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JP2024523509A - 子癇前症及び他の血管新生障害の治療のために最適化された抗ｆｌｔ１オリゴヌクレオチド化合物 - Google Patents

子癇前症及び他の血管新生障害の治療のために最適化された抗ｆｌｔ１オリゴヌクレオチド化合物 Download PDF

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Abstract

本開示は、血管新生障害の新規標的に関する。新規オリゴヌクレオチドも提供する。血管新生障害（例えば、子癇前症）の治療のための新規オリゴヌクレオチドの使用方法も提供される。
【選択図】なし

Description

関連出願
本出願は、２０２１年６月２３日に出願された米国仮特許出願第６３／２１４，２２４号の利益を主張するものであり、その開示全体が参照により本明細書に援用される。
技術分野
本開示は、血管新生障害（例えば、子癇前症）を治療するための新規血管新生標的及び新規オリゴヌクレオチド化合物に関する。
子癇前症（ＰＥ）は、世界中の妊娠中の５～８％に起こる重篤な進行性の致死的合併症であり、その結果、早産のほか、母体及び胎児両方の罹患率及び死亡率が増加する。高血圧及びタンパク尿を特徴とし、ＰＥは、広範囲の腎損傷及び肝損傷、溶血、血小板減少及び死を引き起こし得る。
ＰＥの母体の症状は、主に、高レベルの胎盤分泌可溶性ｆｍｓ様チロシンキナーゼ－１（ｓＦＬＴ１）によって引き起こされ、これは本疾患の診断及び予後の両方のマーカーである。研究により、ｓＦＬＴ１がＰＥの治療のための有望な治療標的であることが示されている。
これまでの研究では、妊娠中のマウス及び非ヒト霊長類において、胎盤及び循環中のｓＦＬＴ１のレベルを両方とも低下させるためにｓＦＬＴ１の主要なアイソフォームを標的とするｓｉＲＮＡが同定されている（Ｔｕｒａｎｏｖ ｅｔ．ａｌ．Ｎａｔ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．２０１８ Ｎｏｖ １９：１０．１０３８／ｎｂｔ．４２９７）。しかし、妊婦における治療的使用のために最適化されたｓｉＲＮＡの開発が依然として必要とされている。
本発明は、ｓＦＬＴ１タンパク質をコードし、かつ全長ＦＬＴ１（ｆｌ－ＦＬＴ１）タンパク質をコードしていないｍＲＮＡアイソフォームを標的にする最適化されたオリゴヌクレオチドの発見に一部基づく。本発明の新規オリゴヌクレオチドは、ＰＥ、分娩後ＰＥ、子癇、及び／またはＨＥＬＬＰ症候群を治療するために使用することができる。本発明の新規オリゴヌクレオチド配列（例えば、低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ））は、ｆｌ－ＦＬＴ１中に存在しない配列の１つ以上、例えば、１つ以上のｓＦＬＴ１タンパク質をコードするｍＲＮＡの１つ以上のイントロン領域に結合することによって、ｆｌ－ＦＬＴ１に影響を与えることなく、ｓＦＬＴ１レベルを選択的に減少させるように操作されている。本明細書に記載の新規の最適化されたオリゴヌクレオチド（例えばｓｉＲＮＡ）は、胎児に送達することなく母体に全身的（すなわち、静脈内または皮下）送達を用いて、胎盤栄養膜細胞（過剰なｓＦＬＴ１産生の原因となる細胞型）に優先的に送達され得る。特定の実施形態では、本明細書に記載の最適化されたオリゴヌクレオチドは、高レベルのサイレンシング効果を保持し、胎盤組織の蓄積の増加、オフターゲット組織の蓄積の減少、ｓｉＲＮＡ分解の減少、毒性の減少、及びより広い治療指数を有する。
いくつかの態様では、本開示は、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子を提供し、本ｄｓＲＮＡは、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖は、５’末端及び３’末端を有し、ここで、（１）アンチセンス鎖は、５’ＣＴＣＴＣＧＧＡＴＣＴＣＣＡＡＡＴＴＴＡ３’（配列番号１）または５’ＣＡＴＣＡＴＡＧＣＴＡＣＣＡＴＴＴＡＴＴ３’（配列番号２）の核酸配列に実質的に相補的な配列を含み；（２）アンチセンス鎖は、少なくとも２０ヌクレオチド長であり；（３）アンチセンス鎖は、少なくとも５０％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；（４）アンチセンス鎖の５’末端から２位、４位、５位、６位、８位、１０位、１２位、１４位、１６位、及び２０位のいずれか１つ以上のヌクレオチドは、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく；（５）アンチセンス鎖の３’末端から１～２位から１～８位のヌクレオチドは、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されており；（６）アンチセンス鎖の一部が、センス鎖の一部に相補的である。
別の態様では、本開示は、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子を提供し、本ｄｓＲＮＡは、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖は、５’末端及び３’末端を有し、ここで、（１）アンチセンス鎖は、５’ＣＴＣＴＣＧＧＡＴＣＴＣＣＡＡＡＴＴＴＡ３’（配列番号１）または５’ＣＡＴＣＡＴＡＧＣＴＡＣＣＡＴＴＴＡＴＴ３’（配列番号２）の核酸配列に実質的に相補的な配列を含み；（２）アンチセンス鎖は、少なくとも２０ヌクレオチド長であり；（３）アンチセンス鎖は、少なくとも５０％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；（４）アンチセンス鎖の５’末端から２位、４位、５位、６位、８位、１０位、１２位、１４位、１６位、及び２０位のいずれか１つ以上のヌクレオチドは、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく；（５）アンチセンス鎖の３’末端から１～２位から１～８位のヌクレオチドは、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されており；（６）アンチセンス鎖の一部が、センス鎖の一部に相補的であり；（７）センス鎖は、少なくとも１５のヌクレオチド長であり；（８）センス鎖は、少なくとも６５％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；（９）センス鎖の５’末端から、４位、６位、８位、１０位、及び１４位のいずれか１つ以上のヌクレオチドは、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく；（１０）センス鎖の５’末端から１～２位のヌクレオチドが、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されている。
特定の実施形態では、アンチセンス鎖の５’末端から２位、４位、５位、６位、８位、１０位、１２位、１４位、１６位、及び２０位のヌクレオチドは、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではない。
いくつかの態様では、本開示は、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）を提供し、本ｄｓＲＮＡは、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖は、５’末端及び３’末端を有し、ここで、（１）アンチセンス鎖は、５’ＣＴＣＴＣＧＧＡＴＣＴＣＣＡＡＡＴＴＴＡ３’（配列番号１）または５’ＣＡＴＣＡＴＡＧＣＴＡＣＣＡＴＴＴＡＴＴ３’（配列番号２）の核酸配列に実質的に相補的な配列を含み；（２）アンチセンス鎖が、２’－メトキシ－リボヌクレオチド及び２’－フルオロ－リボヌクレオチドを交互に含み；（３）アンチセンス鎖の５’末端から２位及び１４位のヌクレオチドが、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく；（４）アンチセンス鎖の３’末端から１～２位から１～７位のヌクレオチドは、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されており；（５）アンチセンス鎖の一部が、センス鎖の一部に相補的である。
別の態様では、本開示は、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）を提供し、本ｄｓＲＮＡは、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖は、５’末端及び３’末端を有し、ここで、（１）アンチセンス鎖は、５’ＣＴＣＴＣＧＧＡＴＣＴＣＣＡＡＡＴＴＴＡ３’（配列番号１）または５’ＣＡＴＣＡＴＡＧＣＴＡＣＣＡＴＴＴＡＴＴ３’（配列番号２）の核酸配列に実質的に相補的な配列を含み；（２）アンチセンス鎖が、２’－メトキシ－リボヌクレオチド及び２’－フルオロ－リボヌクレオチドを交互に含み；（３）アンチセンス鎖の５’末端から２位及び１４位のヌクレオチドが、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく；（４）アンチセンス鎖の３’末端から１～２位から１～７位のヌクレオチドは、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されており；（５）アンチセンス鎖の一部が、センス鎖の一部に相補的であり；（６）センス鎖は、２’－メトキシ－リボヌクレオチド及び２’－フルオロ－リボヌクレオチドを交互に含み；（７）センス鎖の５’末端から１～２位のヌクレオチドが、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されている。
いくつかの態様では、本開示は、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子を提供し、本ｄｓＲＮＡは、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖は、５’末端及び３’末端を有し、ここで、（１）アンチセンス鎖は、５’ＣＴＣＴＣＧＧＡＴＣＴＣＣＡＡＡＴＴＴＡ３’（配列番号１）または５’ＣＡＴＣＡＴＡＧＣＴＡＣＣＡＴＴＴＡＴＴ３’（配列番号２）の核酸配列に実質的に相補的な配列を含み；（２）アンチセンス鎖は、少なくとも２０ヌクレオチド長であり；（３）アンチセンス鎖は、少なくとも５０％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；（４）アンチセンス鎖の５’末端から２位、４位、５位、６位、８位、１０位、１２位、１４位、１６位、及び１８位のいずれか１つ以上のヌクレオチドは、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく；（５）アンチセンス鎖の３’末端から１～２位から１～８位のヌクレオチドは、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されており；（６）アンチセンス鎖の一部が、センス鎖の一部に相補的である。
別の態様では、本開示は、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子を提供し、本ｄｓＲＮＡは、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖は、５’末端及び３’末端を有し、ここで、（１）アンチセンス鎖は、５’ＣＴＣＴＣＧＧＡＴＣＴＣＣＡＡＡＴＴＴＡ３’（配列番号１）または５’ＣＡＴＣＡＴＡＧＣＴＡＣＣＡＴＴＴＡＴＴ３’（配列番号２）の核酸配列に実質的に相補的な配列を含み；（２）アンチセンス鎖は、少なくとも２０ヌクレオチド長であり；（３）アンチセンス鎖は、少なくとも５０％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；（４）アンチセンス鎖の５’末端から２位、４位、５位、６位、８位、１０位、１２位、１４位、１６位、及び１８位のいずれか１つ以上のヌクレオチドは、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく；（５）アンチセンス鎖の３’末端から１～２位から１～８位のヌクレオチドは、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されており；（６）アンチセンス鎖の一部が、センス鎖の一部に相補的であり；（７）センス鎖は、少なくとも１５のヌクレオチド長であり；（８）センス鎖は、少なくとも８０％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；（９）センス鎖の５’末端から、７位、９位、及び１１位のいずれか１つ以上のヌクレオチドは、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく；（１０）センス鎖の５’末端から１～２位のヌクレオチドが、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されている。
特定の実施形態では、アンチセンス鎖の５’末端から２位、４位、５位、６位、８位、１０位、１２位、１４位、１６位、及び１８位のヌクレオチドは、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではない。
特定の実施形態では、センス鎖の５’末端から７位、９位及び１１位のヌクレオチドは、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではない。
いくつかの態様では、本開示は、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子を提供し、本ｄｓＲＮＡは、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖は、５’末端及び３’末端を有し、ここで、（１）アンチセンス鎖は、５’ＣＴＣＴＣＧＧＡＴＣＴＣＣＡＡＡＴＴＴＡ３’（配列番号１）または５’ＣＡＴＣＡＴＡＧＣＴＡＣＣＡＴＴＴＡＴＴ３’（配列番号２）の核酸配列に実質的に相補的な配列を含み；（２）アンチセンス鎖は、少なくとも２０ヌクレオチド長であり；（３）アンチセンス鎖は、少なくとも７０％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；（４）アンチセンス鎖の５’末端から２位、４位、５位、６位、８位、及び１４位のいずれか１つ以上のヌクレオチドは、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく；（５）アンチセンス鎖の３’末端から１～２位から１～８位のヌクレオチドは、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されており；（６）アンチセンス鎖の一部が、センス鎖の一部に相補的である。
別の態様では、本開示は、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子を提供し、本ｄｓＲＮＡは、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖は、５’末端及び３’末端を有し、ここで、（１）アンチセンス鎖は、５’ＣＴＣＴＣＧＧＡＴＣＴＣＣＡＡＡＴＴＴＡ３’（配列番号１）または５’ＣＡＴＣＡＴＡＧＣＴＡＣＣＡＴＴＴＡＴＴ３’（配列番号２）の核酸配列に実質的に相補的な配列を含み；（２）アンチセンス鎖は、少なくとも２０ヌクレオチド長であり；（３）アンチセンス鎖は、少なくとも７０％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；（４）アンチセンス鎖の５’末端から２位、４位、５位、６位、８位、及び１４位のいずれか１つ以上のヌクレオチドは、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく；（５）アンチセンス鎖の３’末端から１～２位から１～８位のヌクレオチドは、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されており；（６）アンチセンス鎖の一部が、センス鎖の一部に相補的であり；（７）センス鎖は、少なくとも１５のヌクレオチド長であり；（８）センス鎖は、１００％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；（９）センス鎖の５’末端から１～２位のヌクレオチドが、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されている。
特定の実施形態では、アンチセンス鎖の５’末端から２位、４位、５位、６位、８位、及び１４位のヌクレオチドは、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではない。
いくつかの態様では、本開示は、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子を提供し、本ｄｓＲＮＡは、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖は、５’末端及び３’末端を有し、ここで、（１）アンチセンス鎖は、５’ＣＴＣＴＣＧＧＡＴＣＴＣＣＡＡＡＴＴＴＡ３’（配列番号１）または５’ＣＡＴＣＡＴＡＧＣＴＡＣＣＡＴＴＴＡＴＴ３’（配列番号２）の核酸配列に実質的に相補的な配列を含み；（２）アンチセンス鎖は、少なくとも２０ヌクレオチド長であり；（３）アンチセンス鎖は、少なくとも７５％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；（４）アンチセンス鎖の５’末端から２位、４位、５位、６位、及び１４位のいずれか１つ以上のヌクレオチドは、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく；（５）アンチセンス鎖の３’末端から１～２位から１～８位のヌクレオチドは、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されており；（６）アンチセンス鎖の一部が、センス鎖の一部に相補的である。
別の態様では、本開示は、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子を提供し、本ｄｓＲＮＡは、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖は、５’末端及び３’末端を有し、ここで、（１）アンチセンス鎖は、５’ＣＴＣＴＣＧＧＡＴＣＴＣＣＡＡＡＴＴＴＡ３’（配列番号１）または５’ＣＡＴＣＡＴＡＧＣＴＡＣＣＡＴＴＴＡＴＴ３’（配列番号２）の核酸配列に実質的に相補的な配列を含み；（２）アンチセンス鎖は、少なくとも２０ヌクレオチド長であり；（３）アンチセンス鎖は、少なくとも７５％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；（４）アンチセンス鎖の５’末端から２位、４位、５位、６位、及び１４位のいずれか１つ以上のヌクレオチドは、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく；（５）アンチセンス鎖の３’末端から１～２位から１～８位のヌクレオチドは、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されており；（６）アンチセンス鎖の一部が、センス鎖の一部に相補的であり；（７）センス鎖は、少なくとも１５のヌクレオチド長であり；（８）センス鎖は、１００％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；（９）センス鎖の５’末端から１～２位のヌクレオチドが、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されている。
いくつかの態様では、本開示は、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子を提供し、本ｄｓＲＮＡは、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖は、５’末端及び３’末端を有し、ここで、（１）アンチセンス鎖は、５’ＣＴＣＴＣＧＧＡＴＣＴＣＣＡＡＡＴＴＴＡ３’（配列番号１）または５’ＣＡＴＣＡＴＡＧＣＴＡＣＣＡＴＴＴＡＴＴ３’（配列番号２）の核酸配列に実質的に相補的な配列を含み；（２）アンチセンス鎖は、少なくとも２０ヌクレオチド長であり；（３）アンチセンス鎖は、少なくとも８５％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；（４）アンチセンス鎖の５’末端から２位及び１４位のいずれか１つ以上のヌクレオチドは、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく；（５）アンチセンス鎖の３’末端から１～２位から１～８位のヌクレオチドは、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されており；（６）アンチセンス鎖の一部が、センス鎖の一部に相補的である。
別の態様では、本開示は、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子を提供し、本ｄｓＲＮＡは、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖は、５’末端及び３’末端を有し、ここで、（１）アンチセンス鎖は、５’ＣＴＣＴＣＧＧＡＴＣＴＣＣＡＡＡＴＴＴＡ３’（配列番号１）または５’ＣＡＴＣＡＴＡＧＣＴＡＣＣＡＴＴＴＡＴＴ３’（配列番号２）の核酸配列に実質的に相補的な配列を含み；（２）アンチセンス鎖は、少なくとも２０ヌクレオチド長であり；（３）アンチセンス鎖は、少なくとも８５％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；（４）アンチセンス鎖の５’末端から２位及び１４位のいずれか１つ以上のヌクレオチドは、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく；（５）アンチセンス鎖の３’末端から１～２位から１～８位のヌクレオチドは、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されており；（６）アンチセンス鎖の一部が、センス鎖の一部に相補的であり；（７）センス鎖は、少なくとも１５のヌクレオチド長であり；（８）センス鎖は、１００％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；（９）センス鎖の５’末端から１～２位のヌクレオチドが、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されている。
特定の実施形態では、アンチセンス鎖は、２０ヌクレオチド長である。特定の実施形態では、アンチセンス鎖は、２１ヌクレオチド長である。特定の実施形態では、アンチセンス鎖は、２２ヌクレオチド長である。
特定の実施形態では、センス鎖は、１５ヌクレオチド長である。特定の実施形態では、センス鎖は、１６ヌクレオチド長である。特定の実施形態では、センス鎖は、１８ヌクレオチド長である。特定の実施形態では、センス鎖は、２０ヌクレオチド長である。
特定の実施形態では、ｄｓＲＮＡは、１５塩基対～２０塩基対の二本鎖領域を含む。特定の実施形態では、ｄｓＲＮＡは、１５塩基対の二本鎖領域を含む。特定の実施形態では、ｄｓＲＮＡは、１６塩基対の二本鎖領域を含む。特定の実施形態では、ｄｓＲＮＡは、１８塩基対の二本鎖領域を含む。特定の実施形態では、ｄｓＲＮＡは、２０塩基対の二本鎖領域を含む。
特定の実施形態では、ｄｓＲＮＡは、平滑末端を含む。
特定の実施形態では、ｄｓＲＮＡは、少なくとも１つの一本鎖ヌクレオチドオーバーハングを含む。
特定の実施形態では、ｄｓＲＮＡは、約２ヌクレオチド～５ヌクレオチドの一本鎖ヌクレオチドオーバーハングを含む。
特定の実施形態では、ｄｓＲＮＡは、４～１６のホスホロチオエートヌクレオチド間連結を含む。特定の実施形態では、ｄｓＲＮＡは、８～１３のホスホロチオエートヌクレオチド間連結を含む。
特定の実施形態では、センス鎖は、アンチセンス鎖とセンス鎖との間に１つ以上のヌクレオチドミスマッチを含む。
特定の実施形態では、アンチセンス鎖は、５’ホスフェート、５’－アルキルホスホネート、５’アルキレンホスホネート、または５’アルケニルホスホネートを含む。
特定の実施形態では、アンチセンス鎖は、５’ビニルホスホネートを含む。
特定の実施形態では、機能部分は、センス鎖の３’末端に連結されている。
特定の実施形態では、機能部分は、疎水性部分を含む。
特定の実施形態では、疎水性部分は、脂肪酸、ステロイド、セコステロイド、脂質、ガングリオシド、ヌクレオシド類似体、エンドカンナビノイド、ビタミン、及びそれらの混合物からなる群から選択される。
特定の実施形態では、ステロイドは、コレステロール及びリトコール酸（ＬＣＡ）からなる群から選択される。
特定の実施形態では、脂肪酸は、エイコサペンタエン酸（ＥＰＡ）、ドコサヘキサエン酸（ＤＨＡ）、及びドコサン酸（ＤＣＡ）からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、脂肪酸は、ＥＰＡである。いくつかの実施形態では、脂肪酸は、ＤＨＡである。いくつかの実施形態では、脂肪酸は、ＤＣＡである。いくつかの実施形態では、脂肪酸は、ＰＣ－ＤＣＡである。
特定の実施形態では、ビタミンは、コリン、ビタミンＡ、ビタミンＥ、及びそれらの誘導体、またはそれらの代謝物からなる群から選択される。
特定の実施形態では、機能部分は、リンカーにより、センス鎖に連結されている。
特定の実施形態では、リンカーは、切断可能なリンカーである。
特定の実施形態では、切断可能なリンカーは、ホスホジエステル連結、ジスルフィド連結、酸に不安定な連結、または光切断可能な連結を含む。
特定の実施形態では、切断可能なリンカーは、ホスホジエステルヌクレオチド間連結を有するｄＴｄＴジヌクレオチドを含む。
特定の実施形態では、酸に不安定な連結は、β－チオプロピオネート連結またはカルボキシジメチルマレイン酸無水物（ＣＤＭ）連結を含む。
特定の実施形態では、リンカーは、二価または三価のリンカーを含む。







特定の実施形態では、二価または三価のリンカーは、
（式中、ｎは、１、２、３、４、または５である）からなる群から選択される。
特定の実施形態では、リンカーは、エチレングリコール鎖、アルキル鎖、ペプチド、ＲＮＡ、ＤＮＡ、ホスホジエステル、ホスホロチオエート、ホスホルアミデート、アミド、カルバメート、またはそれらの組み合わせを含む。
特定の実施形態では、リンカーが三価リンカーである場合、リンカーは、ホスホジエステルまたはホスホジエステル誘導体をさらに連結する。
特定の実施形態では、リンカーは、ホスホジエステルまたはホスホジエステル誘導体をさらに連結する。



















特定の実施形態では、ホスホジエステルまたはホスホジエステル誘導体は、以下からなる群から選択される：
（式中、Ｘは、Ｏ、ＳまたはＢＨ３である）。
特定の実施形態では、センス鎖の３’末端から１位及び２位のヌクレオチド、及びアンチセンス鎖の５’末端から１位及び２位のヌクレオチドは、ホスホロチオエート連結を介して隣接するリボヌクレオチドに結合される。
特定の実施形態では、相補性の領域は、配列番号１または配列番号２の少なくとも１５、１６、１７または１８の連続するヌクレオチドと相補的である。
特定の実施形態では、相補性の領域は、配列番号１または配列番号２と３つを超えるミスマッチは含まない。
特定の実施形態では、相補性の領域は、配列番号１または配列番号２に対して完全に相補的である。
特定の実施形態では、アンチセンス鎖は、５’ＵＡＡＡＵＵＵＧＧＡＧＡＵＣＣＧＡＧＡＧＡ３’の核酸配列を含むかまたはそれからなり、センス鎖は５’ＣＧＧＡＵＣＵＣＣＡＡＡＵＵＵＡ３’の核酸配列を含むかまたはそれからなる。
特定の実施形態では、アンチセンス鎖は、５’ＵＡＵＡＡＡＵＧＧＵＡＧＣＵＡＵＧＡＵＧＡ３’の核酸配列を含むかまたはそれからなり、センス鎖は５’ＡＵＡＧＣＵＡＣＣＡＵＵＵＡＵＡ３’の核酸配列を含むかまたはそれからなる。
いくつかの実施形態では、本開示は、ｄｓＲＮＡ分子の塩を提供する。いくつかの実施形態では、塩は、ナトリウム塩またはカリウム塩を含む。いくつかの実施形態では、塩は、薬学的に許容される塩を含む。
特定の実施形態では、細胞または生物におけるｓＦＬＴ１タンパク質の発現は、少なくとも約２０％低下する。
一態様では、本開示は、ＰＥ、分娩後ＰＥ、子癇またはＨＥＬＬＰ症候群を治療または管理する方法を提供し、本方法は、このような治療または管理を必要とする対象に、治療有効量の上記のｄｓＲＮＡを投与することを含む。
いくつかの態様では、本開示は、ＰＥを治療または管理する方法を提供し、本方法は、このような治療または管理を必要とする対象に、治療有効量の上記のｄｓＲＮＡを投与することを含む。
いくつかの態様では、本開示は、分娩後ＰＥを治療または管理する方法を提供し、本方法は、このような治療または管理を必要とする対象に、治療有効量の上記のｄｓＲＮＡを投与することを含む。
いくつかの態様では、本開示は、子癇を治療または管理する方法を提供し、本方法は、このような治療または管理を必要とする対象に、治療有効量の上記のｄｓＲＮＡを投与することを含む。
いくつかの態様では、本開示は、ＨＥＬＬＰ症候群を治療または管理する方法を提供し、本方法は、このような治療または管理を必要とする対象に、治療有効量の上記のｄｓＲＮＡを投与することを含む。
特定の実施形態では、医薬組成物は、静脈内または皮下投与される。
特定の実施形態では、ｓＦＬＴ１タンパク質の発現は、対象において少なくとも約２０％低下する。
一態様では、本開示は、ＰＥ、分娩後ＰＥ、子癇またはＨＥＬＬＰ症候群のうちの１つ以上の症状の治療を必要とする対象において、それを行う方法を提供し、本方法は、上記のｄｓＲＮＡを対象に投与することを含む。
一態様では、本開示は、血管新生障害の１つ以上の症状の治療を必要とする対象において、それを行う方法を提供し、本方法は、上記のｄｓＲＮＡを対象に投与することを含む。
特定の実施形態では、血管新生障害は、ＰＥ、分娩後ＰＥ、子癇及びＨＥＬＬＰ症候群からなる群から選択される。
一態様では、本開示は、第１のｄｓＲＮＡと、第２のｄｓＲＮＡと、薬学的に許容される担体と、を含む医薬組成物を提供し、ここで、第１のｄｓＲＮＡは、第１のセンス鎖及び第１のアンチセンス鎖を含み、上記第１のアンチセンス鎖は、配列番号１に実質的に相補的な相補性領域を含み、上記第１のｄｓＲＮＡは、上記のｄｓＲＮＡを含み；かつ、上記第２のｄｓＲＮＡは、第２のセンス鎖及び第２のアンチセンス鎖を含み、上記第２のアンチセンス鎖は、配列番号２に実質的に相補的な相補性領域を含み、上記第２のｄｓＲＮＡは、上記のｄｓＲＮＡを含む。
一態様では、本開示は、第１のｄｓＲＮＡと、第２のｄｓＲＮＡと、薬学的に許容される担体と、を含む医薬組成物を提供し、ここで、上記第１のｄｓＲＮＡは、第１のセンス鎖及び第１のアンチセンス鎖を含み、各鎖は、５’末端及び３’末端を有し、上記第２のｄｓＲＮＡは、第２のセンス鎖及び第２のアンチセンス鎖を含み、各鎖は、５’末端及び３’末端を有し、ここで、第１のアンチセンス鎖は、配列番号１と実質的に相補的である相補性領域を含み；第２のアンチセンス鎖は、配列番号２と実質的に相補的である相補性領域を含み；第１のｄｓＲＮＡ及び第２のｄｓＲＮＡのそれぞれについて：（１）アンチセンス鎖は、少なくとも２０ヌクレオチド長であり；（３）アンチセンス鎖は、少なくとも５０％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；（４）アンチセンス鎖の５’末端から２位、４位、５位、６位、８位、１０位、１２位、１４位、１６位、及び２０位のいずれか１つ以上のヌクレオチドは、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく；（５）アンチセンス鎖の３’末端から１～２位から１～８位のヌクレオチドは、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されており；（６）アンチセンス鎖の一部が、センス鎖の一部に相補的であり；（７）センス鎖は、少なくとも１５のヌクレオチド長であり；（８）センス鎖は、少なくとも６５％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；（９）センス鎖の５’末端から、４位、６位、８位、１０位、及び１４位のいずれか１つ以上のヌクレオチドは、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく；（１０）センス鎖の５’末端から１～２位のヌクレオチドは、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されている。
いくつかの態様では、本開示は、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖が５’末端及び３’末端を有する二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子を提供し、ここで、（１）アンチセンス鎖は、（ｍＵ）＃（ｆＡ）＃（ｍＡ）（ｆＡ）（ｆＵ）（ｆＵ）（ｍＵ）（ｆＧ）（ｍＧ）（ｆＡ）（ｍＧ）（ｆＡ）（ｍＵ）（ｆＣ）＃（ｍＣ）＃（ｆＧ）＃（ｍＡ）＃（ｍＧ）＃（ｍＡ）＃（ｆＧ）＃（ｍＡ）を含み；（２）センス鎖は、（ｍＣ）＃（ｍＧ）＃（ｍＧ）（ｆＡ）（ｍＵ）（ｆＣ）（ｍＵ）（ｆＣ）（ｍＣ）（ｆＡ）（ｍＡ）（ｍＡ）（ｍＵ）（ｆＵ）＃（ｍＵ）＃（ｍＡ）を含み、ここで、「ｍ」は、２’－Ｏ－メチル修飾に対応し、「ｆ」は、２’－フルオロ修飾に対応し、「＃」は、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結に対応する。
いくつかの態様では、本開示は、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖が５’末端及び３’末端を有する二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子を提供し、ここで、アンチセンス鎖は、（ｍＵ）＃（ｆＡ）＃（ｍＡ）（ｆＡ）（ｆＵ）（ｆＵ）（ｍＵ）（ｆＧ）（ｍＧ）（ｆＡ）（ｍＧ）（ｆＡ）（ｍＵ）（ｆＣ）＃（ｍＣ）＃（ｆＧ）＃（ｍＡ）＃（ｍＧ）＃（ｍＡ）＃（ｆＧ）＃（ｍＡ）を含み；ここで、「ｍ」は、２’－Ｏ－メチル修飾に対応し、「ｆ」は、２’－フルオロ修飾に対応し、「＃」は、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結に対応する。
いくつかの態様では、本開示は、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖が５’末端及び３’末端を有する二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子を提供し、ここで、センス鎖は、（ｍＣ）＃（ｍＧ）＃（ｍＧ）（ｆＡ）（ｍＵ）（ｆＣ）（ｍＵ）（ｆＣ）（ｍＣ）（ｆＡ）（ｍＡ）（ｍＡ）（ｍＵ）（ｆＵ）＃（ｍＵ）＃（ｍＡ）を含み、ここで、「ｍ」は、２’－Ｏ－メチル修飾に対応し、「ｆ」は、２’－フルオロ修飾に対応し、「＃」は、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結に対応する。
いくつかの態様では、本開示は、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖が５’末端及び３’末端を有する二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子を提供し、（１）アンチセンス鎖は、（ｍＵ）＃（ｆＡ）＃（ｍＵ）（ｆＡ）（ｆＡ）（ｆＡ）（ｍＵ）（ｆＧ）（ｍＧ）（ｆＵ）（ｍＡ）（ｆＧ）（ｍＣ）（ｆＵ）＃（ｍＡ）＃（ｆＵ）＃（ｍＧ）＃（ｍＡ）＃（ｍＵ）＃（ｆＧ）＃（ｍＡ）を含み；（２）センス鎖は、（ｍＡ）＃（ｍＵ）＃（ｍＡ）（ｆＧ）（ｍＣ）（ｆＵ）（ｍＡ）（ｆＣ）（ｍＣ）（ｆＡ）（ｍＵ）（ｍＵ）（ｍＵ）（ｆＡ）＃（ｍＵ）＃（ｍＡ）を含み、ここで、「ｍ」は、２’－Ｏ－メチル修飾に対応し、「ｆ」は、２’－フルオロ修飾に対応し、「＃」は、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結に対応する。
いくつかの態様では、本開示は、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖が５’末端及び３’末端を有する二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子を提供し、ここで、アンチセンス鎖は、（ｍＵ）＃（ｆＡ）＃（ｍＵ）（ｆＡ）（ｆＡ）（ｆＡ）（ｍＵ）（ｆＧ）（ｍＧ）（ｆＵ）（ｍＡ）（ｆＧ）（ｍＣ）（ｆＵ）＃（ｍＡ）＃（ｆＵ）＃（ｍＧ）＃（ｍＡ）＃（ｍＵ）＃（ｆＧ）＃（ｍＡ）を含み；ここで、「ｍ」は、２’－Ｏ－メチル修飾に対応し、「ｆ」は、２’－フルオロ修飾に対応し、「＃」は、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結に対応する。
いくつかの態様では、本開示は、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖が５’末端及び３’末端を有する二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子を提供し、ここで、センス鎖は、（ｍＡ）＃（ｍＵ）＃（ｍＡ）（ｆＧ）（ｍＣ）（ｆＵ）（ｍＡ）（ｆＣ）（ｍＣ）（ｆＡ）（ｍＵ）（ｍＵ）（ｍＵ）（ｆＡ）＃（ｍＵ）＃（ｍＡ）を含み、ここで、「ｍ」は、２’－Ｏ－メチル修飾に対応し、「ｆ」は、２’－フルオロ修飾に対応し、「＃」は、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結に対応する。
いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、５’ビニルホスホネートを含む。
いくつかの実施形態では、ｄｓＲＮＡは、センス鎖の３’末端に連結されたドコサン酸（ＤＣＡ）コンジュゲートを含む。
いくつかの実施形態では、ＤＣＡは、リンカーによってセンス鎖に連結されている。
いくつかの実施形態では、リンカーは、切断可能なリンカーである。
いくつかの実施形態では、切断可能なリンカーは、ホスホジエステル連結、ジスルフィド連結、酸に不安定な連結、または光切断可能な連結を含む。
いくつかの実施形態では、切断可能なリンカーは、ホスホジエステルヌクレオチド間連結を有するｄＴｄＴジヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、リンカーは、二価または三価のリンカーを含む。
いくつかの実施形態では、二価または三価のリンカーは、
（式中、ｎは、１、２、３、４または５である）からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、リンカーが三価リンカーである場合、リンカーは、ホスホジエステルまたはホスホジエステル誘導体をさらに連結する。
いくつかの実施形態では、ホスホジエステルまたはホスホジエステル誘導体は、以下からなる群から選択される：
（式中、Ｘは、Ｏ、ＳまたはＢＨ３である）。
いくつかの態様では、本開示は、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖が５’末端及び３’末端を有する二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子を提供し、ここで、（１）アンチセンス鎖は、Ｖ（ｍＵ）＃（ｆＡ）＃（ｍＡ）（ｆＡ）（ｆＵ）（ｆＵ）（ｍＵ）（ｆＧ）（ｍＧ）（ｆＡ）（ｍＧ）（ｆＡ）（ｍＵ）（ｆＣ）＃（ｍＣ）＃（ｆＧ）＃（ｍＡ）＃（ｍＧ）＃（ｍＡ）＃（ｆＧ）＃（ｍＡ）を含み；（２）センス鎖は、（ｍＣ）＃（ｍＧ）＃（ｍＧ）（ｆＡ）（ｍＵ）（ｆＣ）（ｍＵ）（ｆＣ）（ｍＣ）（ｆＡ）（ｍＡ）（ｍＡ）（ｍＵ）（ｆＵ）＃（ｍＵ）＃（ｍＡ）（Ｔ）（Ｔ）－ＰＣＤＣＡを含み、ここで、「ｍ」は、２’－Ｏ－メチル修飾に対応し、「ｆ」は、２’－フルオロ修飾に対応し、「Ｔ」は、チミジンＤＮＡヌクレオチドに対応し、「＃」は、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結に対応し、「Ｖ」は、５’－ビニルホスホネートに対応し、「ＰＣＤＣＡ」は、リン酸リンカーを介した３’－Ｃ７－ホスホコリン－ドコサン酸コンジュゲートに対応する。
