Asn Asp Thr Arg Ile Val Leu Gly Arg
165 170 175
Leu Asp Gin Lys Leu Tyr Ala Ser Ala Glu Ala Thr Asp Ser Lys Ala
180 185 190
Ala Ala Arg Leu Gly Ser Asp Met Gly Glu Phe Tyr Met Pro Tyr Pro
195 200 205
Gly Thr Arg Ile Asn Gin Glu Thr Val Ser Leu Asp Ala Asn Gly Val
210 215 220
Ser Gly Ser Ala Ser Tyr Tyr Glu Val Lys Phe Ser Asp Pro Ser Lys
225 230 235 240
Pro Asn Gly Gin Ile Trp Thr Gly Val Ile Gly Ser Pro Ala Ala Asn
245 250 255
Ala Pro Asp Ala Gly Pro Pro Gin Arg Trp Phe Val Val Trp Leu Gly
260 265 270
Thr Ala Asn Asn Pro Val Asp Lys Gly Ala Ala Lys Ala Leu Ala Glu
275 280 285
Ser Ile Arg Pro Leu Val Ala Pro Pro Pro Ala Pro Ala Pro Ala Pro
290 295 300
Ala Glu Pro Ala Pro Ala Pro Ala Pro Ala Gly Glu Val Ala Pro Thr
305 310 315 320
Pro Thr Thr Pro Thr Pro Gin Arg Thr Leu Pro Ala
325 330
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 54:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 20 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 54:
Asp Pro Val Asp Ala Val Ile Asn Thr Thr Xaa Asn Tyr Gly Gin Val 1 5 10 15
Val Ala Ala Leu 20
99
105 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 55:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 15 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 55:
Ala Val Glu Ser Gly Met Leu Ala Leu Gly Thr Pro Ala Pro Ser η 5 10 15 (2)
Informace (i:
(xi) o sekvenci SEQ ID NO: 56: CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 19 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 56:
Ala Ala Met Lys Pro Arg Thr Gly Asp Gly Pro Leu Glu Ala Ala Lys ! 5 10 15
Glu Gly Arg (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 57:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 15 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 57:
Tvr Tyr Trp Cys Pro Gly Gin Pro Phe Asp Pro Ala Trp Gly Pro 1 5 10 15 ·· fr « ·* «· • * • · ·· • 9· · ·1
106 (2) Informace ο sekvenci SEQ ID NO: 58:
(i) CHARAKTERIŠTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 14 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 58:
Asp Ile Gly Ser Glu Ser Thr Glu Asp Gin Gin Xaa Ala Val 1 5 10 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 59:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 13 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 59:
Ala Glu Glu Ser Ile Ser Thr Xaa Glu Xaa Ile Val Pro 15 10 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 60:
(i) CHARAKTERIŠTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 17 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 60:
Asp Pro Glu Pro Ala Pro Pro Vál Pro Thr Ala Ala Ala Ala Pro Pro 1 5 10 15
Ala *· «· ·* ·« ·· • to · · toto* to·· ««· · · · ·» · ·· • 99 9 9 9 9 9
9999 99 9 9 99 99
Λ
107 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 61:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 15 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 61:
Ala Pro Lys Thr Tyr Xaa Glu Glu Leu Lys Gly Thr Asp Thr Gly 1 5 10 I5 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 62:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 30 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 62:
Asp Pro Ala Ser Ala Pro Asp Val Pro Thr Ala Ala Gin Gin Thr Ser
1 5 10 15 .
Leu Leu Asn Asn Leu Ala Asp Pro Asp Val Ser Phe Ala Asp
20 25 30
(2) Informace 0 sekvenci SEQ ID NO: 63:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 24 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi! POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 63:
Gly Cys Gly Asp Arg Ser Gly Gly Asn Leu Asp Gin lle Arg Leu Arg 15 10 15
Arg Asp Arg Ser Gly Gly Asn Leu 20 ·· »9 • · · · • ·· • · · • · · ·*·· ·« ·· ·· ·· ·· • · · · · · · • · ··· · · · 9 • · · · · ··· ··· • · · · · · ·» ·· ·· ··
108 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 64:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 187 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 64:
Thr Gly 1 Ser Leu Asn 5 Gin Thr His Asn Arg Arg Ala Asn Glu Arg Lys
10 15
Asn Thr Thr Met Lys Met Val Lys Ser lle Ala Ala Gly Leu Thr Ala
20 25 30
Ala Ala Ala lle Gly Ala Ala Ala Ala Gly Val Thr Ser lle Met Ala
35 40 45
Gly Gly Pro Val Val Tyr Gin Met Gin Pro Val Val Phe Gly Ala Pro
50 55 60
Leu Pro Leu Asp Pro Ala Ser Ala Pro Asp Val Pro Thr Ala Ala Gin
65 70 75 80
Leu Thr Ser Leu Leu Asn Ser Leu Ala Asp Pro Asn Val Ser Phe Ala
85 90 95
Asn Lys Gly Ser Leu Val Glu Gly Gly lle Gly Gly Thr Glu Ala Arg
100 105 110
lle Ala Asp His Lys Leu Lys Lys Ala Ala Glu His Gly Asp Leu Pro
115 120 125
Leu Ser Phe Ser Val Thr Asn lle Gin Pro Ala Ala Ala Gly Ser Ala
130 135 140
Thr Ala Asp Val Ser Val Ser Gly Pro Lys Leu Ser Ser Pro Val Thr
145 150 155 160
Gin Asn Val Thr Phe Val Asn Gin Gly Gly Trp Met Leu Ser Arg Ala
165 170 175
Ser Ala Met Glu Leu Leu Gin Ala Ala Gly Xaa
180 185 • · • · · · • · ······· · · • · · · ·· · · · · ·· ··
109 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 65:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 148 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 65:
Asp Glu 1 Val Thr Val Glu Thr Thr Ser Val Phe Arg Ala Asp Phe 15 Leu
5 10
Ser Glu Leu Asp Ala Pro Ala Gin Ala Gly Thr Glu Ser Ala Val Ser
20 25 30
Gly Val Glu Gly Leu Pro Pro Gly Ser Ala Leu Leu Val Val Lys Arg
35 40 45
Gly Pro Asn Ala Gly Ser Arg Phe Leu Leu Asp Gin Ala Ile Thr Ser
50 55 60
Ala Gly Arg His Pro Asp Ser Asp Ile Phe Leu Asp Asp Val Thr Val
65 70 75 80
Ser Arg Arg His Ala Glu Phe Arg Leu Glu Asn Asn Glu Phe Asn Val
85 90 95
Val Asp Val Gly Ser Leu Asn Gly Thr Tyr Val Asn Arg Glu Pro Val
100 105 110
Asp Ser Ala Val Leu Ala Asn Gly Asp Glu Val Gin Ile Gly Lys Leu
115 120 125
Arg Leu Val Phe Leu Thr Gly Pro Lys Gin Gly Glu Asp Asp Gly Ser
130 135 140
Thr Gly Gly Pro 145 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 66:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 230 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 66:
Thr Ser Asn Arg Pro Ala Arg Arg Gly Arg Arg Ala Pro Arg Asp Thr 15 10 15 • ·
110
Gly Pro Asp Arg Ser Ala Ser Leu Ser Leu Val Arg His Arg Arg Gin 20 25 30
Gin Arg Asp Ala Leu Cys Leu Ser Ser Thr Gin lle Ser Arg Gin Ser 35 40 45
Asn Leu Pro Pro Ala Ala Gly Gly Ala Ala Asn Tyr Ser Arg Arg Asn 50 55 60
100
115
130
145
180
195
210
165
Lys lle Phe Met Leu Val Thr Ala Val Val Leu
70 75 80
Val Ala Thr Ala Ala Pro Lys Thr Tyr Cys Glu
90 95
Asp Thr Gly Gin Ala Cys Gin lle Gin Met Ser
105 110
lle Asn lle Ser Leu Pro Ser Tyr Tyr Pro Asp
120 125
Asn Tyr lle Ala Gin Thr Arg Asp Lys Phe Leu
135 140
Ser Thr Pro Arg Glu Ala Pro Tyr Glu Leu Asn
150 155 160
Tyr Gin Ser Ala lle Pro Pro Arg Gly Thr Gin
170 175
Val Tyr His Asn Ala Gly Gly Thr His Pro Thr
185 190
Phe Asp Trp Asp Gin Ala Tyr Arg Lys Pro lle
200 205
Trp Gin Ala Asp Thr Asp Pro Leu Pro Val Val
215
220
Phe Pro lle Val Ala Arg 225 230 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 67:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 132 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 67:
• ·
111
Thr 1 Ala Ala Ser Asp Asn Phe Gin Leu Ser Gin Gly Gly Gin Gly Phe
5 10 15
Ala Ile Pro Ile Gly Gin Ala Met Ala Ile Ala Gly Gin Ile Arg Ser
20 25 30
Gly Gly Gly Ser Pro Thr Val His Ile Gly Pro Thr Ala Phe Leu Gly
35 40 45
Leu Gly Val Val Asp Asn Asn Gly Asn Gly Ala Arg Val Gin Arg Val
50 55 60
Val Gly Ser Ala Pro Ala Ala Ser Leu Gly Ile Ser Thr Gly Asp Val
65 70 75 80
Ile Thr Ala Val Asp Gly Ala Pro Ile Asn Ser Ala Thr Ala Met Ala
85 90 95
Asp Ala Leu Asn Gly His His Pro Gly Asp Val Ile Ser Val Asn Trp
100 105 110
Gin Thr Lys Ser Gly Gly Thr Arg Thr Gly Asn Val Thr Leu Ala Glu
115 120 - 125
Gly Pro Pro Ala -
130 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 68:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 100 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 68:
Val Pro Leu Arg Ser Pro Ser Met Ser Pro Ser Lys Cys Leu Ala Ala
1 5 10 15
Ala Gin Arg Asn Pro Val Ile Arg Arg Arg Arg Leu Ser Asn Pro Pro
20 25 30
Pro Arg Lys Tyr Arg Ser Met Pro Ser Pro Ala Thr Ala Ser Ala Gly
40 45
Met Ala Arg Val Arg Arg Arg Ala Ile Trp Arg Gly Pro Ala Thr Xaa 50 55 60 ··· ···· · • · · · ·· ·· ·· · · ·«
112
Ser Ala Gly Met Ala Arg Val Arg Arg Trp Xaa Val 75 Met Pro Xaa Val 80
65 70
Ile Gin Ser Thr Xaa Ile Arg Xaa Xaa Gly Pro Phe Asp Asn Arg Gly
85 90 95
Ser Glu Arg Lys
100 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 69:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 163 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 69:
Met 1 Thr Asp Asp Ile 5 Leu Leu Ile Asp Thr 10 Asp Glu Arg Val Arg 15 Thr
Leu' Thr Leu Asn 20 Arg Pro Gin Ser Arg 25 Asn Ala Leu Ser Ala 30 Ala Leu
Arg Asp Arg 35 Phe Phe Ala Xaa Leu 40 Xaa Asp Ala Glu Xaa 45 Asp Asp Asp
Ile Asp 50 Val Val Ile Leu Thr 55 Gly Ala Asp Pro Val 60 Phe Cys Ala Gly
Leu 65 Asp Leu Lys Val Ala 70 Gly Arg Ala Asp Arg 75 Ala Ala Gly His Leu 80
Thr Ala Val Gly Gly 85 His Asp Gin Ala Gly 90 Asp Arg Arg Asp Gin 95 Arg
Arg Arg Gly His 100 Arg Arg Ala Arg Thr 105 Gly Ala Val Leu Arg 110 His Pro
Asp Arg Leu 115 Arg Ala Arg Pro Leu 120 Arg Arg His Pro Arg 125 Pro Gly Gly
Ala Ala 130 Ala His Leu Gly Thr 135 Gin Cys Val Leu Ala 140 Ala Lys Gly Arg
His Arg Xaa Gly Pro Val Asp Glu Pro Asp Arg Arg Leu Pro Val Arg
145 150 155 160
Asp Arg Arg • · · • · · · • · · · · · · ···· ·· ·· · · ··
113 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 70:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 344 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 70:
Met 1 Lys Phe Val Asn His 5 lle Glu Pro Val Ala 10 Pro Arg Arg Ala 15
Gly Ala Val Ala Glu Val Tyr Ala Glu Ala Arg Arg Glu Phe Gly
20 25 30
Leu Pro Glu Pro Leu Ala Met Leu Ser Pro Asp Glu Gly Leu Leu
35 40 45
Ala Gly Trp Ala Thr Leu Arg Glu Thr Leu Leu Val Gly Gin Val
50 55 60
Arg Gly Arg Lys Glu Ala Val Ala Ala Ala Val Ala Ala Ser Leu
65 70 75
Cys Pro Trp Cys Val Asp Ala His Thr Thr Met Leu Tyr Ala Ala
85 90 95
Gin Thr Asp Thr Ala Ala Ala lle Leu Ala Gly Thr Ala Pro Ala
100 105 110
Gly Asp Pro Asn Ala Pro Tyr Val Ala Trp Ala Ala Gly Thr Gly
115 120 125
Pro Ala Gly Pro Pro Ala Pro Phe Gly Pro Asp Val Ala Ala Glu
130 135 140
Leu Gly Thr Ala Val Gin Phe His Phe lle Ala Arg Leu Val Leu
145 150 155
Leu Leu Asp Glu Thr Phe Leu Pro Gly Gly Pro Arg Ala Gin Gin
165 170 175
Met Arg Arg Ala Gly Gly Leu Val Phe Ala Arg Lys Val Arg Ala
130 185 190
His Arg Pro Gly Arg Ser Thr Arg Arg Leu Glu Pro Arg Thr Leu
195 200 205
Asp Asp Leu Ala Trp Ala Thr Pro Ser Glu Pro lle Ala Thr Ala
Gly
Arg
Thr
Pro
Arg
Gly
Ala
Thr
Tyr
Val
160
Leu
Glu
Pro
Phe • · · · ···· · ·· · • · ··· ·· ·· · · · · · · ··«···· · · ···· · · ·· ·· · · ··
114
210 215 220
Ala Ala Leu Ser His His Leu Asp Thr Ala Pro His Leu Pro Pro Pro
225 230 235 240
Thr Arg Gin Val Val Arg Arg Val Val Gly Ser Trp His Gly Glu Pro
245 250 255
Met Pro Met Ser Ser Arg Trp Thr Asn Glu His Thr Ala Glu Leu Pro 260 265 270
Ala Asp Leu His Ala Pro Thr Arg Leu Ala Leu Leu Thr Gly Leu Ala 275 280 285
Pro His Gin Val Thr Asp Asp Asp Val' Ala Ala Ala Arg Ser Leu Leu 290 295 300
Asp Thr Asp Ala Ala Leu Val Gly Ala Leu Ala Trp Ala Ala Phe Thr
305 310 315 320
Ala Ala Arg Arg Ile Gly Thr Trp Ile Gly Ala Ala Ala Glu Gly Gin
325 330 335
Val Ser Arg Gin Asn Pro Thr Gly 340 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 71:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 485 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 71:
Asp 1 Asp Pro Asp Met 5 Pro Gly Thr Val Ala 10 Lys Ala Val Ala Asp 15 Ala
Leu Gly Arg Gly 20 Ile Ala Pro Val Glu 25 Asp Ile Gin Asp Cys 30 Val Glu
Ala Arg Leu 35 Gly Glu Ala Gly Leu 4Ó Asp Asp Val Ala Arg 45 Val Tyr Ile
Ile Tyr 50 Arg Gin Arg Arg Ala 55 Glu Leu Arg Thr Ala 60 Lys Ala Leu Leu
Gly 65 Val Arg Asp Glu Leu 70 Lys Leu Ser Leu Ala 75 Ala Val Thr Val Leu 80
• · • · · ·
115 • · · · · · • · • · • · • ·
Arg Glu Arg Tyr Leu Leu His Asp Glu Gin Gly Arg Pro Ala Glu Ser
85 90 95
Thr Gly Glu Leu Met Asp Arg Ser Ala Arg Cys Val Ala Ala Ala Glu
100 105 110
Asp Gin Tyr Glu Pro Gly Ser Ser Arg Arg Trp Ala Glu Arg Phe Ala
115 120 125
Thr Leu Leu Arg Asn Leu Glu Phe Leu Pro Asn Ser Pro Thr Leu Met
130 135 140
Asn Ser Gly Thr Asp Leu Gly Leu Leu Ala Gly Cys Phe Val Leu Pro
145 150 155 160
lle Glu Asp Ser Leu Gin Ser lle Phe Ala Thr Leu Gly Gin Ala Ala
165 170 175
Glu Leu Gin Arg Ala Gly Gly Gly Thr Gly Tyr Ala Phe Ser His Leu
180 185 190
Arg Pro Ala Gly Asp Arg Val Ala Ser Thr Gly Gly Thr Ala Ser Gly
195 200 205
Pro Val Ser Phe Leu Arg Leu Tyr Asp Ser Ala Ala Gly Val Val Ser
210 215 220
Met Gly Gly Arg Arg Arg Gly Ala Cys Met Ala Val Leu Asp Val Ser
225 230 235 240
His Pro Asp lle Cys Asp Phe Val Thr Ala Lys Ala Glu Ser Pro Ser
245 250 255
Glu Leu Pro His Phe Asn Leu Ser Val Gly Val Thr Asp Ala Phe Leu
260 '265 270
Arg Ala Val Glu Arg Asn Gly Leu His Arg Leu Val Asn Pro Arg Thr
275 280 285
Gly Lys lle Val Ala Arg Met Pro Ala Ala Glu Leu Phe Asp Ala lle
290 295 300
Cys Lys Ala Ala His Ala Gly Gly Asp Pro Gly Leu Val Phe Leu Asp
305 310 315 320
Thr lle Asn Arg Ala Asn Pro Val Pro Gly Arg Gly Arg lle Glu Ala
325 330 335
Thr Asn Pro Cys Gly Glu Val Pro Leu Leu Pro Tyr Glu Ser Cys Asn
340 345 350
Leu Gly Ser lle Asn Leu Ala Arg Met Leu Ala Asp Gly Arg Val Asp
355 360 365
Trp Asp Arg Leu Glu Glu Val Ala Gly Val Ala Val Arg Phe Leu Asp • ·· · ···· · ·· · ······· · · ···· ·· ·· ·· ·· ··
116
370 375 380
Asp Val Ile Asp Val Ser Arg Tyr Pro Phe Pro Glu Leu Gly Glu Ala
3Q5 390 395 400
Ala Arg Ala Thr Arg Lys Ile Gly Leu Gly Val Met Gly Leu Ala Glu
405 410 415
Leu Leu Ala Ala Leu Gly Ile Pro Tyr Asp Ser Glu Glu Ala Val Arg 420 425 430
Leu Ala Thr Arg Leu Met Arg Arg Ile Gin Gin Ala Ala His Thr Ala 435 440 445
Ser Arg Arg Leu Ala Glu Glu Arg Gly Ala Phe Pro Ala Phe Thr Asp 450 455 460
Ser Arg Phe Ala Arg Ser Gly Pro Arg Arg Asn Ala Gin Val Thr Ser 465 470 475 480
Val Ala Pro Thr Gly 485 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 72:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 267 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 72:
Gly Val Ile Val Leu Asp Leu Glu Pro Arg Gly Pro Leu Pro Thr Glu
5 10 15
Ile Tyr Trp Arg Arg Arg Gly Leu Ala Leu Gly Ile Ala Val Val Val
25 30
Val Gly Ile Ala Val Ala Ile Val Ile Ala Phe Val Asp Ser Ser Ala 35 40 45
Gly Ala Lys Pro Val Ser Ala Asp Lys Pro Ala Ser Ala Gin Ser His 50 55 60
Pro Gly Ser Pro Ala Pro Gin Ala Pro Gin Pro Ala Gly Gin Thr Glu
70 75 80
Gly Asn Ala Ala Ala Ala Pro Pro Gin Gly Gin Asn Pro Glu Thr Pro
90 95 • ·
• • · · 117 • · · • • · · • • · • · • · • · • · ' · • · • · • • · • · • • ·
Thr Pro Thr Ala Ala Val Gin Pro Pro Pro Val Leu Lys Glu Gly Asp
100 105 110
Asp Cys Pro Asp Ser Thr Leu Ala Val Lys Gly Leu Thr Asn Ala Pro
115 120 125
Gin Tyr Tyr Val Gly Asp Gin Pro Lys Phe Thr Met Val Val Thr Asn
130 135 140
Ile Gly Leu Val Ser Cys Lys Arg Asp Val Gly Ala Ala Val Leu Ala
145 150 155 160
Ala Tyr Val Tyr Ser Leu Asp Asn Lys Arg Leu Trp Ser Asn Leu Asp
165 170 175
Cys Ala Pro Ser Asn Glu Thr Leu Val Lys Thr Phe Ser Pro Gly Glu
180 185 190
Gin Val Thr Thr Ala Val Thr Trp Thr Gly Met Gly Ser Ala Pro Arg
195 200 205
Cys Pro Leu Pro Arg Pro Ala Ile Gly Pro Gly Thr Tyr Asn Leu Val
210 215 220
Val Gin Leu Gly Asn Leu Arg Ser Leu Pro Val Pro Phe Ile Leu Asn
225 230 235 240
Gin Pro Pro Pro Pro Pro Gly Pro Val Pro Ala· Pro Gly Pro Ala Gin
245 250 255
Ala Pro Pro Pro Glu Ser Pro Ala Gin Gly Gly
260 265 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 73:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 97 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 73:
Leu Ile Ser Thr Gly Lys Ala Sér His Ala Ser Leu Gly Val Gin Val
1 5 10 15
Thr Asn Asp Lys Asp Thr Pro Gly Ala Lys Ile Val Glu Val Val Ala
20 25 30
Gly Gly Ala Ala Ala Asn Ala Gly Val Pro Lys Gly Val Val Val Thr
35 40 45
·····*· · · ···· ·· ·· ·· ·· ··
118
Lys Val 50 Asp Asp Arg Pro Ile 55 Asn Ser Ala Asp Ala 60 Leu Val Ala Ala
Val 65 Arg Ser Lys Ala Pro 70 Gly Ala Thr Val Ala 75 Leu Thr Phe Gin Asp 80
Pro Ser Gly Gly Ser 85 Arg Thr Val Gin Val 90 Thr Leu Gly Lys Ala 95 Glu
Gin (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 74:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 364 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 74:
Gly Ala Ala Val Ser Leu Leu Ala Ala Gly Thr Leu Val Leu Thr Ala
5 10 15
Cys Gly Gly Gly Thr Asn Ser Ser Ser Ser Gly Ala Gly Gly Thr Ser
25 30
Gly Ser Val His Cys Gly Gly Lys Lys Glu Leu His Ser Ser Gly Ser 35 40 45
Thr Ala Gin Glu Asn Ala Met Glu Gin Phe Val Tyr Ala Tyr Val Arg 50 55 60
Ser Cys Pro Gly Tyr Thr Leu Asp Tyr Asn Ala Asn Gly Ser Gly Ala
70 75 80
Gly Val Thr Gin Phe Leu Asn Asn Glu Thr Asp Phe Ala Gly Ser Asp
90 95
Val Pro Leu Asn Pro Ser Thr Gly Gin Pro Asp Arg Ser Ala Glu Arg 100 105 HO
Cys Gly Ser Pro Ala Trp Asp Leu Pro Thr Val Phe Gly Pro Ile Ala 115 120 125
Ile Thr Tyr Asn Ile Lys Gly Val Ser Thr Leu Asn Leu Asp Gly Pro 130 135 140
Thr Thr Ala Lys Ile Phe Asn Gly Thr Ile Thr Val Trp Asn Asp Pro
WO 98/16645 119 • · • · « • ' · · · • · • · • · PCT/USa7yi8214
145 150 155 160
Gin lle Gin Ala Leu Asn Ser Gly Thr Asp Leu Pro Pro Thr Pro lle
165 170 175
Ser Val lle Phe Arg Ser Asp Lys Ser Gly Thr Ser Asp Asn Phe Gin
180 185 190
Lys Tyr Leu Asp Gly Val Ser Asn Gly Ala Trp Gly Lys Gly Ala Ser
195 200 205
Glu Thr Phe Ser Gly Gly Val Gly Val Gly Ala Ser Gly Asn Asn Gly
210 215 220
Thr Ser Ala Leu Leu Gin Thr Thr Asp Gly Ser lle Thr Tyr Asn Glu
225 230 235 240
Trp Ser Phe Ala Val Gly Lys Gin Leu Asn Met Ala Gin lle lle Thr
245 250 255
Ser Ala Gly Pro Asp Pro Val Ala lle Thr Thr Glu Ser Val Gly Lys
260 265 270
Thr lle Ala Gly Ala Lys lle Met Gly Gin Gly Asn Asp Leu Val Leu
275 280 285
Asp Thr Ser Ser Phe Tyr Arg Pro Thr Gin Pro Gly Ser Tyr Pro lle
290 295 300
Val Leu Ala Thr Tyr Glu lle Val Cys Ser Lys Tyr Pro Asp Ala Thr
305 310 315 • 320
Thr Gly Thr Ala Val Arg Ala Phe Met Gin Ala Ala lle Gly Pro Gly
325 330 335
Gin Glu Gly Leu Asp Gin Tyr Gly Ser Tle Pro Leu Pro Lys Ser Phe
340 345 350
Gin Ala Lys Leu Ala Ala Ala Val Asn Ala lle Ser
355 360
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 75:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 309 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (Xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 75:
• · ···*··· · · ···· ·· ·· ·· ·· ··
120
Gin 1 Ala Ala Ala Gly 5 Arg Ala Val Arg Arg Thr Gly His Ala Glu Asp
10 15
Gin Thr His Gin Asp Arg Leu His His Gly Cys Arg Arg Ala Ala Val
20 25 30
Val Val Arg Gin Asp Arg Ala Ser Val Ser Ala Thr Ser Ala Arg Pro
35 40 45
Pro Arg Arg His Pro Ala Gin Gly His Arg Arg Arg Val Ala Pro Ser
50 55 60
Gly Gly Arg Arg Arg Pro His Pro His His Val Gin Pro Asp Asp Arg
65 70 75 80
Arg Asp Arg Pro Ala Leu Leu Asp Arg Thr Gin Pro Ala Glu His Pro
85 90 95
Asp Pro His Arg Arg Gly Pro Ala Asp Pro Gly Arg Val Arg Gly Arg
100 105 110
Gly Arg Leu Arg Arg Val Asp Asp Gly Arg Leu Gin Pro Asp Arg Asp
115 120 125
Ala Asp His Gly Ala Pro Val Arg Gly Arg Gly Pro His Arg Gly Val
130 135 140
Gin His Arg Gly Gly Pro Val Phe Val Arg Arg Val Pro Gly Val Arg
145 150 155 160
Cys Ala His Arg Arg Gly His Arg Arg Val Ala Ala Pro Gly Gin Gly
165 170 175
Asp Val Leu Arg Ala Gly Leu Arg Val Glu Arg Leu Arg Pro Val Ala
180 185 190
Ala Val Glu Asn Leu His Arg Gly Ser Gin Arg Ala Asp Gly Arg Val
195 200 205
Phe Arg Pro Ile Arg Arg Gly Ala Arg Leu Pro Ala Arg Arg Ser Arg
210 215 220
Ala Gly Pro Gin Gly Arg Leu His Leu Asp Gly Ala Gly Pro Ser Pro
225 230 235 240
Leu Pro Ala Arg Ala Gly Gin Gin Gin Pro Ser Ser Ala Gly Gly Arg
245 250 255
Arg Ala Gly Gly Ala Glu Arg Ala Asp Pro Gly Gin Arg Gly Arg His
260 265 270
His Gin Gly Gly His Asp Pro Gly Arg Gin Gly Ala Gin Arg Gly Thr
275 280 285
Ala Gly Val Ala His Ala Ala Ala Gly Pro Arg Arg Ala Ala Val Arg • · • · · · • ·
290
295
121
300
Asn Arg Pro Arg Arg 305 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 76:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 580 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 76:
Ser Ala Val Trp Cys Leu Asn Gly Phe Thr Gly Arg His Arg His Gly
1 5 10 15
Arg Cys Arg Val Arg Ala Ser Gly Trp Arg Ser Ser Asn Arg Trp Cys
20 25 30
Ser Thr Thr Ala Asp Cys Cys Ala Ser Lys Thr Pro Thr Gin Ala Ala
35 40 45
Ser Pro Leu Glu Arg Arg Phe Thr Cys Cys Ser Pro Ala Val Gly Cys
50 55 60
Arg Phe Arg Ser Phe Pro Val Arg Arg Leu Ala Leu Gly Ala Arg Thr
65 70 75 80
Ser Arg Thr Leu Gly Val Arg Arg Thr Leu Ser Gin Trp Asn Leu Ser
85 90 95
Pro Arg Ala Gin Pro Ser Cys Ala Val Thr Val Glu Ser His Thr His
100 105 110
Ala Ser Pro Arg Met Ala Lys Leu Ala Arg Val Val Gly Leu Val Gin
115 120 125
Glu Glu Gin Pro Ser Asp Met Thr Asn His Pro Arg Tyr Ser Pro Pro
130 135 140
Pro Gin Gin Pro Gly Thr Pro Gly Tyr Ala Gin Gly Gin Gin Gin Thr
145 150 155 160
Tyr Ser Gin Gin Phe Asp Trp Arg Tyr Pro Pro Ser Pro Pro Pro Gin
165 170 175
Pro Thr Gin Tyr Arg Gin Pro Tyr Glu Ala Leu Gly Gly Thr Arg Pro
180 185 190
·····«· · · ···· ·· ·· «· ·· ··
122
Gly Leu Ile 195 Pro Gly Val Ile Pro Thr Met 200 Thr Pro Pro 205 Pro Gly Met
Val Arg Gin Arg Pro Arg Ala Gly Met Leu Ala Ile Gly Ala Val Thr
210 215 220
lle Ala Val Val Ser Ala Gly Ile Gly Gly Ala Ala Ala Ser Leu Val
225 230 235 240
Gly Phe Asn Arg Ala Pro Ala Gly Pro Ser Gly Gly Pro Val Ala Ala
245 250 255
Ser Ala Ala Pro Ser Ile Pro Ala Ala Asn Met Pro Pro Gly Ser Val
260 265 270
Glu Gin Val Ala Ala Lys Val Val Pro Ser Val Val Met Leu Glu Thr
275 280 285
Asp Leu Gly Arg Gin Ser Glu Glu Gly Ser Gly Ile Ile Leu Ser Ala
290 295 300
Glu Gly Leu Ile Leu Thr Asn Asn His Val Ile Ala Ala Ala Al a Lys
305 310 315 320
Pro Pro Leu Gly Ser Pro Pro Pro Lys Thr Thr Val Thr Phe Ser Asp
325 330 335
Gly Arg Thr Ala Pro Phe Thr Val Val Gly Ala Asp Pro Thr Ser Asp
340 345 350
lle Ala Val Val Arg Val Gin Gly Val Ser Gly Leu Thr Pro Ile Ser
355 360 365
Leu Gly Ser Ser Ser Asp Leu Arg Val Gly Gin Pro Val Leu Ala Ile
370 375 380
Gly Ser Pro Leu Gly Leu Glu Gly Thr Val Thr Thr Gly Ile Val Ser
385 390 395 400
Ala Leu Asn Arg Pro Val Ser Thr Thr Gly Glu Ala Gly Asn Gin Asn
405 410 415
Thr Val Leu Asp Ala Ile Gin Thr Asp Ala Ala Ile Asn Pro Gly Asn
420 425 430
Ser Gly Gly Ala Leu Val Asn Met Asn Ala Gin Leu Val Gly Val Asn
435 4.40 445
Ser Ala Ile Ala Thr Leu Gly Ala Asp Ser Ala Asp Ala Gin Ser Gly
450 455 460
Ser Ile Gly Leu Gly Phe Ala Ile Pro Val Asp Gin Ala Lys Arg Ile
4 65 4 70 475 480
Ala Asp Glu Leu lle Ser Thr Gly Lys Ala Ser His Ala Ser Leu Gly » · • 4 • 4 4«
I · 4 » · · 4 · ► 4 4 a » <4 «
444 444
123
485 490 495
Val Gin Val Thr 500 Asn Asp Lys Asp Thr 505 Pro Gly Ala Lys lle 510 Val Glu
Val Val Ala 515 Gly Gly Ala Ala Ala 520 Asn Ala Gly Val Pro 525 Lys Gly Val
Val Val 530 Thr Lys Val Asp Asp 535 Arg Pro lle Asn Ser 540 Ala Asp Ala Leu
Val 545 Ala Ala Val Arg Ser 550 Lys Ala Pro Gly Ala 555 Thr Val Ala Leu Thr 560
Phe Gin Asp Pro Ser Gly Gly Ser Arg Thr Val Gin Val Thr Leu Gly
565 570 575
Lys Ala Glu Gin 580 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 77:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 233 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 77:
Met 1 Asn Asp Gly Lys 5 Arg Ala Val Thr Ser 10 Ala Val Leu Val Val 15 Leu
Gly Ala Cys Leu 20 Ala Leu Trp Leu Ser 25 Gly Cys Ser Ser Pro 30 Lys Pro
Asp Ala Glu 35 Glu Gin Gly Val Pro 40 Val Ser Pro Thr Ala 45 Ser Asp Pro
Ala Leu 50 Leu Ala Glu lle Arg 55 Gin Ser Leu Asp Ala 60 Thr Lys Gly Leu
Thr 65 Ser Val His Val Ala 70 Val Arg Thr Thr Gly 75 Lys Val Asp Ser Leu 80
Leu Gly lle Thr Ser 85 Ala Asp Val Asp Val 90 Arg Ala Asn Pro Leu 95 Ala
Ala Lys Gly Val 100 Cys Thr Tyr Asn Asp 105 Glu Gin Gly Val Pro 110 Phe Arg
·· ·· «« • · · » « · · • «« · · « • · ·· ·» • · « · * 9 « · • · · 9 9 9 9
999 9 9 9 99 99
124
Val Gin Gly Asp Asn lle Ser Val Lys Leu Phe Asp Asp 125 Trp Ser Asn
115 120
Leu Gly Ser lle Ser Glu Leu Ser Thr Ser Arg Val Leu Asp Pro Ala
130 135 140
Ala Gly Val Thr Gin Leu Leu Ser Gly Val Thr Asn Leu Gin Ala Gin
145 150 155 160
Gly Thr Glu Val lle Asp Gly lle Ser Thr Thr Lys lle Thr Gly Thr
165 170 175
lle Pro Ala Ser Ser Val Lys Met Leu Asp Pro Gly Ala Lys Ser Ala
180 185 190
Arg Pro Ala Thr Val Trp lle Ala Gin Asp Gly Ser His His Leu Val
195 200 205
Arg Ala Ser lle Asp Leu Gly Ser Gly Ser lle Gin Leu Thr Gin Ser
210 215 220
Lys Trp Asn Glu Pro Val Asn Val Asp
225 230
Informace o sekvenci SEQ ID NO: 78:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 66 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 78:
Val 1 lle Asp lle lle 5 Gly Thr Ser Pro Thr 10 Ser Trp Glu Gin Ala 15 Ala
Ala Glu Ala Val 20 Gin Arg Ala Arg Asp 25 Ser Val Asp Asp lle 30 Arg Val
Ala Arg Val 35 lle Glu Gin Asp Met 40 Ala Val Asp Ser Ala 45 Gly Lys lle
Thr Tyr Arg lle Lys Leu Glu Val Ser Phe Lys Met Arg Pro Ala Gin
55 60
Pro Arg 65 ·· ·« • · · * • ·· • · · • · * ···· ·· ·* • · · • · ··· • · · » • · · · ·· *· ·· • · • · • ··· ♦ · ··
S • · ··· • t
125 (2)
Informace o sekvenci SEQ ID NO: 79:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 69 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 79:
Val 1 Pro Pro Ala Pro 5 Pro Leu Pro Pro Leu 10 Pro Pro Ser Pro Ile 15 Ser
Cys Ala Ser Pro 20 Pro Ser Pro Pro Leu 25 Pro Pro Ala Pro Pro 30 Val Ala
Pro Gly Pro Pro 35 Met Pro Pro Leu 40 Asp Pro Trp Pro Pro 45 Ala Pro Pro
Leu Pro 50 Tyr Ser Thr Pro Pro 55 Gly Ala Pro Leu Pro 60 Pro Ser Pro Pro
Ser Pro Pro Leu Pro
65
2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 80:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 355 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 80:
Met 1 Ser Asn Ser Arg 5 Arg Arg Ser Leu Arg 10 Trp Ser Trp Leu Leu 15 Ser
Val Leu Ala Ala 20 Val Gly Leu Gly Leu 25 Ala Thr Ala Pro Ala 30 Gin Ala
Ala Pro Pro 35 Ala Leu Ser Gin Ašp 40 Arg Phe Ala Asp Phe 45 Pro Ala Leu
Pro Leu Asp Pro Ser Ala Met Val Ala Gin Val Ala Pro Gin Val Val
55 60
Asn Ile Asn Thr Lys Leu Gly Tyr Asn Asn Ala Val Gly Ala Gly Thr 65 70 75 80
126
Gly Ile Val Ile Asp 85
Ile Ala Gly Ala Thr 100
Thr Tyr Gly Val Asp 115
Val Leu Gin Leu Arg 130
Gly Gly Val Ala Val 145
Gly Gin Gly Gly Thr 165
Gly Gin Thr Val Gin 180
Leu Asn Gly Leu Ile 195
Gly Gly Pro Val Val 210
Ala Ala Ser Asp Asn 225
Ile Pro Ile Gly Gin 245
Gly Gly Ser Pro Thr 260
Gly Val Val Asp Asn 275
Gly Ser Ala Pro Ala 290
Thr Ala Val Asp Gly 305
Ala Leu Asn Gly His 325
Thr Lys Ser Gly Gly 340
Pro Asn Gly Val Val 90
Asp Ile Asn Ala Phe 105
Val Val Gly Tyr Asp 120
Gly Ala Gly Gly Leu 135
Gly Glu Pro Val Val 150
Pro Arg Ala Val Pro 170
Ala Ser Asp Ser Leu 185
Gin Phe Asp Ala Ala
200
Asn Gly Leu Gly Gin 215
Phe Gin Leu Ser Gin 230
Ala Met Ala Ile Ala 250
Val His Ile Gly Pro 265
Asn Gly Asn Gly Ala 280
Ala Ser Leu Gly Ile 295
Ala Pro Ile Asn Ser 310
His Pro Gly Asp Val 330
Thr Arg Thr Gly Asn 345
Leu Thr Asn Asn His Val 95
Ser Val Gly Ser Gly Gin 110
Arg Thr Gin Asp Val Ala 125
Pro Ser Ala Ala Ile Gly 140
Ala Met Gly Asn Ser Gly 155 160
Gly Arg Val Val Ala Leu 175
Thr Gly Ala Glu Glu Thr 190
Ile Gin Pro Gly Asp Ser
205
Val Val Gly Met Asn Thr 220
Gly Gly Gin Gly Phe Ala 235 240
Gly Gin Ile Arg Ser Gly 255
Thr Ala Phe Leu Gly Leu 270
Arg Val Gin Arg Val Val 285
Ser Thr Gly Asp Val Ile 300
Ala Thr Ala Met Ala Asp 315 320
Ile Ser Val Asn Trp Gin 335
Val Thr Leu Ala Glu Gly 350
Pro Pro Ala 355 • · • · ··· ···· · ···· ·· · 9 ·· ·· · ·
127 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 81:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 205 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 81:
Ser 1 Pro Lys Pro Asp Ala Glu Glu Gin Gly Val Pro Val Ser Pro 15 Thr
5 10
Ala Ser Asp Pro Ala Leu Leu Ala Glu Ile Arg Gin Ser Leu Asp Ala
20 25 30
Thr Lys Gly Leu Thr Ser Val His Val Ala Val Arg Thr Thr Gly Lys
35 40 45
Val Asp Ser Leu Leu Gly Ile Thr Ser Ala Asp Val Asp Val Arg Ala
50 55 60
Asn Pro Leu Ala Ala Lys Gly Val Cys Thr Tyr Asn Asp Glu Gin Gly
65 70 75' 80
Val Pro Phe Arg Val Gin Gly Asp Asn Ile Ser Val Lys Leu Phe Asp
85 90 95
Asp Trp Ser Asn Leu Gly Ser Ile Ser Glu Leu Ser Thr Ser Arg Val
100 105 110
Leu Asp Pro Ala Ala Gly Val Thr Gin Leu Leu Ser Gly Val Thr Asn
115 120 125
Leu Gin Ala Gin Gly Thr Glu Val Ile Asp Gly Ile Ser Thr Thr Lys
130 135 140
Ile Thr Gly Thr Ile Pro Ala Ser Ser Val Lys Met Leu Asp Pro Gly
145 150 155 160
Ala Lys Ser Ala Arg Pro Ala Thr Val Trp Ile Ala Gin Asp Gly Ser
165 170 175
His His Leu Val Arg Ala Ser Ile Asp Leu Gly Ser Gly Ser Ile Gin
180 185 190
Leu Thr Gin Ser Lys Trp Asn Glu Pro Val Asn Val Asp 195 200 205 • · · · · ·
128 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 82:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 286 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 82
Gly Asp 1
Leu Gly
His Ala
Val Ala 50
Ser Gly 65
Tyr Ile
Asn Phe
Ala Thr
Ala Met 130
Asp Val 145
Arg Asp
Pro Ala
Pro Val
Arg Pro
210
Gly Phe
Ser Phe
Ala Thr 20
Asp Gly 35
Tyr Asp
Leu Ala
Thr Val
Asp Pro 100
Glu Gin 115
Pro Ala
Ala Ala
Gly Val
Gly Val 180
Ile Ala 195
Trp Val
Ser Asp
Trp Ala 5
Ala Gly
His Ser
Pro Ala
Arg Met 70
Tyr Asn 85
Glu Gly
Arg Thr
Ala Leu
Asp Val 150
Val Ile 165
Pro Tyr
Val Ser
Pro Gly
Thr Arg
Ala Ala
Arg Thr
Leu Leu 40
Phe Ala 55
Cys Gly
Glu Pro
Val Leu
Asn Lys 120
Arg Ala 135
Trp Ser
Glu Thr
Val Thr
Asp Trp
200
Thr Tyr 215
Pro Ala
Asp Gin 10
