JP2016185150A

JP2016185150A - Ｔｉｍｐ１およびｔｉｍｐ２発現の調節

Info

Publication number: JP2016185150A
Application number: JP2016091639A
Authority: JP
Inventors: 洋司郎新津; Yoshiro Niitsu; 博一高橋; Hiroichi Takahashi; 康進田中; Yasuyuki Tanaka; ファインシュタイン，エレーナ; Feinstein Elena; アヴキン−ナフム，シャロン; Avkin-Nachum Sharon; カリンスキ，ハガール; Kalinski Hagar; メット，イゴール; Mett Igor
Original assignee: Nitto Denko Corp
Current assignee: Nitto Denko Corp
Priority date: 2010-09-30
Filing date: 2016-04-28
Publication date: 2016-10-27
Also published as: TW201249991A; WO2012044620A3; WO2012044620A2; US20120142754A1; KR20140012943A; RU2013107129A; JP2013543722A; CA2810825A1; US20160281083A1; AU2011307259A1; AU2016204214A1; EP2621502A4; US20130030034A9; EP2621502A2; CN103221055A

Abstract

【課題】標的遺伝子、特に組織メタロプロテイナーゼインヒビター１および組織メタロプロテイナーゼインヒビター２（それぞれ、ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２）の発現を調節するための組成物、方法およびキットを提供する。
【解決手段】ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２をコードする遺伝子、例えばヒトＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２をコードする遺伝子を調節する核酸分子（例えば短鎖干渉核酸（ｓｉＮＡ）、短鎖干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）、マイクロＲＮＡ（ｍｉＲＮＡ）または短鎖ヘアピンＲＮＡ（ｓｈＲＮＡ））を含んでいる組成物、方法およびキット。組成物および方法はまた、肝線維症、肺線維症、腹膜線維症および腎線維症を含む線維性疾患および障害を含むＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２に関連する病態および障害の処置に使用することができる。
【選択図】なし

Description

関連する特許出願
この出願は、「ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２発現の調節」という名称の、２０１０年９月３０日に出願された米国仮出願第61/388,572号の利益を主張し、その全体をあらゆる目的のために本明細書に援用する。

配列表
本出願は224 PCT1_ST25.txtと題する配列表を含み、２０１１年８月２４日に作成された、９１０ｋｂのサイズのそのASCIIコピーは、その全体を本明細書に援用する。

発明の分野
本明細書において提供されるのは、ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２の発現を調節するための組成物および方法である。

Sato, Y.らは、肝硬変ラット動物モデルへの、ヒト熱ショックタンパク質４７のラットホモログであるｇｐ４６に対する短鎖干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）を送達するための、ビタミンＡ結合リポソームの投与を開示している。Sato, Y., et al., Nature Biotechnology, vol. 26(4), p. 431-442 (2008)。

Chen, J-J.らは、ケロイド線維芽細胞の増殖を検討するために、ＨＳＰ−４７−ｓｈＲＮＡ（短鎖ヘアピンＲＮＡ）をヒトケロイドサンプルにトランスフェクションすることを開示している。Chen, J-J., et al., British Journal of Dermatology, vol. 156, p. 1188-1195 (2007)。

ＰＣＴ特許公開WO 2006/068232は、レチノイド誘導体および／またはビタミンＡアナログを含む星細胞特異的薬物担体を開示している。

ＰＣＴ特許公開WO 2008/104978およびWO 2007/091269は、ｓｉＲＮＡ構造および組成物を開示している。

ＰＣＴ特許公開WO 2011/072082は、ＨＳＰ４７（ＳＥＲＰＩＮＨ１）を標的とする二本鎖ＲＮＡ化合物を開示している。

標的遺伝子の発現を調節するための組成物、方法およびキットが、本明細書において提供される。様々な側面および態様において、本明細書において提供される組成物、方法およびキットは、それぞれＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２としても知られる、組織メタロプロテアーゼインヒビター１および組織メタロプロテアーゼインヒビター２の発現を調節する。本組成物、方法およびキットは、ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２をコードするヌクレオチド配列（ｍＲＮＡ配列など）、例えば配列番号１によって例示されるヒトＴＩＭＰ１および配列番号２によって例示されるヒトＴＩＭＰ２のためのｍＲＮＡコード配列を結合する核酸分子（例えば短鎖干渉核酸（ｓｉＮＡ）、短鎖干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）、二本鎖（double-stranded）ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）、マイクロＲＮＡ（ｍｉＲＮＡ）または短鎖ヘアピンＲＮＡ（ｓｈＲＮＡ））の使用を伴い得る。特定の好ましい態様において、本明細書で開示される組成物、方法およびキットは、ＴＩＭＰ１またはＴＩＭＰ２の発現を阻害する。例えば、ＴＩＭＰ１またはＴＩＭＰ２の発現を下方調節するか、低減するか、阻害するｓｉＮＡ分子（例えばＲＩＳＣ長ｄｓＮＡ分子またはダイサー長ｄｓＮＡ分子）が提供される。また、脳、皮膚線維症、肺線維症、肝線維症、腎線維症、心線維症、脈管線維症、骨髄線維症、眼線維症、腸の線維症、声帯線維症または他の線維症のうちの少なくとも１つに関連する臓器特異的線維症を含む、ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２に関連する疾患、状態または障害を処置および／または予防するための組成物、方法およびキットも提供される。具体的な適応症としては、肝線維症、肝硬変、間質性肺線維症（ＩＬＦ）を含む肺の線維症、任意の状態（例えばＥＳＲＤを含むＣＫＤ）に起因する腎線維症、腹膜線維症、慢性肝損傷、原線維形成、他の臓器における線維性疾患、偶発的および医原性（手術）の全ての可能な種類の皮膚損傷に関連する異常な瘢痕化（ケロイド）、強皮症、心線維症、緑内障濾過手術の失敗、脳梗塞に関連する脳線維化、ならびに腸管癒着症およびクローン病などが挙げられる。本化合物は、下表Ｉに示すものを含む、臓器特異的適応症を処置するのに有用である。

一側面において、核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）であって、（ａ）該核酸分子はセンス鎖（パッセンジャー鎖）とアンチセンス鎖（ガイド鎖）とを含み、（ｂ）該核酸分子の各々の鎖は、独立して１５〜４９ヌクレオチドの長さであり、（ｃ）アンチセンス鎖の１５〜４９ヌクレオチドの配列は、ヒトＴＩＭＰをコードするｍＲＮＡの配列（例えば、配列番号１または配列番号２）に相補的であり、かつ（ｄ）センス鎖の１５〜４９ヌクレオチドの配列はアンチセンス鎖の配列に相補的であり、ヒトＴＩＭＰ１またはＴＩＭＰ２をコードするｍＲＮＡ（それぞれ、例えば、配列番号１または配列番号２）の１５〜４９ヌクレオチドの配列を含む、核酸分子が提供される。種々の態様において、センス鎖とアンチセンス鎖とは、１５〜４９の塩基対二重鎖を形成する。

特定の態様において、ヒトＴＩＭＰ１をコードするｍＲＮＡの配列に相補的なアンチセンス鎖の配列は、配列番号１のヌクレオチド１９３〜８１３または１〜１９２、または８１３〜８９３の間、あるいは配列番号１のヌクレオチド１〜２００、または８００〜８９３ヌクレオチドの間の配列に相補的な配列を含む。

特定の態様において、アンチセンスの配列は、表Ａ１〜Ａ８またはＣのいずれかに記載のアンチセンス配列を含む。好ましい態様において、アンチセンスの配列は、表Ａ３、Ａ４、Ａ７、Ａ８またはＣに記載のアンチセンス配列を含む。一部の態様において、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、表Ａ３または表Ａ４に記載の配列のペアから選択される。一部の態様において、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、表Ａ７または表Ａ８に記載の配列のペアから選択される。一部の態様において、アンチセンス鎖およびセンス鎖は表Ｃに記載の配列のペアから選択される。

特定の態様において、ヒトＴＩＭＰ２をコードするｍＲＮＡの配列に相補的なアンチセンス鎖の配列は、配列番号２のヌクレオチド３０３〜９６２または１〜３０３、または９６２〜３３６９の間、または配列番号２のヌクレオチド１〜３５０、または９５０〜３３６９の間の配列に相補的な配列を含む。

特定の態様において、アンチセンスの配列は、表Ｂ１〜Ｂ８またはＤのいずれかに記載のアンチセンス配列を含む、好ましい態様において、アンチセンスの配列は、表Ｂ３、Ｂ４、Ｂ７、Ｂ８、Ｄに記載のアンチセンス配列を含む。一部の態様において、アンチセンス鎖およびセンス鎖は表Ｂ３または表Ｂ４に記載の配列のペアから選択される。一部の態様において、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、表Ｂ７または表Ｂ８に記載の配列のペアから選択される。一部の態様において、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、表Ｄに記載の配列のペアから選択される。

一部の態様において、アンチセンス鎖は、配列番号１のヌクレオチド３５５〜３７３もしくはその部分、または配列番号１のヌクレオチド６２０〜６３８もしくはその部分、または配列番号１のヌクレオチド６４０〜６５８もしくはその部分に一致する、ヒトＴＩＭＰ１をコードするｍＲＮＡの配列に相補的な配列を含む。

一部の態様において、アンチセンス鎖は、配列番号２のヌクレオチド４２１〜４３９もしくはその部分、または配列番号２のヌクレオチド５０２〜５２０もしくはその部分、または配列番号２のヌクレオチド５２３〜５４１もしくはその部分、または配列番号２のヌクレオチド６２５〜６４３もしくはその部分、または配列番号２のヌクレオチド６２９〜６４７もしくはその部分に一致する、ヒトＴＩＭＰ２をコードするｍＲＮＡの配列に相補的な配列を含む。

一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖は、表Ａ１またはＡ５に示すアンチセンス配列のいずれかに一致する配列を含む。特定の好ましい態様において、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、表Ａ１に示す配列のペアから選択される。特定の好ましい態様において、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、表Ａ５に示す配列のペアから選択される。一部の態様において、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、表Ａ１または表Ａ５に示す配列のペアから選択される。

特定の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖は、表Ｃに示すアンチセンス配列のいずれかに一致する配列を含む。

本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）の種々の態様において、アンチセンス鎖は長さが１５〜４９ヌクレオチド（例えば長さが１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８または４９ヌクレオチド）、または長さが１７〜３５ヌクレオチド、または長さが１７〜３０ヌクレオチド、または長さが１５〜２５ヌクレオチド、または長さが１８〜２５ヌクレオチド、または長さが１８〜２３ヌクレオチド、または長さが１９〜２１ヌクレオチド、または長さが２５〜３０ヌクレオチド、または長さが２６〜２８ヌクレオチドであってもよい。同様に、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のセンス鎖は、長さが１５〜４９ヌクレオチド（例えば長さが１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８または４９ヌクレオチド）、または長さが１７〜３５ヌクレオチド、または長さが１７〜３０ヌクレオチド、または長さが１５〜２５ヌクレオチド、または長さが１８〜２５ヌクレオチド、または長さが１８〜２３ヌクレオチド、または長さが１９〜２１ヌクレオチド、または長さが２５〜３０ヌクレオチド、または長さが２６〜２８ヌクレオチドであってもよい。本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）の二重鎖（duplex）領域は、長さが１５〜４９ヌクレオチド（例えば、長さが約１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８または４９ヌクレオチド）、長さが１８〜４０ヌクレオチド、または長さが１５〜３５ヌクレオチド、または長さが１５〜３０ヌクレオチド、または長さが約１５〜２５ヌクレオチド、または長さが１７〜２５ヌクレオチド、または長さが１７〜２３ヌクレオチド、または長さが１７〜２１ヌクレオチド、または長さが１９〜２１ヌクレオチド、または長さが２５〜３０ヌクレオチド、または長さが２５〜２８ヌクレオチドであってもよい。一部の態様において、核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）の二重鎖領域は長さが１９ヌクレオチドであってもよい。

特定の態様において、本明細書において提供される核酸（例えばｓｉＮＡ核酸分子）のセンス鎖およびアンチセンス鎖は、別々のポリヌクレオチド鎖である。一部の態様において、別々のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、水素結合、例えばワトソン−クリック型塩基対形成を介して、二本鎖構造を形成する。一部の態様において、センス鎖およびアンチセンス鎖は、互いに共有結合的に連結された２つの別々の鎖である。他の態様において、センス鎖およびアンチセンス鎖は、センス領域およびアンチセンス領域を有する単一のポリヌクレオチド鎖の一部であり、いくつかの好ましい態様において、ポリヌクレオチド鎖は、ヘアピン構造を有する。

特定の態様において、核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、オーバーハングに関して対称な二本鎖核酸（ｄｓＮＡ）分子であり、両端に平滑末端を有する。他の態様において、核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、オーバーハングに関して対称なｄｓＮＡ分子であり、ｄｓＮＡ分子の両端にオーバーハングを有し、好ましくは、分子は、１、２、３、４、５、６、７または８ヌクレオチドのオーバーハングを有し、好ましくは、分子は２ヌクレオチドのオーバーハングを有する。一部の態様において、オーバーハングは５’オーバーハングであり、代替的な態様において、オーバーハングは３’オーバーハングである。一部の態様において、オーバーハングヌクレオチドは、本明細書に開示される修飾で修飾されている。いくつかの態様において、オーバーハングヌクレオチドは、２’−デオキシリボヌクレオチドである。

一部の態様において、分子は、センスおよび／またはアンチセンス鎖の５’または３’末端の１または２以上に非ヌクレオチドオーバーハングを含む。かかる非ヌクレオチドオーバーハングは、無塩基（abasic）リボヌクレオチド部分および無塩基デオキシリボヌクレオチド部分、Ｃ３−Ｃ３部分を包含するアルキル部分、およびアミノ炭素鎖（amino carbon chains）を包含する。

特定の好ましい態様において、核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、オーバーハングに関して非対称なｄｓＮＡ分子であり、分子の一端に平滑末端を有し、分子の他端にオーバーハングを有する。特定の態様において、オーバーハングは１、２、３、４、５、６、７または８ヌクレオチドであり、好ましくは、オーバーハングは２ヌクレオチドである。一部の好ましい態様において、非対称なｄｓＮＡ分子は、センス鎖に存在する二重鎖の一方の側に３’オーバーハング（例えば２ヌクレオチドの３’オーバーハング）を、分子の他方の側に平滑末端を有する。一部の好ましい態様において、非対称ｄｓＮＡ分子は、センス鎖に存在する二重鎖の一方の側に、５’オーバーハング（例えば２ヌクレオチドの５’オーバーハング）を、分子の他方の側に平滑末端を有する。他の好ましい態様において、非対称ｄｓＮＡ分子は、アンチセンス鎖に存在する二重鎖の一方の側に、３’オーバーハング（例えば２ヌクレオチドの３’オーバーハング）を、分子の他方の側に平滑末端を有する。一部の好ましい態様において、非対称ｄｓＮＡ分子は、アンチセンス鎖に存在する二重鎖の一方の側に、５’オーバーハング（例えば２ヌクレオチドの５’オーバーハング）を、分子の他方の側に平滑末端を有する。特定の好ましい態様において、オーバーハングは２’−デオキシリボヌクレオチドである。末端ｄＴｄＴを有するｓｉＮＡ化合物の例は、下表ＣおよびＤに含まれている。

一部の態様において、核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、一端がループ構造であり、他端が平滑末端であるヘアピン構造（１つのポリヌクレオチドにセンス鎖とアンチセンス鎖を有する）を有する。一部の態様において、核酸分子は、一端がループ構造であり、他端がオーバーハング末端である（例えば１、２、３、４、５、６、７または８ヌクレオチドのオーバーハング）ヘアピン構造を有し、特定の態様において、オーバーハングは３’オーバーハングであり、特定の態様において、オーバーハングは５’オーバーハングであり、特定の態様において、オーバーハングはセンス鎖にあり、特定の態様において、オーバーハングはアンチセンス鎖にある。

本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、本明細書に記載の１または２以上の修飾または修飾ヌクレオチドを含んでもよい。例えば、本明細書において提供される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、修飾糖を有する修飾ヌクレオチド、修飾核酸塩基を有する修飾ヌクレオチド、または修飾リン酸基を有する修飾ヌクレオチドを含んでもよい。同様に、本明細書において提供される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、修飾ホスホジエステル骨格を含んでもよく、かつ／または、修飾末端リン酸基を含んでもよい。

提供される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、例えば本明細書に記載のような、修飾糖部分を含む１個または２個以上のヌクレオチドを有してもよい。一部の好ましい態様において、修飾糖部分は、２’−Ｏ−メチル、２’−メトキシエトキシ、２’−デオキシ、２’−フルオロ、２’−アリル、２’−Ｏ−［２−（メチルアミノ）−２−オキソエチル］、４’チオ、４’−（ＣＨ_２）_２−Ｏ−２’架橋、２’ロックド核酸、および２’−Ｏ−（Ｎ−メチルカルバメート）からなる群から選択される。

提供される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、例えば本明細書に記載の１または２以上の修飾核酸塩基を有してもよく、これは好ましくは、キサンチン、ヒポキサンチン、２−アミノアデニン、アデニンおよびグアニンの６−メチルおよび他のアルキル誘導体、アデニンおよびグアニンの２−プロピルおよび他のアルキル誘導体、５−ハロウラシルおよび５−ハロシトシン、５−プロピニルウラシルおよび５−プロピニルシトシン、６−アゾウラシル、６−アゾシトシンおよび６−アゾチミン、５−ウラシル（シュードウラシル）、４−チオウラシル、８−ハロ、アミノ、チオール、チオアルキル、ヒドロキシおよび他の８−置換アデニンおよびグアニン、５−トリフルオロメチルおよび他の５−置換ウラシルおよびシトシン、７−メチルグアニンおよびアシクロヌクレオチドからなる群から選択されるものであってもよい。

提供される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、ホスホジエステル骨格への１または２以上の修飾（例えば、本明細書に記載のもの）を有してもよい。一部の好ましい態様において、ホスホジエステル結合は、ホスホジエステル結合を、ホスホロチオエート、３’−（または−５’）デオキシ−３’−（または−５’）チオ−ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、ホスホロセレネート、３’−（または−５’）デオキシホスフィネート、ボラノホスフェート、３’−（または−５’）デオキシ−３’−（または５’−）アミノホスホルアミデート、水素ホスホネート、ボラノリン酸エステル、ホスホルアミデート、アルキルまたはアリールホスホネートおよびホスホトリエステルまたはリン結合で置換することにより修飾されている。

種々の態様において、提供される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、１または２以上の修飾をアンチセンス鎖ではなくセンス鎖に含んでもよく、他の態様において、提供される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、１または２以上の修飾をセンス鎖ではなくアンチセンス鎖に含み、さらの他の態様において、提供される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、１または２以上の修飾をセンス鎖およびアンチセンス鎖の両方に含む。

提供される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）が修飾を有する一部の態様において、センス鎖は修飾ヌクレオチドと非修飾ヌクレオチドとが交互するパターンを含み、かつ／または、アンチセンス鎖は修飾ヌクレオチドと非修飾ヌクレオチドとが交互するパターンを含む。かかる態様の一部の好ましいバージョンにおいて、修飾は２’−Ｏ−メチル（２’メトキシまたは２’ＯＭｅ）糖部分である。修飾ヌクレオチドと非修飾ヌクレオチドとが交互するパターンは、一方の鎖の５’末端または３’末端の修飾ヌクレオチドから始まってもよい。例えば、修飾ヌクレオチドと非修飾ヌクレオチドとが交互するパターンは、センス鎖の５’末端または３’末端の修飾ヌクレオチドから始まってもよく、かつ／または、修飾ヌクレオチドと非修飾ヌクレオチドとが交互するパターンは、アンチセンス鎖の５’末端または３’末端の修飾ヌクレオチドから始まってもよい。アンチセンス鎖およびセンス鎖の両方が修飾ヌクレオチドが交互するパターンを含む場合、修飾ヌクレオチドのパターンは、センス鎖の修飾ヌクレオチドがアンチセンス鎖の修飾ヌクレオチドに対向するように構成されてもよく、または、センス鎖の修飾ヌクレオチドがアンチセンス鎖の非修飾ヌクレオチドに対向するか、センス鎖の非修飾ヌクレオチドがアンチセンス鎖の修飾ヌクレオチドに対向するといったように、パターンに位相シフトがあってもよい。

本明細書において提供される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、センスおよび／またはアンチセンス鎖の３’末端に１〜３個（すなわち１、２または３個）のデオキシリボヌクレオチドを含んでもよい。

本明細書において提供される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、センス鎖および／またはアンチセンス鎖の５’末端にリン酸基を含んでもよい。

一側面において、構造（Ａ１）：
（Ａ１）５’ （Ｎ）ｘ−Ｚ３’（アンチセンス鎖）
３’ Ｚ’−（Ｎ’）ｙ−ｚ’’ ５’（センス鎖）
を有する二本鎖核酸分子が提供され、
ここで、各々のＮおよびＮ’は非修飾であっても、修飾されていてもよいヌクレオチドであるか、非定型部分（unconventional moiety）であり、
各々の（Ｎ）ｘおよび（Ｎ’）ｙは、各々の連続するＮまたはＮ’が次のＮまたはＮ’に共有結合的に連結されたオリゴヌクレオチドであり、
各々のＺおよびＺ’は、独立して、存在するか、不在であるが、存在する場合は、独立して、それが存在する鎖の３’末端に共有結合的に付着した１〜５個の連続したヌクレオチドまたは非ヌクレオチド部分またはその組合せを含み、
ｚ’’は存在しても、または不在であってもよいが、存在する場合は、（Ｎ’）ｙの５’末端に共有結合的に付着したキャッピング部分であり、
ｘおよびｙの各々は、独立して１８〜４０の間の整数であり、
（Ｎ’）ｙの配列は、（Ｎ）ｘの配列に相補性を有し、（Ｎ）ｘは、配列番号１または配列番号２に対するアンチセンス配列を含む。

一部の態様において、（Ｎ）ｘは、配列番号１に対するアンチセンス配列を含む。一部の態様において、（Ｎ）ｘは、表Ａ１、Ａ２、Ａ３またはＡ４のいずれかに存在するアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む。他の態様において、（Ｎ）ｘは、表Ａ３またはＡ４に存在するアンチセンスオリゴヌクレオチドから選択される。

特定の好ましい態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖は、表Ａ１に示されるアンチセンス配列のいずれかに一致する配列を含む。特定の好ましい態様において、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、表Ａ２に示される配列のペアから選択される。特定の好ましい態様において、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、２以上の種（ヒトおよび少なくとも１つの他の種）で活性を有し、表Ａ２に示される配列のペアから選択される。特定の好ましい態様において、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、表Ａ３、好ましくは表Ａ４に示される配列のペアから選択される。一部の態様において、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、下表Ａ３に示される、二重鎖ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ２、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ６、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１４、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１６、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１７、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１９、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ２０、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ２１、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ２３、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ２４、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ２７、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ２９、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ３１、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ３３、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ３８、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ４２、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ４３、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ４５、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ４９、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ６０、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ７１、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ７３、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ７７、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ７８、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ７９、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ８５、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ８９、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ９１、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ９６、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ９８、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ９９およびｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１０８に記載の配列のペアから選択される。

一部の態様において、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、下表Ａ４に示される、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ２（配列番号２６７および２９９）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ６（配列番号２６８および３００）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１４（配列番号２６９および３０１）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１６（配列番号２７０および３０２）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１７（配列番号２７１および３０３）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１９（配列番号２７２および３０４）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ２０（配列番号２７３および３０５）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ２１（配列番号２７４および３０６）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ２３（配列番号２７５および３０７）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ２９（配列番号２７８および３１０）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ３３（配列番号２８０および３１２）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ３８（配列番号２８１および３１３）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ４２（配列番号２８２および３１４）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ４３（配列番号２８３および３１５）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ４５（配列番号２８４および３１６）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ６０（配列番号２８６および３１８）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ７１（配列番号２８７および３１９）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ７３（配列番号２８８および３２０）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ７８（配列番号２９０および３２２）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ７９（配列番号２９１および３２３）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ８５（配列番号２９２および３２４）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ８９（配列番号２９３および３２５）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ９１（配列番号２９４および３２６）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ９６（配列番号２９５および３２７）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ９８（配列番号２９６および３２８）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ９９（配列番号２９７および３２９）およびｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１０８（配列番号２９８および３３０）に記載の配列のペアから選択される。

一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ２（配列番号２６７および２９９）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ６（配列番号２６８および３００）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１４（配列番号２６９および３０１）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１６（配列番号２７０および３０２）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１７（配列番号２７１および３０３）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１９（配列番号２７２および３０４）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ２０（配列番号２７３および３０５）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ２１（配列番号２７４および３０６）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ２３（配列番号２７５および３０７）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ２９（２７８および３１０）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ３３（配列番号２８０および３１２）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ３８（配列番号２８１および３１３）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ４２（配列番号２８２および３１４）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ４３（配列番号２８３および３１５）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ４５（配列番号２８４および３１６）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ６０（配列番号２８６および３１８）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ７１（配列番号２８７および３１９）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ７３（配列番号２８８および３２０）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ７８（配列番号２９０および３２２）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ７９（配列番号２９１および３２３）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ８５（配列番号２９２および３２４）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ８９（配列番号２９３および３２５）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ９１（配列番号２９４および３２６）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ９６（配列番号２９５および３２７）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ９８（配列番号２９６および３２８）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ９９（配列番号２９７および３２９）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、表Ａ４に示されるｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１０８（配列番号２９８および３３０）に記載の配列のペアを含む。

一部の好ましい態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ２（配列番号２６７および２９９）に記載の配列のペアのアンチセンス鎖およびセンス鎖を含む。一部の好ましい態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ６（配列番号２６８および３００）に記載の配列のペアのアンチセンス鎖およびセンス鎖を含む。一部の好ましい態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１６（配列番号２７０および３０２）に記載の配列のペアのアンチセンス鎖およびセンス鎖を含む。一部の好ましい態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１７（配列番号２７１および３０３）に記載の配列のペアのアンチセンス鎖およびセンス鎖を含む。一部の好ましい態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１９（配列番号２７２および３０４）に記載の配列のペアのアンチセンス鎖およびセンス鎖を含む。一部の好ましい態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ２０（配列番号２７３および３０５）に記載の配列のペアのアンチセンス鎖およびセンス鎖を含む。一部の好ましい態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ２１（配列番号２７４および３０６）に記載の配列のペアのアンチセンス鎖およびセンス鎖を含む。一部の好ましい態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ３８（配列番号２８１および３１３）に記載の配列のペアのアンチセンス鎖およびセンス鎖を含む。

一部の態様において（Ｎ）ｘは、配列番号２に対するアンチセンス配列を含む。一部の態様において、（Ｎ）ｘは、表Ｂ１、Ｂ２、Ｂ３またはＢ４のいずれかに存在するアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む。他の態様において、（Ｎ）ｘは、表Ｂ３またはＢ４に存在するアンチセンスオリゴヌクレオチドから選択される。

特定の好ましい態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖は、表Ｂ１に示されるアンチセンス配列のいずれかに一致する配列を含む。特定の好ましい態様において、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、表Ｂ２に示される配列のペアから選択される。特定の好ましい態様において、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、２以上の種（ヒトおよび少なくとも１つの他の種）で活性を有し、表Ｂ２に示される配列のペアから選択される。特定の好ましい態様において、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、表Ｂ３、好ましくは表Ｂ４に示される配列のペアから選択される。

一部の態様において、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、下表Ｂ３に示される、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ４、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ１６、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ１７、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ１８、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ２０、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ２４、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ２５、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ２７、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ２９、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ３０、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ３３、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ３５、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ３７、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ３８、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ３９、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ４０、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ４１、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ４４、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ４６、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ５１、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ５５、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ６１、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ６２、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ６４、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ６５、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ６７、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ６８、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ６９、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ７１、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ７５、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ７６、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ７８、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ７９、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ８２、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ８３、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ８４、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ８５、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ８６、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ８７、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ８８、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ８９、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ９０、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ９１、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ９２、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ９３、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ９４、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ９５、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ９６、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ９７、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ９８、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ９９、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ１００、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ１０１およびｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ１０２に記載の配列のペアから選択される。

一部の態様において、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、下表Ｂ４に示される、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ２７（配列番号２４７８および２５３１）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ２９（配列番号２４７９および２５３２）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ３０（配列番号２４８０および２５３３）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ３９（配列番号２４８５および２５３８）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ４０（配列番号２４８６および２５３９）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ４１（配列番号２４８７および２５４０）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ４６（配列番号２４８９および２５４２）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ５５（配列番号２４９１および２５４４）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ６２（配列番号２４９３および２５４６）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ６８（配列番号２４９７および２５５０）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ６９（配列番号２４９８および２５５１）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ７１（配列番号２４９９および２５５２）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ７６（配列番号２５０１および２５５４）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ７８（配列番号２５０２および２５５５）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ８９（配列番号２５１１および２５６４）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ９１（配列番号２５１３および２５６６）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ９３（配列番号２５１５および２５６８）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ９５（配列番号２５１７および２５７０）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ９７（配列番号２５１９および２５７２）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ９８（配列番号２５２０および２５７３）およびｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ１００（配列番号２５２２および２５７５）に記載の配列のペアから選択される。

一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ２７（配列番号２４７８および２５３１）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ２９（配列番号２４７９および２５３２）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ３０（配列番号２４８０および２５３３）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ３９（配列番号２４８５および２５３８）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ４０（配列番号２４８６および２５３９）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ４１（配列番号２４８７および２５４０）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ４６（配列番号２４８９および２５４２）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ５５（配列番号２４９１および２５４４）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ６２（配列番号２４９３および２５４６）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ６８（配列番号２４９７および２５５０）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ６９（配列番号２４９８および２５５１）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ７１（配列番号２４９９および２５５２）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ７６（配列番号２５０１および２５５４）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ７８（配列番号２５０２および２５５５）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ８９（配列番号２５１１および２５６４）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ９１（配列番号２５１３および２５６６）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ９３（配列番号２５１５および２５６８）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ９５（配列番号２５１７および２５７０）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ９７（配列番号２５１９および２５７２）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ９８（配列番号２５２０および２５７３）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ１００（配列番号２５２２および２５７５）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ１０２（配列番号１００７および１６２２）に記載の配列のペアを含む。

一部の態様において、各々の連続するＮまたはＮ’を連結する共有結合は、ホスホジエステル結合である。

一部の態様において、ｘ＝ｙであり、ｘおよびｙの各々は、１９、２０、２１、２２または２３である。種々の態様において、ｘ＝ｙ＝１９である。一部の態様において、アンチセンス鎖とセンス鎖とは、塩基対合によって二重鎖を形成する。

一態様によれば、下記の構造：
（Ａ２）５’ Ｎ１−（Ｎ）ｘ−Ｚ３’（アンチセンス鎖）
３’ Ｚ−Ｎ２−（Ｎ’）ｙ−ｚ’’ ５’（センス鎖）
を有する修飾核酸分子が提供され、
ここで、Ｎ２、ＮおよびＮ’の各々は、独立して、非修飾ヌクレオチドまたは修飾ヌクレオチドまたは非定型部分であり、
（Ｎ）ｘおよび（Ｎ’）ｙの各々は、各々の連続するＮまたはＮ’が、隣接するＮまたはＮ’に共有結合によって連結したオリゴヌクレオチドであり、
ｘおよびｙの各々は、独立して１７〜３９の間の整数であり、
（Ｎ’）ｙの配列は（Ｎ）ｘの配列に相補性を有し、（Ｎ）ｘは、配列番号１および配列番号２から選択される標的ｍＲＮＡの連続する配列に相補性を有し、
Ｎ１は（Ｎ）ｘに共有結合的に結合しており、配列番号１または配列番号２に対してミスマッチであり、
Ｎ１は、ウリジン、修飾ウリジン、リボチミジン、修飾リボチミジン、デオキシリボチミジン、修飾デオキシリボチミジン、リボアデニン、修飾リボアデニン、デオキリボアデニンまたは修飾デオキリボアデニンからなる群から選択される部分であり、
Ｎ１とＮ２とは、塩基対を形成し、
ＺおよびＺ’の各々は、独立して、存在するか、または不在であるが、存在する場合は、独立して、それが存在する鎖の３’末端に共有結合的に付着した、１〜５個の連続するヌクレオチド、非ヌクレオチド部分またはその組合せであり、および
ｚ’’は存在しても、または不在であってもよいが、存在する場合は（Ｎ’）ｙの５’末端に共有結合的に付着したキャッピング部分である。

構造Ａ２の記載によってカバーされる分子はまた、本明細書中で「１８＋１」または「１８＋１ｍｅｒ」とも称する。一部の態様において、ｄｓＲＮＡ化合物を形成するのに有用なＮ２−（Ｎ’）ｙおよびＮ１−（Ｎ）ｘオリゴヌクレオチド鎖は、表Ａ５、Ａ６、Ａ７、Ａ８、Ｂ５、Ｂ６、Ｂ７またはＢ８に提示される。一部の態様において、（Ｎ）ｘは、配列番号１（ヒトＴＩＭＰ１ｍＲＮＡ）の連続する配列に相補性を有する。一部の態様において（Ｎ）ｘは、表Ａ５、Ａ６、Ａ７およびＡ８のいずれかに存在するアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む。一部の態様において、ｘ＝ｙ＝１８であり、Ｎ１−（Ｎ）ｘは、表Ａ３またはＡ４のいずれかに存在するアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む。一部の態様において、ｘ＝ｙ＝１９またはｘ＝ｙ＝２０である。特定の好ましい態様において、ｘ＝ｙ＝１８である。

特定の好ましい態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖は、表Ａ５に示されるアンチセンス配列のいずれかに一致する配列を含む。特定の好ましい態様において、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、表Ａ６に示される配列のペアから選択される。特定の好ましい態様において、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、２以上の種（ヒトおよび少なくとも１つの他の種）で活性を有し、表Ａ６に示される配列のペアから選択される。特定の好ましい態様において、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、表Ａ７、好ましくは表Ａ８に示される配列のペアから選択される。

一部の態様において、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、下表Ａ７に示される、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ３、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ４、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ５、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ７、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ８、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ９、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１０、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１１、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１２、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１３、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１５、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１８、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ２２、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ２５、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ２６、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ２８、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ３０、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ３２、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ３４、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ３５、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ３６、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ３７、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ３９、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ４０、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ４１、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ４４、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ４６、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ４７、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ４８、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ５０、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ５１、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ５２、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ５３、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ５４、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ５５、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ５６、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ５７、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ５８、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ５９、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ６１、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ６２、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ６３、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ６４、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ６５、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ６６、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ６７、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ６８、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ６９、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ７０、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ７２、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ７４、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ７５、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ７６、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ８０、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ８１、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ８２、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ８３、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ８４、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ８６、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ８７、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ８８、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ９０、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ９２、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ９３、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ９４、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ９５、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ９７、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１００、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１０１、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１０２、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１０３、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１０４、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１０５、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１０６、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１０９、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１１０、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１１１、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１１２、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１１３およびｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１１４に記載の配列のペアから選択される。

一部の態様において、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、下表Ａ８に示される、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１（配列番号８４５および９２６）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ４（配列番号８４７および９２８）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ５（配列番号８４８および９２９）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ７（配列番号８４９および９３０）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ８（配列番号８５０および９３１）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ９（配列番号８５０および９３１）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１０（配列番号８５２および９３３）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１１（配列番号８５３および９３４）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１２（配列番号８５４および９３５）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１３（配列番号８５５および９３６）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１５（配列番号８５６および９３７）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１８（配列番号８５７および９３８）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ２２（配列番号８５８および９３９）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ２６（配列番号８６０および９４１）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ３６（配列番号８６６および９４７）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ３７（配列番号８６７および９４８）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ３９（配列番号８６８および９４９）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ４０（配列番号８６９および９５０）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ４１（配列番号８７０および９５１）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ４４（配列番号８７１および９５２）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ４７（配列番号８７３および９５４）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ４８（配列番号８７４および９５５）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ５０（配列番号８７５および９５６）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ５１（配列番号８７６および９５７）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ５２（配列番号８７７および９５８）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ５５（配列番号８８０および９６１）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ５６（配列番号８８１および９６２）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ５８（配列番号８８３および９６４）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ６１（配列番号８８５および９６６）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ６４（配列番号８８８および９６９）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ６６（配列番号８９０および９７１）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ６８（配列番号８９２および９７３）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ７０（配列番号８９４および９７５）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ７５（配列番号８９７および９７８）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ８３（配列番号９０２および９８３）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ８６（配列番号９０４および９８５）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ８８（配列番号９０６および９８７）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ９２（配列番号９０８および９８９）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ９３（配列番号９０９および９９０）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ９５（配列番号９１１および９９２）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ９７（配列番号９１２および９９３）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１０２（配列番号９１５および９９６）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１０４（配列番号９１７および９９８）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１０５（配列番号９１８および９９９）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１０６（配列番号９１９および１０００）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１１０（配列番号９２１および１００２）およびｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１１２（配列番号９２３および１００４）に記載の配列のペアから選択される。

一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１（配列番号８４５および９２６）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ４（配列番号８４７および９２８）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ５（配列番号８４８および９２９）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ７（配列番号８４９および９３０）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ８（配列番号８５０および９３１）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ９（配列番号８５０および９３１）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１０（配列番号８５２および９３３）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１１（配列番号８５３および９３４）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１２（配列番号８５４および９３５）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１３（配列番号８５５および９３６）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１５（配列番号８５６および９３７）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１８（配列番号８５７および９３８）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ２２（配列番号８５８および９３９）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ２６（配列番号８６０および９４１）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ３６（配列番号８６６および９４７）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ３７（配列番号８６７および９４８）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ３９（配列番号８６８および９４９）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ４０（配列番号８６９および９５０）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ４１（配列番号８７０および９５１）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ４４（配列番号８７１および９５２）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ４７（配列番号８７３および９５４）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ４８（配列番号８７４および９５５）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ５０（配列番号８７５および９５６）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ５１（配列番号８７６および９５７）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ５２（配列番号８７７および９５８）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ５５（配列番号８８０および９６１）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ５６（配列番号８８１および９６２）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ５８（配列番号８８３および９６４）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ６１（配列番号８８５および９６６）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ６４（配列番号８８８および９６９）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ６６（配列番号８９０および９７１）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ６８（配列番号８９２および９７３）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ７０（配列番号８９４および９７５）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ７５（配列番号８９７および９７８）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ８３（配列番号９０２および９８３）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ８６（配列番号９０４および９８５）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ８８（配列番号９０６および９８７）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ９２（配列番号９０８および９８９）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ９３（配列番号９０９および９９０）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ９５（配列番号９１１および９９２）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ９７（配列番号９１２および９９３）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１０２（配列番号９１５および９９６）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１０４（配列番号９１７および９９８）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１０５（配列番号９１８および９９９）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１０６（配列番号９１９および１０００）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１１０（配列番号９２１および１００２）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１１２（配列番号９２３および１００４）に記載の配列のペアを含む。

一部の好ましい態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１（配列番号８４５および９２６）に記載の配列のペアのアンチセンス鎖およびセンス鎖を含む。一部の好ましい態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ４（配列番号８４７および９２８）に記載の配列のペアのアンチセンス鎖およびセンス鎖を含む。一部の好ましい態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ５（配列番号８４８および９２９）に記載の配列のペアのアンチセンス鎖およびセンス鎖を含む。一部の好ましい態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ７（配列番号８４９および９３０）に記載の配列のペアのアンチセンス鎖およびセンス鎖を含む。一部の好ましい態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ９（配列番号８５０および９３１）に記載の配列のペアのアンチセンス鎖およびセンス鎖を含む。一部の好ましい態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１０（配列番号８５２および９３３）に記載の配列のペアのアンチセンス鎖およびセンス鎖を含む。一部の好ましい態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１１（配列番号８５３および９３４）に記載の配列のペアのアンチセンス鎖およびセンス鎖を含む。一部の好ましい態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１２（配列番号８５４および９３５）に記載の配列のペアのアンチセンス鎖およびセンス鎖を含む。一部の好ましい態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１３（配列番号８５５および９３６）に記載の配列のペアのアンチセンス鎖およびセンス鎖を含む。一部の好ましい態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１５（配列番号８５６および９３７）に記載の配列のペアのアンチセンス鎖およびセンス鎖を含む。一部の好ましい態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１８（配列番号８５７および９３８）に記載の配列のペアのアンチセンス鎖およびセンス鎖を含む。一部の好ましい態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ４４（配列番号８７１および９５２）に記載の配列のペアのアンチセンス鎖およびセンス鎖を含む。一部の好ましい態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ４８（配列番号８７４および９５５）に記載の配列のペアのアンチセンス鎖およびセンス鎖を含む。一部の好ましい態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ５１（配列番号８７６および９５７）に記載の配列のペアのアンチセンス鎖およびセンス鎖を含む。一部の好ましい態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ５２（配列番号８７７および９５８）に記載の配列のペアのアンチセンス鎖およびセンス鎖を含む。

一部の態様において（Ｎ）ｘは、配列番号２（ヒトＴＩＭＰ２ｍＲＮＡ）における連続する配列に相補性を有する。一部の態様において（Ｎ）ｘは、表Ｂ５、Ｂ６、Ｂ７およびＢ８のいずれかに存在するアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む。一部の態様において、ｘ＝ｙ＝１８でありＮ１−（Ｎ）ｘは、表Ｂ３またはＢ４のいずれかに存在するアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む。一部の態様において、ｘ＝ｙ＝１９またはｘ＝ｙ＝２０である。特定の好ましい態様において、ｘ＝ｙ＝１８である。

特定の好ましい態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖は、表Ｂ５に示されるアンチセンス配列のいずれかに一致する配列を含む。特定の好ましい態様において、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、表Ｂ６に示される配列のペアから選択される。特定の好ましい態様において、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、２以上の種（ヒトおよび少なくとも１つの他の種）で活性を有し、表Ｂ６に示される配列のペアから選択される。特定の好ましい態様において、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、表Ｂ７、好ましくは表Ｂ８に示される配列のペアから選択される。

一部の態様において、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、下表Ｂ７に示される、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ１、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ２、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ３、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ５、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ６、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ７、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ８、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ９、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ１０、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ１１、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ１２、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ１３、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ１４、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ１５、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ１９、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ２１、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ２２、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ２３、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ２６、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ２８、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ３１、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ３２、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ３４、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ３６、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ４２、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ４３、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ４５、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ４７、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ４８、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ４９、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ５０、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ５２、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ５３、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ５４、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ５６、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ５７、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ５８、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ５９、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ６０、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ６３、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ６６、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ７０、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ７２、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ７３、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ７４、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ７７、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ８０およびｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ８１に記載の配列のペアから選択される。

一部の態様において、アンチセンス鎖およびセンス鎖は、下表Ｂ８に示される、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ６（配列番号４７７１および４８１９）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ９（配列番号４７７４および４８２２）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ１５（配列番号４７８０および４８２８）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ１９（配列番号４７８１および４８２９）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ２１（配列番号４７８２および４８３０）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ２２（配列番号４７８３および４８３１）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ２３（配列番号４７８４および４８３２）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ２８（配列番号４７８６および４８３４）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ３１（配列番号４７８７および４８３５）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ３６（配列番号４７９０および４８３８）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ４２（配列番号４７９１および４８３９）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ４７（配列番号４７９４および４８４２）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ５０（配列番号４７９７および４８４５）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ５６（配列番号４８０１および４８４９）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ５７（配列番号４８０２および４８５０）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ５８（配列番号４８０３および４８５１）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ６０（配列番号４８０５および４８５３）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ６３（配列番号４８０６および４８５４）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ７０（配列番号４８０８および４８５６）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ７３（配列番号４８１０および４８５８）、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ７４（配列番号４８１１および４８５９）およびｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ８１（配列番号４８１４および４８６２）に記載の配列のペアから選択される。

一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ６（配列番号４７７１および４８１９）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ９（配列番号４７７４および４８２２）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ１５（配列番号４７８０および４８２８）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ１９（配列番号４７８１および４８２９）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ２１（配列番号４７８２および４８３０）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ２２（配列番号４７８３および４８３１）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ２３（配列番号４７８４および４８３２）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ２８（配列番号４７８６および４８３４）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ３１（配列番号４７８７および４８３５）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ３６（配列番号４７９０および４８３８）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ４２（配列番号４７９１および４８３９）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ４７（配列番号４７９４および４８４２）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ５０（配列番号４７９７および４８４５）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ５６（配列番号４８０１および４８４９）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ５７（配列番号４８０２および４８５０）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ５８（配列番号４８０３および４８５１）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ６０（配列番号４８０５および４８５３）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ６３（配列番号４８０６および４８５４）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ７０（配列番号４８０８および４８５６）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ７３（配列番号４８１０および４８５８）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ７４（配列番号４８１１および４８５９）に記載の配列のペアを含む。一部の態様において、本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）のアンチセンス鎖およびセンス鎖は、ｓｉＴＩＭＰ２＿ｐ８１（配列番号４８１４および４８６２）に記載の配列のペアを含む。