いくつかの態様では、本開示は、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖が５’末端及び３’末端を有する二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子を提供し、（１）アンチセンス鎖は、Ｖ（ｍＵ）＃（ｆＡ）＃（ｍＵ）（ｆＡ）（ｆＡ）（ｆＡ）（ｍＵ）（ｆＧ）（ｍＧ）（ｆＵ）（ｍＡ）（ｆＧ）（ｍＣ）（ｆＵ）＃（ｍＡ）＃（ｆＵ）＃（ｍＧ）＃（ｍＡ）＃（ｍＵ）＃（ｆＧ）＃（ｍＡ）を含み；（２）センス鎖は、（ｍＡ）＃（ｍＵ）＃（ｍＡ）（ｆＧ）（ｍＣ）（ｆＵ）（ｍＡ）（ｆＣ）（ｍＣ）（ｆＡ）（ｍＵ）（ｍＵ）（ｍＵ）（ｆＡ）＃（ｍＵ）＃（ｍＡ）（Ｔ）（Ｔ）－ＰＣＤＣＡを含み、ここで、「ｍ」は、２’－Ｏ－メチル修飾に対応し、「ｆ」は、２’－フルオロ修飾に対応し、「Ｔ」は、チミジンＤＮＡヌクレオチドに対応し、「＃」は、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結に対応し、「Ｖ」は、５’－ビニルホスホネートに対応し、「ＰＣＤＣＡ」は、リン酸リンカーを介した３’－Ｃ７－ホスホコリン－ドコサン酸コンジュゲートに対応する。
いくつかの実施形態では、本開示は、ｄｓＲＮＡ分子の塩を提供する。いくつかの実施形態では、塩は、ナトリウム塩またはカリウム塩を含む。いくつかの実施形態では、塩は、薬学的に許容される塩を含む。
いくつかの態様では、本開示は、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖が５’末端及び３’末端を有する二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子を提供し、
（１）アンチセンス鎖が、式Ｉまたはその塩を含み：
（２）センス鎖が、式ＩＩまたはその塩を含む：
いくつかの態様では、本開示は、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖が５’末端及び３’末端を有する二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子を提供し、
（１）アンチセンス鎖が、式ＩＩＩまたはその塩を含み：
（２）センス鎖が、式ＩＶまたはその塩を含む：
いくつかの態様では、本開示は、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖が５’末端及び３’末端を有する二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子を提供し、アンチセンス鎖が、式Ｉまたはその塩を含む：
いくつかの態様では、本開示は、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖が５’末端及び３’末端を有する二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子を提供し、センス鎖が、式ＩＩまたはその塩を含む：








いくつかの態様では、本開示は、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖が５’末端及び３’末端を有する二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子を提供し、アンチセンス鎖が、式ＩＩＩまたはその塩を含む：
いくつかの態様では、本開示は、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖が５’末端及び３’末端を有する二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子を提供し、センス鎖が、式ＩＶまたはその塩を含む：






いくつかの実施形態では、塩は、薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、塩は、ナトリウム塩またはカリウム塩を含む。
いくつかの態様では、本開示は、ＰＥ、分娩後ＰＥ、子癇またはＨＥＬＬＰ症候群を治療または管理する方法を提供し、本方法は、このような治療または管理を必要とする対象に、治療有効量の上記のｄｓＲＮＡを投与することを含む。
いくつかの態様では、本開示は、第１のｄｓＲＮＡと、第２のｄｓＲＮＡと、を含む医薬組成物を提供し、ここで、第１のｄｓＲＮＡは、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖は、５’末端及び３’末端を有し、（１）アンチセンス鎖は、Ｖ（ｍＵ）＃（ｆＡ）＃（ｍＡ）（ｆＡ）（ｆＵ）（ｆＵ）（ｍＵ）（ｆＧ）（ｍＧ）（ｆＡ）（ｍＧ）（ｆＡ）（ｍＵ）（ｆＣ）＃（ｍＣ）＃（ｆＧ）＃（ｍＡ）＃（ｍＧ）＃（ｍＡ）＃（ｆＧ）＃（ｍＡ）を含み；（２）センス鎖は、（ｍＣ）＃（ｍＧ）＃（ｍＧ）（ｆＡ）（ｍＵ）（ｆＣ）（ｍＵ）（ｆＣ）（ｍＣ）（ｆＡ）（ｍＡ）（ｍＡ）（ｍＵ）（ｆＵ）＃（ｍＵ）＃（ｍＡ）（Ｔ）（Ｔ）－ＰＣＤＣＡを含み、第２のｄｓＲＮＡは、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖が５’末端及び３’末端を有し、（１）アンチセンス鎖は、Ｖ（ｍＵ）＃（ｆＡ）＃（ｍＵ）（ｆＡ）（ｆＡ）（ｆＡ）（ｍＵ）（ｆＧ）（ｍＧ）（ｆＵ）（ｍＡ）（ｆＧ）（ｍＣ）（ｆＵ）＃（ｍＡ）＃（ｆＵ）＃（ｍＧ）＃（ｍＡ）＃（ｍＵ）＃（ｆＧ）＃（ｍＡ）を含み；（２）センス鎖は、（ｍＡ）＃（ｍＵ）＃（ｍＡ）（ｆＧ）（ｍＣ）（ｆＵ）（ｍＡ）（ｆＣ）（ｍＣ）（ｆＡ）（ｍＵ）（ｍＵ）（ｍＵ）（ｆＡ）＃（ｍＵ）＃（ｍＡ）（Ｔ）（Ｔ）－ＰＣＤＣＡを含み、ここで、「ｍ」は、２’－Ｏ－メチル修飾に対応し、「ｆ」は、２’－フルオロ修飾に対応し、「Ｔ」は、チミジンＤＮＡヌクレオチドに対応し、「＃」は、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結に対応し、「Ｖ」は、５’－ビニルホスホネートに対応し、「ＰＣＤＣＡ」は、リン酸リンカーを介した３’－Ｃ７－ホスホコリン－ドコサン酸コンジュゲートに対応する。
いくつかの態様では、本開示は、第１のｄｓＲＮＡと、第２のｄｓＲＮＡと、を含む医薬組成物を提供し、ここで、第１のｄｓＲＮＡは、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖は、５’末端及び３’末端を有し、
（１）アンチセンス鎖が、式Ｉまたはその塩を含み：
（２）センス鎖が、式ＩＩまたはその塩を含み：
第２のｄｓＲＮＡは、センス鎖及びアンチセンス鎖を含み、各鎖が５’末端及び３’末端を有し、
（１）アンチセンス鎖が、式ＩＩＩまたはその塩を含み：
（２）センス鎖が、式ＩＶまたはその塩を含む：
いくつかの実施形態では、塩は、薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、塩は、ナトリウム塩またはカリウム塩を含む。
いくつかの態様では、本開示は、ＰＥ、分娩後ＰＥ、子癇またはＨＥＬＬＰ症候群を治療または管理する方法を提供し、本方法は、このような治療または管理を必要とする対象に、治療有効量の上記の医薬組成物を投与することを含む。いくつかの態様では、本開示は、ＰＥを治療または管理する方法を提供し、本方法は、このような治療または管理を必要とする対象に、治療有効量の上記の医薬組成物を投与することを含む。いくつかの態様では、本開示は、分娩後ＰＥを治療または管理する方法を提供し、本方法は、このような治療または管理を必要とする対象に、治療有効量の上記の医薬組成物を投与することを含む。いくつかの態様では、本開示は、子癇を治療または管理する方法を提供し、本方法は、このような治療または管理を必要とする対象に、治療有効量の上記の医薬組成物を投与することを含む。いくつかの態様では、本開示は、ＨＥＬＬＰ症候群を治療または管理する方法を提供し、本方法は、このような治療または管理を必要とする対象に、治療有効量の上記の医薬組成物を投与することを含む。
本発明の上記及び他の特徴及び利点は、添付の図面と関連して記される以下の例示的な実施形態の詳細な説明から、より完全に理解されるであろう。本特許または出願書類は、カラーで作成された少なくとも１つの図面を含む。カラー図面（複数可）を含む本特許または特許出願公開の複写は、請求及び必要な手数料の支払に応じて特許庁より提供される。
いくつかの２’ＯＭｅリッチｓｉＲＮＡ化学修飾パターンのサイレンシング効果を示す。２’ＯＭｅリッチｓｉＲＮＡ化学修飾パターンの概略図を示す。 いくつかの２’ＯＭｅリッチｓｉＲＮＡ化学修飾パターンのサイレンシング効果を示す。ヒトｆｌｔ１を標的とするｓｉＲＮＡの用量反応曲線及び要約表を示す。ＨｅＬａ細胞を、示した濃度で、ｓｉＲＮＡで７２時間処理した。ｍＲＮＡレベルは、Ｄｕａｌ－Ｇｌｏ（登録商標）ルシフェラーゼアッセイシステムを用いて測定し、未処理の対照（Ｃ）の百分率として計算した。図１Ｂの表－最大ＫＤ（％）－最大治療用量のｓｉＲＮＡによる標的ｍＲＮＡノックダウンの最大率、ＩＣ５０－最大阻害濃度の半値、ＡＵＣ－用量反応曲線の下面積、ｐ値－有意性。 組織の蛍光画像及び前述の組織中でのガイド鎖の蓄積を示す図である。肝臓、腎臓及び胎盤組織における様々な機能的部分とコンジュゲートされたＣｙ３標識ｓｉＲＮＡの組織蛍光画像を示す。 組織の蛍光画像及び組織中でのガイド鎖の蓄積を示す図である。ＰＮＡハイブリダイゼーションアッセイにより４８時間後に定量化されたガイド鎖の蓄積を示す（ｎ＝３）。ｐ値は、各化合物とコレステロールコンジュゲート化合物との間の統計的有意差を示す（一元配置分散分析法、＊＊ｐ＜０．０１、＊＊＊ｐ＜０．００１、有意差のないものはマークしていない）。ＮＯＣ－コンジュゲートなし、Ｃｈｏｌ－コレステロール、ＤＣＡ－ドコサン酸、ＰＣ－ＤＣＡ－ホスホコリン－ドコサン酸、ＤＨＡ－ドコサヘキサン酸、ＰＣ－ＤＨＡ－ホスホコリン－ドコサヘキサン酸、ＤＩＯ－二分岐オリゴヌクレオチド。 試験したｓｉＲＮＡの骨髄組織蓄積を示す図である。Ｃｙ３標識ｓＦＬＴ１＿２２８３ ｓｉＲＮＡバリアントを注射したＣＤ－１マウスの骨髄細胞のＦＡＣＳ分析を行った。図３Ｂ～図３Ｄの骨髄における特定の細胞集団のＣｙ３強度を定量化するために使用されるゲーティングスキームを示す。 試験したｓｉＲＮＡの骨髄組織蓄積を示す図である。Ｃｙ３標識ｓＦＬＴ１＿２２８３ ｓｉＲＮＡバリアントを注射したＣＤ－１マウスの骨髄細胞のＦＡＣＳ分析を行った。ｓｉＲＮＡバリアントを注入して２４時間後の骨髄好中球のＣｙ３蛍光強度の頻度分布ヒストグラム（左）及びＣｙ３中央蛍光強度の棒グラフ（右）を示す。 試験したｓｉＲＮＡの骨髄組織蓄積を示す図である。Ｃｙ３標識ｓＦＬＴ１＿２２８３ ｓｉＲＮＡバリアントを注射したＣＤ－１マウスの骨髄細胞のＦＡＣＳ分析を行った。ｓｉＲＮＡバリアントを注入して２４時間後の骨髄顆粒球のＣｙ３蛍光強度の頻度分布ヒストグラム（左）及びＣｙ３中央蛍光強度の棒グラフ（右）を示す。 試験したｓｉＲＮＡの骨髄組織蓄積を示す図である。Ｃｙ３標識ｓＦＬＴ１＿２２８３ ｓｉＲＮＡバリアントを注射したＣＤ－１マウスの骨髄細胞のＦＡＣＳ分析を行った。ｓｉＲＮＡバリアントを注入して２４時間後の骨髄単球のＣｙ３蛍光強度の頻度分布ヒストグラム（左）及びＣｙ３中央蛍光強度の棒グラフ（右）を示す。（ｎ＝３、平均±ＳＤ）ｐ値は、化合物の間の統計的有意差を表す（一元配置分散分析法；＊ｐ＜０．０５；有意差のないものはマークしていない）。 ｓｉＲＮＡサイレンシング効力に対する様々な５’アンチセンス修飾の影響を示す図である。胚日（Ｅ）１３及びＥ１４に、２２８３及び２５１９のｓｉＲＮＡバリアントの２０ｍｇ／ｋｇ等モル混合物を妊娠中のＣＤ－１マウスに注射した。注射されたｓｉＲＮＡ化合物の化学パターン及び試験された５’部分の化学構造の概略図を示す。 ｓｉＲＮＡサイレンシング効力に対する様々な５’アンチセンス修飾の影響を示す図である。胚日（Ｅ）１３及びＥ１４に、２２８３及び２５１９のｓｉＲＮＡバリアントの２０ｍｇ／ｋｇ等モル混合物を妊娠中のＣＤ－１マウスに注射した。Ｑｕａｎｔｉｇｅｎｅ ２．０ ＲＮＡ Ａｓｓａｙを用いて測定されたＥ１８の胎盤中のｓＦｌｔ１－ｉ１３ ｍＲＮＡレベルを示す。レベルをＦｌｔ１に対して正規化し、ＰＢＳ対照のパーセンテージ（ｎ＝５、平均±ＳＤ）として示した。 ｓｉＲＮＡサイレンシング効力に対する様々な５’アンチセンス修飾の影響を示す図である。胚日（Ｅ）１３及びＥ１４に、２２８３及び２５１９のｓｉＲＮＡバリアントの２０ｍｇ／ｋｇ等モル混合物を妊娠中のＣＤ－１マウスに注射した。ＰＮＡハイブリダイゼーションアッセイを用いて測定したＥ１８の胎盤中のｓｉＲＮＡ蓄積の量を示す（ｎ＝５）。ｐ値は、化合物の間の統計的有意差を表す（一元配置分散分析法；＊＊ｐ＜０．０１；＊＊＊＊ｐ＜０．０００１；有意差のないものはマークしていない）。 ｓｉＲＮＡサイレンシング効力に対する様々な５’アンチセンス修飾の影響を示す図である。胚日（Ｅ）１３及びＥ１４に、２２８３及び２５１９のｓｉＲＮＡバリアントの２０ｍｇ／ｋｇ等モル混合物を妊娠中のＣＤ－１マウスに注射した。Ｑｕａｎｔｉｇｅｎｅ ２．０ ＲＮＡ Ａｓｓａｙを使用して測定された、Ｅ１８の胎盤中のｓＦｌｔ１－ｉ１３ ｍＲＮＡレベルを示す。レベルをＦｌｔ１に対して正規化し、ＰＢＳ対照のパーセンテージ（ｎ＝６、平均±ＳＤ）として示した。 ｓｉＲＮＡサイレンシング効力に対する様々な５’アンチセンス修飾の影響を示す図である。胚日（Ｅ）１３及びＥ１４に、２２８３及び２５１９のｓｉＲＮＡバリアントの２０ｍｇ／ｋｇ等モル混合物を妊娠中のＣＤ－１マウスに注射した。ＰＮＡハイブリダイゼーションアッセイを用いて測定したＥ１８の胎盤中のｓｉＲＮＡ蓄積の量を示す（ｎ＝６）。ｐ値は、化合物の間の統計的有意差を表す（一元配置分散分析法；＊＊ｐ＜０．０１；＊＊＊＊ｐ＜０．０００１；有意差のないものはマークしていない。対応のないｔ検定；＃ｐ＜０．０５；＃＃＃＃ｐ＜０．０００１）。 ｓｉＲＮＡサイレンシング効力に対する様々な５’アンチセンス修飾の影響を示す図である。胚日（Ｅ）１３及びＥ１４に、２２８３及び２５１９のｓｉＲＮＡバリアントの２０ｍｇ／ｋｇ等モル混合物を妊娠中のＣＤ－１マウスに注射した。対照マウス及び処置した妊娠マウスの平均子マウス数、平均子マウス体重及び平均胎盤重量を示す。 最適化されたｓｉＲＮＡが血清サイトカイン産生に及ぼす影響を示す。７５ｍｇ／ｋｇのｓＦＬＴ１＿２２８３ ｓｉＲＮＡバリアント（ｎ＝３、平均±ＳＤ）を注射して２４時間後のＣＤ－１マウスの血清サイトカイン濃度を測定した。ｐ値は、化合物の間の統計的有意差を表す（一元配置分散分析法；＊ｐ＜０．０５；＊＊ｐ＜０．０１；＊＊＊ｐ＜０．００１；＊＊＊＊ｐ＜０．０００１；有意差のないものはマークしていない）。 例示的なｓｉＲＮＡ標的ｓＦＬＴ１ ２２８３または２５１９の概略図である。 ｓＦＬＴ１－ｉ１３及びｓＦＬＴ１－ｅ１５ａ（それぞれ）、または２つのｓｉＲＮＡの組み合わせ（１：１ ｓｉＲＮＡ－２２３８：ｓｉＲＮＡ－２５１９）をサイレンシングするｓｉＲＮＡ－２２３８及びｓｉＲＮＡ－２５１９の用量反応曲線を示す。ｓＦＬＴ１－ｉ１３及びｓＦＬＴ１－ｅ１５ａ ｍＲＮＡ発現レベル及びｓＦＬＴ１タンパク質レベルを、試験したそれぞれのｓｉＲＮＡ濃度で測定した。 妊娠ラットにおける子宮胎盤灌流減少モデル（ＲＵＰＰ）で実施されたｉｎ ｖｉｖｏ実験を示す。２つのｓｉＲＮＡの組み合わせ（ｓｉＲＮＡ－２２８３（ｓＦｌｔ１－ｉｌ３標的）及びｓｉＲＮＡ－２５１９（ｓＦｌｔ１－ｅ１５ａ標的）の１：１混合物）を受ける、ＲＵＰＰラットモデルによる治療スキームを示す。 妊娠ラットにおける子宮胎盤灌流減少モデル（ＲＵＰＰ）で実施されたｉｎ ｖｉｖｏ実験を示す。処置ラット及び対照ラットにおける母体の血圧及び胎盤重量を示す。 妊娠ラットにおける子宮胎盤灌流減少モデル（ＲＵＰＰ）で実施されたｉｎ ｖｉｖｏ実験を示す。処置ラット及び対照ラットにおける胎児吸収及び胎児体重を示す。 最適化されたｓｉＲＮＡ分子ｓＦＬＴ１ ２２８３及びｓＦＬＴ１ ２５１９の化学構造を示す。 最適化されたｓｉＲＮＡ分子ｓＦＬＴ１ ２２８３の化学構造を示す。アンチセンス鎖を示す。 最適化されたｓｉＲＮＡ分子ｓＦＬＴ１ ２２８３の化学構造を示す。アンチセンス鎖を示す。 最適化されたｓｉＲＮＡ分子ｓＦＬＴ１ ２２８３の化学構造を示す。センス鎖を示す。 最適化されたｓｉＲＮＡ分子ｓＦＬＴ１ ２２８３の化学構造を示す。センス鎖を示す。 最適化されたｓｉＲＮＡ分子ｓＦＬＴ１ ２５１９の化学構造を示す。アンチセンス鎖を示す。 最適化されたｓｉＲＮＡ分子ｓＦＬＴ１ ２５１９の化学構造を示す。アンチセンス鎖を示す。 最適化されたｓｉＲＮＡ分子ｓＦＬＴ１ ２５１９の化学構造を示す。センス鎖を示す。 最適化されたｓｉＲＮＡ分子ｓＦＬＴ１ ２５１９の化学構造を示す。センス鎖を示す。
新規血管新生標的（例えば、ＰＥ標的配列、例えば、ｓＦｌｔ１ ｍＲＮＡのイントロン配列）が提供される。また、血管新生標的（例えば、ｓＦＬＴ１タンパク質）をコードするｍＲＮＡのイントロン領域を選択的に標的とする新規ｓｉＲＮＡも提供される。血管新生障害、例えば、ＰＥ、分娩後ＰＥ、子癇及び／またはＨＥＬＬＰを治療する方法もまた提供される。
一般に、本明細書に記載される、細胞及び組織培養、分子生物学、免疫学、微生物学、遺伝子学ならびにタンパク質及び核酸化学及びハイブリダイゼーションに関連して使用される命名法は、当該技術分野においてよく知られ、一般的に使用されるものである。本明細書で提供される方法及び技術は、特に記載のない限り、一般に、当該技術分野においてよく知られている従来の方法に従って、また、本明細書全体を通して引用及び考察される一般的かつより具体的な様々な参考文献に記載されるように実施される。酵素反応及び精製技術は、製造業者の仕様書に従って、当該技術分野において一般的に達成されるように、または本明細書に記載されるように実行される。本明細書に記載の分析化学、合成有機化学及び薬学・医薬化学に関連して用いられる用語、ならびにそれらの実験室での手順及び技術は、当分野において周知であり、一般的に用いられるものである。化学合成、化学分析、医薬調製、製剤化、及び送達、及び患者の治療には標準的技術が用いられる。
本明細書で特に定義のない限り、本明細書で使用される科学用語及び技術用語は、当業者によって一般的に理解される意味を有する。何らかの潜在的な曖昧さがある場合、本明細書に提供する定義が、いかなる辞書または外部の定義よりも優先される。別段文脈によって要求されない限り、単数形の用語は複数形を含むものとし、複数形の用語は単数形を含むものとする。「または」の使用は、別段の指示がない限り、「及び／または」を意味する。「含む（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」という用語、ならびに「含む（ｉｎｃｌｕｄｅ）」及び「含まれる（ｉｎｃｌｕｄｅｄ）」などの他の形態の使用は、限定的ではない。
本発明がより容易に理解され得るように、まず特定の用語を定義しておく。
「改変」とは、本明細書に記載されるような標準的な公知の方法によって検出される、遺伝子、ｍＲＮＡまたはポリペプチドの発現レベルの変化（増加または減少）を意味する。本明細書で使用される場合、増加または減少は、発現レベルの１０％の変化、発現レベルの２５％の変化、４０％の変化、または５０％以上の変化を含む。特定の実施形態では、増加または減少は、約３０％～約５０％または約３０％～約４０％の発現レベルの変化である。「改変」は、本発明のｍＲＮＡまたはポリペプチドのいずれか（例えば、ｓＦｌｔ１（例えば、略してｓＦｌｔ１－ｉ１３ ｓｈｏｒｔ、ｓＦｌｔ１－ｉ１３ ｌｏｎｇ及び／またはｓＦｌｔ１－ｉ１５ａ）（ｓＦｌｔ１－ｅ１５ａとしても知られている）の生物学的活性の変化（増加または減少）を示すこともできる。ｓＦｌｔ－１の生物学的活性の例としてＰＥまたは子癇の１つ以上の臨床症状が含まれる。本明細書で使用される場合、増加または減少は、生物学的活性の１０％の変化、好ましくは２５％の変化、より好ましくは４０％の変化、最も好ましくは５０％以上の生物学的活性の変化を含む。特定の好ましい実施形態では、増加または減少は、約３０％～約５０％または約３０％～約４０％の発現レベルの変化である。
本発明の特定の実施形態は、１つ以上の血管新生障害の治療に関する。「血管新生障害の治療」とは、新血管新生、脈管形成及び／または血管新生の生理学的及び病理学的過程を伴う疾患の治療のための医薬組成物中での、本発明のオリゴヌクレオチド（例えば、ｓｉＲＮＡ）の使用を意味する。従って、これらの医薬組成物は、新血管新生、脈管形成または血管新生の阻害を必要とする疾患、症状及び障害、例えば、限定されないが、がん腫瘍の成長及び転移、新生物、眼血管新生（例えば、黄斑変性症、糖尿病性網膜症、虚血性網膜症、未熟児網膜症、脈絡膜血管新生）、関節リウマチ、変形性関節症、慢性喘息、敗血症性ショック、炎症性疾患、滑膜炎、骨及び軟骨の破壊、パンヌスの成長、骨棘形成、骨髄炎、乾癬、肥満、血管腫、カポジ肉腫、アテローム性動脈硬化症（例えば、アテローム性動脈硬化性プラークの破裂）、子宮内膜症、いぼ、過剰な毛髪の成長、傷跡ケロイド、アレルギー性浮腫、機能不全子宮出血、卵胞嚢胞、卵巣過剰刺激、子宮内膜症、骨髄炎、炎症及び感染プロセス（肝炎、肺炎、糸球体腎炎）、喘息、鼻ポリープ、移植、肝臓の再生、白質軟化症、甲状腺炎、甲状腺肥大、リンパ増殖性疾患、血液悪性腫瘍、血管奇形、子癇前症、子癇及び／またはＨＥＬＬＰ症候群の治療に有用である。いくつかの実施形態では、疾患または障害は、子癇前症である。いくつかの実施形態では、疾患または障害は、分娩後子癇前症である。いくつかの実施形態では、疾患または障害は、子癇である。いくつかの実施形態では、疾患または障害は、ＨＥＬＬＰ症候群である。
「子癇前症」（「ＰＥ」）とは、タンパク尿もしくは浮腫、またはその両方を伴う高血圧、及び妊娠中または最近の妊娠の影響による糸球体機能不全、脳浮腫、肝浮腫、または凝固異常のうちの１つ以上を特徴とする多系統障害を意味する。ＰＥは、一般に在胎２０週以降に発生する。ＰＥは、一般に以下の症状のうちの複数の組み合わせとして定義される：（１）在胎２０週以降の収縮期血圧（ＢＰ）＞１４０ｍｍＨｇ及び拡張期ＢＰ＞９０ｍｍＨｇ（一般には、４～１６８時間間隔で２回測定）、（２）タンパク尿の新たな発現（尿検査時の試験紙検査により１＋、２４時間蓄尿時におけるタンパク質３００ｍｇ超、またはタンパク／クレアチニン比＞ｖ０．３を有する１つの無作為尿サンプル）、（３）産後１２週間までに高血圧及びタンパク尿が解消する。
重症ＰＥは、一般に、（１）拡張期ＢＰ＞１１０ｍｍＨｇ（一般には、４～１６８時間間隔で２回測定）、または（２）２４時間蓄尿において３．５ｇ以上のタンパク質または試験紙による少なくとも３＋タンパク質を含む２つの無作為尿サンプルの測定値によって特徴付けられたタンパク尿として規定される。ＰＥでは、高血圧及びタンパク尿は一般に、互いに７日以内に起こる。重症ＰＥでは、重症の高血圧、重症のタンパク尿及びＨＥＬＬＰ症候群（溶血、肝酵素の上昇、血小板減少）または子癇が同時に起こり得るか、または一度に１つの症状のみ生じ得る。
重症ＰＥにより、発作が生じ得ることがある。この症候群の重症形態は、「子癇」と呼ばれる。子癇はまた、肝臓（例えば、肝細胞損傷、門脈周囲壊死）及び中枢神経系（例えば、脳浮腫及び脳出血）などの複数の臓器または組織に対する機能不全または損傷を含み得る。発作の病因は、脳浮腫及び腎臓の小血管の局所痙攣の発生に対して副次的であると考えられている。
「ＨＥＬＬＰ」症候群とは、溶血、肝酵素上昇、及び血小板数の減少を特徴とする、妊婦に生じる一連の症状を意味する。ＨＥＬＬＰ症候群は、ＰＥの変形であると考えられているが、それ自体の実体であり得る。
特定の態様では、ＰＥは、分娩後ＰＥを含む。分娩後ＰＥは、分娩直後に高血圧と褥婦の尿中に過剰なタンパク質が認められた場合に起こる、稀な状態である。分娩後ＰＥは、典型的には分娩後４８時間以内に発生する。しかし、分娩後ＰＥは、分娩後６週までに発生することがあり、これは、後期分娩後ＰＥとして知られている。分娩後ＰＥ及び後期分娩後ＰＥの徴候及び症状は、典型的には妊娠中に起こるＰＥの症状と類似しており、以下のうちの１つまたは任意の組み合わせが含まれ得る：高血圧（すなわち１４０／９０ｍｍＨｇ以上）；タンパク尿；重度の頭痛；一時的な視力喪失、かすみ目または光線過敏症などの視力の変化；顔面及び四肢の腫脹；上腹部の痛み（通常は右側の肋骨の下）；悪心または嘔吐；排尿量の減少；急激な体重増加（典型的には週２ポンド（０．９キログラム）を超える）。
「子宮内発育遅延（ＩＵＧＲ）」とは、胎児の在胎期間に対する予測胎児体重の１０％未満である出生体重となる症候群を意味する。現在の世界保健機関の低出生体重基準は、体重２，５００グラム（５ｌｂｓ．８ｏｚ．）未満、または米国の人種、経産回数、及び乳児の性別ごとの在胎期間別出生体重表による在胎期間に対して１０パーセンタイル未満である（Ｚｈａｎｇ ａｎｄ Ｂｏｗｅｓ，Ｏｂｓｔｅｔ．Ｇｙｎｅｃｏｌ．８６：２００－２０８，１９９５）。これらの低出生体重児は、「在胎不当過小（ＳＧＡ）」とも呼ばれる。ＰＥは、ＩＵＧＲまたはＳＧＡに関連することが知られている状態である。
本発明の特定の実施形態は、１つ以上の腎障害の治療に関する。「腎障害の治療」とは、本発明のオリゴヌクレオチド（例えば、ｓｉＲＮＡ）の、腎臓に関連する疾患、状態または障害の治療のための医薬組成物中での使用を意味する。腎臓に関連する疾患、状態または障害としては、限定されないが、以下が挙げられる：慢性腎疾患（ＣＫＤ）（ステージ１～５であり、ステージ１は、最も軽症で通常は症状がほとんどなく、ステージ５は、重度の疾患であり、未治療であれば、平均余命が不良である（ステージ５のＣＫＤは、多くの場合、末期腎疾患、末期腎不全、または末期腎疾患、慢性腎臓不全（ｃｈｒｏｎｉｃ ｋｉｄｎｅｙ ｆａｉｌｕｒｅ）もしくは慢性腎不全（ｃｈｒｏｎｉｃ ｒｅｎａｌ ｆａｉｌｕｒｅ）と呼ばれる）、及び急性腎不全（ＡＲＦ）（失血を伴う外傷、腎臓への血流の突然の減少、敗血症による腎臓の損傷、尿の流れの妨害、特定の薬物または毒素による損傷、妊娠の合併症（例えば、子癇、ＰＥ及び／またはＨＥＬＬＰ症候群）などによって引き起こされる）。
本発明の特定の実施形態は、１つ以上の肝障害の治療に関する。「肝障害の治療」とは、本発明のオリゴヌクレオチド（例えば、ｓｉＲＮＡ）の、肝臓に関連する疾患、状態または障害の治療のための医薬組成物中での使用を意味する。肝臓に関連する疾患、状態または障害としては、限定されないが、肝蛭症、肝炎（例えば、ウイルス性肝炎、アルコール性肝炎、自己免疫性肝炎、遺伝性肝炎など）、アルコール性肝疾患（例えば、アルコール性脂肪肝疾患）、アルコール性肝炎、及びアルコール性肝硬変）、非アルコール性脂肪肝疾患、脂肪肝、非アルコール性肝硬変、原発性肝癌（例えば、肝細胞癌、胆管癌、脈管肉腫、血管肉腫など）、原発性胆汁性肝硬変、原発性硬化性、小葉中心壊死、バッド・キアリ症候群、ヘモクロマトーシス、ウィルソン病、α１－アンチトリプシン欠損症、糖原病ＩＩ型、トランスサイレチン関連の遺伝性アミロイドーシス、ギルバート症候群、胆道閉鎖症、α－１アンチトリプシン欠乏症、アラジール症候群、進行性家族性肝内胆汁うっ滞症などが挙げられる。
「治療量」とは、ＰＥまたは子癇を有する患者に投与した場合に、本明細書に記載のＰＥまたは子癇の症状を定性的または定量的に減少させるのに十分な量を意味する。また、「治療量」は、ＰＥまたは子癇を有する患者または対象に投与された場合に、本明細書に記載のアッセイのうちの１つ以上により測定された場合、１つ以上のｓＦＬＴ１タンパク質（例えば、ｓＦＬＴ１－ｉ１３ ｓｈｏｒｔ、ｓＦＬＴ１－ｉ１３ ｌｏｎｇ及びｓＦＬＴ１－ｉ１５ａのうちの１つ以上）の発現レベルの低下を引き起こすのに十分な量を意味し得る。
「対象」は、限定されないが、ヒトもしくは非ヒト哺乳動物、例えば、非ヒト霊長類、または、他の動物、例えば、ウシ、ウマ、イヌ、ヒツジ、ヒツジ、ネコ、マウスなどの哺乳動物を意味する。この定義には、妊娠中、分娩後及び非妊娠哺乳動物が含まれる。
「可溶性ＦＬＴ１（ｓＦＬＴ１）」（ｓＶＥＧＦ－Ｒ１としても知られている）とは、ｓＦＬＴ１生物学的活性を有するＦＬＴ１受容体の可溶性形態（例えばｓＦＬＴ１－ｉ１３ ｓｈｏｒｔ、ｓＦＬＴ１－ｉ１３ ｌｏｎｇ及び／またはｓＦＬＴ１－ｉ１５ａ（ｓＦＬＴ１－ｅ１５ａとしても知られている））を意味する。ｓＦＬＴ１ポリペプチドの生物学的活性は、任意の標準方法を使用して、例えば、ＰＥ、分娩後ＰＥ、子癇及び／またはＨＥＬＬＰのうちの１つ以上の臨床症状をアッセイすることによって、ｓＦＬＴ１ ｍＲＮＡ及び／またはタンパク質レベルをアッセイすることによって、ＶＥＧＦなどに結合しているｓＦＬＴ１タンパク質をアッセイすることによって、アッセイされ得る。ｓＦＬＴ１タンパク質は、ＦＬＴ１受容体の膜貫通ドメイン及び細胞質チロシンキナーゼドメインが欠如している。ｓＦＬＴ１タンパク質は、ＶＥＧＦに結合することができ、ＰｌＧＦは、高い親和性で結合するが、増殖または血管新生を誘導することはできないため、ＦＬＴ１受容体及びＫＤＲ受容体とは、機能的に異なる。ｓＦＬＴ１は、最初にヒトの臍帯内皮細胞から精製され、その後にｉｎ ｖｉｖｏで栄養膜細胞によって産生されることが示された。本明細書で使用される場合、ｓＦＬＴ１としては、任意のｓＦＬＴ１ファミリーメンバーまたはアイソフォーム、例えば、ｓＦＬＴ１－ｉ１３（例えば、ｓＦＬＴ１－ｉ１３ ｓｈｏｒｔ及び／またはｓＦＬＴ１－ｉ１３ ｌｏｎｇ（ｓＦＬＴ１＿ｖ１）、ｓＦＬＴ１－ｉ１５ａ（ｓＦＬＴ１＿ｖ２）、ｓＦＬＴ１－ｅ１５ａ、ｓＦＬＴ１＿ｖ３、ｓＦＬＴ１＿ｖ４などが挙げられる。
ｓＦＬＴ１－ｉ１３ ｓｈｏｒｔのアイソフォームの配列は、以下のとおりである：
ＧＴＧＡＧＣＡＣＴＧＣＡＡＣＡＡＡＡＡＧＧＣＴＧＴＴＴＴＣＴＣＴＣＧＧＡＴＣＴＣＣＡＡＡＴＴＴＡＡＡＡＧＣＡＣＡＡＧＧＡＡＴＧＡＴＴＧＴＡＣＣＡＣＡＣＡＡＡＧＴＡＡＴＧＴＡＡＡＡＣＡＴＴＡＡＡＧＧＡＣＴＣＡＴＴＡＡＡＡＡＧＴＡＡ（配列番号５）。
ｓＦＬＴ１－ｉ１３ ｌｏｎｇアイソフォームの配列は、以下のとおりである：ＧＡＡＧＡＡＡＧＡＡＡＴＴＡＣＡＡＴＣＡＧＡＧＧＴＧＡＧＣＡＣＴＧＣＡＡＣＡＡＡＡＡＧＧＣＴＧＴＴＴＴＣＴＣＴＣＧＧＡＴＣＴＣＣＡＡＡＴＴＴＡＡＡＡＧＣＡＣＡＡＧＧＡＡＴＧＡＴＴＧＴＡＣＣＡＣＡＣＡＡＡＧＴＡＡＴＧＴＡＡＡＡＣＡＴＴＡＡＡＧＧＡＣＴＣＡＴＴＡＡＡＡＡＧＴＡＡＣＡＧＴＴＧＴＣＴＣＡＴＡＴＣＡＴＣＴＴＧＡＴＴＴＡＴＴＧＴＣＡＣＴＧＴＴＧＣＴＡＡＣＴＴＴＣＡＧＧＣＴＣＧＧＡＧＧＡＧＡＴＧＣＴＣＣＴＣＣＣＡＡＡＡＴＧＡＧＴＴＣＧＧＡＧＡＴＧＡＴＡＧＣＡＧＴＡＡＴＡＡＴＧＡＧＡＣＣＣＣＣＧＧＧＣＴＣＣＡＧＣＴＣＴＧＧＧＣＣＣＣＣＣＡＴＴＣＡＧＧＣＣＧＡＧＧＧＧＧＣＴＧＣＴＣＣＧＧＧＧＧＧＣＣＧＡＣＴＴＧＧＴＧＣＡＣＧＴＴＴＧＧＡＴＴＴＧＧＡＧＧＡＴＣＣＣＴＧＣＡＣＴＧＣＣＴＴＣＴＣＴＧＴＧＴＴＴＧＴＴＧＣＴＣＴＴＧＣＴＧＴＴＴＴＣＴＣＣＴＧＣＣＴＧＡＴＡＡＡＣＡＡＣＡＡＣＴＴＧＧＧＡＴＧＡＴＣＣＴＴＴＣＣＡＴＴＴＴＧＡＴＧＣＣＡＡＣＣＴＣＴＴＴＴＴＡＴＴＴＴＴＡＡＧＣＧＧＣＧＣＣＣＴＡＴＡＧＴ（配列番号６）。
ｓＦＬＴ１－ｉ１５ａ（ｓＦＬＴ１－ｅ１５ａとしても知られている）アイソフォームの配列は以下のとおりであるＡＡＣＴＧＴＡＴＡＣＡＴＣＡＡＣＧＴＣＡＣＣＡＴＣＧＴＣＡＴＣＧＴＣＡＴＣＡＴＣＡＣＣＡＴＴＧＴＣＡＴＣＡＴＣＡＴＣＡＴＣＡＴＣＧＴＣＡＴＣＡＴＣＡＴＣＡＴＣＡＴＣＡＴＡＧＣＴＡＴＣＡＴＣＡＴＴＡＴＣＡＴＣＡＴＣＡＴＣＡＴＣＡＴＣＡＴＣＡＴＣＡＴＡＧＣＴＡＣＣＡＴＴＴＡＴＴＧＡＡＡＡＣＴＡＴＴＡＴＧＴＧＴＣＡＡＣＴＴＣＡＡＡＧＡＡＣＴＴＡＴＣＣＴＴＴＡＧＴＴＧＧＡＧＡＧＣＣＡＡＧＡＣＡＡＴＣＡＴＡＡＣＡＡＴＡＡＣＡＡＡＴＧＧＣＣＧＧＧＣＡＴＧＧＴＧＧＣＴＣＡＣＧＣＣＴＧＴＡＡＴＣＣＣＡＧＣＡＣＴＴＴＧＧＧＡＧＧＣＣＡＡＧＧＣＡＧＧＴＧＧＡＴＣＡＴＴＴＧＡＧＧＴＣＡＧＧＡＧＴＣＣＡＡＧＡＣＣＡＧＣＣＴＧＡＣＣＡＡＧＡＴＧＧＴＧＡＡＡＴＧＣＴＧＴＣＴＣＴＡＴＴＡＡＡＡＡＴＡＣＡＡＡＡＴＴＡＧＣＣＡＧＧＣＡＴＧＧＴＧＧＣＴＣＡＴＧＣＣＴＧＴＡＡＴＧＣＣＡＧＣＴＡＣＴＣＧＧＧＡＧＧＣＴＧＡＧＡＣＡＧＧＡＧＡＡＴＣＡＣＴＴＧＡＡＣＣＣＡＧＧＡＧＧＣＡＧＡＧＧＴＴＧＣＡＧＧＧＡＧＣＣＧＡＧＡＴＣＧＴＧＴＡＣＴＧＣＡＣＴＣＣＡＧＣＣＴＧＧＧＣＡＡＣＡＡＧＡＧＣＧＡＡＡＣＴＣＣＧＴＣＴＣＡＡＡＡＡＡＣＡＡＡＴＡＡＡＴＡＡＡＴＡＡＡＴＡＡＡＴＡＡＡＣＡＧＡＣＡＡＡＡＴＴＣＡＣＴＴＴＴＴＡＴＴＣＴＡＴＴＡＡＡＣＴＴＡＡＣＡＴＡＣＡＴＧＣＴＡＡ（配列番号７)。
ｓＦＬＴ１タンパク質レベルは、遊離、結合（すなわち、成長因子に結合）、または総ｓＦＬＴ１（結合＋遊離）の量を測定することによって測定され得る。ＶＥＧＦまたはＰｌＧＦレベルは、遊離ＰｌＧＦまたは遊離ＶＥＧＦ（すなわち、ｓＦＬＴ１に結合していない）の量を測定することにより決定される。１つの例示的な測定基準は、［ｓＦＬＴ１／（ＶＥＧＦ＋ＰｌＧＦ）］であり、これはＰＥ抗血管新生指数（ＰＡＡＩ）とも呼ばれる。
「子癇前症抗血管新生指数（ＰＡＡＩ）」は、抗血管新生活性の指標として使用されるｓＦＬＴ１／ＶＥＧＦ＋ＰｌＧＦの比率を意味する。ＰＡＡＩが２０を超える場合、ＰＥまたはＰＥのリスクを示すと考えられる。
「血管内皮成長因子（ＶＥＧＦ）」とは、米国特許第５，３３２，６７１号；同第５，２４０，８４８号；同第５，１９４，５９６号；及びＣｈａｒｎｏｃｋ－Ｊｏｎｅｓ ｅｔ ａｌ．（Ｂｉｏｌ．Ｒｅｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎ，４８：１１２０－１１２８，１９９３）に定義されている成長因子と相同であり、ＶＥＧＦ生物学的活性を有する哺乳動物の成長因子を意味する。ＶＥＧＦは、グリコシル化ホモダイマーとして存在し、少なくとも４つの異なる交互スプライシングされたアイソフォームを含む。天然ＶＥＧＦの生物学的活性として、血管内皮細胞または臍帯静脈内皮細胞の選択的成長の促進、及び血管新生の誘導が挙げられる。本明細書で使用される場合、ＶＥＧＦとしては、任意のＶＥＧＦファミリーメンバーまたはアイソフォーム（例えば、ＶＥＧＦ－Ａ、ＶＥＧＦ－Ｂ、ＶＥＧＦ－Ｃ、ＶＥＧＦ－Ｄ、ＶＥＧＦ－Ｅ、ＶＥＧＦ１８９、ＶＥＧＦ１６５、またはＶＥＧＦ１２１）が挙げられる。特定の実施形態では、ＶＥＧＦは、ＶＥＧＦ１２１またはＶＥＧＦ１６５アイソフォームであり（Ｔｉｓｃｈｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６６，１１９４７－１１９５４，１９９１；Ｎｅｕｆｅｄ ｅｔ ａｌ．Ｃａｎｃｅｒ Ｍｅｔａｓｔａｓｉｓ １５：１５３－１５８，１９９６）、これは、参照により本明細書に組み込まれる米国特許第６，４４７，７６８号；同５，２１９，７３９号；及び同５，１９４，５９６号に記載されている。また、Ｇｉｌｌｅ ｅｔ ａｌ．（Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７６：３２２２－３２３０，２００１）に記載のＫＤＲ選択的ＶＥＧＦ及びＦｌｔ選択的ＶＥＧＦなどのＶＥＧＦの変異形態も含む。ＶＥＧＦは、ヒト形態を含み、かつＶＥＧＦの他の動物形態（例えば、マウス、ラット、イヌ、ニワトリなど）を含み得る。
「胎盤成長因子（ＰｌＧＦ）」とは、ＧｅｎＢａｎｋ受託番号Ｐ４９７６３で定義されるタンパク質に相同であり、ＰｌＧＦ生物学的活性を有する哺乳動物の成長因子を意味する。ＰｌＧＦは、ＶＥＧＦファミリーに属するグリコシル化ホモダイマーであり、選択的スプライシング機構を介して、２つの異なるアイソフォーム中に見出される。ＰｌＧＦは、胎盤中の栄養膜細胞層及び栄養膜合胞体層中に発現しており、ＰｌＧＦの生物学的活性としては、内皮細胞、特に栄養膜細胞の増殖、移動、活性化の誘導が挙げられる。
「栄養膜細胞」とは、子宮粘膜を侵食する胚盤胞を覆い、そこを介して胚が母体から栄養物を受け取る中外胚葉（ｍｅｓｅｃｔｏｄｅｒｍａｌ）細胞層を意味する。栄養膜細胞は、胎盤の形成に寄与する。
「ヌクレオシド」という用語は、リボースまたはデオキシリボース糖に共有結合により連結されたプリンまたはピリミジン塩基を有する分子を指す。例示的ヌクレオシドとしては、アデノシン、グアノシン、シチジン、ウリジン、及びチミジンが挙げられる。さらなる例示的ヌクレオシドとしては、イノシン、１－メチルイノシン、プシュードウリジン、５，６－ジヒドロウリジン、リボチミジン、２Ｎ－メチルグアノシン及び２，２Ｎ，Ｎ－ジメチルグアノシン（「希少」ヌクレオシドとも呼ばれる）が挙げられる。「ヌクレオチド」という用語は、エステル連結内で糖部分に結合された１つ以上のリン酸基を有するヌクレオシドを指す。例示的ヌクレオチドとしては、ヌクレオシド一リン酸、二リン酸、及び三リン酸が挙げられる。「ポリヌクレオチド」及び「核酸分子」という用語は、本明細書では交換可能に使用され、５’及び３’炭素原子間のホスホジエステル連結によって一緒に結合されたヌクレオチドのポリマーを指す。
「ＲＮＡ」または「ＲＮＡ分子」または「リボ核酸分子」という用語は、リボヌクレオチド（例えば、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５、３０、またはそれ以上のリボヌクレオチド）のポリマーを指す。「ＤＮＡ」または「ＤＮＡ分子」または「デオキシリボ核酸分子」という用語は、デオキシリボヌクレオチドのポリマーを指す。ＤＮＡ及びＲＮＡは、自然に合成され得る（例えば、それぞれＤＮＡの複製またはＤＮＡの転写によって）。ＲＮＡは、転写後に修飾され得る。ＤＮＡ及びＲＮＡも化学的に合成され得る。ＤＮＡ及びＲＮＡは、一本鎖（すなわち、それぞれｓｓＲＮＡ及びｓｓＤＮＡ）または多重鎖（例えば、二本鎖、すなわち、それぞれｄｓＲＮＡ及びｄｓＤＮＡ）であり得る。「ｍＲＮＡ」または「メッセンジャーＲＮＡ」は、１つ以上のポリペプチド鎖のアミノ酸配列を特定する一本鎖ＲＮＡである。この情報は、リボソームがｍＲＮＡに結合するときに、タンパク質合成中に翻訳される。
本明細書で使用される用語「低分子干渉ＲＮＡ」（「ｓｉＲＮＡ」）（当技術分野では「短鎖干渉ＲＮＡ」とも呼ばれる）は、約１０～５０のヌクレオチド（またはヌクレオチド類似体）を含むＲＮＡ（またはＲＮＡ類似体）を指し、ＲＮＡ干渉を指示または媒介できる。好ましくは、ｓｉＲＮＡは、約１５～３０のヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体、より好ましくは約１６～２５のヌクレオチド（またはヌクレオチド類似体）、さらにより好ましくは約１８～２３のヌクレオチド（またはヌクレオチド類似体）、及びさらにより好ましくは約１９～２２のヌクレオチド（またはヌクレオチド類似体）（例えば、１９、２０、２１または２２のヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体）を含む。「短い」ｓｉＲＮＡという用語は、約２１ヌクレオチド（またはヌクレオチド類似体）、例えば、１９、２０、２１または２２ヌクレオチドを含むｓｉＲＮＡを指す。「長い」ｓｉＲＮＡという用語は、約２４～２５ヌクレオチド、例えば、２３、２４、２５または２６ヌクレオチドを含むｓｉＲＮＡを指す。短いｓｉＲＮＡは、場合によっては、短いｓｉＲＮＡがＲＮＡｉを媒介する能力を保持するという条件で、１９未満のヌクレオチド、例えば、１６、１７または１８ヌクレオチドを含み得る。同様に、長いｓｉＲＮＡは、場合によっては、より長いｓｉＲＮＡが、短いｓｉＲＮＡへのさらなるプロセシング、例えば酵素プロセシングなく、ＲＮＡｉを媒介する能力を保持するという条件で、２６を超えるヌクレオチドを含み得る。
「ヌクレオチド類似体」または「改変ヌクレオチド」または「修飾ヌクレオチド」という用語は、天然に存在しないリボヌクレオチドまたはデオキシリボヌクレオチドなど、非標準ヌクレオチドを指す。例示的ヌクレオチド類似体は、ヌクレオチドの特定の化学的性質を改変させるが、その意図された機能を実行するヌクレオチド類似体の能力を保持するように、任意の位置で修飾される。誘導体化され得るヌクレオチドの位置の例としては、５位、例えば、５－（２－アミノ）プロピルウリジン、５－ブロモウリジン、５－プロピンウリジン、５－プロペニルウリジン、６位、例えば６－（２－アミノ）プロピルウリジン、アデノシン及び／またはグアノシンの８位、例えば、８－ブロモグアノシン、８－クロログアノシン、８－フルオログアノシンが挙げられる。また、ヌクレオチド類似体としては、デアザヌクレオチド、例えば、７－デアザ－アデノシン、Ｏ－及びＮ－修飾（例えば、アルキル化、例えばＮ６－メチルアデノシン、または当技術分野で知られているもの）ヌクレオチド、及び他の複素環修飾ヌクレオチド類似体、例えば、Ｈｅｒｄｅｗｉｊｎ，Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄ Ｄｒｕｇ Ｄｅｖ．，２０００ Ａｕｇ．１０（４）：２９７－３１０に記載のものが挙げられる。
ヌクレオチド類似体はまた、ヌクレオチドの糖部分への修飾を含み得る。例えば、２’ＯＨ基は、Ｈ、ＯＲ、Ｒ、Ｆ、Ｃｌ、Ｂｒ、Ｉ、ＳＨ、ＳＲ、ＮＨ２、ＮＨＲ、ＮＲ２、ＣＯＯＲまたはＯＲから選択される基によって置換されてもよく、ここでＲは、置換または非置換のＣ１-Ｃ６アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールなどである。他の考えられる修飾は、米国特許第５，８５８，９８８号及び同第６，２９１，４３８号に記載されているものが挙げられる。
ヌクレオチドのリン酸基はまた、例えば、リン酸基の酸素の１つ以上を硫黄（例えば、ホスホロチオエート）で置換することによって、またはヌクレオチドがその意図された機能を実行できるように、他の置換を行うことによって、修飾され得る。例えば、Ｅｃｋｓｔｅｉｎ，Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄ Ｄｒｕｇ Ｄｅｖ．２０００ Ａｐｒ．１０（２）：１１７－２１，Ｒｕｓｃｋｏｗｓｋｉ ｅｔ ａｌ．Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄ Ｄｒｕｇ Ｄｅｖ．２０００ Ｏｃｔ．１０（５）：３３３－４５，Ｓｔｅｉｎ，Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄ Ｄｒｕｇ Ｄｅｖ．２００１ Ｏｃｔ．１１（５）：３１７－２５，Ｖｏｒｏｂｊｅｖ ｅｔ ａｌ．Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄ Ｄｒｕｇ Ｄｅｖ．２００１ Ａｐｒ．１１（２）：７７－８５、及び米国特許第５，６８４，１４３号に記載されている。上で参照した特定の修飾（例えば、リン酸基修飾）は、例えば、ｉｎ ｖｉｖｏまたはｉｎ ｖｉｔｒｏにおいて、好ましくは、類似体を含むポリヌクレオチドの加水分解速度を低下させる。
