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WO2005071110A3 - Amelioration des reactions de ligature de polynucleotides - Google Patents

Amelioration des reactions de ligature de polynucleotides Download PDF

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Abstract

Le procédé de l'invention est destiné à la quantification du nombre relatif ou absolu de molécules uniques présentes dans un échantillon après une procédure d'analyse de l'échantillon. En l'occurrence, on procède en plusieurs étapes. On commence (I) par attacher un marqueur moléculaire unique à sensiblement la totalité des molécules de l'échantillon. On exécute ensuite (ii) la procédure d'analyse en utilisant les molécules de l'échantillon. Enfin, (iii) sur la base des marqueurs moléculaires, on détermine le nombre absolu ou relatif des molécules uniques présentes dans l'échantillon d'origine ayant subi la procédure d'analyse.
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Cited By (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN103154273A (zh) * 2010-09-21 2013-06-12 群体遗传学科技有限公司 通过分子计数提高等位基因调用的置信度
US9567645B2 (en) 2013-08-28 2017-02-14 Cellular Research, Inc. Massively parallel single cell analysis
US11845986B2 (en) 2016-05-25 2023-12-19 Becton, Dickinson And Company Normalization of nucleic acid libraries
USRE50636E1 (en) 2022-10-27 2025-10-14 Becton, Dickinson And Company Accurate molecular barcoding

Families Citing this family (134)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP2158476B8 (fr) 2007-05-08 2019-10-09 Trustees of Boston University Fonctionnalisation chimique d'ensembles de nanopores et de nanopores à semi-conducteurs, et leurs applications
ES2448426T3 (es) 2007-10-12 2014-03-13 Pronota Nv Uso de aptámeros en proteómica
WO2010127186A1 (fr) 2009-04-30 2010-11-04 Prognosys Biosciences, Inc. Produits de construction d'acide nucléique et leurs procédés d'utilisation
EP2483680A4 (fr) 2009-09-30 2014-01-01 Quantapore Inc Séquençage ultrarapide de polymères biologiques au moyen de nanopores marqués
US9315857B2 (en) 2009-12-15 2016-04-19 Cellular Research, Inc. Digital counting of individual molecules by stochastic attachment of diverse label-tags
US8835358B2 (en) 2009-12-15 2014-09-16 Cellular Research, Inc. Digital counting of individual molecules by stochastic attachment of diverse labels
US8735327B2 (en) * 2010-01-07 2014-05-27 Jeansee, Llc Combinatorial DNA taggants and methods of preparation and use thereof
US20190300945A1 (en) 2010-04-05 2019-10-03 Prognosys Biosciences, Inc. Spatially Encoded Biological Assays
HRP20151294T1 (hr) 2010-04-05 2016-03-11 Prognosys Biosciences, Inc. Biološka testiranja sa prostornim kodiranjem
US10787701B2 (en) 2010-04-05 2020-09-29 Prognosys Biosciences, Inc. Spatially encoded biological assays
CA3210003A1 (fr) 2010-10-22 2012-04-26 Cold Spring Harbor Laboratory Comptage varietal d'acides nucleiques pour obtenir des informations sur le nombre de copies genomiques
US10144950B2 (en) 2011-01-31 2018-12-04 Roche Sequencing Solutions, Inc. Methods of identifying multiple epitopes in cells
GB201106254D0 (en) 2011-04-13 2011-05-25 Frisen Jonas Method and product
GB201108678D0 (en) 2011-05-24 2011-07-06 Olink Ab Multiplexed proximity ligation assay
PT3363901T (pt) 2012-02-17 2021-01-22 Hutchinson Fred Cancer Res Composições e métodos para identificar mutações com precisão
AU2013226081B2 (en) 2012-02-27 2018-06-14 Becton, Dickinson And Company Compositions and kits for molecular counting
