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JP2002537808A - Tumor-associated antigen - Google Patents

Tumor-associated antigen

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Publication number
JP2002537808A
JP2002537808A JP2000602769A JP2000602769A JP2002537808A JP 2002537808 A JP2002537808 A JP 2002537808A JP 2000602769 A JP2000602769 A JP 2000602769A JP 2000602769 A JP2000602769 A JP 2000602769A JP 2002537808 A JP2002537808 A JP 2002537808A
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JP
Japan
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peptide
tumor
seq
sequence
dna molecule
Prior art date
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Pending
Application number
JP2000602769A
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Japanese (ja)
Inventor
クリシュトフ エステー クラーデ
ギュンター アドルフ
ヴォルフガング ゾンマーグルーバー
カール−ハインツ ハイダー
Original Assignee
ベーリンガー インゲルハイム インターナショナル ゲゼルシャフト ミット ベシュレンクテル ハフツング
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
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Publication date
Application filed by ベーリンガー インゲルハイム インターナショナル ゲゼルシャフト ミット ベシュレンクテル ハフツング filed Critical ベーリンガー インゲルハイム インターナショナル ゲゼルシャフト ミット ベシュレンクテル ハフツング
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Abstract

(57)【要約】 腫瘍関連抗原、それに由来する免疫原性ペプチドおよびそれらをコードするDNA分子および、それらの癌免疫療法における使用。   (57) [Summary] Tumor associated antigens, immunogenic peptides derived therefrom and DNA molecules encoding them and their use in cancer immunotherapy.

Description

【発明の詳細な説明】DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION

【0001】 本発明は腫瘍疾患の免疫療法に関する。 免疫系は身体を種々の微生物から保護し、それらの微生物と積極的に戦う働き
を有する。無傷の免疫系の有用性は先天的または後天的免疫不全の場合に特に明
瞭である。予防ワクチンプログラムの使用は多くの症例で、ウイルスまたはバク
テリア感染疾病における極めて効果的かつ有効な免疫学的介入であることが証明
された。免疫系が腫瘍細胞の排除において広範囲に関与していることも見出され
ている。免疫系の構成成分による腫瘍関連抗原(TAA)の認識は重要な役割を果た
す。最も広義には、腫瘍細胞のいかなる(ペプチド性または非ペプチド性)成分
も免疫系の要素に認識され、免疫応答を刺激することとなり、免疫原性腫瘍抗原
として働き得る。免疫学的反応を引き起こすだけでなく腫瘍の拒絶も生じさせる
腫瘍抗原は特に重要である。この種の免疫学的反応を引き起こすことのできる特
異的抗原を同定することは分子的に明らかにされた腫瘍ワクチンの開発において
主要な工程を構成する。
The present invention relates to immunotherapy of tumor diseases. The immune system protects the body from various microorganisms and has the function of actively fighting those microorganisms. The utility of the intact immune system is particularly evident in cases of innate or acquired immunodeficiency. The use of prophylactic vaccine programs has proven in many cases to be a very effective and effective immunological intervention in viral or bacterial infectious diseases. It has also been found that the immune system is involved extensively in eliminating tumor cells. Recognition of tumor-associated antigens (TAAs) by components of the immune system plays an important role. In the broadest sense, any (peptidic or non-peptidic) component of a tumor cell will be recognized by a component of the immune system and will stimulate an immune response and may serve as an immunogenic tumor antigen. Of particular interest are tumor antigens that not only cause an immunological reaction but also cause tumor rejection. Identifying specific antigens capable of eliciting this type of immunological response constitutes a major step in the development of molecularly defined tumor vaccines.

【0002】 免疫系のどの要素が腫瘍の拒絶に関与するかは未だ明確ではないが、しかしな
がら、CD-8発現細胞障害性T細胞(CTL)が主要な役割を果たすということは一致し
た意見である(Coulie, 1997)。特に、(メラノーマおよび腎臓癌のような)比
較的高度の自発的緩解率を有するタイプの腫瘍においては、臨床的進行度とCD8+ −およびCD4+−T細胞の出現増加との間に相関が見いだされている(Schendelら、
1993;Mackensenら、1993;Hallidayら、1995;Kawakamiら、1995;Kawakamiら
、1996;Wang、1997;CelluzziとFalo、1998)。特異的CTLクローンは腫瘍浸潤性
リンパ細胞(TIL)または末梢血単球細胞(PBMC)から一般には自家腫瘍細胞との
共培養およびin vitroサイトカイン刺激後に得ることができる。動物モデルおよ
びin vitroヒト細胞培養系の何れにおいても腫瘍細胞に対するT細胞応答は腫瘍
細胞をサイトカインでトランスフェクションすることにより増大した(van Elsas
ら、1997;Gansbacherら、1990;Tepperら、1989;Fearonら、1990;Dranoffら
、1993)。
[0002] It is not yet clear which elements of the immune system are involved in tumor rejection, however, it is agreed that CD-8 expressing cytotoxic T cells (CTLs) play a major role. (Coulie, 1997). In particular, in tumor types with relatively high spontaneous remission rates (such as melanoma and kidney cancer), there is a correlation between clinical progression and increased appearance of CD8 + and CD4 + -T cells. (Schendel et al.,
1993; Mackensen et al., 1993; Halliday et al., 1995; Kawakami et al., 1995; Kawakami et al., 1996; Wang, 1997; Celluzzi and Falo, 1998). Specific CTL clones can be obtained from tumor infiltrating lymphocytes (TIL) or peripheral blood monocytic cells (PBMC), generally after co-culture with autologous tumor cells and in vitro cytokine stimulation. In both animal models and in vitro human cell culture systems, T cell responses to tumor cells were enhanced by transfecting tumor cells with cytokines (van Elsas
Gansbacher et al., 1990; Tepper et al., 1989; Fearon et al., 1990; Dranoff et al., 1993).

【0003】 緩解性とCD8+−T細胞との相関という観点から、CD8陽性CTLによって認識され
る腫瘍関連抗原(TAA)の同定は腫瘍ワクチンの開発へ向けての具体的な第1の目
標である(Pardoll、1998;RobbinsとKawakami、1996)。例えばCD4+−Tヘルパー
細胞のような免疫系の他の型の細胞が重要な役割を果たすかどうかは未だ明確で
ない;メラノーマ患者におけるMAGE-3/HLA-A1ペプチドに関する多数の研究がこ
のことを示した(Marchandら、1995;Boonら、1998)。近年、CTLによって認識
される多数のTAAが同定されている(Boonら、1994;van den Eydeとvan der Bru
ggen, 1997)。
[0003] In view of the correlation between remission and CD8 + -T cells, identification of a tumor-associated antigen (TAA) recognized by CD8-positive CTL is a specific first goal toward the development of a tumor vaccine. Yes (Pardoll, 1998; Robbins and Kawakami, 1996). It is not yet clear whether other types of cells of the immune system, such as CD4 + -T helper cells, play an important role; numerous studies on the MAGE-3 / HLA-A1 peptide in melanoma patients have made this clear. (Marchand et al., 1995; Boon et al., 1998). Recently, a number of TAAs recognized by CTL have been identified (Boon et al., 1994; van den Eyde and van der Bru).
ggen, 1997).

【0004】 T細胞は抗原を細胞表面のMHC分子(主要組織適合性複合体、ヒトではHLA=ヒ
ト白血球抗原(human leukocyte antigen)上に提示されたペプチド断片として認
識する。2つの型のMHC分子がある:MHC-I分子は核を有する大部分の細胞に見出
され、内在性タンパク質のタンパク質分解性の分解(いわゆる抗原プロセッシン
グ)によって生成されるペプチド(通常8〜10mer)を提示する。ペプチド:MHC
-I複合体はCD8-陽性CTLによって認識される。MCH-II分子はいわゆる「専門的抗
原提示細胞(APC)」上にのみ見出され、エンドサイトーシスの過程でAPCによって
吸収されプロセッシングされた外来性タンパク質のペプチドを提示する。ペプチ
ド:MHC-II複合体はCD4-ヘルパーT細胞によって認識される。T細胞レセプターと
ペプチド:MHC複合体との相互作用により、種々のエファクター機構が引き起こ
されることがあり、CTLの場合は標的細胞のアポトーシスを引き起こす。これはM
HC(例えば、移植拒絶の場合)またはペプチド(例えば、細胞内病原体の場合)
が外来性であるとして認識される場合に起こる。いずれにしろ、全ての提示され
たペプチドがT細胞との効果的相互作用のための構造的および機能的要求を満た
すわけではない(Ramenseeら、1995に記載および後述するように)。
[0004] T cells recognize antigens as cell fragments of MHC molecules (major histocompatibility complex, in humans, HLA = human leukocyte antigen), a peptide fragment presented on human leukocyte antigens. There is: MHC-I molecules are found in most nucleated cells and present peptides (usually 8-10 mer) that are produced by proteolytic degradation of endogenous proteins (so-called antigen processing). : MHC
The -I complex is recognized by CD8-positive CTL. MCH-II molecules are found only on so-called "professional antigen presenting cells (APCs)" and present peptides of exogenous proteins that have been absorbed and processed by APCs during endocytosis. The peptide: MHC-II complex is recognized by CD4-helper T cells. Interactions between the T cell receptor and the peptide: MHC complex may trigger various effector mechanisms, in the case of CTLs, causing apoptosis of target cells. This is M
HC (eg, for transplant rejection) or peptide (eg, for intracellular pathogens)
Occurs when is recognized as foreign. In any case, not all presented peptides fulfill the structural and functional requirements for effective interaction with T cells (as described and described in Ramensee et al., 1995).

【0005】 原理的には、腫瘍ワクチンにおけるTAA使用のための多数の投与方法が可能で
ある:抗原は適切なアジュバント若しくは担体系と共に組換えタンパク質として
投与するか、または、抗原をコードするプラスミド(DNAワクチン;Tigheら、199
8)若しくはウイルスベクター上(Restifo、1997)のcDNAとして与えることがで
きる。他の可能性はヒト抗原を組み換え的に発現し、それらの追加的成分の結果
としてアジュバント効果を有する組換えバクテリア(例えば、リステリア、サル
モネラ)を使用することである(Paterson、1996;Pardoll、1998)。これらの
全ての場合において、抗原はいわゆる「専門的抗原提示細胞(APC)」によってプ
ロセッシングされて提示されなければならない。他の可能性は、抗原に等価なT
細胞エピトープに対応し、外部からAPC上に装荷され(Buschleら、1997;Schmid
tら、1997)またはAPCによってMHC I分子に細胞内移送される合成ペプチド(Mel
iefら、1996)を使用することである。特定の抗原を投与する最も治療的に効果
的な方法は一般には臨床試験によって決定される。
[0005] In principle, a number of administration methods are possible for the use of TAA in tumor vaccines: the antigen is administered as a recombinant protein with a suitable adjuvant or carrier system, or a plasmid encoding the antigen ( DNA vaccine; Tighe et al., 199
8) Alternatively, it can be provided as cDNA on a viral vector (Restifo, 1997). Another possibility is to use recombinant bacteria (eg Listeria, Salmonella) that recombinantly express human antigens and have an adjuvant effect as a result of their additional components (Paterson, 1996; Pardoll, 1998). ). In all these cases, the antigen must be processed and presented by so-called "professional antigen presenting cells (APCs)". Another possibility is that the T equivalent to the antigen
Externally loaded on APCs corresponding to cellular epitopes (Buschle et al., 1997; Schmid
t et al., 1997) or a synthetic peptide (Mel) that is intracellularly transferred to MHC I molecules by APC.
ief et al., 1996). The most therapeutically effective method of administering a particular antigen will generally be determined by clinical trial.

【0006】 腫瘍特異的CTLによって認識される抗原またはそのエピトープには、いかなる
タンパク質クラス(例えば、転写因子、レセプター、酵素;総説についてはRamm
enseeら、1995;RobbinsとKawakami, 1996を参照せよ)に由来し得る分子も含ま
れる。抗体による認識の場合に必要であるようにこれらのタンパク質が細胞表面
上に局在することは必ずしも必要でない。CTLによる認識のための腫瘍特異的抗
原として働くためには、あるいは、治療に使用するためには、そのタンパク質は
ある条件を満たさなければならない;まず第一に、その抗原は腫瘍細胞によって
排他的に発現されなければならない、あるいは、いわゆる「決定的な」正常組織
においては腫瘍におけるよりも低い濃度でのみ生じなければならない。決定的な
正常組織とは必須の組織である;それらに向けられた免疫反応は重大な結果、あ
る場合には致死的な結果を引き起こすであろう。
[0006] Antigens or epitopes thereof recognized by tumor-specific CTLs include any protein class (eg, transcription factors, receptors, enzymes;
Ensee et al., 1995; see Robbins and Kawakami, 1996). It is not necessary that these proteins be located on the cell surface, as is required for recognition by antibodies. In order to serve as a tumor-specific antigen for recognition by CTLs, or to be used therapeutically, the protein must meet certain conditions; first of all, the antigen is exclusive by tumor cells Or must occur only at lower concentrations in so-called "critical" normal tissues than in tumors. Critical normal tissues are essential tissues; an immune response directed against them will have serious and in some cases lethal consequences.

【0007】 第2に、この抗原は一次腫瘍においてのみならず転移においても発現されなけ
ればならない。更に、抗原の広範な利用という観点から、幾つかのタイプの腫瘍
において高濃度で存在することが望ましい。ワクチンの効果的な成分としてのTA
Aの適切性に関する更なる前提条件はその抗原のアミノ酸配列中のT細胞エピトー
プの存在である;TAA由来のペプチドはin vitro/in vivo T細胞応答を生じさせ
る筈である(「免疫原性」ペプチド)。臨床的に広範に適用できる免疫原性ペプ
チドを選択するための別の基準は、その抗原が所定の患者集団において出現する
頻度である。 免疫原性腫瘍関連抗原(TAA)は、既にT細胞エピトープを有することが広く示さ
れているが、多数のカテゴリーに分けることができ、それらには、ウイルスタン
パク質、変異タンパク質、過剰発現タンパク質、染色体転座によって形成される
融合タンパク質、分化抗原、癌胎児性抗原(Van den EyndeとBrichard、1995;va
n den Eyndeとvan der Bruggen, 1997)が含まれる。
[0007] Second, this antigen must be expressed not only in primary tumors but also in metastases. Furthermore, in view of the widespread use of antigens, it is desirable to be present at high concentrations in some types of tumors. TA as an effective ingredient in vaccines
A further prerequisite for the suitability of A is the presence of a T cell epitope in the amino acid sequence of the antigen; peptides derived from TAA should elicit in vitro / in vivo T cell responses ("immunogenic" peptide). Another criterion for selecting a clinically broadly applicable immunogenic peptide is the frequency with which the antigen appears in a given patient population. Although immunogenic tumor-associated antigens (TAAs) have been widely shown to already have T cell epitopes, they can be divided into a number of categories, including viral proteins, mutant proteins, overexpressed proteins, chromosomes, Fusion proteins formed by translocation, differentiation antigens, carcinoembryonic antigens (Van den Eynde and Brichard, 1995; va
n den Eynde and van der Bruggen, 1997).