「オリゴヌクレオチド」という用語は、ヌクレオチド及び／またはヌクレオチド類似体の短いポリマーを指す。「ＲＮＡ類似体」という用語は、対応する未改変または未修飾のＲＮＡと比較して、少なくとも１つの改変または修飾されたヌクレオチドを有するが、対応する未改変または未修飾のＲＮＡと同じまたは類似の性質または機能を保持するポリヌクレオチド（例えば、化学的に合成されたポリヌクレオチド）を指す。上述のとおり、オリゴヌクレオチドは、ホスホジエステル連結を有するＲＮＡ分子と比較して、結果としてＲＮＡ類似体の加水分解速度を低下させる連結により連結され得る。例えば、類似体のヌクレオチドは、メチレンジオール、エチレンジオール、オキシメチルチオ、オキシエチルチオ、オキシカルボニルオキシ、ホスホロジアミデート、ホスホロアミデート、及び／またはホスホロチオエート連結を含み得る。好ましいＲＮＡ類似体には、糖及び／または骨格修飾リボヌクレオチド及び／またはデオキシリボヌクレオチドが含まれる。そのような改変または修飾は、ＲＮＡの末端（複数可）または内部（ＲＮＡの１つ以上のヌクレオチド）などへの非ヌクレオチド物質の付加をさらに含むことができる。ＲＮＡ類似体は、ＲＮＡ干渉を媒介する能力を有する天然のＲＮＡと十分に類似していることのみを必要とする。
本明細書で使用される「ＲＮＡ干渉」（「ＲＮＡｉ」）という用語は、ＲＮＡの選択的な細胞内分解を指す。ＲＮＡｉは、細胞内で自然に発生し、外来ＲＮＡ（例えば、ウイルスＲＮＡなど）を除去する。天然のＲＮＡｉは、遊離ｄｓＲＮＡから切断された断片を介して進行し、分解機構を他の同様のＲＮＡ配列に向ける。あるいは、例えば標的遺伝子の発現をサイレンシングするために、ヒトの手によって、ＲＮＡｉを開始させ得る。
「標的特異的ＲＮＡ干渉（ＲＮＡｉ）を指示するために、標的ｍＲＮＡ配列に十分に相補的な配列」である鎖を有するＲＮＡｉ剤、例えば、ＲＮＡサイレンシング剤は、その鎖が、ＲＮＡｉ機構またはプロセスによる標的ｍＲＮＡの破壊を引き起こすのに十分な配列を有することを意味する。
本明細書で使用される「単離ＲＮＡ」（例えば、「単離ｓｉＲＮＡ」または「単離ｓｉＲＮＡ前駆体」）は、組換え技術によって産生された場合は、実質的に他の細胞材料または培養培地を含まないＲＮＡ分子を指し、化学合成された場合は、実質的に化学前駆体または他の化学物質を含まない。
本明細書で使用される「ＲＮＡサイレンシング」という用語は、ＲＮＡ分子によって媒介される配列特異的調節機構（例えば、ＲＮＡ干渉（ＲＮＡｉ）、転写遺伝子サイレンシング（ＴＧＳ）、転写後遺伝子サイレンシング（ＰＴＧＳ）、クエルリング、共抑制、及び翻訳抑制）の一群を指し、これらは、対応するタンパク質コード遺伝子の発現の阻害または「サイレンシング」をもたらす。ＲＮＡサイレンシングは、植物、動物、及び菌類など、多くの種類の生物で観察されている。
「識別的ＲＮＡサイレンシング」という用語は、例えば、両方のポリヌクレオチド配列が同じ細胞中に存在する場合、ＲＮＡ分子が「第１」または「標的」ポリヌクレオチド配列の発現を実質的に阻害する一方で、「第２」または「非標的」ポリヌクレオチド配列の発現を実質的に阻害しない能力を指す。特定の実施形態では、標的ポリヌクレオチド配列は、標的遺伝子に対応し、非標的ポリヌクレオチド配列は、非標的遺伝子に対応する。他の実施形態では、標的ポリヌクレオチド配列は、標的対立遺伝子に対応し、非標的ポリヌクレオチド配列は、非標的対立遺伝子に対応する。特定の実施形態では、標的ポリヌクレオチド配列は、標的遺伝子の調節領域（例えば、プロモーターまたはエンハンサーエレメント）をコードするＤＮＡ配列である。他の実施形態では、標的ポリヌクレオチド配列は、標的遺伝子によってコードされる標的ｍＲＮＡである。
「ｉｎ ｖｉｔｒｏ」という用語は、例えば精製された試薬または抽出物、例えば細胞抽出物を含む、その技術分野で認識されている意味を有する。「ｉｎ ｖｉｖｏ」という用語はまた、例えば、生きている細胞、例えば、不死化細胞、一次細胞、細胞株、及び／または生物内の細胞を含む、当業者によって認識されている意味を有する。
本明細書で使用される場合、「導入遺伝子」という用語は、人工的に細胞に挿入され、細胞から発生する生物のゲノムの一部となる任意の核酸分子を指す。そのような導入遺伝子は、トランスジェニック生物に対して部分的または完全に異種（すなわち、外来）である遺伝子を含み得るか、または生物の内因性遺伝子に相同である遺伝子を表し得る。「導入遺伝子」はまた、トランスジェニック生物、例えば、動物中に発現する、１つ以上の操作されたＲＮＡ前駆体をコードする、１つ以上の選択された核酸配列、例えば、ＤＮＡを含む核酸分子を意味し、これは、一部または完全にトランスジェニック動物と異種である、すなわち外来性であるか、またはトランスジェニック動物の内因性遺伝子と相同であるが、天然遺伝子とは異なる場所で、動物のゲノムに挿入されるように設計されている。導入遺伝子は、選択された核酸配列の発現に必要な１つ以上のプロモーター及び任意の他のＤＮＡ、例えば、イントロンを含み、すべてが、選択された配列に作動可能に連結され、エンハンサー配列を含んでもよい。
疾患または障害に「関与する」遺伝子には、遺伝子、その正常または異常な発現または機能が、疾患もしくは障害、または疾患もしくは障害の少なくとも１つの症状に影響を及ぼすまたはこれらを引き起こす遺伝子が含まれる。
本明細書で使用される「機能獲得型変異」という用語は、遺伝子によってコードされるタンパク質（すなわち、変異タンパク質）が、通常はそのタンパク質（すなわち、野生型タンパク質）に関連しない機能を獲得し、疾患または障害を引き起こすか、またはそれらの一因となる、遺伝子における任意の変異を指す。機能獲得型変異は、コードされたタンパク質の機能の変化を引き起こす、遺伝子中のヌクレオチド（複数可）の欠失、付加、または置換であり得る。一実施形態では、機能獲得型変異は、変異タンパク質の機能を変化させる（例えば、１つ以上のｓＦＬＴ１タンパク質の産生を引き起こす）か、または他のタンパク質との相互作用を引き起こす。別の実施形態では、機能獲得型変異は、例えば、改変変異タンパク質と正常野生型タンパク質との相互作用によって、正常な野生型タンパク質の減少または除去を引き起こす。
本明細書で使用される「標的遺伝子」という用語は、その発現が実質的に阻害されるか、または「サイレンシング」される遺伝子である。このサイレンシングは、例えば、標的遺伝子のｍＲＮＡの切断または標的遺伝子の翻訳抑制によるＲＮＡのサイレンシングによって達成することができる。「非標的遺伝子」という用語は、その発現が実質的にサイレンシングを受けない遺伝子である。一実施形態では、標的遺伝子及び非標的遺伝子のポリヌクレオチド配列（例えば、標的（ｓＦＬＴ１）遺伝子及び非標的（ｆｌＦＬＴ１）遺伝子によってコードされるｍＲＮＡ）は、例えばイントロン領域において、１つ以上のヌクレオチドが異なり得る。別の実施形態では、標的及び非標的遺伝子は、１つ以上の多型（例えば、一塩基多型またはＳＮＰ）によって異なり得る。別の実施形態では、標的及び非標的遺伝子は、１００％未満の配列同一性を共有できる。別の実施形態では、非標的遺伝子は、標的遺伝子の相同体（例えばオルソログまたはパラログ）であってもよい。
「標的対立遺伝子」は、その発現が選択的に阻害または「サイレンシング」される対立遺伝子（例えば、ＳＮＰ対立遺伝子）である。このサイレンシングは、ＲＮＡサイレンシングによって、例えば、ｓｉＲＮＡによって標的遺伝子または標的対立遺伝子のｍＲＮＡを切断することによって達成することができる。「非標的対立遺伝子」という用語は、発現が実質的にサイレンシングを受けない対立遺伝子である。特定の実施形態では、標的対立遺伝子及び非標的対立遺伝子は、同じ標的遺伝子に対応することができる。他の実施形態では、標的対立遺伝子は、標的遺伝子に対応するか、または関連しており、非標的対立遺伝子は、非標的遺伝子に対応するか、または関連している。一実施形態では、標的対立遺伝子及び非標的対立遺伝子のポリヌクレオチド配列は、１つ以上のヌクレオチドが異なり得る。別の実施形態では、標的対立遺伝子及び非標的対立遺伝子は、１つ以上の対立遺伝子多型（例えば、１つ以上のＳＮＰ）が異なり得る。別の実施形態では、標的対立遺伝子及び非標的対立遺伝子は、１００％未満の配列同一性を共有できる。
本明細書で使用される「多型」という用語は、異なる源または対象（しかし、同じ生物）からの同じ遺伝子配列を比較する場合に同定または検出される遺伝子配列中の変形（例えば、１つ以上の欠失、挿入、または置換）を指す。例えば、異なる対象からの同じ遺伝子配列を比較する場合、多型を同定することができる。このような多型の同定は、当技術分野では日常的であり、その方法論は、例えば、乳がんの点変異を検出するために使用されるものと類似している。同定は、例えば、対象のリンパ球から抽出されたＤＮＡから行うことができ、その後多型領域に対する特異的プライマーを使用して、多型領域を増幅することができる。あるいは、同じ遺伝子の２つの対立遺伝子を比較する場合に、多型を同定できる。特定の実施形態では、多型は、一塩基多型（ＳＮＰ）である。
生物内の同じ遺伝子の２つの対立遺伝子間の配列の変形は、本明細書では「対立遺伝子多型」と呼ばれる。特定の実施形態では、対立遺伝子多型は、ＳＮＰ対立遺伝子に対応する。例えば、対立遺伝子多型は、ＳＮＰの２つの対立遺伝子間の単一ヌクレオチド変形を含み得る。多型は、コード領域内のヌクレオチドにあり得るが、遺伝暗号の縮重により、アミノ酸配列の変化はコードされない。あるいは、多型配列は、特定の位置において異なるアミノ酸をコードできるが、アミノ酸の変化は、タンパク質の機能に影響しない。多型領域は、遺伝子の非コード領域にも見られる。例示的な実施形態では、多型は、遺伝子のコード領域または遺伝子の非翻訳領域（例えば、５’ＵＴＲまたは３’ＵＴＲ）に見出される。
本明細書で使用される「対立遺伝子頻度」という用語は、個体集団中の単一遺伝子座における対立遺伝子（例えば、ＳＮＰ対立遺伝子）の相対頻度の尺度（例えば、割合またはパーセンテージ）である。例えば、個体の集団が、体細胞のそれぞれ内に特定の染色体遺伝子座（及びその遺伝子座を占める遺伝子）のｎ遺伝子座を保有する場合、対立遺伝子の対立遺伝子頻度は、集団中に対立遺伝子が占める遺伝子座の割合またはパーセンテージである。特定の実施形態では、対立遺伝子（例えば、ＳＮＰ対立遺伝子）の対立遺伝子頻度は、サンプル集団中において、少なくとも１０％（例えば、少なくとも１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％またはそれ以上）である。
本明細書で使用される場合、「サンプル集団」という用語は、統計的に有意な数の個体を含む個体の集団を指す。例えば、サンプル集団は、５０人、７５人、１００人、２００人、５００人、１０００人、またはそれ以上の個体を含み得る。特定の実施形態では、サンプル集団は、少なくとも共通の疾患表現型（例えば、機能獲得型障害）または変異（例えば、機能獲得型変異）を共有する個体を含み得る。
本明細書で使用する場合、「ヘテロ接合性」という用語は、特定の遺伝子座（例えば、ＳＮＰ）においてヘテロ接合性である（例えば、２つ以上の異なる対立遺伝子を含む）、任意のある集団内の個体の割合を指す。ヘテロ接合性は、当業者に周知の方法を用いて、サンプル集団について計算し得る。
「細胞または生物における遺伝子の機能を検査する」という語句は、そこから生じる発現、活性、機能または表現型を検査または研究することを指す。
本明細書で使用される「ＲＮＡサイレンシング剤」という用語は、標的遺伝子の発現を阻害または「サイレンシング」することができるＲＮＡを指す。特定の実施形態では、ＲＮＡサイレンシング剤は、転写後のサイレンシング機構により、ｍＲＮＡ分子の完全なプロセシング（例えば、完全な翻訳及び／または発現）を防ぐことができる。ＲＮＡサイレンシング剤としては、小さい（＜５０ｂ．ｐ．）、非コードＲＮＡ分子、例えば、対合した鎖を含むＲＮＡ二本鎖、ならびにそのような小さい非コードＲＮＡを生成することができる前駆体ＲＮＡが挙げられる。例示的なＲＮＡサイレンシング剤としては、ｓｉＲＮＡ、ｍｉＲＮＡ、ｓｉＲＮＡ様二本鎖、及び二重機能オリゴヌクレオチド、ならびにそれらの前駆体が挙げられる。一実施形態では、ＲＮＡサイレンシング剤は、ＲＮＡ干渉を誘導することができる。別の実施形態では、ＲＮＡサイレンシング剤は、翻訳抑制を媒介することができる。
本明細書で使用される場合、「希少ヌクレオチド」という用語は、低頻度で生じる天然のヌクレオチド、例えば、低頻度で生じる天然のデオキシリボヌクレオチドまたはリボヌクレオチド、例えば、グアノシン、アデノシン、シトシン、またはウリジンではない天然のリボヌクレオチドを指す。希少ヌクレオチドの例としては、これらに限定されないが、イノシン、１－メチルイノシン、シュードウリジン、５，６－ジヒドロウリジン、リボチミジン、２Ｎ－メチルグアノシン及び２，２Ｎ，Ｎ－ジメチルグアノシンが挙げられる。
「操作された」という用語は、操作されたＲＮＡ前駆体または操作された核酸分子のように、前駆体または分子の核酸配列のすべてまたは一部が、作成されるかまたはヒトによって選択されるという点で、前駆体または分子が自然界に見出されないことを示す。一旦作成されるかまたは選択されると、配列は、細胞内の機構によって複製、翻訳、転写、または他の方法でプロセシングされる。したがって、操作された核酸分子を含む導入遺伝子から細胞内で産生されたＲＮＡ前駆体は、操作されたＲＮＡ前駆体である。
本明細書で使用される用語「マイクロＲＮＡ」（「ｍｉＲＮＡ」）は、当技術分野において「一時的低分子ＲＮＡ（ｓｍａｌｌ ｔｅｍｐｏｒａｌ ＲＮＡ）」（「ｓｔＲＮＡ」）としても称され、（例えば、ウイルス、哺乳動物、または植物のゲノムによって）遺伝的にコードされ、ＲＮＡサイレンシングを指示または媒介することができる小さい（例えば、１０～５０ヌクレオチド）ＲＮＡを指す。「ｍｉＲＮＡ障害」は、ｍｉＲＮＡの異常な発現または活性を特徴とする疾患または障害を指すものとする。
本明細書で使用される場合、用語「二重官能性オリゴヌクレオチド」は、式Ｔ－Ｌ－μを有するＲＮＡサイレンシング剤を指し、式中、Ｔは、ｍＲＮＡ標的化部分であり、Ｌは、連結部分であり、μは、ｍｉＲＮＡ動員部分である。本明細書で使用される場合、用語「ｍＲＮＡ標的化部分」、「標的化部分」、「ｍＲＮＡ標的化部分」または「標的化部分」は、十分なサイズ及びサイレンシングのために選択または標的化されたｍＲＮＡの部分または領域（すなわち、その部分は、標的ｍＲＮＡを捕捉するのに十分な配列を有する）に対して十分な相補性を有する二重機能性オリゴヌクレオチドのドメイン、部分または領域を指す。本明細書で使用される「連結部分（ｌｉｎｋｉｎｇ ｍｏｉｅｔｙ）」または「連結部分（ｌｉｎｋｉｎｇ ｐｏｒｔｉｏｎ）」という用語は、ｍＲＮＡを共有結合により接合させるまたは連結するＲＮＡサイレンシング剤のドメイン、部分または領域を指す。
本明細書で使用される、ＲＮＡサイレンシング剤、例えばｓｉＲＮＡまたはＲＮＡサイレンシング剤の「アンチセンス鎖」という用語は、サイレンシングのために標的化された遺伝子のｍＲＮＡの約１０～５０ヌクレオチド、例えば約１５～３０、１６～２５、１８～２３または１９～２２ヌクレオチドのセクションに実質的に相補的な鎖を指す。アンチセンス鎖または第１の鎖は、標的特異的サイレンシングを指示するために、所望の標的ｍＲＮＡ配列に対して十分に相補的である、例えば、ＲＮＡｉの機構またはプロセス（ＲＮＡｉ干渉）によって所望の標的ｍＲＮＡの破壊を引き起こすのに十分に相補的である、または所望の標的ｍＲＮＡの翻訳抑制を引き起こすのに十分に相補的である配列を有する。
ＲＮＡサイレンシング剤、例えばｓｉＲＮＡまたはＲＮＡサイレンシング剤の「センス鎖」または「第２の鎖」という用語は、アンチセンス鎖または第１の鎖に相補的な鎖を指す。アンチセンス鎖及びセンス鎖はまた、第１の鎖または第２の鎖と称することができ、第１の鎖または第２の鎖は、標的配列に対して相補性を有し、それぞれの第２の鎖または第１の鎖は、第１の鎖または第２の鎖に対して相補性を有する。ｍｉＲＮＡ二本鎖中間体またはｓｉＲＮＡ様二本鎖には、サイレンシングの標的とされる遺伝子のｍＲＮＡの約１０～５０のヌクレオチドのセクションに十分な相補性を有するｍｉＲＮＡ鎖、及びｍｉＲＮＡ鎖と二本鎖を形成するのに十分な相補性を有するｍｉＲＮＡ＊鎖が含まれる。
本明細書で使用される用語「ガイド鎖」は、ＲＩＳＣ複合体に入り、標的ｍＲＮＡの切断を指示する、ＲＮＡサイレンシング剤の鎖、例えば、ｓｉＲＮＡ二本鎖またはｓｉＲＮＡ配列のアンチセンス鎖を指す。
本明細書で使用される「非対称性」という用語は、ＲＮＡサイレンシング剤の二重鎖領域（例えば、ｓｈＲＮＡのステム）の非対称性におけるように、ＲＮＡサイレンシング剤の末端間の結合強度または塩基対強度が不均等（例えば、第１の鎖またはステム部分上の末端ヌクレオチドと、対向する第２の鎖またはステム部分上の末端ヌクレオチドとの間）であることを指す。これにより、二本鎖の一方の鎖の５’末端が、相補鎖の５’末端よりも一過性の不対合状態、例えば一本鎖の状態にある頻度が高くなる。この構造上の違いにより、二重鎖の一方の鎖が、ＲＩＳＣ複合体に優先的に組み込まれることが決定する。５’末端が相補鎖とあまり強固に対合していない鎖は、優先的にＲＩＳＣに組み込まれ、ＲＮＡｉを媒介するであろう。
本明細書で使用される「結合強度」または「塩基対強度」という用語は、主に、Ｈ結合、ファンデルワールス相互作用などによるオリゴヌクレオチド二本鎖（例えば、ｓｉＲＮＡ二本鎖）の対抗する鎖上のヌクレオチド（またはヌクレオチド類似体）の対間、及びこれらのヌクレオチド（またはヌクレオチド類似体）間の相互作用の強度を指す。
本明細書で使用される「５’末端」は、アンチセンス鎖の５’末端のように、５’末端ヌクレオチド、例えば、アンチセンス鎖の５’末端の１～約５ヌクレオチドの間を指す。本明細書で使用される「３’末端」は、センス鎖の３’末端のように、相補的なアンチセンス鎖の５’末端のヌクレオチドに相補的な領域、例えば、１～約５ヌクレオチドの領域を指す。
本明細書で使用される「不安定化ヌクレオチド」という用語は、塩基対が従来の塩基対（すなわち、ワトソン－クリック塩基対）よりも結合強度が低くなるように、第２のヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体と塩基対を形成することができる第１のヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体を指す。特定の実施形態では、不安定化ヌクレオチドは、第２のヌクレオチドとミスマッチ塩基対を形成することができる。他の実施形態では、不安定化ヌクレオチドは、第２のヌクレオチドとゆらぎ塩基対を形成することができる。さらに他の実施形態では、不安定化ヌクレオチドは、第２のヌクレオチドと曖昧な塩基対を形成することができる。
本明細書で使用される「塩基対」という用語は、オリゴヌクレオチド二重鎖（例えば、ＲＮＡサイレンシング剤の鎖及び標的ｍＲＮＡ配列によって形成される二重鎖）の対向する鎖上のヌクレオチド（またはヌクレオチド類似体）の対間の、主に、ヌクレオチド（またはヌクレオチド類似体）間のＨ結合、ファンデルワールス相互作用などによる相互作用を指す。本明細書で使用される「結合強度」または「塩基対強度」という用語は、塩基対の強度を指す。
本明細書で使用される用語「ミスマッチ塩基対」は、例えば、正常な相補的なＧ：Ｃ、Ａ：Ｔ、Ａ：Ｕ塩基対ではない、非相補的または非ワトソンクリック塩基対からなる塩基対を指す。本明細書で使用される用語「曖昧な塩基対」（非識別塩基対としても知られる）は、ユニバーサルヌクレオチドによって形成される塩基対を指す。
本明細書で使用される「ユニバーサルヌクレオチド（ｕｎｉｖｅｒｓａｌ ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ）」（「中性ヌクレオチド」としても知られる）という用語は、塩基対を形成するときの相補的なポリヌクレオチド上で塩基間を有意に識別しない塩基（「ユニバーサル塩基」または「中性塩基」）を有するヌクレオチド（例えば、ある特定の不安定化ヌクレオチド）を含む。ユニバーサルヌクレオチドは、主に疎水性分子であり、スタッキング相互作用により逆平行二本鎖核酸（例えば、二本鎖ＤＮＡまたはＲＮＡ）に効率よくパックすることができる。ユニバーサルヌクレオチドの塩基部分は、典型的には、窒素含有芳香族複素環部分を含む。
本明細書で使用される「十分な相補性」または「十分な程度の相補性」という用語は、ＲＮＡサイレンシング剤が、それぞれ、所望の標的ＲＮＡに結合する、及び標的ｍＲＮＡのＲＮＡサイレンシングを誘発するのに十分な配列を（例えば、アンチセンス鎖、ｍＲＮＡ標的化部分またはｍｉＲＮＡ動員部分中に）有することを意味する。
本明細書で使用される「翻訳抑制」という用語は、ｍＲＮＡ翻訳の選択的阻害を指す。自然な翻訳抑制は、ｓｈＲＮＡ前駆体から切断されたｍｉＲＮＡを介して進行する。ＲＮＡｉ及び翻訳抑制の両方が、ＲＩＳＣによって媒介される。ＲＮＡｉ及び翻訳抑制の両方が自然に発生するか、例えば、標的遺伝子の発現をサイレンシングするためにヒトの手によって開始され得る。
本発明の様々な方法論は、値、レベル、特徴、特性、性質などを、本明細書では交換可能に「適切な対照」と呼ばれる「好適な対照」と比較することを含むステップを含む。「好適な対照」または「適切な対照」は、比較目的に有用な、当業者によく知られている任意の対照または標準である。一実施形態では、「好適な対照」または「適切な対照」は、本明細書に記載のとおり、ＲＮＡｉ方法論を実施する前に決定された値、レベル、特徴、特性、性質などである。例えば、転写速度、ｍＲＮＡレベル、翻訳速度、タンパク質レベル、生物学的活性、細胞の特徴または性質、遺伝子型、表現型などは、本発明のＲＮＡサイレンシング剤を細胞または生物に導入する前に決定することができる。別の実施形態では、「好適な対照」または「適切な対照」は、細胞または生物、例えば対照または例えば、正常な形質を呈する正常な細胞もしくは生物において、決定された値、レベル、特徴、特性、性質などである。さらに別の実施形態では、「好適な対照」または「適切な対照」は、事前定義された値、レベル、特徴、特性、性質などである。
別途定義されない限り、本明細書で使用されるすべての技術及び科学用語は、本発明が属する当業者により一般に理解されるものと同じ意味を有する。本明細書に記載されるものと同様または同等の方法及び材料が、本発明の実践または試験で使用することができるが、好適な方法及び材料が以下に記載される。本明細書で言及されるすべての刊行物、特許出願、特許、及び他の参考文献は、参照によってその全体が組み込まれる。矛盾する場合には、定義を含めて本明細書が優先する。加えて、材料、方法、及び実施例は例示にすぎず、限定であることは意図されない。
いくつかの実施形態では、本発明のＲＮＡサイレンシング剤は、１つ以上のｓＦＬＴ１タンパク質をコードするｍＲＮＡ分子中のイントロン領域を標的とするように設計されている。
本発明は、１つ以上のｓＦＬＴ１ ｍＲＮＡ及びそれらの対応するタンパク質を標的とする。二本鎖ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）の１本の鎖は、ｓＦＬＴ１ ｍＲＮＡ内の標的配列を補完する。ｓｉＲＮＡを対象または細胞に導入後、ｓｉＲＮＡは、部分的に解かれ、ｓＦＬＴ１ ｍＲＮＡ内のイントロン標的領域に部位特異的に結合し、ｍＲＮＡヌクレアーゼを活性化する。このヌクレアーゼは、ｓＦＬＴ１ ｍＲＮＡを切断し、それによってｓＦＬＴ１タンパク質の翻訳が停止される。細胞は、部分的に消化されたｍＲＮＡを自身で除去して、翻訳を妨げるか、または細胞が部分的に翻訳されたタンパク質を消化する。特定の実施形態では、ｓＦＬＴ１タンパク質の発現は、対象または細胞において、約３０％～５０％、または約３０％～４０％減少する。
本発明の実施形態では、本発明のＲＮＡサイレンシング剤は、ヒトｆｌｔ１遺伝子を標的とすることができ、これは、２２８３位（５’ＣＴＣＴＣＧＧＡＴＣＴＣＣＡＡＡＴＴＴＡ３’（配列番号１））または２５１９位（５’ＣＡＴＣＡＴＡＧＣＴＡＣＣＡＴＴＴＡＴＴ３’（配列番号２））に見出すことができる。
本発明の様々な態様は、以下のサブセクションでさらに詳細に説明される。
Ｉ．ｓｉＲＮＡの設計
いくつかの実施形態では、ｓｉＲＮＡは、以下のように設計される。最初に、標的遺伝子（例えばｆｌｔ１遺伝子）の一部、例えば標的配列のうちの１つ以上、例えば、ｓＦＬＴ１－ｉ１３－２２８３、ｓＦＬＴ１－ｉ１５ａ－２５１９、ｓＦＬＴ１－ｉ１３－２３１８、ｓＦＬＴ１－ｉ１５ａ－２５８５のうちの１つまたは任意の組み合わせが、標的遺伝子のイントロン領域から選択される。これらの部位におけるｍＲＮＡの切断は、対応する可溶性タンパク質の翻訳が不要になるものである。センス鎖は、標的配列に基づいて設計された。好ましくは、部分（及び対応するセンス鎖）は、約３０～３５個のヌクレオチド、例えば、３０、３１、３２、３３、３４または３５個のヌクレオチドを含む。より好ましくは、部分（及び対応するセンス鎖）は、２１、２２または２３個のヌクレオチドを含む。しかし、当業者であれば、１９ヌクレオチド未満の長さまたは２５ヌクレオチドを超える長さを有するｓｉＲＮＡも、ＲＮＡｉを媒介するように機能し得ることを理解するであろう。したがって、そのような長さのｓｉＲＮＡもまた、ＲＮＡｉを媒介する能力を保持する限り、本発明の範囲内である。より長いＲＮＡｉ剤が、特定の哺乳動物細胞でインターフェロンまたはＰＫＲ応答を誘発することが実証されているが、これは望ましくない場合がある。好ましくは、本発明のＲＮＡｉ剤は、ＰＫＲ応答を誘発しない（すなわち、十分に短い長さのものである）。しかし、より長いＲＮＡｉ剤は、例えば、ＰＲＫ応答を生じさせることができない細胞型、または代替手段によってＰＫＲ応答が下方制御または抑制されている状況では有用であり得る。
センス鎖配列は、標的配列が本質的に鎖の中央にあるように設計される。標的配列を中心からずれた位置に移動させることにより、場合によっては、ｓｉＲＮＡによる切断の効率が低下し得る。こうした組成物、すなわち効率の低い組成物は、野生型ｍＲＮＡのオフサイレンシングが検出された場合に使用するのに望ましいかもしれない。
アンチセンス鎖は、通常、センス鎖と同じ長さであり、相補的なヌクレオチドを含む。一実施形態では、鎖は、完全に相補的である。すなわち、鎖は、アラインまたはアニーリングさせたときに、平滑末端となる。別の実施形態では、鎖は、１、２、または３ヌクレオチドオーバーハングが、生成されるようにアラインまたはアニーリングを含む。すなわちセンス鎖の３’末端が、アンチセンス鎖の５’末端よりも１、２、または３ヌクレオチド伸長している、及び／またはアンチセンス鎖の３’末端が、センス鎖の５’末端よりも１、２、または３ヌクレオチド伸長している。オーバーハングは、標的遺伝子配列（またはその相補体）に対応するヌクレオチドを含む（またはからなる）ことができる。あるいは、オーバーハングは、デオキシリボヌクレオチド、例えばｄＴ、またはヌクレオチド類似体、または他の好適な非ヌクレオチド物質を含む（またはそれらからなる）ことができる。
ＲＩＳＣへのアンチセンス鎖の侵入を容易にする（したがって、標的の切断及びサイレンシングの効率を上昇させるまたは改善する）ために、センス鎖の５’末端とアンチセンス鎖の３’末端との間の塩基対強度を改変（低下または減少）させ得る。これらは、以下に詳細に記載され、米国特許第７，４５９，５４７号、第７，７７２，２０３号及び第７，７３２，５９３号、表題「Ｍｅｔｈｏｄｓ ａｎｄ Ｃｏｍｐｏｓｉｔｉｏｎｓ ｆｏｒ Ｃｏｎｔｒｏｌｌｉｎｇ Ｅｆｆｉｃａｃｙ ｏｆ ＲＮＡ Ｓｉｌｅｎｃｉｎｇ」、（２００３年６月２日出願）及び米国特許第８，３０９，７０４号、７，７５０，１４４号、第８，３０４，５３０号、第８，３２９，８９２号及び第８，３０９，７０５号表題「Ｍｅｔｈｏｄｓ ａｎｄ Ｃｏｍｐｏｓｉｔｉｏｎｓ ｆｏｒ Ｅｎｈａｎｃｉｎｇ ｔｈｅ Ｅｆｆｉｃａｃｙ ａｎｄ Ｓｐｅｃｉｆｉｃｉｔｙ ｏｆ ＲＮＡｉ」（２００３年６月２日出願）、これらの内容全体がこの参照によりその組み込まれる。本発明のこれらの態様の一実施形態では、第１の鎖またはアンチセンス鎖の５’末端と第２の鎖またはセンス鎖の３’末端との間のＧ：Ｃ塩基対が、第１の鎖またはアンチセンス鎖の３’末端と第２の鎖またはセンス鎖の５’末端との間よりも少ないため、塩基対強度は低い。別の実施形態では、塩基対強度は、第１の鎖またはアンチセンス鎖の５’末端と第２の鎖またはセンス鎖の３’末端との間の少なくとも１つのミスマッチ塩基対により小さい。特定の例示的な実施形態では、ミスマッチ塩基対は、以下からなる群から選択される：Ｇ：Ａ、Ｃ：Ａ、Ｃ：Ｕ、Ｇ：Ｇ、Ａ：Ａ、Ｃ：Ｃ及びＵ：Ｕ。別の実施形態では、塩基対強度は、第１またはアンチセンス鎖の５’末端と第２またはセンス鎖の３’末端との間の少なくとも１つのゆらぎ塩基対、例えば、Ｇ：Ｕにより低い。別の実施形態では、塩基対強度は、希少ヌクレオチド、例えばイノシン（Ｉ）を含む少なくとも１つの塩基対により低い。特定の例示的な実施形態では、塩基対は、Ｉ：Ａ、Ｉ：Ｕ及びＩ：Ｃからなる群から選択される。さらに別の実施形態では、塩基対強度は、修飾ヌクレオチドを含む少なくとも１つの塩基対により低い。特定の例示的な実施形態では、修飾ヌクレオチドは、２－アミノ－Ｇ、２－アミノ－Ａ、２，６－ジアミノ－Ｇ、及び２，６－ジアミノ－Ａからなる群から選択される。
ｓＦＬＴ１標的配列を標的とするのに好適であるｓｉＲＮＡの設計は、以下に詳細に記載する。ｓｉＲＮＡは、ｆｌｔ１遺伝子中に見られる任意の他の標的配列について、上記の例示的な教示に従って設計することができる。さらに、この技術は、例えば疾患を引き起こさない標的配列など、任意の他の標的配列を標的とすることに適用可能である。
ｓｉＲＮＡがｍＲＮＡ（例えば、ｓＦＬＴ１ ｍＲＮＡ）を破壊することによる有効性を検証するために、キイロショウジョウバエをベースにしたｉｎ ｖｉｔｒｏ ｍＲＮＡ発現系において、ｓｉＲＮＡをｃＤＮＡ（例えば、ＦＬＴ１ ｃＤＮＡ）と共にインキュベートすることができる。３２Ｐで放射性標識された、新しく合成されたｍＲＮＡ（例えば、ＦＬＴ１ ｍＲＮＡ）は、アガロースゲル上でオートラジオグラフィーにより検出される。切断されたｍＲＮＡの存在は、ｍＲＮＡヌクレアーゼ活性を示す。好適な対照には、ｓｉＲＮＡの省略が含まれる。あるいは、選択されたｓｉＲＮＡと同じヌクレオチド組成を有するが、適切な標的遺伝子に対して有意な配列相補性を有さない対照ｓｉＲＮＡが選択される。こうした陰性対照は、選択したｓｉＲＮＡのヌクレオチド配列をランダムにスクランブルすることによって設計できる。相同性検索を実行して、陰性対照が、適切なゲノム内の任意の他の遺伝子との相同性を欠いていることが確認できる。さらに、陰性対照ｓｉＲＮＡは、１つ以上の塩基ミスマッチを配列に導入することによって設計できる。
最適なｍＲＮＡ特異性及び最大ｍＲＮＡ切断をもたらすｓｉＲＮＡ－ｍＲＮＡ相補部位が選択される。
ＩＩ．ＲＮＡｉ剤
本発明は、例えば上記のように設計されたｓｉＲＮＡ分子を含む。本発明のｓｉＲＮＡ分子は、化学的に合成することができ、またはＤＮＡ鋳型からｉｎ ｖｉｔｒｏで、または例えばｓｈＲＮＡからｉｎ ｖｉｖｏで転写することができ、または組換えヒトＤＩＣＥＲ酵素を使用して、ｉｎ ｖｉｔｒｏで転写されたｄｓＲＮＡ鋳型を切断して、２０、２１、または２３ｂｐの二本鎖ＲＮＡ媒介ＲＮＡｉのプールにする。ｓｉＲＮＡ分子は、当技術分野で知られている任意の方法を使用して、設計することができる。
一態様では、ＲＮＡｉ剤が干渉リボ核酸、例えば上記のｓｉＲＮＡまたはｓｈＲＮＡである代わりに、ＲＮＡｉ剤は、干渉リボ核酸、例えば上記のｓｈＲＮＡをコードすることができる。換言すれば、ＲＮＡｉ剤は、干渉リボ核酸の転写鋳型となり得る。したがって、本発明示のＲＮＡｉ剤はまた、小さいヘアピンＲＮＡ（ｓｈＲＮＡ）、及びｓｈＲＮＡを発現するように操作された発現構築物を含み得る。ｓｈＲＮＡの転写は、ポリメラーゼＩＩＩ（ｐｏｌ ＩＩＩ）プロモーターで開始され、４－５－チミン転写終結部位の２位で終結すると考えられている。発現時に、ｓｈＲＮＡは、折り畳まれて、３’ＵＵオーバーハングを有するステムループ構造になると考えられ、その後、これらのｓｈＲＮＡの末端がプロセシングされ、ｓｈＲＮＡが、約２１～２３ヌクレオチドのｓｉＲＮＡ様分子に変換される（Ｂｒｕｍｍｅｌｋａｍｐ ｅｔ ａｌ．，２００２；Ｌｅｅ ｅｔ ａｌ．，２００２，上記；Ｍｉｙａｇｉｓｈｉ ｅｔ ａｌ．，２００２；Ｐａｄｄｉｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，２００２，上記；Ｐａｕｌ ｅｔ ａｌ．，２００２，上記；Ｓｕｉ ｅｔ ａｌ．，２００２上記；Ｙｕ ｅｔ ａｌ．，２００２，上記。ｓｈＲＮＡの設計及び使用に関するさらなる情報は、インターネットの次のアドレスで確認できる：ｋａｔａｎｄｉｎ．ｃｓｈｌ．ｏｒｇ：９３３１／ＲＮＡｉ／ｄｏｃｓ／ＢｓｅＲＩ－ＢａｍＨＩ＿Ｓｔｒａｔｅｇｙ．ｐｄｆ ａｎｄ ｋａｔａｎｄｉｎ．ｃｓｈｌ．ｏｒｇ：９３３１／ＲＮＡｉ／ｄｏｃｓ／Ｗｅｂ＿ｖｅｒｓｉｏｎ＿ｏｆ＿ ＰＣＲ＿ｓｔｒａｔｅｇｙ１．ｐｄｆ）。
本発明の発現構築物としては、適切な発現系での使用に好適である任意の構築物が挙げられ、当技術分野において知られているとおり、これらに限定されないが、レトロウイルスベクター、線形発現カセット、プラスミド、及びウイルスまたはウイルス由来のベクターが挙げられる。そのような発現構築物は、１つ以上の誘導性プロモーター、ＲＮＡ Ｐｏｌ ＩＩＩプロモーター系、例えば、Ｕ６ ｓｎＲＮＡプロモーターもしくはＨ１ ＲＮＡポリメラーゼＩＩＩプロモーター、または当技術分野で知られている他のプロモーターを挙げることができる。構築物は、ｓｉＲＮＡの一方または両方の鎖を含むことができる。両方の鎖を発現する発現構築物はまた、両方の鎖を連結するループ構造を含むことができ、または各鎖は、同じ構築物内の別々のプロモーターから別々に転写することができる。各鎖は、別々の発現構築物から転写できる（Ｔｕｓｃｈｌ，Ｔ．，２００２，上記）。
合成ｓｉＲＮＡは、カチオン性リポソームトランスフェクション及びエレクトロポレーションなど、当技術分野で知られている方法によって細胞に送達することができる。標的遺伝子（すなわち、ｆｌｔ１遺伝子）の長期的な抑制を得るため、及び特定の状況下での送達を容易にするために、１つ以上のｓｉＲＮＡを組換えＤＮＡ構築物から細胞内で発現させることができる。組換えＤＮＡ構築物から細胞内でｓｉＲＮＡ二本鎖を発現させて、細胞内でより長期の標的遺伝子抑制を可能にするためのそのような方法は、機能的な二本鎖ｓｉＲＮＡを発現することができる哺乳動物Ｐｏｌ ＩＩＩプロモーター系（例えば、Ｈ１またはＵ６／ｓｎＲＮＡプロモーター系（Ｔｕｓｃｈｌ，Ｔ．，２００２，上記）など、当該分野で既知である（Ｂａｇｅｌｌａ ｅｔ ａｌ．，１９９８；Ｌｅｅ ｅｔ ａｌ．，２００２，上記；Ｍｉｙａｇｉｓｈｉ ｅｔ ａｌ．，２００２，上記；Ｐａｕｌ ｅｔ ａｌ．，２００２，上記；Ｙｕ ｅｔ ａｌ．，２００２），上記；Ｓｕｉ ｅｔ ａｌ．，２００２，上記）。ＲＮＡ ＰｏｌＩＩＩによる転写終結は、ＤＮＡ鋳型内の一連の４つの連続するＴ残基で生じ、これにより、ｓｉＲＮＡ転写産物を特定の配列で終結させる機構がもたらされる。ｓｉＲＮＡは、５’－３’及び３’－５’方向で標的遺伝子の配列に相補的であり、ｓｉＲＮＡの２本の鎖は、同じ構築物または別々の構築物内で発現し得る。Ｈ１またはＵ６ ｓｎＲＮＡプロモーターによって駆動され、細胞内で発現するヘアピンｓｉＲＮＡは、標的遺伝子の発現を阻害し得る（Ｂａｇｅｌｌａ ｅｔ ａｌ．，１９９８；Ｌｅｅ ｅｔ ａｌ．，２００２，上記；Ｍｉｙａｇｉｓｈｉ ｅｔ ａｌ．，２００２，上記；Ｐａｕｌ ｅｔ ａｌ．，２００２，上記；Ｙｕ ｅｔ ａｌ．，２００２），上記；Ｓｕｉ ｅｔ ａｌ．，２００２，上記）。Ｔ７プロモーターの制御下にあるｓｉＲＮＡ 配列を含む構築物は、Ｔ７ ＲＮＡポリメラーゼを発現するベクターと共に細胞に同時トランスフェクトされたときに、機能的なｓｉＲＮＡも作成される（Ｊａｃｑｕｅ ｅｔ ａｌ．，２００２，上記）。単一の構築物は、同じ遺伝子または複数の遺伝子を標的とするｓＦｌｔ１をコードする遺伝子の複数の領域など、ｓｉＲＮＡをコードする複数の配列を含んでもよく、また、例えば、別のＰｏｌＩＩＩ プロモーター部位によって駆動され得る。
動物細胞は、マイクロＲＮＡ（ｍｉＲＮＡ）と呼ばれる約２２ヌクレオチドの一連の非コードＲＮＡを発現する。これは、動物の発育中に転写後または翻訳レベルで遺伝子発現を調節できる。ｍｉＲＮＡの共通の特徴の１つは、おそらくＲＮａｓｅ ＩＩＩ型酵素であるＤｉｃｅｒ、またはその相同体によって、約７０ヌクレオチドの前駆体ＲＮＡステムループからすべてが切り出されることである。ｍｉＲＮＡ前駆体のステム配列を標的ｍＲＮＡに相補的な配列で置換することにより、操作された前駆体を発現するベクター構築物を使用して、ｓｉＲＮＡを産生し、哺乳動物細胞内の特定のｍＲＮＡ標的に対してＲＮＡｉを開始できる（Ｚｅｎｇ ｅｔ ａｌ．，上記，２００２）。ポリメラーゼＩＩＩプロモーターを含むＤＮＡベクターによって発現したときに、マイクロＲＮＡ設計ヘアピンは、遺伝子発現のサイレンシングを行うことができる（ＭｃＭａｎｕｓ ｅｔ ａｌ．，２００２，上記）。多型を標的とするマイクロＲＮＡは、ｓｉＲＮＡ媒介遺伝子サイレンシングがない場合、変異タンパク質の翻訳をブロックするのにも有用であり得る。このような用途は、例えば、設計されたｓｉＲＮＡが、野生型タンパク質のオフターゲット サイレンシングを引き起こした状況において、有用であり得る。
ウイルス媒介性送達機構は、ｓｉＲＮＡの発現を介して、例えば、ＲＮＡ Ｐｏｌ ＩＩ プロモーター転写制御下で、ｓｉＲＮＡを保有する組換えアデノウイルスを生成することによって、標的とした遺伝子の特異的サイレンシングを誘導するためにも使用できる（Ｘｉａ ｅｔ ａｌ．，２００２，上記）。これらの組換えアデノウイルスによるＨｅＬａ細胞の感染により、内因性標的遺伝子の発現が減少し得る。ｓｉＲＮＡの標的遺伝子を発現するトランスジェニックマウスへ組換えアデノウイルスベクターを注入することにより、標的遺伝子発現のｉｎ ｖｉｖｏ減少がもたらされる。同上。動物モデルでは、全胚エレクトロポレーションにより、合成ｓｉＲＮＡを移植後のマウス胚に効率的に送達できる（Ｃａｌｅｇａｒｉ ｅｔ ａｌ．，２００２）。成体マウスでは、ｓｉＲＮＡの効率的な送達は、「高圧」送達技術、大量のｓｉＲＮＡ含有溶液を動物の尾静脈から急速に（５秒以内に）注入することにより達成できる（Ｌｉｕ ｅｔ ａｌ．，１９９９，上記；ＭｃＣａｆｆｒｅｙ ｅｔ ａｌ．，２００２，上記；Ｌｅｗｉｓ ｅｔ ａｌ．，２００２。ナノ粒子及びリポソームを使用して、ｓｉＲＮＡを動物に送達することもできる。特定の例示的な実施形態では、組換えアデノ随伴ウイルス（ｒＡＡＶ）及びそれらの関連ベクターを使用して、１つ以上のｓｉＲＮＡを細胞、例えば神経細胞（例えば脳細胞）に送達することができる（米国特許出願第２０１４／０２９６４８６号、同第２０１０／０１８６１０３号、同第２００８／０２６９１４９号、同第２００６／００７８５４２号、及び同第２００５／０２２０７６６号）。
本発明の核酸組成物は、非修飾ｓｉＲＮＡ及び当技術分野において公知である修飾ｓｉＲＮＡ、例えば、架橋ｓｉＲＮＡ誘導体または例えばそれらの３’末端または５’末端に連結した非ヌクレオチド部分を有する誘導体など、を両方とも含む。このようにｓｉＲＮＡ誘導体を修飾することにより、対応するｓｉＲＮＡと比較して、細胞への取り込みを改善する、または得られたｓｉＲＮＡ誘導体の細胞標的活性を向上させることができ、ｓｉＲＮＡ誘導体を細胞内で追跡する、または対応するｓｉＲＮＡと比較して、ｓｉＲＮＡ誘導体の安定性を改善するのに有用である。
本明細書に記載のとおり、細胞または生物全体に導入された操作されたＲＮＡ前駆体により、所望のｓｉＲＮＡ分子の産生がもたらされる。次いで、そのようなｓｉＲＮＡ分子は、ＲＮＡｉ経路の内因性タンパク質成分と会合して、特定のｍＲＮＡ配列に結合し、切断及び破壊のための標的とする。このようにして、操作されたＲＮＡ前駆体から生成されたｓｉＲＮＡによって標的とされるｍＲＮＡは、細胞または生物から枯渇し、これにより、細胞または生物中のそのｍＲＮＡによってコードされるタンパク質の濃度の低下となる。ＲＮＡ前駆体は、典型的には、ｄｓＲＮＡの１つの鎖を個別にコードするか、またはＲＮＡヘアピンループ構造の全ヌクレオチド配列をコードするかのいずれかである核酸分子である。
本発明の核酸組成物は、コンジュゲートしていなくてもよく、またはナノ粒子などの別の部分にコンジュゲートしてもよく、これにより、組成物の性質、例えば、吸収、効果、バイオアベイラビリティ及び／または半減期などの薬物動態パラメータを向上させる。コンジュゲーションは、例えば、本技術で知られている方法、以下の方法を用いて、達成することができる。Ｌａｍｂｅｒｔ ｅｔ ａｌ．，Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖ．Ｒｅｖ．：４７（１），９９－１１２（２００１）（ポリアルキルシアノアクリレート（ＰＡＣＡ）ナノ粒子に付加された核酸について記載）、Ｆａｔｔａｌ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｃｏｎｔｒｏｌ Ｒｅｌｅａｓｅ ５３（１－３）：１３７－４３（１９９８）（ナノ粒子に結合した核酸について記載）、Ｓｃｈｗａｂ ｅｔ ａｌ．，Ａｎｎ．Ｏｎｃｏｌ．５ Ｓｕｐｐｌ．４：５５－８（１９９４）（インターカレーション剤、疎水性基、ポリカチオンまたはＰＡＣＡナノ粒子と連結した核酸について記載）、及びＧｏｄａｒｄ ｅｔ ａｌ．，Ｅｕｒ．Ｊ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．２３２（２）：４０４－１０（１９９５）（ナノ粒子に連結した核酸について記載）。
