DE19704024A1 - Proteins, DNA sequences coding for them, on the other hand specific antibodies and their use to find nematicidal active substances - Google Patents
Proteins, DNA sequences coding for them, on the other hand specific antibodies and their use to find nematicidal active substancesInfo
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Abstract
Description
Die vorliegende Erfindung betrifft Proteine, sowie Teilstücke dieser Proteine, die mit gegen parasitierende Nematoden wirkenden Stoffen aus der Gruppe der cycli schen oder offenkettigen Depsipeptide, die aus Aminosäuren und Hydroxycarbon säuren bestehen, reagieren, ferner DNA-Sequenzen die für diese Proteine bzw. für Teilstücke dieser Proteine kodieren sowie die Verwendung dieser Proteine oder ihrer Teilstücke zur Identifizierung von Stoffen mit Wirkung gegen parasitierende Nematoden.The present invention relates to proteins, as well as portions of these proteins that with substances acting against parasitic nematodes from the group of cycli or open-chain depsipeptides consisting of amino acids and hydroxycarbon acids exist, react, furthermore DNA sequences for these proteins or for Coding sections of these proteins and the use of these proteins or their sections for the identification of substances with action against parasitizing Nematodes.
Eine Reihe nematizider Substanzen werden bereits seit langem als Breitspektrum- Anthelmintika in der Tierzucht verwendet (z. B. Benzimidazole, Levamisol, Morantel oder Avermectinoide). Ausgehend von den genannten Substanzklassen führten zahlreiche Studien zur Aufklärung des Wirkmechanismus und zur Iden tifizierung des jeweiligen Bindungsproteins/Rezeptors (Benzimidazol: β-Tubulin, Levamisol/Morantel: nikotinerger Acetylcholinrezeptor; Avermectinoide: Glutamat vermittelter Chlorid-Kanal). Durch zunehmende Resistenz gegen diese Breit spektrum-Anthelmintika ist es wünschenswert neue anthelmintisch wirksame Stoffe zu entwickeln.A number of nematicidal substances have long been used as broad-spectrum Anthelmintics used in animal breeding (e.g. benzimidazole, levamisole, Morantel or avermectinoids). Based on the substance classes mentioned conducted numerous studies to elucidate the mechanism of action and to iden tification of the respective binding protein / receptor (benzimidazole: β-tubulin, Levamisole / Morantel: nicotinic acetylcholine receptor; Avermectinoids: glutamate mediated chloride channel). By increasing resistance to this broad spectrum anthelmintics, it is desirable to have new anthelmintically active substances to develop.
Ein cyclisches Depsipeptid PF 1022A und seine Wirkung gegen Endoparasiten ist bekannt (Y. Kodama et al., Sci. Reports of Meiji Seika Kaisha 31, 1992, S. 1-8; EP-OS 382 173 und EP-OS 503 538). Weitere cyclische Depsipeptide (Cycloocta depsipeptide: WO 93/19053; EP-OS 634 408; WO 94/19334; WO 95/07272; EP-OS 626 375; EP-OS 626 376; EP-OS 664 297; Cyclohexadepsipeptide: WO 93/25543; WO 95/27498; EP-OS 658 551) und offenkettige Depsipeptide (EP-OS 657 171; EP-OS 657 172; EP-OS 657 173) und ihre endoparasitizide Wirkung sind bekannt.A cyclic depsipeptide PF 1022A and its activity against endoparasites is known (Y. Kodama et al., Sci. Reports of Meiji Seika Kaisha 31, 1992, pp. 1-8; EP-OS 382 173 and EP-OS 503 538). Other cyclic depsipeptides (Cycloocta depsipeptide: WO 93/19053; EP-OS 634 408; WO 94/19334; WO 95/07272; EP-OS 626 375; EP-OS 626 376; EP-OS 664 297; Cyclohexadepsipeptides: WO 93/25543; WO 95/27498; EP-OS 658 551) and open-chain depsipeptides (EP-OS 657 171; EP-OS 657 172; EP-OS 657 173) and their endoparasiticides Effects are known.
Eine Reihe von Studien bezüglich der Aufklärung des Wirkungsmechanismus von PF 1022A in verschiedenen parasitären Nematoden, beispielsweise Angio strongylus cantonensis, Haemonchus contortus, Ascaris suum, wurden durchgeführt (vgl. dazu M. Terada et al., Jpn. J. Parasitol. 42, 1993 S. 220-226; F.E. Dutton et al., J. Antibiotics 48, 1995, S. 820-823; E. Baldwin et al., J. Exp. Biol. 23, 1947, S. 277-91). A series of studies to elucidate the mechanism of action of PF 1022A in various parasitic nematodes, e.g. angio strongylus cantonensis, Haemonchus contortus, Ascaris suum (see also M. Terada et al., Jpn. J. Parasitol. 42, 1993 pp. 220-226; F.E. Dutton et al., J. Antibiotics 48, 1995, pp. 820-823; E. Baldwin et al., J. Exp. Biol. 23, 1947, Pp. 277-91).
Außer den bereits genannten Breitspektrum-Anthelmintika (z. B. Benzimidazole, Levamisol, Morantel oder Avermectinoide) ist über ein Bindungsprotein bzw. Rezeptor in Nematoden von cyclischen oder offenkettigen Depsipeptiden als Liganden, bestehend aus Aminosäuren und Hydroxycarbonsäuren als Bausteine, insbesondere des cyclischen Depsipeptids PF 1022A, bisher nichts bekannt geworden.In addition to the broad-spectrum anthelmintics already mentioned (e.g. benzimidazoles, Levamisole, morantel or avermectinoids) is via a binding protein or Receptor in nematodes of cyclic or open chain depsipeptides as Ligands consisting of amino acids and hydroxycarboxylic acids as building blocks, in particular the cyclic depsipeptide PF 1022A, so far nothing is known become.
Die vorliegende Erfindung betrifft Proteine, sowie Teilstücke dieser Proteine, die mit gegen parasitierende Nematoden wirkenden Stoffen aus der Gruppe der cycli schen oder offenkettigen Depsipeptide, die aus Aminosäuren und Hydroxycarbon säuren bestehen, reagieren. Die vorliegende Erfindung betrifft ferner DNA-Sequenzen die für diese Proteine bzw. für Teilstücke dieser Proteine kodieren.The present invention relates to proteins, as well as portions of these proteins that with substances acting against parasitic nematodes from the group of cycli or open-chain depsipeptides consisting of amino acids and hydroxycarbon acids exist, react. The present invention further relates to DNA sequences that code for these proteins or for portions of these proteins.
Die vorliegende Erfindung betrifft ferner die Verwendung dieser Proteine oder ihrer Teilstücke zur Identifizierung von Stoffen mit Wirkung gegen parasitierende Nematoden aus der Gruppe der cyclischen oder offenkettigen Depsipeptide, die aus Aminosäuren und Hydroxycarbonsäuren bestehen.The present invention further relates to the use of these proteins or their sections for the identification of substances with action against parasitizing Nematodes from the group of cyclic or open-chain depsipeptides that consist of amino acids and hydroxycarboxylic acids.
Die vorliegende Erfindung betrifft ferner Verfahren zur Identifizierung der Proteine und ihrer Teilstücke, sowie die Herstellung der Proteine oder ihrer Teilstücke über rekombinante Technologie.The present invention further relates to methods for identifying the Proteins and their parts, as well as the production of the proteins or their Sections of recombinant technology.
Identifizierung und Charakterisierung der cDNA-Sequenzen, die für die erfin dungsgemäßen Proteine kodieren, erfolgt durch Konstruktion einer statistisch, repräsentativen cDNA-Bibliothek unter Verwendung polyadenylierter RNA-Fraktionen, isoliert aus parasitären Nematoden und einem sich anschließenden Immunscreening der genannten cDNA-Bibliothek.Identification and characterization of the cDNA sequences required for the inventions encoding proteins according to the invention is carried out by constructing a statistical, representative cDNA library using polyadenylated RNA fractions isolated from parasitic nematodes and a subsequent one Immunoscreening of the cDNA library mentioned.
Identifizierung und Charakterisierung der erfindungsgemäßen cDNA-Sequenzen erfolgen mit Hilfe von Antikörpern gegen ein Konjugat, bestehend aus einem cyclischen oder offenkettigen Depsipeptid-Hapten und einem geeigneten Carrier- Protein.Identification and characterization of the cDNA sequences according to the invention take place with the help of antibodies against a conjugate consisting of a cyclic or open-chain depsipeptide hapten and a suitable carrier Protein.
Es sind bis jetzt nur monoklonale Antikörper gegen verschiedene Cyclodepsi peptid-Synthetasen, beispielsweise die Enniatin-Synthetase (A. Billich et al., Biol. Chem. Hoppe-Seyler 368 (5), 1987, S. 521-529; A. Lawen et al., J. Biol. Chem. 265, (19), 1990, S. 11355-11360) oder die Cyclosporin-Synthetase (A. Lawen et al., J. Biol. Chem. 266, (24), 1991, S. 15567-15570), aber nicht spezifische Antikörper gegen Konjugate bestehend aus Depsipeptid-Hapten und einem geeig neten Carrier-Protein, bekannt geworden.So far, they are only monoclonal antibodies against various cyclodepsi peptide synthetases, for example the Enniatin synthetase (A. Billich et al., Biol. Chem. Hoppe-Seyler 368 (5), 1987, pp. 521-529; A. Lawen et al., J. Biol. Chem. 265, (19), 1990, pp. 11355-11360) or cyclosporin synthetase (A. Lawen et al., J. Biol. Chem. 266, (24), 1991, pp. 15567-15570), but not specific Antibodies against conjugates consisting of depsipeptide hapten and a suitable one neten carrier protein.
Bevorzugt zur Identifizierung und Charakterisierung der erfindungsgemäßen cDNA-Sequenzen werden Konjugate von PF 1022A oder seiner Derivate als Depsipeptid-Hapten an Carrier-Proteine eingesetzt.Preferred for identification and characterization of the invention cDNA sequences are conjugated as PF 1022A or its derivatives Depsipeptide hapten used on carrier proteins.
Die erfindungsgemäßen Proteine werden durch Expression der erfindungsgemäßen cDNA in geeigneten Expressionssystemen, beispielsweise in Bakterien, insbe sondere in E. coli, als prokaryotisches Expressionssystem oder in einem euka ryotischen Expressionssystem, insbesondere dem Baculovirussystem hergestellt.The proteins of the invention are expressed by expression of the cDNA in suitable expression systems, for example in bacteria, in particular especially in E. coli, as a prokaryotic expression system or in an euka ryotic expression system, in particular the baculovirus system.
Wirkstoffe die mit Hilfe der erfindungsgemäßen Proteine aufgefunden werden, sind für die Medizin und Tiermedizin von hohem Interesse.Active substances which are found with the aid of the proteins according to the invention, are of great interest to medicine and veterinary medicine.
Weitere Aspekte der Erfindung und ihre bevorzugten Ausführungsformen sind im folgenden näher erläutert bzw. in den Patentansprüchen definiert.Further aspects of the invention and its preferred embodiments are described in following explained in more detail or defined in the claims.
Da es sich bei den offenkettigen und cyclischen Depsipeptiden, für die spezifische Antikörper entwickelt werden sollen, um relativ kleine und einfache Moleküle handelt, die nach der Applikation in ein Versuchstier alleine nicht in der Lage sind, dort eine entsprechende Immunantwort auszulösen, müssen vor der eigent lichen Immunisierung zunächst vorbereitende Maßnahmen getroffen werden (E. Harlow, D. Lane in; "Antibodies, a Laboratory Manual", Cold Springer Harbor Lab., Cold Spring Harbor, USA, 1988).Since it is the open chain and cyclic depsipeptides, for the specific Antibodies are designed to be relatively small and simple molecules is not able to act alone after application in a test animal are to trigger an appropriate immune response there, must preparatory measures are taken (E. Harlow, D. Lane in; Antibodies, a Laboratory Manual, Cold Springer Harbor Lab., Cold Spring Harbor, USA, 1988).
Man bezeichnet solche Verbindungen, die aufgrund ihrer Größe (Moleküle mit einem Molekulargewicht von weniger als 10.000 Dalton sind normalerweise schwache Immunogene; Moleküle mit einem Molekulargewicht von weniger als 2.000 Dalton können alleine kaum eine Immunantwort auslösen) und einfachen Strukturierung nicht zur Induktion einer Immunreaktion in der Lage sind, als Haptene oder inkomplette Antigene und stellt sie somit den kompletten Antigenen (= Immunogene) gegenüber, die sowohl als Antigen wirken als auch eine Immun antwort zu induzieren vermögen. Solche Haptenmoleküle können an meist lösliche, hochmolekulare Verbindungen (Trägermoleküle) konjugiert werden, wodurch sie in ihren Eigenschaften kompletten Antigenen vergleichbar werden, d. h. sie besitzen jetzt die Fähigkeit zur Auslösung einer Immunantwort.Such compounds are called, because of their size (molecules with a molecular weight of less than 10,000 daltons are normal weak immunogens; Molecules with a molecular weight less than 2,000 daltons alone can hardly trigger an immune response) and simple Structuring are unable to induce an immune response than Haptens or incomplete antigens and thus represents the complete antigens (= Immunogens), which act both as an antigen and an immune response to induce. Such hapten molecules can be attached to mostly soluble, high molecular weight compounds (carrier molecules) are conjugated, making them in their properties become comparable to complete antigens, d. H. they own now the ability to trigger an immune response.