【0008】 腫瘍ワクチンの開発のための出発点となる、TAAを同定し解析する方法は、ひ
とつには患者において既に誘導されている(細胞性免疫応答)CTLの使用、また
は抗体(液性免疫応答)の使用に基づくか、または腫瘍組織と正常組織の間の示
差的転写プロフィールを描き出すことに基づいている。前者の例、免疫学的アプ
ローチでは、MHC-I分子によってCTLエピトープを提示する真核性腫瘍cDNA発現ラ
イブラリー(Boonら、1994)のスクリーニングに患者のCTLが使用され、一方、
高アフィニティー患者抗血清真核性cDNA発現ライブラリーを使用することによっ
て、TAAの存在は個々のプラークのイムノブロット解析によって直接に探索する
ことができる(Sahinら、1995)。CTL反応性とタンパク質−化学的プロセッシン
グの組合せは、患者CTLとの反応性によって予備選択した、腫瘍細胞のMHC-Iから
分離されるペプチドの単離を生じさせる。このペプチドはMHC-I複合体から洗い
出され、質量分光器によって同定される(Falkら、1991;Woelfelら、1994;Cox
ら、1994)。抗原の特性解析のためにCTLを使用するアプローチは、CTLの培養と
活性化を必要とするために、かなりの費用がかかり、または、必ずしも成功する
ものではない。
As a starting point for the development of tumor vaccines, methods for identifying and analyzing TAAs include, in part, the use of CTLs that have already been induced in patients (cellular immune response) or the use of antibodies (humoral immune response). Response) or drawing a differential transcription profile between tumor and normal tissue. In the former example, the immunological approach uses patient CTL to screen a eukaryotic tumor cDNA expression library (Boon et al., 1994) that presents CTL epitopes by MHC-I molecules,
By using a high affinity patient antiserum eukaryotic cDNA expression library, the presence of TAA can be probed directly by immunoblot analysis of individual plaques (Sahin et al., 1995). The combination of CTL reactivity and protein-chemical processing results in the isolation of peptides separated from MHC-I of tumor cells, pre-selected by reactivity with patient CTL. This peptide is washed out of the MHC-I complex and identified by mass spectroscopy (Falk et al., 1991; Woelfel et al., 1994; Cox
Et al., 1994). The approach of using CTLs for antigen characterization requires considerable cost or is not always successful due to the need for CTL culture and activation.

【0009】 正常組織と腫瘍組織の転写プロフィールの比較に基づくTAAの同定方法は多数
あり多様である;それらには、ディファレンシャルハイブリダイゼーション、サ
ブトラクションDNAバンクの確立(「提示的示差解析」("representational diff
erence analysis");HubankとSchatz、1994;Diatchenkoら、1996)およびDNAチ
ップ技術の使用またはSAGE法(Velculescuら199)が含まれる。患者CTLを使用する
上述した免疫学的方法と対照的に、分子生物学的方法を使用する場合は、この方
法によって発見される潜在的抗原候補が腫瘍特異的(腫瘍関連)であって、細胞
障害性T細胞応答を引き起こすことができるT細胞エピトープを確かに有するこ
とを示す必要がある。少なくとも一つの例では(NY-ESO/LAGE-1)、抗原は患者
血清およびRDA(Chenら、1997;Letheら、1998)の両方によって同定され、さらに
、この抗原のCTLエピトープおよび同時自発性液性およびT細胞応答が一人の患者
について述べられている(Jagerら、1998)。
[0009] Methods of identifying TAAs based on a comparison of the transcriptional profiles of normal and tumor tissues are numerous and diverse; including differential hybridization, establishment of subtraction DNA banks ("representational diff").
erence analysis "); Hubank and Schatz, 1994; Diatchenko et al., 1996) and the use of DNA chip technology or the SAGE method (Velculescu et al. 199). In contrast to the immunological methods described above using patient CTL, When using molecular biology methods, the potential antigen candidates discovered by this method are tumor-specific (tumor-associated) and must be used to identify T-cell epitopes that can trigger cytotoxic T-cell responses. In at least one example (NY-ESO / LAGE-1), the antigen was identified by both patient serum and RDA (Chen et al., 1997; Lethe et al., 1998) CTL epitopes and co-spontaneous humoral and T cell responses have been described for one patient (Jager et al., 1998).

【0010】 本発明の目的は、新規な腫瘍関連抗原(TAA)を提供することである。 この目的は最初に腎臓細胞癌組織と正常腎組織との間のRDA(提示的示差解析)
によるcDNAサブトラクションライブラリを樹立し、これを精巣特異的cDNAライブ
ラリーとハイブリダイズさせて腫瘍/精巣型抗原を選抜することによって達成さ
れる。得られたcDNAクローンをシーケンシングし、データバンクで入手可能な配
列と比較した。同定された遺伝子のうちデータバンク中でEST(発現配列タグ)エ
ントリーがあった29の未知の遺伝子があった。これらの遺伝子のうち、ESTが決
定的正常組織に由来しない16個を更に調べた。RT-PCRによって、調べた16個のク
ローンのうち5個は正常腎組織に比較して腎細胞癌において明瞭な過剰発現が示
された。これらのクローンの一つ(9D7)の腫瘍組織と正常組織の発現の(PCRを
用いた)定量的比較は腫瘍における9D7 cDNAの明瞭な過剰発現を示した。ノーザ
ンブロットによる発現プロフィール解析により調べた正常組織では9D7は全く、
またはわずかな転写しかないことが示された。腎細胞癌および正常腎組織の9D7
特異的標識RNAプローブによるin situハイブリダイセーションはRT-PCR、定量的
PCRおよびノーザンブロットで得られた結果を確認するものであった。
[0010] It is an object of the present invention to provide a novel tumor associated antigen (TAA). The purpose of this was to first establish an RDA between renal cell carcinoma tissue and normal kidney tissue.
By establishing a cDNA subtraction library and hybridizing it with a testis-specific cDNA library to select tumor / testis-type antigens. The resulting cDNA clones were sequenced and compared to sequences available in the databank. Of the genes identified, there were 29 unknown genes with EST (expressed sequence tag) entries in the databank. Of these genes, 16 whose ESTs were not derived from critical normal tissues were further examined. By RT-PCR, 5 of the 16 clones examined showed a clear overexpression in renal cell carcinoma compared to normal kidney tissue. Quantitative comparison (using PCR) of the expression of tumor and normal tissues in one of these clones (9D7) showed a clear overexpression of 9D7 cDNA in the tumor. In normal tissues examined by Northern blot expression profile analysis, 9D7 was completely
Or showed only slight transcription. 9D7 in renal cell carcinoma and normal kidney tissue
In situ hybridization with specific labeled RNA probe is RT-PCR, quantitative
It confirmed the results obtained by PCR and Northern blot.

【0011】 ヒト9D7 cDNAは完全にクローン化された;得られた配列を配列番号1に示した
。9D7の配列は、ヌクレオチドおよびタンパク質レベルでSM20(ラットの平滑筋
細胞において成長因子によって誘導される前初期遺伝子であり平滑大動脈筋の細
胞に特異的なマーカーとして記載されている)に高い相同性を示す(Waxら、199
4、1996)。SM20と比較したヒト9D7-cDNAの配列解析により最初の323bpは残りの
cDNAよりも有意に低い相同性を有していることが明らかにされた(導き出される
アミノ酸配列レベルで96%に対して40%)。ヒトcDNAは高相同性から低相同性へ
の遷移位置324に最初のATGを有するので、これがヒト9D7の開始コドンであると
仮定し得る。しかし、位置324の上流配列もより小さいながらも連続したリーデ
ィングフレームを有しSM20と有意な相同性を示すので(導かれるアミノ酸配列レ
ベルで40%)、更に上流に開始コドンがあるという可能性も除外できない。
The human 9D7 cDNA has been completely cloned; the resulting sequence is shown in SEQ ID NO: 1. The 9D7 sequence has high homology at the nucleotide and protein level to SM20, an immediate early gene induced by growth factors in rat smooth muscle cells and described as a marker specific for smooth aortic muscle cells. (Wax et al., 199
4, 1996). Sequence analysis of human 9D7-cDNA compared to SM20 shows the first 323 bp remaining
It was found to have significantly lower homology than cDNA (40% versus 96% at the derived amino acid sequence level). Since human cDNA has the first ATG at transition 324 from high homology to low homology, it can be assumed that this is the start codon for human 9D7. However, since the upstream sequence at position 324 also has a smaller but contiguous reading frame and shows significant homology to SM20 (40% at the derived amino acid sequence level), it is possible that there is an initiation codon further upstream. Cannot be excluded.

【0012】 更に上流に位置する配列の情報は分子生物学の標準的な方法、例えば5'-RACE
(DNA末端の迅速増幅)によって得ることができる。この方法では、RNA、好まし
くはmRNAが9D7が転写されている細胞または組織(例えばRCC組織または786-0の
ようなRCCに由来する細胞株、実施例9を参照せよ)から逆転写され、次に、既
知の配列のアダプターとライゲーションされる。アダプタープライマー(cDNAの
5'末端にあるアダプターに特異的に結合する)および9D7特異的プライマー(例
えば配列番号21、19、17、16、14、12、11、4)を用いたPCRにより対応する8D7
断片の増幅が可能となる。これらのPCR産物は実施例1に記載したような標準的
な方法によりクローン化することができ、特にDNAシーケンシングにより特徴付
けができる。
Information on sequences located further upstream can be obtained by standard methods of molecular biology, for example, 5′-RACE
(Rapid amplification of DNA ends). In this method, RNA, preferably mRNA, is reverse transcribed from the cell or tissue into which 9D7 is transcribed (eg, RCC tissue or a cell line derived from RCC such as 786-0, see Example 9), and Is ligated with an adapter of known sequence. Adapter primer (for cDNA
The corresponding 8D7 by PCR using a 5D-specific adapter and a 9D7-specific primer (eg, SEQ ID NOs: 21, 19, 17, 16, 14, 12, 11, 4).
The fragment can be amplified. These PCR products can be cloned by standard methods as described in Example 1 and can be particularly characterized by DNA sequencing.

【0013】 5'末端の特徴づけの他の方法は9D7に特異的なDNAプローブによるハイブリダイ
セーションまたは9D7に特異的な抗血清によるcDNAライブラリーのスクリーニン
グによるものである。 cDNAライブラリーのスクリーニングが、例えばRNAの顕著な2次構造のための
効率の良くない逆転写のようなこの手順の限界のために所望の結果を達成しない
場合は、例えば、cDNAライブラリーのスクリーニングにおけるように、9D7に特
異的なDNAプローブとハイブリダイズさせることによりゲノムライブラリーを調
べ、得られたcDNAの5'末端の上流に位置する配列(例えば9D7のプロモーター領
域)の情報を含むクローンを単離することもできる。
Other methods of characterizing the 5 'end are by hybridization with a DNA probe specific for 9D7 or screening a cDNA library with an antiserum specific for 9D7. If screening of the cDNA library does not achieve the desired result due to limitations of this procedure, such as inefficient reverse transcription due to the significant secondary structure of the RNA, for example, screening of the cDNA library As described in the above, a genomic library is examined by hybridizing with a DNA probe specific to 9D7, and a clone containing information on the sequence located upstream of the 5 ′ end of the obtained cDNA (for example, the promoter region of 9D7) is obtained. It can also be isolated.

【0014】 この単離cDNAは、9D7と名付けた配列番号2に記載のアミノ酸配列を有する腫
瘍関連抗原(TAA)をコードする。この配列は単離9D7-cDNAの位置324の開始コドン
によって規定されている。 第1の特徴により、本発明は配列番号2に記載したアミノ酸配列を有する9D7
と命名された腫瘍関連抗原に関する。 9D7誘導体が腫瘍ワクチンにおける使用のために所望の免疫原性特性を有する
のであれば、配列番号2に示したアミノ酸配列はいくらかの変異、例えばアミノ
酸の保存的交換によるものを含んでもよい。 他の側面によれば、本発明は9D7配列を部分配列として含むポリペプチドに関
する。配列番号2に示した9D7配列と比較して、このポリペプチドはN末端に伸長
部を有する;その配列は9D7-cDNAの開始コドンによって規定されるが、開始コド
ンは場合により位置324の5'方向上流に位置するかもしれない。
[0014] The isolated cDNA encodes a tumor-associated antigen (TAA) having the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 2, designated 9D7. This sequence is defined by the start codon at position 324 of the isolated 9D7-cDNA. According to a first feature, the present invention provides a 9D7 having the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 2.
Tumor-associated antigen designated as If the 9D7 derivative has the desired immunogenic properties for use in a tumor vaccine, the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2 may contain some mutations, for example, by conservative amino acid exchange. According to another aspect, the present invention relates to a polypeptide comprising the 9D7 sequence as a partial sequence. As compared to the 9D7 sequence shown in SEQ ID NO: 2, this polypeptide has an extension at the N-terminus; the sequence is defined by the start codon of the 9D7-cDNA, which is optionally 5 'of position 324. May be located upstream.

【0015】 このアミノ酸配列(またはこれに対応する9D7-cDNAの配列)は場合により9D7
CTLエピトープ中の個々のアミノ酸を置換することにより改変することができ、
天然の9D7 CTLエピトープと比較してMHC-I分子に対する9D7ペプチドの親和性の
増加を達成し、それにより、増加した免疫原性を生じさせ、最後に腫瘍に対する
より大きな反応性を生じさせることができる。9D7エピトープ領域における改変
は9D7タンパク質全体において行なってもよく(これはAPCによりプロセッシング
されて対応するペプチドを形成する)、あるいは、大きな9D7タンパク質断片ま
たは9D7ペプチドに対して行なってもよい(以下を参照せよ)。
The amino acid sequence (or the corresponding 9D7-cDNA sequence) may optionally include 9D7
Can be modified by replacing individual amino acids in the CTL epitope,
Achieving increased affinity of the 9D7 peptide for MHC-I molecules compared to the native 9D7 CTL epitope, thereby resulting in increased immunogenicity and ultimately greater reactivity against tumors it can. Modifications in the 9D7 epitope region may be made in the entire 9D7 protein (which is processed by APC to form the corresponding peptide), or may be made to large 9D7 protein fragments or peptides (see below). Let's do it.