本発明の核酸分子は、当技術分野で知られている任意の方法を使用して標識することもできる。例えば、核酸組成物は、フルオロフォア、例えば、Ｃｙ３、フルオレセイン、またはローダミンで標識することができる。標識は、キット、例えば、ＳＩＬＥＮＣＥＲ（商標）ｓｉＲＮＡ標識キット（Ａｍｂｉｏｎ）を使用して行うことができる。さらに、ｓｉＲＮＡは、例えば、３Ｈ、３２Ｐまたは他の適切な同位体を使用して、放射標識させ得る。
さらに、ＲＮＡｉは、少なくとも１つの一本鎖ＲＮＡ中間体を介して進行すると考えられているため、当業者であれば、ｓｓ－ｓｉＲＮＡ（例えば、ｄｓ－ｓｉＲＮＡのアンチセンス鎖）も、本明細書に記載のとおり、（例えば、化学合成のために）設計され、生成され（例えば、酵素的に生成され）るか、または（例えば、ベクターまたはプラスミドから）発現され、特許請求される方法論に従って利用され得ることを理解するであろう。さらに、無脊椎動物では、ＲＮＡｉは、ＲＮＡｉのエフェクターとして作用する長いｄｓＲＮＡ（例えば、約１００～１０００ヌクレオチド長のｄｓＲＮＡ、好ましくは、約２００～５００、例えば、約２５０、３００、３５０、４００または４５０ヌクレオチド長など）によって効果的に誘発され得る（Ｂｒｏｎｄａｎｉ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ．２００１ Ｄｅｃ．４；９８（２５）：１４４２８－３３．Ｅｐｕｂ ２００１ Ｎｏｖ．２７．）
ＩＩＩ．抗ｓＦｌｔ１ ＲＮＡサイレンシング剤
本発明は、抗ｓＦＬＴ１ ＲＮＡサイレンシング剤（例えば、ｓｉＲＮＡ及びｓｈＲＮＡ）、上記ＲＮＡサイレンシング剤を作製する方法、及び１つ以上のｓＦＬＴ１タンパク質のＲＮＡサイレンシングのために、改善されたＲＮＡサイレンシング剤（またはその一部）を使用するための方法（例えば、研究及び／または治療方法）を特徴とする。ＲＮＡサイレンシング剤は、アンチセンス鎖（またはその一部）を含み、アンチセンス鎖は、ＲＮＡ媒介サイレンシング機構（例えば、ＲＮＡｉ）を媒介するためにヘテロ接合型一塩基多型に十分な相補性を有する。
ａ）抗ｓＦｌｔ１ ｓｉＲＮＡ分子の設計
本発明のｓｉＲＮＡ分子は、センス鎖及び相補的なアンチセンス鎖からなる二重鎖であり、このアンチセンス鎖は、ＲＮＡｉを媒介するために、ｓＦＬＴ１ ｍＲＮＡに十分に相補性を有する。好ましくは、ｓｉＲＮＡ分子は、約１０～５０以上のヌクレオチド長を有する、すなわち、各鎖は、１０～５０のヌクレオチド（またはヌクレオチド類似体）を含む。より好ましくは、ｓｉＲＮＡ分子は、各鎖に約１６～３０、例えば、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、または３０のヌクレオチド長を有する。ここで、鎖のうちの１つは、標的領域に十分に相補的である。好ましくは、鎖は、アラインしない（すなわち、対向する鎖中に、相補的な塩基が生じない）鎖の末端に、少なくとも１、２、または３の塩基が存在するように配列される。これにより、鎖がアニールされるときに、二本鎖の一端または両端で、１、２、または３残基のオーバーハングが発生するようになる。好ましくは、ｓｉＲＮＡ分子は、約１０～５０以上のヌクレオチド長を有する、すなわち、各鎖は、１０～５０のヌクレオチド（またはヌクレオチド類似体）を含む。より好ましくは、ｓｉＲＮＡ分子は、各鎖に約１６～３０、例えば、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、または３０個のヌクレオチド長を有し、鎖の一方は標的配列に実質的に相補的であり、他方の鎖は第１の鎖と同一または実質的に同一である。
概して、ｓｉＲＮＡは、当技術分野において公知である任意の方法を使用して、例えば、以下のプロトコルを使用して設計することができる：
１．ｓｉＲＮＡは、標的配列、例えば、標的配列に特異的であるものとする。一実施形態では、標的配列は、可溶性Ｆｌｔ１ ｍＲＮＡ中に見出されるが、全長Ｆｌｔ ｍＲＮＡ中には見出されない。別の実施形態では、標的配列は、可溶性Ｆｌｔ１ ｍＲＮＡ及び全長Ｆｌｔ ｍＲＮＡの両方の中に見出される。別の実施形態では、標的配列は、全長Ｆｌｔ ｍＲＮＡ中に見出される。第１の鎖は、標的配列に相補的であるものとし、他の鎖は、第１の鎖に実質的に相補的である。一実施形態では、標的配列は、１つ以上の可溶性Ｆｌｔ ｍＲＮＡ配列のイントロン領域中でコードされる。例示的な標的配列は、標的遺伝子の１つ以上のイントロン領域に対応する。これらの部位においてｍＲＮＡが切断されることにより、対応する可溶性タンパク質の翻訳は除去されるが、全長タンパク質の翻訳は除去されないはずである。ｆｌｔ遺伝子の他の領域からの標的配列も標的化に好適である。センス鎖は、標的配列に基づいて設計される。さらに、より低いＧ／Ｃ含有率（３５～５５％）を有するｓｉＲＮＡは、５５％より高いＧ／Ｃ含量を有するｓｉＲＮＡより活性であり得る。したがって、一実施形態では、本発明は、３５～５５％のＧ／Ｃ含有率を有する核酸分子を含む。
２．ｓｉＲＮＡのセンス鎖は、選択した標的部位の配列に基づいて設計される。好ましくは、センス鎖は、約１９～２５ヌクレオチド、例えば、１９、２０、２１、２２、２３、２４または２５ヌクレオチドを含む。より好ましくは、センス鎖は、２１、２２または２３のヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、１６ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、１７ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、１８ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、１９ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、２０ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、２１ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、２２ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、２３ヌクレオチドを含む。しかし、当業者であれば、１９ヌクレオチド未満の長さまたは２５ヌクレオチドを超える長さを有するｓｉＲＮＡも、ＲＮＡｉを媒介するように機能し得ることを理解するであろう。したがって、そのような長さのｓｉＲＮＡもまた、ＲＮＡｉを媒介する能力を保持する限り、本発明の範囲内である。より長いＲＮＡサイレンシング剤が、特定の哺乳動物細胞でインターフェロンまたはプロテインキナーゼＲ（ＰＫＲ）応答を誘発することが実証されているが、これは望ましくない場合がある。好ましくは、本発明のＲＮＡサイレンシング剤は、ＰＫＲ応答を誘発しない（すなわち、十分に短い長さのものである）。しかし、より長いＲＮＡサイレンシング剤は、例えば、ＰＲＫ応答を生じさせることができない細胞型、または代替手段によって、ＰＫＲ応答が下方制御または抑制されている状況では有用であり得る。
本発明のｓｉＲＮＡ分子は、ｓｉＲＮＡがＲＮＡｉを媒介できるように、標的配列との十分な相補性を有する。一般に、標的遺伝子の標的配列部分と十分に同一であるヌクレオチド配列を含むｓｉＲＮＡが、標的遺伝子のＲＩＳＣ媒介切断をもたらすことが好ましい。したがって、好ましい実施形態では、ｓｉＲＮＡのセンス鎖は、標的の一部に十分に同一である配列を有するように設計される。例えば、センス鎖は、標的部位に対して１００％の同一性を有し得る。しかし、１００％同一である必要はない。センス鎖と標的ＲＮＡ配列との間で、８０％を超える同一性、例えば、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、またはさらには１００％の同一性が好ましい。本開示は、ＲＮＡｉの効率及び特異性を高めるために、特定の配列の変形を許容できるという利点を有する。一実施形態では、センス鎖は、可溶性ｆｌｔ１と全長ｆｌｔ１対立遺伝子との間で少なくとも１つの塩基対が異なる標的領域などの標的領域と４、３、２、１、または０個のミスマッチヌクレオチドを有する。例えば、標的領域は、機能獲得型変異を含み、他の鎖は、第１の鎖と同一であるかまたは実質的に同一である。さらに、１または２ヌクレオチドの小さい挿入または欠失を有するｓｉＲＮＡ配列も、ＲＮＡｉの媒介に有効であり得る。あるいは、ヌクレオチド類似体の置換または挿入を有するｓｉＲＮＡ配列は、阻害に有効であり得る。
配列同一性は、当技術分野で知られている配列比較及びアラインメントアルゴリズムによって決定され得る。２つの核酸配列（または２つのアミノ酸配列）の同一性パーセントを決定するために、最適な比較のために配列をアラインさせる（例えば、最適なアラインのために第１の配列または第２の配列にギャップを導入することができる）。次いで、対応するヌクレオチド（またはアミノ酸）位置のヌクレオチド（またはアミノ酸残基）を比較する。第１の配列内の位置が、第２の配列内の対応する位置と同じ残基で占有されている場合、分子はその位置で同一である。２つの配列間の同一性パーセントは、その配列が共有する同一位置の数に対応し（すなわち、％相同性＝同一位置の数／位置の総数ｘ１００）、任意により、導入されたギャップの数及び／または導入されたギャップの長さのスコアにペナルティを付与する。
配列の比較及び２つの配列間の同一性パーセントの決定は、数学的アルゴリズムを使用して達成され得る。一実施形態では、アラインメントは、十分な同一性を有するアラインされた配列の特定の部分において生成され、低い程度の同一性を有する部分では生成されない（すなわち、局所的アラインメント）。配列の比較に利用される局所アラインメントアルゴリズムの好ましい非限定的な例は、Ｋａｒｌｉｎ ａｎｄ Ａｌｔｓｃｈｕｌ（１９９０）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８７：２２６４－６８、改訂Ｋａｒｌｉｎ ａｎｄ Ａｌｔｓｃｈｕｌ（１９９３）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９０：５８７３－７７のアルゴリズムである。かかるアルゴリズムは、ＢＬＡＳＴプログラム（ｖｅｒｓｉｏｎ ２．０）、Ａｌｔｓｃｈｕｌ，ｅｔ ａｌ．（１９９０）Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２１５：４０３－１０に組み込まれる。
別の実施形態では、アラインメントは、適切なギャップを導入することによって最適化され、パーセント同一性は、アラインされた配列の長さ（すなわち、ギャップのあるアラインメント）にわたって決定される。比較目的のためのギャップアライメントを得るために、Ｇａｐｐｅｄ ＢＬＡＳＴを、Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．（１９９７）Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．２５（１７）：３３８９－３４０２に記載のとおり使用できる。別の実施形態では、適切なギャップを導入することによってアラインメントを最適化し、アラインされた配列の全長においてパーセント同一性を決定する（すなわち、グローバルアラインメント）。配列のグローバル比較に利用される数学的アルゴリズムの好ましい非限定的な例は、Ｍｙｅｒｓ及びＭｉｌｌｅｒのアルゴリズム、ＣＡＢＩＯＳ（１９８９）である。このようなアルゴリズムは、ＧＣＧ配列アラインメントソフトウェアパッケージの一部であるＡＬＩＧＮプログラム（バージョン２．０）に組み込まれている。アミノ酸配列を比較するためにＡＬＩＧＮプログラムを利用する場合、ＰＡＭ１２０重量残基テーブル、１２のギャップ長ペナルティ、及び４のギャップペナルティを使用することができる。
３．ｓｉＲＮＡのアンチセンス鎖またはガイド鎖は、日常的に、センス鎖と同じ長さであり、相補的ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖またはガイド鎖は、センス鎖より長い。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖またはガイド鎖は、センス鎖より短い。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖またはガイド鎖は、約１９～２５ヌクレオチド、例えば、１９、２０、２１、２２、２３、２４または２５ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖またはガイド鎖は、２１、２２または２３ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖またはガイド鎖は、１６ヌクレオチド長を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖またはガイド鎖は、１７ヌクレオチド長を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖またはガイド鎖は、１８ヌクレオチド長を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖またはガイド鎖は、１９ヌクレオチド長を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖またはガイド鎖は、２０ヌクレオチド長を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖またはガイド鎖は、２１ヌクレオチド長を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖またはガイド鎖は、２２ヌクレオチド長を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖またはガイド鎖は、２３ヌクレオチド長を含む。
一実施形態では、ガイド鎖及びセンス鎖は、完全に相補的である。すなわち、鎖は、アラインまたはアニーリングされたときに、平滑末端化される。別の実施形態では、ｓｉＲＮＡの鎖は、１～４、例えば、２ヌクレオチドの３’オーバーハングを有するように、対合させ得る。いくつかの実施形態では、３’オーバーハングは、１ヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、３’オーバーハングは、２ヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、３’オーバーハングは、３ヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、３’オーバーハングは、４ヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、３’オーバーハングは、５ヌクレオチドである。オーバーハングは、標的遺伝子配列（またはその相補体）に対応するヌクレオチドを含む（またはからなる）ことができる。あるいは、オーバーハングは、デオキシリボヌクレオチド、例えばｄＴ、またはヌクレオチド類似体、または他の好適な非ヌクレオチド物質を含む（またはそれらからなる）ことができる。したがって、別の実施形態では、核酸分子は、ＴＴなどの２ヌクレオチドの３’オーバーハングを有し得る。オーバーハングヌクレオチドは、ＲＮＡまたはＤＮＡのいずれかであり得る。上記のとおり、変異体：野生型のミスマッチがプリン：プリンのミスマッチである標的領域を選択することが望ましい。
４．当技術分野で知られている任意の方法を使用して、潜在的な標的を適切なゲノムデータベース（ヒト、マウス、ラットなど）と比較して、他のコード配列と有意な相同性を有する任意の標的配列を考慮する必要がなくなる。このような配列相同性検索の方法の１つは、ＢＬＡＳＴとして知られており、Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ＩｎｆｏｒｍａｔｉｏｎのＷｅｂサイトで入手できる。
５．評価基準を満たす１つ以上の配列を選択する。
ｓｉＲＮＡの設計及び使用に関する一般的な情報は、Ｔｈｅ Ｍａｘ－Ｐｌａｎｋ－Ｉｎｓｔｉｔｕｔ ｆｕｒ Ｂｉｏｐｈｙｓｉｋａｌｉｓｈｅ ＣｈｅｍｉｅのＷｅｂサイトで入手可能な「Ｔｈｅ ｓｉＲＮＡ Ｕｓｅｒ Ｇｕｉｄｅ」に見ることができる。
あるいは、ｓｉＲＮＡは、標的配列とハイブリダイズできる（例えば、４００ｍＭ ＮａＣｌ、４０ｍＭ ＰＩＰＥＳ ｐＨ６．４、１ｍＭＥＤＴＡと、５０℃または７０℃、１２～１６時間ハイブリダイズし、その後洗浄する）ヌクレオチド配列（またはオリゴヌクレオチド配列）として機能的に定義され得る。追加の好ましいハイブリダイゼーション条件には、１ｘＳＳＣで７０℃または１ｘＳＳＣで５０℃、５０％ホルムアミドでのハイブリダイゼーション、その後０．３ｘＳＳＣ、７０℃での洗浄、または４ｘＳＳＣで７０℃または４ｘＳＳＣで５０℃、５０％ホルムアミドでのハイブリダイゼーション、その後１ｘＳＳＣで６７℃での洗浄が含まれる。長さが５０塩基対未満であることが予測されるハイブリッドのハイブリダイゼーション温度は、ハイブリッドの融解温度（Ｔｍ）より５～１０℃低いものとする。ここで、Ｔｍは、次式に従って決定される。長さが１８塩基対未満のハイブリッドの場合、Ｔｍ（℃）＝２（Ａ＋Ｔ塩基数＃）＋４（Ｇ＋Ｃ塩基数＃）。長さが１８～４９塩基対のハイブリッドの場合、Ｔｍ（℃）＝８１．５＋１６．６（ｌｏｇ１０［Ｎａ＋］）＋０．４１（％Ｇ＋Ｃ）－（６００／Ｎ）（式中、Ｎは、ハイブリッド中の塩基数であり、［Ｎａ＋］は、ハイブリダイゼーションバッファ中のナトリウムイオンの濃度である（１ｘＳＳＣの［Ｎａ＋］＝０．１６５Ｍ））。ポリヌクレオチドハイブリダイゼーションのストリンジェンシー条件の追加の例は、Ｓａｍｂｒｏｏｋ，Ｊ．，Ｅ．Ｆ．Ｆｒｉｔｓｃｈ，ａｎｄ Ｔ．Ｍａｎｉａｔｉｓ，１９８９，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ，Ｎ．Ｙ．，ｃｈａｐｔｅｒｓ ９ ａｎｄ １１、及びＣｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，１９９５，Ｆ．Ｍ．Ａｕｓｕｂｅｌ ｅｔ ａｌ．，ｅｄｓ．，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．，ｓｅｃｔｉｏｎｓ ２．１０及び６．３－６．４に記載され、これらは、参照によって本明細書に組み込まれる。
陰性対照ｓｉＲＮＡは、選択されたｓｉＲＮＡと同じヌクレオチド組成物を有するものとするが、適切なゲノムとの有意な配列相補性はない。そのような陰性対照は、選択されたｓｉＲＮＡのヌクレオチド配列をランダムにスクランブルすることによって設計され得る。相同性検索を実施して、陰性対照が、適切なゲノム内の任意の他の遺伝子との相同性を欠いていることを確認できる。さらに、陰性対照ｓｉＲＮＡは、１つ以上の塩基ミスマッチを配列に導入することによって設計できる。
６．これによりｓｉＲＮＡが標的ｍＲＮＡ（例えば、可溶性ＦＬＴ１に対応するｓＦＬＴ１ ｍＲＮＡ）を破壊する有効性を検証するために、ショウジョウバエをベースにしたｉｎ ｖｉｔｒｏ ｍＲＮＡ発現系において、ｓｉＲＮＡを標的ｃＤＮＡ（例えば、ｆｌｔ１ ｃＤＮＡ）と共にインキュベートさせ得る。３２Ｐで放射性標識された、新しく合成された標的ｍＲＮＡ（例えば、ｓＦｌｔ１ ｍＲＮＡ）は、アガロースゲル上でオートラジオグラフィーにより検出される。切断された標的ｍＲＮＡの存在は、ｍＲＮＡヌクレアーゼ活性を示す。好適な対照には、ｓｉＲＮＡの省略及び非標的ｃＤＮＡの使用が含まれる。あるいは、選択されたｓｉＲＮＡと同じヌクレオチド組成を有するが、適切な標的遺伝子に対して有意な配列相補性を有さない対照ｓｉＲＮＡが選択される。そのような陰性対照は、選択されたｓｉＲＮＡのヌクレオチド配列をランダムにスクランブルすることによって設計できる。相同性検索を実施して、陰性対照が、適切なゲノム内の任意の他の遺伝子との相同性を欠いていることを確認できる。さらに、陰性対照ｓｉＲＮＡは、１つ以上の塩基ミスマッチを配列に導入することによって設計できる。
抗ｓｆｌｔ１ ｓｉＲＮＡは、上記の標的配列のいずれかを標的とするように設計され得る。ｓｉＲＮＡは、標的配列のサイレンシングを媒介するために標的配列と十分に相補的であるアンチセンス鎖を含む。特定の実施形態では、ＲＮＡサイレンシング剤は、ｓｉＲＮＡである。
最適なｍＲＮＡ特異性及び最大ｍＲＮＡ切断をもたらすｓｉＲＮＡ－ｍＲＮＡ相補部位が選択される。
ｂ）ｓｉＲＮＡ様分子
本発明のｓｉＲＮＡ様分子は、ＲＮＡｉまたは翻訳抑制による遺伝子サイレンシングを指示するために、ｓｆｌｔ１ ｍＲＮＡの標的配列に「十分に相補的」である配列を有する（すなわち、配列を有する鎖を有する）。ｓｉＲＮＡ様分子は、ｓｉＲＮＡ分子と同じ方法で設計されるが、センス鎖と標的ＲＮＡ間の配列同一性の程度は、ｍｉＲＮＡとその標的間で観察されるものに近似する。一般に、ｍｉＲＮＡ配列と対応する標的遺伝子配列との間の配列同一性の程度が低下したときに、ＲＮＡｉではなく翻訳抑制によって転写後の遺伝子サイレンシングが媒介される傾向が上昇する。したがって、標的遺伝子の翻訳抑制による転写後遺伝子サイレンシングが所望される別の実施形態では、ｍｉＲＮＡ配列は、標的遺伝子配列と部分的な相補性を有する。特定の実施形態では、ｍｉＲＮＡ配列は、標的ｍＲＮＡ内（例えば、標的ｍＲＮＡの３’ＵＴＲ内）に分散した１つ以上の短い配列（相補部位）との部分的な相補性を有する（Ｈｕｔｖａｇｎｅｒ ａｎｄ Ｚａｍｏｒｅ，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２００２；Ｚｅｎｇ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ，２００２；Ｚｅｎｇ ｅｔ ａｌ．，ＲＮＡ，２００３；Ｄｏｅｎｃｈ ｅｔ ａｌ．，Ｇｅｎｅｓ＆Ｄｅｖ．，２００３）。翻訳抑制の機構は協調的であるため、特定の実施形態では、複数の相補性部位（例えば、２、３、４、５、または６）を標的とし得る。
ＲＮＡｉまたは翻訳抑制を媒介するｓｉＲＮＡ様二本鎖の能力は、標的遺伝子配列と相補部位におけるサイレンシング剤のヌクレオチド配列との間の非同一ヌクレオチドの分布によって予測され得る。翻訳抑制による遺伝子サイレンシングが所望される一実施形態では、ｍｉＲＮＡガイド鎖及び標的ｍＲＮＡによって形成される二重鎖が、中央の「バルジ」を含むように、少なくとも１つの同一でないヌクレオチドが相補性部位の中央部分に存在する（Ｄｏｅｎｃｈ Ｊ Ｇ ｅｔ ａｌ．，Ｇｅｎｅｓ＆Ｄｅｖ．，２００３）。別の実施形態では、２、３、４、５、または６の連続したまたは連続していない非同一ヌクレオチドが導入される。非同一ヌクレオチドは、ゆらぎ塩基対（例えば、Ｇ：Ｕ）またはミスマッチ塩基対（Ｇ：Ａ、Ｃ：Ａ、Ｃ：Ｕ、Ｇ：Ｇ、Ａ：Ａ、Ｃ：Ｃ、Ｕ：Ｕ）を形成するように選択され得る。さらに好ましい実施形態では、「バルジ」は、ｍｉＲＮＡ分子の５’末端から１２位及び１３位のヌクレオチドを中心とする。
ｃ）ショートヘアピンＲＮＡ（ｓｈＲＮＡ）分子
特定の特徴的な実施形態では、本発明は、高選択性を有するｓＦｌｔ１標的配列のＲＮＡサイレンシングを媒介することができるｓｈＲＮＡを提供する。ｓｉＲＮＡとは対照的に、ｓｈＲＮＡは、マイクロＲＮＡ（ｍｉＲＮＡ）の天然の前駆体を模倣し、遺伝子サイレンシング経路の最上部に入る。このため、ｓｈＲＮＡは、天然遺伝子サイレンシング経路全体を介して供給されることにより、遺伝子サイレンシングをより効率的に媒介すると考えられている。
ｍｉＲＮＡは、約２２ヌクレオチドの非コードＲＮＡであり、植物及び動物の発育中に、転写後または翻訳レベルで遺伝子発現を調節できる。ｍｉＲＮＡの共通の特徴の１つは、おそらくＲＮａｓｅ ＩＩＩ型酵素であるＤｉｃｅｒ、またはその相同体によって、ｐｒｅ－ｍｉＲＮＡと称される約７０ヌクレオチドの前駆体ＲＮＡステムループからすべてが切り出されることである。天然に存在するｍｉＲＮＡ前駆体（ｐｒｅ－ｍｉＲＮＡ）は、一般に相補的な２つの部分を含む二本鎖ステムを形成する一本鎖と、ステムの２つの部分を接続するループとを有する。典型的なｐｒｅ－ｍｉＲＮＡでは、ステムは、１つ以上のバルジ、例えば、ステムの一部内に単一のヌクレオチド「ループ」を作成する余分なヌクレオチド、及び／またはステムの２つの部分の相互のハイブリダイゼーション内にギャップを作る１つ以上の不対ヌクレオチドを含む。本発明のショートヘアピンＲＮＡまたは操作されたＲＮＡ前駆体は、これらの天然に存在するｐｒｅ－ｍｉＲＮＡに基づく人工構築物であるが、所望のＲＮＡサイレンシング剤（例えば、本発明のｓｉＲＮＡ）を送達するように操作されている。ｐｒｅ－ｍｉＲＮＡのステム配列を標的ｍＲＮＡに相補的な配列に置換することにより、ｓｈＲＮＡが形成される。ｓｈＲＮＡは、細胞の遺伝子サイレンシング経路全体によってプロセシングし、それによってＲＮＡｉを効率的に媒介する。
ｓｈＲＮＡ分子の必要なエレメントは、アニーリングまたはハイブリダイズして二重鎖または二本鎖ステム部分を形成するのに十分な相補性を有する、第１の部分及び第２の部分を含む。２つの部分は、完全にまたは完璧に相補的である必要はない。第１及び第２の「ステム」部分は、ｓｈＲＮＡの他の部分にアニーリングまたはハイブリダイズするには十分でない配列相補性を有する配列を有する部分によって結合される。この後者の部分は、ｓｈＲＮＡ分子内の「ループ」部分と呼ばれる。ｓｈＲＮＡ分子は、プロセシングされて、ｓｉＲＮＡが生成される。ｓｈＲＮＡは、１つ以上のバルジ、すなわち、ステムの一部中に小さいヌクレオチド「ループ」、例えば１、２、または３ヌクレオチドループを作成する余分のヌクレオチドも含むことができる。ステム部分は、同じ長さであることができ、または一部は、例えば、１～５ヌクレオチドのオーバーハングを含むことができる。オーバーハングヌクレオチドは、例えば、ウラシル（Ｕ）、例えばすべてのＵを含み得る。このようなＵは、転写の終結をシグナル伝達するｓｈＲＮＡコードＤＮＡ内のチミジン（Ｔ）によって特にコードされる。
本発明のｓｈＲＮＡ（または操作された前駆体ＲＮＡ）では、二重鎖ステムの一部は、ｓＦｌｔ１標的配列に相補的（またはアンチセンス）な核酸配列である。好ましくは、ｓｈＲＮＡのステム部分の一方の鎖は、標的ＲＮＡ（例えば、ｍＲＮＡ）配列に対して十分に相補的（例えば、アンチセンス）であり、ＲＮＡ干渉（ＲＮＡｉ）を介して標的ＲＮＡの分解または切断を媒介する。したがって、操作されたＲＮＡ前駆体は、２つの部分を有する二重ステムと、２つのステム部分を結合するループとを含む。アンチセンス部分は、ステムの５’または３’末端にあり得る。ｓｈＲＮＡのステム部分は、好ましくは、約１５～約５０ヌクレオチド長である。好ましくは、２つのステム部分は、約１８または１９から約２１、２２、２３、２４、２５、３０、３５、３７、３８、３９、または４０、またはそれ以上のヌクレオチド長である。好ましい実施形態では、ステム部分の長さは、２１ヌクレオチド以上であるものとする。哺乳動物細胞で使用する場合、ステム部分の長さは、インターフェロン経路のような非特異的応答の誘発を避けるために、約３０ヌクレオチド未満であるものとする。非哺乳類細胞では、ステムは、３０ヌクレオチドを超えてもよい。実際、ステムには、標的ｍＲＮＡに相補的なはるかに大きいセクション（最大でｍＲＮＡ全体、及びｍＲＮＡ全体を含む）が含まれる場合がある。実際、ステム部分には、標的ｍＲＮＡに相補的なはるかに大きいセクション（最大でｍＲＮＡ全体、及びｍＲＮＡ全体を含む）が含まれる場合がある。
二重ステムの２つの部分は、ハイブリダイズして二重ステムを形成するのに十分に相補的である必要がある。したがって、２つの部分は、完全にまたは完璧に相補的であり得るが、そうである必要はない。さらに、２つのステム部分は、同じ長さであり得るか、または１つの部分が、１、２、３、または４ヌクレオチドのオーバーハングを含み得る。オーバーハングヌクレオチドは、例えば、ウラシル（Ｕ）、例えばすべてのＵを含み得る。ｓｈＲＮＡまたは操作されたＲＮＡ前駆体内のループは、ループ配列を修飾して、対合ヌクレオチドの数を増減させる、またはループ配列のすべてもしくは一部をテトラループまたは他のループ配列に置き換えることにより、天然のｐｒｅ－ｍｉＲＮＡ配列とは異なり得る。したがって、ｓｈＲＮＡまたは操作されたＲＮＡ前駆体中のループは、２、３、４、５、６、７、８、９、またはそれ以上、例えば、１５または２０またはそれ以上のヌクレオチド長であり得る。
ｓｈＲＮＡまたは操作されたＲＮＡ前駆体内のループは、ループ配列を修飾して、対合ヌクレオチドの数を増減させる、またはループ配列のすべてもしくは一部をテトラループまたは他のループ配列に置き換えることにより、天然のｐｒｅ－ｍｉＲＮＡ配列とは異なり得る。したがって、ｓｈＲＮＡ内のループ部分は、約２～約２０ヌクレオチド長、すなわち、約２、３、４、５、６、７、８、９、またはそれ以上、例えば、１５または２０ヌクレオチド、またはそれ以上のヌクレオチド長であり得る。１つの好ましいループは、「テトラループ」配列からなるか、または「テトラループ」配列を含む。例示的テトラループ配列としては、これらに限定されないが、配列ＧＮＲＡ（式中、Ｎが任意のヌクレオチドであり、Ｒがプリンヌクレオチドである）、ＧＧＧＧ、及びＵＵＵＵである。
特定の実施形態では、本発明のｓｈＲＮＡは、上述の所望のｓｉＲＮＡ分子の配列を含む。他の実施形態では、ｓｈＲＮＡのアンチセンス部分の配列は、本質的に上記のとおり、または一般に、標的ＲＮＡ（例えば、ｓｆｌｔ１ ｍＲＮＡ）内から、例えば、翻訳開始点の上流または下流の１００～２００または３００ヌクレオチドの領域から、１８、１９、２０、２１ヌクレオチド、またはそれより長い配列を選択することによって設計することができる。一般に、配列は、イントロン領域、５’ＵＴＲ（非翻訳領域）、コード配列、または３’ＵＴＲなど、標的ＲＮＡ（例えば、ｍＲＮＡ）の任意の部分から選択することができるが、ただし、本部分が、機能獲得突然変異の部位から離れていることを条件とする。この配列は、任意により、隣接する２つのＡＡヌクレオチドを含む標的遺伝子の領域の直後に続くことができる。ヌクレオチド配列の最後の２つのヌクレオチドは、ＵＵになるように選択することができる。この約２１のヌクレオチド配列を使用して、ｓｈＲＮＡの二本鎖ステムの一部を作製する。この配列は、野生型ｐｒｅ－ｍｉＲＮＡ配列のステム部分を、例えば酵素的に置換することができるか、または合成される完全な配列に含まれる。例えば、ステムループ操作ＲＮＡ前駆体全体をコードする、または前駆体の二本鎖ステムに挿入される部分のみをコードするＤＮＡオリゴヌクレオチドを合成すること、及び制限酵素を使用して、例えば、野生型ｐｒｅ－ｍｉＲＮＡから、操作ＲＮＡ前駆体構築物を構築することができる。
操作されたＲＮＡ前駆体は、二重鎖ステム中にｉｎ ｖｉｖｏで産生されることが望まれるｓｉＲＮＡまたはｓｉＲＮＡ様二重鎖の２１～２２程度のヌクレオチド配列を含む。したがって、操作されたＲＮＡ前駆体のステム部分は、発現が減少されるかまたは阻害される遺伝子のエクソン部分の配列に対応する少なくとも１８または１９のヌクレオチド対を含む。ステムのこの領域に隣接する２つの３’ヌクレオチドは、操作されたＲＮＡ前駆体からのｓｉＲＮＡの産生を最大化するように、ならびにｉｎ ｖｉｖｏ及びｉｎ ｖｉｔｒｏにおいて、ＲＮＡｉによる翻訳抑制または破壊のために対応するｍＲＮＡを標的とする際に、結果として得られるｓｉＲＮＡの有効性を最大化するように選択される。
特定の実施形態では、本発明のｓｈＲＮＡは、ｍｉＲＮＡ配列、任意により末端修飾ｍｉＲＮＡ配列を含み、ＲＩＳＣへの侵入を増強する。ｍｉＲＮＡ配列は、任意の天然に存在するｍｉＲＮＡの配列と類似であるかまたは同一であり得る（例えば、Ｔｈｅ ｍｉＲＮＡ Ｒｅｇｉｓｔｒｙ；Ｇｒｉｆｆｉｔｈｓ－Ｊｏｎｅｓ Ｓ，Ｎｕｃ．Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．，２００４）。現在までに１，０００を超える天然のｍｉＲＮＡが同定されており、それらを合わせるとゲノム内のすべての予測遺伝子のうち約１％を含むと考えられる。多くの天然のｍｉＲＮＡは、ｐｒｅ－ｍＲＮＡのイントロン内に一緒にクラスター化されており、相同性ベースの検索（Ｐａｓｑｕｉｎｅｌｌｉ ｅｔ ａｌ．，２０００；Ｌａｇｏｓ－Ｑｕｉｎｔａｎａ ｅｔ ａｌ．，２００１；Ｌａｕ ｅｔ ａｌ．，２００１；Ｌｅｅ ａｎｄ Ａｍｂｒｏｓ，２００１）、または候補ｍｉＲＮＡ遺伝子がｐｒｉ－ｍＲＮＡのステムループ構造を形成する能力を予測するコンピューターアルゴリズム（例えば、ＭｉＲＳｃａｎ、ＭｉＲＳｅｅｋｅｒ）（Ｇｒａｄ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ．，２００３；Ｌｉｍ ｅｔ ａｌ．，Ｇｅｎｅｓ Ｄｅｖ．，２００３；Ｌｉｍ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２００３；Ｌａｉ Ｅ Ｃ ｅｔ ａｌ．，Ｇｅｎｏｍｅ Ｂｉｏ．，２００３）を使用して、ｉｎ ｓｉｌｉｃｏで同定可能である。オンラインレジストリは、公開されているすべてのｍｉＲＮＡ配列の検索可能なデータベースを提供する（Ｔｈｅ ｍｉＲＮＡ Ｒｅｇｉｓｔｒｙ、Ｓａｎｇｅｒ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ ｗｅｂｓｉｔｅ；Ｇｒｉｆｆｉｔｈｓ－Ｊｏｎｅｓ Ｓ，Ｎｕｃ．Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．，２００４）。例示的な天然ｍｉＲＮＡとしては、ｌｉｎ－４、ｌｅｔ－７、ｍｉＲ－１０、ｍｉｒＲ－１５、ｍｉＲ－１６、ｍｉＲ－１６８、ｍｉＲ－１７５、ｍｉＲ－１９６及びそれらの相同体、ならびにヒト由来及び特定のモデル生物、例えば、キイロショウジョウバエ（Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａ ｍｅｌａｎｏｇａｓｔｅｒ）、カエノラブディティス・エレガンス（Ｃａｅｎｏｒｈａｂｄｉｔｉｓ ｅｌｅｇａｎｓ）、ゼブラフィッシュ（ｚｅｂｒａｆｉｓｈ）、シロイヌナズナ（Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ ｔｈａｌａｎｉａ）、ハツカネズミ（Ｍｕｓ ｍｕｓｃｕｌｕｓ）、及びドブネズミ（Ｒａｔｔｕｓ ｎｏｒｖｅｇｉｃｕｓ）（ＰＣＴ国際公開番号ＷＯ０３／０２９４５９に記載）の他の天然ｍｉＲＮＡが挙げられる。
天然に存在するｍｉＲＮＡは、ｉｎ ｖｉｖｏで内因性遺伝子によって発現され、Ｄｉｃｅｒまたは他のＲＮＡｓｅｓによってヘアピンまたはステムループ前駆体（ｐｒｅ－ｍｉＲＮＡ またはｐｒｉ－ｍｉＲＮＡ）からプロセシングされる（Ｌａｇｏｓ－Ｑｕｉｎｔａｎａ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２００１；Ｌａｕ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２００１；Ｌｅｅ ａｎｄ Ａｍｂｒｏｓ，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２００１；Ｌａｇｏｓ－Ｑｕｉｎｔａｎａ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒ．Ｂｉｏｌ．，２００２；Ｍｏｕｒｅｌａｔｏｓ ｅｔ ａｌ．，Ｇｅｎｅｓ Ｄｅｖ．，２００２；Ｒｅｉｎｈａｒｔ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２００２；Ａｍｂｒｏｓ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒ．Ｂｉｏｌ．，２００３；Ｂｒｅｎｎｅｃｋｅ ｅｔ ａｌ．，２００３；Ｌａｇｏｓ－Ｑｕｉｎｔａｎａ ｅｔ ａｌ．，ＲＮＡ，２００３；Ｌｉｍ ｅｔ ａｌ．，Ｇｅｎｅｓ Ｄｅｖ．，２００３；Ｌｉｍ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２００３）。ｍｉＲＮＡは、二本鎖二重鎖としてｉｎ ｖｉｖｏで一過性に存在することができるが、遺伝子サイレンシングを指示するために、１本の鎖のみ、ＲＩＳＣ複合体に取り込まれる。特定のｍｉＲＮＡ、例えば植物ｍｉＲＮＡは、それらの標的ｍＲＮＡに対して完全なまたはほぼ完全な相補性を有するため、標的ｍＲＮＡを直接切断する。他のｍｉＲＮＡは、標的ｍＲＮＡに対して完全ではない相補性を有するため、標的ｍＲＮＡの翻訳を直接抑制する。ｍｉＲＮＡとその標的ｍＲＮＡとの相補性の程度によって、その作用機序が決定すると考えられている。例えば、ｍｉＲＮＡとその標的ｍＲＮＡとの間の完全またはほぼ完全な相補性は、切断機構を予測するものであり（Ｙｅｋｔａ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２００４）、一方で、完全でない相補性は、翻訳抑制機構を予測するものである。特定の実施形態では、ｍｉＲＮＡ配列は、その異常な発現またはその活性がｍｉＲＮＡ障害と相関している、天然に存在するｍｉＲＮＡ配列のものである。
ｄ）二重機能性オリゴヌクレオチド繋留因子
他の実施形態では、本発明のＲＮＡサイレンシング剤は、ｍｉＲＮＡの細胞間動員に有用な二重機能性オリゴヌクレオチド繋留因子を含む。動物細胞は、転写後または翻訳レベルで遺伝子発現を調節できる約２２ヌクレオチドの非コードＲＮＡである一連のｍｉＲＮＡを発現する。二重機能性オリゴヌクレオチド繋留因子は、ＲＩＳＣに結合したｍｉＲＮＡを結合し、それを標的ｍＲＮＡに動員することにより、例えば動脈硬化プロセスに関与する遺伝子の発現を抑制することができる。オリゴヌクレオチド繋留因子の使用は、特定の遺伝子の発現を抑制する既存の技術よりもいくつかの利点を提供する。第１に、本明細書に記載の方法では、内因性分子（多くの場合、豊富に存在する）、ｍｉＲＮＡがＲＮＡサイレンシングを媒介することが可能になる。したがって、本明細書に記載の方法により、ＲＮＡサイレンシングを媒介するために外来分子（例えば、ｓｉＲＮＡ）を導入する必要がなくなる。第２に、ＲＮＡサイレンシング剤及び特に連結部分（例えば、オリゴヌクレオチド、例えば、２’－Ｏ－メチルオリゴヌクレオチド）を安定させ、ヌクレアーゼ活性に対して耐性にすることができる。結果として、本発明の繋留因子は、直接送達する用に設計することができ、細胞内で所望の剤を作製するように設計された前駆体分子またはプラスミドの間接送達（例えば、ウイルス）が必要なくなる。第３に、繋留因子及びそれぞれの部分は、特定のｍＲＮＡ部位及び特定のｍｉＲＮＡに適合するように設計できる。設計は、細胞及び遺伝子産物に特異的であり得る。第４に、本明細書に開示される方法では、ｍＲＮＡが無傷のままであり、これにより、当業者は、細胞自身の機構を使用して、短いパルスでタンパク質合成を遮断することが可能になる。その結果、これらのＲＮＡサイレンシングの方法は、高度に調節可能である。
本発明の二重機能性オリゴヌクレオチド繋留因子（「繋留因子」）は、ｍｉＲＮＡ（例えば、内因性細胞ｍｉＲＮＡ）を標的ｍＲＮＡに動員して、目的の遺伝子の調節を誘導するように設計される。好ましい実施形態では、繋留因子は、式Ｔ－Ｌ－μを有し、式中、Ｔは、ｍＲＮＡ標的化部分、Ｌは連結部分、μは、ｍｉＲＮＡ動員部分である。任意の１つ以上の部分が、二本鎖であり得る。しかしながら、好ましくは、各部分は、一本鎖である。
繋留因子内の部分は、式Ｔ－Ｌ－μに示すとおり、配置されるか、または連結され得る（５’から３’方向）（すなわち、連結部分の５’末端に連結された標的化部分の３’末端及びｍｉＲＮＡ動員部分の５’末端に連結された連結部分の３’末端）。あるいは、これらの部分は、次のとおり、繋留因子内に配置または連結することができる：μ－Ｔ－Ｌ（すなわち、ｍｉＲＮＡの動員部分の３’末端は、連結部分の５’末端に連結し、連結部分の３’末端は、標的化部分の５’末端に連結する）。
上記のｍＲＮＡ標的化部分は、特定の標的ｍＲＮＡを捕捉することができる。本発明によれば、標的ｍＲＮＡの発現は望ましくないため、ｍＲＮＡの翻訳抑制が望まれる。ｍＲＮＡ標的化部分は、標的ｍＲＮＡに効果的に結合するのに十分なサイズであるものとする。標的化部分の長さは、標的ｍＲＮＡの長さ、及び標的ｍＲＮＡと標的化部分との間の相補性の程度に部分的に依存して、大きく変動する。様々な実施形態では、標的化部分は、約２００未満、１００、５０、３０、２５、２０、１９、１８、１７、１６、１５、１４、１３、１２、１１、１０、９、８、７、６、または５ヌクレオチド長である。特定の実施形態では、標的化部分は、約１５～約２５ヌクレオチド長である。
