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KR101850319B1 - 비대칭 보조 그룹 - Google Patents

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KR101850319B1
KR101850319B1 KR1020157004038A KR20157004038A KR101850319B1 KR 101850319 B1 KR101850319 B1 KR 101850319B1 KR 1020157004038 A KR1020157004038 A KR 1020157004038A KR 20157004038 A KR20157004038 A KR 20157004038A KR 101850319 B1 KR101850319 B1 KR 101850319B1
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마모루 시미즈
타케시 와다
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웨이브 라이프 사이언시스 리미티드
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Abstract

키랄 시약 또는 그의 염이 제공된다. 상기 키랄 시약은 하기 화학식 (I)을 갖는다. 식 (I)에서, G1 및 G2 는 독립적으로 수소 원자, 니트로기 (-NO2), 할로겐 원자, 시아노기 (-CN), 식 (II) 또는 (III)의 그룹이거나, 또는 G1 및 G2 가 모두 함께 식 (IV)의 그룹을 형성한다.

Description

비대칭 보조 그룹{ASYMMETRIC AUXILIARY GROUP}
본 발명은 입체제어된(stereocontrolled) 인 원자-수식 올리고뉴클레오티드 유도체를 합성하기 위해 사용되는 키랄 시약에 관련된다.
JP 2005-89441 A는 옥사자포스포리딘 방법으로 불리는 뉴클레오티드의 유도체 생산 방법을 개시한다. 그러나, 상기 모노머들의 단리 수율이 낮고 상기 방법은 상업적으로 입수되지 않는 특별한 캡핑 시약이 필요하다. 추가로, 얻어진 모노머들은 화학적으로 안정하지 않다. 나아가, 올리고뉴클레오티드 유도체의 단리 수율이 높지 않다. 올리고뉴클레오티드 유도체의 낮은 수율은 탈보호 단계 하에서 분해 반응에 의해 야기되는 것으로 여겨진다.
WO2010/064146 공보는 뉴클레오티드의 유도체의 생산 방법을 개시한다. 거기에서 개시된 방법은 상업적으로 입수되지 않는 특별한 캡핑 시약이 필요로 한다. 나아가, 올리고뉴클레오티드 유도체의 단리 수율이 높지 않다. 올리고뉴클레오티드 유도체의 낮은 수율은 탈보호 단계 하에서 분해 반응에 의해 야기되는 것으로 여겨진다. 이 경향은 뉴클레오티드 유도체의 길이가 길어질 때 강하게 뚜렷해진다.
WO2012/039448 공보는 입체제어된 인 원자-변경된 올리고뉴클레오티드 유도체를 생산하기 위해 사용되는 비대칭 보조 그룹을 개시한다.
[특허문헌 1] JP 2005-89441 A [특허문헌 2] WO2010/064146 A [특허문헌 3] WO2012/039448 A
본 발명의 한 측면은 키랄 시약 또는 그의 염에 관련된다. 상기 키랄 시약은 하기 화학식 (I)을 갖는다.
Figure 112015015674384-pct00001
식 (I)에서, G1 및 G2 는 독립적으로 수소 원자, 니트로기(-NO2), 할로겐 원자, 시아노기(-CN), 식 (II), (III) 또는 (V)의 그룹이거나, 또는 G1 및 G2 는 모두 함께 식 (IV)의 그룹을 형성한다.
Figure 112015015674384-pct00002
식 (II)에서, G21 내지 G23 는 독립적으로 수소 원자, 니트로기, 할로겐 원자, 시아노기 또는 C1 -3 알킬기이다.
Figure 112015015674384-pct00003
식 (III)에서, G31 내지 G33 는 독립적으로 C1 -4 알킬기, C6 -14 아릴기 C1 -4 알콕시기, C7 -14 아르알킬기, C1 -4 알킬 C6 -14 아릴기, C1 -4 알콕시 C6 -14 아릴기, 또는 C6 -14 아릴 C1 -4 알킬기이다.
Figure 112015015674384-pct00004
식 (IV)에서, G41 내지 G46 는 독립적으로 수소 원자, 니트로기, 할로겐 원자, 시아노기 또는 C1 -3 알킬기이다.
Figure 112015015674384-pct00005
식 (V)에서, G51 내지 G53 는 독립적으로 수소 원자, 니트로기, 할로겐 원자, 시아노기, C1 -3 알킬기 또는 C1 -3 알킬옥시기이다.
G3 및 G4 는 독립적으로 수소 원자, C1 -3 알킬기, C6 -14 아릴기이거나, 또는 G3 및 G4 는 둘이 함께 식 (I) 내 NH 모이어티와 함께 3 내지 16 개의 탄소 원자를 갖는 헤테로원자-함유 고리를 형성한다.
바람직한 구체예는 키랄 시약이 하기 화학식 (I')을 갖는다.
Figure 112015015674384-pct00006
식 (I')에서, G1 및 G2 는 상기한 바와 동일하다. 즉, G1 및 G2 는 독립적으로 수소 원자, 니트로기, 할로겐 원자, 시아노기, 식 (II) 또는 (III)의 그룹이거나, 또는 G1 및 G2 는 둘이 함께 식 (IV)의 그룹을 형성한다.
바람직한 구체예는 키랄 시약이 화학식 (I')을 갖고 G1 및 G2는 각각 식 (II)의 그룹이고, 여기에서 G21 내지 G23 는 독립적으로 수소 원자, 니트로기, 할로겐 원자, 시아노기 또는 C1 -3 알킬기이다.
바람직한 구체예는 키랄 시약이 화학식 (I')을 갖고 G1 및 G2 는 각각 식 (II)의 그룹이고, G21 내지 G23 은 각각 수소 원자이다.
바람직한 구체예는 키랄 시약이 화학식 (I')을 갖고 G1 은 수소 원자이고, G2 는 식 (II)의 그룹이고, G21 내지 G23 는 독립적으로 수소 원자, 니트로기, 할로겐 원자, 시아노기 또는 C1 -3 알킬기이다.
바람직한 구체예는 키랄 시약이 화학식 (I')을 갖고 G1 은 수소 원자이고, G2 는 식 (II)의 그룹이고, G21 및 G22 은 각각 수소 원자이고, G23 은 니트로기이다.
바람직한 구체예는 키랄 시약이 화학식 (I')을 갖고 G1 은 수소 원자이고, G2 는 식 (III)의 그룹이며, G31 내지 G33 는 독립적으로 C1 -4 알킬기, C6 -14 아릴기, C7-14 아르알킬기, C1 -4 알킬 C6 -14 아릴기, C1 -4 알콕시 C6 -14 아릴기, 또는 C6 -14 아릴 C1-4 알킬기이다.
바람직한 구체예는 키랄 시약이 화학식 (I')을 갖고 G1 은 수소 원자이고, G2 는 식 (III)의 그룹이며, G31 내지 G33 는 독립적으로 C1 -4 알킬기, C6 아릴기, C7 -10 아르알킬기, C1 -4 알킬 C6 아릴기, C1 -4 알콕시 C6 아릴기, 또는 C6 아릴 C1 -4 알킬기이다.
바람직한 구체예는 키랄 시약이 화학식 (I')을 갖고 G1 은 수소 원자이고, G2 는 식 (III)의 그룹이며, G31 내지 G33 는 독립적으로 C1 -4 알킬기 또는 C6 아릴기이다. C1 -4 알킬기의 예는 메틸기, 에틸기, n-프로필기, iso-프로필기, n-부틸기 및 tert-부틸기이다.
바람직한 구체예는 키랄 시약이 화학식 (I')을 갖고 G1 은 수소 원자이고, G2 는 식 (III)의 그룹이며, G31 내지 G33 는 독립적으로 C1 -4 알킬기이다.
바람직한 구체예는 키랄 시약이 화학식 (I')을 갖고 G1 은 수소 원자이고, G2 는 식 (III)의 그룹이며, G31 및 G33 은 C6 아릴기이고 G32 는 C1 -4 알킬기이다.
바람직한 구체예는 키랄 시약이 화학식 (I')을 갖고 G1 및 G2 는 함께 식 (IV)의 그룹을 형성하고, G41 내지 G46 는 독립적으로 수소 원자, 니트로기, 할로겐 원자, 시아노기 또는 C1 -4 알킬기이다.
바람직한 구체예는 키랄 시약이 화학식 (I')을 갖고 G1 및 G2 는 함께 식 (IV)의 그룹을 형성하고, 여기에서 G41 내지 G46 은 각각 수소 원자이다.
바람직한 구체예는 키랄 시약이 화학식 (I')을 갖고 G1 은 수소 원자이고, G2 는 식 (V)의 그룹이다. 추가로 G51 내지 G53 은 각각 독립적으로 수소 원자, 니트로기, 메틸기, 또는 메톡시기이다. 보다 바람직한 구체예는 G1 은 수소 원자이고, G2 는 식 (V)의 그룹이고, 여기에서 G51 및 G53 은 각각 수소 원자이고, G53 은 4-메틸기이다.
바람직한 구체예는 키랄 시약이 III-a, III-b, V-a, VII-a, VII-b, IX-a, IX-b, XI-a, XIII-a 및 XIII-b 중 하나로부터 선택된다:
( S )-2-( 메틸디페닐실릴 )-1-(( S )- 피롤리딘 -2-일)에탄올 (III-a)
( R )-2-( 메틸디페닐실릴 )-1-(( R )-1- 피롤리딘 -2-일)에탄올 (III-b)
( S )-2-( 트리메틸실릴 )-1-(( S )-1- 피롤리딘 -2-일)에탄올 (V-a)
( R )-2,2- 디페닐 -1-(( S )- 피롤리딘 -2-일)에탄올 (VII-a)
( S )-2,2- 디페닐 -1-(( R )- 피롤리딘 -2-일)에탄올 (VII-b)
( R )-2-(4- 니트로페닐 )-1-(( S )- 피롤리딘 -2-일)에탄올 (IX-a)
( S )-2-(4- 니트로페닐 )-1-(( R )- 피롤리딘 -2-일)에탄올 (IX-b)
( R )-( 9H - 플루오로ren -9-일)(( S )- 피롤리딘 -2-일)메탄올 (XI-a)
( S )-2- Tosyl -1-(( S )-1- 트리틸피롤리딘 -2-일)에탄올 (XIII-a)
( R )-2- Tosyl -1-(( R )-1- 트리틸피롤리딘 -2-일)에탄올 (XIII-b)
본 발명의 두번째 측면은 식 (Va) 또는 (Vb)에 의해 표현되는 뉴클레오사이드 3'-포스포아미다이트 유도체에 관한 것이다.
Figure 112015015674384-pct00007
식 (Va) 및 (Vb)에서, G1 내지 G4 는 상기한 바와 동일하고, G5 는 하이드록실기의 보호기이고, Bs는 하기 식 (VI) 내지 (XI) 또는 그의 유도체에 의해 표현되는 그룹으로부터 선택되는 기이다.
Figure 112015015674384-pct00008
Bs의 예는 아데닌, 티민, 시토신, 구아닌, 우라실, 5-메틸시토신 또는 그의 유도체이다.
R2 는 수소, -OH, -SH, -NRdRd, -N3, 할로겐, 알킬, 알케닐, 알키닐, 알킬-Y1-, 알케닐-Y1-, 알키닐-Y1-, 아릴-Y1-, 헤테로아릴-Y1-, -ORb, 또는 -SRb이고, 여기에서 Rb 는 블로킹 모이어티이다.
Y1 는 O, NRd, S, 또는 Se이다.
Rd 는 독립적으로 수소, 알킬, 알케닐, 알키닐, 아릴, 아실, 치환된 실릴, 카바메이트, -P(O)(Re)2, 또는 -HP(O)(Re)이다.
Re 는 독립적으로 수소, 알킬, 아릴, 알케닐, 알키닐, 알킬-Y2-, 알케닐-Y2-, 알키닐-Y2-, 아릴-Y2-, 또는 헤테로아릴-Y2-, 또는 Na+, Li+, 또는 K+인 양이온이다.
Y2 는 O, NRd, 또는 S이다.
R3 은 -CH2-, -(CH2)2-, -CH2NH-, 또는 -CH2N(CH3)-에 의해 표현되는 그룹이다.
G5 의 예는 트리틸, 4-모노메톡시트리틸, 4,4'-디메톡시트리틸, 4,4',4''-트리메톡시트리틸, 9-페닐잔틴-9-일 (Pixyl) 및 9-(p-메톡시페닐)잔틴-9-일 (MOX)이다.
상기 두번째 측면의 바람직한 구체예는 뉴클레오사이드 3'-포스포아미다이트 유도체가 식 (Va') 또는 (Vb')에 의해 표현되는 것이다.
Figure 112015015674384-pct00009
식 (Va') 및 (Vb')에서, G1, G2, G5, Bs, R2, 및 R3 은 상기한 바와 동일하다.
본 발명의 세 번째 측면은 입체제어된 인 원자-수식 올리고뉴클레오티드 유도체의 합성 방법에 관한 것이다.
첫번째 단계는 비키랄 H-포스포네이트 모이어티를 포함하는 분자를, 첫번째 활성화 시약 및 키랄 시약 또는 그의 염과 반응시켜 모노머를 형성하는 단계이다. 상기 키랄 시약은 화학식 (I) 또는 (I')를 가지고, 상기 모노머는 식 (Va), (Vb), (Va'), 또는 (Vb')에 의해 표현될 수 있다. 상기 모노머는 두번째 활성화 시약 및 뉴클레오사이드와 반응하여 축합 중간체를 형성한다. 다음 단계는 상기 축합 중간체를 키랄 X-포스포네이트 모이어티를 포함하는 핵산으로 전환하는 단계이다.
본 방법에 기초하여, 시작 물질로서 안정하고 상업적으로 입수가능한 물질을 사용하는 것이 가능하다. 비키랄 시작 물질을 이용하여 입체제어된 인 원자-수식 올리고뉴클레오티드 유도체를 생산하는 것이 가능하다.
실시예에서 볼 수 있는 바와 같이, 본 발명의 방법은 탈보호 단계 하에서의 분해를 야기하지 않는다. 또한 상기 방법은 인 원자-수식 올리고뉴클레오티드 유도체를 생산하기 위해 특별한 캡핑 시약을 요구하지 않는다.
본 발명의 네번째 측면은 키랄 모노머를 이용한 입체제어된 인 원자-수식 올리고뉴클레오티드 유도체의 합성 방법에 관한 것이다.
첫번째 단계는 식 (Va), (Vb), (Va'), 또는 (Vb')에 의해 표현되는 뉴클레오사이드 3'-포스포아미다이트 유도체를 두번째 활성화 시약 및 뉴클레오사이드와 반응시켜 축합 중간체를 형성하는 것이다. 두번째 단계는 상기 축합 중간체를 키랄 X-포스포네이트 모이어티를 포함하는 핵산으로 전환하는 것이다.
본 명세서 내에 개시된 모든 문헌 및 특허 출원은 마치 각각의 개별적인 문헌 또는 특허출원이 구체적으로 그리고 개별적으로 참조로서 포함되는 것으로 나타낸 것과 같은 정도로 여기에 그 전체로서 참조로 포함된다.
용어 "핵산"은 폴리- 또는 올리고-리보뉴클레오티드 (RNA) 및 폴리- 또는 올리고-데옥시리보뉴클레오티드 (DNA); 핵염기 및/또는 수식 핵염기의 N-글리코시드 또는 C-글리코시드로부터 유래된 RNA 또는 DNA; 당 및/또는 수식 당으로부터 유래된 핵산; 및 포스페이트 브릿지 및/또는 수식 인-원자 브릿지로부터 유래된 핵산을 포함한다. 상기 용어는 핵염기, 수식 핵염기, 수식 당, 포스페이트 브릿지 또는 수식 인 원자 브릿지의 임의의 조합을 함유하는 핵산들을 포함한다. 예들은, 이에 제한되는 것은 아니나, 리보스 모이어티 함유 핵산, 데옥시리보스 모이어티 함유 핵산, 리보스 및 데옥시리보스 모이어티를 둘다 함유하는 핵산, 리보스 및 수식 리보스 모이어티를 함유하는 핵산을 포함한다. 접두사 폴리-는 약 1 내지 약 10,000개의 뉴클레오티드 모노머 유닛을 함유하는 핵산을 말하고, 여기에서 접두사 올리고-는 약 1 내지 약 200개의 뉴클레오티드 모노머 유닛을 함유하는 핵산을 말한다.
용어 "핵염기"는 핵산 특이적 방식으로 하나의 핵산 가닥이 또다른 상보적인 가닥에 결합하는 수소-결합에 관여하는 핵산의 일부분들을 말한다. 가장 흔한 자연적 발생 핵염기는 아데닌 (A), 구아닌 (G), 우라실 (U), 시토신 (C), 5-메틸시토신, 및 티민 (T)이다.
용어 "수식 핵염기"는 핵염기를 대체할 수 있는 모이어티를 말한다. 수식 핵염기는 핵염기의 공간적 배열, 전기적 특성, 또는 일부 다른 물리화학적 특성은 모방하면서 서열 특이적 방식으로 하나의 핵산 가닥이 또다른 가닥에 결합하는 수소-결합의 특성을 보유한다. 수식 핵염기는 녹는 특성 세포내 효소에 의한 인지 또는 올리고뉴클레오티드 듀플렉스의 활성에 실질적으로 영향을 미치지 않고, 5개의 자연적 발생 핵염기(우라실, 티민, 아데닌, 시토신, 또는 구아닌) 모두와 짝을 이룰 수 있다.
용어 "뉴클레오사이드"는 핵염기 또는 수식 핵염기가 당 또는 수식 당에 공유결합적으로 결합하는 모이어티를 말한다.
용어 "당"은 닫힌 및/또는 열린 폼의 모노사카라이드를 말한다. 당은 이에 제한되는 것은 아니나, 리보스, 데옥시리보스, 펜토푸라노스, 펜토피라노스, 및 헥소피라노스 모이어티를 포함한다.
용어 "수식 당"은 당을 대체할 수 있는 모이어티를 말한다. 수식 당은 당의 입체적 배열, 전기적 특성, 또는 일부 다른 물리화학적 특성을 모방한다.
용어 "뉴클레오티드"는 핵염기 또는 수식 핵염기가 당 또는 수식 당에 공유결합적으로 연결되어 있고, 당 또는 수식 당은 포스페이트기 또는 수식 인-원자 모이어티에 공유결합적으로 연결되어 있는 모이어티를 말한다.
용어 "키랄 시약"은 키랄성이거나 에난티오머적으로 순수한(enantiopure) 화합물을 말하며 핵산 합성에 있어 비대칭적 유도를 위해 사용될 수 있다.
용어 "키랄 리간드" 또는 "키랄 보조제(chiral auxiliary)"는 키랄성 또는 에난티오머적으로 순수하고 반응의 입체화학적 결과를 조절하는 모이어티를 말한다.
축합 반응에서, 용어 "활성화 시약"은 덜 반응성이 있는 위치를 활성화시키고 그것을 친핵체에 의해 공격받기 보다 쉽도록 만드는 시약을 말한다.
용어 "블로킹 모이어티"는 기능기의 반응성을 일시적으로 차단하는 그룹을 말한다. 기능기는 블로킹 모이어티의 제거에 의해 후에 드러날 수 있다.
용어 "보론화제(boronating agents)", "황 친전자체(sulfur electrophiles)", "셀레늄 친전자체(selenium electrophiles)"는 인 원자에서의 변형을 위해, 각각 BH3, S, 및 Se 기를 도입하기 위해 사용되는 변형 단계에서 유용한 화합물들을 말한다.
용어 "모이어티"는 한 분자의 특수한 세그먼트 또는 기능기를 말한다. 화학적 모이어티는 종종 한 분자에 내장되어 있거나 수반되는 화학적 실체로 인지되기도 한다.
용어 "고체 지지체"는 핵산의 합성적 대량 생산을 가능하게 하는 어떠한 지지체를 말하며, 필요시 재사용될 수 있다. 여기에서 사용된, 용어는 핵산 합성을 위해 수행되는 반응 단계들에서 사용된 미디어 내에 불용성인 폴리머를 말하며 반응기들을 포함시키기 위해 수식된다.
용어 "연결 모이어티"는 말단 뉴클레오사이드 및 고체 지지체 사이 또는 말단 뉴클레오사이드 및 또다른 뉴클레오사이드, 뉴클레오티드, 또는 핵산 사이에 선택적으로 위치하는 어떠한 모이어티를 말한다.
여기에서 사용된, "치료" 또는 "치료한다" 또는 "경감한다" 또는 "완화한다"는 본 명세서에 있어서 호환 가능하게 사용된다. 이들 용어는 치료상의 이익 및/또는 예방상의 이익을 포함하지만, 이들로 한정되지 않는 이익 또는 원하는 결과를 얻기 위한 어프로치를 가리킨다. 치료상의 이익이란, 처치하고 있는 기초 질환의 제거 또는 완화를 의미한다. 또, 치료상의 이익은 환자가 덧붙여 기초 질환에 이환할 수 있는 것에도 불구하고, 환자에 있어서 개선이 관찰되는, 기초 질환에 관련된 하나 이상의 생리학적 징후의 제거 또는 완화에 의해서 달성된다. 예방상의 이익을 위해서, 조성물은, 특정의 질환을 발병하는 위험성이 있는 환자, 또는 질환의 하나 이상의 생리학적 징후가 보고되고 있는 환자에게, 비록, 이 질환의 진단이 이루어지지 않았다고 하더라도 투여될 수 있다.
여기에서 사용된, "치료 효과"는 상기 설명한 치료상의 이익 및/또는 예방상의 이익을 포함한다. 예방 효과는 질환 또는 증상의 출현을 연기 또는 배제하는 것, 질환 또는 증상의 징후의 발생을 연기 또는 배제하는 것, 질환 또는 증상의 진행을 지연, 정지 또는 반전시키는 것, 도는 그러한 임의의 조합을 포함한다.
"알킬"기는 지방족 탄화수소기를 말한다. 알킬 모이어티는 포화 알킬기 (불포화된 어떠한 단위, 예컨대, 탄소-탄소 이중 결합 또는 탄소-탄소 삼중 결합을 함유하지 않음을 의미)일 수 있거나 알킬 모이어티는 불포화 알킬기(적어도 하나의 불포화 유닛을 포함함을 의미)일 수 있다. 포화이든 불포화이든 알킬 모이어티는 분지쇄, 직쇄이거나 사이클릭 부분을 포함할 수 있다. 알킬의 부착 포인트는 링의 일부가 아닌 탄소 원자에 있다.
"알킬" 모이어티는 1 내지 10개의 탄소 원자를 가질 수 있다(이러한 표현이 여기에서 언제든 나타날 때는, "1 내지 10"과 같은 숫자 범위는 주어진 범위 내에서의 각각의 정수를 말한다; 예컨대, "1 내지 10 개의 탄소 원자"는 알킬기가 1개의 탄소 원자, 2개의 탄소 원자, 3개의 탄소 원자, 등 10개의 탄소 원자를 포함하여 10개에 이르기까지의 탄소원자로 구성될 수 있으나, 본 정의는 또한 숫자 범위가 지정되지 않은 용어 "알킬"이 사용될 때도 통용된다). 알킬은 분지쇄 및 직쇄 알킬기를 모두 포함한다. 여기에서 기술된 화합물들의 알킬기는 "C1-C6 알킬" 또는 유사한 정의로 지정될 수 있다. 일예로써, " C1-C6 알킬"은 알킬 쇄 내에 1, 2, 3, 4, 5, 또는 6 개의 탄소 원자가 있음을, 즉, 알킬 쇄가 메틸, 에틸, 프로필, iso-프로필, n-부틸, iso-부틸, sec-부틸, 및 tert-부틸로 이루어진 그룹으로부터 선택됨을 나타낸다. 전형적인 알킬기는, 이에 제한되는 것은 아니나, 메틸, 에틸, 프로필, 이소프로필, 부틸, 이소부틸, tert-부틸, 펜틸, 헥실, 알릴, 사이클로프로필메틸, 사이클로부틸메틸, 사이클로펜틸메틸, 사이클로헥실메틸, 등을 포함한다. 한 측면에서, 알킬은 C1-C6 알킬이다.
C1 -3 알킬기는 1 내지 3개의 탄소 원자를 갖는 직쇄 또는 분지쇄의 알킬기를 의미한다. C1 -3 알킬기의 예는 메틸, 에틸, 프로필 및 이소프로필이다. C1 -4 알킬기는1 내지 4개의 탄소 원자를 갖는 직쇄 또는 분지쇄의 알킬기를 의미한다. C1 -4 알킬기의 예는 메틸, 에틸, 프로필, 이소프로필, 부틸, 이소부틸, 및 tert-부틸이다.
