JP6824594B2 - 合成遺伝子の設計方法 - Google Patents
合成遺伝子の設計方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP6824594B2 JP6824594B2 JP2014185629A JP2014185629A JP6824594B2 JP 6824594 B2 JP6824594 B2 JP 6824594B2 JP 2014185629 A JP2014185629 A JP 2014185629A JP 2014185629 A JP2014185629 A JP 2014185629A JP 6824594 B2 JP6824594 B2 JP 6824594B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- recombinant
- gene
- mammalian cell
- luciferase
- protein
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Expired - Fee Related
Links
- 108700005078 Synthetic Genes Proteins 0.000 title description 7
- 238000013461 design Methods 0.000 title description 4
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 248
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 claims description 111
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 97
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 82
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 claims description 59
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims description 52
- 108090000331 Firefly luciferases Proteins 0.000 claims description 49
- 238000003259 recombinant expression Methods 0.000 claims description 44
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims description 41
- 238000004020 luminiscence type Methods 0.000 claims description 37
- IGXWBGJHJZYPQS-SSDOTTSWSA-N D-Luciferin Chemical compound OC(=O)[C@H]1CSC(C=2SC3=CC=C(O)C=C3N=2)=N1 IGXWBGJHJZYPQS-SSDOTTSWSA-N 0.000 claims description 29
- 241000254064 Photinus pyralis Species 0.000 claims description 29
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 claims description 25
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 24
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 24
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 claims description 23
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 claims description 23
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 claims description 23
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 claims description 22
- 238000012258 culturing Methods 0.000 claims description 20
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 claims description 19
- CYCGRDQQIOGCKX-UHFFFAOYSA-N Dehydro-luciferin Natural products OC(=O)C1=CSC(C=2SC3=CC(O)=CC=C3N=2)=N1 CYCGRDQQIOGCKX-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 17
- BJGNCJDXODQBOB-UHFFFAOYSA-N Fivefly Luciferin Natural products OC(=O)C1CSC(C=2SC3=CC(O)=CC=C3N=2)=N1 BJGNCJDXODQBOB-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 17
- DDWFXDSYGUXRAY-UHFFFAOYSA-N Luciferin Natural products CCc1c(C)c(CC2NC(=O)C(=C2C=C)C)[nH]c1Cc3[nH]c4C(=C5/NC(CC(=O)O)C(C)C5CC(=O)O)CC(=O)c4c3C DDWFXDSYGUXRAY-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 17
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 claims description 14
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 claims description 14
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 13
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 claims description 9
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims description 8
- 108700008625 Reporter Genes Proteins 0.000 claims description 5
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 claims description 3
- 108060001084 Luciferase Proteins 0.000 description 101
- 239000005089 Luciferase Substances 0.000 description 80
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 59
- 108010047357 Luminescent Proteins Proteins 0.000 description 47
- 102000006830 Luminescent Proteins Human genes 0.000 description 46
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 26
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 20
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 15
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 15
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 13
- 108010000239 Aequorin Proteins 0.000 description 12
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 12
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 10
- 238000000691 measurement method Methods 0.000 description 10
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 9
- YHIPILPTUVMWQT-UHFFFAOYSA-N Oplophorus luciferin Chemical compound C1=CC(O)=CC=C1CC(C(N1C=C(N2)C=3C=CC(O)=CC=3)=O)=NC1=C2CC1=CC=CC=C1 YHIPILPTUVMWQT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 8
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 8
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 8
- 239000003054 catalyst Substances 0.000 description 7
- 210000004748 cultured cell Anatomy 0.000 description 7
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 7
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 7
- 230000003248 secreting effect Effects 0.000 description 7
- OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N Calcium Chemical compound [Ca] OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 108700010070 Codon Usage Proteins 0.000 description 6
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 6
- 229910052791 calcium Inorganic materials 0.000 description 6
- 239000011575 calcium Substances 0.000 description 6
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 6
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 6
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 5
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 description 5
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 5
- 241000894007 species Species 0.000 description 5
- 241000254173 Coleoptera Species 0.000 description 4
- 108091023040 Transcription factor Proteins 0.000 description 4
- 102000040945 Transcription factor Human genes 0.000 description 4
- 241000238583 Vargula hilgendorfii Species 0.000 description 4
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 description 4
- MKXKFYHWDHIYRV-UHFFFAOYSA-N flutamide Chemical compound CC(C)C(=O)NC1=CC=C([N+]([O-])=O)C(C(F)(F)F)=C1 MKXKFYHWDHIYRV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 4
- 239000012139 lysis buffer Substances 0.000 description 4
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 4
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 4
- 108010089402 phialidin Proteins 0.000 description 4
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 4
- 241000701022 Cytomegalovirus Species 0.000 description 3
- 101150062179 II gene Proteins 0.000 description 3
- 241000254054 Luciola cruciata Species 0.000 description 3
- 101710172711 Structural protein Proteins 0.000 description 3
- 210000004102 animal cell Anatomy 0.000 description 3
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 3
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 3
- 238000001243 protein synthesis Methods 0.000 description 3
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 3
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 3
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 3
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 3
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 3
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 3
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 3
- 230000014616 translation Effects 0.000 description 3
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 2
- 241000059559 Agriotes sordidus Species 0.000 description 2
- 102000005701 Calcium-Binding Proteins Human genes 0.000 description 2
- 108010045403 Calcium-Binding Proteins Proteins 0.000 description 2
- 241000195493 Cryptophyta Species 0.000 description 2
- 241000206602 Eukaryota Species 0.000 description 2
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 2
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 2
- 241001126922 Mnemiopsis Species 0.000 description 2
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 2
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 2
- 241000700584 Simplexvirus Species 0.000 description 2
- IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N Thymidine Chemical compound O=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N 0.000 description 2
- 102000006601 Thymidine Kinase Human genes 0.000 description 2
- 108020004440 Thymidine kinase Proteins 0.000 description 2
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 2
- 210000004436 artificial bacterial chromosome Anatomy 0.000 description 2
- 210000001106 artificial yeast chromosome Anatomy 0.000 description 2
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 2
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 2
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 2
- OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N cytosine Chemical compound NC=1C=CNC(=O)N=1 OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 2
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 2
- 238000013210 evaluation model Methods 0.000 description 2
- 238000013467 fragmentation Methods 0.000 description 2
- 238000006062 fragmentation reaction Methods 0.000 description 2
- UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N guanine Chemical compound O=C1NC(N)=NC2=C1N=CN2 UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 2
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 2
- 150000007523 nucleic acids Chemical group 0.000 description 2
- 230000001699 photocatalysis Effects 0.000 description 2
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 2
- 238000001308 synthesis method Methods 0.000 description 2
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 description 2
- 238000003151 transfection method Methods 0.000 description 2
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 2