ES2776673T3 (es) 2012-02-27 2020-07-31 Univ North Carolina Chapel Hill Métodos y usos para etiquetas moleculares
EP3744857A1 (fr) 2012-03-20 2020-12-02 University Of Washington Through Its Center For Commercialization Méthodes permettant de faire baisser le taux d'erreurs observées lors d'un séquençage massif d'adn eu parallèle en faisant appel à un séquençage par consensus duplex
WO2014026032A2 (fr) 2012-08-08 2014-02-13 Apprise Bio, Inc. Accroissement de la plage dynamique pour identifier de multiples épitopes dans des cellules
EP3470533B2 (fr) 2012-09-04 2023-01-18 Guardant Health, Inc. Systèmes et procédés pour détecter la variation du nombre de copies
US20160040229A1 (en) 2013-08-16 2016-02-11 Guardant Health, Inc. Systems and methods to detect rare mutations and copy number variation
US11913065B2 (en) 2012-09-04 2024-02-27 Guardent Health, Inc. Systems and methods to detect rare mutations and copy number variation
US10876152B2 (en) 2012-09-04 2020-12-29 Guardant Health, Inc. Systems and methods to detect rare mutations and copy number variation
US9593365B2 (en) 2012-10-17 2017-03-14 Spatial Transcriptions Ab Methods and product for optimising localised or spatial detection of gene expression in a tissue sample
US10942184B2 (en) 2012-10-23 2021-03-09 Caris Science, Inc. Aptamers and uses thereof
AU2013340414B2 (en) 2012-10-23 2019-05-02 Caris Science, Inc. Aptamers and uses thereof
US9651539B2 (en) 2012-10-28 2017-05-16 Quantapore, Inc. Reducing background fluorescence in MEMS materials by low energy ion beam treatment
AU2013361323B2 (en) 2012-12-19 2018-09-06 Caris Science, Inc. Compositions and methods for aptamer screening
EP3004385B1 (fr) 2013-05-24 2018-11-28 Quantapore Inc. Analyse d'acides nucléiques basés sur des nanopores avec une détection par fret mixte
EP3013984B1 (fr) 2013-06-25 2023-03-22 Prognosys Biosciences, Inc. Procédés pour déterminer des motifs spatiales de cibles biologiques dans un échantillon
CN105745528A (zh) 2013-10-07 2016-07-06 赛卢拉研究公司 用于以数字方式对阵列上的特征进行计数的方法和系统
ES2784450T3 (es) 2013-12-28 2020-09-25 Guardant Health Inc Métodos y sistemas para detectar variantes genéticas
EP3204519B1 (fr) 2014-10-10 2020-04-29 Quantapore Inc. Analyse de polymères, à base de nanopore, à l'aide de marqueurs fluorescents à désactivation mutuelle
CA2964790C (fr) 2014-10-24 2023-02-21 Quantapore, Inc. Analyse optique efficace de polymeres au moyen de reseaux de nanostructures
EP3766988B1 (fr) 2015-02-19 2024-02-14 Becton, Dickinson and Company Analyse à haut rendement de cellules uniques combinant des informations protéomiques et génomiques
ES2836802T3 (es) 2015-02-27 2021-06-28 Becton Dickinson Co Códigos de barras moleculares espacialmente direccionables
EP3835431B1 (fr) 2015-03-30 2022-11-02 Becton, Dickinson and Company Procédés pour codage à barres combinatoire
CN120425026A (zh) 2015-04-10 2025-08-05 十程基因技术瑞典公司 生物样本的空间区别、多重核酸分析
US11390914B2 (en) 2015-04-23 2022-07-19 Becton, Dickinson And Company Methods and compositions for whole transcriptome amplification
WO2016196229A1 (fr) 2015-06-01 2016-12-08 Cellular Research, Inc. Méthodes de quantification d'arn
JP6698708B2 (ja) 2015-06-09 2020-05-27 ライフ テクノロジーズ コーポレーション 分子タグ付けのための方法、システム、組成物、キット、装置、及びコンピュータ可読媒体
KR102395450B1 (ko) 2015-09-11 2022-05-09 셀룰러 리서치, 인크. 핵산 라이브러리 정규화를 위한 방법 및 조성물
CA3006792A1 (fr) 2015-12-08 2017-06-15 Twinstrand Biosciences, Inc. Adaptateurs ameliores, procedes, et compositions pour le sequencage en double helice