여기에서 사용된, 용어 "아릴"은 방향족 환을 말하며, 여기에서 환을 형성하는 각각의 원자는 탄소 원자이다. 아릴 환은 5, 6, 7, 8, 9 또는 9개를 넘는 탄소 원자에 의해 형성된다. 아릴기는 치환 또는 비치환된다. 한 측면에서, 아릴기는 페닐 또는 나프탈레닐이다. 구조에 의존하여, 아릴기는 모노라디칼 또는 디라디칼(즉, 아릴렌기)일 수 있다. 한 측면에서, 아릴은 C6-C10 아릴이다.
C6 -14 아릴기는 6 내지 14개의 탄소 원자를 갖는 아릴기를 의미한다. C6 -14 아릴기의 예는 페닐, 바이페닐, 나프틸, 안트라실, 인다닐, 프탈리미딜, 나프티미딜, 페난트리디닐, 및 테트라하이드로나프닐을 포함한다.
용어 "아르알킬"은 아릴기로 치환된 알킬기를 말한다. 적합한 아르알킬기는 벤질, 피콜릴 등을 포함하며, 이들 모두는 선택적으로 치환될 수 있다.
"아실 모이어티"는 알킬(C=O), 아릴(C=O), 또는 아르알킬(C=O)기를 의미한다. 아실 모이어티는 옥시, 아미노, 티오 또는 셀레노인 카보닐 및 탄화수소기 사이의 개재 모이어티(intervening moiety) (Y)을 가질 수 있다. 예를 들어, 아실기는 알킬-Y-(C=O), 아릴-Y-(C=O) 또는 아르알킬-Y-(C=O)일 수 있다.
"알케닐"기는 적어도 하나의 탄소-탄소 이중 결합을 함유하는 직쇄, 분지쇄, 및 사이클릭 탄화수소기이다. 알케닐기는 치환될 수 있다.
"알키닐"기는 적어도 하나의 탄소-탄소 삼중 결합을 함유하는 직쇄, 분지쇄, 및 사이클릭 탄화수소기이다. 알키닐기는 치환될 수 있다.
"알콕시"기는 산소에 연결된 알킬기, 즉. (알킬)-O- 기를 말하며, 여기에서 알킬은 본 명세서에서 정의한 대로이다.. 예로는 메톡시 (-OCH3) 또는 에톡시 (-OCH2CH3) 기를 포함한다.
"알케닐옥시"기는 산소에 연결된 알케닐기, 즉, (알케닐)-O- 기를 말하며, 여기에서 알케닐은 본 명세서에서 정의한 대로이다..
"알키닐옥시"기는 산소에 연결된 알키닐기, 즉, (알키닐)-O- 기를 말하며, 여기에서 알키닐은 본 명세서에서 정의한 대로이다..
"아릴옥시"기는 산소에 연결된 아릴기, 즉, (아릴)-O- 기를 말하며, 여기에서 아릴은 여기에서 정의한 대로인다. 예로는 페녹시 (-OC6H5) 기를 포함한다.
용어 "알킬셀레노"는 치환된 셀레노기가 부착되어 있는 알킬기, 즉, (알킬)-Se- 기를 말하며, 여기에서 알킬은 본 명세서에서 정의한 대로이다..
용어 "알케닐셀레노"는 치환된 셀레노기가 부착되어 있는 알케닐기, 즉, (알케닐)-Se 기를 말하며, 여기에서 알케닐은 본 명세서에서 정의한 대로이다.
용어 "알키닐셀레노"는 치환된 셀레노기가 부착되어 있는 알키닐기, 즉, (알키닐)-Se- 기를 말하여, 여기에서 알키닐은 본 명세서에서 정의한 대로이다.
용어 "알킬티오"는 브릿징 황 원자가 부착되어 있는 알킬기, 즉, (알킬)-S- 기를 말하며, 여기에서 알킬는 본 명세서에서 정의한 대로이다. 예를 들어, 알킬티오는 메틸티오 등이다.
용어 "알케닐티오"는 브릿징 황 원자가 부착되어 있는 알케닐기, 즉, (알케닐)-S- 기를 말하며, 여기에서 알케닐은 본 명세서에서 정의한 대로이다.
용어 "알키닐티오"는 브릿징 황 원자가 부착되어 있는 알키닐기, 즉, (알키닐)-S- 기를 말하며, 여기에서 알키닐기는 본 명세서에서 정의한 대로이다.
용어 "알킬아미노"는 적어도 하나의 알킬기로 치환된 아미노기, 즉, -NH(알킬) 또는 -N(알킬)2을 말하며, 여기에서 알킬은 본 명세서에서 정의한 대로이다.
용어 "알케닐아미노"는 적어도 하나의 알케닐기로 치환된 아미노기, 즉, -NH(알케닐) 또는 -N(알케닐)2을 말하며, 여기에서 알케닐은 본 명세서에서 정의한 대로이다.
용어 "알키닐아미노"는 적어도 하나의 알키닐로 치환된 아미노기, 즉, -NH(알키닐) 또는 -N(알키닐)2 을 말하며, 여기에서 알키닐은 본 명세서에서 정의한 대로이다.
용어 "할로겐"은 불소, 염소, 브롬 및 요오드를 포함하는 것으로 의도된다.
"형광기"는 선택된 파장을 갖는 광으로 여기되는 경우, 다른 파장의 광을 발광하는 분자를 말한다. 형광기에는, 이에 제한되는 것은 아니나, 인돌기, 플루오로세인, 테트라메틸로다민, 텍사스 레드, BODIPY, 5-[(2-아미노에틸)아미노]나프탈렌-l-설폰산(EDANS), 쿠마린 및 루시퍼 옐로우가 포함된다.
"암모늄 이온"은 화학식 NH4 +의 양하전된 다원자 양이온이다.
"알킬암모늄 이온"은 그 수소 원자 중 적어도 하나가 알킬기에 의해 대체된 암모늄 이온이며, 여기에서 알킬은 여기에서 정의된 바이다. 예로는 트리에틸암모늄 이온, N,N-디이소프로필에틸암모늄 이온을 포함한다.
"이미늄 이온"은 식 R2C=NR2 +를 갖는다. R 기는 본 명세서에 있어서 정의되는 알킬, 알케닐, 알키닐, 아릴기이다. "헤테로방향족 이미늄 이온"은 질소 및 그 부착한 R기가 헤테로 방향족환을 형성하는 이미늄 이온을 말한다. "헤테로사이클릭 이미늄 이온"은 질소 및 그 부착한 R기가 헤테로사이클린 환을 형성하는 이미늄 이온을 말한다.
용어 "아미노" 또는 "아민"은 -N(Rh)2 라디컬기를 말하며, 식 중 각각의 Rh 는 명세서에서 특별히 달리 언급하지 않는 한, 독립적으로 수소, 알킬, 플루오로알킬, 카보사이클릴, 카보사이클릴알킬, 아릴, 아르알킬, 헤테로사이클릴, 헤테로사이클릴알킬, 헤테로아릴 또는 헤테로아릴알킬이다. -N(Rh)2 기가 수소 이외의 2개의 Rh 를 갖는 경우, 이들은 질소 원자와 결합하여 4-, 5-, 6-, 또는 7-원의 환을 형성할 수 있다. 예를 들어, -N(Rh)2 는 1-피롤리딘일 및 4-모폴린일을 의미할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아닌다. 수소, 알킬, 플루오로알킬, 카보사이클릴, 카보사이클릴알킬, 아릴, 아르알킬, 헤테로사이클릴, 헤테로사이클릴알킬, 헤테로아릴 또는 헤테로아릴알킬 중 임의의 하나 이상은 독립적으로 알킬, 헤테로알킬, 알케닐, 알키닐, 사이클로알킬, 헤테로사이클로알킬, 아릴, 아릴알킬, 헤테로아릴, 헤테로아릴알킬, 하이드록시, 할로, 시아노, 트리플루오로메틸, 트리플루오로메톡시, 니트로, 트리메틸실릴, -ORi, -SRi, -OC(O)Ri, -N(Ri)2, -C(O)Ri, -C(O)ORi, -OC(O)N(Ri)2, -C(O)N(Ri)2, -N(Ri)C(O)OR, -N(Ri)C(O)Ri, - N(Ri)C(O)N(Ri)2, N(Ri)C(NRi)N(Ri)2, -N(Ri)S(O)tRi (여기에서 t는 1 또는 2), -S(O), 또는 -S(O)tN(Ri)2 (여기에서 t는 1 또는 2)인 하나 이상의 치환기에 의해 경우에 따라 치환될 수 있으며, 여기에서 각각의 Ri 는 독립적으로 수소, 알킬, 플루오로알킬, 카보사이클릴, 카보사이클릴알킬, 아릴, 아르알킬, 헤테로사이클릴, 헤테로사이클릴알킬, 헤테로아릴 또는 헤테로아릴알킬이다.
식-C(O) OR를 가지는 아미노기에 부착하는 모이어티를 말하며, 식 중, R는 알킬, 플루오로알킬, 카르보사이클릴, 카르보사이클릴알킬, 아릴, 아르알킬, 헤테로사이클릴, 헤테로사이클릴알킬, 헤테로아릴 또는 헤테로아릴알킬이다. 예에는 Boc (tert-부틸-OC(O)-), CBz (벤질-OC(O)-), Teoc (Me3SiCH2CH2OC(O)-), alloc (알릴-OC(O)-), 또는 Fmoc (9-플루오레닐메틸-OC(O)-)기가 포함되지만, 이들로 한정되지 않는다.
본 명세서에 있어서 「치환 실릴」은 식 R3Si-를 가지는 부분을 가리킨다. 예에는, TBDMS(tert-부틸디메틸실릴), TBDPS(tert-부틸디페닐실릴) 또는 TMS(트리메틸 실릴)가 포함되지만, 이들로 한정되지 않는다.
용어 "티올"은 -SH기를 말하며, 치환된 티올, 즉 -SRJ 기를 포함하고, 여기에서 RJ 는 각각 독립적으로, 여기에서 정의된 바와 같은, 치환된 또는 비치환된 알킬, 사이클로알킬, 알케닐, 알키닐, 아릴 아르알킬, 헤테로사이클릴 또는 헤테로사이클릴알킬기이다.
본 발명의 첫번째 측면은 키랄 시약 또는 그의 염에 관한 것이다. 키랄 시약은 하기 화학식 (I)을 갖는다. 용어 "키랄 시약"은 입체제어된 인 원자-수식 뉴클레오티드 또는 올리고뉴클레오티드 유도체를 생산하기 위해 사용되는 화학적 조성물을 말한다. 키랄 시약은 뉴클레오티드와 반응하여 키랄 중간체를 형성한다.
Figure 112015015674384-pct00010
식 (I)에서, G1 및 G2 는 독립적으로 수소 원자, 니트로기, 할로겐 원자, 시아노기(-CN), 식 (II), (III) 또는 (V)의 그룹이거나, 또는 G1 및 G2 는 함께 식 (IV)의 그룹을 형성한다.
Figure 112015015674384-pct00011
식 (II)에서, G21 내지 G23 는 독립적으로 수소 원자, 니트로기, 할로겐 원자, 시아노기 또는 C1 -3 알킬기이다. G21 내지 G23 의 바람직한 예는 수소 원자이다.
Figure 112015015674384-pct00012
식 (III)에서, G31 내지 G33 는 독립적으로 C1 -4 알킬기, C6 -14 아릴기 C1 -4 알콕시기, C7 -14 아르알킬기, C1 -4 알킬 C6 -14 아릴기, C1 -4 알콕시 C6 -14 아릴기, 또는 C6 -14 아릴 C1 -4 알킬기이다. C1 -4 알킬 C6 -14 아릴기의 예는 메틸페닐기, 및 에틸페닐기이다. C1 -4 알콕시 C6 -14 아릴기의 예를 메톡시페닐기 및 에톡시페닐기이다. C6 -14 아릴 C1-4 알킬기의 예는 벤질기 및 페닐에틸기이다. G31 내지 G33 의 바람직한 예는 독립적으로 메틸기 및 페닐기이다.
Figure 112015015674384-pct00013
식 (IV)에서, G41 내지 G46 는 독립적으로 수소 원자, 니트로기, 할로겐 원자, 시아노기 또는 C1 -3 알킬기이다. G41 내지 G46 의 바람직한 예는 수소 원자이다.
Figure 112015015674384-pct00014
식 (V)에서, G51 내지 G53 는 독립적으로 수소 원자, 니트로기, 할로겐 원자, 시아노기, C1 -3 알킬기 또는 C1 -3 알킬옥시기이다.
G3 및 G4 는 독립적으로 수소 원자, C1 -3 알킬기, C6 -14 아릴기이거나, 또는 G3 및 G4 는 함께 3 내지 16개의 탄소 원자를 갖는 헤테로원자-함유 고리를 형성한다. G3 및 G4 의 바람직한 예는 이들이 식 (I) 내 NH 모이어티와 함께 3 내지 16개의 탄소 원자를 갖는 헤테로원자-함유 고리를 형성하는 것이다.
바람직한 구체예는 키랄 시약이 하기 화학식 (I')을 갖는다.
Figure 112015015674384-pct00015
식 (I')에서, G1 및 G2 는 상기한 바와 동일하고, G1 및 G2 는 독립적으로 수소 원자, 니트로기, 할로겐 원자, 시아노기, 식 (II) 또는 (III)의 그룹이거나, 또는 G1 및 G2 는 둘이 함께 식 (IV)의 그룹을 형성한다.
바람직한 구체예는 키랄 시약이 화학식 (I')을 갖고 G1 및 G2 는 각각 식 (II)의 그룹이고, 여기에서 G21 내지 G23 는 독립적으로 수소 원자, 니트로기, 할로겐 원자, 시아노기 또는 C1 -3 알킬기이다.
바람직한 구체예는 키랄 시약이 화학식 (I')을 갖고 G1 및 G2 는 각각 식 (II)의 그룹이며 G21 내지 G23 은 각각 수소 원자이다.
바람직한 구체예는 키랄 시약이 화학식 (I')을 갖고 G1 은 수소 원자이고, G2 는 식 (II)의 그룹이고, 및 G21 내지 G23 는 독립적으로 수소 원자, 니트로기, 할로겐 원자, 시아노기 또는 C1 -3 알킬기이다.
바람직한 구체예는 키랄 시약이 화학식 (I')을 갖고 G1 은 수소 원자이고, G2 는 식 (II)의 그룹이고, G21 및 G22 은 수소 원자이고, G23 은 니트로기 (-NO2)이다.
바람직한 구체예는 키랄 시약이 화학식 (I')을 갖고 G1 은 수소 원자이고, G2 는 식 (III)의 그룹이며, G31 내지 G33 는 독립적으로 C1 -4 알킬기, C6 -14 아릴기, C7-14 아르알킬기, C1 -4 알킬 C6 -14 아릴기, C1 -4 알콕시 C6 -14 아릴기, 또는 C6 -14 아릴 C1-4 알킬기이다.
바람직한 구체예는 키랄 시약이 화학식 (I')을 갖고 G1 은 수소 원자이고, G2 는 식 (III)의 그룹이며, G31 내지 G33 는 독립적으로 C1 -4 알킬기, C6 아릴기, C7 -10 아르알킬기, C1 -4 알킬 C6 아릴기, C1 -4 알콕시 C6 아릴기, 또는 C6 아릴 C1 -4 알킬기이다.
바람직한 구체예는 키랄 시약이 화학식 (I')을 갖고 G1 은 수소 원자이고, G2 는 식 (III)의 그룹이며, G31 내지 G33 는 독립적으로 C1 -4 알킬기 또는 C6 아릴기 (페닐기)이다. C1 -4 알킬기의 예는 메틸기, 에틸기, n-프로필기, iso-프로필기, n-부틸기 및 tert-부틸기이다.
바람직한 구체예는 키랄 시약이 화학식 (I')을 갖고 G1 은 수소 원자이고, G2 는 식 (III)의 그룹이며, G31 내지 G33 는 독립적으로 C1 -4 알킬기이다.
바람직한 구체예는 키랄 시약이 화학식 (I')을 갖고 G1 은 수소 원자이고, G2 는 식 (III)의 그룹이며, G31 및 G33 은 C6 아릴기 (페닐기) 및 G32 은 C1 -2 알킬기이다.
바람직한 구체예는 키랄 시약이 화학식 (I')을 갖고 G1 및 G2 는 함께 식 (IV)의 그룹을 형성하고, 및 G41 내지 G46 는 독립적으로 수소 원자, 니트로기, 할로겐 원자, 시아노기 또는 C1 -3 알킬기이다.
바람직한 구체예는 키랄 시약이 화학식 (I')을 갖고 G1 및 G2 는 함께 식 (IV)의 그룹을 형성하고, 여기에서 G41 내지 G46 은 각각 수소 원자이다.
바람직한 구체예는 키랄 시약이 화학식 (I')을 갖고 G1 은 수소 원자이고, G2 는 식 (V)의 그룹이다. 추가로 G51 내지 G53 은 각각 독립적으로 수소 원자, 니트로기, 메틸기, 또는 메톡시기이다. 보다 바람직한 구체예는 G1 은 수소 원자이고, G2 는 식 (V)의 그룹이고, 여기에서 G51 및 G53 은 각각 수소 원자이고, G53 은 4-메틸기이다.
바람직한 구체예는 키랄 시약이 III-a, III-b, V-a, VII-a, VII-b, IX-a, IX-b, XI-a, XIII-a 및 XIII-b 중 하나로부터 선택된다:
( S )-2-( 메틸디페닐실릴 )-1-(( S )- 피롤리딘 -2-일)에탄올 (III-a)
( R )-2-( 메틸디페닐실릴 )-1-(( R )-1- 피롤리딘 -2-일)에탄올 (III-b)
( S )-2-( 트리메틸실릴 )-1-(( S )-1- 피롤리딘 -2-일)에탄올 (V-a)
( R )-2,2- 디페닐 -1-(( S )- 피롤리딘 -2-일)에탄올 (VII-a)
( S )-2,2- 디페닐 -1-(( R )- 피롤리딘 -2-일)에탄올 (VII-b)
( R )-2-(4- 니트로페닐 )-1-(( S )- 피롤리딘 -2-일)에탄올 (IX-a)
( S )-2-(4- 니트로페닐 )-1-(( R )- 피롤리딘 -2-일)에탄올 (IX-b)
( R )-( 9H - 플루오로ren -9-일)(( S )- 피롤리딘 -2-일)메탄올 (XI-a)
( S )-2- Tosyl -1-(( S )-1- 트리틸피롤리딘 -2-일)에탄올 (XIII-a)
( R )-2- Tosyl -1-(( R )-1- 트리틸피롤리딘 -2-일)에탄올 (XIII-b)
키랄 시약은 핵산 또는 수식 핵산과 반응하여 비대칭 보조 그룹이 된다. 입체제어된 인 원자-수식 올리고뉴클레오티드 유도체를 제작하는 중간체인 뉴클레오사이드 3'-포스포아미다이트 유도체는 키랄 시약을 핵산 또는 수식 핵산과 반응시킴으로써 얻어진다.
본 발명의 두번째 측면은 식 (Va) 또는 (Vb)에 의해 표현되는 뉴클레오사이드 3'-포스포아미다이트 유도체에 관한 것이다. 식 (Va) 및 (Vb)의 화합물은 올리고뉴클레오티드 유도체를 합성하는데 사용되는 모노머로서 알려져 있다. 이들 화합물들은 또한 옥스아자포스포리딘 모노머(oxazaphospholidine monomers)로도 알려져 있다. 식 (Vb)에 의해 표현되는 화합물들의 당 모이어티는 BNA 및 LNA (R3 가 메틸렌기 일 때)로서 알려져 있다.
Figure 112015015674384-pct00016
식 (Va) 및 (Vb)에서, G1 내지 G4 는 상기한 바와 동일하고, G5 는 하이드록실기의 보호기이며, Bs는 식 (VI) 내지 (XI) 또는 그의 유도체에 의해 표현되는 기들로부터 선택되는 기이다.
Figure 112015015674384-pct00017
Bs의 예는 아데닌, 티민, 시토신, 구아닌, 우라실, 5-메틸시토신, 또는 그의 유도체이다.
R2는 수소, -OH, -SH, -NRdRd, -N3, 할로겐, 알킬, 알케닐, 알키닐, 알킬-Y1-, 알케닐-Y1-, 알키닐-Y1-, 아릴-Y1-, 헤테로아릴-Y1-, -ORb, 또는 -SRb이고, 여기에서 Rb 는 블로킹 모이어티이다.
Y1 은 O, NRd, S, 또는 Se이다.
Rd 는 독립적으로 수소, 알킬, 알케닐, 알키닐, 아릴, 아실, 치환된 실릴, 카바메이트, -P(O)(Re)2, 또는 -HP(O)(Re)이다.
Re 는 독립적으로 수소, 알킬, 아릴, 알케닐, 알키닐, 알킬-Y2-, 알케닐-Y2-, 알키닐-Y2-, 아릴-Y2-, 또는 헤테로아릴-Y2-, 또는 Na+, Li+, 또는 K+인 양이온이다.
Y2 는 O, NRd, 또는 S이다.
알킬의 바람직한 예는 C1 -10 알킬기이고, 알케닐의 바람직한 예는 C2 -10 알케닐이며, 알키닐의 바람직한 예는 C2 -10 알키닐이고, 아릴의 바람직한 예는 C6 -14 아릴이며, 헤테로아릴의 바람직한 예는 C6 -14 헤테로아릴이다.
R3 는 -CH2-, -(CH2)2-, -CH2NH-, 또는 -CH2N(CH3)-에 의해 표현되는 그룹이다.
G5 의 예는 트리틸, 4-모노메톡시트리틸, 4,4'-디메톡시트리틸, 4,4',4''-트리메톡시트리틸, 9-페닐잔틴-9-일 (Pixyl) 및 9-(p-메톡시페닐)잔틴-9-일 (MOX)이다.
Bs는 아데닌, 티민, 시토신, 구아닌, 또는 그의 유도체이다. Bs는 핵염기 또는 수식 핵염기이다. 상기 유도체의 예는 JP 2005-89441 A에 개시된 것으로 다음과 같이 나타난다.
Figure 112015015674384-pct00018
상기 식에서, R8 내지 R10 은 각각 독립적으로 C1 -10 알킬, C6-C10 아릴, C6-C10 아르알킬, 또는 C6-C10 아릴옥시알킬이다. R8의 바람직한 예는 메틸, 이소프로필, 페닐, 벤질, 및 페녹시메틸이다. R9 및 R10 의 바람직한 예는 C1 -4 알킬기이다.
두번째 측면의 바람직한 구체예는 뉴클레오사이드 3'-포스포아미다이트 유도체가 식 (Va') 또는 (Vb')에 의해 표현되는 것이다.
Figure 112015015674384-pct00019
식 (Va') 및 (Vb')에서, G1, G2, G5, Bs, R2, 및 R3 는 상기한 바와 동일하다. 뉴클레오사이드 3'-포스포아미다이트 유도체는 입체제어된 인 원자-수식 뉴클레오티드 및 올리고뉴클레오티드 유도체를 생산하기 위해 사용되는 키랄 모노머이다.
뉴클레오사이드 3'-포스포아미다이트 유도체의 바람직한 예는 식 1a, 1b, 2a, 2b, 3a, 3b, 4a, 4b, 5a, 5b, 6a, 6b, 7a, 7b, 8a, 8b, 9a, 9b, 10a, 10b, 11a, 11b 12a, 12b, 13a, 13b, 14a, 14b, 15a, 15b, 16a, 16b, 17a, 17b, 18a, 18b, 19a, 19b, 20a, 20b, 21a, 21b, 22a, 22b, 23a, 23b, 또는 24a에 의해 표현된다. 이들 화학식은 실험 섹션에 기술되어 있다.
DMTr은 4,4'-디메톡시트리틸기를 나타내고, TOM은 트리이소프로필실록시메틸기를 나타낸다.
뉴클레오사이드 3'-포스포아미다이트 유도체를 이용한 예들은 예컨대, JP 2005-89441 A에 개시되어 있다. 축합 및 탈보호의 단계들을 반복함으로써, 거기에서 개시된 바와 같이 올리고뉴클레오티드 유도체의 사슬을 연장하는 것이 가능하다.
그러한 올리고뉴클레오티드 유도체의 식은 식 (X)으로 나타난다.
Figure 112015015674384-pct00020
식 (X)에서, X는 설파이드 (=S), C1 -3 알킬, C1 -3 알콕시, C1 -3 알킬티오, C6-C10 아릴, C6-C10 아르알킬, 또는 C6-C10 아릴옥시알킬이다. 바람직하게는, X는 설파이드 (=S)를 나타낸다. "n"은 1 내지 150, 1 내지 100, 1 내지 50, 또는 1 내지 30를 나타내는 정수이다. "n"은 바람직하게는 2 내지 100, 바람직하게는 10 내지 100, 바람직하게는 10 내지 50, 보다 바람직하게는 15 내지 30일 수 있다.
본 발명의 세 번째 측면은 입체제어된 인 원자-수식 올리고뉴클레오티드 유도체의 합성에 관한 것이다. 첫번째 단계는 비키랄 H-포스포네이트 모이어티를 포함하는 분자를, 첫번째 활성화 시약 및 키랄 시약 또는 그의 염과 반응시켜 모노머를 형성하는 단계이다. 키랄 시약은 화학식 (I) 또는 (I')를 가지며, 상기 모노머는 식 (Va), (Vb), (Va'), 또는 (Vb')에 의해 표현될 수 있다. 모노머는 두번째 활성화 시약 및 뉴클레오사이드와 반응하여 축합 중간체를 형성한다. 다음 단계는 축합 중간체를 키랄 X-포스포네이트 모이어티를 포함하는 핵산으로 전환하는 단계이다. 상기 방법은 기본적으로 WO 2010/064146 공보에 개시되어 있다. 거기에서 핵심적인 단계는 루트 A 및 루트 B로서 개시되어 있다. 상기 방법에, 본 발명의 키랄 시약이 사용된다.
첫번째 도식은 키랄 올리고의 합성에 관한 것이다.
Figure 112015015674384-pct00021

