JP4965447B2 - 細菌由来のインタクトなミニセルを介した哺乳動物細胞への機能性核酸の送達 - Google Patents
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Description
これらや他の必要性に対処するために、本発明は、一態様では、機能性核酸を送達する方法であって、以下のステップ:(a)機能性核酸分子または機能性核酸分子をコードするセグメントを含むプラスミドを含有するインタクトなミニセルを用意するステップと、続いて(b)前記ミニセルを標的哺乳動物細胞と接触させて、該哺乳動物細胞が該ミニセルを取り込むことができるようにするステップとを含む方法を提供する。ミニセルの取り込みに続いて、機能性核酸分子はその細胞質に放出され、核に輸送され、標的細胞によって発現される。前述のプラスミドは、機能性核酸分子をコードするセグメントに作動可能に連結された、プロモーター、ターミネーター、エンハンサー、またはシグナル配列などの調節エレメントを含んでもよい。プラスミドは、RNAポリメラーゼ(pol)IIまたはRNAIIIポリメラーゼプロモーターヒト7SK、H1、およびU6などのpol IIIに依存するプロモーターを含むことが特に有利である。さらに、プラスミドは、緑色蛍光タンパク質をコードする核酸セグメントなどのレポーターエレメントを含みうる。ミニセルと哺乳動物細胞との接触はin vitroまたはin vivoで生じうる。
phagocytosis-competent)またはエンドサイトーシス適格(endocytosis-competent)である標的哺乳動物細胞にミニセルを接触させる。標的細胞が貪食適格である場合、二重特異性リガンドの使用は任意的なものである。
図1:様々な治療がヒト大腸癌細胞株Caco−2の生存率に及ぼす影響を示す図である。x軸に治療を示し(ミニセルは「M」によって表す)、細胞生存率(%)を棒グラフによって示す。各棒グラフは、6回の独立した測定の平均値および平均値の標準偏差を示す。
本発明者らは、インタクトな細菌由来ミニセルは、siRNA分子、miRNA分子、リボザイム、またはアンチセンス核酸など、いかなる範囲の機能性核酸も安全かつ有効に標的哺乳動物細胞中に導入できることを発見している。特定の状況の癌およびHIV感染において、本発明者らは、インタクトなミニセルを介して機能性核酸を標的細胞中に導入することによって、標的細胞の薬剤耐性またはアポトーシス耐性を低減できることを見出した。
特に明記しない限り、本明細書中で使用する全ての技術用語および科学用語は、当業者によって一般に理解される意味と同じ意味を持つ。
一態様では、本発明は、標的細胞に機能性核酸を送達する方法であって、以下のステップ含む方法を提供する:(a)機能性核酸分子または機能性核酸分子をコードするセグメントを含むプラスミドを含有するインタクトなミニセルを用意するステップと、続いて(b)前記ミニセルを標的哺乳動物細胞と接触させて、該哺乳動物細胞が該ミニセルを取り込むことができるようにするステップ。ミニセルの取り込みに続いて、機能性核酸分子はその標的細胞の細胞質に放出され、または標的細胞によって発現される。WO2005/056749に記載されているように、ミニセルは、二重特異性リガンドを介して標的哺乳動物細胞と接触しうる。ミニセルと標的哺乳動物細胞との間の接触はin vitroでも、またはin vivoでもよい。
本発明のミニセルは、DNA分離を伴う細胞分裂の二分裂中に、配位障害によって生じる大腸菌または他の細菌細胞の無核形である。原核生物の染色体の複製は、細胞中央(mid-cell)隔壁形成を含む正常な二分裂に関連付けられる。大腸菌では、例えば、minCDなどのmin遺伝子が突然変異することによって、細胞分裂中の細胞極での隔壁形成の阻害が取り除かれ、正常な娘細胞および無核ミニセルを産生させることができる。de Boerら、1992;Raskinおよびde Boer、1999;HuおよびLutkenhaus、1999;Harry、2001を参照のこと。ミニセルは、ある状態で自然に発生し放出され、ミニセルとは対照的に、特定の遺伝的再構成またはエピソーム遺伝子の発現によらない他の小型小胞とは区別される。本発明を実施するためには、ミニセルはインタクトな細胞壁を有する(「インタクトなミニセル」)のが望ましい。