一部の態様において、Ｎ１とＮ２とは、ワトソン−クリック塩基対を形成する。他の態様において、Ｎ１とＮ２とは、非ワトソン−クリック塩基対を形成する。一部の態様において、Ｎ１は修飾リボアデノシンまたは修飾リボウリジンである。

特定の態様において、Ｎ１は、リボアデノシン、修飾リボアデノシン、デオキシリボアデノシン、修飾デオキシリボアデノシンからなる群から選択される。他の態様において、Ｎ１は、リボウリジン、デオキシリボウリジン、修飾リボウリジンおよび修飾デオキシリボウリジンからなる群から選択される。

特定の態様において、Ｎ１は、リボアデノシン、修飾リボアデノシン、デオキシリボアデノシン、修飾デオキシリボアデノシンからなる群から選択され、Ｎ２は、リボウリジン、デオキシリボウリジン、修飾リボウリジンおよび修飾デオキシリボウリジンからなる群から選択される。特定の態様において、Ｎ１は、リボアデノシンおよび修飾リボアデノシンからなる群から選択され、Ｎ２は、リボウリジンおよび修飾リボウリジンからなる群から選択される。

特定の態様において、Ｎ２はリボアデノシン、修飾リボアデノシン、デオキシリボアデノシン、修飾デオキシリボアデノシンからなる群から選択され、Ｎ１はリボウリジン、デオキシリボウリジン、修飾リボウリジンおよび修飾デオキシリボウリジンからなる群から選択される。特定の態様において、Ｎ１はリボウリジンおよび修飾リボウリジンからなる群から選択され、Ｎ２はリボアデニンおよび修飾リボアデニンからなる群から選択される。特定の態様において、Ｎ１はリボウリジンであり、Ｎ２はリボアデニンである。

構造（Ａ２）の一部の態様において、Ｎ１は２’ＯＭｅ糖修飾リボウラシルまたは２’ＯＭｅ糖修飾リボアデノシンを含む。構造（Ａ）の特定の態様において、Ｎ２は２’ＯＭｅ糖修飾リボヌクレオチドまたはデオキシリボヌクレオチドを含む。

一部の態様において、ＺおよびＺ’は不在である。他の態様において、ＺまたはＺ’の１つが存在する。

一部の態様において、ＮおよびＮ’の各々は、非修飾ヌクレオチドである。一部の態様において、ＮまたはＮ’の少なくとも１つは、化学的に修飾されたヌクレオチドまたは非定型部分を含む。一部の態様において、非定型部分は、ミラー（mirror）ヌクレオチド、無塩基（abasic）リボース部分および無塩基デオキシリボース部分から選択される。一部の態様において、非定型部分は、ミラーヌクレオチド、好ましくはＬ−ＤＮＡ部分である。一部の態様において、ＮまたはＮ’の少なくとも１つは、２’ＯＭｅ糖修飾リボヌクレオチドを含む。

一部の態様において、（Ｎ’）ｙの配列は、（Ｎ）ｘの配列に完全に相補的である。他の態様において（Ｎ’）ｙの配列は、（Ｎ）ｘの配列に実質的に相補的である。

一部の態様において、（Ｎ）ｘは、標的ｍＲＮＡの約１７〜約３９の連続するヌクレオチドに完全に相補的なアンチセンス配列を含む。他の態様において、（Ｎ）ｘは、標的ｍＲＮＡの約１７〜約３９の連続するヌクレオチドに実質的に相補的なアンチセンス配列を含む。一部の態様において、（Ｎ）ｘは、標的ｍＲＮＡにおける、約１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８から約３９の連続するヌクレオチドに、実質的に相補的なアンチセンスを含む。他の態様において、（Ｎ）ｘは、標的ｍＲＮＡにおける、約１７〜約２３、１８〜約２３、１８〜約２１または１８〜約１９の連続するヌクレオチドと実質的に相補的なアンチセンスを含む。

構造Ａ１および構造Ａ２の一部の態様において、化合物は平滑末端を有し、例えば、ＺおよびＺ’の両方が不在である。代替的な態様において、ＺまたはＺ’の少なくとも１つは存在する。ＺおよびＺ’は、独立して、１または２以上の共有結合的に連結した修飾および／または非修飾ヌクレオチド（デオキシリボヌクレオチドおよびリボヌクレオチドを含む）、または非定型部分、例えば逆位（inverted）無塩基デオキシリボース部分または無塩基リボース部分、非ヌクレオチドＣ３、Ｃ４またはＣ５部分、アミノ−６部分、ミラーヌクレオチドなどを含む。一部の態様において、ＺおよびＺ’の各々は、独立して、Ｃ３部分またはアミノ−Ｃ６部分を含む。一部の態様において、Ｚ’は不在であり、Ｚは存在し、非ヌクレオチドＣ３部分を含む。一部の態様において、Ｚは不在であり、Ｚ’存在し、非ヌクレオチドＣ３部分を含む。

構造Ａ１と構造Ａ２の一部の好ましい態様において、非対称なｓｉＮＡ化合物分子は、アンチセンス鎖に生じる二重鎖の一方の側に、３’末端非ヌクレオチドオーバーハング（例えばＣ３−Ｃ３３’オーバーハング）を有し、分子の他の側に平滑末端を有する。一部の好ましい態様において、Ｚ’は存在し、ｄｓＮＡ分子はセンス鎖に生じる二重鎖の一方の側に５’末端非ヌクレオチドオーバーハング（例えば無塩基部分）を有し、分子の他の側に平滑末端を有する。

構造Ａ１および構造Ａ２の一部の態様において、各々のＮは非修飾リボヌクレオチドからなる。構造Ａ１および構造Ａ２の一部の態様において、各々のＮ’は非修飾ヌクレオチドからなる。好ましい態様において、ＮおよびＮ’の少なくとも１つは、修飾リボヌクレオチドまたは非定型部分である。

他の態様において、構造Ａ１または構造Ａ２の化合物は、糖残基が修飾された少なくとも１つのリボヌクレオチドを含む。一部の態様において、化合物は糖残基の２’位に修飾を含む。一部の態様において、２’位における修飾は、アミノ、フルオロ、アルコキシまたはアルキル部分の存在を含む。特定の態様において、２’修飾はアルコキシ部分を含む。好ましい態様において、アルコキシ部分はメトキシ部分である（別名２’−Ｏ−メチル、２’ＯＭｅ、２’−ＯＣＨ_３）。一部の態様において、核酸化合物は、アンチセンス鎖およびセンス鎖の一方または両方に、交互する２’ＯＭｅ糖修飾リボヌクレオチドを含む。他の態様において、化合物は２’ＯＭｅ糖修飾リボヌクレオチドをアンチセンス鎖、（Ｎ）ｘまたはＮ１−（Ｎ）ｘのみに含む。特定の態様において、アンチセンス鎖の中央のリボヌクレオチド、例えば、１９ｍｅｒ鎖の１０位のリボヌクレオチドは、非修飾である。種々の態様において、核酸化合物は、少なくとも５個の交互する２’ＯＭｅ糖修飾および非修飾リボヌクレオチドを含む。さらなる態様において、構造Ａ１または構造Ａ２の化合物は、交互する位置に修飾リボヌクレオチドを含み、ここで、（Ｎ）ｘまたはＮ１−（Ｎ）ｘの５’および３’末端の各々のリボヌクレオチドは、その糖残基が修飾されており、（Ｎ’）ｙまたはＮ２−（Ｎ）ｙの５’および３’末端の各々のリボヌクレオチドは、その糖残基が非修飾である。

さらなる態様において、構造Ａ１または構造Ａ２の化合物は、交互する位置に修飾リボヌクレオチドを含み、ここで、（Ｎ）ｘまたはＮ１−（Ｎ）ｘの５’および３’末端の各々のリボヌクレオチドは、その糖残基が修飾されており、（Ｎ’）ｙまたはＮ２−（Ｎ）ｙの５’および３’末端の各々のリボヌクレオチドは、その糖残基が非修飾である。

一部の態様において、（Ｎ）ｘまたはＮ１−（Ｎ）ｘは、２、４、６、８、１１、１３、１５、１７および１９位に、２’ＯＭｅ修飾リボヌクレオチドを含む。他の態様において（Ｎ）ｘ（Ｎ）ｘまたはＮ１−（Ｎ）ｘは、１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７および１９位に、２’ＯＭｅ修飾リボヌクレオチドを含む。一部の態様において（Ｎ）ｘまたはＮ１−（Ｎ）ｘは、２’ＯＭｅ修飾ピリミジンを含む。一部の態様において、（Ｎ）ｘまたはＮ１−（Ｎ）ｘにおける全てのピリミジンヌクレオチドは、２’ＯＭｅ修飾されている。一部の態様において（Ｎ’）ｙまたはＮ２−（Ｎ’）ｙは、２’ＯＭｅ修飾ピリミジンを含む。

構造Ａ１および構造Ａ２の一部の態様において、センス鎖もアンチセンス鎖も、３’および５’末端がリン酸化されない。他の態様において、センス鎖またはアンチセンス鎖の一方または両方は、３’末端がリン酸化されている。

構造Ａ１および構造Ａ２の一部の態様において、（Ｎ）ｙは、ミラーヌクレオチドと、２’−５’結合された、または、２’−５’結合としても知られる、隣接するヌクレオチドに２’−５’ヌクレオチド間リン酸結合で連結したヌクレオチドとから選択される少なくとも１個の非定型部分を含む。一部の態様において、非定型部分はミラーヌクレオチドである。種々の態様において、ミラーヌクレオチドは、Ｌ−リボヌクレオチド（Ｌ−ＲＮＡ）およびＬ−デオキシリボヌクレオチド（Ｌ−ＤＮＡ）から選択される。好ましい態様において、ミラーヌクレオチドは、Ｌ−ＤＮＡである。

構造Ａ１の一部の態様において、（Ｎ’）ｙは、少なくとも１個のＬ−ＤＮＡ部分を含む。一部の態様において、ｘ＝ｙ＝１９であり、（Ｎ’）ｙは、１〜１７および１９位における非修飾リボヌクレオチドと、３’の最後から２番目の位置の１個のＬ−ＤＮＡ（１８位）とからなる。他の態様において、ｘ＝ｙ＝１９であり、（Ｎ’）ｙは、１〜１６および１９位の非修飾リボヌクレオチドと、３’の最後から２番目の位置の２個の連続するＬ−ＤＮＡ（１７および１８位）とからなる。種々の態様において、非定型部分は、隣接するヌクレオチドに２’−５’ヌクレオチド間リン酸結合で連結したヌクレオチドである。種々の態様によれば、（Ｎ’）ｙは、２’−５’ヌクレオチド間結合で連結された２、３、４、５または６個の連続するリボヌクレオチドを３’末端に含む。一態様において、（Ｎ’）ｙの３’末端の４個の連続するヌクレオチドは、３個の２’−５’ホスホジエステル結合で連結しており、ここで、２’−５’ホスホジエステル結合を形成する２’−５’ヌクレオチドの１個または２個以上は、３’−Ｏ−メチル（３’ＯＭｅ）糖修飾をさらに含む。好ましくは、（Ｎ’）ｙの３’末端ヌクレオチドは、２’ＯＭｅ糖修飾を含む。特定の態様において、ｘ＝ｙ＝１９であり、（Ｎ’）ｙは１５、１６、１７、１８および１９位に２個または３個以上の連続するヌクレオチドを含み、これは、隣接するヌクレオチドに２’−５’ヌクレオチド間結合で連結したヌクレオチドを含む。種々の態様において、２’−５’ヌクレオチド間結合を形成するヌクレオチドは、３’デオキシリボースヌクレオチドまたは３’メトキシヌクレオチドを含む。一部の態様において、ｘ＝ｙ＝１９であり、（Ｎ’）ｙは、１５〜１６、１６〜１７および１７〜１８位の間、または、１５〜１６位、１７〜１８位および１８〜１９位の間の２’−５’ヌクレオチド間結合により隣接するヌクレオチドに連結したヌクレオチドを含む。一部の態様において、ｘ＝ｙ＝１９であり、（Ｎ’）ｙは、１６〜１７および１７〜１８位の間、または１７〜１８および１８〜１９位の間、または１５〜１６および１７〜１８位の間の２’−５’ヌクレオチド間結合により隣接するヌクレオチドに連結したヌクレオチドを含む。他の態様において、（Ｎ’）ｙ中のピリミジンリボヌクレオチド（ｒＵ、ｒＣ）は、隣接するヌクレオチドに２’−５’ヌクレオチド間結合で連結するヌクレオチドに置換されている。

構造Ａ２の一部の態様において、（Ｎ）ｙは、少なくとも１個のＬ−ＤＮＡ部分を含む。一部の態様において、ｘ＝ｙ＝１８であり、（Ｎ’）ｙは、１〜１６および１８位の非修飾リボヌクレオチドと、３’の最後から２番目の位置（１７位）の１個のＬ−ＤＮＡとからなる。他の態様において、ｘ＝ｙ＝１８であり、（Ｎ’）ｙは、１〜１５および１８位の非修飾リボヌクレオチドと、３’の最後から２番目の位置の２個の連続するＬ−ＤＮＡ（１６および１７位）とからなる。種々の態様において、非定型部分は、隣接するヌクレオチドに２’−５’ヌクレオチド間リン酸結合で連結しているヌクレオチドである。種々の態様によると、（Ｎ’）ｙは、３’末端における２’−５’ヌクレオチド間結合で連結された２、３、４、５または６個の連続するリボヌクレオチドを含む。一態様において、（Ｎ’）ｙの３’末端の４個の連続するヌクレオチドは、３個の２’−５’ホスホジエステル結合で連結しており、ここで、２’−５’ホスホジエステル結合を形成する２’−５’ヌクレオチドの１個または２個以上は、３’−Ｏ−メチル（３’ＯＭｅ）糖修飾をさらに含む。好ましくは、（Ｎ’）ｙの３’末端ヌクレオチドは、２’ＯＭｅ糖修飾を含む。特定の態様において、ｘ＝ｙ＝１８であり、（Ｎ’）ｙにおいて、１４、１５、１６、１７および１８位における２個または３個以上の連続するヌクレオチドは、隣接するヌクレオチドに２’−５’ヌクレオチド間結合で連結したヌクレオチドを含む。種々の態様において、２’−５’ヌクレオチド間結合を形成するヌクレオチドは、３’デオキシリボースヌクレオチドまたは３’メトキシヌクレオチドを含む。一部の態様において、ｘ＝ｙ＝１８であり、（Ｎ’）ｙは、１４〜１５、１５〜１６、１６〜１７および１７〜１８位の間、または、１５〜１６、１６〜１７および１７〜１８位の間、または１６〜１７および１７〜１８位の間、または１７〜１８位の間、または１５〜１６位および１７〜１８位の間の２’−５’ヌクレオチド間結合により隣接するヌクレオチドに連結したヌクレオチドを含む。一部の態様において、ｘ＝ｙ＝１８であり、（Ｎ’）ｙは、１５〜１６、１６〜１７および１７〜１８位の間、または、１６〜１７および１７〜１８位の間の２’−５’ヌクレオチド間結合により隣接するヌクレオチドに連結したヌクレオチドを含む。他の態様において、（Ｎ’）ｙ中のピリミジンリボヌクレオチド（ｒＵ、ｒＣ）は、隣接するヌクレオチドに２’−５’ヌクレオチド間結合で連結するヌクレオチドに置換されている。

一部の態様において、ｘ＝ｙ＝１９であり、（Ｎ’）ｙは、３’末端に４個の２’−５’結合、具体的には、１５〜１６、１６〜１７、１７〜１８および１８〜１９位のヌクレオチドの間の結合で連結された５個の連続するヌクレオチドを含む。

一部の態様において、ヌクレオチド間結合は、ホスホジエステル結合を含む。一部の態様において、ｘ＝ｙ＝１９であり、（Ｎ’）ｙは、３’末端に４個の２’−５’結合で連結された５個の連続するヌクレオチドを含み、任意にさらに、独立して、無塩基部分およびＣ３アルキル［Ｃ３、１，３−プロパンジオールモノ（リン酸二水素）］キャップから選択される、Ｚ’およびｚ’を含む。

一部の態様において、ｘ＝ｙ＝１９であり、（Ｎ’）ｙは、１８位にＬ−ＤＮＡを含み、（Ｎ’）ｙは、任意に、独立して独立して、逆位無塩基部分およびＣ３アルキル［Ｃ３、１，３−プロパンジオールモノ（リン酸二水素）］キャップから選択されるＺ’およびｚ’をさらに含む。

一部の態様において（Ｎ’）ｙは、３’末端ホスフェートを含む。一部の態様において（Ｎ’）ｙは、３’末端ヒドロキシルを含む。

一部の態様において、ｘ＝ｙ＝１９であり、（Ｎ）ｘは、１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９位または２、４、６、８、１１、１３、１５、１７、１９位に、２’ＯＭｅ糖修飾リボヌクレオチドを含む。一部の態様において、ｘ＝ｙ＝１９であり、（Ｎ）ｘは、２’ＯＭｅ糖修飾ピリミジンを含む。一部の態様において、（Ｎ）ｘにおける全てのピリミジンは、２’ＯＭｅ糖修飾を含む。

一部の態様において、ｘ＝ｙ＝１８であり、Ｎ２はリボアデニン部分である。

一部の態様において、ｘ＝ｙ＝１８であり、Ｎ２−（Ｎ’）ｙは、４個の２’-５’結合、具体的には、１５〜１６、１６〜１７、１７〜１８および１８〜１９位のヌクレオチドの間の結合で連結された５個の連続するヌクレオチドを３’末端に含む。一部の態様において、結合はホスホジエステル結合を含む。

一部の態様において、ｘ＝ｙ＝１８であり、Ｎ２−（Ｎ’）ｙは、４個の２’-５’結合で連結された５個の連続するヌクレオチドを３’末端に含み、任意に、独立して逆位無塩基部分およびＣ３アルキル［Ｃ３、１，３−プロパンジオールモノ（リン酸二水素）］キャップから選択されるＺ’およびｚ’をさらに含む。

一部の態様において、ｘ＝ｙ＝１８であり、Ｎ２−（Ｎ’）ｙはＬ−ＤＮＡを１８位に含み、（Ｎ’）ｙは、任意に、独立して逆位無塩基部分およびＣ３アルキル［Ｃ３、１，３−プロパンジオールモノ（リン酸二水素）］キャップから選択されるＺ’およびｚ’をさらに含む。

一部の態様において、Ｎ２−（Ｎ’）ｙは、３’末端ホスフェートを含む。一部の態様において、Ｎ２−（Ｎ’）ｙは、３’末端ヒドロキシルを含む。

一部の態様において、ｘ＝ｙ＝１８であり、Ｎ１−（Ｎ）ｘは、２’ＯＭｅ糖修飾リボヌクレオチドを１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９位、または２、４、６、８、１１、１３、１５、１７、１９位に含む。

一部の態様において、ｘ＝ｙ＝１８であり、Ｎ１−（Ｎ）ｘは、２’ＯＭｅ糖修飾ピリミジンを含む。一部の態様において、（Ｎ）ｘにおけるすべてのピリミジンは、２’ＯＭｅ糖修飾を含む。一部の態様において、Ｎ１−（Ｎ）ｘは、６または７位（５’＞３’）にＬ−ＤＮＡをさらに含む。他の態様において、Ｎ１−（Ｎ）ｘは、５〜６または６〜７位（５’＞３’）のリボヌクレオチドの間に２’５’ヌクレオチド間結合を形成するリボヌクレオチドをさらに含む。

さらなる態様において、Ｎ１−（Ｎ）ｘはＺをさらに含み、ここで、Ｚは非ヌクレオチドオーバーハングを含む。一部の態様において、非ヌクレオチドオーバーハングはＣ３−Ｃ３［１，３−プロパンジオールモノ（リン酸二水素）］２である。

一部の態様において、本明細書に開示される二本鎖分子、特に表Ａ３、Ａ４、Ａ７、Ａ８およびＢ３、Ｂ４、Ｂ７およびＢ８に記載の分子は、以下の修飾の１または２以上を含む：
ａ）アンチセンス鎖の５’末端から５、６、７、８または９位のうちの少なくとも１つのＮが、ＤＮＡ、ＴＮＡ、２’５’ヌクレオチドまたはミラーヌクレオチドから選択される。
ｂ）センス鎖の５’末端から９または１０位のうちの少なくとも１つのＮ’が、ＴＮＡ、２’５’ヌクレオチドおよびシュードウリジンから選択される。
ｃ）（Ｎ’）ｙの３’末端の位置の連続する４、５または６個の位置が２’５’ヌクレオチドを含む。
ｄ）１個または２個以上のピリミジンリボヌクレオチドが、センス鎖、アンチセンス鎖またはセンス鎖とアンチセンス鎖の両方において２’修飾されている。

一部の態様において、二本鎖分子、特に表Ａ３、Ａ４、Ａ７、Ａ８およびＢ３、Ｂ４、Ｂ７およびＢ８に記載の分子は、以下の修飾の組合せを含む：
ａ）アンチセンス鎖が、５’末端から５、６、７、８または９位のうちの少なくとも１つにＤＮＡ、ＴＮＡ、２’５’ヌクレオチドまたはミラーヌクレオチドを含み、
ｂ）センス鎖が、５’末端から９または１０位に、ＴＮＡ、２’５’ヌクレオチドおよびシュードウリジンのうちの少なくとも１つを含み、かつ
ｃ）１個または２個以上のピリミジンリボヌクレオチドが、センス鎖、アンチセンス鎖またはセンス鎖とアンチセンス鎖の両方において２’修飾されている。

一部の態様において、二本鎖分子、特に表Ａ３、Ａ４、Ａ７、Ａ８およびＢ３、Ｂ４、Ｂ７およびＢ８に記載の分子は、以下の修飾の組合せを含む：
ａ）アンチセンス鎖が、５’末端から５、６、７、８または９位のうちの少なくとも１つにＤＮＡ、２’５’ヌクレオチドまたはミラーヌクレオチドを含み、
ｂ）センス鎖が、３’末端から２番目、または３’末端の位置に、４、５または６個の連続する２’５’ヌクレオチドを含み、かつ
ｃ）１個または２個以上のピリミジンリボヌクレオチドが、センス鎖、アンチセンス鎖またはセンス鎖とアンチセンス鎖の両方において２’修飾されている。

構造Ａ１および／または構造Ａ２の一部の態様において、（Ｎ）ｙは、ミラーヌクレオチド、２’５’ヌクレオチドおよびＴＮＡから選択される少なくとも１個の非定型部分を含む。一部の態様において、非定型部分はミラーヌクレオチドである。種々の態様において、ミラーヌクレオチドは、Ｌ−リボヌクレオチド（Ｌ−ＲＮＡ）およびＬ−デオキシリボヌクレオチド（Ｌ−ＤＮＡ）から選択される。好ましい態様において、ミラーヌクレオチドはＬ−ＤＮＡである。特定の態様において、センス鎖は、非定型部分を９または１０位（５’末端から）に含む。好ましい態様において、センス鎖は、非定型部分を９位（５’末端から）に含む。一部の態様において、センス鎖は長さが１９ヌクレオチドであり、４、５または６個の連続する非定型部分を１５位（５’末端から）に含む。一部の態様において、センス鎖は４個の連続する２’５’リボヌクレオチドを、１５、１６、１７および１８位に含む。一部の態様において、センス鎖は５個の連続する２’５’リボヌクレオチドを、１５、１６、１７、１８および１９位に含む。種々の態様において、センス鎖はＺ’をさらに含む。一部の態様において、Ｚ’は、Ｃ３ＯＨ部分またはＣ３Ｐｉ部分を含む。

構造Ａ１および／または構造Ａ２の一部の態様において、（Ｎ）ｙは、ミラーヌクレオチドと、２’−５’結合された、または、２’−５’結合としても知られる、隣接するヌクレオチドに２’−５’ヌクレオチド間リン酸結合で連結したヌクレオチドとから選択される少なくとも１個の非定型部分を含む。一部の態様において、非定型部分はミラーヌクレオチドである。種々の態様において、ミラーヌクレオチドは、Ｌ−リボヌクレオチド（Ｌ−ＲＮＡ）およびＬ−デオキシリボヌクレオチド（Ｌ−ＤＮＡ）から選択される。好ましい態様において、ミラーヌクレオチドは、Ｌ−ＤＮＡである。

構造Ａ１の一部の態様において、（Ｎ’）ｙは、少なくとも１個のＬ−ＤＮＡ部分を含む。一部の態様において、ｘ＝ｙ＝１９であり、（Ｎ’）ｙは、１〜１７および１９位における非修飾リボヌクレオチドと、３’の最後から２番目の位置の１個のＬ−ＤＮＡ（１８位）とからなる。他の態様において、ｘ＝ｙ＝１９であり、（Ｎ’）ｙは、１〜１６および１９位の非修飾リボヌクレオチドと、３’の最後から２番目の位置の２個の連続するＬ−ＤＮＡ（１７および１８位）とからなる。種々の態様において、非定型部分は、隣接するヌクレオチドに２’−５’ヌクレオチド間リン酸結合で連結したヌクレオチドである。種々の態様によれば、（Ｎ’）ｙは、２’−５’ヌクレオチド間結合で連結された２、３、４、５または６個の連続するリボヌクレオチドを３’末端に含む。一態様において、（Ｎ’）ｙの３’末端の４個の連続するヌクレオチドは、３個の２’−５’ホスホジエステル結合で連結している。一態様において、（Ｎ’）ｙの３’末端の５個の連続するヌクレオチドは、４個の２’−５’ホスホジエステル結合で連結している。２’−５’ヌクレオチドの１個または２個以上が２’−５’ホスホジエステル結合を形成する一部の態様において、ヌクレオチドは、３’−Ｏ−メチル（３’ＯＭｅ）糖修飾をさらに含む。一部の態様において、（Ｎ’）ｙの３’末端ヌクレオチドは、３’ＯＭｅ糖修飾を含む。特定の態様において、ｘ＝ｙ＝１９であり、（Ｎ’）ｙは１５、１６、１７、１８および１９位に２個または３個以上の連続するヌクレオチドを含み、これは、隣接するヌクレオチドに２’−５’ヌクレオチド間結合で連結したヌクレオチドを含む。種々の態様において、２’−５’ヌクレオチド間結合を形成するヌクレオチドは、３’デオキシリボースヌクレオチドまたは３’メトキシヌクレオチドを含む。一部の態様において、ｘ＝ｙ＝１９であり、（Ｎ’）ｙは、１５〜１６、１６〜１７および１７〜１８位の間、または１６〜１７、１７〜１８および１８〜１９位の間の２’−５’ヌクレオチド間結合により隣接するヌクレオチドに連結したヌクレオチドを含む。一部の態様において、ｘ＝ｙ＝１９であり、（Ｎ’）ｙは、１６〜１７および１７〜１８位の間、または１７〜１８および１８〜１９位の間、または１５〜１６および１７〜１８位の間の２’−５’ヌクレオチド間結合により隣接するヌクレオチドに連結したヌクレオチドを含む。他の態様において、（Ｎ’）ｙにおけるピリミジンリボヌクレオチド（ｒＵ、ｒＣ）は、隣接するヌクレオチドに２’−５’ヌクレオチド間結合で連結するヌクレオチドに置換されている。

構造Ａ２の一部の態様において、（Ｎ）ｙは、少なくとも１個のＬ−ＤＮＡ部分を含む。一部の態様において、ｘ＝ｙ＝１８であり、Ｎ２−（Ｎ’）ｙは、１〜１７および１９位の非修飾リボヌクレオチドと、３’の最後から２番目の位置（１８位）の１個のＬ−ＤＮＡとからなる。他の態様において、ｘ＝ｙ＝１８であり、Ｎ２−（Ｎ’）ｙは、１〜１６および１９位の非修飾リボヌクレオチドと、３’の最後から２番目の位置の２個の連続するＬ−ＤＮＡ（１７および１８位）とからなる。種々の態様において、非定型部分は、隣接するヌクレオチドに２’−５’ヌクレオチド間リン酸結合で連結しているヌクレオチドである。種々の態様によると、Ｎ２−（Ｎ’）ｙは、３’末端における２’−５’ヌクレオチド間結合で連結された２、３、４、５または６個の連続するリボヌクレオチドを含む。一態様において、Ｎ２−（Ｎ’）ｙの３’末端の４個の連続するヌクレオチドは、３個の２’−５’ホスホジエステル結合で連結しており、ここで、２’−５’ホスホジエステル結合を形成する２’−５’ヌクレオチドの１個または２個以上は、３’−Ｏ−メチル（３’ＯＭｅ）糖修飾をさらに含む。一部の態様において、Ｎ２−（Ｎ’）ｙの３’末端ヌクレオチドは、２’ＯＭｅ糖修飾を含む。特定の態様において、ｘ＝ｙ＝１８であり、Ｎ２−（Ｎ’）ｙにおいて、１５、１６、１７、１８および１９位における２個または３個以上の連続するヌクレオチドは、隣接するヌクレオチドに２’−５’ヌクレオチド間結合で連結したヌクレオチドを含む。種々の態様において、２’−５’ヌクレオチド間結合を形成するヌクレオチドは、３’デオキシリボースヌクレオチドまたは３’メトキシヌクレオチドを含む。一部の態様において、ｘ＝ｙ＝１８であり、Ｎ２−（Ｎ’）ｙは、１６〜１７および１７〜１８位の間、または１７〜１８および１８〜１９位の間、または１５〜１６および１７〜１８位の間の２’−５’ヌクレオチド間結合により隣接するヌクレオチドに連結したヌクレオチドを含む。他の態様において、Ｎ２−（Ｎ’）ｙにおけるピリミジンリボヌクレオチド（ｒＵ、ｒＣ）は、隣接するヌクレオチドに２’−５’ヌクレオチド間結合で連結するヌクレオチドを含む。

構造Ａ１およびＡ２のさらなる態様において、（Ｎ’）ｙは１〜８個の修飾リボヌクレオチドを含み、ここで、該修飾リボヌクレオチドはデオキシリボース（ＤＮＡ）ヌクレオチドである。特定の態様において（Ｎ’）ｙは、１個、２個、３個、４個、５個、６個、７個、または８個までのＤＮＡ部分を含む。構造Ａ１およびＡ２のさらなる態様において、（Ｎ’）ｙは１〜８個の修飾リボヌクレオチドを包含し、ここで、該修飾リボヌクレオチドはＤＮＡヌクレオチドである。特定の態様において（Ｎ’）ｙは、１個、２個、３個、４個、５個、６個、７個、または８個までのＤＮＡ部分を包含する。

一部の態様において、ＺおよびＺ’のいずれか一方が存在し、独立して２個の非ヌクレオチド部分を含む。

さらなる態様において、ＺおよびＺ’が存在し、各々は独立して、２個の非ヌクレオチド部分を含む。

一部の態様において、ＺおよびＺ’の各々は、無塩基部分、例えばデオキシリボ無塩基部分（本明細書において「ｄＡｂ」と称する）またはリボ無塩基部分（本明細書において「ｒＡｂ」と称する）を含む。一部の態様において、Ｚおよび／またはＺ’の各々は、２個の共有結合的に連結した無塩基部分を含み、例えば、ｄＡｂ−ｄＡｂまたはｒＡｂ−ｒＡｂまたはｄＡｂ−ｒＡｂまたはｒＡｂ−ｄＡｂであり、ここで、各々の部分は隣接する部分に共有結合により、好ましくはリン酸ベース（phospho-based）の結合を介して、付着している。一部の態様において、リン酸ベースの結合は、ホスホロチオエート、ホスホノアセテートまたはホスホジエステル結合を含む。好ましい態様において、リン酸ベースの結合は、ホスホジエステル結合を含む。

一部の態様において、Ｚおよび／またはＺ’の各々は、独立して、アルキル部分、任意にプロパン［（ＣＨ２）３］部分（Ｃ３）、または、プロパノール（Ｃ３−ＯＨ）およびプロパンジオール（「Ｃ３−３’Ｐｉ」）を含むその誘導体を含む。一部の態様において、Ｚおよび／またはＺ’の各々は、２個のアルキル部分を含み、一部の例において、これはＣ３−Ｃ３−ＯＨである。センス鎖の３’末端および／またはアンチセンス鎖の３’末端は、Ｃ３部分にリン酸ベースの結合を介して共有結合的に付着しており、Ｃ３部分は、Ｃ３−ＯＨ部分にリン酸ベースの結合を介して共有結合的に結合している。一部の態様において、リン酸ベースの結合は、ホスホロチオエート、ホスホノアセテートまたはホスホジエステル結合を含む。好ましい態様において、リン酸ベースの結合は、ホスホジエステル結合を含む。

構造Ａ１または構造Ａ２の１つの具体的な態様において、ＺはＣ３−Ｃ３−ＯＨ（ホスホジエステル結合を介してプロパノール部分に共有結合しているプロピル部分）を含む。一部の態様において、Ｚは、ホスホジエステル結合を介してアンチセンス鎖の３’末端に共有結合により付着したプロパノール部分を含む。一部の態様において、Ｃ３−Ｃ３−ＯＨオーバーハングは、共有結合、例えばホスホジエステル結合を介して、（Ｎ）ｘまたは（Ｎ’）ｙの３’末端に共有結合により付着している。一部の態様において、第１のＣ３と第２のＣ３との間の結合は、ホスホジエステル結合である。

種々の態様において、アルキル部分は、末端ヒドロキシル基、末端アミノ基または末端リン酸基を含む、Ｃ３アルキル（「Ｃ３」）〜Ｃ６アルキル（「Ｃ６」）（例えばＣ３、Ｃ４、Ｃ５またはＣ６）部分である。

一部の態様において、アルキル部分は、Ｃ３アルキル部分である。一部の態様において、Ｃ３アルキル部分は、プロパノール、プロピルホスフェート、プロピルホスホロチオエートまたはこれらの組合せを含む。

Ｃ３アルキル部分は、（Ｎ’）ｙの３’末端、および／または、（Ｎ）ｘの３’末端に、ホスホジエステル結合を介して共有結合していてもよい。一部の態様において、アルキル部分は、プロパノール、プロピルホスフェート（トリメチルホスフェート）またはプロピルホスホロチオエート（トリメチルホスホロチオアート）を含む。

一部の態様において、ＺおよびＺ’の各々は、独立して、プロパノール、プロピルホスフェート（トリメチルホスフェート）、プロピルホスホロチオエート（トリメチルホスホロチオエート）、これらの組合せまたはこれらを複数含むものから選択される。

一部の態様において、ＺおよびＺ’の各々は、独立して、プロピルホスフェート（トリメチルホスフェート）、プロピルホスホロチオエート（トリメチルホスホロチオエート）、プロピルホスホ−プロパノール、プロピルホスホ−プロピルホスホロチオエート、プロピルホスホ−プロピルホスフェート、（プロピルホスフェート）３、（プロピルホスフェート）２−プロパノール、（プロピルホスフェート）２−プロピルホスホロチオエートから選択される。任意のプロパンまたはプロパノール結合部分を、ＺまたはＺ’に含めることができる。

さらなる態様において、Ｚおよび／またはＺ’の各々は、無塩基部分と非修飾デオキシリボヌクレオチドまたは非修飾リボヌクレオチドとの組合せ、または、炭化水素部分と非修飾デオキシリボヌクレオチドまたは非修飾リボヌクレオチドとの組合せ、または、無塩基部分（デオキシリボまたはリボ）と炭化水素部分との組合せを含む。かかる態様において、Ｚおよび／またはＺ’の各々はＣ３−ｒＡｂまたはＣ３−ｄＡｂを含み、ここで各々の部分は、隣接する部分に、リン酸ベースの結合、好ましくはホスホジエステル、ホスホロチオエートまたはホスホノアセテート結合を介して、共有結合的に結合している。

特定の態様において、本明細書に開示される核酸分子は、表Ａ１〜Ｂ８のいずれかから選択されるセンスオリゴヌクレオチド配列を含む。

一部の態様においては、タンデム構造、および、ＲＮＡｓｔａｒとしても知られる、トリプルアーム構造（triple armed structure）が提供される。かかる構造は、ＰＣＴ特許公開WO 2007/091269に開示されている。タンデムオリゴヌクレオチドは、少なくとも２個のｓｉＲＮＡ化合物を含む。

三本鎖オリゴヌクレオチドは、以下の一般構造を有するオリゴリボヌクレオチドであってもよい：

ここで、リンカーＡ、リンカーＢまたはリンカーＣのうち１または２以上が存在し、鎖の極性および分子の一般構造が維持されるかぎり、２または３以上のオリゴヌクレオチド、および、リンカーＡ〜Ｃのうちの１または２以上の任意の組合せが可能である。さらに、リンカーＡ〜Ｃのうち２または３以上が存在する場合、それらは同一であっても、異なってもよい。

一部の態様において、「ギャップを有する（gapped）」ＲＮＡｓｔａｒ化合物が好ましく、ここで該化合物は、以下の一般構造を有する３本のｓｉＲＮＡ二重鎖を形成する４本のリボヌクレオチド鎖で構成される：
ここで、各々のオリゴＡ、オリゴＢ、オリゴＣ、オリゴＤ、オリゴＥおよびオリゴＦは少なくとも１９個の連続するリボヌクレオチドを表し、オリゴＡ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、ＥおよびＦの各々における、１９〜４０個のかかる連続するリボヌクレオチドは、ｓｉＲＮＡ二重鎖の鎖を含み、各々のリボヌクレオチドは修飾されていても、非修飾であってもよく、
鎖１は、化合物の第１のｓｉＲＮＡ二重鎖のセンス部分であるか、または、アンチセンス部分であるオリゴＡを含み、鎖２は、オリゴＡにおける少なくとも１９個のヌクレオチドに相補的なオリゴＢを含み、オリゴＡとオリゴＢは、一緒になって、第１の標的ｍＲＮＡを標的とする第１のｓｉＲＮＡ二重鎖を形成し、
鎖１は、化合物の第２のｓｉＲＮＡ二重鎖のセンス部分であるか、または、アンチセンス部分であるオリゴＣをさらに含み、鎖３は、オリゴＣにおける少なくとも１９個のヌクレオチドに相補的なオリゴＤを含み、オリゴＣとオリゴＤは、一緒になって、第２の標的ｍＲＮＡを標的とする第２のｓｉＲＮＡ二重鎖を形成し、
鎖４は、化合物の第３のｓｉＲＮＡ二重鎖のセンス部分であるか、または、アンチセンス部分であるオリゴＥを含み、鎖２は、オリゴＥにおける少なくとも１９個のヌクレオチドに相補的なオリゴＦを含み、オリゴＥとオリゴＦは、一緒になって、第３の標的ｍＲＮＡを標的とする第３のｓｉＲＮＡ二重鎖を形成し、
リンカーＡはオリゴＡとオリゴＣとを共有結合により連結する部分であり、リンカーＢはオリゴＢとオリゴＦとを共有結合により連結する部分であり、リンカーＡとリンカーＢとは、同一であっても異なっていてもよい。

一部の態様において、第１、第２および第３のｓｉＲＮＡ二重鎖は同じ遺伝子を標的とする。他の態様において、第１、第２および第３のｓｉＲＮＡ二重鎖のうちの２本は同じｍＲＮＡを標的とし、第３のｓｉＲＮＡ二重鎖は異なるｍＲＮＡを標的とする。一部の態様において、第１、第２および第３の二重鎖の各々は、異なるｍＲＮＡを標的とする。

別の側面において、提供されるのは、本明細書において提供される核酸分子を、ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２の発現を低減するのに十分な量で細胞に導入することにより、細胞においてＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２の発現を低減する方法である。一態様において、細胞は肝星細胞である。別の態様において、細胞は腎臓または肺組織における星細胞である。特定の態様において、方法はin vitroで行われ、他の態様において、方法はin vivoで行われる。

さらに別の側面において、提供されるのは、ＴＩＭＰ１および／またはＴＩＭＰ２に関連する疾患に罹患した個体を処置する方法である。本方法は、個体に、例えば本明細書において提供される核酸分子などを、ＴＩＭＰ１またはＴＩＭＰ２の発現を低減するのに十分な量で投与することを含む。特定の態様において、ＴＩＭＰ１またはＴＩＭＰ２に関連する疾患は肝線維症、肝硬変、肺線維症（ＩＬＦを含む）を含む肺の線維症、腎線維症を惹起するあらゆる状態（例えば、ＥＳＲＤを含むＣＫＤ）、腹膜線維症、慢性肝損傷、原線維形成、他の臓器における線維性疾患、偶発的および医原性（手術）の全ての可能な種類の皮膚損傷に関連する異常な瘢痕化（ケロイド）、強皮症、心線維症、脳における線維化、緑内障濾過手術の失敗、および腸管癒着症からなる群から選択される疾患である。本化合物は、下表Ｉに示すものを含む臓器特異的な適応症の処置に有用である。

表Ｉ

一部の態様において、好ましい適応症は、肝移植後Ｃ型肝炎による肝硬変、非アルコール性脂肪肝炎（ＮＡＳＨ）による肝硬変、特発性肺線維症（ＩＰＦ）、肺線維症につながる放射線肺炎、糖尿病性腎症、持続携帯式腹膜透析（ＣＡＰＤ）に関連する腹膜硬化症および眼瘢痕性類天疱瘡を含む。

線維性の肝の適応症は、アルコール性肝硬変、Ｂ型肝炎肝硬変、Ｃ型肝炎肝硬変、同所性肝移植後のＣ型肝炎（ＨｅｐＣ）肝硬変、ＮＡＳＨ／ＮＡＦＬＤ（ここで、ＮＡＳＨは非アルコール性脂肪肝疾患（ＮＡＦＬＤ）の極端な病態である）、原発性胆汁性肝硬変（ＰＢＣ）、原発性硬化性胆管炎（ＰＳＣ）、胆道閉鎖症、アルファ１抗トリプシン欠乏症（Ａ１ＡＤ）、銅蓄積症（ウイルソン病）、フルクトース血症、ガラクトース血症、糖原病（特にＩＩＩ、ＩＶ、ＶＩ、ＩＸおよびＸ型）、鉄過剰症候群（ヘモクロマトーシス）、脂質異常（例えばゴーシェ病）、ペルオキシソーム障害（例えばツェルヴェーガー症候群）、チロシン血症、先天性肝線維症、細菌感染症（例えばブルセラ症）、寄生虫疾患（例えば包虫症）、バット・キアリ症候群（肝静脈閉塞性疾患）を含む。

肺の適応症は、特発性肺線維症、珪肺症、塵肺症、新生児呼吸窮迫症候群に続発する新生児における気管支肺異形成症、ブレオマイシン／化学療法剤誘発性肺損傷、肺移植後閉塞性細気管支炎（ＢＯＳ）、慢性閉塞性肺障害（ＣＯＰＤ）、嚢胞性線維症、喘息を含む。

心臓の適応症は、心筋症、アテローム性硬化症（バージャー病など）、心内膜心筋線維症、心房細動、心筋梗塞（ＭＩ）後瘢痕形成を含む。

他の胸部の適応症は、テクスチャードタイプの乳房インプラント周囲における放射線による被膜組織反応（Radiation-induced capsule tissue reactions）および口腔粘膜下線維症を含む。