Thr Leu 25
Leu Asp
Tyr Glu
Glu Asn
Tyr Val 90
Gly Gly 105
Xaa Gin
Ala Gin
Val Thr
Glu Lys 170
Arg Ala 185
Met Arg
Leu Thr
Gly Arg
Met Ala
Thr Gly
Ala Thr
Ile Gly 60
Pro Glu 75
Gin Pro
Ile Tyr
Ile Leu
Met Leu 140
Ser Trp 155
Leu Arg
Leu Glu
Ala Val
Leu Gly 220
Arg Tyr
Arg Gly
Glu Gly 30
Asn Pro 45
Tyr Ile
Asn Ile
Pro Glu
Arg Tyr 110
Ala Ser 125
Ala Ala
Gly Glu
His Pro
Asn Ala 190
Pro Glu 205
Thr Asp
Phe Asn
Phe Val 15
Leu Gin
Ala Val
Xaa Glu
Phe Phe . 80
Pro Glu 95
His Ala
Gly Val
Glu Trp
Leu Asn 160
Asp Arg 175
Arg Gly
Gin Ile
Gly Phe
Thr Asp • ·
129
225 230 235 240
Ala Glu Ser Gin Val 245 Gly Arg Gly Phe Gly 250 Arg Gly Trp Pro Gly 255 Arg
Arg Val Asn Ile 260 Asp Pro Phe Gly Ala 265 Gly Arg Gly Pro Pro 270 Ala Gin
Leu Pro Gly Phe Asp Glu Gly Gly Gly Leu Arg Pro Xaa Lys
275 280 285 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 83:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 173 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 83:
Thr Lys 1 Phe His Ala 5 Leu Met Gin Glu Gin Ile His Asn Glu Phe Thr
10 .15
Ala Ala Gin Gin Tyr Val Ala Ile Ala Val Tyr Phe Asp Ser Glu Asp
20 25 30
Leu Pro Gin Leu Ala Lys His Phe Tyr Ser Gin Ala Val Glu Glu Arg
35 40 45
Asn His Ala Met Met Leu Val Gin His Leu Leu Asp Arg Asp Leu Arg
50 55 60
Val Glu Ile Pro Gly Val Asp Thr Val Arg Asn Gin Phe Asp Arg Pro
65 70 75 80
Arg Glu Ala Leu Ala Leu Ala Leu Asp Gin Glu Arg Thr Val Thr Asp
85 90 95
Gin Val Gly Arg Leu Thr Ala Val Ala Arg Asp Glu Gly Asp Phe Leu
100 105 110
Gly Glu Gin Phe Met Gin Trp Phe Leu Gin Glu Gin Ile Glu Glu Val
115 120 125
Ala Leu Met Ala Thr Leu Val Arg Val Ala Asp Arg Ala Gly Ala Asn
130 135 140
Leu Phe Glu Leu Glu Asn Phe Val Ala Arg Glu Val Asp Val Ala Pro
145 150 155 160
130
Ala Ala Ser Gly Ala Pro His Ala Ala Gly Gly Arg Leu 165 170 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 84:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 107 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 84:
Arg 1 Ala Asp Glu Arg 5 Lys Asn Thr Thr Met 10 Lys Met Val Lys Ser 15 Ile
Ala Ala Gly Leu 20 Thr Ala Ala Ala Ala 25 Ile Gly Ala Ala Ala 30 Ala Gly
Val Thr Ser 35 Ile Met Ala Gly Gly 40 Pro Val Val Tyr Gin 45 Met Gin Pro
Val Val 50 Phe Gly Ala Pro Leu 55 Pro Leu Asp Pro Xaa 60 Ser Ala Pro Xaa
Val 65 Pro Thr Ala Ala Gin 70 Trp Thr Xaa Leu Leu 75 Asn Xaa Leu Xaa Asp 80
Pro Asn Val Ser Phe 85 Xaa Asn Lys Gly Ser 90 Leu Val Glu Gly Gly 95 Ile
Gly Gly Xaa Glu Gly Xaa Xaa Arg Arg Xaa Gin 100 105 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 85:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 125 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 85:
Val Leu Ser Val Pro Val Gly Asp Gly Phe Trp Xaa Arg Val Val Asn 15 10 15
Pro Leu Gly Gin Pro Ile Asp Gly Arg Gly Asp Val Asp Ser Asp Thr • ·
131
25 30
Arg Arg Ala Leu Glu Leu Gin Ala Pro Ser Val Val Xaa Arg Gin Gly
35 40 4 5
Val Lys Glu Pro Leu Xaa Thr Gly lle Lys Ala lle Asp Ala Met Thr
50 55 60
Pro lle Gly Arg Gly Gin Arg Gin Leu lle lle Gly Asp Arg Lys Thr
65 70 75 80
Gly Lys Asn Arg Arg Leu Cys Arg Thr Pro Ser Ser Asn Gin Arg Glu
85 90 95
Glu Leu Gly Val Arg Trp lle Pro Arg Ser Arg Cys Ala Cys Val Tyr
100 105 110
Val Gly His Arg Ala Arg Arg Gly Thr Tyr His Arg Arg
115 120 125
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 86:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 117 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 86:
Cys 1 Asp Ala Val Met 5 Gly Phe Leu
Val Asp Gin Gin 20 Leu Val Thr Arg
Gin Ala Ala 35 Ala Val Pro Val Val 40
Ala Asp 50 Leu Ala Glu lle Lys 55 Ala
Gly 65 Thr Gly Gly Val Gly 70 Met Ala
Gly Val Glu Val Phe 85 Val Thr Ala
Arg Ala Xaa Xaa Phe Asp Asp Xaa
100
Gly Gly Ala Gly Pro Leu Ala Val 10 15
Val Pro Gin Gly Trp Ser Phe Ala 25 30
Phe Leu Thr Ala Trp Tyr Gly Leu 45
Gly Glu Ser Val Leu lle His Ala 60
Ala Val Gin Leu Ala Arg Gin Trp 75 80
Ser Arg Gly Lys Trp Asp Thr Leu 90 95
Pro Tyr Arg Xaa Phe Pro His Xaa
105 110
132
Arg Ser Ser Xaa Gly 115 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 87:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 103 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (Xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 87:
Met 1 Tyr Arg Phe Ala 5 Cys Arg Thr Leu Met 10 Leu Ala Ala Cys lle 15 Leu
Ala Thr Gly Val 20 Ala Gly Leu Gly Val 25 Gly Ala Gin Ser Ala 30 Ala Gin
Thr Ala Pro 35 Val Pro Asp Tyr Tyr 40 Trp Cys Pro Gly Gin 45 Pro Phe Asp
Pro Ala 50 Trp Gly Pro Asn Trp 55 Asp Pro Tyr Thr Cys 60 His Asp Asp Phe
His 65 Arg Asp Ser Asp Gly 70 Pro Asp His Ser Arg 75 Asp Tyr Pro Gly Pro 80
lle Leu Glu Gly Pro 85 Val Leu Asp Asp Pro 90 Gly Ala Ala Pro Pro 95 Pro
Pro Ala Ala Gly Gly Gly Ala 100 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 88:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 88 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 88:
Val Gin Cys Arg Val Trp Leu Glu lle Gin Trp Arg Gly Met Leu Gly 1 5 10 15 • · • ·
133
Ala Asp Gin Ala Arg Ala Gly Gly Pro Ala Arg Ile Trp Arg
20 25 30
Ser Met Ala Ala Met Lys Pro Arg Thr Gly Asp Gly Pro Leu
35 40 45
Thr Lys Glu Gly Arg Gly Ile Val Met Arg Val Pro Leu Glu
50 55 60
Gly Arg Leu Val Val Glu Leu Thr Pro Asp Glu Ala Ala Ala
65 70 75
Asp Glu Leu Lys Gly Val Thr Ser
85
Informace o sekvenci SEQ ID NO: 89:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 95 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 89:
Thr 1 Asp Ala Ala Thr 5 Leu Ala Gin Glu Ala 10 Gly Asn Phe Glu Arg 15 Ile
Ser Gly Asp Leu 20 Lys Thr Gin Ile Asp 25 Gin Val Glu Ser Thr 30 Ala Gly
Ser Leu Gin 35 Gly Gin Trp Arg Gly 40 Ala Ala Gly Thr Ala 45 Ala Gin Ala
Ala Val 50 Val Arg Phe Gin Glu 55 Ala Ala Asn Lys Gin 60 Lys Gin Glu Leu
Asp 65 Glu Ile Ser Thr Asn 70 Ile Arg Gin Ala Gly 75 Val Gin Tyr Ser Arg 80
Ala Asp Glu Glu Gin 85 Gin Gin Ala Leu Ser 90 Ser Gin Met Gly Phe 95
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 90:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 166 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 90:
• · • · • · · · · · · · ···· ·· ·· ·· ··
134
Met Thr Gin Ser Gin Thr Val Thr Val Asp Gin Gin Glu Ile Leu Asn
1 5 10 15
Arg Ala Asn Glu Val Glu Ala Pro Met Ala Asp Pro Pro Thr Asp Val
20 25 30
Pro Ile Thr Pro Cys Glu Leu Thr Xaa Xaa Lys Asn Ala Ala Gin Gin
35 40 45
Xaa Val Leu Ser Ala Asp Asn Met Arg Glu Tyr Leu Ala Ala Gly Ala
50 55 60
Lys Glu Arg Gin Arg Leu Ala Thr Ser Leu Arg Asn Ala Ala Lys Xaa
65 70 75 80
Tyr Gly Glu Val Asp Glu Glu Al a Ala Thr Ala Leu Asp Asn Asp Gly
85 90 95
Glu Gly Thr Val Gin Ala Glu Ser Ala Gly Ala Val Gly Gly Asp Ser
100 105 110
Ser Ala Glu Leu Thr Asp Thr Pro Arg Val Ala Thr Ala Gly Glu Pro
115 120 125
Asn Phe Met Asp Leu Lys Glu Ala Ala Arg Lys Leu Glu Thr Gly Asp
130 135 140
Gin Gly Ala Ser Leu Ala His Xaa Gly Asp Gly Trp Asn Thr Xaa Thr
145 150 155 160
Leu Thr Leu Gin Gly Asp
165 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 91:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 5 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 91:
Arg Ala Glu Arg Met 1 5 • ·
135 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 92:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 263 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 92:
Val 1 Ala Trp Met Ser Val 5 Thr Ala Gly Gin Ala Glu Leu Thr Ala Ala
10 15
Gin Val Arg Val Ala Ala Ala Ala Tyr Glu Thr Ala Tyr Gly Leu Thr
20 25 30
Val Pro Pro Pro Val Ile Ala Glu Asn Arg Ala Glu Leu Met Ile Leu
35 40 45
Ile Ala Thr Asn Leu Leu Gly Gin Asn Thr Pro Ala Ile Ala Val Asn
50 55 60
Glu Ala Glu Tyr Gly Glu Met Trp Ala Gin Asp Ala Ala Ala Met Phe
65 70 75 80
Gly Tyr Ala Ala Ala Thr Ala Thr Ala Thr Ala Thr Leu Leu Pro Phe
85 90 95
Glu Glu Ala Pro Glu Met Thr Ser Ala Gly Gly Leu Leu Glu Gin Ala
100 105 110
Ala Ala Val Glu Glu Ala Ser Asp Thr Ala Ala Ala Asn Gin Leu Met
115 120 125
Asn Asn Val Pro Gin Ala Leu Lys Gin Leu Ala Gin Pro Thr Gin Gly
130 135 140
Thr Thr Pro Ser Ser Lys Leu Gly Gly Leu Trp Lys Thr Val Ser Pro
145 150 155 160
His Arg Ser Pro Ile Ser Asn Met Val Ser Met Ala Asn Asn His Met
165 170 175
Ser Met Thr Asn Ser Gly Val Ser Met Thr Asn Thr Leu Ser Ser Met
180 185 190
Leu Lys Gly Phe Ala Pro Ala Ala Ala Ala Gin Ala Val Gin Thr Ala
195 200 205
Ala Gin Asn Gly Val Arg Ala Met Ser Ser Leu Gly Ser Ser Leu Gly
• · • ·
136
210 215 220
Ser 225 Ser Gly Leu Gly Gly 230 Gly Val Ala Ala Asn 235 Leu Gly Arg Ala Ala 240
Ser Val Arg Tyr Gly 245 His Arg Asp Gly Gly 250 Lys Tyr Ala Xaa Ser 255 Gly
Arg Arg Asn Gly 260 Gly Pro Ala
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 93:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 303 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 93:
Met Thr Tyr Ser Pro Gly Asn Pro Gly Tyr Pro Gin Ala Gin Pro Ala
5 10 15
Gly Ser Tyr Gly Gly Val Thr Pro Ser Phe Ala His Ala Asp Glu Gly
25 30
Ala Ser Lys Leu Pro Met Tyr Leu Asn Ile Ala Val Ala Val Leu Gly 35 40 45
Leu Ala Ala Tyr Phe Ala Ser Phe Gly Pro Met Phe Thr Leu Ser Thr 50 55 60
Glu Leu Gly Gly Gly Asp Gly Ala Val Ser Gly Asp Thr Gly Leu Pro
70 75 80
Val Gly Val Ala Leu Leu Ala Ala Leu Leu Ala Gly Val Val Leu Val
90 95
Pro Lys Ala Lys Ser His Val Thr Val Val Ala Val Leu Gly Val Leu 100 105 110
Gly Val Phe Leu Met Val Ser Ala Thr Phe Asn Lys Pro Ser Ala Tyr 115 120 125
Ser Thr Gly Trp Ala Leu Trp Val Val Leu Ala Phe Ile Val Phe Gin 130 135 140
Ala Val Ala Ala Val Leu Ala Leu Leu Val Glu Thr Gly Ala Ile Thr 145 150 155 160 • 9
99 99 ·9 • · · · · « · ·
9 9 · 9 9 9 9 · • 9 · · · · · 9 • · · · · 9 9 9 9 9 ··
137
Ala Pro Ala Pro Arg 165 Pro Lys Phe Asp Pro Tyr Gly Gin Tyr Gly Arg
170 175
Tyr Gly Gin Tyr Gly Gin Tyr Gly Val Gin Pro Gly Gly Tyr Tyr Gly
180 185 190
Gin Gin Gly Ala Gin Gin Ala Ala Gly Leu Gin Ser Pro Gly Pro Gin
195 200 205
Gin Ser Pro Gin Pro Pro Gly Tyr Gly Ser Gin Tyr Gly Gly Tyr Ser
210 215 220
Ser Ser Pro Ser Gin Ser Gly Ser Gly Tyr Thr Ala Gin Pro Pro Ala
225 230 235 240
Gin Pro Pro Ala Gin Ser Gly Ser Gin Gin Ser His Gin Gly Pro Ser
245 250 255
Thr Pro Pro Thr Gly Phe Pro Ser Phe Ser Pro Pro Pro Pro Val Ser
260 2 65 270
Ala Gly Thr Gly Ser Gin Ala Gly Ser Ala Pro Val Asn Tyr Ser Asn
275 280 285
Pro Ser Gly Gly Glu Gin Ser Ser Sér Pro Gly Gly Ala ' Pro Val
290 295 300 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 94:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 507 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 94:
ATGAAGATGG TGAAATCGAT CGCCGCAGGT CTGACCGCCG CGGCTGCAAT CGGCGCCGCT 60
GCGGCCGGTG TGACTTCGAT CATGGCTGGC GGCCCGGTCG TATACCAGAT GCAGCCGGTC 120
GTCTTCGGCG CGCCACTGCC GTTGGACCCG GCATCCGCCC CTGACGTCCC GACCGCCGCC 180
CAGTTGACCA GCCTGCTCAA CAGCCTCGCC GAŤCCCAACG TGTCGTTTGC GAACAAGGGC 240
AGTCTGGTCG AGGGCGGCAT CGGGGGCACC GAGGCGCGCA TCGCCGACCA CAAGCTGAAG 300
AAGGCCGCCG AGCACGGGGA TCTGCCGCTG TCGTTCAGCG TGACGAACAT CCAGCCGGCG 360
GCCGCCGGTT CGGCCACCGC CGACGTTTCC GTCTCGGGTC CGAAGCTCTC GTCGCCGGTC ' 420
• · • · • · · · • ·· · · ··· 4 ······· · » ·♦♦· ·· ·· 99 49 99
138
ACGCAGAACG TCACGTTCGT GAATCAAGGC GGCTGGATGC TGTCACGCGC ATCGGCGATG 480
GAGTTGCTGC AGGCCGCAGG GAACTGA 507 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 95:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 168 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 95:
Met 1 Lys Met Val Lys 5 Ser Ile Ala Ala Gly Leu 10 Thr Ala Ala Ala 15 Ala
Ile Gly Ala Ala Ala Ala Gly Val Thr Ser Ile Met Ala Gly Gly Pro
20 25 30
Val Val Tyr Gin Met Gin Pro Val Val Phe Gly Ala Pro Leu Pro Leu
35 40 45
Asp Pro Ala Ser Ala Pro Asp Val Pro Thr Ala Ala Gin Leu Thr Ser
50 55 60
Leu Leu Asn Ser Leu Ala Asp Pro Asn Val Ser Phe Ala Asn Lys Gly
65 70 75 80
Ser Leu Val Glu Gly Gly Ile Gly Gly Thr Glu Ala Arg Ile Ala Asp
85 90 95
His Lys Leu Lys Lys Ala Ala Glu His Gly Asp Leu Pro Leu Ser Phe
100 105 110
Ser Val Thr Asn Ile Gin Pro Ala Ala Ala Gly Ser Ala Thr Ala Asp
115 120 125
Val Ser Val Ser Gly Pro Lys Leu Ser Ser Pro Val Thr Gin Asn Val
130 135 140
Thr Phe Val Asn Gin Gly Gly Trp Met Leu Ser Arg Ala Ser Ala Met
145 150 155 160
Glu Leu Leu Gin Ala Ala Gly Asn 165
139 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 96:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 500 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 96:
CGTGGCAATG TCGTTGACCG TCGGGGCCGG GGTCGCCTCC GCAGATCCCG TGGACGCGGT 60
CATTAACACC ACCTGCAATT ACGGGCAGGT AGTAGCTGCG CTCAACGCGA CGGATCCGGG 120
GGCTGCCGCA CAGTTCAACG CCTCACCGGT GGCGCAGTCC TATTTGCGCA ATTTCCTCGC 180
CGCACCGCCA CCTCAGCGCG CTGCCATGGC CGCGCAATTG CAAGCTGTGC CGGGGGCGGC 240
ACAGTACATC GGCCTTGTCG AGTCGGTTGC CGGCTCCTGC AACAACTATT AAGCCCATGC 300
GGGCCCCATC CCGCGACCCG GCATCGTCGC CGGGGCTAGG CCAGATTGCC CCGCTCCTCA 360
ACGGGCCGCA TCCCGCGACC CGGCATCGTC GCCGGGGCTA GGCCAGATTG CCCCGCTCCT 420
CAACGGGCCG CATCTCGTGC CGAATTCCTG CAGCCCGGGG GATCCACTAG TTCTAGAGCG 480
GCCGCCACCG CGGTGGAGCT 500
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 97:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 96 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 97:
Val 1 Ala Met Ser Leu 5 Thr Val Gly Ala Gly 10 Val Ala Ser Ala Asp 15 Pro
Val Asp Ala Val 20 Ile Asn Thr Thr Cys 25 Asn Tyr Gly Gin Val 30 Val Ala
Ala Leu Asn 35 Ala Thr Asp Pro Gly 40 Ala Ala Ala Gin Phe 45 Asn Ala Ser
Pro Val Ala Gin Ser Tyr Leu Arg Asn Phe Leu Ala Ala Pro Pro Pro
55 60
• · · · · · · 4 ···· ·· ·· ·· ·· ··
140
Gin 65 Arg Ala Ala Met Ala 70 Ala Gin Leu Gin Ala 75 Val Pro Gly Ala Ala 80
Gin Tyr lle Gly Leu Val Glu Ser Val Ala Gly Ser Cys Asn Asn Tyr
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 98:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 154 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 98:
ATGACAGAGC AGCAGTGGAA TTTCGCGGGT ATCGAGGCCG CGGCAAGCGC AATCCAGGGA
AATGTCACGT CCATTCATTC CCTCCTTGAC GAGGGGAAGC AGTCCCTGAC CAAGCTCGCA
GCGGCCTGGG GCGGTAGCGG TTCGGAAGCG TACC (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 99:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 51 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 99:
Met 1 Thr Glu Gin Gin 5 Trp Asn Phe Ala Gly 10 lle Glu Ala Ala Ala 15 Ser
Ala lle Gin Gly 20 Asn Val Thr Ser lle 25 His Ser Leu Leu Asp 30 Glu Gly
Lys Gin Ser Leu Thr Lys Leu Ala Ala Ala Trp Gly Gly Ser Gly Ser
40 45
Glu Ala Tyr 50
141 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 100:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 282 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 100:
CGGTCGCGCA CTTCCAGGTG ACTATGAAAG TCGGCTTCCG NCTGGAGGAT TCCTGAACCT 60
TCAAGCGCGG CCGATAACTG AGGTGCATCA TTAAGCGACT TTTCCAGAAC ATCCTGACGC 120
GCTCGAAACG CGGCACAGCC GACGGTGGCT CCGNCGAGGC GCTGNCTCCA AAATCCCTGA 180
GACAATTCGN CGGGGGCGCC TACAAGGAAG TCGGTGCTGA ATTCGNCGNG TATCTGGTCG 240
ACCTGTGTGG TCTGNAGCCG GACGAAGCGG TGCTCGACGT CG 282
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 101: (i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE: (A) DÉLKA: 3058 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (Xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 101: -
GATCGTACCC GTGCGAGTGC TCGGGCCGTT TGAGGATGGA GTGCACGTGT CTTTCGTGAT 60
GGCATACCCA GAGATGTTGG CGGCGGCGGC TGACACCCTG CAGAGCATCG GTGCTACCAC 120
TGTGGCTAGC AATGCCGCTG CGGCGGCCCC GACGACTGGG GTGGTGCCCC CCGCTGCCGA 180
TGAGGTGTCG GCGCTGACTG CGGCGCACTT CGCCGCACAT GCGGCGATGT ATCAGTCCGT 240
GAGCGCTCGG GCTGCTGCGA TTCATGACCA GTTCGTGGCC ACCCTTGCCA GCAGCGCCAG 300
CTCGTATGCG GCCACTGAAG TCGCCAATGC GGCGGCGGCC AGCTAAGCCA GGAACAGTCG 360
GCACGAGAAA CCACGAGAAA TAGGGACACG TAATGGTGGA TTTCGGGGCG TTACCACCGG 420
AGATCAACTC CGCGAGGATG TACGCCGGCC CGGGTTCGGC CTCGCTGGTG GCCGCGGCTC 480
AGATGTGGGA CAGCGTGGCG AGTGACCTGT TTTCGGCCGC GTCGGCGTTT CAGTCGGTGG 540
TCTGGGGTCT GACGGTGGGG TCGTGGATAG GTTCGTCGGC GGGTCTGATG GTGGCGGCGG 600
»··· *·«’ *·„·
142
CCTCGCCGTA TGTGGCGTGG ATGAGCGTCA CCGCGGGGCA GGCCGAGCTG ACCGCCGCCC 660
AGGTCCGGGT TGCTGCGGCG GCCTACGAGA CGGCGTATGG GCTGACGGTG CCCCCGCCGG 720
TGATCGCCGA GAACCGTGCT GAACTGATGA TTCTGATAGC GACCAACCTC TTGGGGCAAA 780
ACACCCCGGC GATCGCGGTC AACGAGGCCG AATACGGCGA GATGTGGGCC CAAGACGCCG 840
CCGCGATGTT TGGCTACGCC GCGGCGACGG CGACGGCGAC GGCGACGTTG CTGCCGTTCG 900
AGGAGGCGCC GGAGATGACC AGCGCGGGTG GGCTCCTCGA GCAGGCCGCC GCGGTCGAGG 960
AGGCCTCCGA CACCGCCGCG GCGAACCAGT TGATGAACAA TGTGCCCCAG GCGCTGCAAC 1020
AGCTGGCCCA GCCCACGCAG GGCACCACGC CTTCTTCCAA GCTGGGTGGC CTGTGGAAGA 1080
CGGTCTCGCC GCATCGGTCG CCGATCAGCA ACATGGTGTC GATGGCCAAC AACCACATGT 1140
CGATGACCAA CTCGGGTGTG TCGATGACCA ACACCTTGAG CTCGATGTTG AAGGGCTTTG 1200
CTCCGGCGGC GGCCGCCCAG GCCGTGCAAA CCGCGGCGCA AAACGGGGTC CGGGCGATGA 1260
GCTCGCTGGG CAGCTCGCTG GGTTCTTCGG GTCTGGGCGG TGC-GGTGGCC GCCAACTTGG 1320
GTCGGGCGGC CTCGGTCGGT TCGTTGTCGG TGCCGCAGGC CTGGGCCGCG GCCAACCAGG 1380
CAGTGACCCC GGCGGCGCGG GCGCTGCCGC TGACCAGCCT GACCAGCGCC GCGGAAAGAG 1440
GGCCCGGGCA GATGCTGGGC GGGCTGCCGG TGGGGCAGAT GGGCGCCAGG GCCGGTGGTG 1500
GGCTCAGTGG TGTGCTGCGT GTTCCGCCGC GACCCTATGT GATGCCGCAT TCTCCGGCGG 1560
CCGGCTAGGA GAGGGGGCGC AGACTGTCGT TATTTGACCA GTGATCGGCG GTCTCGGTGT 1620
TTCCGCGGCC GGCTATGACA ACAGTCAATG TGCATGACAA GTTACAGGTA TTAGGTCCAG 1680
GTTCAACAAG GAGACAGGCA ACATGGCCTC ACGTTTTATG ACGGATCCGC ACGCGATGCG 1740
GGACATGGCG GGCCGTTTTG AGGTGCACGC CCAGACGGTG GAGGACGAGG CTCGCCGGAT 1800
GTGGGCGTCC GCGCAAAACA TTTCCGGTGC GGGCTGGAGT GGCATGGCCG AGGCGACCTC 1860
GCTAGACACC ATGGCCCAGA TGAATCAGGC GTTTCGCAAC ATCGTGAACA TGCTGCACGG 1920
GGTGCGTGAC GGGCTGGTTC GCGACGCCAA CAACTACGAG CAGCAAGAGC AGGCCTCCCA 1980
GCAGATCCTC AGCAGCTAAC GTCAGCCGCT GCAGCACAAT ACTTTTACAA GCGAAGGAGA 2040
ACAGGTTCGA TGACCATCAA CTATCAATTC GGGGATGTCG ACGCTCACGG CGCCATGATC 2100
CGCGCTCAGG CCGGGTTGCT GGAGGCCGAG CATCAGGCCA TCATTCGTGA TGTGTTGACC 2160
GCGAGTGACT TTTGGGGCGG CGCCGGTTCG GCGGCCTGCC AGGGGTTCAT TACCCAGTTG 2220
GGCCGTAACT TCCAGGTGAT CTACGAGCAG GCCAACGCCC ACGGGCAGAA GGTGCAGGCT 2280
tt
143
GCCGGCAACA ACATGGCGCA AACCGACAGC GCCGTCGGCT CCAGCTGGGC CTGACACCAG 2340
GCCAAGGCCA GGGACGTGGT GTACGAGTGA AGTTCCTCGC GTGATCCTTC GGGTGGCAGT 2400
CTAAGTGGTC AGTGCTGGGG TGTTGGTGGT TTGCTGCTTG GCGGGTTCTT CGGTGCTGGT 2460
CAGTGCTGCT CGGGCTCGGG TGAGGACCTC GAGGCCCAGG TAGCGCCGTC CTTCGATCCA 2520
TTCGTCGTGT TGTTCGGCGA GGACGGCTCC GACGAGGCGG ATGATCGAGG CGCGGTCGGG 2580
GAAGATGCCC ACGACGTCGG TTCGGCGTCG TACCTCTCGG TTGAGGCGTT CCTGGGGGTT 2640
GTTGGACCAG ATTTGGCGCC AGATCTGCTT GGGGAAGGCG GTGAACGCCA GCAGGTCGGT 2700
GCGGGCGGTG TCGAGGTGCT CGGCCACCGC GGGGAGTTTG TCGGTCAGAG CGTCGAGTAC 2760
CCGATCATAT TGGGCAACAA CTGATTCGGC GTCGGGCTGG TCGTAGATGG AGTGCAGCAG 2820
GGTGCGCACC CACGGCCAGG AGGGCTTCGG GGTGGCTGCC ATCAGATTGG CTGCGTAGTG 2880
GGTTCTGCAG CGCTGCCAGG CCGCTGCGGG CAGGGTGGCG CCGATCGCGG CCACCAGGCC 2940
GGCGTGGGCG TCGCTGGTGA CCAGCGCGAC CCCGGACAGG CCGCGGGCGA CCAGGTCGCG 3000
GAAGAACGCC AGCCAGCCGG CCCCGTCCTC GGCGGAGGTG ACCTGGATGC CCAGGATC 3058 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 102:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 391 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 102:
Met 1 Val Asp Phe Gly 5 Ala Leu Pro Pro Glu 10 Ile Asn Ser Ala Arg 15 Met
Tyr Ala Gly Pro 20 Gly Ser Ala Ser Leu 25 Val Ala Ala Ala Gin 30 Met Trp
Asp Ser Val 35 Ala Ser Asp Leu Phe 40 Ser Ala Ala Ser Ala 45 Phe Gin Ser
Val Val 50 Trp Gly Leu Thr Val 55 Gly Ser Trp Ile Gly 60 Ser Ser Ala Gly
Leu Met Val Ala Ala Ala Ser Pro Tyr Val Ala Trp Met Ser Val Thr
• · · « ··· »· ·« ··
144
Ala Gly Gin Ala Glu Leu Thr Ala Ala Gin Val Arg Val Ala Ala Ala 85 90 95
Ala Tyr Glu Thr Ala Tyr Gly Leu Thr Val Pro Pro Pro Val Ile Ala 100 105 110
Glu Asn Arg Ala Glu Leu Met Ile Leu Ile Ala Thr Asn Leu Leu Gly 115 120 125
Gin Asn Thr Pro Ala Ile Ala Val Asn Glu Ala Glu Tyr Gly Glu Met 130 135 140
Trp Ala Gin Asp Ala Ala Ala Met Phe Gly Tyr Ala Ala Ala Thr Ala
145 150 155 160
Thr Ala Thr Ala Thr Leu Leu Pro Phe Glu Glu Ala Pro Glu Met Thr
165 170 175
Ser Ala Gly Gly Leu Leu Glu Gin Ala Ala Ala Val Glu Glu Ala Ser 180 185 190
Asp Thr Ala Ala Ala Asn Gin Leu Met Asn Asn Val Pro Gin Ala Leu 195 200 205
Gin Gin Leu Ala Gin Pro Thr Gin Gly Thr Thr Pro Ser Ser Lys Leu 210 215 220
Gly Gly Leu Trp Lys Thr Val Ser Pro His Arg Ser Pro Ile Ser Asn
225
230
235
240
Met Val Ser Met Ala Asn Asn His Met Ser Met Thr Asn Ser Gly Val 245 250 255
Ser Met Thr Asn Thr Leu Ser Ser Met Leu Lys Gly Phe Ala Pro Ala 260 265 270
Ala Ala Ala Gin Ala Val Gin Thr Ala Ala Gin Asn Gly Val Arg Ala 275 280 285
Met Ser Ser Leu Gly Ser Ser Leu Gly Ser Ser Gly Leu Gly Gly Gly 290 295 300
Val Ala Ala Asn Leu Gly Arg Ala Ala Ser Val Gly Ser Leu Ser Val
305 310 315 320
Pro Gin Ala Trp Ala Ala Ala Asn Gin Ala Val Thr Pro Ala Ala Arg
325 330 335
Ala Leu Pro Leu Thr Ser Leu Thr Ser Ala Ala Glu Arg Gly Pro Gly 340 345 350
Gin Met Leu Gly Gly Leu Pro Val Gly Gin Met Gly Ala Arg Ala Gly 355 360 365 ·· ···♦ ·« ·· ··
F · · ► · · · · ► · · 4 » · · 4 ·· 4«
145
Gly Gly Leu Ser Gly Val Leu Arg Val Pro Pro Arg Pro Tyr Val Met 370 375 380
Pro His Ser Pro Ala Ala Gly 385 390 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 103:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 1725 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 103:
GACGTCAGCA CCCGCCGTGC AGGGCTGGAG CGTGGTCGGT TTTGATCTGC GGTCAAGGTG 60
ACGTCCCTCG GCGTGTCGCC GGCGTGGATG CAGACTCGAT GCCGCTCTTT AGTGCAACTA 120
ATTTCGTTGA AGTGCCTGCG AGGTATAGGA CTTCACGATT GGTTAATGTA GCGTTCACCC 180
CGTGTTGGGG TCGATTTGGC CGGACCAGTC GTCACCAACG CTTGGCGTGC GCGCCAGGCG 240
GGCGATCAGA TCGCTTGACT ACCAATCAAT CTTGAGCTCC CGGGCCGATG CTCGGGCTAA 300
ATGAGGAGGA GCACGCGTGT CTTTCACTGC GCAACCGGAG ATGTTGGCGG CCGCGGCTGG 360
CGAACTTCGT TCCCTGGGGG CAACGCTGAA GGCTAGCAAT GCCGCCGCAG CCGTGCCGAC 420
GACTGGGGTG GTGCCCCCGG CTGCCGACGA GGTGTCGCTG CTGCTTGCCA CACAATTCCG 480
TACGCATGCG GCGACGTATC AGACGGCCAG CGCCAAGGCC GCGGTGATCC ATGAGCAGTT 540
TGTGACCACG CTGGCCACCA GCGCTAGTTC ATATGCGGAC ACCGAGGCCG CCAACGCTGT 600
GGTCACCGGC TAGCTGACCT GACGGTATTC GAGCGGAAGG ATTATCGAAG TGGTGGATTT 660
CGGGGCGTTA CCACCGGAGA TCAACTCCGC GAGGATGTAC GCCGGCCCGG GTTCGGCCTC 720
GCTGGTGGCC GCCGCGAAGA TGTGGGACAG CGTGGCGAGT GACCTGTTTT CGGCCGCGTC 780
GGCGTTTCAG TCGGTGGTCT GGGGTCTGAC GGTGGGGTCG TGGATAGGTT CGTCGGCGGG 840
TCTGATGGCG GCGGCGGCCT CGCCGTATGT GGCGTGGATG AGCGTCACCG CGGGGCAGGC 900
CCAGCTGACC GCCGCCCAGG TCCGGGTTGC TGCGGCGGCC TACGAGACAG CGTATAGGCT 960
GACGGTGCCC CCGCCGGTGA TCGCCGAGAA CCGTACCGAA CTGATGACGC TGACCGCGAC 1020
CAACCTCTTG GGGCAAAACA CGCCGGCGAT CGAGGCCAAT CAGGCCGCAT ACAGCCAGAT 1080 ·· ·· ·· • · · · · · • ·· · '· • · · « · 9 • · 9 · 9
9999 99 99 ···
9 9 9
9 9 9 • 9 ··· 999 • 9 9
99 99
146
GTGGGGCCAA GACGCGGAGG CGATGTATGG CTACGCCGCC ACGGCGGCGA CGGCGACCGA 1140
GGCGTTGCTG CCGTTCGAGG ACGCCCCACT GATCACCAAC CCCGGCGGGC TCCTTGAGCA 1200
GGCCGTCGCG GTCGAGGAGG CCATCGACAC CGCCGCGGCG AACCAGTTGA TGAACAATGT 1260
GCCCCAAGCG CTGCAACAGC TGGCČCAGCC AGCGCAGGGC GTCGTACCTT CTTCCAAGCT 1320
GGGTGGGCTG TGGACGGCGG TCTCGCCGCA TCTGTCGCCG CTCAGCAACG TCAGTTCGAT 1380
AGCCAACAAC CACATGTCGA TGATGGGCAC GGGTGTGTCG ATGACCAACA CCTTGCACTC 1440
GATGTTGAAG GGCTTAGCTC CGGCGGCGGC TCAGGCCGTG GAAACCGCGG CGGAAAACGG 1500
GGTCTGGGCG ATGAGCTCGC TGGGCAGCCA GCTGGGTTCG TCGCTGGGTT CTTCGGGTCT 1560
GGGCGCTGGG GTGGCCGCCA ACTTGGGTCG GGCGGCCTCG GTCGGTTCGT TGTCGGTGCC 1620
GCCAGCATGG GCCGCGGCCA ACCAGGCGGT CACCCCGGCG GCGCGGGCGC TGCCGCTGAC 1680
CAGCCTGACC AGCGCCGCCC AAACCGCCCC CGGACACATG CTGGG 1725
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 104:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 359 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 104:
Val Val Asp Phe Gly Ala Leu Pro Pro Glu Ile Asn Ser Ala Arg Met 15 10 15
Tyr Ala Gly Pro Gly Ser Ala Ser Leu Val Ala Ala Ala Lys Met Trp 20 25 30
Asp Ser Val Ala Ser Asp Leu Phe Ser Ala Ala Ser Ala Phe Gin Ser 35 40 45 .
Val Val Trp Gly Leu Thr Val Gly Ser Trp Ile Gly Ser Ser Ala Gly 50 55 60
Leu Met Ala Ala Ala Ala Ser Pro Tyr Val Ala Trp Met Ser Val Thr
70 75 80
Ala Gly Gin Ala Gin Leu Thr Ala Ala Gin Val Arg Val Ala Ala Ala
90 95 • · · · • · · · · · · · • ··· ·· ·· · · · · ·«
147
Ala Tyr Glu Thr Ala Tyr Arg Leu Thr Val Pro Pro Pro Val Ile Ala
100 105 110
Glu Asn Arg Thr Glu Leu Met Thr Leu Thr Ala Thr Asn Leu Leu Gly
115 120 125
Gin Asn Thr Pro Ala Ile Glu Ala Asn Gin Ala Ala Tyr Ser Gin Met
130 135 140
Trp Gly Gin Asp Ala Glu Ala Met Tyr Gly Tyr Ala Ala Thr Ala Ala
145 150 155 160
Thr Ala Thr Glu Ala Leu Leu Pro Phe Glu Asp Ala Pro Leu Ile Thr
165 170 175
Asn Pro Gly Gly Leu Leu Glu Gin Ala Val Ala Val Glu Glu Ala Ile
180 185 190
Asp Thr Ala Ala Ala Asn Gin Leu Met Asn Asn Val Pro Gin Ala Leu
195 200 205
Gin Gin Leu Ala Gin Pro Ala Gin Gly Val Val Pro Ser Ser Lys Leu
210 215 220
Gly Gly Leu Trp Thr Ala Val Ser Pro His Leu Ser Pro Leu Ser Asn
225 230 235 240
Val Ser Ser Ile Ala Asn Asn His Met Ser Met Met Gly Thr Gly Val
245 250 255
Ser Met Thr Asn Thr Leu His Ser Met Leu Lys Gly Leu Ala Pro Ala
260 265 270
Ala Ala Gin Ala Val Glu Thr Ala Ala Glu Asn Gly Val Trp Ala Met
275 280 285
Ser Ser Leu Gly Ser Gin Leu Gly Ser Ser Leu Gly Ser Ser Gly Leu
290 295 300
Gly Ala Gly Val Ala Ala Asn Leu Gly Arg Ala Ala Ser Val Gly Ser
305 310 315 320
Leu Ser Val Pro Pro Ala Trp Ala Ala Ala Asn Gin Ala Val Thr Pro
325 330 335
Ala Ala Arg Ala Leu Pro Leu Thr Ser Leu Thr Ser Ala Ala Gin Thr
340 345 350
Ala Pro Gly His Met Leu Gly 355
148 (2) Informace ο sekvenci SEQ ID NO: 105:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 3027 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 105:
AGTTCAGTCG AGAATGATAC TGACGGGCTG TATCCACGAT GGCTGAGACA ACCGAACCAC 60
CGTCGGACGC GGGGACATCG CAAGCCGACG CGATGGCGTT GGCCGCCGAA GCCGAAGCCG 120
CCGAAGCCGA AGCGCTGGCC GCCGCGGCGC GGGCCCGTGC CCGTGCCGCC CGGTTGAAGC 180
GTGAGGCGCT GGCGATGGCC CCAGCCGAGG ACGAGAACGT CCCCGAGGAT ATGCAGACTG 240
GGAAGACGCC GAAGACTATG ACGACTATGA CGACTATGAG GCCGCAGACC AGGAGGCCGC 300
ACGGTCGGCA TCCTGGCGAC GGCGGTTGCG GGTGCGGTTA CCAAGACTGT CCACGATTGC 360
CATGGCGGCC GCAGTCGTCA TCATCTGCGG CTTCACCGGG CTCAGCGGAT ACATTGTGTG 420
GCAACACCAT GAGGCCACCG AACGCCAGCA GCGCGCCGCG GCGTTCGCCG CCGGAGCCAA 480
GCAAGGTGTC ATCAACATGA CCTCGCTGGA CTTCAACAAG GCCAAAGAAG ACGTCGCGCG 540
TGTGATCGAC AGCTCCACCG GCGAATTCAG GGATGACTTC CAGCAGCGGG CAGCCGATTT 600
CACCAAGGTT GTCGAACAGT CCAAAGTGGT CACCGAAGGC ACGGTGAACG CGACAGCCGT 660
CGAATCCATG AACGAGCATT CCGCCGTGGT GCTCGTCGCG GCGACTTCAC GGGTCACCAA 720
TTCCGCTGGG GCGAAAGACG AACCACGTGC GTGGCGGCTC AAAGTGACCG TGACCGAAGA 780
GGGGGGACAG TACAAGATGT CGAAAGTTGA GTTCGTACCG TGACCGATGA CGTACGCGAC 840
GTCAACACCG AAACCACTGA CGCCACCGAA GTCGCTGAGA TCGACTCAGC CGCAGGCGAA 900
GCCGGTGATT CGGCGACCGA GGCATTTGAC ACCGACTCTG CAACGGAATC TACCGCGCAG 960
AAGGGTCAGC GGCACCGTGA CCTGTGGCGA ATGCAGGTTA CCTTGAAACC CGTTCCGGTG 1020
ATTCTCATCC TGCTCATGTT GATCTCTGGG GGCGCGACGG GATGGCTATA CCTTGAGCAA 1080
TACGACCCGA TCAGCAGACG GACTCCGGCG CCGCCCGTGC TGCCGTCGCC GCGGCGTCTG 1140
ACGGGACAAT CGCGCTGTTG TGTATTCACC CGACACGTCG ACCAAGACTT CGCTACCGCC 1200
AGGTCGCACC TCGCCGGCGA TTTCCTGTCC TATACGACCA GTTCACGCAG CAGATCGTGG 1260
CTCCGGCGGC CAAACAGAAG TCACTGAAAA CCACCGCCAA GGTGGTGCGC GCGGCCGTGT 1320
CGGAGCTACA TCCGGATTCG GCCGTCGTTC TGGTTTTTGT CGACCAGAGC ACTACCAGTA 1380
• ·
149 • · • 999 • · · · · ·· 9 · · 9 • toto to
AGGACAGCCC CAATCCGTCG ATGGCGGCCA GCAGCGTGAT GGTGACCCTA GCCAAGGTCG 1440
ACGGCAATTG GCTGATCACC AAGTTCACCC CGGTTTAGGT TGCCGTAGGC GGTCGCCAAG 1500
TCTGACGGGG GCGCGGGTGG CTGCTCGTGC GAGATACCGG CCGTTCTCCG GACAATCACG 1560
GCCCGACCTC AAACAGATCT CGGCCGCTGT CTAATCGGCC GGGTTATTTA AGATTAGTTG 1620
CCACTGTATT TACCTGATGT TCAGATTGTT CAGCTGGATT TAGCTTCGCG GCAGGGCGGC 1680
TGGTGCACTT TGCATCTGGG GTTGTGACTA CTTGAGAGAA TTTGACCTGT TGCCGACGTT 1740
GTTTGCTGTC CATCATTGGT GCTAGTTATG GCCGAGCGGA AGGATTATCG AAGTGGTGGA 1800
CTTCGGGGCG TTACCACCGG AGATCAACTC CGCGAGGATG TACGCCGGCC CGGGTTCGGC 1860
CTCGCTGGTG GCCGCCGCCA AGATGTGGGA CAGCGTGGCG AGTGACCTGT TTTCGGCCGC 1920
GTCGGCGTTT CAGTCGGTGG TCTGGGGTCT GACGACGGGA TCGTGGATAG GTTCGTCGGC 1980
GGGTCTGATG GTGGCGGCGG CCTCGCCGTA TGTGGCGTGG ATGAGCGTCA CCGCGGGGCA 2040
GGCCGAGCTG ACCGCCGCCC AGGTCCGGGT TGCTGCGGCG GCCTACGAGA CGGCGTATGG 2100
GCTGACGGTG CCCCCGCCGG TGATCGCCGA GAACCGTGCT GAACTGATGA TTCTGATAGC 2160
GACCAACCTC TTGGGGCAAA ACACCCCGGC GATCGCGGTC AACGAGGCCG AATACGGGGA 2220
GATGTGGGCC CAAGACGCCG CCGCGATGTT TGGCTACGCC GCCACGGCGG CGACGGCGAC 2280
CGAGGCGTTG CTGCCGTTCG AGGACGCCCC ACTGATCACC AACCCCGGCG GGCTCCTTGA 2340
GCAGGCCGTC GCGGTCGAGG AGGCCATCGA CACCGCCGCG GCGAACCAGT TGATGAACAA 2400
TGTGCCCCAA GCGCTGCAAC AACTGGCCCA GCCCACGAAA AGCATCTGGC CGTTCGACCA 2460
ACTGAGTGAA CTCTGGAAAG CCATCTCGCC GCATCTGTCG CCGCTCAGCA ACATCGTGTC 2520
GATGCTCAAC AACCACGTGT CGATGACCAA CTCGGGTGTG TCGATGGCCA GCACCTTGCA 2580
CTCAATGTTG AAGGGCTTTG CTCCGGCGGC GGCTCAGGCC GTGGAAACCG CGGCGCAAAA 2640
CGGGGTCCAG GCGATGAGCT CGCTGGGCAG CCAGCTGGGT TCGTCGCTGG GTTCTTCGGG 2700
TCTGGGCGCT GGGGTGGCCG CCAACTTGGG TCGGGCGGCC TCGGTCGGTT CGTTGTCGGT 2760
GCCGCAGGCC TGGGCCGCGG CCAACCAGGC GGTCACCCCG GCGGCGCGGG CGCTGCCGCT 2820
GACCAGCCTG ACCAGCGCCG CCCAAACCGC CCCCGGACAC ATGCTGGGCG GGCTACCGCT 2880
GGGGCAACTG ACCAATAGCG GCGGCGGGTT CGGCGGGGTT AGCAATGCGT TGCGGATGCC 2940
GCCGCGGGCG TACGTAATGC CCCGTGTGCC CGCCGCCGGG TAACGCCGAT CCGCACGCAA 3000
• ·
WO 98/16645 • · · · · · · · • · · · · · · · · ·· · .· : : · :pcuus5?7/isTfit ··:
···· ·· ·· ·· . tt ' tt
150
TGCGGGCCCT CTATGCGGGC AGCGATC