短鎖干渉RNA(siRNA)分子は、転写後遺伝子サイレンシングメカニズムであるRNA干渉(RNAi)の実施に有用である。一般的には、siRNAは、約10〜約30ヌクレオチド長の二本鎖RNA分子を指し、タンパク質の発現を特異的に干渉するその能力にちなんで名付けられた。好ましくは、siRNA分子は12〜28ヌクレオチド長であり、より好ましくは15〜25ヌクレオチド長であり、よりさらに好ましくは19〜23ヌクレオチド長であり、最も好ましくは21〜23ヌクレオチド長である。従って、siRNA分子は、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28または29ヌクレオチド長であることが好ましい。
リボザイムは、ヌクレオチド塩基配列に特異的な方式で、他のRNA分子を繰り返し切断できる酵素活性を持つRNA分子である。そのような酵素的RNA分子は、事実上いかなるRNA転写産物を標的にすることも可能で、in vitroでの効率的な切断が可能である。
本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、タンパク質をコードする核酸と特異的にハイブリダイズし、そのタンパク質の転写または翻訳を干渉する。一実施形態では、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、DNAを標的とし、その複製および/または転写を干渉する。別の実施形態では、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、pre−mRNAおよびmRNAをはじめとするRNAと特異的にハイブリダイズする。そのようなアンチセンスオリゴヌクレオチドは、例えば、タンパク質翻訳部位へのRNAの移動、RNAからのタンパク質の翻訳、一個または複数のmRNA種を得るためのRNAのスプライシング、およびRNAが関与し、またはRNAによって促進されうる触媒活性に作用しうる。そのような干渉の全体的効果は、標的タンパク質の発現を調節し、低減し、または阻害するものである。
本発明の好ましい実施形態では、ミニセルは、機能性核酸をコードする核酸を含む。例えば、プラスミドは、哺乳動物標的細胞の細胞内で発現する機能性核酸をコードしうる。これが、機能性核酸の内因性送達を可能にし、この送達は外来性送達の一過的な性質に勝る。
本発明のアプローチによって導入する核酸分子は、レポーターエレメントを含むことができる。レポーターエレメントは、組換え宿主に、通常、それ以外の場合には宿主が産生しないポリペプチドをコードすることによって容易に検出できる表現型または特徴を備えさせ、そのポリペプチドは、発現により、in vivoイメージング技術などによる組織学的解析またはin situ分析により検出できるものである。例えば、本発明によるインタクトなミニセルによって送達されるレポーターエレメントは、貪食性宿主細胞中で、in situ分析によって検出可能であり、転写活性化の定量指標または半定量指標である、比色変化または蛍光変化を発生するタンパク質をコードすることができる。これらのタンパク質の例は、エステラーゼ、ホスファターゼ、プロテアーゼおよび他の酵素であり、それらの活性が検出可能な発色団または蛍光団を生じさせる。
本発明のアプローチによって導入される核酸分子はまた、プロモーター、ターミネーター、エンハンサー、および/またはシグナル配列など、調節エレメントに作動的に連結した所望のコードセグメントも有する。適当なプロモーターは、組織特異的であるか、または治療状況に応じて腫瘍特異的なものでありうる。
本発明の機能性核酸は、薬剤耐性を促進するか、アポトーシスを阻害するか、または新生物の表現型を促進するタンパク質の遺伝子または転写産物を標的とする。こうした状況における機能性核酸の戦略の好首尾な適用は、当技術分野で既になされているが、ミニセルベクターの利点によるものではない。例えば、Sioud(2004)、Caplen(2003)、Wuら(2003)、Niethら(2003)、CaplenおよびMousses(2003)、Duxburyら(2004)、Yagueら(2004)、Duanら(2004)を参照のこと。