上述のとおり、ｍｉＲＮＡ動員部分は、ｍｉＲＮＡと会合することができる。本発明によれば、ｍｉＲＮＡは、標的ｍＲＮＡを抑制することができる任意のｍｉＲＮＡ （例えば、１つ以上のｓｆｌｔ１ ｍＲＮＡ）であり得る。哺乳動物は、２５０を超える内因性ｍｉＲＮＡを有することが報告されている（Ｌａｇｏｓ－Ｑｕｉｎｔａｎａ ｅｔ ａｌ．（２００２）Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｂｉｏｌ．１２：７３５－７３９；Ｌａｇｏｓ－Ｑｕｉｎｔａｎａ ｅｔ ａｌ．（２００１）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２９４：８５８－８６２；ａｎｄ Ｌｉｍ ｅｔ ａｌ．（２００３）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２９９：１５４０）。様々な実施形態では、ｍｉＲＮＡは、当技術分野で認識されている任意のｍｉＲＮＡであり得る。
連結部分は、標的化部分の活性が維持されるように標的化部分を連結することができる任意の剤である。連結部分は、好ましくは、標的化剤がそれぞれの標的と十分に相互作用できるように、十分な数のヌクレオチドを含むオリゴヌクレオチド部分である。連結部分は、細胞のｍＲＮＡまたはｍｉＲＮＡ配列との配列相同性をほとんどまたは全く有しない。例示的な連結部分としては、１つ以上の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド、例えば、２’－β－メチルアデノシン、２’－Ｏ－メチルチミジン、２’－Ｏ－メチルグアノシンまたは２’－Ｏ－メチルウリジンが挙げられる。
ｅ）遺伝子サイレンシングオリゴヌクレオチド
特定の例示的な実施形態では、遺伝子発現（すなわち、ｓｆｌｔ１遺伝子発現）は、ｓｆｌｔ１遺伝子発現を効果的に阻害または減少させるために、２つ以上の接近可能な３’末端の存在が可能になるそれらの５’末端を介して連結された２つ以上の一本鎖アンチセンスオリゴヌクレオチドを含むオリゴヌクレオチドベースの化合物を使用して、調節することができる。このような連結されたオリゴヌクレオチドは、遺伝子サイレンシングオリゴヌクレオチド（ＧＳＯ）としても知られている。（例えば、Ｉｄｅｒａ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｉｎｃ．に譲渡された米国特許第８，４３１，５４４号を参照されたい。これは、あらゆる目的のためにその全体が参照により本明細書に組み込まれる）。
ＧＳＯの５’末端での連結は、他のオリゴヌクレオチド連結とは独立しており、５’、３’、または２’ヒドロキシル基を介して直接的に、または非ヌクレオチドリンカーまたはヌクレオシドを介して、ヌクレオシドの２’または３’ヒドロキシル位置のいずれかを使用して、間接的であり得る。連結はまた、５’末端ヌクレオチドの機能化された糖または核酸塩基を利用し得る。
ＧＳＯは、ホスホジエステル、ホスホロチオエート、または非ヌクレオシドリンカーを介して、それらの５’－５’末端でコンジュゲートされた２つの同一または異なる配列を含むことができる。そのような化合物は、遺伝子産物のアンチセンスの下方制御のために目的のｍＲＮＡ標的の特定の部分に相補的である１５～２７ヌクレオチドを含み得る。同一の配列を含むＧＳＯは、ワトソン－クリック水素結合相互作用を介して特定のｍＲＮＡに結合し、タンパク質の発現を阻害することができる。異なる配列を含むＧＳＯは、１つ以上のｍＲＮＡ標的の２つ以上の異なる領域に結合し、タンパク質発現を阻害することができる。このような化合物は、標的ｍＲＮＡに相補的なヘテロヌクレオチド配列で構成され、ワトソン－クリック水素結合により安定した二重鎖構造を形成する。特定の条件下で、２つの遊離３’末端（５’－５’付着アンチセンス）を含むＧＳＯは、単一の遊離３’末端または遊離３’末端を含まないものよりも強力な遺伝子発現阻害剤となり得る。
いくつかの実施形態では、非ヌクレオチドリンカーは、グリセロールまたは式ＨＯ－－（ＣＨ２）ｏ－－ＣＨ（ＯＨ）－－（ＣＨ２）ｐ－－ＯＨのグリセロール相同体であり、式中、ｏ及びｐは、独立して１～約６、１～約４、または１～約３の整数である。いくつかの他の実施形態では、非ヌクレオチドリンカーは、１，３－ジアミノ－２－ヒドロキシプロパンの誘導体である。いくつかのそのような誘導体は、式ＨＯ－－（ＣＨ２）ｍ－－Ｃ（Ｏ）ＮＨ－－ＣＨ２－－ＣＨ（ＯＨ）－－ＣＨ２－－ＮＨＣ（Ｏ）－－（ＣＨ２）ｍ－－ＯＨを有し、式中、ｍは、０～約１０、０～約６、２～約６、または２～約４の整数である。
いくつかの非ヌクレオチドリンカーでは、３つ以上のＧＳＯ成分の付着が可能になる。例えば、非ヌクレオチドリンカーグリセロールは、ＧＳＯ成分が共有結合により付着され得る３つのヒドロキシル基を有する。したがって、本発明のいくつかのオリゴヌクレオチドベースの化合物は、ヌクレオチドまたは非ヌクレオチドリンカーに連結された２つ以上のオリゴヌクレオチドを含む。本発明によるそのようなオリゴヌクレオチドは、「分岐している」と呼ばれる。
特定の実施形態では、ＧＳＯは、少なくとも１４ヌクレオチド長である。特定の例示的な実施形態では、ＧＳＯは、１５～４０ヌクレオチド長または２０～３０ヌクレオチド長である。したがって、ＧＳＯの成分オリゴヌクレオチドは、独立して、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、または４０ヌクレオチド長であり得る。
これらのオリゴヌクレオチドは、ホスホルアミデートまたはＨ－ホスホネート化学などの当技術分野で認められた方法によって調製することができ、これらは、手動または自動合成装置によって実施できる。これらのオリゴヌクレオチドは、ｍＲＮＡにハイブリダイズする能力を損なうことなく、複数の方法で修飾することもできる。そのような修飾は、１つのヌクレオチドの５’末端と別のヌクレオチドの３’末端の間でのアルキルホスホネート、ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、メチルホスホネート、リン酸エステル、アルキルホスホノチオエート、ホスホルアミデート、カルバメート、カーボネート、ホスフェートヒドロキシル、アセトアミデート、またはカルボキシメチルエステル、またはこれら及び他のヌクレオチド間連結の組み合わせであるオリゴヌクレオチドの少なくとも１つのヌクレオチド間連結を含み得、ここで、５’ヌクレオチドのホスホジエステル連結が、任意の数の化学基で置換されている。
ＩＶ．修飾された抗ｓＦｌｔ１ ＲＮＡサイレンシング剤
本発明の特定の態様では、本発明のＲＮＡサイレンシング剤（またはその任意の部分）は、上記のとおり、剤の活性がさらに改善されるように修飾され得る。例えば、本明細書に記載のＲＮＡサイレンシング剤は、以下に記載の修飾のいずれかで修飾され得る。修飾は、部分的に、標的識別をさらに向上させるため、剤の安定性を向上させるため（例えば、分解を防止するため）、細胞取り込みを促進するため、標的効率を向上させるため、結合（例えば、標的への）の有効性を改善するため、剤に対する患者の耐性を改善するため、及び／または毒性を軽減するために、作用し得る。
特定の実施形態では、以下の特性のうちの１つまたは任意の組み合わせを有するｓｉＲＮＡ化合物が提供される：（１）完全に化学的に安定化されている（すなわち、未修飾の２’－ＯＨ残基がない）；（２）非対称性；（３）１１～１６塩基対の二本鎖；（４）化学修飾されたヌクレオチドの交互パターン（例えば、２’－フルオロ及び２’－メトキシ修飾）、または２’－メトキシリッチパターン（アンチセンス鎖中５０％を超える２’－メトキシ及びセンス鎖中６５％を超える２’－メトキシ）；（５）５～８塩基の一本鎖、完全にホスホロチオエート化された尾部。ホスホロチオエート修飾の数は、異なる実施形態では、合計６～１７個で変化する。
上記及び本明細書に記載の構造特性を有する本発明の特定の化合物は、「ｈｓｉＲＮＡ－ＡＳＰ」（高度安定化パターンを特徴とする疎水的に修飾された低分子干渉ＲＮＡ）と称され得る。さらに、このｈｓｉＲＮＡ－ＡＳＰパターンは、脳、脊髄から、肝臓、胎盤、腎臓、脾臓、及び他のいくつかの組織への送達を介して劇的に改善された分布を示し、治療的介入に利用できるようになった。
肝細胞ではなく、内皮細胞及びクッパー（ｋｕｐｐｅｒ）細胞に対して特異的な肝臓でのｈｓｉＲＮＡ－ＡＳＰの送達により、この化学修飾パターンを、ＧａｌＮａｃコンジュゲートに競合的な技術ではなく、相補的にする。
本開示の化合物は、以下の態様及び実施形態で説明することができる。
第１の態様では、本明細書では、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子を提供し、本ｄｓＲＮＡは、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖は、５’末端及び３’末端を有し、ここで、（１）アンチセンス鎖は、５’ＣＴＣＴＣＧＧＡＴＣＴＣＣＡＡＡＴＴＴＡ３’（配列番号１）または５’ＣＡＴＣＡＴＡＧＣＴＡＣＣＡＴＴＴＡＴＴ３’（配列番号２）の核酸配列に実質的に相補的な配列を含み；（２）アンチセンス鎖は、少なくとも２０ヌクレオチド長であり；（３）アンチセンス鎖は、少なくとも５０％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；（４）アンチセンス鎖の５’末端から２位、４位、５位、６位、８位、１０位、１２位、１４位、１６位、及び２０位のいずれか１つ以上のヌクレオチドは、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく；（５）アンチセンス鎖の３’末端から１～２位から１～８位のヌクレオチドは、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されており；（６）アンチセンス鎖の一部が、センス鎖の一部に相補的であり；（７）センス鎖は、少なくとも１５のヌクレオチド長であり；（８）センス鎖は、少なくとも６５％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；（９）センス鎖の５’末端から、４位、６位、８位、１０位、及び１４位のいずれか１つ以上のヌクレオチドは、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく；（１０）センス鎖の５’末端から１～２位のヌクレオチドが、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されている。
本開示の第１の態様の実施形態では、アンチセンス鎖の５’末端から２位、４位、５位、６位、８位、１０位、１２位、１４位、１６位、及び２０位のヌクレオチドは、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく、センス鎖の５’末端から４位、６位、８位、１０位及び１４位のヌクレオチドは、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではない。
本開示の第１の態様の実施形態では、アンチセンス鎖は、２１ヌクレオチド長であり、センス鎖は、１６ヌクレオチド長である。
本開示の第１の態様の実施形態では、アンチセンス鎖は、５’ＵＡＡＡＵＵＵＧＧＡＧＡＵＣＣＧＡＧＡＧＡ３’の核酸配列を含み、センス鎖は、５’ＣＧＧＡＵＣＵＣＣＡＡＡＵＵＵＡ３’の核酸配列を含む。
本開示の第１の態様の実施形態では、アンチセンス鎖は、５’ＵＡＵＡＡＡＵＧＧＵＡＧＣＵＡＵＧＡＵＧＡ３’の核酸配列を含み、センス鎖は、５’ＡＵＡＧＣＵＡＣＣＡＵＵＵＡＵＡ３’の核酸配列を含む。
本開示の第１の態様の実施形態では、アンチセンス鎖は、５’ビニルホスホネートを含む。
第２の態様では、本明細書では、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）を提供し、本ｄｓＲＮＡは、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖は、５’末端及び３’末端を有し、ここで、（１）アンチセンス鎖は、５’ＣＴＣＴＣＧＧＡＴＣＴＣＣＡＡＡＴＴＴＡ３’（配列番号１）または５’ＣＡＴＣＡＴＡＧＣＴＡＣＣＡＴＴＴＡＴＴ３’（配列番号２）の核酸配列に実質的に相補的な配列を含み；（２）アンチセンス鎖が、２’－メトキシ－リボヌクレオチド及び２’－フルオロ－リボヌクレオチドを交互に含み；（３）アンチセンス鎖の５’末端から２位及び１４位のヌクレオチドが、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく；（４）アンチセンス鎖の３’末端から１～２位から１～７位のヌクレオチドは、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されており；（５）アンチセンス鎖の一部が、センス鎖の一部に相補的であり；（６）センス鎖は、２’－メトキシ－リボヌクレオチド及び２’－フルオロ－リボヌクレオチドを交互に含み；（７）センス鎖の５’末端から１～２位のヌクレオチドが、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されている。
本開示の第２の態様の実施形態では、アンチセンス鎖は、２１ヌクレオチド長であり、センス鎖は、１６ヌクレオチド長である。
本開示の第２の態様の実施形態では、アンチセンス鎖は、５’ＵＡＡＡＵＵＵＧＧＡＧＡＵＣＣＧＡＧＡＧＡ３’の核酸配列を含み、センス鎖は、５’ＣＧＧＡＵＣＵＣＣＡＡＡＵＵＵＡ３’の核酸配列を含む。
本開示の第２の態様の実施形態では、アンチセンス鎖は、５’ＵＡＵＡＡＡＵＧＧＵＡＧＣＵＡＵＧＡＵＧＡ３’の核酸配列を含み、センス鎖は、５’ＡＵＡＧＣＵＡＣＣＡＵＵＵＡＵＡ３’の核酸配列を含む。
本開示の第２の態様の実施形態では、アンチセンス鎖は、５’ビニルホスホネートを含む。
第３の態様では、本明細書では、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子を提供し、本ｄｓＲＮＡは、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖は、５’末端及び３’末端を有し、ここで、（１）アンチセンス鎖は、５’ＣＴＣＴＣＧＧＡＴＣＴＣＣＡＡＡＴＴＴＡ３’（配列番号１）または５’ＣＡＴＣＡＴＡＧＣＴＡＣＣＡＴＴＴＡＴＴ３’（配列番号２）の核酸配列に実質的に相補的な配列を含み；（２）アンチセンス鎖は、少なくとも２０ヌクレオチド長であり；（３）アンチセンス鎖は、少なくとも５０％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；（４）アンチセンス鎖の５’末端から２位、４位、５位、６位、８位、１０位、１２位、１４位、１６位、及び１８位のいずれか１つ以上のヌクレオチドは、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく；（５）アンチセンス鎖の３’末端から１～２位から１～８位のヌクレオチドは、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されており；（６）アンチセンス鎖の一部が、センス鎖の一部に相補的であり；（７）センス鎖は、少なくとも１５のヌクレオチド長であり；（８）センス鎖は、少なくとも８０％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；（９）センス鎖の５’末端から、７位、９位、及び１１位のいずれか１つ以上のヌクレオチドは、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく；（１０）センス鎖の５’末端から１～２位のヌクレオチドが、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されている。
本開示の第３の態様の実施形態では、アンチセンス鎖の５’末端から２位、４位、５位、６位、８位、１０位、１２位、１４位、１６位及び１８位のヌクレオチドは、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく、センス鎖の５’末端から７位、９位、及び１１位のヌクレオチドは、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではない。
本開示の第３の態様の実施形態では、アンチセンス鎖は、２１ヌクレオチド長であり、センス鎖は、１６ヌクレオチド長である。
本開示の第３の態様の実施形態では、アンチセンス鎖は、５’ＵＡＡＡＵＵＵＧＧＡＧＡＵＣＣＧＡＧＡＧＡ３’の核酸配列を含み、センス鎖は、５’ＣＧＧＡＵＣＵＣＣＡＡＡＵＵＵＡ３’の核酸配列を含む。
本開示の第３の態様の実施形態では、アンチセンス鎖は、５’ＵＡＵＡＡＡＵＧＧＵＡＧＣＵＡＵＧＡＵＧＡ３’の核酸配列を含み、センス鎖は、５’ＡＵＡＧＣＵＡＣＣＡＵＵＵＡＵＡ３’の核酸配列を含む。
本開示の第３の態様の実施形態では、アンチセンス鎖は、５’ビニルホスホネートを含む。
第４の態様では、本明細書では、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子を提供し、本ｄｓＲＮＡは、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖は、５’末端及び３’末端を有し、ここで、（１）アンチセンス鎖は、５’ＣＴＣＴＣＧＧＡＴＣＴＣＣＡＡＡＴＴＴＡ３’（配列番号１）または５’ＣＡＴＣＡＴＡＧＣＴＡＣＣＡＴＴＴＡＴＴ３’（配列番号２）の核酸配列に実質的に相補的な配列を含み；（２）アンチセンス鎖は、少なくとも２０ヌクレオチド長であり；（３）アンチセンス鎖は、少なくとも７０％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；（４）アンチセンス鎖の５’末端から２位、４位、５位、６位、８位、及び１４位のいずれか１つ以上のヌクレオチドは、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく；（５）アンチセンス鎖の３’末端から１～２位から１～８位のヌクレオチドは、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されており；（６）アンチセンス鎖の一部が、センス鎖の一部に相補的であり；（７）センス鎖は、少なくとも１５のヌクレオチド長であり；（８）センス鎖は、１００％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；（９）センス鎖の５’末端から１～２位のヌクレオチドが、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されている。
本開示の第４の態様の実施形態では、アンチセンス鎖の５’末端から２位、４位、５位、６位、８位、及び１４位のヌクレオチドは、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではない。
本開示の第４の態様の実施形態では、アンチセンス鎖は、２１ヌクレオチド長であり、センス鎖は、１６ヌクレオチド長である。
本開示の第４の態様の実施形態では、アンチセンス鎖は、５’ＵＡＡＡＵＵＵＧＧＡＧＡＵＣＣＧＡＧＡＧＡ３’の核酸配列を含み、センス鎖は、５’ＣＧＧＡＵＣＵＣＣＡＡＡＵＵＵＡ３’の核酸配列を含む。
本開示の第４の態様の実施形態では、アンチセンス鎖は、５’ＵＡＵＡＡＡＵＧＧＵＡＧＣＵＡＵＧＡＵＧＡ３’の核酸配列を含み、センス鎖は、５’ＡＵＡＧＣＵＡＣＣＡＵＵＵＡＵＡ３’の核酸配列を含む。
本開示の第４の態様の実施形態では、アンチセンス鎖は、５’ビニルホスホネートを含む。
第５の態様では、本明細書では、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子を提供し、本ｄｓＲＮＡは、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖は、５’末端及び３’末端を有し、ここで、（１）アンチセンス鎖は、５’ＣＴＣＴＣＧＧＡＴＣＴＣＣＡＡＡＴＴＴＡ３’（配列番号１）または５’ＣＡＴＣＡＴＡＧＣＴＡＣＣＡＴＴＴＡＴＴ３’（配列番号２）の核酸配列に実質的に相補的な配列を含み；（２）アンチセンス鎖は、少なくとも２０ヌクレオチド長であり；（３）アンチセンス鎖は、少なくとも７５％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；（４）アンチセンス鎖の５’末端から２位、４位、５位、６位、及び１４位のいずれか１つ以上のヌクレオチドは、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく；（５）アンチセンス鎖の３’末端から１～２位から１～８位のヌクレオチドは、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されており；（６）アンチセンス鎖の一部が、センス鎖の一部に相補的であり；（７）センス鎖は、少なくとも１５のヌクレオチド長であり；（８）センス鎖は、１００％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；（９）センス鎖の５’末端から１～２位のヌクレオチドが、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されている。
本開示の第５の態様の実施形態では、アンチセンス鎖の５’末端から２位、４位、５位、６位、及び１４位のヌクレオチドは、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではない。
本開示の第５の態様の実施形態では、アンチセンス鎖は、２１ヌクレオチド長であり、センス鎖は、１６ヌクレオチド長である。
本開示の第５の態様の実施形態では、アンチセンス鎖は、５’ＵＡＡＡＵＵＵＧＧＡＧＡＵＣＣＧＡＧＡＧＡ３’の核酸配列を含み、センス鎖は、５’ＣＧＧＡＵＣＵＣＣＡＡＡＵＵＵＡ３’の核酸配列を含む。
本開示の第５の態様の実施形態では、アンチセンス鎖は、５’ＵＡＵＡＡＡＵＧＧＵＡＧＣＵＡＵＧＡＵＧＡ３’の核酸配列を含み、センス鎖は、５’ＡＵＡＧＣＵＡＣＣＡＵＵＵＡＵＡ３’の核酸配列を含む。
本開示の第５の態様の実施形態では、アンチセンス鎖は、５’ビニルホスホネートを含む。
第６の態様では、本明細書では、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子を提供し、本ｄｓＲＮＡは、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖は、５’末端及び３’末端を有し、ここで、（１）アンチセンス鎖は、５’ＣＴＣＴＣＧＧＡＴＣＴＣＣＡＡＡＴＴＴＡ３’（配列番号１）または５’ＣＡＴＣＡＴＡＧＣＴＡＣＣＡＴＴＴＡＴＴ３’（配列番号２）の核酸配列に実質的に相補的な配列を含み；（２）アンチセンス鎖は、少なくとも２０ヌクレオチド長であり；（３）アンチセンス鎖は、少なくとも８５％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；（４）アンチセンス鎖の５’末端から２位、及び１４位のいずれか１つ以上のヌクレオチドは、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく；（５）アンチセンス鎖の３’末端から１～２位から１～８位のヌクレオチドは、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されており；（６）アンチセンス鎖の一部が、センス鎖の一部に相補的であり；（７）センス鎖は、少なくとも１５のヌクレオチド長であり；（８）センス鎖は、１００％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；（９）センス鎖の５’末端から１～２位のヌクレオチドが、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されている。
本開示の第６の態様の実施形態では、アンチセンス鎖の５’末端から２位及び１４位のヌクレオチドは、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではない。
本開示の第６の態様の実施形態では、アンチセンス鎖は、２１ヌクレオチド長であり、センス鎖は、１６ヌクレオチド長である。
本開示の第６の態様の実施形態では、アンチセンス鎖は、５’ＵＡＡＡＵＵＵＧＧＡＧＡＵＣＣＧＡＧＡＧＡ３’の核酸配列を含み、センス鎖は、５’ＣＧＧＡＵＣＵＣＣＡＡＡＵＵＵＡ３’の核酸配列を含む。
本開示の第６の態様の実施形態では、アンチセンス鎖は、５’ＵＡＵＡＡＡＵＧＧＵＡＧＣＵＡＵＧＡＵＧＡ３’の核酸配列を含み、センス鎖は、５’ＡＵＡＧＣＵＡＣＣＡＵＵＵＡＵＡ３’の核酸配列を含む。
本開示の第６の態様の実施形態では、アンチセンス鎖は、５’ビニルホスホネートを含む。
本開示の第１～第６の態様のいずれかの実施形態では、センス鎖の３’末端は、Ｃ７アミノリンカー及びｄＴｄＴ切断可能なリンカーを介して、ＰＣ－ＤＣＡ（ホスホコリン－ドコサン酸）に連結している。
１）標的識別を向上させるための修飾
特定の実施形態では、本発明のＲＮＡサイレンシング剤は、単一ヌクレオチド標的識別を向上させるために、不安定化ヌクレオチドで置換され得る（米国出願第１１／６９８，６８９号、２００７年１月２５日に出願、米国仮出願第６０／７６２，２２５号、２００６年１月２５日に出願を参照されたい。これらは、両方とも参照により本明細書に組み込まれる）。そのような修飾は、標的ｍＲＮＡ（例えば、機能獲得型変異ｍＲＮＡ）に対するＲＮＡサイレンシング剤の特異性に目に見える影響を与えることなく、非標的ｍＲＮＡ（例えば、野生型ｍＲＮＡ）に対するＲＮＡサイレンシング剤の特異性を無効にするのに十分であり得る。
好ましい実施形態では、本発明のＲＮＡサイレンシング剤は、そのアンチセンス鎖に少なくとも１つのユニバーサルヌクレオチドを導入することによって修飾される。ユニバーサルヌクレオチドは、４つの従来のヌクレオチド塩基（例えば、Ａ、Ｇ、Ｃ、Ｕ）のいずれかと無差別に塩基対形成できる塩基部分を含む。ユニバーサルヌクレオチドは、ＲＮＡ二重鎖の安定性、またはＲＮＡサイレンシング剤のガイド鎖と標的ｍＲＮＡによって形成される二重鎖の安定性に比較的小さい効果のみを有するために好ましい。例示的なユニバーサルヌクレオチドとしては、デオキシイノシン（例えば、２’－デオキシイノシン）、７－デアザ－２’－デオキシイノシン、２’－アザ－２’－デオキシイノシン、ＰＮＡ－イノシン、モルホリノ－イノシン、ＬＮＡ－イノシン、ホスホルアミデート－イノシン、２’－Ｏ－メトキシエチル－イノシン、及び２’－ＯＭｅ－イノシンからなる群から選択されるイノシン塩基部分またはイノシン類似塩基部分を有するものが挙げられる。特定の好ましい実施形態では、ユニバーサルヌクレオチドは、イノシン残基またはその天然類似体である。
特定の実施形態では、本発明のＲＮＡサイレンシング剤は、特異性決定ヌクレオチド（すなわち、疾患関連多型を認識するヌクレオチド）から５ヌクレオチド以内に少なくとも１つの不安定化ヌクレオチドを導入することによって修飾される。例えば、不安定化ヌクレオチドは、特異性決定ヌクレオチドから５、４、３、２、または１ヌクレオチド以内の位置に導入され得る。例示的な実施形態では、不安定化ヌクレオチドは、特異性決定ヌクレオチドから３ヌクレオチド離れた位置に（すなわち、不安定化ヌクレオチドと特異性決定ヌクレオチドとの間に２つの安定化ヌクレオチドが存在するように）導入される。２つの鎖または鎖部分を有するＲＮＡサイレンシング剤（例えば、ｓｉＲＮＡ及びｓｈＲＮＡ）では、特異性決定ヌクレオチドを含まない鎖または鎖部分内に不安定化ヌクレオチドを導入することができる。好ましい実施形態では、不安定化ヌクレオチドは、特異性決定ヌクレオチドを含む同じ鎖または鎖部分に導入される。
２）有効性及び特異性を高めるための修飾
特定の実施形態では、本発明のＲＮＡサイレンシング剤は、非対称設計規則に従って、ＲＮＡｉを媒介する際の有効性及び特異性を容易に高めるように改変され得る（米国特許第８，３０９，７０４号、第７，７５０，１４４号、第８，３０４，５３０号、第８，３２９，８９２号及び第８，３０９，７０５号を参照されたい）。このような改変により、ｓｉＲＮＡのアンチセンス鎖（例えば、本発明の方法を用いて設計されたｓｉＲＮＡ、またはｓｈＲＮＡから産生されたｓｉＲＮＡ）のＲＩＳＣへの侵入をセンス鎖に有利に進めることが容易になる。これにより、アンチセンス鎖は、標的ｍＲＮＡの切断または翻訳抑制を優先的に誘導し、したがって、標的の切断及びサイレンシングの効率を増大または改善するようになる。好ましくは、ＲＮＡサイレンシング剤の非対称性は、ＲＮＡサイレンシング剤のアンチセンス鎖３’末端（ＡＳ３’）とセンス鎖５’末端（Ｓ’５）との間の結合強度または塩基対強度に対して、ＲＮＡサイレンシング剤のアンチセンス鎖５’末端（ＡＳ５’）とセンス鎖３’末端（Ｓ３’）との間の塩基対強度を低下させることによって向上される。
一実施形態では、本発明のＲＮＡサイレンシング剤の非対称性は、第１またはアンチセンス鎖の５’末端とセンス鎖部分の３’末端との間のＧ：Ｃ塩基対が、第１またはアンチセンス鎖の３’末端とセンス鎖部分の５’末端との間のＧ：Ｃ塩基対よりも少なくなるように、向上され得る。別の実施形態では、本発明のＲＮＡサイレンシング剤の非対称性は、第１またはアンチセンス鎖の５’末端とセンス鎖部分の３’末端との間に少なくとも１つのミスマッチ塩基対が存在するように向上され得る。好ましくは、ミスマッチ塩基対は、以下からなる群から選択される：Ｇ：Ａ、Ｃ：Ａ、Ｃ：Ｕ、Ｇ：Ｇ、Ａ：Ａ、Ｃ：Ｃ及びＵ：Ｕ。別の実施形態では、本発明のＲＮＡサイレンシング剤の非対称性は、少なくとも１つのゆらぎ塩基対、例えば、Ｇ：Ｕが、第１またはアンチセンス鎖の５’末端とセンス鎖部分の３’末端との間に存在するように向上され得る。別の実施形態では、本発明のＲＮＡサイレンシング剤の非対称性は、希少ヌクレオチド、例えばイノシン（Ｉ）を含む少なくとも１つの塩基対が存在するように向上され得る。好ましくは、塩基対は、Ｉ：Ａ、Ｉ：Ｕ、及びＩ：Ｃからなる群から選択される。さらに別の実施形態では、本発明のＲＮＡサイレンシング剤の非対称性は、修飾ヌクレオチドを含む少なくとも１つの塩基対が存在するように、向上され得る。好ましい実施形態では、修飾ヌクレオチドは、２－アミノ－Ｇ、２－アミノ－Ａ、２，６－ジアミノ－Ｇ、及び２，６－ジアミノ－Ａからなる群から選択される。
３）安定性の向上を有するＲＮＡサイレンシング剤
本発明のＲＮＡサイレンシング剤は、血清中または細胞培養用の成長培地中での安定性を改善するために修飾させ得る。安定性を向上させるために、３’－残基を分解に対して安定化させてよく、特に、アデノシンまたはグアノシンヌクレオチドなどのプリンヌクレオチドからなるように選択され得る。あるいは、修飾類似体によるピリミジンヌクレオチドの置換、例えば、２’－デオキシチミジンによるウリジンの置換は許容され、ＲＮＡ干渉の効率に影響を与えない。
好ましい態様では、本発明は、第１及び第２の鎖を含むＲＮＡサイレンシング剤を特徴とし、第２の鎖及び／または第１の鎖は、対応する非修飾ＲＮＡサイレンシング剤と比較して、ｉｎ ｖｉｖｏ安定性が向上するように、内部ヌクレオチドを修飾ヌクレオチドで置換することによって、修飾される。本明細書で定義されるように、「内部」ヌクレオチドは、核酸分子、ポリヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチドの５’末端または３’末端以外の任意の位置に存在するものである。内部ヌクレオチドは、一本鎖分子内にあっても、二本鎖もしくは二本鎖分子の鎖内にあってもよい。一実施形態では、センス鎖及び／またはアンチセンス鎖は、少なくとも１つの内部ヌクレオチドの置換によって修飾される。別の実施形態では、センス鎖及び／またはアンチセンス鎖は、少なくとも２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、またはそれ以上の内部ヌクレオチドの置換によって修飾される。別の実施形態では、センス鎖及び／またはアンチセンス鎖は、少なくとも５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、またはそれ以上の内部ヌクレオチドの置換によって修飾される。さらに別の実施形態では、センス鎖及び／またはアンチセンス鎖は、内部ヌクレオチドのすべての置換によって修飾される。
いくつかの実施形態では、センス鎖は、内部ヌクレオチドの少なくとも５０％の置換によって修飾される。いくつかの実施形態では、センス鎖は、内部ヌクレオチドの少なくとも５５％の置換によって修飾される。いくつかの実施形態では、センス鎖は、内部ヌクレオチドの少なくとも６０％の置換によって修飾される。いくつかの実施形態では、センス鎖は、内部ヌクレオチドの少なくとも６５％の置換によって修飾される。いくつかの実施形態では、センス鎖は、内部ヌクレオチドの少なくとも７０％の置換によって修飾される。いくつかの実施形態では、センス鎖は、内部ヌクレオチドの少なくとも７５％の置換によって修飾される。いくつかの実施形態では、センス鎖は、内部ヌクレオチドの少なくとも８０％の置換によって修飾される。いくつかの実施形態では、センス鎖は、内部ヌクレオチドの少なくとも８５％の置換によって修飾される。いくつかの実施形態では、センス鎖は、内部ヌクレオチドの少なくとも９０％の置換によって修飾される。いくつかの実施形態では、センス鎖は、内部ヌクレオチドの少なくとも９５％の置換によって修飾される。いくつかの実施形態では、センス鎖は、内部ヌクレオチドの少なくとも９６％の置換によって修飾される。いくつかの実施形態では、センス鎖は、内部ヌクレオチドの少なくとも９７％の置換によって修飾される。いくつかの実施形態では、センス鎖は、内部ヌクレオチドの少なくとも９８％の置換によって修飾される。いくつかの実施形態では、センス鎖は、内部ヌクレオチドの少なくとも９９％の置換によって修飾される。いくつかの実施形態では、センス鎖は、内部ヌクレオチドの１００％の置換によって修飾される。
いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、内部ヌクレオチドの少なくとも５０％の置換によって修飾される。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、内部ヌクレオチドの少なくとも５５％の置換によって修飾される。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、内部ヌクレオチドの少なくとも６０％の置換によって修飾される。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、内部ヌクレオチドの少なくとも６５％の置換によって修飾される。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、内部ヌクレオチドの少なくとも７０％の置換によって修飾される。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、内部ヌクレオチドの少なくとも７５％の置換によって修飾される。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、内部ヌクレオチドの少なくとも８０％の置換によって修飾される。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、内部ヌクレオチドの少なくとも８５％の置換によって修飾される。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、内部ヌクレオチドの少なくとも９０％の置換によって修飾される。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、内部ヌクレオチドの少なくとも９５％の置換によって修飾される。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、内部ヌクレオチドの少なくとも９６％の置換によって修飾される。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、内部ヌクレオチドの少なくとも９７％の置換によって修飾される。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、内部ヌクレオチドの少なくとも９８％の置換によって修飾される。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、内部ヌクレオチドの少なくとも９９％の置換によって修飾される。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、内部ヌクレオチドの１００％の置換によって修飾される。
本発明の好ましい実施形態では、ＲＮＡサイレンシング剤は、少なくとも１つの修飾ヌクレオチド類似体を含み得る。１つ以上のヌクレオチド類似体は、標的特異的サイレンシング活性、例えばＲＮＡｉ媒介活性または翻訳抑制活性が、実質的に生じない位置、例えばｓｉＲＮＡ分子の５’末端及び／または３’末端にある領域に配置され得る。特に、修飾ヌクレオチド類似体を組み込むことによって、末端を安定化させ得る。
例示的なヌクレオチド類似体としては、糖－及び／または骨格修飾リボヌクレオチド（すなわち、リン酸糖骨格への修飾を含む）。例えば、天然ＲＮＡのホスホジエステル連結は、窒素または硫黄ヘテロ原子の少なくとも１つを含むように修飾され得る。例示的な骨格修飾リボヌクレオチドでは、隣接するリボヌクレオチドに結合するリン酸エステル基は、例えばホスホチオエート基の修飾基によって置換される。例示的な糖修飾リボヌクレオチドでは、２’ＯＨ－基は、Ｈ、ＯＲ、Ｒ、ハロ、ＳＨ、ＳＲ、ＮＨ２、ＮＨＲ、ＮＲ２またはＯＮから選択される基で置き換えられ、式中、Ｒは、Ｃ１－Ｃ６アルキル、アルケニルまたはアルキニルであり、ハロはＦ、Ｃｌ、ＢｒまたはＩである。
特定の実施形態では、修飾は、２’－フルオロ、２’－アミノ、及び／または２’－チオ修飾である。特に好ましい修飾としては、２’－フルオロ－シチジン、２’－フルオロ－ウリジン、２’－フルオロ－アデノシン、２’－フルオロ－グアノシン、２’－アミノ－シチジン、２’－アミノ－ウリジン、２’－アミノ－アデノシン、２’－アミノ－グアノシン、２，６－ジアミノプリン、４－チオ－ウリジン、及び／または５－アミノ－アリル－ウリジンが挙げられる。特定の実施形態では、２’－フルオロリボヌクレオチドは、すべてのウリジン及びシチジンである。追加の例示的な修飾としては、５－ブロモ－ウリジン、５－ヨード－ウリジン、５－メチル－シチジン、リボ－チミジン、２－アミノプリン、２’－アミノ－ブチリル－ピレン－ウリジン、５－フルオロ－シチジン、及び５－フルオロウリジンが挙げられる。２’－デオキシ－ヌクレオチド及び２’－Ｏｍｅヌクレオチドも、本発明の修飾ＲＮＡサイレンシング剤内で使用することができる。追加の修飾残基としては、デオキシ脱塩基、イノシン、Ｎ３－メチル－ウリジン、Ｎ６，Ｎ６－ジメチル－アデノシン、シュードウリジン、プリンリボヌクレオシド、及びリバビリンが挙げられる。特定の好ましい実施形態では、連結部分が２’－Ｏ－メチルオリゴヌクレオチドであるように、２’部分がメチル基である。
例示的な実施形態では、本発明のＲＮＡサイレンシング剤は、ロックド核酸（ＬＮＡ）を含む。ＬＮＡは、ヌクレアーゼ活性に抵抗する（高度に安定である）糖修飾ヌクレオチドを含み、ｍＲＮＡについて単一ヌクレオチド識別を有する（Ｅｌｍｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．，（２００５），３３（１）：４３９－４４７；Ｂｒａａｓｃｈ ｅｔ ａｌ．（２００３）Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ４２：７９６７－７９７５，Ｐｅｔｅｒｓｅｎ ｅｔ ａｌ．（２００３）Ｔｒｅｎｄｓ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ ２１：７４－８１）。これらの分子は、２’－デオキシ－２’’－フルオロウリジンなど、修飾が可能な２’－Ｏ、４’－Ｃ－エチレン架橋核酸を有する。さらに、ＬＮＡは、糖部分を３’－エンドコンフォメーションに拘束することによってオリゴヌクレオチドの特異性を増大し、それによって塩基対合形成のためにヌクレオチドを事前に組織化し、オリゴヌクレオチドの融解温度を１塩基当たり１０℃ほど上昇させる。
別の例示的な実施形態では、本発明のＲＮＡサイレンシング剤は、ペプチド核酸（ＰＮＡ）を含む。ＰＮＡは、ヌクレオチドの糖－リン酸部分が、ポリアミド骨格を形成できる中性の２－アミノエチルグリシン部分で置換され、ヌクレアーゼ消化に対して高い抵抗性があり、分子に対して、改善された結合特異性を付与する修飾ヌクレオチドを含む（Ｎｉｅｌｓｅｎ，ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，（２００１），２５４：１４９７－１５００）。
天然に存在する核酸塩基の代わりに、少なくとも１つの天然に存在しない核酸塩基を含有する核酸塩基修飾リボヌクレオチド、すなわちリボヌクレオチドも好ましい。アデノシンデアミナーゼの活性を遮断するために、塩基を修飾することができる。修飾核酸塩基の例としては、これらに限定されないが、５位で修飾されたウリジン及び／またはシチジン、例えば、５－（２－アミノ）プロピルウリジン、５－ブロモウリジン、８位で修飾されたアデノシン及び／またはグアノシン、例えば８－ブロモグアノシン、デアザヌクレオチド、例えば、７－デアザ－アデノシン、Ｏ－及びＮ－アルキル化ヌクレオチド、例えばＮ６－メチルアデノシンが挙げられ、好適である。上記の修飾を組み合わせてもよいことに留意されたい。