활성화 단계
비키랄 H-포스포네이트 모이어티를 첫번째 활성화 시약으로 처리하여 첫번째 중간체를 형성하다. 한 구체예에서, 상기 첫번째 활성화 시약은 축합 단계 동안 반응 혼합물에 가해진다. 첫번째 활성화 시약의 사용은 상기 반응에 사용되는 용매와 같은 반응 조건에 의존적이다. 첫번째 활성화 시약의 예는 포스진, 트리클로로메틸 클로로포르메이트, 비스(트리클로로메틸)카보네이트 (BTC), 옥살릴 클로라이드, Ph3PCl2, (PhO)3PCl2 , N,N'-비스(2-옥소-3-옥사졸리딘일)포스피닉 클로라이드 (BopCl), 1,3-디메틸-2-(3-니트로-1,2,4-트리아졸-1-일)-2-피롤리딘-1-일-1,3,2-디아자포스포리디늄 헥사플루오로포스페이트 (MNTP), 또는 3-니트로-1,2,4-트리아졸-1-일-트리스(피롤리딘-1-일)포스포늄 헥사플루오로포스페이트 (PyNTP).
비키랄 H-포스포네이트 모이어티의 예는 상기 도식에 나타난 화합물이다. DBU는 1,8-디아자바이사이클로[5.4.0]운데크-7-엔을 나타낸다. H+DBU는, 예를 들어, 암모늄 이온, 알킬암모늄 이온, 헤테로방향족 이미늄 이온, 또는 헤테로사이클릭 이미늄 이온일 수 있으며, 이들 중 어느 하나는 제1급, 제2급, 제3급 또는 제4급이며, 또는 1가 금속 이온일 수 있다.
키랄 시약과의 반응
첫번째 활성화 단계 후, 활성화된 비키랄 H-포스포네이트 모이어티는 식 (I) 또는 (I')로 나타낸 키랄 시약과 반응하여 식 (Va), (Vb), (Va'), 또는 (Vb')의 키랄 중간체를 형성한다.
입체특이적 축합 단계
식 Va ((Vb), (Va'), 또는 (Vb'))의 키랄 중간체를 두번째 활성화 시약 및 뉴클레오사이드와 반응시켜 축합 중간체를 형성한다. 상기 뉴클레오사이드는 고체화될 수 있다. 두번째 활성화시약의 예는 4,5-디시아노이미다졸 (DCI), 4,5-디클로로이미다졸, 1-페닐이미다졸리움 트리플레이트 (PhIMT), 벤즈이미다졸리움 트리플레이트 (BIT), 벤즈트리아졸, 3-니트로-l,2,4-트리아졸(NT), 테트라졸, 5-에틸티오테트라졸 (ETT), 5-벤질티오테트라졸(BTT), 5-(4-니트로페닐)테트라졸, N-시아노메틸피롤리디늄 트리플레이트 (CMPT), N-시아노메틸피페리디늄 트리플레이트, N-시아노메틸디메틸암모늄 트리플레이트이다. 식 Va ((Vb), (Va'), 또는 (Vb'))의 키랄 중간체는 모노머로서 단리될 수 있다. 대개, Va ((Vb), (Va'), 또는 (Vb'))의 중간체는 단리되지 않고 뉴클레오사이드 또는 수식 뉴클레오사이드와 함께 동일한 포트에서 반응을 겪어 키랄 포스파이트 화합물, 축합 중간체를 제공한다. 다른 구체예에서, 상기 방법이 고상 합성을 통해 수행될 때, 상기 화합물을 포함하는 고상 지지체를 여과하여 부산물, 불순물 및/또는 시약을 없앤다.
캡핑 단계
최종 핵산이 다이머보다 큰 경우, 미반응 -OH 모이어티를 블로킹기로 캡핑하고 화합물중의 키랄 보조제 또한 블로킹기로 캡핑하여 캡핑된 축합 중간체를 형성할 수도 있다. 최종 핵산이 다이머라면, 캡핑 단계는 필요하지 않다.
수식 단계
화합물은 친전자체(electrophile)와의 반응에 의해 수식된다. 캡핑된 축합 중간체는 수식단계에서 수행될 수 있다. 본 발명의 일부 구체예에서, 수식 단계는 황 친전자체, 셀레늄 친전자체 또는 보론화제를 이용하여 수행된다. 수식 단계의 바람직한 예는 산화(oxidation) 및 황화(sulfurization)의 단계이다.
본 발명의 일부 구체예에서, 황 친전자체는 하기 식 중 하나를 갖는 화합물이다:
S8 (식 B), Z1-S-S-Z2, 또는 Z1-S-V-Z2.
Z1 및 Z2 는 독립적으로 알킬, 아미노알킬, 사이클로알킬, 헤테로사이클릭, 사이클로알킬알킬, 헤테로사이클로알킬, 아릴, 헤테로아릴, 알킬옥시, 아릴옥시, 헤테로아릴옥시, 아실, 아미드, 이미드, 또는 티오카보닐이거나, 또는 Z1 및 Z2 는 함께 치환 또는 비치환될 수 있는, 3 내지 8 원의 알리사이클릭 또는 헤테로사이클릭 환을 형성하며, V는 SO2, O, 또는 NRf이고, Rf 는 수소, 알킬, 알케닐, 알키닐, 또는 아릴이다.
본 발명의 일부 구체예에서, 황 친전자체는 하기 식 A, B, C, D, E, 또는 F의 화합물이다:
Figure 112015015674384-pct00022
본 발명의 일부 구체예에서, 셀레늄 친전자체는 하기 식 중 하나를 갖는 화합물이다:
Se (식 G), Z3-Se-Se-Z4, 또는 Z3-Se-V-Z4
Z3 및 Z4 는 독립적으로 알킬, 아미노알킬, 사이클로알킬, 헤테로사이클릭, 사이클로알킬알킬, 헤테로사이클로알킬, 아릴, 헤테로아릴, 알킬옥시, 아릴옥시, 헤테로아릴옥시, 아실, 아미드, 이미드, 또는 티오카보닐이거나, 또는 Z3 및 Z4 는 함께 치환 또는 비치환될 수 있는, 3 내지 8원의 알리사이클릭 또는 헤테로사이클릭환을 형성할 수 있으며, V는 SO2, S, O, 또는 NRf이고, Rf 는 수소, 알킬, 알케닐, 알키닐, 또는 아릴이다.
본 발명의 일부 구체예에서, 셀레늄 친전자체는 식 G, H, I, J, K, 또는 L의 화합물이다.
Figure 112015015674384-pct00023
본 발명의 일부 구체예에서, 보론화제는 보란-N,N-di이소프로필에틸아민 (BH3 DIPEA), 보란-피리딘 (BH3 Py), 보란-2-클로로피리딘 (BH3 CPy), 보란-아닐린 (BH3 An), 보란-테트라하이드로피란 (BH3 THF), 또는 보란-디메틸설파이드 (BH3 Me2S)이다.
본 발명의 일부 구체예에서, 수식 단계는 산화 단계이다. 산화 단계는 예컨대, JP 2010-265304 A 및 WO2010/064146에 개시되어 있다.
사슬 신장 사이클 및 탈보호 단계
캡핑된 축합 중간체를 탈블로킹하여 자라나는 핵산 사슬의 5'-말단에 있는 블로킹기를 제거하고 화합물을 제공한다. 화합물은 선택적으로 사슬 신장 사이클에 재진입이 허용되어 축합 중간체, 캡핑된 축합 중간체, 수식 캡핑된 축합 중간체 및 5'-탈보호된 수식 캡핑된 중간체를 형성한다. 사슬 신장 사이클의 적어도 하나의 라운드에 따라, 5'-탈보호된 수식 캡핑된 중간체는 키랄 보조 리간드 및 다른 보호기, 예컨대, 핵염기, 수식 핵염기, 당 및 수식 당 보호기의 제거에 의해 추가로 탈보호되어 핵산을 제공한다. 다른 구체예에서, 5'-OH 모이어티를 포함하는 뉴클레오사이드는 여기에서 기술된 바와 같은 이전의 사슬 신장 사이클로부터의 중간체이다. 또 다른 구체예에서, 5'-OH 모이어티를 포함하는 뉴클레오사이드는 또다른 공지의 핵산 합성 방법으로부터 얻은 중간체이다. 고상 지지체가 사용되는 경우의 구체예들에서, 인-원자 수식 핵산은 고상 지지체로부터 절단된다. 특정 구체예에서, 핵산은 정제의 목적을 위해 고상 지지체 상에 부착된 채 남겨지고 정제 후 고상 지지체로부터 절단된다.
본 발명의 방법에 근거하면, 시작 물질로서 안정하고 상업적으로 입수가능한 물질을 사용하는 것이 가능하다. 비키랄 시작 물질을 이용하여 입체제어된 인 원자-수식 올리고뉴클레오티드 유도체를 생산하는 것이 가능하다.
실시예에 나타낸 바와 같이, 본 발명의 방법은 탈보호 단계 하에서 분해를 야기하지 않는다. 추가로 본 방법은 인 원자 -수식 올리고뉴클레오티드 유도체를 생산하기 위해 특별한 캡핑 시약을 필요로 하지 않는다.
본 발명의 네 번째 측면은 키랄 모노머를 이용한 입체제어된 인 원자-수식 올리고뉴클레오티드 유도체의 합성 방법에 관한 것이다. 첫번째 단계는 식 (Va), (Vb), (Va'), 또는 (Vb')로 나타낸 뉴클레오사이드 3'-포스포아미다이트 유도체를 두번째 활성화 시약 및 뉴클레오사이드와 반응시켜 축합 중간체를 형성하는 단계이다. 두번째 단계는 축합 중간체를 키랄 X-포스포네이트 모이어티를 포함하는 핵산으로 전환시키는 것이다.
두번째 도식은 식 Va ((Vb), (Va'), 또는 (Vb'))의 모노머를 이용한 키랄 올리고의 합성에 관한 것이다. 두번째 도식은 JP 2005-89441 A에 개시된 방법에 기초한다.
Figure 112015015674384-pct00024