CN108603228B (zh) 2015-12-17 2023-09-01 夸登特健康公司 通过分析无细胞dna确定肿瘤基因拷贝数的方法
ES2956757T3 (es) 2016-05-02 2023-12-27 Becton Dickinson Co Codificación con códigos de barras moleculares precisa
CN109074430B (zh) 2016-05-26 2022-03-29 贝克顿迪金森公司 分子标记计数调整方法
US10202641B2 (en) 2016-05-31 2019-02-12 Cellular Research, Inc. Error correction in amplification of samples
US10640763B2 (en) 2016-05-31 2020-05-05 Cellular Research, Inc. Molecular indexing of internal sequences
WO2018009346A1 (fr) 2016-07-05 2018-01-11 Quantapore, Inc. Séquencement de nanopores à base optique
KR102363716B1 (ko) 2016-09-26 2022-02-18 셀룰러 리서치, 인크. 바코딩된 올리고뉴클레오티드 서열을 갖는 시약을 이용한 단백질 발현의 측정
CN117594126A (zh) 2016-11-08 2024-02-23 贝克顿迪金森公司 用于表达谱分类的方法
US11608497B2 (en) 2016-11-08 2023-03-21 Becton, Dickinson And Company Methods for cell label classification
US10722880B2 (en) 2017-01-13 2020-07-28 Cellular Research, Inc. Hydrophilic coating of fluidic channels
US11319583B2 (en) 2017-02-01 2022-05-03 Becton, Dickinson And Company Selective amplification using blocking oligonucleotides
WO2018183942A1 (fr) 2017-03-31 2018-10-04 Grail, Inc. Préparation de banques améliorées et leur utilisation pour la correction d'erreurs basées sur le séquençage et/ou l'identification de variants
JP7536450B2 (ja) 2017-06-05 2024-08-20 ベクトン・ディキンソン・アンド・カンパニー 単一細胞用のサンプルインデックス付加
SG11202003885UA (en) 2017-11-08 2020-05-28 Twinstrand Biosciences Inc Reagents and adapters for nucleic acid sequencing and methods for making such reagents and adapters
US11946095B2 (en) 2017-12-19 2024-04-02 Becton, Dickinson And Company Particles associated with oligonucleotides
WO2019213294A1 (fr) 2018-05-03 2019-11-07 Becton, Dickinson And Company Analyse multi-omique d'échantillons à haut débit
EP3788170B1 (fr) 2018-05-03 2025-01-01 Becton, Dickinson and Company Codage à barres moléculaire sur des extrémités de transcrit en regard
AU2019300172A1 (en) 2018-07-12 2021-01-28 Twinstrand Biosciences, Inc. Methods and reagents for characterizing genomic editing, clonal expansion, and associated applications
US11519033B2 (en) 2018-08-28 2022-12-06 10X Genomics, Inc. Method for transposase-mediated spatial tagging and analyzing genomic DNA in a biological sample
WO2020072380A1 (fr) 2018-10-01 2020-04-09 Cellular Research, Inc. Détermination de séquences de transcripts 5'
US11932849B2 (en) 2018-11-08 2024-03-19 Becton, Dickinson And Company Whole transcriptome analysis of single cells using random priming
EP4567127A3 (fr) 2018-12-10 2025-09-03 10x Genomics, Inc. Procédés de détermination d'un emplacement d'un analyte biologique dans un échantillon biologique
CN113195717A (zh) 2018-12-13 2021-07-30 贝克顿迪金森公司 单细胞全转录组分析中的选择性延伸
US11649485B2 (en) 2019-01-06 2023-05-16 10X Genomics, Inc. Generating capture probes for spatial analysis
US11926867B2 (en) 2019-01-06 2024-03-12 10X Genomics, Inc. Generating capture probes for spatial analysis
WO2020150356A1 (fr) 2019-01-16 2020-07-23 Becton, Dickinson And Company Normalisation de réaction en chaîne de la polymérase par titrage d'amorce
ES2989967T3 (es) 2019-01-23 2024-11-28 Becton Dickinson Co Oligonucleótidos asociados con anticuerpos
US12071617B2 (en) 2019-02-14 2024-08-27 Becton, Dickinson And Company Hybrid targeted and whole transcriptome amplification
WO2020214642A1 (fr) 2019-04-19 2020-10-22 Becton, Dickinson And Company Procédés d'association de données phénotypiques et de données de séquençage monocellule
