JP2022535648A - ゲンチオオリゴ糖の製造における耐熱性β-グルコシダーゼの使用 - Google Patents
ゲンチオオリゴ糖の製造における耐熱性β-グルコシダーゼの使用 Download PDFInfo
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Abstract
【選択図】図7
Description
(1)前記組換え菌を35~40℃で2~5時間培養して、菌液を得る。
(2)菌液を2500~3500rpmで3~6分遠心分離して、60~90体積%の上清を除去し、残りの10~40体積%の上清をLBプレートに塗布し、35~40℃のインキュベータで10~16時間培養する。
(3)LBプレートから単一コロニーをLB液体培地に採取して7~11時間培養した後、2~6mLの培養液を100mL TB培地に播種し、35~40℃で1.5~3時間培養し、さらに30~34℃で45~50時間培養する。
(4)培養終了後、培養して得た菌液を7000~9000rpmで15~25分遠心分離し、菌体を収集する。
(5)菌体に45~55mLのクエン酸-リン酸二ナトリウム緩衝液を加えて、菌体を再懸濁する。
(6)高圧ホモジナイザーを用いて細胞壁を破壊し、9000~12000rpmで15~25分遠心分離した後、細胞壁破壊上清液である粗酵素液を収集する。
(1)酵素活性単位の定義:1mlの酵素液がpNPGを1分加水分解して1μmolのp-ニトロフェノールを生成する酵素活性を1酵素活性単位とする。
相対酵素活性の計算方法:酵素活性=(A405+0.002)*反応系*希釈倍数/(0.0074*反応時間*酵素添加量)。
(2)酵素活性の測定ステップ
反応系を1mLとして、pH5.0の酢酸緩衝液960μLに、適切に希釈した(好ましくは、反応停止時の反応液の405nm吸光度が0.2~1.2の範囲である)粗酵素液20μLを加え、次に100mmol/L pNPGを20μL加え、60℃の恒温ウォーターバスにて10分反応させ、10分後、直ぐ1mol/L Na2CO3溶液200μLを加えて反応を停止し、氷浴で5分処理し、405nmで光吸収値を測定する。加熱により不活化した酵素液を同様な方法で処理してブランクコントロールとする。
LB培地:酵母粉5g/L、トリプトン10g/L、NaCl 10g/L。
TB培地:酵母粉24g/L、グリセリン5g/L、トリプトン12g/L、K2HPO4・3H2O 16.43g/L、KH2PO4 2.31g/L。
RM培地:酵母エキス5.0g/L、トリプトン10.0g/L、NaCl 10.0g/L、ソルビトール90.0g/L、マンニトール70.0g/L。
(1)組換え菌の細胞壁破壊上清液500mLに35%の固体硫酸アンモニウム50mLを加えて一晩(12時間)塩析する。
(2)塩析後の粗酵素液を4℃、10000rpmで20分遠心分離し、20mMリン酸ナトリウム、0.5M塩化ナトリウム、20mMイミダゾールを含有するpH7.4の緩衝液Aで沈殿を溶解し、緩衝液Aにて一晩(12時間)透析した後、0.22μm膜でろ過し、注入(充填)サンプルとする。
(3)Niアフィニティーカラムを緩衝液Aで平衡化した後、注入サンプルをNiカラムに吸い込み、完全に吸着した後、緩衝液Aを100mL、20~480mMイミダゾールを含有する緩衝液Aを100mL、480mMイミダゾールを含有する緩衝液Aを100mLのそれぞれを用いて、流速1mL/分で溶出することで、480mMイミダゾールを含有する緩衝液Aで目的蛋白であるβ-グルコシダーゼを溶出し、この画分の溶出液を収集する。
(4)上述480mMイミダゾールを含有する蛋白溶出液をpH6.0、50mMのリン酸ナトリウム緩衝液にて一晩透析して、精製したβ-グルコシダーゼの酵素製品を得る。
(5)精製後の組換えβ-グルコシダーゼを電気泳動する。精製後の電気泳動図を図2に示す。