상기 도식의 구체적인 조건은 첫번째 도식의 것과 유사하다. 식 Va (Vb), 특히 식 Va' (또는 Vb')의 시작 물질은 화학적으로 한정하다. 실시예에 나타낸 바와 같이, 본 발명의 방법은 탈보호 단계 하에서의 분해를 야기하지 않는다. 추가로 본 방법은 인 원자-수식 올리고뉴클레오티드 유도체를 생산하기 위해 특별한 캡핑 시약을 필요로 하지 않는다.
보조제의 제거를 위한 메커니즘은 다음과 같이 나타난다:
Figure 112015015674384-pct00025
상기 도식에서, Nu는 친핵체(Nucleophile)를 나타낸다. 상기 메커니즘은 보조제의 제거를 위한 이전의 메커니즘과는 다른 것으로 생각된다.
도 1은 4b의 모노머를 이용한 올리고뉴클레오티드 유도체의 생산에서의 UPLC 프로파일이다.
도 2는 25 의 모노머를 이용한 올리고뉴클레오티드 유도체의 생산에서의 UPLC 프로파일이다..
[실시예]
약어
ac: 아세틸
bz : 벤조일
CSO : (1S )-(+)-(10- 캄퍼설포닐 ) 옥사지리딘
DBU : 1,8- 디아자바이사이클로[5.4.0]운데크 -7-엔
DCA : 디클로로아세트산
DCM : 디클로로메탄, CH 2 Cl 2
DMTr : 4,4'- 디메톡시트리틸
Tr : 트리틸 , 트리페닐메틸
MeIm : N - 메틸이미다졸
NIS : N - 요오도숙신이미드
pac: 페녹시아세틸
Ph : 페닐
PhIMT : N - 페닐이미다졸리움 트리플레이트
POS: 3- 페닐 -1,2,4- 디티아졸린 -5-온
TBS: tert - 부틸디메틸실릴
TBDPS : tert - 부틸디페닐실릴
TOM: 트리이소프로필실록시메틸
TFA : 트리플루오로아세트산
[ 실시예 1]
Figure 112015015674384-pct00026
화합물 I-a는 문헌에 기술된 과정에 따라 L-프롤린으로부터 합성하였다 (Guga, P. Curr . Top. Med . Chem . 2007, 7, 695-713.).
[ 실시예 2]
Figure 112015015674384-pct00027
화합물 I-b는 화합물 I-a와 유사한 방식으로 D-프롤린로부터 합성하였다.
[ 실시예 3]
Figure 112015015674384-pct00028
THF (14 mL) 중의 클로로메틸디페닐메틸실란 (4.02 g, 16.3 mmol) 및 마그네슘 (402 mg, 16.3 mmol)으로부터 제조된 THF 중의 메틸디페닐실릴메틸 마그네슘 클로라이드의 용액에 빙냉 하에서 I-a (2.79 g, 8.14 mmol) 함유 THF (30 mL) 용액을 가하였다. 빙냉 하에서 1.5 시간 교반 후, 혼합물을 실온으로 데우고, 30분 동안 교반을 계속하였다. 포화 수성 NH4Cl (100 mL) 을 0℃에서 반응 혼합물에 가하고, 디에틸에테르 (100 mL)로 3회 추출을 수행하였다. 합쳐진 추출물을 Na2SO4 상에서 건조하고, 여과하고 감압하에서 농축하였다. 잔사를 실리카겔 상에서 크로마토그래피하여 무색 폼으로서 II-a를 얻었다 (3.91 g, 87%).
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 7.48-7.08 (25H, m), 4.33-4.23 (1H, m), 3.16-2.89 (3H, m), 2.84 (1H, brs), 1.70-1.54 (1H, m), 1.35 (1H, dd, J = 14.7, 6.3Hz), 1.10 (1H, dd, J = 14.7, 8.1Hz), 1.18-1.05 (1H, m), 1.04-0.90 (1H, m), 0.34 (3H, s), -0.17- -0.36 (1H, m).
[ 실시예 4]
Figure 112015015674384-pct00029
II-a (3.91 g, 7.06 mmol)를 3% DCA를 함유하는 DCM (70 mL) 중에서 용해시키고, 실온에서 10분 동안 교반하였다. 상기 혼합물에 1M NaOH (200 mL)를 가하고, DCM (100 mL)으로 3회 동안 추출을 수행하였다. 합쳐진 추출물을 Na2SO4 상에서 건조하고, 여과하고 감압 하에서 농축하였다. 잔사를 실리카겔 상에서 크로마토그래피하여 옅은 황색 오일로서 III-a를 얻었다 (1.99 g, 90%).
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 7.57-7.52 (5H, m), 7.38-7.33 (5H, m), 3.77 (1H, ddd, J = 8.9, 5.4, 3.5Hz), 3.01 (1H, dt, J = 7.4, 3.6Hz), 2.97-2.79 (2H, m), 2.27 (2H, brs), 1.76-1.53 (4H, m), 1.38 (1H, dd, J = 15.0, 9.0Hz), 1.24 (1H, dd, J = 15.0, 5.4Hz), 0.65 (3H, s); 13C NMR (100.4 MHz, CDCl3) d 137.4, 137.1, 134.6, 134.5, 129.1, 127.8, 69.5, 64.1, 47.0, 25.8, 24.0, 19.6, -3.4. MALDI TOF-MS m/z Calcd for C19H26NOSi [M+H]+ 312.18, found 312.06.
[ 실시예 5]
Figure 112015015674384-pct00030
I-a 대신 I- b 를 이용하여 화합물 II-a와 유사한 방식으로 화합물 II-b를 얻었다. 1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 7.48-7.12 (25H, m), 4.33-4.24 (1H, m), 3.16-2.89 (3H, m), 2.86 (1H, brs), 1.69-1.52 (1H, m), 1.35 (1H, dd, J = 14.4, 6.0Hz), 1.10 (1H, dd, J = 14.4, 8.4Hz), 1.18-1.05 (1H, m), 1.03-0.89 (1H, m), 0.33 (3H, s), -0.19- -0.39 (1H, m); 13C NMR (75.5 MHz, CDCl3) d 144.5, 137.5, 136.8, 134.6, 134.3, 129.8, 129.0, 127.8, 127.7, 127.4, 126.1, 77.9, 71.7, 65.1, 53.5, 25.0, 24.8, 19.6, -4.0. MALDI TOF-MS m/z Calcd for C38H40NOSi [M+H]+ 554.29, found 554.09.
[ 실시예 6]
Figure 112015015674384-pct00031
II-a 대신 II- b 를 이용하여 화합물 III-a와 유사한 방식으로 화합물 III-b를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 7.58-7.52 (5H, m), 7.38-7.33 (5H, m), 3.78 (1H, ddd, J = 9.0, 5.1, 3.6Hz), 3.00 (1H, dt, J = 7.4, 3.3Hz), 2.97-2.78 (2H, m), 2.19 (2H, brs), 1.76-1.53 (4H, m), 1.38 (1H, dd, J = 14.6, 9.0Hz), 1.24 (1H, dd, J = 14.6, 5.1Hz), 0.66 (3H, s); 13C NMR (75.5 MHz, CDCl3) d 137.5, 137.1, 134.5, 134.4, 129.0, 127.7, 69.2, 64.2, 46.9, 25.8, 24.0, 19.7, -3.4. MALDI TOF-MS m/z Calcd for C19H26NOSi [M+H]+ 312.18, found 312.09.
[ 실시예 7]
Figure 112015015674384-pct00032
"클로로메틸디페닐메틸실란" 대신 "클로로메틸트리메틸실란" 을 이용하여 화합물 II-a와 유사한 방식으로 화합물 IV-a를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 7.58-7.51 (5H, m), 7.31-7.14 (10H, m), 4.13 (1H, dt, J = 7.5, 3.0Hz), 3.39-3.31 (1H, m), 3.20-2.99 (2H, m), 2.84 (1H, s), 1.74-1.57 (1H, m), 1.29-1.10 (2H, m), 0.74 (1H, dd, J = 14.4, 7.2Hz), 0.46 (1H, dd, J = 14.4, 7.2Hz), -0.15 (9H, s). MALDI TOF-MS m/z Calcd for C28H36NOSi [M+H]+ 430.26, found 430.09.
[ 실시예 8]
Figure 112015015674384-pct00033
II-a 대신 IV- a 를 이용하여 화합물 III-a와 유사한 방식으로 화합물 V-a를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 3.76 (1H, ddd, J = 8.8, 5.7, 3.3Hz), 3.08 (1H, dt, J = 7.8, 3.3Hz), 3.02-2.87 (2H, m), 2.48 (2H, brs), 1.81-1.58 (4H, m), 0.83 (1H, dd, J = 14.7, 8.7Hz), 0.68 (1H, dd, J = 14.7, 6.0Hz), 0.05 (9H, s); 13C NMR (75.5 MHz, CDCl3) d 69.6, 64.3, 46.9, 25.8, 23.9, 22.0, -0.8. MALDI TOF-MS m/z Calcd for C9H22NOSi [M+H]+ 188.15, found 188.00.
[ 실시예 9]
Figure 112015015674384-pct00034
무수 THF (36 mL) 중의 디페닐메탄 (6.7 mL, 40mmol)의 용액에, 헥산의 n-BuLi (1.67M) 용액을 실온에서 적가하고 1시간 동안 교반하였다. 상기 혼합물에, 톨루엔으로의 반복된 동시증발에 의해 건조된, 무수 THF (40mL) 중의 I-a (3.41g, 10mmol)를 0℃에서 서서히 적가하고, 45분 동안 교반을 계속하였다. 그리고나서 포화 NH4Cl 수성 용액 (100mL) 및 Et2O (100mL)를 가하고, 유기층을 분리하고, 수성상을 Et2O (2 x 100mL)로 추출하였다. 유기층을 합치고, Na2SO4 상에서 건조하고, 여과하고, 감압하에서 농축하였다. 잔사를 실리카겔 상에서 크로마토그래피에 의해 정제하여 흰색 폼으로서 VI-a를 얻었다(1.41g, 28%).
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 7.45-7.01 (23H, m), 6.67-6.61 (2H, m), 4.80 (1H, d, J = 10.8Hz), 3.63 (1H, d, J = 10.8Hz), 3.36-3.27 (1H, m), 3.23-3.09 (1H, m), 3.02-2.89 (1H, m), 2.66 (1H, s), 1.90-1.75 (1H, m), 1.32-1.04 (2H, m), 0- -0.18 (1H, m).
[ 실시예 10]
Figure 112015015674384-pct00035
II-a 대신 VI- a 를 이용하여 화합물 III-a와 유사한 방식으로 화합물 VII-a를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 7.44-7.38 (2H, m), 7.33-7.14 (8H, m), 4.46 (1H, dd, J = 9.9, 3.3Hz), 3.91 (1H, d, J = 9.9Hz), 3.02-2.88 (2H, m), 2.81-2.69 (1H, m), 2.52 (2H, brs), 1.88-1.56 (4H, m); 13C NMR (75.5 MHz, CDCl3) d 142.3, 142.0, 128.6, 128.5, 128.4, 128.2, 126.5, 126.4, 73.5, 60.1, 55.8, 46.6, 25.8, 23.4. MALDI TOF-MS m/z Calcd for C18H22NO [M+H]+ 268.17, found 268.06.
[ 실시예 11]
Figure 112015015674384-pct00036
I-a 대신 I- b 를 이용하여 화합물 VI-a와 유사한 방식으로 화합물 VI-b를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 7.44-7.37 (6H, m), 7.30-7.01 (17H, m), 6.66-6.61 (2H, m), 4.80 (1H, d, J = 10.8Hz), 3.63 (1H, d, J = 10.8Hz), 3.36-3.28 (1H, m), 3.22-3.09 (1H, m), 3.01-2.89 (1H, m), 2.66 (1H, s), 1.90-1.75 (1H, m), 1.29-1.04 (2H, m), 0.00--0.19 (1H, m); 13C NMR (75.5 MHz, CDCl3) d 144.2, 142.9, 141.6, 130.0, 128.5, 128.4, 127.9, 127.8, 127.4, 126.4, 126.2, 77.9, 75.9, 61.9, 55.4, 53.4, 24.7, 24.5. MALDI TOF-MS m/z Calcd for C37H36NO [M+H]+ 510.28, found 510.11.
[ 실시예 12]
Figure 112015015674384-pct00037
VI-a 대신 VI- b 를 이용하여 화합물 VII-a와 유사한 방식으로 화합물 VII-b를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 7.45-7.14 (10H, m), 4.45 (1H, dd, J = 9.9, 3.3Hz), 3.91 (1H, d, J = 9.9Hz), 3.00-2.89 (2H, m), 2.82-2.71 (1H, m), 2.40 (2H, brs), 1.87-1.55 (4H, m); 13C NMR (75.5 MHz, CDCl3) d 142.3, 142.0, 128.5, 128.3, 128.1, 126.3, 126.2, 73.4, 60.1, 55.9, 46.5, 25.8, 23.5. MALDI TOF-MS m/z Calcd for C18H22NO [M+H]+ 268.17, found 268.03.
[ 실시예 13]
Figure 112015015674384-pct00038
"디페닐메탄" 대신 "4-니트로벤질클로라이드"를 이용하여 화합물 VI-a와 유사한 방식으로 화합물 VIII-a를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 8.09-8.03 (2H, m), 7.49-7.43 (6H, m), 7.28-7.09 (11H, m), 4.23 (1H, ddd, J = 8.3, 5.6, 3.0Hz), 3.43-3.33 (1H, m), 3.23-3.11 (1H, m), 3.07-2.96 (1H, m), 2.83 (1H, brs), 2.74 (1H, dd, J = 13.8, 8.4Hz), 2.49 (1H, dd, J = 13.8, 5.1Hz), 1.83-1.67 (1H, m), 1.41-1.17 (2H, m), 0.27-0.08 (1H, m); 13C NMR (75.5 MHz, CDCl3) d 147.3, 146.3, 144.3, 129.8, 129.6, 127.5, 126.3, 123.4, 77.9, 74.8, 63.5, 53.2, 39.5, 25.0, 24.9. MALDI TOF-MS m/z Calcd for C31H31N2O3 [M+H]+ 479.23, found 479.08.
[ 실시예 14]
Figure 112015015674384-pct00039
VI-a 대신 VIII- a 를 이용하여 화합물 VII-a와 유사한 방식으로 화합물 IX-a를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 8.15 (2H, d, J = 8.7Hz), 7.42 (2H, d, J = 8.7Hz), 3.86-3.79 (1H, m), 3.16-3.07 (1H, m), 2.99-2.68 (6H, m), 1.84-1.68 (4H, m); 13C NMR (75.5 MHz, CDCl3) d 147.4, 146.2, 129.9, 123.2, 72.4, 62.0, 46.6, 40.4, 25.7, 24.4. MALDI TOF-MS m/z Calcd for C12H17N2O3 [M+H]+ 237.12, found 237.01.
[ 실시예 15]
Figure 112015015674384-pct00040
I-a 대신 I- b 를 이용하여 화합물 VIII-a와 유사한 방식으로 화합물 VIII-b를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 8.09-8.04 (2H, m), 7.49-7.43 (6H, m), 7.28-7.09 (11H, m), 4.22 (1H, ddd, J = 8.4, 5.6, 3.0Hz), 3.43-3.33 (1H, m), 3.24-3.10 (1H, m), 3.08-2.94 (1H, m), 2.81 (1H, brs), 2.75 (1H, dd, J = 14.0, 8.1Hz), 2.49 (1H, dd, J = 14.0, 5.1Hz), 1.81-1.67 (1H, m), 1.40-1.16 (2H, m), 0.26-0.09 (1H, m); 13C NMR (75.5 MHz, CDCl3) d 147.3, 144.3, 129.8, 129.6, 129.4, 126.3, 123.5, 77.9, 74.8, 63.5, 53.2, 39.5, 25.0, 24.9. MALDI TOF-MS m/z Calcd for C31H31N2O3 [M+H]+ 479.23, found 479.08.
[ 실시예 16]
Figure 112015015674384-pct00041
VIII-a 대신 VIII- b 를 이용하여 화합물 IX-a와 유사한 방식으로 화합물 IX-b를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 8.19-8.13 (2H, m), 7.45-7.39 (2H, m), 3.83 (1H, ddd, J = 7.7, 5.4, 3.9Hz), 3.14 (1H, dt, J = 7.7, 3.9Hz), 3.01-2.87 (2H, m), 2.83 (1H, d, J = 3.3Hz), 2.81 (1H, s), 2.62 (2H, brs), 1.79-1.72 (4H, m); 13C NMR (75.5 MHz, CDCl3) d 147.3, 146.5, 130.0, 123.5, 72.7, 61.7, 46.7, 40.1, 25.8, 24.2. MALDI TOF-MS m/z Calcd for C12H17N2O3 [M+H]+ 237.12, found 237.02.
[ 실시예 17]
Figure 112015015674384-pct00042
"디페닐메탄" 대신 "플루오렌"을 이용하여 화합물 VI-a와 유사한 방식으로 화합물 X-a를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 7.70 (1H, d, J = 7.5Hz), 7.66 (1H, d, J = 7.8Hz), 7.55 (2H, d, J = 7.5Hz), 7.44-7.09 (18H, m), 6.87-6.62 (1H, m), 4.55-4.48 (1H, m), 4.06 (1H, d, J = 7.5Hz), 3.43-3.34 (1H, m), 3.18-3.06 (1H, m), 2.98-2.88 (1H, m), 2.85 (1H, brs), 1.42-1.24 (1H, m), 1.18-1.04 (1H, m), 0.53-0.39 (1H, m), -0.02- -0.20 (1H, m); MALDI TOF-MS m/z Calcd for C37H34NO [M+H]+ 508.26, found 508.12.
[ 실시예 18]
Figure 112015015674384-pct00043
II-a 대신 X- a 를 이용하여 화합물 III-a와 유사한 방식으로 화합물 XI-a를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 7.76 (2H, d, J = 7.5Hz), 7.68 (2H, t, J = 8.0Hz), 7.43-7.35 (2H, m), 7.34-7.25 (2H, m), 4.28 (1H, d, J = 6.3Hz), 4.03 (1H, dd, J = 6.5, 4.2Hz), 3.19-3.11 (1H, m), 2.97-2.88 (1H, m), 2.86-2.76 (1H, m), 2.02 (2H, brs), 1.77-1.53 (3H, m), 1.38-1.23 (1H, m); MALDI TOF-MS m/z Calcd for C18H20NO [M+H]+ 266.15, found 266.04.
[ 실시예 19]
Figure 112015015674384-pct00044
"클로로메틸디페닐메틸실란" 대신 "클로로메틸 p-톨릴 설폰"을 이용하여 화합물 II-a와 유사한 방식으로 화합물 XII-a를 얻었다.
1H NMR (600 MHz, CDCl3) d 7.66 (2H, d, J = 8.4Hz), 7.48-7.44 (6H, m), 7.35 (2H, d, J = 7.2Hz), 7.21-7.13 (9H, m), 4.39-4.36 (1H, m), 3.33 (1H, s), 3.24-3.20 (1H, m), 3.19-3.10 (2H, m), 2.98-2.92 (2H, m), 2.49 (3H, s), 1.55-1.49 (1H, m), 1.33-1.26 (1H, m), 1.12-1.04 (1H, m), 0.22-0.14 (1H, m); 13C NMR (150.9 MHz, CDCl3) d 144.6, 144.5, 136.3, 129.9, 129.5, 128.1, 127.5, 126.2, 78.0, 69.1, 63.9, 60.2, 52.6, 25.5, 24.7, 21.7.