3027 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 106:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 396 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 106:
Val 1 Val Asp Phe Gly 5 Ala Leu Pro Pro Glu 10 Ile Asn Ser Ala Arg 15 Met
Tyr Ala Gly Pro Gly Ser Ala Ser Leu Val Ala Ala Ala Lys Met Trp
20 25 30
Asp Ser Val Ala Ser Asp Leu Phe Ser Ala Ala Ser Ala Phe Gin Ser
35 40 45
Val Val Trp Gly Leu Thr Thr Gly Ser Trp Ile Gly Ser Ser Ala Gly
50 55 60
Leu Met Val Ala Ala Ala Ser Pro Tyr Val Ala Trp Met Ser Val Thr
65 70 75 80
Ala Gly Gin Ala Glu Leu Thr Ala Ala Gin Val Arg Val Ala Ala Ala
85 90 95
Ala Tyr Glu Thr Ala Tyr Gly Leu Thr Val Pro Pro Pro Val Ile Ala
100 105 110
Glu Asn Arg Ala Glu Leu Met Ile Leu Ile Ala Thr Asn Leu Leu Gly
115 120 125
Gin Asn Thr Pro Ala Ile Ala Val Asn Glu Ala Glu Tyr Gly Glu Met
130 135 140
Trp Ala Gin Asp Ala Ala Ala Met Phe Gly Tyr Ala Ala Thr Ala Ala
145 150 155 160
Thr Ala Thr Glu Ala Leu Leu Pro Phe Glu Asp Ala Pro Leu Ile Thr
165 170 175
Asn Pro Gly Gly Leu Leu Glu Gin Ala Val Ala Val Glu Glu Ala Ile
180 185 190
Asp Thr Ala Ala Ala Asn Gin Leu Met Asn Asn Val Pro Gin Ala Leu
195 200 205
• · • · » · · » · · • · · 4 • · · · · · · ······ ·* »»
151
Gin Gin Leu Ala Gin Pro Thr Lys Ser lle Trp Pro Phe Asp Gin Leu 210 215 220
Ser Glu Leu Trp Lys Ala lle Ser Pro His Leu Ser Pro Leu Ser Asn
225 230 235 240 lle Val Ser Met Leu Asn Asn His Val Ser Met Thr Asn Ser Gly Val
245 250 255
Ser Met Ala Ser Thr Leu His Ser Met Leu Lys Gly Phe Ala Pro Ala 260 265 270
Ala Ala Gin Ala Val Glu Thr Ala Ala Gin Asn Gly Val Gin Ala Met 275 280 285
Ser Ser Leu Gly Ser Gin Leu Gly Ser Ser Leu Gly Ser Ser Gly Leu 290 295 300
Gly Ala Gly Val Ala Ala Asn Leu Gly Arg Ala Ala Ser Val Gly Ser
305 310 315 320
Leu Ser Val Pro Gin Ala Trp Ala Ala Ala Asn Gin Ala Val Thr Pro
325. 330 335
Ala Ala Arg Ala Leu Pro Leu Thr Ser Leu Thr Ser Ala Ala Gin Thr 340 345 350
Ala Pro Gly His Met Leu Gly Gly Leu Pro Leu Gly Gin Leu Thr Asn 355 360 365
Ser Gly Gly Gly Phe Gly Gly Val Ser Asn Ala Leu Arg Met Pro Pro 370 375 380
Arg Ala Tyr Val Met Pro Arg Val Pro Ala Ala Gly 385 390 395 (2) Informace o sekvencí SEQ ID NO: 107:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 1616 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 107:
CATCGGAGGG AGTGATCACC ATGCTGTGGC ACGCAATGCC ACCGGAGTAA ATACCGCACG 60
GCTGATGGCC GGCGCGGGTC CGGCTCCAAT GCTTGCGGCG GCCGCGGGAT GGCAGACGCT 120
TTCGGCGGCT CTGGACGCTC AGGCCGTCGA GTTGACCGCG CGCCTGAACT CTCTGGGAGA 180
• ·
152
AGCCTGGACT GGAGGTGGCA GCGACAAGGC GCTTGCGGCT GCAACGCCGA TGGTGGTCTG 240
GCTACAAACC GCGTCAACAC AGGCCAAGAC CCGTGCGATG CAGGCGACGG CGCAAGCCGC 300
GGCATACACC CAGGCCATGG CCACGACGCC GTCGCTGCCG GAGATCGCCG CCAACCACAT 360
CACCCAGGCC GTCCTTACGG CCACCAACTT CTTCGGTATC AACACGATCC CGATCGCGTT 420
GACCGAGATG GATTATTTCA TCCGTATGTG GAACCAGGCA GCCCTGGCAA TGGAGGTCTA 480
CCAGGCCGAG ACCGCGGTTA ACACGCTTTT CGAGAAGCTC GAGCCGATGG CGTCGATCCT 54 0
TGATCCCGGC GCGAGCCAGA GCACGACGAA CCCGATCTTC GGAATGCCCT CCCCTGGCAG 600
CTCAACACCG GTTGGCCAGT TGCCGCCGGC GGCTACCCAG ACCCTCGGCC AACTGGGTGA 660
GATGAGCGGC CCGATGCAGC AGCTGACCCA GCCGCTGCAG CAGGTGACGT CGTTGTTCAG 720
CCAGGTGGGC GGCACCGGCG GCGGCAACCC AGCCGACGAG GAAGCCGCGC AGATGGGCCT 780
GCTCGGCACC AGTCCGCTGT CGAACCATCC GCTGGCTGGT GGATCAGGCC CCAGCGCGGG 840
CGCGGGCCTG CTGCGCGCGG AGTCGCTACC TGGCGCAGGT GGGTCGTTGA CCCGCACGCC 900
GCTGATGTCT CAGCTGATCG AAAAGCCGGT TGCCCCCTCG GTGATGCCGG CGGCTGCTGC 960
CGGATCGTCG GCGACGGGTG GCGCCGCTCC GGTGGGTGCG GGAGCGATGG GCCAGGGTGC 1020
GCAATCCGGC GGCTCCACCA GGCCGGGTCT GGTCGCGCCG GCACCGCTCG CGCAGGAGCG 1080
TGAAGAAGAC GACGAGGACG ACTGGGACGA AGAGGACGAC TGGTGAGCTC CCGTAATGAC 1140
AACAGACTTC CCGGCCACCC GGGCCGGAAG ACTTGCCAAC ATTTTGGCGA GGAAGGTAAA 1200
GAGAGAAAGT AGTCCAGCAT GGCAGAGATG AAGACCGATG CCGCTACCCT CGCGCAGGAG 1260
GCAGGTAATT TCGAGCGGAT CTCCGGCGAC CTGAAAACCC AGATCGACCA GGTGGAGTCG 1320
ACGGCAGGTT CGTTGCAGGG CCAGTGGCGC GGCGCGGCGG GGACGGCCGC CCAGGCCGCG 1380
GTGGTGCGCT TCCAAGAAGC AGCCAATAAG CAGAAGCAGG AACTCGACGA GATCTCGACG 1440
AATATTCGTC AGGCCGGCGT CCAATACTCG AGGGCCGACG AGGAGCAGCA GCAGGCGCTG 1500
TCCTCGCAAA TGGGCTTCTG ACCCGCTAAT ACGAAAAGAA ACGGAGCAAA AACATGACAG 1560
AGCAGCAGTG GAATTTCGCG GGTATCGAGG CČGCGGCAAG CGCAATCCAG GGAAAT 1616
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 108:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 432 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 108:
• ·
153
CTAGTGGATG GGACCATGGC CATTTTCTGC AGTCTCACTG CCTTCTGTGT TGACATTTTG 60
GCACGCCGGC GGAAACGAAG CACTGGGGTC GAAGAACGGC TGCGCTGCCA TATCGTCCGG 120
AGCTTCCATA CCTTCGTGCG GCCGGAAGAG CTTGTCGTAG TCGGCCGCCA TGACAACCTC 180
TCAGAGTGCG CTCAAACGTA TAAACACGAG AAAGGGCGAG ACCGACGGAA GGTCGAACTC 240
GCCCGATCCC GTGTTTCGCT ATTCTACGCG AACTCGGCGT TGCCCTATGC GAACATCCCA 300
GTGACGTTGC CTTCGGTCGA AGCCATTGCC TGACCGGCTT CGCTGATCGT CCGCGCCAGG 360
TTCTGCAGCG CGTTGTTCAG CTCGGTAGCC GTGGCGTCCC ATTTTTGCTG GACACCCTGG 420
TACGCCTCCG AA 432
(2) Informace ο sekvenci SEQ ID NO: 109:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 368 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 109:
Met Leu Trp His Ala Met Pro Pro Glu Xaa Asn Thr Ala Arg Leu Met 15 10 15
Ala Gly Ala Gly Pro Ala Pro Met Leu Ala Ala Ala Ala Gly Trp Gin 20 25 30
Thr Leu Ser Ala Ala Leu Asp Ala Gin Ala Val Glu Leu Thr Ala Arg 35 ' 40 45
Leu Asn Ser Leu Gly Glu Ala Trp Thr Gly Gly Gly Ser Asp Lys Ala 50 55 60
Leu Ala Ala Ala Thr Pro Met Val Val Trp Leu Gin Ťhr Ala Ser Thr
70 75 80
Gin Ala Lys Thr Arg Ala Met Gin Ala Thr Ala Gin Ala Ala Ala Tyr
90 95 • ·· · ···· · · · · • · · · · · · ·· ··· ··· • •••••ft · · ···· ·· ·» ·· ·· ··
154
Thr Gin Ala Met 100 Ala Thr Thr Pro Ser 105 Leu Pro Glu Ile Ala 110 Ala Asn -
His Ile Thr Gin Ala Val Leu Thr Ala Thr Asn Phe Phe Gly Ile Asn 1
115 120 125
Thr Ile Pro Ile Ala Leu Thr Glu Met Asp Tyr Phe Ile Arg Met Trp -
130 135 140
Asn Gin Ala Ala Leu Ala Met Glu Val Tyr Gin Ala Glu Thr Ala Val
145 150 155 160
Asn Thr Leu Phe Glu Lys Leu Glu Pro Met Ala Ser Ile Leu Asp Pro
165 170 175
Gly Ala Ser Gin Ser Thr Thr Asn Pro Ile Phe Gly Met Pro Ser Pro
180 185 190
Gly Ser Ser Thr Pro Val Gly Gin Leu Pro Pro Ala Ala Thr Gin Thr
195 200 205
Leu Gly Gin Leu Gly Glu Met Ser Gly Pro Met Gin Gin Leu Thr Gin
210 215 220
Pro Leu Gin Gin Val Thr Ser Leu Phe Ser Gin Val Gly Gly Thr Gly
225 230 235 240
Gly Gly Asn Pro Ala Asp Glu Glu Ala Ala Gin Met Gly Leu Leu Gly
245 250 255
Thr Ser Pro Leu Ser Asn His Pro Leu Ala Gly Gly Ser Gly Pro Ser
260 265 270
Ala Gly Ala Gly Leu Leu Arg Ala Glu Ser Leu Pro Gly Ala Gly Gly
275 280 285
Ser Leu Thr Arg Thr Pro Leu Met Ser Gin Leu Ile Glu Lys Pro Val
290 295 300
Ala Pro Ser Val Met Pro Ala Ala Ala Ala Gly Ser Ser Ala Thr Gly
305 310 315 320
Gly Ala Ala Pro Val Gly Ala Gly Ala Met Gly Gin Gly Ala Gin Ser
325 330 335
Gly Gly Ser Thr Arg Pro Gly Leu Val Ala Pro Ala Pro Leu Ala Gin
340 345 350
Glu Arg Glu Glu Asp Asp Glu Asp Asp Trp Asp Glu Glu Asp Asp Trp 355 360 365 • 0 0
0 • · · 0·00 ···· 00 00 ·»
155 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 110:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 100 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 110:
Met 1 Ala Glu Met Lys Thr Asp Ala Ala Thr Leu Ala Gin Glu Ala Gly
5 10 15
Asn Phe Glu Arg Ile Ser Gly Asp Leu Lys Thr Gin Ile Asp Gin Val
20 25 30
Glu Ser Thr Ala Gly Ser Leu Gin Gly Gin Trp Arg Gly Ala Ala Gly
35 40 45
Thr Ala Ala Gin Ala Ala Val Val Arg Phe Gin Glu Ala Ala Asn Lys
50 55 60
Gin Lys Gin Glu Leu Asp Glu Ile Ser Thr Asn Ile Arg Gin Ala Gly
65 70 75 80
Val Gin Tyr Ser Arg Ala Asp Glu Glu Gin Gin Gin Ala Leu Ser Ser
90 . 95
Gin Met Gly Phe 100 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 111:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 396 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 111:
GATCTCCGGC GACCTGAAAA CCCAGATCGA CCAGGTGGAG TCGACGGCAG GTTCGTTGCA 60
GGGCCAGTGG CGCGGCGCGG CGGGGACGGC CGCCCAGGCC GCGGTGGTGC GCTTCCAAGA 120
AGCAGCCAAT AAGCAGAAGC AGGAACTCGA CGAGATCTCG ACGAATATTC GTCAGGCCGG ' 180
CGTCCAATAC TCGAGGGCCG ACGAGGAGCA GCAGCAGGCG CTGTCCTCGC AAATGGGCTT 240
156
CTGACCCGCT AATACGAAAA GAAACGGAGC AAAAACATGA CAGAGCAGCA GTGGAATTTC 300
GCGGGTATCG AGGCCGCGGC AAGCGCAATC CAGGGAAATG TCACGTCCAT TCATTCCCTC 360
CTTGACGAGG GGAAGCAGTC CCTGACCAAG CTCGCA 396 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 112:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 80 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 112:
Ile 1 Ser Gly Asp Leu 5 Lys Thr Gin Ile Asp 10 Gin Val Glu Ser Thr 15 Ala
Gly Ser Leu Gin 20 Gly Gin Trp Arg Gly 25 Ala Ala Gly Thr Ala 30 Ala Gin
Ala Ala Val 35 .Val Arg Phe Gin Glu 40 Ala Ala Asn Lys Gin 45 Lys Gin Glu
Leu Asp 50 Glu Ile Ser Thr Asn 55 Ile Arg Gin Ala Gly 60 Val Gin Tyr Ser
Arg Ala Asp Glu Glu Gin Gin Gin Ala Leu Ser Ser Gin Met Gly Phe
70 75 80 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 113:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 387 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 113:
GTGGATCCCG ATCCCGTGTT TCGCTATTCT ACGCGAACTC GGCGTTGCCC TATGCGAACA 60
TCCCAGTGAC GTTGCCTTCG GTCGAAGCCA TTGCCTGACC GGCTTCGCTG ATCGTCCGCG 120
CCAGGTTCTG CAGCGCGTTG TTCAGCTCGG TAGCCGTGGC GTCCCATTTT TGCTGGACAC 180
157
CCTGGTACGC CTCCGAACCG CTACCGCCCC AGGCCGCTGC GAGCTTGGTC AGGGACTGCT 240
TCCCCTCGTC AAGGAGGGAA TGAATGGACG TGACATTTCC CTGGATTGCG CTTGCCGCGG 300
CCTCGATACC CGCGAAATTC CACTGCTGCT CTGTCATGTT TTTGCTCCGT TTCTTTTCGT 360
ATTAGCGGGT CAGAAGCCCA TTTGCGA 387
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 114:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 272 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 114:
CGGCACGAGG ATCTCGGTTG GCCCAACGGC GCTGGCGAGG GCTCCGTTCC GGGGGCGAGC 60
TGCGCGCCGG ATGCTTCCTC TGCCCGCAGC CGCGCCTGGA TGGATGGACC AGTTGCTACC 120
TTCCCGACGT TTCGTTCGGT GTCTGTGCGA TAGCGGTGAC CCCGGCGCGC ACGTCGGGAG 180
TGTTGGGGGG CAGGCCGGGT CGGTGGTTCG GCCGGGGACG CAGACGGTCT GGACGGAACG 240
GGCGGGGGTT CGCCGATTGG CATCTTTGCC CA 272
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 115:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 20 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE:
(D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 115:
Asp Pro Val Asp Ala Val Ile Asn Thr Thr Cys Asn Tyr Gly Gin Val 15 10 15
Val Ala Ala Leu 20 • · · ·
158 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 116:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 15 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE:
(D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 116:
Ala Val Glu Ser Gly Met Leu Ala Leu Gly Thr Pro Ala Pro Ser 15 10 15 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 117:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 19 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE:
(D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 117:
Ala Ala Met Lys Pro Arg Thr Gly Asp Gly Pro Leu Glu Ala Ala Lys 15 10 15
Glu Gly Arg (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 118:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 15 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE:
(D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 118:
Tyr Tyr Trp Cys Pro Gly Gin Pro Phe Asp 15 10
Pro Ala Trp Gly Pro 15 • · · · · · · · · · · ··· · ···· · ·· · ······· · · ···· ·· ·· ·· ·· ··
159 (2) Informace ο sekvenci SEQ ID NO: 119:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 14 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE:
(D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 119:
Asp Ile Gly Ser Glu Ser Thr Glu Asp Gin Gin Xaa Ala Val 1 5 10 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 120:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 13 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE:
(D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 120:
Ala Glu Glu Ser 1
Ile Ser Thr Xaa Glu 5
Xaa Ile Val Pro 10 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 121:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 17 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE:
(D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 121:
Asp Pro Glu Pro Ala Pro Pro Val Pro Thr Thr Ala Ala Ser Pro Pro 1 5 10 15
Ser • toto to to • · · • · · · ··
160 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 122:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 15 aminokyselin (E) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE:
(D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 122:
Ala Pro Lys Thr Tyr Xaa Glu Glu Leu Lys Gly Thr Asp Thr Gly 15 10 15 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 123:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 30 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE:
(D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 123:
Asp 1 Pro Ala Ser Ala 5 Pro Asp Val Pro Thr Ala Ala 10 Gin Leu Thr Ser 15
Leu Leu Asn Ser Leu Ala Asp Pro Asn Val Ser Phe Ala Asn
20 25 30
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 124:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 22 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE:
(D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 124:
Asp Pro Pro Asp Pro His Gin Xaa Asp Met Thr Lys Gly Tyr Tyr Pro 15 10 15
Gly Gly Arg Arg Xaa Phe 20 ·· ··
WO 98/16645
ί.. ·..* •.PCXO^/iaíW..
161 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 125:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 7 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE:
(D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 125:
(xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO:125:
Asp Pro Gly Tyr Thr Pro Gly 1 5 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 126:
(i) CHARAKTERIŠTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 10 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE:
(D) TOPOLOGIE: lineární (ix) RYSY:
(D) JINÉ INFORMACE: (pozn.= „druhým zbytkem může být buď Pro nebo Thr (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 126:
Xaa Xaa Gly Phe Thr Gly Pro Gin Phe Tyr 15 10 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 127:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 9 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE:
(D) TOPOLOGIE: lineární (ix) RYSY:
(D) JINÉ INFORMACE: (pozn.= „třetím zbytkem může být buď Gin nebo Leu (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 127:
Pro Xaa Val Thr Ala Tyr Ala Gly 5
Xaa • · • · · ···· · ···· ·· ·· ·· ·· ··
162 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 128:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 9 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE:
(D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 128:
Xaa Xaa Xaa Glu Lys Pro Phe Leu Arg 1 5 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 129:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 15 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE:
(D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 129:
Xaa Asp Ser Glu Lys Ser Ala Thr Ile Lys Val Thr Asp Ala Ser 15 10 15 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 130:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 15 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE:
(D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 130:
Ala Gly Asp Thr Xaa Ile Tyr Ile Val Gly Asn Leu Thr Ala Asp 1 5 10 15 • · ···· ··· ····
99 9 9 999 9 9 9 9 • · ··· ·· «· ·«· ·«· ······· · · ···· ·· ·· 99 99 99
163 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 131:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 15 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE:
(D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 131:
Ala Pro Glu Ser Gly Ala Gly Leu Gly Gly Thr Val Gin Ala Gly 1 5 10 15 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 132:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 21 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE:
(D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 132
Xaa Tyr Ile Ala Tyr Xaa Thr Thr Ala Gly Ile Val Pro Gly Lys Ile 15 10 15
Asn Val His Leu Val 20 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 133:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 882 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: DNA (genomová) (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 133:
GCAACGCTGT CGTGGCCTTT GCGGTGATCG GTTTCGCCTC GCTGGCGGTG GCGGTGGCGG 60
TCACCATCCG ACCGACCGCG GCCTCAAAAC CGGTAGAGGG ACACCAAAAC GCCCAGCCAG 120
GGAAGTTCAT GCCGTTGTTG CCGACGCAAC AGCAGGCGCC GGTCCCGCCG CCTCCGCCCG 180
ATGATCCCAC CGCTGGATTC CAGGGCGGCA CCATTCCGGC TGTACAGAAC GTGGTGCCGC 240
• · • · • · • ···
GGCCGGGTAC CTCACCCGGG GTGGGTGGGA
CCGTGCCCGG TGTTGTGCCT GCCCCGGTGC
TCCCGGGTTG GCAGCCTGGA ATGCCGACCA
CCACGTCGGC GACGACGCCG CCGACCACGC
CGACGCCGCČ GACCACGCCG GTGACCACGC
CCACGCCACC AACGACCGTC GCCCCGACGA
CCGTCGCCCC GACCACGGTC GCTCCAGCCA
CGACGCAGCA GCCCACGCAA CAACCAACCC
CCCCGCAGAC GGTGGCGCCG GCTCCGCAGC
GGGGCGACTT ATTCGGCGGG TTCTGATCAC
GGCCGGTGAT GCGGTGACGG TGGTGCTGCC
164
CGCCGGCTTC
CAATCCCGGT
TCCCCACCGC
CGCCGACCAC
CGCCAACGAC
CCGTCGCCCC
CCGCCACGCC
AACAGATGCC
CGCCGTCCGG
GGTCGCGGCT
CTGTCTCAAC
GCCTGCGCCG GAAGCGCCGG 300
CCCGATCATC ATTCCCCCGT 360
ACCGCCGACG ACGCCGGTGA 420
GCCGGTGACC ACGCCGCCAA 480
GCCGCCGACC ACGCCGGTGA 540
GACGACGGTC GCTCCGACCA 600
GACGACCGTC GCTCCGCAGC 660
AACCCAGCAG CAGACCGTGG 720
TGGCCGCAAC GGCAGCGGCG 780
TCACTACGGT CGGAGGACAT 840
GA 882
(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO:134:
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 134:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 815 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: DNA (genomová)
(xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 134:
CCATCAACCA ACCGCTCGCG CCGCCCGCGC CGCCGGATCC GCCGTCGCCG CCACGCCCGC 60
CGGTGCCTCC GGTGCCCCCG TTGCCGCCGT CGCCGCCGTC GCCGCCGACC GGCTGGGTGC 120
CTAGGGCGCT GTTACCGCCC TGGTTGGCGG GGACGCCGCC GGCACCACCG GTACCGCCGA 180
TGGCGCCGTT GCCGCCGGCG GCACCGTTGC CACCGTTGCC ACCGTTGCCA CCGTTGCCGA 240
CCAGCCACCC GCCGCGACCA CCGGCACCGC CGGCGCCGCC CGCACCGCCG GCGTGCCCGT 300
TCGTGCCCGT ACCGCCGGCA CCGCCGTTGC CGCCGTCACC GCCGACGGAA CTACCGGCGG 360
ACGCGGCCTG CCCGCCGGCG CCGCCCGCAC CGCCATTGGC ACCGCCGTCA CCGCCGGCTG 420
GGAGTGCCGC GATTAGGGCA CTGACCGGCG CAACCAGCGC AAGTACTCTC GGTCACCGAG 480
CACTTCCAGA CGACACCACA GCACGGGGTT GTCGGCGGAC TGGGTGAAAT GGCAGCCGAT 540
• 4
165 4 4 • 4 • • 4 • · 4 4 • 4 44*4 • · 4 4 4 ·· · · 4·· 4 4 4 4 4 4 4 • ♦ · 4 4 4 ·· *· 44 4 · 4 4 • 4 • «44 • 4 ·
AGCGGCTAGC TGTCGGCTGC GGTCAACCTC GATCATGATG TCGAGGTGAC CGTGACCGCG 600
CCCCCCGAAG GAGGCGCTGA ACTCGGCGTT GAGCCGATCG GCGATCGGTT GGGGCAGTGC 660
CCAGGCCAAT ACGGGGATAC CGGGTGTCNA AGCCGCCGCG AGCGCAGCTT CGGTTGCGCG 720
ACNGTGGTCG GGGTGGCCTG TTACGCCGTT GTCNTCGAAC ACGAGTAGCA GGTCTGCTCC 1 780
GGCGAGGGCA TCCACCACGC GTTGCGTCAG CTCGT 815
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 135:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 1152 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: DNA (genomová) (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 135:
ACCAGCCGCC GGCTGAGGTC TCAGATCAGA GAGTCTCCGG ACTCACCGGG GCGGTTCAGC 60
CTTCTCCCAG AACAACTGCT GAAGATCCTC GCCCGCGAAA CAGGCGCTGA TTTGACGCTC 120
TATGACCGGT TGAACGACGA GATCATCCGG CAGATTGATA TGGCACCGCT GGGCTAACAG 180
GTGCGCAAGA TGGTGCAGCT GTATGTCTCG GACTCCGTGT CGCGGATCAG CTTTGCCGAC 240
GGCCGGGTGA TCGTGTGGAG CGAGGAGCTC GGCGAGAGCC AGTATCCGAT CGAGACGCTG 300
GACGGCATCA CGCTGTTTGG GCGGCCGACG ATGACAACGC CCTTCATCGT TGAGATGCTC 360
AAGCGTGAGC GCGACATCCA GCTCTTCACG ACCGACGGCC ACTACCAGGG CCGGATCTCA 420
ACACCCGACG TGTCATACGC GCCGCGGCTC CGTCAGCAAG TTCACCGCAC CGACGATCCT 480
GCGTTCTGCC TGTCGTTAAG CAAGCGGATC GTGTCGAGGA AGATCCTGAA TCAGCAGGCC 540
TTGATTCGGG CACACACGTC GGGGCAAGAC GTTGCTGAGA GCATCCGCAC GATGAAGCAC 600
TCGCTGGCCT GGGTCGATCG ATCGGGCTCC CTGGCGGAGT TGAACGGGTT CGAGGGAAAT 660
GCCGCAAAGG CATACTTCAC CGCGCTGGGG CATCTCGTCC CGCAGGAGTT CGCATTCCAG 720
GGCCGCTCGA CTCGGCCGCC GTTGGACGCC TTCAACTCGA TGGTCAGCCT CGGCTATTCG 780
CTGCTGTACA AGAACATCAT AGGGGCGATC GAGCGTCACA GCCTGAACGC GTATATCGGT 840
TTCCTACACC AGGATTCACG AGGGCACGCA ACGTCTCGTG CCGAATTCGG CACGAGCTCC 900
• 44 ··· • » · · · 9 a tl 4 4 • « · 4 t 4 4 4«
4444444 4 4
444444 44 44 44 44
166
GCTGAAACCG CTGGCCGGCT GCTCAGTGCC CGTACGTAAT CCGCTGCGCC CAGGCCGGCC 960
CGCCGGCCGA ATACCAGCAG ATCGGACAGC GAATTGCCGC CCAGCCGGTT GGAGCCGTGC 1020
ATACCGCCGG CACACTCACC GGCAGCGAAC AGGCCTGGCA CCGTGGCGGC GCCGGTGTCC 1080
GCGTCTACTT CGACACCGCC CATCACGTAG TGACACGTCG GCCCGACTTC CATTGCCTGC 1140
GTTCGGCACG AG 1152 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 136:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 655 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: DNA (genomová) (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 136:
CTCGTGCCGA TTCGGCAGGG TGTACTTGCC GGTGGTGTAN GCCGCATGAG TGCCGACGAC 60
CAGCAATGCG GCAACAGCAC GGATCCCGGT CAACGACGCC ACCCGGTCCA CGTGGGCGAT 120
CCGCTCGAGT CCGCCCTGGG CGGCTCTTTC CTTGGGCAGG GTCATCCGAC GTGTTTCCGC 180
CGTGGTTTGC CGCCATTATG CCGGCGCGCC GCGTCGGGCG GCCGGTATGG CCGAANGTCG 240
ATCAGCACAC CCGAGATACG GGTCTGTGCA AGCTTTTTGA GCGTCGCGCG GGGCAGCTTC 300
GCCGGCAATT CTACTAGCGA GAAGTCTGGC CCGATACGGA TCTGACCGAA GTCGCTGCGG 360
TGCAGCCCAC CCTCATTGGC GATGGCGCCG ACGATGGCGC CTGGACCGAT CTTGTGCCGC 420
TTGCCGACGG CGACGCGGTA GGTGGTCAAG TCCGGTCTAC GCTTGGGCCT TTGCGGACGG 480
TCCCGACGCT GGTCGCGGTT GCGCCGCGAA AGCGGCGGGT CGGGTGCCAT CAGGAATGCC 540
TCACCGCCGC GGCACTGCAC GGCCAGTGCC GCGGCGATGT CAGCCATCGG GACATCATGC 600
TCGCGTTCAT ACTCCTCGAC CAGTCGGCGG AACAGCTCGA TTCCCGGACC GCCCA 655
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 137:
(i) CHARAKTERIŠTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 267 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: DNA (genomová) (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 137:
»· ·· ·· ·« ·· ,· ···· »·· ··«* . · ·· · · ··· · · · · • · ··· ·· »« «·· ««· ······· · a ···· ·» »· ·· ·· ,,
167
Asn Ala Val Val Ala Phe Ala Val Ile Gly Phe Ala Ser Leu Ala Val
1 5 10 15
Ala Val Ala Val Thr Ile Arg Pro Thr Ala Ala Ser Lys Pro Val Glu
20 25 30
Gly His Gin Asn Ala Gin Pro Gly Lys Phe Met Pro Leu Leu Pro Thr
35 40 45
Gin Gin Gin Ala Pro Val Pro Pro Pro Pro Pro Asp Asp Pro Thr Ala
50 55 60
Gly Phe Gin Gly Gly Thr Ile Pro Ala Val Gin Asn Val Val Pro Arg
65 70 75 80
Pro Gly Thr Ser Pro Gly Val Gly Gly Thr Pro Ala Ser Pro Ala Pro
85 90 95
Glu Ala Pro Ala Val Pro Gly Val Val Pro Ala Pro Val Pro Ile Pro
100 105 110
Val Pro Ile Ile Ile Pro Pro Phe Pro Gly Trp Gin Pro Gly Met Pro
115 120 125
Thr Ile Pro Thr Ala Pro Pro Thr Thr Pro Val Thr Thr Ser Ala Thr
130 135 140
Thr Pro Pro Thr Thr Pro Pro Thr Thr Pro Val Thr Thr Pro Pro Thr
145 150 155 160
Thr Pro Pro Thr Thr Pro Val Thr Thr Pro Pro Thr Thr Pro Pro Thr
165 170 175
Thr Pro Val Thr Thr Pro Pro Thr Thr Val Ala Pro Thr Thr Val Ala
180 185 190
Pro Thr Thr Val Ala Pro Thr Thr Val Ala Pro Thr Thr Val Ala Pro
195 200 205
Ala Thr Ala Thr Pro Thr Thr Vál Ala Pro Gin Pro Thr Gin Gin Pro
210 215 220
Thr Gin Gin Pro Thr Gin Gin Met Pro Thr Gin Gin Gin Thr Val Ala
225 230 235 240
Pro Gin Thr Val Ala Pro Ala Pro Gin Pro Pro Ser Gly Gly Arg Asn 245 250 255 ·· ·· ·· • · · ···· ··
Gly Ser Gly Gly Gly Asp Leu Phe Gly Gly Phe
260 265 ·· • 9 • ··· • · 4 • · 4 ft ··
168 (2, Informace o sekvenci SEQ ID NO: 138:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 174 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: peptid (Xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 138:
Ile 1 Asn Gin Pro Leu 5 Ala Pro Pro Ala Pro 10 Pro Asp Pro Pro Ser 15 Pro
Pro Arg Pro Pro 20 Val Pro Pro Val Pro 25 Pro Leu Pro Pro Ser 30 Pro Pro
Ser Pro Pro 35 Thr Gly Trp Val Pro 40 Arg Ala Leu Leu Pro 45 Pro Trp Leu
Ala Gly 50 Thr Pro Pro Ala Pro 55 Pro Val Pro Pro Met 60 Ala Pro Leu Pro
Pro 65 Ala Ala Pro Leu Pro 70 Pro Leu Pro Pro Leu 75 Pro Pro Leu Pro Thr 80
Ser His Pro Pro Arg 85 Pro Pro Ala Pro Pro 90 Ala Pro Pro Ala Pro 95 Pro
Ala Cys Pro Phe 100 Val Pro Val Pro Pro 105 Ala Pro Pro Leu Pro 110 Pro Ser
Pro Pro Thr 115 Glu Leu Pro Ala Asp 120 Ala Ala Cys Pro Pro 125 Ala Pro Pro
Ala Pro 130 Pro Leu Ala Pro Pro 135 Ser Pro Pro Ala Gly 140 Ser Ala Ala Ile
Arg 145 Ala Leu Thr Gly Ala 150 Thr Ser Ala Ser Thr 155 Leu Gly His Arg Ala 160
Leu Pro Asp Asp Thr Thr Ala Arg Gly Cys Arg Arg Thr Gly 165 170 • ·
169 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 139:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 35 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: peptid (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 139:
Gin 1 Pro Pro Ala Glu 5 Val Ser Asp Gin Arg 10 Val Ser Gly Leu Thr 15 Gly
Ala Val Gin Pro Ser Pro Arg Thr Thr Ala Glu Asp Pro Arg Pro Arg
25 30
Asn Arg Arg 35 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 140:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 104 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: peptid (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 140:
Arg 1 Ala Asp Ser Ala 5 Gly Cys Thr Cys Arg 10 Trp Cys Xaa Pro His 15 Glu
Cys Arg Arg Pro 20 Ala Met Arg Gin Gin 25 His Gly Ser Arg Ser 30 Thr Thr
Pro Pro Gly 35 Pro Arg Gly Arg Ser 40 Ala Arg Val Arg Pro 45 Gly Arg Leu
Phe Pro 50 Trp Ala Gly Ser Ser 55 Asp Val Phe Pro Pro 60 Trp Phe Ala Ala
Ile 65 Met Pro Ala Arg Arg 70 Val Gly Arg Pro Val 75 Trp Pro Xaa Val Asp 80
Gin His Thr Arg Asp Thr Gly Leu Cys Lys Leu Phe Glu Arg Arg Ala
90 95
Gly Gin Leu Arg Arg Gin Phe Tyr
100
170 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 141:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 53 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (A) POPIS: primer PCR (vi) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANIZMUS: Mycobacterium tuberculosis (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 141:
GGATCCATAT GGGCCATCAT CATCATCATC ACGTGATCGA CATCATCGGG ACC (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 142:
(i) CHARAKTERIŠTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 42 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (A) POPIS: primer PCR (vi) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANIZMUS: Mycobacterium tuberculosis (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 142:
CCTGAATTCA GGCCTCGGTT GCGCCGGCCT CATCTTGAAC GA (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 143:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 31 nukleová kyselina (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (A) POPIS: primer PCR (vi) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANIZMUS: Mycobacterium tuberculosis (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 143:
171
GGATCCTGCA GGCTCGAAAC CACCGAGCGG T (2)
Informace (i) o sekvenci SEQ ID NO: 144:
CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 31 nukleová kyselina (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární TYP MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (A) POPIS: primer PCR (vi) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANIZMUS: Mycobacterium tuberculosis (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 144:
(ii:
CTCTGAATTC AGCGCTGGAA ATCGTCGCGA T (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 145:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 33 nukleová kyselina (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (A) POPIS: primer PCR (vi) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANIZMUS: Mycobacterium tuberculosis (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 145:
GGATCCAGCG CTGAGATGAA GACCGATGCC GCT (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 146:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 33 nukleová kyselina (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (A) POPIS: primer PCR (vi) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANIZMUS: Mycobacterium tuberculosis (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 146:
······* · · ···· ·· ·· ··. «· ··
172
GAGAGAATTC TCAGAAGCCC ATTTGCGAGG ACA (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 147:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 1993 nukleová kyselina (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: DNA (genomová) (vi) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANIZMUS: Mycobacteríum tuberculosis (ix) RYSY:
(A) JMÉNO/KLÍČ: CDS (B) POZICE: 152..1237
(xi) POPIS SEKVENCE: ; SEQ ID NO: 147:
TGTTCTTCGA CGGCAGGCTG GTGGAGGAAG GGCCCACCGA ACAGCTGTTC TCCTCGCCGA 60
AGCATGCGGA AACCGCCCGA TACGTCGCCG GACTGTCGGG GGACGTCAAG GACGCCAAGC 120
GCGGAAATTG AAGAGCACAG AAAGGTATGG C GTG AAA Val Lys 1 ATT CGT TTG Ile Arg Leu 5 CAT ACG His Thr 172
CTG TTG Leu Leu GCC GTG Ala Val 10 TTG Leu ACC GCT GCG CCG CTG CTG CTA GCA GCG GCG Ala GGC Gly 220
Thr Ala Ala 15 Pro Leu Leu Leu Ala 20 Ala
TGT GGC TCG AAA CCA CCG AGC GGT TCG CCT GAA ACG GGC GCC GGC GCC 268
Cys Gly Ser Lys Pro Pro Ser Gly Ser Pro Glu Thr Gly Ala Gly Ala
25 30 35
GGT ACT GTC GCG ACT ACC CCC GCG TCG TCG CCG GTG ACG TTG GCG GAG 316
Gly Thr Val Ala Thr Thr Pro Ala Ser Ser Pro Val Thr Leu Ala Glu
40 45 50 55
ACC GGT AGC ACG CTG CTC TAC CCG CTG TTC AAC CTG TGG GGT CCG GCC 364
Thr Gly Ser Thr Leu Leu Tyr Pro Leu Phe Asn Leu Trp Gly Pro Ala