Genbankデータベースにおけるサーモトガ(Thermotoga sp KOL6)β-グルコシダーゼTsbglのアミノ酸配列(WP_101510358)に従って、ヌクレオチド配列が配列番号1で示される遺伝子を化学的に合成した。
合成した遺伝子断片とpET-24aを酵素消化後(酵素消化部位:Nde IとEcoR I)、連結して連結産物を得て、連結産物を熱ショック形質転換法により大腸菌E.coli.JM109に形質転換した。形質転換産物を得て、形質転換産物をLB固体培地(0.05mg/mLカナマイシン含有)に塗布し、37℃の恒温インキュベータで8~12時間倒置培養し、形質転換体を得た。
熱ショック形質転換法:
(1)E.coli.JM109コンピテント細胞を氷に5分放置しておき、コンピテント細胞が完全に溶けた後、完全なプラスミド又はPCR産物を10μL加え、優しくピペッティングして均一にした後、氷に45分放置した。
(2)コンピテント細胞を42℃の水浴鍋に入れて90秒熱ショックし、熱ショック終了後、氷に5分放置した。
(3)氷浴終了後、コンピテント細胞にLB液体培地0.8mLを加え、均一に混合した後、37℃のシェーカーに入れて約60分振とう培養した。
(4)培養が終了したコンピテント細胞を3000rpmで5分遠心分離し、一部の上清液を捨てて、200μL程度の発酵液を残して菌体を再びピペッティングして再懸濁させ、10μg/mLアンピシリン抗生物質含有のLB固体プレートに塗布し、37℃インキュベータで約10時間静置培養し、プレートに単一コロニーを成長させた。
モノクローナルコロニーを10μg/mLアンピシリン含有の耐性LB液体培地に播種し、37℃、120~180rpmの条件下、振とうフラスコ培養を8~12時間行った後、プラスミドを抽出して酵素消化による検証及び配列決定による検証を行い、検証が正確であると組換えプラスミドpET24a-tsbglが得られた。
プラスミドpET24a-tsbglとpBSMμL3をテンプレートとして、上下流に15bpホモロジーアームを含む目的遺伝子プライマーとベクタープライマーをそれぞれ設計し、ホモロジーアームを備える目的遺伝子断片tsbgl(プライマー1と2)及びテンプレート断片pBSMμL3(プライマー3と4)をPCRにより増幅した。
プライマー1:TAAGGAGTGTCAAGAATGAGCATGAAAAAGTTTCCGGAAG(配列番号3);
プライマー2:TTTATTACCAAGCTTTTAATCTTCCAGGCCGTTATTTTTAATAAC(配列番号4);
プライマー3:AAGCTTGGTAATAAAAAAACACCTC(配列番号5);
プライマー4:CATTCTTGACACTCCTTATTTG(配列番号6)。
PCR系:2×Super PfxMasterMix25μL、2本のプライマー各1.25μL、ddH2O 22μL、テンプレート0.5μL。
反応条件:(1)94℃、4分、(2)94℃、1分、(3)55℃、1分、(4)72℃、2分、(2)~(4)を35サイクル増幅後、(5)72℃、5分、(6)4℃で温度を保持し;それぞれ増幅して目的遺伝子断片tsbgl及びテンプレート断片pBSMμL3を得た。
増幅した断片をゲル回収キット(天根生化科技有限公司)で回収し、配列決定による検証を行い、配列決定による検証の結果が正確である2本の回収断片を、In-Fusion HD Cloning Plus kitキットで連結し、連結系として遺伝子断片400 ng、ベクター断片200ng、5×In-Fusion HD Enzyme Premix2μLを用いて、水で10μLとなるまで補充し、連結系を50℃で25分反応し、連結産物を得て、連結産物をクローン宿主JM109(具体的な実施形態は以上の熱ショック形質転換法を参照)に形質転換して、LB固体培地(10μg/mLアンピシリン含有)に塗布し、37℃で8~10時間培養後、単一コロニーをピックアップして100mg/Lアンピシリン含有のLB液体培地に播種し、37℃で10時間培養後、菌体を収集してプラスミドを抽出し(プラスミド抽出キットは天根生化科技有限公司から購入)、pBSMμL3-tsbglプラスミド(図1)を得、酵素消化により検証をして専門会社に配列決定による検証をしてもらった。