Einige der im Verlauf der Immunisierungsreaktion gebildeten Antikörper sind dann in der Lage, mit spezifischen Epitopen auf dem Haptenmolekül zu reagieren, unabhängig davon, ob das Haptenmolekül allein oder aber nach wie vor gekoppelt an das Carriermolekül vorliegt.Some of the antibodies produced in the course of the immunization reaction are then able to react with specific epitopes on the hapten molecule regardless of whether the hapten molecule is alone or still coupled to the carrier molecule.
Bei der Immunisierung mit Hapten-Carrier-Konjugaten werden neben den Hapten spezifischen Antikörpern auch solche induziert und gebildet, die gegen den Carrier oder das Bindeglied zwischen Carrier und Hapten, oder die nur gegen den Kom plex aus Hapten-(Bindeglied)-Carrier gerichtet sind. Die spezifischen Anti-Hapten- Antikörper sind im Regelfall gegen denjenigen Teil des Moleküls gerichtet, der vom Carrier am weitesten entfernt ist.When immunizing with hapten-carrier conjugates, in addition to the hapten specific antibodies also induce and form antibodies against the carrier or the link between carrier and hapten, or only against the comm plex from Hapten (link) carrier are directed. The specific anti-hapten Antibodies are usually directed against that part of the molecule that furthest away from the carrier.
Unter der im folgenden häufig verwendeten Bezeichnung Hapten werden im Rah men der Erfindung die für die Immunisierung verwendeten offenkettigen oder cyclischen Depsipeptide, bevorzugt das Cyclodepsipeptid PF 1022A oder seine Derivate verstanden.Under the frequently used name Hapten in the Rah men of the invention, the open chain or used for immunization cyclic depsipeptides, preferably the cyclodepsipeptide PF 1022A or its Derivatives understood.
Im Rahmen dieser Erfindung werden daher die als Haptene wirkenden offen kettigen und cyclischen Depsipeptide, insbesondere PF 1022A oder seine Derivate, vor der Immunisierung von Versuchstieren, bevorzugt Nagetieren, wie z. B. Mäuse, Ratten, Kaninchen, Meerschweinchen, an einen hochmolekularen Träger "Carrier" gekoppelt, der geeignet ist, besagten Depsipeptiden eine komplette Wirksamkeit zu verleihen.In the context of this invention, those which act as haptens are therefore open chain and cyclic depsipeptides, in particular PF 1022A or its derivatives, before the immunization of experimental animals, preferably rodents, such as. B. mice, Rats, rabbits, guinea pigs, to a high molecular weight carrier coupled, which is suitable, said depsipeptides a complete effectiveness to lend.
Unter geeigneten Carrier-Molekülen im Rahmen dieser Erfindung sind in erster Linie makromolekulare Verbindungen zu verstehen, die frei zugängliche reaktive Gruppen für die Kupplungsreaktion mit dem Hapten aufweisen und die in der Lage sind, durch Kupplung an das Hapten, diesem eine immunogene Potenz zu verleihen oder aber deren bereits vorhandene Immunogenizität zu verstärken.Suitable carrier molecules within the scope of this invention are the first Line to understand macromolecular compounds that are freely accessible reactive Have groups for the coupling reaction with the hapten and in the By coupling to the hapten, it is capable of producing an immunogenic potency confer or increase their existing immunogenicity.
Besonders bevorzugte Carrier sind makromolekulare Verbindungen, die frei zugängliche reaktive Aminogruppen enthalten. Particularly preferred carriers are macromolecular compounds that are free accessible reactive amino groups included.
Ganz besonders bevorzugt als Carriermoleküle sind lysinreiche Proteine mit einem Molekulargewicht zwischen 10.000 und 1.500.000, wie sie z. B. "Bovine Serum Albumin" (BSA: Molekulargewicht 66.200), "Humanes Serum Albumin" (HSA; Molekulargewicht: 58.000) oder "Keyhole Limpet Protein" (KLH; Molekular gewicht: 1.000.000). Diese sind kommerziell erhältlich.Lysine-rich proteins with a are very particularly preferred as carrier molecules Molecular weight between 10,000 and 1,500,000, as z. B. "Bovine Serum Albumin "(BSA: molecular weight 66,200)," Human Serum Albumin "(HSA; Molecular Weight: 58,000) or "Keyhole Limpet Protein" (KLH; molecular weight: 1,000,000). These are commercially available.
Selbstverständlich können auch andere makromolekulare Verbindungen als Carrier- Moleküle verwendet werden, wie z. B. "Porcine Thyreoglobulin", B2 Microglobu lin, Haemocyanin, Immunglobuline, Toxine (Cholera-, Tetanus-, Diptheria-Toxin u. a.), Polysaccharide, Lipopolysaccharide, natürliche oder synthetische Polyadenyl- und Polyuridylsäuren, Polyalanyl- und Polylysin-Polypeptide oder Zellmembran komponenten, wie beispielsweise Formalin- oder Glutaraldehyd-behandelte Erythrozytenzellmembranen.Of course, other macromolecular compounds as carrier Molecules are used, such as. B. "Porcine Thyreoglobulin", B2 Microglobu lin, haemocyanin, immunoglobulins, toxins (cholera, tetanus, diptheria toxin u. a.), polysaccharides, lipopolysaccharides, natural or synthetic polyadenyl and polyuridylic acids, polyalanyl and polylysine polypeptides or cell membrane components, such as treated with formalin or glutaraldehyde Erythrocyte cell membranes.
Ebenso geeignet für die Verwendung als Carrier-Molekül ist beispielsweise die gereinigte IgG-Fraktion gegen Maus IgG (H+L) aus Kaninchen gemäß dem bei H. Kawamura und J.A. Berzofsky (J. Immunol. 58 (1986), S. 136) beschriebenen Verfahren.The, for example, is also suitable for use as a carrier molecule purified IgG fraction against mouse IgG (H + L) from rabbits according to that at H. Kawamura and J.A. Berzofsky (J. Immunol. 58 (1986), p. 136) Method.
Die Kopplung von Haptenen an Carriern erfolgt nach an sich etablierten Techniken (P. Tijssen in: "Practice and Theory of Enzyme Immunoassays", Burdon, R.H. & Knippenberg, P.H., Hrsg., Elsevier, Oxford, UK 1985).The coupling of haptens to carriers takes place according to established methods Techniques (P. Tijssen in: "Practice and Theory of Enzyme Immunoassays", Burdon, R.H. & Knippenberg, P.H., ed., Elsevier, Oxford, UK 1985).
Die Konjugation des Haptens an das Trägermolekül kann entweder direkt oder aber vorzugsweise über ein Brückenglied erfolgen, welches gegebenenfalls zu nächst an das Haptenmolekül angelagert wird.The conjugation of the hapten to the carrier molecule can either be direct or but preferably take place via a bridge link, which if necessary is next attached to the hapten molecule.
Die Kupplung der offenkettigen und cyclischen Depsipeptide als Haptene, insbesondere des PF 1022A oder seiner Derivate, an das Trägermolekül muß dabei in der Weise erfolgen, daß die relevanten Strukturelemente der Depsipeptide frei zugänglich bleiben und somit in der Lage sind eine spezifische Immunantwort auszulösen, d. h. die Bildung spezifischer Antikörper zu induzieren.The coupling of the open-chain and cyclic depsipeptides as haptens, in particular the PF 1022A or its derivatives, on the carrier molecule in such a way that the relevant structural elements of the depsipeptides are free remain accessible and thus able to respond to a specific immune response trigger, d. H. to induce the formation of specific antibodies.
Als bevorzugte Haptene dienen Depsipeptid-Liganden aus offenkettigen oder cyclischen Depsipeptiden mit 6 bis 30 Ringatomen, bestehend aus Aminosäuren und Hydroxycarbonsäuren als Bausteine. Depsipeptide ligands from open-chain or are used as preferred haptens cyclic depsipeptides with 6 to 30 ring atoms, consisting of amino acids and hydroxycarboxylic acids as building blocks.
Als ganz besonders bevorzugte Haptene dienen Depsipeptid-Liganden aus cycli schen Depsipeptiden mit 24 Ringatomen, bestehend aus Aminosäuren und Hydroxycarbonsäuren als Bausteine.Depsipeptide ligands from cycli serve as very particularly preferred haptens depsipeptides with 24 ring atoms, consisting of amino acids and Hydroxycarboxylic acids as building blocks.
Zu den cyclischen Depsipeptiden mit 24 Ringatomen zählen Verbindungen der
allgemeinen Formel (I)
Cyclic depsipeptides with 24 ring atoms include compounds of the general formula (I)
in welcher
R1 für gegebenenfalls substituiertes Benzyl, wobei als Substituenten genannt
seien Wasserstoff, C1-4-Alkyl, insbesondere Methyl, Hydroxy, Halogen, ins
besondere Fluor, C1-4-Alkoxy, insbesondere Methoxy oder tert.-Butyloxy,
Nitro, Amino, Dialkylamino, insbesondere Dimethylamino oder
Diethylamino, N-Morpholinyl, N-Pyrrolidinyl oder N-Piperidinyl, steht,
R2 für Wasserstoff, C1-4-Alkyl, insbesondere Methyl, Hydroxy, Halogen,
insbesondere Fluor, C1-4-Alkoxy, insbesondere Methoxy oder tert.-Butyl
oxy, Nitro, Amino, Dialkylamino, insbesondere Dimethylamino oder Di
ethylamino, N-Morpholinyl, N-Pyrrolidinyl oder N-Piperidinyl, steht,
wobei
in which
R 1 for optionally substituted benzyl, where hydrogen, C 1-4 -alkyl, in particular methyl, hydroxy, halogen, in particular fluorine, C 1-4 -alkoxy, in particular methoxy or tert-butyloxy, nitro, amino may be mentioned as substituents , Dialkylamino, in particular dimethylamino or diethylamino, N-morpholinyl, N-pyrrolidinyl or N-piperidinyl,
R 2 is hydrogen, C 1-4 -alkyl, in particular methyl, hydroxy, halogen, in particular fluorine, C 1-4 -alkoxy, in particular methoxy or tert-butyloxy, nitro, amino, dialkylamino, in particular dimethylamino or diethylamino, N-morpholinyl, N-pyrrolidinyl or N-piperidinyl,
in which
-
a) für den Fall, daß R1 für Benzyl steht,
R2 für Wasserstoff- Hydroxy, C1-4-Alkoxy, insbesondere Meth oxy, Halogen, insbesondere Fluor, Alkenyloxy, insbesondere Allyloxy, steht,a) in the event that R 1 is benzyl,
R 2 represents hydrogen-hydroxy, C 1-4 -alkoxy, in particular methoxy, halogen, in particular fluorine, alkenyloxy, in particular allyloxy, -
b) für dem Fall, daß R1 für Methyl steht,
R2 für Wasserstoff- Hydroxy, C1-6-Alkoxy, insbesondere Meth oxy, Nitro, Amino, Dialkylamino, insbesondere Dimethyl amino, N-Morpholinyl steht.b) in the event that R 1 is methyl,
R 2 represents hydrogen hydroxy, C 1-6 alkoxy, in particular meth oxy, nitro, amino, dialkylamino, in particular dimethyl amino, N-morpholinyl.
Die Verbindungen der allgemeinen Formel (I) können in ihren optisch aktiven, stereoisomeren Formen oder als racemische Gemische vorliegen. Vorzugsweise werden die optisch aktiven, stereoisomeren Formen der Verbindungen der allge meinen Formel (I) verwendet. Besonders bevorzugt werden die cyclischen Depsi peptide verwendet, die sich aus L-konfigurierten Aminosäuren und D-konfigu rierten Hydroxycarbonsäuren als Ringbausteine zusammensetzen.The compounds of the general formula (I) can be used in their optically active, stereoisomeric forms or as racemic mixtures. Preferably the optically active, stereoisomeric forms of the compounds of gen my formula (I) used. The cyclic depsi are particularly preferred peptides used, which are composed of L-configured amino acids and D-configu reassembled hydroxycarboxylic acids as ring building blocks.
Beispielhaft sei als cyclisches Depsipeptid die aus EP-OS 382 173 und
EP-OS 503 538 bekannte Verbindung PF 1022A der folgenden Formel (Ia), in der
R1 für Benzyl und R2 für Wasserstoff steht, genannt:
The compound PF 1022A of the following formula (Ia) known from EP-OS 382 173 and EP-OS 503 538, in which R 1 is benzyl and R 2 is hydrogen, may be mentioned as an example as a cyclic depsipeptide:
Außerdem seien als cyclische Depsipeptide die aus der PCT-Anmeldung WO 93/19053 und EP 0 634 408 A1 bekannten Verbindungen genannt, die geeignete funktionelle Gruppen enthalten, die eine direkte kovalente Kopplung an ein Carrier-Protein oder aber eine Kopplung über ein Brückenmolekül an ein Carrier-Protein gestatten.In addition, the cyclic depsipeptides are those from the PCT application WO 93/19053 and EP 0 634 408 A1 known compounds that suitable functional groups containing a direct covalent coupling a carrier protein or a coupling via a bridge molecule to one Allow carrier protein.
Insbesondere seien aus der PCT-Anmeldung WO 93/19053 und EP 0 634 408 A1
die Verbindungen der folgenden Formel (Ib), in der R1 für (R3) substituiertes
Benzyl steht, genannt:
From PCT application WO 93/19053 and EP 0 634 408 A1, the compounds of the following formula (Ib), in which R 1 represents (R 3 ) substituted benzyl, may be mentioned in particular:
in welcher
R2 und R3 jeweils für Nitro, Amino oder Hydroxy stehen.in which
R 2 and R 3 each represent nitro, amino or hydroxy.
Weiterhin seien als Depsipeptide die aus der PCT-Anmeldung WO 94/19334 bekannten Verbindungen genannt.Further depsipeptides are those from PCT application WO 94/19334 known compounds called.