他の実施形態では、架橋を使用して、ＲＮＡサイレンシング剤の薬物動態を変化させ、例えば、身体内での半減期を延長することができる。従って、本発明は、核酸の２つの相補鎖を有するＲＮＡサイレンシング剤を含み、２つの鎖は、架橋されている。本発明はまた、別の部分（例えば、ペプチドなどの非核酸部分）または有機化合物（例えば、染料）などに対して（例えば、その３’末端において）コンジュゲートされているかまたはコンジュゲートされていないＲＮＡサイレンシング剤を含む。このようにｓｉＲＮＡ誘導体を修飾することにより、対応するｓｉＲＮＡと比較して、細胞への取り込みを改善する、または得られたｓｉＲＮＡ誘導体の細胞標的活性を向上させることができ、ｓｉＲＮＡ誘導体を細胞内で追跡する、または対応するｓｉＲＮＡと比較して、ｓｉＲＮＡ誘導体の安定性を改善するのに有用である。
他の例示的な修飾としては、以下が挙げられる：（ａ）２’の修飾、例えば、センスまたはアンチセンス鎖における、特にセンス鎖における、Ｕ上の２’ＯＭｅ部分、及び／または、センス鎖またはアンチセンス鎖中、特にセンス鎖における、Ｕ上の２’Ｆ部分、及び／または３’オーバーハング中、例えば３’末端での２’ＯＭｅ部分（３’末端は、分子の３’原子または最も３’の部分、例えば、文脈によって示されるように、最も３’のＰまたは２’位を意味する）及び／または２’Ｆ部分の提供；（ｂ）リン酸骨格における、例えばＯのＳによる置換による、例えば、特にアンチセンス鎖における、ＵまたはＡまたは両方へのホスホロチオエート修飾の提供；例えば、ＰのＳによる置換による、骨格の修飾；（ｃ）ＵのＣ５アミノリンカーによる置換；（ｄ）ＡのＧによる置換（配列変化は、好ましくは、アンチセンス鎖ではなくセンス鎖に配置され得る）；及び（ｄ）２’位、６’位、７’位、または８’位での修飾。例示的な実施形態は、これらの修飾の１つ以上がセンス上に存在するが、アンチセンス鎖には存在しない実施形態、またはアンチセンス鎖が、そのような修飾をほとんど有さない実施形態である。さらに他の例示的な修飾としては、３’オーバーハング中、例えば３’末端におけるメチル化Ｐの使用、２’修飾の組み合わせ、例えば２’ＯＭｅ部分の提供と骨格の修飾、例えばＰのＳによる置換、例えばホスホロチオエート修飾の提供、または３’オーバーハング中、例えば３’末端でのメチル化Ｐの使用、３’アルキルによる修飾、３’オーバーハング中、例えば３’末端での脱塩基ピロリドンによる修飾、ナプロキセン、イブプロフェン、または３’末端での分解を阻害する他の部分による修飾が挙げられる。
高度に修飾されたＲＮＡサイレンシング剤
特定の実施形態では、ＲＮＡサイレンシング剤は、少なくとも８０％の化学修飾ヌクレオチドを含む。特定の実施形態では、ＲＮＡサイレンシング剤は、完全に化学修飾されており、すなわち、ヌクレオチドの１００％が化学修飾されている。
特定の実施形態では、ＲＮＡサイレンシング剤は、２’－Ｏ－メチルリッチである、すなわち、５０％を超える２’－Ｏ－メチル含有量を含む。特定の実施形態では、ＲＮＡサイレンシング剤は、少なくとも約５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または１００％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド含有量を含む。特定の実施形態では、ＲＮＡサイレンシング剤は、少なくとも約７０％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。特定の実施形態では、ＲＮＡサイレンシング剤は、約７０％～約９０％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。
特定の実施形態では、ＲＮＡサイレンシング剤は、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含むｄｓＲＮＡである。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、少なくとも約５０％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、約５０％を超える２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾（例えば、５１％、５２％、５３％、５４％、５５％、５６％、５７％、５８％、５９％、６０％、６１％、６２％、６３％、６４％、６５％、６６％、６７％、６８％、６９％、７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、または９０％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾）を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、５０％を超える２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、６０％を超える２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、約５０％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、約５５％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、約６０％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、約６５％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、約７０％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、約７５％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、約８０％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、約８５％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、約９０％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、約９５％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、約９９％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、約１００％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。特定の実施形態では、アンチセンス鎖は、少なくとも約７０％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。特定の実施形態では、アンチセンス鎖は、約７０％～約９０％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、約７０％～約９０％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、約５０％～約１００％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、約５０％～約９０％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、約５０％～約８０％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、約５０％～約７５％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、約５０％～約７０％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、約５０％～約６５％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、約５０％～約６０％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、約５０％～約５５％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。
いくつかの実施形態では、センス鎖は、少なくとも約６０％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、６０％を超える２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。特定の実施形態では、センス鎖は、少なくとも約７０％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、６０％、６１％、６２％、６３％、６４％、６５％、６６％、６７％、６８％、６９％、７０％、７１％、７２％、７３％、７４％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、約６０％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、約６５％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、約７０％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、約７５％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、約８０％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、約８５％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、約９０％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、約９９％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、約１００％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。特定の実施形態では、センス鎖は、約７０％～約９０％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。特定の実施形態では、センス鎖は、１００％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、約７０％～約９０％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、約６０％～約１００％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、約６０％～約９５％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、約６０％～約９０％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、約６０％～約８５％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、約６０％～約８０％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、約６０％～約７５％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、約６０％～約７０％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、約６５％～約９０％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、約６５％～約８５％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、約６５％～約８０％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、約６５％～約７５％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、約６５％～約７０％の２’－Ｏ－メチルヌクレオチド修飾を含む。
２’－Ｏ－メチルリッチＲＮＡサイレンシング剤及び特定の化学修飾パターンは、米国特許第１１，２７９，９３０Ｂ２号及びＵＳ２０２１／０１１５４４２Ａ１にさらに記載され、そのそれぞれが参照により本明細書に組み込まれる。
ヌクレオチド間連結修飾
特定の実施形態では、少なくとも１つのヌクレオチド間連結、サブユニット間連結、またはヌクレオチド骨格が、ＲＮＡサイレンシング剤中で修飾される。特定の実施形態では、ＲＮＡサイレンシング剤中のヌクレオチド間連結のすべてが修飾される。特定の実施形態では、修飾ヌクレオチド間連結が、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を含む。特定の実施形態では、ＲＮＡサイレンシング剤は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、または２５のホスホロチオエートヌクレオチド間連結を含む。特定の実施形態では、ＲＮＡサイレンシング剤は、４～１６のホスホロチオエートヌクレオチド間連結を含む。特定の実施形態では、ＲＮＡサイレンシング剤は、８～１３のホスホロチオエートヌクレオチド間連結を含む。特定の実施形態では、ＲＮＡサイレンシング剤は、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含むｄｓＲＮＡであり、それぞれ５’末端及び３’末端を含む。特定の実施形態では、センス鎖の５’末端から１位及び２位のヌクレオチドは、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して隣接するリボヌクレオチドに結合される。特定の実施形態では、センス鎖の３’末端から１位及び２位のヌクレオチドは、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して隣接するリボヌクレオチドに結合される。特定の実施形態では、アンチセンス鎖の５’末端から１位及び２位のヌクレオチドは、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して隣接するリボヌクレオチドに結合される。特定の実施形態では、アンチセンス鎖の３’末端から１～２位から１～８位のヌクレオチドは、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して隣接するリボヌクレオチドに結合される。特定の実施形態では、アンチセンス鎖の３’末端から１～２位、１～３位、１～４位、１～５位、１～６位、１～７位、または１～８位のヌクレオチドは、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して隣接するリボヌクレオチドに結合される。特定の実施形態では、アンチセンス鎖の３’末端から１～２位から１～７位のヌクレオチドは、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して隣接するリボヌクレオチドに結合される。
４）細胞の取り込みを増強する修飾
他の実施形態では、ＲＮＡサイレンシング剤は、例えば標的細胞（例えば神経細胞）による細胞取り込みを増強するために、化学的部分で修飾されてもよい。したがって、本発明は、別の部分（例えば、ペプチドなどの非核酸部分）または有機化合物（例えば、染料）などに対して（例えば、その３’末端において）コンジュゲートされているかまたはコンジュゲートされていないＲＮＡサイレンシング剤を含む。コンジュゲーションは、例えば、本技術で知られている方法、以下の方法を用いて、達成することができる。Ｌａｍｂｅｒｔ ｅｔ ａｌ．，Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖ．Ｒｅｖ．：４７（１），９９－１１２（２００１）（ポリアルキルシアノアクリレート（ＰＡＣＡ）ナノ粒子に付加された核酸について記載）、Ｆａｔｔａｌ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｃｏｎｔｒｏｌ Ｒｅｌｅａｓｅ ５３（１－３）：１３７－４３（１９９８）（ナノ粒子に結合した核酸について記載）、Ｓｃｈｗａｂ ｅｔ ａｌ．，Ａｎｎ．Ｏｎｃｏｌ．５ Ｓｕｐｐｌ．４：５５－８（１９９４）（インターカレーション剤、疎水性基、ポリカチオンまたはＰＡＣＡナノ粒子と連結した核酸について記載）、及びＧｏｄａｒｄ ｅｔ ａｌ．，Ｅｕｒ．Ｊ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．２３２（２）：４０４－１０（１９９５）（ナノ粒子に連結した核酸について記載）。
特定の実施形態では、本発明のＲＮＡサイレンシング剤は、親油性部分にコンジュゲートされる。一実施形態では、親油性部分は、カチオン基を含むリガンドである。別の実施形態では、親油性部分は、ｓｉＲＮＡの一方または両方の鎖に付着している。例示的な実施形態では、親油性部分は、ｓｉＲＮＡのセンス鎖の一端に付着している。別の例示的な実施形態では、親油性部分は、センス鎖の３’末端に付着している。特定の実施形態では、親油性部分は、コレステロール、ビタミンＥ、ビタミンＫ、ビタミンＡ、葉酸、またはカチオン色素（例えば、Ｃｙ３）からなる群から選択される。例示的な実施形態では、親油性部分は、コレステロールである。他の親油性部分としては、コール酸、アダマンタン酢酸、１－ピレン酪酸、ジヒドロテストステロン、１，３－ビス－Ｏ（ヘキサデシル）グリセロール、ゲラニルオキシヘキシル基、ヘキサデシルグリセロール、ボルネオール、メントール、１，３－プロパンジオール、ヘプタデシル基、パルミチン酸、ミリスチン酸、Ｏ３－（オレオイル）リトコール酸、Ｏ３－（オレオイル）コレン酸、ジメトキシトリチル、またはフェノキサジンが挙げられる。
５）繋留リガンド
他の実体は、本発明のＲＮＡサイレンシング剤に繋留することができる。例えば、リガンドは、例えばエンドサイトーシス依存性機序または非依存性機序による、安定性、標的核酸とのハイブリダイゼーション熱力学、特定の組織または細胞型へのターゲティング、または細胞透過性を改善するために、ＲＮＡサイレンシング剤に繋留される。リガンド及び関連する修飾は、配列の特異性を高め、その結果、オフサイトターゲティングを減少させることもできる。繋留因子リガンドは、インターカレーターとして機能できる１つ以上の修飾塩基または糖を含むことができる。これらは、好ましくは、ＲＮＡサイレンシング剤／標的二重鎖のバルジ内などの内部領域内に位置させる。インターカレーターは、芳香族、例えば、多環式芳香族または複素環式芳香族化合物であり得る。多環式インターカレーターは、スタッキング能力を有し得、２つ、３つ、または４つの縮合環を有する系を含むことができる。本明細書に記載のユニバーサル塩基は、リガンドに含めることができる。一実施形態では、リガンドは、標的核酸の切断による標的遺伝子の阻害に寄与する切断基を含むことができる。切断基は、例えば、ブレオマイシン（例えば、ブレオマイシン－Ａ５、ブレオマイシン－Ａ２、またはブレオマイシン－Ｂ２）、ピレン、フェナントロリン（例えば、Ｏ－フェナントロリン）、ポリアミン、トリペプチド（例えば、ｌｙｓ－ｔｙｒ－ｌｙｓトリペプチド）、または金属イオンキレート基であり得る。金属イオンキレート基としては、例えば、Ｌｕ（ＩＩＩ）またはＥＵ（ＩＩＩ）大環状錯体、Ｚｎ（ＩＩ）２，９－ジメチルフェナントロリン誘導体、Ｃｕ（ＩＩ）テルピリジン、またはアクリジンを挙げることができ、これらは、Ｌｕ（ＩＩＩ）などの遊離金属イオンによるバルジ部位での標的ＲＮＡの選択的切断を促進することができる。いくつかの実施形態では、ペプチドリガンドは、例えばバルジ領域で、標的ＲＮＡの切断を促進するためにＲＮＡサイレンシング剤に繋留することができる。例えば、１，８－ジメチル－１，３，６，８，１０，１３－ヘキサアザシクロテトラデカン（サイクラム）は、標的ＲＮＡ切断を促進するために（例えば、アミノ酸誘導体によって）ペプチドにコンジュゲートすることができる。繋留リガンドは、アミノグリコシドリガンドであり得、これは、ＲＮＡサイレンシング剤に改善されたハイブリダイゼーション特性または改善された配列特異性を持たせることができる。例示的なアミノグリコシドとしては、グリコシル化ポリリジン、ガラクトシル化ポリリジン、ネオマイシンＢ、トブラマイシン、カナマイシンＡ、及びアミノグリコシドのアクリジンコンジュゲート、例えば、Ｎｅｏ－Ｎ－アクリジン、Ｎｅｏ－Ｓ－アクリジン、Ｎｅｏ－Ｃ－アクリジン、Ｔｏｂｒａ－Ｎ－アクリジン、及びＫａｎａＡ－Ｎ－アクリジンが挙げられる。アクリジン類似体の使用により、配列の特異性を高めることができる。例えば、ネオマイシンＢは、ＤＮＡと比較して、ＲＮＡに対して高い親和性を有するが、配列特異性は低くなる。アクリジン類似体であるネオ－５－アクリジンは、ＨＩＶ Ｒｅｖ－応答エレメント（ＲＲＥ）に対する親和性が高くなる。いくつかの実施形態では、アミノグリコシドリガンドのグアニジン類似体（グアニジノグリコシド）は、ＲＮＡサイレンシング剤に繋留されている。グアニジノグリコシド内では、アミノ酸上のアミン基がグアニジン基に交換されている。グアニジン類似体が付着することにより、ＲＮＡサイレンシング剤の細胞透過性が増大し得る。繋留リガンドは、オリゴヌクレオチド剤の細胞取り込みを増大することができるポリアルギニンペプチド、ペプトイドまたはペプチド模倣体であり得る。
例示的なリガンドは、好ましくは、直接、または介在繋留因子を介して間接的に、リガンドコンジュゲート担体に共有結合によりカップリングされる。例示的実施形態では、リガンドは、介在繋留因子を介して担体に付着している。例示的実施形態では、リガンドにより、それが組み込まれるＲＮＡサイレンシング剤の分布、標的化または寿命が変化する。例示的実施形態では、リガンドは、そのようなリガンドが存在しない種と比較して、選択された標的、例えば、分子、細胞または細胞型、コンパートメント、例えば、細胞または器官コンパートメント、身体の組織、器官または領域に対して、例えば、より高い親和性を提供する。
例示的なリガンドは、輸送、ハイブリダイゼーション、及び特異性特性を改善することができ、結果として得られる天然のまたは修飾されたＲＮＡサイレンシング剤、または本明細書に記載のモノマーの任意の組み合わせを含むポリマー分子及び／または天然または修飾リボヌクレオチドのヌクレアーゼ耐性も改善し得る。リガンドは、一般に、例えば、取り込みを増大するための治療修飾因子、例えば、分布を監視するための診断用化合物またはレポーター基、架橋剤、ヌクレアーゼ耐性付与部分、及び天然または異常な核酸塩基を含むことができる。一般的な例としては、親油性物質、脂質、ステロイド（例えば、ウバオール、ヘシゲニン（ｈｅｃｉｇｅｎｉｎ）、ジオスゲニン）、テルペン（例えば、トリテルペン、例えば、サルササポゲニン、フリーデリン、エピフリーデラノール誘導体化リトコール酸）、ビタミン（例えば、葉酸、ビタミンＡ、ビオチン、ピリドキサール）、炭水化物、タンパク質、タンパク質結合剤、インテグリン標的分子、ポリカチオン、ペプチド、ポリアミン、及びペプチド模倣物が挙げられる。リガンドとしては、天然に存在する物質（例えば、ヒト血清アルブミン（ＨＳＡ）、低密度リポタンパク質（ＬＤＬ）、またはグロブリン）、炭水化物（例えば、デキストラン、プルラン、キチン、キトサン、イヌリン、シクロデキストリンまたはヒアルロン酸）、アミノ酸、または脂質を挙げることができる。リガンドはまた、組換え分子または合成分子、例えば、合成ポリマー、例えば、合成ポリアミノ酸であってもよい。ポリアミノ酸の例としては、ポリリジン（ＰＬＬ）であるポリアミノ酸、ポリＬ－アスパラギン酸、ポリＬ－グルタミン酸、スチレン－無水マレイン酸コポリマー、ポリ（Ｌ－ラクチド－コ－グリコール化）コポリマー、ジビニルエーテル－無水マレイン酸コポリマー、Ｎ－（２－ヒドロキシプロピル）メタクリルアミドコポリマー（ＨＭＰＡ）、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、ポリビニルアルコール（ＰＶＡ）、ポリウレタン、ポリ（２－エチルアクリル酸）、Ｎ－イソプロピルアクリルアミドポリマー、またはポリホスファジンが挙げられる。ポリアミンの例としては、ポリエチレンイミン、ポリリジン（ＰＬＬ）、スペルミン、スペルミジン、ポリアミン、シュードペプチド－ポリアミン、ペプチド模倣ポリアミン、デンドリマーポリアミン、アルギニン、アミジン、プロタミン、カチオン性脂質、カチオン性ポルフィリン、ポリアミンの四級塩、またはアルファらせんペプチドが挙げられる。
リガンドはまた、胎盤細胞、腎細胞、及び／または肝細胞などの特定の細胞型に結合する標的基、例えば細胞または組織標的剤、例えばレクチン、糖タンパク質、脂質またはタンパク質、例えば抗体を挙げることができる。標的基はまた、甲状腺刺激ホルモン、メラノトロピン、レクチン、糖タンパク質、サーファクタントプロテインＡ、ムチン炭水化物、多価ラクトース、多価ガラクトース、Ｎ－アセチルガラクトサミン、Ｎ－アセチルグルコサミン、多価マンノース、多価フコース、グリコシル化ポリアミノ酸、多価ガラクトース、トランスフェリン、ビスホスホネート、ポリグルタミン酸、ポリアスパラギン酸、脂質、コレステロール、ステロイド、胆汁酸、葉酸、ビタミンＢ１２、ビオチン、またはＲＧＤペプチドまたはＲＧＤペプチド模倣体であり得る。リガンドの他の例としては、色素、インターカレーション剤（例えば、アクリジン及び置換アクリジン）、架橋剤（例えば、ソラレン、マイトマイシンＣ）、ポルフィリン（ＴＰＰＣ４、テキサフィリン、サフィリン）、多環式芳香族炭化水素（例えば、フェナジン、ジヒドロフェナジン、フェナントロリン、ピレン）、ｌｙｓ－ｔｙｒ－ｌｙｓ トリペプチド、アミノグリコシド、グアニジウムアミノグリコジ（ａｍｉｎｏｇｌｙｃｏｄｉｅｓ）、人工エンドヌクレアーゼ（例えば、ＥＤＴＡ）、親油性分子、例えば、コレステロール（及びそのチオ類似体）、コール酸、コラン酸、リトコール酸、アダマンタン酢酸、１－ピレン酪酸、ジヒドロテストステロン、グリセロール（例えば、エステル（例えば、モノ、ビス、またはトリス脂肪酸エステル、例えば、Ｃ１０、Ｃ１１、Ｃ１２、Ｃ１３、Ｃ１４、Ｃ１５、Ｃ１６、Ｃ１７、Ｃ１８、Ｃ１９またはＣ２０脂肪酸）及びそのエーテル、例えば、Ｃ１０、Ｃ１１、Ｃ１２、Ｃ１３、Ｃ１４、Ｃ１５、Ｃ１６、Ｃ１７、Ｃ１８、Ｃ１９、またはＣ２０アルキル、例えば、１，３－ビス－Ｏ（ヘキサデシル）グリセロール、１，３－ビス－Ｏ（オクタアデシル）グリセロール）、ゲラニルオキシヘキシル基、ヘキサデシルグリセロール、ボルネオール、メントール、１，３－プロパンジオール、ヘプタデシル基、パルミチン酸、ステアリン酸（例えば、ジステアリン酸グリセリル）、オレイン酸、ミリスチン酸、Ｏ３－（オレオイル）リトコール酸、Ｏ３－（オレオイル）コレン酸、ジメトキシトリチル、またはフェノキサジン）及びペプチドコンジュゲート（例えば、アンテナペディアペプチド、Ｔａｔペプチド）、アルキル化剤、リン酸、アミノ、メルカプト、ＰＥＧ（例えば、ＰＥＧ－４０Ｋ）、ＭＰＥＧ、［ＭＰＥＧ］２、ポリアミノ、アルキル、置換アルキル、放射性標識マーカー、酵素、ハプテン（例えば、ビオチン）、輸送／吸収促進剤（例えば、アスピリン、ナプロキセン、ビタミンＥ、葉酸）、合成リボヌクレアーゼ（例えば、イミダゾール、ビスイミダゾール、ヒスタミン、イミダゾールクラスター、アクリジン－イミダゾールコンジュゲート、テトラアザマクロ環のＥｕ３＋錯体）、ジニトロフェニル、ＨＲＰまたはＡＰが挙げられる。
リガンドは、糖タンパク質などのタンパク質、またはコリガンドに対して特異的親和性を有する分子などのペプチド、またはがん細胞、内皮細胞、または骨細胞などの特定の細胞型に結合する抗体などの抗体であり得る。リガンドとしては、ホルモン及びホルモン受容体を挙げることもできる。それらはまた、非ペプチド種、例えば、脂質、レクチン、炭水化物、ビタミン、補因子、多価ラクトース、多価ガラクトース、Ｎ－アセチル－ガラクトサミン、Ｎ－アセチル－グルコサミン多価マンノース、または多価フコースを含むことができる。リガンドは、例えば、リポ多糖、ｐ３８ ＭＡＰキナーゼのアクチベーター、またはＮＦ－ｋＢのアクチベーターであり得る。
リガンドは、例えば、細胞の細胞骨格を破壊することにより、例えば、細胞の微小管、マイクロフィラメント、及び／または中間フィラメントを破壊することにより、細胞へのＲＮＡサイレンシング剤の取り込みを増加させることができる物質、例えば薬物であり得る。薬物は、例えば、タクソン、ビンクリスチン、ビンブラスチン、サイトカラシン、ノコダゾール、ｊａｐｌａｋｉｎｏｌｉｄｅ、ラトランキュリンＡ、ファロイジン、スウィンホリドＡ、インダノシン、またはミオセルビン（ｍｙｏｓｅｒｖｉｎ）であり得る。リガンドは、例えば、炎症反応を活性化することにより、細胞へのＲＮＡサイレンシング剤の取り込みを増加させることができる。そのような効果を有する例示的なリガンドとしては、腫瘍壊死因子アルファ（ＴＮＦα）、インターロイキン－１ベータ、またはガンマインターフェロンが挙げられる。１つの態様では、リガンドは、脂質または脂質系分子である。かかる脂質または脂質系分子は、好ましくは、血清タンパク質、例えば、ヒト血清アルブミン（ＨＳＡ）に結合する。ＨＳＡ結合リガンドでは、標的組織へのコンジュゲートの分布が可能になる。例えば、標的組織は、胎盤、腎臓、または肝臓であり得る。ＨＳＡに結合することができる他の分子もまたリガンドとして使用することができる。例えば、ナプロキセンまたはアスピリンを使用することができる。脂質または脂質系リガンドは、（ａ）コンジュゲートの耐分解性を向上させること、（ｂ）標的細胞または細胞膜への標的化または輸送を増加させること、及び／または（ｃ）血清タンパク質、例えば、ＨＳＡへの結合を調節するために使用することができる。脂質系リガンドは、コンジュゲートの標的組織への結合を調節、例えば、制御するために使用することができる。例えば、より強固にＨＳＡに結合する脂質または脂質系リガンドは、胎盤、肝臓、及び／または腎臓を標的とする可能性が低く、それ故、体内から排出される可能性が低い。ＨＳＡにあまり強固に結合しない脂質または脂質系リガンドは、コンジュゲートを胎盤、肝臓及び／または腎臓に標的化するために使用することができる。脂質系リガンドの代わりに、またはそれに加えて、胎盤、肝臓及び／または腎臓の細胞を標的とする他の部分もまた使用することができる。
別の態様では、リガンドは、標的細胞、例えば、増殖性細胞によって取り込まれる部分、例えば、ビタミンである。これらは、望ましくない細胞増殖、例えば、悪性または非悪性型の、例えば、がん細胞を特徴とする障害の治療に特に有用である。代表的なビタミンとしては、ビタミンＡ、Ｅ、及びＫが挙げられる。他のビタミンの例としては、ビタミンＢ、例えば葉酸、Ｂ１２、リボフラビン、ビオチン、ピリドキサール、または他のビタミンもしくはがん細胞によって取り込まれる栄養素が挙げられる。同様に含まれるのは、ＨＳＡ及び低密度リポタンパク質（ＬＤＬ）である。
別の態様では、リガンドは、好ましくは、らせん細胞透過剤などの細胞透過剤である。好ましくは、剤は、両親媒性である。例示的な薬剤は、ｔａｔまたはａｎｔｅｎｎｏｐｅｄｉａなどのペプチドである。本剤がペプチドの場合、それはペプチジル模倣、逆転異性体、非ペプチドまたはシュードペプチド結合、及びＤ－アミノ酸の使用を含め、修飾されていてもよい。らせん剤は、好ましくは、アルファらせん剤であり、好ましくは、親油性相及び疎油性相を有する。
リガンドは、ペプチドまたはペプチド模倣体であり得る。ペプチド模倣体（本明細書ではオリゴペプチド模倣体とも呼ばれる）とは、天然のペプチドと同様の一定の三次元構造に折り畳むことが可能な分子である。オリゴヌクレオチド剤へのペプチド及びペプチド模倣体の付着は、細胞の認識及び吸収を向上させることなどによって、ＲＮＡサイレンシング剤の薬物動態分布に影響を与えることができる。ペプチドまたはペプチド模倣体部分は、約５～５０アミノ酸長、例えば、約５、１０、１５、２０、２５、３０、３５、４０、４５、または５０アミノ酸長であり得る。ペプチドまたはペプチド模倣体は、例えば、細胞透過性ペプチド、カチオン性ペプチド、両親媒性ペプチド、または疎水性ペプチド（例えば、主にＴｙｒ、Ｔｒｐ、またはＰｈｅからなる）であり得る。ペプチド部分は、デンドリマーペプチド、拘束ペプチド、または架橋ペプチドであり得る。ペプチド部分は、Ｌ－ペプチドまたはＤ－ペプチドであり得る。別の代替では、ペプチド部分は、疎水性膜トランスロケーション配列（ＭＴＳ）を含むことができる。ペプチドまたはペプチド模倣体は、ファージ提示ライブラリ、または１ビーズ１化合物（ＯＢＯＣ）コンビナトリアルライブラリから同定されたペプチドなどのランダムなＤＮＡ配列によってコードされ得る（Ｌａｍ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ ３５４：８２－８４，１９９１）。例示的な実施形態では、組み込まれたモノマーユニットを介してＲＮＡサイレンシング剤に繋留されたペプチドまたはペプチド模倣体は、アルギニン－グリシン－アスパラギン酸（ＲＧＤ）－ペプチドまたはＲＧＤミミックなどの細胞標的ペプチドである。あるペプチド部分は、長さが約５アミノ酸から約４０アミノ酸に及び得る。ペプチド部分は、例えば、安定性を向上させるまたは配座性を指示するなどの構造修飾を有することができる。
特定の実施形態では、機能部分は、本開示のＲＮＡサイレンシング剤の５’末端及び／または３’末端に連結されている。特定の実施形態では、機能部分は、本開示のＲＮＡサイレンシング剤のアンチセンス鎖の５’末端及び／または３’末端に連結されている。特定の実施形態では、機能部分は、本開示のＲＮＡサイレンシング剤のセンス鎖の５’末端及び／または３’末端に連結されている。特定の実施形態では、機能部分は、本開示のＲＮＡサイレンシング剤のセンス鎖の３’末端に連結されている。
特定の実施形態では、機能部分は、リンカーによってＲＮＡサイレンシング剤に連結されている。特定の実施形態では、機能部分は、リンカーにより、アンチセンス鎖及び／またはセンス鎖に連結されている。特定の実施形態では、機能部分は、リンカーにより、センス鎖の３’末端に連結されている。特定の実施形態では、リンカーは、二価または三価のリンカーを含む。特定の実施形態では、リンカーは、エチレングリコール鎖、アルキル鎖、ペプチド、ＲＮＡ、ＤＮＡ、ホスホジエステル、ホスホロチオエート、ホスホルアミデート、アミド、カルバメート、またはそれらの組み合わせを含む。特定の実施形態では、二価または三価のリンカーは、以下から選択される：


（式中、ｎは、１、２、３、４または５である）。
特定の実施形態では、リンカーは、ホスホジエステルまたはホスホジエステル誘導体をさらに含む。特定の実施形態では、ホスホジエステルまたはホスホジエステル誘導体は、以下からなる群から選択される：
（式中、Ｘは、Ｏ、ＳまたはＢＨ３である）。
本開示の様々な機能部分及びそれらをＲＮＡサイレンシング剤にコンジュゲートするための手段は、ＷＯ２０１７／０３０９７３Ａ１及びＷＯ２０１８／０３１９３３Ａ２にさらに詳細に記載されており、これらは、参照により本明細書に組み込まれる。
特定の実施形態では、リンカーは、切断可能なリンカーである。
特定の実施形態では、切断可能なリンカーは、ホスホジエステル連結、ジスルフィド連結、酸に不安定な連結、または光切断可能な連結を含む。
特定の実施形態では、切断可能なリンカーは、ホスホジエステルヌクレオチド間連結を有するｄＴｄＴジヌクレオチドを含む。
特定の実施形態では、酸に不安定な連結は、β－チオプロピオネート連結またはカルボキシジメチルマレイン酸無水物（ＣＤＭ）連結を含む。
特定の実施形態では、Ｃ７アミノリンカーを有する機能部分ＰＣ－ＤＣＡは、
によって表される（式中、「ｓｉＲＮＡ」は、センス鎖の３’末端に対応する）。
Ｖ．核酸、ベクター及び宿主細胞の導入方法
本発明のＲＮＡサイレンシング剤は、細胞（例えば、神経細胞）に（すなわち、細胞内に）直接導入することができる。または細胞外から空洞、間隙、生物の循環に導入される、経口的に導入される、または核酸を含む溶液に細胞もしくは生物を浸すことによって導入され得る。血管または血管外循環、血液またはリンパ系、及び脳脊髄液は、核酸が導入され得る部位である。
本発明のＲＮＡサイレンシング剤は、核酸を含む溶液の注入、核酸によって覆われた粒子による衝撃、核酸の溶液への細胞または生物の浸漬、または核酸の存在下での細胞膜のエレクトロポレーションなど、当技術分野において知られている核酸送達法を使用して、導入され得る。核酸を細胞に導入するための当技術分野で公知の他の方法、例えば脂質媒介担体輸送、化学媒介輸送、及びリン酸カルシウムなどのカチオン性リポソームトランスフェクションなどを使用してもよい。核酸は、以下の活性のうちの１つ以上を行う他の成分と共に導入され得る：細胞による核酸の取り込みを増強する、さもなければ標的遺伝子の阻害を増加させる。
核酸を導入する物理的方法としては、ＲＮＡを含む溶液の注入、ＲＮＡで覆われた粒子による衝撃、ＲＮＡの溶液への細胞または生物の浸漬、またはＲＮＡの存在下での細胞膜のエレクトロポレーションが挙げられる。ウイルス粒子にパッケージ化されたウイルス構築物は、細胞への発現構築物の効率的な導入、及び発現構築物によってコードされるＲＮＡの転写の両方を達成する。核酸を細胞に導入するための当技術分野で公知の他の方法、例えば脂質媒介担体輸送、化学媒介輸送、例えば、リン酸カルシウムなどを使用してもよい。したがって、ＲＮＡは、以下の活性のうちの１つ以上を行う成分と共に導入され得る：細胞によるＲＮＡ取り込みの増強、一本鎖のアニーリングの阻害、一本鎖の安定化、またはさもなければ標的遺伝子の阻害の増加。
ＲＮＡは、細胞に（すなわち、細胞内に）直接導入することができる。または細胞外から空洞、間隙、生物の循環に導入される、経口的に導入される、またはＲＮＡを含む溶液に細胞もしくは生物を浸すことによって導入され得る。血管または血管外循環、血液またはリンパ系、及び脳脊髄液は、ＲＮＡが導入され得る部位である。
標的遺伝子を有する細胞は、生殖系列または体細胞、全能性または多能性、分裂または非分裂、柔組織または上皮、不死化または形質転換などに由来し得る。細胞は、幹細胞または分化細胞であり得る。分化する細胞型としては、脂肪細胞、線維芽細胞、筋細胞、心筋細胞、内皮細胞、ニューロン、グリア細胞、血液細胞、巨核球、リンパ球、マクロファージ、好中球、好酸球、好塩基球、肥満細胞、白血球、顆粒球、ケラチノサイト、軟骨細胞、骨芽細胞、破骨細胞、肝細胞、及び内分泌腺または外分泌腺の細胞が挙げられる。
特定の標的遺伝子及び送達される二本鎖ＲＮＡ材料の用量に応じて、このプロセスは、標的遺伝子の部分的または完全な機能喪失をもたらし得る。少なくとも５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％または９９％、またはそれ以上の標的細胞における遺伝子発現の減少または喪失が典型的である。遺伝子発現の阻害とは、標的遺伝子からのタンパク質及び／またはｍＲＮＡ産物のレベルの欠如（または観察可能な減少）を指す。特異性とは、細胞の他の遺伝子に明らかな影響を与えることなく、標的遺伝子を阻害する能力を指す。阻害の結果は、細胞または生物の外部特性を調べることによって（以下の実施例に示されているとおり）、または生化学的手法、例えば、ＲＮＡ溶液ハイブリダイゼーション、ヌクレアーゼ保護、ノーザンハイブリダイゼーション、逆転写、マイクロアレイによる遺伝子発現モニタリング、抗体結合、酵素結合免疫吸着測定法（ＥＬＩＳＡ）、ウェスタンブロッティング、ラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）、他のイムノアッセイ、及び蛍光活性化セルソーティング（ＦＡＣＳ）によって確認することができる。
細胞株または生物全体におけるＲＮＡ媒介阻害の場合、タンパク質産物が容易にアッセイされるレポーターまたは薬剤耐性遺伝子を使用することによって、遺伝子発現は、簡便にアッセイされる。このようなレポーター遺伝子としては、アセトヒドロキシ酸シンターゼ（ＡＨＡＳ）、アルカリホスファターゼ（ＡＰ）、ベータガラクトシダーゼ（ＬａｃＺ）、ベータグルコロニダーゼ（ＧＵＳ）、クロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼ（ＣＡＴ）、緑色蛍光タンパク質（ＧＦＰ）、ホースラディッシュペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）、ルシフェラーゼ（Ｌｕｃ）、ノパリンシンターゼ（ＮＯＳ）、オクトピンシンターゼ（ＯＣＳ）、及びそれらの誘導体が挙げられる。アンピシリン、ブレオマイシン、クロラムフェニコール、ゲンタマイシン（ｇｅｎｔａｒｎｙｃｉｎ）、ハイグロマイシン、カナマイシン、リンコマイシン、メトトレキサート、ホスフィノスリシン、ピューロマイシン、及びテトラサイクリンに対する耐性を付与する複数の選択マーカーが利用可能である。アッセイに応じて、遺伝子発現量の定量化により、本発明により治療されていない細胞と比較して、１０％、３３％、５０％、９０％、９５％または９９％を超える阻害度を判定することができる。注入された材料の用量が少なく、ＲＮＡｉ剤の投与後の時間が長い場合には、細胞のより少ない割合（例えば、標的細胞の少なくとも１０％、２０％、５０％、７５％、９０％、または９５％）で阻害され得る。細胞内の遺伝子発現の定量化は、標的ｍＲＮＡの蓄積または標的タンパク質の翻訳のレベルで、同様の量の阻害を示し得る。一例として、細胞内の遺伝子産物の量を評価することにより、阻害の効率を判定してもよい。ｍＲＮＡは、阻害性二本鎖ＲＮＡに使用される領域外にヌクレオチド配列を有するハイブリダイゼーションプローブにより検出され得るか、または翻訳されたポリペプチドが、その領域のポリペプチド配列に対して産生された抗体で検出され得る。