酵素消化による検証及び配列決定の結果が正確である組換えプラスミドpBSMμL3-tsbglを線形化した後、Bacillus subtilis WSH11(Bacillus subtilis WSH11は公開番号CN108102997Aの特許に記載)にエレクトロプロレーションした。組換えプラスミドpBSMμL3-tsbglをBacillus subtilis WSH11コンピテント細胞に電気ショックで形質転換した:
(1)Bacillus subtilis WSH11コンピテント細胞を氷上に5分放置しておき、コンピテント細胞が完全に溶けた後、組換えプラスミド10μLを加え、優しくピペッティングして均一にした後、氷上に15分放置した。
(2)エレクトロポレーターを予め起動して30分予熱し、電気ショック電圧を2400Vに設定して、氷浴が終了したコンピテント細胞を、事前に予冷した直径2mmのエレクトロポレーションキュベットに加え、エレクトロポレーションキュベットの外壁に付いた水を拭いた後、エレクトロポレーションキュベットをエレクトロポレーターに入れて電気ショック(エレクトロポレーション)をした。
(3)電気ショック終了後、事前に予冷したRM培地1mLを素早く加え、均一にピペッティングした後、菌液を殺菌したEP管1.5mLに移し、37℃のシェーカーに入れて、200rpmで3時間振とう培養した。
(4)培養が終了した菌液を3000rpmで5分遠心分離し、一部の上清液を捨てて、200μL程度の上清液を残して菌体を改めてピペッティングして再懸濁させ、テトラサイクリン耐性を有するLB固体プレートに塗布し、37℃のインキュベータで約10時間培養し、プレートに単一コロニーを成長させた。
(5)単一コロニーを取り、配列決定により検証をして、プラスミドpBSMμL3-tsbglを含有する陽性形質転換体を得た。
組換えプラスミドpBSMμL3-tsbglを含有する陽性形質転換体をLB液体培地(10μg/mLテトラサイクリン含有)に播種して8~10時間培養した後、培養液5mLをTB培地100mLに播種し、37℃で2時間培養し、さらに33℃で48時間培養し、発酵終了後、8000rpmで20分遠心分離して菌体を収集した。50mM、pH6.0クエン酸-リン酸二ナトリウム緩衝液50mLを菌体に加え、菌体を十分に再懸濁させた後、高圧ホモジナイザーを用いて細胞壁を破壊し、10000rpmで20分遠心分離後、細胞壁破壊上清液である粗酵素液を収集し、OD600が5である粗酵素液の酵素活性は10.41U/mLであった。
収集した粗酵素液を精製して、電気泳動を行い、精製後の電気泳動図を図2に示す。
(1)β-グルコシダーゼTSBGlの最適温度
pNPGを基質として、実施例2で得た精製後のβ-グルコシダーゼを酵素活性測定反応系に加え、pHを6.0として様々な温度で反応させ、酵素活性を測定し、その相対酵素活性を算出して、結果を図3に示し、具体的なデータを表1に示し、以上から、β-グルコシダーゼの最適温度は90℃であることが分かり、90~100℃では、相対酵素活性は85%以上に達する。
(2)β-グルコシダーゼTSBGlの最適pH
pNPGを基質として、実施例2で得た精製後のβ-グルコシダーゼを酵素活性測定反応系に加え、様々なpH下、90℃の恒温水浴にて10分反応させた。反応後の酵素活性を測定し、その相対酵素活性を算出し、結果を図4に示し、具体的なデータを表2に示し、以上から、β-グルコシダーゼの最適pHは6.0であることが分かった。
(3)β-グルコシダーゼTSBGlの熱安定性