EP3976820A1 (fr) 2019-05-30 2022-04-06 10X Genomics, Inc. Procédés de détection de l'hétérogénéité spatiale d'un échantillon biologique
EP4004231A1 (fr) 2019-07-22 2022-06-01 Becton, Dickinson and Company Dosage de séquençage par immunoprécipitation de la chromatine monocellulaire
WO2021092433A2 (fr) 2019-11-08 2021-05-14 10X Genomics, Inc. Amélioration de la spécificité de la liaison d'un analyte
EP4407041A3 (fr) 2019-11-08 2024-09-25 Becton Dickinson and Company Utilisation d'un amorçage aléatoire pour obtenir des informations v(d)j de pleine longueur pour le séquençage du répertoire immunitaire
EP4055185A1 (fr) 2019-11-08 2022-09-14 10X Genomics, Inc. Agents de capture d'analytes marqués spatialement pour le multiplexage d'analytes
FI3891300T3 (fi) 2019-12-23 2023-05-10 10X Genomics Inc Menetelmät spatiaalista analyysiä varten rna-templatoitua ligaatiota käyttäen
EP4081656A1 (fr) 2019-12-23 2022-11-02 10X Genomics, Inc. Compositions et méthodes d'utilisation d'échantillons biologiques fixés dans des dosages basés sur des compartiments
US12365942B2 (en) 2020-01-13 2025-07-22 10X Genomics, Inc. Methods of decreasing background on a spatial array
US11649497B2 (en) 2020-01-13 2023-05-16 Becton, Dickinson And Company Methods and compositions for quantitation of proteins and RNA
US12405264B2 (en) 2020-01-17 2025-09-02 10X Genomics, Inc. Electrophoretic system and method for analyte capture
US11702693B2 (en) 2020-01-21 2023-07-18 10X Genomics, Inc. Methods for printing cells and generating arrays of barcoded cells
US11732299B2 (en) 2020-01-21 2023-08-22 10X Genomics, Inc. Spatial assays with perturbed cells
US20210230681A1 (en) 2020-01-24 2021-07-29 10X Genomics, Inc. Methods for spatial analysis using proximity ligation
US11821035B1 (en) 2020-01-29 2023-11-21 10X Genomics, Inc. Compositions and methods of making gene expression libraries
WO2021155057A1 (fr) 2020-01-29 2021-08-05 Becton, Dickinson And Company Puits à code-barres pour la cartographie spatiale de cellules individuelles par séquençage
US12076701B2 (en) 2020-01-31 2024-09-03 10X Genomics, Inc. Capturing oligonucleotides in spatial transcriptomics
US11898205B2 (en) 2020-02-03 2024-02-13 10X Genomics, Inc. Increasing capture efficiency of spatial assays
US12110541B2 (en) 2020-02-03 2024-10-08 10X Genomics, Inc. Methods for preparing high-resolution spatial arrays
US11732300B2 (en) 2020-02-05 2023-08-22 10X Genomics, Inc. Increasing efficiency of spatial analysis in a biological sample
US12129516B2 (en) 2020-02-07 2024-10-29 10X Genomics, Inc. Quantitative and automated permeabilization performance evaluation for spatial transcriptomics
US11835462B2 (en) 2020-02-11 2023-12-05 10X Genomics, Inc. Methods and compositions for partitioning a biological sample
US12399123B1 (en) 2020-02-14 2025-08-26 10X Genomics, Inc. Spatial targeting of analytes
US12281357B1 (en) 2020-02-14 2025-04-22 10X Genomics, Inc. In situ spatial barcoding
US11891654B2 (en) 2020-02-24 2024-02-06 10X Genomics, Inc. Methods of making gene expression libraries
WO2021173719A1 (fr) 2020-02-25 2021-09-02 Becton, Dickinson And Company Sondes bi-spécifiques permettant l'utilisation d'échantillons monocellulaires en tant que contrôle de compensation de couleur unique
US11926863B1 (en) 2020-02-27 2024-03-12 10X Genomics, Inc. Solid state single cell method for analyzing fixed biological cells
US11768175B1 (en) 2020-03-04 2023-09-26 10X Genomics, Inc. Electrophoretic methods for spatial analysis