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Chemical compound O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N β‐Mercaptoethanol Chemical compound OCCS DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000007469 Actins Human genes 0.000 description 1
- 108010085238 Actins Proteins 0.000 description 1
- GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N Adenine Chemical compound NC1=NC=NC2=C1N=CN2 GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229930024421 Adenine Natural products 0.000 description 1
- 241000143060 Americamysis bahia Species 0.000 description 1
- DWRXFEITVBNRMK-UHFFFAOYSA-N Beta-D-1-Arabinofuranosylthymine Natural products O=C1NC(=O)C(C)=CN1C1C(O)C(O)C(CO)O1 DWRXFEITVBNRMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- 102000008186 Collagen Human genes 0.000 description 1
- 108010035532 Collagen Proteins 0.000 description 1
- 241000700108 Ctenophora <comb jellyfish phylum> Species 0.000 description 1
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 description 1
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 1
- 102000003688 G-Protein-Coupled Receptors Human genes 0.000 description 1
- 108090000045 G-Protein-Coupled Receptors Proteins 0.000 description 1
- 108010043121 Green Fluorescent Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000004144 Green Fluorescent Proteins Human genes 0.000 description 1
- 102000004310 Ion Channels Human genes 0.000 description 1
- 241000254158 Lampyridae Species 0.000 description 1
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 1
- 108700009124 Transcription Initiation Site Proteins 0.000 description 1
- 229960000643 adenine Drugs 0.000 description 1
- IQFYYKKMVGJFEH-UHFFFAOYSA-N beta-L-thymidine Natural products O=C1NC(=O)C(C)=CN1C1OC(CO)C(O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 1
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 1
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 1
- 229910000389 calcium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001506 calcium phosphate Substances 0.000 description 1
- 235000011010 calcium phosphates Nutrition 0.000 description 1
- -1 cationic lipid Chemical class 0.000 description 1
- 210000004978 chinese hamster ovary cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 1
- 229920001436 collagen Polymers 0.000 description 1
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 1
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 1
- 239000013601 cosmid vector Substances 0.000 description 1
- 125000004122 cyclic group Chemical group 0.000 description 1
- 210000000805 cytoplasm Anatomy 0.000 description 1
- 229940104302 cytosine Drugs 0.000 description 1
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 1
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 1
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 1
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 description 1
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 239000012091 fetal bovine serum Substances 0.000 description 1
- 239000005090 green fluorescent protein Substances 0.000 description 1
- 239000005556 hormone Substances 0.000 description 1
- 229940088597 hormone Drugs 0.000 description 1
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 1
- 238000001638 lipofection Methods 0.000 description 1
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 1
- 238000003670 luciferase enzyme activity assay Methods 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 238000000520 microinjection Methods 0.000 description 1
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 1
- 108700043045 nanoluc Proteins 0.000 description 1
- 238000001668 nucleic acid synthesis Methods 0.000 description 1
- 238000005457 optimization Methods 0.000 description 1
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 1
- 239000000018 receptor agonist Substances 0.000 description 1
- 229940044601 receptor agonist Drugs 0.000 description 1
- 239000002464 receptor antagonist Substances 0.000 description 1
- 229940044551 receptor antagonist Drugs 0.000 description 1
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 1
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 1
- 239000008223 sterile water Substances 0.000 description 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 1
- 238000010189 synthetic method Methods 0.000 description 1
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 1
- 229940104230 thymidine Drugs 0.000 description 1
- 230000005030 transcription termination Effects 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H tricalcium bis(phosphate) Chemical compound [Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H 0.000 description 1
- 238000012795 verification Methods 0.000 description 1