Insbesondere seien aus der PCT-Anmeldung WO 94/19334 die Verbindungen der
folgenden Formel (Ic), in der R1 für Benzyl steht, genannt:
The compounds of the following formula (Ic) in which R 1 is benzyl may be mentioned in particular from PCT application WO 94/19334:
in welcher
R2 für Hydroxy steht.in which
R 2 represents hydroxy.
Schließlich seien als Depsipeptide die aus der PCT-Anmeldung WO 95/07272 bekannten Verbindungen genannt.Finally, the depsipeptides are those from PCT application WO 95/07272 known compounds called.
Insbesondere seien aus der PCT-Anmeldung WO 95/07272 die Verbindungen der
folgenden Formel (Id), in der R1 für Methyl steht, genannt:
From PCT application WO 95/07272, the compounds of the following formula (Id), in which R 1 represents methyl, may be mentioned in particular:
in welcher
R2 für Nitro, Amino oder Methoxycarbonylamino steht.
in which
R 2 represents nitro, amino or methoxycarbonylamino.
Besonders bevorzugt werden cyclische Depsipeptide mit 24 Ringatomen der allgemeinen Formel (Ib) eingesetzt, die über eine freie primäre Aminogruppe des Benzylfragments, gegebenenfalls mittels eines geeigneten Brückengliedes, mit einer primären Aminofunktion auf dem Carrier-Protein zur kovalenten Hapten- Carrier-Bindung gebunden sind.Cyclic depsipeptides with 24 ring atoms are particularly preferred general formula (Ib) used, which has a free primary amino group of Benzyl fragments, optionally by means of a suitable bridge member a primary amino function on the carrier protein for covalent hapten Carrier binding are bound.
Als Brückenglieder für eine Konjugation des Haptens, insbesondere des Cyclo depsipeptids PF 1022A und seiner Derivate der allgemeinen Formel (Ib), an das Carrier-Molekül kommen in erster Linie Verbindungen in Betracht, die mindestens zwei oder aber mehrere reaktive Gruppen enthalten, welche in der Lage sind, mit den frei zugänglichen reaktiven Gruppen des Carrier-Moleküls in Wechselwirkung zu treten.As bridge members for conjugation of the hapten, especially the cyclo depsipeptids PF 1022A and its derivatives of the general formula (Ib), to which Carrier molecules are primarily compounds that are at least contain two or more reactive groups which are able to react with the freely accessible reactive groups of the carrier molecule interact to kick.
Besonders bevorzugt im Rahmen dieser Erfindung ist die Verwendung von Brückengliedern die zwischen 3 und 10 Brücken-C-Atome umfassen und die als reaktive Gruppen z. B. Amino-, Formyl-, Carboxyl- oder SH-Gruppen besitzen.The use of is particularly preferred in the context of this invention Bridge members that contain between 3 and 10 bridge carbon atoms and that as reactive groups e.g. B. have amino, formyl, carboxyl or SH groups.
Diese reaktiven Gruppen können mit Hilfe bekannter Verfahren mit den reaktiven Gruppen des Hapten- und Carrier-Moleküls zur Reaktion gebracht werden unter Ausbildung eines Hapten-Carrier-Konjugates.These reactive groups can be used with the reactive using known methods Groups of the hapten and carrier molecules are reacted under Formation of a hapten-carrier conjugate.
So ist es beispielsweise möglich ein Brückenglied über eine reaktive Amino gruppe, insbesondere der Derivate des Cyclodepsipeptids PF 1022A, mit Hilfe von Dialdehyden, wie z. B. Glutardialdehyd, an eine der freien Aminogruppen des Carrier-Moleküls zu binden.For example, it is possible to build a bridge over a reactive amino group, in particular the derivatives of the cyclodepsipeptide PF 1022A, with the help of Dialdehydes such as e.g. B. glutardialdehyde, to one of the free amino groups of Bind carrier molecule.
In einer spezifischen Ausführungsform der vorliegenden Erfindung geht man von den in der PCT-Anmeldung WO 93/19053 und EP 0 634 408 A1 genannten Deri vaten des Cyclodepsipeptids PF 1022A der allgemeinen Formel (Ib), vorzugsweise vom Nitrobenzyl-Derivat aus und setzt diese Verbindungen mit Hilfe bekannter Methoden, wie z. B. durch Hydrierung, in einem weiteren Reaktionsschritt sehr einfach in das bekannte Aminobenzyl-Derivat des Cyclodepsipeptids PF 1022A um.In a specific embodiment of the present invention, one proceeds from the deri mentioned in PCT application WO 93/19053 and EP 0 634 408 A1 vaten of the cyclodepsipeptide PF 1022A of the general formula (Ib), preferably from the nitrobenzyl derivative and sets these compounds using known ones Methods such as B. by hydrogenation, in a further reaction step very simply into the well-known aminobenzyl derivative of the cyclodepsipeptide PF 1022A around.
Die eigentliche Kopplungsreaktion erfolgt dann vorzugsweise mit Hilfe der Diazo kupplung. Dabei wird das Aminobenzyl-Derivat des Cyclodepsipeptid PF 1022A zunächst in einem geeigneten Lösungsmittel solubilisiert. Als geeignete Lösungs mittel kommen insbesondere Wasser und verdünnte Säuren in Betracht.The actual coupling reaction then preferably takes place with the aid of the diazo clutch. The aminobenzyl derivative of the cyclodepsipeptide PF 1022A first solubilized in a suitable solvent. As a suitable solution water and dilute acids are particularly suitable.
Im Anschluß an die Umwandlung der Aminofunktion in das entsprechende Dia zoniumsalz nach literaturbekannten Methoden (vgl. Houben-Weyl, Methoden der Organischen Chemie, Band X/3) wird das Carrier-Protein wie z. B. BSA oder KLH zugegeben. Nach einer Inkubationszeit von 0,1 bis 12 Stunden, vorzugsweise 2 bis 4 Stunden wird neutralisiert, dialysiert und anschließend lyophilisiert. Der Rück stand kann dann gegebenenfalls nach Zwischenschaltung weiterer Reinigungs schritte und nachfolgender Bestimmung des Substitutionsgrades (vgl. P. Tijssen in: "Practice and Theory of Enzyme Immunoassays", Burdon, R.H. & Knippenberg, P.H., Hrsg., Elsevier, Oxford, UK 1985) für die eigentliche Immunisierungs reaktion verwendet werden.Following the conversion of the amino function into the corresponding slide zonium salt according to methods known from the literature (cf. Houben-Weyl, methods of Organic chemistry, volume X / 3) the carrier protein such. B. BSA or KLH admitted. After an incubation period of 0.1 to 12 hours, preferably 2 to It is neutralized for 4 hours, dialyzed and then lyophilized. The back can then if necessary after the interposition of further cleaning steps and subsequent determination of the degree of substitution (see P. Tijssen in: "Practice and Theory of Enzyme Immunoassays", Burdon, R.H. & Knippenberg, P.H., ed., Elsevier, Oxford, UK 1985) for the actual immunization reaction.
Neben der als bevorzugt genannten Diazokupplung, können auch alternative Ver fahren für die Kupplung des Haptens an das Carrier-Molekül verwendet werden, wie z. B. die Schiffbasenbildung, die Aktivestermethode oder die gemischte An hydridmethode. Bei der zuletzt genannten Methode wird die Carboxylfunktion des Brückengliedes unter Verwendung von Essigsäureanhydrid oder des Carbodiimid- Derivates 1-Ethyl-3-(3'-dimethylaminopropyl)carbodiimid an das Carrier-Molekül geknüpft.In addition to the diazo coupling mentioned as preferred, alternative Ver drive to be used for coupling the hapten to the carrier molecule such as B. the ship base formation, the active ester method or the mixed type hydride method. In the latter method, the carboxyl function of the Bridge member using acetic anhydride or the carbodiimide Derivatives 1-ethyl-3- (3'-dimethylaminopropyl) carbodiimide to the carrier molecule knotted.
Besitzt das Brückenglied beispielsweise eine reaktive SH-Gruppe, so kann alternativ die Konjugation des Haptens an das Carrier-Molekül durch eine Oxi dation mit freien SH-Gruppen des Carriers durchgeführt werden.For example, if the pontic has a reactive SH group, then alternatively, conjugation of the hapten to the carrier molecule by an oxi dation with free SH groups of the carrier.
Die Immunisierung der Donortiere, bevorzugt Kaninchen (Code-Nr.: SA 1100-1102; SA 1003-1005, Fa. Eurogentec, Seraing, Belgien), erfolgt durch eine ein- bis mehrmalige Applikation der an das hochmolekulare Carrier-Protein, bei spielsweise KLH oder BSA, gekoppelten Depsipeptid-Haptene.The immunization of the donor animals, preferably rabbits (code no .: SA 1100-1102; SA 1003-1005, Fa. Eurogentec, Seraing, Belgium), is carried out by a up to repeated application of the to the high molecular carrier protein for example KLH or BSA, coupled depsipeptide haptens.
Die bevorzugte Applikationsform ist die Injektion, die sowohl intravenös, intraperitoneal oder subcutan erfolgen kann.The preferred form of administration is injection, which is both intravenous, can be done intraperitoneally or subcutaneously.
Besonders bevorzugt ist jedoch eine intravenöse Injektion. However, intravenous injection is particularly preferred.
In einer spezifischen Ausführungsform der vorliegenden Erfindung werden die KLH-PF 1022A-Derivat- und BSA-PF 1022A-Derivat-Konjugate (Komplexe) zur Immunisierung von mehreren Donortieren, insbesondere von drei Kaninchen, pro Carrier-Hapten-Komplex eingesetzt. Die erste Boost-Immunisierung erfolgt dabei 14 Tage nach der Erstimmunisierung. Weitere Boost-Immunisierungen, insbeson dere 10 Boost-Immunisierungen, folgen dann im Abstand von jeweils 4 Wochen. Ab der dritten Boost-Immunisierung wird jeweils nach 10 Tagen das erfin dungsgemäße Serum gewonnen.In a specific embodiment of the present invention, the KLH-PF 1022A derivative and BSA-PF 1022A derivative conjugates (complexes) for Immunization of several donor animals, especially three rabbits, per Carrier-hapten complex used. The first boost immunization takes place 14 days after the first vaccination. Further boost immunizations, in particular another 10 boost immunizations, then follow every 4 weeks. From the third boost immunization, this is invented every 10 days Serum according to the invention obtained.
Der Erfolg der Immunisierung läßt sich durch Bestimmung der Konzentration von spezifischen Antikörpern mit einem, dem Fachmann an sich bekannten Enzym gekoppelten Immunoassay (ELISA "Enzyme Linked Immuno Sorbent Assay") oder durch Western blot-Analyse kontrollieren. Polyklonale Antiseren, die bei der Western blot-Analyse gute Signale produzieren, sind für ein "Immunscreening" von cDNA-Bibliotheken verwendbar.The success of the immunization can be determined by determining the concentration of specific antibodies with an enzyme known per se to the person skilled in the art coupled immunoassay (ELISA "Enzyme Linked Immuno Sorbent Assay") or control by Western blot analysis. Polyclonal antisera used in the Western blot analysis producing good signals are essential for "immune screening" usable from cDNA libraries.
Besonders bevorzugt zur Bestimmung der Spezifität des Antiserums gegen Depsipeptide, insbesondere gegen PF 1022A-Derivat ist die Western blot-Analyse.Particularly preferred for determining the specificity of the antiserum against Depsipeptides, especially against PF 1022A derivative, is Western blot analysis.
Dabei werden die Carrier-Hapten-Komplexe, insbesondere der KLH-PF 1022A- Derivat-Komplex und das Carrier-Protein KLH oder der BSA-PF 1022A-Derivat- Komplex und das Carrier-Protein BSA in einem SDS-PAGE (SDS-Polyacryl amidgel) aufgetrennt (vgl. Laemmli et al., Nature 227, 1970, S. 680-685) und die erhaltenen Proteine anschließend auf Nitrozellulose geblottet. Alternativ werden die Carrier-Hapten-Komplexe bzw. die Carrier-Proteine auch mittels einer "Mini fold S" Apparatur (Schleicher & Schuell, Dassel) direkt auf Nitrozellulose-Filter geblottet. Die Inkubation der Filter mit geeigneten Serumverdünnungen, bevorzugt im Verhältnis 1 : 1.000, ganz besonders bevorzugt im Verhältnis 1 : 500, führt zu einer deutlich stärkeren Nachweisreaktion mit den erfindungsgemäßen Carrier- Hapten-Komplexen als mit den Carrier-Proteinen KLH oder BSA (Verwendung von alkalischer NBT/B CIP-Lösung; vgl. Herstellungsbeispiele).The carrier-hapten complexes, in particular the KLH-PF 1022A- Derivative complex and the carrier protein KLH or the BSA-PF 1022A derivative Complex and the carrier protein BSA in an SDS-PAGE (SDS-polyacrylic amide gel) (see Laemmli et al., Nature 227, 1970, pp. 680-685) and the obtained proteins then blotted onto nitrocellulose. Alternatively be the carrier-hapten complexes or the carrier proteins also by means of a "mini fold S "apparatus (Schleicher & Schuell, Dassel) directly onto nitrocellulose filters blotted. Incubation of the filters with suitable serum dilutions is preferred in a ratio of 1: 1,000, very particularly preferably in a ratio of 1: 500 a significantly stronger detection reaction with the carrier Hapten complexes as with the carrier proteins KLH or BSA (use of alkaline NBT / B CIP solution; see. Manufacturing examples).