【0016】 他の側面によれば、本発明は9D7に由来する免疫原性断片およびペプチドに関
する。後者は以下では9D7ペプチドと称する。最初のグループは液性免疫応答を
起動する(抗体の誘導)9D7ペプチドである。そのようなペプチドは、例えば表
面可能性ブロット(Eminiら、1985)、疎水性ブロット(KyteとDoolittle、1982
)および抗原性インデックス(JamesonとWolf、1988)のようないわゆる予測ア
ルゴリズムによって決定できる9D7の選択した部分(少なくとも12〜15アミノ酸
)である。 9D7ペプチドは直接投与、あるいは改変された形で(例えばKLH=キーホールリ
ンペットヘモシアニンに結合して)投与され、抗体の形成は通常の免疫学的アッ
セイ、例えばELISAによって決定される。
According to another aspect, the invention relates to immunogenic fragments and peptides derived from 9D7. The latter is referred to below as the 9D7 peptide. The first group is the 9D7 peptides that trigger a humoral immune response (induction of antibodies). Such peptides are described, for example, in surface potential blots (Emini et al., 1985), hydrophobic blots (Kyte and Doolittle, 1982).
) And a selected portion of 9D7 (at least 12-15 amino acids) that can be determined by so-called prediction algorithms such as the antigenic index (Jameson and Wolf, 1988). The 9D7 peptide is administered directly or in a modified form (eg, KLH = keyhole limpet hemocyanin) and antibody formation is determined by conventional immunological assays, eg, ELISA.

【0017】 本発明の範囲内において、好ましい他の9D7ペプチドはMHC分子によって提示さ
れ、細胞性免疫応答を生み出すものである。2つの型のMHC分子、すなわちCD8陽
性CTLによって認識されるMHC-I分子およびCD4陽性Tヘルパー細胞によって認識さ
れるMHC-II分子がある。 ペプチドが細胞性免疫応答を起動するためには、そのペプチドはMHC分子に結
合しなければならず、一方問題とする分子はそのレパトワールの中になければな
らない。従って、患者のMHC-サブタイプを決定することは、細胞性免疫応答の起
動という観点から、その患者におけるペプチドの効果的な使用のために最も重要
な欠くことのできないことの一つを構成する。 治療的に使用されるペプチドの配列は、アンカーアミノ酸および長さの観点か
ら問題としているMHC-分子によって決定される。明らかにしたアンカー位置と長
さは、問題にしている患者のMHC-分子のペプチド結合溝にそのペプチドが適合す
ることを保証する。この結果は、免疫系が刺激され、腫瘍抗原に由来するペプチ
ドが使用された場合は、患者の腫瘍細胞に対して向けられた細胞性免疫反応が生
成されるというものである。
Within the scope of the present invention, other preferred 9D7 peptides are those that are presented by MHC molecules and generate a cellular immune response. There are two types of MHC molecules, MHC-I molecules recognized by CD8-positive CTLs and MHC-II molecules recognized by CD4-positive T helper cells. For a peptide to elicit a cellular immune response, the peptide must bind to an MHC molecule, while the molecule in question must be in its repertoire. Thus, determining the MHC-subtype of a patient constitutes one of the most important and essential for the effective use of the peptide in that patient in terms of eliciting a cellular immune response . The sequence of the peptide used therapeutically is determined by the MHC-molecule in question in terms of anchor amino acids and length. The defined anchor position and length ensure that the peptide fits into the peptide binding groove of the MHC-molecule of the patient in question. The result is that if the immune system is stimulated and peptides derived from tumor antigens are used, a cellular immune response directed against the patient's tumor cells will be generated.

【0018】 免疫原性9D7ペプチドは既知の方法によって同定してよい;基本的条件の一つ
はMHC-結合性とCTL-誘導性の間の相関である。 従って、免疫原性ペプチドの配列はそのペプチド結合モチーフに基づいて予測
することができるため、CTLエピトープを構成する9D7ペプチドを同定することが
でき、9D7タンパク質配列に基づいて合成することができる。これを行なうため
の種々の方法が利用でき、それらは既知のタンパク質抗原のCTLエピトープを同
定するために使用される方法である;例えば、ヒトパピローマウイルスにおける
T細胞エピトープを同定するためにStaussら、1992によって記載された方法。 MHC分子に結合し、提示されるペプチドに関する各MHC-Iアレル産物のアレル特
異的要求はモチーフとして集められている(例えば、Falkら、1991)。これまで
に、多数のMHCペプチドモチーフおよびMHCリガンドが両方とも知られるようにな
った。本発明の範囲内にある、特定のMHC-I分子に適合する既知のタンパク質の
エピトープを捜すための適切な方法はRammenseeら、1995の総説によって記載さ
れている。この方法は以下の工程を含む:第1に、アンカーモチーフに対応する
断片についてタンパク質配列が検索され、一方、ペプチド長およびアンカー占有
についてはある種の変動が可能である。例えば、モチーフが末端にIleまたはLeu
を有する9merを指定している場合、対応するC末端を有する10merも考慮するこ
とができ、ValまたはMetのような他の脂肪族残基を有するペプチドも考慮するこ
とができる。
[0018] Immunogenic 9D7 peptides may be identified by known methods; one of the basic conditions is a correlation between MHC-binding and CTL-inducibility. Therefore, since the sequence of the immunogenic peptide can be predicted based on the peptide binding motif, the 9D7 peptide constituting the CTL epitope can be identified, and can be synthesized based on the 9D7 protein sequence. A variety of methods are available for doing this, which are the methods used to identify CTL epitopes of known protein antigens; for example, in human papillomavirus
The method described by Stauss et al., 1992 for identifying T cell epitopes. Allele-specific requirements of each MHC-I allele product for peptides that bind to and display MHC molecules have been collected as motifs (eg, Falk et al., 1991). To date, a number of MHC peptide motifs and MHC ligands have both become known. Suitable methods for searching for epitopes of known proteins that fit within a particular MHC-I molecule, within the scope of the present invention, are described by the review of Rammensee et al., 1995. The method includes the following steps: First, the protein sequence is searched for fragments corresponding to the anchor motif, while certain variations in peptide length and anchor occupancy are possible. For example, the motif ends with Ile or Leu
If a 9-mer with a is designated, a 10-mer with the corresponding C-terminus can also be considered, as well as peptides with other aliphatic residues such as Val or Met.

【0019】 このようにして、多数のペプチド候補が得られる。これらは既知のリガンドと
共通する可能な限り多数のアンカーグループの存在に関して検索され、および/
または、それらが種々のMHC分子に対して「好ましい」残基を有しているか否か
が(Rammenseeら、1995の表に従って)検索される。弱く結合するペプチドを排
除するために、好ましくは結合アッセイが行なわれる。特定のMHC分子に対する
ペプチド結合に対する要求が既知であれば、ペプチド候補は結合に負の影響また
は正の影響を有する非アンカー残基について検索され、または、そもそも結合を
可能にするかどうかについて検索される(Ruppertら、1993)。しかしながら、
この方法では、ペプチド結合モチーフは天然のリガンドを捜す場合の唯一の決定
因子ではないことを心に止めておかなければならない;他の側面、例えば抗原プ
ロセッシングの過程での酵素特異性もMHC結合性の特異性に加えてリガンドの同
定に寄与する。これらの側面を考慮し、本発明の範囲内の免疫原性9D7ペプチド
を同定するために適した一つの方法は、特にKawakamiら、1995において既知のHL
A-A*0101モチーフに基づいてgp100エピトープを同定するために使用された。
In this way, a large number of peptide candidates are obtained. These are searched for the presence of as many anchor groups as possible in common with known ligands, and / or
Alternatively, it is searched (according to the table of Rammensee et al., 1995) whether they have "preferred" residues for the various MHC molecules. A binding assay is preferably performed to eliminate weakly binding peptides. If the requirements for peptide binding to a particular MHC molecule are known, candidate peptides are searched for non-anchor residues that have a negative or positive effect on binding, or whether they allow binding in the first place. (Ruppert et al., 1993). However,
In this method, it must be kept in mind that the peptide binding motif is not the only determinant when searching for a natural ligand; other aspects, such as enzyme specificity during antigen processing and MHC binding Contributes to the identification of ligands in addition to the specificity of Given these aspects, one suitable method for identifying immunogenic 9D7 peptides within the scope of the present invention is the HL method known in Kawakami et al., 1995, among others.
It was used to identify the gp100 epitope based on the AA * 0101 motif.

【0020】 ペプチドはまたMCH-II分子への結合能について選択してもよい。 9アミノ酸を超えるMHC-II結合モチーフはMHC-I結合モチーフよりもアンカー
位置についてより高度の縮退度を有する。MHC-II結合モチーフの正確な解析を可
能とするMHC-II分子のX線構造解析およびそれに基づいたペプチド配列中の変動
に基づく方法が近年開発されている(Rammenseeら、1995、およびそれに引用さ
れた原論文)。MHC-II分子に結合するペプチドは典型的には樹状細胞、マクロフ
ァージまたはB細胞によってCD4-T細胞に提示される。CD4-T細胞は、次に例えば
サイトカインの放出によって次々とCTLを直接的に活性化し、APC(樹状細胞、マ
クロファージおよびB細胞)による抗原提示の効率を増大させる。
[0020] The peptides may also be selected for their ability to bind to the MCH-II molecule. MHC-II binding motifs greater than 9 amino acids have a higher degree of degeneracy at the anchor position than MHC-I binding motifs. X-ray structural analysis of MHC-II molecules and methods based on variations in peptide sequences based thereon have been recently developed that allow accurate analysis of MHC-II binding motifs (Rammensee et al., 1995, and cited therein). Original paper). Peptides that bind to MHC-II molecules are typically presented to CD4-T cells by dendritic cells, macrophages or B cells. CD4-T cells then in turn activate CTLs directly, for example by the release of cytokines, increasing the efficiency of antigen presentation by APCs (dendritic cells, macrophages and B cells).

【0021】 最近、データバンクおよび特定のMHC分子に結合するペプチドエピトープのよ
り信頼性のある予測を可能とする予測アルゴリズムが得られるようになった。 本発明の範囲内において、Parkerら、1994によって記載されたアルゴリズムを
用いて、最も重要なHLA-型、特にHAL-A1、-A*0201、-A3、-B7、-B14および-B*44
03に対する候補ペプチドが得られ、これらは対応するHLA分子に結合することが
期待され、従って、免疫原性CTL-エピトープを構成することが期待される;発見
されたペプチドは表3に列挙されている。同様に、ペプチドの種々の特徴(疎水
性、電荷、大きさ)、または、HLA分子の3D構造のようなペプチドに対する要求
を考慮した他のアルゴリズムを用いることによって、おそらく、他のHLA型に対
する潜在的ペプチドエピトープを発見することが可能である。
[0021] Recently, prediction algorithms have become available that allow more reliable prediction of peptide epitopes binding to databanks and specific MHC molecules. Within the scope of the present invention, using the algorithm described by Parker et al., 1994, the most important HLA-types, especially HAL-A1, -A * 0201, -A3, -B7, -B14 and -B * 44
Candidate peptides for 03 were obtained, which are expected to bind to the corresponding HLA molecule and thus are expected to constitute an immunogenic CTL-epitope; the peptides found are listed in Table 3. I have. Similarly, by using other algorithms that take into account the peptide's various characteristics (hydrophobicity, charge, size), or the requirements for the peptide, such as the 3D structure of the HLA molecule, the potential for other HLA types is probably It is possible to discover specific peptide epitopes.

【0022】 記載した方法によって9D7ペプチド候補を選択した後は、そのMHC結合性がペプ
チド結合アッセイによってテストされる。第1に、良好な結合特性を有するペプ
チドの免疫原性が決定される(ペプチド−MHC相互作用の安定性は多くの場合免
疫原性と相関する;van der Burgら、1996)。選択したペプチドまたはペプチド
等価物の免疫原性を決定するために、記載されたような方法、例えば、Sette、1
994らによって記載された方法を定量的MHC結合アッセイと組み合せて使用するこ
とができる。あるいは、選択したペプチドの免疫原性は既知の方法を用いたin v
itro CTL誘導によってテストしてよい(ex vivo CTL誘導について以下に記載した
ように)。いくつかの工程で行われる、細胞性免疫応答を起動することのできる
ペプチドを選択する方法の原理がWO 97/30721に記載されている。この文献の内
容は引用により本明細書に含まれるものとする。本発明の範囲内にある効率的な
免疫原性ペプチドを得るための一般的なストラテジーはSchweighoffer,1997によ
っても記載されている。
After selecting a candidate 9D7 peptide by the described method, its MHC binding is tested by a peptide binding assay. First, the immunogenicity of peptides with good binding properties is determined (stability of peptide-MHC interactions often correlates with immunogenicity; van der Burg et al., 1996). To determine the immunogenicity of the selected peptide or peptide equivalent, methods as described, e.g., Sette, 1
The method described by 994 et al. Can be used in combination with a quantitative MHC binding assay. Alternatively, the immunogenicity of the selected peptide can be determined in vivo using known methods.
It may be tested by itro CTL induction (as described below for ex vivo CTL induction). The principle of a method of selecting a peptide capable of eliciting a cellular immune response in several steps is described in WO 97/30721. The contents of this document are incorporated herein by reference. A general strategy for obtaining efficient immunogenic peptides within the scope of the present invention is also described by Schweighoffer, 1997.

【0023】 MHC-IまたはMHC-II分子の結合溝に適合する元々のペプチド、すなわち、未改
変9D7に由来するペプチドを使用する代わりに、元のペプチド配列に基づいて特
定されるアンカー位置および長さに関する最小限の要求に従って、変異を行なっ
てもよい。ただし、それらの変異が、MHC分子への結合アフィニティーによって
形成されるペプチドの効果的な免疫原性およびT細胞レセプター活性化能力を損
なわないだけでなく好ましくはそれを増強することを条件とする。 この場合、MHC分子への結合能に関する要求に合致するように設計された人工
的ペプチドまたはペプチド等価物が使用される。
Instead of using the original peptide that fits into the binding groove of the MHC-I or MHC-II molecule, ie a peptide derived from unmodified 9D7, the anchor position and length specified based on the original peptide sequence Mutations may be made according to the minimum requirements of the present invention. Provided that these mutations not only impair, but preferably enhance, the effective immunogenicity and T cell receptor activating capacity of the peptide formed by the binding affinity to the MHC molecule. In this case, an artificial peptide or peptide equivalent designed to meet the requirements for the ability to bind to the MHC molecule is used.