[ 실시예 20]
Figure 112015015674384-pct00045
II-a 대신 XII- a 를 이용하여 화합물 III-a와 유사한 방식으로 화합물 XIII-a를 얻었다.
1H NMR (600 MHz, CDCl3) d 7.82 (2H, d, J = 8.4Hz), 7.37 (2H, d, J = 8.4Hz), 4.01 (1H, ddd, J = 12.0, 5.1, 3.0Hz), 3.32 (1H, dd, J = 14.4, 3.0Hz), 3.25 (1H, dd, J = 14.4, 9.0Hz), 3.16 (1H, dt, J = 7.8, 5.1Hz), 2.90-2.82 (2H, m), 2.46 (3H, s), 2.04 (2H, brs), 1.78-1.63 (3H, m), 1.62-1.55 (1H, m); 13C NMR (150.9 MHz, CDCl3) d 144.5, 136.7, 129.7, 127.7, 67.4, 61.8, 60.1, 46.7, 25.7, 21.4. MALDI TOF-MS m/z Calcd for C13H20NO3S [M+H]+ 270.12, found 270.04.
[ 실시예 2]
Figure 112015015674384-pct00046
I-a 대신 I- b 를 이용하여 화합물 XII-a와 유사한 방식으로 화합물 XII-b를 얻었다.
1H NMR (600 MHz, CDCl3) d 7.66 (2H, d, J = 8.4Hz), 7.47-7.44 (6H, m), 7.35 (2H, d, J = 7.8Hz), 7.21-7.13 (9H, m), 4.37 (1H, dt, J = 8.6, 2.4Hz), 3.33 (1H, s), 3.23-3.20 (1H, m), 3.19-3.12 (2H, m), 2.98-2.92 (2H, m), 2.49 (3H, s), 1.56-1.49 (1H, m), 1.32-1.26 (1H, m), 1.11-1.03 (1H, m), 0.23-0.15 (1H, m); 13C NMR (150.9 MHz, CDCl3) d 144.6, 144.5, 136.3, 129.9, 129.6, 128.1, 127.6, 126.2, 78.0, 69.1, 63.9, 60.2, 52.6, 25.5, 24.7, 21.7.
[ 실시예 21]
Figure 112015015674384-pct00047
XII-a 대신 XII- b 를 이용하여 화합물 XIII-a와 유사한 방식으로 화합물 XIII-b를 얻었다.
1H NMR (600 MHz, CDCl3) d 7.82 (2H, d, J = 8.4Hz), 7.37 (2H, d, J = 8.4Hz), 4.01 (1H, ddd, J = 9.0, 5.1, 3.0Hz), 3.32 (1H, dd, J = 14.4, 3.0Hz), 3.25 (1H, dd, J = 14.4, 9.0Hz), 3.17 (1H, dt, J = 7.2, 5.1Hz), 2.89-2.83 (2H, m), 2.46 (3H, s), 2.04 (2H, brs), 1.79-1.64 (3H, m), 1.62-1.55 (1H, m); 13C NMR (150.9 MHz, CDCl3) d 144.8, 136.6, 129.8, 127.9, 67.7, 61.8, 60.1, 46.8, 25.9, 25.8, 21.6. MALDI TOF-MS m/z Calcd for C13H20NO3S [M+H]+ 270.12, found 270.05.
[ 실시예 22]
Figure 112015015674384-pct00048
건조 톨루엔으로의 반복된 동시증발에 의해 3a (560 mg, 1.80 mmol)를 건조하고, 아르곤 하에서 건조 디에틸에테르 (0.90 mL) 중에 용해시켰다. N-메틸모폴린(400 mL, 3.60 mmol)을 상기 용액에 가하고, 아르곤 하에서 교반하면서 0 ℃에서, 생성된 용액을 건조 디에틸에테르 (0.90 mL) 중의 PCl3 (160 mL, 1.80 mmol)의 용액에 적가하였다. 그런 다음, 혼합물을 실온으로 데워지도록 놔두고 30분 동안 교반하였다. 생성된 N-메틸모폴린 하이드로 클로라이드를 질소 하에서 여과에 의해 제거하고, 여액을 감압 하에서 농축하여 건조시켜 크루드한 2-클로로-1,3,2-옥스아자포스포리딘 유도체를 얻었다. 조물질을 신선하게 증류한 THF (3.6 mL) 중에 용해시켜 0.5 M 용액을 만들고, 이를 추가의 정제없이 뉴클레오사이드 3'-O-옥스아자포스포리딘을 합성하기 위해 사용하였다.
5'-O-(DMTr)-2-N-(페녹시아세틸)-6-O-(시아노에틸)구아노신 (636 mg, 0.84 mmol)은 건조 톨루엔의 반복된 동시증발에 의해 건조하고, 신선하게 증류한 THF (2.5 mL) 중에 아르곤 하에서 용해시켰다. Et3N (0.58 mL, 4.2 mmol)을 가하고, 혼합물을 -78 Ž로 냉각시켰다. THF (3.6 mL, 1.80 mmol) 중의 상응하는 크루드 2-클로로-1,3,2-옥스아자포스포리딘 유도체의 0.5 M 용액을 시린지를 통해 적가하고, 혼합물을 실온에서 15분 동안 교반하였다. 그런 다음, 포화 NaHCO3 수용액 (70 mL) 및 CHCl3 (70 mL)을 가하고, 유기층을 분리하고, 포화 NaHCO3 수용액 (2 x 70 mL)으로 세척하였다. 합쳐진 수성층을 CHCl3 (70 mL)으로 역추출하였다. 유기층을 합치고, Na2SO4 상에서 건조하고, 여과하고, 감암하에서 건조하였다. 잔사를 실리카겔 상에서 크로마토그래피에 의해 정재하여 백색 폼으로서 3a (829 mg, 90%)를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 8.77 (1H, brs), 7.99 (1H, s), 7.54-6.98 (24H, m), 6.81-6.73 (4H, m), 6.35 (1H, dd, J = 8.0, 6.3Hz), 4.89-4.73 (4H, m), 4.68 (2H, brs), 4.05-3.98 (1H, m), 3.75 (6H, s), 3.62-3.46 (1H, m), 3.41-3.20 (3H, m), 3.18-3.04 (1H, m), 3.08 (2H, t, J = 6.6Hz), 2.58-2.36 (2H, m), 1.94-1.59 (2H, m), 1.56 (1H, dd, J = 15.0, 8.7Hz), 1.43 (1H, dd, J = 15.0, 5.7Hz), 1.33-1.16 (2H, m), 0.62 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 153.5 (1P, s).
[ 실시예 23]
[0202]
Figure 112015015674384-pct00049
III-a 대신 III- b 를 이용하여 화합물 3a와 유사한 방식으로 화합물 3b를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 8.80 (1H, brs), 7.96 (1H, s), 7.54-6.96 (24H, m), 6.79-6.71 (4H, m), 6.19 (1H, t, J = 6.6Hz), 4.90-4.73 (4H, m), 4.66 (2H, brs), 4.16-4.08 (1H, m), 3.76 (6H, s), 3.60-3.36 (2H, m), 3.29 (1H, d, J = 3.9Hz), 3.27-3.12 (2H, m), 3.09 (2H, t, J = 6.6Hz), 2.59-2.46 (1H, m), 2.07-1.97 (1H, m), 1.94-1.41 (5H, m), 1.36-1.18 (1H, m), 0.65 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 157.1 (1P, s).
[ 실시예 24]
Figure 112015015674384-pct00050
"5'-O-(DMTr)-2-N-(페녹시아세틸)-6-O-(시아노에틸)구아노신" 대신 "5'-O-(DMTr)-6-N-(벤조일)아데노신"을 이용하여 화합물 3a와 유사한 방식으로 화합물 1a를 얻었다.
1H NMR (600 MHz, CDCl3) d 8.71 (1H, s), 8.12 (1H, s), 8.04 (2H, d, J = 7.8Hz), 7.62-7.15 (23H, m), 6.80-6.75 (4H, m), 6.37 (1H, dd, J = 7.8, 6.0Hz), 4.94-4.88 (1H, m), 4.80 (1H, ddd, J = 12.0, 6.0, 5.4Hz), 4.07-4.04 (1H, m), 3.76 (6H, s), 3.58-3.49 (1H, m), 3.41-3.34 (1H, m), 3.33 (1H, dd, J = 10.8, 4.8Hz), 3.25 (1H, dd, J = 10.8, 4.8Hz), 3.13-3.06 (1H, m), 2.66-2.58 (1H, m), 2.40-2.35 (1H, m), 1.91-1.84 (1H, m), 1.73-1.66 (1H, m), 1.56 (1H, dd, J = 15.0, 9.0Hz), 1.44 (1H, dd, J = 15.0, 5.4Hz), 1.47-1.41 (1H, m), 1.30-1.23 (1H, m), 0.63 (3H, s); 31P NMR (243.0 MHz, CDCl3) d 151.8 (1P, s).
[ 실시예 25]
Figure 112015015674384-pct00051
III-a 대신 III- b 를 이용하여 화합물 1a와 유사한 방식으로 화합물 1b를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 9.06 (1H, brs), 8.76 (1H, s), 8.12 (1H, s), 8.07-7.99 (2H, m), 7.64-7.14 (22H, m), 6.83-6.75 (4H, m), 6.25 (1H, t, J = 6.6Hz), 4.86-4.75 (2H, m), 4.20-4.15 (1H, m), 3.77 (6H, s), 3.61-3.38 (2H, m), 3.36 (1H, dd, J = 10.2, 4.2Hz), 3.27 (1H, dd, J = 10.2, 4.2Hz), 3.27-3.13 (1H, m), 2.71-2.59 (1H, m), 2.12-2.01 (1H, m), 1.94-1.42 (5H, m), 1.36-1.20 (1H, m), 0.67 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 157.3 (1P, s).
[ 실시예 26]
Figure 112015015674384-pct00052
"5'-O-(DMTr)-2-N-(페녹시아세틸)-6-O-(시아노에틸)구아노신" 대신 "5'-O-(DMTr)-4-N-(이소부티릴)시티딘"를 이용하여 화합물 3a와 유사한 방식으로 화합물 2a를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 8.33 (1H, brs), 8.17 (1H, d, J = 7.5Hz), 7.52-7.22 (19H, m), 7.07 (1H, d, J = 7.5Hz), 6.88-6.81 (4H, m), 6.20 (1H, t, J = 6.2Hz), 4.81-4.64 (2H, m), 3.93-3.87 (1H, m), 3.79 (6H, s), 3.59-3.43 (1H, m), 3.39-3.29 (3H, m), 3.16-3.02 (1H, m), 2.69-2.52 (2H, m), 2.12-2.00 (1H, m), 1.91-1.50 (3H, m), 1.47-1.32 (2H, m), 1.27-1.16 (7H, m), 0.60 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 154.8 (1P, s).
[ 실시예 27]
Figure 112015015674384-pct00053
III-a 대신 III- b 를 이용하여 화합물 2a와 유사한 방식으로 화합물 2b를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 8.33 (1H, d, J = 7.5Hz), 8.23 (1H, brs), 7.57-7.22 (19H, m), 7.12 (1H, d, J = 7.5Hz), 6.88-6.81 (4H, m), 6.15 (1H, dd, J = 6.6, 4.2Hz), 4.82-4.63 (2H, m), 4.03-3.97 (1H, m), 3.80 (6H, s), 3.55-3.26 (4H, m), 3.19-3.05 (1H, m), 2.59 (1H, quintet, J = 6.9Hz), 2.39-2.27 (1H, m), 2.21-2.10 (1H, m), 1.90-1.56 (3H, m), 1.50-1.32 (2H, m), 1.26-1.17 (7H, m), 0.66 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 157.2 (1P, s).
[ 실시예 28]
Figure 112015015674384-pct00054
"5'-O-(DMTr)-2-N-(페녹시아세틸)-6-O-(시아노에틸)구아노신" 대신 "5'-O-(DMTr)티미딘"을 이용하여 화합물 3a와 유사한 방식으로 화합물 4a를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 7.58-7.23 (21H, m), 6.86-6.79 (4H, m), 6.35 (1H, dd, J = 8.1, 5.7Hz), 4.79-4.67 (2H, m), 3.83-3.78 (1H, m), 3.78 (6H, s), 3.59-3.43 (1H, m), 3.34 (1H, dd, J = 10.5, 2.4Hz), 3.35-3.24 (1H, m), 3.20 (1H, dd, J = 10.5, 2.4Hz), 3.16-3.02 (1H, m), 2.36-2.26 (1H, m), 2.15-2.02 (1H, m), 1.92-1.77 (1H, m), 1.74-1.59 (1H, m), 1.52 (1H, dd, J = 14.7, 9.0Hz), 1.40 (3H, s), 1.45-1.15 (3H, m), 0.60 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 153.7 (1P, s).
[ 실시예 29]
Figure 112015015674384-pct00055
III-a 대신 III- b 를 이용하여 화합물 4a와 유사한 방식으로 화합물 4b를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 8.46 (1H, brs), 7.59-7.20 (20H, m), 6.86-6.79 (4H, m), 6.26 (1H, t, J = 6.8Hz), 4.78-4.65 (2H, m), 4.01-3.95 (1H, m), 3.78 (6H, s), 3.55-3.40 (1H, m), 3.42 (1H, dd, J = 10.5, 2.7Hz), 3.40-3.28 (1H, m), 3.22 (1H, dd, J = 10.5, 3.0Hz), 3.19-3.06 (1H, m), 2.16-1.95 (2H, m), 1.90-1.54 (3H, m), 1.49-1.35 (1H, m), 1.43 (3H, s), 1.34-1.17 (2H, m), 0.67 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 156.2 (1P, s).
[ 실시예 30]
Figure 112015015674384-pct00056
"5'-O-(DMTr)-2-N-(페녹시아세틸)-6-O-(시아노에틸)구아노신" 대신 "5'-O-(DMTr)-2'-O-메틸-6-N-(벤조일)아데노신"을 이용하여 화합물 3a와 유사한 방식으로 화합물 5a를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 8.66 (1H, s), 8.13 (1H, s), 8.03 (2H, d, J = 7.2Hz), 7.64-7.16 (23H, m), 6.79 (4H, d, J = 8.7Hz), 6.08 (1H, d, J = 6.3Hz), 4.91-4.81 (1H, m), 4.77-4.69 (1H, m), 4.64-4.57 (1H, m), 4.15-4.10 (1H, m), 3.76 (6H, s), 3.60-3.23 (4H, m), 3.35 (3H, s), 3.14-3.00 (1H, m), 1.90-1.19 (6H, m), 0.62 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 155.8 (1P, s).
[ 실시예 31]
Figure 112015015674384-pct00057
III-a 대신 III- b 를 이용하여 화합물 5a와 유사한 방식으로 화합물 5b를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 9.12 (1H, brs), 8.73 (1H, s), 8.24 (1H, s), 8.07-8.01 (2H, m), 7.62-7.17 (22H, m), 6.83-6.77 (4H, m), 6.12 (1H, d, J = 4.8Hz), 4.84-4.73 (2H, m), 4.43 (1H, t, J = 4.8Hz), 4.25-4.19 (1H, m), 3.77 (6H, s), 3.55-3.20 (4H, m), 3.28 (3H, s), 3.16-3.03 (1H, m), 1.90-1.17 (6H, m), 0.65 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 155.0 (1P, s).
[ 실시예 32]
Figure 112015015674384-pct00058
"5'-O-(DMTr)-2-N-(페녹시아세틸)-6-O-(시아노에틸)구아노신" 대신 "5'-O-(DMTr)-2'-O-메틸-4-N-(이소부티릴)시티딘"을 이용하여 화합물 3a와 유사한 방식으로 화합물 6a를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 8.49 (1H, d, J = 7.2Hz), 7.58-7.20 (19H, m), 6.96 (1H, d, J =7.2Hz), 6.90-6.82 (4H, m), 5.98 (1H, s), 4.84 (1H, dd, J = 13.1, 7.5Hz), 4.59 (1H, dt, J = 8.3, 4.5Hz), 4.19-4.13 (1H, m), 3.79 (6H, s), 3.78-3.72 (1H, m), 3.63-3.40 (3H, m), 3.55 (3H, s), 3.36-3.24 (1H, m), 3.09-2.95 (1H, m), 2.59 (1H, septet, J = 6.9Hz), 1.85-1.53 (5H, m), 1.48-1.37 (1H, m), 1.24-1.17 (6H, m), 0.59 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 155.2 (1P, s).
[ 실시예 33]
Figure 112015015674384-pct00059
III-a 대신 III- b 를 이용하여 화합물 6a와 유사한 방식으로 화합물 6b를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 8.62 (1H, d, J = 7.5Hz), 7.57-7.23 (19H, m), 7.02 (1H, d, J =7.5Hz), 6.89-6.81 (4H, m), 5.92 (1H, s), 4.90 (1H, dt, J = 9.0, 5.7Hz), 4.61 (1H, dt, J = 8.7, 4.8Hz), 4.25-4.17 (1H, m), 3.81 (6H, s), 3.67 (1H, d, J = 4.5Hz), 3.62-3.25 (4H, m), 3.38 (3H, s), 3.16-3.02 (1H, m), 2.58 (1H, septet, J = 6.9Hz), 1.87-1.40 (6H, m), 1.26-1.14 (6H, m), 0.64 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 158.2 (1P, s).
[ 실시예 34]
Figure 112015015674384-pct00060
"5'-O-(DMTr)-2-N-(페녹시아세틸)-6-O-(시아노에틸)구아노신" 대신 "5'-O-(DMTr)-2'-O-메틸-2-N-(페녹시아세틸)-6-O-(시아노에틸)구아노신"를 이용하여 화합물 3a와 유사한 방식으로 화합물 7a를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 8.67 (1H, brs), 8.01 (1H, s), 7.56-7.16 (24H, m), 6.83-6.74 (4H, m), 6.08 (1H, d, J = 6.9Hz), 4.85-4.76 (1H, m), 4.84 (2H, t, J = 6.6Hz), 4.65-4.56 (1H, m), 4.59 (2H, brs), 4.48 (1H, dd, J = 6.6, 5.1Hz), 4.09-4.05 (1H, m), 3.75 (6H, s), 3.60-3.42 (2H, m), 3.40-3.26 (2H, m), 3.35 (3H, s), 3.18-3.05 (1H, m), 3.08 (2H, t, J = 6.6Hz), 1.89-1.49 (3H, m), 1.48-1.16 (3H, m), 0.59 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 156.9 (1P, s).
[ 실시예 35]
Figure 112015015674384-pct00061