Die auf diese Weise erhaltenen spezifischen, polyklonalen Antikörper werden dann in immunologischen Verfahren, wie beispielsweise dem erfindungsgemäßen "Immunscreening", zur Isolierung und Charakterisierung von cDNA-Sequenzen eingesetzt, die für Proteine kodieren, die in verschiedenartigen Nematodenspezies vorkommen und für die Bindung von cyclischen oder offenkettigen Depsipeptiden als Liganden, bestehend aus Aminosäuren und Hydroxycarbonsäuren als Bausteine, insbesondere des cyclischen Depsipeptids PF 1022A, verantwortlich sind.The specific polyclonal antibodies thus obtained then become in immunological processes, such as the one according to the invention "Immune screening", for the isolation and characterization of cDNA sequences used, which code for proteins, in different kinds of nematode species occur and for the binding of cyclic or open-chain depsipeptides as ligands, consisting of amino acids and hydroxycarboxylic acids as building blocks, especially the cyclic depsipeptide PF 1022A, are responsible.
Darüber hinaus ist selbstverständlich der Einsatz der erfindungsgemäßen Anti körper in allen bekannten Immunoassays, wie z. B. immunoradiometrischen Tests nach Markierung des Tracerantikörpers mit Chloramin T oder Bolton-Hunter-Rea genz, sowie anderen kompetetiven und nicht-kompetetiven Bindungsassays, wie Fluoreszenz-, Enzym- (ELISA), Chemilumineszenz- oder anderen Immunoassays, einschließlich allen Formen des Radioimmunoassays (HA) denkbar. (Harlow, E.: Lane, d. (1988) Antibodies: A Laboratory Manual, CSH; 2nd Edn.; New York; 319 bis 359; 353 bis 612). Dabei ist es unerheblich, ob der Schichtantikörper an Polystyrolröhrchen, Polystyrolkügelchen, paramagnetische Partikel oder aktivierte Säulenmaterialien aller Art kovalent oder nicht-kovalent gebunden ist.In addition, the use of the anti according to the invention is of course body in all known immunoassays, such as. B. immunoradiometric tests after labeling the tracer antibody with chloramine T or Bolton-Hunter-Rea genz, as well as other competitive and non-competitive binding assays, such as Fluorescence, enzyme (ELISA), chemiluminescence or other immunoassays, including all forms of radioimmunoassay (HA) possible. (Harlow, E .: Lane, i.e. (1988) Antibodies: A Laboratory Manual, CSH; 2nd Edn .; New York; 319 to 359; 353 to 612). It is irrelevant whether the layer antibody is on Polystyrene tubes, polystyrene beads, paramagnetic particles or activated Column materials of all types are bound covalently or non-covalently.
Im Rahmen der Erfindung werden zur Konstruktion einer statistisch, repräsen tativen cDNA-Bibliothek polyadenylierte RNA-Fraktionen, die aus parasitären Nematoden nach der von Chirgwin et al. beschriebenen Guanidinium-Isothiocya nat/Cäsiumchlorid-Kissen Methode (vgl. Biochemistry 18, 1979, S. 5294 bis 5299) isolierbar sind, für die cDNA-Synthese verwendet.Within the scope of the invention, to represent a statistical, represent tative cDNA library polyadenylated RNA fractions resulting from parasitic Nematodes according to the Chirgwin et al. described guanidinium isothiocya nat / cesium chloride cushion method (see Biochemistry 18, 1979, pp. 5294 to 5299) are isolable, used for cDNA synthesis.
Im Rahmen der vorliegenden Erfindung werden bevorzugt zur Konstruktion einer statistisch repräsentativen cDNA-Bibliothek polyadenylierte RNA-Fraktionen aus parasitären Nematoden der Ordnung der Strongylida, insbesondere Haemonchus spp. oder Trichostrongyius spp., für die cDNA-Synthese verwendet.Within the scope of the present invention, a statistically representative cDNA library from polyadenylated RNA fractions parasitic nematodes of the order of the Strongylida, especially Haemonchus spp. or Trichostrongyius spp., used for cDNA synthesis.
Die Synthese erfolgt entsprechend den bekannten Methoden des "Great Length cDNA Synthesis Kit" von Clontech (Heidelberg).The synthesis is carried out according to the known methods of "Great Length cDNA Synthesis Kit "from Clontech (Heidelberg).
Die Erststrangsynthese wird mit geeigneten Primern, insbesondere einem Oligo(dT)25(dN) Primer, durchgeführt. EcoRI Adaptoren werden an die doppelsträngige cDNA ligiert und cDNA-Moleküle < 500 bp über Chromaspin- Säulen (Clontech) fraktioniert.The first strand synthesis is carried out using suitable primers, in particular an oligo (dT) 25 (dN) primer. EcoRI adapters are ligated to the double-stranded cDNA and cDNA molecules <500 bp are fractionated using Chromaspin columns (Clontech).
Nach Ligation der cDNA in die EcoRI-Schnittstelle des Vektors ZAPII (Stra tagene, Heidelberg) werden die Konstrukte in vitro verpackt (Gigapack Gold II, Stratagene). After ligation of the cDNA into the EcoRI site of the vector ZAPII (Stra tagene, Heidelberg) the constructs are packaged in vitro (Gigapack Gold II, Stratagene).
In einer spezifischen Ausführungsform der vorliegenden Erfindung werden die weiter oben erhaltenen Antiseren gegen die Carrier-Hapten-Komplexe, insbeson dere aber der KLH-PF 1022A-Derivat-Komplex, nun im "Immunscreening" eingesetzt.In a specific embodiment of the present invention, the Antisera obtained above against the carrier-hapten complexes, in particular but the KLH-PF 1022A derivative complex, now in "immune screening" used.
Dazu werden nach Entfernung der Anti-E. coli Antikörper aus den genannten Antiseren durch Inkubation mit Filter-gebundenem E. coli Lysat, ca. 5.000 "plaque forming units" (pfu) der Bibliothek pro Assay auf LB-Agar plattiert und so lange bei +37°C inkubiert bis Plaques sichtbar werden. Anschließend erfolgt eine Expressionsinduktion der Fusionsproteine mittels Induktor gesättigtem Nitrozellulosefilter.After removing the Anti-E. coli antibodies from the named Antisera by incubation with filter-bound E. coli lysate, approx. 5,000 "plaque forming units "(pfu) of the library per assay plated on LB agar and so long Incubate at + 37 ° C until plaques become visible. Then there is one Expression induction of the fusion proteins by means of an inductor saturated Nitrocellulose filter.
Vorzugsweise verwendet man hierfür den Induktor Isopropyl-β-thiogalakto-pyrano sid (LPTG).The inductor isopropyl-β-thiogalactopyrano is preferably used for this sid (LPTG).
Nach einer weiteren Inkubationszeit von 1 bis 24 Stunden, bevorzugt von 4 bis 12 Stunden bei Temperaturen zwischen +40°C und +45°C, bevorzugt bei +42°C, werden die Filter mit den Carrier-Hapten-Komplexen, insbesondere dem KLH-PF 1022A-Komplex, inkubiert.After a further incubation period of 1 to 24 hours, preferably 4 to 12 Hours at temperatures between + 40 ° C and + 45 ° C, preferably at + 42 ° C, the filters with the carrier-hapten complexes, especially the KLH-PF 1022A complex, incubated.
Die Inkubationszeit mit den Carrier-Hapten-Komplexen, insbesondere dem KLH- PF 1022A-Komplex, beträgt 1 bis 12 Stunden. Die Inkubation erfolgt bei Temperaturen zwischen +5 und +45°C, bevorzugt jedoch bei Raumtemperatur. Danach werden die Filter für 4 Stunden bei Raumtemperatur mit dem Antiserum inkubiert. Das Antiserum liegt in einer Verdünnung von 1 : 200 bis 1 : 2.000, bevorzugt von 1 : 500 bis 1 : 1.000, vor.The incubation period with the carrier-hapten complexes, especially the KLH PF 1022A complex, is 1 to 12 hours. The incubation takes place at Temperatures between +5 and + 45 ° C, but preferably at room temperature. After that, the filters are left for 4 hours at room temperature with the antiserum incubated. The antiserum is diluted from 1: 200 to 1: 2,000, preferably from 1: 500 to 1: 1,000.
Im Anschluß an die Detektion der gebundenen Antikörper, beispielsweise mit an alkalischer Phosphatase gekoppelten Anti-Kaninchen-Antikörpern und NBT/BCIP- Substratlösung, erfolgt die Abtrennung positiver Agarbereiche sowie eine Eluie rung der Phagen.Following the detection of the bound antibodies, for example with alkaline phosphatase-coupled anti-rabbit antibodies and NBT / BCIP Substrate solution, positive agar areas are separated and an eluent is carried out phages.
Die auf diese Weise erhaltenen Phagen werden einem "rescreening" unterworfen. Die isolierten reinen Phagenklone können dann mittels in vivo Exzision zu Plasmidklonen konvertiert, und die Plasmid-DNA kann für weitere DNA-Analysen eingesetzt werden. The phages obtained in this way are subjected to a "rescreening". The isolated pure phage clones can then be excised in vivo Plasmid clones are converted, and the plasmid DNA can be used for further DNA analysis be used.
Beide Stränge der erfindungsgemäßen cDNA werden mehrmals über automatische Laser-Fluoreszenz-Sequenzierung analysiert und die Sequenzdaten mit einer Software der Genetics Computer Group Inc. (Madison, WI, USA) weiter untersucht.Both strands of the cDNA according to the invention are repeated several times over automatically Laser fluorescence sequencing is analyzed and the sequence data with a Software from Genetics Computer Group Inc. (Madison, WI, USA) examined.
Auf diese Weise wurden erfindungsgemäß zwei klonierte cDNA's mit der Bezeichnung pHC-1 bzw. pHC-2 erhalten.In this way, according to the invention, two cloned cDNA's with the Obtained designation pHC-1 or pHC-2.
Die in den Sequenzprotokollen ID No. 1 und 3 gezeigten erfindungsgemäßen Sequenzen enthalten jeweils einen "offenen Leserahmen" für ein Protein, das den Wirkstoff PF 1022A und andere Wirkstoffe mit ähnlichen immunulogischen Bindungseigenschaften erkennt.The ID No. in the sequence listing 1 and 3 shown in the invention Sequences each contain an "open reading frame" for a protein that the Active ingredient PF 1022A and other active ingredients with similar immunulogical Recognizes binding properties.
Der erste klonierte cDNA mit der Bezeichnung pHC-2 weist 972 Basen der im Sequenzprotokoll ID No. 1 gezeigten Sequenz auf.The first cloned cDNA called pHC-2 has 972 bases of the im Sequence listing ID No. 1 shown sequence.
Der nicht-kodierende 5'-Abschnitt der erfindungsgemäßen pHC-2 cDNA besteht nur aus 10 Basen. Die durch Northern blot-Analyse bestimmte Größe der kom plementären RNA (1,05 kb) stimmt sehr gut mit der Länge der cDNA überein.The non-coding 5 'section of the pHC-2 cDNA according to the invention consists only from 10 bases. The size of the com complementary RNA (1.05 kb) agrees very well with the length of the cDNA.
Für die pHC-2 cDNA Sequenz mit 972 Basen (vgl. Sequenzprotokoll ID No. 1) stellt die erste Nucleotidsequenz ATG an der Sequenzposition 11 das Startkodon dar. So ist beispielsweise diese Initiationsstelle der Translation vom Kozak-Typ (vgl. M. Kozak, J. Cell Biol. 108, 1989, S. 229). Darüber hinaus ist ein N- terminales Signalpeptid mit der Spaltstelle zwischen 18 und 19 detektierbar (vgl. von Heinje, Nucleic Acids Research 14, 1986, S. 4.683 bis 4.690).For the pHC-2 cDNA sequence with 972 bases (see sequence listing ID No. 1) the first nucleotide sequence ATG at sequence position 11 represents the start codon For example, this initiation site of translation is of the Kozak type (see M. Kozak, J. Cell Biol. 108, 1989, p. 229). In addition, an N- terminal signal peptide with the cleavage site between 18 and 19 detectable (cf. by Heinje, Nucleic Acids Research 14, 1986, pp. 4,683 to 4,690).
Aus der Nucleotidsequenz der erfindungsgemäßen pHC-2 cDNA mit 972 Basen der im Sequenzprotokoll ID No. 1 gezeigten Sequenz des gastrointestinalen Nema toden Haemonchus contortus läßt sich die entsprechende Aminosäuresequenz für das Protein ableiten. Das erfindungsgemäße erste Protein, das PF 1022A erkennt, ist dadurch gekennzeichnet, daß es eine Sequenz von 207 Aminosäuren mit einem daraus resultierenden Molekulargewicht von 23.991 g/mol aufweist (s. Sequenz protokoll ID No. 2).From the nucleotide sequence of the pHC-2 cDNA with 972 bases according to the invention the ID No. in the sequence listing 1 sequence of the gastrointestinal nema shown death Haemonchus contortus, the corresponding amino acid sequence for derive the protein. The first protein of the invention that recognizes PF 1022A is characterized in that it has a sequence of 207 amino acids with a resulting molecular weight of 23,991 g / mol (see sequence protocol ID No. 2).
Das erste erfindungsgemäße Protein ist ein integrales Membranprotein. Es besitzt neben der Signalpeptidsequenz eine potentielle Transmembranregion (Position 174-190). The first protein according to the invention is an integral membrane protein. It owns in addition to the signal peptide sequence, a potential transmembrane region (position 174-190).
Eine Glycosylierungsstelle ist am Asparagin (Asn) der Position 167 lokali sierbar. Bevorzugt finden Glycosylierungen des erfindungsgemäßen Proteins an dieser Position 167 statt.A glycosylation site is local to asparagine (Asn) at position 167 sizable. Glycosylations of the protein according to the invention are preferred this position 167 instead.