【0024】 このようにして改変したペプチドは「ヘテロクリティックペプチド」と称され
る。それらは以下の方法によって得ることができる: まず最初に、例えば、Rammenseeら、1995によって記載された原理を用いてMHC
-IまたはMHC-IIリガンドのエピトープまたはそれらの変異体を得る。このペプチ
ドの長さは、それがMHC-I分子に適合すべきであるならば、好ましくは必要なア
ンカーアミノ酸を有する8〜10個のアミノ酸という最小配列に対応するものであ
る。 所望であれば、ペプチドはC末端および/またはN末端において伸長させてもよ
いが、但しその伸長がMHC分子への結合能に影響せず、伸長させたペプチドが最
小配列へ細胞プロセッシングを受け得ることを条件とする。 次に改変ペプチドは、Parkhurstら、1996およびBeckerら、1997に記載された
ように、TIL(腫瘍浸潤性リンパ細胞) による認識、CTL誘導および増加したMHC結
合性および免疫原性について調べられる。
The peptides modified in this way are called “heteroclitic peptides”. They can be obtained by the following methods: First, for example, use MHC using the principles described by Rammensee et al., 1995.
Obtaining epitopes of -I or MHC-II ligands or variants thereof. The length of this peptide, if it should be compatible with the MHC-I molecule, preferably corresponds to a minimum sequence of 8 to 10 amino acids with the necessary anchor amino acids. If desired, the peptide may be extended at the C-terminus and / or N-terminus, provided that the extension does not affect the ability to bind to the MHC molecule and that the extended peptide may undergo cellular processing to a minimal sequence. It is a condition. The modified peptides are then examined for recognition by TIL (tumor infiltrating lymphocytes), CTL induction and increased MHC binding and immunogenicity as described in Parkhurst et al., 1996 and Becker et al., 1997.

【0025】 本発明の目的に適した天然の9D7ペプチドの免疫原性よりも大きな免疫原性を
有するペプチドを見出す他の方法は、Blakeら、1996に記載されているように、
天然に腫瘍上に見出される9D7ペプチドを認識するCTLでペプチドライブラリーを
スクリーニングすることを基礎とする;これとの関係で、MHC-I拘束CTLによって
認識される腫瘍エピトープを模倣する分子を設計するためにコンビナトリアルペ
プチドライブラリーを使用することが推奨される。 本発明による9D7ペプチドまたは免疫原性断片またはそれらに由来するペプチ
ドはWO 96/10413に記載されたように組換え的に作成してもよく、ペプチド合成
によって産生してもよい。この文献の開示は引用により本明細書に含まれるもの
とする。組換え産生のために、対応するDNA分子が標準的な方法で発現ベクター
に挿入され、適切な宿主細胞にトランスフェクションされ、この宿主が適切な発
現条件下で培養され、タンパク質が精製される。慣習的な方法、例えば商業的に
入手可能な自動ペプチド合成機を9D7ペプチドの化学合成に使用してよい。
Another method for finding peptides having greater immunogenicity than the native 9D7 peptide suitable for the purposes of the present invention is as described in Blake et al., 1996.
Based on screening peptide libraries with CTLs that recognize the 9D7 peptide found naturally on tumors; in this context, designing molecules that mimic tumor epitopes recognized by MHC-I restricted CTLs It is recommended to use a combinatorial peptide library for this. 9D7 peptides or immunogenic fragments or peptides derived therefrom according to the invention may be produced recombinantly as described in WO 96/10413 or may be produced by peptide synthesis. The disclosure of this document is incorporated herein by reference. For recombinant production, the corresponding DNA molecule is inserted into an expression vector by standard methods, transfected into a suitable host cell, the host is cultured under appropriate expression conditions, and the protein is purified. Routine methods may be used for chemical synthesis of the 9D7 peptide, for example, a commercially available automated peptide synthesizer.

【0026】 天然の9D7ペプチドまたはヘテロクリティックペプチドの代わりにその様なペ
プチドを模倣する物質、例えば、「ペプチド疑似物」または「レトロインバース
ペプチド」を使用することもできる。腫瘍ワクチンにおける治療的用途という観
点からこれらの分子をテストするために、天然の9D7ペプチドまたは9D7ペプチド
等価物について上述したのと同じ方法を使用することができる。 本発明の9D7と命名されたTAAおよび、それに由来するタンパク質断片、ペプチ
ドまたはペプチド等価物またはペプチド疑似物は癌治療、例えば、対応する抗原
決定基を発現する腫瘍細胞に対する免疫応答を誘導するために使用することがで
きる。これらは強い9D7発現のある腫瘍、特に腎臓細胞癌、肺癌および乳癌、お
よびホジキンリンパ腫における発現のある腫瘍の治療に使用されることが好まし
い。 CTL誘導という形の免疫応答はin vivoまたはex vivoで達成することができる
In place of the natural 9D7 peptide or heteroclitic peptide, substances that mimic such a peptide, such as “peptide mimetics” or “retroinverse peptides” can also be used. To test these molecules in terms of therapeutic use in tumor vaccines, the same methods described above for native 9D7 peptides or 9D7 peptide equivalents can be used. TAA designated 9D7 of the present invention and protein fragments, peptides or peptide equivalents or peptide mimetics derived therefrom are useful for cancer therapy, e.g., to induce an immune response against tumor cells expressing the corresponding antigenic determinant. Can be used. They are preferably used to treat tumors with strong 9D7 expression, especially tumors with expression in renal cell carcinoma, lung and breast cancer, and Hodgkin's lymphoma. An immune response in the form of CTL induction can be achieved in vivo or ex vivo.

【0027】 in vivoでCTLを誘導するために、TAA 9D7またはそれに由来する断片若しくは
ペプチドを活性成分として含む医薬組成物がそのTAAと関連した癌性疾病に苦し
む患者に投与されるが、TAA(ペプチド)の量は抗原保持腫瘍に対する効果的なC
TL応答を得るために充分でなければならない。 従って、別の側面によれば、本発明は非経口投与、局所的投与、経口投与また
は部分投与のための医薬組成物に関する。好ましくは、本組成物は非経口的に使
用され、例えば皮下、皮内または筋肉内適用のために使用される。9D7-TAA/ペ
プチドは医薬的に許容できる担体、好ましくは水性担体に溶解又は懸濁される。
この組成物はバッファー等の慣用されるアジュバントを含んでいてもよい。TAA
/ペプチドはそれ単独でまたはアジュバント、例えば、フロイントの不完全アジ
ュバント、サポニン、アルミニウム塩、あるいは、好ましい実施態様ではポリア
ルギニンまたはポリリジンのようなポリカチオンと組み合せて使用してよい。こ
のペプチドはCTL誘導またはCTL活性化を助ける成分、例えばTヘルパーペプチド
、脂質若しくはリポソームに結合させてもよく、これらの物質および/または免
疫刺激物質、例えばサイトカイン(IL-2、IFN-γ)とともに投与してもよい。本
発明の医薬組成物の調製および投与のための適切な方法はWO 95/04542およびWO
97/30721に記載されており、これらの開示は本明細書に含まれるものとする。
In order to induce CTL in vivo, a pharmaceutical composition comprising TAA 9D7 or a fragment or peptide derived therefrom as an active ingredient is administered to a patient suffering from a cancerous disease associated with the TAA. Peptide) is effective C for antigen-bearing tumors
Must be sufficient to get a TL response. Thus, according to another aspect, the present invention relates to a pharmaceutical composition for parenteral, topical, oral or partial administration. Preferably, the compositions are used parenterally, for example for subcutaneous, intradermal or intramuscular applications. 9D7-TAA / peptide is dissolved or suspended in a pharmaceutically acceptable carrier, preferably an aqueous carrier.
The composition may include a conventional adjuvant such as a buffer. TAA
The / peptide may be used alone or in combination with an adjuvant, eg, Freund's incomplete adjuvant, saponin, aluminum salt, or in a preferred embodiment a polycation such as polyarginine or polylysine. The peptide may be bound to a component that aids in CTL induction or CTL activation, such as a T helper peptide, lipid or liposome, and may be combined with these substances and / or immunostimulatory substances, such as cytokines (IL-2, IFN-γ). It may be administered. Suitable methods for the preparation and administration of the pharmaceutical compositions of the invention are described in WO 95/04542 and WO
97/30721, the disclosures of which are incorporated herein.

【0028】 9D7(断片)または9D7ペプチドはex vivoでCTL応答を起動するために使用して
もよい。9D7を発現する腫瘍に対するex vivo CTL応答はCTL前駆細胞をAPCおよび
9D7ペプチドまたは9D7タンパク質と共にインキュベーションすることによって誘
導される。活性化されたCTLは次に増殖させられ、その後患者に再投与される。
あるいは、APCに9D7ペプチドを装荷してもよい。それにより、9D7陽性腫瘍に対
する細胞性免疫応答の効率的な活性化が起こり得る(Mayordomoら、1995;Zitvo
gelら、1996)。細胞上、例えば樹上細胞上へのペプチド装荷の適切な方法の一
つはWO 97/19169に記載されている。 本発明の一つの実施態様においては、異なるいくつかの9D7ペプチドまたは9D7
ペプチド等価物の組み合わせが使用される。他の実施態様では、9D7ペプチド他
のTAAに由来するペプチドと合わされる。その様な組み合わせのためのペプチド
の選択は、種々の異なる腫瘍抗原由来のペプチドを合わせることにより、最も広
範囲の患者集団をカバーするために種々のMHC型を検出するという観点から行わ
れ、および/または可能な最も広範な症例スペクトルを目的として行われる。医
薬組成物中のペプチドの数は広範囲に変動し得るものであるが、典型的には臨床
的に有用なワクチンは1〜15好ましくは3〜10の異なるペプチドを含む。
[0028] 9D7 (fragments) or 9D7 peptides may be used to trigger a CTL response ex vivo. Ex vivo CTL responses to tumors expressing 9D7 show that CTL precursors
Induced by incubation with 9D7 peptide or 9D7 protein. The activated CTL are then expanded and subsequently re-administered to the patient.
Alternatively, the APC may be loaded with the 9D7 peptide. This can result in efficient activation of the cellular immune response against 9D7-positive tumors (Mayordomo et al., 1995; Zitvo
gel et al., 1996). One suitable method for loading peptides on cells, for example on dendritic cells, is described in WO 97/19169. In one embodiment of the invention, several different 9D7 peptides or 9D7
A combination of peptide equivalents is used. In another embodiment, the 9D7 peptide is combined with other TAA-derived peptides. The selection of peptides for such combinations is made in terms of detecting different MHC types to cover the broadest patient population by combining peptides from different tumor antigens, and / or Or for the broadest possible spectrum of cases. While the number of peptides in a pharmaceutical composition can vary widely, typically a clinically useful vaccine will contain from 1 to 15, preferably from 3 to 10, different peptides.

【0029】 本発明によるペプチドはまた診断試薬として使用することもできる。例えば、
本ペプチドは、免疫原性ペプチドによって引き起こされる液性または細胞性免疫
応答に対する患者の応答性をテストするために使用してもよい。これは治療手順
を改善する可能性を提供するものである。例えば、TAAの投与形態(ペプチド、
全タンパク質またはDNAワクチン)に依存して、規定のペプチドエピトープに対
する反応性を示すPBL中のT細胞前駆体の増加を調べることができる(RobbinsとK
awakami、1996および、これに引用される文献)。更に、ペプチドまたは全タン
パク質またはTAAに向けられた抗体は9D7関連腫瘍に屈する患者の危険性を予測す
るため、または、9D7陽性腫瘍の進行を特性付けるために使用できる(例えば1
次腫瘍および転移の免疫化学的解析による)。この種のストラテジーは多くの場
合に成功することが証明されており、例えば乳癌における内分泌療法を行う判断
の基礎としてのエストロゲンレセプターの検出;乳癌における予後および治療過
程における関連マーカーとしてのc-erbB-2(Raviaioliら、1998;Revillionら、
1998)の検出;前立腺癌の上皮細胞に対する血清中マーカーとしてのPSMA(前立
腺特異的膜抗原)、または前立腺癌に関する免疫シンチグラフィーにおけるPSMA
に対する111In標識モノクローナル抗体の使用によるPSMAの検出(Murphyら、199
8およびそれに含まれる文献);大腸癌にかかった患者における予後および進行
に関する血清学的マーカーとしてのCEA(癌胎児性抗原)(JessupとLoda、1998
)の検出。
[0029] The peptides according to the invention can also be used as diagnostic reagents. For example,
The peptides may be used to test a patient's responsiveness to a humoral or cellular immune response elicited by the immunogenic peptide. This offers the potential to improve treatment procedures. For example, TAA dosage forms (peptides,
Depending on the total protein or DNA vaccine, the increase in T cell precursors in PBLs that are responsive to defined peptide epitopes can be examined (Robbins and K
awakami, 1996 and references cited therein). In addition, antibodies directed against peptides or total protein or TAA can be used to predict the risk of a patient succumbing to a 9D7-associated tumor or to characterize the progression of 9D7-positive tumors (eg,
By immunochemical analysis of secondary tumors and metastases). This type of strategy has proven to be successful in many cases, for example detecting the estrogen receptor as a basis for making an endocrine therapy in breast cancer; c-erbB- as a relevant marker in the prognosis and course of treatment in breast cancer 2 (Raviaioli et al., 1998; Revillion et al.,
1998); PSMA (prostate specific membrane antigen) as serum marker for prostate cancer epithelial cells, or PSMA in immunoscintigraphy for prostate cancer
Of PSMA by Using a 111 In-Labeled Monoclonal Antibody Against Murine (Murphy et al., 199
8 and references therein); CEA (carcinoembryonic antigen) as a serological marker for prognosis and progression in colorectal cancer patients (Jessup and Loda, 1998
) Detection.

【0030】 他の側面により、本発明は9D7の免疫原性特性を有するタンパク質またはその
断片をコードする単離DNA分子に関する。 好ましくは、本発明は配列番号1に示した配列を有するポリヌクレオチドを含
む単離DNA分子またはストリンジェントな条件下で配列番号1に示した配列のポリ
ヌクレオチドにハイブリダイズするヌクレオチドを含む単離DNA分子である。 本発明において「ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件」とは、50
%ホルムアミド、5x SSC(1x SSC=150mM NaCl、15mMクエン酸三ナトリウム)
、50mMリン酸ナトリウム(pH7.6)、5xデンハルト溶液、10%硫酸デキストラン、
および20μg/mlの変性剪断サケ精子DNAを含む溶液中で42℃にて一晩インキュベ
ーションし、続いてフィルターを0.1x SSCで約65℃にて洗浄する、またはこれと
等価な条件を言う。
According to another aspect, the invention relates to an isolated DNA molecule encoding a protein or a fragment thereof having the immunogenic properties of 9D7. Preferably, the present invention provides an isolated DNA molecule comprising a polynucleotide having the sequence set forth in SEQ ID NO: 1 or an isolated DNA comprising a nucleotide that hybridizes under stringent conditions to a polynucleotide having the sequence set forth in SEQ ID NO: 1. Is a molecule. In the present invention, “stringent hybridization conditions” refers to 50
% Formamide, 5 × SSC (1 × SSC = 150 mM NaCl, 15 mM trisodium citrate)
, 50 mM sodium phosphate (pH 7.6), 5x Denhardt's solution, 10% dextran sulfate,
And in a solution containing 20 μg / ml denatured sheared salmon sperm DNA at 42 ° C. overnight, followed by washing the filters with 0.1 × SSC at about 65 ° C., or equivalent conditions.