腎臓の適応症は、常染色体優性多発性嚢胞腎（ＡＤＰＫＤ）、糖尿病性腎症（糖尿病性糸球体硬化症）、ＦＳＧＳ（崩壊性、他の組織学的変種）、ＩｇＡ腎症（バージャー病）、ループス腎炎、ウェゲナー病、強皮症、グッドパスチャー症候群、尿細管間質性線維症、薬剤性（保護的）、ペニシリン、セファロスポリン、鎮痛剤性腎症、膜性増殖性糸球体腎炎（ＭＰＧＮ）、ヘーノホ−シェーンライン紫斑病、先天性腎症、腎髄質嚢胞症、爪膝蓋骨症候群およびアルポート症候群を含む。

骨髄の適応症は、リンパ脈管筋腫症（ＬＡＭ）、慢性移植片対宿主病、真性多血症、本態性血小板血症、骨髄線維症を含む。

眼の適応症は、未熟児網膜症（ＲｏＰ）、眼瘢痕性類天疱瘡、涙腺線維化、網膜復位術、角膜混濁、ヘルペス角膜炎、翼状片、緑内障、加齢性黄斑変性症（ＡＭＤ／ＡＲＭＤ）、真性糖尿病（ＤＭ）網膜症に関連する網膜線維症を含む。

脳の適応症は、脳梗塞に関連する線維化を含む。

婦人科の適応症は、瘢痕形成の防止のためのホルモン療法に合併する子宮内膜症、ＳＴＤ後の線維症／卵管炎を含む。

全身性の適応症は、デュピュイトラン病、手掌線維腫症、ペイロニー病、レダーホース病、ケロイド、多巣性線維硬化症、腎性全身性線維症、腎性骨髄線維症（貧血症）を含む。

傷害関連性線維性疾患（injury associated fibrotic diseases）は熱傷性（化学物質を含む）の皮膚および軟部組織の瘢痕形成および収縮、がん放射線治療後の放射線による皮膚および臓器の瘢痕形成、ケロイド（皮膚）を含む。

外科的な適応症は、腹膜透析カテーテル後の腹膜線維症、角膜移植、人工内耳、他の移植物、胸部へのシリコーン移植物、慢性副鼻腔炎、癒着、透析グラフトの偽内膜過形成を含む。

他の適応症は、慢性膵炎を含む。

一部の態様において、本方法は個体に、核酸分子、例えば、本明細書で提供されるものを、ＴＩＭＰ１の発現を低減するのに十分な量で投与することを含む。一部の態様において、本方法は個体に、核酸分子、例えば、本明細書で提供されるものを、ＴＩＭＰ２の発現を低減するのに十分な量で投与することを含む。一部の態様において、本方法は個体に、複数の核酸分子、例えば、本明細書で提供されるものを、ＴＩＭＰ１の発現を低減するのに十分な量で投与することを含む。一部の態様において、本方法は個体に、複数の核酸分子、例えば、本明細書で提供されるものを、ＴＩＭＰ２の発現を低減するのに十分な量で投与することを含む。一部の態様においては、表Ｉに記載の疾患または障害から選択される線維性疾患の処置のための、本明細書に開示される核酸が提供される。別の態様においては、治療に用いるための核酸分子が提供される。一部の態様において、治療は、表Ｉに記載の線維性疾患または障害の処置を含む。一部の態様においては、本明細書に開示される核酸分子の、表Ｉに記載の線維性疾患または障害を治療するのに有用な医薬の製造のための使用が提供される。一部の態様において、核酸分子は表Ｃに記載され、例えばＴＩＭＰ１−Ａ、ＴＩＭＰ１−Ｂ、ＴＩＭＰ１−Ｃである。一部の態様において、核酸分子は表Ｄに記載され、例えばＴＩＭＰ２−Ａ、ＴＩＭＰ２−Ｂ、ＴＩＭＰ２−Ｃ、ＴＩＭＰ２−Ｄ、ＴＩＭＰ２−Ｅである。一部の態様において、核酸分子のセンス配列およびアンチセンス配列は、表Ａ３、表Ａ４、表Ａ７または表Ａ８のいずれかに記載の配列のペアから選択される。一部の態様において、核酸分子のセンス配列およびアンチセンス配列は、表Ｂ３、表Ｂ４、表Ｂ７または表Ｂ８のいずれかに記載の配列のペアから選択される。

一側面において、提供されるのは、薬学的に許容し得る担体中の、本明細書に記載の核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）を含む医薬組成物である。特定の態様において、医薬製剤は、患者などの個体に核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）を送達するのに適した送達システム、例えば、以下にさらに詳細に記述される送達システムを含むか、これを伴う。

関連する側面において、提供されるのは、患者による使用のためにパッケージされた、核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）を含む組成物またはキットである。パッケージは、ラベルを付されていても、パッケージラベルまたは添付文書を含んでいてもよく、これは、パッケージの内容を示し、核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）が患者によりどのように使用されるべきか、または、どのように使用することができるかに関する特定の情報を提供し、例えば、ラベルは投薬情報および／または使用適応を含んでもよい。特定の態様において、ラベルの内容は、政府関係機関、例えば米国食品医薬品局（ＦＤＡ）によって定められた形式の通知を有する。特定の態様において、ラベルは核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）が、ＴＩＭＰ１またはＴＩＭＰ２に関連する疾患に罹患した患者を処置するために適することを示してもよく、例えば、ラベルは、核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）が線維性疾患を治療するために適することを示してもよく、または、例えば、ラベルは、核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）が線維症、肝線維症、肝硬変、肺線維症、腎線維症、腹膜線維症、慢性肝損傷および原線維形成からなる群から選択される疾患を処置するために適することを示してもよい。

本明細書で用いる場合、用語「組織メタロプロテアーゼインヒビター１」または「ＴＩＭＰ１」は、互換可能に用いられ、任意の組織メタロプロテアーゼインヒビター１ペプチド、または任意のＴＩＭＰ１タンパク質活性を有するポリペチドを指す。組織メタロプロテアーゼインヒビター１は、マトリックスメタロプロテアーゼの天然のインヒビターである。特定の好ましい態様において、「ＴＩＭＰ１」は、ヒトＴＩＭＰ１を指す。組織メタロプロテアーゼインヒビター１（または、より具体的には、ヒトＴＩＭＰ１）は、配列番号３（図１Ｃ）と同じか、実質的に同じアミノ酸配列を有してもよい。

本明細書で用いる場合、用語「組織メタロプロテアーゼインヒビター２」または「ＴＩＭＰ２」は、互換可能に用いられ、任意の組織メタロプロテアーゼインヒビター２ペプチド、または任意のＴＩＭＰ２タンパク質活性を有するポリペチドを指す。組織メタロプロテアーゼインヒビター２（または、より具体的には、ヒトＴＩＭＰ２）は、配列番号４（図１Ｄ）と同じか、実質的に同じアミノ酸配列を有してもよい。

本明細書で用いる場合、用語「ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２をコードするヌクレオチド配列」は、ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２タンパク質またはその部分をコードするヌクレオチド配列を意味する。用語「ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２をコードするヌクレオチド配列」はまた、ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２コード配列、例えばＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２アイソフォーム、変異体ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２遺伝子、ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２遺伝子のスプライスバリアント、およびＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２遺伝子多型を含むものとする。ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２をコードする核酸配列は、ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２をコードするｍＲＮＡ配列を含み、それはまた、「ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２ｍＲＮＡ」と称することもある。ヒトＴＩＭＰ１ｍＲＮＡおよびＴＩＭＰ２ｍＲＮＡの例示的な配列は、それぞれ、配列番号１および配列番号２に記載されている。

本明細書で用いる場合、用語「核酸分子」または「核酸」は、互換可能に用いられ、オリゴヌクレオチド、ヌクレオチドまたはポリヌクレオチドを指す。「核酸分子」のバリエーションは、本明細書にさらに詳細に記載されている。核酸分子は、本明細書に記載の修飾核酸分子と非修飾核酸分子の両方を含む。核酸分子は、デオキシリボヌクレオチド、リボヌクレオチド、修飾ヌクレオチドまたはヌクレオチドアナログを、あらゆる組合せで含んでもよい。

本明細書で用いる場合、用語「ヌクレオチド」は、糖（またはそのアナログ、または修飾糖）、ヌクレオチド塩基（またはそのアナログ、または修飾塩基）およびリン酸基（またはそのアナログ、または修飾リン酸基）を有する化学部分を指す。ヌクレオチドは、本明細書に記載の修飾ヌクレオチドと非修飾ヌクレオチドの両方を含む。本明細書で用いる場合、ヌクレオチドは、デオキシリボヌクレオチド（例えば非修飾デオキシリボヌクレオチド）、リボヌクレオチド（例えば非修飾リボヌクレオチド）、および修飾ヌクレオチドアナログを含んでもよく、修飾ヌクレオチドアナログは、とりわけ、ロックド核酸および非ロックド（unlocked）核酸、ペプチド核酸、Ｌ−ヌクレオチド（ミラーヌクレオチドとも称する）、エチレン架橋核酸（ＥＮＡ）、アラビノシド、ＰＡＣＥ、六炭糖を有するヌクレオチド、ならびに、しばしば非ヌクレオチドとみなされるヌクレオチドアナログ（無塩基ヌクレオチドを含む）を含む。一部の態様において、ヌクレオチドは、糖、ヌクレオチド塩基および／またはリン酸基が、当該技術分野において既知の任意の修飾（例えば、本明細書に記載された修飾）で修飾されていてもよい。本明細書で用いる「ポリヌクレオチド」または「オリゴヌクレオチド」は、連結されたヌクレオチドの鎖を指す。ポリヌクレオチドおよびオリゴヌクレオチドは、同様に、当該技術分野において周知のように、および／または、本明細書に開示されているように、ヌクレオチド糖、ヌクレオチド塩基およびリン酸骨格に修飾を有してもよい。

本明細書で用いる場合、用語「短鎖干渉核酸」、「ｓｉＮＡ」または「短鎖干渉核酸分子」は、遺伝子発現またはウイルス複製を調節することができるあらゆる核酸分子を指す。好ましくは、ｓｉＮＡは遺伝子発現またはウイルス複製を阻害または下方調節する。ｓｉＮＡは、限定されずに、配列特異的ＲＮＡｉを誘導することができる核酸分子、例えば、短鎖干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）、マイクロＲＮＡ（ｍｉＲＮＡ）、短鎖ヘアピンＲＮＡ（ｓｈＲＮＡ）、短鎖干渉オリゴヌクレオチド、短鎖干渉核酸、短鎖干渉修飾オリゴヌクレオチド、化学修飾ｓｉＲＮＡ、転写後遺伝子サイレンシングＲＮＡ（ｐｔｇｓＲＮＡ）などを含む。本明細書で用いる場合、「短鎖干渉核酸」、「ｓｉＮＡ」または「短鎖干渉核酸分子」は、本明細書の別の箇所でより詳細に記載された意味を有する。

本明細書で用いる場合、用語「相補的」は、核酸が、他の核酸配列と、古典的なワトソン−クリック型か、または他の非古典的なタイプにより水素結合を形成できることを意味する。本明細書に開示される核酸分子に関して、核酸分子の、その相補配列との結合自由エネルギーは、核酸が、関連する機能、例えばＲＮＡｉ作用を遂行することを許容するのに十分である。核酸分子の結合自由エネルギーの決定は当該技術分野において周知である（例えば、Turner et al., 1987, CSH Symp. Quant. Biol. LII pp. 123-133、Frier et al., 1986, Proc. Nat. Acad. Sci. USA 83:9373-9377、Turner et al., 1987, J. Am. Chem. Soc. 109:3783-3785を参照）。相補性パーセントは、第２の核酸配列と水素結合（例えば、ワトソン−クリック塩基対）を形成することができる核酸分子の連続する残基のパーセンテージを示す（例えば、第１のオリゴヌクレオチドの合計１０ヌクレオチドのうち５、６、７、８、９または１０ヌクレオチドが、１０個のヌクレオチドを有する第２の核酸配列と塩基対を形成することは、それぞれ、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％および１００％の相補性を表す）。「完全に相補的」は、核酸配列の全ての連続する残基が、第２の核酸配列における同じ数の連続する残基と水素結合することを意味する。一態様において、本明細書に開示される核酸分子は、１または２以上の標的核酸分子またはその部分に相補的なヌクレオチドを、約１５〜約３５個以上（例えば約１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４または３５個以上）含む。

本明細書で用いる場合、用語「センス領域」は、ｓｉＮＡ分子のアンチセンス領域と（部分的にまたは完全に）相補的なｓｉＮＡ分子のヌクレオチド配列を指す。ｓｉＮＡ分子のセンス鎖は、標的核酸配列と相同性を有する核酸配列を含んでもよい。本明細書で用いる場合、「センス鎖」は、センス領域を含み、また追加のヌクレオチドを含んでもよい核酸分子を指す。

本明細書で用いる場合、用語「アンチセンス領域」は、標的核酸配列と（部分的にまたは完全に）相補的なｓｉＮＡ分子のヌクレオチド配列を指す。ｓｉＮＡ分子のアンチセンス鎖は、ｓｉＮＡ分子のセンス領域に相補的な核酸配列を任意に含むことができる。本明細書で用いる場合、「アンチセンス鎖」はアンチセンス領域を含み、また追加のヌクレオチドを含んでもよい核酸分子を指す。

本明細書で用いる場合、用語「ＲＮＡ」は、少なくとも１個のリボヌクレオチド残基を含む分子を指す。

本明細書で用いる場合、用語「二重鎖領域」は、相補的か実質的に相補的な２個のオリゴヌクレオチドにおいて、ワトソン−クリック型塩基対、または、相補的か実質的に相補的な２個のオリゴヌクレオチド鎖の間での二重鎖を可能にする他の任意の方法によって、互いに塩基対を形成する領域を指す。例えば、２１ヌクレオチド単位を有するオリゴヌクレオチド鎖は、２１ヌクレオチド単位の別のオリゴヌクレオチドと塩基対を形成するが、二重鎖領域が１９塩基対からなるよう、各々の鎖の１９塩基のみが相補的か実質的に相補的であってもよい。残りの塩基対は、例えば、５’および３’オーバーハングとして存在してもよい。さらに、二重鎖領域内で１００％の相補性は必要とされず、実質的な相補性が二重鎖領域内で許容される。実質的な相補性は、生物学的条件下でアニーリングできる鎖間の相補性を指す。２本の鎖が生物学的条件下でアニーリングができるかを実験的に決定する技法は、当該技術分野において周知である。あるいは、２本の鎖を合成し、生物学的条件下で一緒に添加して、これらが互いにアニーリングするかを決定することができる。

本明細書で用いる場合、用語「非対合（non-pairing）ヌクレオチドアナログ」は、非塩基対部分を含むヌクレオチドアナログを意味し、非塩基対部分は、限定されずに、６デスアミノアデノシン（ネブラリン）、４−Ｍｅ−インドール、３−ニトロピロール、５−ニトロインドール、Ｄｓ、Ｐａ、Ｎ３−ＭｅリボＵ、Ｎ３−ＭｅリボＴ、Ｎ３−ＭｅｄＣ、Ｎ３−Ｍｅ−ｄＴ、Ｎ１−Ｍｅ−ｄＧ、Ｎ１−Ｍｅ−ｄＡ、Ｎ３−エチル−ｄＣ、Ｎ３−ＭｅｄＣを含む。一部の態様において、非塩基対ヌクレオチドアナログは、リボヌクレオチドである。他の態様において、それはデオキシリボヌクレオチドである。

本明細書で用いる場合、用語「末端官能基」は、限定されずに、ハロゲン、アルコール、アミン、カルボン酸、エステル、アミド、アルデヒド、ケトン、エーテル基を含む。

本明細書で用いる「無塩基ヌクレオチド」または「無塩基ヌクレオチドアナログ」は、本明細書および当該技術分野において、しばしば、偽ヌクレオチドまたは非定型部分とも称することがある。ヌクレオチドは核酸のモノマー単位であり、一般的に、リボースまたはデオキシリボース糖、リン酸、および塩基（ＤＮＡにおけるアデニン、グアニン、チミンまたはシトシン、ＲＮＡにおけるアデニン、グアニン、ウラシルまたはシトシン）からなるが、無塩基または偽ヌクレオチドは塩基を欠き、したがって、厳密には、当該技術分野で一般的に用いられる用語としてのヌクレオチドではない。無塩基デオキシリボース部分は、例えば、無塩基デオキシリボース−３’−ホスフェート、１，２−ジデオキシ−Ｄ−リボフラノース−３−ホスフェート、１，４−アンヒドロ−２−デオキシ−Ｄ−リビトール−３−ホスフェートを含む。逆位無塩基デオキシリボース部分は、逆位デオキシリボ無塩基、３’，５’逆位デオキシ無塩基５’−ホスフェートを含む。

本明細書で用いる用語「キャッピング部分」（ｚ’’）は、（Ｎ’）ｙの５’末端に共有結合的に連結できる部分を含み、無塩基リボース部分、無塩基デオキシリボース部分、無塩基リボースおよび無塩基デオキシリボース部分の修飾体（２’Ｏアルキル修飾体を含む）、逆位無塩基リボースおよび無塩基デオキシリボース部分およびその修飾体、Ｃ６−イミノ−Ｐｉ、Ｌ−ＤＮＡとＬ−ＲＮＡを含むミラーヌクレオチド、５’ＯＭｅヌクレオチド、および、ヌクレオチドアナログ、例えば、４’，５’−メチレンヌクレオチド、１−（β−Ｄ−エリスロフラノシル）ヌクレオチド、４’チオヌクレオチド、炭素環式ヌクレオチド、５’−アミノ−アルキルホスフェート、１，３−ジアミノ−２−プロピルホスフェート、３−アミノプロピルホスフェート、６−アミノヘキシルホスフェート、１２−アミノドデシルホスフェート、ヒドロキシプロピルホスフェート、１，５−アンヒドロヘキシトールヌクレオチド、アルファ−ヌクレオチド、トレオ−ペントフラノシルヌクレオチド、非環式３’，４’−セコヌクレオチド、３，４−ジヒドロキシブチルヌクレオチド、３，５−ジヒドロキシペンチルヌクレオチド、５’−５’−逆位無塩基部分、１，４−ブチレングリコールホスフェート、５’−アミノおよび架橋または非架橋メチルホスホネートおよび５’−メルカプト部分を含む。

特定のキャッピング部分は、無塩基リボースまたは無塩基デオキシリボース部分、逆位無塩基リボースまたは無塩基デオキシリボース部分、Ｃ６−アミノ−Ｐｉ、Ｌ−ＤＮＡおよびＬ−ＲＮＡを含むミラーヌクレオチドであってもよい。本明細書に開示される核酸分子は、１個または２個以上の逆位ヌクレオチド、例えば、逆位チミジンまたは逆位アデニンを用いて合成してもよい（例えば、Takei, et al., 2002. JBC 277(26):23800-06参照）。

本明細書で用いる用語「非定型部分」は、無塩基部分、逆位無塩基部分、炭化水素（アルキル）部分およびその誘導体を含む非ヌクレオチド部分を指し、さらに、デオキシリボヌクレオチド、修飾デオキシリボヌクレオチド、ミラーヌクレオチド（Ｌ−ＤＮＡまたはＬ−ＲＮＡ）、非塩基対ヌクレオチドアナログおよび２’−５’ヌクレオチド間リン酸結合で隣接するヌクレオチドと連結したヌクレオチド、ＬＮＡおよびエチレン架橋核酸を含む架橋核酸、結合修飾ヌクレオチド（例えばＰＡＣＥ）および塩基修飾ヌクレオチド、ならびに、本明細書で非定型部分として明示的に開示されているさらなる部分を含む。

本明細書で用いる場合、用語「阻害する」、「下方調節する」または「低減する」は、遺伝子発現に関して、遺伝子の発現、または１または２以上のタンパク質またはタンパク質サブユニットをコードするＲＮＡ分子または同等のＲＮＡ分子（例えばｍＲＮＡ）のレベル、または１または２以上のタンパク質またはタンパク質サブユニットの活性が、阻害因子（核酸分子、例えばｓｉＮＡ、例えば、本明細書に記載の構造的特徴を有するものなど）の非存在下で観察されるものよりも低減していることを意味し、例えば、発現は、インヒビターの非存在下で観察されるものの９０％、８０％、７０％、６０％、５０％、４０％、３０％、２０％、１０％、５％またはそれ未満に低減していてもよい。

図１Ａ〜１Ｄは、例示的なポリヌクレオチド配列およびポリペチド配列を示した図である。図１Ａは、ヒトＴＩＭＰ１のｍＲＮＡ配列を示す（NM_003254.2 GI:73858576、配列番号１）。図１Ｂは、ＴＩＭＰ２のｍＲＮＡ配列を示す（NM_003255.4 GI:738585774、配列番号２）。図１Ｃは、ヒトＴＩＭＰ１のポリペチド配列を表す（NP_003245.1 GI:4507509、配列番号３）。図１Ｄは、ヒトＴＩＭＰ２のポリペチド配列を示す（NP_003246.1 GI:4507511、配列番号４）。

図２は、ｑＰＣＲで決定した、ＴＩＭＰ１に対するＴＩＭＰ１−Ａ、ＴＩＭＰ１−ＢまたはＴＩＭＰ１−ＣｓｉＲＮＡ（表Ｃ）のノックダウン効率を示した図である。ｓｉＲＮＡ化合物は、標的であるＴＩＭＰ１遺伝子をノックダウンすることができた。

図３は、ｑＰＣＲで決定した、ＴＩＭＰ２−Ａ、ＴＩＭＰ２−Ｂ、ＴＩＭＰ２−Ｃ、ＴＩＭＰ２−ＤおよびＴＩＭＰ２−ＥｓｉＲＮＡ（表Ｄ）のノックダウン効率を示した図である。ｓｉＲＮＡ化合物は、標的であるＴＩＭＰ２遺伝子をノックダウンすることができた。

図４は、肝線維症の処置におけるｓｉＴＩＭＰ１およびｓｉＴＩＭＰ２の有効性を試験したin vivoアッセイの結果を示した図である。肝線維化領域の分析は、シリウスレッド染色を用いて行った。線維化領域は、４枚の肝スライドの平均として計算した。棒グラフは、各群についての染色のデジタル定量化をまとめたものである。

発明の詳細な説明
ＲＮＡ干渉およびｓｉＮＡ核酸分子
ＲＮＡ干渉は、短鎖干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）によって誘導される動物における配列特異的転写後遺伝子サイレンシングのプロセスを指す（Zamore et al., 2000, Cell, 101, 25-33、Fire et al., 1998, Nature, 391, 806、Hamilton et al., 1999, Science, 286, 950-951、Lin et al., 1999, Nature, 402, 128-129、Sharp, 1999, Genes & Dev., 13:139-141およびStrauss, 1999, Science, 286, 886）。植物における対応するプロセス（Heifetz et al., ＰＣＴ国際公開WO 99/61631）は、転写後遺伝子サイレンシング（ＰＴＧＳ）またはＲＮＡサイレンシングとしばしば称される。転写後遺伝子サイレンシングのプロセスは、外来遺伝子の発現を防止するのに用いられる進化的に保存された細胞防衛機構であると考えられている（Fire et al., 1999, Trends Genet., 15, 358）。外来遺伝子の発現からのかかる保護は、ウイルス感染、または宿主ゲノムへのトランスポゾン要素のランダムな統合に由来する二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）の産生に対応して、相同な一本鎖ＲＮＡまたはウイルスゲノムＲＮＡを特異的に破壊する細胞反応を介して進化したと考えられる。細胞におけるｄｓＲＮＡの存在は、まだ完全に特徴づけられていないメカニズムによって、ＲＮＡｉ反応を引き起こす。このメカニズムは、二本鎖ＲＮＡに特異的なリボヌクレアーゼを伴う他の既知のメカニズム、例えば、プロテインキナーゼＰＫＲおよび２’，５’−オリゴアデニル酸合成酵素の活性化によって生じ、リボヌクレアーゼＬによるｍＲＮＡの非特異的切断をもたらすインターフェロン反応などとは異なるようである（例えば、米国特許第6,107,094号、第5,898,031号、Clemens et al., 1997, J. Interferon & Cytokine Res., 17, 503-524、Adah et al., 2001, Curr. Med. Chem., 8, 1189参照）。

細胞における長いｄｓＲＮＡの存在は、ダイサーと称するリボヌクレアーゼＩＩＩ酵素の活性を刺激する（Bass, 2000, Cell, 101, 235、Zamore et al., 2000, Cell, 101, 25-33、Hammond et al., 2000, Nature, 404, 293）。ダイサーは、短鎖干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）として知られるｄｓＲＮＡの短い部分へのｄｓＲＮＡのプロセッシングに関与している（Zamore et al., 2000, Cell, 101, 25-33、Bass, 2000, Cell, 101, 235、Berstein et al., 2001, Nature, 409, 363）。ダイサー活性に由来する短鎖干渉ＲＮＡは典型的には長さが約２１〜約２３ヌクレオチドであり、約１９塩基対の二重鎖を含む（Zamore et al., 2000, Cell, 101, 25-33、Elbashir et al., 2001, Genes Dev., 15, 188）。ダイサーはまた、翻訳調節に関与する保存された構造の前駆体ＲＮＡから、２１および２２ヌクレオチドの短鎖一過性ＲＮＡ（ｓｔＲＮＡ）の切り出しにも関与している（Hutvagner et al., 2001, Science, 293, 834）。ＲＮＡｉ反応はまた、一般にＲＮＡ誘導サイレンシング複合体（ＲＩＳＣ）と称されるエンドヌクレアーゼ複合体を特徴とし、これはｓｉＲＮＡ二重鎖のアンチセンス鎖に相補的な配列を有する一本鎖ＲＮＡの切断を誘導する。標的ＲＮＡの切断は、ｓｉＲＮＡ二重鎖のアンチセンス鎖に相補的な領域の中央で生じる（Elbashir et al., 2001, Genes Dev., 15, 188）。

ＲＮＡｉは、種々の系で研究されている。Fire et al., 1998, Nature, 391, 806は、 C. elegansにおいてＲＮＡｉを観察した最初のものであった。Bahramian and Zarbl, 1999, Molecular and Cellular Biology, 19, 274-283およびWianny and Goetz, 1999, Nature Cell Biol., 2, 70は、哺乳動物の系におけるｄｓＲＮＡによって誘導されるＲＮＡｉを記載している。Hammond et al., 2000, Nature, 404, 293は、ｄｓＲＮＡをトランスフェクションしたショウジョウバエ細胞におけるＲＮＡｉを記載している。Elbashir et al., 2001, Nature, 411, 494およびTuschl et al., ＰＣＴ国際公開WO 01/75164は、ヒト胎児腎臓細胞とＨｅＬａ細胞を含む培養哺乳動物細胞への合成２１ヌクレオチドＲＮＡの二重鎖の導入によって誘導されるＲＮＡｉを記載している。ショウジョウバエ胚溶解物における最近の研究（Elbashir et al., 2001, EMBO J., 20, 6877およびTuschl et al., ＰＣＴ国際公開WO 01/75164）は、ｓｉＲＮＡの長さ、構造、化学組成および効果的なＲＮＡｉ活性を誘導するために重要な配列に関する特定の必要条件を明らかにした。

核酸分子（例えば、本明細書に記載の構造特徴を有するもの）は、配列特異的にＲＮＡ干渉「ＲＮＡｉ」または遺伝子サイレンシングを誘導することによって、遺伝子発現またはウイルス複製を阻害または下方調節することができる（例えば、Zamore et al., 2000, Cell, 101, 25-33、Bass, 2001, Nature, 411, 428-429、Elbashir et al., 2001, Nature, 411, 494-498、およびKreutzer et al., ＰＣＴ国際公開WO 00/44895、Zernicka-Goetz et al., ＰＣＴ国際公開WO 01/36646、Fire, ＰＣＴ国際公開WO 99/32619、Plaetinck et al., ＰＣＴ国際公開WO 00/01846、Mello and Fire, ＰＣＴ国際公開WO 01/29058、Deschamps-Depaillette, ＰＣＴ国際公開WO 99/07409、およびLi et al., ＰＣＴ国際公開WO 00/44914、Allshire, 2002, Science, 297, 1818-1819、Volpe et al., 2002, Science, 297, 1833-1837、Jenuwein, 2002, Science, 297, 2215-2218、およびHall et al., 2002, Science, 297, 2232-2237、Hutvagner and Zamore, 2002, Science, 297, 2056-60、McManus et al., 2002, RNA, 8, 842-850、Reinhart et al., 2002, Gene & Dev., 16, 1616-1626、およびReinhart & Bartel, 2002, Science, 297, 1831参照）。

ｓｉＮＡ核酸分子は、２個の別々のポリヌクレオチド鎖から組み立てられてもよく、ここで一方の鎖はセンス鎖であり、他方の鎖はアンチセンス鎖であり、アンチセンス鎖とセンス鎖は自己相補性である（すなわち、各々の鎖は、他の鎖におけるヌクレオチド配列に相補的であるヌクレオチド配列を含む）。例えば、アンチセンス鎖とセンス鎖は、提供される核酸分子について、本明細書に記載の任意の長さおよび構造を有する二重鎖または二本鎖構造を形成する。例えば、ここで、二本鎖領域（二重鎖領域）は約１５〜約４９（例えば約１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８または４９）塩基対であり、アンチセンス鎖は、標的核酸分子（すなわちＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２ｍＲＮＡ）におけるヌクレオチド配列またはその部分に相補的であるヌクレオチド配列を含み、センス鎖は、標的核酸配列またはその部分と一致するヌクレオチド配列を含む（例えば、この中の核酸分子の約１７〜約４９以上のヌクレオチドは、標的核酸またはその部分に相補的である）。

特定の側面および態様において、本明細書において提供される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、以下でさらに詳細に解説されるように、「ＲＩＳＣ長」分子であってもよく、ダイサー基質であってもよい。

ｓｉＮＡ核酸分子は、別々のセンスおよびアンチセンス配列または領域を含んでもよく、ここで、センスおよびアンチセンス領域は、当該技術分野で既知のヌクレオチドまたは非ヌクレオチドリンカー分子によって共有結合的に連結されるか、あるいはイオン相互作用、水素結合、ファンデルワールス相互作用、疎水的相互作用および／またはスタッキング相互作用によって非共有結合的に連結されている。核酸分子は、標的遺伝子ヌクレオチド配列に相補的なヌクレオチド配列を含んでもよい。核酸分子は、標的遺伝子のヌクレオチド配列と、標的遺伝子の発現阻害を引き起こす仕方で相互作用することができる。

あるいは、ｓｉＮＡ核酸分子は、単一のポリヌクレオチドから組み立てられ、ここで、核酸分子の自己相補的なセンスおよびアンチセンス領域は、核酸ベースまたは非核酸ベースのリンカーによって連結されている。すなわちアンチセンス鎖およびセンス鎖は、折り畳まれて二重鎖領域を形成する（例えば、当該技術分野において周知のヘアピン構造を形成する）アンチセンス領域とセンス領域とを有する単一のポリヌクレオチドの一部である。かかるｓｉＮＡ核酸分子は、二重鎖、非対称二重鎖、ヘアピンまたは非対称ヘアピン二次構造を有し、自己相補的なセンスおよびアンチセンス領域を有するポリヌクレオチドであってもよく、ここで、アンチセンス領域は、別個の標的核酸分子またはその部分におけるヌクレオチド配列に相補的なヌクレオチド配列を含み、センス領域は、標的核酸配列（例えば、ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２ｍＲＮＡの配列）に対応するヌクレオチド配列を有する。かかるｓｉＮＡ核酸分子は、２個または３個以上のループ構造と、自己相補的なセンスおよびアンチセンス領域を含むステムとを有する環状の一本鎖ポリヌクレオチドであってもよく、ここで、アンチセンス領域は標的核酸分子またはその部分におけるヌクレオチド配列に相補的なヌクレオチド配列を含み、センス領域は、標的核酸配列またはその部分に対応するヌクレオチド配列を有し、環状ポリヌクレオチドは、in vivoまたはin vitroでプロセシングされ、ＲＮＡｉを誘導することができる活性核酸分子を生成することができる。

以下の命名法が、ｓｉＮＡ分子の長さとオーバーハングを記述するために当該技術分野においてしばしば用いられ、本明細書および例の全体にわたって用いることができる。二重鎖に付与される名称は、オリゴマーの長さとオーバーハングの有無を示す。例えば、「２１＋２」二重鎖は、２本の核酸鎖を含み、その両方が２１ヌクレオチドの長さであり（２１ｍｅｒｓｉＲＮＡ二重鎖または２１ｍｅｒ核酸とも呼ばれる）、２ヌクレオチドの３’オーバーハングを有する。「２１−２」のデザインは、２ヌクレオチドの５’オーバーハングを有する２１ｍｅｒ核酸二重鎖を指す。２１−０のデザインは、オーバーハングを有しない（平滑な）２１ｍｅｒ核酸二重鎖である。「２１＋２ＵＵ」は２ヌクレオチドの３’オーバーハングを有し、３’末端の末端の２ヌクレオチドが両方ともＵ残基である、２１ｍｅｒ二重鎖である（それは、標的配列とのミスマッチをもたらし得る）。前記の命名法は、様々な長さの鎖、二重鎖およびオーバーハングのｓｉＮＡ分子に適用することができる（例えば、１９−０、２１＋２、２７＋２、など）。代替的だが、類似した命名法において、「２５／２７」は、２５塩基のセンス鎖と２７塩基のアンチセンス鎖とを有し、２ヌクレオチドの３’オーバーハングを伴う非対称の二重鎖である。「２７／２５」は、２７塩基のセンス鎖と２５塩基のアンチセンス鎖とを有する非対称の二重鎖である。

化学修飾
特定の側面および態様において、本明細書において提供される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、１または２以上の修飾（または化学修飾）を含む。特定の態様において、かかる修飾は、分子を、「非修飾」リボヌクレオチドまたは非修飾リボ核酸と称することがある、標準的なリボヌクレオチドまたはＲＮＡ分子（すなわち、標準的なアデニン、シトシン、ウラシルまたはグアニン部分を含むもの）とは異なるようにする、核酸分子またはポリヌクレオチドへの任意の変化を含む。アデニン、シトシン、チミンまたはグアニン部分によって代表される、２’−デオキシ糖を有する伝統的なＤＮＡ塩基およびポリヌクレオチドは、「非修飾デオキシリボヌクレオチド」または「非修飾デオキシリボ核酸」と称することができる。したがって、本明細書で用いる用語「非修飾ヌクレオチド」または「非修飾核酸」は、それと異なる明確な指示がない限り、「非修飾リボヌクレオチド」または「非修飾リボ核酸」を指す。かかる修飾は、ヌクレオチド糖、ヌクレオチド塩基、ヌクレオチドリン酸基および／またはポリヌクレオチドのリン酸骨格におけるものであってもよい。

特定の態様において、本明細書に開示される修飾は、分子のＲＮＡｉ活性を増大させるため、および／または分子のin vivoでの安定性、特に血清中の安定性を増大させるため、および／または分子の生体利用能を増大させるために用いてもよい。修飾の非限定例は、限定されずに、ヌクレオチド間またはヌクレオシド間結合、核酸分子の任意の位置および鎖におけるデオキシリボヌクレオチドまたはジデオキシリボヌクレオチド、２’位における、好ましくはアミノ、フルオロ、メトキシ、アルコキシおよびアルキルから選択される修飾を有する核酸（例えばリボ核酸）、２’−デオキシリボヌクレオチド、２’−Ｏ−メチルリボヌクレオチド、２’−デオキシ−２’−フルオロリボヌクレオチド、「ユニバーサル塩基」ヌクレオチド、非環式ヌクレオチド、５−Ｃ−メチルヌクレオチド、ビオチン基、および末端グリセリルおよび/または逆位デオキシ無塩基残基の導入、立体障害分子、例えば、蛍光分子などを含む。他のヌクレオチド修飾因子は、３’−デオキシアデノシン（コルジセピン）、３’−アジド−３’−デオキシチミジン（ＡＺＴ）、２’，３’−ジデオキシイノシン（ｄｄＩ）、２’，３’−ジデオキシ−３’−チアシチジン（３ＴＣ）、２’，３’−ジデヒドロ−２’，３’−ジデオキシチミジン（ｄ４Ｔ）、および３’−アジド−３’−デオキシチミジン（ＡＺＴ）、２’，３’−ジデオキシ−３’−チアシチジン（３ＴＣ）および２’，３’−ジデヒドロ−２’，３’−ジデオキシチミジン（ｄ４Ｔ）の一リン酸ヌクレオチドを含んでもよい。種々の修飾に関するさらなる詳細は、以下でさらに詳細に解説する。

修飾ヌクレオチドは、ノーザンコンフォメーション（例えば、ノーザン擬似回転サイクル、例えばSaenger, Principles of Nucleic Acid Structure, Springer-Verlag ed., 1984参照）を有するものを含む。ノーザンコンフォメーションを有するヌクレオチドの非限定例は、ロックド核酸（ＬＮＡ）ヌクレオチド（例えば２’−Ｏ、４’−Ｃ−メチレン−（Ｄ−リボフラノシル）ヌクレオチド）、２’−メトキシエトキシ（ＭＯＥ）ヌクレオチド、２’−メチルチオエチル、２’−デオキシ−２’−フルオロヌクレオチド、２’−デオキシ−２’−クロロヌクレオチド、２’−アジドヌクレオチド、および２’−Ｏ−メチルヌクレオチドを含む。ロックド核酸またはＬＮＡは、例えば、Elman et al., 2005、Kurreck et al., 2002、Crinelli et al., 2002、Braasch and Corey, 2001、Bondensgaard et al., 2000、Wahlestedt et al., 2000、および国際特許公開WO 00/47599、WO 99/14226、およびWO 98/39352およびWO 2004/083430に記載されている。一態様において、ＬＮＡはセンス鎖の５’末端に組み込まれている。

化学修飾はまた、アンロックド核酸またはＵＮＡを含み、これはＣ２’−Ｃ３’結合が存在しない非ヌクレオチド、非環式アナログである（ＵＮＡは、真の意味でのヌクレオチドではないが、ここで考慮する「修飾」ヌクレオチドまたは修飾核酸の範囲に明示的に含まれる）。具体的な態様において、オーバーハングを有する核酸分子は、オーバーハングの位置（すなわち２ヌクレオチドオーバーハング）にＵＮＡを有するよう修飾されてもよい。他の態様において、ＵＮＡは３’または５’末端に含まれる。ＵＮＡは、核酸鎖に沿ってどこに位置してもよく、すなわち７位に位置してもよい。核酸分子は、１個または２個以上のＵＮＡを含んでもよい。例示的なＵＮＡは、Nucleic Acids Symposium Series No. 52 p. 133-134 (2008)に開示されている。特定の態様において、本明細書に記載の核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、１個または２個以上のＵＮＡ、または１個のＵＮＡを含む。一部の態様において、本明細書に記載の３’オーバーハングを有する核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、３’オーバーハングに１個または２個のＵＮＡを含む。一部の態様において、本明細書に記載の核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、アンチセンス鎖、例えばアンチセンス鎖の６位または７位に、ＵＮＡ（例えば１個のＵＮＡ）を含む。化学修飾はまた、非対合ヌクレオチドアナログ、例えば、本明細書に開示されるものを含む。化学修飾はさらに、本明細書に開示される非定型部分をさらに含む。

化学修飾はまた、オリゴヌクレオチドの５’または３’部分に末端修飾を含み、これはキャッピング部分としても知られる。かかる末端修飾は、ヌクレオチド、修飾ヌクレオチド、脂質、ペプチドおよび糖から選択される。

化学修飾はまた、６員の「６員環ヌクレオチドアナログ」を含む。６員環ヌクレオチドアナログの例は、Allart, et al., Nucleosides & Nucleotides, 1998, 17:1523-1526およびPerez-Perez, et al., 1996, Bioorg. and Medicinal Chem Letters 6:1457-1460に開示されている。ヘキシトールおよびアルトリトールヌクレオチドモノマーを含む６員環ヌクレオチドアナログは、国際特許出願公開WO 2006/047842に開示されている。

化学修飾はまた、正常な天然に存在するヌクレオチドと比較して逆のキラリティーを有する「ミラー」ヌクレオチドを含む。つまり、ミラーヌクレオチドは、天然に存在するＤ−ヌクレオチドのＬ−ヌクレオチドアナログであってもよい（米国特許第6,602,858号参照）。ミラーヌクレオチドは、少なくとも１つの糖または塩基修飾および／または骨格修飾、例えば、本明細書に記載のもの、例えば、ホスホロチオエートまたはホスホネート部分などをさらに含んでもよい。米国特許第6,602,858号は、少なくとも１個のＬ−ヌクレオチド置換を含む核酸触媒を開示している。ミラーヌクレオチドは、例えば、Ｌ−ＤＮＡ（Ｌ−デオキシリボアデノシン−３’−ホスフェート（ミラーｄＡ）、Ｌ−デオキシリボシチジン−３’−ホスフェート（ミラーｄＣ）、Ｌ−デオキシリボグアノシン−３’−ホスフェート（ミラーｄＧ）、Ｌ−デオキシリボチミジン−３’−ホスフェート（鏡像ｄＴ））およびＬ−ＲＮＡ（Ｌ−リボアデノシン−３’−ホスフェート（ミラーｒＡ）、Ｌ−リボシチジン−３’−ホスフェート（ミラーｒＣ）、Ｌ−リボグアノシン−３’−ホスフェート（ミラーｒＧ）、Ｌ−リボウラシル−３’−ホスフェート（ミラーｄＵ）を含む。

一部の態様において、修飾リボヌクレオチドは、修飾デオキシリボヌクレオチド、例えば、５’末端位（１位）におけるヌクレオチドとして有用たり得る５’ＯＭｅＤＮＡ（５−メチル−デオキシリボグアノシン−３’−ホスフェート）、ＰＡＣＥ（デオキシリボアデニン３’ホスホノアセテート、デオキシリボシチジン３’ホスホノアセテート、デオキシリボグアノシン３’ホスホノアセテート、デオキシリボチミジン３’ホスホノアセテート）を含む。

修飾は、本明細書に開示される核酸分子の１または２以上の鎖、例えば、センス鎖、アンチセンス鎖または両方の鎖に存在してもよい。特定の態様において、アンチセンス鎖は修飾を含んでもよく、センス鎖は非修飾ＲＮＡのみを含んでもよい。

核酸塩基
本明細書に開示される核酸の核酸塩基は、非修飾リボヌクレオチド（プリンおよびピリミジン）、例えばアデニン、グアニン、シトシン、ウリジンを含んでもよい。一方または両方の鎖の核酸塩基は、天然核酸塩基および合成核酸塩基、例えばチミン、キサンチン、ヒポキサンチン、イノシン、２−アミノアデニン、アデニンおよびグアニンの６−メチル誘導体および他のアルキル誘導体、任意の「ユニバーサル塩基」ヌクレオチド、アデニンおよびグアニンの２−プロピル誘導体および他のアルキル誘導体、５−ハロウラシルおよび５−ハロシトシン、５−プロピニルウラシルおよび５−プロピニルシトシン、６−アゾウラシル、６−アゾシトシンおよび６−アゾチミン、５−ウラシル（シュードウラシル）、４−チオウラシル、８−ハロ、アミノ、チオール、チオアルキル、ヒドロキシルおよび他の８−置換アデニンおよびグアニン、５−トリフルオロメチルおよび他の５−置換ウラシルおよび５−置換シトシン、７−メチルグアニン、デアザプリン、プリンおよびピリミジンの複素環置換アナログ、例えばアミノエチオキシフェノキサジン、プリンおよびピリミジンの誘導体（例えば１−アルキル誘導体、１−アルケニル誘導体、複素芳香環誘導体および１−アルキニル誘導体）およびその互変異性体、８−オキソ−Ｎ６−メチルアデニン、７−ジアザキサンチン、５−メチルシトシン、５−メチルウラシル、５（１−プロピニル）ウラシル、５−（１−プロピニル）シトシンおよび４，４−エタノシトシンなどにより修飾されていてもよい。好適な塩基の他の例は、非プリン塩基および非ピリミジン塩基、例えば２−アミノピリジンおよびトリアジンなどを含む。