別の態様では、本発明は、被験体において、薬剤耐性を克服し、癌やAIDSなどの疾患を治療する方法を提供する。該方法は、(a)機能性核酸分子または機能性核酸分子をコードするセグメントを含むプラスミドを含有するインタクトなミニセルを用意するステップであって、前記機能性核酸分子が薬剤耐性を促進するタンパク質の遺伝子または転写産物を標的とするステップと、(b)前記ミニセルを標的哺乳動物細胞と接触させて、該哺乳動物細胞が該ミニセルを取り込むことができるようにするステップと、(c)該標的哺乳動物細胞に薬物を送達するステップとを含む。好ましくは、ステップ(a)および(b)の後にステップ(c)を実施して、薬物を投与する前に機能性核酸が薬物に対する耐性を減少できるようにする。薬物の送達および機能性核酸の導入は、任意の順序で連続的に、または同時に行うことができる。
薬物送達は、慣用の手段により行うことができるが、ミニセルを介した送達が好ましい。この点で、本発明者らは、異なる内容物を封入し、標的化したインタクトなミニセルにより、同一の哺乳動物細胞を首尾よく再トランスフェクトできることを発見した。例えば、siRNAをコードするプラスミドが封入されたミニセルを哺乳動物細胞にトランスフェクトし、その後、薬物を封入したミニセルが、薬物をその同じ哺乳動物細胞に送達することができる。この発見は驚くべきことであり、ミニセルの分解、内容物のエンドソーム放出、および細胞内標的への内容物の流出を伴う細胞内過程は、一回目のトランスフェクトおよび内容物送達後も、依然として十分に機能することを示している。
本発明で有用な薬物は、動物、特に、哺乳動物およびヒトで所望の局所的または全身的効果をもたらす、任意の生理学的にまたは薬理学的に活性な物質でありうる。薬物は、それだけには限らないが、ペプチド、タンパク質、核酸、および小分子をはじめとする無機または有機化合物であってよく、そのどれも特徴づけされているか、または特徴づけされていないことが可能である。薬物は、様々な形態、例えば、未変化分子、分子複合体、薬理学的に許容される塩、例えば、塩酸塩、臭化水素酸塩、硫酸塩、ラウリン酸塩、パルミチン酸塩、リン酸塩、亜硝酸塩、硝酸塩、ホウ酸塩、酢酸塩、マレイン酸塩、酒石酸塩、オレイン酸塩、サリチル酸塩などであってよい。酸性薬物には、金属塩、アミン、または有機カチオン、例えば、四級アンモニウムを使用することができる。塩基、エステル、およびアミドなどの薬物の誘導体を使用することもできる。非水溶性薬物は、その水溶性誘導体の形で、またはその塩基誘導体として使用することができ、その誘導体は、どちらの場合でも、またはその送達により、酵素により転換され、身体のpHにより、または他の代謝過程により、元の治療活性形態へ加水分解される。
本発明の一態様では、WO2005/056749に記載されているように、ミニセルは、二重特異性リガンドを介して標的哺乳動物細胞に到達する。ミニセルと哺乳動物細胞成分の両方に特異性を有する二重特異性リガンドは、ミニセルが哺乳動物細胞によって取り込まれ、哺乳動物細胞が機能性核酸分子を産生できるように、ミニセルと哺乳動物細胞を結合させる。この標的化した送達法は、in vivoもしくはin vitroで、またはin vivoとin vitroの両方で実施することができる。
さらに、本発明は、細菌由来ミニセルを貪食適格またはエンドサイトーシス適格である哺乳動物細胞と接触させることによって送達を準備する。細胞内細菌性病原体の方式で、親細菌細胞を取り込むことができる哺乳動物細胞は、同様にミニセルを取り込み、その内容物を哺乳動物細胞の細胞質中に放出する。この送達手法は、標的リガンドの使用なしに達成することができる。