III-a 대신 III- b 를 이용하여 화합물 7a와 유사한 방식으로 화합물 7b를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 8.74 (1H, brs), 8.09 (1H, s), 7.56-6.94 (24H, m), 6.84-6.71 (4H, m), 6.09 (1H, d, J = 4.8Hz), 4.83-4.70 (2H, m), 4.83 (2H, t, J = 6.6Hz), 4.63 (2H, brs), 4.35 (1H, t, J = 5.0Hz), 4.23-4.16 (1H, m), 3.75 (6H, s), 3.58-3.19 (4H, m), 3.32 (3H, s), 3.16-3.04 (1H, m), 3.07 (2H, t, J = 6.6Hz), 1.90-1.55 (3H, m), 1.48-1.15 (3H, m), 0.64 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 154.6 (1P, s).
[ 실시예 36]
Figure 112015015674384-pct00062
"5'-O-(DMTr)-2-N-(페녹시아세틸)-6-O-(시아노에틸)구아노신" 대신 "5'-O-(DMTr)-2'-O-(메틸)우리딘"을 이용하여 화합물 3a와 유사한 방식으로 화합물 8a를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 7.91 (1H, d, J = 7.8Hz), 7.58-7.20 (19H, m), 6.88-6.80 (4H, m), 5.96 (1H, d, J = 3.3Hz), 5.19 (1H, d, J = 7.8Hz), 4.88-4.78 (1H, m), 4.66-4.57 (1H, m), 4.03-3.95 (1H, m), 3.90-3.74 (1H, m), 3.78 (6H, s), 3.77-3.71 (1H, m), 3.58-3.29 (2H, m), 3.45 (3H, s), 3.13-2.82 (2H, m), 1.88-1.53 (3H, m), 1.49-1.16 (3H, m), 0.60 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 155.3 (1P, s).
[ 실시예 37]
Figure 112015015674384-pct00063
III-a 대신 III- b 를 이용하여 화합물 8a와 유사한 방식으로 화합물 8b를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 8.10 (1H, d, J = 8.4Hz), 7.58-7.20 (19H, m), 6.87-6.79 (4H, m), 5.89 (1H, d, J = 1.5Hz), 5.21 (1H, d, J = 8.4Hz), 4.92-4.82 (1H, m), 4.73-4.63 (1H, m), 4.15-4.08 (1H, m), 3.89-3.73 (1H, m), 3.78 (6H, s), 3.66-3.62 (1H, m), 3.57-3.27 (2H, m), 3.30 (3H, s), 3.17-2.82 (2H, m), 1.89-1.55 (3H, m), 1.55-1.40 (1H, m), 1.35-1.15 (2H, m), 0.66 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 157.5 (1P, s).
[ 실시예 38]
Figure 112015015674384-pct00064
"5'-O-(DMTr)-2-N-(페녹시아세틸)-6-O-(시아노에틸)구아노신" 대신 "5'-O-(DMTr)-2'-데옥시-2'-플루오로-6-N-(벤조일)아데노신"을 이용하여 화합물 3a와 유사한 방식으로 화합물 9a를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 8.64 (1H, s), 8.14 (1H, s), 8.06-8.01 (2H, m), 7.63-7.07 (23H, m), 6.78-6.70 (4H, m), 6.12 (1H, dd, J = 18.0, 2.4Hz), 5.24-5.01 (2H, m), 4.94-4.84 (1H, m), 4.17-4.06 (1H, m), 3.73 (6H, s), 3.55-3.40 (3H, m), 3.30-3.22 (1H, m), 3.03-2.88 (1H, m), 1.92-1.19 (6H, m), 0.62 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 150.5 (1P, d, J = 7.7Hz).
[ 실시예 39]
Figure 112015015674384-pct00065
III-a 대신 III- b 를 이용하여 화합물 9a와 유사한 방식으로 화합물 9b를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 9.07 (1H, brs), 8.80 (1H, s), 8.24 (1H, s), 8.08-8.01 (2H, m), 7.66-7.15 (22H, m), 6.81-6.75 (4H, m), 6.14 (1H, dd, J = 18.0, 1.8Hz), 5.16-4.91 (3H, m), 4.28-4.21 (1H, m), 3.76 (6H, s), 3.57-3.11 (5H, m), 1.82-1.16 (6H, m), 0.65 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 157.8 (1P, d, J = 5.6Hz).
[ 실시예 40]
Figure 112015015674384-pct00066
"5'-O-(DMTr)-2-N-(페녹시아세틸)-6-O-(시아노에틸)구아노신" 대신 "5'-O-(DMTr)-2'-데옥시-2'-플루오로-4-N-(이소부티릴)시티딘"을 이용하여 화합물 3a와 유사한 방식으로 화합물 10a를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 8.66 (1H, brs), 8.41 (1H, d, J = 7.5Hz), 7.55-7.20 (19H, m), 7.01 (1H, d, J = 7.5Hz), 6.89-6.81 (4H, m), 6.06 (1H, d, J = 15.9Hz), 4.85 (1H, dd, J = 51.4, 3.9Hz), 4.84 (1H, dd, J = 12.9, 7.5Hz), 4.77-4.59 (1H, m), 4.15-4.08 (1H, m), 3.79 (6H, s), 3.63-3.29 (4H, m), 3.10-2.96 (1H, m), 2.65 (1H, septet, J = 6.9Hz), 1.85-1.53 (3H, m), 1.48-1.17 (3H, m), 1.21 (3H, d, J = 4.8Hz), 1.19 (3H, d, J = 4.8Hz), 0.59 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 155.5 (1P, d, J = 6.6Hz).
[ 실시예 41]
Figure 112015015674384-pct00067
III-a 대신 III- b 를 이용하여 화합물 10a와 유사한 방식으로 화합물 10b를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 8.53 (1H, d, J = 7.5Hz), 7.57-7.23 (20H, m), 7.10 (1H, d, J = 7.5Hz), 6.89-6.81 (4H, m), 6.10 (1H, d, J = 15.9Hz), 5.00-4.92 (1H, m), 4.84 (1H, dd, J = 51.5, 3.3Hz), 4.75-4.58 (1H, m), 4.24 (1H, d, J = 9.3Hz), 3.81 (6H, s), 3.65-3.39 (3H, m), 3.32-3.06 (2H, m), 2.59 (1H, septet, J = 6.9Hz), 1.88-1.53 (4H, m), 1.49-1.34 (2H, m), 1.27-1.18 (6H, m), 0.65 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 159.0 (1P, d, J = 4.4).
[ 실시예 42]
Figure 112015015674384-pct00068
"5'-O-(DMTr)-2-N-(페녹시아세틸)-6-O-(시아노에틸)구아노신" 대신 "5'-O-(DMTr)-2'-데옥시-2'-플루오로-2-N-(페녹시아세틸)-6-O-(시아노에틸)구아노신" 을 이용하여 화합물 3a와 유사한 방식으로 화합물 11a를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 8.74 (1H, brs), 8.03 (1H, s), 7.55-6.94 (24H, m), 6.80-6.69 (4H, m), 6.21 (1H, dd, J = 14.9, 3.6Hz), 5.34 (1H, dt, J = 52.3, 3.6Hz), 5.01-4.75 (2H, m), 4.84 (1H, t, J = 6.6Hz), 4.62 (2H, brs), 4.15-4.07 (1H, m), 3.73 (6H, s), 3.59-3.29 (4H, m), 3.15-3.00 (1H, m), 3.07 (2H, t, J = 6.6Hz), 1.90-1.49 (3H, m), 1.47-1.12 (3H, m), 0.58 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 155.6 (1P, d, J = 10.9Hz).
[ 실시예 43]
Figure 112015015674384-pct00069
III-a 대신 III- b 를 이용하여 화합물 11a와 유사한 방식으로 화합물 11b를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 8.81 (1H, brs), 8.06 (1H, s), 7.55-6.95 (24H, m), 6.77-6.69 (4H, m), 6.06 (1H, d, J = 17.1Hz), 5.24-5.08 (1H, m), 5.04-4.80 (2H, m), 4.87 (1H, t, J = 6.6Hz), 4.62 (2H, brs), 4.25-4.19 (1H, m), 3.73 (6H, s), 3.58-3.02 (5H, m), 3.10 (2H, t, J = 6.6Hz), 1.90-1.56 (3H, m), 1.50-1.15 (3H, m), 0.63 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 158.0 (1P, d, J = 4.4Hz).
[ 실시예 44]
Figure 112015015674384-pct00070
"5'-O-(DMTr)-2-N-(페녹시아세틸)-6-O-(시아노에틸)구아노신" 대신 "5'-O-(DMTr)-2'-데옥시-2'-플루오로우리딘"을 이용하여 화합물 3a와 유사한 방식으로 화합물 12a를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 7.85 (1H, d, J = 8.1Hz), 7.58-7.20 (19H, m), 6.87-6.79 (4H, m), 5.98 (1H, d, J = 16.5Hz), 5.23 (1H, d, J = 8.1Hz), 4.86-4.61 (3H, m), 3.99 (1H, d, J = 6.9Hz), 3.76 (6H, d, J = 3.0Hz), 3.56-3.34 (4H, m), 3.10-2.96 (1H, m), 1.88-1.74 (1H, m), 1.72-1.52 (2H, m), 1.48-1.16 (3H, m), 0.61 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 154.3 (1P, d, J = 8.9Hz).
[ 실시예 45]
Figure 112015015674384-pct00071
III-a 대신 III- b 를 이용하여 화합물 12a와 유사한 방식으로 화합물 12b를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 8.01 (1H, d, J = 8.4Hz), 7.58-7.20 (19H, m), 6.87-6.79 (4H, m), 6.03 (1H, d, J = 16.2Hz), 5.29 (1H, d, J = 8.4Hz), 4.96 (1H, dd, J = 13.1, 7.5Hz), 4.80-4.54 (2H, m), 4.15 (1H, d, J = 9.0Hz), 3.78 (6H, s), 3.61-3.39 (3H, m), 3.37-3.25 (1H, m), 3.23-3.09 (1H, m), 1.91-1.56 (3H, m), 1.51-1.13 (3H, m), 0.66 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 158.9 (1P, d, J = 4.4Hz).
[ 실시예 46]
Figure 112015015674384-pct00072
"5'-O-(DMTr)-2-N-(페녹시아세틸)-6-O-(시아노에틸)구아노신" 대신 "5'-O-(DMTr)-2'-O-TOM-6-N-(아세틸)아데노신"을 이용하여 화합물 3a와 유사한 방식으로 화합물 13a를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 8.82 (1H, brs), 8.49 (1H, s), 8.10 (1H, s), 7.58-7.17 (19H, m), 6.83-6.73 (4H, m), 6.11 (1H, d, J = 6.6Hz), 5.15 (1H, dd, J = 6.6, 5.4Hz), 4.98-4.77 (4H, m), 4.18-4.11 (1H, m), 3.76 (6H, s), 3.59-3.25 (4H, m), 3.16-3.02 (1H, m), 2.62 (3H, s), 1.91-1.53 (3H, m), 1.49-1.18 (3H, m), 0.96-0.80 (3H, m), 0.90 (18H, s), 0.62 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 156.7 (1P, s).
[ 실시예 47]
Figure 112015015674384-pct00073
III-a 대신 III- b 를 이용하여 화합물 13a와 유사한 방식으로 화합물 13b를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 8.56 (1H, brs), 8.55 (1H, s), 8.13 (1H, s), 7.57-7.17 (19H, m), 6.82-6.73 (4H, m), 6.16 (1H, d, J = 5.7Hz), 5.06 (1H, t, J = 5.6Hz), 4.93 (1H, d, J = 5.1Hz), 4.83 (1H, d, J = 5.1Hz), 4.81-4.69 (2H, m), 4.27-4.19 (1H, m), 3.76 (6H, s), 3.55-3.40 (2H, m), 3.33-3.16 (2H, m), 3.12-2.97 (1H, m), 2.63 (3H, s), 1.88-1.52 (3H, m), 1.45-1.16 (3H, m), 0.91-0.79 (3H, m), 0.86 (18H, s), 0.64 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 154.8 (1P, s).
[ 실시예 48]
Figure 112015015674384-pct00074
"5'-O-(DMTr)-2-N-(페녹시아세틸)-6-O-(시아노에틸)구아노신" 대신 "5'-O-(DMTr)-2'-O-TOM-4-N-(아세틸)시티딘"을 이용하여 화합물 3a와 유사한 방식으로 화합물 14a를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 10.04 (1H, brs), 8.30 (1H, d, J = 7.5Hz), 7.51-7.21 (19H, m), 6.99 (1H, d, J = 7.5Hz), 6.89-6.81 (4H, m), 6.12 (1H, d, J = 3.3Hz), 5.07 (1H, d, J = 4.8Hz), 5.05 (1H, d, J = 4.8Hz), 4.84-4.75 (1H, m), 4.62-4.52 (1H, m), 4.31-4.25 (1H, m), 4.08-4.01 (1H, m), 3.78 (6H, d, J = 3.0Hz), 3.55-3.23 (4H, m), 3.10-2.96 (1H, m), 2.24 (3H, s), 1.84-1.49 (3H, m), 1.46-0.96 (24H, m), 0.58 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 156.5 (1P, s).
[ 실시예 49]
Figure 112015015674384-pct00075
III-a 대신 III- b 를 이용하여 화합물 14a와 유사한 방식으로 화합물 14b를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 10.19 (1H, brs), 8.46 (1H, d, J = 7.5Hz), 7.54-7.23 (19H, m), 7.01 (1H, d, J = 7.5Hz), 6.88-6.79 (4H, m), 6.19 (1H, d, J = 1.8Hz), 5.11 (1H, d, J = 4.8Hz), 5.07 (1H, d, J = 4.8Hz), 4.81-4.71 (1H, m), 4.60-4.51 (1H, m), 4.26-4.18 (2H, m), 3.79 (6H, s), 3.63-3.55 (1H, m), 3.48-3.28 (2H, m), 3.21-2.94 (2H, m), 2.26 (3H, s), 1.81-1.49 (3H, m), 1.43-0.96 (24H, m), 0.62 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 156.4 (1P, s).
[ 실시예 50]
Figure 112015015674384-pct00076
"5'-O-(DMTr)-2-N-(페녹시아세틸)-6-O-(시아노에틸)구아노신" 대신 "5'-O-(DMTr)-2'-O-TOM-2-N-(아세틸)구아노신"을 이용하여 화합물 3a와 유사한 방식으로 화합물 15a를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 7.70 (1H, s), 7.63-7.13 (21H, m), 6.84-6.76 (4H, m), 5.77 (1H, d, J = 8.4Hz), 5.41-5.33 (1H, m), 4.90 (2H, s), 4.78-4.68 (2H, m), 3.86 (1H, brs), 3.75 (3H, s), 3.74 (3H, s), 3.56-3.41 (2H, m), 3.32-2.90 (3H, m), 1.92-1.10 (9H, m), 0.97-0.87 (21H, m), 0.52 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 158.1 (1P, s).
[ 실시예 51]
Figure 112015015674384-pct00077
III-a 대신 III- b 를 이용하여 화합물 15a와 유사한 방식으로 화합물 15b를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 7.77 (1H, s), 7.56-7.15 (21H, m), 6.82-6.75 (4H, m), 5.86 (1H, d, J = 7.5Hz), 5.26-5.17 (1H, m), 4.95 (1H, d, J =5.4Hz), 4.85 (1H, d, J =5.4Hz), 4.78-4.71 (1H, m), 4.59-4.49 (1H, m), 4.10-4.05 (1H, m), 3.74 (6H, s), 3.52-3.37 (2H, m), 3.30-3.18 (1H, m), 3.11-2.85 (2H, m), 1.85-1.15 (9H, m), 0.93-0.84 (21H, m), 0.62 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 152.3 (1P, s).
[ 실시예 52]
Figure 112015015674384-pct00078
"5'-O-(DMTr)-2-N-(페녹시아세틸)-6-O-(시아노에틸)구아노신" 대신 "5'-O-(DMTr)-2'-O-TOM-우리딘" 을 이용하여 화합물 3a와 유사한 방식으로 화합물 16a를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 7.76 (1H, d, J = 8.1Hz), 7.55-7.18 (20H, m), 6.88-6.80 (4H, m), 6.11 (1H, d, J = 6.0Hz), 5.32 (1H, d, J = 8.1Hz), 4.99 (1H, d, J = 5.1Hz), 4.93 (1H, d, J = 5.1Hz), 4.84-4.75 (1H, m), 4.54-4.46 (1H, m), 4.38 (1H, t, J = 5.7Hz), 3.87-3.83 (1H, m), 3.78 (3H, s), 3.77 (3H, s), 3.56-3.42 (1H, m), 3.39-3.28 (1H, m), 3.36 (1H, dd, J = 11.0, 2.7Hz), 3.25 (1H, dd, J = 11.0, 2.7Hz), 3.16-3.03 (1H, m), 1.88-1.12 (6H, m), 1.08-0.97 (21H, m), 0.59 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 156.6 (1P, s).
[ 실시예 53]
Figure 112015015674384-pct00079
III-a 대신 III- b 를 이용하여 화합물 16a와 유사한 방식으로 화합물 16b를 얻었다.