糖部分
本明細書に開示される核酸の糖部分は、何ら修飾のない２’−ヒドロキシル−ペントフラノシル糖部分を含んでもよい。あるいは、糖部分は修飾されていてもよく、例えば２’−デオキシ−ペントフラノシル糖部分、Ｄ−リボース、ヘキソース、ペントフラノシル糖部分の２’位における修飾、例えば、２’−Ｏ−アルキル（２’−Ｏ−メチルおよび２’−Ｏ−エチルを含む）、すなわち２’−アルコキシ、２’−アミノ、２’−Ｏ−アリル、２’−Ｓ−アルキル、２’−ハロゲン（２’−フルオロ、２’−クロロおよび２’−ブロモを含む）、２’−メトキシエトキシ、２’−Ｏ−メトキシエチル、２’−Ｏ−２−メトキシエチル、２’−アリルオキシ（−ＯＣＨ_２ＣＨ＝ＣＨ_２）、２’−プロパルギル、２’−プロピル、エチニル、プロペニル、ＣＦ、シアノ、イミダゾール、カルボキシレート、チオエート、Ｃ１〜Ｃ１０低級アルキル、置換低級アルキル、アルカリルまたはアラルキル、ＯＣＦ_３、ＯＣＮ、Ｏ−、Ｓ−またはＮ−アルキル、Ｏ−、Ｓ−またはＮ−アルケニル、ＳＯＣＨ_３、ＳＯ_２ＣＨ_３、ＯＮＯ_２、ＮＯ_２、Ｎ_３、ヘテロシクロアルキル、ヘテロシクロアルカリル、アミノアルキルアミノ、ポリアルキルアミノまたは置換シリル、特に、例えば、欧州特許EP 0 586 520 B1またはEP 0 618 925 B1に記載のものなどであってもよい。

アルキル基は、飽和脂肪族基を含み、これは直鎖アルキル基（例えばメチル、エチル、プロピル、ブチル、ペンチル、ヘキシル、ヘプチル、オクチル、ノニル、デシルなど）、分枝鎖アルキル基（イソプロピル、ｔｅｒｔ−ブチル、イソブチルなど）、シクロアルキル（脂環式）基（シクロプロピル、シクロペンチル、シクロヘキシル、シクロヘプチル、シクロオクチル）、アルキル置換シクロアルキル基を含む。特定の態様において、直鎖または分枝鎖アルキルはその骨格に６個またはそれ未満の炭素原子を有し（例えば、直鎖についてはＣ１〜Ｃ６、分枝鎖についてはＣ３〜Ｃ６）、より好ましくは４個またはそれ未満の炭素原子を有する。同様に、好ましいシクロアルキルは、その環構造中に３〜８個の炭素原子を有してもよく、より好ましくは５個または６個の炭素を環構造中に有してもよい。用語Ｃ１〜Ｃ６は、１〜６個の炭素原子を含有するアルキル基を含む。アルキル基は、置換アルキル基、例えば、炭化水素骨格の１個または２個以上の炭素上で水素に置換する置換基を有するアルキル部分であってもよい。かかる置換基は、例えば、アルケニル、アルキニル、ハロゲン、ヒドロキシル、アルキルカルボニルオキシ、アリールカルボニルオキシ、アルコキシカルボニルオキシ、アリールオキシカルボニルオキシ、カルボキシレート、アルキルカルボニル、アリールカルボニル、アルコキシカルボニル、アミノカルボニル、アルキルアミノカルボニル、ジアルキルアミノカルボニル、アルキルチオカルボニル、アルコキシル、ホスフェート、ホスホナト、ホスフィナト、シアノ、アミノ（アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、アリールアミノ、ジアリールアミノおよびアルキルアリールアミノを含む）、アシルアミノ（アルキルカルボニルアミノ、アリールカルボニルアミノ、カルバモイルおよびウレイドを含む）、アミジノ、イミノ、スルフヒドリル、アルキルチオ、アリールチオ、チオカルボキシレート、硫酸塩、アルキルスルフィニル、スルホナト、スルファモイル、スルホンアミド、ニトロ、トリフルオロメチル、シアノ、アジド、ヘテロシクリル、アルキルアリールまたは、芳香族部分または複素環式芳香族部分を含んでもよい。

アルコキシ基は、酸素原子に共有結合的に連結した、置換および非置換アルキル、アルケニルおよびアルキニル基を含む。アルコキシ基の例は、メトキシ、エトキシ、イソプロピルオキシ、プロポキシ、ブトキシおよびペントキシ基を含む。置換アルコキシ基の例は、ハロゲン化アルコキシ基を含む。アルコキシ基は、例えば、アルケニル、アルキニル、ハロゲン、ヒドロキシル、アルキルカルボニルオキシ、アリールカルボニルオキシ、アルコキシカルボニルオキシ、アリールオキシカルボニルオキシ、カルボキシレート、アルキルカルボニル、アリールカルボニル、アルコキシカルボニル、アミノカルボニル、アルキルアミノカルボニル、ジアルキルアミノカルボニル、アルキルチオカルボニル、アルコキシル、ホスフェート、ホスホナト、ホスフィナト、シアノ、アミノ（アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、アリールアミノ、ジアリールアミノおよびアルキルアリールアミノを含む）、アシルアミノ（アルキルカルボニルアミノ、アリールカルボニルアミノ、カルバモイルおよびウレイドを含む）、アミジノ、イミノ、スルフヒドリル、アルキルチオ、アリールチオ、チオカルボキシレート、硫酸塩、アルキルスルフィニル、スルホナト、スルファモイル、スルホンアミド、ニトロ、トリフルオロメチル、シアノ、アジド、ヘテロシクリル、アルキルアリールまたは芳香族部分または複素環式芳香族部分で置換されていてもよい。ハロゲン置換アルコキシ基の例は、限定されずに、フルオロメトキシに、ジフルオロメトキシ、トリフルオロメトキシ、クロロメトキシ、ジクロロメトキシ、トリクロロメトキシなどを含む。

一部の態様において、ペントフラノシル環は、ペントフラノシル環のＣ２’−Ｃ３’結合を欠く非環式誘導体と置き換わっていてもよい。例えば、アシクロヌクレオチドはｄＮＭＰに通常存在する２’−デオキシリボフラノシル糖の２’−ヒドロキシエトキシメチル基と置換してもよい。

ハロゲンは、フッ素、臭素、塩素、ヨウ素を含む。

骨格
本明細書に開示される核酸のヌクレオシドサブユニットは、ホスホジエステル結合によって互いに連結されていてもよい。ホスホジエステル結合は、任意に、他の結合で置換されていてもよい。例えば、ホスホロチオエート、チオリン酸−Ｄ−リボース体、トリエステル、チオエート、２’−５’架橋骨格（５’−２’とも称する）、ＰＡＣＥ、３’−（または−５’）デオキシ−３’−（または−５’）チオ−ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、ホスホロセレネート、３’−（または−５’）デオキシホスフィネート、ボラノホスフェート、３’−（または−５’）デオキシ−３’−（または５’−）アミノホスホルアミデート、水素ホスホネート、ホスホネート、ボラノリン酸エステル、ホスホルアミデート、アルキルまたはアリールホスホネートおよびホスホトリエステル修飾、アルキルホスホトリエステル、ホスホトリエステルリン結合、５’−エトキシホスホジエステル、Ｐ−アルキルオキシホスホトリエステル、メチルホスホネートなど、および非リン含有結合、例えば、炭酸塩、カルバメート、シリル、硫黄、スルホネート、スルホンアミド、ホルムアセタール、チオホルムアセチル、オキシム、メチレンイミノ、メチレンメチルイミノ、メチレンヒドラゾ、メチレンジメチルヒドラゾおよびメチレンオキシメチルイミノなどである。

本明細書に開示される核酸分子は、ペプチド核酸（ＰＮＡ）骨格を含んでもよい。ＰＮＡ骨格は、ペプチド結合で連結されたＮ（２−アミノエチル）グリシン単位の繰り返しを含む。種々の塩基、例えば、プリン、ピリミジン、天然および合成塩基は、メチレンカルボニル結合によって骨格に連結している。

末端ホスフェート
修飾は、末端リン酸基でなされてもよい。様々な安定化化学の非限定例を、例えば、核酸配列の３’末端を安定させるのに用いてもよく、これは、（１）［３〜３’］−逆位デオキシリボース、（２）デオキシリボヌクレオチド、（３）［５’−３’］−３’−デオキシリボヌクレオチド、（４）［５’−３’］−リボヌクレオチド、（５）［５’−３’］−３’−Ｏ−メチルリボヌクレオチド、（６）３’−グリセリル、（７）［３’−５’］−３’−デオキシリボヌクレオチド、（８）［３’−３’］−デオキシリボヌクレオチド、（９）［５’−２’］−デオキシリボヌクレオチドおよび（１０）［５−３’］−ジデオキシリボヌクレオチドを含む。さらに、非修飾骨格化学は、本明細書に記載の１または２以上の異なる骨格修飾と組み合わせることができる。
例示的な化学的に修飾した末端リン酸基は、以下に示すものを含む：

コンジュゲート（conjugate）
本明細書で提供される修飾ヌクレオチドおよび核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）はコンジュゲート、例えば化学修飾核酸分子に共有結合的に付着したコンジュゲートを含んでもよい。コンジュゲートの非限定例は、Vargeese et al., U.S. Ser. No. 10/427,160に記載のコンジュゲートおよびリガンドを含む。コンジュゲートは、生分解可能なリンカーを介して核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）に共有結合的に付着していてもよい。コンジュゲート分子は、化学修飾核酸分子のセンス鎖、アンチセンス鎖のいずれか一方または両方の鎖の３’末端に付着していてもよい。

コンジュゲート分子は、化学修飾核酸分子のセンス鎖、アンチセンス鎖のいずれか一方または両方の鎖の５’末端に付着していてもよい。コンジュゲート分子は、化学修飾核酸分子のセンス鎖、アンチセンス鎖のいずれか一方または両方の鎖の３’末端および５’末端の両方に付着していてもよく、またはこれらの任意の組合せであってもよい。一態様において、コンジュゲート分子は、生物系（例えば細胞）への化学修飾核酸分子の送達を容易にする分子を含んでもよい。別の態様において、化学修飾核酸分子に付着するコンジュゲート分子は、ポリエチレングリコール、ヒト血清アルブミンまたは細胞取り込みを誘導することができる細胞レセプターに対するリガンドである。化学修飾核酸分子に付着することができる、本明細書で企図される具体的なコンジュゲート分子の例は、Vargeese et al., U.S. Ser. No. 10/427,160に記載されている。

リンカー
本明細書において提供される核酸分子（例えばｓｉＮＡ）は、核酸のセンス領域と核酸のアンチセンス領域とを連結する、ヌクレオチドリンカー、非ヌクレオチドリンカー、またはにヌクレオチド／非ヌクレオチド複合リンカーを含んでもよい。ヌクレオチドリンカーは、長さが≧２ヌクレオチド、例えば長さが約３、４、５、６、７、８、９、１０ヌクレオチドのリンカーであってもよい。ヌクレオチドリンカーは、核酸アプタマーであってもよい。本明細書で用いる「アプタマー」または「核酸アプタマー」は、標的分子に特異的に結合する核酸分子を指し、ここで、前記核酸分子は、標的分子がその天然の状態で認識する配列を含む配列を有する。あるいは、アプタマーは、標的分子が天然では核酸と結合しない標的分子（例えばＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２ｍＲＮＡ）に結合する核酸分子であってもよい。例えば、アプタマーはタンパク質のリガンド結合領域と結合することに用いることができ、それによって天然に存在するリガンドのタンパク質との相互作用を防止する。これは非限定例であり、当業者は、他の態様が、当該技術分野において一般的に知られている技術を用いて容易に生成できることを認識している。例えば、Gold et al., 1995, Annu. Rev. Biochem., 64, 763、Brody and Gold, 2000, J. Biotechnol., 74, 5、Sun, 2000, Curr. Opin. Mol. Ther., 2, 100、Kusser, 2000, J. Biotechnol., 74, 27、Hermann and Patel, 2000, Science, 287, 820およびJayasena, 1999, Clinical Chemistry, 45, 1628参照。

非ヌクレオチドリンカーは、無塩基ヌクレオチド、ポリエーテル、ポリアミン、ポリアミド、ペプチド、炭水化物、脂質、ポリ炭化水素または他の高分子化合物（例えばポリエチレングリコール（例えば、２〜１００エチレングリコール単位を有するもの））を含んでもよい。具体的な例は、Seela and Kaiser, Nucleic Acids Res. 1990, 18:6353およびNucleic Acids Res. 1987, 15:3113、Cload and Schepartz, J. Am. Chem. Soc. 1991, 113:6324、Richardson and Schepartz, J. Am. Chem. Soc. 1991, 113:5109、Ma et al., Nucleic Acids Res. 1993, 21:2585およびBiochemistry 1993, 32:1751、Durand et al., Nucleic Acids Res. 1990, 18:6353、McCurdy et al., Nucleosides & Nucleotides 1991, 10:287、Jschke et al., Tetrahedron Lett. 1993, 34:301、Ono et al., Biochemistry 1991, 30:9914、Arnold et al.,国際公開公報WO 89/02439、Usman et al.,国際公開公報WO 95/06731、Dudycz et al.,国際公開公報WO 95/11910 およびFerentz and Verdine, J. Am. Chem. Soc. 1991, 113:4000に記載されたものを含む。

５’末端、３’末端およびオーバーハング
本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、両端が平滑であっても、両端にオーバーハングを有しても、または平滑末端およびオーバーハング末端の組合せを有してもよいグ。オーバーハングは、センス鎖またはアンチセンス鎖の５’末端または３’末端のいずれかに存在してもよい。

二本鎖核酸分子（例えばｓｉＮＡ）の５’末端および／または３’末端は、平滑末端であっても、オーバーハングを有してもよい。５’末端は平滑末端であってもよく、３’末端は、センス鎖またはアンチセンス鎖のいずれかにおいてオーバーハングを有する。他の態様において、３’末端は平滑末端であってもよく、５’末端はセンス鎖またはアンチセンス鎖のいずれかにおいてオーバーハングを有する。さらに他の態様においては、５’末端および３’末端の両方が平滑末端であるか、５’末端および３’末端の両方がオーバーハングを有する。

核酸の一方または両方の鎖の５’末端および／または３’末端は、フリーのヒドロキシル基を含んでもよい。任意の核酸分子の鎖の５’末端および／または３’末端は、化学修飾を含むように改変されていてもよい。かかる修飾は核酸分子を安定させることができ、例えば、３’末端は核酸分子修飾の存在により安定性が増大していてもよい。末端修飾（例えば末端キャップ）の例は、限定されずに、無塩基、デオキシ無塩基、逆位（デオキシ）無塩基、グリセリル、ジヌクレオチド、非環式ヌクレオチド、アミノ、フルオロ、クロロ、ブロモ、ＣＮ、ＣＦ、メトキシ、イミダゾール、カルボキシレート、チオエート、Ｃ_１〜Ｃ_１０低級アルキル、置換低級アルキル、アルカリルまたはアラルキル、ＯＣＦ_３、ＯＣＮ、Ｏ−、Ｓ−またはＮ−アルキル、Ｏ−、Ｓ−またはＮ−アルケニル、ＳＯＣＨ_３、ＳＯ_２ＣＨ_３、ＯＮＯ_２、ＮＯ_２、Ｎ_３、ヘテロシクロアルキル、ヘテロシクロアルカリル、アミノアルキルアミノ、ポリアルキルアミノまたは置換シリル、特に、欧州特許EP 586,520およびEP 618,925に記載のもの、および本明細書に開示される他の修飾を含む。

核酸分子は、平滑末端、すなわちオーバーハングヌクレオチドを全く含まない末端を有するものを含む。核酸分子は、１個または２個以上の平滑末端を含むことができる。平滑末端核酸分子は、核酸分子の各々の鎖に存在するヌクレオチドの数に等しい数の塩基対を有する。核酸分子は１個の平滑末端を含むことができ、例えば、ここで、アンチセンス鎖の５’末端とセンス鎖の３’末端はオーバーハングヌクレオチドを全く有しない。核酸分子は１個の平滑末端を含んでもよく、例えば、ここで、アンチセンス鎖の３’末端とセンス鎖の５’末端はオーバーハングヌクレオチドを全く有しない。核酸分子は２個の平滑末端を含んでもよく、例えば、ここで、アンチセンス鎖の５’末端とセンス鎖の３’末端、ならびに、アンチセンス鎖の３’末端とセンス鎖の５’末端はオーバーハングヌクレオチドを全く有しない。平滑末端核酸分子に存在する他のヌクレオチドは、例えば、ＲＮＡ干渉を誘導するための核酸分子の活性を調節するための、ミスマッチ、バルジ、ループまたはゆらぎ（wobble）塩基対を含んでもよい。

本明細書において提供される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）の特定の態様において、分子の少なくとも一端は、少なくとも１ヌクレオチドのオーバーハング（例えば、１〜８個のオーバーハングヌクレオチド）を有する。例えば、本明細書に開示される二本鎖核酸分子の一方または両方の鎖は、５’末端または３’末端または両方にオーバーハングを有してもよい。オーバーハングは、核酸分子のセンス鎖およびアンチセンス鎖の一方または両方に存在してもよい。オーバーハングの長さは、わずか１ヌクレオチドであっても、１〜８ヌクレオチド程度またはそれを超えてもよく（例えば、１、２、３、４、５、６、７または８ヌクレオチド）、一部の好ましい態様において、オーバーハングは２、３、４、５、６、７または８ヌクレオチドであり、例えば、オーバーハングは２ヌクレオチドであってもよい。オーバーハングを形成する１個または２個以上のヌクレオチドは、１個または２個以上のデオキシリボヌクレオチド、１個または２個以上のリボヌクレオチド、天然もしくは非天然核酸塩基、または糖、塩基もしくはリン酸基が修飾された任意のヌクレオチド、例えば本明細書に開示されるものなどを含んでもよい。二本鎖核酸分子は、５’オーバーハングおよび３’オーバーハングの両方を有してもよい。５’末端および３’末端のオーバーハングは、異なる長さであってもよい。オーバーハングは少なくとも１個の核酸修飾を含んでもよく、それはデオキシリボヌクレオチドであってもよい。１個または２個以上のデオキシリボヌクレオチドが５’末端にあってもよい。核酸分子のそれぞれの反対鎖（counter-strand）の３’末端は、オーバーハングを有しなくてもよく、より好ましくはデオキシリボヌクレオチドオーバーハングを有しなくてもよい。１個または２個以上のデオキシリボヌクレオチドは、３’末端にあってもよい。ｄｓＲＮＡのそれぞれの反対鎖の５’末端は、オーバーハングを有しなくてもよく、より好ましくはデオキシリボヌクレオチドオーバーハングを有しなくてもよい。好ましくは、鎖の５’末端または３’末端のいずれかにおけるオーバーハングは、１〜８個（例えば、約１、２、３、４、５、６、７または８個）の不対ヌクレオチドであってもよく、オーバーハングは２〜３個の不対ヌクレオチドであり、より好ましくは２個の不対ヌクレオチドである。核酸分子は、約１〜約２０（例えば、約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１、１５、１６、１７、１８、１９または２０）、好ましくは１〜８（例えば、約１、２、３、４、５、６、７または８）ヌクレオチドのオーバーハング末端を有する二重鎖核酸分子、例えば約１９個の塩基対と３’末端モノヌクレオチド、ジヌクレオチドまたはトリヌクレオチドオーバーハングとを有する約２１ヌクレオチドの二重鎖を含んでもよい。本明細書に記載の核酸分子は、平滑末端を有する二重鎖核酸分子を含んでもよく、ここで、両端は平滑であるか、あるいは、末端の１つは平滑である。本明細書に開示される核酸分子は、１個または２個以上の平滑末端を含むことができ、すなわち、ここで、平滑末端はオーバーハングヌクレオチドを全く有しない。一態様において、平滑末端核酸分子は、核酸分子の各々の鎖に存在するヌクレオチドの数に等しい数の塩基対を有する。核酸分子は１個の平滑末端を含むことができ、例えば、ここで、アンチセンス鎖の５’末端とセンス鎖の３’末端はオーバーハングヌクレオチドを全く有しない。核酸分子は１個の平滑末端を含んでもよく、例えば、ここで、アンチセンス鎖の３’末端とセンス鎖の５’末端はオーバーハングヌクレオチドを全く有しない。核酸分子は２個の平滑末端を含んでもよく、例えば、ここで、アンチセンス鎖の５’末端とセンス鎖の３’末端、ならびに、アンチセンス鎖の３’末端とセンス鎖の５’末端はオーバーハングヌクレオチドを全く有しない。特定の好ましい態様において、核酸化合物は平滑末端を有する。平滑末端ｓｉＮＡ分子に存在する他のヌクレオチドは、例えば、ＲＮＡ干渉を誘導するための核酸分子の活性を調節するための、ミスマッチ、バルジ、ループまたはゆらぎ塩基対を含んでもよい。

多くの態様において、本明細書に記載の核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）の、１個もしくは２個以上、または、全てのオーバーハングヌクレオチドは、本明細書に記載のとおりに修飾されており、例えば、１個もしくは２個以上、または全てのヌクレオチドは２’−デオキシリボヌクレオチドであってもよい。

修飾の数、位置およびパターン
本明細書に開示される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、核酸分子に存在するヌクレオチドの総数のパーセンテージとしての、修飾ヌクレオチドを含んでもよい。このように、核酸分子は、約５％〜約１００％の修飾ヌクレオチド（例えば約５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％または１００％の修飾ヌクレオチド）を含んでもよい。所定の核酸分子に存在する修飾ヌクレオチドの実際のパーセンテージは、核酸に存在するヌクレオチドの総数に依存する。核酸分子が一本鎖の場合、パーセント修飾は一本鎖核酸分子に存在するヌクレオチドの総数に基づくことができる。同様に、核酸分子が二本鎖の場合、パーセント修飾はセンス鎖、アンチセンス鎖またはセンス鎖およびアンチセンス鎖の両方に存在するヌクレオチドの総数に基づくことができる。

本明細書に開示される核酸分子は、核酸分子における総ヌクレオチドのパーセンテージとしての、非修飾ＲＮＡを含んでもよい。このように、核酸分子は約５％〜約１００％の修飾ヌクレオチド（例えば、核酸分子に存在する総ヌクレオチドの約５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％または１００％）を含んでもよい。

核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、約１個〜約５個、具体的には約１、２、３、４または５個のホスホロチオエートヌクレオチド間結合、および／または、１個または２個以上（例えば、約１、２、３、４、５個または６個以上）の２’−デオキシ、２’−Ｏ−メチル、２’−デオキシ−２’−フルオロ、および／または１個または２個以上（例えば、約１、２、３、４、５個または６個以上）のユニバーサル塩基修飾ヌクレオチド、および任意に、センス鎖の３’末端、５’末端または３’末端および５’末端の両方に末端キャップ分子を含むセンス鎖を含んでもよく、ここで、アンチセンス鎖は、約１個〜約５個、具体的には約１、２、３、４、５個または６個以上のホスホロチオエートヌクレオチド間結合、および／または、１個または２個以上（例えば、約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０個または１１個以上）の２’−デオキシ、２’−Ｏ−メチル、２’−デオキシ−２’−フルオロ、および／または１個または２個以上（例えば、約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０個または１１個以上）のユニバーサル塩基修飾ヌクレオチド、および任意に、アンチセンス鎖の３’末端、５’末端または３’末端および５’末端の両方に末端キャップ分子を含む。核酸分子は、２’−デオキシ、２’−Ｏ−メチルおよび／または２’−デオキシ−２’−フルオロヌクレオチドで化学的に修飾され、約１個〜約５個または６個以上、例えば、約１、２、３、４、５個または６個以上のホスホロチオエートヌクレオチド間結合を有する、または有しない、約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０個または１１個以上の、センス鎖および／またはアンチセンス核酸鎖のピリミジンヌクレオチド、および／または、３’末端、５’末端、または、同じ鎖もしくは異なる鎖に存在する３’末端および５’末端の両方における末端キャップ分子を含んでもよい。

核酸分子は、約１個〜約５個または６個以上（具体的には、約１、２、３、４、５個または６個以上）のホスホロチオエートヌクレオチド間結合を核酸分子の各々の鎖に含んでもよい。

核酸分子は、２’−５’ヌクレオチド間結合を、例えば、一方または両方の核酸配列鎖の３’末端、５’末端または３’末端および５’末端の両方に含んでもよい。さらに、１個または２個以上の２’−５’ヌクレオチド間結合は、一方または両方の核酸配列鎖内の他の様々な位置に存在してもよく、例えば、ｓｉＮＡ分子の一方または両方の鎖におけるピリミジンヌクレオチドの全てのヌクレオチド間結合を含む約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０箇所または１１箇所以上が、２’−５’ヌクレオチド間結合を含んでもよく、または、ｓｉＮＡ分子の一方または両方の鎖におけるプリンヌクレオチドの全てのヌクレオチド間結合を含む約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０箇所または１１箇所以上が、２’−５’ヌクレオチド間結合を含んでもよい。

化学修飾短鎖干渉核酸（ｓｉＮＡ）分子は、アンチセンス領域に存在する任意の（例えば、１個または２個以上または全ての）ピリミジンヌクレオチドが２’−デオキシ−２’−フルオロピリミジンヌクレオチドであり（例えば、全てのピリミジンヌクレオチドが２’−デオキシ−２’−フルオロピリミジンヌクレオチドであるか、または、複数のピリミジンヌクレオチドが２’−デオキシ−２’−フルオロピリミジンヌクレオチドである）、アンチセンス領域に存在する任意の（例えば、１個または２個以上または全ての）プリンヌクレオチドが２’−デオキシプリンヌクレオチドである（例えば、全てのプリンヌクレオチドが２’−デオキシプリンヌクレオチドであるか、または、複数のプリンヌクレオチドが２’−デオキシプリンヌクレオチドである）アンチセンス領域を含んでもよい。

化学修飾短鎖干渉核酸（ｓｉＮＡ）分子は、アンチセンス領域に存在する任意の（例えば、１個または２個以上または全ての）ピリミジンヌクレオチドが２’−デオキシ−２’−フルオロピリミジンヌクレオチドであり（例えば、全てのピリミジンヌクレオチドが２’−デオキシ−２’−フルオロピリミジンヌクレオチドであるか、または、複数のピリミジンヌクレオチドが２’−デオキシ−２’−フルオロピリミジンヌクレオチドである）、アンチセンス領域に存在する任意の（例えば、１個または２個以上または全ての）プリンヌクレオチドが２’−Ｏ−メチルプリンヌクレオチドである（例えば、全てのプリンヌクレオチドが２’−Ｏ−メチルプリンヌクレオチドであるか、または、複数のプリンヌクレオチドが２’−Ｏ−メチルプリンヌクレオチドである）アンチセンス領域を含んでもよい。

細胞または再構成されたin vitroの系の内部でＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２に対するＲＮＡ干渉（ＲＮＡｉ）を誘導することができる化学修飾短鎖干渉核酸（ｓｉＮＡ）分子は、センス領域に存在する１個または２個以上のピリミジンヌクレオチドが２’−デオキシ−２’−フルオロピリミジンヌクレオチドであり（例えば、全てのピリミジンヌクレオチドが２’−デオキシ−２’−フルオロピリミジンヌクレオチドであるか、または、複数のピリミジンヌクレオチドが２’−デオキシ−２’−フルオロピリミジンヌクレオチドである）、センス領域に存在する１個または２個以上のプリンヌクレオチドが２’−デオキシプリンヌクレオチド（例えば、全てのプリンヌクレオチドが２’−デオキシプリンヌクレオチドであるか、または、複数のプリンヌクレオチドが２’−デオキシプリンヌクレオチドである）センス領域、および、アンチセンス領域に存在する１個または２個以上のピリミジンヌクレオチドが２’−デオキシ−２’−フルオロピリミジンヌクレオチドであり（例えば、全てのピリミジンヌクレオチドが２’−デオキシ−２’−フルオロピリミジンヌクレオチドであるか、または、複数のピリミジンヌクレオチドが２’−デオキシ−２’−フルオロピリミジンヌクレオチドである）、アンチセンス領域に存在する１個または２個以上のプリンヌクレオチドが２’−Ｏ−メチルプリンヌクレオチドである（例えば、全てのプリンヌクレオチドが２’−Ｏ−メチルプリンヌクレオチドであるか、または、複数のプリンヌクレオチドが２’−Ｏ−メチルプリンヌクレオチドである）アンチセンス領域を含んでもよい。センス領域および／またはアンチセンス領域は、末端キャップ修飾、例えば、センス配列および／またはアンチセンス配列の３’末端、５’末端または３’末端および５’末端の両方に任意に存在する任意の修飾などを有してもよい。センス領域および／またはアンチセンス領域は、任意に、約１個〜約４個の（例えば約１、２、３または４個の）２’−デオキシリボヌクレオチドを有する３’末端ヌクレオチドオーバーハングをさらに含んでもよい。オーバーハングヌクレオチドは、１個または２個以上（例えば、１、２、３、４個または５個以上）のホスホロチオエート、ホスホノアセテート、および／または、チオホスホノアセテートヌクレオチド間結合をさらに含んでもよい。センス領域のプリンヌクレオチドは、代替的に２’−Ｏ−メチルプリンヌクレオチドであってもよく（例えば、全てのプリンヌクレオチドが２’−Ｏ−メチルプリンヌクレオチドであるか、または、複数のプリンヌクレオチドが２’−Ｏ−メチルプリンヌクレオチドである）、アンチセンス領域に存在する１個または２個以上のプリンヌクレオチドは、２’−Ｏ−メチルプリンヌクレオチドである（例えば、全てのプリンヌクレオチドが２’−Ｏ−メチルプリンヌクレオチドであるか、または、複数のプリンヌクレオチドが２’−Ｏ−メチルプリンヌクレオチドである）。センス領域の１個または２個以上のプリンヌクレオチドは、代替的にプリンリボヌクレオチドであってもよく（例えば、全てのプリンヌクレオチドがプリンリボヌクレオチドであるか、または、複数のプリンヌクレオチドがプリンリボヌクレオチドである）、アンチセンス領域に存在する任意のプリンヌクレオチドは２’−Ｏ−メチルプリンヌクレオチドである（例えば、全てのプリンヌクレオチドが２’−Ｏ−メチルプリンヌクレオチドであるか、または、複数のプリンヌクレオチドが２’−Ｏ−メチルプリンヌクレオチドである）。センス領域における、および／またはアンチセンス領域に存在する１個または２個以上のプリンヌクレオチドは、代替的に、２’−デオキシヌクレオチド、ロックド核酸（ＬＮＡ）ヌクレオチド、２’−メトキシエチルヌクレオチド、４’−チオヌクレオチド、および２’−Ｏ−メチルヌクレオチドからなる群から選択されてもよい（例えば、全てのプリンヌクレオチドが２’−デオキシヌクレオチド、ロックド核酸（ＬＮＡ）ヌクレオチド、２’−メトキシエチルヌクレオチド、４’−チオヌクレオチド、および２’−Ｏ−メチルヌクレオチドからなる群から選択されるか、または、複数のプリンヌクレオチドが２’−デオキシヌクレオチド、ロックド核酸（ＬＮＡ）ヌクレオチド、２’−メトキシエチルヌクレオチド、４’−チオヌクレオチド、および２’−Ｏ−メチルヌクレオチドからなる群から選択される）。

一部の態様において、本明細書に記載の核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、アンチセンス鎖に修飾ヌクレオチド（例えば１個の修飾ヌクレオチド）を、例えばアンチセンス鎖の６位または７位に含む。

修飾パターンおよび交互する修飾
本明細書において提供される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、修飾核酸および非修飾核酸のパターンを有してもよい。ヌクレオチドの連続するストレッチ（stretch）におけるヌクレオチドの修飾のパターンは、単一のヌクレオチド、または、標準的なホスホジエステル結合、もしくは少なくとも部分的に、ホスホロチオエート結合を介して互いに共有結合的に連結されたヌクレオチドの群に含まれる修飾であってもよい。したがって、本明細書で企図する「パターン」は、必ずしも反復単位を伴う必要はないが、反復単位を伴ってもよい。本明細書において提供される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）に関連して用いることができる修飾パターンの例は、Giese、米国特許第7,452,987号に開示されるものを含む。例えば、本明細書において提供される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、例えば、Giese、米国特許第7,452,987号の図２に図式的に示されているパターンに類似の修飾パターン、またはそれと同じ修飾パターンを有するものを含む。

修飾ヌクレオチドまたは修飾ヌクレオチドの群はセンス鎖またはアンチセンス鎖の５’末端または３’末端にあってもよく、隣接するヌクレオチドまたはヌクレオチドの群は、修飾ヌクレオチドまたは修飾ヌクレオチドの群の両側に配列し、隣接するヌクレオチドまたはヌクレオチドの群は非修飾であるか、前のヌクレオチドまたはヌクレオチドの群と同じ修飾は有しない。隣接するヌクレオチドまたはヌクレオチドの群は、しかしながら、異なる修飾を有してもよい。それぞれ、修飾ヌクレオチドまたは修飾ヌクレオチドの群、および、非修飾か、異なる修飾を有するヌクレオチド、または非修飾か、異なる修飾を有するヌクレオチドの群のこの配列は、１回または２回以上繰り返されてもよい。

一部のパターンにおいて、鎖の５’末端ヌクレオチドは修飾ヌクレオチドであり、一方、他のパターンにおいて、鎖の５’末端ヌクレオチドは非修飾ヌクレオチドである。一部のパターンにおいて、鎖の５’末端は修飾ヌクレオチドの群で開始し、一方、他のパターンにおいて、５’末端は、非修飾ヌクレオチドの群である。このパターンは、核酸分子の第１のストレッチもしくは第２のストレッチのいずれか、またはその両方にあってもよい。

核酸分子の一方の鎖の修飾ヌクレオチドは、他方の鎖の修飾または非修飾ヌクレオチドまたはヌクレオチドの群に対し、位置について相補的であってもよい。

修飾群が重ならないように、一方の鎖の修飾または修飾のパターンの間に、他の鎖の修飾のパターンに対する位相シフトがあってもよい。１つの例において、シフトは、センス鎖の修飾ヌクレオチドの群が、アンチセンス鎖の非修飾ヌクレオチドの群に対応するもの、およびその逆のものである。

修飾群が重なるように、修飾のパターンの部分的なシフトがあってもよい。任意の所定の鎖における修飾ヌクレオチドの群は、任意に同じ長さであってもよいが、異なる長さであってもよい。同様に、任意の所定の鎖の非修飾ヌクレオチドの群は、任意に、同じ長さであっても、または異なる長さであってもよい。

一部のパターンにおいて、鎖の末端の２番目の（最後から２番目の）ヌクレオチドは、非修飾ヌクレオチドであるか、または非修飾ヌクレオチドの群の始まりである。好ましくは、この非修飾ヌクレオチドまたは非修飾ヌクレオチドの群は、センス鎖およびアンチセンス鎖の一方または両方の５’末端、より一層好ましくはセンス鎖の末端に位置する。非修飾ヌクレオチドまたは非修飾ヌクレオチドの群は、センス鎖の５’末端に位置してもよい。好ましい態様において、パターンは交互する単一の修飾ヌクレオチドおよび非修飾ヌクレオチドを含む。

一部の二本鎖核酸分子において、２’−Ｏ−メチル修飾ヌクレオチドおよび非修飾ヌクレオチド、好ましくは２’−Ｏ−メチル修飾を有しないヌクレオチドが、両方の鎖に交互する様式で組み込まれ、その結果、２’−Ｏ−メチル修飾ヌクレオチドと、非修飾か、または、少なくとも２’−Ｏ−メチル修飾を含まないヌクレオチドが交互するパターンがもたらされる。特定の態様において、同じ２’−Ｏ−メチル修飾および非修飾の配列は第２の鎖に存在し、他の態様において、交互する２’−Ｏ−メチル修飾ヌクレオチドはセンス鎖のみに存在し、アンチセンス鎖には存在せず、さらに他の態様において、交互する２’−Ｏ−メチル修飾ヌクレオチドは、センス鎖のみに存在し、アンチセンス鎖には存在しない。特定の態様において、２本の鎖の間に位相シフトが存在し、例えば、第１の鎖における２’−Ｏ−メチル修飾ヌクレオチドは第２の鎖の１個または２個以上の非修飾ヌクレオチドと塩基対を形成し、この逆もまた同様である。この特定の配置、すなわち、両方の鎖における１個または２個以上の２’−Ｏ−メチル修飾ヌクレオチドおよび非修飾ヌクレオチドの塩基対形成は、特定の態様において特に好ましい。特定の態様において、交互する２’−Ｏ−メチル修飾ヌクレオチドのパターンは、核酸分子全体、または二重鎖領域全体にわたって存在する。他の態様において、交互する２’−Ｏ−メチル修飾ヌクレオチドのパターンは、核酸の部分、または二重鎖領域の部分にのみに存在する。

「位相シフト」パターンにおいて、アンチセンス鎖が５’末端の２’−Ｏ−メチル修飾ヌクレオチドから開始し、その結果、２番目のヌクレオチドが非修飾であり、３番目、５番目、７番目といったヌクレオチドが再び２’−Ｏ−メチル修飾であり、２番目、４番目、６番目、８番目といったヌクレオチドが非修飾ヌクレオチドとなることが好ましいことがある。

例示的な修飾位置およびパターン

例示的なパターンを以下でさらに詳細に提供するが、本明細書に開示される、および、当該技術分野において既知の、核酸分子の全ての可能な特徴（例えば、特徴は、限定されずに、センス鎖の長さ、アンチセンス鎖の長さ、二重鎖領域の長さ、オーバーハングの長さ、二本鎖核酸分子の一方または両方の末端が平滑であるか、または、オーバーハングを有するか、修飾核酸の数、修飾の種類、ダブルオーバーハング核酸分子が、各側のオーバーハングに同じか、または、異なる数のヌクレオチドを有するか、核酸分子において用いられている修飾は１種類か、または１種類を超えるか、および、連続する修飾／非修飾ヌクレオチドの数を含む）を有する全てのパターンの置換が企図される。以下で提供される全ての詳細な例に関して、二重鎖領域は１９ヌクレオチドであることが示されているが、二重鎖領域の各々の鎖は独立して１７〜４９ヌクレオチドの長さであることができるため、本明細書において提供される核酸分子は１〜４９ヌクレオチドの長さの範囲の二重鎖領域を有することができる。例示的なパターンを本明細書において提供する。

核酸分子は、単一の修飾核酸または修飾核酸の連続したセットを含む両方の末端に、平滑末端（ｎが０である場合）を有してもよい。修飾核酸は、センス鎖またはアンチセンス鎖のいずれかに沿った任意の位置に位置してもよい。核酸分子は、約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８または４９個の連続する修飾ヌクレオチドの群を含んでもよい。修飾核酸は、核酸鎖の１％、２％、３％、５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、９８％または１００％を形成してもよい。すぐ下の例の修飾核酸は、センス鎖のみ、アンチセンス鎖のみ、またはセンス鎖およびアンチセンス鎖の両方にあってもよい。

一般的な核酸パターンを以下に示し、ここで、Ｘ＝二重鎖領域におけるセンス鎖ヌクレオチド、Ｘａ＝センス鎖における５’オーバーハングヌクレオチド、Ｘｂ＝センス鎖における３’オーバーハングヌクレオチド、Ｙ＝二重鎖領域におけるアンチセンス鎖ヌクレオチド、Ｙａ＝アンチセンス鎖における３’オーバーハングヌクレオチド、Ｙｂ＝アンチセンス鎖における５’オーバーハングヌクレオチド、およびＭ＝二重鎖領域における修飾ヌクレオチドである。各々のａおよびｂは、独立して０〜８（例えば０、１、２、３、４、５、６、７または８）である。各々のＸ、Ｙ、ａおよびｂは、独立して修飾または非修飾である。センス鎖およびアンチセンス鎖は、各々独立して１７〜４９ヌクレオチドの長さであることができる。以下で提供される例は、１９ヌクレオチドの二重鎖領域を有する。しかし、本明細書に開示される核酸分子は、１７〜４９ヌクレオチドの二重鎖領域をどこにでも有することができ、ここで、各々の鎖は独立して１７〜４９ヌクレオチドの長さである。

さらなる例示的な核酸分子パターンを以下に示し、ここで、Ｘ＝非修飾センス鎖ヌクレオチド、ｘ＝センス鎖における非修飾オーバーハングヌクレオチド、Ｙ＝非修飾アンチセンス鎖ヌクレオチド、ｙ＝アンチセンス鎖における非修飾オーバーハングヌクレオチド、Ｍ＝修飾ヌクレオチドである。センス鎖およびアンチセンス鎖は、各々独立して１７〜４９ヌクレオチドの長さであることができる。以下で提供される例は、１９ヌクレオチドの二重鎖領域を有する。しかし、本明細書に開示される核酸分子は、１７〜４９ヌクレオチドの二重鎖領域をどこにでも有することができ、ここで、各々の鎖は独立して１７〜４９ヌクレオチドの長さである。

核酸分子は、両方の末端に平滑末端を有し、交互する修飾核酸を伴ってもよい。修飾核酸は、センス鎖またはアンチセンス鎖に沿った任意の位置に位置してもよい。

平滑な５’末端および３’末端のオーバーハング末端を有し、単一の修飾核酸を含む核酸分子である。

５’末端オーバーハングおよび平滑な３’末端を有し、単一の修飾核酸を含む核酸分子である。

両方の末端にオーバーハングを有し、全てのオーバーハングが修飾核酸である核酸分子である。すぐに下のパターンにおいて、Ｍはｎ個の修飾核酸であり、ここで、ｎは０〜８の整数（すなわち０、１、２、３、４、５、６、７および８）である。

両方の末端にオーバーハングを有し、一部のオーバーハングヌクレオチドが修飾ヌクレオチドである核酸分子である。すぐに下のパターンにおいて、Ｍはｎ個の修飾核酸であり、ｘはセンス鎖におけるｎ個の非修飾オーバーハングヌクレオチドであり、ｙはアンチセンス鎖におけるｎ個の非修飾オーバーハングヌクレオチドであり、ここで、各々のｎは、独立して、０〜８の整数（すなわち０、１、２、３、４、５、６、７および８）であり、各々のオーバーハングは最大２０ヌクレオチド、好ましくは最大８ヌクレオチド（修飾および／または非修飾）である。

センス領域の３’末端における修飾ヌクレオチド。

センス領域の５’末端におけるオーバーハング。

アンチセンス領域の３’末端におけるオーバーハング。

センス領域内における１個または２個以上の修飾ヌクレオチド。

例示的な核酸分子を、上記で用いた記号に沿った同等の一般構造とともに、以下に提供する。以下の二重鎖は、パターン：
に従う。

１９ヌクレオチド（すなわち１９ｍｅｒ）の二重鎖領域と、センス鎖およびアンチセンス鎖の３’末端における修飾された２ヌクレオチド（すなわちデオキシヌクレオチド）オーバーハングとを有する、ヒト、マウス、ラットおよびアカゲザルのＴＩＭＰ１に対するＴＩＭＰ１−ＡｓｉＲＮＡ。