65 70 ·····»· · · ···· ·· ·· ·· *· ·«
173
TTT Phe CAC GAG AGG TAT CCG AAC GTC ACG ATC ACC GCT CAG GGC ACC GGT Gly 412
His Glu Arg 75 Tyr Pro Asn Val Thr Ile 80 Thr Ala Gin Gly 85 Thr
TCT GGT GCC GGG ATC GCG CAG GCC GCC GCC GGG ACG GTC AAC ATT GGG 4 60
Ser Gly Ala Gly Ile Ala Gin Ala Ala Ala Gly Thr Val Asn Ile Gly
90 95 100
GCC TCC GAC GCC TAT CTG TCG GAA GGT GAT ATG GCC GCG CAC AAG GGG 508
Ala Ser Asp Ala Tyr Leu Ser Glu Gly Asp Met Ala Ala His Lys Gly
105 110 115
CTG ATG AAC ATC GCG CTA GCC ATC TCC GCT CAG CAG GTC AAC TAC AAC 556
Leu Met Asn Ile Ala Leu Ala Ile Ser Ala Gin Gin Val Asn Tyr Asn
120 125 130 135
CTG CCC GGA GTG AGC GAG CAC CTC AAG CTG AAC GGA AAA GTC CTG GCG 604
Leu Pro Gly Val Ser Glu His Leu Lys Leu Asn Gly Lys Val Leu Ala
140 145 150
GCC ATG TAC CAG GGC ACC ATC AAA ACC TGG GAC GAC CCG CAG ATC GCT 652
Ala Met Tyr Gin Gly Thr Ile Lys Thr Trp Asp Asp Pro Gin Ile Ala
155 160 165
GCG CTC AAC CCC GGC GTG AAC CTG CCC GGC ACC GCG GTA GTT CCG CTG 700
Ala Leu Asn Pro Gly Val Asn Leu Pro Gly Thr Ala Val Val Pro Leu
170 175 180
CAC CGC TCC GAC GGG TCC GGT GAC ACC TTC TTG TTC ACC CAG TAC CTG 748
His Arg Ser Asp Gly Ser Gly Asp Thr Phe Leu Phe Thr Gin Tyr Leu
185 190 195
TCC AAG CAA GAT CCC GAG GGC TGG GGC AAG TCG CCC GGC TTC GGC ACC 796
Ser Lys Gin Asp Pro Glu Gly Trp Gly Lys Ser Pro Gly Phe Gly Thr
200 205 210 215
ACC GTC GAC TTC CCG GCG GTG CCG GGT GCG CTG GGT GAG AAC GGC AAC 844
Thr Val Asp Phe Pro Ala Val Pro Gly Ala Leu Gly Glu Asn Gly Asn
220 225 230
GGC GGC ATG GTG ACC GGT TGC GCC GAG ACA CCG GGC TGC GTG GCC TAT 892
Gly Gly Met Val Thr Gly Cys Ala Glu Thr Pro Gly Cys Val Ala Tyr
235 240 245
ATC GGC ATC AGC TTC CTC GAC CAG GCC AGT CAA CGG GGA CTC GGC GAG 940
Ile Gly Ile Ser Phe Leu Asp Gin Ala Ser Gin Arg Gly Leu Gly Glu
250 255 260
GCC CAA CTA GGC AAT AGC TCT GGC AAT TTC TTG TTG CCC GAC GCG CAA 988
Ala Gin Leu Gly Asn Ser Ser Gly Asn Phe Leu Leu Pro Asp Ala Gin
265 270 275
AGC ATT CAG GCC GCG GCG GCT GGC TTC GCA TCG AAA ACC CCG GCG AAC 1036
Ser Ile Gin Ala Ala Ala Ala Gly Phe Ala Ser Lys Thr Pro Ala Asn
• · · · · · ···· ·· · · · ·
174
280 285 290 295
CAG GCG ATT TCG ATG ATC GAC GGG CCC GCC CCG GAC GGC TAC CCG ATC 1084
Gin Ala lle Ser Met lle Asp Gly Pro Ala Pro Asp Gly Tyr Pro lle
300 305 310
ATC AAC TAC GAG TAC GCC ATC GTC AAC AAC CGG CAA AAG GAC GCC GCC 1132
lle Asn Tyr Glu Tyr Ala lle Val Asn Asn Arg Gin Lys Asp Ala Ala
315 320 - 325
ACC GCG CAG ACC TTG CAG GCA TTT CTG CAC TGG GCG ATC ACC GAC GGC 1180
Thr Ala Gin Thr Leu Gin Ala Phe Leu His Trp Ala lle Thr Asp Gly
330 335 340
AAC AAG GCC TCG TTC CTC GAC CAG GTT CAT TTC CAG CCG CTG CCG CCC 1228
Asn Lys Ala Ser Phe Leu Asp Gin Val His Phe Gin Pro Leu Pro Pro
345 350 355
GCG GTG GTG AAG TTG TCT GAC GCG Ala Val Val Lys Leu Ser Asp Ala : 360 365 TTG ATC GCG Leu lle Ala 370 ACG ATT TCC AGC Thr lle Ser Ser 1273
TAGCCTCGTT GACCACCACG CGACAGCAAC CTCCGTCGGG CCATtGGGCT GCTTTGCGGA 1333
GCATGCTGGC CCGTGCCGGT GAAGTCGGCC GCGCTGGCCC GGCCATCCGG TGGTTGGGTG 1393
GGATAGGTGC GGTGATCCCG CTGCTTGCGC TGGTCTTGGT GCTGGTGGTG CTGGTCATCG 1453
AGGCGATGGG TGCGATCAGG CTCAACGGGT TGCATTTCTT CACCGCCACC GAATGGAATC 1513
CAGGCAACAC CTACGGCGAA ACCGTTGTCA CCGACGCGTC GCCCATCCGG TCGGCGCCTA 1573
CTACGGGGCG TTGCCGCTGA TCGTCGGGAC GCTGGCGACC TCGGCAATCG CCCTGATCAT 1633
CGCGGTGCCG GTCTCTGTAG GAGCGGCGCT GGTGATCGTG GAACGGCTGC CGAAACGGTT 1693
GGCCGAGGCT GTGGGAATAG TCCTGGAATT GCTCGCCGGA ATCCCCAGCG TGGTCGTCGG 1753
TTTGTGGGGG GCAATGACGT TCGGGCCGTT CATCGCTCAT CACATCGCTC CGGTGATCGC 1813
TCACAACGCT CCCGATGTGC CGGTGCTGAA CTACTTGCGC GGCGACCCGG GCAACGGGGA 1873
GGGCATGTTG GTGTCCGGTC TGGTGTTGGC GGTGATGGTC GTTCCCATTA TCGCCACCAC 1933
CACTCATGAC CTGTTCCGGC AGGTGCCGGT GTTGCCCCGG GAGGGCGCGA TCGGGAATTC 1993
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 148:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 374 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: protein (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 148:
• · ······· · · ···· ·· ·· ·· ·· ··
175
Val Lys 1 Ile Arg Leu 5 His Thr Leu Leu Ala Val Leu Thr Ala Ala Pro
10 15
Leu Leu Leu Ala Ala Ala Gly Cys Gly Ser Lys Pro Pro Ser Gly Ser
20 25 30
Pro Glu Thr Gly Ala Gly Ala Gly Thr Val Ala Thr Thr Pro Ala Ser
35 40 45
Ser Pro Val Thr Leu Ala Glu Thr Gly Ser Thr Leu Leu Tyr Pro Leu
50 55 60
Phe Asn Leu Trp Gly Pro Ala Phe His Glu Arg Tyr Pro Asn Val Thr
65 70 75 80
Ile Thr Ala Gin Gly Thr Gly Ser Gly Ala Gly Ile Ala Gin Ala Ala
85 90 95
Ala Gly Thr Val Asn Ile Gly Ala Ser Asp Al a Tyr Leu Ser Glu Gly
100 105 110
Asp Met Ala Ala His Lys Gly Leu Met Asn Ile Ala Leu Ala Ile Ser
115 120 125
Ala Gin Gin Val Asn Tyr Asn Leu Pro Gly Val Ser Glu His Leu Lys
130 135 140
Leu Asn Gly Lys Val Leu Ala Ala Met Tyr Gin Gly Thr Ile Lys Thr
145 150 155 160
Trp Asp Asp Pro Gin Ile Ala Ala Leu Asn Pro Gly Val Asn Leu Pro
165 170 175
Gly Thr Ala Val Val Pro Leu His Arg Ser Asp Gly Ser Gly Asp Thr
180 185 190
Phe Leu Phe Thr Gin Tyr Leu Ser Lys Gin Asp Pro Glu Gly Trp Gly
195 200 205
Lys Ser Pro Gly Phe Gly Thr Thr Val Asp Phe Pro Ala Val Pro Gly
210 215 220
Ala Leu Gly Glu Asn Gly Asn Gly Gly Met Val Thr Gly Cys Ala Glu
225 230 235 240
Thr Pro Gly Cys Val Ala Tyr Ile Gly Ile Ser Phe Leu Asp Gin Ala
245 250 255
Ser Gin Arg Gly Leu Gly Glu Ala Gin Leu Gly Asn Ser Ser Gly Asn
260 265 270
• · ·«·«·>· · · • ··· · ·· · · ·· ··
176
Phe Leu Leu 275 Pro Asp Ala Gin Ser 280 lle Gin Ala Ala Ala 285 Ala Gly Phe
Ala Ser 290 Lys Thr Pro Ala Asn 295 • Gin Ala lle Ser Met 300 lle Asp Gly Pro
Ala 305 Pro Asp Gly Tyr Pro 310 lle lle Asn Tyr Glu 315 Tyr Ala lle Val Asn 320
Asn Arg Gin Lys Asp 325 Ala Ala Thr Ala Gin 330 Thr Leu Gin Ala Phe 335 Leu
His Trp Ala lle 340 Thr Asp Gly Asn Lys 345 Ala Ser Phe Leu Asp 350 Gin Val
His Phe Gin 355 Pro Leu Pro Pro Ala 360 Val Val Lys Leu Ser 365 Asp Ala Leu
lle Ala 370 Thr lle Ser Ser
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 149:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 1993 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 149:
TGTTCTTCGA CGGCAGGCTG GTGGAGGAAG GGCCCACCGA ACAGCTGTTC TCCTCGCCGA 60
AGCATGCGGA AACCGCCCGA TACGTCGCCG GACTGTCGGG GGACGTCAAG GACGCCAAGC 120
GCGGAAATTG AAGAGCACAG AAAGGTATGG CGTGAAAATT CGTTTGCATA CGCTGTTGGC 180
CGTGTTGACC GCTGCGCCGC TGCTGCTAGC AGCGGCGGGC TGTGGCTCGA AACCACCGAG 240
CGGTTCGCCT GAAACGGGCG CCGGCGCCGG TACTGTCGCG ACTACCCCCG CGTCGTCGCC 300
GGTGACGTTG GCGGAGACCG GTAGCACGCT GCTCTACCCG CTGTTCAACC TGTGGGGTCC 360
GGCCTTTCAC GAGAGGTATC CGAACGTCAC GATCACCGCT CAGGGCACCG GTTCTGGTGC 420
CGGGATCGCG CAGGCCGCCG CCGGGACGGT CAACATTGGG GCCTCCGACG CCTATCTGTC 480
GGAAGGTGAT ATGGCCGCGC ACAAGGGGCT GATGAACATC GCGCTAGCCA TCTCCGCTCA 540
GCAGGTCAAC TACAACCTGC CCGGAGTGAG CGAGCACCTC AAGCTGAACG GAAAAGTCCT 600
• · • ·
177
GGCGGCCATG TACCAGGGCA CCATCAAAAC CTGGGACGAC CCGCAGATCG CTGCGCTCAA 660
CCCCGGCGTG AACCTGCCCG GCACCGCGGT AGTTCCGCTG CACCGCTCCG ACGGGTCCGG 720
TGACACCTTC TTGTTCACCC AGTACCTGTC CAAGCAAGAT CCCGAGGGCT GGGGCAAGTC 780
GCCCGGCTTC GGCACCACCG TCGACTTCCC GGCGGTGCCG GGTGCGCTGG GTGAGAACGG 840
CAACGGCGGC ATGGTGACCG GTTGCGCCGA GACACCGGGC TGCGTGGCCT ATATCGGCAT 900
CAGCTTCCTC GACCAGGCCA GTCAACGGGG ACTCGGCGAG GCCCAACTAG GCAATAGCTC 960
TGGCAATTTC TTGTTGCCCG ACGCGCAAAG CATTCAGGCC GCGGCGGCTG GCTTCGCATC 1020
GAAAACCCCG GCGAACCAGG CGATTTCGAT GATCGACGGG CCCGCCCCGG ACGGCTACCC 1080
GATCATCAAC TACGAGTACG CCATCGTCAA CAACCGGCAA AAGGACGCCG CCACCGCGCA 1140
GACCTTGCAG GCATTTCTGC ACTGGGCGAT CACCGACGGC AACAAGGCCT CGTTCCTCGA 1200
CCAGGTTCAT TTCCAGCCGC TGCCGCCCGC GGTGGTGAAG TTGTCTGACG CGTTGATCGC 1260
GACGATTTCC AGCTAGCCTC GTTGACCACC ACGCGACAGC AACCTCCGTC GGGCCATCGG 1320
GCTGCTTTGC GGAGCATGCT GGCCCGTGCC GGTGAAGTCG GCCGCGCTGG CCCGGCCATC 1380
CGGTGGTTGG GTGGGATAGG TGCGGTGATC CCGCTGCTTG CGCTGGTCTT GGTGCTGGTG 1440
GTGCTGGTCA TCGAGGCGAT GGGTGCGATC AGGCTCAACG GGTTGCATTT CTTCACCGCC 1500
ACCGAATGGA ATCCAGGCAA CACCTACGGC GAAACCGTTG TCACCGACGC GTCGCCCATC 1560
CGGTCGGCGC CTACTACGGG GCGTTGCCGC TGATCGTCGG GACGCTGGCG ACCTCGGCAA 1620
TCGCCCTGAT CATCGCGGTG CCGGTCTCTG TAGGAGCGGC GCTGGTGATC GTGGAACGGC 1680
TGCCGAAACG GTTGGCCGAG GCTGTGGGAA TAGTCCTGGA ATTGCTCGCC GGAATCCCCA 1740
GCGTGGTCGT CGGTTTGTGG GGGGCAATGA CGTTCGGGCC GTTCATCGCT CATCACATCG 1800
CTCCGGTGAT CGCTCACAAC GCTCCCGATG TGCCGGTGCT GAACTACTTG CGCGGCGACC 1860
CGGGCAACGG GGAGGGCATG TTGGTGTCCG GTCTGGTGTT GGCGGTGATG GTCGTTCCCA 1920
TTATCGCCAC CACCACTCAT GACCTGTTCC GGCAGGTGCC GGTGTTGCCC CGGGAGGGCG 1980
CGATCGGGAA TTC 1993
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 150:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 374 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 150:
--
• · · · ·» ·· · · · · · «
179
Ser Gin Arg Gly Leu Gly Glu Ala Gin 265 Leu Gly Asn Ser Ser 270 Gly Asn
260
Phe Leu Leu Pro Asp , Ala Gin Ser Ile Gin Ala Ala Ala Ala Gly Phe
275 280 285
Ala Ser Lys Thr Pro Ala Asn Gin Ala Ile Ser Met Ile Asp Gly Pro
290 295 300
Ala Pro Asp Gly Tyr Pro Ile Ile Asn Tyr Glu Tyr Ala Ile Val Asn
305 310 315 320
Asn Arg Gin Lys Asp Ala Ala Thr Ala Gin Thr Leu Gin Ala Phe Leu
325 330 335
His Trp Ala Ile Thr Asp Gly Asn Lys Ala Ser Phe Leu Asp Gin Val
340 345 350
His Phe Gin Pro Leu Pro Pro Ala Val Val Lys Leu Ser Asp Ala Leu
355 360 365
Ile Ala Thr Ile Ser Ser
370 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 151:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 1777 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 151:
GGTCTTGACC ACCACCTGGG TGTCGAAGTC GGTGCCCGGA TTGAAGTCCA GGTACTCGTG 60
GGTGGGGCGG GCGAAACAAT AGCGACAAGC ATGCGAGCAG CCGCGGTAGC CGTTGACGGT 120
GTAGCGAAAC GGCAACGCGG CCGCGTTGGG CACCTTGTTC AGCGCTGATT TGCACAACAC 180
CTCGTGGAAG GTGATGCCGT CGAATTGTGG CGCGCGAACG CTGCGGACCA GGCCGATCCG 240
CTGCAACCCG GCAGCGCCCG TCGTCAACGG GCATCCCGTT CACCGCGACG GCTTGCCGGG 300
CCCAACGCAT ACCATTATTC GAACAACCGT TCTATACTTT GTCAACGCTG GCCGCTACCG 360
AGCGCCGCAC AGGATGTGAT ATGCCATCTC TGCCCGCACA GACAGGAGCC AGGCCTTATG 420
ACAGCATTCG GCGTCGAGCC CTACGGGCAG CCGAAGTACC TAGAAATCGC CGGGAAGCGC 480
ATGGCGTATA TCGACGAAGG CAAGGGTGAC GCCATCGTCT TTCAGCACGG CAACCCCACG 540
• · • · · · • ·
180 • · · • · · » · · • · é · · • · · · · · • • ·
TCGTCTTACT TGTGGCGCAA CATCATGCCG CACTTGGAAG GGCTGGGCCG GCTGGTGGCC 600
TGCGATCTGA TCGGGATGGG CGCGTCGGAC AAGCTCAGCC CATCGGGACC CGACCGCTAT 660
AGCTATGGCG AGCAACGAGA CTTTTTGTTC GCGCTCTGGG ATGCGCTCGA CCTCGGCGAC 720
CACGTGGTAC TGGTGCTGCA CGACTGGGGC TCGGCGCTCG GCTTCGACTG GGCTAACCAG 780
CATCGCGACC GAGTGCAGGG GATCGCGTTC ATGGAAGCGA TCGTCACCCC GATGACGTGG 840
GCGGACTGGC CGCCGGCCGT GCGGGGTGTG TTCCAGGGTT TCCGATCGCC TCAAGGCGAG 900
CCAATGGCGT TGGAGCACAA CATCTTTGTC GAACGGGTGC TGCCCGGGGC GATCCTGCGA 960
CAGCTCAGCG ACGAGGAAAT GAACCACTAT CGGCGGCCAT TCGTGAACGG CGGCGAGGAC 1020
CGTCGCCCCA CGTTGTCGTG GCCACGAAAC CTTCCAATCG ACGGTGAGCC CGCCGAGGTC 1080
GTCGCGTTGG TCAACGAGTA CCGGAGCTGG CTCGAGGAAA CCGACATGCC GAAACTGTTC 1140
ATCAACGCCG AGCCCGGCGC GATCATCACC GGCCGCATCC GTGACTATGT CAGGAGCTGG 1200
CCCAACCAGA CCGAAATCAC AGTGCCCGGC GTGCATTTCG TTCAGGAGGA CAGCGATGGC 1260
GTCGTATCGT GGGCGGGCGC TCGGCAGCAT CGGCGACCTG GGAGCGCTCT CATTTCACGA 1320
GACCAAGAAT GTGATTTCCG GCGAAGGCGG CGCCCTGCTT GTCAACTCAT AAGACTTCCT 1380
GCTCCGGGCA GAGATTCTCA GGGAAAAGGG CACCAATCGC AGCCGCTTCC TTCGCAACGA 1440
GGTCGACAAA TATACGTGGC AGGACAAAGG TCTTCCTATT TGCCCAGCGA ATTAGTCGCT 1500
GCCTTTCTAT GGGCTCAGTT CGAGGAAGCC GAGCGGATCA CGCGTATCCG ATTGGACCTA 1560
TGGAACCGGT ATCATGAAAG CTTCGAATCA TTGGAACAGC GGGGGCTCCT GCGCCGTCCG 1620
ATCATCCCAC AGGGCTGCTC TCACAACGCC CACATGTACT ACGTGTTACT AGCGCCCAGC 1680
GCCGATCGGG AGGAGGTGCT GGCGCGTCTG ACGAGCGAAG GTATAGGCGC GGTCTTTCAT 1740
TACGTGCCGC TTCACGATTC GCCGGCCGGG CGTCGCT 1777
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 152:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 324 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 152:
• ·
I • · · ·
• · · · · · · ···· · · ·· ·· • · • · · ·
181
GAGATTGAAT CGTACCGGTC TCCTTAGCGG CTCCGTCCCG TGAATGCCCA TATCACGCAC 60
GGCCATGTTC TGGCTGTCGA CCTTCGCCCC ATGCCCGGAC GTTGGTAAAC CCAGGGTTTG 120
ATCAGTAATT CCGGGGGACG GTTGCGGGAA GGCGGCCAGG ATGTGCGTGA GCCGCGGCGC 180
CGCCGTCGCC CAGGCGACCG CTGGATGCTC AGCCCCGGTG CGGCGACGTA GCCAGCGTTT 240
GGCGCGTGTC GTCCACAGTG GTACTCCGGT GACGACGCGG CGCGGTGCCT GGGTGAAGAC 300
CGTGACCGAC GCCGCCGATT CAGA 324
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 153:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 1338 párů baží
(B) TYP: nukleová kyselina
(C) DRUH ŘETĚZCE: j ednořetězcová
(D) TOPOLOGIE: lineární
(xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 153:
GCGGTACCGC CGCGTTGCGC TGGCACGGGA CCTGTACGAC CTGAACCACT TCGCCTCGCG 60
AACGATTGAC GAACCGCTCG TGCGGCGGCT GTGGGTGCTC AAGGTGTGGG GTGATGTCGT 120
CGATGACCGG CGCGGCACCC GGCCACTACG CGTCGAAGAC GTCCTCGCCG CCCGCAGCGA 180
GCACGACTTC CAGCCCGACT CGATCGGCGT GCTGACCCGT CCTGTCGCTA TGGCTGCCTG 240
GGAAGCTCGC GTTCGGAAGC GATTTGCGTT CCTCACTGAC CTCGACGCCG ACGAGCAGCG 300
GTGGGCCGCC TGCGACGAAC GGCACCGCCG CGAAGTGGAG AACGCGCTGG CGGTGCTGCG 360
GTCCTGATCA ACCTGCCGGC GATCGTGCCG TTCCGCTGGC ACGGTTGCGG CTGGACGCGG 420
CTGAATCGAC TAGATGAGAG CAGTTGGGCA CGAATCCGGC TGTGGTGGTG AGCAAGACAC 480
GAGTACTGTC ATCACTATTG GATGCACTGG ATGACCGGCC TGATTCAGCA GGACCAATGG 540
AACTGCCCGG GGCAAAACGT CTCGGAGATG ATCGGCGTCC CCTCGGAACC CTGCGGTGCT 600
GGCGTCATTC GGACATCGGT CCGGCTCGCG GGATCGTGGT GACGCCAGCG CTGAAGGAGT 660
GGAGCGCGGC GGTGCACGCG CTGCTGGACG GCCGGCAGAC GGTGCTGCTG CGTAAGGGCG 720
GGATCGGCGA GAAGCGCTTC GAGGTGGCGG CCCACGAGTT CTTGTTGTTC CCGACGGTCG 780
CGCACAGCCA CGCCGAGCGG GTTCGCCCCG AGCACCGCGA CCTGCTGGGC CCGGCGGCCG 840
182
CCGACAGCAC CGACGAGTGT GTGCTACTGC GGGCCGCAGC GAAAGTTGTT GCCGCACTGC 900
CGGTTAACCG GCCAGAGGGT CTGGACGCCA TCGAGGATCT GCACATCTGG ACCGCCGAGT 960
CGGTGCGCGC CGACCGGCTC GACTTTCGGC CCAAGCACAA ACTGGCCGTC TTGGTGGTCT 1020
CGGCGATCCC GCTGGCCGAG CCGGTCCGGC TGGCGCGTAG GCCCGAGTAC GGCGGTTGCA 1080
CCAGCTGGGT GCAGCTGCCG GTGACGCCGA CGTTGGCGGC GCCGGTGCAC GACGAGGCCG 1140
CGCTGGCCGA GGTCGCCGCC CGGGTCCGCG AGGCCGTGGG TTGACTGGGC GGCATCGCTT 1200
GGGTCTGAGC TGTACGCCCA GTCGGCGCTG CGAGTGATCT GCTGTCGGTT CGGTCCCTGC 1260
TGGCGTCAAT TGACGGCGCG GGCAACAGCA GCATTGGCGG CGCCATCCTC CGCGCGGCCG 1320
GCGCCCACCG CTACAACC 1338 (2) Informace o sekvenci SÉQ ID NO: 154:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 321 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 154:
CCGGCGGCAC CGGCGGCACC GGCGGTACCG GCGGCAACGG CGCTGACGCC GCTGCTGTGG 60
TGGGCTTCGG CGCGAACGGC GACCCTGGCT TCGCTGGCGG CAAAGGCGGT AACGGCGGAA 120
TAGGTGGGGC CGCGGTGACA GGCGGGGTCG CCGGCGACGG CGGCACCGGC GGCAAAGGTG 180
GCACCGGCGG TGCCGGCGGC GCCGGCAACG ACGCCGGCAG CACCGGCAAT CCCGGCGGTA 240
AGGGCGGCGA CGGCGGGATC GGCGGTGCCG GCGGGGCCGG CGGCGCGGCC GGCACCGGCA 300
ACGGCGGCCA TGCCGGCAAC C 321
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 155:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 492 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 155:
• · • ·
183 (xi) SEQUENCE DEŠCRIPTION: SEQ ID NO:155:
GAAGACCCGG CCCCGCCATA TCGATCGGCT CGCCGACTAC TTTCGCCGAA CGTGCACGCG 60
GCGGCGTCGG GCTGATCATC ACCGGTGGCT ACGCGCCCAA CCGCACCGGA TGGCTGCTGC 120
CGTTCGCCTC CGAACTCGTC ACTTCGGCGC AAGCCCGACG GCACCGCCGA ATCACCAGGG 180
CGGTCCACGA TTCGGGTGCA AAGATCCTGC TGCAAATCCT GCACGCCGGA CGCTACGCCT 240
ACCACCCACT TGCGGTCAGC GCCTCGCCGA TCAAGGCGCC GATCACCCCG TTTCGTCCGC 300
GAGCACTATC GGCTCGCGGG GTCGAAGCGA CCATCGCGGA TTTCGCCCGC TGCGCGCAGT 360
TGGCCCGCGA TGCCGGCTAC GACGGCGTCG AAATCATGGG CAGCGAAGGG TATCTGCTCA 420
ATCAGTTCCT GGCGCCGCGC ACCAACAAGC GCACCGACTC GTGGGGCGGC ACACCGGCCA 480
ACCGTCGCCG GT 4 92
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 156:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 536 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE:
(D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 156:
Phe Ala Gin His Leu Val Glu Gly Asp Ala Val Glu Leu Trp Arg Ala 15 10 15
Asn Ala Ala Asp Gin Ala Asp Pro Leu Gin Pro Gly Ser Ala Arg Arg 20 25 30
Gin Arg Ala Ser Arg Ser Pro Arg Arg Leu Ala Gly Pro Asn Ala Tyr 35 40 45
His Tyr Ser Asn Asn Arg Ser Ile Leu Cys Gin Arg Trp Pro Leu Pro 50 55 . 60
Ser Ala Ala Gin Asp Val Ile Cys His Leu Cys Pro His Arg Gin Glu
70 75 80
Pro Gly Leu Met Thr Ala Phe Gly Val Glu Pro Tyr Gly Gin Pro Lys
90 95
Tyr Leu Glu Ile Ala Gly Lys Arg Met Ala Tyr Ile Asp Glu Gly Lys
184
100 105 110
Gly Asp Ala 115 Ile Val Phe Gin His Gly Asn Pro Thr Ser Ser Tyr Leu
120 125
Trp Arg Asn Ile Met Pro His Leu Glu Gly Leu Gly Arg Leu Val Ala
130 135 140
Cys Asp Leu Ile Gly Met Gly Ala Ser Asp Lys Leu Ser Pro Ser Gly
145 150 155 160
Pro Asp Arg Tyr Ser Tyr Gly Glu Gin Arg Asp Phe Leu Phe Ala Leu
165 170 175
Trp Asp Ala Leu Asp Leu Gly Asp His Val Val Leu Val Leu His Asp
180 185 190
Trp Gly Ser Ala Leu Gly Phe Asp Trp Ala Asn Gin His Arg Asp Arg
195 200 205
Val Gin Gly Ile Ala Phe Met Glu Ala Ile Val Thr Pro Met Thr Trp
210 215 220
Ala Asp Trp Pro Pro Ala Val Arg Gly Val Phe Gin Gly Phe Arg Ser
225 230 235 240
Pro Gin Gly Glu Pro Met Ala Leu Glu His Asn Ile Phe Val Glu Arg
245 250 255
Val Leu Pro Gly Ala Ile Leu Arg Gin Leu Ser Asp Glu Glu Met Asn
260 265 270
His Tyr Arg Arg Pro Phe Val Asn Gly Gly Glu Asp Arg Arg Pro Thr
275 280 285
Leu Ser Trp Pro Arg Asn Leu Pro Ile Asp Gly Glu Pro. Ala Glu Val
290 295 300
Val Ala Leu Val Asn Glu Tyr Arg Ser Trp Leu Glu Glu Thr Asp Met
305 310 315 320
Pro Lys Leu Phe Ile Asn Ala Glu Pro Gly Ala Ile Ile Thr Gly Arg
325 330 335
Ile Arg Asp Tyr Val Arg Ser Trp Pro Asn Gin Thr Glu Ile Thr Val
340 345 350
Pro Gly Val His Phe Val Gin Glu Asp Ser Asp Gly Val Val Ser Trp
355 360 365
Ala Gly Ala Arg Gin His Arg Arg Pro Gly Ser Ala Leu Ile Ser Arg
370 375 380
Asp Gin Glu Cys Asp Phe Arg Arg Arg Arg Arg Pro Ala Cys Gin Leu
385 390 395 400
• ·
0 0 0 0 0 0 0 ···· ·· ·0 00 00 00
185
Ile Arg Leu Pro Ala 405 Pro Gly Arg Asp Ser 410 Gin Gly Lys Gly His 415 Gin
Ser Gin Pro Leu 420 Pro Ser Gin Arg Gly Arg 425 Gin Ile Tyr Val 430 Ala Gly
Gin Arg Ser 435 Ser Tyr Leu Pro Ser 440 Glu Leu Val Ala Ala 445 Phe Leu Trp
Ala Gin Phe Glu Glu Ala Glu Arg Ile Thr Arg Ile Arg Leu Asp Leu
450 455 460
Trp Asn Arg Tyr His Glu Ser Phe Glu Ser Leu Glu Gin Arg Gly Leu 465 470 475 480
Leu Arg Arg Pro Ile 485 Ile Pro Gin Gly Cys 490 Ser His Asn Ala His 495 Met
Tyr Tyr Val Leu 500 Leu Ala Pro Ser Ala 505 Asp Arg Glu Glu Val 510 Leu Ala
Arg Leu Thr Ser 515 Glu Gly Ile Gly 520 Ala Vci Phe His Tyr 525 Val Pro Leu
His Asp 530 Ser Pro Ala Gly Arg 535 Arg
Informace o sekvenci SEQ ID : NO: 157:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 284 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE:
(D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 157:
Asn 1 Glu Ser Ala Pro 5 Arg Ser Pro Met Leu 10 Pro Ser Ala Arg Pro 15 Arg
Tyr Asp Ala Ile 20 Ala Val Leu Leu Asn 25 Glu Met His Ala Gly 30 His Cys
Asp Phe Gly 35 Leu Val Gly Pro Ala 40 Pro Asp Ile Val Thr 45 Asp Ala Ala
Gly Asp 50 Asp Arg Ala Gly Leu 55 Gly Val Asp Glu Gin 60 Phe Arg His Val
Gly Phe Leu Glu Pro Ala Pro Val Leu Val Asp Gin Arg Asp Asp Leu
000 0000 0 0000 00 00 00 00 00
186
65 70 75 80
Gly Gly Leu Thr Val Asp Trp Lys Val Ser Trp Pro Arg Gin Arg Gly
85 90 95
Ala Thr Val Leu Ala Ala Val His Glu Trp Pro Pro Ile Val Val His
100 105 110
Phe Leu Val Ala Glu Leu Ser Gin Asp Arg Pro Gly Gin His Pro Phe
115 120 125
Asp Lys Asp Val Val Leu Gin Arg His Trp Leu Ala Leu Arg Arg Ser
130 135 140
Glu Thr Leu Glu His Thr Pro His Gly Arg Arg Pro Val Arg Pro Arg
145 150 155 160
His Arg Gly Asp Asp Arg Phe His Glu Arg Asp Pro Leu His Ser Val
165 170 175
Ala Met Leu Val Ser Pro Val Glu Ala Glu Arg Arg Ala Pro Val Val
180 185 190
Gin His Gin Tyr His Val Val Ala Glu Val Glu Arg Ile Pro Glu Arg
195 200 205
Glu Gin Lys Val Ser Leu Leu Ala Ile Ala Ile Ala Val Gly Ser Arg
210 215 220
Trp Ala Glu Leu Val Arg Arg Ala His Pro Asp Gin Ile Ala Gly His
225 230 235 240
Gin Pro Ala Gin Pro Phe Gin Val Arg His Asp Val Ala Pro Gin Val
245 250 255
Arg Arg Arg Gly Val Ala Val Leu Lys Asp Asp Gly Val Thr Leu Ala
260 265 270
Phe Val Asp Ile Arg His Ala Leu Pro Gly Asp Phe
275 280 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 158:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 264 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 158:
< · to to · · ·
187 • ·· • to to • to· · ·· • ···· · · • · · · · ·· ·· ·· • to • to to
ATGAACATGT CGTCGGTGGT GGGTCGCAAG GCCTTTGCGC GATTCGCCGG CTACTCCTCC 60
GCCATGCACG CGATCGCCGG TTTCTCCGAT GCGTTGCGCC AAGAGCTGCG GGGTAGCGGA 120
ATCGCCGTCT CGGTGATCCA CCCGGCGCTG ACCCAGACAC CGCTGTTGGC CAACGTCGAC 180
CCCGCCGACA TGCCGCCGCC GTTTCGCAGC CTCACGCCCA TTCCCGTTCA CTGGGTCGCG 240
GCAGCGGTGC TTGACGGTGT GGCG 264
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 159: (i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE: (A) DÉLKA: 1171 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 159:
TAGTCGGCGA CGATGACGTC GCGGTCCAGG CCGACCGCTT CAAGCACCAG CGCGACCACG 60
AAGCCGGTGC GATCCTTACC CGCGAAGCAG TGGGTGAGCA CCGGGCGTCC GGCGGCAAGC 120
AGTGTGACGA CACGATGTAG CGCGCGCTGT GCTCCATTGC GCGTTGGGAA TTGGCGATAC 180
TCGTCGGTCA TGTAGCGGGT GGCCGCGTCA TTTATCGACT GGCTGGATTC GCCGGACTCG 240
CCGTTGGACC CGTCATTGGT TAGCAGCCTC TTGAATGCGG TTTCGTGCGG CGCTGAGTCG 300
TCGGCGTCAT CATCGGCGAG GTCGGGGAAC GGCAGCAGGT GGACGTCGAT GCCGTCCGGA 360
ACCCGTCCTG GACCGCGGCG GGCAACCTCC CGGGACGACC GCAGGTCGGC AACGTCGGTG 420
ATCCCCAGCC GGCGCAGCGT TGCCCCTCGT GCCGAATTCG GCACGAGGCT GGCGAGCCAC 480
CGGGCATCAC CAAGCAACGC TTGCCCAGTA CGGATCGTCA CTTCCGCATC CGGCAGACCA 540
ATCTCCTCGC CGCCCATCGT CAGATCCCGC TCGTGCGTTG ACAAGAACGG CCGCAGATGT 600
GCCAGCGGGT ATCGGAGATT GAACCGCGCA CGCAGTTCTT CAATCGCTGC GCGCTGCCGC 660
ACTATTGGCA CTTTCCGGCG GTCGCGGTAT TCAGCAAGCA TGCGAGTCTC GACGAACTCG 720
CCCCACGTAA CCCACGGCGT AGCTCCCGGC GTGACGCGGA GGATCGGCGG GTGATCTTTG 780
CCGCCACGCT CGTAGCCGTT GATCCACCGC TTCGCGGTGC CGGCGGGGAG GCCGATCAGC 840
TTATCGACCT CGGCGTATGC CGACGGCAAG CTGGGCGCGT TCGTCGAGGT CAAGAACTCC 900
ACCATCGGCA CCGGCACCAA GGTGCCGCAC CTGACCTACG TCGGCGACGC CGACATCGGC 960
• ·
188
GAGTACAGCA ACATCGGCGC CTCCAGCGTG TTCGTCAACT ACGACGGTAC GTCCAAACGG 1020
CGCACCACCG TCGGTTCGCA CGTACGGACC GGGTCCGACA CCATGTTCGT GGCCCCAGTA 1080
ACCATCGGCG ACGGCGCGTA TACCGGGGCC GGCACAGTGG TGCGGGAGGA TGTCCCGCCG 1140
GGGGCGCTGG CAGTGTCGGC GGGTCCGCAA C 1171
(2) Informace ο sekvenci SEQ ID NO: 160:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 227 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 160:
GCAAAGGCGG CACCGGCGGG GCCGGCATGA ACAGCCTCGA CCCGCTGCTA GCCGCCCAAG 60
ACGGCGGCCA AGGCGGCACC GGCGGCACCG GCGGCAACGC CGGCGCCGGC GGCACCAGCT 120
TCACCCAAGG CGCCGACGGC AACGCCGGCA ACGGCGGTGA CGGCGGGGTC GGCGGCAACG 180
GCGGAAACGG CGGAAACGGC GCAGACAACA CCACCACCGC CGCCGCC 227
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 161:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 304 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 161:
CCTCGCCACC ATGGGCGGGC AGGGCGGTAG CGGTGGCGCC GGCTCTACCC CAGGCGCCAA 60
GGGCGCCCAC GGCTTCACTC CAACCAGCGG CGGCGACGGC GGCGACGGCG GCAACGGCGG 120
CAACTCCCAA GTGGTCGGCG GCAACGGCGG CGACGGCGGC AATGGCGGCA ACGGCGGCAG 180
CGCCGGCACG GGCGGCAACG GCGGCCGCGG CGGCGACGGC GCGTTTGGTG GCATGAGTGC 240
CAACGCCACC AACCCTGGTG AAAACGGGCC AAACGGTAAC CCCGGCGGCA ACGGTGGCGC 300
189
CGGC 304 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 162:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 1439 párů bázi (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 162:
GTGGGACGCT GCCGAGGCTG TATAACAAGG ACAACATCGA CCAGCGCCGG CTCGGTGAGC 60
TGATCGACCT ATTTAACAGT GCGCGCTTCA GCCGGCAGGG CGAGCACCGC GCCCGGGATC 120
TGATGGGTGA GGTCTACGAA TACTTCCTCG GCAATTTCGC TCGCGCGGAA GGGAAGCGGG 180
GTGGCGAGTT CTTTACCCCG CCCAGCGTGG TCAAGGTGAT CGTGGAGGTG CTGGAGCCGT 240
CGAGTGGGCG GGTGTATGAC CCGTGCTGCG GTTCCGGAGG CATGTTTGTG CAGACCGAGA 300
AGTTCATCTA CGAACACGAC GGCGATCCGA AGGATGTCTC GATCTATGGC CAGGAAAGCA' 360
TTGAGGAGAC CTGGCGGATG GCGAAGATGA ACCTCGCCAT CCACGGCATC GACAACAAGG 420
GGCTCGGCGC CCGATGGAGT GATACCTTCG CCCGCGACCA GCACCCGGAC GTGCAGATGG 480
ACTACGTGAT GGCCAATCCG CCGTTCAACA TCAAAGACTG GGCCCGCAAC GAGGAAGACC 540
CACGCTGGCG CTTCGGTGTT CCGCCCGCCA ATAACGCCAA CTACGCATGG ATTCAGCACA 600
TCCTGTACAA CTTGGCGCCG GGAGGTCGGG CGGGCGTGGT GATGGCCAAC GGGTCGATGT 660
CGTCGAACTC CAACGGCAAG GGGGATATTC GCGCGCAAAT CGTGGAGGCG GATTTGGTTT 720
CCTGCATGGT CGCGTTACCC ACCCAGCTGT TCCGCAGCAC CGGAATCCCG GTGTGCCTGT 780
GGTTTTTCGC CAAAAACAAG. GCGGCAGGTA AGCAAGGGTC TATCAACCGG TGCGGGCAGG 840
TGCTGTTCAT CGACGCTCGT GAACTGGGCG ACCTAGTGGA CCGGGCCGAG CGGGCGCTGA 900
CCAACGAGGA GATCGTCCGC ATCGGGGATA CCTTCCACGC GAGCACGACC ACCGGCAACG 960
CCGGCTCCGG TGGTGCCGGC GGTAATGGGG GCACTGGCCT CAACGGCGCG GGCGGTGCTG 1020
GCGGGGCCGG CGGCAACGCG GGTGTCGCCG GCGTGTCCTT CGGCAACGCT GTGGGCGGCG 1080
ACGGCGGCAA CGGCGGCAAC GGCGGCCACG GCGGCGACGG CACGACGGGC GGCGCCGGCG 1140
GCAAGGGCGG CAACGGCAGC AGCGGTGCCG CCAGCGGCTC AGGCGTCGTC AACGTCACCG 1200
• · · · • · ····«·· · « • · ♦ · ·· ·· · * · · · ·
190
CCGGCCACGG CGGCAACGGC GGCAATGGCG GCAACGGCGG CAACGGCTCC GCGGGCGCCG 1260
GCGGCCAGGG CGGTGCCGGC GGCAGCGCCG GCAACGGCGG CCACGGCGGC GGTGCCACCG' 1320
GCGGCGCCAG CGGCAAGGGC GGCAACGGCA CCAGCGGTGC CGCCAGCGGC TCAGGCGTCA 1380
TCAACGTCAC CGCCGGCCAC GGCGGCAACG GCGGCAATGG CCGCAACGGC GGCAACGGC 1439
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 163:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 329 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 163:
GGGCCGGCGG GGCCGGATTT TCTCGTGCCT TGATTGTCGC TGGGGATAAC GGCGGTGATG 60
GTGGTAACGG CGGGATGGGC GGGGCTGGCG GGGCTGGCGG CCCCGGCGGG GCCGGCGGCC 120
TGATCAGCCT GCTGGGCGGC CAAGGCGCCG GCGGGGCCGG CGGGACCGGC GGGGCCGGCG 180
GTGTTGGCGG TGACGGCGGG GCCGGCGGCC CCGGCAACCA GGCCTTCAAC GCAGGTGCCG 240
GCGGGGCCGG CGGCCTGATC AGCCTGCTGG GCGGCCAAGG CGCCGGCGGG GCCGGCGGGA 300
CCGGCGGGGC CGGCGGTGTT GGCGGTGAC 329
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 164:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 80 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 164:
GCAACGGTGG CAACGGCGGC ACCAGCACGA CCGTGGGGAT GGCCGGAGGT AACTGTGGTG 60
CCGCCGGGCT GATCGGCAAC
4· • · · 4 • * · ·· ·· » · 9 · » · · · ··· · ··
191 (2) Informace ο sekvenci SEQ ID NO: 165:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 392 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 165:
GGGCTGTGTC GCACTCACAC CGCCGCATTC GGCGACGTTG GCCGCCCAAT ATCCAGCTCA 60
AGGCCTACTA CTTACCGTCG GAGGACCGCC GCATCAAGGT GCGGGTCAGC GCCCAAGGAA 120
TCAAGGTCAT CGACCGCGAC GGGCATCGAG GCCGTCGTCG CGCGGCTCGG GCAGGATCCG 180
CCCCGGCGCA CTTCGCGCGC CAAGCGGGCT CATCGCTCCG AACGGCGGCG ATCCTGTGAG 240
CACAACTGAT GGCGCGCAAC GAGATTCGTC CAATTGTCAA GCCGTGTTCG ACCGCAGGGA 300
CCGGTTATAC GTATGTCAAC CTATGTCACT CGCAAGAACC GGCATAACGA TCCCGTGATC 360
CGCCGACAGC CCACGAGTGC AAGACCGTTA CA 392
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 166:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 535 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 166:
ACCGGCGCCA CCGGCGGCAC CGGGTTCGCC GGTGGCGCCG GCGGGGCCGG CGGGCAGGGC 60
GGTATCAGCG GTGCCGGCGG CACCAACGGC TCTGGTGGCG CTGGCGGCAC CGGCGGACAA 120
GGCGGCGCCG GGGGCGCTGG CGGGGCCGGC GCCGATAACC CCACCGGCAT CGGCGGCGCC 180
GGCGGCACCG GCGGCACCGG CGGAGCGGCC GGAGCCGGCG GGGCCGGTGG CGCCATCGGT 240
ACCGGCGGCA CCGGCGGCGC GGTGGGCAGC GTCGGTAACG CCGGGATCGG CGGTACCGGC 300
GGTACGGGTG GTGTCGGTGG TGCTGGTGGT GCAGGTGCGG CTGCGGCCGC TGGCAGCAGC 360
GCTACCGGTG GCGCCGGGTT CGCCGGCGGC GCCGGCGGAG AAGGCGGACC GGGCGGCAAC 420
AGCGGTGTGG GCGGCACCAA CGGCTCCGGC GGCGCCGGCG GTGCAGGCGG CAAGGGCGGC 480
·· • ·
·· ·· ·· ·· • · · · · · · • · ··· · · · · • · · · · ··· · ·· • · · · · · ·« 99 99.. 99
192
ACCGGAGGTG CCGGCGGGTC CGGCGCGGAC AACCCCACCG GTGCTGGTTT CGCCG 535 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 167:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 690 párů baží , (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 167:
CCGACGTCGC CGGGGCGATA CGGGGGTCAC CGACTACTAC ATCATCCGCA CCGAGAATCG 60
GCCGCTGCTG CAACCGCTGC GGGCGGTGCC GGTCATCGGA GATCCGCTGG CCGACCTGAT 120
CCAGCCGAAC CTGAAGGTGA TCGTCAACCT GGGCTACGGC GACCCGAACT ACGGCTACTC 180
GACGAGCTAC GCCGATGTGC GAACGCCGTT CGGGCTGTGG CCGAACGTGC CGCCTCAGGT 240
CATCGCCGAT GCCCTGGCCG CCGGAACACA AGAAGGCATC CTTGACTTCA CGGCCGACCT 300
GCAGGCGCTG TCCGCGCAAC CGCTCACGCT CCCGCAGATC CAGCTGCCGC AACCCGCCGA 360
TCTGGTGGCC GCGGTGGCCG CCGCACCGAC GCCGGCCGAG GTGGTGAACA CGCTCGCCAG 420
GATCATCTCA ACCAACTACG CCGTCCTGCT GCCCACCGTG GACATCGCCC TCGCCTGGTC 480
ACCACCCTGC CGCTGTACAC CACCCAACTG TTCGTCAGGC AACTCGCTGC GGGCAATCTG 540
ATCAACGCGA TCGGCTATCC CCTGGCGGCC ACCGTAGGTT TAGGCACGAT CGATAGCGGG 600
CGGCGTGGAA TTGCTCACCC TCCTCGCGGC GGCCTCGGAC ACCGTTCGAA ACATCGAGGG 660
CCTCGTCACC TAACGGATTC CCGACGGCAT 690
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 168:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 407 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 168:
• ·» · • ·· • · · • · · ···· »· ·· ·· ·· ·· • · · · · · · • · ··· · · · · • · · · · ··· ··· • · · · · · ·· ·«.____ ·· «·
193
ACGGTGACGG CGGTACTGGC GGCGGCCACG GCGGCAACGG CGGGAATCCC GGGTGGCTCT 60
TGGGCACAGC CGGGGGTGGC GGCAACGGTG GCGCCGGCAG CACCGGTACT GCAGGTGGCG 120
GCTCTGGGGG CACCGGCGGC GACGGCGGGA CCGGCGGGCG TGGCGGCCTG TTAATGGGCG 180
CCGGCGCCGG CGGGCACGGT GGCACTGGCG GCGCGGGCGG TGCCGGTGTC GACGGTGGCG 240
GCGCCGGCGG GGCCGGCGGG GCCGGCGGCA ACGGCGGCGC CGGGGGTCAA GCCGCCCTGC 300
TGTTCGGGCG CGGCGGCACC GGCGGAGCCG GCGGCTACGG CGGCGATGGC GGTGGCGGCG 360