Darüber hinaus lassen sich aus dem Aminosäuresequenz Sequenzprotokoll ID No.2 des erfindungsgemäßen Targetproteins drei potentielle antigene Determinanten, im Bereich der Abschnitte 69 bis 75, 157 bis 162 und 159 bis 164, ableiten.In addition, sequence protocol ID No.2 of the target protein according to the invention three potential antigenic determinants, in Derive the range of sections 69 to 75, 157 to 162 and 159 to 164.
Diese Determinanten der Arninosäuresequenz des erfindungsgemäßen Proteins sind bevorzugt zur Erzeugung monoklonaler Antikörper gegen das Protein von Bedeu tung.These are determinants of the amino acid sequence of the protein of the invention preferred for the production of monoclonal antibodies against the protein from Bedeu tung.
Das erste erfindungsgemäße Protein, welches das Depsipeptid PF 1022A erkennt, zeigt Ähnlichkeiten zu verschiedenen Proteinen aus unterschiedlichen Organismen (Swiss-Prot Datenbank mit 43.470 Proteinsequenzen). 'Best Fit' Analysen ergeben eine Identität von 28% bzw. eine Ähnlichkeit von 53% zum 25 kDa Glyco protein GP25L von Canis familiaris (EMBL Accession Nr. P27869). GP25L ist ein Teil eines heterotetrameren Ca2+-bindenden Proteinkomplexes des Endoplasma tischen Retikulums (ER). Dieser Komplex ist offenbar für die Retention von ER-residenten Proteinen von Bedeutung (Wada et al., J. Biol. Chem. 266, 1991, S. 19.599 bis 19.610).The first protein according to the invention, which recognizes the depsipeptide PF 1022A, shows similarities to different proteins from different organisms (Swiss-Prot database with 43,470 protein sequences). 'Best Fit' analyzes show an identity of 28% or a similarity of 53% to the 25 kDa Glyco protein GP25L from Canis familiaris (EMBL Accession No. P27869). GP25L is part of a heterotetrameric Ca 2+ binding protein complex of the endoplasmic reticulum (ER). This complex is apparently of importance for the retention of ER-resident proteins (Wada et al., J. Biol. Chem. 266, 1991, pp. 19,599 to 19,610).
Der Xenopus laevis cDNA Klon X1262 (EMBL Accession Nr.: X90517) kodiert ebenfalls ein GP25L-ähnliches Protein (Joost et al., Biochem. J. 312, 1995, S. 205 bis 213), das eine Identität von 56% bzw. Ähnlichkeit von 73% zum erfin dungsgemäßen Targetprotein aufweist.The Xenopus laevis cDNA clone X1262 (EMBL Accession No .: X90517) encodes also a GP25L-like protein (Joost et al., Biochem. J. 312, 1995, p. 205 to 213), which invented an identity of 56% or similarity of 73% has target protein according to the invention.
Ein humanes EST ("expressed sequence tag" cDNA-Fragment; EMBL Accession Nr: T32283) kodiert gleichfalls ein GP25L-ähnliches Aminosäurefragment, das eine Identität von 71% bzw. Ähnlichkeit von 83% zum erfindungsgemäßen Protein aufweist.A human EST ("expressed sequence tag" cDNA fragment; EMBL accession No: T32283) also encodes a GP25L-like amino acid fragment that an identity of 71% or similarity of 83% to the invention Has protein.
Das Protein zeigt außerdem eine Identität von 24% bzw. eine Ähnlichkeit von 52% zu dem 23 kDa Saccharomyces cerevisiae-Vorläuferprotein P24B (EMBL Accession Nr: P32803). Dieses Protein ist wahrscheinlich am Transport von einigen sekretorischen Proteinen vom ER zum Golgi-Komplex beteiligt (Schimmöller et al. EMBO J. 14, 1995, S. 1.329 bis 1.339). The protein also shows an identity of 24% or a similarity of 52% to the 23 kDa Saccharomyces cerevisiae precursor protein P24B (EMBL Accession No: P32803). This protein is probably in the process of transporting involved some secretory proteins from the ER to the Golgi complex (Schimmöller et al. EMBO J. 14, 1995, pp. 1,329 to 1,339).
Gemeinsamkeiten des GP25L-Vorl äuferproteins bzw. GP25L-ähnlichen Proteinen zum erfindungsgemäßen Protein sind die Signalsequenz für den Transport in das ER, die Transmembrandomäne, eine N-Glykosylierungsstelle sowie eine ähnliche Molmasse.Similarities of the GP25L precursor protein or GP25L-like proteins to the protein according to the invention are the signal sequence for the transport into the ER, the transmembrane domain, an N-glycosylation site and the like Molar mass.
Durch Northern blot Analyse für die zum zweiten cDNA Klon pHC-1 korrespondierende mRNA wurde eine Größe von ca. 3,5 kb ermittelt. Der über das Immunscreening isolierte Klon pHC-1 weist eine Größe von 2 kb auf. Der noch fehlende 5'-Bereich der mRNA wurde mittels der 5'-RACE Methodik isoliert [M. A. Frohmann (1990) PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications (M. A. Innis, D. H. Gelfand, J. J. Sninsky & T. J. White eds.) S. 28-38, Academic Press, San Diego, USA]. Die so aus mehreren cDNA-Fragmenten charakterisierte mRNA setzt sich aus 3.539 Basen der im Sequenzprotokoll ID No. 3 gezeigten Sequenz zusammen.By Northern blot analysis for the second cDNA clone pHC-1 corresponding mRNA was determined to be approximately 3.5 kb in size. The one about that Clone pHC-1 isolated from immune screening is 2 kb in size. The still missing 5 'region of the mRNA was isolated using the 5'-RACE methodology [M. A. Frohmann (1990) PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications (M. A. Innis, D.H. Gelfand, J.J. Sninsky & T.J. White eds.) Pp. 28-38, Academic Press, San Diego, USA]. The mRNA characterized in this way from several cDNA fragments consists of 3,539 bases of the sequence no. 3 sequence shown together.
Der 5'-nicht translatierte Abschnitt der mRNA (vgl. Sequenzprotokoll ID No. 3) umfaßt 98 Basen. Es kann sein, daß noch einige Basen des 5'-Endes der mRNA fehlen. Der 3'-nicht translatierte Abschnitt (ohne poly(A)-tail) besteht aus 462 Basen. Das wahrscheinliche Startkodon vom Kozak-Typ liegt an Sequenzposition 99, obwohl strangaufwärts noch zwei weitere ATG-Kodons liegen. Diese scheiden aber als Initiationsstelle der Translation aus folgenden Gründen aus: Das ATG an Sequenzposition 22 ist nicht vom Kozak-Typ und die von dieser Position deduzierte Antinosäuresequenz bricht bereits mit einem TAA-Stop an Position 55 ab. Das ATG an Sequenzposition 75 ist ebenfalls nicht vom Kozak-Typ und die von dieser Position deduzierte Aminosäuresequenz bricht mit einem TAA-Stop bereits an Position 90 ab. Ausgehend vom Startkodon ab Position 99 ist das zweite erfindungsgemäße Targetprotein, das PF 1022A erkennt, dadurch gekennzeichnet, daß es eine Sequenz aus 986 Aminosäuren mit einem Molekulargewicht von 109.740 g/mol aufweist (s. Sequenzprotokoll ID No. 4). Zudem zeigt das erfin dungsgemäße Protein einen pI von 6.13.The 5 'untranslated section of the mRNA (see sequence listing ID No. 3) comprises 98 bases. There may still be some bases at the 5 'end of the mRNA absence. The 3 'non-translated section (without poly (A) tail) consists of 462 Bases. The probable Kozak-type start codon is at the sequence position 99, although there are two more ATG codons upstream. These divorce but as the initiation point for translation for the following reasons: The ATG on Sequence position 22 is not of the Kozak type and that of this position deduced antino acid sequence already breaks with a TAA stop at position 55 from. The ATG at sequence position 75 is also not of the Kozak type and that amino acid sequence deduced from this position breaks with a TAA stop already at position 90. Starting from position 99 starting from position 99 is the second one Target protein according to the invention which recognizes PF 1022A, characterized in that that there is a sequence of 986 amino acids with a molecular weight of 109,740 g / mol (see Sequence Listing ID No. 4). This also shows inventions protein according to the invention has a pI of 6.13.
Das zweite erfindungsgemäße Protein ist ebenfalls ein integrales Membranprotein. Es besitzt neben einem aminoterminalen Signalpeptid (Spaltstelle zwischen den Aminosäuren 18 und 19) fünf Transmembrandomänen (Aminosäureabschnitte: 531 bis 562, 595 bis 615, 673 bis 700, 725 bis 744 und 750 bis 774). Potentielle N- Glykosylierungsstellen sind jeweils am Asparagin (Asn) in Position 26, in Position 499 sowie in Position 862 lokalisierbar. The second protein according to the invention is also an integral membrane protein. In addition to an amino terminal signal peptide (cleavage point between the Amino acids 18 and 19) five transmembrane domains (amino acid sections: 531 to 562, 595 to 615, 673 to 700, 725 to 744 and 750 to 774). Potential N- Glycosylation sites are each on the asparagine (Asn) in position 26, in position 499 and can be located in position 862.
Darüber hinaus lassen sich aus der Aminosäuresequenz Sequenzprotokoll ID No. 4 des zweiten erfindungsgemäßen Targetproteins drei potentielle antigene Determi nanten im Bereich der Aminosäureabschnitte 150 bis 156, 428 bis 434 und 799 bis 804 ableiten. Diese Determinanten der Aminosäuresequenz des zweiten erfin dungsgemäßen Proteins sind bevorzugt zur Erzeugung monoklonaler Antikörper gegen das Protein von Bedeutung.In addition, sequence protocol ID no. 4th of the second target protein according to the invention three potential antigenic determi names in the range of amino acid sections 150 to 156, 428 to 434 and 799 to Derive 804. These determinants of the amino acid sequence of the second invent Proteins according to the invention are preferred for generating monoclonal antibodies against the protein of importance.
Besonders auffällig ist im aminoterminalen Bereich ein Abschnitt aus 20 Threonin (Thr)-Resten, der von einem Serin (Ser)-Rest unterbrochen ist (Aminosäureposition 128 bis 147), der carboxyterminale Teil des erfindungsgemäßen Proteins enthält auffällig viele Prolin (Pro)-Reste (Position 915 bis 926: extrem Prolinreicher Abschnitt). Das erfindungsgemäße Targetprotein weist allerdings keinen auffällig hohen Prolingehalt auf. Prolinreiche Abschnitte können 'Targets' für Protein- Protein Wechselwirkungen sein oder als 'Spacer' zwischen funktionalen Domänen fungieren (siehe z. B. Yu et al., Cell Vol. 78, 1994, S. 933-945; Linial, Neuro report Vol. 5, 1994, S. 2009-2015).A section of 20 threonine is particularly striking in the amino terminal area (Thr) residues interrupted by a serine (Ser) residue (amino acid position 128 to 147), which contains the carboxy-terminal part of the protein according to the invention Strikingly many proline (pro) residues (positions 915 to 926: extremely rich in proline Section). However, the target protein according to the invention is not noticeable high proline content. Proline-rich sections can be 'targets' for protein Protein interactions or as a 'spacer' between functional domains act (see e.g. Yu et al., Cell Vol. 78, 1994, pp. 933-945; Linial, Neuro report Vol. 5, 1994, pp. 2009-2015).
Der cDNA-Abschnitt, der für das zweite erfindungsgemäße Protein kodiert, zeigte beim Screening der EMBL-Datenbank zwischen den Basen 1790 bis 2460, der im Sequenzprotokoll ID No. 4 gezeigten Sequenz, eine 60%ige Homologie zu einem Genomabschnitt des freilebenden Nematoden C. elegans (Accession-Nr: Z54306, Wilson et al., Nature Vol. 368, 1994, S. 32-38).The cDNA section which codes for the second protein according to the invention showed when screening the EMBL database between bases 1790 to 2460, which in the Sequence listing ID No. 4 sequence shown, a 60% homology to one Genome section of the free-living nematode C. elegans (accession no .: Z54306, Wilson et al., Nature Vol. 368, 1994, pp. 32-38).
Der ähnliche C. elegans Genomabschnitt ist ein Exon eines Gens, dessen dedu ziertes Genprodukt ähnlich zu G-Protein gekoppelten Rezeptoren sein soll. Weitere Informationen über dieses Gen bzw. Genprodukt existieren nicht, da die veröffent lichte Sequenz Produkt des C. elegans Genomprojektes ist (vgl. Wilson et al., Nature Vol. 368, 1994, S. 32-38). Die 'Best Fit' Analyse zeigt eine 49%ige Iden tität bzw. 65%ige Ähnlichkeit dieses deduzierten Proteins zu dem H. contortus Genprodukt. Auch das C. elegans Protein besitzt in der aminoterminalen Region einen Threonin (Thr)-Abschnitt aus 15 Resten, der ebenfalls von einem Serin (Ser)-Rest unterbrochen wird.The similar C. elegans genome section is an exon of a gene whose dedu graced gene product is said to be similar to G protein-coupled receptors. Further Information about this gene or gene product does not exist because the published light sequence is the product of the C. elegans genome project (see Wilson et al., Nature Vol. 368, 1994, pp. 32-38). The 'Best Fit' analysis shows a 49% identity tity or 65% similarity of this deduced protein to the H. contortus Gene product. The C. elegans protein also has in the amino terminal region a threonine (Thr) section of 15 residues, also from a serine (Ser) rest is interrupted.