１９ヌクレオチド（すなわち１９ｍｅｒ）の二重鎖領域と、センス鎖およびアンチセンス鎖の３’末端における修飾された２ヌクレオチド（すなわちデオキシヌクレオチド）オーバーハングとを有する、ヒトおよびアカゲザルのＴＩＭＰ１に対するＴＩＭＰ１−ＢｓｉＲＮＡ。

１９ヌクレオチド（すなわち１９ｍｅｒ）の二重鎖領域と、センス鎖およびアンチセンス鎖の３’末端における修飾された２ヌクレオチド（すなわちデオキシヌクレオチド）オーバーハングとを有する、ヒト、マウス、ラットおよびアカゲザルのＴＩＭＰ１に対するＴＩＭＰ１−ＣｓｉＲＮＡ。

１９ヌクレオチド（すなわち１９ｍｅｒ）の二重鎖領域と、センス鎖およびアンチセンス鎖の３’末端における修飾された２ヌクレオチド（すなわちデオキシヌクレオチド）オーバーハングとを有する、ヒトＴＩＭＰ２に対するＴＩＭＰ２−ＡｓｉＲＮＡ。

１９ヌクレオチド（すなわち１９ｍｅｒ）の二重鎖領域と、センス鎖およびアンチセンス鎖の３’末端における修飾された２ヌクレオチド（すなわちデオキシヌクレオチド）オーバーハングとを有する、ヒト、アカゲザルおよびウサギのＴＩＭＰ２に対するＴＩＭＰ２−ＢｓｉＲＮＡ。

１９ヌクレオチド（すなわち１９ｍｅｒ）の二重鎖領域と、センス鎖およびアンチセンス鎖の３’末端における修飾された２ヌクレオチド（すなわちデオキシヌクレオチド）オーバーハングとを有する、ヒト、マウス、ラット、ウシ、イヌおよびブタのＴＩＭＰ２に対するＴＩＭＰ２−ＣｓｉＲＮＡ。

１９ヌクレオチド（すなわち１９ｍｅｒ）の二重鎖領域と、センス鎖およびアンチセンス鎖の３’末端における修飾された２ヌクレオチド（すなわちデオキシヌクレオチド）オーバーハングとを有する、ヒトＴＩＭＰ２に対するＴＩＭＰ２−ＤｓｉＲＮＡ。

１９ヌクレオチド（すなわち１９ｍｅｒ）の二重鎖領域と、センス鎖およびアンチセンス鎖の３’末端における修飾された２ヌクレオチド（すなわちデオキシヌクレオチド）オーバーハングとを有する、ヒトＴＩＭＰ２に対するＴＩＭＰ２−ＥｓｉＲＮＡ。

核酸鎖におけるニックおよびギャップ
本明細書において提供される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、ニックまたはギャップを有する鎖、好ましくはセンス鎖を有してもよい。このように、核酸分子は、例えば、国際特許出願PCT/US07/081836に開示されている部分二重鎖ＲＮＡ（ｍｄＲＮＡ）のような、３本または４本以上の鎖を有してもよい。ニックまたはギャップを有する鎖を有する核酸分子は、約１〜４９ヌクレオチドであってもよく、または、ＲＩＳＣ長（例えば約１５〜２５ヌクレオチド）またはダイサー基質長（例えば約２５〜３０ヌクレオチド）、例えば本明細書に開示されているものなどであってもよい。

３本または４本以上の鎖を有する核酸分子は、例えば、「Ａ」（アンチセンス）鎖、「Ｓ１」（第２の）鎖および「Ｓ２」（第３）鎖を含み、ここで、「Ｓ１」鎖および「Ｓ２」鎖は、「Ａ」鎖の非オーバーラップ領域に相補的であり、これと塩基対を形成する（例えば、ｍｄＲＮＡはＡ：Ｓ１Ｓ２の形態をとり得る）。Ｓ１、Ｓ２またはさらなる鎖は、一緒に、「Ａ」アンチセンス鎖に対するセンス鎖に実質的に類似するものを形成する。「Ｓ１」鎖と「Ａ」鎖のアニーリングによって形成される二重鎖領域は、「Ｓ２」鎖と「Ａ」鎖のアニーリングによって形成される二重鎖領域とは異なるものであり、オーバーラップしない。核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は「ギャップ」を有する分子であってもよく、これは０ヌクレオチドから約１０ヌクレオチド（例えば０、１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０ヌクレオチド）の範囲の「ギャップ」を意味する。好ましくは、センス鎖がギャップ有する。一部の態様において、Ａ：Ｓ１二重鎖は、Ａ：Ｓ２二重鎖から、Ａ：Ｓ１二重鎖とＡ：Ｓ２二重鎖との間に位置し、「Ａ」鎖、「Ｓ１」鎖および「Ｓ２」鎖の１または２以上の３’末端の１個または２個以上の不対ヌクレオチドのいずれとも異なる、少なくとも１個の不対ヌクレオチド（約１０個までの不対ヌクレオチド）によって生じるギャップによって分離している。Ａ：Ｓ１二重鎖は、Ａ：Ｓ２二重鎖から、Ａ：Ｓ１二重鎖とＡ：Ｓ２二重鎖との間のゼロヌクレオチドのギャップ（すなわち、ポリヌクレオチド分子において２ヌクレオチド間のホスホジエステル結合だけが断たれているか、欠けているニック）によって分離していてもよく、これはニック入り（nicked）ｄｓＲＮＡ（ｎｄｓＲＮＡ）と呼ぶこともできる。例えば、Ａ：Ｓ１Ｓ２は、合計で約１４塩基対から約４０塩基対を組み合わせた少なくとも２個の二重鎖領域を有し、二重鎖領域が約０〜約１０ヌクレオチドのギャップによって分離され、任意に平滑末端を有するｄｓＲＮＡを含んでもよく、または、Ａ：Ｓ１Ｓ２は、１０ヌクレオチドまでのギャップによって分離された少なくとも２個の二重鎖領域を有するｄｓＲＮＡを含んでもよく、ここで二重鎖領域の少なくとも１つは約５塩基対〜１３塩基対を含む。

ダイサー基質
特定の態様において、本明細書において提供される核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）は、例えばRossi、米国特許出願20050244858に記載されているような、in vivoでプロセシングされ、活性な核酸分子を生成する前駆体「ダイサー基質」分子、例えば二本鎖核酸であってもよい。特定の条件および状況において、これらの比較的長いｄｓＲＮＡｓｉＮＡ種、例えば約２５〜約３０ヌクレオチドのものが、効力および作用持続時間に関して予想外に効果的な結果をもたらし得ることが見出されている。いかなる特定の理論に束縛されることを望むものではないが、より長いｄｓＲＮＡ種は、細胞の細胞質における酵素ダイサーの基質として用いられると考えられる。二本鎖核酸をより短いセグメントに切断することに加えて、ダイサーは、切断されたｄｓＲＮＡに由来する一本鎖切断産物の、標的遺伝子に由来する細胞質内ＲＮＡの破壊に関与するＲＮＡ誘導サイレンシング複合体（ＲＩＳＣ複合体）への組込みを容易にすることができる。

ダイサー基質は、ダイサーによるそのプロセシングを強化するある種の特性を有してもよい。ダイサー基質は、それがダイサーによってプロセシングされ、活性な核酸分子を生成するのに十分な長さであり、以下の特性の１または２以上をさらに含んでもよい：（ｉ）ｄｓＲＮＡは非対称であり、例えば、第１の鎖（アンチセンス鎖）に３’オーバーハングを有する、および、（ｉｉ）ｄｓＲＮＡは、ダイサーの結合の方向およびｄｓＲＮＡの活性なｓｉＲＮＡへのプロセシングを誘導するための、アンチセンス鎖（センス鎖）における修飾３’末端を有する。特定の態様において、ダイサー基質における最長の鎖は、２４〜３０ヌクレオチドであってもよい。

ダイサー基質は対称性であっても非対称性であってもよい。ダイサー基質は、２２〜２８ヌクレオチドを含むセンス鎖を有してもよく、アンチセンス鎖は２４〜３０ヌクレオチドを含んでもよい。したがって、一部の態様において、結果として生じるダイサー基質は、アンチセンス鎖の３’末端に、オーバーハングを有してもよい。ダイサー基質は、長さが２５ヌクレオチドのセンス鎖と、２塩基の３’オーバーハングを有し、２７ヌクレオチドの長さを有するアンチセンス鎖とを有してもよい。オーバーハングは、１〜３ヌクレオチド、例えば２ヌクレオチドであってもよい。センス鎖はまた、５’ホスフェートを有してもよい。

非対称性ダイサー基質は、リボヌクレオチドのうちの２個の代わりに、センス鎖の３’末端に２個のデオキシリボヌクレオチドをさらに含んでもよい。一部の例示的なダイサー基質長および構造は、２１＋０、２１＋２、２１−２、２２＋０、２２＋１、２２−１、２３＋０、２３＋２、２３−２、２４＋０、２４＋２、２４−２、２５＋０、２５＋２、２５−２、２６＋０、２６＋２、２６−２、２７＋０、２７＋２および２７−２である。

ダイサー基質のセンス鎖は、長さが約２２〜約３０（例えば、約２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９または３０）、約２２〜約２８、約２４〜約３０、約２５〜約３０、約２６〜約３０、約２６〜２９、または約２７〜約２８ヌクレオチドであってもよい。特定の好ましい態様において、ダイサー基質は、長さが少なくとも約２５ヌクレオチドであり、約３０ヌクレオチドよりは長くないか、約２６〜２９ヌクレオチドか、または長さが２７ヌクレオチドの、センス鎖およびアンチセンス鎖を含む。センス鎖およびアンチセンス鎖は、同じ長さ（平滑末端）であっても、異なる長さ（オーバーハングを有する）であっても、または組合せであってもよい。センス鎖およびアンチセンス鎖は、同じポリヌクレオチドに存在しても、異なるポリヌクレオチドに存在してもよい。ダイサー基質は、約１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５または２７ヌクレオチドの二重鎖領域を有してもよい。

本明細書において提供される他のｓｉＮＡ分子と同様に、ダイサー基質のアンチセンス鎖は、生物学的条件下、例えば、真核細胞の細胞質内などにおいて、アンチセンス鎖にアニーリングする任意の配列を有してもよい。

ダイサー基質は、ヌクレオチド塩基、糖またはリン酸骨格に対する、当該技術分野において既知の、および／または、本明細書において他の核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）について記載された、任意の修飾を有してもよい。特定の態様において、ダイサー基質は、センス鎖の３’末端に位置する好適な修飾因子によってダイサープロセシングのために修飾されたセンス鎖を有してもよい。すなわち、このｄｓＲＮＡはダイサーの結合およびプロセシングの方向を誘導するように設計されている。好適な修飾因子は、ヌクレオチド、例えば、デオキシリボヌクレオチド、ジデオキシリボヌクレオチド、アシクロヌクレオチドなど、および、立体障害（sterically hindered）分子、例えば、蛍光分子などを含む。アシクロヌクレオチドは、ｄＮＭＰにおいて通常存在する２’−デオキシリボフラノシル糖における２−ヒドロキシエトキシメチル基を置換する。ダイサー基質ｓｉＮＡ分子において用いることができる他のヌクレオチド修飾因子は、３’−デオキシアデノシン（コルジセピン）、３’−アジド−３’−デオキシチミジン（ＡＺＴ）、２’，３’−ジデオキシイノシン（ｄｄＩ）、２’，３’−ジデオキシ−３’−チアシチジン（３ＴＣ）、２’，３’−ジデヒドロ−２’，３’−ジデオキシチミジン（ｄ４Ｔ）、ならびに３’−アジド−３’−デオキシチミジン（ＡＺＴ）、２’，３’−ジデオキシ−３’−チアシチジン（３ＴＣ）および２’，３’−ジデヒドロ−２’，３’−ジデオキシチミジン（ｄ４Ｔ）の一リン酸ヌクレオチドを含む。一態様において、デオキシリボヌクレオチドが修飾因子として用いられる。ヌクレオチド修飾因子を利用する場合、ダイサー基質の長さが変わらないように、それらはリボヌクレオチドを置換してもよい（例えば、１〜３個のヌクレオチド修飾因子または２個のヌクレオチド修飾因子が、センス鎖の３’末端におけるリボヌクレオチドと置き換わる）。立体障害分子を利用する場合、これらはアンチセンス鎖の３’末端のリボヌクレオチドに付着させてもよい。したがって、特定の態様において、鎖の長さは、修飾因子の組込みによって変化しない。特定の態様において、ｄｓＲＮＡの２個のＤＮＡ塩基が、アンチセンス鎖のダイサープロセシングの方向を誘導するために置換されている。さらなる態様において、２個の末端ＤＮＡ塩基が、センス鎖の３’末端とアンチセンス鎖の５’末端において、二重鎖の平滑末端を形成しているセンス鎖の３’末端の２個のリボヌクレオチドと置き換わり、２ヌクレオチドＲＮＡオーバーハングがアンチセンス鎖の３’末端に位置する。これは、平滑末端におけるＤＮＡとオーバーハング末端におけるＲＮＡ塩基を有する非対称性の構成である。

特定の態様において、修飾は、修飾が核酸分子がダイサーのために基質として機能することを妨げないように、ダイサー基質に含められる。一態様において、ダイサー基質のダイサープロセシングを強化する１または２以上の修飾がなされる。より効果的なＲＮＡｉの生成をもたらす１または２以上の修飾がなされてもよい。より大きなＲＮＡｉ効果を支持する１または２以上の修飾がなされてもよい。各々のダイサー基質につき、細胞に送達されるより大きな能力をもたらす１または２以上の修飾がなされる。修飾は、３’末端領域、５’末端領域、３’末端領域および５’末端領域の両方、または配列内の種々の位置に組み込まれてもよい。修飾が核酸分子がダイサーのために基質として機能することを妨げない限り、任意の数と組合せの修飾をダイサー基質に組み込むことができる。複数の修飾が存在する場合、それらは同じであっても、異っていてもよい。塩基、糖部分、リン酸骨格に対する修飾、およびこれらの組合せが企図される。どちらの５’末端もリン酸化することができる。

ダイサー基質リン酸骨格修飾の例は、メチルホスホネートを含むホスホネート、ホスホロチオエートおよびホスホトリエステル修飾、例えばアルキルホスホトリエステルなどを含む。ダイサー基質糖部分修飾の例は、２’−アルキルピリミジン、例えば２’−Ｏ−メチル、２’−フルオロ、アミノおよびデオキシ修飾などを含む（例えば、Amarzguioui et al., 2003参照）を含む。ダイサー基質塩基基修飾の例は、無塩基糖、２−Ｏ−アルキル修飾ピリミジン、４−チオウラシル、５−ブロモウラシル、５−ヨードウラシルおよび５−（３−アミノアリル）−ウラシルなどを含む。ロックド核酸またはＬＮＡもまた組み込むことができる。

センス鎖は、センス鎖の３’末端に位置する好適な修飾因子によってダイサープロセシングのために修飾されていてもよい。すなわち、このダイサー基質はダイサーの結合およびプロセシングの方向を誘導するように設計されている。好適な修飾因子は、ヌクレオチド、例えば、デオキシリボヌクレオチド、ジデオキシリボヌクレオチド、アシクロヌクレオチドなど、および、立体障害分子、例えば、蛍光分子などを含む。アシクロヌクレオチドは、ｄＮＭＰにおいて通常存在する２’−デオキシリボフラノシル糖における２−ヒドロキシエトキシメチル基を置換する。他のヌクレオチド修飾因子は、３’−デオキシアデノシン（コルジセピン）、３’−アジド−３’−デオキシチミジン（ＡＺＴ）、２’，３’−ジデオキシイノシン（ｄｄＩ）、２’，３’−ジデオキシ−３’−チアシチジン（３ＴＣ）、２’，３’−ジデヒドロ−２’，３’−ジデオキシチミジン（ｄ４Ｔ）、ならびに３’−アジド−３’−デオキシチミジン（ＡＺＴ）、２’，３’−ジデオキシ−３’−チアシチジン（３ＴＣ）および２’，３’−ジデヒドロ−２’，３’−ジデオキシチミジン（ｄ４Ｔ）の一リン酸ヌクレオチドを含む。一態様において、デオキシリボヌクレオチドが修飾因子として用いられる。ヌクレオチド修飾因子を利用する場合、１〜３個のヌクレオチド修飾因子または２個のヌクレオチド修飾因子が、センス鎖の３’末端におけるリボヌクレオチドと置き換わる。立体障害分子を利用する場合、これらはアンチセンス鎖の３’末端のリボヌクレオチドに付着させる。したがって、鎖の長さは、修飾因子の組込みによって変化しない。別の態様において、ダイサー基質の２個のＤＮＡ塩基を、アンチセンス鎖のダイサープロセシングの方向を誘導するために置換することが企図される。本発明のさらなる態様において、２個の末端ＤＮＡ塩基が、センス鎖の３’末端とアンチセンス鎖の５’末端において、二重鎖の平滑末端を形成しているセンス鎖の３’末端の２個のリボヌクレオチドと置き換わり、２ヌクレオチドＲＮＡオーバーハングがアンチセンス鎖の３’末端に位置する。これは、平滑末端におけるＤＮＡとオーバーハング末端におけるＲＮＡ塩基を有する非対称性の構成である。

アンチセンス鎖は、アンチセンス鎖の３’末端に位置する好適な修飾因子によってダイサープロセシングのために修飾されいてもよい。すなわち、このｄｓＲＮＡはダイサーの結合およびプロセシングの方向を誘導するように設計されている。好適な修飾因子は、ヌクレオチド、例えば、デオキシリボヌクレオチド、ジデオキシリボヌクレオチド、アシクロヌクレオチドなど、および、立体障害分子、例えば、蛍光分子などを含む。アシクロヌクレオチドは、ｄＮＭＰにおいて通常存在する２’−デオキシリボフラノシル糖における２−ヒドロキシエトキシメチル基を置換する。他のヌクレオチド修飾因子は、３’−デオキシアデノシン（コルジセピン）、３’−アジド−３’−デオキシチミジン（ＡＺＴ）、２’，３’−ジデオキシイノシン（ｄｄＩ）、２’，３’−ジデオキシ−３’−チアシチジン（３ＴＣ）、２’，３’−ジデヒドロ−２’，３’−ジデオキシチミジン（ｄ４Ｔ）、ならびに３’−アジド−３’−デオキシチミジン（ＡＺＴ）、２’，３’−ジデオキシ−３’−チアシチジン（３ＴＣ）および２’，３’−ジデヒドロ−２’，３’−ジデオキシチミジン（ｄ４Ｔ）の一リン酸ヌクレオチドを含む。一態様において、デオキシリボヌクレオチドが修飾因子として用いられる。ヌクレオチド修飾因子を利用する場合、１〜３個のヌクレオチド修飾因子または２個のヌクレオチド修飾因子が、アンチセンス鎖の３’末端におけるリボヌクレオチドと置き換わる。立体障害分子を利用する場合、これらはアンチセンス鎖の３’末端のリボヌクレオチドに付着させる。したがって、鎖の長さは、修飾因子の組込みによって変化しない。別の態様においては、ｄｓＲＮＡの２個のＤＮＡ塩基を、アンチセンス鎖のダイサープロセシングの方向を誘導するために置換してもよい。さらなる態様において、２個の末端ＤＮＡ塩基が、センス鎖の５’末端とアンチセンス鎖の３’末端において、二重鎖の平滑末端を形成しているアンチセンス鎖の３’末端の２個のリボヌクレオチドの代わりに位置し、２ヌクレオチドＲＮＡオーバーハングがセンス鎖の３’末端に位置する。これは、平滑末端におけるＤＮＡとオーバーハング末端におけるＲＮＡ塩基を有する非対称性の構成である。

センス鎖およびアンチセンス鎖を有するダイサー基質は、第３の構造で連結されていてもよい。第３の構造は、ダイサー基質におけるダイサーの活性を妨害せず、標的遺伝子から転写されるＲＮＡの有向性の破壊（directed destruction）を妨げない。第３の構造は、化学的連結基（chemical linking group）であってもよい。好適な化学的連結基は当該技術分野において既知であり、使用可能である。あるいは、第３の構造は、ｄｓＲＮＡの２個のオリゴヌクレオチドを、この２個のオリゴヌクレオチドのアニーリングによりヘアピン構造が生じ、ダイサー基質が生成される様式で連結するオリゴヌクレオチドであってもよい。ヘアピン構造は、好ましくはダイサー基質におけるダイサーの活性を妨害せず、または、標的遺伝子から転写されるＲＮＡの有向性の破壊を妨げない。

ダイサー基質のセンス鎖およびアンチセンス鎖は、完全に相補的であることを要しない。それらは、生物学的条件下でアニーリングし、標的配列と十分に相補的なｓｉＲＮＡを生じる、ダイサーのための基質を提供するために、実質的に相補的であることが必要とされるにすぎない。

ダイサー基質は、ダイサーによるそのプロセシングを強化するある種の特性を有してもよい。ダイサー基質は、それがダイサーによってプロセシングされ、活性な核酸分子（例えば、ｓｉＲＮＡ）を生成するのに十分な長さを有してもよく、以下の特性の１または２以上を含んでもよい：（ｉ）ダイサー基質は非対称であり、例えば、第１の鎖（アンチセンス鎖）に３’オーバーハングを有する、および、（ｉｉ）ダイサー基質は、ダイサーの結合の方向およびｄｓＲＮＡの活性なｓｉＲＮＡへのプロセシングを誘導するための、第２の鎖（センス鎖）における修飾３’末端を有する。ダイサー基質は、センス鎖が２２〜２８ヌクレオチドを含み、アンチセンス鎖が２４〜３０ヌクレオチドを含むように、非対称であってもよい。したがって、結果として生じるダイサー基質は、アンチセンス鎖の３’末端にオーバーハングを有する。オーバーハングは、１〜３ヌクレオチド、例えば２ヌクレオチドである。センス鎖はまた、５’ホスフェートを有してもよい。

ダイサー基質は、アンチセンス鎖の３’末端にオーバーハングを有してもよく、センス鎖は、ダイサープロセシングのために修飾されている。センス鎖の５’末端は、ホスフェートを有してもよい。センス鎖およびアンチセンス鎖は、生物学的条件、例えば細胞の細胞質で見出される条件下でアニーリングしてもよい。ダイサー基質の１方の鎖、特にアンチセンス鎖の領域は、少なくとも１９ヌクレオチドの配列長を有してもよく、ここで、これらヌクレオチドは、アンチセンス鎖の３’末端に隣接する２１ヌクレオチドの領域にあり、標的遺伝子から生成されるＲＮＡのヌクレオチド配列と十分に相補的である。ダイサー基質はまた、以下のさらなる特性の１または２以上を有してもよい：（ａ）アンチセンス鎖は、対応する２１ｍｅｒに対して右へのシフトを有する（すなわち、対応する２１ｍｅｒと比較した場合、アンチセンス鎖は分子の右側にヌクレオチドを含む）、（ｂ）鎖は完全には相補的でなくてもよく、すなわち、鎖は単純なミスマッチ対を含んでもよい、および（ｃ）塩基修飾、例えば１個または２個以上のロックド核酸は、センス鎖の５’末端に含まれてもよい。

ダイサー基質核酸分子のアンチセンス鎖は、５’末端に１〜９個のリボヌクレオチドを含み、２２〜２８ヌクレオチドの長さを与えるように修飾されてもよい。アンチセンス鎖が２１ヌクレオチドの長さを有する場合、１〜７個のリボヌクレオチド、または２〜５個のリボヌクレオチド、および／または、４個のリボヌクレオチドが、３’末端に追加されてもよい。追加されたリボヌクレオチドは、任意の配列を有してもよい。追加されたリボヌクレオチドは標的遺伝子配列に相補的であってもよいが、標的配列とアンチセンス鎖との間の完全な相補性は必要ではない。つまり、結果として得られるアンチセンス鎖は、標的配列と十分に相補的である。センス鎖は、したがって、２４〜３０ヌクレオチドを有してもよい。センス鎖は、生物学的条件下でアンチセンス鎖にアニーリングするために、アンチセンス鎖と実質的に相補的であってもよい。一態様において、アンチセンス鎖は、ダイサープロセシングを誘導するために、修飾３’末端を含むように合成されてもよい。センス鎖は、３’オーバーハングを有してもよい。アンチセンス鎖は、ダイサーの結合およびプロセシングのための修飾３’末端を含むように合成されてもよく、センス鎖は３’オーバーハングを有する。

ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２
標的となる組織メタロプロテアーゼインヒビター１および２（ヒトＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２）ｃＤＮＡの例示的な核酸配列は、GenBankアクセッション番号NM_003454およびNM_003455に開示され、対応するｍＲＮＡ配列は、例えば配列番号１および配列番号２としてリストされたとおりである。当業者は、所定の配列が時間とともに変化し得、それにしたがって、本明細書における核酸分子に必要なあらゆる変化を組み込むことを理解する。

ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２の発現は、肝線維症を有するラットからの線維化した肝において増大していることが示された（Nie, et al 2004. World J. Gastroenterol. 10:86-90）。ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２は、線維症の処置のための潜在的な標的である。

ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２を阻害するための方法および組成物
提供されるのは、ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２遺伝子発現に対するＲＮＡ干渉を誘導することができる、または誘導する、短鎖核酸分子、例えば短鎖干渉核酸（ｓｉＮＡ）、ＲＮＡ干渉（ＲＮＡｉ）、短鎖干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）、マイクロＲＮＡ（ｍｉＲＮＡ）および短鎖ヘアピンＲＮＡ（ｓｈＲＮＡ）分子などを用いることによる、ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２発現の抑制のための組成物および方法である。本明細書に開示される組成物および方法はまた、種々の線維症、例えば肝線維症、肺線維症、腎線維症および上表Ｉに示した線維化病態の処置にも有用である。

本明細書に開示される１もしくは２以上の核酸分子および／または方法は、例えば、GenbankアクセッションNM_003254.2およびNM_004255.4に記載のＲＮＡをコードする１もしくは２以上の遺伝子の発現を下方調節するのに用いられる。

本明細書において提供される組成物、方法およびキットは、ＴＩＭＰ１および／またはＴＩＭＰ２タンパク質および／またはＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２タンパク質をコードする遺伝子、ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２と関連する疾患、状態または障害、例えば、肝線維症、肝硬変、肺線維症、腎線維症、腹膜線維症、慢性肝損傷および原線維形成の維持および／または発症に関連するタンパク質および／またはＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２をコードする遺伝子（例えば、GenBankアクセッション番号NM_003254およびNM_003255によって言及される配列を含む配列をコードする遺伝子）、またはＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２遺伝子ファミリーメンバー（ここで、遺伝子または遺伝子ファミリー配列は配列相同性を共有する）の発現を、独立して、または、組み合わせて調節する１または２以上の核酸分子（例えばｓｉＮＡ）および方法を含んでもよい。種々の側面および態様の説明は、例示的な遺伝子ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２に関して提供される。しかしながら、種々の側面および態様はまた、他の関連するＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２遺伝子、例えばホモログ遺伝子および転写変異体、および、特定のＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２遺伝子に関連する多型（例えば、一塩基多型（ＳＮＰｓ））をも対象とする。したがって、種々の側面および態様はまた、ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２が誘導するシグナル伝達経路に関与している他の遺伝子、または、例えば、本明細書に記載の疾患、形質または状態の維持または発症に関与している遺伝子発現をも対象とする。これらのさらなる遺伝子は、本明細書中ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２遺伝子に関して記載された方法を用いて、標的部位について分析することができる。したがって、他の遺伝子の調節および他の遺伝子のかかる調節の効果は、本明細書に記載のとおりに実行、決定、および測定することができる。

一態様において、本明細書において提供される組成物および方法は、ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２遺伝子（例えば、それぞれ配列番号１および配列番号２によって例示されるヒトＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２）の発現を下方調節する二本鎖短鎖干渉核酸（ｓｉＮＡ）分子を含み、ここで該核酸分子は約１５個〜約４９個の塩基対を含む。

一態様において、開示される核酸は、ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２遺伝子またはＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２遺伝子ファミリーの発現を阻害するために用いられてもよく、ここで、遺伝子または遺伝子ファミリー配列は配列相同性を共有する。かかる相同配列は、当該技術分野において知られていているように同定することができ、例えば配列アラインメントを用いて同定することができる。核酸分子は、例えば、完全に相補的な配列を用いて、または、さらなる標的配列を提供することができる非正準（non-canonical）塩基対、例えばミスマッチおよび／またはゆらぎ塩基対を組み込むことによって、かかる相同配列を標的とするように設計することができる。ミスマッチが確認された場合、非正準塩基対（例えばミスマッチおよび／またはゆらぎ塩基）を用いて、複数の遺伝子配列を標的とする核酸分子を生成することができる。非限定例において、非正準塩基対、例えば、ＵＵおよびＣＣ塩基対等を用いて、配列相同性を共有する異なる標的ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２のための配列をターゲティングできる核酸分子を生成する。したがって、本明細書に開示されるｓｉＮＡを用いることの１つの利点は、単一の核酸が、相同遺伝子間で保存されているヌクレオチド配列に相補的な核酸配列を含むように設計できることである。このアプローチにおいては、複数の核酸分子を異なる遺伝子のターゲティングに用いる代わりに、単一の核酸を複数の遺伝子の発現の阻害に用いることができる。

核酸分子は、ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２ファミリー遺伝子などの、１または２以上の遺伝子ファミリーに対応する保存配列のターゲティングに用いることができる。したがって、複数の標的ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２をターゲティングする核酸分子は、増大した治療効果を提供することができる。そのうえ、核酸は、種々の用途において、遺伝子機能の経路を特徴づけるのに用いることができる。例えば、核酸分子は、遺伝子機能分析、ｍＲＮＡ機能分析または翻訳分析において、ある経路における１種または２種以上の標的遺伝子の活性を阻害し、特徴づけられていない１種または２種以上の遺伝子の機能を決定するために用いることができる。核酸分子は、医薬開発に向けて、種々の疾患および状態に関与する潜在的な標的遺伝子経路を決定するために用いることができる。核酸分子は、例えば、線維症、例えば、肝臓、腎臓または肺線維症および／または炎症性および増殖性の形質、疾患、障害および／または状態に関与する遺伝子発現の経路を理解するために用いることができる。

一態様において、本明細書において提供される組成物および方法は、ＴＩＭＰ１ＲＮＡに対してＲＮＡｉ活性を有する核酸分子を含み、ここで、核酸分子は、ＴＩＭＰ１をコードする配列を有する任意のＲＮＡに相補的な配列を含む。別の態様において、核酸分子は、ＴＩＭＰ１ＲＮＡに対するＲＮＡｉ活性を有してもよく、ここで、核酸分子は、変異体ＴＩＭＰ１をコードする配列、例えば、線維症の維持および／または発症に関連することが当該技術分野において知られている他の変異ＴＩＭＰ１遺伝子、を有するＲＮＡに相補的な配列を含む。別の態様において、本明細書に開示される核酸分子は、ＴＩＭＰ１遺伝子のヌクレオチド配列と相互作用することができ、それによって、ＴＩＭＰ１遺伝子発現のサイレンシングを誘導するヌクレオチド配列を含み、例えば、ここで、核酸分子は、染色体構造またはＴＩＭＰ１遺伝子のメチル化パターンを調節し、ＴＩＭＰ１遺伝子の転写を防止する細胞プロセスによって、ＴＩＭＰ１遺伝子発現の調整を媒介する。

別の態様において、本明細書において提供される組成物および方法は、ＴＩＭＰ２ＲＮＡに対してＲＮＡｉ活性を有する核酸分子を含み、ここで、核酸分子は、ＴＩＭＰ２をコードする配列、例えばGenBankアクセッション番号NM_003455を有する配列、を有する任意のＲＮＡに相補的な配列を含む。核酸分子は、ＴＩＭＰ２ＲＮＡに対するＲＮＡｉ活性を有してもよく、ここで、核酸分子は、変異体ＴＩＭＰ２をコードする配列、例えば、線維症の維持および／または発症に関連することが当該技術分野において知られている他の変異ＴＩＭＰ２遺伝子、を有するＲＮＡに相補的な配列を含む。本明細書に開示される核酸分子は、ＴＩＭＰ２遺伝子のヌクレオチド配列と相互作用することができ、それによって、ＴＩＭＰ２遺伝子発現のサイレンシングを誘導するヌクレオチド配列を含み、例えば、ここで、核酸分子は、染色体構造またはＴＩＭＰ２遺伝子のメチル化パターンを調節し、ＴＩＭＰ２遺伝子の転写を防止する細胞プロセスによって、ＴＩＭＰ２遺伝子発現の調整を媒介する。

処置方法
一態様において、核酸分子は、ＴＩＭＰ１および／または、ＴＩＭＰ１および／または疾患もしくは状態（例えば線維症）と関連するＴＩＭＰ１ハプロタイプ多型に起因するＴＩＭＰ１タンパク質の発現を下方調節または阻害するのに用いることができる。ＴＩＭＰ１および／またはＴＩＭＰ１遺伝子、またはＴＩＭＰ１および／またはＴＩＭＰ１タンパク質またはＲＮＡレベルの分析を、かかる多型を有する対象、または、本明細書に記載の形質、状態または疾患を発症するリスクを有するこれらの対象を同定することに用いることができる。これらの対象は、処置、例えば本明細書に開示される核酸分子およびＴＩＭＰ１および／またはＴＩＭＰ１遺伝子発現に関連した疾患を処置するのに有用なあらゆる他の組成物による処置に適している。したがって、ＴＩＭＰ１および／またはＴＩＭＰ１タンパク質またはＲＮＡレベルの分析は、対象の処置における処置の種類および治療過程の決定に用いることができる。ＴＩＭＰ１および／またはＴＩＭＰ１タンパク質またはＲＮＡレベルのモニタリングは、処置結果の予測、および、形質、状態または疾患に関連する特定のＴＩＭＰ１および／またはＴＩＭＰ１タンパク質のレベルおよび／または活性を調節する化合物および組成物の有効性の決定に用いることができる。

一態様において、核酸分子は、ＴＩＭＰ２および／または、ＴＩＭＰ２および／または疾患もしくは状態（例えば線維症）と関連するＴＩＭＰ２ハプロタイプ多型に起因するＴＩＭＰ２タンパク質の発現を下方調節または阻害するのに用いることができる。ＴＩＭＰ２および／またはＴＩＭＰ２遺伝子、またはＴＩＭＰ２および／またはＴＩＭＰ２タンパク質またはＲＮＡレベルの分析を、かかる多型を有する対象、または、本明細書に記載の形質、状態または疾患を発症するリスクを有するこれらの対象を同定することに用いることができる。これらの対象は、処置、例えば本明細書に開示される核酸分子およびＴＩＭＰ２および／またはＴＩＭＰ２遺伝子発現に関連した疾患を処置するのに有用なあらゆる他の組成物による処置に適している。したがって、ＴＩＭＰ２および／またはＴＩＭＰ２タンパク質またはＲＮＡレベルの分析は、対象の処置における処置の種類および治療過程の決定に用いることができる。ＴＩＭＰ２および／またはＴＩＭＰ２タンパク質またはＲＮＡレベルのモニタリングは、処置結果の予測、および、形質、状態または疾患に関連する特定のＴＩＭＰ２および／またはＴＩＭＰ２タンパク質のレベルおよび／または活性を調節する化合物および組成物の有効性の決定に用いることができる。

提供されるのは、ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２遺伝子発現に対するＲＮＡ干渉を誘導することができる、または誘導する、本明細書において提供される短鎖核酸分子、例えば短鎖干渉核酸（ｓｉＮＡ）、ＲＮＡ干渉（ＲＮＡｉ）、短鎖干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）、マイクロＲＮＡ（ｍｉＲＮＡ）および短鎖ヘアピンＲＮＡ（ｓｈＲＮＡ）分子などを用いることによる、ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２発現の抑制のための組成物および方法である。本明細書に開示される組成物および方法はまた、種々の線維症、例えば肝線維症、肺線維症および腎線維症の処置にも有用である。

本明細書に開示される核酸分子は、単独で、または他の薬剤と組み合わせて、もしくは他の薬剤とともに、ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２に関連する疾患、形質、状態および／または障害、例えば、肝線維症、肝硬変、肺線維症、腎線維症、腹膜線維症、慢性肝損傷および原線維形成の予防または処置に用いることができる。

本明細書に開示される核酸分子は、ＴＩＭＰ１またはＴＩＭＰ２の発現を配列特異的な様式で阻害することができる。核酸分子は、センス鎖およびＴＩＭＰ１またはＴＩＭＰ２ｍＲＮＡに少なくとも部分的に相補的（アンチセンス）な連続ヌクレオチドを含むアンチセンス鎖を含んでもよい。

一部の態様において、ＴＩＭＰ１またはＴＩＭＰ２に特異的なｄｓＲＮＡは、例えば新たに合成されたタンパク質のフォールディングを補助する他の分子シャペロン、例えば、カルネキシン、カルレティキュリン、ＢｉＰ（Bergeron et al. Trends Biochem. Sci. 1994; 19:124-128、Herbert et al. 1995; Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol. 60:405-415）に特異的な他のｄｓＲＮＡとともに用いることができる。

線維症は、本明細書に開示される核酸分子を用いたＲＮＡ干渉により処置することができる。例示的な線維症は、肝線維症、腹膜線維症、肺線維症、腎線維症、声帯線維症、腸管線維症を含む。本明細書に開示される核酸分子は、配列特異的な様式でＴＩＭＰ１またはＴＩＭＰ２の発現を阻害することができる。

線維症の処置は、当該技術分野で既知の好適な技法を用いて、例えば、抗コラーゲンＩ抗体を用いて、細胞外のコラーゲンのレベルを決定することによりモニタリングできる。処置はまた、罹患組織の細胞におけるＴＩＭＰ１またはＴＩＭＰ２ｍＲＮＡのレベルまたはＴＩＭＰ１またはＴＩＭＰ２タンパク質のレベルを決定することによってもモニタリングできる。処置はまた、罹患臓器または組織の非侵襲性スキャン、例えば、コンピュータ連動断層撮影スキャン、核磁気共鳴弾性率計測スキャンなどによってもモニタリングできる。

対象または生体におけるＴＩＭＰ１に関連する疾患または状態を処置または予防するための方法は、対象または生体と、本明細書において提供される核酸分子とを、対象または生体におけるＴＩＭＰ１遺伝子の発現の調節に好適な条件下で接触させることを含んでもよい。

対象または生体におけるＴＩＭＰ２に関連する疾患または状態を処置または予防するための方法は、対象または生体と、本明細書において提供される核酸分子とを、対象または生体におけるＴＩＭＰ２遺伝子の発現の調節に好適な条件下で接触させることを含んでもよい。

対象または生体における線維症を処置または予防するための方法は、対象または生体と、核酸分子とを、対象または生体におけるＴＩＭＰ１および／またはＴＩＭＰ２遺伝子の発現の調節に好適な条件下で接触させることを含んでもよい。

対象または生体における、肝線維症、腎線維症および肺線維症からなる群から選択される１種または２種以上の線維症を処置または予防するための方法は、対象または生体と、核酸分子とを、対象または生体におけるＴＩＭＰ１および／またはＴＩＭＰ２遺伝子の発現の調節に好適な条件下で接触させることを含んでもよい。

線維性疾患
線維性疾患は、一般的に、細胞外マトリックス中の線維状物質の過剰な堆積を特徴とし、それは組織構造の異常な変化の一因となり、正常な臓器の機能を妨げる。

外傷によって損傷を受けた組織は全て、創傷治癒プログラムの開始により反応する。過剰な瘢痕化を特徴とする障害の一種である線維症は、創傷治癒反応の正常な自己制御プロセスが妨げられた場合に生じ、コラーゲンの過剰な産生および堆積をもたらす。その結果、臓器の正常な組織は瘢痕組織と置き換わり、これがやがては臓器の機能不全をもたらす。

線維症は、多様な原因により、種々の臓器で発症し得る。肝硬変、肺線維症、サルコイドーシス、ケロイドおよび腎線維症は全て、進行性の線維症に関連した慢性の状態であり、それによって正常な組織機能の持続的な喪失をもたらす。

急性線維化（通常、突発性で重篤な発症を伴い、持続期間は短い）は、種々の形態の、偶発的な損傷（特に脊柱および中枢神経系の損傷）を含む外傷、感染症、手術、虚血性疾患（例えば心臓発作後の心臓の瘢痕化）、熱傷、環境汚染物、アルコールおよび他の種類の毒素、急性呼吸不全症候群、放射線および化学療法処置への共通の反応として生じる。

線維症、線維化に関係する病態、または、細胞タンパク質の異常な架橋に関係する病態は全て本明細書に開示されるｓｉＲＮＡによって処置することができる。線維性疾患または線維化が明白な疾患（線維化に関係する病態）は、組織線維症の急性および慢性形態の両方を含み、これは以下の全ての病因的類似疾患（etiological variant）を含む：間質性肺疾患および線維性肺疾患を含む肺線維症、肝線維症、心筋線維症を含む心線維症、慢性腎不全を含む腎線維症、強皮症を含む皮膚線維症、ケロイドおよび肥厚性瘢痕、骨髄線維症（骨髄の線維症）、脳梗塞に関連する脳における線維化、増殖性硝子体網膜症（ＰＶＲ）、および白内障または緑内障を処置する手術により生じた瘢痕化を含むあらゆる種類の眼の瘢痕化、多様な病因の炎症性腸疾患、黄斑部変性、グレーブス眼症、薬剤誘導性麦角中毒、ケロイド瘢痕、強皮症、乾癬、リ・フラウメニ症候群における膠芽腫、散発性膠芽腫、骨髄性白血病、急性骨髄性白血病、骨髄異形成症候群、骨髄増殖性症候群、婦人科がん、カポジ肉腫、ハンセン病、脳梗塞に関連する線維化、および膠原性大腸炎。

種々の態様において、本明細書に開示される化合物（核酸分子）は線維性疾患、例えば本明細書に開示されるもの、ならびに、線維性疾患以外の多くの他の疾患および状態、例えば本明細書に開示されるものの処置に用いることができる。処置される他の状態は、他の臓器における線維性疾患、あらゆる原因の腎線維症（ＥＳＲＤを含むＣＫＤ）、肺線維症（ＩＬＦを含む）、骨髄線維症、偶発的および医原性（手術）の全ての可能な種類の皮膚損傷に関連する異常な瘢痕化（ケロイド）、強皮症、心線維症、緑内障濾過手術の失敗、および腸管癒着症を含む。

眼科手術および線維性合併症
眼の手術に起因する瘢痕組織の収縮は頻繁に生じ得る。新たな排出路を形成するための緑内障手術は組織の瘢痕化と収縮のために失敗することが多く、形成した排出システムが閉塞することがあり、さらなる外科的介入が必要となる。現行の抗収縮レジメン（マイトマイシンＣまたは５ＦＵ）は、関連する合併症（例えば失明）によって制限されている（例えば、Cordeiro MF, et al., Human anti-transforming growth factor-beta2 antibody: a new glaucoma anti-scarring agent Invest Ophthalmol Vis Sci. 1999 Sep;40(10):2225-34参照）。角膜外傷または角膜手術（例えば組織の収縮が不正確な結果をもたらすことがある近視または屈折異常のためのレーザーまたは外科的処置）の後に形成される瘢痕組織の収縮もあり得る。瘢痕組織は、例えば硝子体液または網膜の上／内部に形成されることがあり、一部の糖尿病患者においては最終的に失明を生じ得、網膜剥離手術後に形成されることがあり、増殖性硝子体網膜症（ＰＶＲ）と呼ばれている。ＰＶＲは網膜剥離後の最もよく見られる合併症であり、網膜孔または網膜裂孔と関係している。ＰＶＲは、網膜色素上皮細胞を含む、硝子体腔内および網膜前面および後面上の細胞膜の増殖を指す。本質的に瘢痕組織であるこれらの膜は網膜を牽引し、当初は成功した網膜剥離治療の後でさえ、網膜剥離の再発をもたらすことがある。