GTGACGGCTT CGACGGCACG ATGGCCGGCC TGGGTGGTAC CGGTGGC 407
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 169:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 468 párů bázi (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 169:
GATCGGTCAG CGCATCGCCC TCGGCGGCAA GCGATTCCGC GGTCTCACCG AAGAACATCG 60
TGCACGCGGC GGCGCGGACC AGCCCGCTGC GCTGCGGCGC GTCGAACGCC TCCAGCAGGC 120
ACAGCCAGTC CTTGGCGGCC TGCGAGGCGA ACACGTCGGT GTCACCGGTG TAGATCGCCG 180
GGATGCCCGC CTCCGCCAAC GCATTCCGGC ACGCCCGCGC GTCTTTGTGA TGCTCGACGA 240
TCACCGCGAT GTCTGCGGCC ACCACGGGCC GCCCGGCGAA GGTGGCCCCG CTGGCCAGTA 300
GCGCCGCGAC GTCGGCGGCC AGGTCGTCGG GGATGTGCCG GCGCAGCGCT CCGGCGCGAC 360
GCCCGAAAAA CGACCCCTCA CCCAGCTGGG TCCCGCTGGC ATATCCCTTG CCGTCCTGGG 420
CGATATTGGA CGCGCATGCC CCGACCGCGT ACAGGCCGGC CACCACCG 468
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 170;
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 219 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 170:
• · · · ··· · · · · ··· · ···· · ·· · • · · · · 9 9 9 9 999 999
9 9 9 9 9 9 9.9
9999 99 99 99 ~ 99 99
194 (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO:170:
GGTGGTAACG GCGGCCAGGG TGGCATCGGC GGCGCCGGCG AGAGAGGCGC CGACGGCGCC 60
GGCCCCAATG CTAACGGCGC AAACGGCGAG AACGGCGGTA GCGGTGGTAA CGGTGGCGAC 120
GGCGGCGCCG GCGGCAATGG CGGCGCGGGC GGCAACGCGC AGGCGGCCGG GTACACCGAC 180
GGCGCCACGG GCACCGGCGG CGACGGCGGC AACGGCGGC 219
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 171:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 494 párů bázi (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 171:
TAGCTCCGGC GAGGGCGGCA AGGGCGGCGA CGGTGGCCAC GGCGGTGACG GCGTCGGCGG 60
CAACAGTTCC GTCACCCAAG GCGGCAGCGG CGGTGGCGGC GGCGCCGGCG GCGCCGGCGG 120
CAGCGGCTTT TTCGGCGGCA AGGGCGGCTT CGGCGGCGAC GGCGGTCAGG GCGGCCCCAA 180
CGGCGGCGGT ACCGTCGGCA CCGTGGCCGG TGGCGGCGGC AACGGCGGTG TCGGCGGCCG 240
GGGCGGCGAC GGCGTCTTTG CCGGTGCCGG CGGCCAGGGC GGCCTCGGTG GGCAGGGCGG 300
CAATGGCGGC GGCTCCACCG GCGGCAACGG CGGCCTTGGC GGCGCGGGCG GTGGCGGAGG 360
CAACGCCCCG GCTCGTGCCG AATCCGGGCT GACCATGGAC AGCGCGGCCA AGTTCGCTGC 420
CATCGCATCA GGCGCGTACT GCCCCGAACA CCTGGAACAT CACCCGAGTT AGCGGGGCGC 480
ATTTCCTGAT CACC 494
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 172:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 220 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 172:
• ·
195 • 9 9 • · · 9 · 9 9 9 » • 9 9 9 9 · · 9 9 9 9 · • · 9 9 9 9 • · - 9 - - • 9
GGGCCGGTGG TGCCGCGGGC CAGCTCTTCA GCGCCGGAGG CGCGGCGGGT GCCGTTGGGG 60
TTGGCGGCAC CGGCGGCCAG GGTGGGGCTG GCGGTGCCGG AGCGGCCGGC GCCGACGCCC 120
CCGCCAGCAC AGGTCTAACC GGTGGTACCG GGTTCGCTGG CGGGGCCGGC GGCGTCGGCG 180
GCCAGAGCGG CAACGCCATT GCCGGCGGCA TCAACGGCTC 220
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 173:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 388 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 173:
ATGGCGGCAA CGGGGGCCCC GGCGGTGCTG GCGGGGCCGG CGACTACAAT TTCCAACGGC 60
GGGCAGGGTG GTGCCGGCGG CCAAGGCGGC CAAGGCGGCC TGGGCGGGGC AAGCACCACC ' 120
TGATCGGCCT AGCCGCACCC GGGAAAGCCG ATCCAACAGG CGACGATGCC GCCTTCCTTG 180
CCGCGTTGGA CCAGGCCGGC ATCACCTACG CTGACCCAGG CCACGCCATA ACGGCCGCCA 240
AGGCGATGTG TGGGCTGTGT GCTAACGGCG TAACAGGTCT ACAGCTGGTC GCGGACCTGC 300
GGGACTACAA TCCCGGGCTG ACCATGGACA GCGCGGCCAA GTTCGCTGCC ATCGCATCAG 360
GCGCGTACTG CCCCGAACAC CTGGAACA 388
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 174:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 400 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 174:
GCAAAGGCGG CACCGGCGGG GCCGGCATGA ACAGCCTCGA CCCGCTGCTA GCCGCCCAAG 60
ACGGCGGCCA AGGCGGCACC GGCGGCACCG GCGGCAACGC CGGCGCCGGC GGCACCAGCT - 120 • · • · · ·
• · · • · · · · · • · · · · • · · · · · • • ·
196
TCACCCAAGG CGCCGACGGC AACGCCGGCA ACGGCGGTGA CGGCGGGGTC GGCGGCAACG 180
GCGGAAACGG CGGAAACGGC GCAGACAACA CCACCACCGC CGCCGCCGGC ACCACAGGCG ' 240
GCGACGGCGG GGCCGGCGGG GCCGGCGGAA CCGGCGGAAC CGGCGGAGCC GCCGGCACCG 300
GCACCGGCGG CCAACAAGGC AACGGCGGCA ACGGCGGCAC CGGCGGCAAA GGCGGCACCG 360
GCGGCGACGG TGCACTCTCA GGCAGCACCG GTGGTGCCGG 400
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 175: (i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE: (A) DÉLKA: 538 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 175:
GGCAACGGCG GCAACGGCGG CATCGCCGGC ATTGGGCGGC AACGGCGTTC CGGGACGGGC 60
AGCGGCAACG GCGGCCAACG GCGGCAGCGG CGGCAACGGC GGCAACGCCG GCATGGGCGG 120
CAACAGCGGC ACCGGCAGCG GCGACGGCGG TGCCGGCGGG AACGGCGGCG CGGCGGGCAC 180
GGGCGGCACC GGCGGCGACG GCGGCCTCAC CGGTACTGGC GGCACCGGCG GCAGCGGTGG 240
CACCGGCGGT GACGGCGGTA ACGGCGGCAA CGGAGCAGAT AACACCGCAA ACATGACTGC 300
GCAGGCGGGC GGTGACGGTG GCAACGGCGG CGACGGTGGC TTCGGCGGCG GGGCCGGGGC 360
CGGCGGCGGT GGCTTGACCG CTGGCGCCAA CGGCACCGGC GGGCAAGGCG GCGCCGGCGG 420
CGATGGCGGC AACGGGGCCA TCGGCGGCCA CGGCCCACTC ACTGACGACC CCGGCGGCAA 480
CGGGGGCACC GGCGGCAACG GCGGCACCGG CGGCACCGGC GGCGCGGGCA TCGGCAGC 538
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 176:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 239 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 176:
197 • · · • · · · · · • · · · • · · · • · • * · ·
(xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO:176:
GGGCCGGTGG TGCCGCGGGC CAGCTCTTCA GCGCCGGAGG CGCGGCGGGT GCCGTTGGGG 60
TTGGCGGCAC CGGCGGCCAG GGTGGGGCTG GCGGTGCCGG AGCGGCCGGC GCCGACGCCC 120
CCGCCAGCAC AGGTCTAACC GGTGGTACCG GGTTCGCTGG CGGGGCCGGC GGCGTCGGCG 180
GCCACGGCGG CAACGCCATT GCCGGCGGCA TCAACGGCTC CGGTGGTGCC (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 177: (i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE: (A) DÉLKA: 985 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 177: GGCGGCACC 239
AGCAGCGCTA CCGGTGGCGC CGGGTTCGCC GGCGGCGCCG GCGGAGAAGG CGGAGCGGGC 60
GGCAACAGCG GTGTGGGCGG CACCAACGGC TCCGGCGGCG CCGGCGGTGC AGGCGGCAAG 120
GGCGGCACCG GAGGTGCCGG CGGGTCCGGC GCGGACAACC CCACCGGTGC TGGTTTCGCC 180
GGTGGCGCCG GCGGCACAGG TGGCGCGGCC GGCGCCGGCG GGGCCGGCGG GGCGACCGGT 240
ACCGGCGGCA CCGGCGGCGT TGTCGGCGCC ACCGGTAGTG CAGGCATCGG CGGGGCCGGC 300
GGCCGCGGCG GTGACGGCGG CGATGGGGCC AGCGGTCTCG GCCTGGGCCT CTCCGGCTTT 360
GACGGCGGCC AAGGCGGCCA AGGCGGGGCC GGCGGCAGCG CCGGCGCCGG CGGCATCAAC 420
GGGGCCGGCG GGGCCGGCGG CAACGGCGGC GACGGCGGGG ACGGCGCAAC CGGTGCCGCA 480
GGTCTCGGCG ACAACGGCGG GGTCGGCGGT GACGGTGGGG CCGGTGGCGC CGCCGGCAAC 540
GGCGGCAACG CGGGCGTCGG CCTGACAGCC AAGGCCGGCG ACGGCGGCGC CGCGGGCAAT 600
GGCGGCAACG GGGGCGCCGG CGGTGCTGGC GGGGCCGGCG ACAACAATTT CAACGGCGGC 660
CAGGGTGGTG CCGGCGGCCA AGGCGGCCAA GGCGGCTTGG GCGGGGCAAG CACCACCTGA 720
TCGGCCTAGC CGCACCCGGG AAAGCCGATC CAACAGGCGA CGATGCCGCC TTCCTTGCCG 780
CGTTGGACCA GGCCGGCATC ACCTACGCTG ACCCAGGCCA CGCCATAACG GCCGCCAAGG 840
CGATGTGTGG GCTGTGTGCT AACGGCGTAA CAGGTCTACA GCTGGTCGCG GACCTGCGGG 900
AATACAATCC CGGGCTGACC ATGGACAGCG CGGCCAAGTT CGCTGCCATC GCATCAGGCG 960
• · • · · ·
• · · · · · 198 • · · · • · · ·
CGTACTGCCC CGAACACCTG GAACA 985
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 178: (i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE: (A) DÉLKA: 2138 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární
(xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 178:
CGGCACGAGG ATCGGTACCC CGCGGCATCG GCAGCTGCCG ATTCGCCGGG TTTCCCCACC 60
CGAGGAAAGC CGCTACCAGA TGGCGCTGCC GAAGTAGGGC GATCCGTTCG CGATGCCGGC 120
ATGAACGGGC GGCATCAAAT TAGTGCAGGA ACCTTTCAGT TTAGCGACGA TAATGGCTAT 180
AGCACTAAGG AGGATGATCC GATATGACGC AGTCGCAGAC CGTGACGGTG GATCAGCAAG 240
AGATTTTGAA CAGGGCCAAC GAGGTGGAGG CCCCGATGGC GGACCCACCG ACTGATGTCC 300
CCATCACACC GTGCGAACTC ACGGCGGCTA AAAACGCCGC CCAACAGCTG GTATTGTCCG 360
CCGACAACAT GCGGGAATAC CTGGCGGCCG GTGCCAAAGA GCGGCAGCGT CTGGCGACCT 420
CGCTGCGCAA CGCGGCCAAG GCGTATGGCG AGGTTGATGA GGAGGCTGCG ACCGCGCTGG 480
ACAACGACGG CGAAGGAACT GTGCAGGCAG AATCGGCCGG GGCCGTCGGA GGGGACAGTT 540
CGGCCGAACT AACCGATACG CCGAGGGTGG CCACGGCCGG TGAACCCAAC TTCATGGATC 600
TCAAAGAAGC GGCAAGGAAG CTCGAAACGG GCGACCAAGG CGCATCGCTC GCGCACTTTG 660
CGGATGGGTG GAACACTTTC AACCTGACGC TGCAAGGCGA CGTCAAGCGG TTCCGGGGGT 720
TTGACAACTG GGAAGGCGAT GCGGCTACCG CTTGCGAGGC TTCGCTCGAT CAACAACGGC 780
AATGGATACT CCACATGGCC AAATTGAGCG CTGCGATGGC CAAGCAGGCT CAATATGTCG 840
CGCAGCTGCA CGTGTGGGCT AGGCGGGAAC ATCCGACTTA TGAAGACATA GTCGGGCTCG 900
AACGGCTTTA CGCGGAAAAC CCTTCGGCCC GCGACCAAAT TCTCCCGGTG TACGCGGAGT 960
ATCAGCAGAG GTCGGAGAAG GTGCTGACCG AATACAACAA CAAGGCAGCC CTGGAACCGG 1020
TAAACCCGCC GAAGCCTCCC CCCGCCATCA AGATCGACCC GCCCCCGCCT CCGCAAGAGC 1080
AGGGATTGAT CCCTGGCTTC CTGATGCCGC CGTCTGACGG CTCCGGTGTG ACTCCCGGTA 1140
······· · · ···· · · · · 9 · · · ··
199
CCGGGATGCC AGCCGCACCG ATGGTTCCGC CTACCGGATC GCCGGGTGGT GGCCTCCCGG 1200
CTGACACGGC GGCGCAGCTG ACGTCGGCTG GGCGGGAAGC CGCAGCGCTG TCGGGCGACG 1260
TGGCGGTCAA AGCGGCATCG CTCGGTGGCG GTGGAGGCGG CGGGGTGCCG TCGGCGCCGT 1320
TGGGATCCGC GATCGGGGGC GCCGAATCGG TGCGGCCCGC TGGCGCTGGT GACATTGCCG 1380
GCTTAGGCCA GGGAAGGGCC GGCGGCGGCG CCGCGCTGGG CGGCGGTGGC ATGGGAATGC 1440
CGATGGGTGC CGCGCATCAG GGACAAGGGG GCGCCAAGTC CAAGGGTTCT CAGCAGGAAG 1500
ACGAGGCGCT CTACACCGAG GATCGGGCAT GGACCGAGGC CGTCATTGGT AACCGTCGGC 1560
GCCAGGACAG TAAGGAGTCG AAGTGAGCAT GGACGAATTG GACCCGCATG TCGCCCGGGC 1620
GTTGACGCTG GCGGCGCGGT TTCAGTCGGC CCTAGACGGG ACGCTCAATC AGATGAACAA 1680
CGGATCCTTC CGCGCCACCG ACGAAGCCGA GACCGTCGAA GTGACGATCA ATGGGCACCA 1740
GTGGCTCACC GGCCTGCGCA TCGAAGATGG TTTGCTGAAG AAGCTGGGTG CCGAGGCGGT 1800
GGCTCAGCGG GTCAACGAGG CGCTGCACAA TGCGCAGGCC GCGGCGTCCG CGTATAACGA 1860
CGCGGCGGGC GAGCAGCTGA CCGCTGCGTT ATCGGCCATG TCCCGCGCGA TGAACGAAGG 1920
AATGGCCTAA GCCCATTGTT GCGGTGGTAG CGACTACGCA CCGAATGAGC GCCGCAATGC 1980
GGTCATTCAG CGCGCCCGAC ACGGCGTGAG TACGCATTGT CAATGTTTTG ACATGGATCG 2040
GCCGGGTTCG GAGGGCGCCA TAGTCCTGGT CGCCAATATT GCCGCAGCTA GCTGGTCTTA 2100
GGTTCGGTTA CGCTGGTTAA TTATGACGTC CGTTACCA 2138
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 179:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 460 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE:
(D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 179:
Met Thr Gin Ser Gin Thr Val Thr Val Asp Gin Gin Glu lle Leu Asn
1 5 10 15
Arg Ala Asn Glu Val Glu Ala Pro Met Ala Asp Pro Pro Thr Asp Val
25 30
Pro lle Thr Pro Cys Glu Leu Thr Ala Ala Lys Asn Ala Ala Gin Gin
• ·
201
- Ala Gin Leu Thr Ser Ala Gly Arg Glu Ala Ala Ala Leu Ser Gly Asp
340 345 350
Val Ala Val Lys Ala Ala Ser Leu Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Val
- 355 360 365
Pro Ser Ala Pro Leu Gly Ser Ala lle Gly Gly Ala Glu Ser Val Arg
370 375 380
Pro Ala Gly Ala Gly Asp lle Ala Gly Leu Gly Gin Gly Arg Ala Gly
385 390 395 400
Gly Gly Ala Ala Leu Gly Gly Gly Gly Met Gly Met Pro Met Gly Ala
405 410 415
Ala His Gin Gly Gin Gly Gly Ala Lys Ser Lys Gly Ser Gin Gin Glu
420 425 430
Asp Glu Ala Leu Tyr Thr Glu Asp Arg Ala Trp Thr Glu Ala Val lle
435 440 445
Gly Asn Arg Arg Arg Gin Asp Ser Lys Glu Ser Lys
450 455 460
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 180:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 277 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE:
(D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 180:
Ala Gly 1 Asn Val Thr 5 Ser Ala Ser Gly Pro His Arg Phe Giy Ala Pro
10 15
Asp Arg Gly Ser Gin Arg Arg Arg Arg His Pro Ala Ala Ser Thr Ala
20 25 30
- Thr Glu Arg Cys Arg Phe Asp Arg His Val Ala Arg Gin Arg Cys Gly
35 40 45
Phe Pro Pro Ser Arg Arg Gin Leu Arg Arg Arg Val Ser Arg Glu Ala
50 55 60
Thr Thr Arg Arg Ser Gly Arg Arg Asn His Arg Cys Gly Trp His Pro
65 70 75 80
Gly Thr Gly Ser His Thr Gly Ala Val Arg Arg Arg His Gin Glu Ala
202
90 95
Arg Asp Gin Ser Leu Leu Leu Arg Arg Arg Gly Arg Val Asp Leu Asp
100 105 110
Gly Gly Gly Arg Leu Arg Arg Val Tyr Arg Phe Gin Gly Cys Leu Val
115 120 125
Val Val Phe Gly Gin His Leu Leu Arg Pro Leu Leu Ile Leu Arg Val
130 135 140
His Arg Glu Asn Leu Val Ala Gly Arg Arg Val Phe Arg Val Lys Pro
145 150 155 160
Phe Glu Pro Asp Tyr Val Phe Ile Ser Arg Met Phe Pro Pro Ser Pro
165 170 175
His Val Gin Leu Arg Asp Ile Leu Ser Leu Leu Gly His Arg Ser Ala
180 185 190
Gin Phe Gly His Val Glu Tyr Pro Leu Pro Leu Leu Ile Glu Arg Ser
195 200 205
Leu Ala Ser Gly Ser Arg Ile Ala Phe Pro Val Val Lys Pro Pro Glu
210 215 220
Pro Leu Asp Val Ala Leu Gin Arg Gin Val Glu Ser Val Pro Pro Ile
225 230 235 240
Arg Lys Val Arg Glu Arg Cys Ala Leu Val Ala Arg Phe Glu Leu Pro
245 250 255
Cys Arg Phe Phe Glu Ile His Glu Val Gly Phe Thr Gly Arg Gly His
260 265 270
Pro Arg Arg Ile Gly 275 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 181:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 192 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE:
(D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO:.181:
Arg Val Ala Ala Ser Phe Ile Asp Trp Leu Asp Ser Pro Asp Ser Pro 1 5 10 15 • · · ·
203 • • · · • • · · « · • · • · · • • • • ·
Leu Asp Pro Ser Leu Val Ser Ser Leu Leu Asn Ala Val Ser Cys Gly
20 25 30
Ala Glu Ser Ser Ala Ser Ser Ser Ala Arg Ser Gly Asn Gly Ser Arg
35 40 45
Trp Thr Ser Met Pro Ser Gly Thr Arg Pro Gly Pro Arg Arg Ala Thr
50 55 60
Ser Arg Asp Asp Arg Arg Ser Ala Thr Ser Val Ile Pro Ser Arg Arg
65 70 75 80
Ser Val Ala Pro Arg Ala Glu Phe Gly Thr Arg Leu Ala Ser His Arg
85 90 95
Ala Ser Pro Ser Asn Ala Cys Pro Val Arg Ile Val Thr Ser Ala Ser
100 105 110
Gly Arg Pro Ile Ser Ser Pro Pro Ile Val Arg Ser Arg Ser Cys Val
115 120 125
Asp Lys Asn Gly Arg Arg Cys Ala Ser Gly Tyr Arg Arg Leu Asn Arg
130 135 140
Ala Arg Ser Ser Ser Ile Ala Ala Arg Cys Arg Thr Ile Gly Thr Phe
145 150 155 160
Arg Arg Ser Arg Tyr Ser Ala Ser Met Arg Val Ser Thr Asn Ser Pro
165 170 175
His Val Thr His Gly Val Ala Pro Gly Val Thr Arg Arg Ile Gly Gly
180 185 190 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 182:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 196 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina' (C) DRUH ŘETĚZCE:
(D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 182:
Gin Glu Arg Pro Gin Met Cys Gin Arg Val Ser Glu Ile Glu Pro Arg
1 5 10 15
Thr Gin Phe Phe Asn Arg Cys Ala Leu Pro His Tyr Trp His Phe Pro
20 25 30
Ala Val Ala Val Phe Ser Lys His Ala Ser Leu Asp Glu Leu Ala Pro
204
40 45
Arg Asn 50 Pro Arg Arg Ser Ser 55 Arg Arg Asp Ala Glu 60 Asp Arg Arg Val
Ile 65 Phe Ala Ala Thr Leu 70 Val Ala Val Asp Pro 75 Pro Leu Arg Gly Ala 80
Gly Gly Glu Ala Asp 85 Gin Leu Ile Asp Leu 90 Gly Val Cys Arg Árg 95 Gin
Ala Gly Arg Val 100 Arg Arg Gly Gin Glu 105 Leu His His Arg His 110 Arg His
Gin Gly Ala 115 Ala Pro Asp Leu Arg 120 Arg Arg Arg Arg His 125 Arg Arg Val
Gin Gin 130 His Arg Arg Leu Gin 135 Arg Val Arg Gin Leu 140 Arg Arg Tyr Val
Gin 145 Thr Ala His His Arg 150 Arg Phe Ala Arg Thr 155 Asp Arg Val Arg His 160
His Val Arg Gly Pro 165 Ser Asn His Arg Arg 170 Arg Arg Val Tyr Arg 175 Gly
Arg His Ser Gly Ala Gly Gly Cys Pro Ala Gly Gly Ala Gly Ser Val
180 185 190
Gly Gly Ser Ala 195 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 183:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 311 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE:
(D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 183:
Val 1 Arg Cys Gly Thr 5 Leu Val Pro Val Pro 10 Met Val Glu Phe Leu 15 Thr
Ser Thr Asn Ala 20 Pro Ser Leu Pro Ser 25 Ala Tyr Ala Glu Val 30 Asp Lys
Leu Ile Gly Leu Pro Ala Gly Thr Ala Lys Arg Trp Ile Asn Gly Tyr
40 45
• 9
9.99 9 9 9 9 9 ·
--- 9999 99 99 99 99 99
206 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 184:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 2072 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 184:
CTCGTGCCGA TTCGGCACGA GCTGAGCAGC CCAAGGGGCC GTTCGGCGAA GTCATCGAGG 60
CATTCGCCGA CGGGCTGGCC GGCAAGGGTA AGCAAATCAA CACCACGCTG AACAGCCTGT 120
CGCAGGCGTT GAACGCCTTG AATGAGGGCC GCGGCGACTT CTTCGCGGTG GTACGCAGCC 180
TGGCGCTATT CGTCAACGCG CTACATCAGG ACGACCAACA GTTCGTCGCG TTGAACAAGA 240
ACCTTGCGGA GTTCACCGAC AGGTTGACCC ACTCCGATGC GGACCTGTCG AACGCCATCC 300
AGCAATTCGA CAGCTTGCTC GCCGTCGCGC GCCCGTTCTT CGCCAAGAAC CGCGAGGTGC 360
TGACGCATGA CGTCAATAAT CTCGCGACCG TGACCACCAC GTTGCTGCAG CCCGATCCGT 420
TGGATGGGTT GGAGACCGTC CTGCACATCT TCCCGACGCT GGCGGCGAAC ATTAACCAGC 480
TTTACCATCC GACACACGGT GGCGTGGTGT CGCTTTCCGC GTTCACGAAT TTCGCCAACC 540
CGATGGAGTT CATCTGCAGC TCGATTCAGG CGGGTAGCCG GCTCGGTTAT CAAGAGTCGG 600
CCGAACTCTG TGCGCAGTAT CTGGCGCCAG TCCTCGATGC GATCAAGTTC AACTACTTTC 660
CGTTCGGCCT GAACGTGGCC AGCACCGCCT CGACACTGCC TAAAGAGATC GCGTACTCCG 720
AGCCCCGCTT GCAGCCGCCC AACGGGTACA AGGACACCAC GGTGCCCGGC ATCTGGGTGC 780
CGGATACGCC GTTGTCACAC CGCAACACGC AGCCCGGTTG GGTGGTGGCA CCCGGGATGC 840
AAGGGGTTCA GGTGGGACCG ATCACGCAGG GTTTGCTGAC GCCGGAGTCC CTGGCCGAAC 900
TCATGGGTGG TCCCGATATC GCCCCTCCGT CGTCAGGGCT GCAAACCCCG CCCGGACCCC 960
CGAATGCGTA CGACGAGTAC CCCGTGCTGC CGCCGATCGG TTTACAGGCC CCACAGGTGC 1020
CGATACCACC GCCGCCTCCT GGGCCCGACG TAATCCCGGG TCCGGTGCCA CCGGTCTTGG 1080
CGGCGATCGT GTTCCCAAGA GATCGCCCGG CAGCGTCGGA AAACTTCGAC TACATGGGCC 1140
TCTTGTTGCT GTCGCCGGGC CTGGCGACCT TCCTGTTCGG GGTGTCATCT AGCCCCGCCC 1200
GTGGAACGAT GGCCGATCGG CACGTGTTGA TACCGGCGAT CACCGGCCTG GCGTTGATCG 1260
CGGCATTCGT CGCACATTCG TGGTACCGCA CAGAACATCC GCTCATAGAC ATGCGCTTGT 1320
TCCAGAACCG AGCGGTCGCG CAGGCCAACA TGACGATGAC GGTGCTCTCC CTCGGGCTGT 1380
207 • · · · • · · • · · 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4444 4 4 4 4
•4 44 44 ··· • 4 4 4 4 • 4 44 44 • 4 4 • • 4
TTGGCTCCTT CTTGCTGCTC CCGAGCTACC TCCAGCAAGT GTTGCACCAA TCACCGATGC 1440
AATCGGGGGT GCATATCATC CCACAGGGCC TCGGTGCCAT GCTGGCGATG CCGATCGCCG 1500
GAGCGATGAT GGACCGACGG GGACCGGCCA AGATCGTGCT GGTTGGGATC ATGCTGATCG 1560
CTGCGGGGTT GGGCACCTTC GCCTTTGGTG TCGCGCGGCA AGCGGACTAC TTACCCATTC 1620
TGCCGACCGG GCTGGCAATC ATGGGCATGG GCATGGGCTG CTCCATGATG CCACTGTCCG 1680
GGGCGGCAGT GCAGACCCTG GCCCCACATC AGATCGCTCG CGGTTCGACG CTGATCAGCG 1740
TCAACCAGCA GGTGGGCGGT TCGATAGGGA CCGCACTGAT GTCGGTGCTG CTCACCTACC 1800
AGTTCAATCA CAGCGAAATC ATCGCTACTG CAAAGAAAGT CGCACTGACC CCAGAGAGTG 1860
GCGCCGGGCG GGGGGCGGCG GTTGACCCTT CCTCGCTACC GCGCCAAACC AACTTCGCGG 1920
CCCAACTGCT GCATGACCTT TCGCACGCCT ACGCGGTGGT ATTCGTGATA GCGACCGCGC 1980
TAGTGGTCTC GACGCTGATC CCCGCGGCAT TCCTGCCGAA ACAGCAGGCT AGTCATCGAA 2040
GAGCACCGTT GCTATCCGCA TGACGTCTGC TT (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 185: (i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE: (A) DÉLKA: 1923 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 185: 2072
TCACCCCGGA GAAGTCGTTC GTCGACGACC TGGACATCGA CTCGCTGTCG ATGGTCGAGA 60
TCGCCGTGCA GACCGAGGAC AAGTACGGCG TCAAGATCCC CGACGAGGAC CTCGCCGGTC 120
TGCGTACCGT CGGTGACGTT GTCGCCTACA TCCAGAAGCT CGAGGAAGAA AACCCGGAGG 180
CGGCTCAGGC GTTGCGCGCG AAGATTGAGT CGGAGAACCC CGATGCGGCA CGAGCAGATC 240
GGTGCGTTTC ACCCACATCG CAAGCTCGAG AČGCCCGTCG TCCTCTTGCA CGCTCAGCCA 300
GGTTGGCGTG TCGCCGCCTT CCAGCAAGTG TTCCCACCAC ACGAAGGGAC CCTCGCGAAA 360
GGTGACTGAT CCGCGGACCA CATAGTCGAT GCCACCGTGG CTGACAATTG CGCCGGGTCC 420
GAGTTGGCGG GGGCCGAATT GCGGCATTGC GTCGAAGGCC AGCGGATCCC GGCGCCCGCC 480
• · • ·
208
CGGCGTGGCT GGTGTTTTGG GCCGCCGGAT GGCCACGACG AGAACGACGA TGGCGGCGAT 540
GAACAGCGCC ACGGCAATCA CGACCAGCAG ATTTCCCACG CATACCCTCT CGTACCGCTG 600
CGCCGCGGTT GGTCGATCGG TCGCATATCG ATGGCGCCGT TTAACGTAAC AGCTTTCGCG 660
GGACCGGGGG TCACAACGGG CGAGTTGTCC GGCCGGGAAC CCGGCAGGTC TCGGCCGCGG 720
TCACCCCAGC TCACTGGTGC ACCATCCGGG TGTCGGTGAG CGTGCAACTC AAACACACTC 780
AACGGCAACG GTTTCTCAGG TCACCAGCTC AACCTCGACC CGCAATCGCT CGTACGTTTC 840
GACCGCGCGC AGGTCGCGAG TCAGCAGCTT TGCGCCGGCA GCTTTCGCCG TGAAGCCGAC 900
CAGGGCATCG TAGGTTGCGC CACCGGTGAC ATCGTGCTCG GCGAGGTGGT CGGTCAAGCC 960
GCGATATGAG CAGGCATCCA GTGCCAGGTA GTTGCTGGAG GTGATGTCCG CCAAGTAGGC 1020
GTGGACGGCA ACAGGGGCAA TACGATGCGG CGGTGGTAGC CGGGTCAAGA CCGAATAGGT 1080
TTCCACAGCC GCGTGCGCGA TCAGATGGAC GCCACGGTTG AGCGCGCGCA CGGCGGCCTC 1140
GTGCCCTTCG TGCCAGGTCG CGAATCCGGC AACCAGCACG CTGGTGTCTG GTGCGATCAC 1200
CGCCGTGTGC GATCGAGCGT TTCCCGAACG ATTTCGTCGG TCAACGGGGG CAGGGGACGT 1260
TCTGGCCGTG CGACGAGAAC CGAGCCTTCC CGAACGAGTT CGACACCGGT CGGGGCCGGC 1320
TCAATCTCGA TGCGCCCATC GCGCTCGGTG ATCTCCACCT GGTCGTTCCC GCGCAAGCCA 1380
AGGCGCTCGC GAATCCGCTT GGGAATCACC AGACGTCCTG CGACATCGAT GGTTGTTCGC 1440
ATGGTAGGAA ATTTACCATC GCACGTTCCA TAGGCGTGTC CTGCGCGGGA TGTCGGGACG 1500
ATCCGCTAGC GTATCGAACG ATTGTTTCGG AAATGGCTGA GGGAGCGTGC GGTGCGGGTG 1560
ATGGGTGTCG ATCCCGGGTT GACCCGATGC GGGCTGTCGC TCATCGAGAG TGGGCGTGGT 1620
CGGCAGCTCA CCGCGCTGGA TGTCGACGTG GTGCGCACAC CGTCGGATGC GGCCTTGGCG 1680
CAGCGCCTGT TGGCCATCAG CGATGCCGTC GAGCACTGGC TGGACACCCA TCATCCGGAG 1740
GTGGTGGCTA TCGAACGGGT GTTCTCTCAG CTCAACGTGA CCACGGTGAT GGGCACCGCG 1800
CAGGCCGGCG GCGTGATCGC CCTGGCGGCG GCCAAACGTG GTGTCGACGT GCATTTCCAT 1860
ACCCCCAGCG AGGTCAAGGC GGCGGTCACT GGCAACGGTT CCGCAGACAA GGCTCAGGTC 1920
ACC
1923 • · • · • ·
209 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 186:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE: :
(A) DÉLKA: 1055 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární
(xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 186:
CTGGCGTGCC AGTGTCACCG GCGATATGAC GTCGGCATTC AATTTCGCGG CCCCGCCGGA 60
CCCGTCGCCA CCCAATCTGG ACCACCCGGT CCGTCAATTG CCGAAGGTCG CCAAGTGCGT 120
GCCCAATGTG GTGCTGGGTT TCTTGAACGA AGGCCTGCCG TATCGGGTGC CCTACCCCCA 180
AACAACGCCA GTCCAGGAAT CCGGTCCCGC GCGGCCGATT CCCAGCGGCA TCTGCTAGCC 240
GGGGATGGTT CAGACGTAAC GGTTGGCTAG GTCGAAACCC GCGCCAGGGC CGCTGGACGG 300
GCTCATGGCA GCGAAATTAG AAAACCCGGG ATATTGTCCG CGGATTGTCA TACGATGCTG 360
AGTGCTTGGT GGTTCGTGTT TAGCCATTGA GTGTGGATGT GTTGAGACCC TGGCCTGGAA 420
GGGGACAACG TGCTTTTGCC TCTTGGTCCG CCTTTGCCGC CCGACGCGGT GGTGGCGAAA 480
CGGGCTGAGT CGGGAATGCT CGGCGGGTTG TCGGTTCCGC TCAGCTGGGG AGTGGCTGTG 540
CCACCCGATG ATTATGACCA CTGGGCGCCT GCGCCGGAGG ACGGCGCCGA TGTCGATGTC 600
CAGGCGGCCG AAGGGGCGGA CGCAGAGGCC GCGGCCATGG ACGAGTGGGA TGAGTGGCAG 660
GCGTGGAACG AGTGGGTGGC GGAGAACGCT GAACCCCGCT TTGAGGTGCC ACGGAGTAGC 720
AGCAGCGTGA TTCCGCATTC TCCGGCGGCC GGCTAGGAGA GGGGGCGCAG ACTGTCGTTA 780
TTTGACCAGT GATCGGCGGT CTCGGTGTTC CCGCGGCCGG CTATGACAAC AGTCAATGTG 840
CATGACAAGT TACAGGTATT AGGTCCAGGT TCAACAAGGA GACAGGCAAC ATGGCAACAC 900
GTTTTATGAC GGATCCGCAC GCGATGCGGG ACATGGCGGG CCGTTTTGAG GTGCACGCCC 960
AGACGGTGGA GGACGAGGCT CGCCGGATGT GGGCGTCCGC GCAAAACATC TCGGGNGCGG 1020
GCTGGAGTGG CATGGCCGAG GCGACCTCGC TAGAC 1055
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 187:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 359 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 187:
• 4 • 44 4
4444444 4 4
210 (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO:187:
CCGCCTCGTT GTTGGCATAC TCCGCCGCGG CCGCCTCGAC CGCACTGGCC GTGGCGTGTG 60
TCCGGGCTGA CCACCGGGAT CGCCGAACCA TCCGAGATCA CCTCGCAATG ATCCACCTCG 120
CGCAGCTGGT CACCCAGCCA CCGGGCGGTG TGCGACAGCG CCTGCATCAC CTTGGTATAG 180
CCGTCGCGCC CCAGCCGCAG GAAGTTGTAG TACTGGCCCA CCACCTGGTT ACCGGGACGG 240
GAGAAGTTCA GGGTGAAGGT CGGCATGTCG CCGCCGAGGT AGTTGACCCG GAAAACCAGA 300
TCCTCCGGCA GGTGCTCGGG CCCGCGCCAC ACGACAAACC CGACGCCGGG ATAGGTCAG 359
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 188:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 350 párů bázi (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 188:
AACGGGCCCG TGGGCACCGC TCCTCTAAGG GCTCTCGTTG GTCGCATGAA GTGCTGGAAG 60
GATGCATCTT GGCAGATTCC CGCCAGAGCA AAACAGCCGC TAGTCCTAGT CCGAGTCGCC 120
CGCAAAGTTC CTCGAATAAC TCCGTACCCG GAGCGCCAAA CCGGGTCTCC TTCGCTAAGC 180
TGCGCGAACC ACTTGAGGTT CCGGGACTCC TTGACGTCCA GACCGATTCG TTCGAGTGGC 240
TGATCGGTTC GCCGCGCTGG CGCGAATCCG CCGCCGAGCG GGGTGATGTC AACCCAGTGG 300
GTGGCCTGGA AGAGGTGCTC TACGAGCTGT CTCCGATCGA GGACTTCTCC 350
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 189:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 679 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 189:
·· ·· toto toto ·· ' ·· • to · · · to · to to to to • ·« to t ttt · toto to ·« · « · «· ·· ··· ··· • · · to to · to · · • to·· ·· ·· ·· ·· ··
211
Glu Gin 1 Pro Lys Gly 5 Pro Phe Gly Glu Val 10 Ile Glu Ala Phe Ala 15 Asp
Gly Leu Ala Gly Lys Gly Lys Gin Ile Asn Thr Thr Leu Asn Ser Leu
20 25 30
Ser Gin Ala Leu Asn Ala Leu Asn Glu Gly Arg Gly Asp Phe Phe Ala
35 40 45
Val Val Arg Ser Leu Ala Leu Phe Val Asn Ala Leu His Gin Asp Asp
50 55 60
Gin Gin Phe Val Ala Leu Asn Lys Asn Leu Ala Glu Phe Thr Asp Arg
65 70 75 80
Leu Thr His Ser Asp Ala Asp Leu Ser Asn Ala Ile Gin Gin Phe Asp
85 90 95
Ser Leu Leu Ala Val Ala Arg Pro Phe Phe Ala Lys Asn Arg Glu Val
100 105 110
Leu Thr His Asp Val Asn Asn Leu Ala Thr Val Thr Thr Thr Leu Leu
115 120 125
Gin Pro Asp Pro Leu Asp Gly Leu Glu Thr Val Leu His Ile Phe Pro
130 135 140
Thr Leu Ala Ala Asn Ile Asn Gin Leu Tyr His Pro Thr His Gly Gly
145 150 155 160
Val Val Ser Leu Ser Ala Phe Thr Asn Phe Ala Asn Pro Met Glu Phe
165 170 175
Ile Cys Ser Ser Ile Gin Ala Gly Ser Arg Leu Gly Tyr Gin Glu Ser
180 185 190
Ala Glu Leu Cys Ala Gin Tyr Leu Ala Pro Val Leu Asp Ala Ile Lys
195 200 205
Phe Asn Tyr Phe Pro Phe Gly Leu Asn Val Ala Ser Thr Ala Ser Thr
210 215 220
Leu Pro Lys Glu Ile Ala Tyr Ser Glu Pro Arg Leu Gin Pro Pro Asn
225 230 235 240
Gly Tyr Lys Asp Thr Thr Val Pro Gly Ile Trp Val Pro Asp Thr Pro
245 250 255
Leu Ser His Arg Asn Thr Gin Pro Gly Trp Val Val Ala Pro Gly Met
260 265 270
Gin Gly Val Gin Val Gly Pro Ile Thr Gin Gly Leu Leu Thr Pro Glu
275 280 285
·· ·· »· ·· ·· ·· ···· «·· ···· • »· · · ··· · · · · ·· ··· ·· 4 · 444 444
4444444 4 4
4444 44 44 44 44 44
212
Ser Leu Ala Glu Leu Met Gly Gly Pro Asp Ile Ala Pro Pro Ser Ser 290 295 300
Gly Leu Gin Thr Pro Pro Gly Pro Pro Asn Ala Tyr Asp Glu Tyr Pro
305 310 315 320
Val Leu Pro Pro Ile Gly Leu Gin Ala Pro Gin Val Pro Ile Pro Pro
325 330 335
Pro Pro Pro Gly Pro Asp Val Ile Pro Gly Pro Val Pro Pro Val Leu 340 345 350
Ala Ala Ile Val Phe Pro Arg Asp Arg Pro Ala Ala Ser Glu Asn Phe 355 360 365
Asp Tyr Met Gly Leu Leu Leu Leu Ser Pro Gly Leu Ala Thr Phe Leu 370 375 380
Phe Gly Val Ser Ser Ser Pro Ala Arg Gly Thr Met Ala Asp Arg His
385 390 395 400
Val Leu Ile Pro Ala Ile Thr Gly Leu Ala Leu Ile Ala Ala Phe Val
405 410 415
Ala His Ser Trp Tyr Arg Thr Glu His Pro Leu Ile Asp Met Arg Leu 420 425 430
Phe Gin Asn Arg Ala Val Ala Gin Ala Asn Met Thr Met Thr Val Leu 435 440 445
Ser Leu Gly Leu Phe Gly Ser Phe Leu Leu Leu Pro Ser Tyr Leu Gin 450 455 460
Gin Val Leu His Gin Ser Pro Met Gin Ser Gly Val His Ile Ile Pro
465 470 475 480
Gin Gly Leu Gly Ala Met Leu Ala Met Pro Ile Ala Gly Ala Met Met
485 490 495
Asp Arg Arg Gly Pro Ala Lys Ile Val Leu Val Gly Ile Met Leu Ile 500 505 510
Ala Ala Gly Leu Gly Thr Phe Ala Phe Gly Val Ala Arg Gin Ala Asp 515 520 525
Tyr Leu Pro Ile Leu Pro Thr Gly Leu Ala Ile Met Gly Met Gly Met 530 535 540
Gly Cys Ser Met Met Pro Leu Ser Gly Ala Ala Val Gin Thr Leu Ala
545 550 555 560
Pro His Gin Ile Ala Arg Gly Ser Thr Leu Ile Ser Val Asn Gin Gin
565 570 575
Val Gly Gly Ser Ile Gly Thr Ala Leu Met Ser Val Leu Leu Thr Tyr
213
580 585 590
Gin Phe Asn His Ser Glu Ile Ile Ala Thr Ala Lys Lys Val Ala Leu
595 600 605
Thr Pro Glu Ser Gly Ala Gly Arg Gly Ala Ala Val Asp Pro Ser Ser
610 615 620
Leu Pro Arg Gin Thr Asn Phe Ala Ala Gin Leu Leu His Asp Leu Ser
625 630 635 640
His Ala Tyr Ala Val Val Phe Val Ile Ala Thr Ala Leu Val Val Ser
645 650 655
Thr Leu Ile Pro Ala Ala Phe Leu Pro Lys Gin Gin Ala Ser His Arg
660 665 670
Arg Ala Pro Leu Leu Ser Ala
675 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 190:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 120 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE:
(D) TOPOLOGIE: lineární (xi.). POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 190:
Thr Pro 1
Met Val
Pro Asp
Tyr Ile 50
Arg Ala 65
Cys Val
Arg Ser
Glu Lys
Glu Ile 20
Glu Asp 35
Gin Lys
Lys Ile
Ser Pro
Ala Arg 100
Ser Phe Val Asp Asp Leu Asp Ile Asp Ser Leu Ser 5 10 15
Ala Val Gin Thr Glu Asp Lys Tyr Gly Val Lys Ile 25 30
Leu Ala Gly Leu Arg Thr Val Gly Asp Val Val Tkla 40 45
Leu Glu Glu Glu Asn Pro Glu Ala Ala Gin Ala Leu 55 60
Glu Ser Glu Asn Pro Asp Ala Ala Arg Ala Asp Arg 70 75 80
Thr Ser Gin Ala Arg Asp Ala Arg Arg Pro Leu Ala 85 90 95
Leu Ala Cys Arg Arg Leu Pro Ala Ser Val Pro Thr 105 110 • ·
214
Thr Arg Arg Asp Pro Arg Glu Arg 115 120 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 191:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 89 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE:
(D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 191:
Leu Ala Cys Gin Cys His Arg Arg Tyr Asp Val Gly Ile Gin Phe Arg
1 5 10 15
Gly Pro Ala Gly Pro Val Ala Thr Gin Ser Gly Pro Pro Gly Pro Ser
20 25 30
Ile Ala Glu Gly Arg Gin Val Arg Ala Gin Cys Gly Ala Gly Phe Leu
35 40 45
Glu Arg Arg Pro Ala Val Ser Gly Ala Leu Pro Pro Asn Asn Ala Ser
50 55 60
Pro Gly Ile Arg Ser Arg Ala Ala Asp Ser Gin Arg His Leu Leu Ala
65 70 75 80
Gly Asp Gly Ser Asp Val Thr Val Gly
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 192:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 119 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE:
(D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 192:
Ala Ser Leu Leu Ala Tyr Ser Ala Ala Ala Ala Ser Thr Ala Leu Ala
1 5 10 15
Val Ala Cys Val Arg Ala Asp His Arg Asp Arg Arg Thr Ile Arg Asp
25 30 • ·
215
His Leu Ala 35 Met Ile His Leu Ala 40 Gin Leu Val Thr Gin 45 Pro Pro Gly
Gly Val 50 Arg Gin Arg Leu His 55 His Leu Gly Ile Ala Val 60 Ala Pro Gin