Die 'Best Fit' Analyse des zweiten erfindungsgemäßen Proteins im Vergleich zu verschiedenen G-Protein-gekoppelten Rezeptoren zeigt folgendes Ergebnis: Zum Vorläuferprotein des Calcitonin Rezeptors des Schweins (SwissProt-Accession-Nr: P25 117) besteht eine Identität von 22% bzw. Ähnlichkeit von 44%; zum Gastrin/ Cholecystokinin Typ B Rezeptor der Ratte (Accession-Nr: P30553) besteht eine Identität von 20% bzw. eine Ähnlichkeit von 45% und zum Neuromedin K Rezeptor der Ratte (Accession-Nr.: P16177) besteht 18% Identität bzw. 46% Ähnlichkeit.The 'best fit' analysis of the second protein according to the invention compared to different G protein-coupled receptors shows the following result: Pig precursor protein of the calcitonin receptor (SwissProt accession no .: P25 117) there is an identity of 22% or similarity of 44%; to gastrin / Rat cholecystokinin type B receptor (accession no: P30553) has one Identity of 20% or a similarity of 45% and to Neuromedin K Rat receptor (accession no .: P16177) consists of 18% identity or 46% Similarity.
Weitere Proteine, die Threonin (Thr)-reiche Abschnitte aufweisen (aus der SwissProt-Datenbank), z. B. Integument Mucin aus Xenopus laevis (Accession-Nr: P10667, Q05049), Fasciclin II aus Drosophila melanogaster (P34083), intestinale alkalische Phosphatase aus der Maus (P24822) oder das Speichelprotein SGS-3 aus Drosophila melanogaster (P13729) zeigen - abgesehen vom gemeinsamen Threonin (Thr)-Abschnitt - keine weiteren signifikanten Ähnlichkeiten zum erfin dungsgemäßen Protein.Other proteins that have threonine (Thr) -rich sections (from the SwissProt database), e.g. B. Integument Mucin from Xenopus laevis (accession no: P10667, Q05049), Fasciclin II from Drosophila melanogaster (P34083), intestinal mouse alkaline phosphatase (P24822) or the saliva protein SGS-3 Drosophila melanogaster (P13729) show - apart from the common Threonine (Thr) section - no other significant similarities to the invented protein according to the invention.
Die beiden erfindungsgemäßen Proteine (vgl. Sequenzprotokolle ID No. 2 und 4) können als neue Prototypen von spezifischen Proteinen parasitärer Nematoden, insbesondere in Nematoden aus der Ordnung der Strongylida, wie beispielsweise Haemonchus spp., angesehen werden.The two proteins according to the invention (cf. sequence listing ID No. 2 and 4) as new prototypes of specific proteins of parasitic nematodes, in particular in nematodes from the order of the Strongylida, such as, for example Haemonchus spp.
Mit Hilfe der erfindungsgemäßen cDNA-Sequenzen (vgl. Sequenzprotokolle ID No. 1 und 3) ist es beispielsweise möglich, Zellinien herzustellen, die die jewei ligen erfindungsgemäßen Proteine permanent exprimieren. Hierzu werden mit an sich bekannten gentechnologischen Methoden die für diese Proteine kodierenden cDNA-Sequenzen jeweils in einen geeigneten Vektor eingebaut, mit dem eine geeignete Zellinie, die das jeweilige Protein bisher nicht exprimierte, transformiert wird. Dadurch können Zellinien erhalten werden, die das jeweilig erste oder zweite erfindungsgemäße Protein (vgl. Sequenzprotokolle ID No. 2 und 4) konstant expri mieren.With the aid of the cDNA sequences according to the invention (cf. sequence protocols ID No. 1 and 3) it is possible, for example, to produce cell lines that each permanently express the proteins according to the invention. To do this, use the to known genetic engineering methods that code for these proteins cDNA sequences each inserted into a suitable vector with which one suitable cell line, which has not yet expressed the respective protein becomes. As a result, cell lines can be obtained which are the first and second respectively protein according to the invention (cf. sequence listing ID No. 2 and 4) constant expri lubricate.
So können die erfindungsgemäßen Proteine durch Expression in einem prokaryo tischen oder eukaryotischen Expressionssystem in an sich bekannter Weise gewon nen werden.For example, the proteins according to the invention can be expressed in a prokaryo table or eukaryotic expression system in a conventional manner be.
Geeignete prokaryotische Expressionssysteme sind dabei alle bekannten Wirts- Vektor-Systeme wie Bakterien der Arten Streptomyces, spp. Bacillus subtilis, Salmonella typhimurium oder Serratia marcescens, insbesondere E. coli, in denen die Expression einer unter Kontrolle eines induzierbaren Promotors stehenden rekombinanten DNA möglich ist. Suitable prokaryotic expression systems are all known hosts. Vector systems such as bacteria of the species Streptomyces, spp. Bacillus subtilis, Salmonella typhimurium or Serratia marcescens, especially E. coli, in which the expression of a controlled inducible promoter recombinant DNA is possible.
Als Promotoren für eine Expression in E. coli kommen natürliche, Hybrid- oder Bakteriophagenpromotoren in Betracht. Bevorzugt verwendet man hierbei Promotoren oder Operatoren aus der Gruppe lac-, lacuv5-, trp-, tac-, trc-, rac-, phoA-, PL oder PR des Phagen λ, hsp, omp oder synthetische Promotoren, wie sie beispielsweise in der DE-OS 34 30 683 bzw. in der EP-A 0 173 149 vorgeschlagen sind. Vorteilhaft ist z. B. die tac-Promotor-Operator-Sequenz, die inzwischen handelsüblich ist (z. B. Expressionsvektor pKK223-3, Pharmacia, "Molecular Biologicals, Chemicals and Equipment for Molecular Biology", 1984, S. 63).Natural, hybrid or bacteriophage promoters come into consideration as promoters for expression in E. coli. It is preferred to use promoters or operators from the group lac-, lacuv5-, trp-, tac-, trc-, rac-, phoA-, P L or P R of phage λ, hsp, omp or synthetic promoters such as those used for example in DE-OS 34 30 683 and in EP-A 0 173 149 are proposed. It is advantageous for. B. the tac promoter operator sequence, which is now commercially available (z. B. Expression vector pKK223-3, Pharmacia, "Molecular Biologicals, Chemicals and Equipment for Molecular Biology", 1984, p. 63).
Als geeignetes eukaryotisches Expressionssystem ist insbesondere das Baculo virussystem zu nennen.Baculo is a particularly suitable eukaryotic expression system to name virus system.
Vorzugsweise verwendet man zur Expression der erfindungsgemäßen Proteine ein geeignetes eukaryotisches Expressionssystem, insbesondere das Baculovirussystem, bei dem post-translationale Modifikationen durchgeführt werden.Preferably, one is used to express the proteins of the invention suitable eukaryotic expression system, in particular the baculovirus system, in which post-translational modifications are made.
Bei der Expression der erfindungsgemäßen Proteine kann es sich als zweckmäßig erweisen, einzelne Kodons zu verändern. Dabei ist der gezielte Austausch von Basen in der kodierenden Region auch sinnvoll, wenn die genutzten Kodons in den Proteinen abweichend sind von der Kodonnutzung im heterologen Expres sionssystem, um eine optimale Synthese des Proteins zu gewährleisten. Zudem sind oft Deletionen von nicht-translatierten 5'- bzw. 3'-Abschnitten sinnvoll, bei spielsweise wenn mehrere destabilisierende Sequenzmotive ATTTA im 3'-Bereich der cDNA vorliegen. Dann sollten diese bei der bevorzugten Expression in Eukaryonten deletiert werden.When expressing the proteins according to the invention, it can be useful prove to change individual codons. The targeted exchange of Bases in the coding region also make sense if the codons used in the proteins differ from the codon usage in heterologous express sion system to ensure an optimal synthesis of the protein. In addition deletions of non-translated 5 'or 3' sections are often useful, at for example if several destabilizing sequence motifs ATTTA in the 3 'range the cDNA are available. Then they should be in the preferred expression in Eukaryotes can be deleted.
Veränderungen dieser Art sind Deletionen, Additionen oder Austausch von Basen und ebenfalls Gegenstand der vorliegenden Erfindung.Changes of this kind are deletions, additions or exchange of bases and also the subject of the present invention.
Mit den erfindungsgemäßen spezifischen Antikörpern gegen die Proteine können beispielsweise durch Western blot-Analysen homologe bzw. kreuzreagierende Proteine anderer, parasitärer Nematoden, detektiert werden.With the specific antibodies against the proteins according to the invention for example, by Western blot analyzes homologous or cross-reactive Proteins from other parasitic nematodes can be detected.
Mit Hilfe der erfindungsgemäßen Proteine und ihrer Homologen können neue spezifische Wirkstoffe gegen Nematoden gefunden werden. With the help of the proteins according to the invention and their homologues new ones can be obtained specific active substances against nematodes can be found.
Insbesondere kann das erfindungsgemäße Protein aufgrund der potentiellen Rezep toreigenschaften zur Bindung von offenkettigen oder cyclischen Depsipeptiden als Liganden, bestehend aus Aminosäuren und Hydroxycarbonsäuren als Bausteine, in geeigneten Testkits zum Screening auf nematizide Wirkung dieser Verbindungen verwendet werden.In particular, the protein according to the invention can be based on the potential recipe Gate properties for binding open-chain or cyclic depsipeptides as Ligands consisting of amino acids and hydroxycarboxylic acids as building blocks, in suitable test kits for screening for nematicidal activity of these compounds be used.
Die Wirkstoffe, die mit Hilfe der erfindungsgemäßen Proteine gefunden werden,
eignen sich bei günstiger Warmblütertoxizität zur Bekämpfung von pathogenen
Endoparasiten, die bei Menschen und in der Tierhaltung und Tierzucht bei Nutz-,
Zucht-, Zoo-, Labor-, Versuchs- und Hobbytieren vorkommen. Sie sind dabei
gegen alle oder einzelne Entwicklungsstadien der Schädlinge sowie gegen
resistente und normal sensible Arten wirksam. Durch die Bekämpfung der patho
genen Endoparasiten sollen Krankheit, Todesfälle und Leistungsminderungen (z. B.
bei der Produktion von Fleisch, Milch, Wolle, Häuten, Eiern usw.) vermindert
werden, so daß durch den Einsatz der Wirkstoffe eine wirtschaftlichere und ein
fachere Tierhaltung möglich ist. Zu den pathogenen Endoparasiten zählen
Nematoden. Ganz besonders genannt seien:
Aus der Ordnung der Enoplida z. B.: Trichuris spp., Capillaria spp., Tri
chomosoides spp., Trichinella spp.
Aus der Ordnung der Rhabditia z. B.: Micronema spp., Strongyloides spp. .
Aus der Ordnung der Strongylida z. B.: Strongylus spp., Triodontophorus spp.,
Oesophagodontus spp., Trichonema spp., Gyalocephalus spp., Cylindropharynx
spp., Poteriostomum spp., Cyclococercus spp., Cylicostephanus spp., Oesopha
gostomum spp., Chabertia spp., Stephanurus spp.), Ancylostoma spp., Uncinaria
spp., Bunostomum spp., Globocephalus spp., Syngamus spp.), Cyathostoma spp.,
Metastrongylus spp., Dictyocaulus spp., Muellerius spp., Protostrongylus spp.,
Neostrongylus spp., Cystocaulus spp., Pneumostrongylus spp., Spicocaulus spp.,
Elaphostrongylus spp., Parelaphostrongylus spp., Crenosoma spp., Paracrenosoma
spp., Angiostrongylus spp., Aelurostrongylus spp., Filaroides spp., Parafilaroides
spp., Trichostrongylus spp., Haemonchus spp.), Ostertagia spp., Marshallagia spp.,
Cooperia spp., Nematodirus spp., Hyostrongylus spp., Obeliscoides spp.,
Amidostomum spp., Ollulanus spp.
Aus der Ordnung der Oxyurida z. B.: Oxyuris spp., Enterobius spp., Passalurus
spp., Syphacia spp., Aspiculuris spp., Heterakls spp.
Aus der Ordnung der Ascaridia z. B.: Ascaris spp., Toxascaris spp., Toxocara spp.,
Parascaris spp., Anisakls spp., Ascaridia spp.
Aus der Ordnung der Spirurida z. B.: Gnathostoma spp., Physaloptera spp.,
Thelazia spp., Gongylonema spp., Habronema spp., Parabronema spp., Draschia
spp., Dracunculus spp.
Aus der Ordnung der Filariida z. B.: Stephanofilaria spp., Parafilaria spp., Setaria
spp., Loa spp., Dirofilaria spp., Litomosoides spp., Brugia spp., Wuchereria spp.,
Onchocerca spp.
Aus der Ordnung der Gigantorhynchida z. B.: Filicollis spp., Moniliformis spp.,
Macracanthorhynchus spp., Prosthenorchis spp.The active ingredients that are found with the help of the proteins according to the invention are suitable for combating pathogenic endoparasites, which occur in humans and in animal husbandry and animal breeding in useful, breeding, zoo, laboratory, experimental and hobby animals, with favorable warm-blooded toxicity . They are effective against all or individual stages of development of the pests and against resistant and normally sensitive species. By combating the pathogenic endoparasites, disease, deaths and reduced performance (e.g. in the production of meat, milk, wool, hides, eggs, etc.) are to be reduced, so that the use of the active compounds makes animal husbandry more economical and more professional is possible. Pathogenic endoparasites include nematodes. Particularly worth mentioning:
From the order of the Enoplida z. For example: Trichuris spp., Capillaria spp., Tri chomosoides spp., Trichinella spp.
From the order of the Rhabditia z. E.g. Micronema spp., Strongyloides spp. .