pNPGを基質として、実施例3で得た精製後のβ-グルコシダーゼを酵素活性測定反応系に加え、pH6.0では、それぞれ70℃、80℃、90℃の温水浴にて60分間反応させ、60分間内に酵素の酵素活性を測定し、その相対酵素活性を算出し、結果を図5に示し、60分間になったときには、β-グルコシダーゼTSBGlは、70℃、80℃、90℃での相対酵素活性がそれぞれ99.18%、99.31%、99.81%であった。β-グルコシダーゼは、90℃では高い熱安定性を有した。
800g/Lのグルコースを基質として、pH6、90℃で24時間時間反応させ、酵素添加量を300U/g、400U/g、500U/g、600U/g、700U/gとして、高濃度グルコースを基質として逆加水分解活性によりゲンチオオリゴ糖を合成する場合の酵素添加量を研究した。
図6に示す実験結果から、所定の範囲では、基質の転化率は酵素添加量の増加に伴い向上し続けて、酵素添加量が500U/gグルコースに達すると、基質の転化率は10.94%に達し、さらに酵素添加量を増加させると、転化率はほぼ変わらなかった。総合的に考慮すると、500U/gの酵素添加量を選択し、この場合、基質の転化率は10.94%、ゲンチオオリゴ糖の収率は73g/Lに達する。
具体的な実施方法は実施例4を参照できるが、酵素添加量を500U/gグルコースとし、且つβ-グルコシダーゼTSBGlの高温反応の特性により高温でより高い基質濃度下の逆加水分解合成反応を可能とする点が異なり、このため、グルコース基質の濃度(それぞれ800g/L、900g/L、1000g/L、1100g/L、1200g/L)によるゲンチオオリゴ糖の逆加水分解合成の場合の収率及び転化率への影響を調べた。
図7に示す実験結果から、グルコース基質の最終濃度が800g/L、900g/L、1000g/L及び1100g/Lである場合、基質の転化率はそれぞれ10.42%、12.72%、14.43%、14.82%であり、グルコース基質の最終濃度が1200g/Lである場合、ゲンチオオリゴ糖の収率は178.2g/Lに達し、基質の転化率は14.85%であり、これは、今まで該方法によりゲンチオオリゴ糖を合成する最高収率であった。
Claims (12)
- 組換え菌が発現するβ-グルコシダーゼを利用してグルコースによるゲンチオオリゴ糖の生成を触媒し、前記組換え菌は枯草菌を発現宿主として、アミノ酸配列が配列番号2で示されるβ-グルコシダーゼを発現することを特徴とする、ゲンチオオリゴ糖の収率向上方法。
- 前記β-グルコシダーゼの添加量が300~800U/gグルコースであることを特徴とする、請求項1に記載の方法。
- 前記グルコースの濃度は800~1500g/Lであることを特徴とする、請求項1に記載の方法。
- 60~100℃、pH5.0~7.0で20~30時間反応させることを特徴とする、請求項1に記載の方法。
- β-グルコシダーゼをコードする遺伝子であって、
前記遺伝子のヌクレオチド配列が配列番号1で示されることを特徴とする遺伝子。 - 請求項5に記載の遺伝子を運ぶベクター。
- pBSMμL3であることを特徴とする、請求項6に記載のベクター。
- 枯草菌を発現宿主として、アミノ酸配列が配列番号2で示されるβ-グルコシダーゼを発現することを特徴とする、組換え菌。
- 枯草菌を発現宿主とし、請求項5又は7に記載のベクターを含有することを特徴とする、組換え菌。
- 請求項8に記載の組換え菌の発酵によりβ-グルコシダーゼを生産することを特徴とする、β-グルコシダーゼを生産する方法。
- 食品及び化粧品の分野におけるゲンチオオリゴ糖含有製品の調製における請求項1~4又は請求項10のいずれか1項に記載の方法の使用。
- 食品及び化粧品の分野におけるゲンチオオリゴ糖含有製品の調製における請求項5に記載の遺伝子、又は請求項6又は7に記載のベクター、又は請求項8又は9に記載の組換え菌の使用。
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