【0031】 本発明のDNA分子またはその断片は、配列番号2に示したアミノ酸配列を有す
る9D7と命名された免疫原性(ポリ)ペプチドまたはそれに由来するタンパク質
断片若しくはペプチドをコードする;これには、遺伝子コードの縮退の結果とし
て配列番号1に示した配列からの変異を示すDNA分子が含まれる。
The DNA molecule of the present invention or a fragment thereof encodes an immunogenic (poly) peptide designated 9D7 having the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2 or a protein fragment or peptide derived therefrom; And DNA molecules that show mutations from the sequence shown in SEQ ID NO: 1 as a result of the degeneracy of the genetic code.

【0032】 本発明はまた、腫瘍ワクチンとしての使用に関して望ましい免疫原性特性を有
する9D7誘導体または断片またはペプチドをコードする限り、アミノ酸の保存的
交換によって生じる配列番号1に示した配列からの偏向を有するDNA分子に関す
る。 配列番号1に示した分子と比較して、本発明のDNA分子は、場合により位置324
の上流に位置してもよい開始コドンまで5'末端において伸長されていてもよい
。 本発明の9D7 DNA分子または、これも本発明の主題である対応するRNAは、それ
によってコードされる(ポリ)ペプチドと同様に、癌疾病の免疫療法のために使
用される。
The present invention also provides for deviations from the sequence set forth in SEQ ID NO: 1 resulting from conservative exchange of amino acids, as long as they encode a 9D7 derivative or fragment or peptide having desirable immunogenic properties for use as a tumor vaccine. DNA molecules having. As compared to the molecule shown in SEQ ID NO: 1, the DNA molecule of the present invention may
May be extended at the 5 'end to a start codon that may be located upstream of The 9D7 DNA molecule of the invention, or the corresponding RNA, which is also a subject of the invention, as well as the (poly) peptide encoded thereby, are used for immunotherapy of cancer diseases.

【0033】 本発明の一つの実施態様では天然の9D7をコードするDNA分子が使用される。天
然の9D7 cDNAまたはその断片の代わりに、改変した誘導体を使用することもでき
る。これらには、より大きな免疫原性を有するタンパク質(断片)またはペプチ
ドをコードする改変を有する配列が含まれ、一方、上述したペプチドに適用され
るのと同じ考察がDNAレベルの改変に適用される。他の型の改変は、数珠のよう
に免疫的に関連のあるペプチドをコードする多数の配列を並べることである(To
esら、1997)。配列はまた、免疫原のより効率的な放出とプロセッシングを保証
する補助的要素、例えば官能基、を追加することによって改変してもよい(Wuら
、1995)。例えば、抗原のプロセッシングおよび、従って提示および最終的な免
疫原性はエンドプラズミックレティキュラムへの局在配列(「ER標的化配列」)
を追加することにより増大させることができる。
In one embodiment of the invention, a DNA molecule encoding native 9D7 is used. In place of the native 9D7 cDNA or a fragment thereof, a modified derivative may be used. These include sequences with modifications that encode proteins (fragments) or peptides with greater immunogenicity, while the same considerations that apply to peptides described above apply to modifications at the DNA level. . Another type of modification is to align multiple sequences encoding peptides that are immunologically related like a rosary (To
es et al., 1997). The sequence may also be modified by the addition of auxiliary elements to ensure more efficient release and processing of the immunogen, such as functional groups (Wu et al., 1995). For example, antigen processing and, thus, presentation and ultimate immunogenicity are localized to the endoplasmic reticulum ("ER targeting sequences").
Can be increased by adding

【0034】 他の側面では、本発明は9D7 DNAを含む組換えDNA分子に関する。 本発明のDNA分子は、好ましくはプラスミドとして組換え形態で直接または組
換えウイルス若しくはバクテリアの一部として投与してよい。理論的には、どん
な遺伝子治療方法もDNA(DNAワクチン)、9D7 DNAに基づくin vivoおよびex viv
oのどちらの癌免疫療法のためにも使用し得る。 In vivo投与の例は、筋肉内経路による、あるいは遺伝子銃を用いた「裸の」D
NAの直接注射であり、これは腫瘍抗原に対するCTLの形成をもたらすことが示さ
れている。組換え体生物の例はワクシニアウイルス、アデノウイルス又はリステ
リア単球遺伝子(monocytogene)である(概説がCoulie、1997によって与えられ
ている)。さらに、カチオン性脂質、微小球体、微小ペレットまたはリポソーム
のような核酸用の合成担体を9D7ペプチドをコードする核酸分子のin vivo投与の
ために使用してもよい。ペプチドのように、免疫応答を増強する、タンパク質の
形であってもそれをコードするプラスミドの形であっても、サイトカインのよう
な種々のアジュバントを投与してもよい。この適用は場合により物理的な方法、
例えばエレクトロポレーションと組み合わせてもよい。
[0034] In another aspect, the invention relates to a recombinant DNA molecule comprising 9D7 DNA. The DNA molecules of the present invention may be administered directly in recombinant form, preferably as a plasmid, or as part of a recombinant virus or bacterium. Theoretically, any gene therapy method could be based on DNA (DNA vaccine), 9D7 DNA, in vivo and ex vivo
o Can be used for either cancer immunotherapy. Examples of in vivo administration include "naked" D via the intramuscular route or using a gene gun.
Direct injection of NA, which has been shown to result in the formation of CTL against tumor antigens. Examples of recombinant organisms are vaccinia virus, adenovirus or the Listeria monocyte gene (review is given by Coulie, 1997). In addition, synthetic carriers for nucleic acids such as cationic lipids, microspheres, micropellets or liposomes may be used for in vivo administration of a nucleic acid molecule encoding a 9D7 peptide. Various adjuvants, such as cytokines, either in the form of a protein or in the form of a plasmid encoding it, which enhance the immune response, such as peptides, may be administered. This application is sometimes physical,
For example, it may be combined with electroporation.

【0035】 ex vivo投与の例は、Tuting、1997によって記載されたような樹状細胞のトラ
ンスフェクション、または細胞性癌ワクチンとして使用される他のAPCのトラン
スフェクションである。 従って、他の側面によれば、本発明は、対応するコード配列でトランスフェク
ションした、9D7それ自体または場合により改変された形態の9D7を発現する細胞
の癌ワクチン製造のための使用に関する。 他の側面では、本発明は9D7又はその断片に対する抗体に関する。ポリクロー
ナル抗体は動物、特にウサギを免疫することによって、抗原又はその断片を注射
し続いて免疫グロブリンを精製することによって慣用的に得られる。 モノクローナル抗9D7抗体はKolerとMilstein、1975によって記載された原理に
従った標準的な方法により、動物特にマウスを免疫し、免疫動物の抗体産生細胞
を、例えばミエローマ細胞と融合させることにより不死化し、得られたハイブリ
ドーマの上清を免疫学的に標準的なアッセイにより抗9D7抗体についてスクリー
ニングすることによって得ることができる。ヒトにおける治療的又は診断的使用
のために、これらの動物抗体は場合により通常のやり方でキメラ化(Neuberger
ら、1984)しても、ヒト化(Riechamnnら、1988、Grazianoら、1995)してもよ
い。
Examples of ex vivo administration are the transfection of dendritic cells as described by Tuting, 1997, or of other APCs used as cellular cancer vaccines. Thus, according to another aspect, the invention relates to the use of cells expressing 9D7 itself or optionally modified forms of 9D7 transfected with the corresponding coding sequence for the production of a cancer vaccine. In another aspect, the invention relates to antibodies to 9D7 or a fragment thereof. Polyclonal antibodies are conventionally obtained by immunizing an animal, particularly a rabbit, by injecting the antigen or a fragment thereof followed by purification of the immunoglobulin. The monoclonal anti-9D7 antibody is immunized in an animal, particularly a mouse, and immortalized by fusing the antibody-producing cells of the immunized animal with, for example, myeloma cells, by standard methods according to the principles described by Koler and Milstein, 1975. The obtained hybridoma supernatant can be obtained by screening for anti-9D7 antibody by an immunologically standard assay. For therapeutic or diagnostic use in humans, these animal antibodies may optionally be chimerized in a conventional manner (Neuberger
Et al., 1984) or humanized (Riechamnn et al., 1988; Graziano et al., 1995).

【0036】 ヒトモノクローナル抗9D7抗体(またはその断片)はいわゆるファージディス
プレイライブラリ(Winterら、1994、Griffithsら、1994、Kruifら、1995、Mc G
uinessら、1996)から、およびトランスジェニック動物(Bruggemannら、1996、
Jakobovitsら、1995)によっても得ることができる。 本発明の抗9D7抗体は診断目的の免疫組織学的分析に使用することができる。 他の側面において、本発明は、9D7を発現する腫瘍に対してまたはその中へ所
望の物質を選択的に与えるための9D7特異的抗体の使用に関する。そのような物
質の例は、細胞障害性試薬または放射活性原子核であり、その活性がin situで
腫瘍を損傷することにある物質である。9D7の腫瘍特異的発現のために、副作用
は全くまたはほとんど予想しえない。他の側面によれば、9D7を発現する細胞を
顕在化させるための物質を9D7抗体の助けと共に使用してもよい。これは診断お
よび治療の評価のために有用である。抗9D7抗体に応用できる治療的および診断
的な抗体の使用はWO 95/3377に記載されている。
The human monoclonal anti-9D7 antibody (or fragment thereof) is a so-called phage display library (Winter et al., 1994, Griffiths et al., 1994, Kruif et al., 1995, McG
uiness et al., 1996), and transgenic animals (Bruggemann et al., 1996,
Jakobovits et al., 1995). The anti-9D7 antibody of the present invention can be used for immunohistological analysis for diagnostic purposes. In another aspect, the present invention relates to the use of a 9D7-specific antibody for selectively providing a desired substance to or into a tumor expressing 9D7. Examples of such substances are cytotoxic reagents or radioactive nuclei, substances whose activity is to damage the tumor in situ. Due to the tumor-specific expression of 9D7, no or almost no side effects are expected. According to another aspect, a substance for revealing cells expressing 9D7 may be used with the aid of a 9D7 antibody. This is useful for diagnosis and treatment evaluation. The use of therapeutic and diagnostic antibodies applicable to anti-9D7 antibodies is described in WO 95/3377.

【0037】 腫瘍細胞における9D7の優先的発現のために、このタンパク質は腫瘍にとって
重要な機能、例えば、腫瘍形成、浸潤及び増殖などの機能を有することが仮定さ
れる。従って、9D7(DNA)はこのタンパク質を調節、特に阻害する物質を同定する
ためのスクリーニングアッセイに使用され得る。一つの実施態様では、そのよう
なアッセイは、増殖について9D7活性と反応する9D7タンパク質またはその活性な
断片を細胞に導入すること、あるいは、それぞれの9D7 DNAを細胞中で発現させ
ること、およびテスト物質の存在下または非存在下における細胞の増殖を測定す
ることを含む。増殖阻害性効果を有する物質は9D7の強い発現を有する腫瘍、特
に腎臓細胞癌、肺癌、大腸癌および乳癌およびホジキンリンパ腫の治療に使用す
ることができる。
Due to the preferential expression of 9D7 in tumor cells, it is hypothesized that this protein has functions important for tumors, such as tumorigenesis, invasion and proliferation. Thus, 9D7 (DNA) can be used in screening assays to identify substances that modulate, especially inhibit, this protein. In one embodiment, such an assay comprises introducing into a cell a 9D7 protein or an active fragment thereof that reacts with 9D7 activity for growth, or expressing the respective 9D7 DNA in a cell, and testing the test substance. Measuring the proliferation of the cells in the presence or absence of the. Substances with an antiproliferative effect can be used for the treatment of tumors with strong expression of 9D7, especially renal cell carcinoma, lung cancer, colon and breast cancer and Hodgkin's lymphoma.

【0038】 (実施例) 実施例1: 腎臓細胞癌組織および正常腎臓組織のRDA(表現差異解析(representational d
ifference analysis)) 同じ患者からの明瞭な細胞型のヒト腎臓細胞癌(RCC、腎細胞癌)の生検およ
び正常な腎臓組織を外科的除去の直後に液体N2で瞬間凍結し、-80℃で保存した
。RNAの単離のため、20μmの連続切片をクリオミクロトーム中(Jung CM1800, L
eica)、-20℃にて調製し、4Mグアニジニウムチオシアネート/1%β-メルカプ
トエタノールに直接溶解した。このサンプルをCsCl勾配の超遠心にかけた(Samb
rook、1989)。
Examples Example 1: RDA (representational analysis) of renal cell carcinoma tissue and normal kidney tissue
Ifference analysis)) human kidney cell carcinoma (RCC of clear cell type from the same patient, the biopsy and normal kidney tissues RCC) immediately after surgical removal and frozen in liquid N 2, -80 ° C. Saved in. For RNA isolation, serial 20 μm sections were placed in a cryomicrotome (Jung CM1800, L
eica), prepared at −20 ° C., and directly dissolved in 4M guanidinium thiocyanate / 1% β-mercaptoethanol. The sample was ultracentrifuged on a CsCl gradient (Samb
rook, 1989).