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/85—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/0004—Oxidoreductases (1.)
- C12N9/0069—Oxidoreductases (1.) acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, i.e. oxygenases (1.13)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/66—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving luciferase
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y113/00—Oxidoreductases acting on single donors with incorporation of molecular oxygen (oxygenases) (1.13)
- C12Y113/12—Oxidoreductases acting on single donors with incorporation of molecular oxygen (oxygenases) (1.13) with incorporation of one atom of oxygen (internal monooxygenases or internal mixed function oxidases)(1.13.12)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y113/00—Oxidoreductases acting on single donors with incorporation of molecular oxygen (oxygenases) (1.13)
- C12Y113/12—Oxidoreductases acting on single donors with incorporation of molecular oxygen (oxygenases) (1.13) with incorporation of one atom of oxygen (internal monooxygenases or internal mixed function oxidases)(1.13.12)
- C12Y113/12005—Renilla-luciferin 2-monooxygenase (1.13.12.5), i.e. renilla-luciferase
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y113/00—Oxidoreductases acting on single donors with incorporation of molecular oxygen (oxygenases) (1.13)
- C12Y113/12—Oxidoreductases acting on single donors with incorporation of molecular oxygen (oxygenases) (1.13) with incorporation of one atom of oxygen (internal monooxygenases or internal mixed function oxidases)(1.13.12)
- C12Y113/12007—Photinus-luciferin 4-monooxygenase (ATP-hydrolysing) (1.13.12.7), i.e. firefly-luciferase
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y113/00—Oxidoreductases acting on single donors with incorporation of molecular oxygen (oxygenases) (1.13)
- C12Y113/12—Oxidoreductases acting on single donors with incorporation of molecular oxygen (oxygenases) (1.13) with incorporation of one atom of oxygen (internal monooxygenases or internal mixed function oxidases)(1.13.12)
- C12Y113/12013—Oplophorus-luciferin 2-monooxygenase (1.13.12.13)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2800/00—Nucleic acids vectors
- C12N2800/22—Vectors comprising a coding region that has been codon optimised for expression in a respective host
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
Description
(1)目的タンパク質遺伝子の塩基配列を、ヒト細胞で使用頻度の高いコドンのみを選択し、かつGC含量が60%以上になるよう改変する工程を含む、選択型遺伝子の設計方法。
(2)目的タンパク質遺伝子が、機能性タンパク質、または構造性タンパク質をコードする遺伝子である、上記(1)記載の方法。
(3)目的タンパク質遺伝子が、発光タンパク質または発光酵素をコードする遺伝子である、上記(2)に記載の方法。
(4)発光タンパク質または発光酵素が、イクオリン、クライチィンII、ガウシアルシフェラーゼ、エビルシフェラーゼの発光触媒タンパク質の変異体、北米産ホタルルシフェラーゼ、ゲンジボタルルシフェラーゼ、またはレニラルシフェラーゼから選択される、上記(3)に記載の方法。
(5)上記(1)または(2)に記載の方法によって合成された、選択型遺伝子。
(6)上記(3)に記載の方法によって合成された、発光タンパク質または発光酵素をコードする選択型遺伝子。
(7)上記(4)に記載の方法によって合成された、イクオリンをコードする選択型遺伝子。
(8)上記(4)に記載の方法によって合成された、クライチィンIIをコードする選択型遺伝子。
(9)上記(4)に記載の方法によって合成された、ガウシアルシフェラーゼをコードする選択型遺伝子。
(10)上記(4)に記載の方法によって合成された、エビルシフェラーゼの発光触媒タンパク質の変異体をコードする選択型遺伝子。
(11)上記(4)に記載の方法によって合成された、北米産ホタルルシフェラーゼをコードする選択型遺伝子。
(12)上記(4)に記載の方法によって合成された、ゲンジボタルルシフェラーゼをコードする選択型遺伝子。
(13)上記(4)に記載の方法によって合成された、レニラルシフェラーゼをコードする選択型遺伝子。
(14)上記(5)〜(13)に記載のいずれか1つに記載の選択型遺伝子と、他のタンパク質をコードするポリヌクレオチドとが融合した選択型遺伝子。
(15)上記(1)または(2)に記載の方法で合成した選択型遺伝子を用いて、哺乳類細胞において作動するプロモーターの制御調節下に置いた組換え発現ベクターを調製する工程、
前記組換え発現ベクターを哺乳類細胞に導入し、組換え哺乳類細胞を作製する工程、
前記組換え哺乳類細胞を培養し、前記選択型遺伝子を発現させる工程を含む、
目的タンパク質の製造方法。
(16)上記(3)に記載の方法で合成した選択型遺伝子を用いて、哺乳類細胞において作動するプロモーターの制御調節下に置いた組換え発現ベクターを調製する工程、
前記組換え発現ベクターを哺乳類細胞に導入し、組換え哺乳類細胞を作製する工程、
前記組換え哺乳類細胞を培養し、前記選択型遺伝子を発現させる工程を含む、
発光タンパク質または発光酵素の製造方法。
(17)上記(4)に記載の方法で合成した選択型遺伝子のいずれか1つを用いて、哺乳類細胞において作動するプロモーターの制御調節下に置いた組換え発現ベクターを調製する工程、前記組換え発現ベクターを哺乳類細胞に導入し、組換え哺乳類細胞を作製する工程、
前記組換え哺乳類細胞を培養し、前記選択型遺伝子を発現させる工程を含む、
発光タンパク質または発光酵素の製造方法。
(18)上記(14)に記載の方法で合成した選択型遺伝子を用いて、哺乳類細胞において作動するプロモーターの制御調節下に置いた組換え発現ベクターを調製する工程、
前記組換え発現ベクターを哺乳類細胞に導入し、組換え哺乳類細胞を作製する工程、
前記組換え哺乳類細胞を培養し、前記選択型遺伝子を発現させる工程を含む、
融合目的タンパク質の製造方法。
(19)哺乳類細胞がヒト細胞である、上記(15)〜(18)に記載のいずれか1つに記載の製造方法。
(20)上記(15)または(19)に記載の方法で製造した目的タンパク質。
(21)上記(16)または(19)に記載の方法で製造した発光タンパク質または発光酵素。
(22)上記(17)または(19)に記載の方法で製造した発光タンパク質または発光酵素。
(23)上記(18)または(19)に記載の方法で製造した融合目的タンパク質。
(24)上記(5)〜(14)のいずれか1つに記載の選択型遺伝子の位置が、哺乳類細胞において作動するプロモーターの制御調節下である、組換え発現ベクター。
(25)上記(5)〜(14)のいずれか1つに記載の選択型遺伝子を有する組換え哺乳類細胞。
(26)哺乳類細胞がヒト細胞である、上記(25)の組換え哺乳類細胞。
(27)上記(1)または(2)に記載の方法で合成した選択型遺伝子を用いて、哺乳類細胞において作動するプロモーターの制御調節下に置いた組換え発現ベクターを調製する工程、
前記組換え発現ベクターを哺乳類細胞に導入し、組換え哺乳類細胞を作製する工程、
前記組換え哺乳類細胞を培養し、前記選択型遺伝子を発現させる工程を含む、
目的タンパク質の発現量を増加させる方法。
(28)上記(3)に記載の方法で合成した選択型遺伝子を用いて、哺乳類細胞において作動するプロモーターの制御調節下に置いた組換え発現ベクターを調製する工程、
前記組換え発現ベクターを哺乳類細胞に導入し、組換え哺乳類細胞を作製する工程、
前記組換え哺乳類細胞を培養し、前記選択型遺伝子を発現させる工程を含む、
発光タンパク質または発光酵素の発現量を増加させる方法。
(29)上記(4)に記載の方法で合成した選択型遺伝子のいずれか1つを用いて、哺乳類細胞において作動するプロモーターの制御調節下に置いた組換え発現ベクターを調製する工程、前記組換え発現ベクターを哺乳類細胞に導入し、組換え哺乳類細胞を作製する工程、