1H NMR (600 MHz, CDCl3) d 7.87 (1H, d, J = 7.8Hz), 7.52-7.48 (4H, m), 7.38-7.21 (16H, m), 6.83-6.79 (4H, m), 6.14 (1H, d, J = 4.8Hz), 5.33 (1H, d, J = 7.8Hz), 4.99 (1H, d, J = 5.4Hz), 4.89 (1H, d, J = 5.4Hz), 4.67 (1H, dd, J = 13.8, 7.2Hz), 4.52 (1H, dt, J = 10.4, 4.8Hz), 4.31 (1H, t, J = 4.8Hz), 4.06-4.03 (1H, m), 3.78 (3H, s), 3.77 (3H, s), 3.47 (1H, dd, J = 10.4, 2.4Hz), 3.47-3.39 (1H, m), 3.22-3.17 (2H, m), 3.00 (1H, ddd, J = 19.5, 10.4, 4.8Hz), 1.82-1.74 (1H, m), 1.68-1.58 (1H, m), 1.56 (1H, dd, J = 14.4, 8.4Hz), 1.38 (1H, dd, J = 14.4, 7.2Hz), 1.31-1.25 (1H, m), 1.26-1.17 (1H, m), 1.08-0.98 (21H, m), 0.63 (3H, s); 31P NMR (243.0 MHz, CDCl3) d 154.3 (1P, s).
[ 실시예 54]
Figure 112015015674384-pct00080
"5'-O-(DMTr)-2-N-(페녹시아세틸)-6-O-(시아노에틸)구아노신" 대신 "5'-O-(DMTr)-2'-O,4'-C-메틸렌-6-N-(벤조일)아데노신"을 이용하여 화합물 3a와 유사한 방식으로 화합물 17a를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 9.10 (1H, brs), 8.76 (1H, s), 8.32 (1H, s), 8.04 (2H, d, J = 7.2Hz), 7.64-7.18 (22H, m), 6.84 (4H, d, J = 8.7Hz), 6.10 (1H, s), 4.76 (1H, d J = 6.9Hz), 4.58 (1H, s), 4.61-4.51 (1H, m), 3.91 (1H, d, J = 7.8Hz), 3.77 (1H, d, J = 7.8Hz), 3.75 (6H, s), 3.50 (1H, s), 3.47-3.33 (1H, m), 3.31-3.19 (1H, m), 3.03-2.88 (1H, m), 1.84-1.09 (6H, m), 0.51 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 152.9 (1P, s).
[ 실시예 55]
Figure 112015015674384-pct00081
III-a 대신 III- b 를 이용하여 화합물 17a와 유사한 방식으로 화합물 17b를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 8.81 (1H, s), 8.30 (1H, s), 8.07-8.00 (2H, m), 7.64-7.17 (22H, m), 6.86-6.79 (4H, m), 6.12 (1H, s), 4.81-4.72 (1H, m), 4.62 (1H, d J = 7.2Hz), 4.57 (1H, s), 3.94 (1H, d, J = 7.8Hz), 3.89 (1H, d, J = 7.8Hz), 3.77 (6H, s), 3.48 (2H, s), 3.46-3.32 (1H, m), 3.24-3.13 (1H, m), 3.10-2.97 (1H, m), 1.84-1.49 (3H, m), 1.42-1.09 (3H, m), 0.58 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 157.3 (1P, s).
[ 실시예 56]
Figure 112015015674384-pct00082
"5'-O-(DMTr)-2-N-(페녹시아세틸)-6-O-(시아노에틸)구아노신" 대신 "5'-O-(DMTr)-2'-O,4'-C-메틸렌-4-N-(이소부티릴)-5-메틸시티딘" 을 이용하여 화합물 3a와 유사한 방식으로 화합물 18a를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 7.88 (1H, brs), 7.58-7.18 (20H, m), 6.88-6.80 (4H, m), 5.65 (1H, s), 4.69-4.60 (1H, m), 4.52 (1H, d, J = 6.6Hz), 4.49 (1H, s), 3.81-3.74 (1H, m), 3.75 (3H, s), 3.73 (3H, s), 3.64 (1H, d, J = 8.1Hz), 3.56 (1H, d, J = 11.1Hz), 3.53 (1H, d, J = 8.1Hz), 3.46 (1H, d, J = 11.1Hz), 3.56-3.40 (1H, m), 3.32-3.20 (1H, m), 3.14-3.00 (1H, m), 1.85-1.12 (6H, m), 1.60 (3H, s), 1.19 (6H, d, J = 6.9Hz), 0.55 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 155.9 (1P, s).
[ 실시예 57]
Figure 112015015674384-pct00083
III-a 대신 III- b 를 이용하여 화합물 18a와 유사한 방식으로 화합물 18b를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 7.86 (1H, brs), 7.56-7.19 (20H, m), 6.88-6.79 (4H, m), 5.69 (1H, s), 4.86-4.76 (1H, m), 4.46 (1H, s), 4.45 (1H, d, J = 7.5Hz), 3.80-3.75 (1H, m), 3.79 (6H, s), 3.74 (1H, d, J = 8.1Hz), 3.69 (1H, d, J = 8.1Hz), 3.51 (1H, d, J = 11.1Hz), 3.44-3.30 (1H, m), 3.39 (1H, d, J = 11.1Hz), 3.29-3.17 (1H, m), 3.11-2.97 (1H, m), 1.86-1.52 (3H, m), 1.64 (3H, s), 1.45-1.10 (3H, m), 1.21 (6H, d, J = 6.6Hz), 0.62 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 158.2 (1P, s).
[ 실시예 58]
Figure 112015015674384-pct00084
"5'-O-(DMTr)-2-N-(페녹시아세틸)-6-O-(시아노에틸)구아노신" 대신 "5'-O-(DMTr)-2'-O,4'-C-메틸렌-2-N-(페녹시아세틸)-6-O-(시아노에틸)구아노신"을 이용하여 화합물 3a와 유사한 방식으로 화합물 19a를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 8.71 (1H, brs), 8.16 (1H, s), 7.50-7.17 (21H, m), 7.09-7.01 (3H, m), 6.86-6.79 (4H, m), 6.03 (1H, s), 4.84 (2H, t, J = 6.6Hz), 4.72 (2H, s), 4.68 (1H, d, J = 7.2Hz), 4.55-4.46 (1H, m), 4.50 (1H, s), 3.90 (1H, d, J = 7.8Hz), 3.77 (1H, d, J = 7.8Hz), 3.75 (6H, s), 3.51 (1H, d, J = 10.8Hz), 3.47 (1H, d, J = 10.8Hz), 3.45-3.21 (2H, m), 3.08 (2H, t, J =6.6Hz), 3.03-2.89 (1H, m), 1.80-1.08 (6H, m), 0.47 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 153.2 (1P, s).
[ 실시예 59]
Figure 112015015674384-pct00085
III-a 대신 III- b 를 이용하여 화합물 19a와 유사한 방식으로 화합물 19b를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 8.86 (1H, brs), 8.13 (1H, s), 7.55-7.17 (21H, m), 7.08-6.98 (3H, m), 6.95-6.78 (4H, m), 6.01 (1H, s), 4.86 (2H, t, J = 6.6Hz), 4.82-4.73 (1H, m), 4.70 (2H, s), 4.64 (1H, d, J = 7.5Hz), 4.49 (1H, s), 3.94 (1H, d, J = 7.8Hz), 3.89 (1H, d, J = 7.8Hz), 3.77 (6H, s), 3.46 (2H, s), 3.45-3.30 (1H, m), 3.24-3.12 (1H, m), 3.09 (2H, t, J =6.6Hz), 3.09-2.96 (1H, m), 1.81-1.50 (3H, m), 1.41-1.06 (3H, m), 0.58 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 157.4 (1P, s).
[ 실시예 60]
Figure 112015015674384-pct00086
"5'-O-(DMTr)-2-N-(페녹시아세틸)-6-O-(시아노에틸)구아노신" 대신 "5'-O-(DMTr)-2'-O,4'-C-메틸렌-5-메틸우리딘" 을 이용하여 화합물 3a와 유사한 방식으로 화합물 20a를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 7.71 (1H, d, J = 0.9Hz), 7.50-7.17 (20H, m), 6.87-6.80 (4H, m), 5.61 (1H, s), 4.69-4.60 (1H, m), 4.55 (1H, d, J = 6.9Hz), 4.41 (1H, s), 3.74 (3H, s), 3.73 (3H, s), 3.64 (1H, d, J = 7.8Hz), 3.55 (1H, d, J = 7.8Hz), 3.53 (1H, d, J = 10.8Hz), 3.46 (1H, d, J = 10.8Hz), 3.56-3.42 (1H, m), 3.35-3.24 (1H, m), 3.13-3.00 (1H, m), 1.85-1.45 (3H, m), 1.55 (3H, d, J = 0.9Hz), 1.41-1.12 (3H, m), 0.56 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 155.1 (1P, s).
[ 실시예 61]
Figure 112015015674384-pct00087
III-a 대신 III- b 를 이용하여 화합물 20a와 유사한 방식으로 화합물 20b를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 7.69 (1H, s), 7.56-7.19 (20H, m), 6.88-6.79 (4H, m), 5.66 (1H, s), 4.87-4.77 (1H, m), 4.47 (1H, d, J = 7.8Hz), 4.40 (1H, s), 3.78 (6H, s), 3.74 (1H, d, J = 7.8Hz), 3.68 (1H, d, J = 7.8Hz), 3.50 (1H, d, J = 10.8Hz), 3.46-3.32 (1H, m), 3.39 (1H, d, J = 10.8Hz), 3.30-3.19 (1H, m), 3.12-2.98 (1H, m), 1.85-1.56 (3H, m), 1.59 (3H, s), 1.46-1.12 (3H, m), 0.63 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 158.1 (1P, s).
[ 실시예 62]
Figure 112015015674384-pct00088
"5'-O-(DMTr)-2-N-(페녹시아세틸)-6-O-(시아노에틸)구아노신" 대신 "5'-O-(DMTr)-2'-O-메톡시에틸-5-메틸우리딘" 을 이용하여 화합물 3a와 유사한 방식으로 화합물 21a를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 7.62-7.18 (21H, m), 6.84 (4H, d, J = 8.7Hz), 6.07 (1H, d, J = 5.7Hz), 4.86-4.76 (1H, m), 4.63-4.54 (1H, m), 4.20 (1H, t, J = 5.4Hz), 3.95-3.89 (1H, m), 3.78 (6H, s), 3.78-3.71 (2H, m), 3.60-3.48 (2H, m), 3.44-3.02 (5H, m), 3.31 (3H, s), 1.88-1.15 (6H, m), 1.35 (3H, s), 0.58 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 156.3 (1P, s).
[ 실시예 63]
Figure 112015015674384-pct00089
III-a 대신 III- b 를 이용하여 화합물 21a와 유사한 방식으로 화합물 21b를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 7.71 (1H, d, J = 1.2Hz), 7.55-7.22 (20H, m), 6.86-6.78 (4H, m), 5.99 (1H, d, J = 3.9Hz), 4.78-4.62 (2H, m), 4.13-4.08 (1H, m), 4.07-4.02 (1H, m), 3.77 (6H, s), 3.77-3.70 (1H, m), 3.65-3.56 (1H, m), 3.52-3.36 (4H, m), 3.33-3.14 (2H, m), 3.29 (3H, s), 3.08-2.94 (1H, m), 1.86-1.72 (1H, m), 1.71-1.55 (2H, m), 1.30 (3H, d, J = 1.2Hz), 1.47-1.16 (3H, m) 0.64 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 155.6 (1P, s).
[ 실시예 64]
Figure 112015015674384-pct00090
III-a 대신 VII- a 를 이용하여 화합물 4a와 유사한 방식으로 화합물 22a를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 7.57 (1H, d, J = 0.9Hz), 7.37-6.94 (20H, m), 6.87-6.78 (4H, m), 6.48 (1H, dd, J = 8.6, 5.7Hz), 5.42 (1H, dd, J = 11.0, 5.1Hz), 4.81-4.71 (1H, m), 4.02 (1H, d, J = 11.0Hz), 3.83 (1H, d, J = 2.1Hz), 3.79 (6H, s), 3.61-3.41 (2H, m), 3.24-3.09 (1H, m), 3.16 (1H, dd, J = 10.8, 2.4Hz), 3.02 (1H, dd, J = 10.8, 2.4Hz), 2.54-2.44 (1H, m), 2.34-2.22 (1H, m), 1.94-1.79 (1H, m), 1.74-1.56 (1H, m), 1.38 (3H, s), 1.38-1.28 (2H, m); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 160.9 (1P, s).
[ 실시예 65]
Figure 112015015674384-pct00091
VII-a 대신 VII- b 를 이용하여 화합물 22a와 유사한 방식으로 화합물 22b를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 7.57 (1H, d, J = 1.5Hz), 7.43-7.11 (20H, m), 6.85-6.78 (4H, m), 6.48 (1H, dd, J = 7.5, 5.7Hz), 5.58 (1H, dd, J = 11.4, 5.1Hz), 4.82-4.73 (1H, m), 4.17-4.02 (2H, m), 3.78 (6H, s), 3.56-3.40 (3H, m), 3.32 (1H, dd, J = 10.7, 2.4Hz), 3.22-3.07 (1H, m), 2.26-2.04 (2H, m), 1.95-1.81 (1H, m), 1.74-1.56 (1H, m), 1.40 (3H, d, J = 1.5Hz), 1.44-1.34 (2H, m); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 162.2 (1P, s).
[ 실시예 66]
Figure 112015015674384-pct00092
III-a 대신 IX- a 를 이용하여 화합물 4a와 유사한 방식으로 화합물 23a를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 9.22 (1H, brs), 8.05-7.99 (2H, m), 7.52 (1H, d, J = 1.2Hz), 7.41-7.19 (11H, m), 6.87-6.79 (4H, m), 6.37 (1H, dd, J = 8.4, 5.7Hz), 4.88-4.75 (2H, m), 3.86-3.80 (1H, m), 3.79 (6H, s), 3.64-3.49 (2H, m), 3.27-3.12 (3H, m), 2.97 (2H, d, J = 6.6Hz), 2.51-2.41 (1H, m), 2.33-2.20 (1H, m), 2.03-1.75 (2H, m), 1.72-1.59 (1H, m), 1.46-1.36 (1H, m), 1.40 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 157.5 (1P, s).
[ 실시예 67]
Figure 112015015674384-pct00093
IX-a 대신 IX- b 를 이용하여 화합물 23a와 유사한 방식으로 화합물 23b를 얻었다.
1H NMR (300 MHz, CDCl3) d 8.67 (1H, brs), 8.18-8.11 (2H, m), 7.57 (1H, d, J = 1.2Hz), 7.47-7.22 (11H, m), 6.86-6.79 (4H, m), 6.29 (1H, t, J = 6.6Hz), 4.87 (1H, dt, J = 7.5, 5.7Hz), 4.80-4.72 (1H, m), 4.11-4.05 (1H, m), 3.79 (6H, s), 3.67-3.47 (2H, m), 3.43 (1H, dd, J = 10.8, 2.7Hz), 3.27 (1H, dd, J = 10.8, 2.4Hz), 3.25-3.13 (1H, m), 3.07-2.99 (2H, m), 2.19-2.12 (2H, m), 2.03-1.62 (3H, m), 1.46-1.30 (1H, m), 1.41 (3H, s); 31P NMR (121.5 MHz, CDCl3) d 158.1 (1P, s).
[ 실시예 68]
Figure 112015015674384-pct00094
III-a 대신 XIII- a 를 이용하여 화합물 4a와 유사한 방식으로 화합물 24a를 얻었다.
1H NMR (600 MHz, CDCl3) d 7.76 (2H, d, J = 9.0Hz), 7.62 (1H, d, J = 1.2Hz), 7.40 (2H, d, J = 7.2Hz), 7.32-7.23 (10H, m), 6.85 (4H, d, J = 8.4Hz), 6.41 (1H, dd, J = 8.4, 5.4Hz), 4.94 (1H, dd, J = 12.3, 5.4Hz), 4.84-4.79 (1H, m), 4.03-4.01 (1H, m), 3.79 (6H, s), 3.59-3.53 (1H, m), 3.52-3.44 (2H, m), 3.41 (1H, dd, J = 14.7, 7.2Hz), 3.37-3.30 (2H, m), 3.13 (1H, ddd, J = 19.3, 10.3, 4.1Hz), 2.50-2.44 (1H, m), 2.39 (3H, s), 2.35-2.29 (1H, m), 1.91-1.72 (2H, m), 1.64-1.59 (1H, m), 1.40 (3H, s), 1.12-1.05 (1H, m); 31P NMR (243.0 MHz, CDCl3) d 154.2 (1P, s).
키랄- 올리고의 합성을 위한 일반 과정:
키랄-올리고의 자동화된 고상 합성이 표 1에 따른 사이클에 따라 수행되었다. 합성 후, 수지를 25% NH3 수성 용액(1 mL)으로 55℃에서 12시간 동안 처리하였다. 혼합물을 실온으로 냉각시키고 상기 수지를 막 여과에 의해 제거하였다. 여액을 농축하여 감압 하에서 건조시켰다. 잔사를 H2O (3 mL)에 용해시키고 0.1 M 트리에틸암모늄 아세테이트 완충액 (pH 7.0) 중의 아세토니트릴(0-50%/30 min)의 선형 구배를 갖는 RP-UPLC-MS에 의해 50 ℃에서 0.3 mL/min의 속도로 분석하였다.
단계 공정 시약 및 용매 부피 시간
1 디트리틸레이션(detritylation) 3% DCA/DCM 1.6 mL 20 s
2 커플링 0.1 M 모노머/MeCN + 1M 0.5 mL 5 min
3 캡핑 AC2O/THF-피리딘 + 16% /THF 0.5 mL 30 s
4 산화/우리제이션(urization) 0.5 M CSO/MeCN 또는 0.1 MeCN 0.5 mL 90 s
[비교 실시예 1]
Figure 112015015674384-pct00095
통상적인 모노머를 나타내는 상기 화합물 25를 이용하여 올리고를 생산하였다. 도 2는 비교 실시예 1을 통해 얻은 생산물의 차트를 나타낸다.
분석
실시예의 모노머들은 화학적으로 안정했다. 모노머들의 단리 수율은 80% 이상이었으며, 이는 통상적 방법에 비해 높았다.
우리는 두번째 일반 공정에 근거한 상기 실시예의 키랄 시약 및 첫번째 일반 공정에 근거한 상기 실시예의 모노머를 이용하여 올리고뉴클레오티드 유도체를 합성하였다. 도 2에서 볼 수 있는 바와 같이, 통상적인 모노머는 불완전한 탈보호 산물, 부산물 및 실패 서열들을 야기하였다. 반면, 본 발명의 방법은 도 1에서 볼 수 있는 바와 같이 실패 서열을 야기하긴 하나 탈보호 산물과 부산물이 거의 없다. 본 발명의 방법은 불완전한 탈보호 산물 및 부산물을 줄일 수 있음이 명백하다. 본 발명은 원치않는 산물을 줄일 수 있으므로 타겟 올리고뉴클레오티드 유도체를 단리하는 것이 쉽다.