【0039】 腎臓細胞癌RCC6からの60μgの全RNAおよび自家正常腎臓N6並びに他の正常腎臓
組織(N3)からの350μgの全RNAから出発して、RDA(Diatchenkoら、;HubankとSch
atz)をPCR-SelectTMキット(Clontech、Palo Alto)を用いて業者の指示に従っ
て行なった:RCC(テスター)および正常腎臓組織(ドライバー)からのRNAを使
用してpolyATtractキット(Promega)を業者の指示に従って用いてポリ-A(+)RNA
を単離した。オリゴ-dTを用いて二本鎖cDNAを合成した後、これをRsaIで消化し
た。テスターcDNAの等価の部分をアダプターAまたはBのいずれかと共にライゲー
ションし、それぞれ別個に過剰のドライバーcDNAと65℃にてハイブリダイズさせ
た。次に、この2つの混合物を合わせ、新しい変性ドライバーcDNAと第2のハイ
ブリダイセーションにかけた。濃縮されたテスター特異的cDNAを次にアダプター
AまたはB特異的なプライマーを用いてPCRにより指数関数的に増幅した。さらに
濃縮するために、この反応物のアリコートを内部の特異的入れ子プライマーによ
り第2のPCRにかけた。この反応の結果の生成物をpCRIIベクター(Invitrogen)
にライゲーションし次にコンピテントE.coli(OneShotTM, Invitrogen)にトラン
スフェクションした。1920個の陽性形質転換体(青−白選抜)を96穴ブロックで
LB-Amp培地中で24〜48時間37℃にて培養した。
Starting from 60 μg of total RNA from renal cell carcinoma RCC6 and 350 μg of total RNA from autologous normal kidney N6 and other normal kidney tissue (N3), RDA (Diatchenko et al .; Hubank and Sch
atz) was performed using the PCR-Select kit (Clontech, Palo Alto) according to the manufacturer's instructions: a polyATtract kit (Promega) was purchased from the manufacturer using RCC (tester) and RNA from normal kidney tissue (driver). Use poly-A (+) RNA as directed
Was isolated. After synthesizing a double-stranded cDNA using oligo-dT, this was digested with RsaI. An equivalent portion of the tester cDNA was ligated with either adapter A or B and each separately hybridized at 65 ° C. with an excess of driver cDNA. The two mixtures were then combined and subjected to a second hybridization with the new denatured driver cDNA. The enriched tester-specific cDNA is then adaptered
Exponentially amplified by PCR using A or B specific primers. An aliquot of this reaction was subjected to a second PCR with specific internal nested primers for further enrichment. The product of this reaction is transferred to the pCRII vector (Invitrogen)
And then transfected into competent E. coli (OneShot , Invitrogen). 1920 positive transformants (blue-white selection) in a 96-well block
The cells were cultured in LB-Amp medium for 24 to 48 hours at 37 ° C.

【0040】 大腸菌懸濁液の200μlアリコートを100℃に10分間加熱した。バクテリア残渣
を短時間遠心分離した後、140μlの透明な上清(〜1μgのプラスミドDNA)を60
μlの20xSSCに移し、DNAドットブロットを作成するための標準的な方法(Sambro
ok, 1989)に従って平衡化したナイロン膜(Hybond-N、Amersham)に固定化した
。残りのバクテリア培養物はグリセリン親培養物として-80℃に保存した。 cDNAサブトラクションライブラリーを1920個の個々のクローンから得た。それ
らは、E.coliグリセリン親培養物として、およびDNAドットブロット上に固定化
されたプラスミドの両方として存在している。
A 200 μl aliquot of the E. coli suspension was heated to 100 ° C. for 10 minutes. After brief centrifugation of the bacterial residue, 140 μl of the clear supernatant ((1 μg of plasmid DNA)
Transfer to μl 20xSSC and use standard method for making DNA dot blots (Sambro
ok, 1989) and immobilized on a nylon membrane (Hybond-N, Amersham) equilibrated. The remaining bacterial culture was stored at -80 ° C as the glycerin parent culture. A cDNA subtraction library was obtained from 1920 individual clones. They exist both as E. coli glycerin parent cultures and as plasmids immobilized on DNA dot blots.

【0041】 実施例2: cDNAサブトラクションライブラリーの精巣特異的cDNAライブラリーとのハイブ
リダイゼーションによる腫瘍−精巣抗原の選抜 「Human Testis-Specific PCR-SelectTM cDNA」(ヒト精巣−特異的 PCR-セ
レクト)(Clontech、Palo、Alto)を業者の指示に従って、11サイクルのPCRに
よって増幅した。アリコートをランダムプライミング法(HiPrime Kit,Boehring
er Mannheim)によって[α-32P]dCTP(NEN、Boston)で標識し、ストリンジェント
な条件下(65℃)で標準的な方法(Sambrook、1989)によって実施例1に記載
したDNAドットブロットにハイブリダイズさせた。Human Testis-Specific PCR-S
electTM cDNAにハイブリダイズするクローンを標準的なオートラジオグラフィー
(Xomat DR フィルム、Kodak)により視覚化した。実施例2の結果により、腎臓
細胞癌RCC6および精巣中で支配的に転写されている150個のクローンを選抜する
ことができた。これらのクローンは腫瘍−精巣抗原のクラスの候補である。
Example 2 Selection of Tumor-Testis Antigen by Hybridizing a cDNA Subtraction Library with a Testis-Specific cDNA Library “Human Testis-Specific PCR-Select cDNA” (Human Testis-Specific PCR-Select) (Clontech, Palo, Alto) were amplified by 11 cycles of PCR according to the manufacturer's instructions. Aliquots are random primed (HiPrime Kit, Boehring
er Mannheim) with [α- 32 P] dCTP (NEN, Boston) and the DNA dot blot described in Example 1 under stringent conditions (65 ° C.) by standard methods (Sambrook, 1989). Hybridized. Human Testis-Specific PCR-S
Clones hybridizing to the elect cDNA were visualized by standard autoradiography (Xomat DR film, Kodak). According to the results of Example 2, 150 clones predominantly transcribed in renal cell carcinoma RCC6 and testis could be selected. These clones are candidates for a class of tumor-testis antigens.

【0042】 実施例3: 腫瘍精巣抗原抗のDNAシーケンシングおよびアノテーション 実施例2で得られた結果に基づいて選抜した62個のクローンからのプラスミド
DNAを業者の指示に従って(QIAgen)単離し、ABI-prism装置でサンガー法によっ
てシーケンシングした。 このようにして決定された配列をBioWorkBenchソフトウエア(GeneData, Basl
e)を用いて解析し、データバンク(Genbank)比較にかけた。これにより、33の既
知の遺伝子および29の未知の遺伝子を同定することができた。後者については、
ESTエントリーしかなかった。既知の遺伝子はそれ以上処理しなかった。29の未
知の遺伝子については発現プロフィールを評価した:実験的に決定した配列と95
%より大きい相同性(BALST)を有するデータバンク中の全てのESTについて、対応
するcDNAライブラリーについて出発組織を調べた。これらをi)決定的な正常組
織、ii)胎児性、「使い捨て可能」の、および、免疫支配的組織およびiii)腫
瘍および細胞株に細分化した。この「仮想的mRNAプロフィール」に基づいて、ES
Tがグループi)に見出されなかった16個のクローンを更なる実験的解析のた
めの選抜した。
Example 3 DNA Sequencing and Annotation of Tumor Testis Antigen Plasmids from 62 Clones Selected Based on the Results Obtained in Example 2
DNA was isolated according to the manufacturer's instructions (QIAgen) and sequenced by the Sanger method on an ABI-prism instrument. The sequence determined in this way is transferred to BioWorkBench software (GeneData, Basl
Analysis was performed using e) and the data bank (Genbank) was compared. This allowed the identification of 33 known genes and 29 unknown genes. For the latter,
There was only EST entry. Known genes were not processed further. Expression profiles were evaluated for 29 unknown genes: experimentally determined sequences and 95
For all ESTs in the data bank with greater than% homology (BALST), the starting tissue was checked against the corresponding cDNA library. These were subdivided into i) critical normal tissues, ii) fetal, "disposable" and immunodominant tissues and iii) tumors and cell lines. ES based on this “virtual mRNA profile”
The 16 clones in which T was not found in group i) were selected for further experimental analysis.

【0043】 実施例4: 候補クローンの腎臓細胞癌および正常腎臓における転写解析 腫瘍組織または正常組織からの2〜5μgの全RNAをSuperscriptII(Gibco)また
はAMV-RT(Promega)により、業者の推奨に従って逆転写した。個々のRNAプロー
ブのそれぞれについて、染色体DNAによるコンタミネーションに対する対照とし
て逆転写を行なわずに第2のバッチを走らせた。あるいは、ヒト心臓、白血球、
腎臓、肝臓、肺及び精巣のプラスミドcDNAライブラリー(Gibco)を使用した。C
DNAの品質及び量をβ-アクチン特異的プライマー(配列番号29および30)を用い
て、20、25および30サイクルのPCR(94℃にて40秒、55℃にて45秒、72℃にて
1分30秒、サイクル11からは各更なるサイクルにおいて、55℃にて30秒および、
55℃にて3秒の伸長)後に調べた。9D7 cDNAを配列番号3および4に記載の9D7
特異的プライマーで同じプロブラムの30サイクルによって増幅した。他の15個の
候補クローンも同様に特異的プライマーで調べた。PCR産物をアガロース電気泳
動およびエチジウムブロミド染色によって検出した。調べた16個のクローンのう
ち5個について、RT-PCRにより自己の正常な腎臓組織N6に比較して腎臓細胞癌RCC
6において明瞭な過剰発現が検出できた。精巣cDNAにおける出現をすべてのクロ
ーンについて追加の陽性対照として調べた。
Example 4 Transcriptional Analysis of Candidate Clones in Renal Cell Carcinoma and Normal Kidney 2-5 μg of total RNA from tumor tissue or normal tissue was analyzed by Superscript II (Gibco) or AMV-RT (Promega) according to the manufacturer's recommendations Reverse transcribed. For each individual RNA probe, a second batch was run without reverse transcription as a control for chromosomal DNA contamination. Or human heart, leukocytes,
Kidney, liver, lung and testis plasmid cDNA libraries (Gibco) were used. C
20, 25 and 30 cycles of PCR (40 sec at 94 ° C., 45 sec at 55 ° C., 72 ° C.) using β-actin specific primers (SEQ ID NOs: 29 and 30) 1 minute 30 seconds, from cycle 11 on each additional cycle for 30 seconds at 55 ° C and
(3 seconds elongation at 55 ° C.). The 9D7 cDNA was replaced with the 9D7
Amplified by 30 cycles of the same program with specific primers. The other 15 candidate clones were also tested with specific primers. PCR products were detected by agarose electrophoresis and ethidium bromide staining. Five of the 16 clones examined were compared with their normal kidney tissue N6 by RT-PCR for renal cell carcinoma RCC.
In Figure 6, clear overexpression could be detected. Appearance in testis cDNA was examined as an additional positive control for all clones.

【0044】 実施例5: 腫瘍組織と正常組織との間の9D7 mRNA発現の定量的比較 3つの腫瘍組織および正常組織の全RNAの9μgのプールをDNaseI(Boehringer
Mannheim)で前処理し、続いてフェノール抽出した後、オリゴ-dTおよびAMV-RT(P
romega)を用いて逆転写した。9D7 cDNAのコピー数または全cDNAの量と質の対照
としてのグリセルアルデヒド-3-リン酸-デヒドロゲナーゼcDNA(GAPDH)を5'-ヌク
レアーゼPCRアッセイ(TaqManRPCR, PE Applied Biosystems)を用いて定量した。
cDNA定量のためのプライマーまたは標識TaqManプローブは配列番号3並びに4、
および配列番号31(6-カルボキシ-フルオレセインで5'末端が標識され、6-カル
ボキシ-テトラメチル-ローダミンで3'末端が標識されている)に記載したもの、
また、GADPHについては、配列番号25並びに26、および配列番号32に記載のプラ
イマー(テトラクロロ-6-カルボキシ-フルオレセインで5'末端が標識され、6-カ
ルボキシ-テトラメチル-ローダミンで3'末端が標識されている)からなる。ABI
PRISM 7700シーケンス検出システム(PE Applied Biosystems)を用いて、PCR(9D
7については40サイクル{95℃にて15秒、60℃にて1分間}またはGAPDHについては
、40サイクル{95℃にて15秒、66℃にて1分間})およびオンライン蛍光測定を行
なった。
Example 5: Quantitative Comparison of 9D7 mRNA Expression between Tumor and Normal Tissues A 9 μg pool of total RNA from three tumor and normal tissues was prepared using DNaseI (Boehringer
Mannheim), followed by phenol extraction, followed by oligo-dT and AMV-RT (P
reverse transcripts using the following method. 9D7 cDNA of glyceraldehyde-3-phosphate as a control of copy number or total cDNA quantity and quality - dehydrogenase cDNA and (GAPDH) 5'-nuclease PCR assay (TaqMan R PCR, PE Applied Biosystems ) quantitated using a did.
Primers or labeled TaqMan probes for cDNA quantification are SEQ ID NOs: 3 and 4,
And SEQ ID NO: 31 (labeled at the 5 'end with 6-carboxy-fluorescein and labeled at the 3' end with 6-carboxy-tetramethyl-rhodamine),
For GAPDH, the primers described in SEQ ID NOS: 25 and 26, and SEQ ID NO: 32 (the 5 ′ end is labeled with tetrachloro-6-carboxy-fluorescein, and the 3 ′ end is labeled with 6-carboxy-tetramethyl-rhodamine) Labeled). ABI
Using the PRISM 7700 sequence detection system (PE Applied Biosystems), PCR (9D
For 7 cycles, 40 cycles {95 seconds at 95 ° C, 1 minute at 60 ° C} or for GAPDH, 40 cycles {15 seconds at 95 ° C, 1 minute at 66 ° C}) and online fluorescence measurements .

【0045】 実施例5により9D7が腎臓細胞癌及び肺癌(SCC)のプールにおいてGAPDHよりも
およそ1.5倍から6.5倍強く転写されていることが示された。他の型の腫瘍におい
ては、転写速度はGAPDHの値の0.25倍から0.6倍の間で変動する。正常肝および精
巣はGAPDH転写の約10%の値を示すが、一方、調べた他の正常組織は事実上9D7の
転写を全く示さない(表1)。
Example 5 showed that 9D7 was transcribed approximately 1.5 to 6.5 times more strongly than GAPDH in a pool of renal cell carcinoma and lung cancer (SCC). In other types of tumors, the rate of transcription varies between 0.25 and 0.6 times the value of GAPDH. Normal liver and testis show about 10% value of GAPDH transcript, while other normal tissues examined show virtually no 9D7 transcript (Table 1).

【0046】 実施例6: 腫瘍組織および正常組織における9D7の発現プロフィール 15の候補の内の一つ(9D7と命名)はRT-PCRによれば調べた全ての腎臓細胞癌
および幾つかの他の型の腫瘍において強力に転写されていることが示された。し
かしながら、大部分の正常組織において、転写は見られなかった。図1は4つの
正常腎臓(N1、2,4,5)と4つの腎臓細胞癌(RCC1, 2,3,6)間の比較
を示している;また、このテストでは、心筋(he)、白血球(leu)、腎臓(ki)、肝
臓(li)、肺(lu)および精巣(tes)のcDNAもテストされ、対照はβ−アクチンプラ
イマーを用いて行なった。これらの結果は、異なる3種のプライマー対(配列番
号3と4、配列番号5と10、および、配列番号11と15)を用いた独立の実験によ
って確認された。
Example 6: Expression profile of 9D7 in tumor and normal tissues One of the 15 candidates (designated 9D7) was identified by RT-PCR in all renal cell carcinomas and some other It was shown to be strongly transcribed in tumor types. However, no transcript was found in most normal tissues. FIG. 1 shows a comparison between four normal kidneys (N1, 2, 4, 5) and four renal cell carcinomas (RCC1, 2, 3, 6); and in this test, the myocardium (he), Leukocyte (leu), kidney (ki), liver (li), lung (lu) and testis (tes) cDNAs were also tested; controls were performed with β-actin primers. These results were confirmed by independent experiments using three different primer pairs (SEQ ID NOs: 3 and 4, SEQ ID NOs: 5 and 10, and SEQ ID NOs: 11 and 15).