瘢痕組織は、眼窩内または眼球および眼瞼筋上に、斜視、眼窩または眼瞼の手術後、または甲状腺眼症に生じることがある。そこでは、結膜の瘢痕形成が、緑内障手術後、または、瘢痕性疾患、炎症性疾患、例えば類天疱瘡、または感染症、例えばトラコーマにおいて生じ得るのと同様にして起こる。コラーゲン含有組織の収縮に関連するさらなる眼の問題は、白内障摘出後の水晶体カプセルの不透明化および収縮である。ＭＭＰの重要な役割が、創傷治癒、ドライアイ、無菌性角膜潰瘍、再発性上皮びらん、角膜血管新生、翼状片、結膜弛緩症、緑内障、ＰＶＲおよび眼線維症を含む眼科疾患で認められている。

肝線維症
肝線維症（ＬＦ）は、複数の病因の肝損傷の一般的に不可逆的な結果である。欧米諸国において、主な病因学的カテゴリーは、アルコール性肝疾患（３０〜５０％）、ウイルス性肝炎（３０％）、胆管疾患（５〜１０％）、原発性ヘモクロマトーシス（５％）、ならびに薬剤性肝硬変および病因不明の特発性肝硬変（１０〜１５％）である。ウイルソン病、α１アンチトリプシン欠損症および他の奇病も、肝線維症を症状の１つとして有する。肝線維症の末期である肝硬変は、肝移植を要することが多く、欧米諸国における死因の上位１０位以内に入っている。

腎線維症および関連する状態
慢性腎不全（ＣＲＦ）
慢性腎不全は、老廃物を排出し、尿を濃縮し、電解質を維持する腎臓の能力の漸次的かつ進行性の喪失である。ＣＲＦは、ゆっくりと進行する。それは最も多くの場合、腎機能の漸次的な喪失をもたらす任意の疾患から生じ、線維症はＣＲＦを生じさせる主な病態である。

糖尿病性腎障害
糖尿病性腎障害（その特徴は糸球体硬化症および尿細管間質性線維症である）は、現代社会における末期腎疾患の唯一のもっとも頻度の高い原因であり、糖尿病患者は透析を受ける最大の人口を構成する。かかる治療は効果であり、決して最適なものではない。移植はより良い結果を提供するが、提供者の深刻な不足に悩まされている。

慢性腎臓病
慢性腎臓病（ＣＫＤ）は、世界的な公衆衛生上の問題であり、心臓血管疾患および慢性腎不全（ＣＲＦ）の増大した危険性と関連している、よく見られる状態であると認識されている。

米国腎臓財団（ＮＫＦ）の腎臓病成果品質イニシアティブ（Ｋ／ＤＯＱＩ）は、慢性腎臓病を、３ヵ月または４ヶ月以上の腎臓損傷または減少した腎臓糸球体濾過率（ＧＦＲ）として定義する。ＣＫＤの他のマーカーも知られており、診断のために用いられている。一般に、不可逆的な硬化による腎臓マス（renal mass）の破壊およびネフロンの消失は、ＧＦＲの漸進的低下につながる。最近、Ｋ／ＤＯＱＩは、ＣＫＤのステージ分類を発表し、それは以下のとおりであった：
ステージ１：正常または亢進したＧＦＲ（＞９０ｍＬ／分／１．７３ｍ２）を伴う腎臓損傷
ステージ２：ＧＦＲの軽度低下（６０〜８９ｍＬ／分／１．７３ｍ２）
ステージ３：ＧＦＲの中程度低下（３０〜５９ｍＬ／分／１．７３ｍ２）
ステージ４：ＧＦＲの重度低下（１５〜２９ｍＬ／分／１．７３ｍ２）
ステージ５：腎不全（ＧＦＲ＜１５ｍＬ／分／１．７３ｍ２または透析）

ステージ１および２のＣＫＤでは、ＧＦＲだけでは診断を確定できない。血液または尿組成の異常またはイメージング試験の異常を含む腎臓損傷の他のマーカーに依拠してもよい。

ＣＫＤの病態生理学
約１００万個のネフロンが各々の腎臓に存在し、各々が総ＧＦＲに寄与する。腎損傷の病因論にかかわりなく、ネフロンの漸進性破壊を受けると、腎臓は、残存する健康なネフロンの過剰濾過および代償性肥大によって、ＧＦＲを維持することができる。このネフロンの適応性により、血漿溶質の継続的な正常なクリアランスが可能となり、総ＧＦＲが５０％に低下した後に、腎臓の余力が使い果たされて初めて、尿素およびクレアチニンなどの物質の血漿レベルが顕著な上昇を示し始める。血漿クレアチニン値は、ＧＦＲの５０％の低下でほぼ２倍になる。したがって、患者における、０．６ｍｇ／ｄＬのベースライン値から１．２ｍｇ／ｄＬへの血漿クレアチニンの倍加は、機能するネフロン数の５０％の消失を実質的に表す。

残存するネフロン過剰濾過と肥大は、指摘した理由のために有益であるが、進行性の腎臓機能障害の主な原因であると考えられている。これは、上昇した糸球体毛細血管圧が原因で生じると思われており、これは毛細血管に損傷を与え、まず最初に巣状分節性糸球体硬化症を、そしてやがては球状糸球体硬化症をもたらす。この仮説は、ＣＫＤを有するヒトで観察されるのと同一の病変を発症する５／６腎摘出ラットの研究に基づいている。

慢性腎臓病の最も一般的な２つの原因は、糖尿病と高血圧である。他の要因は、造影剤を含む腎毒素による急性傷害、または灌流の低下、タンパク尿症、間質の損傷による腎アンモニア生成の増加、高脂血症、リン酸カルシウムの沈着を伴う高リン酸血症、亜酸化窒素レベルの低下および喫煙を含む。

アメリカ合衆国においてＣＫＤの発生率および有病率は上昇しており、成果は乏しく、保健システムに対する高いコストを伴う。腎臓病は、米国における死因の第９位である。この高い死亡率により、米国公衆衛生局長官はアメリカ市民のHealthy People 2010に、ＣＫＤに焦点を当てた章を含めることを命じた。この章の目的は、目標を明確化し、米国における慢性腎臓病の発生率、羅病率、死亡率および医療費を低減するための戦略を提供することである。

末期腎疾患（ＥＳＲＤ）の発生率もまた、１９８９年以降世界的に着実に増加している。アメリカ合衆国はＥＳＲＤの発生率が最も高く、これに日本が続く。日本は人口１００万人あたりの有病率が最も高く、これに米国が続く。

血液透析に関連する死亡率は目を引くものであり、血液透析を開始する患者の寿命が著しく短くなることを示す。どの年齢においても、透析を受けているＥＳＲＤ患者は、非透析患者および腎疾患を有しない人と比較して顕著に高い死亡率を有する。６０歳において、健康な人は、２０年を超えて生存することを期待できるが、血液透析を始めている６０才の患者の寿命は４年前後である（Aurora and Verelli, May 21, 2009. Chronic Renal Failure: Treatment & Medication. Emedicine. http://emedicine.medscape.com/article/238798-treatment）。

肺線維症
間質性肺線維症（ＩＰＦ）は、鉱物粒子、有機ダストおよびオキシダントガスを含む種々の吸入物質、または未知の理由（特発性肺線維症）に起因する肺の瘢痕形成である。この疾患は世界中で何百万もの人を苦しめており、効果的治療手段がない。有用な処置を欠く主な理由は、治療のための適切な標的を設計するために十分に明らかにされた疾患の分子機構がほとんどないことである（Lasky JA., Brody AR. (2000), “Interstitial fibrosis and growth factors”, Environ Health Perspect.;108 Suppl 4:751-62）。

心線維症
心不全のみの有病率が高まる一方、他の状態は顕著に減少しているという点で、心不全は、心血管障害の中でユニークな存在である。その一部の原因は、米国および欧州の人口の高齢化に帰することができる。心筋の損傷を有する患者を救助する能力もまた主な要因であるが、それは、これらの患者が心臓の有害なリモデリングによる左室機能不全の進行を起こすことがあるためである。

正常な心筋は、種々の細胞、心筋細胞と、内皮細胞、血管平滑筋細胞および線維芽細胞を含む非心筋細胞とから構成される。

心室壁の構造的リモデリングは、心疾患の臨床転帰の重要な決定要因である。かかるリモデリングは、細胞外マトリックスタンパク質の産生および破壊、細胞増殖および遊走、ならびにアポトーシス性および壊死性細胞死を含む。心線維芽細胞はこれらのプロセスに決定的に関与しており、オートクリンおよびパラクリン因子として作用する増殖因子およびサイトカイン、ならびに細胞外マトリックスタンパク質およびプロテイナーゼを産生する。最近の研究は、心線維芽細胞と心筋細胞との相互作用が、心臓リモデリング（その正味の結果は心機能の低下および心不全の発症である）の進行に不可欠であることを示した（Manabe I, et al., (2002), “Gene expression in fibroblasts and fibrosis: involvement in cardiac hypertrophy”, Circ Res. 13;91(12):1103-13）。

熱傷および瘢痕
特に線維性疾患で起こり得る特有の問題は、組織の収縮、例えば瘢痕の収縮である。細胞外マトリックス成分を含む組織の収縮、特にコラーゲン含有組織の収縮は、多くの異なる病的状態、および外科的または美容的手法に関連して生じることがある。例えば、瘢痕の収縮は、医学的処置が必要となり得るの身体的な問題を引き起こすことがあり、または、純粋に美容的性質の問題を引き起こすことがある。コラーゲンは、瘢痕および他の収縮した組織の主成分であり、したがって、考慮すべき最も重要な構造的成分である。とはいえ、瘢痕および他の収縮した組織はまた、他の構造的成分、特に他の細胞外マトリックス成分、例えばエラスチンを含み、これもまた組織の収縮に関与し得る。

他の細胞外マトリックス成分を含むことがあるコラーゲン含有組織の収縮は、しばしば熱傷の治癒において生じる。熱傷は、化学熱傷、熱による熱傷または放射線熱傷であってもよく、眼、皮膚表面、または皮膚およびその下にある組織の熱傷であってもよい。放射線処置に起因するもののように、熱傷が内部の組織にあることもある。熱傷した組織の収縮はしばしば問題であり、身体的および／または美容的問題、例えば運動の喪失および／または外観の損傷につながることがある。

植皮片は種々の理由のために適用することができ、適用後にしばしば収縮をおこし得る。熱傷を受けた組織の治癒と同様に、収縮は身体的問題および美容的問題の両方につながり得る。多くの植皮片が、例えば重度の熱傷のケースで必要となるため、これは特に深刻な問題である。

収縮はまた、人工皮膚の生産においても問題である。真の人工皮膚を作製するためには、上皮細胞（ケラチノサイト）でできた表皮と、線維芽細胞が存在するコラーゲンでできた真皮とが必要である。両方の種類の細胞を有することが重要である。それは、これらが、増殖因子を使用して互いにシグナルを送り、刺激するからである。人工皮膚のコラーゲン成分は、そこに線維芽細胞が存在する場合、その原面積の１０分の１未満にしばしば収縮する。

瘢痕収縮、瘢痕の線維組織の縮小による収縮は一般的である。場合によっては、瘢痕は悪性瘢痕、収縮によって重大な変形が生じる瘢痕になることがある。患者の胃は、胃潰瘍が治癒するときに形成される瘢痕組織の収縮によって、砂時計形収縮により事実上２個の別々の室に分かれることがある。通路および管の閉塞、瘢痕性狭窄症は、瘢痕組織の収縮のために生じることがある。血管の収縮は、原発性閉塞（primary obstruction）または外科的な外傷、例えば、手術または血管形成術の後のものであってもよい。他の管腔臓器、例えば尿管の狭窄症もまた生じ得る。偶発的な傷からまたは手術から生じるかどうかに関係なく、あらゆる形の瘢痕形成が起こる所に問題が生じ得る。コラーゲン含有組織の収縮を含む皮膚および腱の状態は、手術または事故から生じる外傷後の状態、例えば、手または足の腱の損傷、移植後の状態および病的状態、例えば強皮症、デュピュイトラン拘縮および表皮水疱症を含む。眼内の組織の瘢痕形成および収縮は、種々の状態、例えば網膜剥離の後遺症または糖尿病性眼疾患（上記のとおり）において生じ得る。眼球と、外眼筋および眼瞼を含むその付属構造のための頭蓋に見出されるくぼみ（socket）の収縮は、そこに外傷または炎症性損傷がある場合に生じ得る。組織はくぼみ内で収縮し、複視および醜い外観を含む種々の問題を引き起こす。

他の適応症は、声帯線維症、腸管線維症および脳梗塞に関連する線維化を含む。

様々な種類の線維症に関するさらなる情報については、Molina V, et al., (2002), “Fibrotic diseases”, Harefuah, 141(11): 973-8, 1009、Yu L, et al., (2002), “Therapeutic strategies to halt renal fibrosis”, Curr Opin Pharmacol. 2(2):177-81、Keane WF and Lyle PA. (2003), “Recent advances in management of type 2 diabetes and nephropathy: lessons from the RENAAL study”, Am J Kidney Dis. 41(3 Suppl 2): S22-5、Bohle A, et al., (1989), “The pathogenesis of chronic renal failure”, Pathol Res Pract. 185(4):421-40、Kikkawa R, et al., (1997), “Mechanism of the progression of diabetic nephropathy to renal failure”, Kidney Int Suppl. 62:S39-40、Bataller R, and Brenner DA. (2001), “Hepatic stellate cells as a target for the treatment of liver fibrosis”, Semin Liver Dis. 21(3):437-51、Gross TJ and Hunninghake GW, (2001) “Idiopathic pulmonary fibrosis”, N Engl J Med. 345(7):517-25、Frohlich ED. (2001) “Fibrosis and ischemia: the real risks in hypertensive heart disease”, Am J Hypertens;14(6 Pt 2):194S-199S、Friedman SL. (2003), “Liver fibrosis - from bench to bedside”, J Hepatol. 38 Suppl 1:S38-53、Albanis E, et al., (2003), “Treatment of hepatic fibrosis: almost there”, Curr Gastroenterol Rep. 5(1):48-56、(Weber KT. (2000), “Fibrosis and hypertensive heart disease”, Curr Opin Cardiol. 15(4):264-72)を参照のこと。

核酸分子の送達および医薬製剤
核酸分子は、線維性の（例えば、肝、腎、腹膜、肺）疾患、形質、状態および／または障害および／または、細胞または組織におけるＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２のレベルに関連する、または、反応する他のあらゆる形質、疾患、障害または状態を予防または処置することに使用するために適応させることができる。核酸分子は、リポソームを含む、対象に投与するための送達ビヒクル、担体および希釈剤およびその塩を含んでいてもよく、および／または、薬学的に許容し得る製剤中に存在してもよい。

本発明の核酸分子は、担体または希釈剤とともに調製される裸の分子の直接的な適用によって、標的組織に送達されてもよい。

用語「裸の核酸」または「裸のｄｓＲＮＡ」または「裸のｓｉＲＮＡ」は、ウイルス配列、ウイルス粒子、リポソーム製剤、リポフェクチンまたは沈殿剤などを包含する、細胞への進入を補助し、促進し、または容易にするように作用するあらゆる送達ビヒクルからフリーの核酸分子を指す。例えば、ＰＢＳ中のｄｓＲＮＡは、「裸のｄｓＲＮＡ」である。

本明細書に開示される核酸分子は、ウイルスベクター、ウイルス粒子、リポソーム製剤、リポフェクチンまたは沈殿剤などを含む、細胞への進入を補助、促進または容易化する作用を有する任意の送達ビヒクルではなく、担体または希釈剤とともに直接送達または投与されてもよい。

核酸分子は、核酸分子を、担体または希釈剤または、ウイルス配列、ウイルス粒子、リポソーム製剤、リポフェクチンまたは沈殿剤などを含む、細胞への進入を補助、促進または容易化する作用を有する任意の他の送達ビヒクルとともに直接適用することにより、対象に送達または投与されてもよい。所望の対象への核酸の導入を容易にするポリペプチドは、米国出願公開第20070155658号に記載のもの（例えば、２，４，６−トリグアニジノトリアジンおよび２，４，６−トリアミドサルコシルメラミンなどのメラミン誘導体、ポリアルギニンポリペチド、および交互するグルタミンおよびアスパラギン残基を含むポリペチド）など。

核酸分子の送達のための方法は、Akhtar et al., Trends Cell Bio., 2: 139 (1992)、Delivery Strategies for Antisense Oligonucleotide Therapeutics, ed. Akhtar, (1995)、 Maurer et al., Mol. Membr. Biol., 16: 129-140 (1999)、Hofland and Huang, Handb. Exp. Pharmacol., 137: 165-192 (1999)、およびLee et al., ACS Symp. Ser., 752: 184-192 (2000)、米国特許第6,395,713号、第6,235,310号、第5,225,182号、第5,169,383号、第5,167,616号、第4,959217号、第4.925,678号、第4,487,603号、および第4,486,194号、およびSullivan et al., PCT WO 94/02595およびPCT WO 00/03683およびPCT WO 02/08754、および米国特許出願公開第2003077829号に記載されている。これらのプロトコルは、実質的にあらゆる核酸分子の送達のために利用することができる。核酸分子は、限定されずに、リポソームへの封入、イオン泳動法による、または他のビヒクル、例えば生分解性ポリマー、ヒドロゲル、シクロデキストリン（例えば、Gonzalez et al., Bioconjugate Chem., 10: 1068-1074 (1999)、Wang et al.、ＰＣＴ国際公開WO 03/47518およびWO 03/46185参照）、ポリ（乳酸−コ−グリコール酸）（ＰＬＧＡ）およびＰＬＣＡミクロスフェア（例えば、米国特許第6,447,796号および米国出願公開第2002130430号参照）、生物分解性ナノ粒子および生体付着性ミクロスフェアなどへの組込みによる、またはタンパク質性ベクター（O'Hare and Normand、ＰＣＴ国際公開WO 00/53722）によるものを含む、当業者に既知の種々の方法により投与することができる。あるいは、核酸／ビヒクルの組合せは、直接注入により、またはインフュージョンポンプの使用により、局所的に送達される。本明細書に開示される核酸分子の直接注入は、皮下にせよ、筋肉内にせよ、皮内にせよ、標準的な針と注射器による方法論を用いて、またはニードルフリー技術、例えばConry et al., Clin. Cancer Res., 5: 2330-2337 (1999)およびBarry et al.、ＰＣＴ国際公開WO 99/31262に記載されたものなどにより行うことができる。本明細書に開示される分子は、医薬品として使用することができる。医薬品は、対象における疾患状況を予防、発生を調節、または処置（症状、好ましくは症状の全てをある程度緩和）し得る。

核酸分子は、カチオン性脂質と複合体化されても、リポソームに被包されても、または、別様に標的細胞または組織に送達されてもよい。核酸または核酸複合体は、バイオポリマーに組み込まれ、または組み込まれずに、直接的な皮膚適用、経皮適用または注射を介して、関係する組織にex vivoまたはin vivoで、局所投与することができる。

送達システムは、ポリ（エチレングリコール）脂質を含む表面修飾リポソーム（ＰＥＧ修飾、または長期循環リポソームまたはステルスリポソーム）を含む。これらの製剤は、標的組織における薬剤の集積を増大する方法を提供する。この種類の薬物担体は、単核食細胞系（ＭＰＳまたはＲＥＳ）によるオプソニン化および排除に耐性であり、それによって、封入された薬剤のより長い血液循環時間および増強された組織への暴露が可能となる（Lasic et al. Chem. Rev. 1995, 95, 2601-2627、Ishiwata et al., Chem. Pharm. Bull. 1995, 43, 1005-1011）。

核酸分子は、ポリエチレンイミン（例えば、直鎖または分枝ＰＥＩ）、および／または、例えば、ポリエチレンイミン−ポリエチレングリコール−Ｎ−アセチルガラクトサミン（ＰＥＩ−ＰＥＧ−ＧＡＬ）またはポリエチレンイミン−ポリエチレングリコール−トリ−Ｎ−アセチルガラクトサミン（ＰＥＩ−ＰＥＧ−ｔｒｉＧＡＬ）誘導体、グラフトＰＥＩ、例えば、ガラクトースＰＥＩ、コレステロールＰＥＩ、抗体誘導体化ＰＥＩ、およびこれらのポリエチレングリコールＰＥＩ（ＰＥＧ−ＰＥＩ）誘導体を含む、ポリエチレンイミン誘導体（例えば、Ogris et al., 2001, AAPA PharmSci, 3, 1-11、Furgeson et al., 2003, Bioconjugate Chem., 14, 840-847、Kunath et al., 2002, Pharmaceutical Research, 19, 810-817、Choi et al., 2001, Bull. Korean Chem. Soc., 22, 46-52、Bettinger et al., 1999, Bioconjugate Chem., 10, 558-561、Peterson et al., 2002, Bioconjugate Chem., 13, 845-854、Erbacher et al., 1999, Journal of Gene Medicine Preprint, 1, 1-18、Godbey et al., 1999., PNAS USA, 96, 5177-5181、Godbey et al., 1999, Journal of Controlled Release, 60, 149-160、Diebold et al., 1999, Journal of Biological Chemistry, 274, 19087-19094、Thomas and Klibanov, 2002, PNAS USA, 99, 14640-14645、Sagara, 米国特許第6,586,524号および米国特許出願公開第20030077829号参照）と製剤化または複合体化されてもよい。

核酸分子は、膜破壊剤、例えば米国出願公開第20010007666号に記載のものなどと複合体化されてもよい。１または２以上の膜破壊剤と核酸分子とはまた、カチオン性脂質またはヘルパー脂質分子、例えば米国特許第6,235,310号に記載のものなどと複合体化されてもよい。

核酸分子は肺送達、例えば、関連する肺組織への核酸分子の迅速な局所取り込みをもたらす吸入装置または噴霧器によって投与されるエアゾールまたは噴霧乾燥製剤の吸入などによって投与することができる。微粉化された核酸組成物の呼吸可能な乾燥粒子を含む固体粒子組成物は、乾燥または凍結乾燥した核酸組成物を粉砕し、次いで、微粉化された組成物を４００メッシュのスクリーンに通し、大きな集塊を分割または分離することにより調製することができる。本明細書で企図される核酸組成物を含む固体粒子組成物は、任意に、エアゾールの形成を容易にするのに役立つ分散剤、ならびに、他の治療化合物を含んでもよい。好適な分散剤はラクトースであり、それは任意の好適な比率、例えば１対１の重量比で、核酸化合物と混合することができる。

液体粒子のエアゾールは、本明細書に開示される核酸分子を含んでもよく、任意の好適な手段、例えば噴霧器（例えば米国特許第4,501,729号参照）などにより製造することができる。噴霧器は、圧縮ガス、典型的には空気または酸素の、狭いベンチュリ開口を介した加速か、または超音波撹拌により、活性成分の溶液または懸濁液を治療的なエアゾールに変換する市販の装置である。噴霧器に用いられる好適な製剤は、活性成分を、製剤の４０％ｗ/ｗまでの量、好ましくは２０％ｗ/ｗ未満の量で液体担体に含む。担体は、典型的には、水または希釈アルコール水溶液であり、好ましくは、例えば塩化ナトリウムまたは他の好適な塩の添加によって体液と等張にされる。任意の添加剤は、製剤が無菌で調製されない場合は防腐剤、例えば、ヒドロキシ安息香酸メチル、抗酸化剤、香味料、揮発油、緩衝剤および乳化剤および他の製剤界面活性剤を含む。活性組成物と界面活性剤とを含む固体粒子のエアゾールは、任意の固体粒子エアゾール発生器で同様に製造することができる。対象に固体粒子治療剤を投与するためのエアゾール発生器は、上記で説明したとおり、吸入可能な粒子を産生し、ヒトへの投与に好適な速度で、治療組成物の予め定められた計量された用量を含むエアゾールの量を生成する。固体粒子エアゾール発生器の１つの例示的な種類は、吸入器（insufflator）である。吸入法による投与のための好適な製剤は、吸入器で送達することができる、微細に粉砕された粉末を含む。吸入器内で、粉末、例えば本明細書に記載の処置を実行するのに有効なその計量された用量は、カプセルまたはカートリッジ（典型的にはゼラチンまたはプラスチック製）に含まれ、それはin situで穿刺されるか開放され、粉末は、吸入により装置を介して吸い込まれる空気によって、または手動ポンプによって送達される。吸入器で使用される粉末は、単に活性成分のみか、または、活性成分、好適な粉末希釈剤、例えばラクトースおよび任意に界面活性剤を含む粉末混合物からなる。活性成分は、典型的には、製剤の０．１〜１００ｗ／ｗを含む。エアゾール発生器の第２の例示的な種類は、定量式インヘラー（inhaler）を含む。定量式インヘラーは、加圧式エアゾールディスペンサーであり、典型的には、液化噴射剤中の活性成分の懸濁液または溶液製剤を含む。使用の間、これらのデバイスは、計量された容量を送達し、活性成分を含む微粒子スプレーを生成するよう構成されたバルブを介して製剤を放出する。好適な噴射剤は、一部のクロロフルオロカーボン化合物、例えば、ジクロロジフルオロメタン、トリクロロフルオロメタン、ジクロロテトラフルオロエタンおよびこれらの混合物を含む。製剤は、１種または２種以上の共溶媒、例えば、エチルアルコール、乳化剤および他の製剤界面活性剤、例えば、オレイン酸またはトリオレイン酸ソルビタン、抗酸化剤および好適な香料をさらに含むことができる。肺送達のための他の方法は、例えば、米国特許出願第20040037780号および米国特許第6,592,904号、第6,582,728号、第6,565,885号に記載されている。ＰＣＴ特許公開WO2008/132723は、概してオリゴヌクレオチドの、そして特にｓｉＲＮＡの呼吸器系へのエアゾール送達を開示する。

核酸分子は、中枢神経系（ＣＮＳ）または末梢神経系（ＰＮＳ）に投与することができる。実験は、in vivoでのニューロンによる核酸の効果的な取り込みを証明した。例えば、Sommer et al., 1998, Antisense Nuc. Acid Drug Dev., 8, 75、Epa et al., 2000, Antisense Nuc. Acid Drug Dev., 10, 469、Broaddus et al., 1998, J. Neurosurg., 88(4), 734、Karle et al., 1997, Eur. J. Pharmocol., 340(2/3), 153、Bannai et al., 1998, Brain Research, 784(1,2), 304、Rajakumar et al., 1997, Synapse, 26(3), 199、Wu-pong et al., 1999, BioPharm, 12(1), 32、Bannai et al., 1998, Brain Res. Protoc., 3(1), 83、and Simantov et al., 1996, Neuroscience, 74(1), 39を参照のこと。核酸分子は、したがって、ＣＮＳおよび／またはＰＮＳにおける細胞への送達およびこれらの細胞による取り込みに適している。

ＣＮＳへの核酸分子の送達は、種々の異なる戦略によって提供される。用いることができるＣＮＳ送達の伝統的なアプローチは、限定されずに、クモ膜下および脳室内投与、カテーテルおよびポンプの移植、損傷部位または病変部位への直接注射または灌流、脳動脈系への注射、または血液脳関門の化学的または浸透圧的開放を含む。他のアプローチは、種々の輸送および担体システムの使用、例えば、コンジュゲートおよび生分解性ポリマーの使用を介するものを含んでもよい。さらに、ＣＮＳで核酸分子を発現させるために、遺伝子治療アプローチ、例えば、Kaplitt et al.、米国特許第6,180,613号およびDavidson、WO 04/013280に記載のものを用いることができる。

送達システムは、例えば、水性および非水性のゲル、クリーム、複エマルション、マイクロエマルション、リポソーム、軟膏、水性および非水性の溶液、ローション、エアゾール、炭化水素基剤およびパウダーなどを含んでもよく、賦形剤、例えば可溶化剤、浸透促進剤（例えば脂肪酸、脂肪酸エステル、脂肪族アルコールおよびアミノ酸など）および親水性ポリマー（例えばポリカルボフィルおよびポリビニルピロリドンなど）を含むことができる。一態様において、薬学的に許容し得る担体は、リポソームまたは経皮促進剤である。用いることができるリポソームの例は、以下を含む：（１）CellFectin（カチオン性脂質Ｎ，ＮＩ，ＮＩＩ，ＮＩＩＩ−テトラメチル−Ｎ，ＮＩ，ＮＩＩ，ＮＩＩＩ−テトラパルミチルスペルミンとジオレイルホスファチジルエタノールアミン（ＤＯＰＥ）との１：１．５（Ｍ／Ｍ）のリポソーム製剤（GIBCO BRL）、（２）Cytofectin GSV、カチオン性脂質とＤＯＰＥとの２：１（Ｍ／Ｍ）のリポソーム製剤（Glen Research）、（３）ＤＯＴＡＰ（Ｎ−［１（２，３−ジオレオイルオキシ）−Ｎ，Ｎ，Ｎ−トリメチルアンモニウムサルフェート（Boehringer Manheim）および（４）Lipofectamine、ポリカチオン性脂質ＤＯＳＰＡ、中性脂質ＤＯＰＥとジアルキル化アミノ酸（ＤｉＬＡ２）との３：１（Ｍ／Ｍ）リポソーム製剤（GIBCO BRL）。

送達システムは、パッチ、錠剤、坐薬、ペッサリー、ゲルおよびクリームを含んでもよく、賦形剤、例えば可溶化剤および促進剤（例えばプロピレングリコール、胆汁酸塩およびアミノ酸など）、および他のビヒクル（例えば、ポリエチレングリコール、脂肪酸エステルおよび誘導体、および親水性ポリマー、例えばヒドロキシプロピルメチルセルロースおよびヒアルロン酸など）を含むことができる。

核酸分子は、ポリエチレンイミン（例えば、直鎖または分枝ＰＥＩ）、および／または、例えば、グラフトＰＥＩ、例えば、ガラクトースＰＥＩ、コレステロールＰＥＩ、抗体誘導体化ＰＥＩ、およびこれらのポリエチレングリコールＰＥＩ（ＰＥＧ−ＰＥＩ）誘導体を含む、ポリエチレンイミン誘導体（例えば、Ogris et al., 2001, AAPA PharmSci, 3, 1-11、Furgeson et al., 2003, Bioconjugate Chem., 14, 840-847、Kunath et al., 2002, Pharmaceutical Research, 19, 810-817、Choi et al., 2001, Bull. Korean Chem. Soc., 22, 46-52、Bettinger et al., 1999, Bioconjugate Chem., 10, 558-561、Peterson et al., 2002, Bioconjugate Chem., 13, 845-854、Erbacher et al., 1999, Journal of Gene Medicine Preprint, 1, 1-18、Godbey et al., 1999., PNAS USA, 96, 5177-5181、Godbey et al., 1999, Journal of Controlled Release, 60, 149-160、Diebold et al., 1999, Journal of Biological Chemistry, 274, 19087-19094、Thomas and Klibanov, 2002, PNAS USA, 99, 14640-14645およびSagara, 米国特許第6,586,524号参照）と製剤化または複合体化されてもよい。

核酸分子は、バイオコンジュゲート、例えばVargeese et al.、米国出願第10/427,160号、米国特許第6,528,631号、米国特許第6,335,434号、米国特許第6,235,886号、米国特許第6,153,737号、米国特許第5,214,136号、米国特許第5,138,045号などに記載の核酸コンジュゲートを含んでもよい。

本明細書に開示される組成物、方法およびキットは、本明細書で提供される少なくとも１個の核酸分子を、該核酸分子の発現を可能にする様式でコードする核酸配列を含む発現ベクターを含んでもよい。核酸分子またはｄｓＲＮＡの鎖を発現することができる１個または２個以上のベクターを細胞の環境に導入する方法は、細胞の種類およびその環境の構成に依存する。核酸分子またはベクター構築物は、細胞の内部に（すなわち、細胞内に）、直接導入しても、または生体の空洞内、間質腔内、循環中に、細胞外導入しても、経口的に導入しても、または、生体または細胞をｄｓＲＮＡを含む溶液に浸すことによって導入してもよい。細胞は、好ましくは哺乳動物細胞であり、より好ましくはヒト細胞である。発現ベクターの核酸分子は、センス領域とアンチセンス領域とを含むことができる。アンチセンス領域は、ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２をコードするＲＮＡまたはＤＮＡの配列に相補的な配列を含んでもよく、センス領域はアンチセンス領域に相補的な配列を含んでもよい。核酸分子は、相補的なセンスおよびアンチセンス領域を有する２本の異なった鎖を含んでもよい。核酸分子は、相補的なセンスおよびアンチセンス領域を有する単一の鎖を含んでもよい。

標的ＲＮＡ分子と相互作用し、標的ＲＮＡ分子（例えば、本明細書に記載のＧｅｎｂａｎｋアクセッション番号によって示される標的ＲＮＡ分子）をコードする遺伝子を下方調節する核酸分子は、ＤＮＡまたはＲＮＡベクターに挿入された転写単位から発現させてもよい。組換えベクターは、ＤＮＡプラスミドまたはウイルスベクターであってもよい。核酸分子を発現するウイルスベクターは、限定されずに、アデノ随伴ウイルス、レトロウイルス、アデノウイルスまたはアルファウイルスをベースに構築することができる。核酸分子を発現させることができる組換えベクターは本明細書に記載のとおりに送達され、標的細胞内に存続することができる。あるいは、ウイルスベクターは、核酸分子の一過性発現をもたらすことに用いることができる。かかるベクターは、必要に応じて繰り返し投与することができる。核酸分子は、ひとたび発現されると、結合し、遺伝子機能または発現をＲＮＡ干渉（ＲＮＡｉ）を介して下方調節する。核酸分子を発現するベクターの送達は、全身性であってもよく、これは例えば静脈内もしくは筋肉内投与によるもの、対象から外植した標的細胞への投与と、その後の対象への再導入によるもの、または、所望の標的細胞への導入を可能にする他のあらゆる手段によるものであってもよい。

発現ベクターは、少なくとも１個の本明細書に開示される核酸分子をコードする核酸配列を、該核酸分子の発現を可能にする様式で含んでもよい。例えば、ベクターは、二重鎖を含む核酸分子の両方の鎖をコードする１または２以上の配列を含んでもよい。ベクターはまた、自己相補的で、したがって核酸分子を形成する単一の核酸分子をコードする１または２以上の配列を含んでもよい。かかる発現ベクターの非限定例は、Paul et al., 2002, Nature Biotechnology, 19, 505、Miyagishi and Taira, 2002, Nature Biotechnology, 19, 497、Lee et al., 2002, Nature Biotechnology, 19, 500、およびNovina et al., 2002, Nature Medicine,オンライン先行発表doi:10.1038/nm725に記載されている。発現ベクターはまた、哺乳動物（例えば、ヒト）の細胞に含まれていてもよい。

発現ベクターは、同じであっても異なっていてもよい、２個または３個以上核酸分子をコードする核酸配列を含んでもよい。発現ベクターは、Genbankアクセッション番号NM_003254（ＴＩＭＰ１）またはNM_003255（ＴＩＭＰ２）で示される核酸分子に相補的な核酸分子に関する配列を含んでもよい。

発現ベクターは、核酸二重鎖の一方または両方の鎖、または自己ハイブリダイゼーションして核酸二重鎖となる単一の自己相補鎖をコードしてもよい。核酸分子をコードする核酸配列は、核酸分子の発現を可能にする様式で作動的に連結することができる（例えばPaul et al., 2002, Nature Biotechnology, 19, 505、Miyagishi and Taira, 2002, Nature Biotechnology, 19, 497、Lee et al., 2002, Nature Biotechnology, 19, 500、およびNovina et al., 2002, Nature Medicine,オンライン先行発表doi:10.1038/nm725参照）。

発現ベクターは、以下の１個または２個以上：ａ）転写開始領域（例えば真核生物ｐｏｌＩ、ＩＩまたはＩＩＩ開始領域）、ｂ）転写終止領域（例えば真核生物ｐｏｌＩ、ＩＩまたはＩＩＩ終止領域）、ｃ）イントロン、およびｄ）核酸分子の少なくとも１個をコードする核酸配列、を含んでもよく、ここで、該配列は、核酸分子の発現および／または送達を可能にする様式で、開始領域および終止領域に作動的に連結している。ベクターは、核酸分子をコードする配列の５’側または３’側に作動的に連結した、タンパク質のためのオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）、および／またはイントロン（介在配列）を任意に含んでもよい。

核酸分子配列の転写は、真核生物ＲＮＡポリメラーゼＩ（ｐｏｌＩ）、ＲＮＡポリメラーゼＩＩ（ｐｏｌＩＩ）またはＲＮＡポリメラーゼＩＩＩ（ｐｏｌＩＩＩ）のためのプロモーターから開始されてもよい。ｐｏｌＩＩまたはｐｏｌＩＩＩプロモーターからの転写物は、全ての細胞において高レベルで発現される。所定の細胞種における所定のｐｏｌＩＩプロモーターのレベルは、近くに存在する遺伝子調節配列（エンハンサー、サイレンサーなど）の性質に依存する。原核生物ＲＮＡポリメラーゼ酵素が適切な細胞で発現されているという条件で、原核生物ＲＮＡポリメラーゼプロモーターも用いられる（Elroy-Stein and Moss, 1990, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 87, 6743-7、Gao and Huang 1993, Nucleic Acids Res., 21, 2867-72、Lieber et al., 1993, Methods Enzymol., 217, 47-66、Zhou et al., 1990, Mol. Cell. Biol., 10, 4529-37）。複数の研究者は、かかるプロモーターから発現される核酸分子が、哺乳動物細胞において機能し得ることを証明した（例えば、Kashani-Sabet et al., 1992, Antisense Res. Dev., 2, 3-15、Ojwang et al., 1992, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89, 10802-6、Chen et al., 1992, Nucleic Acids Res., 20, 4581-9、Yu et al., 1993, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90, 6340-4、L'Huillier et al., 1992, EMBO J., 11, 4411-8、Lisziewicz et al., 1993, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A, 90, 8000-4、Thompson et al., 1995, Nucleic Acids Res., 23, 2259、Sullenger & Cech, 1993, Science, 262, 1566）。より詳細には、転写単位、例えば、Ｕ６低分子核（ｓｎＲＮＡ）、転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）およびアデノウイルスＶＡＲＮＡをコードする遺伝子に由来するものなどが、高濃度の所望のＲＮＡ分子、例えばｓｉＮＡなどを細胞内で生成するのに有用である（上記Thompson et al.、上記Couture and Stinchcomb, 1996、Noonberg et al., 1994, Nucleic Acid Res., 22, 2830、Noonberg et al., U.S. Pat. No. 5,624,803、Good et al., 1997, Gene Ther., 4, 45、Beigelman et al.、ＰＣＴ国際公開WO 96/18736）。上記の核酸転写単位は、限定されずに、プラスミドＤＮＡベクター、ウイルスＤＮＡベクター（例えばアデノウイルスまたはアデノ随伴ウイルスベクター）またはウイルスＲＮＡベクター（例えばレトロウイルスまたはアルファウイルスベクター）などを含む、哺乳動物細胞への導入のための様々なベクターに組み込むことができる（上記Couture and Stinchcomb, 1996参照）。

核酸分子は、細胞内で、真核生物プロモーター（例えば、Izant and Weintraub, 1985, Science, 229, 345、McGarry and Lindquist, 1986, Proc. Natl. Acad. Sci., USA 83, 399、Scanlon et al., 1991, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 88, 10591-5、Kashani-Sabet et al., 1992, Antisense Res. Dev., 2, 3-15、Dropulic et al., 1992, J. Virol., 66, 1432-41、Weerasinghe et al., 1991, J. Virol., 65, 5531-4、Ojwang et al., 1992, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89, 10802-6、Chen et al., 1992, Nucleic Acids Res., 20, 4581-9、Sarver et al., 1990 Science, 247, 1222-1225、Thompson et al., 1995, Nucleic Acids Res., 23, 2259、Good et al., 1997, Gene Therapy, 4, 45）から発現させることができる。当業者は、あらゆる核酸を、適切なＤＮＡ／ＲＮＡベクターから真核細胞において発現させ得ることを理解する。かかる核酸の活性は、酵素核酸による一次転写産物からのその放出によって増大させることができる（Draper et al., PCT WO 93/23569、およびSullivan et al., PCT WO 94/02595、Ohkawa et al., 1992, Nucleic Acids Symp. Ser., 27, 15-6、Taira et al., 1991, Nucleic Acids Res., 19, 5125-30、Ventura et al., 1993, Nucleic Acids Res., 21, 3249-55、Chowrira et al., 1994, J. Biol. Chem., 269, 25856）。

ウイルス粒子にパッケージされたウイルス構築物は、細胞への発現構築物の効果的な導入と発現構築物がコードするｄｓＲＮＡ構築物の転写の両方を達成する。

経口的な導入のための方法は、ＲＮＡと生物の食物との直接の混合、ならびに、食物として用いられる種をＲＮＡを発現するように操作し、次いで、影響を受ける生物に与える、遺伝子工学的アプローチを含む。細胞に核酸分子溶液を導入するために物理的な方法を使用してもよい。核酸を導入する物理的な方法は、核酸分子を含む溶液の注射、核酸分子で被覆した粒子による衝撃、細胞または生物のＲＮＡの溶液への浸漬、または核酸分子の存在下における細胞膜のエレクトロポレーションを含む。

核酸を細胞に導入するための当該技術分野で既知の他の方法、例えば、脂質媒介性担体輸送、化学物質媒介性輸送、例えばリン酸カルシウムなどを用いてもよい。したがって、核酸分子は、以下の活性の１または２以上を有する成分と共に導入されてもよい：細胞によるＲＮＡの取り込みを強化する、二重鎖のアニーリングを促進する、アニールした鎖を安定させる、または別の方法で標的遺伝子の阻害を増大させる。

核酸分子またはベクター構築物は、好適な製剤を用いて細胞に導入することができる。１つの製剤は、脂質製剤、例えばLipofectamine^TM 2000（Invitrogen, CA, USA）、ビタミンＡ結合リポソーム（Sato et al. Nat Biotechnol 2008; 26:431-442、PCT特許公開WO 2006/068232）などを含む。脂質製剤はまた、静脈内、筋肉内もしくは腹膜内注射によって、または経口的に、または吸入もしくは当該技術分野において既知の方法などによって、動物に投与することができる。製剤が、動物、例えば、哺乳動物、そしてより具体的にはヒトへの投与に適している場合、製剤はまた、薬学的に許容し得る。オリゴヌクレオチドを投与するための薬学的に許容し得る製剤は知られており、用いることができる。場合によって、ｄｓＲＮＡを緩衝液または食塩水で製剤化し、製剤化されたｄｓＲＮＡを、卵母細胞による研究におけるように、直接細胞に注射することが好ましいことがある。ｄｓＲＮＡ二重鎖の直接注射を行ってもよい。ｄｓＲＮＡを導入する好適な方法については、参照によって本明細書に援用する米国特許出願公開第2004/0203145号、第20070265220号を参照のこと。