本発明は、その範囲に組成物または製剤を含み、該組成物または製剤は、(a)インタクトなミニセル、および(b)その製薬上許容される担体を含み、該ミニセルは、機能性核酸分子または機能性核酸分子をコードするセグメントを含むプラスミドを含有する。機能性核酸は、本明細書に記載したsiRNA、shRNA、リボザイム、またはアンチセンス分子のいずれであってもよい。機能性核酸はまた、本明細書に記載したようなプラスミドなど、別の核酸によってコードされうる。機能性核酸をコードする核酸は、本明細書に記載したような調節エレメントまたはレポーターエレメントのいずれかを含みうる。
本発明の製剤は、様々な経路により、哺乳動物の身体の様々な部位に、所望の治療効果を実現するために局所にまたは全身に投与することができる。送達は、例えば、経口投与、体腔への製剤の塗布、吸入または通気、あるいは非経口、筋肉内、静脈内、門脈内、肝内、腹膜、皮下、腫瘍内、または皮内投与により行いうる。方式および投与部位は、標的細胞の位置に依存する。例えば、嚢胞性−線維性細胞は、標的化ミニセルの吸入送達によって有効に標的になりうる。同様に、腫瘍転移は、標的化ミニセルを静脈内送達することにより、より有効に治療しうる。原発性卵巣癌は、標的化ミニセルを腹腔内送達することにより治療しうる。
本発明のミニセルは、混入親細菌細胞を実質上含まない。すなわち、本発明のミニセル含有製剤は、107個ミニセル当たり約1個未満の混入親細菌細胞を含有するのが好ましく、108個ミニセル当たり約1個未満の混入親細菌細胞を含有するのがより好ましく、109個ミニセル当たり約1個未満の混入親細菌細胞を含有するのがさらにいっそう好ましく、1010個ミニセル当たり約1個未満の混入親細菌細胞を含有するのがよりさらに好ましく、1011個ミニセル当たり約1個未満の混入親細菌細胞を含有するのが最も好ましい。
一般に、本明細書に開示した製剤は、いかなる潜在的毒性も最小限に抑えながら、最適の生理学的効果を得るために、定型試験により求めた適当な投薬量で使用しうる。投与レジメンは、患者の年齢、体重、性別、健康状態、治療しようとする病状の重症度、投与経路、ならびに患者の腎機能および肝機能をはじめとする様々な要因に従って選択しうる。
shRNA配列(Mdr1またはbcl−2)をコードするプラスミドを保有する組換えミニセルを以下のように生成した。この研究で使用するMdrl shRNA配列は、Wuらが2003年に記載し(5’−TCGAAAGAAACCAACTGTCAGTGTA gagtactg TACACTGACAGTTGGTTTCTTTTTTT−3’)(配列番号1)、使用したbcl−2 shRNA配列は、Wacheckらが2003年に記載している(5’−TCGATGTGGATGACTGAGTACCTGA gagtactg TCAGGTACTCAGTCATCCACATTTTT−3’)(配列番号2)。それぞれのshRNA配列を合成し、プラスミドU6プロモーターから発現されるように、別個にプラスミドIMG−800(Imgenex Corp., San Diego, CA, USA)中にサブクローニングした。このプラスミドは、細菌細胞で高いプラスミド複製数を可能にすることができるpUC複製起点を保有する。shRNA配列が、U6プロモーターから発現させるため、適正でありかつインフレームであることを確めるために、組換えプラスミドを配列決定した。US 10/602,201に記載されているように、その組換えプラスミドをネズミチフス菌minCDE突然変異株に形質転換し、プラスミドを保有するミニセルを精製した。組換えミニセルを、それぞれ、ミニセルshRNA−MDR−1およびミニセルshRNA−bcl−2と名付けた。
複数の転写産物をコードする一定範囲の異なる薬剤耐性を対象とするsiRNAは、in vitroで癌細胞において薬剤耐性を逆転させることが示されており、重要なハードルは、siRNAを癌細胞中に特にin vivoで標的化して送達することである。特許出願WO2005/056749に記載されているように、抗MDR1 shRNAプラスミドを保有する組換えミニセル(ミニセルshRNA−MDR−1)およびnonsenseRNA配列に対する対照shRNA(ミニセルshRNA−nonsense)を精製し、抗ネズミチフス菌O抗原と抗ヒトEGFR特異性とを保有する二重特異性抗体を調製し、組換えミニセルに結合させた。これらの標的化組換えミニセルをEGFRミニセルshRNA−MDR−1およびEGFRミニセルshRNA−nonsenseと名付けた。化学療法剤5−FUおよびイリノテカンを封入したミニセルも調製し、上記のように標的化し、それぞれ、EGFRミニセル5−FUおよびEGFRミニセルIrinoと名付けた。