Pro 65 Gin Glu Val Val Val 70 Leu Ala His His Leu 75 Val Thr Gly Thr Gly 80
Glu Val Gin Gly Glu 85 Gly Arg His Val Ala 90 Ala Glu Val Val Asp 95 Pro
Glu Asn Gin Ile 100 Leu Arg Gin Val Leu 105 Gly Pro Ala·Pro His 110 Asp Lys
Pro Asp Ala Gly Ile Gly Gin
115 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 193:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 116 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE:
(D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 193:
Arg Ala Arg Gly His Arg Ser Ser Lys Gly Ser Arg Trp Ser His Glu
1 5 10 15
Val Leu Glu Gly Cys Ile Leu Ala Asp Ser Arg Gin Ser Lys Thr Ala
20 25 30
Ala Ser Pro Ser Pro Ser Arg Pro Gin Ser Ser Ser Asn Asn Ser Val
35 40 45
Pro Gly Ala Pro Asn Arg Val Ser Phe Ala Lys Leu Arg Glu Pro Leu
50 55 60
Glu Val Pro Gly Leu Leu Asp Val Gin Thr Asp Ser Phe Glu Trp Leu
65 70 75 80
Ile Gly Ser Pro Arg Trp Arg Ólu Ser Ala Ala Glu Arg Gly Asp Val
85 90 95
Asn Pro Val Gly Gly Leu Glu Glu Val Leu Tyr Glu Leu Ser Pro' Ile
100 105 110
Glu Asp Phe Ser
115 • · · • · · · ····· ···· ·· ·· ·♦
216 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 194:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 811 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 194:
TGCTACGCAG CAATCGCTTT GGTGACAGAT
GTGAAAGCCG
GTGCGGGCCG
GCCGGTGTTC
TCATCGGGTC
ACGCGCTGCT
TCGACGTGCG
ACCAGGCCGC
ACAACGATTT
TGGTGCTGGC
GACCGGTCGA
GTTGCCCGGG
GCCCGCGCAG
GGAAACGAAT (2)
CCGACGTGTT
CCATCGATCG
CGTTGCCGTT
GCGCGTGGAT
GCCCGCCGCG
CGACGCCAGC
CATGGTGGGT
CGCCACCACG
GTCGTCGATG
CCCGCTGCCG
GTGCGGCGAG
CCTGTACGCG
GGCGGTTCCG
CGCCGCATTC
GGTCGCCGAC
CGAGCTGCCA
GCGGCGTTAC
CACGGGCCAA
GCGCTGGCCC
GCCGGCGTCA
GTGCTGCTGG
GTGGTTTACG
CGGCGGCGAG
CCAGTCATCT
GCAGCAAGAC
TGGTGGCGTT
GTGGATGCCG GCGTCGCTGC TGGCGATGGC 60
GGGGAGAACA TCGAACTGCT CAAAAGGCTG 120
GAGCGCACGT GCACGCACTG TCAACACCAC 180
TGAGGGTGCT GCTGACCGGC GCGGCCGGCT 240
GGGCTGCGGG TCACGACGTG GTGGGCGTCG 300
ACCCGGTGCT GCCACCGGGC TGCCAGCGGG 360
CGTTGTTGGC CGGTGTCGAT CTGGTGTGTC 420
ACGCCGCCGA CGCACCCGCC TATGGCGGCC 480
CGCAGATGTT CGCCGCCGGG GTCCGCCGTT 540
GGCAGGGGCG CTATGACTGT CCCCAGCATG 600
CCGACCTGGA CAATGGGGTC TTCGAGCACC 660
GGCAATTGGT CGACGAAGAT GCCCCGTTGC 720
CGCGCAGGAG CACTACGCGC TGGCGTGGTC 780
G 811
Informace o sekvenci SEQ ID NO: 195:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 966 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 195:
217 • · · • · · • · • ·'· · · · • · · · • · · · · • · · · · • · · · • · · • · · • • · · ·
GTCCCGCGAT GTGGCCGAGC ATGACTTTCG GCAACACCGG CGTAGTAGTC GAAGATATCG 60
GACTTTGTGG TCCCGGTGGC GGGATAGAGC ACCTGTCGGC GTTGGTCAGC GTCACCCGTT 120
GCTCGGACGC CGAACCCATG CTTTCAACGT AGCCTGTCGG TCACACAAGT CGCGAGCGTA 180
ACGTCACGGT CAAATATCGC GTGGAATTTC GCCGTGACGT TCCGCTCGCG GACAATCAAG 240
GCATACTCAC TTACATGCGA GCCATTTGGA CGGGTTCGAT CGCCTTCGGG CTGGTGAACG 300
TGCCGGTCAA GGTGTACAGC GCTACCGCAG ACCACGACAT CAGGTTCCAC CAGGTGCACG 360
CCAAGGACAA CGGACGCATC CGGTACAAGC GCGTCTGCGA GGCGTGTGGC GAGGTGGTCG 420
ACTACCGCGA TCTTGCCCGG GCCTACGAGT CCGGCGACGG CCAAATGGTG GCGATCACCG 480
ACGACGACAT CGCCAGCTTG CCTGAAGAAC GCAGCCGGGA GATCGAGGTG TTGGAGTTCG 540
TCCCCGCCGC CGACGTGGAC CCGATGATGT TCGACCGCAG CTACTTTTTG GAGCCTGATT 600
CGAAGTCGTC GAAATCGTAT GTGCTGCTGG CTAAGACACT CGCCGAGACC GACCGGATGG 660
CGATCGTGGA TCGCCCCACC GGCCGTGAAT GCAGGAAAAA TAAGAGCCGC TATCCACAAT 720
TCGGCGTCGA GCTCGGCTAC CACAAACGGT AGAACGATCG AGACATTCCC GAGCTGAAGT 780
GCGGCGCTAT AGAAGCCGCT CTGCGCGATT ATCAAACGCA AAATACGCTT ACTCATGCCA 840
TCGGCGCTGC TCACCCGATG CGACGTTTTT GCCACGCTCC ACCGCCTGCC GCGCGACCTC 900
AAGTGGGCAT GCATCCCACC CGTTCCCGGA AACCGGTTCC GGCGGGTCGG CTCATCGCTT 960
CATCCT 966
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 196:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 2367 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 196:
CCGCACCGCC GGCAATACCG CCAGCGCCAC CGTTACCGCC GTTTGCGCCG TTGCCCCCGT 60
TGCCGCCCGT CCCGCCGGCC CCGCCGATGG AGTTCTCATC GCCAAAAGTA CTGGCGTTGC 120
CACCGGAGCC GCCGTTGCCG CCGTCACCGC CAGCCCCGCC GACTCCACCG GCCCCACCGA 180
218 • · · • · · • · · · · · • · · · · · ·· ·
• · · · • · toto • · • · · ·
CTCCGCCGCT GCCACCGTTG CCGCCGTTGC CGATCAACAT GCCGCTGGCG CCACCCTTGC 240
CACCCACGCC ACCGGCTCCG CCCACCCCGC CGACACCAAG CGAGCTGCCG ČCGGAGCCAC 300
CATCACCACC TACGCCACCG ACCGCCCAGA CACCAGCGAC CGGGTCTTCG TGAAACGTCG 360
CGGTGCCACC ACCGCCGCCG TTACCGCCAA CCCCACCGGC AACGCCGGCG CCGCCATCCC 420
CGCCGGCCCC GGCGTTGCCG CCGTTGCCGC CGTTGCCGAA CAACAACCCG CCGGCGCCGC 480
CGTTGCCGCC CGCGCCGCCG GTCCCGCCGG CGCCGCCGAC GCCAAGGCCG CTGCCGCCCT 540
TGCCGCCATC ACCACCCTTG CCGCCGACCA CATCGGGTTC TGCCTCGGGG TCTGGGCTGT 600
CAAACCTCGC GATGCCAGCG TTGCCGCCGC TTCCCCCGGG CCCCCCCGTG GCGCCGTCAC 660
CACCGATACC ACCCGCGCCA CCGGCGCCAC CGTTGCCGCC ATCACCGAAT AGCAACCCGC 720
CGGCGCCACC ATTGCCGCCA GCTCCCCCTG CGCCACCGTC GGCGCCGGAG GCGGCACTGG 780
CAGCCCCGTT ACCACCGAAA CCGCCGCTAC CACCGGTAGA GGTGGCAGTG GCGATGTGTA 840
CGAAAGCGCC GCCTCCGGCG CCGCCGCTAC CACCCCCACT GCCGGCGGCT ACACCGTCGG 900
ACCCGTTGCC ACCATCACCG CCAAAGGCGC TCGCAATGTC GCCCTGCGCG ACTCCGCCGT 960
CGCCGCCGTT GCCGCCGCCG CCACCGGCAG CGGCGGTACC GCCGTCACCA CCGGCACCGC 1020
CGGTGGCCTT GCCCGAGCCT GCCGTCGCGG TGGCACCGTC GCCGCCGGTG CCACCGGTCG 1080
GCGTGCCGGC AGTGCCATGG CCGCCCGTGC CGCCGTCGCC GCCGGTTTGA TCACCGATGC 1140
CGGACACATC TGCCGGGCTG TCCCCGGTGC TGGCCGCGGG GCCGGGCGTG GGATTGACCC 1200
CGTTTGCCCC GGCGAGGCCG GCGCCGCCGG TACCACCGGC GCCGCCATGG CCGAACAGCC 1260
CGGCGTTGCC GCCGTTACCG CCCGCACCCC CGATGCCTGC GGCCACGCTG GTGCCGCCGA 1320
CACCGCCGTT GCCGCCGTTG CCCCACAACC ACCCCCCGTT CCCACCGGCA CCGCCGGCCG 1380
CGCCGGTACC ACCGGCCCCG CCGTTGCCGC CGTTGCCGAT CAACCCGGCC GCGCCTCCGC 1440
TGCCGCCGGT TTGACCGAAC CCGCCAGCCG CGCCGTTGCC ACCGTTGCCA AACAGCAACC 1500
CGCCGGCCGC GCCAGGCTGC CCGGGTGCCG TCCCGTCGGC GCCGTTTCCG ATCAACGGGC 1560
GCCCCAAAAG CGCCTCGGTG GGCGCATTCA CČGCACCCAG CAGACTCCGC TCAACAGCGG 1620
CTTCAGTGCT GGCATACCGA CCCGCGGCCG CAGTCAACGC CTGCACAAAC TGCTCGTGAA 1680
ACGCTGCCAC CTGTACGCTG AGCGCCTGAT ACTGCCGAGC ATGGGCCCCG AACAACCCCG 1740
CAATCGCCGC CGACACTTCA TCGGCAGCCG CAGCCACCAC TTCCGTCGTC GGGATCGCCG 1800
• ·
219
CGGCCGCATT AGCCGCGCTC ACCTGCGAAC CAATAGTCGA TAAATCCAAA GCCGCAGTTG 1860
CCAGCAGCTG CGGCGTCGCG ATCACCAAGG ACACCTCGCA CCTCCGGATA CCCCATATCG 1920
CCGCACCGTG TCCCCAGCGG CCACGTGACC TTTGGTCGCT GGCTGGCGGC CCTGACTATG 1980
GCCGCGACGG CCCTCGTTCT GATTCGCCCC GGCGCGCAGC TTGTTGCGCG AGTTGAAGAC 2040
GGGAGGACAG GCCGAGCTTG GTGTAGACGT GGGTCAAGTG GGAATGCACG GTCCGCGGCG 2100
AGATGAATAG GCGGACGCCG ATCTCCTTGT TGCTGAGTCC CTCACCGACC AGTAGAGCCA 2160
CCTCAAGCTC TGTCGGTGTC AACGCGCCCC AGCCACTTGT CGGGCGTTTC CGTGCACCGC 2220
GGCCTCGTTG CGCGTACGCG ATCGCCTCAT CGATCGATAA CGCAGTTCCT TCGGCCCAGG 2280
CATCGTCGAA CTCGCTGTCA CCCATGGATT TTCGAAGGGT GGCTAGCGAC GAGTTACAGC 2340
CCGCCTGGTA GATCCCGAAG CGGACCG 2367
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 197:
(i) CHARAKTERISTIKA. SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 376 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE:
(D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 197:
Gin 1 Pro Ala Gly Ala 5 Thr Ile Ala Ala Ser 10 Ser Pro Cys Ala Thr 15 Val
Gly Ala Gly Gly 20 Gly Thr Gly Ser Pro 25 Val Thr Thr Glu Thr 30 Ala Ala
Thr Thr Gly 35 Arg Gly Gly Ser Gly 40 Asp Val Tyr Glu Ser 45 Ala Ala Ser
Gly Ala 50 Ala Ala Thr Thr Pro 55 Thr Ala Gly Gly Tyr 60 Thr Val Gly Pro
Val 65 Ala Thr Ile Thr Ala 70 Lys Gly Ala Arg Asn 75 Val Ala Leu Arg Asp 80
Ser Ala Val Ala Ala 85 Val Ala Ala Ala Ala 90 Thr Gly Ser Gly Gly 95 Thr
Ala Val Thr Thr Gly Thr Ala Gly Gly Leu Ala Arg Ala Cys Arg Arg
1Q0 105 110
130
145
210
225
290
305
370 • · e . ·· ·· ·· ·· ·· ···· ··· ···< ··· · ···· · · · < • · ··· *· ·· ··· · · I ··· ···· a ·
115
195
275
355
220 • · · · • · • · • · • ·
Val Ala Ala Gly Ala Thr Gly Arg Arg Ala Gly Ser Ala
120 125
Arg Ala Ala Val Ala Ala Gly Leu lle Thr Asp Ala Gly
135 140
Arg Ala Val Pro Gly Ala Gly Arg Gly Ala Gly Arg Gly
150 155 160
Val Cys Pro Gly Glu Ala Gly Ala Ala Gly Thr Thr Gly
165 170 175
Ala Glu Gin Pro Gly Val Ala Ala Val Thr Ala Arg Thr
180 185 190
Cys Gly His Ala Gly Ala Ala Asp Thr Ala Val Ala Ala
200 205
Gin Pro Pro Pro Val Pro Thr Gly Thr Ala Gly Arg Ala
215 220
Gly Pro Ala Val Ala Ala Val Ala Asp Gin Pro Gly Arg
230 235 240
Ala Ala Gly Leu Thr Glu Pro Ala Ser- Arg Ala Val Ala
245 250 255
Lys Gin Gin Pro Ala Gly Arg Ala Arg Leu Pro Gly Cys
260 265 270
Gly Ala Val Ser Asp Gin Arg Ala Pro Gin Lys Arg Leu
280 285
lle His Arg Thr Gin Gin Thr Pro Leu Asn Ser Gly Phe
295 300
lle Pro Thr Arg Gly Arg Ser Gin Arg Leu His Lys Leu
310 315 320
Arg Cys His Leu Tyr Ala Glu Arg Leu lle Leu Pro Ser
325 330 335
Glu Gin Pro Arg Asn Arg Arg Arg His Phe lle Gly Ser
340 345 350
His Phe Arg Arg Arg Asp Arg Arg Gly Arg lle Ser Arg
360 365
Arg Thr Asn Ser Arg
375 • · • ·
221 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 198:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 2852 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 198:
GGCCAAAACG CCCCGGCGAT CGCGGCCACC GAGGCCGCCT ACGACCAGAT GTGGGCCCAG 60
GACGTGGCGG CGATGTTTGG CTACCATGCC GGGGCTTCGG CGGCCGTCTC GGCGTTGACA 120
CCGTTCGGCC AGGCGCTGCC GACCGTGGCG GGCGGCGGTG CGCTGGTCAG CGCGGCCGCG 180
GCTCAGGTGA CCACGCGGGT CTTCCGCAAC CTGGGCTTGG CGAACGTCCG CGAGGGCAAC 240
GTCCGCAACG GTAATGTCCG GAACTTCAAT CTCGGCTCGG CCAACATCGG CAACGGCAAC 300
ATCGGCAGCG GCAACATCGG CAGCTCCAAC ATCGGGTTTG GCAACGTGGG TCCTGGGTTG 360
ACCGCAGCGC TGAACAACAT CGGTTTCGGC AACACCGGCA GCAACAACAT CGGGTTTGGC 420
AACACCGGCA GCAACAACAT CGGGTTCGGC AATACCGGAG ACGGCAACCG AGGTATCGGG 480
CTCACGGGTA GCGGTTTGTT GGGGTTCGGC GGCCTGAACT CGGGCACCGG CAACATCGGT 540
CTGTTCAACT CGGGCACCGG AAACGTCGGC ATCGGCAACT CGGGTACCGG GAACTGGGGC 600
ATTGGCAACT CGGGCAACAG CTACAACACC GGTTTTGGCA ACTCCGGCGA CGCCAACACG 660
GGCTTCTTCA ACTCCGGAAT AGCCAACACC GGCGTCGGCA ACGCCGGCAA CTACAACACC· 720
GGTAGCTACA ACCCGGGCAA CAGCAATACC GGCGGCTTCA ACATGGGCCA GTACAACACG 780
GGCTACCTGA ACAGCGGCAA CTACAACACC GGCTTGGCAA ACTCCGGCAA TGTCAACACC 840
GGCGCCTTCA TTACTGGCAA CTTCAACAAC GGCTTCTTGT GGCGCGGCGA CCACCAAGGC 900
CTGATTTTCG GGAGCCCCGG CTTCTTCAAC TCGACCAGTG CGCCGTCGTC GGGATTCTTC 960
AACAGCGGTG CCGGTAGCGC GTCCGGCTTC CTGAACTCCG GTGCCAACAA TTCTGGCTTC 1020
TTCAACTCTT CGTCGGGGGC CATCGGTAAC TCCGGCCTGG CAAACGCGGG CGTGCTGGTA 1080
TCGGGCGTGA TCAACTCGGG CAACACCGTA TCGGGTTTGT TCAACATGAG CCTGGTGGCC 1140
ATCACAACGC CGGCCTTGAT CTCGGGCTTC TTCAACACCG GAAGCAACAT GTCGGGATTT 1200
TTCGGTGGCC CACCGGTCTT CAATCTCGGC CTGGCAAACC GGGGCGTCGT GAACATTCTC 1260
GGCAACGCCA ACATCGGCAA TTACAACATT CTCGGCAGCG GAAACGTCGG TGACTTCAAC 1320
ATCCTTGGCA GCGGCAACCT CGGCAGCCAA AACATCTTGG GCAGCGGCAA CGTCGGCAGC 1380
• · • ·
222 • · • · · · « · • · · · · ·· ·· • ·· ··
TTCAATATCG GCAGTGGAAA CATCGGAGTA TTCAATGTCG GTTCCGGAAG CCTGGGAAAC 1440
TACAACATCG GATCCGGAAA CCTCGGGATC TACAACATCG GTTTTGGAAA CGTCGGCGAC 1500
TACAACGTCG GCTTCGGGAA CGCGGGCGAC TTCAACCAAG GCTTTGCCAA CACCGGCAAC 1560
AACAACATCG GGTTCGCCAA CACCGGCAAC AACAACATCG GCATCGGGCT GTCCGGCGAC 1620
AACCAGCAGG GCTTCAATAT TGCTAGCGGC TGGAACTCGG GCACCGGCAA CAGCGGCCTG 1680
TTCAATTCGG GCACCAATAA CGTTGGCATC TTCAACGCGG GCACCGGAAA CGTCGGCATC 1740
GCAAACTCGG GCACCGGGAA CTGGGGTATC GGGAACCCGG GTACCGACAA TACCGGCATC 1800
CTCAATGCTG GCAGCTACAA CACGGGCATC CTCAACGCCG GCGACTTCAA CACGGGCTTC 1860
TACAACACGG GCAGCTACAA CACCGGCGGC TTCAACGTCG GTAACACCAA CACCGGCAAC 1920
TTCAACGTGG GTGACACCAA TACCGGCAGC TATAACCCGG GTGACACCAA CACCGGCTTC 1980
TTCAATCCCG GCAACGTCAA TACCGGCGCT TTCGACACGG GCGACTTCAA CAATGGCTTC 2040
TTGGTGGCGG GCGATAACCA GGGCCAGATT GCCATCGATC TCTCGGTCAC CACTCCATTC 2100
ATCCCCATAA ACGAGCAGAT GGTCATTGAC GTACACAACG TAATGACCTT CGGCGGCAAC 2160
ATGATCACGG TCACCGAGGC CTCGACCGTT TTCCCCCAAA CCTTCTATCT GAGCGGTTTG 2220
TTCTTCTTCG GCCCGGTCAA TCTCAGCGCA TCCACGCTGA CCGTTCCGAC GATCACCCTC 2280
ACCATCGGCG GACCGACGGT GACCGTCCCC ATCAGCATTG TCGGTGCTCT GGAGAGCCGC 2340
ACGATTACCT TCCTCAAGAT CGATCCGGCG CCGGGCATCG GAAATTCGAC CACCAACCCC 2400
TCGTCCGGCT TCTTCAACTC GGGCACCGGT GGCACATCTG GCTTCCAAAA CGTCGGCGGC 2460
GGCAGTTCAG GCGTCTGGAA CAGTGGTTTG AGCAGCGCGA TAGGGAATTC GGGTTTCCAG 2520
AACCTCGGCT CGCTGCAGTC AGGCTGGGCG AACCTGGGCA ACTCCGTATC GGGCTTTTTC 2580
AACACCAGTA CGGTGAACCT CTCCACGCCG GCCAATGTCT CGGGCCTGAA CAACATCGGC 2640
ACCAACCTGT CCGGCGTGTT CCGCGGTCCG ACCGGGACGA TTTTCAACGC GGGCCTTGCC 2700
AACCTGGGCC AGTTGAACAT CGGCAGCGCC TCGTGCCGAA TTCGGCACGA GTTAGATACG 2760
GTTTCAACAA TCATATCCGC GTTTTGCGGC ÁGTGCATCAG ACGAATCGAA CCCGGGAAGC 2820
GTAAGCGAAT AAACCGAATG GCGGCCTGTC AT
2852
0 • 000000 0 0 0000 0 0. 00 0 0 00 00
223 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 199:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 943 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE:
(D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 199:
Gly 1 Gin Asn Ala Pro 5 Ala Ile Ala Ala Thr 10 Glu Ala Ala Tyr Asp 15 Gin
Met Trp Ala Gin 20 Asp Val Ala Ala Met 25 Phe Gly Tyr His Ala 30 Gly Ala
Ser Ala Ala 35 Val Ser Ala Leu Thr 40 Pro Phe Gly Gin Ala 45 Leu Pro Thr
Val Ala 50 Gly Gly Gly Ala Leu 55 Val Ser Ala Ala Ala 60 Ala Gin Val Thr
Thr 65 Arg Val Phe Arg Asn 70 Leu Gly Leu Al a Asn 75 Val Arg Glu Gly Asn 80
Val Arg Asn Gly Asn 85 Val Arg Asn Phe Asn 90 Leu Gly Ser Ala Asn 95 Ile
Gly Asn Gly Asn 100 Ile Gly Ser Gly Asn 105 Ile Gly Ser Ser Asn 110 Ile Gly
Phe Gly Asn 115 Val Gly Pro Gly Leu 120 Thr Ala Ala Leu Asn 125 Asn Ile Gly
Phe Gly 130 Asn Thr Gly Ser Asn 135 Asn Ile Gly Phe Gly 140 Asn Thr Gly Ser
Asn 145 Asn Ile Gly Phe Gly 150 Asn Thr Gly Asp Gly 155 Asn Arg Gly Ile Gly 160
Leu Thr Gly Ser Gly 165 Leu Leu Gly Phe Gly 170 Gly Leu Asn Ser Gly 175 Thr
Gly Asn Ile Gly 180 Leu Phe Asn Ser Gly 185 Thr Gly Asn Val Gly 190 Ile Gly
Asn Ser Gly 195 Thr Gly Asn Trp Gly 200 Ile Gly Asn Ser Gly 205 Asn Ser Tyr
Asn Thr 210 Gly Phe Gly Asn Ser 215 Gly Asp Ala Asn Thr 220 Gly Phe Phe Asn
Ser Gly Ile Ala Asn Thr Gly Val Gly Asn Ala Gly Asn Tyr Asn Thr 225 230 235 240 • · ·· ·· ·· ·« • · · · 9 • · · · · · · · ·
224
305
385
465
Ser Tyr Asn Pro Gly Asn Ser Asn Thr Gly Gly Phe Asn Met Gly
245 250 255
Tyr Asn Thr Gly Tyr Leu Asn Ser Gly Asn Tyr Asn Thr Gly Leu
260 265 270
Asn Ser Gly Asn Val Asn Thr Gly Ala Phe Ile Thr Gly Asn Phe
275 280 285
Asn Gly Phe Leu Trp Arg Gly Asp His Gin Gly Leu Ile Phe Gly
290 295 300
Pro Gly Phe Phe Asn Ser Thr Ser Ala Pro Ser Ser Gly Phe Phe
310 315 320
Ser Gly Ala Gly Ser Ala Ser Gly Phe Leu Asn Ser Gly Ala Asn
325 330 335
Ser Gly Phe Phe Asn Ser Ser Ser Gly Ala Ile Gly Asn Ser Gly
340 '345 350
Ala Asn Ala Gly Val Leu Val Ser Gly Val Ile Asn Ser Gly Asn
355 360 365
Val Ser Gly Leu Phe Asn Met Ser Leu Val Ala Ile Thr Thr Pro
370 375 380
Leu Ile Ser Gly Phe Phe Asn Thr Gly Ser Asn Met Ser Gly Phe
390 395 400
Gly Gly Pro Pro Val Phe Asn Leu Gly Leu Ala Asn Arg Gly Val
405 410 415
Asn Ile Leu Gly Asn Ala Asn Ile Gly Asn Tyr Asn Ile Leu Gly
420 425 430
Gly Asn Val Gly Asp Phe Asn Ile Leu Gly Ser Gly Asn Leu Gly
435 440 445
Gin Asn Ile Leu Gly Ser Gly Asn Val Gly Ser Phe Asn Ile Gly
450 455 460
Gly Asn Ile Gly Val Phe Asn Val Gly Ser Gly Ser Leu Gly Asn
470 475 480
Asn Ile Gly Ser Gly Asn Leu Gly Ile Tyr Asn Ile Gly Phe Gly
485 4 90 495
Val Gly Asp Tyr Asn Val Gly Phe Gly Asn Ala Gly Asp Phe Asn
500 505 510
Gly Phe Ala Asn Thr Gly Asn Asn Asn Ile Gly Phe Ala Asn Thr
515 520 525
Gly Asn Asn Asn Ile Gly Ile Gly Leu Ser Gly Asp Asn Gin Gin Gly * · . to· ·· »« ·· «ι • · · · ··· ··· · ·· · ···· · · >
··· · · ♦ · · ···· ·· «« ·« ·« ««
225
530
535
540
Phe Asn lle Ala Ser Gly Trp Asn Ser Gly Thr Gly Asn Ser Gly Leu
545 550 555 560
Phe Asn Ser Gly Thr Asn Asn Val Gly lle Phe Asn Ala Gly Thr Gly
565 570 575
Asn Val Gly lle Ala Asn Ser Gly Thr Gly Asn Trp Gly lle Gly Asn 580 585 590
Pro Gly Thr Asp Asn Thr Gly Tle Leu Asn Ala Gly Ser Tyr Asn Thr 595 600 605
Gly lle Leu Asn Ala Gly Asp Phe Asn Thr Gly Phe Tyr Asn Thr Gly 610 615 620
Ser Tyr Asn Thr Gly Gly Phe Asn Val Gly Asn Thr Asn Thr Gly Asn
625 630 635 640
Phe Asn Val Gly Asp Thr Asn Thr Gly Ser Tyr Asn Pro Gly Asp Thr
645 650 655
Asn Thr Gly Phe Phe Asn Pro Gly Asn Val Asn Thr Gly Ala Phe Asp 660 665 670
Thr Gly Asp Phe Asn Asn Gly Phe Leu Val Ala Gly Asp Asn Gin Gly 675 680 685
Gin lle Ala lle Asp Leu Ser Val Thr Thr Pro Phe lle Pro lle Asn 690 695 700
Glu Gin Met Val lle Asp Val His Asn Val Met Thr Phe Gly Gly Asn
705 710 715 720
Met lle Thr Val Thr Glu Ala Ser Thr Val Phe Pro Gin Thr Phe Tyr
725 730 735
Leu Ser Gly Leu Phe Phe Phe Gly Pro Val Asn Leu Ser Ala Ser Thr 740 745 750
Leu Thr Val Pro Thr lle Thr Leu Thr lle Gly Gly Pro Thr Val Thr 755 760 765
Val Pro lle Ser lle Val Gly Ala Leu Glu Ser Arg Thr lle Thr Phe 770 775 780
Leu Lys lle Asp Pro Ala Pro Gly lle Gly Asn Ser Thr Thr Asn Pro
785 790 795 800
Ser Ser Gly Phe Phe Asn Ser Gly Thr Gly Gly Thr Ser Gly Phe Gin
805 810 815
Asn Val Gly Gly Gly Ser Ser Gly Val Trp Asn Ser Gly Leu Ser Ser 820 825 830 . . . . *· ·· ·· »· • ! · · « « · · « · <
• ·· » · ··· · · , , • J ϊ*· · · · · ·»· ··« ······· .· « ···♦ ·· ·· ·· ·< «<
226
Ala Ile Gly Asn Ser Gly Phe Gin Asn Leu Gly Ser Leu Gin Ser Gly
835 840 845
Trp Ala Asn Leu Gly Asn Ser Val Ser Gly Phe Phe Asn Thr Ser Thr
850 855 860
Val Asn Leu Ser Thr Pro Ala Asn Val Ser Gly Leu Asn Asn Ile Gly
865 870 875 880
Thr Asn Leu Ser Gly Val Phe Arg Gly Pro Thr Gly Thr Ile Phe Asn
885 890 895
Ala Gly Leu Ala Asn Leu Gly Gin Leu Asn Ile Gly Ser Ala Ser Cys
900 905 910
Arg Ile Arg His Glu Leu Asp Thr Val Ser Thr Ile Ile Ser Ala Phe
915 920 925
Cys Gly Ser Ala Ser Asp Glu Ser Asn Pro Gly Ser Val Ser Glu
930
935
940 (2) Informace ο sekvenci SEQ ID NO: 200:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 53 párů bázi (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 200:
GGATCCATAT GGGCCATCAT CATCATCATC ACGTGATCGA CATCATCGGG ACC (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 201:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 42 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 201:
CCTGAATTCA GGCCTCGGTT GCGCCGGCCT CATCTTGAAC GA • ·· · ·· ··
227 (2) Informace ο sekvenci SEQ ID NO: 202:
·· ·· • φ • ··· (i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 31 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 202:
GGATCCTGCA GGCTCGAAAC CACCGAGCGG T (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 203:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 31 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 203:
CTCTGAATTC AGCGCTGGAA ATCGTCGCGA T (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 204:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 33 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 204:
GGATCCAGCG CTGAGATGAA GACCGATGCC GCT
228 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 205:
{i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 38 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 205:
GGATATCTGC AGAATTCAGG TTTAAAGCCC ATTTGCGA 38 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 206:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 30 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 206:
CCGCATGCGA GCCACGTGCC CACAACGGCC (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 207:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 37 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 207:
CTTCATGGAA TTCTCAGGCC GGTAAGGTCC GCTGCGG 37 (2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 208:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 7676 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 208:
TGGCGAATGG GACGCGCCCT GTAGCGGCGC ATTAAGCGCG GCGGGTGTGG TGGTTACGCG 60 • · ·
• · · • · · · to· • · · · ·· ·· • · • · · ·
229
CAGCGTGACC GCTACACTTG CCAGCGCCCT AGCGCCCGCT CCTTTCGCTT TCTTCCCTTC 120
CTTTCTCGCC ACGTTCGCCG GCTTTCCCCG TCAAGCTCTA AATCGGGGGC TCCCTTTAGG 180
GTTCCGATTT AGTGCTTTÁC GGCACCTCGA CCCCAAAAAA CTTGATTAGG GTGATGGTTC 240
ACGTAGTGGG CCATCGCCCT GATAGACGGT TTTTCGCCCT TTGACGTTGG AGTCCACGTT 300
CTTTAATAGT GGACTCTTGT TCCAAACTGG AACAACACTC AACCCTATCT CGGTCTATTC 360
TTTTGATTTA TAAGGGATTT TGCCGATTTC GGCCTATTGG TTAAAAAATG AGCTGATTTA 420
ACAAAAATTT AACGCGAATT TTAACAAAAT ATTAACGTTT ACAATTTCAG GTGGCACTTT 480
TCGGGGAAAT GTGCGCGGAA CCCCTATTTG TTTATTTTTC TAAATACATT CAAATATGTA 540
TCCGCTCATG AATTAATTCT TAGAAAAACT CATCGAGCAT CAAATGAAAC TGCAATTTAT 600
TCATATCAGG ATTATCAATA CCATATTTTT GAAAAAGCCG TTTCTGTAAT GAAGGAGAAA 660
ACTCACCGAG GCAGTTCCAT AGGATGGCAA GATCCTGGTA TCGGTCTGCG ATTCCGACTC 720
GTCCAACATC AATACAACCT ATTAATTTCC CCTCGTCAAA AATAAGGTTA TCAAGTGAGA 780
AATCACCATG AGTGACGACT GAATCCGGTG AGAATGGCAA AAGTTTATGC ATTTCTTTCC 840
AGACTTGTTC AACAGGCCAG CCATTACGCT CGTCATCAAA ATCACTCGCA TCAACCAAAC 900
CGTTATTCAT TCGTGATTGC GCCTGAGCGA GACGAAATAC GCGATCGCTG TTAAAAGGAC 960
AATTACAAAC AGGAATCGAA TGCAACCGGC GCAGGAACAC TGCCAGCGCA TCAACAATAT 1020
TTTCACCTGA ATCAGGATAT TCTTCTAATA CCTGGAATGC TGTTTTCCCG GGGATCGCAG 1080
TGGTGAGTAA CCATGCATCA TCAGGAGTAC GGATAAAATG CTTGATGGTC GGAAGAGGCA 1140
TAAATTCCGT CAGCCAGTTT AGTCTGACCA TCTCATCTGT AACATCATTG GCAACGCTAC 1200
CTTTGCCATG TTTCAGAAAC AACTCTGGCG CATCGGGCTT CCCATACAAT CGATAGATTG 1260
TCGCACCTGA TTGCCCGACA TTATCGCGAG CCCATTTATA CCCATATAAA TCAGCATCCA 1320
TGTTGGAATT TAATCGCGGC CTAGAGCAAG ACGTTTCCCG TTGAATATGG CTCATAACAC 1380
CCCTTGTATT ACTGTTTATG TAAGCAGACA GTTTTATTGT TCATGACCAA AATCCCTTAA 1440
CGTGAGTTTT CGTTCCACTG AGCGTCAGAC ČCCGTAGAAA AGATCAAAGG ATCTTCTTGA 1500
GATCCTTTTT TTCTGCGCGT AATCTGCTGC TTGCAAACAA AAAAACCACC GCTACCAGCG 1560
GTGGTTTGTT TGCCGGATCA AGAGCTACCA ACTCTTTTTC CGAAGGTAAC TGGCTTCAGC 1620
AGAGCGCAGA TACCAAATAC TGTCCTTCTA GTGTAGCCGT AGTTAGGCCA CCACTTCAAG 1680
• · • · ······· · · • · · · ·· ·· ·· ·· · ·
230
AACTCTGTAG CACCGCCTAC ATACCTCGCT CTGCTAATCC TGTTACCAGT GGCTGCTGCC 1740
AGTGGCGATA AGTCGTGTCT TACCGGGTTG GACTCAAGAC GATAGTTACC GGATAAGGCG 1800
CAGCGGTCGG GCTGAACGGG GGGTTCGTGC ACACAGCCCA GCTTGGAGCG AACGACCTAC 1860
ACCGAACTGA GATACCTACA GCGTGAGCTA TGAGAAAGCG CCACGCTTCC CGAAGGGAGA 1920
AAGGCGGACA GGTATCCGGT AAGCGGCAGG GTCGGAACAG GAGAGCGCAC GAGGGAGCTT 1980
CCAGGGGGAA ACGCCTGGTA TCTTTATAGT CCTGTCGGGT TTCGCCACCT CTGACTTGAG 2040
CGTCGATTTT TGTGATGCTC GTCAGGGGGG CGGAGCCTAT GGAAAAACGC CAGCAACGCG 2100
GCCTTTTTAC GGTTCCTGGC CTTTTGCTGG CCTTTTGCTC ACATGTTCTT TCCTGCGTTA 2160
TCCCCTGATT CTGTGGATAA CCGTATTACC GCCTTTGAGT GAGCTGATAC CGCTCGCCGC 2220
AGCCGAACGA CCGAGCGCAG CGAGTCAGTG AGCGAGGAAG CGGAAGAGCG CCTGATGCGG 2280
TATTTTCTCC TTACGCATCT GTGCGGTATT TCACACCGCA TATATGGTGC ACTCTCAGTA 2340
CAATCTGCTC TGATGCCGCA TAGTTAAGCC AGTATACACT CCGCTATCGC TACGTGACTG 2400
GGTCATGGCT GCGCCCCGAC ACCCGCCAAC ACCCGCTGAC GCGCCCTGAC GGGCTTGTCT 2460
GCTCCCGGCA TCCGCTTACA GACAAGCTGT GACCGTCTCC GGGAGCTGCA TGTGTCAGAG 2520
GTTTTCACCG TCATCACCGA AACGCGCGAG GCAGCTGCGG TAAAGCTCAT CAGCGTGGTC 2580
GTGAAGCGAT TCACAGATGT CTGCCTGTTC ATCCGCGTCC AGCTCGTTGA GTTTCTCCAG 2640
AAGCGTTAAT GTCTGGCTTC TGATAAAGCG GGCCATGTTA AGGGCGGTTT TTTCCTGTTT 2700
GGTCACTGAT GCCTCCGTGT AAGGGGGATT TCTGTTCATG GGGGTAATGA TACCGATGAA 2760
ACGAGAGAGG ATGCTCACGA TACGGGTTAC TGATGATGAA CATGCCCGGT TACTGGAACG 2820
TTGTGAGGGT AAACAACTGG CGGTATGGAT GCGGCGGGAC CAGAGAAAAA TCACTCAGGG 2880
TCAATGCCAG CGCTTCGTTA ATACAGATGT AGGTGTTCCA CAGGGTAGCC AGCAGCATCC 2940
TGCGATGCAG ATCCGGAACA TAATGGTGCA GGGCGCTGAC TTCCGCGTTT CCAGACTTTA ' 3000
CGAAACACGG AAACCGAAGA CCATTCATGT TGTTGCTCAG GTCGCAGACG TTTTGCAGCA 3060
GCAGTCGCTT CACGTTCGCT CGCGTATCGG TGATTCATTC TGCTAACCAG TAAGGCAACC 3120
CCGCCAGCCT AGCCGGGTCC TCAACGACAG GAGCACGATC ATGCGCACCC GTGGGGCCGC 3180
CATGCCGGCG ATAATGGCCT GCTTCTCGCC GAAACGTTTG GTGGCGGGAC CAGTGACGAA 3240
GGCTTGAGCG AGGGCGTGCA AGATTCCGAA TACCGCAAGC GACAGGCCGA TCATCGTCGC 3300
GCTCCAGCGA AAGCGGTCCT CGCCGAAAAT GACCCAGAGC GCTGCCGGCA CCTGTCCTAC 3360
• · • · ··· · ···· · ·· ·
231 • · · • « · · · · • · · · • · · · • · • » · ·
GAGTTGCATG ATAAAGAAGA CAGTCATAAG TGCGGCGACG ATAGTCATGC CCCGCGCCCA 3420
CCGGAAGGAG CTGACTGGGT TGAAGGCTCT CAAGGGCATC GGTCGAGATC CCGGTGCCTA 3480
ATGAGTGAGC TAACTTACAT TAATTGCGTT GCGCTCACTG CCCGCTTTCC AGTCGGGAAA 3540
CCTGTCGTGC CAGCTGCATT AATGAATCGG CCAACGCGCG GGGAGAGGCG GTTTGCGTAT 3600
TGGGCGCCAG GGTGGTTTTT CTTTTCACCA GTGAGACGGG CAACAGCTGA TTGCCCTTCA 3660
CCGCCTGGCC CTGAGAGAGT TGCAGCAAGC GGTCCACGCT GGTTTGCCCC AGCAGGCGAA 3720
AATCCTGTTT GATGGTGGTT AACGGCGGGA TATAACATGA GCTGTCTTCG GTATCGTCGT 3780
ATCCCACTAC CGAGATATCC GCACCAACGC GCAGCCCGGA CTCGGTAATG GCGCGCATTG 3840
CGCCCAGCGC CATCTGATCG TTGGCAACCA GCATCGCAGT GGGAACGATG CCCTCATTCA 3900
GCATTTGCAT GGTTTGTTGA AAACCGGACA TGGCACTCCA GTCGCCTTCC CGTTCCGCTA 3960
TCGGCTGAAT TTGATTGCGA GTGAGATATT TATGCCAGCC AGCCAGACGC AGACGCGCCG 4020
AGACAGAACT TAATGGGCCC GCTAACAGCG CGATTTGCTG GTGACCCAAT GCGACCAGAT 4080
GCTCCACGCC CAGTCGCGTA CCGTCTTCAT GGGAGAAAAT AATACTGTTG ATGGGTGTCT 4140
GGTCAGAGAC ATCAAGAAAT AACGCCGGAA CATTAGTGCA GGCAGCTTCC ACAGCAATGG 4200
CATCCTGGTC ATCCAGCGGA TAGTTAATGA TCAGCCCACT GACGCGTTGC GCGAGAAGAT 4260
TGTGCACCGC CGCTTTACAG GCTTCGACGC CGCTTCGTTC TACCATCGAC ACCACCACGC 4320
TGGCACCCAG TTGATCGGCG CGAGATTTAA TCGCCGCGAC AATTTGCGAC GGCGCGTGCA 4380
GGGCCAGACT GGAGGTGGCA ACGCCAATCA GCAACGACTG TTTGCCCGCC AGTTGTTGTG 4440
CCACGCGGTT GGGAATGTAA TTCAGCTCCG CCATCGCCGC TTCCACTTTT TCCCGCGTTT 4500
TCGCAGAAAC GTGGCTGGCC TGGTTCACCA CGCGGGAAAC GGTCTGATAA GAGACACCGG 4560
CATACTCTGC GACATCGTAT AACGTTACTG GTTTCACATT CACCACCCTG AATTGACTCT 4620
CTTCCGGGCG CTATCATGCC ATACCGCGAA AGGTTTTGCG CCATTCGATG GTGTCCGGGA 4680
TCTCGACGCT CTCCCTTATG CGACTCCTGC ATTAGGAAGC AGCCCAGTAG TAGGTTGAGG 4740
CCGTTGAGCA CCGCCGCCGC AAGGAATGGT GCATGCAAGG AGATGGCGCC CAACAGTCCC 4800
CCGGCCACGG GGCCTGCCAC CATACCCACG CCGAAACAAG CGCTCATGAG CCCGAAGTGG 4860
CGAGCCCGAT CTTCCCCATC GGTGATGTCG GCGATATAGG CGCCAGCAAC CGCACCTGTG 4920
GCGCCGGTGA TGCCGGCCAC GATGCGTCCG GCGTAGAGGA TCGAGATCTC GATCCCGCGA 4980
• · · · ······· · · ···· ·· ·· ·· ·· ··
232
AATTAATACG ACTCACTATA GGGGAATTGT GAGCGGATAA CAATTCCCCT CTAGAAATAA 5040
TTTTGTTTAA CTTTAAGAAG GAGATATACA TATGGGCCAT CATCATCATC ATCACGTGAT 5100
CGACATCATC GGGACCAGCC CCACATCCTG GGAACAGGCG GCGGCGGAGG CGGTCCAGCG 5160
GGCGCGGGAT AGCGTCGATG ACATCCGCGT CGCTCGGGTC ATTGAGCAGG ACATGGCCGT 5220
GGACAGCGCC GGCAAGATCA CCTACCGCAT CAAGCTCGAA GTGTCGTTCA AGATGAGGCC 5280
GGCGCAACCG AGGGGCTCGA AACCACCGAG CGGTTCGCCT GAAACGGGCG CCGGCGCCGG 5340
TACTGTCGCG ACTACCCCCG CGTCGTCGCC GGTGACGTTG GCGGAGACCG GTAGCACGCT 5400
GCTCTACCCG CTGTTCAACC TGTGGGGTCC GGCCTTTCAC GAGAGGTATC CGAACGTCAC 5460
GATCACCGCT CAGGGCACCG GTTCTGGTGC CGGGATCGCG CAGGCCGCCG CCGGGACGGT 5520
CAACATTGGG GCCTCCGACG CCTATCTGTC GGAAGGTGAT ATGGCCGCGC ACAAGGGGCT 5580
GATGAACATC GCGCTAGCCA TCTCCGCTCA GCAGGTCAAC TACAACCTGC CCGGAGTGAG 5640
CGAGCACCTC AAGCTGAACG GAAAAGTCCT GGCGGCCATG TACCAGGGCA CCATCAAAAC 5700
CTGGGACGAC CCGCAGATCG CTGCGCTCAA CCCCGGCGTG AACCTGCCCG GCACCGCGGT 5760
AGTTCCGCTG CACCGCTCCG ACGGGTCCGG TGACACCTTC TTGTTCACCC AGTACCTGTC 5820
CAAGCAAGAT CCCGAGGGCT GGGGCAAGTC GCCCGGCTTC GGCACCACCG TCGACTTCCC 5880
GGCGGTGCCG GGTGCGCTGG GTGAGAACGG CAACGGCGGC ATGGTGACCG GTTGCGCCGA 5940
GACACCGGGC TGCGTGGCCT ATATCGGCAT CAGCTTCCTC GACCAGGCCA GTCAACGGGG 6000
ACTCGGCGAG GCCCAACTAG GCAATAGCTC TGGCAATTTC TTGTTGCCCG ACGCGCAAAG 6060
CATTCAGGCC GCGGCGGCTG GCTTCGCATC GAAAACCCCG GCGAACCAGG CGATTTCGAT 6120
GATCGACGGG CCCGCCCCGG ACGGCTACCC GATCATCAAC TACGAGTACG CCATCGTCAA 6180
CAACCGGCAA AAGGACGCCG CCACCGCGCA GACCTTGCAG GCATTTCTGC ACTGGGCGAT 6240
CACCGACGGC AACAAGGCCT CGTTCCTCGA CCAGGTTCAT TTCCAGCCGC TGCCGCCCGC 6300
GGTGGTGAAG TTGTCTGACG CGTTGATCGC GACGATTTCC AGCGCTGAGA TGAAGACCGA 6360
TGCCGCTACC CTCGCGCAGG AGGCAGGTAA TTTCGAGCGG ATCTCCGGCG ACCTGAAAAC 6420
CCAGATCGAC CAGGTGGAGT CGACGGCAGG TTCGTTGCAG GGCCAGTGGC GCGGCGCGGC •6480
GGGGACGGCC GCCCAGGCCG CGGTGGTGCG CTTCCAAGAA GCAGCCAATA AGCAGAAGCA 6540
GGAACTCGAC GAGATCTCGA CGAATATTCG TCAGGCCGGC GTCCAATACT CGAGGGCCGA 6600
CGAGGAGCAG CAGCAGGCGC TGTCCTCGCA AATGGGCTTT GTGCCCACAA CGGCCGCCTC 6660
233
GCCGCCGTCG ACCGCTGCAG CGCCACCCGC ACCGGCGACA CCTGTTGCCC CCCCACCACC . 6720
GGCCGCCGCC AACACGCCGA ATGCCCAGCC GGGCGATCCC AACGCAGCAC CTCCGCCGGC 6780
CGACCCGAAC GCACCGCCGC CACCTGTCAT TGCCCCAAAC GCACCCCAAC CTGTCCGGAT 6840
CGACAACCCG GTTGGAGGAT TCAGCTTCGC GCTGCCTGCT GGCTGGGTGG AGTCTGACGC 6900
CGCCCACTTC GACTACGGTT CAGCACTCCT CAGCAAAACC ACCGGGGACC CGCCATTTCC 6960
CGGACAGCCG CCGCCGGTGG CCAATGACAC CCGTATCGTG CTCGGCCGGC TAGACCAAAA 7020
GCTTTACGCC AGCGCCGAAG CCACCGACTC CAAGGCCGCG GCCCGGTTGG GCTCGGACAT 7080
GGGTGAGTTC TATATGCCCT ACCCGGGCAC CCGGATCAAC CAGGAAACCG TCTCGCTTGA 7140
CGCCAACGGG GTGTCTGGAA GCGCGTCGTA TTACGAAGTC AAGTTCAGCG ATCCGAGTAA 7200
GCCGAACGGC CAGATCTGGA CGGGCGTAAT CGGCTCGCCC GCGGCGAACG CACCGGACGC 7260
CGGGCCCCCT CAGCGCTGGT TTGTGGTATG GCTCGGGACC GCCAACAACC CGGTGGACAA 7320
GGGCGCGGCC AAGGCGCTGG CCGAATCGAT CCGGCCTTTG GTCGCCCCGC CGCCGGCGCC 7380
GGCACCGGCT CCTGCAGAGC CCGCTCCGGC GCCGGCGCCG GCCGGGGAAG TCGCTCCTAC 7440
CCCGACGACA CCGACACCGC AGCGGACCTT ACCGGCCTGA GAATTCTGCA GATATCCATC 7500
ACACTGGCGG CCGCTCGAGC ACCACCACCA CCACCACTGA GATCCGGCTG CTAACAAAGC 7560
CCGAAAGGAA GCTGAGTTGG CTGCTGCCAC CGCTGAGCAA TAACTAGCAT AACCCCTTGG 7620
GGCCTCTAAA CGGGTCTTGA GGGGTTTTTT GCTGAAAGGA GGAACTATAT CCGGAT 7676
(2) Informace o sekvenci SEQ ID NO: 209:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 802 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 209:
Met Gly His His His His His His Val Ile Asp Ile Ile Gly Thr Ser
1 5 10 15
Pro Thr Ser Trp Glu Gin Ala Ala Ala Glu Ala Val Gin Arg Ala Arg
20 25 30
1/Mé, 237
OKY
rozpustného antigenů