From the order of Strongylida z. For example: Strongylus spp., Triodontophorus spp., Oesophagodontus spp., Trichonema spp., Gyalocephalus spp., Cylindropharynx spp., Poteriostomum spp., Cyclococercus spp., Cylicostephanus spp., Oesopha gostabertia spp., .), Ancylostoma spp., Uncinaria spp., Bunostomum spp., Globocephalus spp., Syngamus spp.), Cyathostoma spp., Metastrongylus spp., Dictyocaulus spp., Muellerius spp., Protostrongylus spp., Neostrongylus ., Pneumostrongylus spp., Spicocaulus spp., Elaphostrongylus spp., Parelaphostrongylus spp., Crenosoma spp., Paracrenosoma spp., Angiostrongylus spp., Aelurostrongylus spp., Filaroides spp., Parafilaruschpp., Parafilaropp. , Ostertagia spp., Marshallagia spp., Cooperia spp., Nematodirus spp., Hyostrongylus spp., Obeliscoides spp., Amidostomum spp., Ollulanus spp.
From the order of the Oxyurida z. For example: Oxyuris spp., Enterobius spp., Passalurus spp., Syphacia spp., Aspiculuris spp., Heterakls spp.
From the order of Ascaridia z. For example: Ascaris spp., Toxascaris spp., Toxocara spp., Parascaris spp., Anisakls spp., Ascaridia spp.
From the order of the Spirurida z. E.g .: Gnathostoma spp., Physaloptera spp., Thelazia spp., Gongylonema spp., Habronema spp., Parabronema spp., Draschia spp., Dracunculus spp.
From the order of the Filariida z. For example: Stephanofilaria spp., Parafilaria spp., Setaria spp., Loa spp., Dirofilaria spp., Litomosoides spp., Brugia spp., Wuchereria spp., Onchocerca spp.
From the order of the Gigantorhynchida z. For example: Filicollis spp., Moniliformis spp., Macracanthorhynchus spp., Prosthenorchis spp.
Zu den Nutz- und Zuchttieren gehören Säugetiere wie z. B. Rinder, Pferde, Schafe, Schweine, Ziegen, Kamele, Wasserbüffel, Esel, Kaninchen, Damwild, Rentiere, Pelztiere wie z. B. Nerze, Chinchilla, Waschbär, Vögel wie z. B. Hühner, Gänse, Puten, Enten, Süß- und Salzwasserfische wie z. B. Forellen, Karpfen und Aale.The livestock and breeding animals include mammals such as B. cattle, horses, sheep, Pigs, goats, camels, water buffalos, donkeys, rabbits, fallow deer, reindeer, Fur animals such as B. mink, chinchilla, raccoon, birds such. B. chickens, geese, Turkeys, ducks, fresh and salt water fish such as B. trout, carp and eels.
Zu Labor- und Versuchstieren gehören Mäuse, Ratten, Meerschweinchen, Gold hamster, Hunde und Katzen.Laboratory and experimental animals include mice, rats, guinea pigs, gold hamsters, dogs and cats.
Zu den Hobbytieren gehören Hunde und Katzen.The pets include dogs and cats.
Die Anwendung kann sowohl prophylaktisch als auch therapeutisch erfolgen.The application can be prophylactic as well as therapeutic.
Die Anwendung der Wirkstoffe erfolgt direkt oder in Form von geeigneten Zube reitungen enteral, parenteral, dermal oder nasal.The active ingredients are used directly or in the form of suitable accessories Horse riding enterally, parenterally, dermally or nasally.
Weiterhin können mit Hilfe der erfindungsgemäßen Proteine auch Antikörper, insbesondere monoklonale Antikörper, hergestellt werden, die nematizide Wirkung besitzen und als nematizide Wirkstoffe eingesetzt werden können. Antibodies, in particular monoclonal antibodies, which have nematicidal activity own and can be used as nematicidal active ingredients.
Insbesondere können die drei antigenen Determinanten des ersten erfindungs gemäßen Proteins (ID-No. 2), die Abschnitte 69 bis 75, 157 bis 162 und 159 bis 164 für die Erzeugung monoklonaler Antikörper dienen.In particular, the three antigenic determinants of the first invention according to protein (ID No. 2), sections 69 to 75, 157 to 162 and 159 to 164 serve for the generation of monoclonal antibodies.
Weiterhin können insbesondere die drei antigenen Determinanten des erfindungs gemäßen Proteins (ID-No. 4), die Abschnitte 150 bis 156, 428 bis 434 und 799 bis 804 für die Erzeugung monoklonaler Antikörper dienen.Furthermore, in particular the three antigenic determinants of the invention according to protein (ID No. 4), sections 150 to 156, 428 to 434 and 799 to 804 for the production of monoclonal antibodies.
200 mg Cyclo-(MeLeu-D-4-NH2-PhLac-MeLeu-D-Lac-MeLeu-D-4-NH2-PhLac- MeLeu-D-Lac-) werden in 4,39 ml eiskalter 0,1 N Salzsäure gelöst und bei 0°C mit 3,27 ml einer 0,05 M Natriumnitritiösung versetzt. Ebenfalls bei 0°C wird eine Lösung aus 200 mg BSA oder KLH mit 91,5 mg NaCl in 10 ml 0,5 M Natron lauge zugetropft. Man rührt noch zwei Stunden bei 0°C nach und neutralisiert mit konzentrierter Salzsäure. Anschließend wird dialysiert und lyophilisiert. Danach wird der Rückstand in Wasser aufgenommen, mit Methylenchlorid gewaschen. Nach Abtrennung der wäßrigen Phase wird erneut lyophilisiert. Die zumeist pulverigen KLH-PF 1022A-Derivat- und BSA-PF 1022A-Derivat-Konjugate lassen sich ohne weitere Reinigung für die nachfolgenden Immunisierungsversuche verwenden.200 mg of cyclo- (MeLeu-D-4-NH 2 -PhLac-MeLeu-D-Lac-MeLeu-D-4-NH 2 -PhLac- MeLeu-D-Lac-) are added in 4.39 ml of ice-cold 0.1 N dissolved hydrochloric acid and mixed at 0 ° C with 3.27 ml of a 0.05 M sodium nitrite solution. A solution of 200 mg BSA or KLH with 91.5 mg NaCl in 10 ml 0.5 M sodium hydroxide solution is also added dropwise at 0 ° C. The mixture is stirred for a further two hours at 0 ° C. and neutralized with concentrated hydrochloric acid. It is then dialyzed and lyophilized. The residue is then taken up in water and washed with methylene chloride. After the aqueous phase has been separated off, it is lyophilized again. The mostly powdery KLH-PF 1022A derivative and BSA-PF 1022A derivative conjugates can be used for subsequent immunization experiments without further purification.
Die KLH-PF 1022A-Derivat- und BSA-PF 1022A-Derivat-Konjugate (Komplexe) wurden zur Immunisierung von Kaninchen eingesetzt (3 Tiere pro Carrier-Hapten- Komplex). Die ersten Boost-Immunisierungen erfolgte 14 Tage nach der Erstim munisierung. Im Abstand von jeweils 4 Wochen wurden insgesamt 10 weitere Boost-Immunisierungen durchgeführt. Ab der dritten Boost-Immunisierung wurde jeweils nach 10 Tagen ca. 20 ml Blut für die Serumgewinnung entnommen. 24 Tage nach der letzten Immunisierung wurden die Tiere komplett ausgeblutet.The KLH-PF 1022A derivative and BSA-PF 1022A derivative conjugates (complexes) were used to immunize rabbits (3 animals per carrier hapten Complex). The first boost immunizations occurred 14 days after the initial ammunition. A total of 10 more were every 4 weeks Boost immunizations performed. From the third boost immunization was on Approximately 20 ml of blood is drawn after 10 days for serum extraction. The animals were completely bled 24 days after the last immunization.
Die Spezifität des Antiserums gegen das PF 1022A-Derivat wurde durch Western blot-Analyse überprüft. Der KLH-PF 1022A-Derivat-Komplex sowie das Carrier- Protein KLH wurden über eine "slot blot" Apparatur (Minifold S, Schleicher & Schuell, Dassel) in gleichen Mengen (20 µg pro "slot") an Nitrozellulosefilter ge bunden. Die Filter wurden mit einer 1 : 500 Verdünnung des Antiserums für vier Stunden bei Raumtemperatur inkubiert. Der Nachweis der gebundenen Antikörper erfolgte mit alkalischer Phosphatase-konjugierten Anti-Kaninchen-Antikörpern (Sigma, Deisenhofen) und einer alkalischen Nitroblautetrazolium/5-Bromo-3- chloro-3-indolylphosphat-Substratlösung (NBT/BCIP). Der KLH-PF 1022A-Kom plex reagierte deutlich stärker mit dem Antiserum als KLH.The specificity of the antiserum against the PF 1022A derivative was determined by Western blot analysis checked. The KLH-PF 1022A derivative complex and the carrier Protein KLH were used on a "slot blot" apparatus (Minifold S, Schleicher & Schuell, Dassel) in equal amounts (20 µg per "slot") of nitrocellulose filter bound. The filters were run at a 1: 500 dilution of the antiserum for four Incubated for hours at room temperature. Detection of bound antibodies was carried out with alkaline phosphatase-conjugated anti-rabbit antibodies (Sigma, Deisenhofen) and an alkaline nitro blue tetrazolium / 5-bromo-3- chloro-3-indolyl phosphate substrate solution (NBT / BCIP). The KLH-PF 1022A-Kom plex reacted much more strongly with the antiserum than KLH.
Die Extraktion der totalen RNA des gastrointestinalen Nematoden Haemon chus contortus erfolgte nach der von Chirgwin et al. beschriebenen Guani dinium-Isothiocyanat/Cäsiumchlorid-Kissen Methode (Biochemistry 18, 1979, S. 5.294 bis 5.299). Die polyadenylierte RNA-Fraktion wurde an schließend über Oligo(dT)-Chromatographie gereinigt (Aviv & Leder, Proc. Natl. Acad. Sci., USA, 69, 1972, S. 1.408 bis 1.412).Extraction of total RNA from the gastrointestinal nematode Haemon chus contortus was performed according to the Chirgwin et al. described guani dinium isothiocyanate / cesium chloride cushion method (Biochemistry 18, 1979, pp. 5,294 to 5,299). The polyadenylated RNA fraction was turned on finally purified via oligo (dT) chromatography (Aviv & Leder, Proc. Natl. Acad. Sci., USA, 69, 1972, pp. 1,408 to 1,412).
Zur Konstruktion einer statistisch repräsentativen cDNA-Bibliothek wurden 5 µg der polyadenylierten RNA-Fraktion für die cDNA-Synthese einge setzt. Die Synthese folgte den Vorschriften des "Great Lenght cDNA Syn thesis Kit" von Clontech (Heidelberg). Die Erststrangsynthese wurde mit einem Oligo(dT)25 (dN) Primer durchgeführt. EcoRI Adaptoren wurden an die doppelsträngige cDNA ligiert und cDNA-Moleküle < 500 bp über Chromaspin-Säulen (Clontech) fraktioniert. Nach Ligation der cDNA in die EcoRI-Schnittstelle des Vektors λZAPII (Stratagene, Heidelberg) wurden die Konstrukte in vitro verpackt (Gigapack Gold II, Stratagene).To construct a statistically representative cDNA library, 5 µg of the polyadenylated RNA fraction were used for the cDNA synthesis. The synthesis followed the regulations of the "Great Lenght cDNA Synthesis Kit" from Clontech (Heidelberg). The first strand synthesis was carried out with an Oligo (dT) 25 (dN) primer. EcoRI adapters were ligated to the double-stranded cDNA and cDNA molecules <500 bp were fractionated using Chromaspin columns (Clontech). After ligation of the cDNA into the EcoRI site of the vector λZAPII (Stratagene, Heidelberg), the constructs were packaged in vitro (Gigapack Gold II, Stratagene).
Das Antiserum gegen den KLH-PF 1022A-Derivat-Komplex wurde für das Immunscreening verwendet. Um die Anti-E. coli Antikörper aus dem Anti serum zu entfernen, wurde 1 : 100 verdünntes Antiserum für vier Stunden bei Raumtemperatur mit Filter-gebundenem E. coli Lysat inkubiert. Ca. 5.000 "plaque forming units" (pfu) der Bibliothek wurden pro Assay auf LB-Agar plattiert und so lange bei 37°C inkubiert, bis Plaques sichtbar wurden. Es wurde dann ein mit Isopropyl-β-thiogalakto-pyranosid gesättig ter Nitrocellulosefilter auf die Platte gelegt, um die Expression der Fusions proteine zu induzieren. Nach einer Inkubationszeit von vier bis 12 Stunden bei 42°C wurde der Filter wieder entfernt und mit dem KLH-PF 1022A- Konjugat (20 mg/ml) für mindestens eine Stunde bei Raumtemperatur inku biert. Danach wurden die Filter mit Antiserum (1 : 500 bis 1 : 1.000 Verdün nung) für vier Stunden bei Raumtemperatur inkubiert. Gebundene Antikör per wurden mit alkalischer Phosphatase konjugierten Anti-Kaninchen-Anti körpern und NBT/BCIP-Substratlösung detektiert.The antiserum against the KLH-PF 1022A derivative complex was used for the Immune screening used. To the anti-E. coli antibodies from the anti To remove serum was diluted 1: 100 antiserum for four hours incubated at room temperature with filter-bound E. coli lysate. Approx. 5,000 "plaque forming units" (pfu) from the library were assayed LB agar plated and incubated at 37 ° C until plaques are visible were. It then became saturated with isopropyl-β-thiogalacto-pyranoside The nitrocellulose filter placed on the plate to allow expression of the fusion to induce proteins. After an incubation period of four to 12 hours at 42 ° C the filter was removed again and with the KLH-PF 1022A- Incu conjugate (20 mg / ml) for at least one hour at room temperature beer. The filters were then diluted with antiserum (1: 500 to 1: 1,000 dilution incubation) for four hours at room temperature. Bound antibody per were anti-rabbit anti conjugated with alkaline phosphatase bodies and NBT / BCIP substrate solution detected.