本実施例は、受容体標的化ミニセルを、癌細胞でin vivoにおいて薬剤耐性を逆転させるために使用できること実証する。
結腸直腸癌細胞は、別の主要な化学療法剤、5−フルオロウラシル(5−FU)に対して非常に耐性であることも知られており、本実施例は、本発明の方法がin vivoで薬剤耐性を逆転させるだけでなく、腫瘍の安定化/退縮を可能にすることを示す。
本発明者らは、ヒト乳腺癌細胞株であるMDA−MB−468はドキソルビシンに対して感受性が高く、EGFRミニセルDoxを静脈内処置したマウス異種移植は安定化/退縮することが示された。
本実施例は、薬剤耐性の逆転に対する投薬スケジュールの効果および治療効果を実証する。受容体を標的化し薬物を封入したミニセルを投与する前に、効率的にshRNAを腫瘍細胞に送達するための十分な時間を与えると結果は向上する。Caco−2細胞異種移植を行ったヌードマウスに、EGFRミニセルshRNA−MDR−1を静脈内投与する経時実験を実施した。別の群(n=一群当たりマウス11頭)では、EGFRミニセルshRNA−MDR−1処置後、96時間(G3)、120時間(G4)、または144時間(G5)目に、マウスにEGFRミニセルIrinoを与えた。G1およびG2は腫瘍のみと遊離イリノテカン(〜2.4×105ng/用量)対照とした。一用量当たり5×108個のミニセルを投与し、各用量にはミニセル中に約80ngのイリノテカンが封入され、これは遊離薬物として投与した用量の3,000分の1の用量であった。結果は、shRNAの発現を可能にする時間と、続くEGFRミニセルIrinoの投与との間に明瞭な相関が示され(図5)、薬剤耐性を逆転し有意な処理効果を得るには144時間(G5)が最も有効であった。
本実施例は、実施例6で観察された投薬スケジュール効果が広く適用可能であることを実証する。
本明細書中で言及したすべての刊行物および特許文献は、参照により本明細書中に組み入れられる。しかしながら、刊行物または特許文献の参照は、先行技術についての承認を構成するものではない。
Claims (9)
- (a)アンチセンス分子もしくはリボザイムを含有する、または機能性核酸分子をコードするセグメントを含むプラスミドを含有するインタクトな細菌由来ミニセル、(b)癌化学療法剤を含有するインタクトな細菌由来ミニセル、ならびに(c)製薬上許容される担体、を含んでなる組成物であって、各ミニセルが腫瘍細胞で過剰に発現する哺乳動物細胞表面受容体に対する特異性を有する二重特異性リガンドに結合しており、前記アンチセンス分子、リボザイムまたは機能性核酸分子が、前記癌化学療法剤への耐性に関与するタンパク質の転写産物を標的とする、上記組成物。
- 前記ミニセル(a)が前記プラスミドを含有する、請求項1に記載の組成物。
- 前記機能性核酸が、前記癌化学療法剤への耐性に関与するタンパク質の転写産物を標的とするsiRNA、shRNAまたはmiRNA分子である、請求項2に記載の組成物。
- 前記機能性核酸分子が、P−糖タンパク質、MDR−2またはMDR−3の転写産物を標的とする、請求項3に記載の組成物。
- 前記哺乳動物細胞表面受容体がEGFRである、請求項1〜4のいずれか1項に記載の組成物。
- 109個ミニセル当たり約1個未満の混入親細菌細胞を含有する、請求項1〜5のいずれか1項に記載の組成物。
- 1010個ミニセル当たり約1個未満の混入親細菌細胞を含有する、請求項1〜5のいずれか1項に記載の組成物。
- 1011個ミニセル当たり約1個未満の混入親細菌細胞を含有する、請求項1〜5のいずれか1項に記載の組成物。
- 癌の治療用である、請求項1〜8のいずれか1項に記載の組成物。
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