Claims (54)

  1. PATENTOVÉ NÁR
    1. Polypeptid obsahující antigenní část
    M. tuberculosis nebo variantu uvedeného antigenů, která se liší pouze v konzervativních substitucích a/nebo modifikacích, přičemž uvedený antigen má N-terminální sekvenci vybranou ze skupiny zahrnující:
    (a) Asp-Pro-Val-Asp-Ala-Val-Ile-Asn-Thr-Thr-Cys-Asn-Tyr-GlyGln-Val-Val-Ala-Ala-Leu (SEQ ID NO: 115);
    (b) Ala-Val-Glu-Ser-Gly-Met-Leu-Ala-Leu-Gly-Thr-Pro-Ala-ProSer (SEQ ID NO: 116);
    (c) Ala-Ala-Met-Lys-Pro-Arg-Thr-Gly-Asp-Gly-Pro-Leu-Glu-AlaAla-Lys-Glu-Gly-Arg (SEQ ID NO: 17);
    (d) Tyr-Tyr-Trp-Cys-Pro-Gly-Gln-Pro-Phe-Asp-Pro-Ala-Trp-GlyPro (SEQ ID NO: 118);
    (e) Asp-Ile-Gly-Ser-Glu-Ser-Thr-Glu-Asp-Gln-Gln-Xaa-Ala-Val (SEQ ID NO:119);
    (f) Ala-Glu-Glu-Ser-Ile-Ser-Thr-Xaa-Glu-Xaa-Ile-Val-Pro (SEQ ID NO: 120);
    (g) Asp-Pro-Glu-Pro-Ala-Pro-Pro-Val-Pro-Thr-Thr-Ala-Ala-SerPro-Pro-Ser (SEQ ID NO: 121);
    (h) Ala-Pro-Lys-Thr-Tyr-Xaa-Glu-Glu-Leu-Lys-Gly-Thr-Asp-ThrGly (SEQ ID NO: 122);
    (i) Asp-Pro-Ala-Ser-Ala-Pro-Asp-Val-Pro-Thr-Ala-Ala-Gln-LeuThr-Ser-Leu-Leu-Asn-Ser-Leu-Ala-Asp-Pro-Asn-Val-Ser-PheAla-Asn (SEQ ID NO: 123) a (j) Ala-Pro-Glu-Ser-Gly-Ala-Gly-Leu-Gly-Gly-Thr-Val-Gln-AlaGly (SEQ ID NO:131), kde Xaa může být libovolná aminokyselina.
  2. 2. Polypeptid obsahující imunogenní část antigenů M. tuberculosis nebo variantu uvedeného antigenů, která se liší pouze v konzervativních substitucích a/nebo modifikacích,
    238 • ··· • · ······· · · ···· ·» ·· ·· ·· ·♦ přičemž uvedený antigen má N-terminální sekvenci vybranou ze skupiny zahrnující:
    (a) Asp-Pro-Pro-Asp-Pro-His-Gln-Xaa-Asp-Met-Thr-Lys-Gly-TyrTyr-Pro-Gly-Gly-Arg-Arg-Xaa-Phe (SEQ ID NO: 124) a (b) Xaa-Tyr-Ile-Ala-Tyr-Xaa-Thr-Thr-Ala-Gly-Ile-Val-Pro-GlyLys-Ile-Asn-Val-His-Leu-Val (SEQ ID NO: 132) kde Xaa může být libovolná aminokyselina.
  3. 3. Polypeptid obsahující antigenní část rozpustného antigenu M. tuberculosis nebo variantu uvedeného antigenu, která se liší pouze v konzervativních substitucích a/nebo modifikacích, přičemž uvedený antigen obsahuje aminokyselinovou sekvenci kódovanou sekvencí DNA vybranou ze skupiny, která zahrnuje sekvence uvedené v SEQ ID NO: 1, 2, 4 až 10, 13 až 25, 52, 94 a 96, komplementy uvedených sekvencí a sekvence DNA, které hybridizují se sekvencemi uvedenými v SEQ ID NO: 1, 2, 4 až 10, 13 až 25, 52, 94 a 96 nebo s jejich komplementem za mírně přísných podmínek.
  4. 4. Polypeptid obsahující antigenní část antigenu M.
    tuberculosis nebo variantu uvedeného antigenu, která se liší pouze v konzervativních substitucích a/nebo modifikacích, přičemž uvedený antigen obsahuje aminokyselinovou sekvenci kódovanou sekvencí DNA vybranou ze skupiny, která zahrnuje sekvence uvedené v SEQ ID NO: 26 až 51, 133, 134, 158-178 a 196, komplementy uvedených sekvencí a sekvence DNA, které hybridizují se sekvencemi uvedenými v SEQ ID NO: 26 až 51,
    133, 134, 158-178 a 196 nebo s jejich komplementem za mírně přísných podmínek.
  5. 5. Molekula DNA obsahující nukleotidovou sekvenci kódující polypeptid podle libovolného z nároků 1 až 4.
    239 • · • ···
  6. 6. Rekombinantní expresivní vektor, vyznačující se tím, že obsahuje molekulu DNA podle nároku 5.
  7. 7. Hostitelská buňka, vyznačující se tím, že je transformována expresivním vektorem podle nároku 6.
  8. 8. Hostitelská buňka podle nároku 7, vyznačuj ící se tím, zeje vybrána ze skupiny zahrnující buňky E. coli, buňky kvasinek a savčí buňky.
  9. 9. Způsob detekce infekce M. tuberculosis v biologickém vzorku, vyznačující se tím, že zahrnuje:
    (a) kontakt biologického vzorku s jedním nebo více polypeptidů podle libovolného z nároků 1 až 4 a (b) detekci přítomnosti protilátek ve vzorku, které se vážou alespoň na jeden z polypeptidů, čímž v biologickém vzorku detekují infekci M. tuberculosis.
  10. 10. Způsob detekce infekce M. tuberculosis v biologickém vzorku, vyznačující se tím, že zahrnuje:
    (a) kontakt biologického vzorku s polypeptidem, který vykazuje N-terminální sekvenci vybranou ze skupiny zahrnující sekvence uvedené v SEQ ID NO: 129 a 130 a (b) detekci přítomnosti protilátek ve vzorku, které se vážou alespoň na jeden z polypeptidů, čímž v biologickém vzorku detekují infekci M. tuberculosis.
  11. 11. Způsob detekce infekce M. tuberculosis v biologickém vzorku, vyznačující se tím, že zahrnuje:
    (a) kontakt biologického vzorku s jedním nebo více polypeptidů, který je kódován sekvencí DNA vybranou ze skupiny zahrnující SEQ ID NO: 3, 11, 12, 135, 136, 151 až 155, 184 až 188, 194 až 195 a 198, komplementy uvedených sekvencí a sekvence DNA, které hybridizují se sekvencí
    240 ·· ··· ·· ·· ··· ··· ······· · · ···· ·· ·· ·· ·· ·· uvedenou, v SEQ ID NO: 3, 11, 12, 135, 136, 151 až 155,
    184 až 188, 194 až 195 a 198, a (b) detekci přítomnosti protilátek ve vzorku, které se vážou alespoň na jeden z polypeptidů, čímž v biologickém vzorku detekují infekci M. tuberculosis.
  12. 12. Způsob podle libovolného z nároků 9 až 11, vyznačující se tím, že krok popsaný v odstavci (a) navíc zahrnuje kontakt biologického vzorku s antigenem 38 kD M. tuberculosis a krok popsaný v odstavci (b) navíc zahrnuje detekci přítomnosti protilátek ve vzorku, které se vážou na antigen 38 kD M. tuberculosis.
  13. 13. Způsob podle libovolného z nároků 9 až 11, vyznačující se tím, že polypeptid(y) je vázán na pevném podkladu.
  14. 14. Způsob podle nároku 13, vyznačující se tím, ž e pevný podklad obsahuje nitrocelulózový, latexový nebo plastový materiál.
  15. 15. Způsob podle libovolného z nároků 9 až 11, vyznačující se tím, že biologický vzorek se vybral ze skupiny zahrnující plnou krev, sérum, plazmu, sliny, mozkomíšní mok a moč.
  16. 16. Způsob podle nároku 15, vyznačující se tím, že biologickým vzorkem je plná krev nebo sérum.
  17. 17. Způsob detekce infekce M. tuberculosis v biologickém vzorku, vyznačující se tím, že zahrnuje:
    (a) kontakt vzorku při polymerázové řetězcové reakci alespoň s dvěma oligonukleotidovými primery, přičemž alespoň
    241 • 44 • ···
    4 4« • 4 (b) jeden z nukleotidových primerů je specifický pro molekulu DNA podle nároku 5 a detekci sekvence DNA ve vzorku, která se amplifikuje v přítomnosti oligonukleotidových primerů, čímž se detekuje infekce M. tuberculosis.
  18. 18. Způsob podle nároku 17, vyznačující se tím, že alespoň jeden z oligonukleotidových primerů obsahuje alespoň přibližně deset přiléhajících nukleotidů molekuly DNA podle nároku 5.
  19. 19. Způsob detekce infekce M. tuberculosis v biologickém vzorku, vyznačující se tím, že zahrnuje:
    (a) kontakt vzorku při polymerázové řetězcové reakci alespoň s dvěma oligonukleotidovými primery, přičemž alespoň jeden z oligonukleotidových primerů je specifický pro sekvenci DNA vybranou za skupiny zahrnující SEQ ID NO: 3, 11, 12, 135, 136, 151 až 155, 184 až 188, 194 až 195 a 198 a (b) detekci sekvence DNA ve vzorku, která se amplifikuje v přítomnosti prvního a druhého oligonukleotidového primeru, čímž se detekuje infekce M. tuberculosis.
  20. 20. Způsob podle nároku 19, vyznačující se tím, že alespoň jeden z oligonukleotidových primerů obsahuje alespoň přibližně deset k sobě přiléhajících nukleotidů sekvence DNA vybrané za skupiny zahrnující SEQ ID NO: 3, 11, 12, 135, 136, 151 až 155, 184 až 188, 194 až 195 a 198.
  21. 21. Způsob podle nároku 17 nebo 19, vyznačující se tím, že biologický vzorek se vybral ze skupiny zahrnující plnou krev, sputum, sérum, plazmu, sliny, mozkomíšní mok a moč.
    242 • · • ·· · φ«
  22. 22. Způsob detekce infekce M. tuberculosis v biologickém vzorku, vyznačující se tím, že zahrnuje:
    (a) kontakt vzorku s jednou nebo více oligonukleotidových sond specifických pro molekulu DNA podle nároku 5 a (b) detekci sekvence DNA ve vzorku, která hybridizuje s oligonukleotidovou sondou, čímž se detekuje infekce M. tuberculosis.
  23. 23. Způsob podle nároku 22,vyznačující se tím, ž e sonda obsahuje alespoň přibližně 15 k sobě přiléhajících nukleotidů molekuly DNA podle nároku 5.
  24. 24. Způsob detekce infekce M. tuberculosis v biologickém vzorku, vyznačující se tím, že zahrnuje:
    (a) kontakt vzorku s jednou nebo více oligonukleotidových sond specifických pro sekvencí DNA vybranou ze skupiny zahrnující SEQ ID NO: 3, 11, 12, 135, 136, 151-155, 184188, 194-195 a 198 a (b) detekci sekvence DNA ve vzorku, která hybridizuje s oligonukleotidovou sondou, čímž se detekuje infekce M. tuberculosis.
  25. 25. Způsob podle nároku 24, vyznačující se tím, ž e oligonukleotidové sonda obsahuje alespoň přibližně 15 k sobě přiléhajících nukleotidů sekvence DNA vybrané ze skupiny zahrnující SEQ ID NO: 3, 11, 12, 135, 136, 151-155, 184-188, 194-195 a 198.
  26. 26. Způsob podle nároků 22 nebo 24, vyznačující se tím, že biologický vzorek se vybral ze skupiny zahrnující plnou krev, sputum, sérum, plazmu, sliny, mozkomíšní mok a moč.
    « · ·
    243
  27. 27. Způsob detekce infekce M. tuberculosis v biologickém vzorku, vyznačující se tím, že zahrnuje:
    (a) kontakt biologického vzorku s vazebným činidlem, které je schopné se vázat na polypeptid podle libovolného z nároků 1 až 4 a (b) detekci proteinu nebo polypeptidu ve vzorku, který se váže na vazebné činidlo, čímž se detekuje infekce M. tuberculosis.
  28. 28. Způsob detekce infekce M. tuberculosis v biologickém vzorku, vyznačující se tím, že zahrnuje:
    (a) kontakt biologického vzorku s vazebným činidlem, které je schopné se vázat na polypeptid, který má N-terminální sekvenci vybranou ze skupiny zahrnující sekvence uvedené v SEQ ID NO: 129 a 130 a (b) detekci proteinu nebo polypeptidu ve vzorku, který je schopen se vázat na vazebné činidlo, čímž se v biologickém vzorku detekuje infekce M. tuberculosis.
  29. 29. Způsob detekce infekce M. tuberculosis v biologickém vzorku, vyznačující se tím, že zahrnuje:
    (a) kontakt biologického vzorku s vazebným činidlem, které je schopné se vázat na polypeptid kódovaný sekvencí DNA vybranou ze skupiny zahrnující SEQ ID NO: 3, 11, 12, 135, 136, 151-155, 184-188, 194-195 a 198 a komplementy uvedených sekvencí a sekvence DNA, které hybridizují se sekvencí uvedenou v SEQ ID NO: 3, 11, 12, 135, 136, 151155, 184-188, 194-195 a 198 a (b) detekci proteinu nebo polypeptidu ve vzorku, který je schopen se vázat na vazebné činidlo, čímž se v biologickém vzorku detekuje infekce M. tuberculosis .
    ···
    244 ·· ·· « · · • ·· • · • · · ···· ·· ·· ·· • · • ··· • · · • · · ·· «· ··· ·· «
    ··
  30. 30. Způsob podle libovolného z nároků 27 až 29, vyznačující se tím, že vazebným činidlem je monoklonální protilátka.
  31. 31. Způsob podle libovolného z nároků 27 až 29, vyznačující se tím, že vazebné činidlo je polyklonální protilátka.
  32. 32. Diagnostický kit, vyznačující se tím, že obsahuje:
    (a) jeden nebo více polypeptidů podle libovolného z nároků 1 až 4 a (b) detekční činidlo.
  33. 33. Diagnostický kit, vyznačující se tím, že obsahuje:
    (a) jeden nebo více polypeptidů, který má N-terminální sekvenci vybranou ze skupiny zahrnující sekvence uvedené v SEQ ID NO: 129 a 130 a (b) detekční činidlo.
  34. 34. Diagnostický kit, vyznačující se tím, že obsahuj e:
    (a) jeden nebo více polypeptidů kódovaných sekvencí DNA vybranou ze skupiny zahrnující SEQ ID NO: 3, 11, 12, 135, 136, 151-155, 184-188, 194-195 a 198, komplementy uvedených sekvencí a sekvence DNA, které hybridizují se sekvencí uvedené v SEQ ID NO: 3, 11, 12, 135, 136, 151155, 184-188, 194-195 a 198 a (b) detekční činidlo.
  35. 35. Kit podle libovolného z nároků 32 až 34, vyznačující se tím, že polypeptid(y) je imobilizovaný na pevném podkladu.
    245 • · ··« ·· ·· ··· ··· ······· · · ···· ·· ·· ·· ·· ··
  36. 36. Kit podle nároku 35, vyznačující se tím, že pevný podklad obsahuje nitrocelulózu, latex nebo plastový materiál.
  37. 37. Kit podle libovolného z nároků 32 až 34, vyznačující se tím, že detekční činidlo obsahuje reportní skupinu spojenou s vazebným činidlem.
  38. 38. Kit podle nároku 37,vyznačující se tím, ž e vazebné činidlo se vybralo ze skupiny obsahující antiimunoglobiny, protein G, protein A a lektiny.
  39. 39. Kit podle nároku 37,vyznačující se tím, ž e reportní skupina se vybrala ze skupiny zahrnující radioizotopy, fluorescenční skupiny, luminiscenční skupiny, enzymy, biotin a částice barviva.
  40. 40. Diagnostický kit, vyznačující se tím, že obsahuje alespoň dva oligonukleotidové primery, přičemž alespoň jeden z oligonukleotidových primerů je specifický pro molekulu DNA podle nároku 5.
  41. 41. Diagnostický kit podle nároku 40, vyznačující se tím, že alespoň jeden z oligonukleotidových primerů obsahuje alespoň přibližně 10 k sobě přiléhajících nukleotidů molekuly DNA podle nároku 5.
  42. 42. Diagnostický kit, vyznačující se tím, že obsahuje alespoň dva oligonukleotidové primery, přičemž alespoň jeden z primerů je specifický pro sekvenci DNA vybranou ze skupiny zahrnující SEQ ID NO: 3, 11, 12, 135, 136, 151-155, 184-188, 194-195 a 198.
    • · • ·
    246
  43. 43. Diagnostický kit podle nároku 42, vyznačující se tím, že alespoň jeden z oligonukleotidových primerů obsahuje přibližně 10 přiléhajících nukleotidů sekvence DNA vybrané ze skupiny zahrnující SEQ ID NO: 3, 11, 12, 135, 136, 151-155, 184-188, 194-195 a 198.
  44. 44. Diagnostický kit obsahující alespoň jednu oligonukleotidovou sondu, vyznačující se tím, že oligonukleotidová sonda je specifická pro molekulu DNA podle nároku 5.
  45. 45. Kit podle nároku 44, vyznačující se tím, ž e oligonukleotidová sonda obsahuje alespoň přibližně 15 k sobě přiléhajících nukleotidů molekuly DNA podle nároku 5.
  46. 46. Diagnostický kit, vyznačující se tím, že obsahuje alespoň jednu oligonukleotidovou sondu, která je specifická pro sekvenci DNA vybranou ze skupiny zahrnující SEQ ID NO: 3, 11, 12, 135, 136, 151-155, 184-188, 194-195 a 198.
  47. 47. Kit podle nároku 46, vyznačující se tím, že oligonukleotidová sonda obsahuje alespoň přibližně 15 k sobě přiléhajících nukleotidů sekvence DNA vybrané ze skupiny zahrnující SEQ ID NO: 3, 11, 12, 135, 136, 151-155, 184-188, 194-195 a 198.
  48. 48. Monoklonální protilátky, které se váží na polypeptid podle libovolného z nároků 1 až 4.
  49. 49. Polyklonální protilátky, které se váží na polypeptid podle libovolného z nároků 1 až 4.
    247 ·· ··· ·· ·· ··· ··· ······· · · ···· ·· ·· ·· ·· ·*
  50. 50. Fúzní protein, který obsahuje dva nebo více polypeptidů podle libovolného z nároků 1 až 4.
  51. 51. Fúzní protein, který obsahuje dva nebo více polypeptidů podle libovolného z nároků 1 až 4 a ESAT-6 (SEQ ID NO: 99).
  52. 52. Fúzní protein, který obsahuje polypeptid, který má Nterminální sekvenci vybranou ze skupiny sekvencí uvedených v SEQ ID NO: 129 a 130.
  53. 53. Fúzní protein, který obsahuje dva nebo více polypeptidů podle libovolného z nároků 1 až 4 a antigen 38 kD (SEQ ID NO: 150) M. tuberculosis .
  54. 54. Diagnostický kit, vyznačující se tím, že zahrnuje:
    (a) jeden nebo více fůzních proteinů podle libovolného z nároků 50 až 53 a (b) detekční činidlo.
CZ991266A 1996-10-11 1997-10-07 Polypeptid obsahující antigenní část rozpustného antigenu M. tuberculosis nebo variantu uvedeného antigenu, molekula DNA kódující tento polypeptid, expresivní vektor, hostitelská buňka, způsoby diagnostiky infekce M. tuberculosis a diagnostické kity CZ126699A3 (cs)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US72962296A 1996-10-11 1996-10-11
US08/818,111 US6338852B1 (en) 1995-09-01 1997-03-13 Compounds and methods for diagnosis of tuberculosis