ES3014967T3 (en) 2020-04-22 2025-04-28 10X Genomics Inc Methods for spatial analysis using targeted rna depletion
WO2021231779A1 (fr) 2020-05-14 2021-11-18 Becton, Dickinson And Company Amorces pour profilage de répertoire immunitaire
CN116134308B (zh) 2020-05-19 2025-05-27 10X基因组学有限公司 电泳盒和仪器
EP4553168A3 (fr) 2020-05-22 2025-08-27 10x Genomics, Inc. Analyse spatiale pour détecter des variantes de séquence
EP4414459B1 (fr) 2020-05-22 2025-09-03 10X Genomics, Inc. Mesure spatio-temporelle simultanée de l'expression génique et de l'activité cellulaire
WO2021242834A1 (fr) 2020-05-26 2021-12-02 10X Genomics, Inc. Procédé de réinitialisation d'un réseau
ES2987035T3 (es) 2020-06-02 2024-11-13 Becton Dickinson Co Oligonucleótidos y perlas para el ensayo de expresión génica principal 5
AU2021283184A1 (en) 2020-06-02 2023-01-05 10X Genomics, Inc. Spatial transcriptomics for antigen-receptors
US12265079B1 (en) 2020-06-02 2025-04-01 10X Genomics, Inc. Systems and methods for detecting analytes from captured single biological particles
WO2021247543A2 (fr) 2020-06-02 2021-12-09 10X Genomics, Inc. Procédés de banques d'acides nucléiques
US12031177B1 (en) 2020-06-04 2024-07-09 10X Genomics, Inc. Methods of enhancing spatial resolution of transcripts
EP4421186B1 (fr) 2020-06-08 2025-08-13 10X Genomics, Inc. Procédés de détermination d'une marge chirurgicale et procédés d'utilisation de ceux-ci
WO2021252591A1 (fr) 2020-06-10 2021-12-16 10X Genomics, Inc. Procédés de détermination d'un emplacement d'un analyte dans un échantillon biologique
CN116034166A (zh) 2020-06-25 2023-04-28 10X基因组学有限公司 Dna甲基化的空间分析
US11981960B1 (en) 2020-07-06 2024-05-14 10X Genomics, Inc. Spatial analysis utilizing degradable hydrogels
US12209280B1 (en) 2020-07-06 2025-01-28 10X Genomics, Inc. Methods of identifying abundance and location of an analyte in a biological sample using second strand synthesis
US11761038B1 (en) 2020-07-06 2023-09-19 10X Genomics, Inc. Methods for identifying a location of an RNA in a biological sample
US11932901B2 (en) 2020-07-13 2024-03-19 Becton, Dickinson And Company Target enrichment using nucleic acid probes for scRNAseq
US12391940B2 (en) 2020-07-31 2025-08-19 Becton, Dickinson And Company Single cell assay for transposase-accessible chromatin
US11981958B1 (en) 2020-08-20 2024-05-14 10X Genomics, Inc. Methods for spatial analysis using DNA capture
EP4491742A3 (fr) 2020-09-18 2025-05-21 10x Genomics, Inc. Appareil de manipulation d'échantillons et procédés d'enregistrement d'images
US11926822B1 (en) 2020-09-23 2024-03-12 10X Genomics, Inc. Three-dimensional spatial analysis
US11827935B1 (en) 2020-11-19 2023-11-28 10X Genomics, Inc. Methods for spatial analysis using rolling circle amplification and detection probes
CN116635533A (zh) 2020-11-20 2023-08-22 贝克顿迪金森公司 高表达的蛋白和低表达的蛋白的谱分析
WO2022132206A1 (fr) 2020-12-15 2022-06-23 Becton, Dickinson And Company Analyse du sécrétome de cellule unique
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EP4294571B8 (fr) 2021-02-19 2024-07-10 10X Genomics, Inc. Procédé d'utilisation d'un dispositif modulaire de support d'essai
ES3008686T3 (en) 2021-03-18 2025-03-24 10X Genomics Inc Multiplex capture of gene and protein expression from a biological sample
EP4428246A3 (fr) 2021-04-14 2024-11-27 10X Genomics, Inc. Procédés de mesure de la localisation erronée d'un analyte
WO2022236054A1 (fr) 2021-05-06 2022-11-10 10X Genomics, Inc. Procédés pour augmenter la résolution d'une analyse spatiale