前記組換え哺乳類細胞を培養し、前記選択型遺伝子を発現させる工程を含む、
発光タンパク質または発光酵素の発現量を増加させる方法。
(30)上記(14)に記載の方法で合成した選択型遺伝子を用いて、哺乳類細胞において作動するプロモーターの制御調節下に置いた組換え発現ベクターを調製する工程、
前記組換え発現ベクターを哺乳類細胞に導入し、組換え哺乳類細胞を作製する工程、
前記組換え哺乳類細胞を培養し、前記選択型遺伝子を発現させる工程を含む、
融合目的タンパク質の発現量を増加させる方法。
(31)哺乳類細胞がヒト細胞である、上記(27)〜(30)のいずれか1つに記載の発現量を増加させる方法。
(32)上記(3)に記載の方法で合成した選択型遺伝子を用いて、哺乳類細胞において作動するプロモーターの制御調節下に置いた組換え発現ベクターを調製する工程、
前記組換え発現ベクターを哺乳類細胞に導入し、組換え哺乳類細胞を作製する工程、
前記組換え哺乳類細胞を培養し、前記選択型遺伝子を発現させる工程を含む、
発光タンパク質または発光酵素の検出感度を増加させる方法。
(33)上記(4)に記載の方法で合成した選択型遺伝子のいずれか1つを用いて、哺乳類細胞において作動するプロモーターの制御調節下に置いた組換え発現ベクターを調製する工程、前記組換え発現ベクターを哺乳類細胞に導入し、組換え哺乳類細胞を作製する工程、
前記組換え哺乳類細胞を培養し、前記選択型遺伝子を発現させる工程を含む、
発光タンパク質または発光酵素の検出感度を増加させる方法。
(34)哺乳類細胞がヒト細胞である、上記(32)または(33)に記載の検出感度を増加させる方法。
(35)上記(21)または(22)に記載の発光タンパク質、発光酵素、もしくは上記(23)に記載の融合目的タンパク質を、ルシフェリン、またはルシフェリン類縁体と接触させ、発生した光量を測定する、発光活性の測定方法。
(36)ルシフェリン、またはルシフェリン類縁体の発光強度を増強させるための、上記(5)〜(14)のいずれか1つに記載の選択型遺伝子、上記(21)または(22)に記載の発光タンパク質、発光酵素、もしくは上記(23)に記載の融合目的タンパク質の使用。
(37)上記(5)〜(14)のいずれか1つに記載の選択型遺伝子をレポーター遺伝子として、プロモーター制御に関する配列の活性を測定する方法。
(38)上記(5)〜(14)のいずれか1つに記載の選択型遺伝子を哺乳類細胞内で発現させ、発光タンパク質、発光酵素、もしくは融合目的タンパク質を形成させる工程、
前記哺乳類細胞をルシフェリン、またはルシフェリン類縁体と接触させる工程、
発生した光量を測定する工程を含む、細胞内カルシウム濃度の変化を測定する方法。
(39)哺乳類細胞がヒト細胞である、上記(38)に記載の細胞内カルシウム濃度の変化を測定する方法。
(40)上記(5)〜(14)のいずれか1つに記載の選択型遺伝子、上記(24)に記載の組換え発現ベクター、もしくは上記(25)または(26)に記載の組換え哺乳類細胞の少なくとも1つを含み、さらにルシフェリンおよび/またはルシフェリン類縁体を含む、キット。
本発明は、ヒト細胞で使用頻度の高いコドンのみを優先的に選択し、かつGC含量が60%以上になるように発光タンパク質または発光酵素遺伝子を改変することで、天然型遺伝子と比較して高発現し、検出感度が向上する発光タンパク質または発光酵素の合成遺伝子、ならびに当該合成遺伝子の設計方法を提供する。
[配列番号:1]天然型イクオリン遺伝子の塩基配列を示す。GenBank Accession No.は、L29571である。
[配列番号:2]ヒト型イクオリン遺伝子の塩基配列を示す。
[配列番号:3]選択型イクオリン遺伝子の塩基配列を示す。
[配列番号:4]天然型クライチィンII遺伝子の塩基配列を示す。GenBank Accession No.は、AB360785である。
[配列番号:5]選択型クライチィンII遺伝子の塩基配列を示す。GenBank Accession No.は、HJ241347である。
[配列番号:6]天然型ガウシアルシフェラーゼ遺伝子の塩基配列を示す。GenBank Accession No.は、AY015993である。
[配列番号:7]ヒト型ガウシアルシフェラーゼ遺伝子の塩基配列を示す。
[配列番号:8]選択型ガウシアルシフェラーゼ遺伝子の塩基配列を示す。
[配列番号:9]ヒト型エビルシフェラーゼの発光触媒タンパク質変異体遺伝子の塩基配列を示す。GenBank Accession No.は、JQ437370である。
[配列番号:10]選択型エビルシフェラーゼの発光触媒タンパク質変異体遺伝子の塩基配列を示す。GenBank Accession No.は、AB823628である。
[配列番号:11]天然型北米産ホタルルシフェラーゼ遺伝子の塩基配列を示す。GenBank Accession No.は、M15077である。
[配列番号:12]ヒト型北米産ホタルルシフェラーゼの塩基配列を示す。GenBank Accession No.は、AY738225である。
[配列番号:13]選択型北米産ホタルルシフェラーゼ遺伝子の塩基配列を示す。
[配列番号:14]天然型ゲンジホタルルシフェラーゼ遺伝子の塩基配列を示す。GenBank Accession No.は、M26194である。
[配列番号:15]ヒト型ゲンジホタルルシフェラーゼ遺伝子の塩基配列を示す。
[配列番号:16]選択型ゲンジホタルルシフェラーゼ遺伝子の塩基配列を示す。
[配列番号:17]天然型レニラルシフェラーゼ遺伝子の塩基配列を示す。GenBank Accession No.は、M63501である。
[配列番号:18]ヒト型レニラルシフェラーゼ遺伝子の塩基配列を示す。
GenBank Accession No.は、AY738226である。
[配列番号:19]選択型レニラルシフェラーゼ遺伝子の塩基配列を示す。
[配列番号:20]実施例2で用いられたDNA断片(HindIII配列-コザック配列-ATG配列)の塩基配列を示す。
[配列番号:21]実施例2で用いられたDNA断片(BamHI配列-コザック配列)の塩基配列を示す。
[配列番号:22]実施例2で用いられたDNA断片(HindIII配列-コザック配列)の塩基配列を示す。
[配列番号:23]実施例2で用いられたDNA断片(HindIII配列-コザック配列)の塩基配列を示す。
実施例1:評価モデル酵素の選択型遺伝子の化学合成と遺伝子組成評価
モデルタンパク質として、表2に示した発光タンパク質遺伝子(イクオリン:AQ、クライティンII: CLII)およびルシフェラーゼ遺伝子(ガウシアルシフェラーゼ:GLuc、2種のホタルルシフェラーゼ:エビルシフェラーゼの発光触媒19kDaタンパク質: KAZ、PyLucとLcLuc、レニラルシフェラーゼ:RLuc)について、天然型のアミノ酸配列を変えずに、ヒト細胞で使用頻度の高いコドンのみを優先的に選択し、かつGC含量が60%以上になるように選択型新規遺伝子(opAQ、opCLII、nanoKAZ、opGLuc、opPyLuc、opLcLuc、opRLuc)を合成委託により、化学合成した(オペロンバイオテクノロジー社)。天然型遺伝子(wAQ、wCLII、wGLuc、wPyLuc、wLcLuc)、ヒト型遺伝子(hAQ、 nanoLuc、hGLuc、hPyLuc、hLcLuc、hRL)も必要に応じて、発現比較、活性比較のためのコントロール遺伝子は、化学合成法またはPCR法により調製した。
(1)イクオリン
動物培養細胞発現ベクターpcDNA3(インビトロジェン社製)の制限酵素HindIII−XbaI部位に、5’末端に制限酵素HindIII配列−コザック配列−ATG配列(AAGCTTGGTACCACCATG:配列番号20)および3’末端に制限酵素部位XbaI配列(TCTAGA)を付加した天然型(配列番号1)、ヒト型(配列番号2)、または選択型(配列番号3)イクオリン遺伝子のHindIII−XbaIフレグメントを調製し、挿入することにより、pcDNA3-wAQ、pcDNA3-hAQおよびpcDNA3-opAQを構築した。
動物培養細胞発現ベクターpcDNA3(インビトロジェン社製)の制限酵素HindIII−XbaI部位に、5’末端に制限酵素HindIII配列−コザック配列−ATG配列(AAGCTTGGTACCACCATG:配列番号20)および3’末端に制限酵素XbaI配列(TCTAGA)を付加した天然型(配列番号4)、または選択型(配列番号5)クライチィンII遺伝子のHindIII−XbaIフレグメントを調製し、挿入することにより、pcDNA3-wCLIIおよびpcDNA3-opCLIIを構築した。
動物培養細胞発現ベクターpcDNA3(インビトロジェン社製)の制限酵素BamHI−XbaI部位に、5’末端に制限酵素BamHI配列−コザック配列(GGATCCAACCGCC:配列番号21)および3’末端に制限酵素XbaI配列(TCTAGA)をもつ天然型(配列番号6)、ヒト型(配列番号7)、または選択型(配列番号8)ガウシアルシフェラーゼ遺伝子のBamHI−XbaIフレグメントを調製し、挿入することにより、pcDNA3-wGlucおよびpcDNA3-opGLucを構築した。
ガウシアルシフェラーセの分泌シグナル配列を有する動物培養細胞分泌発現ベクターpcDNA3-GLsp(Biochem.Biopphys.Res.Commun. (2013) 437: 23-28)の制限酵素EcoRI-XbaI部位に、ヒト型(配列番号9)、または選択型(配列番号10)エビルシフェラーゼの発光触媒タンパク質の変異体遺伝子の5’および3’末端に制限酵素EcoRIとXbaIを有するフラグメントを調製し、挿入することにより、pcDNA3-GLsp-nanoLucおよびpcDNA3-GLsp-dnKAZを構築した。
ヒト型(配列番号12)北米産ホタルルシフェラーゼ発現ベクターpGL4.13[luc2/sv40](プロメガ社製)の制限酵素HindIII−XbaI部位に挿入されている北米産ホタルルシフェラーゼ遺伝子を、5’末端に制限酵素HindIII配列−コザック配列(AAGCTTGGCAATCCGGTACTGTTGGTAAAGCCACC:配列番号22)および3’末端に制限酵素XbaI配列(TCTAGA)をもつ天然型(配列番号11)および選択型(配列番号13)北米産ホタルルシフェラーゼ遺伝子のHindIII−XbaIフレグメントを調製し、置換することにより、pJN-wPyLuc-svおよびpJN-opPyLuc-svを構築した。
ヒト型(配列番号12)北米産ホタルルシフェラーゼ発現ベクターpGL4.13[luc2/sv40](プロメガ社製)の制限酵素HindIII−XbaI部位に挿入されている北米産ホタルルシフェラーゼ遺伝子を、5’末端に制限酵素HindIII配列−コザック配列(AAGCTTGGCAATCCGGTACTGTTGGTAAAGCCACC:配列番号22)および3’末端に制限酵素XbaI配列(TCTAGA)をもつ天然型(配列番号14)、ヒト型(配列番号15)および選択型(配列番号16)ゲンジホタルルシフェラーゼ遺伝子のHindIII−XbaIフレグメントを調製し、置換することにより、pJN-wLcLuc-sv、pJN-hLcLuc-svおよびpJN-opLcLuc-svをした。