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CZ126699A3 true CZ126699A3 (cs) 1999-09-15

Family

ID=27111919

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CZ991266A CZ126699A3 (cs) 1996-10-11 1997-10-07 Polypeptid obsahující antigenní část rozpustného antigenu M. tuberculosis nebo variantu uvedeného antigenu, molekula DNA kódující tento polypeptid, expresivní vektor, hostitelská buňka, způsoby diagnostiky infekce M. tuberculosis a diagnostické kity

Country Status (11)

Country Link
EP (1) EP0934415A2 (cs)
JP (1) JP2001500383A (cs)
AU (1) AU4750597A (cs)
BR (1) BR9712298A (cs)
CA (1) CA2268036A1 (cs)
CZ (1) CZ126699A3 (cs)
IL (2) IL129389A0 (cs)
NO (1) NO991693L (cs)
PL (1) PL333304A1 (cs)
TR (1) TR199901569T2 (cs)
WO (1) WO1998016645A2 (cs)

Families Citing this family (28)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6991797B2 (en) 1993-07-02 2006-01-31 Statens Serum Institut M. tuberculosis antigens
US6982085B2 (en) 1997-04-02 2006-01-03 Statens Serum Institut TB diagnostic based on antigens from M. tuberculosis
US6613881B1 (en) * 1997-05-20 2003-09-02 Corixa Corporation Compounds for immunotherapy and diagnosis of tuberculosis and methods of their use
EP1003870A1 (en) * 1997-07-16 2000-05-31 Institut Pasteur A polynucleotide functionally coding for the lhp protein from mycobacterium tuberculosis, its biologically active derivative fragments, as well as methods using the same
EP1484405A1 (en) * 1997-11-10 2004-12-08 Statens Serum Institut Nucleic acid fragments and polypeptide fragments derived from M. Tuberculosis
US6465633B1 (en) 1998-12-24 2002-10-15 Corixa Corporation Compositions and methods of their use in the treatment, prevention and diagnosis of tuberculosis
US20030027774A1 (en) * 1999-03-18 2003-02-06 Ronald C. Hendrickson Tuberculosis antigens and methods of use therefor
EP2087906A1 (en) 1999-05-04 2009-08-12 The University of Medicine and Dentistry of New Jersey Proteins expressed by Mycobacterium tuberculosis and not by BCG and their use as diagnostic reagents and vaccines
US7009042B1 (en) 1999-10-07 2006-03-07 Corixa Corporation Methods of using a Mycobacterium tuberculosis coding sequence to facilitate stable and high yield expression of the heterologous proteins
ATE354663T1 (de) * 1999-10-07 2007-03-15 Corixa Corp Eine mycobacterium tuberculosis kodierende sequenz zur expression von heterologen proteinen
US6316205B1 (en) 2000-01-28 2001-11-13 Genelabs Diagnostics Pte Ltd. Assay devices and methods of analyte detection
WO2001062893A2 (en) 2000-02-25 2001-08-30 Corixa Corporation Compounds and methods for diagnosis and immunotherapy of tuberculosis
ATE526994T1 (de) 2000-06-20 2011-10-15 Corixa Corp Mtb32a antigen aus mycobakterium tuberculosis mit inaktivierter protease aktivität und fusionsproteine die das antigen enthalten
AU2001271963A1 (en) * 2000-07-10 2002-01-21 Colorado State University Research Foundation Mid-life vaccine and methods for boosting anti-mycobacterial immunity
WO2003000721A2 (en) 2001-06-22 2003-01-03 Health Protection Agency Mycobacterial antigens expressed under low oxygen tension
EP1404706A2 (en) 2001-07-04 2004-04-07 Health Protection Agency Mycobacterial antigens expressed during latency
ATE470710T1 (de) * 2001-07-25 2010-06-15 Tosoh Corp Auf nasba basiertes detektionsverfahren zur detektion des tuberkelbazillus
GB0125535D0 (en) * 2001-10-24 2001-12-12 Microbiological Res Authority Mycobacterial genes down-regulated during latency
WO2003070187A2 (en) 2002-02-15 2003-08-28 Corixa Corporation Fusion proteins of mycobacterium tuberculosis
US8475735B2 (en) 2004-11-01 2013-07-02 Uma Mahesh Babu Disposable immunodiagnostic test system
AU2005305869B2 (en) 2004-11-16 2010-12-09 Aeras Global Tb Vaccine Foundation Multivalent vaccines comprising recombinant viral vectors
EA012576B1 (ru) 2005-04-29 2009-10-30 Глаксосмитклайн Байолоджикалс С.А. Новый способ предупреждения или лечения инфекции, вызываемой m.tuberculosis
ES2534428T3 (es) * 2005-07-26 2015-04-22 Rutgers, The State University Of New Jersey Perfiles de anticuerpos específicos de un estado tuberculoso
CN100999550B (zh) 2006-01-10 2010-10-06 中国人民解放军第三○九医院 结核分枝杆菌融合蛋白及其应用
GB0618127D0 (en) * 2006-09-14 2006-10-25 Isis Innovation Biomarker
EP2368568A1 (en) 2006-11-01 2011-09-28 Immport Therapeutics, INC. Compositions and methods for immunodominant antigens
PT2528621T (pt) 2010-01-27 2016-12-20 Glaxosmithkline Biologicals Sa Antigénios de tuberculose modificados
CN115746092B (zh) * 2022-08-12 2024-08-13 齐鲁工业大学 具有抗氧化、抗衰老活性的钝顶螺旋藻藻蓝蛋白活性肽及其应用

Family Cites Families (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
FR2244539A1 (en) * 1973-07-13 1975-04-18 Mitsui Pharmaceuticals Tuberculin active proteins and peptides prepn - from tubercle bacillus
FR2265402A1 (en) * 1974-03-29 1975-10-24 Mitsui Pharmaceuticals Tuberculin active proteins and peptides prepn - from tubercle bacillus
EP0419355B1 (en) * 1989-09-19 2000-02-09 N.V. Innogenetics S.A. Recombinant polypeptides and peptides, nucleic acids coding for the same and use of these polypeptides and peptides in the diagnostic of tuberculosis
FR2677365B1 (fr) * 1991-06-07 1995-08-04 Pasteur Institut Proteines de mycobacterium et applications.
US5330754A (en) * 1992-06-29 1994-07-19 Archana Kapoor Membrane-associated immunogens of mycobacteria
DK79893D0 (da) * 1993-07-02 1993-07-02 Statens Seruminstitut New vaccine
DK79793D0 (da) * 1993-07-02 1993-07-02 Statens Seruminstitut Diagnostic test
US5714593A (en) * 1995-02-01 1998-02-03 Institut Pasteur DNA from mycobacterium tuberculosis which codes for a 45/47 kilodalton protein
ATE426025T1 (de) * 1995-09-01 2009-04-15 Corixa Corp Verbindungen und verfahren zur immuntherapie und diagnose von tuberkulose
ATE324445T1 (de) * 1995-09-01 2006-05-15 Corixa Corp Verbindungen und verfahren zur diagnose von tuberkulose

Also Published As

Publication number Publication date
IL129389A0 (en) 2000-02-17
BR9712298A (pt) 2000-10-24
PL333304A1 (en) 1999-11-22
AU4750597A (en) 1998-05-11
NO991693L (no) 1999-06-09
WO1998016645A2 (en) 1998-04-23
IL121936A0 (en) 1998-03-10
EP0934415A2 (en) 1999-08-11
CA2268036A1 (en) 1998-04-23
TR199901569T2 (xx) 2000-12-21
JP2001500383A (ja) 2001-01-16
NO991693D0 (no) 1999-04-09
WO1998016645A3 (en) 1998-08-06

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US6458366B1 (en) Compounds and methods for diagnosis of tuberculosis
US6592877B1 (en) Compounds and methods for immunotherapy and diagnosis of tuberculosis
CZ126699A3 (cs) Polypeptid obsahující antigenní část rozpustného antigenu M. tuberculosis nebo variantu uvedeného antigenu, molekula DNA kódující tento polypeptid, expresivní vektor, hostitelská buňka, způsoby diagnostiky infekce M. tuberculosis a diagnostické kity
CZ126599A3 (cs) Polypeptid pro imunoterapii a diagnosu tuberkulosy
WO1998016646A9 (en) Compounds and methods for immunotherapy and diagnosis of tuberculosis
US6350456B1 (en) Compositions and methods for the prevention and treatment of M. tuberculosis infection
SA99200488B1 (ar) تركيبات وطرق لاج والوقاية من الاصابة بعدوي بكتيريا العصيات الفطرية للدرنM.tuberculosis
AU727602B2 (en) Compounds and methods for immunotherapy and diagnosis of tuberculosis
US6338852B1 (en) Compounds and methods for diagnosis of tuberculosis
EP0850305A2 (en) Compounds and methods for diagnosis of tuberculosis
US20010012888A1 (en) Compounds for diagnosis of tuberculosis and methods of their use
MXPA01009383A (es) Antigenos de tuberculosis y metodos para utilizar los mismos.
MXPA99003393A (en) Compounds and methods for diagnosis of tuberculosis
CN1241212A (zh) 免疫治疗和诊断结核病的化合物和方法
MXPA99003392A (en) Compounds and methods for immunotherapy and diagnosis of tuberculosis
CN1242047A (zh) 诊断结核病的化合物和方法
HK1040366A (en) Compounds and methods for diagnosis of tuberculosis
AU765833B2 (en) Compounds and methods for immunotherapy and diagnosis of tuberculosis
KR20000049100A (ko) 결핵을 진단하는 화합물 및 방법

Legal Events

Date Code Title Description
PD00 Pending as of 2000-06-30 in czech republic