ＲＮＡは、細胞当たり少なくとも１コピーの送達が可能になる量で導入され得る。高用量の材料（例えば、少なくとも５、１０、１００、５００または１０００コピー／細胞）は、より効果的な阻害をもたらし得、低用量は、特定の用途にも有用であり得る。
例示的な態様では、本発明のＲＮＡｉ剤（例えば、ｆｌｔ１イントロン標的配列を標的とするｓｉＲＮＡ）の効力について、細胞内、特に胎盤細胞（例えば、ラビリンス（ｌａｂｙｒｉｎｔｈ）細胞、栄養膜細胞（例えば、栄養膜合胞体層及び／または栄養膜細胞層）、間葉系細胞、間葉系マクロファージ（ホーフバウアー細胞）、線維芽細胞、胎児血管細胞（例えば、平滑筋細胞、血管周囲細胞（周皮細胞）、及び内皮細胞））、肝細胞及び／または腎細胞において、変異体ｍＲＮＡ（例えば、ｓｆｌｔ１ ｍＲＮＡ及び／またはｓＦｌｔ１タンパク質の産生）を特異的に分解する能力の試験を行う。また、細胞ベースの検証アッセイに好適であるのは、他の容易にトランスフェクト可能な細胞、例えば、栄養膜細胞、ＨｅＬａ細胞またはＣＯＳ細胞である。細胞は、ヒトの野生型または変異体ｃＤＮＡ（例えば、ヒトの野生型または分泌型ｆｌｔ１ ｃＤＮＡ）でトランスフェクトされる。標準的なｓｉＲＮＡ、修飾ｓｉＲＮＡ、またはＵループ型ｍＲＮＡからｓｉＲＮＡを生成できるベクターを同時トランスフェクトする。標的ｍＲＮＡの選択的減少（例えば、ｓｆｌｔ１ ｍＲＮＡ）及び／または標的タンパク質（例えば、ｓＦｌｔ１タンパク質）を測定する。標的ｍＲＮＡまたはタンパク質の減少は、ＲＮＡｉ剤の非存在下またはｓＦｌｔ１ ｍＲＮＡを標的としないＲＮＡｉ剤の存在下での標的ｍＲＮＡまたはタンパク質のレベルと比較することができる。外因的に導入されたｍＲＮＡまたはタンパク質（または内因性のｍＲＮＡまたはタンパク質）は、比較目的でアッセイできる。標準的なトランスフェクション技術に対してある程度耐性があることが知られている神経細胞を利用する場合、受動的取り込みによって、ＲＮＡｉ剤（例えば、ｓｉＲＮＡ）を導入することが望ましい場合がある。
ＶＩ．治療方法
本発明は、分泌されたＦｌｔ１タンパク質によって全体的または部分的に引き起こされる疾患または障害のリスクがある（または障害を受けやすい）対象を治療する予防的方法及び治療的方法の両方を提供する。一実施形態では、疾患または障害は、肝疾患または障害である。別の実施形態では、疾患または障害は、腎疾患または障害である。一実施形態では、疾患または障害は、胎盤疾患または障害である。一実施形態では、疾患または障害は、妊娠関連の疾患または障害である。好ましい実施形態では、疾患または障害は、可溶性Ｆｌｔ１タンパク質の発現に関連し、かつ可溶性Ｆｌｔ１タンパク質の発現の増幅が、ＰＥ、分娩後ＰＥ、子癇及び／またはＨＥＬＬＰの臨床症状をもたらす障害である。いくつかの実施形態では、疾患または障害は、ＰＥである。いくつかの実施形態では、疾患または障害は、分娩後ＰＥである。いくつかの実施形態では、疾患または障害は、子癇である。いくつかの実施形態では、疾患または障害は、ＨＥＬＬＰである。
本明細書で使用される「治療」または「治療すること」は、患者への治療剤（例えば、ＲＮＡ剤またはベクターもしくはそれをコードする導入遺伝子）の適用もしくは投与、または患者から単離された組織もしくは細胞株への治療剤の適用もしくは投与として定義され、患者は、その疾患もしくは障害、その疾患もしくは障害の症状または疾患もしくは障害の素因を有し、疾患もしくは障害、疾患もしくは障害の症状、または疾患の素因を治療する、治癒させる、軽減させる、緩和させる、変更させる、修復させる、回復させる、改善させるまたは影響を与えるために行う。
一態様では、本発明は、対象に治療剤（例えば、ＲＮＡｉ剤またはベクターまたはそれをコードする導入遺伝子）を投与することによって、対象において上記の疾患または障害を予防する方法を提供する。疾患のリスクがある対象は、例えば、本明細書に記載の診断アッセイまたは予後アッセイのいずれかまたは組み合わせによって同定することができる。予防剤の投与は、疾患または障害に特徴的な症状が現れる前に行うことができ、これにより、その疾患または障害を予防するか、あるいはその進行を遅らせるようになる。
本発明の別の態様は、対象を治療的に処置する方法、すなわち、疾患または障害の症状の発症を変化させる方法に関する。例示的な実施形態では、本発明の調節方法は、機能獲得変異体を発現する細胞を、遺伝子内の１つ以上の標的配列（例えば、配列番号１もしくは２、またはそれらの任意の組み合わせ）に特異的な治療剤（例えば、ＲＮＡｉ剤またはベクターもしくはそれをコードする導入遺伝子）と接触させることを含み、これにより、遺伝子に対する配列特異的な干渉が達成されるようになる。これらの方法は、ｉｎ ｖｉｔｒｏ（例えば、細胞を剤と共に培養することにより）で、あるいはｉｎ ｖｉｖｏ（例えば、剤を対象に投与することにより）で行うことができる。
治療の予防的方法及び治療的方法の両方に関して、そのような治療は、ファーマコゲノミクスの分野から得られた知識に基づいて、特別に調整または修正され得る。本明細書で使用される「ファーマコゲノミクス」は、遺伝子配列決定、統計遺伝学、及び遺伝子発現分析などのゲノミクス技術を、臨床開発中及び市販中の薬物に適用することを指す。より具体的には、この用語は、患者の遺伝子が薬物に対する応答（例えば、患者の「薬物反応表現型」または「薬物反応遺伝子型」）を決定する方法についての研究を指す。したがって、本発明の別の態様は、個体の薬物応答遺伝子型に従って、本発明の標的遺伝子分子または標的遺伝子調節因子のいずれかを用いて、個体の予防的または治療的処置を調整する方法を提供する。ファーマコゲノミクスにより、臨床医または医師は、処置から最も恩恵を受ける患者に予防的または治療的処置を標的にすること、及び有毒な薬物関連の副作用を経験する患者の処置を回避することが可能になる。
治療剤は、適切な動物モデルで試験され得る。例えば、本明細書に記載のＲＮＡｉ剤（またはそれをコードする発現ベクターまたは導入遺伝子）を動物モデルで使用して、ＲＮＡｉ剤による処置の有効性、毒性、または副作用を決定することができる。あるいは、治療剤を動物モデルで使用して、そのような剤の作用機序を決定することができる。例えば、剤を動物モデルで使用して、そのような剤による処置の有効性、毒性、または副作用を決定することができる。あるいは、剤を動物モデルで使用して、そのような剤の作用機序を決定することができる。
本発明のＲＮＡサイレンシング剤を含む医薬組成物は、例えばＰＥ及び／または子癇などの妊娠関連障害、肝疾患及び／または腎疾患関連障害を有すると診断されたまたは発症そのリスクがあるあらゆる患者に投与することができる。一実施形態では、患者は、ＰＥ及び／または子癇を有すると診断され、その他の点では患者は、一般に良好な健康状態である。例えば、患者は、末期症状ではなく、診断後少なくとも２年、３年、５年、またはそれ以上生存する可能性が高い。患者は、診断直後に治療することができるか、または患者が、ＰＥの２つ以上の症状、もしくは子癇の１つ以上の症状など、さらに衰弱させる症状を経験するまで、遅延させることができる。別の実施形態では、患者は、疾患の進行段階に達していない。
臓器に直接（例えば、胎盤、肝臓及び／または腎臓に直接）ＲＮＡサイレンシング剤を送達することは、肝臓関連、腎臓関連もしくは妊娠関連の疾患または障害、例えば、ＰＥ、分娩後ＰＥ、子癇及び／またはＨＥＬＬＰを治療または予防するのに有効な投与量であり得る。
ＲＮＡサイレンシング剤組成物の濃度は、障害の治療または予防に有効であるか、またはヒトにおいて生理学的状態を調節するのに十分な量である。投与されるＲＮＡサイレンシング剤の濃度または量は、剤について決定されたパラメータ及び投与方法、例えば、鼻、頬、または肺を通した投与方法に依存する。
ＶＩ．医薬組成物及び投与方法
本発明は、以下に記載の予防的及び／または治療的治療のための上記剤の使用に関する。したがって、本発明の調節因子（例えば、ＲＮＡｉ剤）は、投与に好適である医薬組成物に組み込むことができる。そのような組成物は、典型的には、核酸分子、タンパク質、抗体、または調節化合物及び薬学的に許容される担体を含む。本明細書において「薬学的に許容される担体」という用語は、薬剤投与に適合する任意の及びすべての溶媒、分散媒体、コーティング、抗菌及び抗真菌剤、等張性及び吸収遅延剤などを含むことを意図する。薬学的活性物質のためのそのような培地及び剤の使用は、当技術分野で周知である。任意の従来の培地または剤が活性化合物と不適合である場合を除いて、組成物におけるそれらの使用が企図される。補足的活性化合物を組成物に組み込むこともできる。
本明細書で提供されるＲＮＡｉ剤（例えば、ｄｓＲＮＡ）を含む医薬組成物は、任意の薬学的に許容される塩、エステル、またはそのようなエステルの塩を包含する。したがって、例えば、本開示は、ＲＮＡｉ剤の薬学的に許容される塩、プロドラッグ、そのようなプロドラッグの薬学的に許容される塩、及び他の生物学的同等物も対象とする。好適な薬学的に許容される塩には、ナトリウム塩及びカリウム塩が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、本開示は、ＲＮＡｉ剤（例えば、ｄｓＲＮＡ）の塩を提供する。いくつかの実施形態では、本開示は、ｄｓＲＮＡ剤の塩を提供する。いくつかの実施形態では、本開示は、ｓｉＲＮＡ剤の塩を提供する。いくつかの実施形態では、塩は、ナトリウム塩である。いくつかの実施形態では、塩は、カリウム塩である。いくつかの実施形態では、塩は、薬学的に許容される塩である。いくつかの実施形態では、ＲＮＡｉ剤の塩は、薬学的に許容される塩である。いくつかの実施形態では、ｄｓＲＮＡ剤の塩は、薬学的に許容される塩である。いくつかの実施形態では、ｓｉＲＮＡ剤の塩は、薬学的に許容される塩である。
本発明の医薬組成物は、その意図される投与経路に適合するように製剤化される。投与経路の例としては、非経口、例えば静脈内（ＩＶ）、皮内、皮下（ＳＣまたはＳＱ）、腹腔内、筋肉内、経口（例えば吸入）、経皮（局所）、及び経粘膜投与が挙げられる。非経口、皮内、または皮下適用に使用される溶液または懸濁液としては、次の成分を挙げることができる：滅菌希釈剤、例えば、注射用水、食塩水、固定油、ポリエチレングリコール、グリセリン、プロピレングリコールまたは他の合成溶媒；抗菌剤、例えば、ベンジルアルコールまたはメチルパラベン；抗酸化剤、例えば、アスコルビン酸または重亜硫酸ナトリウム；キレート剤、例えば、エチレンジアミン四酢酸；緩衝液、例えば、酢酸塩、クエン酸塩またはリン酸塩、及び張性を調整するための剤、例えば、塩化ナトリウムまたはデキストロース。ｐＨは、塩酸または水酸化ナトリウムなどの酸または塩基で調整できる。非経口調製物は、ガラスもしくはプラスチック製のアンプル、使い捨てシリンジ、または複数回投与バイアル内に封入することができる。
注射使用に好適な医薬組成物としては、滅菌注射液または分散体を用時調製するための滅菌水溶液（水溶性の場合）または分散体及び滅菌粉末が挙げられる。静脈内投与の場合、好適な担体としては、生理食塩水、静菌水、Ｃｒｅｍｏｐｈｏｒ ＥＬ（商標）（ＢＡＳＦ，Ｐａｒｓｉｐｐａｎｙ，Ｎ．Ｊ．）またはリン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）が挙げられる。すべての場合において、組成物は、滅菌でなければならず、容易に注射することができる程度に流動性であるべきである。組成物は、製造及び保存の条件下において安定でなければならず、細菌または真菌などの微生物の汚染作用に対して保護されなければならない。担体は、例えば、水、エタノール、ポリオール（例えば、グリセロール、プロピレングリコール、及び液体ポリエチレングリコールなど）、及びそれらの好適な混合物を含有する、溶媒または分散媒であり得る。適切な流動性は、例えば、レシチンなどのコーティングの使用によって、分散の場合には必要とされる粒径の維持によって、及び界面活性剤の使用によって、維持することができる。微生物の作用の防止は、種々の抗菌剤及び抗真菌剤、例えば、パラベン、クロロブタノール、フェノール、アスコルビン酸、チメロサールなどによって達成され得る。多くの場合、等張剤、例えば、糖、ポリアルコール（マンニトール、ソルビトール、塩化ナトリウムなど）を組成物中に含むことが好ましい。注射用組成物の長期吸収は、吸収を遅延させる薬剤、例えば、モノステアリン酸アルミニウム及びゼラチンを組成物に含めることによってもたらすことができる。
滅菌注射液は、必要な量の活性化合物を、必要に応じて、上に列挙された成分のうちの１つまたはその組み合わせと共に適切な溶媒中に組み込み、続いて濾過滅菌することによって、調製することができる。一般に、分散液は、活性化合物を、基本的な分散媒及び上で列挙されたものからの必要とされる他の成分を含有する滅菌ビヒクル中に組み込むことによって、調製される。滅菌注射液の調製のための滅菌粉末の場合、その調製の好ましい方法は、予め滅菌濾過した溶液から有効成分と任意の所望の追加成分とを合わせた粉末が得られる、真空乾燥及び凍結乾燥である。
経口組成物は、一般に、不活性希釈剤または食用担体を含む。それらはゼラチンカプセルに封入するか、錠剤内に圧縮することができる。経口治療投与の目的で、活性化合物を、賦形剤と共に組み込み、錠剤、トローチ剤、またはカプセル剤の形態で使用することができる。経口組成物はまた、口腔洗浄薬として使用するために流動性担体を使用して調製することができ、流動性担体中の化合物は、経口的に適用され、口の中に入れてすすぎ、吐き出されるかまたは飲み込まれる。薬学的に適合性のある結合剤、及び／またはアジュバント材料を、組成物の一部として含めることができる。錠剤、丸薬、カプセル剤、トローチ剤などは、以下の成分のいずれか、または類似の性質の化合物を含有することができる：微結晶性セルロース、トラガカントガムもしくはゼラチンなどの結合剤；デンプンまたはラクトースなどの賦形剤、アルギン酸、Ｐｒｉｍｏｇｅｌ、またはコーンスターチなどの崩壊剤；ステアリン酸マグネシウムやＳｔｅｒｏｔｅｓなどの滑沢剤；コロイド状二酸化ケイ素などの流動促進剤；スクロースもしくはサッカリンなどの甘味剤；または、ペパーミント、サリチル酸メチル、もしくはオレンジフレーバーなどの香味剤。
吸入による投与の場合、化合物は、好適な噴射剤、例えば二酸化炭素などのガス、またはネブライザーを含有する加圧容器またはディスペンサーからエアロゾルスプレーの形態で送達される。
全身投与はまた、経粘膜的または経皮的手段によるものであり得る。経粘膜または経皮投与のために、浸透すべき障壁に適切な浸透剤が製剤に使用される。そのような浸透剤は、当技術分野で一般に知られており、例えば、経粘膜投与用に、界面活性剤、胆汁酸塩、及びフシジン酸誘導体が挙げられる。経粘膜投与は、経鼻スプレーまたは坐薬を使用して行うことができる。経皮投与の場合、活性化合物は、当技術分野で一般に知られているように、軟膏、膏薬、ゲル、またはクリームに製剤化される。
化合物はまた、坐剤（例えば、ココアバター及び他のグリセリドなどの従来の坐剤基剤を含む）または直腸送達用の保持浣腸の形態で調製することができる。
ＲＮＡサイレンシング剤は、当技術で知られている方法を用いて、トランスフェクションまたは感染によって投与することもでき、以下に記載の方法などが挙げられる。ＭｃＣａｆｆｒｅｙ ｅｔ ａｌ．（２００２），Ｎａｔｕｒｅ，４１８（６８９３），３８－９（ハイドロダイナミックトランスフェクション）；Ｘｉａ ｅｔ ａｌ．（２００２），Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．，２０（１０），１００６－１０（ウイルス媒介性送達）；またはＰｕｔｎａｍ（１９９６），Ａｍ．Ｊ．Ｈｅａｌｔｈ Ｓｙｓｔ．Ｐｈａｒｍ．５３（２），１５１－１６０，ｅｒｒａｔｕｍ ａｔ Ａｍ．Ｊ．Ｈｅａｌｔｈ Ｓｙｓｔ．Ｐｈａｒｍ．５３（３），３２５（１９９６）。
ＲＮＡサイレンシング剤は、ＤＮＡワクチンなど、核酸剤の投与に好適である任意の方法によって投与することもできる。これらの方法としては、遺伝子銃、バイオインジェクター、皮膚パッチ、及び米国特許第６，１９４，３８９号に開示の微粒子ＤＮＡワクチン技術などのニードルフリー法、米国特許第６，１６８，５８７号に開示の粉状ワクチンを用いた哺乳動物の経皮的ニードルフリーワクチン接種が挙げられる。また、とりわけ、Ｈａｍａｊｉｍａ ｅｔ ａｌ．（１９９８），Ｃｌｉｎ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｉｍｍｕｎｏｐａｔｈｏｌ．，８８（２），２０５－１０などに記載の鼻腔内送達が可能である。リポソーム（例えば、米国特許第６，４７２，３７５号に記載）及びマイクロカプセル化も使用できる。生分解性の標的化可能な微粒子送達システムも使用できる（例えば、米国特許第６，４７１，９９６号に記載のものなど）。
一実施形態では、活性化合物は、植込み体及びマイクロカプセル化送達システムを含む制御放出製剤など、身体からの急速な排出から化合物を保護する担体と共に調製される。エチレン酢酸ビニル、ポリ無水物、ポリグリコール酸、コラーゲン、ポリオルトエステル、及びポリ乳酸などの生分解性、生体適合性ポリマーを使用することができる。このような製剤を調製するための方法は、当業者には明らかであろう。これらの材料は、Ａｌｚａ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ及びＮｏｖａ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｉｎｃ．から商業的に入手可能である。リポソーム懸濁液（ウイルス抗原に対するモノクローナル抗体で感染細胞を標的とするリポソームを含む）も、薬学的に許容される担体として使用することができる。これらは、当業者に知られている方法、例えば、米国特許第４，５２２，８１１号に記載されている方法に従って調製され得る。
投与の容易性及び投薬量の均一性のために、経口または非経口組成物を投薬単位形態で製剤化することはとりわけ有利である。本明細書で使用される投薬単位形態は、対象を治療するための単位投薬量として適した物理的に別個の単位を指し、各単位は、必要とされる医薬担体と共に所望の治療効果をもたらすように算出された、所定量の活性化合物を含有する。本発明の投薬単位形態の仕様は、活性化合物の固有の特徴及び達成されるべき特定の治療効果、ならびに個体の治療のためにこのような活性化合物を調合する当技術分野の本質的な制限によって決まり、またそれに直接依存している。
そのような化合物の毒性及び治療効果は、例えば、ＬＤ５０（集団の５０％に対する致死量）及びＥＤ５０（集団の５０％に治療的に有効な用量）を決定するために、細胞培養または実験動物における標準的な薬学的手順によって、決定することができる。毒性効果と治療効果の用量比は、治療指数であり、ＬＤ５０／ＥＤ５０比として表すことができる。大きい治療指数を示す化合物が好ましい。有毒な副作用を示す化合物を使用し得るが、非感染細胞への潜在的な損傷を最小限に抑え、それによって副作用を減少させるために、そのような化合物を患部組織の部位に向ける送達システムを設計するように留意する必要がある。
細胞培養アッセイ及び動物研究から得られたデータは、ヒトで使用するための用量範囲を調剤する際に使用できる。そのような化合物の投与量は、好ましくは、毒性をほとんどまたは全く有しないＥＤ５０を含む循環濃度の範囲内にある。投与量は、使用される投与形態及び利用される投与経路に応じて、この範囲内で変化し得る。本発明の方法で使用される任意の化合物について、治療有効用量は、最初に細胞培養アッセイから推定することができる。用量は、細胞培養で決定されるＥＣ５０（すなわち、最大応答の半分を達成する試験化合物の濃度）を含む循環血漿濃度範囲を達成するように、動物モデルで製剤化され得る。このような情報は、ヒトでの有用な用量をより正確に決定するために使用できる。血漿中のレベルは、例えば高速液体クロマトグラフィによって測定することができる。
医薬組成物は、任意の投与説明書と共に、容器、パック、またはディスペンサー内に含めることができる。
送達経路は、患者の障害に依存し得る。特定の例示的な実施形態では、ＰＥ、分娩後ＰＥ、子癇、及び／またはＨＥＬＬＰと診断される対象は、本発明の抗ｓＦｌｔ１ ＲＮＡサイレンシング剤をＩＶ投与またはＳＣ投与により投与することができる。本発明のＲＮＡサイレンシング剤に加えて、患者には、第２の治療法、例えば緩和治療法及び／または疾患特異的治療法を施すことができる。第２の治療法は、例えば、対症療法（例えば、症状を緩和するため）、保護療法（例えば、疾患の進行を遅延または停止させるため）、または回復療法（例えば、疾患プロセスを逆転させるため）であり得る。ＰＥ、分娩後ＰＥ、子癇及び／またはＨＥＬＬＰの治療に関して、例えば対症療法は、アテノロール、ヒドララジン、ラベタロール、硫酸マグネシウム、メチルドパ、ニカルジピン、ニフェジピン、ニトロプルシドナトリウムなどの薬物をさらに含むことができる。
一般に、本発明のＲＮＡサイレンシング剤は、任意の好適な方法によって投与され得る。本明細書で使用される場合、局所送達とは、眼、粘膜、体腔の表面など身体の任意の表面または任意の内面へのＲＮＡサイレンシング剤の直接適用を指すことができる。局所投与用の製剤としては、経皮パッチ、軟膏、ローション、クリーム、ゲル、ドロップ、スプレー、及び液体が挙げられ得る。従来の薬学的担体、水性、粉末、または油性基剤、増粘剤などは、必須であるか、または望ましい場合がある。局所投与は、ＲＮＡサイレンシング剤を対象の表皮または真皮、またはその特定の層、またはその下にある組織に選択的に送達する手段としても使用され得る。
非経口投与用の製剤は、緩衝液、希釈剤及び他の好適な添加剤を含み得る滅菌水溶液を含んでもよい。脳室内注射は、例えばリザーバーに取り付けられた脳室内カテーテルによって促進され得る。静脈内使用の場合、調製物を等張性にするためには溶質の総濃度を制御するものとする。
本明細書で使用される「立体化学異性体形態」、「立体形態」、「立体アイソフォーム」、「立体異性体」などの語句は、同じ結合順序で結合されるが交換可能ではない異なる三次元構造を有する同じ原子で構成される、異なる化合物を指す。本開示のいくつかの実施形態では、ＲＮＡｉ剤（例えばｄｓＲＮＡ）を含む医薬組成物は、ＲＮＡｉ剤の個々の立体化学異性体形態の純粋な調製物であってもよく、またはそれらを含んでもよい。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、ＲＮＡｉ剤の２つ以上の立体化学的異性体形態の混合物であってもよく、またはそれらを含んでもよい。
ＶＩＩ．キット
特定の他の態様では、本発明は、ＲＮＡサイレンシング剤、例えば二本鎖ＲＮＡサイレンシング剤、またはｓＲＮＡ剤（例えば前駆体、例えばプロセシングを受けてｓＲＮＡ剤になり得るより大きいＲＮＡサイレンシング剤、またはＲＮＡサイレンシング剤、例えば二本鎖ＲＮＡサイレンシング剤、またはｓＲＮＡ剤、またはその前駆体をコードするＤＮＡ）の医薬製剤を含む好適な容器を含むキットを提供する。特定の実施形態では、医薬製剤の個々の成分は、１つの容器に提供され得る。あるいは、医薬製剤の成分を、２つ以上の容器、例えば、ＲＮＡサイレンシング剤調製用の１つの容器と、少なくとも別の担体化合物用の容器に別々に提供することが望ましい場合がある。キットは、１つのボックス内に１つ以上の容器など、複数の異なる構成にパッケージングしてもよい。例えば、キットに提供された指示に従って、異なる構成要素を組み合わせることができる。これらの成分は、本明細書に記載される方法に従って、例えば、医薬組成物を調製し、投与するために組み合わせることができる。キットは、送達デバイスを含むこともできる。
本明細書に記載される方法の他の好適な改変及び適合は、本明細書で開示される実施形態の範囲から逸脱することなく、好適な等価物を使用して行うことができることは、当業者には容易に明らかであろう。ここまで特定の実施形態を詳細に説明してきたが、実施形態は、以下の実施例を参照することにより、より明確に理解されるであろう。実施例は、例示のみを目的に含まれるものであり、限定を意図するものではない。
実施例１．子癇前症（ＰＥ）の背景及び重要性
疫学及び実験的研究からの圧倒的なエビデンスは現在、ＰＥが、母体の血流中のＦｌｔ１遺伝子（ＶＥＧＦＲ１）からの「可溶性デコイ」タンパク質（可溶性ＦＬＴ１（ｓＦＬＴ１））のレベルが上昇することによって引き起こされることを示している（Ｙｏｕｎｇ，Ｂ．Ｃ．，Ｌｅｖｉｎｅ，Ｒ．Ｊ．＆Ｋａｒｕｍａｎｃｈｉ，Ｓ．Ａ．Ｐａｔｈｏｇｅｎｅｓｉｓ ｏｆ ｐｒｅｅｃｌａｍｐｓｉａ．Ａｎｎｕａｌ ｒｅｖｉｅｗ ｏｆ ｐａｔｈｏｌｏｇｙ ５，１７３－１９２（２０１０）；Ｍａｙｎａｒｄ，Ｓ．Ｅ．ｅｔ ａｌ．Ｅｘｃｅｓｓ ｐｌａｃｅｎｔａｌ ｓｏｌｕｂｌｅ ｆｍｓ－ｌｉｋｅ ｔｙｒｏｓｉｎｅ ｋｉｎａｓｅ １（ｓＦｌｔ１）ｍａｙ ｃｏｎｔｒｉｂｕｔｅ ｔｏ ｅｎｄｏｔｈｅｌｉａｌ ｄｙｓｆｕｎｃｔｉｏｎ，ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｏｎ，ａｎｄ ｐｒｏｔｅｉｎｕｒｉａ ｉｎ ｐｒｅｅｃｌａｍｐｓｉａ．Ｔｈｅ Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ ｃｌｉｎｉｃａｌ ｉｎｖｅｓｔｉｇａｔｉｏｎ １１１，６４９－６５８（２００３）；Ｌｅｖｉｎｅ，Ｒ．Ｊ．ｅｔ ａｌ．Ｃｉｒｃｕｌａｔｉｎｇ ａｎｇｉｏｇｅｎｉｃ ｆａｃｔｏｒｓ ａｎｄ ｔｈｅ ｒｉｓｋ ｏｆ ｐｒｅｅｃｌａｍｐｓｉａ．Ｔｈｅ Ｎｅｗ Ｅｎｇｌａｎｄ ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ ｍｅｄｉｃｉｎｅ ３５０，６７２－６８３（２００４）；Ｈｅｙｄａｒｉａｎ，Ｍ．ｅｔ ａｌ．Ｎｏｖｅｌ ｓｐｌｉｃｅ ｖａｒｉａｎｔｓ ｏｆ ｓＦｌｔ１ ａｒｅ ｕｐｒｅｇｕｌａｔｅｄ ｉｎ ｐｒｅｅｃｌａｍｐｓｉａ．Ｐｌａｃｅｎｔａ ３０，２５０－２５５（２００９））。ＦＬＴ１は、主に胎盤で発現する受容体チロシンキナーゼ（ＲＴＫ）である。ＲＴＫ調節のための一般的なメカニズムは、シグナル伝達経路全体の支配的な負の調節因子として作用する短縮分泌形態の受容体の産生である。このような可溶性デコイによるリガンド隔離は、完全長受容体による細胞内シグナル伝達を阻害し、それによってリガンド濃度に対する系の脱感作が行われる（Ｖｏｒｌｏｖａ，Ｓ．ｅｔ ａｌ．Ｉｎｄｕｃｔｉｏｎ ｏｆ ａｎｔａｇｏｎｉｓｔｉｃ ｓｏｌｕｂｌｅ ｄｅｃｏｙ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ｔｙｒｏｓｉｎｅ ｋｉｎａｓｅｓ ｂｙ ｉｎｔｒｏｎｉｃ ｐｏｌｙＡ ａｃｔｉｖａｔｉｏｎ．Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｃｅｌｌ ４３，９２７－９３９（２０１１））。ＦＬＴ１の場合には、可溶性デコイは、ｆｌ－ＦＬＴ１膜貫通（ＴＭ）及びキナーゼドメインをコードするエクソンの上流にある２つのイントロン（ｉ１３及びｉ１５）内のポリアデニル化によって生成される短縮ｍＲＮＡから発現する。
哺乳動物では、ＦＬＴ１は、主に胎盤中で発現し、ヒト胎盤Ｆｌｔ１ ｍＲＮＡレベルは、他の成体組織中で観察されるよりも１０～１００倍高い（Ｃｅｒｄｅｉｒａ，Ａ．Ｓ．＆Ｋａｒｕｍａｎｃｈｉ，Ｓ．Ａ．Ａｎｇｉｏｇｅｎｉｃ ｆａｃｔｏｒｓ ｉｎ ｐｒｅｅｃｌａｍｐｓｉａ ａｎｄ ｒｅｌａｔｅｄ ｄｉｓｏｒｄｅｒｓ．Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ ｐｅｒｓｐｅｃｔｉｖｅｓ ｉｎ ｍｅｄｉｃｉｎｅ ２（２０１２））。全長アイソフォームが非妊娠成人のヒト（上記）におけるすべての組織で優勢であるのに対して、胎盤発現は、３つの短縮型アイソフォーム、すなわちｓＦｌｔ１－ｉ１３ ｓｈｏｒｔ、ｓＦｌｔ１－ｉ１３ ｌｏｎｇ、及びｓＦｌｔ１－ｉ１５ａが優位であり、これらはすべて、ｓＦＬＴ１タンパク質をコードする。胎盤中での高Ｆｌｔ１及び他の非妊娠成体組織での低い発現であるこの同じパターンは、げっ歯類で観察される。しかしながら、げっ歯類は、イントロン１４のポリアデニル化部位を欠いているため、１つの可溶性デコイ形態：ｓＦｌｔ１－ｉ１３のみを発現する。ＰＥでは、完全長（ｆｌ－Ｆｌｔ１）及び短縮型Ｆｌｔ１のｍＲＮＡの両方が正常妊娠時よりも胎盤において高いレベルに蓄積し、短縮型アイソフォームがさらに顕著になる。ｍＲＮＡレベルでのこうした変化は、ＰＥの間の母体血流におけるｓＦＬＴ１タンパク質の有意な上昇を説明している可能性がある。
ＰＥの治療のためのｓｉＲＮＡの適用性
以前の研究では、ＰＥの治療のためのｓｉＲＮＡベースの治療薬の適用性が示されていた（米国特許第９，８６２，９５２号明細書、参照により本明細書に組み込まれる）。
実施例２．ｓＦＬＴ１を標的とするｓｉＲＮＡの最適化
胎盤組織の蓄積を促進し、ｓｉＲＮＡの分解を最小限に抑え、毒性を低減する一方で、サイレンシングを増強するために、前述のｓｉＲＮＡの最適化を行った。最適化は、安定性を向上させるための２’－ＯＭｅリッチ足場、及び胎盤送達を向上させるためのＰＣ－ＤＣＡコンジュゲートセンス鎖を導入することにより実施した。最適化されたｓｉＲＮＡは、以前に開発された化学物質と比較して、蓄積の増加、有効性及び安全性の向上を示した。
２’ＯＭｅ内容物の最適化
図１Ａに示すとおり、ｓｉＲＮＡのアンチセンス鎖及びセンス鎖において、様々な量の２’ＯＭｅ修飾を用いた。図１Ｂに示すとおり、ｓｉＲＮＡの用量反応結果（ｎ＝３、平均±ＳＤ）を、２２８３位（５’ＣＴＣＴＣＧＧＡＴＣＴＣＣＡＡＡＴＴＴＡ３’（配列番号１）において、ヒトｆｌｔ１遺伝子の配列を標的として生成した。２５１９位（５’ＣＡＴＣＡＴＡＧＣＴＡＣＣＡＴＴＴＡＴＴ３’（配列番号２）を標的とするｓｉＲＮＡも試験し、同様の結果であった。ＨｅＬａ細胞を、示した濃度で、ｓｉＲＮＡで７２時間処理した。ｍＲＮＡレベルは、Ｄｕａｌ－Ｇｌｏ（登録商標）ルシフェラーゼアッセイシステムを用いて測定し、未処理の対照（Ｃ）の百分率として計算した。図１Ｂの表－最大ＫＤ（％）－最大治療用量のｓｉＲＮＡによる標的ｍＲＮＡノックダウンの最大率、ＩＣ５０－最大阻害濃度の半値、ＡＵＣ－用量反応曲線の下面積、ｐ値－有意性。この結果は、ｓｉＲＮＡ中の２’ＯＭｅ修飾の量を増加させることにより、ｓｉＲＮＡのサイレンシング効力が実質的に低下しないことを実証している。２’ＯＭｅ修飾は、２’Ｆ修飾よりも毒性が低い。したがって、２’ＯＭｅリッチｓｉＲＮＡが、治療的使用により好適であり得る。
センス鎖コンジュゲート最適化
ｓｉＲＮＡコンジュゲートは、ｓｉＲＮＡを適切な組織及び細胞に誘導する際に重要な役割を果たす。図２Ａに示すとおり、Ｃｙ３標識されたｓｉＲＮＡを、様々な機能部分とコンジュゲートし、肝臓、腎臓、及び胎盤組織の送達を、組織蛍光イメージングによって観測した。本試験では、妊娠中のＣＤ１マウスに、２０ｍｇ／ｋｇのＣｙ３標識ｓｉＲＮＡバリアントを注射した。組織蛍光イメージングを、Ｌｅｉｃａ ＤＭｉ８倒立傾斜顕微鏡１０ｘタイル状アレイ画像を用いて実施した。スケールバー＝２ｍｍ。すべての画像は、同一のレーザ強度で取得した。図２Ｂに示すとおり、ガイド鎖の蓄積を、ＰＮＡハイブリダイゼーションアッセイにより４８時間後に定量化した（ｎ＝３）。ｐ値は、各化合物とコレステロールコンジュゲート化合物との間の統計的有意差を示す（一元配置分散分析法、＊＊ｐ＜０．０１、＊＊＊ｐ＜０．００１、有意差のないものはマークしていない）。ＮＯＣ－コンジュゲートなし、Ｃｈｏｌ－コレステロール、ＤＣＡ－ドコサン酸、ＰＣ－ＤＣＡ－ホスホコリン－ドコサン酸、ＤＨＡ－ドコサヘキサン酸、ＰＣ－ＤＨＡ－ホスホコリン－ドコサヘキサン酸、ＤＩＯ－二分岐オリゴヌクレオチド。この結果は、ＰＣ－ＤＣＡ ｓｉＲＮＡコンジュゲートにより、胎盤蓄積が増強することを実証していることを実証している。
ＰＣ－ＤＣＡ ｓｉＲＮＡコンジュゲートは、骨髄内での蓄積の減少を示すことをさらに特徴とした。Ｃｙ３標識ｓＦＬＴ１＿２２８３ ｓｉＲＮＡバリアントを注射したＣＤ－１マウスの骨髄細胞のＦＡＣＳ分析を行った。図３Ａには、図３Ｂ～図３Ｄの骨髄における特定の細胞集団のＣｙ３強度を定量化するために使用されるゲーティングスキームを示す。図３Ｂには、ｓｉＲＮＡバリアントを注入して２４時間後の骨髄好中球のＣｙ３蛍光強度の頻度分布ヒストグラム（左）及びＣｙ３中央蛍光強度の棒グラフ（右）を示す。図３Ｃには、ｓｉＲＮＡバリアントを注入して２４時間後の骨髄顆粒球のＣｙ３蛍光強度の頻度分布ヒストグラム（左）及びＣｙ３中央蛍光強度の棒グラフ（右）を示す。図３Ｄには、ｓｉＲＮＡバリアントを注入して２４時間後の骨髄単球のＣｙ３蛍光強度の頻度分布ヒストグラム（左）及びＣｙ３中央蛍光強度の棒グラフ（右）を示す。（ｎ＝３、平均±ＳＤ）ｐ値は、化合物の間の統計的有意差を表す（一元配置分散分析法；＊ｐ＜０．０５；有意差のないものはマークしていない）。その結果、ＰＣ－ＤＣＡコンジュゲートｓｉＲＮＡは、骨髄単球、顆粒球及び好中球における蓄積が低いことが示され、ＰＣ－ＤＣＡコンジュゲートは、オフターゲットの蓄積が最小である胎盤送達に有用であることを実証している。
アンチセンス鎖５’末端最適化
アンチセンス鎖は、５’エキソヌクレアーゼの作用に感受性であり得る。したがって、分解を減少させるような修飾により、５’末端を保護することが有利である。これらのｓｉＲＮＡを、３つの異なるアンチセンス５’末端修飾、５’ビニルホスホネート（ＶＰ）、５’ホスホロチオエート（ＰＳ）、及び５’－ヒドロキシル（ＯＨ）の効果を試験することにより、さらに最適化した。ｓｉＲＮＡ化学修飾パターンの概略図。
胚日（Ｅ）１３及びＥ１４に、２２８３及び２５１９のｓｉＲＮＡバリアントの２０ｍｇ／ｋｇ等モル混合物を妊娠中のＣＤ－１マウスに注射した。図４Ａは、注射されたｓｉＲＮＡ化合物の化学パターン及び試験された５’部分の化学構造の概略図を示す。図４Ｂに示すとおり、Ｅ１８の胎盤中のｓｆｌｔ１－ｉ１３ ｍＲＮＡレベルは、Ｑｕａｎｔｉｇｅｎｅ ２．０ ＲＮＡ Ａｓｓａｙを用いて測定した。レベルをＦｌｔ１に対して正規化し、ＰＢＳ対照のパーセンテージ（ｎ＝５、平均±ＳＤ）として示した。
５’部分、２’修飾パターン及びコンジュゲートの最適化により、ｉｎ ｖｉｖｏでの組織蓄積及び効力の増大がもたらされた。図４Ｃに、ＰＮＡハイブリダイゼーションアッセイを用いて測定したＥ１８の胎盤中のｓｉＲＮＡ蓄積の量を示す（ｎ＝５）。ｐ値は、化合物の間の統計的有意差を表す（一元配置分散分析法；＊＊ｐ＜０．０１；＊＊＊＊ｐ＜０．０００１；有意差のないものはマークしていない）。図４Ｄに示すとおり、Ｅ１８の胎盤中のｓｆｌｔ１－ｉ１３ ｍＲＮＡレベルは、Ｑｕａｎｔｉｇｅｎｅ ２．０ ＲＮＡ Ａｓｓａｙを用いて測定した。レベルをＦｌｔ１に対して正規化し、ＰＢＳ対照のパーセンテージ（ｎ＝６、平均±ＳＤ）として示した。図４Ｅに、ＰＮＡハイブリダイゼーションアッセイを用いて測定したＥ１８の胎盤中のｓｉＲＮＡ蓄積の量を示す（ｎ＝６）。ｐ値は、化合物の間の統計的有意差を表す（一元配置分散分析法；＊＊ｐ＜０．０１；＊＊＊＊ｐ＜０．０００１；有意差のないものはマークしていない。対応のないｔ検定；＃ｐ＜０．０５；＃＃＃＃ｐ＜０．０００１）。図４Ｆに示すとおり、マウスの平均子マウス数、子マウス平均体重、及び平均胎盤重量は、対照マウスと処置した妊娠中マウスとの間でほぼ同じであり、２２８３及び２５１９ ｓｉＲＮＡの混合物がこれらの測定基準に対して悪影響を及ぼさなかったことを示す。
血清サイトカイン産生の減少
最適化されたｓｉＲＮＡを、血清サイトカインの産生に及ぼす効果について試験した。最適化されたｓｉＲＮＡを生成して、部分的に、毒性を低下させ、治療指数を拡大させた。血清サイトカインの産生が減少することにより、毒性を低下させ、治療指数を拡大することを示すであろう。
図５に示すとおり、７５ｍｇ／ｋｇのｓＦＬＴ１＿２２８３ ｓｉＲＮＡバリアント（ｎ＝３、平均±ＳＤ）を注射して２４時間後のＣＤ－１マウスの血清サイトカイン濃度を測定した。ｐ値は、化合物の間の統計的有意差を表す（一元配置分散分析法；＊ｐ＜０．０５；＊＊ｐ＜０．０１；＊＊＊ｐ＜０．００１；＊＊＊＊ｐ＜０．０００１；有意差のないものはマークしていない）。多数のインターロイキン、コロニー刺激因子、及びケモカインレベルを測定し、第２世代の最適化されたｓｉＲＮＡでは、第１世代のｓｉＲＮＡと比較して低いことが判明した。治療指数が広いとは、ｓｉＲＮＡを毒性の問題のリスクがなく、高濃度で投与できることを意味する。このことは、投与頻度の減少及び／またはｓＦＬＴ－１のより良好なサイレンシングをもたらし得る。
実施例２の全体的な結果は、ｓＦｌｔ－１ ２２８３及び２５１９の標的部位を標的とする最適化されたｓｉＲＮＡが、第１世代ｓｉＲＮＡと比較した場合、同様のサイレンシング効力を有するとともに、優れた胎盤組織蓄積、オフターゲット組織蓄積の減少、分解の減少、毒性の低下、及びより広い治療指数を有することを示している。
リード化合物を評価するための既存のアッセイシステム。
これまでに開発されたアッセイ及びモデルは、以下のとおりである。
Ｉｎ ｓｉｔｕ組織分布の蛍光顕微鏡検査評価
センス（パッセンジャー）鎖の５’末端に非分解性リンカーを介して付着させたＣｙ３またはＣｙ５．５（自家蛍光が少ない）色素を含むｈｓｉＲＮＡバリアントを合成した。この化合物は、２４時間以内に検出可能なＣｙ３切断なく生物学的に安定であった。相補的なガイド鎖にハイブリダイズした蛍光センス鎖（したがって二本鎖ｈｓｉＲＮＡを形成する）を動物に投与し、オリゴヌクレオチドの分布パターンは、ＤＡＰＩまたは／及び細胞型選択抗体でも染色した４μｍ組織切片で調べた。平行セクションは、詳細な組織学マッピングが可能になる標準組織学マーカーによって染色することができた。ｈｓｉＲＮＡは、既に著しく疎水修飾されているため、色素を添加しても、全体的な疎水性にほとんど影響を与えることはなく、したがって、オリゴヌクレオチド分布への影響は最小である。このアッセイでは、組織及び細胞型分布の迅速な評価が可能になり、直接的なガイド鎖検出のためのＰＮＡベースの定量アッセイによって補完した。
組織溶解物中の定量的なガイド鎖検出のためのＰＮＡハイブリダイゼーション
組織中の完全なガイド鎖の直接的な定量が可能になるように、新規アッセイを開発し、実施し、これにより、ガイド鎖を完全相補的なＣｙ３標識ＰＮＡ（ペプチド核酸）オリゴヌクレオチドにハイブリダイズさせ、ＨＰＬＣによって、対応する二本鎖を、過剰な一本鎖ＰＮＡから分離した。ＰＮＡは、非荷電であり、ガイド鎖に対して、非常に強固な結合を有するため、ｈｓｉＲＮＡセンス鎖及びあらゆる内因性標的配列の両方との競合に勝つ。Ｃｙ３－ＰＮＡ：ガイドハイブリッドの蛍光検出では、組織溶解物中のガイド鎖の存在量を直接的に測定する。ＨＰＬＣ自動インジェクターと組み合わせることで、このアッセイでは、数百サンプル中でのガイド鎖の定量を一晩で行うことが可能になった。このアッセイも感度が高く、検出限界は、１０ｆｍｏｌ／グラム未満であり、全長の、部分的に分解された、５’－リン酸化及び５’－脱リン酸化されたガイド鎖を含むハイブリッドはすべて、ＨＰＬＣ追跡において別のピークまたは肩として定量化することができる。このアッセイは、標識された化合物及び非標識化合物を両方とも検出できるため、臨床サンプル分析のために、その後のＣＲＯに直接移行することができる。
細胞及び組織中でのＦｌｔ１ ｍＲＮＡバリアントを直接検出するためのＱｕａｎｔｉＧｅｎｅ（登録商標）（Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ）アッセイ
ＱｕａｎｔｉＧｅｎｅ（登録商標）は、高感度９６ウェルベースのアッセイであり、このアッセイでは、組織及び／または細胞溶解物から直接、シグナル増幅によってｍＲＮＡが直接検出される。この直接検出アッセイを１９２ウェルの自動ＴｉｓｓｕｅＬｙｓｅｒに連結することにより、動物１匹当たり数十個のサンプルの処理が可能になるハイスループット型が開発された。このように、標的遺伝子及びハウスキーピング遺伝子の発現に関する定量的データが、多くの動物において一度に生成された。パイロット試験では、ｎ＝８は、８０％の信頼度でｓＦｌｔ１ ｍＲＮＡアイソフォーム発現の４０％の調節を検出するのに十分であった。ｂＤＮＡアッセイは、Ｃｏｌｅｓ ｅｔ ａｌ．Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄ Ｔｈｅｒ．（２０１５）Ｎｏｖ ２３．ＰＭＩＤ：２６５９５７２１に記載されている。
馴化培地及び血液におけるｓＦＬＴ１タンパク質の検出のためのＥＬＩＳＡ（＃ＭＶＲ１００，Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ）
この９６ウェルベースのアッセイでは、１サンプル当たり１０μＬの生物学的流体のみ必要であった。このアッセイは、ｉｎ ｖｉｔｒｏ及びｉｎ ｖｉｖｏの両方での研究のために、長年にわたって最適化されている。これは臨床的に適合性があり、動物を屠殺することなく、循環ｓＦＬＴ１タンパク質レベルの評価が可能になり、特に非ヒト霊長類試験に有用であろう。
正常マウス妊娠モデル
ｓＦｌｔ１－ｉ１３バリアントは、マウス妊娠中に発現し、ｉ１３レベルは、１４日目～１９日目から指数関数的に増加する。ｓＦＬＴ１－ｉ１３－２２８３化合物とｉ１３マウスバリアントとの完全な相同性により、この単純なげっ歯類モデルにおいて、有効性及び安全性を両方とも試験することが可能になる。
子癇前症モデル
以下でさらに説明するように、胎盤虚血の子宮灌流圧低下（ＲＵＰＰ）モデル及び子癇前症の低酸素モデルを使用する。