動物培養細胞発現ベクターpcDNA3(インビトロジェン社製)の制限酵素HindIII−XbaI部位に、5’末端に制限酵素部位HindIII−コザック配列(AAGCTTGGTACCACC:配列番号22)および3’末端に制限酵素部位XbaI配列(TCTAGA)をもつ天然型(配列番号17)、ヒト型(配列番号18)、または選択型(配列番号19)レニラルシフェラーゼ遺伝子のHindIII−XbaIフレグメントを調製し、挿入することにより、pcDNA3-RL、pcDNA3-hRL、およびpcDNA3-opRLを構築した。
(1)発現プラスミドの精製
実施例2にて得られた組換えプラスミドを用いて以下の実験を行った。組換えプラスミドは大腸菌JM83またはDH5aより、プラスミド精製キット(QIAGEN社製)を用いて精製、滅菌水に溶解し、トランスフェクションに使用した。
動物培養細胞株CHO−K1株を、10%(v/v)牛胎児血清(HyClone社製またはBiowest社製)を含むHam’s F−12培地(和光純薬社製)(以降Ham’s−F12培地と記載することもある)にて培養した。
(1)発光タンパク質イクオリンおよびクライティンIIの発光測定法
実施例3で得られた発光タンパク質のアポ発光蛋白質発現細胞を、3 mLのPBS(和光純薬社製)で洗浄後、1mL PBSを加え、スクレーパーで細胞を回収した。250μLの回収細胞溶液に、250μLの30mM Tris-HCl(pH7.6)−10mM EDTAを加え、氷上で5秒間超音波破砕機にて破砕した。その破砕溶液に、1μgのセレンテラジン(JNC社製)および1μLの2−メルカプトエタノール(和光純薬社製)を加え、4oCで3時間以上放置し、アポ発光蛋白質から発光蛋白質へ再生した。10μLの再生溶液に、50mM Tris-HCl(pH7.6)に溶解した50 mM CaCl2を100μL注入することにより、発光反応を開始させた。発光測定装置(ベルトールド社:LB960)で、0.1秒間隔で5秒間測定し、最大発光値(Imax)の平均値(n=3)として表した。
実施例3で得られたガウシアルシフェラーゼの分泌発現細胞の培養液および細胞内の発光活性を測定した。細胞抽出液は、発現細胞を0.5 mLのPBS 溶液で3回洗浄後、100μLのPassive lysis buffer(プロメガ社製)を加え室温で15分震振し調製した。培養液または細胞抽出液の発光測定のために、Passive lysis bufferで100倍希釈した後、1μLを、セレンテラジン(0.25μg)を含む50μL のPBSに加え、発光反応を開始させた。発光活性は、発光測定装置(アトー社製:AB2200)で、0.1秒間隔で5秒間測定し、最大発光値(Imax)の平均値(n=4)として表した。
実施例3で得られたエビルシフェラーゼの発光触媒タンパク質の変異体の分泌発現細胞の培養液1μLを、セレンテラジン(0.25μg)を含む50μL のPBSに加え、発光反応を開始させた。発光活性は、発光測定装置(アトー社製:AB2200)で、1/100の減衰フィルター存在下、0.1秒間隔で5秒間測定し、最大発光値(Imax)の平均値(n=4)として表した。
実施例3で得られたホタルルシフェラーゼ発現細胞からの細胞抽出液の調製は、発現細胞を1mLのPBS 溶液で3回洗浄後、100μLのPassive lysis buffer(プロメガ社製)加え、室温で15分震振した。得られた細胞抽出液10μLを、50μLのホタルルシフェラーゼアッセイ溶液(Firefly luciferase assay solution:プロメガ社製)に加え、発光反応を開始させた。 発光活性は、発光測定装置(アトー社製:AB2200)で、1/100の減衰フィルター存在下、0.1秒間隔で10秒間測定し、10秒間の発光の積分値(Int.)の平均(n=4)として表した。
実施例3で得られたレニラルシフェラーゼ発現細胞からの細胞抽出液の調製は、発現細胞を1mLのPBS 溶液で3回洗浄後、100μLのPassive lysis buffer(プロメガ社製)加え、室温で15分震振した。得られた細胞抽出液10μLを、セレンテラジン(0.25μg)を含む50μL のPBSに加え、発光反応を開始させた。発光活性は、発光測定装置(アトー社製:AB2200)で、1/10の減衰フィルター存在下、0.1秒間隔で10秒間測定し、10秒間の発光の積分値の平均(n = 4)として表した。
(1)イクオリンの発現
実施例4記載の活性測定法により、細胞内での発現イクオリンの活性を測定した(表4)。その結果、天然型遺伝子に比べ、ヒト型遺伝子は2.7倍、選択型遺伝子は7.9倍高い活性を示した。
実施例4記載の活性測定法により、細胞内での発現イクオリンの活性を測定した(表5)。その結果、天然型遺伝子に比べ、選択型遺伝子は11.8倍高い活性を示した。
実施例4記載の活性測定法により、培養液と細胞内での発現ガウシアルシフェラーゼの活性を測定した(表6)。天然型遺伝子の培養液の活性および細胞質の活性に比べ、選択型遺伝子は,培養液では12.6倍、細胞内では10.8倍高い活性を示した。
実施例4記載の活性測定法により、培養液に分泌したエビルシフェラーゼの発光触媒タンパク質の変異体の活性を測定した(表7)。その結果、ヒト型遺伝子は、選択型遺伝子に比べ89%の活性を示し、ほぼ同様な活性であった。
実施例4記載の活性測定法により、細胞内での北米産ホタルルシフェフェラーゼの活性を測定した(表8)。その結果、天然型遺伝子に比べ、ヒト型遺伝子は5.2倍、選択型遺伝子は3.4倍高い活性を示した。
実施例4記載の活性測定法により、細胞内でのゲンジホタルルシフェフェラーゼの活性を測定した(表9)。その結果、天然型遺伝子に比べ、ヒト型遺伝子は320倍、選択型遺伝子は402倍高い活性を示した。
実施例4記載の活性測定法により、細胞内でのレニラルシフェフェラーゼの活性を測定した(表10)。その結果、天然型遺伝子に比べ、ヒト型遺伝子は25.4倍、選択型遺伝子は47.4倍高い活性を示した。
Claims (16)
- 配列番号13の塩基配列を有し、北米産ホタルルシフェラーゼをコードするポリヌクレオチド。
- さらに他のタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含み、北米産ホタルルシフェラーゼと他のタンパク質の融合タンパク質をコードする、請求項1に記載のポリヌクレオチド。
- 請求項1に記載のポリヌクレオチドを用いて、哺乳類細胞において作動するプロモーターの制御調節下に置いた組換え発現ベクターを調製する工程、
前記組換え発現ベクターを哺乳類細胞に導入し、組換え哺乳類細胞を作製する工程、
前記組換え哺乳類細胞を培養し、配列番号13の塩基配列を有するポリヌクレオチドによってコードされる北米産ホタルルシフェラーゼを製造する工程を含む、
北米産ホタルルシフェラーゼの製造方法。 - 請求項2に記載のポリヌクレオチドを用いて、哺乳類細胞において作動するプロモーターの制御調節下に置いた組換え発現ベクターを調製する工程、
前記組換え発現ベクターを哺乳類細胞に導入し、組換え哺乳類細胞を作製する工程、
前記組換え哺乳類細胞を培養し、北米産ホタルルシフェラーゼと他のタンパク質の融合タンパク質を製造する工程を含む、
北米産ホタルルシフェラーゼと他のタンパク質の融合タンパク質の製造方法。 - 哺乳類細胞がヒト細胞である、請求項3または4に記載の製造方法。
- 請求項1または2に記載のポリヌクレオチドの発現が、哺乳類細胞において作動するプロモーターの制御調節下である、組換え発現ベクター。
- 請求項1または2に記載のポリヌクレオチドを有する組換え哺乳類細胞。
- 哺乳類細胞がヒト細胞である、請求項7の組換え哺乳類細胞。
- 請求項1に記載のポリヌクレオチドを用いて、哺乳類細胞において作動するプロモーターの制御調節下に置いた組換え発現ベクターを調製する工程、
前記組換え発現ベクターを哺乳類細胞に導入し、組換え哺乳類細胞を作製する工程、
前記組換え哺乳類細胞を培養し、配列番号13の塩基配列を有するポリヌクレオチドによってコードされる北米産ホタルルシフェラーゼを製造する工程を含む、
北米産ホタルルシフェラーゼの天然型遺伝子を用いた場合と比較して北米産ホタルルシフェラーゼの発現量を増加させる方法。 - 請求項2に記載のポリヌクレオチドを用いて、哺乳類細胞において作動するプロモーターの制御調節下に置いた組換え発現ベクターを調製する工程、
前記組換え発現ベクターを哺乳類細胞に導入し、組換え哺乳類細胞を作製する工程、
前記組換え哺乳類細胞を培養し、北米産ホタルルシフェラーゼと他のタンパク質の融合タンパク質を製造する工程を含む、
北米産ホタルルシフェラーゼの天然型遺伝子を用いた場合と比較して北米産ホタルルシフェラーゼと他のタンパク質の融合タンパク質の発現量を増加させる方法。 - 哺乳類細胞がヒト細胞である、請求項9または10に記載の発現量を増加させる方法。
- 請求項1に記載のポリヌクレオチドを用いて、哺乳類細胞において作動するプロモーターの制御調節下に置いた組換え発現ベクターを調製する工程、
前記組換え発現ベクターを哺乳類細胞に導入し、組換え哺乳類細胞を作製する工程、
前記組換え哺乳類細胞を培養し、配列番号13の塩基配列を有するポリヌクレオチドによってコードされる北米産ホタルルシフェラーゼを製造する工程を含む、
北米産ホタルルシフェラーゼの天然型遺伝子を用いた場合と比較して北米産ホタルルシフェラーゼの検出感度を増加させる方法。 - 哺乳類細胞がヒト細胞である、請求項12に記載の検出感度を増加させる方法。
- ルシフェリン、またはルシフェリン類縁体の発光強度を増強させるための、請求項1または2に記載のポリヌクレオチドの使用。
- 請求項1または2に記載のポリヌクレオチドをレポーター遺伝子として、プロモーター制御に関する配列の活性を測定する方法。
- 請求項1または2に記載のポリヌクレオチド、請求項6に記載の組換え発現ベクター、もしくは請求項7または8に記載の組換え哺乳類細胞の少なくとも1つを含み、さらにルシフェリンおよび/またはルシフェリン類縁体を含む、キット。
Priority Applications (5)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP2014185629A JP6824594B2 (ja) | 2014-09-11 | 2014-09-11 | 合成遺伝子の設計方法 |
| GB1515662.3A GB2535563B (en) | 2014-09-11 | 2015-09-04 | Design method for synthetic genes |