【0047】 ノーザンブロット解析のために、ヒトの複数の組織ノーザンブロット(Clonte
ch, Palo Alto)を[α-32P]dCTP(NEN, Boston)で標識した170bpの9D7 PCR産物と
65℃にて16時間ハイブリダイズさせた。視覚化は標準的なオートラジオグラフィ
ー(Xomat ARフィルム、Kodak)によって得た。図2は、この解析結果を示す:1
6の正常組織(1.白血球、2.大腸、3.小腸、4.卵巣、5.精巣、6.前
立腺、7.胸腺、8.脾臓、9.膵臓、10.腎臓、11.骨格筋、12.肝臓、13.肺
、14.胎盤、15.脳、16.心筋)のうち、心筋においてのみ大きさ〜2.2kbの転写物
が存在した。しかしながら、シグナル強度が低いので免疫学的に関連のある発現
はありそうにない。 9D7のmRNAプロフィールに関する全ての実験結果は(RT-PCR、定量的RT-PCRお
よびノーザンブロット解析から集めたもの)表2に示してある。実施例6により
、9D7は種々の指標の腫瘍の高い割合において強く転写されており、一方、調べ
たどの正常組織においても全くまたはほとんど転写が見られないことが示された
For Northern blot analysis, multiple human tissue Northern blots (Clonte
ch, Palo Alto) and a 170bp 9D7 PCR product labeled with [α- 32 P] dCTP (NEN, Boston).
Hybridization was performed at 65 ° C. for 16 hours. Visualization was obtained by standard autoradiography (Xomat AR film, Kodak). Figure 2 shows the results of this analysis: 1
6. Normal tissues (1. white blood cells, 2. large intestine, 3. small intestine, 4. ovary, 5. testis, 6. prostate, 7. thymus, 8. spleen, 9. pancreas, 10. kidney, 11. skeletal muscle, (12 liver, 13. lung, 14. placenta, 15. brain, 16. myocardium), transcripts of ~ 2.2 kb were present only in myocardium. However, immunologically relevant expression is unlikely due to the low signal intensity. All experimental results for the 9D7 mRNA profile (collected from RT-PCR, quantitative RT-PCR and Northern blot analysis) are shown in Table 2. Example 6 showed that 9D7 was strongly transcribed in a high percentage of tumors of various indices, while no or little transcript was found in any of the normal tissues examined.

【0048】 実施例7: 9D7特異的RNAプローブと腎臓細胞癌組織および正常腎臓組織とのin situハイ
ブリダイゼーション 9D7の220bpの配列情報を有する280bpのNotI断片をpBluescriptにサブクローニ
ングし、次にこれを用いてコンピテントE.coli DH5-αを形質転換した。T3−お
よびT7−RNAポリメラーゼを用いて(センス;SacI, T3;アンチセンス:BamHI
、T7)、ジゴキシゲニン-UTPを添加して業者の推奨(DIG RNA 標識キット、Boeh
ringer Mannheim)に従って、in vitro転写によりRNAプローブを合成した。転写
物の精製後(セファデックスG50クイックスピンカラム、Boehringer Mannheim)
標識効率をドットブロットにより測定した。In situハイブリダイゼーションを
標準的な方法を用いて行なった(Boehringer Mannheim、非放射性in situハイブ
リダイゼーション応用マニュアル(Non-radioactive In situ hybridization Ap
plication Manual)、1996):5μm凍結切片をパラホルムアルデヒドで固定後
に変性させ、アセチル化および脱水または再水和させ、一晩湿室の中で52℃にて
ハイブリダイズさせた。通常の洗滌工程の後、非特異的タンパク質結合部位を10
%FCSおよび3%ヤギ血清(DAKO)で15分間飽和させた。9D7 mRNAにハイブリダイズ
したプローブの視覚化はNBT/BCIP(Boehringer Mannheim)と共にα-DIG-AP結合体
とインキュベーションし、暗所で4℃にて現像することによって行なった。
Example 7: In situ hybridization of 9D7-specific RNA probe to renal cell carcinoma tissue and normal kidney tissue A 280 bp NotI fragment having 220 bp sequence information of 9D7 was subcloned into pBluescript and then used. To transform competent E. coli DH5-α. Using T3- and T7-RNA polymerases (sense; SacI, T3; antisense: BamHI
, T7), add digoxigenin-UTP and add to the manufacturer's recommendations (DIG RNA labeling kit, Boeh
RNA probes were synthesized by in vitro transcription according to Ringer Mannheim). After transcript purification (Sephadex G50 Quick Spin Column, Boehringer Mannheim)
Labeling efficiency was measured by dot blot. In situ hybridization was performed using standard methods (Boehringer Mannheim, Non-radioactive In situ hybridization Applica- tion Manual).
Replication Manual), 1996): 5 μm frozen sections were denatured after fixation with paraformaldehyde, acetylated and dehydrated or rehydrated and hybridized overnight at 52 ° C. in a moist chamber. After a normal washing step, 10 non-specific protein binding sites
Saturated with% FCS and 3% goat serum (DAKO) for 15 minutes. Visualization of the probe hybridized to 9D7 mRNA was performed by incubation with α-DIG-AP conjugate with NBT / BCIP (Boehringer Mannheim) and development at 4 ° C. in the dark.

【0049】 図3は、腎臓細胞癌組織または正常腎臓組織と9D7特異的ジゴキシゲニン-UTP
標識RNAプローブ(アンチセンス)とのin situハイブリダイゼーションの結果を
示している:腫瘍組織は強い均一な染色を示しているが、正常組織は反応してい
ない;染色の特異性は負の対照(センス)によって示されている。 実施例7は、9D7は腎臓細胞癌組織の腫瘍細胞中では転写されているが、正常
腎臓組織のどの細胞型でも転写されていないことを示しており、従って、実施例
4から6に記載した結果が確認される。
FIG. 3 shows that renal cell carcinoma tissue or normal kidney tissue and 9D7-specific digoxigenin-UTP
Shown is the result of in situ hybridization with a labeled RNA probe (antisense): tumor tissue shows strong homogeneous staining, but normal tissue is unreactive; staining specificity is negative control ( Sense). Example 7 shows that 9D7 is transcribed in tumor cells of renal cell carcinoma tissue, but not in any cell type of normal kidney tissue, and is therefore described in Examples 4-6. The result is confirmed.

【0050】 実施例8: 9D7タンパク質発現を検出するために、9D7特異的抗体をウサギで生成させた。
DAEERAEAKKKFRNLTRKTES(配列番号59)の配列を有する9D7-3aaと命名されたペプチ
ドを免疫感作に使用し、得られた血清をペプチド9D7-3aaでアフィニティー精製
した。9D7-3aa血清の特異的反応性を調べるため、完全な9D7リーディングフレー
ムをGFP融合タンパク質としてCOS細胞中で一過性に発現させ、トランスフェクシ
ョンされた細胞を9D7-3aa血清でウエスタンブロットでテストした。この血清は
真核細胞的に発現された融合タンパク質と明確に反応した。続いて、18の異なる
腎臓細胞癌を9D7-3aa血清を用いて9D7発現について免疫組織化学的に解析した。
腫瘍細胞における発現は15の症例で検出され、一方9D7発現は胃癌では検出でき
なかった。これらの例を図4に示してある。
Example 8: To detect 9D7 protein expression, 9D7-specific antibodies were raised in rabbits.
A peptide named 9D7-3aa having the sequence of DAEERAEAKKKFRNLTRKTES (SEQ ID NO: 59) was used for immunization, and the resulting serum was affinity-purified with peptide 9D7-3aa. To determine the specific reactivity of 9D7-3aa sera, the complete 9D7 reading frame was transiently expressed in COS cells as a GFP fusion protein, and transfected cells were tested by western blot with 9D7-3aa sera . This serum clearly reacted with the eukaryotically expressed fusion protein. Subsequently, 18 different renal cell carcinomas were analyzed immunohistochemically for 9D7 expression using 9D7-3aa serum.
Expression in tumor cells was detected in 15 cases, whereas 9D7 expression was not detectable in gastric cancer. These examples are shown in FIG.

【0051】 実施例9: 9D7のクローニング クローン9D7はRDAによって導入されたアダプターの間に221bp長の未知のヒト
遺伝子の挿入を有する。データバンクとの比較によって9D7のラットSM20との相
同性が示され、69bpのC末端コード領域(23アミノ酸に対応)、SM20の停止コド
ンおよび149bpの3'非翻訳領域はアンチセンス方向に9D7の221bpに対応する。こ
の23アミノ酸は、ラットとヒトの間で2個の交換しか示さない。SM20は成長因子
によって誘導される前初期遺伝子として、および平滑大動脈筋の特異的マーカー
として記載されている(Waxら、1994;Waxら、1996)。ヒト配列を完全にクロー
ニングするために、以下の手順を行った:UniGene Analysis(National Center
for Biotechnology Information)は9D7に相同な以下のESTを生成した:AA23412
7、AA233899、AA917421、AA878927。腫瘍細胞株786-0(ATCC# CRL-1932)または
A549(ATCC# CCL 185)からTRIzol(Gibco)を用いて全RNAを単離し、Superscipt
II MMLV-RT(Gibco)およびアダプター-オリゴdT-プライマー(配列番号27)で業
者の説明書に従って逆転写した。このcDNAの配列番号5,6、7および10に記載
のプライマーと元のプライマー(配列番号3および4)、および互いを用いたPC
R増幅は、相同な配列に従った期待される断片を生成した。最も長い804bpの断片
は配列番号10および5に記載のプライマーを組み合わせることによって得られた
。配列番号8および9のプライマーはEST-AA234127の配列範囲中に位置し、この
配列範囲はSM-20と相同性を有せず、従って他のどのプライマーによっても増幅
産物を生じなかった。
Example 9: Cloning of 9D7 Clone 9D7 has an insertion of an unknown human gene of 221 bp in length between the adapters introduced by RDA. Comparison with the data bank shows the homology of 9D7 to rat SM20, with a 69 bp C-terminal coding region (corresponding to 23 amino acids), a stop codon for SM20 and a 149 bp 3 ′ untranslated region with 9D7 in the antisense orientation. It corresponds to 221 bp. The 23 amino acids show only two exchanges between rat and human. SM20 has been described as a growth factor-induced immediate early gene and as a specific marker of smooth aortic muscle (Wax et al., 1994; Wax et al., 1996). To fully clone the human sequence, the following procedure was performed: UniGene Analysis (National Center
for Biotechnology Information) generated the following EST homologous to 9D7: AA23412
7, AA233899, AA917421, AA878927. Tumor cell line 786-0 (ATCC # CRL-1932) or
Total RNA was isolated from A549 (ATCC # CCL 185) using TRIzol (Gibco).
Reverse transcription was performed with II MMLV-RT (Gibco) and adapter-oligo dT-primer (SEQ ID NO: 27) according to the manufacturer's instructions. The primers of SEQ ID NOs: 5, 6, 7 and 10 of this cDNA and the original primers (SEQ ID NOs: 3 and 4), and PC
R amplification produced the expected fragment according to the homologous sequence. The longest 804 bp fragment was obtained by combining the primers of SEQ ID NOs: 10 and 5. The primers of SEQ ID NOs: 8 and 9 are located within the sequence range of EST-AA234127, which sequence sequence has no homology to SM-20 and thus did not generate an amplification product with any other primer.

【0052】 3'末端のクローニング:腎臓細胞癌細胞株786-0からの10μgの全RNAを逆転写
し、そのcDNAのアリコートの一つをPCRに欠けた。PCRプログラムは遺伝子特異的
プライマーのみがcDNAに結合するように高いアニーリング温度(Tm〜93℃、配列
番号22)で開始するものであり、一方第2のプライマー(Tm〜53℃、配列番号28
)は低い温度で新たに合成されたDNAのみに結合するものである。このいわゆる
タッチダウンPCR(Mastercycler Gradient, Eppendorf)を以下の条件で行った
:20サイクルの{95℃にて15秒、80℃にて30秒(各サイクルごとに1℃下げる)、
72℃にて2分間}および20サイクルの{95℃にて15秒、50℃にて30秒、72℃にて2
分間}。 5'末端のクローニング:腎臓細胞癌細胞株786-0からの全RNA1μgを改変SMART TM 手順(SMARTTM PCR cDNA Synthethic Kit, Clontech)により配列番号4およ
びSmart-II(配列番号23)のプライマーを用いて逆転写した:cDNAは配列番号4
に記載の9D7特異的プライマーにより、RNasin(Promega)を添加して行った。配列
番号11に記載の9D7特異的プライマーを最終濃度0.4μMで、および、SMART-PCRプ
ライマー(配列番号24)を0.1μMで使用した。PCR増幅は(95℃にて15秒、65℃
にて30秒、72℃にて2分間)を40サイクル行った。
Cloning of 3 ′ end: reverse transcription of 10 μg of total RNA from renal cell carcinoma cell line 786-0
However, one aliquot of the cDNA was lacking in PCR. PCR programs are gene-specific
High annealing temperature (Tm-93 ° C, sequence
No. 22), while a second primer (Tm-53 ° C., SEQ ID NO: 28)
) Binds only to newly synthesized DNA at low temperatures. This so-called
Touchdown PCR (Mastercycler Gradient, Eppendorf) was performed under the following conditions
: 20 cycles of {95 ° C for 15 seconds, 80 ° C for 30 seconds (1 ° C decrease for each cycle),
72 ° C for 2 minutes} and 20 cycles of {95 ° C for 15 seconds, 50 ° C for 30 seconds, 72 ° C for 2 seconds
Minutes}. 5 'end cloning: 1 μg of total RNA from renal cell carcinoma cell line 786-0 modified SMART TM Instructions (SMARTTM PCR cDNA Synthethic Kit, Clontech)
And Smart-II (SEQ ID NO: 23) were reverse transcribed: cDNA was SEQ ID NO: 4
RNasin (Promega) was added using the 9D7-specific primer described in (1). Array
No. 11 9D7-specific primer at a final concentration of 0.4 μM and SMART-PCR
A primer (SEQ ID NO: 24) was used at 0.1 μM. PCR amplification is performed at 95 ° C for 15 seconds, 65 ° C
For 30 seconds and 72 ° C. for 2 minutes) for 40 cycles.