WO2022256503A1 (fr) 2021-06-03 2022-12-08 10X Genomics, Inc. Procédés, compositions, kits et systèmes pour améliorer la capture d'analytes pour une analyse spatiale
EP4196605B1 (fr) 2021-09-01 2024-12-04 10X Genomics, Inc. Procédés pour bloquer une sonde de capture sur un réseau spatial
EP4419707A1 (fr) 2021-11-10 2024-08-28 10X Genomics, Inc. Procédés, compositions et kits pour déterminer l'emplacement d'un analyte dans un échantillon biologique
EP4305195A2 (fr) 2021-12-01 2024-01-17 10X Genomics, Inc. Procédés, compositions et systèmes pour la détection améliorée d'analytes in situ et analyse spatiale
EP4441711A1 (fr) 2021-12-20 2024-10-09 10X Genomics, Inc. Auto-test pour dispositif d'imagerie

Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5604097A (en) * 1994-10-13 1997-02-18 Spectragen, Inc. Methods for sorting polynucleotides using oligonucleotide tags
WO2001000816A1 (fr) * 1999-03-18 2001-01-04 Complete Genomics As Procedes de clonage et de production de chaines de fragments avec un contenu d'information lisible
WO2001061037A1 (fr) * 2000-02-18 2001-08-23 Ulf Landegren Procedes et trousses de detection de proximite
US20020028458A1 (en) * 1998-12-23 2002-03-07 Preben Lexow Sequencing method using magnifying tags
WO2003031591A2 (fr) * 2001-10-10 2003-04-17 Superarray Bioscience Corporation Detection de cibles a l'aide de marqueurs uniques d'identification de nucleotides

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5604097A (en) * 1994-10-13 1997-02-18 Spectragen, Inc. Methods for sorting polynucleotides using oligonucleotide tags
US20020028458A1 (en) * 1998-12-23 2002-03-07 Preben Lexow Sequencing method using magnifying tags
WO2001000816A1 (fr) * 1999-03-18 2001-01-04 Complete Genomics As Procedes de clonage et de production de chaines de fragments avec un contenu d'information lisible
WO2001061037A1 (fr) * 2000-02-18 2001-08-23 Ulf Landegren Procedes et trousses de detection de proximite
WO2003031591A2 (fr) * 2001-10-10 2003-04-17 Superarray Bioscience Corporation Detection de cibles a l'aide de marqueurs uniques d'identification de nucleotides

Non-Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
BURGESS J K: "Gene expression studies using microarrays.", CLINICAL AND EXPERIMENTAL PHARMACOLOGY & PHYSIOLOGY. APR 2001, vol. 28, no. 4, April 2001 (2001-04-01), pages 321 - 328, XP002325541, ISSN: 0305-1870 *
DEAMER D W ET AL: "Nanopores and nucleic acids: prospects for ultrarapid sequencing", TRENDS IN BIOTECHNOLOGY, ELSEVIER, AMSTERDAM, NL, vol. 18, no. 4, April 2000 (2000-04-01), pages 147 - 151, XP004194002, ISSN: 0167-7799 *
FREDRIKSSON S ET AL: "Protein detection using proximity-dependent DNA ligation assays", NATURE BIOTECHNOLOGY, NATURE PUBLISHING, US, vol. 20, May 2002 (2002-05-01), pages 473 - 477, XP002960538, ISSN: 1087-0156 *

Cited By (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN103154273A (zh) * 2010-09-21 2013-06-12 群体遗传学科技有限公司 通过分子计数提高等位基因调用的置信度
US9567645B2 (en) 2013-08-28 2017-02-14 Cellular Research, Inc. Massively parallel single cell analysis
US9598736B2 (en) 2013-08-28 2017-03-21 Cellular Research, Inc. Massively parallel single cell analysis
US11845986B2 (en) 2016-05-25 2023-12-19 Becton, Dickinson And Company Normalization of nucleic acid libraries
USRE50636E1 (en) 2022-10-27 2025-10-14 Becton, Dickinson And Company Accurate molecular barcoding

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