| US14/848,535 US9938539B2 (en) | 2014-09-11 | 2015-09-09 | Method for synthetic genes |
| US15/905,521 US10196650B2 (en) | 2014-09-11 | 2018-02-26 | Method for synthetic genes |
| US16/216,228 US11268106B2 (en) | 2014-09-11 | 2018-12-11 | Method for synthetic genes |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP2014185629A JP6824594B2 (ja) | 2014-09-11 | 2014-09-11 | 合成遺伝子の設計方法 |
Related Child Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2019148272A Division JP2019187453A (ja) | 2019-08-13 | 2019-08-13 | 合成遺伝子の設計方法 |
Publications (3)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JP2016054715A JP2016054715A (ja) | 2016-04-21 |
| JP2016054715A5 JP2016054715A5 (ja) | 2017-05-18 |
| JP6824594B2 true JP6824594B2 (ja) | 2021-02-03 |
Family
ID=54345750
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2014185629A Expired - Fee Related JP6824594B2 (ja) | 2014-09-11 | 2014-09-11 | 合成遺伝子の設計方法 |
Country Status (3)
| Country | Link |
|---|---|
| US (3) | US9938539B2 (ja) |
| JP (1) | JP6824594B2 (ja) |
| GB (1) | GB2535563B (ja) |
Families Citing this family (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US10121100B2 (en) | 2016-12-20 | 2018-11-06 | Capital One Services, Llc | Two piece transaction card having fabric inlay |
| WO2020257638A1 (en) * | 2019-06-21 | 2020-12-24 | University Of Utah Research Foundation | Novel live-cell assay for neuronal activity |
| CN112646838B (zh) * | 2021-01-06 | 2022-06-28 | 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院 | 一种hspa13基因表达载体及其构建方法和应用 |
Family Cites Families (26)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5670356A (en) * | 1994-12-12 | 1997-09-23 | Promega Corporation | Modified luciferase |
| US5976796A (en) * | 1996-10-04 | 1999-11-02 | Loma Linda University | Construction and expression of renilla luciferase and green fluorescent protein fusion genes |
| AU765703B2 (en) * | 1998-03-27 | 2003-09-25 | Bruce J. Bryan | Luciferases, fluorescent proteins, nucleic acids encoding the luciferases and fluorescent proteins and the use thereof in diagnostics, high throughput screening and novelty items |
| BR0010077A (pt) * | 1999-04-26 | 2002-01-15 | K U Leuven Res & Dev Universit | Gene sintético para expressão de uma proteìna retroviral ativa em eucariotas |
| WO2002061137A2 (en) | 2001-01-30 | 2002-08-08 | The Trustees Of Princeton University | Compositions and methods for enhancing polynucleotide amplification reactions |
| SE0101519D0 (sv) * | 2001-04-27 | 2001-04-27 | Astrazeneca Ab | Nucleic ACID |
| DE50214201D1 (de) * | 2001-06-05 | 2010-03-25 | Curevac Gmbh | Stabilisierte mRNA mit erhöhtem G/C-Gehalt, enkodierend für ein bakterielles Antigen sowie deren Verwendung |
| DE102004037611B4 (de) | 2004-08-03 | 2013-10-02 | Geneart Ag | Induzierbare Genexpression |
| WO2006049777A2 (en) * | 2004-09-30 | 2006-05-11 | Trustees Of Dartmouth College | Nucleic acid sequences encoding luciferase for expression in filamentous fungi |
| CA2636891A1 (en) * | 2006-01-11 | 2007-07-19 | Axxam S.P.A. | Luminescent stem cells and uses thereof |
| JPWO2007139080A1 (ja) * | 2006-05-26 | 2009-10-08 | ノアセルサイエンス株式会社 | 受容体及びイオンチャンネルを介したカルシウムの応答と引き続いて起こる遺伝子発現を測定する連続アッセイ法 |
| US20100035287A1 (en) * | 2006-10-12 | 2010-02-11 | The General Hospital Corporation | Secreted Luciferase Fluorescent Protein Conjugate Nucleic Acid Construct and Uses Thereof |
| US20080305500A1 (en) * | 2007-06-08 | 2008-12-11 | Senomyx, Inc. | Novel cell-based assays for identifying enhancers or inhibitors of t1r taste receptors (t1r2/t1r3 sweet) and umami (t1r1/t1r3 umami) taste receptors |
| EP2019134A1 (en) | 2007-07-26 | 2009-01-28 | Vision 7 GmbH | Gene therapy of chronic granulomatous disease |
| US7723502B2 (en) * | 2008-10-10 | 2010-05-25 | Marker Gene Technologies, Inc | Modified Luciola cruciata luciferase gene and protein |
| US8450054B2 (en) * | 2008-10-10 | 2013-05-28 | Marker Gene Technologies, Inc. | Modified Luciola cruciata luciferase gene and protein |
| JP5304275B2 (ja) | 2009-01-29 | 2013-10-02 | Jnc株式会社 | アポクライティン−iiをコードするコドン最適化核酸およびその使用方法 |
| US20110081298A1 (en) * | 2009-10-01 | 2011-04-07 | Andrew Tsourkas | Ratiometric bioluminescent sensor for imagining oxidative stress |
| WO2011102178A1 (ja) | 2010-02-19 | 2011-08-25 | 独立行政法人産業技術総合研究所 | 改良されたレポーター遺伝子を用いる分析システム |
| ES2643610T3 (es) * | 2010-05-19 | 2017-11-23 | Icosagen Cell Factory Oü | Método y kit para identificar compuestos capaces de inhibir la replicación del virus del papiloma humano |
| KR20120107741A (ko) * | 2011-03-22 | 2012-10-04 | 한국생명공학연구원 | 패혈증 단백질 치료제의 효능 분석 및 스크리닝 방법 |
| KR101292894B1 (ko) * | 2011-04-26 | 2013-08-02 | 서울대학교산학협력단 | 루시퍼라아제 유전자를 과발현하는 형질전환 동물 및 이의 제조 방법 |
| WO2012170998A1 (en) * | 2011-06-10 | 2012-12-13 | Cornell University | Immobilized protein system for rapid and enhanced multiplexed diagnostics |