【0053】 PCRバッチのアリコートを直接PCR2.1(Invitrogen)にライゲーションし、コ
ンピテントE.coli(OneShotTM, Invitrogen)に形質転換した。陽性クローンを青
−白選抜によりシーケンシングした。シーケンシングによりEST-AA878927にこれ
まで確認されたところでは3'末端に50個の追加のヌクレオチドが明らかにされ、
および、これまでに確認されたところでは5'末端に870個の追加のヌクレオチド
が明らかにされた。腫瘍細胞株(786-0、A549)および腎臓細胞癌の生検からの
配列番号14から21に記載のプライマーによるcDNAのPCR増幅は、クローニング後
、もともとのプライマーおよび互いを使用して期待される断片を生成した。全て
のPCR産物の同一性はシーケンシングにより確認した。シーケンシングの際、282
bpのエクソン(位置399-680)を有するまたは有しない多数のクローンが明らか
になった。2つのスプライシング変異体の存在は配列番号11および15または13に
記載のプライマーを用いたRT-PCRにより幾つかの腫瘍プローブ(腎臓細胞癌、肺
癌/SCC、大腸癌/AC)において示された。
An aliquot of the PCR batch was ligated directly to PCR 2.1 (Invitrogen) and transformed into competent E. coli (OneShot , Invitrogen). Positive clones were sequenced by blue-white selection. Sequencing revealed 50 additional nucleotides at the 3 'end, previously identified in EST-AA878927,
And so far identified 870 additional nucleotides at the 5 'end. PCR amplification of cDNA with the primers of SEQ ID NOs: 14-21 from tumor cell line (786-0, A549) and renal cell carcinoma biopsies is expected after cloning using the original primers and each other A fragment was generated. The identity of all PCR products was confirmed by sequencing. 282 during sequencing
Numerous clones with or without exons of bp (positions 399-680) were revealed. The presence of two splice variants was shown in several tumor probes (renal cell carcinoma, lung cancer / SCC, colon cancer / AC) by RT-PCR using primers as set forth in SEQ ID NOs: 11 and 15 or 13.

【0054】 実施例10: 9D7のコード領域中の潜在的MHC結合ペプチド 配列番号2の9D7のコード領域内の潜在的ペプチドエピトープは、Parkerら、1
994によって記載されたアルゴリズムを用いて、既知のモチーフ(Rammenseeら、
1995)を基礎として行った。最も重要なHLA型、特にHLA-A1、A*0201、A3、 B7,
B14およびB*4403について、対応するHLA分子に結合し得ることが期待され、従っ
て、免疫原性CTL-エピトープであると期待される候補ペプチドを同定した;見い
だされたこれらのペプチドを表3に掲げた。類似の方法を用いて、他のHLA型に
対する他の潜在的なペプチドエピトープも見つけることができる。
Example 10: Potential MHC-binding peptide in the coding region of 9D7 A potential peptide epitope in the coding region of 9D7 of SEQ ID NO: 2 is described by Parker et al., 1
Using the algorithm described by 994, known motifs (Rammensee et al.
1995). The most important HLA types, especially HLA-A1, A * 0201, A3, B7,
For B14 and B * 4403, candidate peptides expected to be able to bind to the corresponding HLA molecule and thus expected to be immunogenic CTL-epitope were identified; these peptides found are listed in Table 3. Raised. Similar methods can be used to find other potential peptide epitopes for other HLA types.

【0055】[0055]

【表1】 表1.腫瘍組織および正常組織における9D7のGAPDHに対する相対的転写 [Table 1] Table 1. Relative transcription of 9D7 to GAPDH in tumor and normal tissues

【0056】[0056]

【表2】 表2.9D7のmRNA発現プロフィール Table 2. mRNA expression profile of 9D7

【0057】[0057]

【表3】 表3.免疫原性9D7ペプチド候補 [Table 3] Table 3. Immunogenic 9D7 peptide candidate

【0058】[0058]

【表4】 表3.つづき [Table 4] Table 3. Continued

【0059】 文献 Becker, D., Kuhn, U., Lempertz, U., Enk, A., Saloga, J., and Knop, J. (1
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【配列表】[Sequence list]

【図面の簡単な説明】[Brief description of the drawings]

【図1】 正常組織およびRCCにおける9D7の転写:腎臓、心臓、白血球、肝臓、肺、精巣
および4つの腎臓細胞癌からのRNAについての半定量的RT-PCR。
FIG. 1. Transcription of 9D7 in normal tissues and RCC: semi-quantitative RT-PCR for RNA from kidney, heart, leukocytes, liver, lung, testis and four renal cell carcinomas.

【図2】 正常組織における9D7の転写:16の正常組織のmRNAのノーザンブロット解析。FIG. 2. Transcription of 9D7 in normal tissues: Northern blot analysis of mRNA of 16 normal tissues.

【図3】 腎細胞癌および正常腎臓組織切片による9D7-RNAのin situハイブリダイゼーシ
ョン。
FIG. 3. In situ hybridization of 9D7-RNA with renal cell carcinoma and normal kidney tissue sections.

【図4】 腎臓細胞癌における9D7発現の検出。FIG. 4. Detection of 9D7 expression in renal cell carcinoma.

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) A61K 48/00 A61P 37/04 A61P 35/00 C07K 14/47 37/04 16/28 C07K 14/47 C12P 21/08 16/28 C12N 15/00 ZNAA // C12P 21/08 A61K 37/02 (81)指定国 EP(AT,BE,CH,CY, DE,DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,I T,LU,MC,NL,PT,SE),EA(AM,AZ ,BY,KG,KZ,MD,RU,TJ,TM),AU ,BG,BR,CA,CN,CZ,EE,HU,ID, IL,IN,JP,KR,LT,LV,MX,NO,N Z,PL,RO,SG,SI,SK,TR,UA,US ,UZ,VN,YU,ZA (72)発明者 アドルフ ギュンター オーストリア アー−1070 ヴィーン シ ュティフトガッセ 15−17/10 (72)発明者 ゾンマーグルーバー ヴォルフガング オーストリア アー−3002 プルカースド ルフ リンツァー−シュトラッセ 19 ハ ウス 4 (72)発明者 ハイダー カール−ハインツ オーストリア アー−2000 シュトッケラ ウ ヨハン−シュトラウス プロメナーデ 4/11 Fターム(参考) 4B024 AA01 AA11 AA12 BA36 BA54 CA04 DA06 EA04 4B064 AG26 AG27 AG31 DA03 DA05 DA14 4C084 AA02 AA07 AA13 BA02 CA53 MA52 MA55 NA14 ZB09 ZB26 4C085 AA03 AA13 AA14 BB11 BB31 CC01 DD62 GG08 GG10 4H045 AA10 AA11 BA09 BA54 CA41 DA76 DA86 EA22 EA51 FA74──────────────────────────────────────────────────続 き Continued on the front page (51) Int.Cl. 7 Identification symbol FI theme coat ゛ (Reference) A61K 48/00 A61P 37/04 A61P 35/00 C07K 14/47 37/04 16/28 C07K 14/47 C12P 21/08 16/28 C12N 15/00 ZNAA // C12P 21/08 A61K 37/02 (81) Designated country EP (AT, BE, CH, CY, DE, DK, ES, FI, FR, GB, GR, IE, IT, LU, MC, NL, PT, SE), EA (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM), AU, BG, BR, CA, CN, CZ, EE , HU, ID, IL, IN, JP, KR, LT, LV, MX, NO, NZ, PL, RO, SG, SI, SK, TR, UA, US, UZ, VN, YU ZA (72) Inventor Adolf Günther Austria Aer-1070 Vin Schuttgasse 15-17 / 10 (72) Inventor Sommergrober Wolfgang Austria Aer 3002 Purkasd Ruff Linzer-Strasse 19 Haus 4 (72) Inventor Haider Carl- Heinz Austria A-2000 Stockerau Johann-Strauss Promenade 4/11 F-term (reference) 4B024 AA01 AA11 AA12 BA36 BA54 CA04 DA06 EA04 4B064 AG26 AG27 AG31 DA03 DA05 DA14 4C084 AA02 AA07 AA13 BA02 CA53 MA52 A55 NA14 BB11 BB31 CC01 DD62 GG08 GG10 4H045 AA10 AA11 BA09 BA54 CA41 DA76 DA86 EA22 EA51 FA74

Claims (20)

【特許請求の範囲】[Claims] 【請求項1】 配列番号2に記載のアミノ酸配列を有することを特徴とする
腫瘍関連抗原9D7。
1. A tumor-associated antigen 9D7 having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2.
【請求項2】 配列番号2に記載のアミノ酸配列を部分配列として含むこと
を特徴とするポリペプチド。
2. A polypeptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2 as a partial sequence.
【請求項3】 請求項1に記載の腫瘍関連抗原に由来することを特徴とする
、免疫原性タンパク質断片またはペプチド。
3. An immunogenic protein fragment or peptide derived from the tumor-associated antigen according to claim 1.
【請求項4】 液性免疫応答を起動する、請求項1〜3のいずれか1項に記
載の免疫原性(ポリ)ペプチド。
4. The immunogenic (poly) peptide according to claim 1, which elicits a humoral immune response.
【請求項5】 MHC分子によって提示され、かつ、細胞性免疫応答を起動す
ることを特徴とする請求項1〜3に記載の免疫原性(ポリ)ペプチドまたはその
分解産物。
5. The immunogenic (poly) peptide or a degradation product thereof according to claim 1, which is presented by an MHC molecule and activates a cellular immune response.
【請求項6】 配列番号34から58に記載のペプチドの群から選ばれる、請求
項5に記載の免疫原性ペプチド。
6. The immunogenic peptide according to claim 5, which is selected from the group of peptides set forth in SEQ ID NOs: 34 to 58.
【請求項7】 癌疾病のin vivoまたはex vivo免疫療法のための請求項1〜
6のいずれか1項に記載の免疫原性(ポリ)ペプチドであって、患者において9D7
を発現している腫瘍細胞に対する免疫応答を誘導する、前記(ポリ)ペプチド。
7. The method of claim 1 for in vivo or ex vivo immunotherapy of a cancer disease.
An immunogenic (poly) peptide according to any one of claims 6 to 9 wherein the patient has 9D7
(Poly) peptides that induce an immune response against tumor cells expressing
【請求項8】 活性成分として請求項1〜6のいずれか1項に記載の免疫原
性(ポリ)ペプチドを含むことを特徴とする、非経口投与、局所的投与、経口ま
たは部分投与のための医薬組成物。
8. Parenteral administration, topical administration, oral or partial administration, characterized in that it comprises the immunogenic (poly) peptide according to any one of claims 1 to 6 as an active ingredient. Pharmaceutical composition.
【請求項9】 9D7に由来する種々のペプチドを含むことを特徴とする請求
項8に記載の医薬組成物。
9. The pharmaceutical composition according to claim 8, comprising various peptides derived from 9D7.
【請求項10】 他の腫瘍関連抗原に由来するペプチドと混合された1以上
の9D7由来のペプチドを含むことを特徴とする、請求項9に記載の医薬組成物。
10. The pharmaceutical composition according to claim 9, comprising one or more peptides derived from 9D7 mixed with peptides derived from other tumor-associated antigens.
【請求項11】 ペプチドが少なくとも2種の異なるHLA型に結合することを
特徴とする、請求項9または10に記載の医薬組成物。
11. The pharmaceutical composition according to claim 9, wherein the peptide binds to at least two different HLA types.
【請求項12】 請求項1に記載の腫瘍関連抗原の免疫原性特性を有するタ
ンパク質またはその断片をコードする単離DNA分子。
12. An isolated DNA molecule encoding a protein having immunogenic properties of the tumor-associated antigen according to claim 1 or a fragment thereof.
【請求項13】 配列番号2に記載のアミノ酸配列を有する免疫原性ポリペ
プチド9D7、または、9D7に由来するタンパク質断片若しくはペプチドをコードす
る、請求項12に記載のDNA分子。
13. The DNA molecule according to claim 12, which encodes the immunogenic polypeptide 9D7 having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2, or a protein fragment or peptide derived from 9D7.
【請求項14】 配列番号1に記載の配列を有するポリヌクレオチドである
DNA分子若しくは配列番号1に記載の配列を有するポリヌクレオチドを含むDNA分
子、または、配列番号1に記載の配列を有するポリヌクレオチドとストリンジェ
ントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドであるDNA分子若しくは配
列番号1に記載の配列を有するポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下で
ハイブリダイズするポリヌクレオチドを含むDNA分子。
14. A polynucleotide having the sequence of SEQ ID NO: 1.
A DNA molecule comprising a DNA molecule or a polynucleotide having the sequence of SEQ ID NO: 1, or a DNA molecule or sequence that is a polynucleotide that hybridizes under stringent conditions to a polynucleotide having the sequence of SEQ ID NO: 1 A DNA molecule comprising a polynucleotide that hybridizes under stringent conditions to a polynucleotide having the sequence of No. 1.
【請求項15】 請求項12〜14のいずれか1項に記載のDNA分子を含む組
換えDNA分子。
15. A recombinant DNA molecule comprising the DNA molecule according to any one of claims 12 to 14.
【請求項16】 癌の免疫療法のための請求項12〜15のいずれか1項に
記載のDNA分子であって、前記DNA分子によって発現される9D7(ポリ)ペプチド
が患者において9D7を発現している腫瘍細胞に対する免疫応答を誘導するもので
ある、前記DNA分子。
16. The DNA molecule according to any one of claims 12 to 15 for immunotherapy of cancer, wherein the 9D7 (poly) peptide expressed by the DNA molecule expresses 9D7 in a patient. The DNA molecule that induces an immune response against the tumor cell in question.
【請求項17】 請求項1または2に記載の腫瘍関連抗原を発現している細
胞の癌ワクチン調製のための使用。
17. Use of a cell expressing the tumor-associated antigen according to claim 1 or 2 for the preparation of a cancer vaccine.
【請求項18】 請求項1〜6のいずれか1項に記載の(ポリ)ペプチドに
対する抗体。
18. An antibody against the (poly) peptide of any one of claims 1 to 6.
【請求項19】 モノクローナル抗体である、請求項18に記載の抗体。19. The antibody according to claim 18, which is a monoclonal antibody. 【請求項20】 9D7の発現と関連した癌の治療および診断のための請求項
18または19に記載の抗体。
20. The antibody according to claim 18 or 19, for treating and diagnosing cancer associated with 9D7 expression.
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