Claims (25)

  1. 하기 화학식 (I')을 갖는 키랄 시약 또는 그의 염:
    Figure 112018001413170-pct00215

    여기에서 G1은 수소 원자, 니트로기, 할로겐 원자, 시아노기, 식 (II), (III) 또는 (V)의 그룹이고 G2는 니트로기, 시아노기, 식 (II), (III) 또는 (V)의 그룹이거나, 또는 G1 및 G2는 함께 식 (IV)의 그룹을 형성하고,
    Figure 112018001413170-pct00097

    여기에서 G21 내지 G23 는 독립적으로 수소 원자, 니트로기, 할로겐 원자, 시아노기 또는 C1-3 알킬기이며,
    Figure 112018001413170-pct00098

    여기에서 G31 내지 G33 는 독립적으로 C1-4 알킬기, C1-4 알콕시기, C6-14 아릴기, C7-14 아르알킬기, C1-4 알킬 C6-14 아릴기, C1-4 알콕시 C6-14 아릴기, 또는 C6-14 아릴 C1-4 알킬기이고,
    Figure 112018001413170-pct00099

    여기에서 G41 내지 G46 는 독립적으로 수소 원자, 니트로기, 할로겐 원자, 시아노기 또는 C1-3 알킬기이며, 및
    Figure 112018001413170-pct00100

    여기에서 G51 내지 G53 는 독립적으로 수소 원자, 니트로기, 할로겐 원자, 시아노기, C1-3 알킬기 또는 C1-3 알킬옥시기이다.
  2. 제1항에 있어서,
    G1 및 G2 은 각각 식 (II)의 그룹이고, 여기에서 G21 내지 G23 는 독립적으로 수소 원자, 니트로기, 할로겐 원자, 시아노기 또는 C1-3 알킬기인 키랄 시약 또는 그의 염.
  3. 제1항에 있어서,
    G1 및 G2 은 각각 식 (II)의 그룹이고, 여기에서 G21 내지 G23 은 각각 수소 원자인 키랄 시약 또는 그의 염.
  4. 제1항에 있어서,
    G1 은 수소 원자이고, G2 는 식 (II)의 그룹이고, 여기에서 G21 내지 G23 는 독립적으로 수소 원자, 니트로기, 할로겐 원자, 시아노기 또는 C1-3 알킬기인 키랄 시약 또는 그의 염.
  5. 제1항에 있어서,
    G1 은 수소 원자이고, G2 는 식 (II)의 그룹이며, 여기에서 G21 및 G22 는 각각 수소 원자이고, G23 는 니트로기인 키랄 시약 또는 그의 염.
  6. 제1항에 있어서,
    G1 은 수소 원자이고, G2 는 식 (III)의 그룹이며, 여기에서 G31 내지 G33 는 독립적으로 C1-4 알킬기, C6-14 아릴기, C7-14 아르알킬기, C1-4 알킬 C6-14 아릴기, C1-4 알콕시 C6-14 아릴기, 또는 C6-14 아릴 C1-4 알킬기인 키랄 시약 또는 그의 염.
  7. 제1항에 있어서,
    G1 은 수소 원자이고, G2 는 식 (III)의 그룹이며, 여기에서 G31 내지 G33 는 독립적으로 C1-4 알킬기, C6 아릴기, C7-10 아르알킬기, C1-4 알킬 C6 아릴기, C1-4 알콕시 C6 아릴기, 또는 C6 아릴 C1-4 알킬기인 키랄 시약 또는 그의 염.
  8. 제1항에 있어서,
    G1 은 수소 원자이고, G2 는 식 (III)의 그룹이며, 여기에서 G31 내지 G33 는 독립적으로 C1-4 알킬기, 또는 C6 아릴기인 키랄 시약 또는 그의 염.
  9. 제1항에 있어서,
    G1 은 수소 원자이고, G2 는 식 (III)의 그룹이며, 여기에서 G31 내지 G33 는 독립적으로 C1-4 알킬기인 키랄 시약 또는 그의 염.
  10. 제1항에 있어서,
    G1 은 수소 원자이고, G2 는 식 (III)의 그룹이며, 여기에서 G31 및 G33 은 C6 아릴기이고, G32 는 C1-4 알킬기인 키랄 시약 또는 그의 염.
  11. 제1항에 있어서,
    G1 및 G2 는 함께 식 (IV)의 그룹을 형성하고, 여기에서 G41 내지 G46 는 독립적으로 수소 원자, 니트로기, 할로겐 원자, 시아노기 또는 C1-3 알킬기인 키랄 시약 또는 그의 염.
  12. 제1항에 있어서,
    G1 및 G2 는 함께 식 (IV)의 그룹을 형성하고, 여기에서 G41 내지 G46 은 각각 수소 원자인 키랄 시약 또는 그의 염.
  13. 제1항에 있어서,
    G1 은 수소 원자이고, G2 는 식 (V)의 그룹이고, 여기에서 G51 내지 G53 은 각각 독립적으로 수소 원자, 니트로기, 메틸기, 또는 메톡시기인 키랄 시약 또는 그의 염.
  14. 제1항에 있어서,
    G1 은 수소 원자이고, G2 는 식 (V)의 그룹이고, 여기에서 G51 및 G53 은 각각 수소 원자이고, G53 은 4-메틸기인 키랄 시약 또는 그의 염.
  15. 제1항에 있어서,
    상기 키랄 시약은 III-a, III-b, V-a, VII-a, VII-b, IX-a, IX-b, XI-a, XIII-a 또는 XIII-b인 키랄 시약 또는 그의 염:
    (S)-2-(메틸디페닐실릴)-1-((S)-피롤리딘-2-일)에탄올 (III-a)
    (R)-2-(메틸디페닐실릴)-1-((R)-1-피롤리딘-2-일)에탄올 (III-b)
    (S)-2-(트리메틸실릴)-1-((S)-1-피롤리딘-2-일)에탄올 (V-a)
    (R)-2,2-디페닐-1-((S)-피롤리딘-2-일)에탄올 (VII-a)
    (S)-2,2-디페닐-1-((R)-피롤리딘-2-일)에탄올 (VII-b)
    (R)-2-(4-니트로페닐)-1-((S)-피롤리딘-2-일)에탄올 (IX-a)
    (S)-2-(4-니트로페닐)-1-((R)-피롤리딘-2-일)에탄올 (IX-b)
    (R)-(9H-플루오렌-9-일)((S)-피롤리딘-2-일)메탄올 (XI-a)
    (S)-2-Tosyl-1-((S)-1-트리틸피롤리딘-2-일)에탄올 (XIII-a)
    (R)-2-Tosyl-1-((R)-1-트리틸피롤리딘-2-일)에탄올 (XIII-b)
  16. 식 (Va') 또는 (Vb')에 의해 표현되는 뉴클레오사이드 3'-포스포아미다이트 유도체:
    Figure 112018001413170-pct00216

    여기에서 G1은 수소 원자, 니트로기, 할로겐 원자, 시아노기, 식 (II), (III) 또는 (V)의 그룹이고 G2는 니트로기, 시아노기, 식 (II), (III) 또는 (V)의 그룹이거나, 또는 G1 및 G2는 함께 식 (IV)의 그룹을 형성하고,
    Figure 112018001413170-pct00103

    여기에서 G21 내지 G23 는 독립적으로 수소 원자, 니트로기, 할로겐 원자, 시아노기 또는 C1-3 알킬기이고,
    Figure 112018001413170-pct00104

    여기에서 G31 내지 G33 는 독립적으로 C1-4 알킬기, C1-4 알콕시기, C6-14 아릴기, C7-14 아르알킬기, C1-4 알킬 C6-14 아릴기, C1-4 알콕시 C6-14 아릴기, 또는 C6-14 아릴 C1-4 알킬기이며,
    Figure 112018001413170-pct00105

    여기에서 G41 내지 G46 는 독립적으로 수소 원자, 니트로기, 할로겐 원자, 시아노기 또는 C1-3 알킬기이고,
    Figure 112018001413170-pct00106

    여기에서 G51 내지 G53 는 독립적으로 수소 원자, 니트로기, 할로겐 원자, 시아노기, C1-3 알킬기 또는 C1-3 알킬옥시기이며,
    G5 는 하이드록실기의 보호기이고,
    R2 는 수소, -OH, -SH, -NRdRd, -N3, 할로겐, C1-10 알킬, C2-10 알케닐, C2-10 알키닐, C1-10 알킬-Y1-, C2-10 알케닐-Y1-, C2-10 알키닐-Y1-, C6-14 아릴-Y1-, C6-14 헤테로아릴-Y1-, -ORb, 또는 -SRb 이며, 여기에서 Rb 는 블로킹 모이어티이고,
    Y1 는 O, NRd, S, 또는 Se이며,
    Rd 는 독립적으로 수소, C1-10 알킬, C2-10 알케닐, C2-10 알키닐, C6-14 아릴, 아실, 치환된 실릴, 카바메이트, -P(O)(Re)2, 또는 -HP(O)(Re)이고,
    Re 는 독립적으로 수소, C1-10 알킬, C6-14 아릴, C2-10 알케닐, C2-10 알키닐, C1-10 알킬-Y2-, C2-10 알케닐-Y2-, C2-10 알키닐-Y2-, C6-14 아릴-Y2-, 또는 C6-14 헤테로아릴-Y2-, 또는 Na+, Li+, 또는 K+인 양이온이며,
    Y2 는 O, S 또는 NRd 이고, 상기 Rd는 독립적으로 수소, C1-10 알킬, C2-10 알케닐, C2-10 알키닐, C6-14 아릴, 아실, 치환된 실릴, 카바메이트이고,
    R3 는 -CH2-, -(CH2)2-, -CH2NH-, 또는 -CH2N(CH3)-로 표현되는 그룹이며,
    Bs 는 하기 식 (VI) 내지 (XI) 또는 그의 유도체로 표현되는 그룹들로부터 선택되는 그룹이다.
    Figure 112018001413170-pct00214
  17. 제16항에 있어서,
    상기 뉴클레오사이드 3'-포스포아미다이트 유도체는 식 1a, 1b, 2a, 2b, 3a, 3b, 4a, 4b, 5a, 5b, 6a, 6b, 7a, 7b, 8a, 8b, 9a, 9b, 10a, 10b, 11a, 11b, 12a, 12b, 13a, 13b, 14a, 14b, 15a, 15b, 16a, 16b, 17a, 17b, 18a, 18b, 19a, 19b, 20a, 20b, 21a, 21b, 22a, 22b, 23a, 23b, 또는 24a에 의해 표현되는 것인 뉴클레오사이드 3'-포스포아미다이트 유도체:
    Figure 112018001413170-pct00109
    Figure 112018001413170-pct00110
    Figure 112018001413170-pct00111
    Figure 112018001413170-pct00112
    Figure 112018001413170-pct00113
    Figure 112018001413170-pct00114
    Figure 112018001413170-pct00115
    Figure 112018001413170-pct00116
    Figure 112018001413170-pct00117
    Figure 112018001413170-pct00118
    Figure 112018001413170-pct00119
    Figure 112018001413170-pct00120
    Figure 112018001413170-pct00121
    Figure 112018001413170-pct00122
    Figure 112018001413170-pct00123
    Figure 112018001413170-pct00124
    Figure 112018001413170-pct00125
    Figure 112018001413170-pct00126
    Figure 112018001413170-pct00127
    Figure 112018001413170-pct00128
    Figure 112018001413170-pct00129
    Figure 112018001413170-pct00130
    Figure 112018001413170-pct00131
    Figure 112018001413170-pct00132
    Figure 112018001413170-pct00133
    Figure 112018001413170-pct00134
    Figure 112018001413170-pct00135
    Figure 112018001413170-pct00136
    Figure 112018001413170-pct00137
    Figure 112018001413170-pct00138
    Figure 112018001413170-pct00139
    Figure 112018001413170-pct00140
    Figure 112018001413170-pct00141
    Figure 112018001413170-pct00142
    Figure 112018001413170-pct00143
    Figure 112018001413170-pct00144
    Figure 112018001413170-pct00145
    Figure 112018001413170-pct00146
    Figure 112018001413170-pct00147
    Figure 112018001413170-pct00148

    Figure 112018001413170-pct00149
    Figure 112018001413170-pct00150
    Figure 112018001413170-pct00151
    Figure 112018001413170-pct00152
    Figure 112018001413170-pct00153
    Figure 112018001413170-pct00154
    Figure 112018001413170-pct00155

    여기에서 DMTr은 4,4'-디메톡시트리틸기를 나타내고, TOM은 트리이소프로필실록시메틸기를 나타낸다.
  18. 비키랄 H-포스포네이트 모이어티를 포함하는 분자를 키랄 시약 또는 그의 염과 반응시켜 뉴클레오사이드 3'-포스포아미다이트 유도체의 모노머를 형성하고,
    상기 모노머 및 뉴클레오사이드를 반응시켜 축합 중간체를 형성하고;
    상기 축합 중간체를 키랄 X-포스포네이트 모이어티를 포함하는 핵산으로 전환시키는 단계를 포함하며,
    상기 키랄 시약은 하기 화학식 (I')을 갖는 것인
    입체제어된 인 원자-수식 올리고뉴클레오티드 유도체의 합성 방법:
    Figure 112018001413170-pct00217

    여기에서 G1은 수소 원자, 니트로기, 할로겐 원자, 시아노기, 식 (II), (III) 또는 (V)의 그룹이고 G2는 니트로기, 시아노기, 식 (II), (III) 또는 (V)의 그룹이거나, 또는 G1 및 G2는 함께 식 (IV)의 그룹을 형성하고,
    Figure 112018001413170-pct00157

    여기에서 G21 내지 G23 는 독립적으로 수소 원자, 니트로기, 할로겐 원자, 시아노기 또는 C1-3 알킬기이고,
    Figure 112018001413170-pct00158

    여기에서 G31 내지 G33 는 독립적으로 C1-4 알킬기 또는 C6-14 아릴기, C1-4 알콕시기, C6-14 아릴기, C7-14 아르알킬기, C1-4 알킬 C6-14 아릴기, C1-4 알콕시 C6-14 아릴기, 또는 C6-14 아릴 C1-4 알킬기이며,
    Figure 112018001413170-pct00159

    여기에서 G41 내지 G46 는 독립적으로 수소 원자, 니트로기, 할로겐 원자, 시아노기 또는 C1-3 알킬기이고, 및
    Figure 112018001413170-pct00160

    여기에서 G51 내지 G53 는 독립적으로 수소 원자, 니트로기, 할로겐 원자, 시아노기, C1-3 알킬기 또는 C1-3 알킬옥시기이다.
  19. 제18항에 있어서,
    상기 키랄 시약은 III-a, III-b, V-a, VII-a, VII-b, IX-a, IX-b, XI-a, XIII-a 및 XIII-b에 의해 표현되는 것인 입체제어된 인 원자-수식 올리고뉴클레오티드 유도체의 합성 방법:
    (S)-2-(메틸디페닐실릴)-1-((S)-피롤리딘-2-일)에탄올 (III-a)
    (R)-2-(메틸디페닐실릴)-1-((R)-1-피롤리딘-2-일)에탄올 (III-b)
    (S)-2-(트리메틸실릴)-1-((S)-1-피롤리딘-2-일)에탄올 (V-a)
    (R)-2,2-디페닐-1-((S)-피롤리딘-2-일)에탄올 (VII-a)
    (S)-2,2-디페닐-1-((R)-피롤리딘-2-일)에탄올 (VII-b)
    (R)-2-(4-니트로페닐)-1-((S)-피롤리딘-2-일)에탄올 (IX-a)
    (S)-2-(4-니트로페닐)-1-((R)-피롤리딘-2-일)에탄올 (IX-b)
    (R)-(9H-플루오로ren-9-일)((S)-피롤리딘-2-일)메탄올 (XI-a)
    (S)-2-Tosyl-1-((S)-1-트리틸피롤리딘-2-일)에탄올 (XIII-a)
    (R)-2-Tosyl-1-((R)-1-트리틸피롤리딘-2-일)에탄올 (XIII-b).
  20. 식 (Va') 또는 (Vb')에 의해 표현되는 뉴클레오사이드 3'-포스포아미다이트 유도체를, 활성화 시약 및 뉴클레오사이드와 반응시켜 축합 중간체를 형성하고;
    상기 축합 중간체를 키랄 X-포스포네이트 모이어티를 포함하는 핵산으로 전환하는 단계를 포함하는 입체제어된 인 원자-수식 올리고뉴클레오티드 유도체의 합성 방법:
    Figure 112018001413170-pct00218

    (상기 식 (Va') 또는 (Vb')에서, G1, G2, G5, Bs, R2 및 R3은 상기 청구항 제16항에 정의된 바와 같다.).
  21. 제20항에 있어서,
    상기 뉴클레오사이드 3'-포스포아미다이트 유도체는 식 1a, 1b, 2a, 2b, 3a, 3b, 4a, 4b, 5a, 5b, 6a, 6b, 7a, 7b, 8a, 8b, 9a, 9b, 10a, 10b, 11a, 11b, 12a, 12b, 13a, 13b, 14a, 14b, 15a, 15b, 16a, 16b, 17a, 17b, 18a, 18b, 19a, 19b, 20a, 20b, 21a, 21b, 22a, 22b, 23a, 23b, 또는 24a에 의해 표현되는 것인 입체제어된 인 원자-수식 올리고뉴클레오티드 유도체의 합성 방법:
    Figure 112018001413170-pct00164
    Figure 112018001413170-pct00165
    Figure 112018001413170-pct00166
    Figure 112018001413170-pct00167
    Figure 112018001413170-pct00168
    Figure 112018001413170-pct00169
    Figure 112018001413170-pct00170
    Figure 112018001413170-pct00171
    Figure 112018001413170-pct00172
    Figure 112018001413170-pct00173
    Figure 112018001413170-pct00174
    Figure 112018001413170-pct00175
    Figure 112018001413170-pct00176
    Figure 112018001413170-pct00177
    Figure 112018001413170-pct00178
    Figure 112018001413170-pct00179
    Figure 112018001413170-pct00180
    Figure 112018001413170-pct00181
    Figure 112018001413170-pct00182
    Figure 112018001413170-pct00183
    Figure 112018001413170-pct00184
    Figure 112018001413170-pct00185
    Figure 112018001413170-pct00186
    Figure 112018001413170-pct00187
    Figure 112018001413170-pct00188
    Figure 112018001413170-pct00189
    Figure 112018001413170-pct00190
    Figure 112018001413170-pct00191
    Figure 112018001413170-pct00192
    Figure 112018001413170-pct00193
    Figure 112018001413170-pct00194
    Figure 112018001413170-pct00195
    Figure 112018001413170-pct00196
    Figure 112018001413170-pct00197
    Figure 112018001413170-pct00198
    Figure 112018001413170-pct00199
    Figure 112018001413170-pct00200
    Figure 112018001413170-pct00201
    Figure 112018001413170-pct00202
    Figure 112018001413170-pct00203
    Figure 112018001413170-pct00204
    Figure 112018001413170-pct00205
    Figure 112018001413170-pct00206
    Figure 112018001413170-pct00207
    Figure 112018001413170-pct00208
    Figure 112018001413170-pct00209
    Figure 112018001413170-pct00210

    여기에서 DMTr은 4,4'-디메톡시트리틸기를 나타내고, TOM은 트리이소프로필실록시메틸기를 나타낸다.
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