| WO2013056212A2 (en) | 2011-10-14 | 2013-04-18 | Phycal Llc | Chlorophyte genes for the optimization of productivity |
| KR102287184B1 (ko) * | 2012-03-27 | 2021-08-06 | 큐어백 아게 | 개선된 단백질 또는 펩타이드 발현을 위한 인공 핵산 분자 |
| JP6511720B2 (ja) * | 2013-02-28 | 2019-05-15 | Jnc株式会社 | コドン最適化変異エビルシフェラーゼ遺伝子およびその使用方法 |
-
2014
- 2014-09-11 JP JP2014185629A patent/JP6824594B2/ja not_active Expired - Fee Related
-
2015
- 2015-09-04 GB GB1515662.3A patent/GB2535563B/en not_active Expired - Fee Related
- 2015-09-09 US US14/848,535 patent/US9938539B2/en active Active
-
2018
- 2018-02-26 US US15/905,521 patent/US10196650B2/en active Active
- 2018-12-11 US US16/216,228 patent/US11268106B2/en active Active
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| GB2535563B (en) | 2020-10-28 |
| US20190100770A1 (en) | 2019-04-04 |
| US20160076052A1 (en) | 2016-03-17 |
| US9938539B2 (en) | 2018-04-10 |
| US20180171356A1 (en) | 2018-06-21 |
| JP2016054715A (ja) | 2016-04-21 |
| GB2535563A (en) | 2016-08-24 |
| GB201515662D0 (en) | 2015-10-21 |
| US11268106B2 (en) | 2022-03-08 |
| US10196650B2 (en) | 2019-02-05 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| JP6275635B2 (ja) | cAMPのためのルシフェラーゼバイオセンサー | |
| JP5973591B2 (ja) | 改善された細胞表面発現を有するgpcr | |
| JP2002512015A (ja) | 迅速分解性gfp融合タンパク質および使用方法 | |
| US6956112B2 (en) | Rapidly degrading GFP-fusion proteins and methods of use | |
| WO2021110119A1 (zh) | 一种高活性转座酶及其应用 | |
| US11268106B2 (en) | Method for synthetic genes | |
| JP2019129772A (ja) | 2−ヘプタノンの匂いを抑制する物質のスクリーニング方法 | |
| US8476038B1 (en) | Method for determining capability of a compound for inhibiting a receptor using codon-optimized nucleic acid | |
| JP2019129773A (ja) | 2−ノナノンの匂いを抑制する物質のスクリーニング方法 | |
| EP1819812B1 (en) | The lupac bifunctional marker and its use in protein production | |
| JP2019187453A (ja) | 合成遺伝子の設計方法 | |
| US20040171005A1 (en) | Codon-optimised nucleic acid coding for apoaequorin and uses thereof | |
| CA3145920A1 (en) | Biosensors for detecting arrestin signaling | |
| US20250270518A1 (en) | Novel luciferases with improved properties | |
| JP2019039711A (ja) | 嗅覚受容体の応答測定方法 | |
| JP2008521421A (ja) | Lupac二機能マーカーと、タンパク質生産におけるその使用 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20170307 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20170324 |
|
| A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20180109 |
|
| A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20180309 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20180427 |
|
| A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20181009 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20181204 |
|
| A02 | Decision of refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02 Effective date: 20190514 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20190813 |
|
| C60 | Trial request (containing other claim documents, opposition documents) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: C60 Effective date: 20190813 |
|
| A911 | Transfer to examiner for re-examination before appeal (zenchi) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A911 Effective date: 20190821 |
|
| C21 | Notice of transfer of a case for reconsideration by examiners before appeal proceedings |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: C21 Effective date: 20190827 |
|
| A912 | Re-examination (zenchi) completed and case transferred to appeal board |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A912 Effective date: 20191018 |
|
| C211 | Notice of termination of reconsideration by examiners before appeal proceedings |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: C211 Effective date: 20191023 |
|
| C22 | Notice of designation (change) of administrative judge |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: C22 Effective date: 20200512 |
|
| C13 | Notice of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: C13 Effective date: 20200714 |
|
| C28A | Non-patent document cited |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: C2838 Effective date: 20200714 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20200907 |
|
| C23 | Notice of termination of proceedings |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: C23 Effective date: 20201201 |
|
| C03 | Trial/appeal decision taken |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: C03 Effective date: 20210105 |
|
| C30A | Notification sent |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: C3012 Effective date: 20210105 |
|
| A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20210113 |
|
| R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 6824594 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
| LAPS | Cancellation because of no payment of annual fees |