ヒヒ野生型妊娠モデル
ｓＦｌｔ１－ｉ１５ａバリアントは、妊娠中のげっ歯類では発現しないため、効力の読出しとしての非侵襲的アッセイであるＥＬＩＳＡを用いて、野生型妊娠中のヒヒにおける組み合わせの全体的な有効性及び安全性が評価されることになる。
実施例３．ｉｎ ｖｉｔｒｏ及び子癇前症のＲＵＰＰラットモデルにおけるｓＦｌｔ－１を標的とする最適化されたｓｉＲＮＡ
ｓＦｌｔ－１を標的とする最適化されたｓｉＲＮＡを、ヒト細胞株を用いてｉｎ ｖｉｔｒｏ、及び子癇前症のＲＵＰＰラットモデルで試験した。この実施例では、以下のｓｉＲＮＡを使用した：
図９、図１０Ａ～図１０Ｂ、及び図１１Ａ～図１１Ｂは、ｓｉＲＮＡを標的とする最適化されたｓＦｌｔ－１（ｓＦＬＴ－２２８３及びｓＦＬＴ－２５１９）を示す。
最適化されたｓｉＲＮＡをヒトＷＭ－１１５細胞株で試験し、標的をサイレンシングするｓｉＲＮＡ－２２８３及びｓｉＲＮＡ－２５１９の能力を分析した。ｓｉＲＮＡ－２２８３（標的ｓＦＬＴ１－ｉ１３）及びｓｉＲＮＡ－２５１９（標的ｓＦＬＴ１－ｅ１５ａ）を単独または１：１比で組み合わせて試験した。図７に示すとおり、各ｓｉＲＮＡ単独では、標的のｓＦＬＴ１ ｍＲＮＡアイソフォームをサイレンシングして、総ｓＦＬＴ１タンパク質レベルを低下させることができるのに対して、組み合わせでは、個々のアイソフォームのさらなるサイレンシング及び総タンパク質の減少が示された。
同じｓｉＲＮＡを、ＲＵＰＰ（妊娠ラットにおける子宮胎盤灌流減少モデル）子癇前症ラットモデルにおいて、組み合わせて試験した。ＲＵＰＰ処置は、胎盤虚血を誘導し、子癇前症の十分に特徴付けられたモデルである。ＲＵＰＰラットは、母体平均動脈血圧（ＭＡＰ）の上昇及びｓＦＬＴ１値の上昇を伴う糸球体濾過量（ＧＦＲ）の低下などの子癇前症の特徴的な症状を示す。
ＲＵＰＰモデルにおいて、ｓＦｌｔ１を標的とする最適化されたｓｉＲＮＡを評価するために、在胎１３日目及び１４日目に、１０ｍｇ／ｋｇ体重の組み合わせｓｉＲＮＡ療法（ｓＦＬＴ１ ｓｉＲＮＡ：（ｓｉＲＮＡ－２２８３（ｓＦＬＴ１－ｉ１３標的）とｓｉＲＮＡ－２５１９（ｓＦＬＴ１－ｅ１５ａ標的）との１：１混合物）またはＰＢＳ対照をラットに皮下注射した（図８Ａを参照）。
ＲＵＰＰモデルを生成するために、在胎１４日目にＳｐｒａｇｕｅ Ｄａｗｌｅｙ妊娠ラットの子宮内の腹部大動脈及び卵巣動脈の周囲に銀クリップを外科的に配置した。Ｓｈａｍ手術（腹部切開及びクリップを配置せずに縫合）を対照として使用した。
在胎１９日目に血液及び組織を採取し、妊娠バイオメトリクスを分析した。在胎１９日目に意識のあるラットにおいて血圧を測定し、次いで動物をイソフルランで血液に麻酔してｓＦＬＴ－１を測定し、組織学的分析のために組織を採取した。
以下のアッセイを実施した：
・母体の血圧測定：在胎１８日目。１９日目に意識下において動脈血圧及び心拍数を測定するために頸カテーテルを移植した。
・胎児体重及び胎盤重量：在胎１９日目に、屠殺の時点で、胎児重量及び胎盤重量を測定した。ラット１匹当たりの胎児及び胎盤の総重量及び平均重量を計算した。
・胎児の吸収：母体により吸収された胎児の数を視覚的に決定する。
図８Ｂに示すとおり、組み合わせ療法のＲＵＰＰ群では母体血圧が低下し、血圧を対照レベルにした（Ｓｈａｍ）。さらに、組み合わせ療法により処置したＲＵＰＰ群において、胎盤重量を保持した（図８Ｂ）。胎児吸収率及び胎児体重（図８Ｃに示す）により測定した場合、胎児の悪影響はなく、胎児発育の改善に向けた傾向があった。
均等物
本開示は、その精神または本質的特徴から逸脱することなく、他の特定の形態で具現化され得る。したがって、前述の実施形態は、本開示を限定するものではなく、あらゆる点において例示的であると見なされるべきである。したがって、本開示の範囲は、前述の説明によってではなく添付の特許請求の範囲によって示され、特許請求の範囲の意味及び均等の範囲内に入るすべての変更は、本明細書に含まれることが意図される。

Claims (81)

  1. アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖が５’末端及び３’末端を有する二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子であって、
    ここで、（１）前記アンチセンス鎖が、５’ＣＴＣＴＣＧＧＡＴＣＴＣＣＡＡＡＴＴＴＡ３’（配列番号１）または５’ＣＡＴＣＡＴＡＧＣＴＡＣＣＡＴＴＴＡＴＴ３’（配列番号２）の核酸配列に実質的に相補的な配列を含み；
    （２）前記アンチセンス鎖が、少なくとも２０ヌクレオチド長であり；
    （３）前記アンチセンス鎖が、少なくとも５０％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；
    （４）前記アンチセンス鎖の前記５’末端から２位、４位、５位、６位、８位、１０位、１２位、１４位、１６位、及び２０位のいずれか１つ以上の前記ヌクレオチドが、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく；
    （５）前記アンチセンス鎖の前記３’末端から１～２位から１～８位の前記ヌクレオチドが、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されており；
    （６）前記アンチセンス鎖の一部が、前記センス鎖の一部に相補的であり；
    （７）前記センス鎖が、少なくとも１５のヌクレオチド長であり；
    （８）前記センス鎖が、少なくとも６５％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；
    （９）前記センス鎖の前記５’末端から、４位、６位、８位、１０位、及び１４位のいずれか１つ以上の前記ヌクレオチドが、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく；
    （１０）前記センス鎖の前記５’末端から１～２位の前記ヌクレオチドが、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されている、前記ｄｓＲＮＡ分子。
  2. アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖が５’末端及び３’末端を有する二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）であって、
    ここで、（１）前記アンチセンス鎖が、５’ＣＴＣＴＣＧＧＡＴＣＴＣＣＡＡＡＴＴＴＡ３’（配列番号１）または５’ＣＡＴＣＡＴＡＧＣＴＡＣＣＡＴＴＴＡＴＴ３’（配列番号２）の核酸配列に実質的に相補的な配列を含み；
    （２）前記アンチセンス鎖が、２’－メトキシ－リボヌクレオチド及び２’－フルオロ－リボヌクレオチドを交互に含み；
    （３）前記アンチセンス鎖の前記５’末端から２位及び１４位の前記ヌクレオチドが、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく；
    （４）前記アンチセンス鎖の前記３’末端から１～２位から１～７位の前記ヌクレオチドが、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されており；
    （５）前記アンチセンス鎖の一部が、前記センス鎖の一部に相補的であり；
    （６）前記センス鎖が、２’－メトキシ－リボヌクレオチド及び２’－フルオロ－リボヌクレオチドを交互に含み；
    （７）前記センス鎖の前記５’末端から１～２位の前記ヌクレオチドが、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合している、前記ｄｓＲＮＡ。
  3. アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖が５’末端及び３’末端を有する二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子であって、
    ここで、（１）前記アンチセンス鎖が、５’ＣＴＣＴＣＧＧＡＴＣＴＣＣＡＡＡＴＴＴＡ３’（配列番号１）または５’ＣＡＴＣＡＴＡＧＣＴＡＣＣＡＴＴＴＡＴＴ３’（配列番号２）の核酸配列に実質的に相補的な配列を含み；
    （２）前記アンチセンス鎖が、少なくとも２０ヌクレオチド長であり；
    （３）前記アンチセンス鎖が、少なくとも５０％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；
    （４）前記アンチセンス鎖の前記５’末端から２位、４位、５位、６位、８位、１０位、１２位、１４位、１６位、及び１８位のいずれか１つ以上の前記ヌクレオチドが、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく；
    （５）前記アンチセンス鎖の前記３’末端から１～２位から１～８位の前記ヌクレオチドが、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されており；
    （６）前記アンチセンス鎖の一部が、前記センス鎖の一部に相補的であり；
    （７）前記センス鎖が、少なくとも１５のヌクレオチド長であり；
    （８）前記センス鎖が、少なくとも８０％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；
    （９）前記センス鎖の前記５’末端から、７位、９位、及び１１位のいずれか１つ以上の前記ヌクレオチドが、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく；
    （１０）前記センス鎖の前記５’末端から１～２位の前記ヌクレオチドが、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されている、前記ｄｓＲＮＡ分子。
  4. アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖が５’末端及び３’末端を有する二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子であって、
    ここで、（１）前記アンチセンス鎖が、５’ＣＴＣＴＣＧＧＡＴＣＴＣＣＡＡＡＴＴＴＡ３’（配列番号１）または５’ＣＡＴＣＡＴＡＧＣＴＡＣＣＡＴＴＴＡＴＴ３’（配列番号２）の核酸配列に実質的に相補的な配列を含み；
    （２）前記アンチセンス鎖が、少なくとも２０ヌクレオチド長であり；
    （３）前記アンチセンス鎖が、少なくとも７０％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；
    （４）前記アンチセンス鎖の前記５’末端から２位、４位、５位、６位、８位、及び１４位のいずれか１つ以上の前記ヌクレオチドが、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく；
    （５）前記アンチセンス鎖の前記３’末端から１～２位から１～８位の前記ヌクレオチドが、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されており；
    （６）前記アンチセンス鎖の一部が、前記センス鎖の一部に相補的であり；
    （７）前記センス鎖が、少なくとも１５のヌクレオチド長であり；
    （８）前記センス鎖が、１００％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；
    （９）前記センス鎖の前記５’末端から１～２位の前記ヌクレオチドが、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されている、前記ｄｓＲＮＡ分子。
  5. アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖が５’末端及び３’末端を有する二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子であって、
    ここで、（１）前記アンチセンス鎖が、５’ＣＴＣＴＣＧＧＡＴＣＴＣＣＡＡＡＴＴＴＡ３’（配列番号１）または５’ＣＡＴＣＡＴＡＧＣＴＡＣＣＡＴＴＴＡＴＴ３’（配列番号２）の核酸配列に実質的に相補的な配列を含み；
    （２）前記アンチセンス鎖が、少なくとも２０ヌクレオチド長であり；
    （３）前記アンチセンス鎖が、少なくとも７５％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；
    （４）前記アンチセンス鎖の前記５’末端から２位、４位、５位、６位、及び１４位のいずれか１つ以上の前記ヌクレオチドが、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく；
    （５）前記アンチセンス鎖の前記３’末端から１～２位から１～８位の前記ヌクレオチドが、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されており；
    （６）前記アンチセンス鎖の一部が、前記センス鎖の一部に相補的であり；
    （７）前記センス鎖が、少なくとも１５のヌクレオチド長であり；
    （８）前記センス鎖が、１００％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；
    （９）前記センス鎖の前記５’末端から１～２位の前記ヌクレオチドが、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されている、前記ｄｓＲＮＡ分子。
  6. アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖が５’末端及び３’末端を有する二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子であって、
    ここで、（１）前記アンチセンス鎖が、５’ＣＴＣＴＣＧＧＡＴＣＴＣＣＡＡＡＴＴＴＡ３’（配列番号１）または５’ＣＡＴＣＡＴＡＧＣＴＡＣＣＡＴＴＴＡＴＴ３’（配列番号２）の核酸配列に実質的に相補的な配列を含み；
    （２）前記アンチセンス鎖が、少なくとも２０ヌクレオチド長であり；
    （３）前記アンチセンス鎖が、少なくとも８５％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；
    （４）前記アンチセンス鎖の前記５’末端から２位及び１４位のいずれか１つ以上の前記ヌクレオチドが、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく；
    （５）前記アンチセンス鎖の前記３’末端から１～２位から１～８位の前記ヌクレオチドが、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されており；
    （６）前記アンチセンス鎖の一部が、前記センス鎖の一部に相補的であり；
    （７）前記センス鎖が、少なくとも１５のヌクレオチド長であり；
    （８）前記センス鎖が、１００％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；
    （９）前記センス鎖の前記５’末端から１～２位の前記ヌクレオチドが、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されている、前記ｄｓＲＮＡ分子。
  7. 前記アンチセンス鎖が、２０ヌクレオチド長である、請求項１～６のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡ。
  8. 前記アンチセンス鎖が、２１ヌクレオチド長である、請求項１～６のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡ。
  9. 前記アンチセンス鎖が、２２ヌクレオチド長である、請求項１～６のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡ。
  10. 前記センス鎖が、１５ヌクレオチド長である、請求項１～６のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡ。
  11. 前記センス鎖が、１６ヌクレオチド長である、請求項１～６のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡ。
  12. 前記センス鎖が、１８ヌクレオチド長である、請求項１～６のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡ。
  13. 前記センス鎖が、２０ヌクレオチド長である、請求項１～６のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡ。
  14. １５塩基対～２０塩基対の二本鎖領域を含む、請求項１～６のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡ。
  15. １５塩基対の二本鎖領域を含む、請求項１～６のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡ。
  16. １６塩基対の二本鎖領域を含む、請求項１～６のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡ。
  17. １８塩基対の二本鎖領域を含む、請求項１～６のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡ。
  18. ２０塩基対の二本鎖領域を含む、請求項１～６のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡ。
  19. 前記ｄｓＲＮＡが、平滑末端を含む、請求項１～１８のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡ。
  20. 前記ｄｓＲＮＡが、少なくとも１つの一本鎖ヌクレオチドオーバーハングを含む、請求項１～１９のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡ。
  21. 前記ｄｓＲＮＡが、約２ヌクレオチド～５ヌクレオチドの一本鎖ヌクレオチドオーバーハングを含む、請求項２０に記載のｄｓＲＮＡ。
  22. ４～１６のホスホロチオエートヌクレオチド間連結を含む、請求項１～２１のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡ。
  23. ８～１３のホスホロチオエートヌクレオチド間連結を含む、請求項１～２１のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡ。
  24. 前記センス鎖が、前記アンチセンス鎖と前記センス鎖との間に１つ以上のヌクレオチドミスマッチを含む、請求項１～２３のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡ。
  25. 前記アンチセンス鎖が、５’ホスフェート、５’－アルキルホスホネート、５’アルキレンホスホネート、または５’アルケニルホスホネートを含む、請求項１～２４のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡ。
  26. 前記アンチセンス鎖が、５’ビニルホスホネートを含む、請求項２５に記載のｄｓＲＮＡ。
  27. 機能部分が、前記センス鎖の前記３’末端に連結されている、請求項１～２６のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡ。
  28. 前記機能部分が、疎水性部分を含む、請求項２７に記載のｄｓＲＮＡ。
  29. 前記疎水性部分が、脂肪酸、ステロイド、セコステロイド、脂質、ガングリオシド、ヌクレオシド類似体、エンドカンナビノイド、ビタミン、及びそれらの混合物からなる群から選択される、請求項２８に記載のｄｓＲＮＡ。
  30. 前記ステロイドが、コレステロール及びリトコール酸（ＬＣＡ）からなる群から選択される、請求項２９に記載のｄｓＲＮＡ。
  31. 前記脂肪酸が、エイコサペンタエン酸（ＥＰＡ）、ドコサヘキサエン酸（ＤＨＡ）、及びドコサン酸（ＤＣＡ）からなる群から選択される、請求項２９に記載のｄｓＲＮＡ。
  32. 前記ビタミンが、コリン、ビタミンＡ、ビタミンＥ、及びそれらの誘導体、またはそれらの代謝物からなる群から選択される、請求項２９に記載のｄｓＲＮＡ。
  33. 前記機能部分が、リンカーにより前記センス鎖に連結されている、請求項２７～３２のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡ。
  34. 前記リンカーが、切断可能なリンカーである、請求項３３に記載のｄｓＲＮＡ。
  35. 前記切断可能なリンカーが、ホスホジエステル連結、ジスルフィド連結、酸に不安定な連結、または光切断可能な連結を含む、請求項３４に記載のｄｓＲＮＡ。
  36. 前記切断可能なリンカーが、ホスホジエステルヌクレオチド間連結を有するｄＴｄＴジヌクレオチドを含む、請求項３４または３５に記載のｄｓＲＮＡ。
  37. 前記酸に不安定な連結が、β－チオプロピオネート連結またはカルボキシジメチルマレイン酸無水物（ＣＤＭ）連結を含む、請求項３５に記載のｄｓＲＮＡ。
  38. 前記リンカーが、二価または三価のリンカーを含む、請求項３３～３７のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡ。
  39. 前記二価または三価のリンカーが、
    Figure 2024523509000021
     （式中、ｎは、１、２、３、４、または５である）からなる群から選択される、請求項３８に記載のｄｓＲＮＡ。
  40. 前記リンカーが、エチレングリコール鎖、アルキル鎖、ペプチド、ＲＮＡ、ＤＮＡ、ホスホジエステル、ホスホロチオエート、ホスホルアミデート、アミド、カルバメート、またはそれらの組み合わせを含む、請求項３３～３９のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡ。
  41. 前記リンカーが、三価リンカーである場合、前記リンカーは、ホスホジエステルまたはホスホジエステル誘導体をさらに連結する、請求項３８～４０のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡ。
  42. 前記ホスホジエステルまたはホスホジエステル誘導体が、以下からなる群から選択される、請求項４１に記載のｄｓＲＮＡ：





    Figure 2024523509000022
     （式中、Ｘは、Ｏ、ＳまたはＢＨ３である）。
  43. センス鎖の前記３’末端から１位及び２位の前記ヌクレオチド、及びアンチセンス鎖の前記５’末端から１位及び２位の前記ヌクレオチドが、ホスホロチオエート連結を介して隣接するリボヌクレオチドに結合される、請求項１～４２のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡ。
  44. 前記相補性の領域が、配列番号１または配列番号２の少なくとも１５、１６、１７または１８の連続したヌクレオチドに相補的である、請求項１～４３のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡ。
  45. 前記相補性の領域が、配列番号１または配列番号２と３つを超えるミスマッチは
    含まない、請求項１～４３のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡ。
  46. 前記相補性の領域が、配列番号１または配列番号２に対して完全に相補的である、請求項１～４３のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡ。
  47. 前記アンチセンス鎖が、５’ＵＡＡＡＵＵＵＧＧＡＧＡＵＣＣＧＡＧＡＧＡ３’の核酸配列を含み、前記センス鎖が、５’ＣＧＧＡＵＣＵＣＣＡＡＡＵＵＵＡ３’の核酸配列を含む、請求項１～４６のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡ。
  48. 前記アンチセンス鎖が、５’ＵＡＵＡＡＡＵＧＧＵＡＧＣＵＡＵＧＡＵＧＡ３’の核酸配列を含み、前記センス鎖が、５’ＡＵＡＧＣＵＡＣＣＡＵＵＵＡＵＡ３’の核酸配列を含む、請求項１～４６のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡ。
  49. 細胞または生物におけるｓＦＬＴ１タンパク質の発現が、少なくとも約２０％低下する、請求項１～４６のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡ。
  50. ＰＥ、分娩後ＰＥ、子癇またはＨＥＬＬＰ症候群を治療または管理する方法であって、このような治療または管理を必要とする対象に、治療有効量の請求項１～４８のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡを投与することを含む、前記方法。
  51. 前記医薬組成物が、静脈内または皮下投与される、請求項５０に記載の方法。
  52. ｓＦＬＴ１タンパク質の発現を、前記対象において少なくとも約２０％減少させる、請求項５０に記載の方法。
  53. ＰＥ、分娩後ＰＥ、子癇またはＨＥＬＬＰ症候群のうちの１つ以上の症状の治療を必要とする対象において、それを行う方法であって、請求項１～４８のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡを前記対象に投与することを含む、前記方法。
  54. 血管新生障害の１つ以上の症状の治療を必要とする対象において、それを行う方法であって、請求項１～４８のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡを前記対象に投与することを含む、前記方法。
  55. 前記血管新生障害が、ＰＥ、分娩後ＰＥ、子癇及びＨＥＬＬＰ症候群からなる群から選択される、請求項５４に記載の方法。
  56. 第１のｄｓＲＮＡと、第２のｄｓＲＮＡと、薬学的に許容される担体と、を含む医薬組成物であって：
    前記第１のｄｓＲＮＡが、第１のセンス鎖及び第１のアンチセンス鎖を含み、前記第１のアンチセンス鎖が、配列番号１に実質的に相補的である相補性領域を含み、前記第１のｄｓＲＮＡが、請求項１～４６のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡを含み；
    前記第２のｄｓＲＮＡが、第２のセンス鎖及び第２のアンチセンス鎖を含み、前記第２のアンチセンス鎖が、配列番号２に実質的に相補的である相補性領域を含み、前記第２のｄｓＲＮＡが、請求項１～４６のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡを含む；
    前記医薬組成物。
  57. 第１のｄｓＲＮＡと、第２のｄｓＲＮＡと、薬学的に許容される担体と、を含む医薬組成物であって：
    前記第１のｄｓＲＮＡが、第１のセンス鎖及び第１のアンチセンス鎖を含み、各鎖は、５’末端及び３’末端を有し、前記第１のアンチセンス鎖が、配列番号１と実質的に相補的である相補性領域を含み；
    前記第２のｄｓＲＮＡが、第２のセンス鎖及び第２のアンチセンス鎖を含み、各鎖が５’末端及び３’末端を有し、前記第２のアンチセンス鎖が、配列番号２と実質的に相補的である相補性領域を含み；
    前記第１のｄｓＲＮＡ及び前記第２のｄｓＲＮＡのそれぞれについて、
    （１）前記アンチセンス鎖が、少なくとも２０ヌクレオチド長であり；
    （３）前記アンチセンス鎖が、少なくとも５０％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；
    （４）前記アンチセンス鎖の前記５’末端から２位、４位、５位、６位、８位、１０位、１２位、１４位、１６位、及び２０位のいずれか１つ以上の前記ヌクレオチドが、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく；
    （５）前記アンチセンス鎖の前記３’末端から１～２位から１～８位の前記ヌクレオチドが、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されており；
    （６）前記アンチセンス鎖の一部が、前記センス鎖の一部に相補的であり；
    （７）前記センス鎖が、少なくとも１５のヌクレオチド長であり；
    （８）前記センス鎖が、少なくとも６５％の２’－Ｏ－メチル修飾を含み；
    （９）前記センス鎖の前記５’末端から、４位、６位、８位、１０位、及び１４位のいずれか１つ以上の前記ヌクレオチドが、２’－メトキシ－リボヌクレオチドではなく；
    （１０）前記センス鎖の前記５’末端から１～２位の前記ヌクレオチドが、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を介して互いに結合されている、前記医薬組成物。
  58. アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖が５’末端及び３’末端を有する二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子であって、
    （１）前記アンチセンス鎖が、（ｍＵ）＃（ｆＡ）＃（ｍＡ）（ｆＡ）（ｆＵ）（ｆＵ）（ｍＵ）（ｆＧ）（ｍＧ）（ｆＡ）（ｍＧ）（ｆＡ）（ｍＵ）（ｆＣ）＃（ｍＣ）＃（ｆＧ）＃（ｍＡ）＃（ｍＧ）＃（ｍＡ）＃（ｆＧ）＃（ｍＡ）を含み；
    （２）前記センス鎖が、（ｍＣ）＃（ｍＧ）＃（ｍＧ）（ｆＡ）（ｍＵ）（ｆＣ）（ｍＵ）（ｆＣ）（ｍＣ）（ｆＡ）（ｍＡ）（ｍＡ）（ｍＵ）（ｆＵ）＃（ｍＵ）＃（ｍＡ）を含み、
    ここで、「ｍ」は、２’－Ｏ－メチル修飾に対応し、「ｆ」は、２’－フルオロ修飾に対応し、「＃」は、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結に対応する、前記ｄｓＲＮＡ分子。
  59. アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖が５’末端及び３’末端を有する二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子であって、
    （１）前記アンチセンス鎖が、（ｍＵ）＃（ｆＡ）＃（ｍＵ）（ｆＡ）（ｆＡ）（ｆＡ）（ｍＵ）（ｆＧ）（ｍＧ）（ｆＵ）（ｍＡ）（ｆＧ）（ｍＣ）（ｆＵ）＃（ｍＡ）＃（ｆＵ）＃（ｍＧ）＃（ｍＡ）＃（ｍＵ）＃（ｆＧ）＃（ｍＡ）を含み；
    （２）前記センス鎖が、（ｍＡ）＃（ｍＵ）＃（ｍＡ）（ｆＧ）（ｍＣ）（ｆＵ）（ｍＡ）（ｆＣ）（ｍＣ）（ｆＡ）（ｍＵ）（ｍＵ）（ｍＵ）（ｆＡ）＃（ｍＵ）＃（ｍＡ）を含み、
    ここで、「ｍ」は、２’－Ｏ－メチル修飾に対応し、「ｆ」は、２’－フルオロ修飾に対応し、「＃」は、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結に対応する、前記ｄｓＲＮＡ分子。
  60. 前記アンチセンス鎖が、５’ビニルホスホネートを含む、請求項５８または５９に記載のｄｓＲＮＡ。
  61. 前記センス鎖の前記３’末端に連結されたドコサン酸（ＤＣＡ）コンジュゲートを含む、請求項５８～６０のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡ。
  62. 前記ＤＣＡが、リンカーにより前記センス鎖に連結されている、請求項６１に記載のｄｓＲＮＡ。
  63. 前記リンカーが、切断可能なリンカーである、請求項６２に記載のｄｓＲＮＡ。
  64. 前記切断可能なリンカーが、ホスホジエステル連結、ジスルフィド連結、酸に不安定な連結、または光切断可能な連結を含む、請求項６３に記載のｄｓＲＮＡ。
  65. 前記切断可能なリンカーが、ホスホジエステルヌクレオチド間連結を有するｄＴｄＴジヌクレオチドを含む、請求項６３または６４に記載のｄｓＲＮＡ。
  66. 前記リンカーが、二価または三価のリンカーを含む、請求項６２～６５のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡ。
  67. 前記二価または三価のリンカーが、
    Figure 2024523509000023
     （式中、ｎは、１、２、３、４、または５である）からなる群から選択される、請求項６６に記載のｄｓＲＮＡ。
  68. 前記リンカーが、三価リンカーである場合、前記リンカーは、ホスホジエステルまたはホスホジエステル誘導体をさらに連結する、請求項６２～６７のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡ。
  69. 前記ホスホジエステルまたはホスホジエステル誘導体が、以下からなる群から選択される、請求項６８に記載のｄｓＲＮＡ：
    Figure 2024523509000024
     （式中、Ｘは、Ｏ、ＳまたはＢＨ３である）。
  70. アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖が５’末端及び３’末端を有する二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子であって、
    （１）前記アンチセンス鎖が、Ｖ（ｍＵ）＃（ｆＡ）＃（ｍＡ）（ｆＡ）（ｆＵ）（ｆＵ）（ｍＵ）（ｆＧ）（ｍＧ）（ｆＡ）（ｍＧ）（ｆＡ）（ｍＵ）（ｆＣ）＃（ｍＣ）＃（ｆＧ）＃（ｍＡ）＃（ｍＧ）＃（ｍＡ）＃（ｆＧ）＃（ｍＡ）を含み；
    （２）前記センス鎖が、（ｍＣ）＃（ｍＧ）＃（ｍＧ）（ｆＡ）（ｍＵ）（ｆＣ）（ｍＵ）（ｆＣ）（ｍＣ）（ｆＡ）（ｍＡ）（ｍＡ）（ｍＵ）（ｆＵ）＃（ｍＵ）＃（ｍＡ）（Ｔ）（Ｔ）－ＰＣＤＣＡを含み、
    ここで、「ｍ」は、２’－Ｏ－メチル修飾に対応し、「ｆ」は、２’－フルオロ修飾に対応し、「Ｔ」は、チミジンＤＮＡヌクレオチドに対応し、「＃」は、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結に対応し、「Ｖ」は、５’－ビニルホスホネートに対応し、「ＰＣＤＣＡ」は、リン酸リンカーを介した３’－Ｃ７－ホスホコリン－ドコサン酸コンジュゲートに対応する、前記ｄｓＲＮＡ分子。
  71. アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖が５’末端及び３’末端を有する二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子であって、
    （１）前記アンチセンス鎖が、Ｖ（ｍＵ）＃（ｆＡ）＃（ｍＵ）（ｆＡ）（ｆＡ）（ｆＡ）（ｍＵ）（ｆＧ）（ｍＧ）（ｆＵ）（ｍＡ）（ｆＧ）（ｍＣ）（ｆＵ）＃（ｍＡ）＃（ｆＵ）＃（ｍＧ）＃（ｍＡ）＃（ｍＵ）＃（ｆＧ）＃（ｍＡ）を含み；
    （２）前記センス鎖が、（ｍＡ）＃（ｍＵ）＃（ｍＡ）（ｆＧ）（ｍＣ）（ｆＵ）（ｍＡ）（ｆＣ）（ｍＣ）（ｆＡ）（ｍＵ）（ｍＵ）（ｍＵ）（ｆＡ）＃（ｍＵ）＃（ｍＡ）（Ｔ）（Ｔ）－ＰＣＤＣＡを含み、
    ここで、「ｍ」は、２’－Ｏ－メチル修飾に対応し、「ｆ」は、２’－フルオロ修飾に対応し、「Ｔ」は、チミジンＤＮＡヌクレオチドに対応し、「＃」は、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結に対応し、「Ｖ」は、５’－ビニルホスホネートに対応し、「ＰＣＤＣＡ」は、リン酸リンカーを介した３’－Ｃ７－ホスホコリン－ドコサン酸コンジュゲートに対応する、前記ｄｓＲＮＡ分子。
  72. アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖が５’末端及び３’末端を有する二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子であって、
    （１）前記アンチセンス鎖が、式Ｉまたはその塩を含み：
    Figure 2024523509000025
     （２）前記センス鎖が、式ＩＩまたはその塩：
    Figure 2024523509000026
     を含む、前記ｄｓＲＮＡ分子。
  73. アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖が５’末端及び３’末端を有する二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子であって、
    （１）前記アンチセンス鎖が、式ＩＩＩまたはその塩を含み：
    Figure 2024523509000027
     （２）前記センス鎖が、式ＩＶまたはその塩：
    Figure 2024523509000028
     を含む、前記ｄｓＲＮＡ分子。
  74. 前記塩が、ナトリウム塩またはカリウム塩を含む、請求項７２または７３に記載のｄｓＲＮＡ。
  75. ＰＥ、分娩後ＰＥ、子癇またはＨＥＬＬＰ症候群を治療または管理する方法であって、このような治療または管理を必要とする対象に、治療有効量の請求項５８～７４のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡを投与することを含む、前記方法。
  76. 血管新生障害の１つ以上の症状の治療を必要とする対象において、それを行う方法であって、請求項５８～７４のいずれか１項に記載のｄｓＲＮＡを前記対象に投与することを含む、前記方法。
  77. 第１のｄｓＲＮＡと、第２のｄｓＲＮＡと、を含む医薬組成物であって：
    前記第１のｄｓＲＮＡが、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖が５’末端及び３’末端を有し、
    （１）前記アンチセンス鎖が、Ｖ（ｍＵ）＃（ｆＡ）＃（ｍＡ）（ｆＡ）（ｆＵ）（ｆＵ）（ｍＵ）（ｆＧ）（ｍＧ）（ｆＡ）（ｍＧ）（ｆＡ）（ｍＵ）（ｆＣ）＃（ｍＣ）＃（ｆＧ）＃（ｍＡ）＃（ｍＧ）＃（ｍＡ）＃（ｆＧ）＃（ｍＡ）を含み；
    （２）前記センス鎖が、（ｍＣ）＃（ｍＧ）＃（ｍＧ）（ｆＡ）（ｍＵ）（ｆＣ）（ｍＵ）（ｆＣ）（ｍＣ）（ｆＡ）（ｍＡ）（ｍＡ）（ｍＵ）（ｆＵ）＃（ｍＵ）＃（ｍＡ）（Ｔ）（Ｔ）－ＰＣＤＣＡを含み、
    前記第２のｄｓＲＮＡが、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖が５’末端及び３’末端を有し、
    （１）前記アンチセンス鎖が、Ｖ（ｍＵ）＃（ｆＡ）＃（ｍＵ）（ｆＡ）（ｆＡ）（ｆＡ）（ｍＵ）（ｆＧ）（ｍＧ）（ｆＵ）（ｍＡ）（ｆＧ）（ｍＣ）（ｆＵ）＃（ｍＡ）＃（ｆＵ）＃（ｍＧ）＃（ｍＡ）＃（ｍＵ）＃（ｆＧ）＃（ｍＡ）を含み；
    （２）前記センス鎖が、（ｍＡ）＃（ｍＵ）＃（ｍＡ）（ｆＧ）（ｍＣ）（ｆＵ）（ｍＡ）（ｆＣ）（ｍＣ）（ｆＡ）（ｍＵ）（ｍＵ）（ｍＵ）（ｆＡ）＃（ｍＵ）＃（ｍＡ）（Ｔ）（Ｔ）－ＰＣＤＣＡを含み、
    ここで、「ｍ」は、２’－Ｏ－メチル修飾に対応し、「ｆ」は、２’－フルオロ修飾に対応し、「Ｔ」は、チミジンＤＮＡヌクレオチドに対応し、「＃」は、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結に対応し、「Ｖ」は、５’－ビニルホスホネートに対応し、「ＰＣＤＣＡ」は、リン酸リンカーを介した３’－Ｃ７－ホスホコリン－ドコサン酸コンジュゲートに対応する、前記医薬組成物。
  78. 第１のｄｓＲＮＡと、第２のｄｓＲＮＡと、を含む医薬組成物であって：
    前記第１のｄｓＲＮＡが、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖が５’末端及び３’末端を有し、
    （１）前記アンチセンス鎖が、式Ｉまたはその塩を含み：
    Figure 2024523509000029
     （２）前記センス鎖が、式ＩＩまたはその塩を含み：
    Figure 2024523509000030
     前記第２のｄｓＲＮＡが、アンチセンス鎖及びセンス鎖を含み、各鎖が５’末端及び３’末端を有し、
    （１）前記アンチセンス鎖が、式ＩＩＩまたはその塩を含み：
    Figure 2024523509000031
     （２）前記センス鎖が、式ＩＶまたはその塩：
    Figure 2024523509000032
     を含む、前記医薬組成物。
  79. 前記塩が、ナトリウム塩またはカリウム塩を含む、請求項７８に記載の医薬組成物。
  80. ＰＥ、分娩後ＰＥ、子癇またはＨＥＬＬＰ症候群を治療または管理する方法であって、このような治療または管理を必要とする対象に、治療有効量の請求項７７または７８に記載の医薬組成物を投与することを含む、前記方法。
  81. 血管新生障害の１つ以上の症状の治療を必要とする対象において、それを行う方法であって、請求項７７または７８に記載の医薬組成物を前記対象に投与することを含む、前記方法。
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