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WO2008039997A3 - Conjugués de nucléobase avec liants à ossature cationique - Google Patents

Conjugués de nucléobase avec liants à ossature cationique Download PDF

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WO2008039997A3
WO2008039997A3 PCT/US2007/079935 US2007079935W WO2008039997A3 WO 2008039997 A3 WO2008039997 A3 WO 2008039997A3 US 2007079935 W US2007079935 W US 2007079935W WO 2008039997 A3 WO2008039997 A3 WO 2008039997A3
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WO
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conjugates
methods
cationic backbone
nucleobase
label
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PCT/US2007/079935
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English (en)
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Inventor
Paul M Kenney
Shaheer H Khan
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Applera Corp
Paul M Kenney
Shaheer H Khan
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Publication date
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Abstract

La présente invention fournit des conjugués marqueur-nucléotide et des compositions associés dans lesquels un marqueur, tel qu'un colorant fluorescent, est lié directement ou indirectement à une nucléobase par un liant. Dans certains modes de réalisation, le liant possède une ossature comprenant une fraction d'imidazolium. De tels conjugués sont utiles, par exemple, dans des procédés d'extension d'amorce et dans des techniques associées ainsi que dans des procédés qui impliquent une électrophorèse des polynucléotides, telle que certaines techniques de séquençage d'ADN. L'invention décrit également des procédés, des kits et des compositions.
PCT/US2007/079935 2006-09-28 2007-09-28 Conjugués de nucléobase avec liants à ossature cationique WO2008039997A2 (fr)

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US60/848,316 2006-09-28

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Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
USRE46683E1 (en) 2008-03-31 2018-01-23 Applied Biosystems, Llc Nucleic acid terminators incorporating a cationic moiety and methods for their use

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2001014345A1 (fr) * 1999-08-20 2001-03-01 The Research Foundation Of State University Of New York Derives 5-propynylpyrimidine utilises comme inhibiteurs d'enzyme cytotoxique
WO2001049790A2 (fr) * 2000-01-04 2001-07-12 Applera Corporation Colorants a base de cyanine a modification de mobilite
WO2002030944A2 (fr) * 2000-10-11 2002-04-18 Applera Corporation Conjugues fluorescents a nucleobase contenant des lieurs anioniques

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2001014345A1 (fr) * 1999-08-20 2001-03-01 The Research Foundation Of State University Of New York Derives 5-propynylpyrimidine utilises comme inhibiteurs d'enzyme cytotoxique
WO2001049790A2 (fr) * 2000-01-04 2001-07-12 Applera Corporation Colorants a base de cyanine a modification de mobilite
WO2002030944A2 (fr) * 2000-10-11 2002-04-18 Applera Corporation Conjugues fluorescents a nucleobase contenant des lieurs anioniques

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
USRE46683E1 (en) 2008-03-31 2018-01-23 Applied Biosystems, Llc Nucleic acid terminators incorporating a cationic moiety and methods for their use

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