ポリマーナノカプセルまたはマイクロカプセルは、封入された、または、結合したｄｓＲＮＡの細胞内への輸送および放出を促進する。これらは、ポリマー材料およびモノマー材料を含み、特にポリブチルシアノアクリレートを含む。材料および作製方法の概要は公開されている（Kreuter, 1991参照）。モノマーおよび／またはオリゴマー前駆体から、重合／ナノ粒子生成ステップにおいて形成されるポリマー材料は、先行技術から自体公知であり、これは、ナノ粒子作製の分野における当業者が、通常の能力に従って好適に選択することができるポリマー材料の分子量および分子量分布と同様である。

核酸分子は、マイクロエマルションとして製剤化してもよい。マイクロエマルションは、光学的に等方な、熱力学的に安定した単一の溶液である、水、油および両親媒性物質の系である。マイクロエマルションは、典型的には、最初に水性界面活性剤溶液に油を分散させ、次いで十分量の第４の成分、一般に中間的な鎖長のアルコールを添加し、透明な系を形成させることによって調製する。

マイクロエマルションの調製に用いることができる界面活性剤は、限定されずに、単独のまたは共界面活性と組み合わされた、剤イオン性界面活性剤、非イオン性界面活性剤、Brij 96、ポリオキシエチレンオレイルエーテル、ポリグリセリン脂肪酸エステル、テトラグリセリンモノラウレート（ＭＬ３１０）、テトラグリセリンモノオレエート（ＭＯ３１０）、ヘキサグリセリンモノオレエート（ＰＯ３１０）、ヘキサグリセリンペンタオレエート（ＰＯ５００）、デカグリセリンモノカプレート（ＭＣＡ７５０）、デカグリセリンモノオレエート（ＭＯ７５０）、デカグリセリンセキオレエート（ＳＯ７５０）、デカグリセリンデカオレエート（ＤＡ０７５０）を含む。共活性剤は、普通は短鎖アルコール、例えばエタノール、１−プロパノールおよび１−ブタノールなどであり、界面活性剤膜に侵入し、その結果、界面活性剤分子の間に生じる隙間により無秩序な膜を生成することによって、界面流動性を増大させるのに役立つ。

水溶性架橋ポリマー
送達製剤は、１または２以上の分解性架橋脂質部分、１または２以上のＰＥＩ部分、および／または１または２以上のｍＰＥＧ（ＰＥＧのジメチルエーテル誘導体（メトキシポリ（エチレングリコール））を含む、水溶性分解性架橋ポリマーを含んでもよい。

分解性脂質部分は、好ましくは、以下の構造モチーフを有する化合物を含む：

上記式において、エステル結合は生分解性基であり、Ｒは比較的疎水性の「脂肪（lipo）」基を表し、示した構造モチーフはｍ回現れ、ここでｍは約１〜約３０の範囲にある。例えば、特定の態様において、ＲはＣ２〜Ｃ５０アルキル、Ｃ２〜Ｃ５０ヘテロアルキル、Ｃ２〜Ｃ５０がアルケニル、Ｃ２〜Ｃ５０ヘテロアルケニル、Ｃ５〜Ｃ５０アリール、Ｃ２〜Ｃ５０ヘテロアリール、Ｃ２〜Ｃ５０アルキニル、Ｃ２〜Ｃ５０ヘテロアルキニル、Ｃ２〜Ｃ５０カルボキシアルケニルおよびＣ２〜Ｃ５０カルボキシヘテロアルケニルからなる群から選択される。好ましい態様において、Ｒは、４〜３０個の炭素、より好ましくは８〜２４個の炭素を有する飽和もしくは不飽和アルキル、またはステロール、好ましくはコレステリル部分である。好ましい態様において、Ｒは、オレイン酸部分、ラウリン酸部分、ミリスチン酸部分、パルミチン酸部分、マルガリン酸部分、ステアリン酸部分、アラキドン酸部分、ベヘン酸部分、またはリグノセリン酸部分である。最も好ましい態様において、Ｒはオレイン酸部分である。

式（Ｂ）のＮは、電子対または水素原子への結合を有してもよい。Ｎが電子対を有する場合、繰返し単位は低ｐＨでカチオン性たり得る。

分解性架橋脂質部分は、下記のスキームＡに示すように、ポリエチレンイミン（ＰＥＩ）と反応させることができる：

式（Ａ）において、Ｒは上記と同じ意味を有する。ＰＥＩは、式（Ｂ）の繰返し単位を含んでもよく、式中ｘは約１〜約１００の範囲の整数であり、ｙは約１〜約１００の範囲の整数である。

スキームＡで例示される反応は、ＰＥＩとジアクリレート（Ｉ）とを、相互溶媒、例えばエチルアルコール、メタノールまたはジクロロメタン中、撹拌しながら、好ましくは室温で数時間混合し、次いで溶媒を蒸発させ、結果として生じるポリマーを回収することにより行うことができる。いかなる特定の理論に束縛されることを望むものではないが、ＰＥＩとジアクリレート（Ｉ）との反応が、ＰＥＩの１個または２個以上のアミンと、ジアクリレートの１個または２個以上の二重結合との間のミカエル反応を伴うと考えられる（J. March, Advanced Organic Chemistry 3rd Ed., pp. 711-712 (1985)参照）。スキームＡに示すジアクリレートは、米国特許出願第11/216,986号（米国公開第2006/0258751号）に記載の手法で調製することができる。

ＰＥＩの分子量は、好ましくは、約２００〜２５，０００ダルトン、より好ましくは、４００〜５，０００ダルトン、より一層好ましくは６００〜２０００ダルトンの範囲にある。ＰＥＩは、分枝状であっても、直鎖状であってもよい。

ＰＥＩのジアクリレートに対するモル比は、好ましくは約１：２〜約１：２０の範囲にある。カチオン性リポポリマーの重量平均分子量は、約５００ダルトン〜約１，０００，０００ダルトンの範囲、好ましくは約２，０００ダルトン〜約２００，０００ダルトンの範囲にあってもよい。分子量は、ＰＥＧ標準物質を用いたサイズ排除クロマトグラフィーにより、またはアガロースゲル電気泳動により測定することができる。

カチオン性リポポリマーは、好ましくは分解性であり、より好ましくは生分解性であり、例えば、加水分解、酵素的切断、還元、光切断およびソニケーションからなる群から選択されるメカニズムで分解可能である。いかなる特定の理論に束縛されることを望むものではないが、細胞内での式（ＩＩ）のカチオン性リポポリマーの分解はエステル結合の酵素的切断および／または加水分解によって進行すると考えられる。

合成は、上記のとおり、分解性脂質部分とＰＥＩ部分とを反応させることによって行うことができる。次いで、（ＰＥＧのジメチルエーテル誘導体（メトキシポリ（エチレングリコール））を添加し、分解性架橋ポリマーを形成する。好ましい態様において、反応は室温で行われる。反応生成物は、クロマトグラフィーの技術を含む、当該技術分野において既知の任意の手段で単離することができる。好ましい態様において、反応生成物は、沈殿と、その後の遠心分離によって取り出すことができる。

投与量
投与すべき有用な投与量および具体的な投与方法は、当業者に直ちに明らかであるように、細胞種、または、in vivoでの使用については、年齢、体重、および処置する動物およびその領域、使用する具体的な核酸と送達方法、考慮される治療的もしくは診断的用途、および製剤の剤形（例えば、懸濁剤、エマルション、ミセルもしくはリポソーム）などの要因に応じて異なる。典型的には、投薬量はより低いレベルで投与され、所望の効果が達成されるまで増量する。

核酸を送達するのに脂質を用いる場合、投与する脂質化合物の量は異なってもよく、一般に、投与する核酸の量に依存する。例えば、脂質化合物の核酸に対する重量比は、好ましくは約１：１〜約３０：１であり、約５：１〜約１０：１の重量比がより好ましい。

核酸分子の好適な投与単位は、１日あたりレシピエントの体重１キログラムにつき０．００１〜０．２５ミリグラムの範囲、１日あたり体重１キログラムにつき０．０１〜２０マイクログラムの範囲、１日あたり体重１キログラムにつき０．０１〜１０マイクログラムの範囲、１日あたり体重１キログラムにつき０．１０〜５マイクログラムの範囲、または１日あたり体重１キログラムにつき０．１〜２．５マイクログラムの範囲にあってもよい。

好適な量の核酸分子を導入することができ、これらの量は、標準的な方法を用いて実験的に決定することができる。細胞の環境における個々の核酸分子種の有効濃度は、約１フェムトモル、約５０フェムトモル、１００フェムトモル、１ピコモル、１．５ピコモル、２．５ピコモル、５ピコモル、１０ピコモル、２５ピコモル、５０ピコモル、１００ピコモル、５００ピコモル、１ナノモル、２．５ナノモル、５ナノモル、１０ナノモル、２５ナノモル、５０ナノモル、１００ナノモル、５００ナノモル、１マイクロモル、２．５マイクロモル、５マイクロモル、１０マイクロモル、１００マイクロモルであっても、またはそれを上回ってもよい。

投与量は、体重１ｋｇあたり０．０１μｇ〜１ｇであってもよい（例えば、１ｋｇあたり０．１μｇ、０．２５μｇ、０．５μｇ、０．７５μｇ、１μｇ、２．５μｇ、５μｇ、１０μｇ、２５μｇ、５０μｇ、１００μｇ、２５０μｇ、５００μｇ、１ｍｇ、２．５ｍｇ、５ｍｇ、１０ｍｇ、２５ｍｇ、５０ｍｇ、１００ｍｇ、２５０ｍｇまたは５００ｍｇ）。

１日あたり体重１キログラムにつき約０．１ｍｇ〜約１４０ｍｇ程度の投与量レベルは、上記状態の処置に有用である（１日あたり１対象につき約０．５ｍｇ〜約７ｇ）。単一の投薬形態を生成するために担体材料と組み合わせることができる活性成分の量は、処置される宿主と、具体的な投与方法によって異なる。投薬単位形態は、一般的に、約１ｍｇ〜約５００ｍｇの活性成分を含む。

任意の特定の対象のための具体的な用量レベルは、使用する具体的な化合物の活性、年齢、体重、一般健康状態、性別、食事、投与、投与時間、投与経路、および排出速度、併用薬剤および治療を受けている特定の疾患の重篤度を含む種々の要因に依存することが理解される。

本明細書に開示される核酸分子を含む医薬組成物は、１日１回、ｑｉｄ、ｔｉｄ、ｂｉｄ、ＱＤ、または、医学的に適切な任意の間隔で、任意の期間投与することができる。しかし、治療剤はまた、１日を通して適切な間隔で投与される、２、３、４、５、６または７以上の下位用量を含む投薬単位で投薬することもできる。その場合、各々の下位用量に含まれる核酸分子は、１日の合計投薬単位を達成するために、対応してより少なくてもよい。投薬単位はまた、例えば、数日間にわたってｄｓＲＮＡの持続的な一定の放出をもたらす従来の徐放製剤を用いて、数日にわたる単一の用量のために組み合わせる（compound）ことができる。徐放製剤は当該技術分野において周知である。投薬単位は、対応する複数の一日量を含んでもよい。組成物は、核酸の複数の単位の合計が一緒になって十分な用量を含むように、組み合わせることができる。

医薬組成物、キットおよび容器
また提供されるのは、本明細書において提供されるＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２の発現を低減するための核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）を含む、該核酸分子を患者に投与または分配するための組成物、キット、容器および製剤である。キットは、少なくとも１個の容器と少なくとも１枚のラベルとを含んでもよい。好適な容器は、例えば、ボトル、バイアル、シリンジ、および試験管を含む。容器は、種々の材料、例えばガラス、金属またはプラスチックから形成されていてもよい。容器は、１または２以上のアミノ酸配列、１または２以上の小分子、１または２以上の核酸配列、１または２以上の細胞集団および／または１または２以上の抗体を保持していてもよい。一態様において、容器は、細胞のｍＲＮＡ発現プロファイルを検査するためのポリヌクレオチドを、この目的のために用いる試薬と共に保持する。別の態様において、容器は、細胞および組織におけるＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２タンパク質の発現の評価に用いるための、または関連する実験室用途、予後判定用途、診断用途、予防用途および治療用途のための抗体、その結合断片または特異的結合タンパク質を含む。これらの用途のための指示および／または使用法が、かかる容器上またはかかる容器と共に含まれていてもよい。これらの目的のために用いる試薬および他の組成物またはツールが、同様に含まれていてもよい。キットは、関連する指示および／または使用法をさらに含んでもよく、かかる目的のために用いる試薬および他の組成物またはツールが含まれていてもよい。

容器は、代替的に、状態を処置、診断、予後判定または予防するのに有効な組成物を保持することができ、無菌のアクセスポートを有してもよい（例えば、容器はストッパーを皮下注射針によって穿刺可能な密栓を有する静脈注射用の溶液バッグまたはバイアルであってもよい）。組成物中の活性剤は、ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２に特異的に結合することができる、および／またはＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２の機能を調節することができる核酸分子であってもよい。

キットは、薬学的に許容し得るバッファー、例えばリン酸緩衝食塩水、リンゲル液および／またはブドウ糖溶液などを含む第２の容器をさらに含んでもよい。それは、他のバッファー、希釈液、フィルター、撹拌器、針、注射器および／または、使用適応および／または使用説明を含む添付文書を含む、商業的見地および使用者の見地から望ましい他の材料をさらに含んでもよい。

核酸分子が使用前に包装されている単位投与量アンプルまたは多用量容器は、その薬学的に有効な用量、または複数の有効用量のために適した量のポリヌクレオチドまたはポリヌクレオチドを含む溶液が入った密閉容器を含んでもよい。ポリヌクレオチドは無菌製剤として包装され、密閉容器は使用まで製剤の無菌性を維持するように設計されている。

細胞性免疫応答要素をコードする配列またはその断片を含むポリヌクレオチドを含む容器は、ラベルが付されたパッケージを含んでもよく、ラベルは、政府関係機関、例えば米国食品医薬品局によって定められた形式の通知を有してもよく、その通知は、そこに含まれるポリヌクレオチド材料のヒトへの投与のため製造、使用または販売に関する、前記機関による連邦法上の承認を反映する。

連邦法は、ヒトの治療における医薬組成物の使用について連邦政府の機関の承認を得ることを義務づけている。米国において、執行は食品医薬品局の管轄であり、同局は、かかる承認を保証するために、21 U.S.C.§301〜392に詳述される、適切な規制を設けている。動物の組織から製造される産物を含む生物学的材料のための規制は、42 U.S.C.§301に設けられている。類似した承認が外国のほとんどで必要とされる。規制は国ごとに異なるが、個々の手続は当業者に周知であり、本明細書において提供される組成物および方法は、好ましくはしかるべくそれに従う。

投与される投与量は、処置する対象の状態と大きさ、および、処置の頻度と投与経路に大きく依存する。用量および頻度を含む継続的治療のためのレジメンは、初期の反応および臨床判断によってガイドされてもよい。組織間隙への注射の非経口経路が好ましいが、他の非経口経路、例えばエアゾール製剤の吸入などが、特定の投与、例えば鼻の粘膜、喉、気管支組織または肺への投与において必要とされることがある。

したがって、本明細書において提供されるのは、薬学的に許容し得る注射用担体中の溶液の状態の、細胞性免疫反応要素またはその断片をコードする配列を含み、組織中の間質に導入され、組織の細胞に細胞性免疫反応要素またはその断片を発現させるのに適したポリヌクレオチド、溶液を入れた容器、および、医薬品の製造、使用または販売を規制する政府関係機関によって定められた形式の容器に関連した通知、を含んでもよい医薬製品であり、その通知は、ポリヌクレオチド溶液のヒトへの投与のための製造、使用または販売に関する、前記機関による承認を反映している。

適応症
本明細書に開示される核酸分子は、ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２に関連する疾患、状態または障害、例えば肝線維症、肝硬変、肺線維症、腎線維症、腹膜線維症、慢性肝損傷および原線維形成など、ならびに、細胞または組織におけるＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２のレベルに関係するか、または反応するあらゆる他の疾患または状態を処置するのに用いることができる。したがって、本明細書に開示される組成物、キットおよび方法は、ラベルまたは添付文書を含む、本明細書に開示される核酸分子の包装を含んでもよい。ラベルは、核酸分子の使用法、例えば、肝線維症、腹膜線維症、腎線維症および肺線維症、ならびに、細胞または組織におけるＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２のレベルに関係するか、または反応するあらゆる他の疾患または状態の処置または予防のための使用法を含んでもよい。ラベルは、ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２の発現の低減における使用法を含んでもよい。「添付文書」は、治療用製品の商用パッケージに通例含まれる指示を指すのに用い、それは、適応症、用法、用量、投与、禁忌、包装された製品と併用すべき他の治療用製品および／またはかかる治療用製品の使用に関する警告などに関する情報を含む。

当業者は、２種または３種以上のｓｉＴＩＭＰ１および／またはｓｉＴＩＭＰ２を組み合わせることができること、または、当該技術分野において既知の他の抗線維症処置、薬剤および治療法を、本明細書に記載の核酸分子（例えばｓｉＮＡ分子）と容易に組み合わせることができることを認識し、それゆえに、これらは本明細書において考慮されている。

本明細書において提供される方法および組成物は、以下の非限定例を参照して、以下でより詳細に解説される。

例１
ｓｉＲＮＡ配列
ＴＩＭＰ−１、ＴＩＭＰ−２、陽性対照および陰性対照のためのｓｉＲＮＡ配列を表ＣおよびＤに列挙する。１００μＭのｓｉＲＮＡ原液を、ヌクレアーゼフリー水（Ambion）に溶解することにより調製した。表ＣおよびＤの「配列」欄において、小文字は非修飾リボヌクレオチドを表し、「Ｔ」はデオキシリボチミジンを表す。

例２
ｓｉＲＮＡの送達
ＨＴ−１０８０細胞（Japanese Collection of Research Bioresources）を、１０％のウシ胎児血清（FBS; Hyclone, Cat.# SH30070.03）、１％ｖ／ｖのＬ−グルタミン−ペニシリン−ストレプトマイシン溶液（Sigma, Cat.# G1146）および１％ｖ／ｖのＬ−グルタミン溶液（Sigma, Cat.# G7513）を含むＤＭＥＭ（Sigma, Cat# D6546）中でインキュベートして維持した。ｓｉＲＮＡを送達する前に、細胞を６穴プレート（Nunc. #140675）に、１ウェルあたり５×１０^３個の密度で播種し、２日間、３７℃、７．５％ＣＯ_２でインキュベートした。ＴＩＭＰ１に対するｓｉＲＮＡは、Sato et al.（Sato Y. et al. Nature Biotechnology 2008. Vol.26, p431）により記載されたＶＡ結合リポソーム（ＶＡ−リポソーム）で細胞にトランスフェクトし、ＴＩＭＰ２に対するｓｉＲＮＡは、社内で５：１（ＶＡ−ポリマー：ｓｉＲＮＡ、ｗ／ｗ）の比率で合成したＶＡ結合カチオンポリマー（ＶＡ−ポリマー）で送達した。ｓｉＲＮＡの終濃度は５０ｎＭであった。ｓｉＲＮＡ送達の２時間後に、細胞培養培地を１０％のＦＢＳを含む新しいＤＭＥＭに交換し、２晩、３７℃、７．５％ＣＯ_２でインキュベートした。

例３
ＲＴ−ＰＣＲによるｓｉＲＮＡの遺伝子ノックダウンの評価

例２に記載のトランスフェクションの後、全ＲＮＡを、QIAshreader（QIAGEN, 79654）およびRNeasy Mini Kit（QIAGEN, 74104）により、製造者のプロトコルに従って単離した。単離した全ＲＮＡの１μｇを、Hicapacity RNA-to-cDNA Master Mix（Applied Biosystems, 4390779）による、製造者のプロトコルに従った、ｃＤＮＡの調製に用いた。次いで、０．０５μｇのｃＤＮＡをExTaq（TaKaRa, RR001B）ポリメラーゼによる、提供されたマニュアルに従ったポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＴ）に用いた。各々の遺伝子の検出のためのプライマーは、excelファイルにリストされている。ＰＣＲ条件は以下のとおりであった：９４℃ ４分、次いで４℃ ３０秒、６３℃ ３０秒、７２℃ １分を２３サイクル、終了前に７２℃ ５分。ＴＩＭＰ−１またはＴＩＭＰ−２遺伝子に関する１５μｌのＰＣＲ産物と、５μｌのＧＡＰＤＨ遺伝子に関するＰＣＲ産物とをアガロースゲル電気泳動によって同定した。

図２は、ｑＰＣＲで測定した、ＴＩＭＰ１に対するｓｉＲＮＡのノックダウン効率を示す。ＴＩＭＰ−１ｓｉＲＮＡ、例えばＴＩＭＰ１−Ａ（配列番号５および６）、ＴＩＭＰ１−Ｂ（配列番号７および８）またはＴＩＭＰ１−Ｃ（配列番号９および１０）をトランスフェクトした細胞からのＰＣＲ産物の量は、未処理の細胞からのものより少なかった。したがって、ＴＩＭＰ１遺伝子に対するこれらのｓｉＲＮＡは標的遺伝子をノックダウンすることが可能である。

図３は、ｑＰＣＲで測定した、ＴＩＭＰ２に対するｓｉＲＮＡのノックダウン効率を表す：ＴＩＭＰ２−Ａ（配列番号１１および１２）、ＴＩＭＰ２−Ｂ（配列番号１３および１４）、ＴＩＭＰ２−Ｃ（配列番号１５および１６）、ＴＩＭＰ２−Ｄ（配列番号１７および１８）およびＴＩＭＰ２−Ｅ（配列番号１９および２０）。ＴＩＭＰ２ｓｉＲＮＡは標的遺伝子のノックダウンを示し、遺伝子サイレンシングのレベルは配列に依存していた。

例４
ｓｉＴＩＭＰ１およびｓｉＴＩＭＰ２によるラットにおける肝硬変の処置

肝硬変動物モデル：肝硬変は、Satoら（Sato Y. et al. Nat Biotech 2008. 26:431）により記載された方法を用いてラットに誘発した。簡潔に述べると、肝硬変は、４週齢の雄性ＳＤラットに、ジメチルニトロソアミン（ＤＭＮ）（Wako Chemicals, Japan）を以下のとおりに注射することにより誘発した：リン酸緩衝食塩水（ＰＢＳ）中の０．５％のＤＭＮを、体重あたり２ｍｌ／ｋｇの用量で、毎週３日連続してラットに腹膜内投与した。具体的には、ＤＭＮ溶液は、第０（実験の開始）、２、４、７、９、１１、１４、１６、１８、２１、２３、２５、２８、３０、３２、３４および３６日に注射した。

ＴＩＭＰ１に対するｓｉＲＮＡ配列（「ｓｉＴＩＭＰ１−Ａ」）
Ｓ（５’−＞３’）ｃｃａｃｃｕｕａｕａｃｃａｇｃｇｕｕａＴＴ（配列番号５）
ＡＳ（３’−＞５’）ＴＴｇｇｕｇｇａａｕａｕｇｇｕｃｇｃａａｕ（配列番号６）

ＴＩＭＰ２に対するｓｉＲＮＡ配列（「ｓｉＴＩＭＰ２−Ｃ」）
Ｓ（５’−＞３’）ｇｃａｇａｕａａａｇａｕｇｕｕｃａａａＴＴ（配列番号１５）
ＡＳ（３’−＞５’）ＴＴｃｇｕｃｕａｕｕｕｃｕａｃａａｇｕｕｕ（配列番号１６）

１０μｇ／μｌのｓｉＲＮＡ原液を、ｓｉＲＮＡ二重鎖（ｓｉＴＩＭＰ１またはｓｉＴＩＭＰ２）をヌクレアーゼフリー水（Ambion）に溶解することにより調製した。ラットの処置のために、ｓｉＲＮＡをSatoら（Sato Y. et al. Nat Biotech 2008. 26:431）により記載されたビタミンＡ結合リポソームで製剤化した。ビタミンＡ（ＶＡ）−リポソーム−ｓｉＲＮＡ製剤は、５％グルコース溶液中の、０．３３μｍｏｌ／ｍｌのＶＡ、０．３３μｍｏｌ／ｍｌのリポソーム（Coatsome EL-01-D, NOF Corporation）および０．５μｇ／μｌのｓｉＲＮＡで構成されていた。

０．７５ｍｇ／ｋｇの濃度で送達されるｓｉＲＮＡの注射溶液

リポソームはヌクレアーゼフリー水の添加によって１ｍＭの濃度に調製し、使用の前に室温で１５分間放置した。ＶＡ結合リポソームを調製するために、１００ｎｍｏｌのビタミンＡ（ＤＭＳＯに溶解）とリポソーム（１００ｎｍｏｌ）とを、室温で１５秒間ボルテックスで混合した。

ｓｉＲＮＡ二重鎖（１５０μｇ）は、ヌクレアーゼフリー水の添加によって、１０μｇ／μｌの濃度に調製した。５％グルコース（１７５μｌ）溶液を、リポソーム懸濁液に添加した（３００μｌの総体積）。ＶＡ−リポソーム−ｓｉＲＮＡ溶液は、０．７５ｍｌ／ｋｇ体重の終濃度で、各々のラットに注射した。

１．５ｍｇ／ｋｇの濃度で送達されるｓｉＲＮＡの注射溶液

リポソームはヌクレアーゼフリー水の添加によって１ｍＭの濃度に調製し、使用の前に１５分間放置した。ＶＡ結合リポソームを調製するために、２００ｎｍｏｌのビタミンＡ（ＤＭＳＯに溶解）とリポソーム（２００ｎｍｏｌ）とを、室温で１５秒間ボルテックスで混合した。

ｓｉＲＮＡ二重鎖（３００μｇ）は、ヌクレアーゼフリー水の添加によって、１０μｇ／μｌの濃度に調製した。５％グルコース（５０μｌ）溶液を、リポソーム懸濁液に添加した（３００μｌの総体積）。ＶＡ−リポソーム−ｓｉＲＮＡ溶液は、１．５ｍｌ／ｋｇ体重の終濃度で、各々のラットに注射した。

ｓｉＲＮＡ処置

ｓｉＲＮＡ処置は、第２８日から５回静脈内注射によって行った。詳細には、ラットをＤＭＮ処置後の第２８、３０、３２、３４および３６日にｓｉＲＮＡで処置した。ラットは、第３８または３９日に致死させた。２つの異なるｓｉＲＮＡ種（ｓｉＴＩＭＰ１−ＡおよびｓｉＴＩＭＰ２−Ｃ）および２つの異なる用量（体重ｋｇあたり０．７５ｍｇのｓｉＲＮＡ、体重ｋｇあたり１．５ｍｇのｓｉＲＮＡ）を試験した。試験群の詳細および各群の動物数は、以下のとおりである：
１）対照動物：肝硬変をＤＭＮ注射により誘発し、５％グルコースを投与（ｎ＝９）
２）ＶＡ−Ｌｉｐ−ｓｉＴＩＭＰ１−Ａ０．７５ｍｇ／ｋｇ（ｎ＝９）
３）ＶＡ−Ｌｉｐ−ｓｉＴＩＭＰ１−Ａ１．５ｍｇ／ｋｇ（ｎ＝９）
４）ＶＡ−Ｌｉｐ−ｓｉＴＩＭＰ２−Ｃ０．７５ｍｇ／ｋｇ（ｎ＝９）
５）ＶＡ−Ｌｉｐ−ｓｉＴＩＭＰ２−Ｃ１．５ｍｇ／ｋｇ（ｎ＝９）
６）Ｓｈａｍ（ＤＭＮの代わりにＰＢＳを注射。ｓｉＲＮＡの代わりに５％グルコースを投与）（ｎ＝５）
７）無処置対照動物（インタクト）（ｎ＝５）

治療効果の評価

第３８日に、「ｓｉＴＩＭＰ２−Ｃ」群の１０頭のうち２頭が死亡し、さらに分析しなかった。しかしながら、他の動物は致死させるまで生存した。ラットを致死させた後、肝組織を１０％ホルマリンで固定した。肝左葉を組織スライド調製のためにパラフィンに包埋した。組織スライドは、シリウスレッドならびにヘマトキシリン−エオジン（ＨＥ）で染色した。シリウスレッド染色は、コラーゲン沈着領域を視覚化し、肝硬変のレベルを測定するために用いた。ＨＥ染色は、対比染色として核および細胞質のために用いた。各スライドは顕微鏡（BZ-9000, Keyence Corp. Japan）下で観察し、スライドあたりのシリウスレッド染色領域のパーセンテージを、顕微鏡に付属する画像分析ソフトウェアで決定した。各肝につき少なくとも４枚のスライドを画像分析のために調製し、各スライドの（肝切片）の全領域をカメラで撮像し、分析した。統計分析はｔ検定によって行った。結果を図４に示す。肝切片は×３２倍で撮影した。線維化領域は、４枚の肝切片の平均として計算した。棒グラフは、各群についての染色のデジタル定量化をまとめたものである。統計数値は以下のとおりである：＊＝Ｐ＜０．０５、＊＊＝Ｐ＜０．０１、＊＊＊＝Ｐ＜０．００１。

図４は、肝切片における線維化領域を表す。「疾患ラット」(群１)における線維化領域は「ｓｈａｍ」(群６)または「無処置」(群７)より広かった。したがって、ＤＭＮ処置は、肝線維症に特有の、肝におけるコラーゲン沈着を誘発した。線維化領域は、ＴＩＭＰ１遺伝子を標的とするｓｉＲＮＡの処置により、「疾患ラット」群と比べ、顕著に縮小した(群２および３)。これは、ＴＩＭＰ１に対するｓｉＲＮＡが線維性疾患および障害の処置において治療効果を有することを示すものである。

例５
ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２核酸分子配列の選択：

ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２に対する核酸分子（例えば、ｓｉＮＡ≦２５ヌクレオチド）は、独自のデータベースを用いて設計した。候補配列は、in vitroノックダウンアッセイで検証する。表に記載の核酸の詳細は以下のとおりである。

表（Ａ１、Ａ２、Ａ５、Ａ６、Ｂ１、Ｂ２、Ｂ５、Ｂ６）は以下を含む：
ａ．独自のデータベースにより活性を有することが予測された１９ｍｅｒおよび１８ｍｅｒｓｉＲＮＡ（センス配列と、二重鎖ｓｉＲＮＡを形成するための対応するアンチセンス配列）から、既知の１９ｍｅｒｓｉＲＮＡを除いたもの、
ｂ．ヒトと、イヌ、ラット、マウスおよびウサギから選択される少なくとも２つのさらなる種（種間交差（cross species））を標的とし、活性を有することが予測されたｓｉＲＮＡ、
ｉ．種間交差ｓｉＲＮＡ化合物の組み入れは、示された標的（「センス」）との完全一致を有するｓｉＲＮＡ
ｉｉ．標的に対して、１位、１９位（５’＞３’）または両方におけるミスマッチを有するｓｉＲＮＡの組み入れ。

「好ましい」ｓｉＲＮＡの表（Ａ３、Ａ７、Ｂ３、Ｂ７）は、以下のとおりに選択したセンス配列および対応するアンチセンス配列を含む：
ｉ．ヒト（Ｈ）およびラット（Ｒｔ）に対する種間交差についての選択および１／１９（５’＞３’）以外の位置のラット標的に対する１ＭＭ（単一ミスマッチ（ＭＭ））を有する配列の組み入れ
ｉｉ．ラットを標的としないが、イヌ、マウスおよびウサギから選択される少なくとも２つの他の種を標的とする、予測された、活性を有するｓｉＲＮＡ化合物の追加。
ｉｉｉ．ヒトまたはヒト＋アカゲザルを標的とする最良のｓｉＲＮＡの追加
ｉｖ．ｍｉＲＮＡのシード配列を標的とするｓｉＲＮＡの除外
ｖ．高Ｇ／Ｃ含有ｓｉＲＮＡの除外
ｖｉ．複数のＳＮＰｓを標的とするｓｉＲＮＡの除外

「最低の予測ＯＴ効果」と称する表（表Ａ４、Ａ８、Ｂ４およびＢ８）は、最良のオフターゲット（ＯＴ）特性を有する、「好ましい」表からのｓｉＲＮＡに関し、これは以下を含む：
ｃ．「種間交差性」と称する欄は、以下のとおりの種特異性を示す：
ｉ． H/Rt＝少なくともヒトおよびラットを標的とするｓｉＲＮＡ
ｉｉ． H/Rt (Rt cross - with 1 MM)＝少なくともヒトおよびラットを標的とするｓｉＲＮＡ。ラットに対する標的一致（target match）は部分的であり、１位または１９位以外の位置に１個のミスマッチがある
ｉｉｉ． Other (w/o Rt)＝ｓｉＲＮＡはヒトおよび他の種を標的とするが、ラットは標的としない
ｉｖ． H +/- Rh＝ヒトのみ、またはヒトおよびアカゲザルを標的とするが、他の種は標的としないｓｉＲＮＡ

「# in HTS list」と称する欄は、それより前の「好ましい」表（Ａ３、Ａ７、Ｂ３、Ｂ７）におけるｓｉＲＮＡ番号を示す。
２．選択は、以下の手法でなされる：
ｉ．ミスマッチ（ＭＭ）は、ガイド鎖の２〜１８位に確認される。１位および１９位のＭＭはミスマッチとみなさない。
ｉｉ．他の遺伝子に対して完全な一致（０ＭＭ）を有するｓｉＲＮＡの除外
ｉｉｉ．他の遺伝子に対して、（ＡＳ鎖の）１７位または１８位に１個のＭＭを有するｓｉＲＮＡｓの除外
ｉｖ．優先度（予測されたＯＴ活性のランキング）：
１−ＡＳ（５’＞３’）の２〜１６位の中に３個のＭＭを有する。
２−２〜１６位の中に１〜４種の遺伝子標的に対する２個のＭＭを有する
３−（２〜１６位）の中に５〜９種の遺伝子標的に対する２個のＭＭを有する
４−２個のＭＭ（位置２〜１６）で、１０〜２０種の遺伝子を標的とする

ｓｉＲＮＡ分子の調製に有用なセンスオリゴヌクレオチドおよびアンチセンスオリゴヌクレオチドの配列を、下表Ａ１、Ａ２、Ａ３、Ａ４、Ａ５、Ａ６、Ａ７、Ａ８、Ｂ１、Ｂ２、Ｂ３、Ｂ４、Ｂ５、Ｂ６、Ｂ７、Ｂ８（表Ａ１〜Ｂ８）に開示する。最良のＯＴは、オフターゲット遺伝子に対する最小の一致（match）の数を指す。

以下の略号を表Ａ１〜Ｂ８（表Ａ１、Ａ２、Ａ３、Ａ４、Ａ５、Ａ６、Ａ７、Ａ８、Ｂ１、Ｂ２、Ｂ３、Ｂ４、Ｂ５、Ｂ６、Ｂ７およびＢ８）で用いる。ここで、「他種」は、他の動物（ＤまたはＤｇ−イヌ、Ｒｔ−ラット、Ｒｂ−ウサギ、Ｒｈ−アカゲザル、Ｐｇ−ブタ、ＭまたはＭｓ−マウス、Ｃｋ−ニワトリ、Ｃｗ−ウシ）との種間交差同一性を示し、ＯＲＦ：オープンリーディングフレームである。１９ｍｅｒおよび１８＋１ｍｅｒは、それぞれ、長さが１９および１８＋１（アンチセンスの１位のＵ、センス鎖の１９のＡまたはアンチセンスの１位のＡ、センス鎖の１９位のＵ）リボヌクレオチドのオリゴマーを指す。

表Ａ１１９ｍｅｒのｓｉＴＩＭＰ１

表Ａ２１９ｍｅｒの種間交差性ｓｉＴＩＭＰ１

表Ａ３好ましい１９ｍｅｒのｓｉＴＩＭＰ１

表Ａ４最低の予測ＯＴ効果を有する１９ｍｅｒのｓｉＴＩＭＰ１

表Ａ５１８ｍｅｒのｓｉＴＩＭＰ１

表Ａ６１８ｍｅｒの種間交差性ｓｉＴＩＭＰ１

表Ａ７好ましい１８＋ＡｍｅｒのｓｉＴＩＭＰ１

表Ａ８最低の予測オフターゲット（ＯＴ）効果を有する１８＋１ｍｅｒのｓｉＴＩＭＰ１

ＴＩＭＰ２−ＴＩＭＰメタロペプチダーゼインヒビター２
表Ｂ１ｓｉＴＩＭＰ２１９ｍｅｒ

表Ｂ２１９ｍｅｒのｓｉＴＩＭＰ２種間交差性

表Ｂ３好ましい１９ｍｅｒのｓｉＴＩＭＰ２

表Ｂ４最低の予測ＯＴ効果を有する１９ｍｅｒのｓｉＴＩＭＰ２

表Ｂ５１８ｍｅｒのｓｉＴＩＭＰ２

表Ｂ６１８ｍｅｒｓｉＴＩＭＰ２種間交差性

表Ｂ７好ましい１８＋１ｍｅｒのｓｉＴＩＭＰ２

表Ｂ８最低の予測ＯＴ効果を有する１８＋１ｍｅｒのｓｉＴＩＭＰ２

例６
標的遺伝子用ｓｉＲＮＡ化合物のin vitro試験
ヒトおよびラットＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２遺伝子に対するｓｉＲＮＡオリゴのためのロースループットスクリーニング（ＬＴＳ）

ＴＩＭＰ１またはＴＩＭＰ２遺伝子を内因性に発現する約２×１０^５個のヒト細胞系（ＨｅＬａ、ＬＸ２、ｈＨＳＣまたはＰＣ−３）を、２４時間後に３０〜５０％コンフルエントに達するよう、１．５ｍｌの増殖培地に接種する。細胞に、トランスフェクション細胞につき０．０１〜５ｎＭの終濃度のLipofectamine2000^(R)試薬でトランスフェクションする。細胞を、３７±１℃、５％ＣＯ_２で４８時間インキュベーションする。ｓｉＲＮＡをトランスフェクションした細胞を採取し、ＲＮＡをEZ-RNA^(R) kit（Biological Industries (#20-410-100)）を用いて単離する。

逆転写は、以下のとおりに行う。ｃＤＮＡの合成を行い、ヒトＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２ｍＲＮＡレベルをリアルタイムｑＰＣＲで決定し、各々のサンプルにつき、シクロフィリンＡ（CYNA, PPIA）ｍＲＮＡのレベルに対して正規化する。ｓｉＲＮＡ活性は、ｓｉＲＮＡ処理サンプル中のＴＩＭＰ１またはＴＩＭＰ２ｍＲＮＡ量対非トランスフェクション対照サンプルの比率に基づいて決定する。

最も活性な配列をさらなるアッセイから選択する。

ＬＴＳで選択したＴＩＭＰ１またはＴＩＭＰ２ｓｉＲＮＡオリゴのＩＣ _５０値
細胞を上記のとおりに増殖させる。試験したＲＮＡｉ活性のＩＣ_５０値を、種々の最終的なｓｉＲＮＡ濃度で得られた活性の結果を用いた用量反応曲線を作成することによって決定する。用量反応曲線は、残存するＴＩＭＰ１またはＴＩＭＰ２ｍＲＮＡの相対量を、トランスフェクションしたｓｉＲＮＡ濃度の対数に対してプロットすることによって作成する。曲線は、測定したデータに最良のＳ字状曲線をフィットさせることによって計算する。Ｓ字状曲線のフィットのための方法はまた、３点曲線フィット（3-point curve fit）として知られている。

式中、Ｙは残存するＴＩＭＰ１またはＴＩＭＰ２ｍＲＮＡの反応であり、ＸはトランスフェクションしたｓｉＲＮＡ濃度の対数であり、ＢｏｔはボトムプラトーにおけるＹ値であり、ＬｏｇＩＣ５０はＹがボトムプラトーとトッププラトーとの中間にあるときのＸ値であり、HillSlopeは曲線の傾き（steepness）である。

具体的なｓｉＲＮＡを用いた遺伝子発現の阻害パーセントは、内因性遺伝子を発現する細胞における標的遺伝子のｑＰＣＲ分析によって決定した。表Ａ１、Ａ２、Ａ３、Ａ４、Ａ５、Ａ６、Ａ７、Ａ８、Ｂ１、Ｂ２、Ｂ３、Ｂ４、Ｂ５、Ｂ６、Ｂ７、Ｂ８（表Ａ１〜Ｂ８）による他のｓｉＲＮＡ化合物をin vitroで試験し、そこでは、これらのｓｉＲＮＡ化合物が遺伝子発現を阻害することが示される。活性は、残存するｍＲＮＡのパーセントとして示され、したがって、低い値はより優れた活性を示す。

ｓｉＲＮＡ化合物の血清中の安定性を試験するために、具体的なｓｉＲＮＡ分子を、４つの異なるバッチのヒト血清（濃度１００％）中、３７℃で、２４時間までインキュベーションする。サンプルは、０．５、１、３、６、８、１０、１６および２４時間で回収する。指標としての移動パターンを、各回収時間において、ポリアクリルアミドゲル電気泳動（ＰＡＧＥ）により決定する。

例７
ｓｉＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２のノックダウン効果のタンパク質レベルでの検証
ＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２ｍＲＮＡ発現に対する種々のｓｉＴＩＭＰ１およびｓｉＴＩＭＰ２ｓｉＮＡ分子の阻害効果を、種々のｓｉＴＩＭＰ１およびｓｉＴＩＭＰ２をトランスフェクションしたｈＴＥＲＴ細胞におけるＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２を測定することにより、タンパク質レベルで検証する。種々のｓｉＴＩＭＰ１およびｓｉＴＩＭＰ２のｈＴＥＲＴ細胞へのトランスフェクションは、上記のとおりに行う。トランスフェクションしたｈＴＥＲＴ細胞を溶解し、細胞溶解物を遠心分離により清澄化する。清澄化した細胞溶解物中のタンパク質を、ＳＤＳポリアクリルアミドゲル電気泳動によって分割する。細胞溶解物中のＴＩＭＰ１およびＴＩＭＰ２タンパク質のレベルを、抗ＴＩＭＰ１または抗ＴＩＭＰ２抗体を一次抗体として、ＨＲＰとコンジュゲートした抗体（Millipore）を二次抗体として用い、その後Supersignal West Pico Chemiluminescence kit（Pierce）で検出して決定する。抗アクチン抗体（Abcam）を、タンパク質負荷対照として用いる。

例８
ｓｉＴＩＭＰ１およびｓｉＴＩＭＰ２ｓｉＲＮＡ二重鎖によるコラーゲンＩ発現の下方調節

コラーゲンＩ発現レベルに対するｓｉＴＩＭＰ１およびｓｉＴＩＭＰ２の、単独または組み合わせての効果を決定するために、種々のｓｉＴＩＭＰ１および／またはｓｉＴＩＭＰ２で処理したｈＴＥＲＴ細胞におけるコラーゲンＩｍＲＮＡレベル。簡潔に述べると、ｈＴＥＲＴ細胞に種々のｓｉＴＩＭＰ１および／またはｓｉＴＩＭＰ２を例２に記載のとおりにトランスフェクションする。細胞を７２時間後に溶解し、ｍＲＮＡをRNeasy mini kitを用い、マニュアル（Qiagen）に従って単離する。コラーゲンＩｍＲＮＡのレベルを、TaqMan^(R)プローブを用いた定量ＰＣＲと組み合わせた逆転写により決定する。簡潔に述べると、ｃＤＮＡ合成を、High-Capacity cDNA Reverse Transcription Kit（ABI）を用いてメーカーの指示に従って行い、TaqMan Gene Expression Assay（ABI、COL1A1アッセイID Hs01076780_g1）に供する。コラーゲンＩｍＲＮＡのレベルは、メーカーの指示（ABI）に従って、ＧＡＰＤＨｍＲＮＡのレベルに対して正規化する。シグナルは、スクランブルｓｉＮＡをトランスフェクションした細胞から得られるシグナルに対して正規化する。