Positive Agarbereiche wurden ausgestochen (20 bis 30 verschiedene Plaques) und die eluierten Phagen wurden einem "rescreening" unterwor fen. Die letztlich isolierten reinen Phagenklone wurden mittels in vitro Excision zu Plasmidklonen konvertiert und die Plasmid-DNA für weitere Analysen eingesetzt.Positive agar areas were cut out (20 to 30 different Plaques) and the eluted phages were subjected to a "rescreening" fen. The pure phage clones which were ultimately isolated were analyzed in vitro Excision converted to plasmid clones and the plasmid DNA for further Analyzes used.
Die Analyse des Klons erfolgte über automatisierte Laser-Fluoreszenz- Sequenzierung (A.L.F.-DNA Sequencer, Pharmacia Freiburg, bzw. Licor 4000, MWG, Ebersberg) unter Verwendung des "Auto Read Sequencing" System (Pharmacia) bzw. des "Thermo-Sequenase Fluorescence" Sequen zierungskit (Amersham, Braunschweig). Beide Stränge der erfindungs gemäßen cDNA wurden mehrmals sequenziert. Sequenzdaten wurden mit der GCG Software (Genetics Computer Group Inc., Madison, WI, USA) analysiert. Es erfolgte die Benutzung der Protein- bzw. DNA-Bibliotheken der EMBL (Heidelberg).The clone was analyzed using automated laser fluorescence Sequencing (A.L.F.-DNA Sequencer, Pharmacia Freiburg, or Licor 4000, MWG, Ebersberg) using "Auto Read Sequencing" System (Pharmacia) or the "Thermo-Sequenase Fluorescence" sequence decorative kit (Amersham, Braunschweig). Both strands of the invention cDNA were sequenced several times. Sequence data were created using GCG Software (Genetics Computer Group Inc., Madison, WI, USA) analyzed. The protein or DNA libraries were used the EMBL (Heidelberg).
d) Glyoxal-denaturierte poly-A⁺-RNA (10 µg/Spur) wurde in Agarosegelen aufgetrennt und auf eine Hybond-N-Membran (Amersham, Braunschweig) transferiert (Chomczynski, Anal. Biochem. 201, 1992, S. 134 bis 139). Die Hybridisierung des Filters erfolgte über Nacht bei 65°C in 6 × SSC, 5 × Denhardt's Reagenz mit radioaktiv markierter Plasmid-DNA ("random priming" mit 50 µCi [α-32P]dCTP). Die Membranen wurden anschließend unter hoher Stringenz in 0,2 × SSC, 0,5% SDS bei 65°C gewaschen (Sambrock et al., Molecular Cloning: a Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor NY, 1989). d) Glyoxal-denatured poly-A⁺-RNA (10 µg / lane) was separated in agarose gels and transferred to a Hybond-N membrane (Amersham, Braunschweig) (Chomczynski, Anal. Biochem. 201, 1992, pp. 134 bis 139). The filter was hybridized overnight at 65 ° C. in 6 × SSC, 5 × Denhardt's reagent with radioactively labeled plasmid DNA (“random priming” with 50 μCi [α- 32 P] dCTP). The membranes were then washed with high stringency in 0.2 × SSC, 0.5% SDS at 65 ° C. (Sambrock et al., Molecular Cloning: a Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor NY, 1989) .
Mit Hilfe der in der vorliegenden Anmeldung beschriebenen Techniken konnten zwei mRNA-Spezies aus Nematoden kloniert und vollständig sequenziert werden (vgl. Sequenzprotokolle ID) No. 1 und 3, Anhang).Using the techniques described in the present application two mRNA species are cloned from nematodes and fully sequenced (see Sequence Listing ID) No. 1 and 3, Appendix).
Die erste klonierte cDNA mit der Bezeichnung pHC-2 umfaßt 972 Basen und kodiert für ein Protein mit 207 Aminosäuren (vgl. Sequenzprotokoll ID No. 2).The first cloned cDNA called pHC-2 comprises 972 bases and encodes a protein with 207 amino acids (see Sequence Listing ID No. 2).
Die aus mehreren cDNA-Fragmenten (pHC-1) charakterisierte zweite mRNA setzt sich aus 3.539 Basen zusammen und kodiert für ein Protein mit 986 Aminosäuren (vgl. Sequenzprotokoll ID No. 4).The second mRNA characterized from several cDNA fragments (pHC-1) sets is composed of 3,539 bases and codes for a protein with 986 amino acids (see sequence listing ID No. 4).
Im folgenden Sequenzprotokoll zeigt:
Seq. ID No. 1 die Nucleotidsequenz der erfindungsgemäßen cDNA (pHC-2) aus
dem gastrointestinalen Nematoden Haemonchus contortus. Die dargestellte cDNA
umfaßt 972 Basen, die für 207 Aminosäuren des Proteins gemäß Seq. ID) No. 2
kodieren. Start für die Kodierung von Protein ID No. 2 ist die Position 11.The following sequence listing shows:
Seq. ID No. 1 shows the nucleotide sequence of the cDNA (pHC-2) according to the invention from the gastrointestinal nematode Haemonchus contortus. The cDNA shown comprises 972 bases, which for 207 amino acids of the protein according to Seq. ID) No. 2 code. Start of coding for Protein ID No. 2 is position 11.
Seq. ID No. 2 die aus der Nucleotidsequenz Seq. ID No. 1 abgeleitete Amino
säuresequenz des ersten Proteins aus dem gastrointestinalen Nematoden
Haemonchus contortus. In dieser Sequenz liegen auf den Positionen
Seq. ID No. 2 which results from the nucleotide sequence Seq. ID No. 1 derived amino acid sequence of the first protein from the gastrointestinal nematode Haemonchus contortus. In this sequence lie on the positions
- a) 1-18 NH2-terminales Signalpeptid, Spaltstelle zwischen Aminosäuren 18 und 19,a) 1-18 NH 2 -terminal signal peptide, cleavage site between amino acids 18 and 19,
- b) 174-190 eine Transmembranregion,b) 174-190 a transmembrane region,
- c) 69-75 eine antigene Determinante,c) 69-75 an antigenic determinant,
- d) 157-162 eine antigene Determinante,d) 157-162 an antigenic determinant,
- e) 159-164 eine antigene Determinante,e) 159-164 an antigenic determinant,
- f) 167 eine Stelle für N-Glycosylierungen.f) 167 a site for N-glycosylation.
Seq. ID No. 3 die Nucleotidsequenz der erfindungsgemäßen cDNA (pHC-1) aus dem gastrointestinalen Nematoden Haemonchus contortus. Die aus mehreren cDNAs charakterisierte mRNA besteht aus 3.539 Basen, die für 986 Aminosäuren des Proteins gemäß Seq. ID No. 4 kodieren. Start für die Kodierung von Protein ID No. 4 ist die Position 99. Seq. ID No. 3 the nucleotide sequence of the cDNA (pHC-1) according to the invention the gastrointestinal nematode Haemonchus contortus. The one out of several cDNAs characterized mRNA consists of 3,539 bases, which for 986 amino acids of the protein according to Seq. ID No. 4 code. Start coding for protein ID No. 4 is position 99.
Seq. ID No. 4 die aus der Nucleotidsequenz Seq. ID No. 3 abgeleitete Amino
säuresequenz des zweiten Proteins aus dem gastrointestinalen Nematoden
Haemonchus contortus. In dieser Sequenz liegen auf den Positionen
Seq. ID No. 4 which results from the nucleotide sequence Seq. ID No. 3 derived amino acid sequence of the second protein from the gastrointestinal nematode Haemonchus contortus. In this sequence lie on the positions
- a) 1-18 NH2-terminales Signalpeptid, Spaltstelle zwischen Aminosäuren 18 und 19,a) 1-18 NH 2 -terminal signal peptide, cleavage site between amino acids 18 and 19,
- b) 531-562 erste Transmembrandomäne,b) 531-562 first transmembrane domain,
- c) 595-615 zweite Transmembrandomäne,c) 595-615 second transmembrane domain,
- d) 673-700 dritte Transmembrandomäne,d) 673-700 third transmembrane domain,
- e) 725-744 vierte Transmembrandomäne,e) 725-744 fourth transmembrane domain,
- f) 750-774 fünfte Transmembrandomäne,f) 750-774 fifth transmembrane domain,
- g) 26 eine Stelle für N-Glycosylierungen,g) 26 a site for N-glycosylations,
- h) 499 eine Stelle für N-Glycosylierungen,h) 499 a site for N-glycosylations,
- i) 862 eine Stelle für N-Glycosylierungen,i) 862 a site for N-glycosylations,
- j) 150-156 eine antigene Determinante,j) 150-156 an antigenic determinant,
- k) 428-434 eine antigene Determinante,k) 428-434 an antigenic determinant,
- l) 799-804 eine antigene Determinante.l) 799-804 an antigenic determinant.
Abb. 1 zeigt die Nucleotidsequenz aus Seq ID 1 und zugeordnet die Aminosäuren des Proteins aus Seq ID 2. Fig. 1 shows the nucleotide sequence from Seq ID 1 and assigned the amino acids of the protein from Seq ID 2.
Abb. 2 zeigt die Nucleotidsequenz aus Seq ID 3 und zugeordnet die Aminosäuren des Proteins aus Seq ID 4. Fig. 2 shows the nucleotide sequence from Seq ID 3 and assigned the amino acids of the protein from Seq ID 4.
Abb. 1 Translation of the nucleic acid sequence (pHC-2 DNA) Fig. 1 Translation of the nucleic acid sequence (pHC-2 DNA)
Claims (22)
- a) 1-18 NH2-terminales Signalpeptid,
- b) 174-190 eine Transmembranregion,
- c) 69-75 eine antigene Determinante,
- d) 157-162 eine antigene Determinante,
- e) 159-164 eine antigene Determinante,
- f) 167 eine Stelle für N-Glycosylierungen.
- a) 1-18 NH 2 -terminal signal peptide,
- b) 174-190 a transmembrane region,
- c) 69-75 an antigenic determinant,
- d) 157-162 an antigenic determinant,
- e) 159-164 an antigenic determinant,
- f) 167 a site for N-glycosylation.
- a) 1-18 NH2-terminales Signalpeptid,
- b) 531-562 erste Transmembrandomäne
- c) 595-615 zweite Transmembrandomäne
- d) 673-700 dritte Transmembrandomäne
- e) 725-744 vierte Transmembrandomäne
- f) 750-774 fünfte Transmembrandomäne
- g) 26 eine Stelle für N-Glycosylierungen
- h) 499 eine Stelle für N-Glycosylierungen
- i) 862 eine Stelle für N-Glycosylierungen
- j) 150-156 eine antigene Determinante
- k) 428-434 eine antigene Determinante
- l) 799-804 eine antigene Determinante.
- a) 1-18 NH 2 -terminal signal peptide,
- b) 531-562 first transmembrane domain
- c) 595-615 second transmembrane domain
- d) 673-700 third transmembrane domain
- e) 725-744 fourth transmembrane domain
- f) 750-774 fifth transmembrane domain
- g) 26 a site for N-glycosylation
- h) 499 a site for N-glycosylation
- i) 862 a site for N-glycosylation
- j) 150-156 an antigenic determinant
- k) 428-434 an antigenic determinant
- l) 799-804 an antigenic determinant.
- a) einen nematiziden Wirkstoff aus der Gruppe der cyclischen oder offenkettigen Depsipeptide, bestehend aus Aminosäuren und Hydroxycarbonsäuren als Bausteine, als Hapten mit einem Carrier molekül konjugiert,
- b) ein Donor-Tier mittels geeigneter Applikation mit diesem Hapten- Carrier-Konjugatimmunisiert,
- c) die Spezifität der gebildeten Antikörper bestimmt,
- d) gegebenenfalls die Konzentration der gebildeten spezifischen Anti körper bestimmt,
- e) die aus Seren oder Antikörper produzierenden Lymphozyten gewon nenen spezifischen Antikörper abtrennt und gegebenenfalls reinigt.
- a) a nematicidal active ingredient from the group of cyclic or open-chain depsipeptides, consisting of amino acids and hydroxycarboxylic acids as building blocks, conjugated as a hapten to a carrier molecule,
- b) a donor animal is immunized with this hapten-carrier conjugate by means of suitable application,
- c) determines the specificity of the antibodies formed,
- d) if appropriate, the concentration of the specific antibodies formed is determined,
- e) the specific antibodies obtained from sera or antibodies producing lymphocytes are separated and, if necessary, purified.
Priority Applications (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| DE19704024A DE19704024A1 (en) | 1996-10-10 | 1997-02-04 | Proteins, DNA sequences coding for them, on the other hand specific antibodies and their use to find nematicidal active substances |
| AU46249/97A AU4624997A (en) | 1996-10-10 | 1997-09-29 | Nematode proteins, dna sequences coding therefor, their specific antibodies and their use in identifying nematicidal active substances |
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Publications (1)
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| Country | Link |
|---|---|
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Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2002020830A3 (en) * | 2000-09-07 | 2002-07-25 | Bayer Ag | Test systems based on transmembrane receptors from helminths and the use thereof for identifying and characterizing compounds |
-
1997
- 1997-02-04 DE DE19704024A patent/DE19704024A1/en not_active Withdrawn
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| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2002020830A3 (en) * | 2000-09-07 | 2002-07-25 | Bayer Ag | Test systems based on transmembrane receptors from helminths and the use thereof for identifying and characterizing compounds |
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| 8127 | New person/name/address of the applicant |
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