例９
ｓｉＴＩＭＰ１および／またはｓｉＴＩＭＰ２で処理したｈＴＥＲＴ細胞の免疫蛍光染色
トランスフェクションしたｈＴＥＲＴ細胞における２種の線維症マーカー、コラーゲンＩおよびα平滑筋アクチン（ＳＭＡ）の発現を視覚化するために、細胞をウサギ抗コラーゲンＩ抗体（Abcam）およびマウス抗アルファＳＭＡ抗体（Sigma）で染色する。Alexa Fluor 594ヤギ抗マウスＩｇＧおよびAlexa Fluor 488ヤギ抗ウサギＩｇＧ（Invitrogen（Molecular Probes））を、コラーゲンＩ（緑）およびアルファＳＭＡ（赤）を視覚化する二次抗体として用いる。Hoeschtを、核（青）を視覚化するために用いる。

例１０
動物モデル：線維性状態のモデル系
本明細書で提供されるｓｉＲＮＡは、予測動物モデルで試験することができる。腎線維症のラット糖尿病およびエイジングモデルは、Zucker糖尿病肥満（ＺＤＦ）ラット、老齢ｆａ／ｆａ（肥満Zucker）ラット、老齢Sprague-Dawley（ＳＤ）ラットおよびGoto Kakizaki（ＧＫ）ラットを含む。ＧＫラットは、Wisterラットに由来し、ＮＩＤＤＭ（ＩＩ型糖尿病）の自然発生について選択された近交系である。腎線維症の誘導モデルは、健康な非糖尿病動物に生じる急性間質性線維症のモデルである、恒常的片側性尿管閉塞（ＵＵＯ）モデルを含み、腎線維症は、閉塞後で数日のうちに発症する。腎線維症の別の誘導モデルは、５／６腎摘出モデルである。

ラットにおける肝線維症の２つのモデルは、以下の参考文献に記載の、偽手術を対照とする胆管結紮（ＢＤＬ）と、オリーブ油給餌動物を対照とするＣＣｌ４中毒である：Lotersztajn S, et al Hepatic Fibrosis: Molecular Mechanisms and Drug Targets. Annu Rev Pharmacol Toxicol. 2004 Oct 07、Uchio K, et al., Down-regulation of connective tissue growth factor and type I collagen mRNA expression by connective tissue growth factor antisense oligonucleotide during experimental liver fibrosis. Wound Repair Regen. 2004 Jan-Feb;12(1):60-6、Xu XQ, et al., Molecular classification of liver cirrhosis in a rat model by proteomics and bioinformatics Proteomics. 2004 Oct;4(10):3235-45。

眼の瘢痕形成に関するモデルは、当該技術分野において周知であり、例えば、Sherwood MB et al., J Glaucoma. 2004 Oct;13(5):407-12. A new model of glaucoma filtering surgery in the rat、Miller MH et al., Ophthalmic Surg. 1989 May;20(5):350-7. Wound healing in an animal model of glaucoma fistulizing surgery in the Rb、vanBockxmeer FM et al., Retina. 1985 Fall-Winter; 5(4): 239-52. Models for assessing scar tissue inhibitors、Wiedemann P et al., J Pharmacol Methods. 1984 Aug; 12(1): 69-78. Proliferative vitreoretinopathy: the Rb cell injection model for screening of antiproliferative drugsなどがある。

白内障のモデルは、以下の出版物に記載されている：The role of Src family kinases in cortical cataract formation. Zhou J, Menko AS.Invest Ophthalmol Vis Sci. 2002 Jul;43(7):2293-300、Bioavailability and anticataract effects of a topical ocular drug delivery system containing disulfiram and hydroxypropyl-beta-cyclodextrin on selenite-treated rats. Wang S, et al. Curr Eye Res. 2004 Jul;29(1):51-8、および Long-term organ culture system to study the effects of UV-A irradiation on lens transglutaminase. Weinreb O, Dovrat A.; Curr Eye Res. 2004 Jul;29(1):51-8。

本明細書に開示される化合物は線維性状態のこれらのモデルでテストされ、そこにおいて、それらが肝線維症および他の線維性状態の処置に効果的であることが明らかとなる。本明細書に記載される化合物はこの動物モデルで試験され、結果は、これらのｓｉＲＮＡ化合物が肺移植後の虚血再灌流の処置および／または予防に有用であることを示す。

本明細書で言及または引用した論文、特許および特許出願、および他の全ての文書および電子的に利用可能な情報の内容は、その全体が同程度に、あたかも各々の個々の公表物が、参照により援用されるよう具体的かつ個々に指示されたかのように、参照により本明細書に援用される。

出願人は、この出願に、あらゆるかかる論文、特許、特許出願、または他の物理的および電子的文書から、任意のおよび全ての資料および情報を、物理的に組み込む権利を保有する。

様々な置換および改変が、本発明の範囲および精神から逸脱することなく、本明細書に開示される発明になされ得ることは、当業者において明白である。したがって、かかるさらなる態様は、本発明および以下の請求の範囲の範囲内である。本開示は、当業者に、本明細書に記載の化学修飾の種々の組合せおよび／または置換を、ＲＮＡｉ活性を誘導するために改善された活性を有する核酸構築物を生成する目的で試験することを教示する。かかる改善された活性は、改善された安定性、改善された生体利用能、および／または、ＲＮＡｉを誘導する細胞反応の改善された活性化を含んでもよい。したがって、本明細書に記載の具体的態様は限定的ではなく、当業者は、改善されたＲＮＡｉ活性を有する核酸分子を同定する目的で、本明細書に記載の具体的な修飾の組合せを、過度な実験なしに試験し得ることを容易に認識することができる。

本明細書に例示的に記載した発明は、本明細書に具体的に開示されていないあらゆる１または２以上の要素、１または２以上の限定なしに、好適に実施することができる。したがって、例えば、発明の記載するという文脈（特に以下の請求の範囲の文脈）における用語「a」および「an」および「the」および類似の指示語は、本明細書に別記されているか、文脈から明らかに矛盾しないかぎり、単数および複数の両方をカバーするものとする。用語「含む」、「有する」、「包含する」、「含有する」などは、拡張的に、限定なしに（例えば、「限定されずに含む」の意味に）解釈すべきである。本明細書における数値範囲の記載は、本明細書に別記されない限り、単にこの範囲内に属する各々の個々の数値を個別に指す省略法として機能することを意図するものであり、各々の個々の数値は、あたかもそれが本明細書に個々に記載されているかのように、本明細書に組み込まれる。本明細書に記載の全ての方法は、本明細書に別記されているか、文脈から明らかに矛盾しないかぎり、あらゆる好適な順序で行うことができる。本明細書において提供される、あらゆるおよび全ての例、または例示的文体（例えば、「例えば．．．など」）は、単に発明をよりよく明らかにすることを意図したものであり、請求の範囲に別記されない限り、発明の範囲を限定するものではない。本明細書中の言葉は、請求の範囲に記載されていない要素が、発明の実施に必須であることを示しているように解してはならない。さらに、本明細書で利用されている用語および表現は、限定の用語としてではなく、説明の用語として用いており、かかる用語および表現の使用において、示され、記載された特徴またはその部分の任意の均等物を除外する意図はないが、請求の範囲に記載された発明の範囲内で、様々な改変が可能であることが認識される。したがって、本発明は、好ましい態様および任意の特徴によって具体的に開示されているが、当業者はそこに具現された本明細書に開示されている発明の改変物および変更物を採用することができ、そして、かかる改変物および変更物は、本発明の範囲内とみなされることを理解すべきである。

本発明は、本明細書に広く、一般的に記載されている。一般的な開示の範囲に属する各々の狭い種（species）および亜属の（subgeneric）群もまた、本発明の一部を形成する。これは、属から任意の主題を取り除く但書または否定的限定を有する発明の一般的記載を含み、それは切り取られたものが本明細書に具体的に記載されているか否かとは無関係である。他の態様は以下の請求の範囲の範囲内である。さらに、発明の特徴または側面がマーカッシュ群の観点で記載されている場合、当業者は、発明がまた、それによって、マーカッシュ群の任意の個別の成員または成員の亜群に関しても記載されていることを認識する。

Claims

核酸分子であって、
（ａ）該核酸分子はセンス鎖とアンチセンス鎖とを含み、
（ｂ）該核酸分子のそれぞれの鎖は、独立して１５〜４９ヌクレオチドの長さであり、
（ｃ）アンチセンス鎖の１５〜４９ヌクレオチドの配列は、ＴＩＭＰ１をコードするｍＲＮＡの配列に相補的であり、かつ
（ｄ）センス鎖の１５〜４９ヌクレオチドの配列はアンチセンス鎖の配列に相補的であり、それにより二重鎖領域を形成し、かつ、ＴＩＭＰ１をコードするｍＲＮＡ（配列番号１）の１５〜４９ヌクレオチドの配列を含む、
前記核酸分子。
アンチセンス鎖およびセンス鎖がｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ２（配列番号２６７および２９９）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ６（配列番号２６８および３００）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１４（配列番号２６９および３０１）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１６（配列番号２７０および３０２）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１７（配列番号２７１および３０３）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１９（配列番号２７２および３０４）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ２０（配列番号２７３および３０５）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ２１（配列番号２７４および３０６）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ２３（配列番号２７５および３０７）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ２９（配列番号２７８および３１０）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ３３（配列番号２８０および３１２）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ３８（配列番号２８１および３１３）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ４２（配列番号２８２および３１４）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ４３（配列番号２８３および３１５）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ４５（２８４および３１６）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ６０（配列番号２８６および３１８）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ７１（配列番号２８７および３１９）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ７３（配列番号２８８および３２０）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ７８（配列番号２９０および３２２）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ７９（配列番号２９１および３２３）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ８５（配列番号２９２および３２４）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ８９（配列番号２９３および３２５）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ９１（配列番号２９４および３２６）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ９６（配列番号２９５および３２７）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ９８（配列番号２９６および３２８）、ｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ９９（配列番号２９７および３２９）およびｓｉＴＩＭＰ１＿ｐ１０８（配列番号２９８および３３０）に記載の配列のペアから選択される、請求項１に記載の核酸分子。
センス鎖およびアンチセンス鎖が、表Ｃに示され、ＴＩＭＰ１−Ａ（配列番号５および６）、ＴＩＭＰ１−Ｂ（配列番号７および８）およびＴＩＭＰ１−Ｃ（配列番号である９および１０）として記載された配列のペアから選択される、請求項１に記載の核酸分子。
ヒトＴＩＭＰ１をコードするｍＲＮＡの配列に相補的なアンチセンス鎖の配列が、配列番号１のヌクレオチド３００〜４００の間の配列に相補的な配列を含む、請求項１に記載の核酸分子。
ヒトＴＩＭＰ１をコードするｍＲＮＡの配列に相補的なアンチセンス鎖の配列が、配列番号１のヌクレオチド６００〜７５０の間の配列に相補的な配列を含む、請求項１に記載の核酸分子。
ヒトＴＩＭＰ１をコードするｍＲＮＡの配列に相補的なアンチセンス鎖の配列が、配列番号１のヌクレオチド３５５〜３７３の間の配列に相補的な配列を含む、請求項４に記載の核酸分子。
ヒトＴＩＭＰ１をコードするｍＲＮＡの配列に相補的なアンチセンス鎖の配列が、配列番号１のヌクレオチド６２０〜６３８または６４０〜６５８の間の配列に相補的な配列を含む、請求項５に記載の核酸分子。
核酸分子であって、
（ａ）該核酸分子は、センス鎖とアンチセンス鎖とを含み、
（ｂ）該核酸分子の各々の鎖は、独立して、長さが１５〜４９ヌクレオチドであり、
（ｃ）アンチセンス鎖の１５〜４９ヌクレオチドの配列は、ＴＩＭＰ２をコードするｍＲＮＡの配列に相補的であり、および
（ｄ）センス鎖の１５〜４９ヌクレオチドの配列はアンチセンス鎖に相補的であり、それによって二重鎖領域を形成し、かつ、ＴＩＭＰ２をコードするｍＲＮＡ（配列番号２）の１５〜４９ヌクレオチドの配列を含む、
前記核酸分子。
センス鎖およびアンチセンス鎖が、表Ｄに示される配列のペアから選択される、請求項８に記載の核酸分子。
ヒトＴＩＭＰ２をコードするｍＲＮＡの配列に相補的なアンチセンス鎖の配列が、配列番号２のヌクレオチド６９８〜７１６の間の配列に相補的な配列を含む、請求項８に記載の核酸分子。
ヒトＴＩＭＰ２をコードするｍＲＮＡの配列に相補的なアンチセンス鎖の配列が、配列番号２のヌクレオチド４００〜５００の間の配列に相補的な配列を含む、請求項８に記載の核酸分子。
ヒトＴＩＭＰ２をコードするｍＲＮＡの配列に相補的なアンチセンス鎖の配列が、配列番号２のヌクレオチド５００〜６００の間の配列に相補的な配列を含む、請求項８に記載の核酸分子。
ヒトＴＩＭＰ２をコードするｍＲＮＡの配列に相補的なアンチセンス鎖の配列が、配列番号２のヌクレオチド６００〜７００の間の配列に相補的な配列を含む、請求項８に記載の核酸分子。
ヒトＴＩＭＰ２をコードするｍＲＮＡの配列に相補的なアンチセンス鎖の配列が、配列番号２のヌクレオチド４２１〜４３９の間の配列に相補的な配列を含む、請求項１０に記載の核酸分子。
ヒトＴＩＭＰ２をコードするｍＲＮＡの配列に相補的なアンチセンス鎖の配列が、配列番号２のヌクレオチド５０２〜５２０または５２３〜５４１の間の配列に相補的な配列を含む、請求項１１に記載の核酸分子。
ヒトＴＩＭＰ２をコードするｍＲＮＡの配列に相補的なアンチセンス鎖の配列が、配列番号２のヌクレオチド６２５〜６４３の間の配列に相補的な配列を含む、請求項１２に記載の核酸分子。
ヒトＴＩＭＰ２をコードするｍＲＮＡの配列に相補的なアンチセンス鎖の配列が、配列番号２のヌクレオチド６２９〜６４７の間の配列に相補的な配列を含む、請求項１２に記載の核酸分子。
アンチセンス鎖およびセンス鎖が、独立して、１７〜４９ヌクレオチドの長さである、請求項１または８に記載の核酸分子。
アンチセンス鎖およびセンス鎖が、独立して、１７〜３０ヌクレオチドの長さである、請求項１８に記載の核酸分子。
アンチセンス鎖およびセンス鎖が、独立して、１５〜２５ヌクレオチドの長さである、請求項１８に記載の核酸分子。
アンチセンス鎖およびセンス鎖が、独立して、１８〜２３ヌクレオチドの長さである、請求項１８に記載の核酸分子。
アンチセンス鎖およびセンス鎖が、独立して、１９〜２１ヌクレオチドの長さである、請求項１８に記載の核酸分子。
アンチセンス鎖およびセンス鎖が、独立して、２５〜３０ヌクレオチドの長さである、請求項１８に記載の核酸分子。
アンチセンス鎖およびセンス鎖が、各々１９ヌクレオチドの長さである、請求項１８に記載の核酸分子。
二重鎖領域が１５〜４９ヌクレオチドの長さである、請求項１または８に記載の核酸分子。
二重鎖領域が１５〜３５ヌクレオチドの長さである、請求項２５に記載の核酸分子。
二重鎖領域が１５〜２５ヌクレオチドの長さである、請求項２５に記載の核酸分子。
二重鎖領域が１７〜２３ヌクレオチドの長さである、請求項２５に記載の核酸分子。
二重鎖領域が１７〜２１ヌクレオチドの長さである、請求項２５に記載の核酸分子。
二重鎖領域が２５〜３０ヌクレオチドの長さである、請求項２５に記載の核酸分子。
二重鎖領域が１５〜２５ヌクレオチドの長さである、請求項２５に記載の核酸分子。
二重鎖領域が１９ヌクレオチドの長さである、請求項２５に記載の核酸分子。
アンチセンス鎖とセンス鎖とが別々のポリヌクレオチド鎖である、請求項１または８に記載の核酸分子。
アンチセンス鎖とセンス鎖とが別々のポリヌクレオチド鎖であり、該アンチセンス鎖と該センス鎖とが、水素結合によって二本鎖構造を形成する、請求項３３に記載の核酸分子。
アンチセンス鎖とセンス鎖とが別々のポリヌクレオチド鎖であり、該アンチセンス鎖と該センス鎖とが、共有結合によって連結されている、請求項３３に記載の核酸分子。
センス鎖とアンチセンス鎖とが、センス領域とアンチセンス領域の両方を有する単一のポリヌクレオチド鎖の一部である、請求項１〜３２のいずれか一項に記載の核酸分子。
センス鎖とアンチセンス鎖とが、センス領域とアンチセンス領域の両方を有する単一のポリヌクレオチド鎖の一部であり、核酸分子がヘアピン構造を有する、請求項３６に記載の核酸分子。
核酸分子が二本鎖分子であり、両方の末端が平滑末端である、請求項１〜３２のいずれか一項に記載の核酸分子。
核酸分子が二本鎖分子であり、一端が平滑末端である、請求項１〜３２のいずれか一項に記載の核酸分子。
核酸分子が二本鎖分子であり、分子の両端に少なくとも１つのオーバーハングを有する、請求項１〜３２のいずれか一項に記載の核酸分子。
核酸分子が二本鎖分子であり、少なくとも１つの鎖が３’ヌクレオチドまたは非ヌクレオチドオーバーハングを有する、請求項１〜３２のいずれか一項に記載の核酸分子。
核酸分子が二本鎖分子であり、分子の両端に３’オーバーハングを有し、該オーバーハングが２ヌクレオチドの長さである、請求項４１に記載の核酸分子。
核酸分子が二本鎖分子であり、分子の少なくとも一端に５’オーバーハングを有する、請求項４０に記載の核酸分子。
核酸分子が二本鎖分子であり、分子の両端に５’オーバーハングを有し、該オーバーハングが２ヌクレオチドの長さである、請求項４３に記載の核酸分子。
核酸分子が二本鎖分子であり、分子の一端に平滑末端を有し、分子の他端にオーバーハングを有する、請求項３９に記載の核酸分子。
核酸分子が二本鎖分子であり、分子の一端に平滑末端を有し、分子の他端にオーバーハングを有し、該オーバーハングが、１〜８ヌクレオチドオーバーハングである、請求項４５に記載の核酸分子。
核酸分子が二本鎖分子であり、分子の一端に平滑末端を有し、分子の他端にオーバーハングを有し、該オーバーハングが、３’ヌクレオチドまたは非ヌクレオチドオーバーハングである、請求項４５に記載の核酸分子。
核酸分子が二本鎖分子であり、分子の一端に平滑末端を有し、分子の他端にオーバーハングを有し、該オーバーハングが、２ヌクレオチドの３’オーバーハングである、請求項４７に記載の核酸分子。
核酸分子が二本鎖分子であり、分子の一端に平滑末端を有し、分子の他端にオーバーハングを有し、該オーバーハングが３’オーバーハングであり、該オーバーハングがセンス鎖にある、請求項４７に記載の核酸分子。
核酸分子が二本鎖分子であり、分子の一端に平滑末端を有し、分子の他端にオーバーハングを有し、該オーバーハングが３’オーバーハングであり、該オーバーハングがアンチセンス鎖にある、請求項４７に記載の核酸分子。
核酸分子が二本鎖分子であり、分子の一端に平滑末端を有し、分子の他端にオーバーハングを有し、該オーバーハングが５’オーバーハングである、請求項４６に記載の核酸分子。
核酸分子が二本鎖分子であり、分子の一端に平滑末端を有し、分子の他端にオーバーハングを有し、該オーバーハングが２ヌクレオチドの５’オーバーハングである、請求項４６に記載の核酸分子。
核酸分子が二本鎖分子であり、分子の一端に平滑末端を有し、分子の他端にオーバーハングを有し、該オーバーハングが５’オーバーハングであり、該オーバーハングがセンス鎖にある、請求項４６に記載の核酸分子。
核酸分子が二本鎖分子であり、分子の一端に平滑末端を有し、分子の他端にオーバーハングを有し、該オーバーハングが５’オーバーハングであり、該オーバーハングがアンチセンス鎖にある、請求項４６に記載の核酸分子。
オーバーハングヌクレオチドが修飾ヌクレオチドである、請求項４６に記載の核酸分子。
オーバーハングヌクレオチドが２’−デオキシリボヌクレオチドである、請求項５５に記載の核酸分子。
核酸分子が１または２以上の修飾または修飾ヌクレオチドを含む、請求項１〜５６のいずれか一項に記載の核酸分子。
核酸分子が修飾糖部分を含む１個または２個以上ヌクレオチドを含む、請求項５７に記載の核酸分子。
核酸分子が修飾糖部分を含む１個または２個以上ヌクレオチドを含み、該修飾糖部分が、独立して、２’−Ｏ−メチル、２’−メトキシエトキシ、２’−デオキシ、２’−フルオロ、２’−アリル、２’−Ｏ−［２（メチルアミノ）−２−オキソエチル］、４’チオ、４’−（ＣＨ_２）_２−Ｏ−２’−架橋、２’−ロックド核酸または２’−Ｏ−（Ｎ−メチルカルバメート）からなる群から選択される、請求項５８に記載の核酸分子。
核酸分子が１個または２個以上の修飾核酸塩基を含む、請求項５７に記載の核酸分子。
核酸分子が１個または２個以上の修飾核酸塩基を含み、該１個または２個以上の修飾核酸塩基が、独立して、キサンチン、ヒポキサンチン、２−アミノアデニン、アデニンおよびグアニンの６−メチルおよび他のアルキル誘導体、アデニンおよびグアニンの２−プロピルおよび他のアルキル誘導体、５−ハロウラシルおよび５−ハロシトシン、５−プロピニルウラシルおよび５−プロピニルシトシン、６−アゾウラシル、６−アゾシトシンおよび６−アゾチミン、５−ウラシル（シュードウラシル）、４−チオウラシル、８−ハロ、アミノ、チオール、チオアルキル、ヒドロキシおよび他の８−置換アデニンおよびグアニン、５−トリフルオロメチルおよび他の５−置換ウラシルおよびシトシン、７−メチルグアニンおよびアシクロヌクレオチドからなる群から選択される、請求項６０に記載の核酸分子。
核酸分子がホスホジエステル骨格に１または２以上の修飾を含む、請求項５７に記載の核酸分子。
核酸分子がホスホジエステル骨格への１または２以上の修飾を含み、該ホスホジエステル骨格への１または２以上の修飾が、独立して、ホスホロチオエート、３’−（または５’−）デオキシ−３’−（または５’−）チオ−ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、ホスホロセレネート、３’−（または５’−）デオキシホスフィネート、ボラノホスフェート、３’−（または５’−）デオキシ−３’−（または５’−）アミノホスホルアミデート、水素ホスホネート、ボラノリン酸エステル、ホスホルアミデート、アルキルまたはアリールホスホネートおよびホスホトリエステルまたはリン結合からなる群から選択される、請求項６２に記載の核酸分子。
核酸分子が、１または２以上の修飾をセンス鎖に含むが、アンチセンス鎖には含まない、請求項５７に記載の核酸分子。
核酸分子が、１または２以上の修飾をアンチセンス鎖に含むが、センス鎖には含まない、請求項５７に記載の核酸分子。
核酸分子が、１または２以上の修飾をセンス鎖およびアンチセンス鎖の両方に含む、請求項５７に記載の核酸分子。
センス鎖が、交互する修飾のパターンを含む、請求項５７に記載の核酸分子。
アンチセンス鎖が、交互する修飾のパターンを含む、請求項５７に記載の核酸分子。
センス鎖が修飾ヌクレオチドと非修飾ヌクレオチドとが交互するパターンを含み、修飾が２’−Ｏ−メチル糖部分である、請求項６７に記載の核酸分子。
アンチセンス鎖が修飾ヌクレオチドと非修飾ヌクレオチドとが交互するパターンを含み、修飾が２’−Ｏ−メチル糖部分である、請求項６８に記載の核酸分子。
センス鎖が修飾ヌクレオチドと非修飾ヌクレオチドとが交互するパターンを含み、修飾が２’−Ｏ−メチル糖部分であり、パターンがセンス鎖の５’末端における修飾ヌクレオチドから始まる、請求項６９に記載の核酸分子。
アンチセンス鎖が修飾ヌクレオチドと非修飾ヌクレオチドとが交互するパターンを含み、修飾が２’−Ｏ−メチル糖部分であり、パターンがアンチセンス鎖の５’末端における修飾ヌクレオチドから始まる、請求項７０に記載の核酸分子。
センス鎖が修飾ヌクレオチドと非修飾ヌクレオチドとが交互するパターンを含み、修飾が２’−Ｏ−メチル糖部分であり、パターンがセンス鎖の３’末端における修飾ヌクレオチドから始まる、請求項６９に記載の核酸分子。
アンチセンス鎖が修飾ヌクレオチドと非修飾ヌクレオチドとが交互するパターンを含み、修飾が２’−Ｏ−メチル糖部分であり、パターンがアンチセンス鎖の３’末端における修飾ヌクレオチドから始まる、請求項７０に記載の核酸分子。
センス鎖およびアンチセンス鎖の両方が修飾ヌクレオチドと非修飾ヌクレオチドとが交互するパターンを含み、修飾が２’−Ｏ−メチル糖部分であり、パターンが、センス鎖の修飾ヌクレオチドがアンチセンス鎖の非修飾ヌクレオチドに対向し、センス鎖の非修飾ヌクレオチドがアンチセンス鎖の修飾ヌクレオチドに対向するように構成される、請求項６６に記載の核酸分子。
センス鎖およびアンチセンス鎖の両方が修飾ヌクレオチドと非修飾ヌクレオチドとが交互するパターンを含み、修飾が２’−Ｏ−メチル糖部分であり、パターンが、センス鎖の各の修飾ヌクレオチドがアンチセンス鎖の修飾ヌクレオチドに対向するように構成される、請求項６６に記載の核酸分子。
センス鎖および／またはアンチセンス鎖の一方または両方が、３’末端における１〜３個のデオキシリボヌクレオチドを含む、請求項１〜７６のいずれか一項に記載の核酸分子。
センス鎖および／またはアンチセンス鎖の一方または両方が、５’末端におけるリン酸基を含む、請求項１〜７７のいずれか一項に記載の核酸分子。
センス鎖が少なくとも１個のニックまたはギャップを含む、請求項１〜７８のいずれか一項に記載の核酸分子。
請求項１〜７のいずれか一項に記載の核酸分子を、ＴＩＭＰ１の発現を低減するのに十分な量で細胞内に導入することを含む、細胞においてＴＩＭＰ１の発現を低減する方法。
請求項８〜１７のいずれか一項に記載の核酸分子を、ＴＩＭＰ２の発現を低減するのに十分な量で細胞内に導入することを含む、細胞においてＴＩＭＰ２の発現を低減する方法。
細胞が肝星細胞である、請求項８０または８１に記載の方法。
細胞が、腎臓または肺組織における、または腎臓または肺組織由来の星細胞である、請求項８０または８１に記載の方法。
方法がin vitroで行われる、請求項８０〜８３のいずれか一項に記載の方法。
方法がin vivoで行われる、請求項８０〜８３のいずれか一項に記載の方法。
ＴＩＭＰ１に関連する疾患に罹患した個体を処置する方法であって、請求項１〜７のいずれか一項に記載の核酸分子を、ＴＩＭＰ１の発現を低減するのに十分な量で前記個体に投与することを含む、前記方法。
ＴＩＭＰ２に関連する疾患に罹患した個体を処置する方法であって、請求項８〜１７のいずれか一項に記載の核酸分子を、ＴＩＭＰ２の発現を低減するのに十分な量で前記個体に投与することを含む、前記方法。
ＴＩＭＰ１またはＴＩＭＰ２に関連する疾患が、線維症、肝線維症、肝硬変、肺線維症、腎線維症、腹膜線維症、慢性肝損傷および原線維形成からなる群から選択される疾患である、請求項８６または８７に記載の方法。
請求項１〜７９のいずれか一項に記載の核酸分子と、薬学的に許容し得る担体とを含む組成物。
患者による使用のために包装された、請求項１〜７９のいずれか一項に記載の核酸分子を含む組成物。
組成物が、請求項１〜７９のいずれか一項に記載の核酸分子をどのように用いることができるのかに関する特定の情報を提供するラベルまたは添付文書を含む、請求項８９または９０に記載の組成物。
ラベルまたは添付文書が投薬情報および／または使用適応を含む、請求項９１に記載の組成物。
ラベルまたは添付文書が使用適応を含む、請求項９１または９２に記載の組成物。
ラベルまたは添付文書が、請求項１〜７９のいずれか一項に記載の核酸分子が治療への使用に適することを示す、請求項９１〜９３のいずれか一項に記載の組成物。
ラベルまたは添付文書が、請求項１〜７９のいずれか一項に記載の核酸分子が、ＴＩＭＰ１に関連する疾患に罹患した患者を処置するために適することを示す、請求項９１〜９４のいずれか一項に記載の組成物。
ラベルまたは添付文書が、請求項１〜７９のいずれか一項に記載の核酸分子が、ＴＩＭＰ２に関連する疾患に罹患した患者を処置するために適することを示す、請求項９１〜９４のいずれか一項に記載の組成物。
ラベルまたは添付文書が、請求項１〜７９のいずれか一項に記載の核酸分子が、線維症、肝線維症、肝硬変、肺線維症、腎線維症、腹膜線維症、慢性肝損傷、声帯線維症、腸管線維症、脳梗塞に関連する脳における線維化および原線維形成からなる群から選択される疾患を処置するために適することを示す、請求項９１〜９６のいずれか一項に記載の組成物。
構造（Ａ１）：
（Ａ１）５’ （Ｎ）ｘ−Ｚ３’（アンチセンス鎖）
３’ Ｚ’−（Ｎ’）ｙ−ｚ’’ ５’（センス鎖）
ここで、各々のＮおよびＮ’は非修飾であっても、修飾されていてもよいリボヌクレオチドであるか、非定型部分であり、
各々の（Ｎ）ｘおよび（Ｎ’）ｙは、各々の連続するＮまたはＮ’が次のＮまたはＮ’に共有結合的に連結されたオリゴヌクレオチドであり、
各々のＺおよびＺ’は、独立して、存在するか、不在であるが、存在する場合は、独立して、それが存在する鎖の３’末端に共有結合的に付着した１〜５個の連続したヌクレオチドまたは非定型部分またはその組合せであり、
ｚ’’は存在しても、または不在であってもよいが、存在する場合は、（Ｎ’）ｙの５’末端に共有結合的に付着したキャッピング部分であり、
ｘおよびｙの各々は、独立して、１８〜４０の整数であり、
（Ｎ’）ｙの配列は、（Ｎ）ｘの配列に対して相補性を有し、（Ｎ）ｘは、配列番号１または配列番号２に記載のｍＲＮＡに対するアンチセンス配列を含む
を有する二本鎖オリゴヌクレオチド化合物。
（Ｎ）ｘが、配列番号１に記載のｍＲＮＡに対するアンチセンス配列を含み、（Ｎ）ｘが、表Ａ１、Ａ２、Ａ３またはＡ４のいずれかに存在するアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む、請求項９８に記載の核酸分子。
（Ｎ）ｘが、表Ａ３またはＡ４のいずれかに存在するアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む、請求項９９に記載の核酸分子。
（Ｎ）ｘが、配列番号２に記載のｍＲＮＡに対するアンチセンス配列を含む、請求項９８に記載の核酸分子。
（Ｎ）ｘが、表Ｂ１、Ｂ２、Ｂ３またはＢ４のいずれかに存在するアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む、請求項１０１に記載の核酸分子。
（Ｎ）ｘが、表Ｂ３またはＢ４のいずれかに存在するアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む、請求項１０２に記載の核酸分子。
いずれの鎖も３’末端および５’末端にホスフェートを含まないか、または、センスおよび／またはアンチセンス鎖の一方または両方が５’末端にリン酸基を含む、請求項９８に記載の核酸分子。
ｘ＝ｙ＝１９である、請求項９８〜１０４のいずれか一項に記載の核酸分子。
ＺおよびＺ’の両方が不在である、請求項９８〜１０５のいずれか一項に記載の核酸分子。
ＺおよびＺ’のうちの１つが存在する、請求項９８〜１０５のいずれか一項に記載の核酸分子。
ＺまたはＺが、独立して、無塩基デオキシリボース部分、無塩基リボース部分、逆位無塩基デオキシリボース部分、逆位無塩基リボース部分、Ｃ３部分、Ｃ４部分、Ｃ５部分、Ｃ６部分、アミノ−６部分から選択される非定型部分である、請求項１０７に記載の核酸分子。
ＺまたはＺ’が、独立して、Ｃ３部分およびアミノ−Ｃ６部分から選択される、請求項１０８に記載の核酸分子。
ＮまたはＮ’の少なくとも１つが２’糖修飾リボヌクレオチドを含む、請求項９８〜１０９のいずれか一項に記載の核酸分子。
２’糖修飾リボヌクレオチドが、アミノ、フルオロ、アルコキシまたはアルキル部分の存在を含む、請求項１１０に記載の核酸分子。
２’糖修飾リボヌクレオチドが、２’−ＯＣＨ３（２’ＯＭｅ）を含む、請求項１１１に記載の核酸分子。
（Ｎ）ｘが、交互する２’ＯＭｅ糖修飾リボヌクレオチドと非修飾リボヌクレオチドとを含む、請求項１１２に記載の核酸分子。
（Ｎ）ｘが、少なくとも５個の交互する２’ＯＭｅ糖修飾リボヌクレオチドと非修飾リボヌクレオチドとを含む、請求項１１３に記載の核酸分子。
（Ｎ）ｘが、２’ＯＭｅ修飾リボヌクレオチドを、２、４、６、８、１１、１３、１５、１７および１９位に含む、請求項１１４に記載の核酸分子。
（Ｎ）ｘが、２’ＯＭｅ修飾リボヌクレオチドを、１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７および１９位に含む、請求項１１４に記載の核酸分子。
（Ｎ）ｘが、２’ＯＭｅ修飾ピリミジンを含む、請求項１１４に記載の核酸分子。
（Ｎ’）ｙが、ミラーヌクレオチドと、隣接するヌクレオチドに２’−５’ヌクレオチド間リン酸結合で連結しているヌクレオチドとから選択される少なくとも１個の非定型部分を含む、請求項９８〜１１７のいずれか一項に記載の核酸分子。
非定型部分がミラーヌクレオチドである、請求項１１８に記載の核酸分子。
ミラーヌクレオチドが、Ｌ−デオキシリボヌクレオチド（Ｌ−ＤＮＡ）である、請求項１１９に記載の核酸分子。
ｘ＝ｙ＝１９であり、（Ｎ’）ｙが、１〜１７および１９位における非修飾リボヌクレオチドおよび３’の最後から２番目の位置（１８位、５’＞３’）におけるＬ−ＤＮＡからなる、請求項１２０に記載の核酸分子。
ｘ＝ｙ＝１９であり、（Ｎ’）ｙが、１〜１６および１９位における非修飾リボヌクレオチドおよび３’の最後から２番目の位置（１７および１８位）における２個の連続するＬ−ＤＮＡを含む、請求項１２０に記載の核酸分子。
非定型部分が、隣接するヌクレオチドに２’−５’ヌクレオチド間リン酸結合で連結しているヌクレオチドである、請求項１１８に記載の核酸分子。
隣接するヌクレオチドに２’−５’ヌクレオチド間リン酸結合で連結しているヌクレオチドが、３’−Ｏ−メチル（３’ＯＭｅ）糖修飾をさらに含む、請求項１２３に記載の核酸分子。
下記の構造（Ａ２）：
（Ａ２）５’ Ｎ１−（Ｎ）ｘ−Ｚ３’（アンチセンス鎖）
３’ Ｚ’−Ｎ２−（Ｎ’）ｙ５’（センス鎖）
ここで、Ｎ２、ＮおよびＮ’の各々は、独立して、非修飾リボヌクレオチドまたは修飾リボヌクレオチドまたは非定型部分であり、
（Ｎ）ｘおよび（Ｎ’）ｙの各々は、各々の連続するＮまたはＮ’が隣接するＮまたはＮ’に共有結合によって連結したオリゴヌクレオチドであり、
ｘとｙの各々は、独立して１７〜３９の整数であり、
（Ｎ’）ｙの配列は（Ｎ）ｘの配列に相補性を有し、（Ｎ）ｘは、配列番号１または配列番号２に記載のｍＲＮＡの連続する配列に相補性を有し、
Ｎ１は（Ｎ）ｘに共有結合的に結合しており、配列番号１または配列番号２に記載のｍＲＮＡに対してミスマッチであり、
Ｎ１は、リボウリジン、修飾リボウリジン、デオキシリボウリジン、修飾デオキシリボウリジン、リボアデニン、修飾リボアデニン、デオキシリボアデニンおよび修飾デオキシリボアデニンからなる群から選択される部分であり、
ＺおよびＺ’の各々は、独立して、存在するか、または不在であるが、存在する場合は、独立して、それが存在する鎖の３’末端に共有結合的に付着した、１〜５個の連続するヌクレオチド、非定型部分またはその組合せである
を有する、二本鎖核酸分子。
ｘ＝ｙ＝１８である、請求項１２５に記載の核酸分子。
（Ｎ）ｘが、配列番号１に記載のｍＲＮＡに対するアンチセンス配列を含む、請求項１２５または１２６に記載の核酸分子。
（Ｎ）ｘが、表Ａ５、Ａ６、Ａ７またはＡ８のいずれかに存在するアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む、請求項１２７に記載の核酸分子。
（Ｎ）ｘが、表Ａ７またはＡ８のいずれかに存在するアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む、請求項１２８に記載の核酸分子。
（Ｎ）ｘが、配列番号２に記載のｍＲＮＡに対するアンチセンス配列を含む、請求項１２５または１２６に記載の核酸分子。
（Ｎ）ｘが、表Ｂ５、Ｂ６、Ｂ７またはＢ８のいずれかに存在するアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む、請求項１３０に記載の核酸分子。
（Ｎ）ｘが、表Ｂ７またはＢ８のいずれかに存在するアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む、請求項１３１に記載の核酸分子。
核酸分子であって、一般構造：
ここで、各々のオリゴＡ、オリゴＢ、オリゴＣ、オリゴＤ、オリゴＥおよびオリゴＦは少なくとも１９個の連続するリボヌクレオチドを表し、オリゴＡ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、ＥおよびＦの各々における、１９〜４０個のかかる連続するリボヌクレオチドは、ｓｉＲＮＡ二重鎖の鎖を含み、各々のリボヌクレオチドは修飾されていても、非修飾であってもよく、
鎖１は、核酸分子の第１のｓｉＲＮＡ二重鎖のセンス部分であるか、または、アンチセンス部分であるオリゴＡを含み、鎖２は、オリゴＡにおける少なくとも１９個のヌクレオチドに相補的なオリゴＢを含み、オリゴＡとオリゴＢは、一緒になって、第１の標的ｍＲＮＡを標的とする第１のｓｉＲＮＡ二重鎖を形成し、
鎖１は、核酸分子の第２のｓｉＲＮＡ二重鎖のセンス部分であるか、または、アンチセンス部分であるオリゴＣをさらに含み、鎖３は、オリゴＣにおける少なくとも１９個のヌクレオチドに相補的なオリゴＤを含み、オリゴＣとオリゴＤは、一緒になって、第２の標的ｍＲＮＡを標的とする第２のｓｉＲＮＡ二重鎖を形成し、
鎖４は、核酸分子の第３のｓｉＲＮＡ二重鎖のセンス部分であるか、または、アンチセンス部分であるオリゴＥを含み、鎖２は、オリゴＥにおける少なくとも１９個のヌクレオチドに相補的なオリゴＦを含み、オリゴＥとオリゴＦは、一緒になって、第３の標的ｍＲＮＡを標的とする第３のｓｉＲＮＡ二重鎖を形成し、
リンカーＡはオリゴＡとオリゴＣとを共有結合により連結する部分であり、リンカーＢはオリゴＢとオリゴＦとを共有結合により連結する部分であり、リンカーＡとリンカーＢとは、同一であっても異なっていてもよく、核酸分子は、表Ａ〜Ｂのいずれかに記載された少なくとも１組のアンチセンス鎖とセンス鎖のペアを含む
を有する３本のｓｉＲＮＡ二重鎖を形成する４本のリボヌクレオチド鎖で構成される、前記核酸分子。
請求項１〜１３３のいずれか一項に記載の核酸分子と、薬学的に許容し得る担体とを含む、医薬組成物。
脳、皮膚、腹膜、肝臓、腎臓、心臓、肺、骨髄、眼、脈管、腸、声帯の１または２以上を冒す臓器特異的線維症から選択される疾患または状態に罹患した対象を処置する方法であって、該対象に、請求項１〜１３３のいずれか一項に記載の核酸分子を、前記疾患または状態を処置するために有効な量で投与することを含む、前記方法。
皮膚、腹膜、肝臓、腎臓、心臓、肺、骨髄、眼、脈管、脳、声帯、腸の１または２以上を冒す臓器特異的線維症から選択される疾患または状態に罹患した対象を処置する方法であって、該対象に、請求項１〜１３３のいずれか一項に記載の核酸分子を、前記疾患または状態を処置するために有効な量で投与することを含む、前記方法。
疾患または状態が、肝線維症、あらゆる原因（ＥＳＲＤを含むＣＫＤ）による腎線維症、肺線維症（ＩＬＦを含む）、骨髄線維症、偶発的および医原性（手術）の全ての可能な種類の皮膚損傷に関連する異常な瘢痕化（ケロイド）、強皮症、心線維症、脳梗塞に関連する線維化、緑内障濾過手術の失敗、腸管癒着症などの、線維性状態から選択される、請求項１３６に記載の方法。
患者による使用のために包装された、請求項１〜１３３のいずれか一項に記載の核酸分子を含む組成物。
組成物が、請求項１〜１３３のいずれか一項に記載の核酸分子をどのように用いることができるのかに関する特定の情報を提供するラベルまたは添付文書を含む、請求項１３８に記載の組成物。
ラベルまたは添付文書が投薬情報を含む、請求項１３９に記載の組成物。
ラベルまたは添付文書が使用適応を含む、請求項１３９に記載の組成物。
ラベルまたは添付文書が、請求項１〜１３３のいずれか一項に記載の核酸分子が治療への使用に適することを示す、請求項１３９に記載の組成物。
ラベルまたは添付文書が、請求項１〜１３３のいずれか一項に記載の核酸分子が、ＴＩＭＰ１に関連する疾患に罹患した患者を処置するために適することを示す、請求項１４２に記載の組成物。
ラベルまたは添付文書が、請求項１〜１３３のいずれか一項に記載の核酸分子が、ＴＩＭＰ２に関連する疾患に罹患した患者を処置するために適することを示す、請求項１４２に記載の組成物。
ラベルまたは添付文書が、請求項１〜１３３のいずれか一項に記載の核酸分子が、線維症、肝線維症、肝硬変、肺線維症、腎線維症、腹膜線維症、慢性肝損傷、および原線維形成からなる群から選択される疾患を処置するために適することを示す、請求項１４３または１４４に記載の組成物。